Candidate fusion list
The following tables show fusion candidates where fusions are grouped based on their genomic locations (table description).
1. 8-8 ff
2. 11-11 rf
3. 12-12 fr
4. 1-1 ff
5. 9-9 rf
6. 7-7 ff
7. 17-17 rf
8. 3-3 ff
9. 17-17 fr
10. 6-6 fr
11. 7-7 fr
12. 1-1 fr
13. 17-17 rf
14. 2-2 ff
15. 11-11 fr
16. 2-2 rf
17. 11-11 rf
18. 19-19 fr
19. 14-14 fr
20. 1-1 rf
21. 17-17 fr
22. 17-17 fr
23. 17-17 fr
24. 12-12 rf
25. 2-2 rf
26. 14-14 fr
27. 1-1 fr
28. 7-7 rf
29. 1-1 rf
30. 5-5 fr
31. 6-6 rf
32. 5-5 fr
33. 19-19 rr
34. 17-17 rf
35. 17-17 rf
36. 9-9 rf
37. 17-17 fr
38. 18-18 rf
39. 17-17 fr
40. 13-13 fr
41. 22-22 rf
42. 19-19 rf
43. 22-22 fr
44. 19-19 rf
45. 7-7 ff
46. 12-12 rf
47. 19-19 rf
48. 20-20 rf
49. 7-7 rf
50. 14-14 rf
51. 11-11 fr
52. 6-6 rf
53. 16-16 rf
54. 4-4 rf
55. 14-14 fr
56. 19-19 rf
57. 1-1 rf
58. 20-20 rf
59. 8-8 rr
60. 6-6 rf
61. 7-7 rf
62. 14-14 fr
63. 12-12 fr
64. 1-1 rf
65. 15-15 fr
66. 9-9 ff
67. 17-17 fr
68. 1-1 fr
69. 19-19 rf
70. 11-11 fr
71. 7-7 rf
72. 15-15 rf
73. 12-12 rf
74. 17-17 fr
75. 1-1 fr
76. 12-12 fr
77. 16-16 rf
78. 19-19 fr
79. 7-7 fr
80. 10-10 rf
81. 19-19 fr
82. 5-5 rf
83. MT-MT rf
84. 2-2 fr
table description
1. Sample name in which a fusion is identified
2. Gene on the "left" side of the fusion
3. Chromosome ID on the left
4. Coordinates on the left
5. Gene on the "right" side
6. Chromosome ID on the right
7. Coordinates on the right
8. Number of spanning reads - this is the number of reads that span a fusion point all on their own. In other words, the read itself has a fusion break point within it.
9. Number of spanning mate pairs - this is the number of pairs of reads where one read maps entirely on the left and the other read maps entirely on the right of the fusion break point. Neither read is split, so these pairs are not counted at all in (8).
10. Number of spanning mate pairs where one end spans a fusion (reads spanning fusion with only a few bases are included).
If you follow the the 9th column, it shows coordinates "number1:number2" where one end is located at a distance of "number1" bases from the left genomic coordinate of a fusion and "number2" is similarly defined.
MDT-AP-0369_MB-0369_Primary_A14804 |
ENSG00000225630 |
1 |
565019 |
ENSG00000225630 |
1 |
565309 |
|
|
0 |
<-------- --------> |
Left flanking sequence | Right flanking sequence |
GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT | AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT |
blast search - genome
left flanking sequence - GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT
>ref|NC_000001.11| Homo sapiens chromosome 1, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000663.2| Homo sapiens chromosome 1, GRCh38 reference primary assembly
Length=248956422
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629689 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 629640
>ref|NT_032977.10| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR1_CTG3
gb|GL000006.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=121390471
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43701 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 43652
>ref|NC_018912.2| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001609.2| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=250522664
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551080 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 551031
>ref|NW_004929288.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150072.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=3324607
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42683 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 42634
>gb|CM000491.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=219474137
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 1275
>gb|CH003496.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=223056964
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102423 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 102374
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519748 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 519699
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538308 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 538259
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2241888 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 2241839
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000462.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=219475005
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT 1275
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT
>ref|NC_000001.11| Homo sapiens chromosome 1, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000663.2| Homo sapiens chromosome 1, GRCh38 reference primary assembly
Length=248956422
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629930 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 629979
>ref|NT_032977.10| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR1_CTG3
gb|GL000006.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=121390471
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43942 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 43991
>ref|NC_018912.2| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001609.2| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=250522664
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551321 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 551370
>ref|NW_004929288.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150072.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=3324607
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42924 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 42973
>gb|CM000491.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=219474137
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 1614
>gb|CH003496.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=223056964
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102664 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 102713
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117878 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 117927
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2242129 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 2242178
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519989 AATCATAATAGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 520038
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538549 AATCATAATAGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 538598
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000462.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=219475005
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565 AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 1614
>ref|NC_000009.12| Homo sapiens chromosome 9, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000671.2| Homo sapiens chromosome 9, GRCh38 reference primary assembly
Length=138394717
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 80565774 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 80565730
>ref|NT_008470.20| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR9_CTG35
gb|GL000089.2| Homo sapiens chromosome 9 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=70114165
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12345222 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 12345178
>ref|NC_018920.2| Homo sapiens chromosome 9, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001617.2| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=141360467
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83327730 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 83327686
>ref|NW_004929366.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150150.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=62239741
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12345797 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 12345753
>gb|KE141275.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold194, whole genome
shotgun sequence
Length=13018965
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12350814 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 12350770
>gb|GL583025.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_45, whole genome
shotgun sequence
Length=15247831
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12027573 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 12027529
>gb|CM000499.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=110558802
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53011918 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 53011874
>gb|DS990702.1| Homo sapiens SCAF_1112675837172 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=17664070
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12183977 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 12183933
>gb|CH003504.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=116547660
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56350264 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 56350220
>gb|CH003456.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=109101138
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51235987 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 51235943
>ref|NW_001839221.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188227, whole genome shotgun sequence
gb|DS486064.1| Homo sapiens SCAF_1103279188227 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=17664250
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12184139 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 12184095
>gb|CH471089.1| Homo sapiens 211000035832507 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=25897798
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12138082 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 12138038
>ref|AC_000141.1| Homo sapiens chromosome 9, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000470.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=110559325
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53012602 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 53012558
>gb|CM000260.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=111583154
Score = 73.1 bits (39), Expect = 8e-11
Identities = 43/45 (96%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 TAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 50
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53758046 TAATGGCCATAGTAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT 53758002
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GTGCCTGCAAAGATGGTAGAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT
right flanking sequence - AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCT
reads
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1 1 565254 565154 100m ATATTGTTGAAGAGGATAGCTATTAGAAGGATTATGGATGCGGTTGCTTGCGTGAGGAAATACTTGATGGCAGCTTCTGTGGAACGAGGGTTTATTTTTT
1 1 565251 565151 100m TTGTTGAAGAGGATAGCTATTAGAAGGATTATGGATGCGGTTGCTTGCGTGAGGAAATACTTGATGGCAGCTTCTGTGGAACGAGGGTTTATTTTTTTGG
1 1 565248 565148 100m TTGAAGAGGATAGCTATTAGAAGGATTATGGATGCGGTTGCTTGCGTGAGGAAATACTTGATGGCAGCTTCTGTGGAACGAGGGTTTATTTTTTTGGTTA
1 1 565245 565144 91m1d9m AAGAGGATAGCTATTAGAAGGATTATGGATGCGGTTGCTTGCGTGAGGAAATACTTGATGGCAGCTTCTGTGGAACGAGGGTTTATTTTTTDGGTTAGAAC
1 1 565242 565142 100m AGGATAGCTATTAGAAGGATTATGGATGCGGTTGCTTGCGTGAGGAAATACTTGATGGCAGCTTCTGTGGAACGAGGGTTTATTTTTTTGGTTAGAACTG
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1 1 565152 565052 100m GTTAGAACTGGAATAAAAGCTAGCATGTTTATTTCTAGGCCTACTCAGGTAAAAAATCAGTGCGAGCTTAGCGCTGTGATGAGTGTGCCTGCAAAGATGG
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1 1 565055 565372 37m565310F63M TGGTAGAGTAGATGACGGCTTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGT
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1 1 565050 565377 32m565310F68M GAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCC
1 1 565050 565377 32m565310F68M GAGTAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCC
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1 1 565047 565380 29m565310F71M TAGATGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAG
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1 1 565043 565384 25m565310F75M TGACGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCAC
1 1 565040 565387 22m565310F78M CGGGTTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCC
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1 1 565038 565389 20m565310F80M GGTTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTC
1 1 565037 565390 19m565310F81M GTTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCT
1 1 565037 565390 19m565310F81M GTTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCT
1 1 565036 565391 18m565310F82M TTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTG
1 1 565036 565391 18m565310F82M TTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTG
1 1 565036 565391 18m565310F82M TTGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTG
1 1 565035 565392 17m565310F83M TGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGA
1 1 565035 565392 17m565310F83M TGGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGA
1 1 565034 565393 16m565310F84M GGGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGAC
1 1 565033 565394 15m565310F85M GGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGACA
1 1 565033 565394 15m565310F85M GGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCAACCCTCTGACA
1 1 565033 565394 15m565310F85M GGCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGACA
1 1 565032 565395 14m565310F86M GCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGACAT
1 1 565032 565395 14m565310F86M GCCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGACAT
1 1 565031 565396 13m565310F87M CCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGACATC
1 1 565031 565396 13m565310F87M CCAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGACATC
1 1 565030 565397 12m565310F88M CAGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGACATCC
1 1 565029 565398 11m565310F89M AGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGGTACCCAAGGCACCCCTCTGACATCCG
1 1 565029 565398 11m565310F89M AGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGACATCCG
1 1 565029 565398 11m565310F89M AGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGACATCCG
1 1 565029 565398 11m565310F89M AGGGGATTAAT AATCATAATGGCTATAGCAATAAAACTAGGAATAGCCCCCTTTCACTTCTGAGTCCCAGAGGTTACCCAAGGCACCCCTCTGACATCCG
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Sbjct 14261209 GCCGAATAGTAGGTACAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAA 14261256
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Sbjct 2055920 GCCGAATAGTAGGTACAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAA 2055873
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Sbjct 12873977 GCCGAATAGTAGGTACAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAA 12874024
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Sbjct 631287 CCCATCATAATCGGAGGCTTTGGCAACTGACTAGTTCCCCTAATAATCGG 631336
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HSCHR1_CTG3
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150072.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 2922 CCCATCATAATCGGAGGCTTTGGCAACTGACTAGTTCCCCTAATAATCGG 2971
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Sbjct 100055045 CCCATCATAATCGGAGGCTTTGGCAACTGGCTAGTTCCCCTAATAAT 100054999
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Query 4 ATCATAATCGGAGGCTTTGGCAACTGACTAGTTCCCCTAATAATCGG 50
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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2821:2569
2821:2569
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1 |
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ENSG00000237973 |
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|
|
2 |
<-------- --------> |
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assembly
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Sbjct 45801 CCGAAAAATCAGAATAGGTGTTGGTATAGAATGGGGTCTCCTCCTCCGGC 45752
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150072.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 3424 CCGAAAAATCAGAATAGGTGTTGGTATAGAATGGGGTCTCCTCCTCCGGC 3375
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - GTCAAAGTATTTAGCTGACTCGCCACACTCCACGGAAGCAATATGAAATG
>ref|NC_000001.11| Homo sapiens chromosome 1, GRCh38 Primary Assembly
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Sbjct 632026 GTCAAAGTATTTAGCTGACTCGCCACACTCCACGGAAGCAATATGAAATG 632075
>ref|NT_032977.10| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR1_CTG3
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assembly
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Sbjct 46038 GTCAAAGTATTTAGCTGACTCGCCACACTCCACGGAAGCAATATGAAATG 46087
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genome shotgun sequence
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Query 1 GTCAAAGTATTTAGCTGACTCGCCACACTCCACGGAAGCAATATGAAATG 50
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Sbjct 553416 GTCAAAGTATTTAGCTGACTCGCCACACTCCACGGAAGCAATATGAAATG 553465
>ref|NW_004929288.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150072.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=3324607
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Query 1 GTCAAAGTATTTAGCTGACTCGCCACACTCCACGGAAGCAATATGAAATG 50
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Sbjct 45019 GTCAAAGTATTTAGCTGACTCGCCACACTCCACGGAAGCAATATGAAATG 45068
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Sbjct 3660 GTCAAAGTATTTAGCTGACTCGCCACACTCCACGGAAGCAATATGAAATG 3709
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>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
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Sbjct 3660 GTCAAAGTATTTAGCTGACTCGCCACACTCCACGGAAGCAATATGAAATG 3709
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CCGAAAAATCAGAATAGGTGTTGGTATAGAATGGGGTCTCCTCCTCCGGC
right flanking sequence - GTCAAAGTATTTAGCTGACTCGCCACACTCCACGGAAGCAATATGAAATG
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1 1 567276 567176 100m AGACCATACCTATGTATCCAAATGGTTCTTTTTTTTCCGGAGTAGTAAGTTACAATATGGGAGATTATTCCGAAGCCTGGTAGGATAAGAATATAAACTT
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>ref|NW_004929407.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150191.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=54469784
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTGGCGAGTCAGCTAAATACTTT 50
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Sbjct 25922938 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTAGCGAGTCAGCTAAATACTTT 25922889
>gb|KE141193.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold122, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTGGCGAGTCAGCTAAATACTTT 50
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Sbjct 6618456 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTAGCGAGTCAGCTAAATACTTT 6618505
>gb|GL583042.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_62, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTGGCGAGTCAGCTAAATACTTT 50
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Sbjct 5472967 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTAGCGAGTCAGCTAAATACTTT 5472918
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>gb|DS990712.1| Homo sapiens SCAF_1112675837225 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTGGCGAGTCAGCTAAATACTTT 50
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Sbjct 50355757 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTAGCGAGTCAGCTAAATACTTT 50355708
>gb|CH471109.2| Homo sapiens 211000035839605 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTGGCGAGTCAGCTAAATACTTT 50
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Sbjct 5582898 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTAGCGAGTCAGCTAAATACTTT 5582849
>ref|NW_001838448.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188280, whole genome shotgun sequence
gb|DS486074.1| Homo sapiens SCAF_1103279188280 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTGGCGAGTCAGCTAAATACTTT 50
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Sbjct 6427619 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTAGCGAGTCAGCTAAATACTTT 6427570
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTGGCGAGTCAGCTAAATACTTT 50
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Sbjct 46559639 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTAGCGAGTCAGCTAAATACTTT 46559590
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTGGCGAGTCAGCTAAATACTTT 50
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Sbjct 47651876 GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTAGCGAGTCAGCTAAATACTTT 47651827
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA
>ref|NC_000001.11| Homo sapiens chromosome 1, GRCh38 Primary Assembly
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Sbjct 632365 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 632414
>ref|NT_032977.10| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR1_CTG3
gb|GL000006.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 46377 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 46426
>ref|NC_018912.2| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001609.2| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 553755 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 553804
>ref|NW_004929288.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150072.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=3324607
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 45358 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 45407
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 3999 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 4048
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Sbjct 105098 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 105147
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 522423 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 522472
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 540983 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 541032
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 2244563 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 2244612
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000462.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 3999 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 4048
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GATCATTTCATATTGCTTCCGTGGAGTGTGGCGAGTCAGCTAAATACTTT
right flanking sequence - CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA
>ref|NR_106781.1| Homo sapiens microRNA 6723 (MIR6723), microRNA
tpe|LM611784.1| TPA: Homo sapiens microRNA hsa-mir-6723 precursor
Length=89
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCAT 49
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Sbjct 49 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCAT 1
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Length=16570
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7195 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7244
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Length=16575
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7200 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7249
>gb|KP189245.1| Homo sapiens haplogroup U5a2b mitochondrion, complete genome
Length=16570
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7195 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7244
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Length=16572
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7197 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7246
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Length=16569
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7194 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7243
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Length=16568
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7193 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7242
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Length=16560
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7194 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7243
>gb|KM096781.1| Homo sapiens isolate 151_Sb haplogroup U4a2c2 mitochondrion,
complete genome
Length=16569
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7194 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7243
>gb|KM096780.1| Homo sapiens isolate 130_Sb haplogroup H5e1 mitochondrion, complete
genome
Length=16573
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7198 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7247
>gb|KM096779.1| Homo sapiens isolate 128_Sb haplogroup U4a2a mitochondrion, complete
genome
Length=16570
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7195 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7244
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genome
Length=16567
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7192 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7241
>gb|KM096777.1| Homo sapiens isolate 117_Sb haplogroup HV2a2 mitochondrion, complete
genome
Length=16569
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7194 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7243
>gb|KM096776.1| Homo sapiens isolate 113_Sb haplogroup H5a1 mitochondrion, complete
genome
Length=16568
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7193 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7242
>gb|KM096775.1| Homo sapiens isolate 106_Sb haplogroup HV10 mitochondrion, complete
genome
Length=16581
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7197 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7246
>gb|KM096774.1| Homo sapiens isolate 103_Sb haplogroup U4a2a1 mitochondrion,
complete genome
Length=16570
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7195 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7244
>gb|KM096773.1| Homo sapiens isolate 100_Sb haplogroup U4a2g1 mitochondrion,
complete genome
Length=16570
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7195 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7244
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genome
Length=16570
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7195 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7244
>gb|KM096770.1| Homo sapiens isolate 67_Sb haplogroup H6a2 mitochondrion, complete
genome
Length=16570
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7195 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7244
>gb|KM096769.1| Homo sapiens isolate 56_Sb haplogroup H5 mitochondrion, complete
genome
Length=16571
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7196 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7245
>gb|KM096768.1| Homo sapiens isolate 47_Sb haplogroup HV16 mitochondrion, complete
genome
Length=16571
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7196 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7245
>gb|KM096767.1| Homo sapiens isolate 45_Sb haplogroup HV16 mitochondrion, complete
genome
gb|KM096772.1| Homo sapiens isolate 97_Sb haplogroup HV16 mitochondrion, complete
genome
Length=16570
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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Sbjct 7195 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTACCCCGATGCATA 7244
>gb|KM096766.1| Homo sapiens isolate 25_Sb haplogroup H6a1a mitochondrion, complete
genome
Length=16571
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCGGCCTATCCGGAATGCCCCGACGTTACTCGGACTATCCCGATGCATA 50
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20 |
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Sbjct 21553039 GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGC 21553088
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sequence
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Sbjct 5729051 GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGC 5729100
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HuRef SCAF_1103279188387, whole genome shotgun sequence
gb|DS486116.1| Homo sapiens SCAF_1103279188387 genomic scaffold, whole genome
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Sbjct 4548158 GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGC 4548207
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shotgun sequence
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Sbjct 21172427 GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGC 21172476
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blast search - nt
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complete sequence
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Sbjct 28199 CTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC 28248
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Sbjct 2968 GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGC 3017
>emb|AL035703.21| Human DNA sequence from clone RP1-61A9 on chromosome 1p35.2-36.13,
complete sequence
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Sbjct 27871 GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGC 27822
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Sbjct 2389 GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGC 2438
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Sbjct 2589 GAGACCACTTCGCTGCAGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGC 2638
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1 1 22928163 22927525 45m538n55m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATCGA
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1 1 22927890 22927579 99m211n1m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
1 1 22927887 22927576 96m211n4m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGC
1 1 22927884 22927573 93m211n7m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGA
1 1 22927881 22927570 90m211n10m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTG
1 1 22927878 22927567 87m211n13m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGG
1 1 22927875 22927564 84m211n16m GTCGAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGG
1 1 22927872 22927557 81m215n19m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGACTGTGGCGGTGGCCCT
1 1 22927869 22927558 78m211n22m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCC
1 1 22927866 22927551 75m215n25m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACT
1 1 22927863 22927552 72m211n28m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGAC
1 1 22927860 22927549 69m211n31m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCT
1 1 22927857 22927546 66m211n34m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAG
1 1 22927854 22927543 63m211n37m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGC
1 1 22927851 22927540 60m211n40m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGC
1 1 22927848 22927537 57m211n43m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGA
1 1 22927845 22927534 54m211n46m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGA
1 1 22927842 22927531 51m211n49m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCG
1 1 22927839 22927528 48m211n52m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCAT
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1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
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1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGCTGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCAGC GAA
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1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
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1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M TTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGTGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927835 22927908 44m211n53m22927906F3M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAG
1 1 22927834 22927909 43m211n53m22927906F4M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAGG
1 1 22927831 22927520 40m211n60m GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATCGAGGACA
1 1 22927829 22927914 38m211n53m22927906F9M GTCAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAGGACACT
1 1 22927826 22927726 100m CAAAGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCACCTGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCA
1 1 22927823 22927723 100m AGCAGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCACCTGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGC
1 1 22927820 22927720 100m AGCTCCGGACGAAGGCAGGGGGTGCGCACCTGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGCTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGA
1 1 22927817 22927717 100m TCCGGACGAAGGCAGGGGGTGGGCACCTGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGA
1 1 22927814 22927714 100m GGACGAAGGCAGGGGGTGGGCACCTGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGG
1 1 22927811 22927711 100m CGAAGGCAGGGGGTGGGCACCTGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGT
1 1 22927808 22927708 100m AGGCAGGGGGTGGGCACCTGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCG
1 1 22927805 22927705 100m CAGGGGGTGGGCACCTGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCA
1 1 22927800 22927700 100m GTTGGGCACCTGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGACTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCA
1 1 22927797 22927697 100m GGGCACCTGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGG
1 1 22927796 22927947 5m211n53m22927906F42M GGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGG
1 1 22927796 22927947 5m211n53m22927906F42M GGCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGG
1 1 22927793 22927693 100m ACCTGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCG
1 1 22927790 22927690 100m TGAGGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGG
1 1 22927787 22927687 100m GGCACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCC
1 1 22927784 22927684 100m ACAGGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGGCCAG
1 1 22927781 22927681 100m GGGGCTCTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCT
1 1 22927778 22927678 100m GCTCTTGGTACGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAACGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGG
1 1 22927775 22927675 100m CTTGGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCT
1 1 22927772 22927672 100m GGTAAGTGGCCAGAGGGTTCGGGAGGCGGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGCGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGT
1 1 22927767 22927667 100m GTGTCCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAG
1 1 22927763 22927663 100m CCAGAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGACCTAGTGTC
1 1 22927760 22927660 100m CAGGGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGG
1 1 22927757 22927657 100m GGTTCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCC
1 1 22927754 22927654 100m TCGGGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAA
1 1 22927751 22927651 100m GGAGGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTG
1 1 22927748 22927648 100m GGCTGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGGCC
1 1 22927745 22927645 100m TGGACCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAG
1 1 22927741 22927641 100m CCCCCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGAC
1 1 22927738 22927638 100m CCAGAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGA
1 1 22927735 22927635 100m GAAGAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCT
1 1 22927732 22927632 100m GAAGCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGG
1 1 22927729 22927629 100m GCAGGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCA
1 1 22927726 22927626 100m GGCTGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATA
1 1 22927723 22927623 100m TGAGGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTG
1 1 22927720 22927620 100m GGAAGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCCAACTGTCCCCGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGA
1 1 22927717 22927617 100m AGGGGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGC
1 1 22927714 22927614 100m GGTTCGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGC
1 1 22927710 22927610 100m CGGCAGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGG
1 1 22927706 22927606 100m AGGGCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTC
1 1 22927703 22927603 100m GCAGGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAG
1 1 22927700 22927600 100m GGGGCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAG
1 1 22927697 22927597 100m GCCGGGGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTG
1 1 22927694 22927594 100m GGTGGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGG
1 1 22927691 22927591 100m GGCCCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGG
1 1 22927688 22927588 100m CCAGGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCA
1 1 22927685 22927585 100m GGCTGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAA
1 1 22927682 22927582 100m TGGGCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGC
1 1 22927679 22927579 100m GCCTGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACC
1 1 22927676 22927576 100m TGGTCCTAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGC
1 1 22927673 22927573 100m TCCTACTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGA
1 1 22927670 22927570 100m TAGTGTCAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTG
1 1 22927667 22927567 100m TGTCCGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGG
1 1 22927664 22927564 100m CAGGGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGG
1 1 22927661 22927561 100m GGCCAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGG
1 1 22927658 22927558 100m CAAACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCC
1 1 22927655 22927555 100m ACTGTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGCGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGA
1 1 22927652 22927552 100m GTCCCAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGAC
1 1 22927648 22927548 100m CAGGGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTC
1 1 22927645 22927545 100m GGACAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGG
1 1 22927642 22927542 100m CAGATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGGTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCT
1 1 22927639 22927539 100m ATCTGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCG
1 1 22927636 22927536 100m TGGGGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGAT
1 1 22927633 22927533 100m GGCAATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCTCCTGCTGTCTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAG
1 1 22927630 22927530 100m AATACTGGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGC
1 1 22927627 22927527 100m ACTGGGAGGAAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC
1 1 22927624 22927523 24m1d76m GGGAGGCAGCTGGGCCTCAAGGAGDTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATCGAGG
1 1 22927621 22927521 100m AGGCAGCTGGGCCTGAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATCGAGGAC
1 1 22927618 22927518 100m CAGCTGGGCCTCAAGGAGCTGGGGTGGGCACAAGGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATCGAGGACACT
1 1 22927585 22927947 58m22927906F42M GGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGG
1 1 22927585 22927947 58m22927906F42M GGCACCTGCTGACTGTGGCGGTGGCCCTGAGACTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGG
1 1 22927553 22928132 26m22927906F61M153N13M CTCTCAGGGCTGCGGATGAGCGCATC GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCC
1 1 22927543 22928142 16m22927906F61M153N23M TGCGGATGAGCGCATC GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCA
1 1 22927535 22928150 8m22927906F61M153N31M AGCGCATC GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCATG
1 1 22927535 22928150 8m22927906F61M153N31M AGCGCATC GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCAA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCATG
1 1 22927533 22928152 6m22927906F61M153N33M CGCATC GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCATGGG
1 1 22927896 22928149 70M153N30M GCCGGTACCGAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCAT
1 1 22927899 22928152 67M153N33M GGTACCGAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCATGGG
1 1 22927902 22928155 64M153N36M ACCGAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCATGGGCCA
1 1 22927905 22928158 61M153N39M GAGACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCATGGGCCACCA
1 1 22927908 22928161 58M153N42M ACCACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCATGGGCCACCAGAA
1 1 22927911 22928164 55M153N45M ACTTCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCATGGGCCACCAGAAGAA
1 1 22927914 22928167 52M153N48M TCGCTGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCATGGGCCACCAGAAGAAGAT
1 1 22927917 22928170 49M153N51M ATGCGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCATGGGCCACCAGAAGAAGATCCT
1 1 22927920 22928173 46M153N54M CGGGCGGATACTCCTCTCTGGGCATGGTGCTACGCATGAACGCCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGACGTGCGCGCCCTGGGCATCACCCTCATGGGCCACCAGAAGAAGATCCTGGG
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Query 1 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 50
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 24488858 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 24488809
>gb|GL583067.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_87, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 458442 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 458491
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>gb|DS990820.1| Homo sapiens SCAF_1112675837179 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>gb|CH003448.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 25650933 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 25650884
>ref|NW_001838576.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188234, whole genome shotgun sequence
gb|DS486182.1| Homo sapiens SCAF_1103279188234 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 133647 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 133598
>gb|CH471059.2| Homo sapiens 211000035844098 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 489843 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 489794
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000462.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 24488825 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 24488776
>gb|CM000252.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 24628985 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 24628936
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT
>ref|XM_003775768.2| PREDICTED: Pongo abelii stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1556
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 564 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 515
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 425 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 376
>gb|KJ897121.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06515 STMN1
gene, encodes complete protein
Length=579
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 425 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 376
>ref|NM_001145454.2| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 4, mRNA
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Sbjct 536 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 487
>ref|XM_004092225.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 536 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 487
>ref|XM_004092224.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 536 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 487
>ref|XM_003271634.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1, transcript variant
2 (STMN1), mRNA
Length=1839
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Sbjct 621 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 572
>ref|XM_004092223.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=904
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Sbjct 536 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 487
>ref|XM_004092222.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1067
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Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 536 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 487
>ref|XM_003271633.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1, transcript variant
1 (STMN1), mRNA
Length=1754
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Sbjct 536 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 487
>ref|XM_004025212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1897
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Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 669 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 620
>ref|XM_004025211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1730
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Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 502 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 453
>ref|XM_004025210.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1985
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Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 757 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 708
>ref|XM_004025209.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=991
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 563 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 514
>ref|XM_004025208.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1791
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 563 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 514
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
Length=900
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 452 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 403
>dbj|AB464250.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8233, Homo sapiens STMN1
gene for stathmin 1/oncoprotein 18, without stop codon, in
Flexi system
Length=464
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 369 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 320
>dbj|AB451448.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, partial cds, clone: FLJ08188AAAF
Length=447
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 360 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 311
>dbj|AB451319.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, complete cds, clone:
FLJ08188AAAN
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 360 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 311
>emb|CU687359.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
3' read STMN1 mRNA
Length=1239
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 106 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 155
>emb|CU687358.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
5' read STMN1 mRNA
Length=1240
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 327
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
Length=543
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 453 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 404
>emb|AM392854.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002031 for hypothetical
protein (STMN1 gene)
Length=489
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 380 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 331
>gb|BC040585.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5269067, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2353
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 1300
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
Length=1069
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 505 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 456
>gb|BC082228.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:99593
IMAGE:2822803), complete cds
Length=990
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 385
>gb|BC023313.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:4939590),
with apparent retained intron
Length=2121
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1568 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 1519
>dbj|AK123488.1| Homo sapiens cDNA FLJ41494 fis, clone BRTHA2005013, moderately
similar to Homo sapiens leukemia-associated phosphoprotein
p18
Length=3441
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2903 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 2854
>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
Length=1417
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 383
>dbj|AB209282.1| Homo sapiens mRNA for stathmin 1 variant protein
Length=2936
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 2349
>gb|DQ000556.1| Synthetic construct clone PSF:109100 leukemia-associated phosphoprotein
p18 gene, complete cds
Length=522
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 383
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
Length=83111
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19094 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 19045
>dbj|AK129748.1| Homo sapiens cDNA FLJ26237 fis, clone CBR04649, highly similar
to Stathmin
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Sbjct 360 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 311
>gb|AY892936.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141262.01L stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, partial cds
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X1, mRNA
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Sbjct 563 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTGGCTTCCATTT 514
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X2, mRNA
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X1, mRNA
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Sbjct 558 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 509
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misc_RNA
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X3, mRNA
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X2, mRNA
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Sbjct 563 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTGGCTTCCATTT 514
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Sbjct 531 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTGGCTTCCATTT 482
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variant X6, mRNA
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Sbjct 467 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 418
>ref|XM_009000684.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 616 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 567
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variant X4, mRNA
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Sbjct 484 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 435
>ref|XM_009000682.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 773 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 724
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variant X2, mRNA
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Sbjct 731 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 682
>ref|XM_003733374.2| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 560 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 511
>ref|XR_620727.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin pseudogene (LOC103793637),
misc_RNA
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Sbjct 437 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 388
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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Sbjct 441 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 392
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variant X1, mRNA
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Sbjct 531 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 482
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Sbjct 504 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 455
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X1, mRNA
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Sbjct 531 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 482
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mRNA
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Sbjct 527 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 478
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Sbjct 497 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 448
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Sbjct 623 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 574
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 666 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 617
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 521 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 472
>ref|XM_002802243.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 3
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 505 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 456
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 457 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 408
>ref|XM_001114361.2| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 1
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 530 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 481
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human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3, mRNA, RefSeq: NM_005563.3
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Sbjct 453 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 404
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Sbjct 306 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 257
>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3,mRNA, RefSeq: NM_005563.3
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Sbjct 454 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 405
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Sbjct 144 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCAT 97
>ref|XM_008067624.1| PREDICTED: Tarsius syrichta stathmin (LOC103270080), mRNA
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Sbjct 453 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCAT 406
>ref|XM_008055475.1| PREDICTED: Tarsius syrichta stathmin-like (LOC103257773), mRNA
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Sbjct 448 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCAT 401
>ref|XM_004637720.1| PREDICTED: Octodon degus stathmin 1 (Stmn1), mRNA
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Sbjct 360 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCAT 313
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X2, mRNA
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Sbjct 440 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTT 391
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X1, misc_RNA
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Sbjct 440 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTT 391
>ref|XM_006924404.1| PREDICTED: Pteropus alecto stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 496 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTT 447
>ref|XM_006869319.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica stathmin-like (LOC102840741),
mRNA
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Sbjct 453 CAGTTTGGCGGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTGGCTTCCATTT 404
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X2, mRNA
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Sbjct 528 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTT 479
>ref|XM_001504114.4| PREDICTED: Equus caballus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 504 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTT 455
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variant X2, mRNA
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Sbjct 498 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTTTCTTTGTTAGCTTCCATTT 449
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variant X1, mRNA
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Sbjct 507 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTTTCTTTGTTAGCTTCCATTT 458
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variant X2, mRNA
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Sbjct 496 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTTTCTTTGTTAGCTTCCATTT 447
>ref|XM_004881071.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber stathmin 1 (Stmn1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 507 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTTTCTTTGTTAGCTTCCATTT 458
>ref|XM_004678639.1| PREDICTED: Condylura cristata stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 508 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTT 459
>ref|XM_004678638.1| PREDICTED: Condylura cristata stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 534 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTT 485
>ref|XM_004450518.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant 2, mRNA
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Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 437 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTT 388
>ref|XM_004450517.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant 1, mRNA
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Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 448 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTT 399
>dbj|AB172668.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-19157, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
1, mRNA, RefSeq: NM_203401.1
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Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 1181 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTATCTTTGTTAGCTTCCATTT 1132
>gb|L37198.1|HUMHDCRA Homo sapiens (clone B3B3E13) Huntington's disease candidate region
mRNA fragment
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Query 7 GGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 920 GGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 963
>ref|XM_007935754.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1541
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Query 2 AGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT 50
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Sbjct 532 AGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTT 484
>ref|XR_503992.1| PREDICTED: Tarsius syrichta stathmin pseudogene (LOC103254904),
misc_RNA
Length=883
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Query 1 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCAT 48
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Sbjct 359 CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTGGTTAGCTTCCAT 312
>ref|XR_622049.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin pseudogene (LOC100895085),
misc_RNA
Length=1072
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Sbjct 439 CAGTTTCTCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 390
>ref|XM_003764951.1| PREDICTED: Sarcophilus harrisii stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=957
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Sbjct 424 CAGCTTAGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTT 375
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG
>ref|NR_037481.1| Homo sapiens microRNA 3917 (MIR3917), microRNA
tpe|LM611253.1| TPA: Homo sapiens microRNA hsa-mir-3917 precursor
Length=93
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Sbjct 40 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 89
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
Length=83111
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Query 1 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 50
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Sbjct 14188 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 14237
>emb|X94912.1| H.sapiens Pr22 gene
Length=16626
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Query 1 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 50
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Sbjct 6150 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 6101
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Query 1 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 50
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Sbjct 9760 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 9809
>gb|M74239.1|HUMPPP18TH Human (dx patient) phosphoprotein (p18) gene, exon 1
Length=1972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 50
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Sbjct 839 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 888
>gb|M31303.1|HUMOP18A Human oncoprotein 18 (Op18) gene, complete cds
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Sbjct 1145 TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGG 1194
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
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1 1 26203019 26232900 27M24935N68M26232906F5m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGG
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1 1 26227564 26232887 14M403N68M26232906F18m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGG
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1 1 26227999 26231205 50M26232906F27m1650n23m CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228002 26231202 47M26232906F27m1650n26m TTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228002 26231202 47M26232906F27m1650n26m TTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228002 26231202 47M26232906F27m1650n26m TTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228002 26231202 47M26232906F27m1650n26m TTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228003 26231201 46M26232906F27m1650n27m GTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228004 26231200 45M26232906F27m1650n28m TCGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228005 26231199 44M26232906F27m1650n29m GGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228006 26231198 43M26232906F27m1650n30m GCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228007 26231197 42M26232906F27m1650n31m CAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26228011 26231193 38M26232906F27m1650n35m CATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26228012 26231192 37M26232906F27m1650n36m ATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228012 26231192 37M26232906F27m1650n36m ATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228013 26231191 36M26232906F27m1650n37m TTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228014 26231190 35M26232906F27m1650n38m TTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228016 26231188 33M26232906F27m1650n40m GTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26228018 26231186 31M26232906F27m1650n42m GCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228018 26231186 31M26232906F27m1650n42m GCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTT TGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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503 |
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188234, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 128745 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 128794
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sequence
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Sbjct 484941 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 484990
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shotgun sequence
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Sbjct 24483923 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 24483972
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Lambda K H
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HSCHR1_CTG3
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assembly
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Sbjct 25320424 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 25320375
>ref|NC_018912.2| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Sbjct 26346167 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 26346118
>ref|NW_004929289.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 23864362 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 23864411
>gb|DS990820.1| Homo sapiens SCAF_1112675837179 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 133642 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 133593
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Query 1 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 50
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>ref|NW_001838576.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188234, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 50
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Sbjct 133644 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 133595
>gb|CH471059.2| Homo sapiens 211000035844098 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 489840 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 489791
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 50
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Sbjct 24488822 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 24488773
>gb|CM000252.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 50
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Sbjct 24628982 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 24628933
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG
>ref|XM_003775768.2| PREDICTED: Pongo abelii stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 560 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 511
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gene, encodes complete protein
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 421 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 372
>gb|KJ897121.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06515 STMN1
gene, encodes complete protein
Length=579
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 421 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 372
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 532 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 483
>ref|XM_004092225.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 532 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 483
>ref|XM_004092224.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 532 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 483
>ref|XM_003271634.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1, transcript variant
2 (STMN1), mRNA
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 617 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 568
>ref|XM_004092223.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 532 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 483
>ref|XM_004092222.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 532 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 483
>ref|XM_003271633.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1, transcript variant
1 (STMN1), mRNA
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 532 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 483
>ref|XM_004025212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 665 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 616
>ref|XM_004025211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 498 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 449
>ref|XM_004025210.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 753 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 704
>ref|XM_004025209.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 559 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 510
>ref|XM_004025208.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1791
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 559 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 510
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
Length=900
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 448 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 399
>dbj|AB464250.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8233, Homo sapiens STMN1
gene for stathmin 1/oncoprotein 18, without stop codon, in
Flexi system
Length=464
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 365 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 316
>dbj|AB451448.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, partial cds, clone: FLJ08188AAAF
Length=447
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 356 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 307
>dbj|AB451319.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, complete cds, clone:
FLJ08188AAAN
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 356 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 307
>emb|CU687359.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
3' read STMN1 mRNA
Length=1239
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Sbjct 110 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 159
>emb|CU687358.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
5' read STMN1 mRNA
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Sbjct 372 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 323
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
Length=543
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Sbjct 449 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 400
>emb|AM392854.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002031 for hypothetical
protein (STMN1 gene)
Length=489
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Sbjct 376 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 327
>gb|BC040585.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5269067, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2353
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Sbjct 1345 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 1296
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
Length=1069
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Sbjct 501 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 452
>gb|BC082228.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:99593
IMAGE:2822803), complete cds
Length=990
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Sbjct 430 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 381
>gb|BC023313.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:4939590),
with apparent retained intron
Length=2121
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Sbjct 1564 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 1515
>dbj|AK123488.1| Homo sapiens cDNA FLJ41494 fis, clone BRTHA2005013, moderately
similar to Homo sapiens leukemia-associated phosphoprotein
p18
Length=3441
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Sbjct 2899 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 2850
>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
Length=1417
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Sbjct 428 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 379
>dbj|AB209282.1| Homo sapiens mRNA for stathmin 1 variant protein
Length=2936
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Sbjct 2394 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 2345
>gb|DQ000556.1| Synthetic construct clone PSF:109100 leukemia-associated phosphoprotein
p18 gene, complete cds
Length=522
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Sbjct 428 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 379
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
Length=83111
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Sbjct 19090 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 19041
>dbj|AK129748.1| Homo sapiens cDNA FLJ26237 fis, clone CBR04649, highly similar
to Stathmin
Length=2820
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Sbjct 2278 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 2229
>gb|AY890476.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141266.01X stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, complete cds
Length=450
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Sbjct 356 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 307
>gb|AY892936.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141262.01L stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, partial cds
Length=450
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 356 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 307
>ref|NM_203401.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 1, mRNA
Length=1730
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 720 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 671
>ref|NM_203399.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 2, mRNA
Length=1518
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 508 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 459
>ref|NM_005563.3| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 3, mRNA
Length=1542
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 532 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 483
>emb|BX647885.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C18102 (from clone DKFZp686C18102)
Length=2972
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 2408 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 2359
>emb|X94912.1| H.sapiens Pr22 gene
Length=16626
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 1252 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 1301
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 14635 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 14586
>emb|Z11566.1| H.sapiens mRNA for Pr22 protein
Length=1436
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Sbjct 447 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 398
>gb|J04991.1|HUMP18 Human p18 protein mRNA, complete cds
Length=1450
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 459 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 410
>gb|M31303.1|HUMOP18A Human oncoprotein 18 (Op18) gene, complete cds
Length=8058
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 6055 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 6006
>emb|X53305.1| H.sapiens mRNA for stathmin
Length=1429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 437 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 388
>gb|L37198.1|HUMHDCRA Homo sapiens (clone B3B3E13) Huntington's disease candidate region
mRNA fragment
Length=1006
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Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 3 GGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 920 GGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 967
>ref|XM_010633450.1| PREDICTED: Fukomys damarensis stathmin 1 (Stmn1), mRNA
Length=950
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 416 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 367
>ref|XM_010355693.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1002
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 554 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 505
>ref|XM_010355448.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana stathmin (LOC104655902), mRNA
Length=1004
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 459 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 410
>ref|XM_001136848.4| PREDICTED: Pan troglodytes stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1195
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Sbjct 642 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTGGCTTCCATTTTGTG 593
>ref|XM_001137168.4| PREDICTED: Pan troglodytes stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1112
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Sbjct 559 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTGGCTTCCATTTTGTG 510
>ref|XM_009202178.1| PREDICTED: Papio anubis stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X3, mRNA
Length=1315
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Sbjct 772 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 723
>ref|XM_003891365.2| PREDICTED: Papio anubis stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1150
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Sbjct 607 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 558
>ref|XM_003891362.2| PREDICTED: Papio anubis stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1097
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Sbjct 554 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 505
>ref|XR_615139.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin pseudogene (LOC100404965),
misc_RNA
Length=475
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Sbjct 432 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 383
>ref|XM_003809472.2| PREDICTED: Pan paniscus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X3, mRNA
Length=1565
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 577 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTGGCTTCCATTTTGTG 528
>ref|XM_003809470.2| PREDICTED: Pan paniscus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1546
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 559 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTGGCTTCCATTTTGTG 510
>ref|XM_008961690.1| PREDICTED: Pan paniscus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=2227
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 527 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTGGCTTCCATTTTGTG 478
>ref|XM_009000685.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X6, mRNA
Length=1444
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 463 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 414
>ref|XM_009000684.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X5, mRNA
Length=1593
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 612 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 563
>ref|XM_009000683.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X4, mRNA
Length=1461
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 480 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 431
>ref|XM_009000682.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X3, mRNA
Length=1750
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 769 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 720
>ref|XM_009000681.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X2, mRNA
Length=1708
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 727 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 678
>ref|XM_003733374.2| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1537
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 556 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 507
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misc_RNA
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Sbjct 433 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 384
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Sbjct 530 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 481
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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Sbjct 437 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 388
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variant X1, mRNA
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Sbjct 527 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 478
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Sbjct 422 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTGGCTTCCATTTTGTG 373
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X2, mRNA
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Sbjct 500 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 451
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X1, mRNA
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Sbjct 527 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 478
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mRNA
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Sbjct 523 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 474
>ref|XM_003471315.2| PREDICTED: Cavia porcellus stathmin 1 (Stmn1), mRNA
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Sbjct 493 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 444
>ref|XM_002802246.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 6
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 619 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 570
>ref|XM_002802245.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 5
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 662 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 613
>ref|XM_002802244.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 4
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 517 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 468
>ref|XM_002802243.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 3
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 501 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 452
>ref|XM_002802242.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 2
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 453 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 404
>ref|XM_001114361.2| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 1
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 526 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 477
>dbj|AB170228.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10916, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3, mRNA, RefSeq: NM_005563.3
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Sbjct 449 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 400
>gb|AY650331.1| Macaca fascicularis stathmin 1 mRNA, partial cds
Length=376
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Sbjct 302 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 253
>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3,mRNA, RefSeq: NM_005563.3
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Sbjct 450 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 401
>ref|XM_008529055.1| PREDICTED: Equus przewalskii stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 436 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTTTGTG 387
>ref|XR_546285.1| PREDICTED: Equus przewalskii stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, misc_RNA
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Sbjct 436 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTTTGTG 387
>ref|XM_008073080.1| PREDICTED: Tarsius syrichta stathmin 1 (STMN1), partial mRNA
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Sbjct 140 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATCTTGTG 91
>ref|XM_008067624.1| PREDICTED: Tarsius syrichta stathmin (LOC103270080), mRNA
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Sbjct 449 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATCTTGTG 400
>ref|XM_008055475.1| PREDICTED: Tarsius syrichta stathmin-like (LOC103257773), mRNA
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Sbjct 444 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATCTTGTG 395
>ref|XM_007935754.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 529 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTTTGTG 480
>ref|XM_006924404.1| PREDICTED: Pteropus alecto stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 492 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTTTGTG 443
>ref|XM_006869319.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica stathmin-like (LOC102840741),
mRNA
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Sbjct 449 TTGGCGGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTGGCTTCCATTTTGTG 400
>ref|XM_005607328.1| PREDICTED: Equus caballus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 524 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTTTGTG 475
>ref|XM_001504114.4| PREDICTED: Equus caballus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 500 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTTTGTG 451
>ref|XM_004678639.1| PREDICTED: Condylura cristata stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 504 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTTTGTG 455
>ref|XM_004678638.1| PREDICTED: Condylura cristata stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1530
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Sbjct 530 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTTTGTG 481
>ref|XM_004637720.1| PREDICTED: Octodon degus stathmin 1 (Stmn1), mRNA
Length=471
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Sbjct 356 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATCTTGTG 307
>ref|XM_004450518.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant 2, mRNA
Length=967
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Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 433 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTTTGTG 384
>ref|XM_004450517.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant 1, mRNA
Length=978
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 444 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTCCATTTTGTG 395
>ref|XM_003764951.1| PREDICTED: Sarcophilus harrisii stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=957
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 417 GCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 371
>ref|XR_622049.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin pseudogene (LOC100895085),
misc_RNA
Length=1072
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 CAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 431 CAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTGTTAGCTTCCATTTTGTG 386
>ref|XR_503992.1| PREDICTED: Tarsius syrichta stathmin pseudogene (LOC103254904),
misc_RNA
Length=883
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG 50
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Sbjct 355 TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTGGTTAGCTTCCATCTTGTG 306
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG
>ref|NR_037481.1| Homo sapiens microRNA 3917 (MIR3917), microRNA
tpe|LM611253.1| TPA: Homo sapiens microRNA hsa-mir-3917 precursor
Length=93
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 50
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Sbjct 43 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 92
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
Length=83111
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14191 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 14240
>emb|X94912.1| H.sapiens Pr22 gene
Length=16626
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6147 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 6098
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 50
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Sbjct 9763 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 9812
>gb|M74239.1|HUMPPP18TH Human (dx patient) phosphoprotein (p18) gene, exon 1
Length=1972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 50
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Sbjct 842 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 891
>gb|M31303.1|HUMOP18A Human oncoprotein 18 (Op18) gene, complete cds
Length=8058
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGTGGGTGCGGGGCTCGGAGGAGGCGG 50
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1 1 26227721 26227821 100M GGTCCCTTGTAGAACCTAACAAGCTGCCTACTGGACTTCCAAGGACTGTGCAATTATGCTGGGAATTAC
1 1 26227729 26227829 100M GGTCCCTTGTAGAACCTAACAAGCTGCCTACTGGACTTCCAAGGACTGTGCAATTATGCTGGGAATTACTGAATATT
1 1 26227743 26227843 100M GGTCCCTTGTAGAACCTAACAAGCTGCCTACTGGACTTCCAAGGACTGTGCAATTATGCTGGGAATTACTGAATATTCCATCTTAAAATAT
1 1 26227746 26227846 100M GGTCCCTTGTAGAACCTAACAAGCTGCCTACTGGACTTCCAAGGACTGTGCAATTATGCTGGGAATTACTGAATATTCCATCTTAAAATATACC
1 1 26227760 26227860 100M GTAGAACCTAACAAGCTGCCTACTGGACTTCCAAGGACTGTGCAATTATGCTGGGAATTACTGAATATTCCATCTTAAAATATACCTTTCATTTAATATG
1 1 26227775 26227875 100M CTGCCTACTGGACTTCCAAGGACTGTGCAATTATGCTGGGAATTACTGAATATTCCATCTTAAAATATACCTTTCATTTAATATGTTAAGCCCCAAAATG
1 1 26227803 26227903 100M AATTATGCTGGGAATTACTGAATATTCCATCTTAAAATATACCTTTCATTTAATATGTTAAGCCCCAAAATGGATGACAAAAAGACACCAAACACCTTTT
1 1 26227845 26227945 100M CTTTCATTTAATAGGTTAAGCCCCAAAATGGATGACAAAAAGACACCAAACACCTTTTATCAAAGCACTTAGTTCAAGCCAACTCATTGGTGCATCAAAC
1 1 26227849 26227949 100M CATTTAATATGTTAAGCCCCAAAATGGATGACAAAAAGACACCAAACACCTTTTATCAAAGCACTTAGTTCAAGCCAACTCATTGGTGCATCAAACTCCA
1 1 26227866 26227966 100M CCCAAAATGGATGACAAAAAGACACCAAACACCTTTTATCAAAGCACTTAGTTCAAGCCAACTCATTGGTGCATCAAACTCCAAGCTCAACCCTTTTACA
1 1 26227890 26227990 100M CCAAACACCTTTTATCAAAGCACTTAGTTCAAGCCAACTCATTGGTGCATCAAACTCCAAGCTCAACCCTTTTACAAAGTAAGAAACCAACCTTCTCTCG
1 1 26227916 26228016 100M GTTCAAGCCAACTCATTGGTGCATCAAACTCCAAGCTCAACCCTTTTACAAAGTAAGAAACCAACCTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTT
1 1 26227926 26228026 100M ACTCATTGGTGCATCAAACTCCAAGCTCAACCCTTTTACAAAGTAAGAAACCAACCTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCG
1 1 26227947 26228047 100M CAAGCTCAACCCTTTTACAAAGTAAGAAACCAACCTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCAT
1 1 26227952 26228052 100M TCAACCCTTTTACAAAGTAAGAAACCAACCTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGT
1 1 26227958 26228058 100M CTTTTACAAAGTAAGAAACCAACCTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCA
1 1 26227980 26231225 73M26232903F24m1650n3m CCTTCTCTCGCAATCGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227980 26231225 73M26232903F24m1650n3m CCTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227980 26231225 73M26232903F24m1650n3m CCTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227980 26231225 73M26232903F24m1650n3m CCTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227980 26231225 73M26232903F24m1650n3m CCTTCCCCCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227980 26231225 73M26232903F24m1650n3m CCTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227981 26231224 72M26232903F24m1650n4m ATTCCCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227981 26231224 72M26232903F24m1650n4m CTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227981 26231224 72M26232903F24m1650n4m CTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGTCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227981 26231224 72M26232903F24m1650n4m CTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227981 26231224 72M26232903F24m1650n4m CTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGTCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227981 26231224 72M26232903F24m1650n4m CTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227982 26231223 71M26232903F24m1650n5m TTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227982 26231223 71M26232903F24m1650n5m TTCGCTCCCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227982 26231223 71M26232903F24m1650n5m TTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGACTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227983 26231222 70M26232903F24m1650n6m TCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227983 26231222 70M26232903F24m1650n6m TCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGTCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227983 26231222 70M26232903F24m1650n6m TCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227983 26231222 70M26232903F24m1650n6m TCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227983 26231222 70M26232903F24m1650n6m TCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227983 26231222 70M26232903F24m1650n6m TCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227983 26231222 70M26232903F24m1650n6m TCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGTCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227984 26231221 69M26232903F24m1650n7m CTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227984 26231221 69M26232903F24m1650n7m CTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227984 26231221 69M26232903F24m1650n7m CTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGTCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227984 26231221 69M26232903F24m1650n7m CTCTCGCAAGCGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227984 26231221 69M26232903F24m1650n7m CTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227984 26231221 69M26232903F24m1650n7m CTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227984 26231221 69M26232903F24m1650n7m CTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227984 26231221 69M26232903F24m1650n7m CTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCCCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227985 26231220 68M26232903F24m1650n8m TCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227985 26231220 68M26232903F24m1650n8m TCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227985 26231220 68M26232903F24m1650n8m TCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227985 26231220 68M26232903F24m1650n8m TCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227986 26231219 67M26232903F24m1650n9m CGCGCAAACGTTCCAGTTTGGCCGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227986 26231219 67M26232903F24m1650n9m CTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCGCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227986 26231219 67M26232903F24m1650n9m CTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227986 26231219 67M26232903F24m1650n9m CTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTGCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227987 26231218 66M26232903F24m1650n10m TCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227987 26231218 66M26232903F24m1650n10m TCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227987 26231218 66M26232903F24m1650n10m TCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227987 26231218 66M26232903F24m1650n10m TCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227987 26231218 66M26232903F24m1650n10m TCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227988 26231217 65M26232903F24m1650n11m CGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227988 26231217 65M26232903F24m1650n11m CGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227988 26231217 65M26232903F24m1650n11m CGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227988 26231217 65M26232903F24m1650n11m CGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227988 26231217 65M26232903F24m1650n11m CGGAAACGTTCCAGTTTTGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227988 26231217 65M26232903F24m1650n11m CGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227989 26231216 64M26232903F24m1650n12m GCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227989 26231216 64M26232903F24m1650n12m GCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227989 26231216 64M26232903F24m1650n12m GCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227989 26231216 64M26232903F24m1650n12m GCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227990 26231215 63M26232903F24m1650n13m CAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227990 26231215 63M26232903F24m1650n13m CAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227990 26231215 63M26232903F24m1650n13m CAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227991 26231214 62M26232903F24m1650n14m AAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227991 26231214 62M26232903F24m1650n14m AAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227991 26231214 62M26232903F24m1650n14m AAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227991 26231214 62M26232903F24m1650n14m AAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227991 26231214 62M26232903F24m1650n14m AAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227991 26231214 62M26232903F24m1650n14m AAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227992 26231213 61M26232903F24m1650n15m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227992 26231213 61M26232903F24m1650n15m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227992 26231213 61M26232903F24m1650n15m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227992 26231213 61M26232903F24m1650n15m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227992 26231213 61M26232903F24m1650n15m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227992 26231213 61M26232903F24m1650n15m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227992 26231213 61M26232903F24m1650n15m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227993 26231212 60M26232903F24m1650n16m ACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG TGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227993 26231212 60M26232903F24m1650n16m ACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227993 26231212 60M26232903F24m1650n16m ACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227993 26231212 60M26232903F24m1650n16m ACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227993 26231212 60M26232903F24m1650n16m ACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227993 26231212 60M26232903F24m1650n16m ACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227994 26231211 59M26232903F24m1650n17m CGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227994 26231211 59M26232903F24m1650n17m CGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227994 26231211 59M26232903F24m1650n17m CGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227994 26231211 59M26232903F24m1650n17m CGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227995 26231210 58M26232903F24m1650n18m GTCCCAGTTTGGAAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227996 26231209 57M26232903F24m1650n19m TTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227996 26231209 57M26232903F24m1650n19m TTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227996 26231209 57M26232903F24m1650n19m TTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227996 26231209 57M26232903F24m1650n19m TTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGCCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227997 26231208 56M26232903F24m1650n20m TCCAGTTTGGTAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227997 26231208 56M26232903F24m1650n20m TCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227999 26231206 54M26232903F24m1650n22m CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227999 26231206 54M26232903F24m1650n22m CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCCCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26227999 26231206 54M26232903F24m1650n22m CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228000 26231205 53M26232903F24m1650n23m AGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228001 26231204 52M26232903F24m1650n24m GTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228001 26231204 52M26232903F24m1650n24m GTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228001 26231204 52M26232903F24m1650n24m GTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228002 26231203 51M26232903F24m1650n25m TTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228002 26231203 51M26232903F24m1650n25m TTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228003 26231202 50M26232903F24m1650n26m TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228003 26231202 50M26232903F24m1650n26m TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228003 26231202 50M26232903F24m1650n26m TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228003 26231202 50M26232903F24m1650n26m TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228004 26231201 49M26232903F24m1650n27m TGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228005 26231200 48M26232903F24m1650n28m GGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228005 26231200 48M26232903F24m1650n28m GGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228005 26231200 48M26232903F24m1650n28m GGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228005 26231200 48M26232903F24m1650n28m GGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228006 26231199 47M26232903F24m1650n29m GCAGCCAGTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228006 26231199 47M26232903F24m1650n29m GCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228007 26231198 46M26232903F24m1650n30m CAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228007 26231198 46M26232903F24m1650n30m CAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228007 26231198 46M26232903F24m1650n30m CAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228008 26231197 45M26232903F24m1650n31m AGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCGGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228009 26231196 44M26232903F24m1650n32m GCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228009 26231196 44M26232903F24m1650n32m GCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228009 26231196 44M26232903F24m1650n32m GCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228009 26231196 44M26232903F24m1650n32m GCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228011 26231194 42M26232903F24m1650n34m CATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228011 26231194 42M26232903F24m1650n34m CATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228012 26231193 41M26232903F24m1650n35m ATTTGTGCCTCTCGGTGCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228013 26231192 40M26232903F24m1650n36m TTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228014 26231191 39M26232903F24m1650n37m TTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228014 26231191 39M26232903F24m1650n37m TTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228014 26231191 39M26232903F24m1650n37m TTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228014 26231191 39M26232903F24m1650n37m TTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228014 26231191 39M26232903F24m1650n37m TTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228015 26231190 38M26232903F24m1650n38m TGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228016 26231189 37M26232903F24m1650n39m GTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228016 26231189 37M26232903F24m1650n39m GTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228016 26231189 37M26232903F24m1650n39m GTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228016 26231189 37M26232903F24m1650n39m GTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228017 26231188 36M26232903F24m1650n40m TGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228018 26231187 35M26232903F24m1650n41m GCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228018 26231187 35M26232903F24m1650n41m GCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228018 26231187 35M26232903F24m1650n41m GCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228018 26231187 35M26232903F24m1650n41m GCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228019 26231186 34M26232903F24m1650n42m CCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228020 26231185 33M26232903F24m1650n43m CTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26228020 26231185 33M26232903F24m1650n43m CTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228021 26231184 32M26232903F24m1650n44m TCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228021 26231184 32M26232903F24m1650n44m TCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228021 26231184 32M26232903F24m1650n44m TCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228022 26231183 31M26232903F24m1650n45m CTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228022 26231183 31M26232903F24m1650n45m CTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228023 26231182 30M26232903F24m1650n46m TCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228024 26231181 29M26232903F24m1650n47m CGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228024 26231181 29M26232903F24m1650n47m CGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26228026 26231179 27M26232903F24m1650n49m GTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228026 26231179 27M26232903F24m1650n49m GTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228026 26231179 27M26232903F24m1650n49m GTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26228027 26231178 26M26232903F24m1650n50m TTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228027 26231178 26M26232903F24m1650n50m TTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228027 26231178 26M26232903F24m1650n50m TTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228028 26231177 25M26232903F24m1650n51m TCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228028 26231177 25M26232903F24m1650n51m TCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228028 26231177 25M26232903F24m1650n51m TCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228028 26231177 25M26232903F24m1650n51m TCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26228029 26231176 24M26232903F24m1650n52m CTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228030 26231175 23M26232903F24m1650n53m TCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228030 26231175 23M26232903F24m1650n53m TCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228030 26231175 23M26232903F24m1650n53m TCTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228031 26231174 22M26232903F24m1650n54m CTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228031 26231174 22M26232903F24m1650n54m CTTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228032 26231173 21M26232903F24m1650n55m TTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228032 26231173 21M26232903F24m1650n55m TTTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228033 26231172 20M26232903F24m1650n56m TTATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26228035 26231170 18M26232903F24m1650n58m ATTAGCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26228039 26231166 14M26232903F24m1650n62m GCTTCCATTTTGTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26228050 26231155 3M26232903F24m1650n73m GTG GGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26232907 26231157 71m1650n29m AGTGTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26232904 26231154 74m1650n26m GTGGTCAGGCGGCTCGGACTGAGCAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26232901 26230226 2m925n75m1650n23m GT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26232897 26231147 81m1650n19m GGCGGCTCGGACTGAGCAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26232892 26230292 11m850n75m1650n14m CTCGGACTGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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67 pairs
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10:-4
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|
91 |
--------> <-------- |
Left flanking sequence | Right flanking sequence |
TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA | AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG |
blast search - genome
left flanking sequence - TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA
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>ref|NT_032977.10| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR1_CTG3
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assembly
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Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25315554 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 25315603
>ref|NC_018912.2| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001609.2| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 24627293 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 24627244
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA
>ref|XM_003775768.2| PREDICTED: Pongo abelii stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 531 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 482
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 392 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 343
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 392 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 343
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Sbjct 503 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 454
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Sbjct 503 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 454
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2 (STMN1), mRNA
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Sbjct 588 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 539
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Sbjct 503 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 454
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Sbjct 503 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 454
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1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 503 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 454
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Sbjct 636 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 587
>ref|XM_004025211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 469 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 420
>ref|XM_004025210.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 724 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 675
>ref|XM_004025209.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 530 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 481
>ref|XM_004025208.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 530 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 481
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
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Sbjct 419 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 370
>dbj|AB464250.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8233, Homo sapiens STMN1
gene for stathmin 1/oncoprotein 18, without stop codon, in
Flexi system
Length=464
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Sbjct 336 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 287
>dbj|AB451448.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, partial cds, clone: FLJ08188AAAF
Length=447
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Sbjct 327 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 278
>dbj|AB451319.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, complete cds, clone:
FLJ08188AAAN
Length=450
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Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 327 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 278
>emb|CU687359.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
3' read STMN1 mRNA
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Sbjct 139 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 188
>emb|CU687358.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
5' read STMN1 mRNA
Length=1240
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 343 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 294
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
Length=543
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 420 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 371
>emb|AM392854.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002031 for hypothetical
protein (STMN1 gene)
Length=489
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Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 347 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 298
>gb|BC040585.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5269067, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2353
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 1316 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 1267
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
Length=1069
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 472 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 423
>gb|BC082228.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:99593
IMAGE:2822803), complete cds
Length=990
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 401 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 352
>gb|BC023313.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:4939590),
with apparent retained intron
Length=2121
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 1535 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 1486
>dbj|AK123488.1| Homo sapiens cDNA FLJ41494 fis, clone BRTHA2005013, moderately
similar to Homo sapiens leukemia-associated phosphoprotein
p18
Length=3441
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 2870 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 2821
>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
Length=1417
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 399 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 350
>dbj|AB209282.1| Homo sapiens mRNA for stathmin 1 variant protein
Length=2936
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 2365 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 2316
>gb|DQ000556.1| Synthetic construct clone PSF:109100 leukemia-associated phosphoprotein
p18 gene, complete cds
Length=522
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 399 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 350
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
Length=83111
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 19061 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 19012
>dbj|AK129748.1| Homo sapiens cDNA FLJ26237 fis, clone CBR04649, highly similar
to Stathmin
Length=2820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 2249 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 2200
>gb|AY890476.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141266.01X stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, complete cds
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 327 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 278
>gb|AY892936.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141262.01L stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, partial cds
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 327 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 278
>ref|NM_203401.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 1, mRNA
Length=1730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 691 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 642
>ref|NM_203399.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 2, mRNA
Length=1518
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 479 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 430
>ref|NM_005563.3| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 3, mRNA
Length=1542
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 503 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 454
>emb|BX647885.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C18102 (from clone DKFZp686C18102)
Length=2972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 2379 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 2330
>emb|X94912.1| H.sapiens Pr22 gene
Length=16626
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 1281 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 1330
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 14606 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 14557
>emb|Z11566.1| H.sapiens mRNA for Pr22 protein
Length=1436
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 418 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 369
>gb|L37198.1|HUMHDCRA Homo sapiens (clone B3B3E13) Huntington's disease candidate region
mRNA fragment
Length=1006
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 947 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 996
>gb|J04991.1|HUMP18 Human p18 protein mRNA, complete cds
Length=1450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 430 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 381
>gb|M31303.1|HUMOP18A Human oncoprotein 18 (Op18) gene, complete cds
Length=8058
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 6026 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 5977
>emb|X53305.1| H.sapiens mRNA for stathmin
Length=1429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 408 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 359
>ref|XM_010355693.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana stathmin 1 (STMN1), mRNA
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variant X1, mRNA
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misc_RNA
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 424 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 375
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(LOC719733), mRNA
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human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
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Sbjct 1148 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 1099
>dbj|AB170228.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10916, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3, mRNA, RefSeq: NM_005563.3
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Sbjct 273 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 224
>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3,mRNA, RefSeq: NM_005563.3
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Sbjct 421 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 372
>ref|XM_010633450.1| PREDICTED: Fukomys damarensis stathmin 1 (Stmn1), mRNA
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Sbjct 387 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 338
>ref|XM_003934831.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis stathmin 1 (STMN1),
mRNA
Length=1530
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Query 1 TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 50
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Sbjct 517 TTTGTTCGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 468
>ref|XM_007935754.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 500 TTTGTTGGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 451
>ref|XM_007522565.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 496 TTTGTTTGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 447
>ref|XM_006924404.1| PREDICTED: Pteropus alecto stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1024
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Sbjct 463 TTTGTTGGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA 414
>ref|XM_006869319.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica stathmin-like (LOC102840741),
mRNA
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Sbjct 420 TTTATTGGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 371
>ref|XM_006862391.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 393 TTTATTGGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 344
>ref|XM_005317627.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus stathmin 1 (Stmn1),
mRNA
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Sbjct 494 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 445
>ref|XM_003471315.2| PREDICTED: Cavia porcellus stathmin 1 (Stmn1), mRNA
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Sbjct 464 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 415
>ref|XM_004850623.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber stathmin 1 (Stmn1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 465 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 416
>ref|XM_004850622.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber stathmin 1 (Stmn1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 474 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 425
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variant X2, mRNA
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Sbjct 463 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 414
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variant X1, mRNA
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Sbjct 474 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 425
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Sbjct 428 TTTGTTGGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 379
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X2, mRNA
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Sbjct 407 TTTGTTGGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 358
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12
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Sbjct 518 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCTATTTCACTGA 469
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Sbjct 475 TTTGTTGGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 426
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Sbjct 501 TTTGTTGGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 452
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Sbjct 392 TTTGTTGGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 343
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Sbjct 465 TTTGTTGGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGA 416
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mRNA
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>gb|AC023157.38| Homo sapiens 12 BAC RP11-467L13 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
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Sbjct 61970 TTTGTTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCTATTTCACTGA 62019
Lambda K H
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Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG
>ref|XM_001136848.4| PREDICTED: Pan troglodytes stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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>ref|XM_001137168.4| PREDICTED: Pan troglodytes stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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X3, mRNA
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X1, mRNA
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Sbjct 157 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 206
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 125 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 174
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X2, mRNA
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Sbjct 98 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 147
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X1, mRNA
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Sbjct 125 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 174
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Sbjct 263 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 312
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Sbjct 157 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 206
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Sbjct 217 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 266
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 260 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 309
>ref|XM_002802244.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 4
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 115 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 164
>ref|XM_002802243.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 3
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 99 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 148
>ref|XM_002802242.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 2
(LOC719733), mRNA
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Query 1 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 50
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Sbjct 51 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 100
>ref|XM_001114361.2| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 1
(LOC719733), mRNA
Length=1570
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Query 1 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 50
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Sbjct 124 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 173
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
Length=900
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Sbjct 46 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 95
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
Length=543
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 96
>dbj|AB170228.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10916, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3, mRNA, RefSeq: NM_005563.3
Length=1394
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 50
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Sbjct 47 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 96
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
Length=1069
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 99 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 148
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IMAGE:2822803), complete cds
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Sbjct 28 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 77
>dbj|AK092187.1| Homo sapiens cDNA FLJ34868 fis, clone NT2NE2014525, highly similar
to SCG10 PROTEIN
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>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
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Sbjct 47 AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG 96
>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
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complete sequence
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to Stathmin
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1 1 26227991 26231204 91M26231214F9m AAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTG
1 1 26227991 26231204 91M26231214F9m AAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTG
1 1 26227992 26231203 90M26231214F10m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGT
1 1 26227992 26231203 90M26231214F10m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTATCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGT
1 1 26227992 26231203 90M26231214F10m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGT
1 1 26227992 26231203 90M26231214F10m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGT
1 1 26227992 26231203 90M26231214F10m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGT
1 1 26227992 26231203 90M26231214F10m AACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGT
1 1 26227992 26231203 90M26231214F10m AACGTTCCGGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGT
1 1 26227993 26231202 89M26231214F11m ACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTG
1 1 26227993 26231202 89M26231214F11m ACGTTCCAGTTTGGGAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTG
1 1 26227993 26231202 89M26231214F11m ACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTG
1 1 26227994 26231201 88M26231214F12m CGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGC
1 1 26227994 26231201 88M26231214F12m CCTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGC
1 1 26227994 26231201 88M26231214F12m CGTTTCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTGTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGC
1 1 26227994 26231201 88M26231214F12m CGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGC
1 1 26227994 26231201 88M26231214F12m CGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGC
1 1 26227995 26231200 87M26231214F13m GTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCA
1 1 26227995 26231200 87M26231214F13m GTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCA
1 1 26227996 26231199 86M26231214F14m TTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAG
1 1 26227996 26231199 86M26231214F14m TTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAG
1 1 26227996 26231199 86M26231214F14m TTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAG
1 1 26227999 26231196 83M26231214F17m CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAAT
1 1 26227999 26231196 83M26231214F17m CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAAT
1 1 26227999 26231196 83M26231214F17m CAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAAT
1 1 26228000 26231195 82M26231214F18m AGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATA
1 1 26228000 26231195 82M26231214F18m AGTTTGGCAGCCATTTATGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATA
1 1 26228001 26231194 81M26231214F19m GTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATAC
1 1 26228002 26231193 80M26231214F20m TTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACA
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1 1 26228003 26231192 79M26231214F21m TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACAC
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1 1 26228003 26231192 79M26231214F21m TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACAC
1 1 26228003 26231192 79M26231214F21m TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACAC
1 1 26228003 26231192 79M26231214F21m TTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACAC
1 1 26228005 26231190 77M26231214F23m GGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTG
1 1 26228006 26231189 76M26231214F24m GCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGC
1 1 26228006 26231189 76M26231214F24m GCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGC
1 1 26228007 26231188 75M26231214F25m CAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCC
1 1 26228007 26231188 75M26231214F25m CAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCC
1 1 26228007 26231188 75M26231214F25m CAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCC
1 1 26228008 26231187 74M26231214F26m AGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCT
1 1 26228008 26231187 74M26231214F26m AGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCT
1 1 26228008 26231187 74M26231214F26m AGCCATTTGTGCCTCCCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTTCTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCT
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1 1 26228008 26231187 74M26231214F26m AGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCT
1 1 26228008 26231187 74M26231214F26m AGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCT
1 1 26228009 26231186 73M26231214F27m GCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTG
1 1 26228009 26231186 73M26231214F27m GCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTG
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1 1 26228010 26231185 72M26231214F28m CCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGT
1 1 26228010 26231185 72M26231214F28m CCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGT
1 1 26228012 26231183 70M26231214F30m ATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCG
1 1 26228013 26231182 69M26231214F31m TTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC
1 1 26228013 26231182 69M26231214F31m TTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC
1 1 26228013 26231182 69M26231214F31m TTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC
1 1 26228014 26231181 68M26231214F32m TTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTGAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATCCACTGCCTGTCGCT
1 1 26228014 26231181 68M26231214F32m TTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCT
1 1 26228015 26231180 67M26231214F33m TGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGTTTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTT
1 1 26228015 26231180 67M26231214F33m TGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTT
1 1 26228018 26231177 64M26231214F36m GCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTC
1 1 26228018 26231177 64M26231214F36m GCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTC
1 1 26228018 26231177 64M26231214F36m GCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTC
1 1 26228018 26231177 64M26231214F36m GCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTC
1 1 26228024 26231171 58M26231214F42m CGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTAT
1 1 26228024 26231171 58M26231214F42m CGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTAT
1 1 26228025 26231170 57M26231214F43m GGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCACTTGTCTTCTATT
1 1 26228025 26231170 57M26231214F43m GGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATT
1 1 26228026 26231169 56M26231214F44m GTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTC
1 1 26228026 26231169 56M26231214F44m GTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTC
1 1 26228031 26231164 51M26231214F49m CTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCAT
1 1 26228031 26231164 51M26231214F49m CTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCAT
1 1 26228032 26231163 50M26231214F50m TTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATG
1 1 26228034 26231161 48M26231214F52m TATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGC
1 1 26228037 26231158 45M26231214F55m TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTC
1 1 26228039 26231156 43M26231214F57m GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTGTTCTATTCACCATGGTTTCTT
1 1 26228039 26231156 43M26231214F57m GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTGTTCTATTCACCATGGTTTCTT
1 1 26228041 26231154 41M26231214F59m TTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCGCCATGGCTTCTTCT
1 1 26228046 26230299 36M26231214F60m850n4m TTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228046 26230299 36M26231214F60m850n4m TTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228050 26230295 32M26231214F60m850n8m GTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228050 26230295 32M26231214F60m850n8m GTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228075 26230270 7M26231214F60m850n33m TTACTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228078 26230267 4M26231214F60m850n36m CTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228078 26230267 4M26231214F60m850n36m CTGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228079 26230266 3M26231214F60m850n37m TGA AGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231221 26230271 68m850n32m CTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231218 26230268 65m850n35m ATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231215 26230265 62m850n38m CCATTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231212 26230262 59m850n41m GTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231208 26230258 55m850n45m ATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231205 26230255 52m850n48m GTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231202 26230252 49m850n51m CAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231199 26230249 46m850n54m AATACACTGCCTGTAGCTTGTCTTCTATTCACAATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231196 26230246 43m850n57m ACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231193 26230243 40m850n60m CTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26231178 26230228 25m850n75m CTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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HuRef SCAF_1103279188198, whole genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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blast search - nt
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variant X5, mRNA
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variant X4, mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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misc_RNA
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gene, encodes complete protein
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gene, encodes complete protein
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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Sbjct 403 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 354
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variant X1, mRNA
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X2, mRNA
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X1, mRNA
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(LOC101971306), misc_RNA
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Sbjct 498 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 449
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2 (STMN1), mRNA
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Sbjct 583 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 534
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Sbjct 498 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 449
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Sbjct 498 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 449
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1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 498 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 449
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Sbjct 631 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 582
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Sbjct 464 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 415
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Sbjct 719 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 670
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Sbjct 525 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 476
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Sbjct 525 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 476
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 585 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 536
>ref|XM_002802245.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 5
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 628 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 579
>ref|XM_002802244.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 4
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 483 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 434
>ref|XM_002802243.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 3
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 467 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 418
>ref|XM_002802242.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 2
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 419 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 370
>ref|XM_001114361.2| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 1
(LOC719733), mRNA
Length=1570
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Sbjct 492 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 443
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
Length=900
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Sbjct 414 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 365
>dbj|AB464250.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8233, Homo sapiens STMN1
gene for stathmin 1/oncoprotein 18, without stop codon, in
Flexi system
Length=464
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Sbjct 331 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 282
>dbj|AB451448.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, partial cds, clone: FLJ08188AAAF
Length=447
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Sbjct 322 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 273
>dbj|AB451319.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, complete cds, clone:
FLJ08188AAAN
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 322 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 273
>emb|CU687359.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
3' read STMN1 mRNA
Length=1239
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Sbjct 144 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 193
>emb|CU687358.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
5' read STMN1 mRNA
Length=1240
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 338 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 289
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
Length=543
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 415 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 366
>dbj|AB172668.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-19157, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
1, mRNA, RefSeq: NM_203401.1
Length=1727
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 1143 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 1094
>dbj|AB170228.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10916, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3, mRNA, RefSeq: NM_005563.3
Length=1394
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 415 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 366
>emb|AM392854.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002031 for hypothetical
protein (STMN1 gene)
Length=489
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 342 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 293
>gb|BC040585.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5269067, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2353
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 1311 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 1262
>gb|AY650331.1| Macaca fascicularis stathmin 1 mRNA, partial cds
Length=376
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 268 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 219
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
Length=1069
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 467 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 418
>gb|BC082228.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:99593
IMAGE:2822803), complete cds
Length=990
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 396 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 347
>gb|BC023313.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:4939590),
with apparent retained intron
Length=2121
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 1530 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 1481
>dbj|AK123488.1| Homo sapiens cDNA FLJ41494 fis, clone BRTHA2005013, moderately
similar to Homo sapiens leukemia-associated phosphoprotein
p18
Length=3441
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 2865 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 2816
>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
Length=1417
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 394 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 345
>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3,mRNA, RefSeq: NM_005563.3
Length=1025
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 416 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 367
>dbj|AB209282.1| Homo sapiens mRNA for stathmin 1 variant protein
Length=2936
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 2360 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 2311
>gb|DQ000556.1| Synthetic construct clone PSF:109100 leukemia-associated phosphoprotein
p18 gene, complete cds
Length=522
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 394 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 345
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
Length=83111
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 19056 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 19007
>dbj|AK129748.1| Homo sapiens cDNA FLJ26237 fis, clone CBR04649, highly similar
to Stathmin
Length=2820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 2244 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 2195
>gb|AY890476.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141266.01X stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, complete cds
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 322 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 273
>gb|AY892936.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141262.01L stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, partial cds
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 322 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 273
>ref|NM_203401.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 1, mRNA
Length=1730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 686 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 637
>ref|NM_203399.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 2, mRNA
Length=1518
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 474 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 425
>ref|NM_005563.3| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 3, mRNA
Length=1542
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 498 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 449
>emb|BX647885.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C18102 (from clone DKFZp686C18102)
Length=2972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 2374 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 2325
>emb|X94912.1| H.sapiens Pr22 gene
Length=16626
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 1286 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 1335
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 14601 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 14552
>emb|Z11566.1| H.sapiens mRNA for Pr22 protein
Length=1436
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Sbjct 413 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 364
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mRNA fragment
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Sbjct 425 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 376
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mRNA
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Sbjct 510 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 463
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Sbjct 606 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 559
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X1, mRNA
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Sbjct 523 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 476
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Sbjct 541 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 494
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X2, mRNA
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Sbjct 523 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 476
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X1, mRNA
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Sbjct 491 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 444
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misc_RNA
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Sbjct 401 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGT 354
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Sbjct 493 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 446
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Sbjct 456 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 409
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Sbjct 382 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 333
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mRNA
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Sbjct 489 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 440
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Sbjct 459 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 410
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variant X2, mRNA
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Sbjct 460 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 411
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variant X1, mRNA
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Sbjct 469 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 420
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variant X2, mRNA
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Sbjct 458 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 409
>ref|XM_004881071.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber stathmin 1 (Stmn1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 469 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 420
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Sbjct 686 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 639
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Sbjct 421 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 374
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X2, mRNA
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Sbjct 400 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 353
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X1, misc_RNA
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Sbjct 400 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 353
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Sbjct 489 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAATTG 442
>ref|XM_006869319.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica stathmin-like (LOC102840741),
mRNA
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Sbjct 413 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 366
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Sbjct 386 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 339
>ref|XM_005607328.1| PREDICTED: Equus caballus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 488 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 441
>ref|XM_001504114.4| PREDICTED: Equus caballus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1039
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Sbjct 464 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 417
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variant X2, mRNA
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Sbjct 468 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 421
>ref|XM_004678638.1| PREDICTED: Condylura cristata stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 494 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 447
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Sbjct 385 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 338
>ref|XM_004603460.1| PREDICTED: Sorex araneus stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1031
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Query 3 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 458 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 411
>ref|XM_004377093.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris stathmin 1 (STMN1),
mRNA
Length=1526
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Query 3 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 482 GCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTG 435
>ref|XR_257791.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus stathmin 1 pseudogene
(LOC101962578), misc_RNA
Length=562
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Query 4 CTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGT 48
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Sbjct 406 CTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGT 362
>ref|XM_008565954.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1074
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Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
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Sbjct 496 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCCTCCGCCATTTTACTAAAGTTG 447
>ref|NG_030122.2| Homo sapiens stathmin 1 pseudogene 1 (STMN1P1) on chromosome
12
Length=835
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Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAG 47
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Sbjct 513 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCTATTTCACTGAAG 467
>ref|XM_004647851.1| PREDICTED: Octodon degus stathmin-like (LOC101584547), mRNA
Length=471
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTG 50
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 337 TAGTTTCCATCTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTTAAGTTG 288
>gb|AC023157.38| Homo sapiens 12 BAC RP11-467L13 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=122351
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Query 1 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAG 47
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Sbjct 61975 TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCTATTTCACTGAAG 62021
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT
>ref|XM_010355693.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1002
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 207
>ref|XM_010355448.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana stathmin (LOC104655902), mRNA
Length=1004
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
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Sbjct 63 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 112
>ref|XM_001136848.4| PREDICTED: Pan troglodytes stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1195
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
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Sbjct 246 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 295
>ref|XM_001137168.4| PREDICTED: Pan troglodytes stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1112
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
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Sbjct 163 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 212
>ref|XM_009202178.1| PREDICTED: Papio anubis stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X3, mRNA
Length=1315
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
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Sbjct 376 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 425
>ref|XM_003891365.2| PREDICTED: Papio anubis stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1150
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Sbjct 223 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 272
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Sbjct 105 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 154
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Sbjct 57 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 106
>ref|XM_001114361.2| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 1
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Sbjct 130 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 179
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
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Sbjct 52 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 101
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
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Sbjct 53 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 102
>dbj|AB170228.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10916, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3, mRNA, RefSeq: NM_005563.3
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Sbjct 53 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 102
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
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Sbjct 105 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 154
>gb|BC082228.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:99593
IMAGE:2822803), complete cds
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Sbjct 34 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 83
>dbj|AK092187.1| Homo sapiens cDNA FLJ34868 fis, clone NT2NE2014525, highly similar
to SCG10 PROTEIN
Length=1810
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Sbjct 53 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 102
>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
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Sbjct 53 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 102
>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3,mRNA, RefSeq: NM_005563.3
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Sbjct 54 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 103
>dbj|AB209282.1| Homo sapiens mRNA for stathmin 1 variant protein
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Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
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Sbjct 40 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 89
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
Length=83111
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Sbjct 15886 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 15935
>dbj|AK129748.1| Homo sapiens cDNA FLJ26237 fis, clone CBR04649, highly similar
to Stathmin
Length=2820
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Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
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Sbjct 1882 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 1931
>ref|NM_203401.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 1, mRNA
Length=1730
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Sbjct 324 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 373
>ref|NM_203399.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 2, mRNA
Length=1518
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Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
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Sbjct 112 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 161
>ref|NM_005563.3| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 3, mRNA
Length=1542
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
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Sbjct 136 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 185
>emb|BX647885.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C18102 (from clone DKFZp686C18102)
Length=2972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 54 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 103
>emb|X94912.1| H.sapiens Pr22 gene
Length=16626
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4456 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 4407
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11458 TTGTGCAGAATACACTGCCTATCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 11507
>emb|Z11566.1| H.sapiens mRNA for Pr22 protein
Length=1436
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 100
>gb|J04991.1|HUMP18 Human p18 protein mRNA, complete cds
Length=1450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 112
>gb|M31303.1|HUMOP18A Human oncoprotein 18 (Op18) gene, complete cds
Length=8058
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2851 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 2900
>emb|X53305.1| H.sapiens mRNA for stathmin
Length=1429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
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Sbjct 41 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 90
>ref|XM_003775768.2| PREDICTED: Pongo abelii stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1556
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 164 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTGTTCACCATGGCTTCT 213
>dbj|D28428.1|HUMS87 Homo sapiens mRNA for stathmin, 5'UTR region
Length=99
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCT 99
>ref|XM_004092225.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=812
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 50
||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136 TTGCGCAGAATACACTGCCCGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT 185
>ref|XM_004092224.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
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1 1 26231196 26230246 57m850n43m ACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231193 26230243 60m850n40m CTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231190 26230240 63m850n37m CCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231187 26230237 66m850n34m GTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231184 26230234 69m850n31m GCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231181 26230231 72m850n28m TGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26231175 26230225 78m850n22m CTATTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231172 26230222 81m850n19m TTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATTCTCAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231169 26230219 84m850n16m AACATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATTCTCAGCCCTCGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26231163 26230213 90m850n10m GCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATTCTCAGCCCTCGGTCAAAAGAATCT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26231157 26230132 96m925n4m TGAGAATCTGTTCCAGAATTCCCCCTTTCCCCTCCAAAGAAGAAGGATCTTTCCCTGGAGGAAATTCAGAAGAAATTAGAAGCTGCAGAAGAAAGA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231154 26228171 1m1958n98m925n1m G||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231150 26230200 99m850n1m GCCAGGTGAAAGGACCGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATTCTCAGCCCTCGGTCAAAAGAATCTGTTCCAGAATTCCCCCTTTCCC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231143 26231043 100m TATTTGGAAAATCTGAAATTGTAATGGGCTTATGATTTTAGATTGAGATGGCTCAGGTCTTCGCCTTTGATTTGGCACTTATGTTTTGGTCTTACCAAAA
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>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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HSCHR1_CTG3
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assembly
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genome shotgun sequence
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Query 1 TCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGGTAGGTAATCTATTTGGAAAATCT 50
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC
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variant X6, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 516 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 467
>ref|XR_620727.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin pseudogene (LOC103793637),
misc_RNA
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Sbjct 381 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 332
>gb|KJ897121.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06515 STMN1
gene, encodes complete protein
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variant X3, mRNA
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Sbjct 460 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 411
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Sbjct 397 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 348
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variant X1, mRNA
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Sbjct 460 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 411
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Sbjct 492 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 443
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Sbjct 492 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 443
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Sbjct 492 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 443
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Sbjct 492 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 443
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Sbjct 625 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 576
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Sbjct 458 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 409
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Sbjct 713 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 664
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 519 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 470
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 519 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 470
>ref|XM_002802246.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 6
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 579 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 530
>ref|XM_002802245.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 5
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 622 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 573
>ref|XM_002802244.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 4
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 477 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 428
>ref|XM_002802243.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 3
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 461 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 412
>ref|XM_002802242.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 2
(LOC719733), mRNA
Length=1497
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Sbjct 413 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 364
>ref|XM_001114361.2| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 1
(LOC719733), mRNA
Length=1570
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Sbjct 486 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 437
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
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Sbjct 408 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 359
>dbj|AB464250.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8233, Homo sapiens STMN1
gene for stathmin 1/oncoprotein 18, without stop codon, in
Flexi system
Length=464
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Sbjct 325 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 276
>dbj|AB451448.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, partial cds, clone: FLJ08188AAAF
Length=447
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Sbjct 316 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 267
>dbj|AB451319.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, complete cds, clone:
FLJ08188AAAN
Length=450
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 316 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 267
>emb|CU687359.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
3' read STMN1 mRNA
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Sbjct 150 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 199
>emb|CU687358.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
5' read STMN1 mRNA
Length=1240
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Sbjct 332 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 283
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
Length=543
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 409 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 360
>dbj|AB172668.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-19157, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
1, mRNA, RefSeq: NM_203401.1
Length=1727
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Sbjct 1137 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 1088
>dbj|AB170228.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10916, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3, mRNA, RefSeq: NM_005563.3
Length=1394
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 409 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 360
>emb|AM392854.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002031 for hypothetical
protein (STMN1 gene)
Length=489
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 336 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 287
>gb|BC040585.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5269067, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2353
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 1305 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 1256
>gb|AY650331.1| Macaca fascicularis stathmin 1 mRNA, partial cds
Length=376
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Sbjct 262 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 213
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
Length=1069
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 461 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 412
>gb|BC082228.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:99593
IMAGE:2822803), complete cds
Length=990
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 390 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 341
>gb|BC023313.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:4939590),
with apparent retained intron
Length=2121
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 1524 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 1475
>dbj|AK123488.1| Homo sapiens cDNA FLJ41494 fis, clone BRTHA2005013, moderately
similar to Homo sapiens leukemia-associated phosphoprotein
p18
Length=3441
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 2859 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 2810
>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
Length=1417
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 388 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 339
>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3,mRNA, RefSeq: NM_005563.3
Length=1025
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 410 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 361
>dbj|AB209282.1| Homo sapiens mRNA for stathmin 1 variant protein
Length=2936
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 2354 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 2305
>gb|DQ000556.1| Synthetic construct clone PSF:109100 leukemia-associated phosphoprotein
p18 gene, complete cds
Length=522
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 388 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 339
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
Length=83111
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 19050 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 19001
>dbj|AK129748.1| Homo sapiens cDNA FLJ26237 fis, clone CBR04649, highly similar
to Stathmin
Length=2820
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 2238 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 2189
>gb|AY890476.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141266.01X stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, complete cds
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 316 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 267
>gb|AY892936.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141262.01L stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, partial cds
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 316 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 267
>ref|NM_203401.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 1, mRNA
Length=1730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 680 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 631
>ref|NM_203399.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 2, mRNA
Length=1518
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 468 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 419
>ref|NM_005563.3| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 3, mRNA
Length=1542
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 492 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 443
>emb|BX647885.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C18102 (from clone DKFZp686C18102)
Length=2972
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 2368 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 2319
>emb|X94912.1| H.sapiens Pr22 gene
Length=16626
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 1292 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 1341
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 14595 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 14546
>emb|Z11566.1| H.sapiens mRNA for Pr22 protein
Length=1436
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 407 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 358
>gb|J04991.1|HUMP18 Human p18 protein mRNA, complete cds
Length=1450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 419 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 370
>gb|M31303.1|HUMOP18A Human oncoprotein 18 (Op18) gene, complete cds
Length=8058
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 6015 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 5966
>emb|X53305.1| H.sapiens mRNA for stathmin
Length=1429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 397 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 348
>ref|XM_006924404.1| PREDICTED: Pteropus alecto stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1024
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTT 49
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Sbjct 452 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTT 404
>ref|XR_258089.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus stathmin 1 pseudogene
(LOC101971306), misc_RNA
Length=523
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTT 49
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Sbjct 389 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTT 341
>ref|XR_622049.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin pseudogene (LOC100895085),
misc_RNA
Length=1072
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 395 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTCGTTGTTC 346
>ref|XM_007459133.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X2, mRNA
Length=1509
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 50
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Sbjct 489 CCATTTTGTGGGTCAGCTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 440
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mRNA
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Sbjct 460 CCATTTTGTGGGTCAGCTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 411
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Sbjct 467 CCATTTTGTGGGTCAGCTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTC 418
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mRNA
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(LOC103097557), ncRNA
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Sbjct 324 CCATTTTGTGGGTCAGTTTTTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTT 276
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Sbjct 407 CCATTTTGTGGGTCAGTTTTTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTT 359
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mRNA fragment
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Sbjct 958 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGT 1002
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Sbjct 485 CCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAATTGTTATTC 436
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Sbjct 331 CCATCTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTTAAGTTGTTGTTC 282
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1 1 26228089 26230233 4M26231180F26m850n70m GTTC TCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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50 |
--------> <-------- |
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left flanking sequence - TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT
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assembly
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genome shotgun sequence
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Sbjct 26341316 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 26341365
>ref|NW_004929289.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 646840 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 646889
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 24484004 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 24484053
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shotgun sequence
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Sbjct 463296 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 463247
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 22559788 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 22559837
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shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188234, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Lambda K H
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 23866077 TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGGTAGGTAATCT 23866126
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shotgun sequence
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Sbjct 25649215 TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGGTAGGTAATCT 25649166
>ref|NW_001838576.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188234, whole genome shotgun sequence
gb|DS486182.1| Homo sapiens SCAF_1103279188234 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGGTAGGTAATCT 50
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Sbjct 131934 TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGGTAGGTAATCT 131885
>gb|CH471059.2| Homo sapiens 211000035844098 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 488130 TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGGTAGGTAATCT 488081
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000462.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 24487112 TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGGTAGGTAATCT 24487063
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Sbjct 24627272 TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGGTAGGTAATCT 24627223
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT
>ref|XM_003934831.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis stathmin 1 (STMN1),
mRNA
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Sbjct 498 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 449
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Sbjct 506 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 457
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Sbjct 411 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 362
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Sbjct 594 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 545
>ref|XM_001137168.4| PREDICTED: Pan troglodytes stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 511 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 462
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Sbjct 512 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 463
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X3, mRNA
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>ref|XM_003891362.2| PREDICTED: Papio anubis stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 506 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 457
>ref|XR_615139.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin pseudogene (LOC100404965),
misc_RNA
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>ref|XM_003809472.2| PREDICTED: Pan paniscus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X3, mRNA
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Sbjct 529 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 480
>ref|XM_003809470.2| PREDICTED: Pan paniscus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 511 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 462
>ref|XM_008961690.1| PREDICTED: Pan paniscus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 479 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 430
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variant X6, mRNA
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 415 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 366
>ref|XM_009000684.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X5, mRNA
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 564 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 515
>ref|XM_009000683.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 432 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 383
>ref|XM_009000682.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 721 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 672
>ref|XM_009000681.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 679 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 630
>ref|XM_003733374.2| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1537
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 508 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 459
>ref|XR_620727.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin pseudogene (LOC103793637),
misc_RNA
Length=674
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 373 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 324
>gb|KJ897121.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06515 STMN1
gene, encodes complete protein
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Sbjct 373 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 324
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variant X3, mRNA
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Sbjct 452 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 403
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variant X2, mRNA
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Sbjct 389 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 340
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variant X1, mRNA
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Sbjct 479 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 430
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Sbjct 481 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 432
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Sbjct 484 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 435
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Sbjct 452 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 403
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Sbjct 479 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 430
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Sbjct 484 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 435
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Sbjct 484 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 435
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2 (STMN1), mRNA
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Sbjct 569 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 520
>ref|XM_004092223.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 484 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 435
>ref|XM_004092222.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 484 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 435
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1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 484 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 435
>ref|XM_004025212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 617 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 568
>ref|XM_004025211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 450 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 401
>ref|XM_004025210.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 705 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 656
>ref|XM_004025209.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 511 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 462
>ref|XM_004025208.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 511 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 462
>ref|XM_002802246.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 6
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 571 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 522
>ref|XM_002802245.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 5
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 614 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 565
>ref|XM_002802244.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 4
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 469 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 420
>ref|XM_002802243.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 3
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 453 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 404
>ref|XM_002802242.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 2
(LOC719733), mRNA
Length=1497
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Sbjct 405 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 356
>ref|XM_001114361.2| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 1
(LOC719733), mRNA
Length=1570
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Sbjct 478 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 429
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
Length=900
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 400 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 351
>dbj|AB464250.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8233, Homo sapiens STMN1
gene for stathmin 1/oncoprotein 18, without stop codon, in
Flexi system
Length=464
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 317 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 268
>dbj|AB451448.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, partial cds, clone: FLJ08188AAAF
Length=447
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 308 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 259
>dbj|AB451319.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, complete cds, clone:
FLJ08188AAAN
Length=450
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 308 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 259
>emb|CU687359.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
3' read STMN1 mRNA
Length=1239
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 158 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 207
>emb|CU687358.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
5' read STMN1 mRNA
Length=1240
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 324 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 275
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
Length=543
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 401 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 352
>dbj|AB172668.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-19157, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
1, mRNA, RefSeq: NM_203401.1
Length=1727
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 1129 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 1080
>dbj|AB170228.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10916, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3, mRNA, RefSeq: NM_005563.3
Length=1394
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 401 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 352
>emb|AM392854.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002031 for hypothetical
protein (STMN1 gene)
Length=489
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 328 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 279
>gb|BC040585.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5269067, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2353
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 1297 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 1248
>gb|AY650331.1| Macaca fascicularis stathmin 1 mRNA, partial cds
Length=376
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 254 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 205
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
Length=1069
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 453 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 404
>gb|BC082228.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:99593
IMAGE:2822803), complete cds
Length=990
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 382 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 333
>gb|BC023313.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:4939590),
with apparent retained intron
Length=2121
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 1467
>dbj|AK123488.1| Homo sapiens cDNA FLJ41494 fis, clone BRTHA2005013, moderately
similar to Homo sapiens leukemia-associated phosphoprotein
p18
Length=3441
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2851 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 2802
>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
Length=1417
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 380 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 331
>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3,mRNA, RefSeq: NM_005563.3
Length=1025
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 402 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 353
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Sbjct 2346 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 2297
>gb|DQ000556.1| Synthetic construct clone PSF:109100 leukemia-associated phosphoprotein
p18 gene, complete cds
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Sbjct 380 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 331
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
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Sbjct 19042 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 18993
>dbj|AK129748.1| Homo sapiens cDNA FLJ26237 fis, clone CBR04649, highly similar
to Stathmin
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Sbjct 2230 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 2181
>gb|AY890476.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141266.01X stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, complete cds
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Sbjct 308 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 259
>gb|AY892936.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141262.01L stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, partial cds
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Sbjct 308 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 259
>ref|NM_203401.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 672 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 623
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Sbjct 460 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 411
>ref|NM_005563.3| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 484 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 435
>emb|BX647885.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C18102 (from clone DKFZp686C18102)
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Sbjct 2360 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 2311
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Sbjct 14587 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 14538
>emb|Z11566.1| H.sapiens mRNA for Pr22 protein
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Sbjct 399 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 350
>gb|J04991.1|HUMP18 Human p18 protein mRNA, complete cds
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Sbjct 411 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 362
>gb|M31303.1|HUMOP18A Human oncoprotein 18 (Op18) gene, complete cds
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Sbjct 6007 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 5958
>emb|X53305.1| H.sapiens mRNA for stathmin
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Sbjct 389 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 340
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Sbjct 674 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 625
>ref|XM_003415403.2| PREDICTED: Loxodonta africana stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 409 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 360
>ref|XM_010633450.1| PREDICTED: Fukomys damarensis stathmin 1 (Stmn1), mRNA
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Sbjct 368 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 319
>ref|XM_008529055.1| PREDICTED: Equus przewalskii stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 388 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 339
>ref|XR_546285.1| PREDICTED: Equus przewalskii stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, misc_RNA
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Sbjct 388 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 339
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mRNA
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Sbjct 401 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 352
>ref|XM_006862391.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 374 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 325
>ref|XM_005607328.1| PREDICTED: Equus caballus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 476 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 427
>ref|XM_001504114.4| PREDICTED: Equus caballus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 452 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 403
>ref|XR_258089.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus stathmin 1 pseudogene
(LOC101971306), misc_RNA
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Sbjct 381 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTTTCTTCTAT 332
>ref|XM_003471315.2| PREDICTED: Cavia porcellus stathmin 1 (Stmn1), mRNA
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Sbjct 445 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 396
>ref|XM_004850623.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber stathmin 1 (Stmn1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 446 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 397
>ref|XM_004850622.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber stathmin 1 (Stmn1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 455 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 406
>ref|XM_004881072.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber stathmin 1 (Stmn1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 444 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 395
>ref|XM_004881071.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber stathmin 1 (Stmn1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 455 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 406
>ref|XM_004678639.1| PREDICTED: Condylura cristata stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 456 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 407
>ref|XM_004678638.1| PREDICTED: Condylura cristata stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1530
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Sbjct 482 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 433
>ref|XM_004603895.1| PREDICTED: Sorex araneus stathmin-like (LOC101543880), mRNA
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Sbjct 373 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 324
>ref|XM_004603460.1| PREDICTED: Sorex araneus stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1031
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Sbjct 446 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 397
>ref|XM_004377093.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris stathmin 1 (STMN1),
mRNA
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Sbjct 470 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 421
>ref|XM_003799784.1| PREDICTED: Otolemur garnettii stathmin 1, transcript variant
5 (STMN1), mRNA
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Sbjct 477 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 428
>ref|XM_003799783.1| PREDICTED: Otolemur garnettii stathmin 1, transcript variant
4 (STMN1), mRNA
Length=1492
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 379 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 330
>ref|XM_003799782.1| PREDICTED: Otolemur garnettii stathmin 1, transcript variant
3 (STMN1), mRNA
Length=1528
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 415 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 366
>ref|XM_003799781.1| PREDICTED: Otolemur garnettii stathmin 1, transcript variant
2 (STMN1), mRNA
Length=1523
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 410 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 361
>ref|XM_003799780.1| PREDICTED: Otolemur garnettii stathmin 1, transcript variant
1 (STMN1), mRNA
Length=1598
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 485 TGGGTCAGTTTCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 436
>ref|XR_622049.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin pseudogene (LOC100895085),
misc_RNA
Length=1072
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCT 48
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Sbjct 387 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTCGTTGTTCTCTTCT 340
>ref|XM_008148058.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1529
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTC 47
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Sbjct 479 TGGGTCAGTTTCTCCTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTC 433
>ref|XM_007522565.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1060
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 477 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAATTGTTATTCTCTTCTAT 428
>ref|XM_007459133.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X2, mRNA
Length=1509
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT 50
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Sbjct 459 TGGGTCAGCTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCCTCTAT 410
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variant X1, mRNA
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mRNA
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variant 1, mRNA
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mRNA
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mRNA
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(LOC103097557), ncRNA
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X1, mRNA
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3 (STMN1), mRNA
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>ref|XM_004321702.1| PREDICTED: Tursiops truncatus stathmin 1, transcript variant
2 (STMN1), mRNA
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1 1 26227575 26228078 3M403N97M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTCTCGCAAACGTTCCAGTTTGGCAGCCATTTGTGCCTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTA
1 1 26227577 26231153 1M463N60M26231193F39m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG
1 1 26227702 26227802 100M TG
1 1 26227721 26227821 100M TGCAATTATGCTGGGAATTAC
1 1 26227729 26227829 100M TGCAATTATGCTGGGAATTACTGAATATT
1 1 26227743 26227843 100M TGCAATTATGCTGGGAATTACTGAATATTCCATCTTAAAATAT
1 1 26227746 26227846 100M TGCAATTATGCTGGGAATTACTGAATATTCCATCTTAAAATATACC
1 1 26227760 26227860 100M TGCAATTATGCTGGGAATTACTGAATATTCCATCTTAAAATATACCTTTCATTTAATATG
1 1 26227775 26227875 100M TGCAATTATGCTGGGAATTACTGAATATTCCATCTTAAAATATACCTTTCATTTAATATGTTAAGCCCCAAAATG
1 1 26227803 26227903 100M AATTATGCTGGGAATTACTGAATATTCCATCTTAAAATATACCTTTCATTTAATATGTTAAGCCCCAAAATGGATGACAAAAAGACACCAAACACCTTTT
1 1 26227845 26227945 100M CTTTCATTTAATAGGTTAAGCCCCAAAATGGATGACAAAAAGACACCAAACACCTTTTATCAAAGCACTTAGTTCAAGCCAACTCATTGGTGCATCAAAC
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1 1 26228020 26231173 81M26231193F19m CTCTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT TGCCTGTCGCTTGTCTTCT
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1 1 26228027 26231166 74M26231193F26m TTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACC
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1 1 26228034 26231159 67M26231193F33m TATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTT
1 1 26228034 26231159 67M26231193F33m TATCAGCTACCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTT
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1 1 26228036 26231157 65M26231193F35m TTAGCTTTCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT GGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCT
1 1 26228037 26231156 64M26231193F36m TAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTT
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1 1 26228054 26230289 47M26231193F39m850n14m GTCATTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAC TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228054 26230289 47M26231193F39m850n14m GTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228063 26230280 38M26231193F39m850n23m TCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228068 26230275 33M26231193F39m850n28m TGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTAT TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228081 26230262 20M26231193F39m850n41m AAGTTGTTGTTCTCTTCTAT TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26228093 26230250 8M26231193F39m850n53m TCTTCTAT TGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231200 26230250 47m850n53m GAATACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231197 26230247 44m850n56m TACACTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231194 26230244 41m850n59m CCTGCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231191 26230241 38m850n62m GCCTGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231188 26230238 35m850n65m TGTCGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231185 26230160 68m925n32m CGCTTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGAATCTGTTCCAGAATTTCCCCTTTCCCCTCCAAAGA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231182 26230232 71m850n29m TTGTCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231179 26230229 74m850n26m TCTTCTATTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231176 26230226 77m850n23m TCTATTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231173 26230223 80m850n20m ATTCACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATTCTCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231170 26230220 83m850n17m CACCATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATTCTCAGCCCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231167 26230217 86m850n14m CATGGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATTCTCAGCCCTCGGTCAA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231164 26230214 89m850n11m GGCTTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATTCTCAGCCCTCGGTCAAAAGAAT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 26231161 26230211 92m850n8m TTCTTCTGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATTCTCAGCCCTCGGTCAAAAGAATCTGTTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 26231155 26230205 98m850n2m TGATATCCAGGTGAAAGAACTGGAGAAGCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATTCTCAGCCCTCGGTCAAAAGAATCTGTTCCAGAATTCCCCC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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blast search - nt
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misc_RNA
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>gb|KJ897121.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06515 STMN1
gene, encodes complete protein
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 559 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 510
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Sbjct 607 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 558
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Sbjct 440 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 391
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Sbjct 695 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 646
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Sbjct 501 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 452
>ref|XM_004025208.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 561 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 512
>ref|XM_002802245.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 5
(LOC719733), mRNA
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>ref|XM_002802244.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 4
(LOC719733), mRNA
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>ref|XM_002802243.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 3
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 443 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 394
>ref|XM_002802242.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 2
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 395 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 346
>ref|XM_001114361.2| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 1
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Sbjct 468 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 419
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
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Sbjct 390 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 341
>dbj|AB464250.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8233, Homo sapiens STMN1
gene for stathmin 1/oncoprotein 18, without stop codon, in
Flexi system
Length=464
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 50
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Sbjct 307 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 258
>dbj|AB451448.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, partial cds, clone: FLJ08188AAAF
Length=447
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 298 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 249
>dbj|AB451319.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, complete cds, clone:
FLJ08188AAAN
Length=450
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 298 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 249
>emb|CU687359.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
3' read STMN1 mRNA
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Sbjct 168 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 217
>emb|CU687358.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
5' read STMN1 mRNA
Length=1240
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Sbjct 314 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 265
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
Length=543
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 391 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 342
>dbj|AB172668.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-19157, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
1, mRNA, RefSeq: NM_203401.1
Length=1727
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Sbjct 1119 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 1070
>dbj|AB170228.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10916, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3, mRNA, RefSeq: NM_005563.3
Length=1394
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Sbjct 391 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 342
>emb|AM392854.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002031 for hypothetical
protein (STMN1 gene)
Length=489
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Sbjct 318 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 269
>gb|BC040585.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5269067, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2353
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Sbjct 1287 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 1238
>gb|AY650331.1| Macaca fascicularis stathmin 1 mRNA, partial cds
Length=376
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Sbjct 244 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 195
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
Length=1069
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Sbjct 443 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 394
>gb|BC082228.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:99593
IMAGE:2822803), complete cds
Length=990
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Sbjct 372 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 323
>gb|BC023313.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:4939590),
with apparent retained intron
Length=2121
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Sbjct 1506 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 1457
>dbj|AK123488.1| Homo sapiens cDNA FLJ41494 fis, clone BRTHA2005013, moderately
similar to Homo sapiens leukemia-associated phosphoprotein
p18
Length=3441
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Sbjct 2841 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 2792
>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
Length=1417
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 370 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 321
>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3,mRNA, RefSeq: NM_005563.3
Length=1025
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 50
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Sbjct 392 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 343
>dbj|AB209282.1| Homo sapiens mRNA for stathmin 1 variant protein
Length=2936
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 50
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Sbjct 2336 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 2287
>gb|DQ000556.1| Synthetic construct clone PSF:109100 leukemia-associated phosphoprotein
p18 gene, complete cds
Length=522
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 50
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Sbjct 370 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 321
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
Length=83111
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 19032 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 18983
>dbj|AK129748.1| Homo sapiens cDNA FLJ26237 fis, clone CBR04649, highly similar
to Stathmin
Length=2820
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 2220 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 2171
>gb|AY890476.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141266.01X stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, complete cds
Length=450
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Sbjct 298 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 249
>gb|AY892936.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141262.01L stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, partial cds
Length=450
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Query 1 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 50
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Sbjct 298 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 249
>ref|NM_203401.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 1, mRNA
Length=1730
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Sbjct 662 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 613
>ref|NM_203399.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 2, mRNA
Length=1518
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Sbjct 450 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 401
>ref|NM_005563.3| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 3, mRNA
Length=1542
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Sbjct 474 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 425
>emb|BX647885.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C18102 (from clone DKFZp686C18102)
Length=2972
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Sbjct 2350 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 2301
>emb|X94912.1| H.sapiens Pr22 gene
Length=16626
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 1310 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 1359
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Query 1 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 50
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Sbjct 14577 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 14528
>emb|Z11566.1| H.sapiens mRNA for Pr22 protein
Length=1436
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Sbjct 389 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 340
>gb|J04991.1|HUMP18 Human p18 protein mRNA, complete cds
Length=1450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 401 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 352
>gb|M31303.1|HUMOP18A Human oncoprotein 18 (Op18) gene, complete cds
Length=8058
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Sbjct 5997 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 5948
>emb|X53305.1| H.sapiens mRNA for stathmin
Length=1429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 379 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 330
>ref|XM_010597770.1| PREDICTED: Loxodonta africana stathmin-like (LOC100658330), mRNA
Length=1257
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Sbjct 664 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGA 615
>ref|XM_003415403.2| PREDICTED: Loxodonta africana stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1010
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 399 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGA 350
>ref|XM_008529055.1| PREDICTED: Equus przewalskii stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
Length=970
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Sbjct 378 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGA 329
>ref|XR_546285.1| PREDICTED: Equus przewalskii stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, misc_RNA
Length=978
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Sbjct 378 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGA 329
>ref|XM_007935754.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1541
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Sbjct 471 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATGGCTTTCTGA 422
>ref|XM_006869319.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica stathmin-like (LOC102840741),
mRNA
Length=977
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Sbjct 391 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGA 342
>ref|XM_006862391.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=516
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Sbjct 364 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGA 315
>ref|XM_005607328.1| PREDICTED: Equus caballus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1063
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Sbjct 466 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGA 417
>ref|XM_001504114.4| PREDICTED: Equus caballus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1039
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Query 1 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 50
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Sbjct 442 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGA 393
>ref|XR_258089.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus stathmin 1 pseudogene
(LOC101971306), misc_RNA
Length=523
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 50
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Sbjct 371 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTTTCTTCTATTGCTTTCTGA 322
>ref|XM_004450518.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant 2, mRNA
Length=967
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGA 50
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Sbjct 375 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGA 326
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variant 1, mRNA
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mRNA
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4 (STMN1), mRNA
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2 (STMN1), mRNA
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1 (STMN1), mRNA
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X3, mRNA
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Sbjct 423 TCTCCTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCGATTGCTTTCTGA 374
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X1, mRNA
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Sbjct 435 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGA 386
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Sbjct 436 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGA 387
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variant X1, mRNA
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variant X2, mRNA
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Sbjct 434 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGA 385
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variant X1, mRNA
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Sbjct 445 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGA 396
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variant X2, mRNA
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Sbjct 446 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGA 397
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variant X1, mRNA
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Sbjct 472 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGA 423
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Sbjct 363 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATCGCTTTCTGA 314
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Sbjct 436 TCTCTTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATCGCTTTCTGA 387
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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right flanking sequence - TCAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC
>ref|XM_001136848.4| PREDICTED: Pan troglodytes stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 222 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 270
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X1, mRNA
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Sbjct 139 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 187
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Sbjct 140 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 188
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Sbjct 157 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 205
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X2, mRNA
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Sbjct 139 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 187
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X1, mRNA
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Sbjct 107 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 155
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Sbjct 112 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 160
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Sbjct 333 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 381
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Sbjct 139 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 187
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Sbjct 139 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 187
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
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Sbjct 28 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 76
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
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Sbjct 29 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 77
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
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Sbjct 81 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 129
>gb|BC082228.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:99593
IMAGE:2822803), complete cds
Length=990
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Query 2 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 50
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Sbjct 10 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 58
>dbj|AK092187.1| Homo sapiens cDNA FLJ34868 fis, clone NT2NE2014525, highly similar
to SCG10 PROTEIN
Length=1810
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Query 2 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 50
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Sbjct 29 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 77
>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
Length=1417
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 2 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 50
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Sbjct 29 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 77
>dbj|AB209282.1| Homo sapiens mRNA for stathmin 1 variant protein
Length=2936
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Strand=Plus/Plus
Query 2 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 50
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Sbjct 16 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 64
>dbj|AK129748.1| Homo sapiens cDNA FLJ26237 fis, clone CBR04649, highly similar
to Stathmin
Length=2820
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 2 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 50
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Sbjct 1858 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 1906
>dbj|D28428.1|HUMS87 Homo sapiens mRNA for stathmin, 5'UTR region
Length=99
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 2 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 50
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Sbjct 29 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 77
>ref|NM_203401.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 1, mRNA
Length=1730
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 2 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 50
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Sbjct 300 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 348
>ref|NM_005563.3| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 112 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 160
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Sbjct 30 CAGGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 78
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variant X2, mRNA
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Sbjct 16 TCAGGGCTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 65
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X1, mRNA
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variant X1, mRNA
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X1, mRNA
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Sbjct 107 CAGGGCTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 155
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 33 CAGGGCTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 81
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 106 CAGGGCTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 154
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human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3, mRNA, RefSeq: NM_005563.3
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>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3,mRNA, RefSeq: NM_005563.3
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Sbjct 30 CAGGGCTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 78
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variant X3, mRNA
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>ref|XM_005544377.1| PREDICTED: Macaca fascicularis Stathmin (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 81 AGGGCTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 128
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(LOC719733), mRNA
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X3, mRNA
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(LOC719733), mRNA
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Query 7 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGC 50
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>ref|NW_001838576.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188234, whole genome shotgun sequence
gb|DS486182.1| Homo sapiens SCAF_1103279188234 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 128807 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 128856
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sequence
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 485003 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 485052
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shotgun sequence
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Sbjct 24483985 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 24484034
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Lambda K H
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right flanking sequence - GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG
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HSCHR1_CTG3
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assembly
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Sbjct 25318751 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 25318702
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genome shotgun sequence
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Sbjct 26344494 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 26344445
>ref|NW_004929289.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 460118 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 460167
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Sbjct 23866040 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 23866089
>gb|DS990820.1| Homo sapiens SCAF_1112675837179 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 131969 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 131920
>gb|CH003448.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 25649252 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 25649203
>ref|NW_001838576.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188234, whole genome shotgun sequence
gb|DS486182.1| Homo sapiens SCAF_1103279188234 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 131971 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 131922
>gb|CH471059.2| Homo sapiens 211000035844098 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=57745789
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 488167 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 488118
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000462.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 24487149 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 24487100
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 24627309 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 24627260
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA
>ref|XM_003934831.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis stathmin 1 (STMN1),
mRNA
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Sbjct 484 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 435
>ref|XM_010355693.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 492 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 443
>ref|XM_010355448.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana stathmin (LOC104655902), mRNA
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Sbjct 397 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 348
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X2, mRNA
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Sbjct 580 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 531
>ref|XM_001137168.4| PREDICTED: Pan troglodytes stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 497 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 448
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 498 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 449
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X3, mRNA
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Sbjct 710 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 661
>ref|XM_003891365.2| PREDICTED: Papio anubis stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 545 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 496
>ref|XM_003891362.2| PREDICTED: Papio anubis stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 492 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 443
>ref|XR_615139.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin pseudogene (LOC100404965),
misc_RNA
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Sbjct 370 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 321
>ref|XM_003809472.2| PREDICTED: Pan paniscus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X3, mRNA
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Sbjct 515 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 466
>ref|XM_003809470.2| PREDICTED: Pan paniscus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 497 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 448
>ref|XM_008961690.1| PREDICTED: Pan paniscus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 465 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 416
>ref|XM_009000685.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X6, mRNA
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Sbjct 401 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 352
>ref|XM_009000684.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X5, mRNA
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 550 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 501
>ref|XM_009000683.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 418 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 369
>ref|XM_009000682.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 707 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 658
>ref|XM_009000681.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 665 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 616
>ref|XM_003733374.2| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 494 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 445
>ref|XR_620727.1| PREDICTED: Callithrix jacchus stathmin pseudogene (LOC103793637),
misc_RNA
Length=674
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 371 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 322
>gb|KJ905819.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15489 STMN1
gene, encodes complete protein
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 359 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 310
>gb|KJ897121.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06515 STMN1
gene, encodes complete protein
Length=579
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 359 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 310
>ref|XM_007979953.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X3, mRNA
Length=1047
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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2 (STMN1), mRNA
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1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 497 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 448
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Sbjct 557 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 508
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 600 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 551
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 455 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 406
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 439 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 390
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 391 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 342
>ref|XM_001114361.2| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 1
(LOC719733), mRNA
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Sbjct 464 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 415
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
Length=900
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Sbjct 386 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 337
>dbj|AB464250.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8233, Homo sapiens STMN1
gene for stathmin 1/oncoprotein 18, without stop codon, in
Flexi system
Length=464
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Sbjct 303 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 254
>dbj|AB451448.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, partial cds, clone: FLJ08188AAAF
Length=447
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Sbjct 294 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 245
>dbj|AB451319.1| Homo sapiens STMN1 mRNA for stathmin 1, complete cds, clone:
FLJ08188AAAN
Length=450
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Sbjct 294 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 245
>emb|CU687359.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
3' read STMN1 mRNA
Length=1239
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Sbjct 172 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 221
>emb|CU687358.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023060
5' read STMN1 mRNA
Length=1240
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 310 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 261
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
Length=543
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 387 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 338
>dbj|AB172668.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-19157, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
1, mRNA, RefSeq: NM_203401.1
Length=1727
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 1115 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 1066
>dbj|AB170228.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10916, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3, mRNA, RefSeq: NM_005563.3
Length=1394
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 387 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 338
>emb|AM392854.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002031 for hypothetical
protein (STMN1 gene)
Length=489
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 314 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 265
>gb|BC040585.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5269067, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2353
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 1283 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 1234
>gb|AY650331.1| Macaca fascicularis stathmin 1 mRNA, partial cds
Length=376
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 240 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 191
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
Length=1069
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 439 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 390
>gb|BC082228.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:99593
IMAGE:2822803), complete cds
Length=990
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 368 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 319
>gb|BC023313.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:4939590),
with apparent retained intron
Length=2121
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 1502 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 1453
>dbj|AK123488.1| Homo sapiens cDNA FLJ41494 fis, clone BRTHA2005013, moderately
similar to Homo sapiens leukemia-associated phosphoprotein
p18
Length=3441
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2837 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 2788
>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
Length=1417
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 366 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 317
>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3,mRNA, RefSeq: NM_005563.3
Length=1025
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 388 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 339
>dbj|AB209282.1| Homo sapiens mRNA for stathmin 1 variant protein
Length=2936
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 2283
>gb|DQ000556.1| Synthetic construct clone PSF:109100 leukemia-associated phosphoprotein
p18 gene, complete cds
Length=522
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 366 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 317
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
Length=83111
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 19028 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 18979
>dbj|AK129748.1| Homo sapiens cDNA FLJ26237 fis, clone CBR04649, highly similar
to Stathmin
Length=2820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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>gb|AY892936.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141262.01L stathmin
1/oncoprotein 18 (STMN1) mRNA, partial cds
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Sbjct 294 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 245
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>gb|M31303.1|HUMOP18A Human oncoprotein 18 (Op18) gene, complete cds
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Sbjct 395 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGAAGCA 346
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X2, mRNA
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X1, misc_RNA
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Sbjct 467 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATGGCTTTCTGAAGCA 418
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mRNA
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Sbjct 387 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGAAGCA 338
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>ref|XM_005607328.1| PREDICTED: Equus caballus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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X1, mRNA
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variant 2, mRNA
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variant 1, mRNA
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mRNA
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Sbjct 456 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGAAGCA 407
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5 (STMN1), mRNA
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Sbjct 463 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGAAGCA 414
>ref|XM_003799783.1| PREDICTED: Otolemur garnettii stathmin 1, transcript variant
4 (STMN1), mRNA
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Sbjct 365 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGAAGCA 316
>ref|XM_003799782.1| PREDICTED: Otolemur garnettii stathmin 1, transcript variant
3 (STMN1), mRNA
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Sbjct 401 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGAAGCA 352
>ref|XM_003799781.1| PREDICTED: Otolemur garnettii stathmin 1, transcript variant
2 (STMN1), mRNA
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Sbjct 396 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGAAGCA 347
>ref|XM_003799780.1| PREDICTED: Otolemur garnettii stathmin 1, transcript variant
1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 471 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTCTGAAGCA 422
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Sbjct 464 TCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCGATTGCTTTCTGAAGCA 416
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Sbjct 408 TCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCGATTGCTTTCTGAAGCA 360
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X3, mRNA
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Sbjct 373 TCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCGATTGCTTTCTGAAGCA 325
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X2, mRNA
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Sbjct 418 TCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCGATTGCTTTCTGAAGCA 370
>ref|XM_005875167.1| PREDICTED: Myotis brandtii stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 427 TCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCGATTGCTTTCTGAAGCA 379
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Sbjct 354 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGAAGCA 305
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Sbjct 357 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCGATTGCTTTCTGAAGCA 308
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variant X2, mRNA
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Sbjct 432 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGAAGCA 383
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variant X1, mRNA
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Sbjct 441 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGAAGCA 392
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variant X2, mRNA
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Sbjct 430 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGAAGCA 381
>ref|XM_004881071.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber stathmin 1 (Stmn1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 441 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGAAGCA 392
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variant X2, mRNA
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Sbjct 442 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGAAGCA 393
>ref|XM_004678638.1| PREDICTED: Condylura cristata stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 468 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCTTTTTGAAGCA 419
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Sbjct 359 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATCGCTTTCTGAAGCA 310
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Query 1 TTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 432 TTCCGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATCGCTTTCTGAAGCA 383
>ref|XM_006101970.1| PREDICTED: Myotis lucifugus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X3, mRNA
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Query 2 TCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 372 TCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCGATGGCTTTCTGAAGCA 324
>ref|XM_006101969.1| PREDICTED: Myotis lucifugus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 2 TCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 418 TCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCGATGGCTTTCTGAAGCA 370
>ref|XM_006101968.1| PREDICTED: Myotis lucifugus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Query 2 TCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA 50
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Sbjct 464 TCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCGATGGCTTTCTGAAGCA 416
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG
>ref|XM_001136848.4| PREDICTED: Pan troglodytes stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 224 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 273
>ref|XM_001137168.4| PREDICTED: Pan troglodytes stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 141 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 190
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Length=1556
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 142 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 191
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X3, mRNA
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Sbjct 159 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 208
>ref|XM_003809470.2| PREDICTED: Pan paniscus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 141 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 190
>ref|XM_008961690.1| PREDICTED: Pan paniscus stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 109 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 158
>ref|NM_001145454.2| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 4, mRNA
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Sbjct 114 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 163
>ref|XM_004025212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
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Sbjct 247 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 296
>ref|XM_004025211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1730
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Sbjct 80 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 129
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Sbjct 335 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 384
>ref|XM_004025209.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=991
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 141 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 190
>ref|XM_004025208.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla stathmin 1 (STMN1), mRNA
Length=1791
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 141 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 190
>dbj|AK303692.1| Homo sapiens cDNA FLJ57769 complete cds, highly similar to Stathmin
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 30 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 79
>dbj|AK311801.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92062, Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein
18 (STMN1), mRNA
Length=543
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 31 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 80
>gb|BC014353.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:24199
IMAGE:3683516), complete cds
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 83 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 132
>gb|BC082228.1| Homo sapiens stathmin 1/oncoprotein 18, mRNA (cDNA clone MGC:99593
IMAGE:2822803), complete cds
Length=990
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 12 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 61
>dbj|AK092187.1| Homo sapiens cDNA FLJ34868 fis, clone NT2NE2014525, highly similar
to SCG10 PROTEIN
Length=1810
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 31 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 80
>dbj|AK054594.1| Homo sapiens cDNA FLJ30032 fis, clone 3NB692001366, highly similar
to STATHMIN
Length=1417
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 31 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 80
>dbj|AB209282.1| Homo sapiens mRNA for stathmin 1 variant protein
Length=2936
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 18 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 67
>emb|AL033528.20| Human DNA sequence from clone RP1-125I3 on chromosome 1p35.1-36.11,
complete sequence
Length=83111
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 15864 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 15913
>dbj|AK129748.1| Homo sapiens cDNA FLJ26237 fis, clone CBR04649, highly similar
to Stathmin
Length=2820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 1860 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 1909
>dbj|D28428.1|HUMS87 Homo sapiens mRNA for stathmin, 5'UTR region
Length=99
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 31 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 80
>ref|NM_203401.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 1, mRNA
Length=1730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 302 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 351
>ref|NM_203399.1| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 2, mRNA
Length=1518
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 90 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 139
>ref|NM_005563.3| Homo sapiens stathmin 1 (STMN1), transcript variant 3, mRNA
Length=1542
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 114 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 163
>emb|BX647885.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C18102 (from clone DKFZp686C18102)
Length=2972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 32 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 81
>emb|X94912.1| H.sapiens Pr22 gene
Length=16626
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 4478 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 4429
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 11436 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTATCGCTTG 11485
>emb|Z11566.1| H.sapiens mRNA for Pr22 protein
Length=1436
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 29 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 78
>gb|J04991.1|HUMP18 Human p18 protein mRNA, complete cds
Length=1450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 41 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 90
>gb|M31303.1|HUMOP18A Human oncoprotein 18 (Op18) gene, complete cds
Length=8058
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 2829 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 2878
>emb|X53305.1| H.sapiens mRNA for stathmin
Length=1429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 19 GGACTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 68
>ref|XM_009202178.1| PREDICTED: Papio anubis stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X3, mRNA
Length=1315
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 4 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 357 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 403
>ref|XM_003891365.2| PREDICTED: Papio anubis stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1150
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 192 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 238
>ref|XM_003891362.2| PREDICTED: Papio anubis stathmin 1 (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1097
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 139 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 185
>ref|XM_007979953.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X3, mRNA
Length=1047
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 85 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 131
>ref|XM_007979952.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X2, mRNA
Length=984
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 4 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 22 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 68
>ref|XM_007979951.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus stathmin 1 (STMN1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1074
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 112 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 158
>ref|XM_005544377.1| PREDICTED: Macaca fascicularis Stathmin (STMN1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1047
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 85 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 131
>ref|XM_005544376.1| PREDICTED: Macaca fascicularis Stathmin (STMN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1074
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 112 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 158
>ref|XM_002802246.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 6
(LOC719733), mRNA
Length=1663
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 204 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 250
>ref|XM_002802245.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 5
(LOC719733), mRNA
Length=1706
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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Sbjct 247 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 293
>ref|XM_002802244.1| PREDICTED: Macaca mulatta stathmin-like, transcript variant 4
(LOC719733), mRNA
Length=1561
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 50
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(LOC719733), mRNA
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Sbjct 111 CTTTCCTTATCCCAGTTGATTGTGCAGAATACACTGCCTGTCGCTTG 157
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>dbj|AB169018.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-16615, similar to
human stathmin 1/oncoprotein 18 (STMN1), transcript variant
3,mRNA, RefSeq: NM_005563.3
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1 1 26228022 26231222 93M26231230F7m CTCGCTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA GGGCTTT
1 1 26228022 26231222 93M26231230F7m CTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA GGACTTT
1 1 26228022 26231222 93M26231230F7m CTCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA GGACTTT
1 1 26228023 26231221 92M26231230F8m TCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA GGACTTTC
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1 1 26228023 26231221 92M26231230F8m TCGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA GGACTTTC
1 1 26228024 26231220 91M26231230F9m CGGTTCTCTTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA GGACTTTCC
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1 1 26228026 26231218 89M26231230F11m GTTCTCGTTATTAGCTTCCATTTTGTGGGTCAGTTTCTCTTCTGCCATTTTACTGAAGTTGTTGTTCTCTTCTATTGCCTTCTGAAGCA GGACTTTCCTT
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1 1 26231154 26228171 1m1958n98m925n1m G||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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HuRef SCAF_1103279188352, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 20125543 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 20125592
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shotgun sequence
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Sbjct 44092268 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 44092317
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HSCHR1_CTG3
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assembly
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Sbjct 44935892 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 44935843
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genome shotgun sequence
gb|CM001609.2| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 46104678 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 46104629
>ref|NW_004929290.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150074.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 15961221 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 15961172
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shotgun sequence
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Sbjct 6218126 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 6218077
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Sbjct 44098897 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 44098848
>gb|GL583036.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_56, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 11964119 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 11964070
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Sbjct 43578140 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 43578189
>gb|DS990751.1| Homo sapiens SCAF_1112675837297 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 4853590 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 4853639
>ref|NW_001838578.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188352, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 4853708 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 4853757
>gb|CH471059.2| Homo sapiens 211000035844098 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 20132383 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 20132334
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 44098930 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 44098881
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC
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variant X2, mRNA
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Sbjct 491 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 442
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variant X1, mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 529 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 480
>ref|XM_003812781.2| PREDICTED: Pan paniscus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 398 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 349
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Sbjct 490 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 441
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
>ref|XM_004089787.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
>ref|XM_004089786.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
>ref|XM_004089785.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
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3 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 457 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 408
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
>ref|XM_004089783.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
>ref|XM_004089781.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
>ref|XM_004089780.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
>ref|XM_003278656.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1, transcript variant
1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
>ref|XM_004025698.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 394 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 345
>ref|NM_001260933.1| Macaca mulatta peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 426 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 377
>ref|XM_003278661.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1, transcript variant
6 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 674 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 625
>ref|XM_003278660.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1, transcript variant
5 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 648 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 599
>ref|NM_001202431.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 4, mRNA
Length=1046
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 457 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 408
>ref|NM_002574.3| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 674 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 625
>ref|NM_181696.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 2, mRNA
Length=1237
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 648 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 599
>ref|NM_181697.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 3, mRNA
Length=1043
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Sbjct 454 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 405
>dbj|AB464009.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB3449, Homo sapiens PRDX1
gene for peroxiredoxin 1, without stop codon, in Flexi system
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Sbjct 342 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 293
>dbj|AB451388.1| Homo sapiens PRDX1 mRNA for peroxiredoxin 1, partial cds, clone:
FLJ08078AAAF
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Sbjct 333 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 284
>dbj|AB451262.1| Homo sapiens PRDX1 mRNA for peroxiredoxin 1, complete cds, clone:
FLJ08078AAAN
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Sbjct 333 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 284
>emb|CU675526.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100016760
3' read PRDX1 mRNA
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Sbjct 283 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 332
>emb|CU675525.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100016760
5' read PRDX1 mRNA
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Sbjct 349 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 300
>dbj|AK311898.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92164, highly similar to Homo sapiens peroxiredoxin
1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 400 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 351
>gb|DQ896472.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010932; FLH194619.01L;
RZPDo839D0470D peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, encodes
complete protein
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Sbjct 355 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 306
>gb|DQ893173.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005803; FLH194623.01X; RZPDo839D0480D
peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, encodes complete protein
Length=640
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Sbjct 355 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 306
>gb|AY650294.1| Macaca fascicularis peroxiredoxin 1 mRNA, partial cds
Length=565
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 318 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 269
>gb|BT019740.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 mRNA, complete cds
Length=600
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Sbjct 333 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 284
>gb|BC007063.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:12514 IMAGE:3961375),
complete cds
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Sbjct 400 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 351
>gb|BC021683.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:24196 IMAGE:3681912),
complete cds
Length=980
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 406 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 357
>emb|AL451136.11| Human DNA sequence from clone RP11-291L19 on chromosome 1, complete
sequence
Length=137143
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Sbjct 131238 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 131287
>emb|CR407652.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H022D
for gene PRDX1, peroxiredoxin 1 complete cds, without stopcodon
Length=597
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 333 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 284
>dbj|AK131049.1| Homo sapiens cDNA FLJ29015 fis, clone MPE08581, highly similar
to Peroxiredoxin 1
Length=946
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 402 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 353
>emb|X67951.1| H.sapiens mRNA for proliferation-associated gene (pag)
Length=937
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 393 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 344
>gb|DQ297142.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, complete cds
Length=14187
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 8298 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 8249
>gb|AY888454.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH007269.01X peroxiredoxin
1 (PRDX1) mRNA, complete cds
Length=600
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 333 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 284
>gb|AY892934.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141378.01L peroxiredoxin
1 (PRDX1) mRNA, partial cds
Length=600
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 333 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 284
>gb|L19184.1|HUMNKEFA Human natural killer cell enhancing factor (NKEFA) mRNA, complete
cds
Length=829
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 400 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 351
>ref|XM_010363061.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=1079
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
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Sbjct 528 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATATTCATGGGTCCCAGTCCTC 479
>ref|XM_002810894.3| PREDICTED: Pongo abelii peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=1074
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 GGTGCGCTTTGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 478
>ref|XM_009001132.1| PREDICTED: Callithrix jacchus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X3, mRNA
Length=1199
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 GGTGCGCTTCGGGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 782
>ref|XM_009001131.1| PREDICTED: Callithrix jacchus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X2, mRNA
Length=792
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 GGTGCGCTTCGGGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 375
>ref|XM_002750759.3| PREDICTED: Callithrix jacchus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X1, mRNA
Length=890
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 522 GGTGCGCTTCGGGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 473
>ref|XR_745598.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis peroxiredoxin-1 pseudogene
(LOC104652265), misc_RNA
Length=759
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 GGTGCGCTTTGGGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 347
>ref|XM_010340101.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis peroxiredoxin-1 (LOC101028711),
mRNA
Length=954
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402 GGTGCGCTTTGGGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 353
>ref|XR_744147.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis peroxiredoxin-1 pseudogene
(LOC101034898), misc_RNA
Length=590
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329 GGTGCACTTTGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 280
>ref|XM_008151204.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=611
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339 GGTGCGCTTGGGGTCTGACACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 290
>ref|XM_003803536.1| PREDICTED: Otolemur garnettii peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=941
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 GGTGCGCTTGGGGTCTGACACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 324
>ref|NM_001285050.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101867473 (LOC101867473),
mRNA
dbj|AB170361.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10484, similar to
human peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 3, mRNA, RefSeq:
NM_181697.1
Length=934
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 407 GGTGCGCTTCGGGTCGGGTACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 358
>ref|XR_177709.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 pseudogene (LOC101175774),
misc_RNA
Length=1165
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 389 TGCGCTTCGGGTCTGAGGCCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 342
>ref|XM_007610735.1| PREDICTED: Cricetulus griseus peroxiredoxin 1 (Prdx1), transcript
variant X1, mRNA
Length=828
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 455 GGTGCGCTTGGGATCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAATCCTC 406
>ref|NM_001246765.1| Cricetulus griseus peroxiredoxin 1 (Prdx1), mRNA
gb|AF221841.1| Cricetulus griseus thioredoxin peroxidase II mRNA, complete cds
Length=600
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTC 50
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 333 GGTGCGCTTGGGATCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAATCCTC 284
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC
>ref|XM_003308062.3| PREDICTED: Pan troglodytes peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1078
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 182
>ref|XM_003812781.2| PREDICTED: Pan paniscus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=1077
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 182
>ref|NM_002574.3| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 1, mRNA
Length=1263
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 108
>ref|NM_181696.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 2, mRNA
Length=1237
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 108
>ref|NM_181697.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 3, mRNA
Length=1043
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 50
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Sbjct 59 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 108
>dbj|AK311898.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92164, highly similar to Homo sapiens peroxiredoxin
1 (PRDX1), mRNA
Length=667
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 50
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Sbjct 5 CTTGTTCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGAC 54
>gb|BC007063.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:12514 IMAGE:3961375),
complete cds
Length=973
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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sequence
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188352, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
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variant X1, mRNA
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 525 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 476
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1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 391 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 342
>ref|NM_001260933.1| Macaca mulatta peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 423 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 374
>ref|XM_003278661.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1, transcript variant
6 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 671 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 622
>ref|XM_003278660.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1, transcript variant
5 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 645 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 596
>ref|NM_001202431.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 4, mRNA
Length=1046
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 454 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 405
>ref|NM_002574.3| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 671 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 622
>ref|NM_181696.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 645 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 596
>ref|NM_181697.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 3, mRNA
Length=1043
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Sbjct 451 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 402
>dbj|AB464009.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB3449, Homo sapiens PRDX1
gene for peroxiredoxin 1, without stop codon, in Flexi system
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Sbjct 339 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 290
>dbj|AB451388.1| Homo sapiens PRDX1 mRNA for peroxiredoxin 1, partial cds, clone:
FLJ08078AAAF
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Sbjct 330 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 281
>dbj|AB451262.1| Homo sapiens PRDX1 mRNA for peroxiredoxin 1, complete cds, clone:
FLJ08078AAAN
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Sbjct 330 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 281
>emb|CU675526.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100016760
3' read PRDX1 mRNA
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Sbjct 286 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 335
>emb|CU675525.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100016760
5' read PRDX1 mRNA
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Sbjct 346 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 297
>dbj|AK311898.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92164, highly similar to Homo sapiens peroxiredoxin
1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 397 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 348
>gb|DQ896472.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010932; FLH194619.01L;
RZPDo839D0470D peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, encodes
complete protein
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Sbjct 352 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 303
>gb|DQ893173.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005803; FLH194623.01X; RZPDo839D0480D
peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, encodes complete protein
Length=640
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Sbjct 352 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 303
>gb|AY650294.1| Macaca fascicularis peroxiredoxin 1 mRNA, partial cds
Length=565
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Sbjct 315 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 266
>gb|BT019740.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 mRNA, complete cds
Length=600
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Sbjct 330 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 281
>gb|BC007063.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:12514 IMAGE:3961375),
complete cds
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Sbjct 397 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 348
>gb|BC021683.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:24196 IMAGE:3681912),
complete cds
Length=980
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 403 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 354
>emb|AL451136.11| Human DNA sequence from clone RP11-291L19 on chromosome 1, complete
sequence
Length=137143
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 131241 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 131290
>emb|CR407652.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H022D
for gene PRDX1, peroxiredoxin 1 complete cds, without stopcodon
Length=597
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 330 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 281
>dbj|AK131049.1| Homo sapiens cDNA FLJ29015 fis, clone MPE08581, highly similar
to Peroxiredoxin 1
Length=946
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 399 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 350
>emb|X67951.1| H.sapiens mRNA for proliferation-associated gene (pag)
Length=937
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 390 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 341
>gb|DQ297142.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, complete cds
Length=14187
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 8295 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 8246
>gb|AY888454.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH007269.01X peroxiredoxin
1 (PRDX1) mRNA, complete cds
Length=600
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 330 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 281
>gb|AY892934.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141378.01L peroxiredoxin
1 (PRDX1) mRNA, partial cds
Length=600
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 330 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 281
>gb|L19184.1|HUMNKEFA Human natural killer cell enhancing factor (NKEFA) mRNA, complete
cds
Length=829
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 397 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 348
>ref|XM_002810894.3| PREDICTED: Pongo abelii peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=1074
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 524 GCGCTTTGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 475
>ref|XM_009001132.1| PREDICTED: Callithrix jacchus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X3, mRNA
Length=1199
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 828 GCGCTTCGGGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 779
>ref|XM_009001131.1| PREDICTED: Callithrix jacchus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X2, mRNA
Length=792
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 421 GCGCTTCGGGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 372
>ref|XM_002750759.3| PREDICTED: Callithrix jacchus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X1, mRNA
Length=890
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 519 GCGCTTCGGGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 470
>ref|XR_745598.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis peroxiredoxin-1 pseudogene
(LOC104652265), misc_RNA
Length=759
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 393 GCGCTTTGGGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 344
>ref|XM_010340101.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis peroxiredoxin-1 (LOC101028711),
mRNA
Length=954
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 399 GCGCTTTGGGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 350
>ref|XR_744147.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis peroxiredoxin-1 pseudogene
(LOC101034898), misc_RNA
Length=590
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 CTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 CTTTGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 277
>ref|XM_008574881.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=740
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 GCGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 341
>ref|XM_008151204.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=611
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 GCGCTTGGGGTCTGACACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 287
>ref|XR_177709.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 pseudogene (LOC101175774),
misc_RNA
Length=1165
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 388 GCGCTTCGGGTCTGAGGCCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 339
>ref|NM_001285050.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101867473 (LOC101867473),
mRNA
dbj|AB170361.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10484, similar to
human peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 3, mRNA, RefSeq:
NM_181697.1
Length=934
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404 GCGCTTCGGGTCGGGTACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 355
>ref|XM_007080334.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica peroxiredoxin-1-like (LOC102951072),
mRNA
Length=806
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 CGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 227
>ref|XM_007077274.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=983
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 397
>ref|XM_003990035.2| PREDICTED: Felis catus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=984
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 446 CGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 398
>ref|XM_006745051.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii peroxiredoxin-1-like (LOC102737922),
mRNA
Length=927
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381 CGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 333
>ref|XR_434361.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii peroxiredoxin 1 pseudogene
(LOC102728539), misc_RNA
Length=640
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
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Query 2 CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381 CGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 333
>ref|XM_006729008.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=600
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 2 CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 329 CGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 281
>ref|XM_005638153.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris peroxiredoxin-1-like (LOC610978),
mRNA
Length=872
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 2 CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 314 CGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 266
>ref|XM_004833857.1| PREDICTED: Mustela putorius furo peroxiredoxin 1 (LOC101688994),
mRNA
Length=913
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 2 CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 379 CGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 331
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mRNA
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Sbjct 366 CGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 318
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Sbjct 449 CGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 401
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mRNA
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Sbjct 328 CGCTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 280
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Sbjct 443 GCGCTTAGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 394
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misc_RNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 358 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 309
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Sbjct 342 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 293
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variant X2, mRNA
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Sbjct 462 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 413
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Sbjct 406 GCGCTTGGGGTCTGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 357
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Sbjct 380 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 331
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Sbjct 366 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 317
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mRNA
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Sbjct 358 GCGCTTGGGGTCTGATATCAACGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 309
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X5, mRNA
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Sbjct 438 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 389
>ref|XM_003128040.2| PREDICTED: Sus scrofa peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant
X3, mRNA
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Sbjct 530 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 481
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X1, mRNA
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Sbjct 484 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 435
>ref|XM_005665472.1| PREDICTED: Sus scrofa peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant
X6, mRNA
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Sbjct 483 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 434
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X1, mRNA
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Sbjct 609 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 560
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misc_RNA
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Sbjct 327 CTTGGGGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 281
>ref|XM_004001919.1| PREDICTED: Ovis aries peroxiredoxin 1, transcript variant 2 (PRDX1),
mRNA
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Sbjct 359 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 310
>ref|XM_004001918.1| PREDICTED: Ovis aries peroxiredoxin 1, transcript variant 1 (PRDX1),
mRNA
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Sbjct 381 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 332
>dbj|AK392161.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10053G10, expressed in hypothalamus
Length=941
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Sbjct 387 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 338
>gb|GU975769.1| Bubalus bubalis peroxiredoxin 1 (PRDX1) mRNA, complete cds
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Sbjct 358 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 309
>dbj|AK346969.1| Sus scrofa mRNA, clone:MLN010083E09, expressed in mesenteric
lymph nodes
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Sbjct 391 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 342
>dbj|AK352082.1| Sus scrofa mRNA, clone:UTR010002G06, expressed in uterus
Length=958
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Sbjct 386 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 337
>gb|BC148009.1| Bos taurus peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:166223 IMAGE:8826513),
complete cds
Length=913
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Sbjct 363 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 314
>dbj|AK231993.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010061H12, expressed in lung
Length=1021
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Sbjct 415 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 366
>dbj|AK231390.1| Sus scrofa mRNA, clone:ITT010053C08, expressed in intestine
Length=1878
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Sbjct 384 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 335
>dbj|AK230806.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010046F04, expressed in alveolar macrophage
Length=1350
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 780 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 731
>gb|DQ082848.1| Bubalus bubalis peroxiredoxin 1 gene, exon 4 and partial cds
Length=1302
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Sbjct 925 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 876
>ref|NM_001246765.1| Cricetulus griseus peroxiredoxin 1 (Prdx1), mRNA
gb|AF221841.1| Cricetulus griseus thioredoxin peroxidase II mRNA, complete cds
Length=600
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 330 GCGCTTGGGATCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAATCCTCCTT 281
>gb|BT021073.1| Bos taurus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA, complete cds
Length=884
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 360 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 311
>gb|AY610415.1| Sus scrofa clone rjej19b_l15.y1.abd, mRNA sequence
Length=642
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 357 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 308
>dbj|AB099055.1| Bos taurus mRNA for similar to peroxiredoxin 1, partial cds,
clone: ORCS12998
Length=499
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
|||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 315
>dbj|AB098940.1| Bos taurus mRNA for similar to peroxiredoxin 1, partial cds,
clone: ORCS10695
Length=458
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Query 1 GCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
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Sbjct 365 GCGCTTGGGGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 316
>ref|XM_008699284.1| PREDICTED: Ursus maritimus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=979
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 CGCTTGGGATCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 391
>ref|XM_006994191.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii peroxiredoxin-1-like
(LOC102905546), mRNA
Length=1293
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 827 CGCTTGGGATCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAATCCTCCTT 779
>ref|XM_006986564.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii peroxiredoxin 1 (Prdx1),
mRNA
Length=936
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTT 50
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 431 CGCTTGGGATCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAATCCTCCTT 383
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGCCCCTG
>ref|NM_002574.3| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 1, mRNA
Length=1263
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGCCCCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 GTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGCCCCTG 135
>ref|NM_181696.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 2, mRNA
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assembly
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genome shotgun sequence
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Sbjct 46104665 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 46104616
>ref|NW_004929290.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 43578153 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 43578202
>gb|DS990751.1| Homo sapiens SCAF_1112675837297 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>ref|NW_001838578.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188352, whole genome shotgun sequence
gb|DS486113.1| Homo sapiens SCAF_1103279188352 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>gb|CH471059.2| Homo sapiens 211000035844098 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 44098917 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 44098868
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Sbjct 44271512 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 44271463
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA
>ref|XR_744147.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis peroxiredoxin-1 pseudogene
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variant X2, mRNA
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Sbjct 480 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 431
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variant X1, mRNA
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
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Sbjct 516 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 467
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 518 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 469
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 387 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 338
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Sbjct 479 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 430
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
>ref|XM_004089787.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
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3 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 446 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 397
>ref|XM_004089784.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
>ref|XM_004089781.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
>ref|XM_004089779.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
>ref|XM_003278656.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1, transcript variant
1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
>ref|XM_004025698.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 383 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 334
>ref|NM_001260933.1| Macaca mulatta peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 415 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 366
>ref|XM_003278661.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1, transcript variant
6 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 663 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 614
>ref|XM_003278660.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1, transcript variant
5 (PRDX1), mRNA
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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>ref|NM_001202431.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 4, mRNA
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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>ref|NM_002574.3| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 1, mRNA
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>ref|NM_181696.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 2, mRNA
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 637 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 588
>ref|NM_181697.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 3, mRNA
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 443 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 394
>dbj|AB464009.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB3449, Homo sapiens PRDX1
gene for peroxiredoxin 1, without stop codon, in Flexi system
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Sbjct 331 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 282
>dbj|AB451388.1| Homo sapiens PRDX1 mRNA for peroxiredoxin 1, partial cds, clone:
FLJ08078AAAF
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Sbjct 322 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 273
>dbj|AB451262.1| Homo sapiens PRDX1 mRNA for peroxiredoxin 1, complete cds, clone:
FLJ08078AAAN
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Sbjct 322 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 273
>emb|CU675526.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100016760
3' read PRDX1 mRNA
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Sbjct 294 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 343
>emb|CU675525.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100016760
5' read PRDX1 mRNA
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Sbjct 338 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 289
>dbj|AK311898.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92164, highly similar to Homo sapiens peroxiredoxin
1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 389 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 340
>gb|DQ896472.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010932; FLH194619.01L;
RZPDo839D0470D peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, encodes
complete protein
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>gb|DQ893173.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005803; FLH194623.01X; RZPDo839D0480D
peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, encodes complete protein
Length=640
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Sbjct 344 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 295
>gb|AY650294.1| Macaca fascicularis peroxiredoxin 1 mRNA, partial cds
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Sbjct 307 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 258
>gb|BT019740.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 mRNA, complete cds
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Sbjct 322 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 273
>gb|BC007063.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:12514 IMAGE:3961375),
complete cds
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Sbjct 389 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 340
>gb|BC021683.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:24196 IMAGE:3681912),
complete cds
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Sbjct 395 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 346
>emb|AL451136.11| Human DNA sequence from clone RP11-291L19 on chromosome 1, complete
sequence
Length=137143
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Sbjct 131249 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 131298
>emb|CR407652.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H022D
for gene PRDX1, peroxiredoxin 1 complete cds, without stopcodon
Length=597
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Sbjct 322 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 273
>dbj|AK131049.1| Homo sapiens cDNA FLJ29015 fis, clone MPE08581, highly similar
to Peroxiredoxin 1
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Sbjct 391 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 342
>emb|X67951.1| H.sapiens mRNA for proliferation-associated gene (pag)
Length=937
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Sbjct 382 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 333
>gb|DQ297142.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, complete cds
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Sbjct 8287 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 8238
>gb|AY888454.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH007269.01X peroxiredoxin
1 (PRDX1) mRNA, complete cds
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Sbjct 322 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 273
>gb|AY892934.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141378.01L peroxiredoxin
1 (PRDX1) mRNA, partial cds
Length=600
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Sbjct 322 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 273
>gb|L19184.1|HUMNKEFA Human natural killer cell enhancing factor (NKEFA) mRNA, complete
cds
Length=829
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Sbjct 389 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 340
>ref|XR_745598.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis peroxiredoxin-1 pseudogene
(LOC104652265), misc_RNA
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Sbjct 385 GGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 336
>ref|XM_010340101.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis peroxiredoxin-1 (LOC101028711),
mRNA
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Sbjct 391 GGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 342
>ref|XM_010363061.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 517 GGTCTGATACCAAAGGAATATTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 468
>ref|XM_009001132.1| PREDICTED: Callithrix jacchus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 820 GGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 771
>ref|XM_009001131.1| PREDICTED: Callithrix jacchus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 413 GGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 364
>ref|XM_002750759.3| PREDICTED: Callithrix jacchus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 511 GGTCTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 462
>ref|XM_008574881.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 382 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 334
>ref|XM_008151204.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 328 GGTCTGACACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 280
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mRNA
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Sbjct 268 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 220
>ref|XM_007077274.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 438 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 390
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Sbjct 439 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 391
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mRNA
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(LOC102733104), misc_RNA
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>ref|XR_434361.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii peroxiredoxin 1 pseudogene
(LOC102728539), misc_RNA
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Sbjct 374 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 326
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Sbjct 322 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 274
>ref|XR_433895.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii peroxiredoxin 1 pseudogene
(LOC102733237), misc_RNA
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Sbjct 361 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 313
>ref|XM_005638153.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris peroxiredoxin-1-like (LOC610978),
mRNA
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Sbjct 307 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 259
>ref|XM_004833857.1| PREDICTED: Mustela putorius furo peroxiredoxin 1 (LOC101688994),
mRNA
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Sbjct 372 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 324
>ref|XM_004833845.1| PREDICTED: Mustela putorius furo peroxiredoxin 1 (LOC101686626),
mRNA
Length=644
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 49
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Sbjct 359 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 311
>ref|XM_004782699.1| PREDICTED: Mustela putorius furo peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=980
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 49
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Sbjct 442 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 394
>ref|XM_004748181.1| PREDICTED: Mustela putorius furo peroxiredoxin 1 (LOC101686626),
mRNA
Length=645
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 49
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Sbjct 364 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 316
>ref|XR_187428.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens peroxiredoxin-1-like (LOC101364083),
misc_RNA
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 49
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Sbjct 321 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 273
>ref|XR_187076.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens peroxiredoxin-1-like (LOC101369041),
misc_RNA
Length=875
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 49
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Sbjct 322 GGTCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 274
>ref|XM_008699284.1| PREDICTED: Ursus maritimus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=979
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 50
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Sbjct 430 TCTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA 383
>ref|XM_008837624.1| PREDICTED: Nannospalax galili peroxiredoxin 1 (Prdx1), mRNA
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variant X1, mRNA
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mRNA
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human peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 3, mRNA, RefSeq:
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(LOC103001666), mRNA
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1 (PRDX1), transcript variant X2, mRNA
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1 (PRDX1), transcript variant X1, mRNA
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variant X2, mRNA
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mRNA
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X1, mRNA
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mRNA
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misc_RNA
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mRNA
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mRNA
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Sbjct 350 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 302
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complete cds
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Sbjct 917 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 869
>gb|BT021073.1| Bos taurus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA, complete cds
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Sbjct 352 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 304
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clone: ORCS12998
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Sbjct 356 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 308
>dbj|AB098940.1| Bos taurus mRNA for similar to peroxiredoxin 1, partial cds,
clone: ORCS10695
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Sbjct 357 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 309
>ref|XM_008057563.1| PREDICTED: Tarsius syrichta peroxiredoxin-1 (LOC103259910), mRNA
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>ref|XM_007946671.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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mRNA
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Sbjct 350 GGTCGGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 302
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variant X4, mRNA
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Sbjct 377 GGTCGGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 329
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variant X3, mRNA
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Sbjct 374 GGTCGGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 326
>ref|XM_008521573.1| PREDICTED: Equus przewalskii peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 538 GGTCGGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 490
>ref|XM_008521572.1| PREDICTED: Equus przewalskii peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 541 GGTCGGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 493
>ref|XM_007450366.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X2, mRNA
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>ref|XM_007450365.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X1, mRNA
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(LOC103001267), mRNA
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Sbjct 322 GGTCTGATATCAAGGGAATTTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 274
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X5, mRNA
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Sbjct 430 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 382
>ref|XM_003128040.2| PREDICTED: Sus scrofa peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant
X3, mRNA
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Sbjct 522 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 474
>ref|XM_003128038.2| PREDICTED: Sus scrofa peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 476 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 428
>ref|XM_005665472.1| PREDICTED: Sus scrofa peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant
X6, mRNA
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Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
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Sbjct 475 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 427
>ref|XM_005607091.1| PREDICTED: Equus caballus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 393 GGTCGGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 345
>ref|XM_001496034.3| PREDICTED: Equus caballus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X1, mRNA
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|||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 GGTCGGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 382
>ref|XM_005607090.1| PREDICTED: Equus caballus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 426 GGTCGGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 378
>ref|XM_004605301.1| PREDICTED: Sorex araneus peroxiredoxin-1-like (LOC101552265),
mRNA
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Sbjct 324 GGTCCGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 276
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variant 3 (LOC101325225), mRNA
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Sbjct 383 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 335
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variant 2 (LOC101325225), mRNA
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Sbjct 377 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 329
>ref|XM_004326232.1| PREDICTED: Tursiops truncatus peroxiredoxin-1-like, transcript
variant 1 (LOC101325225), mRNA
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Sbjct 398 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 350
>ref|XM_004285745.1| PREDICTED: Orcinus orca peroxiredoxin 1, transcript variant 3
(PRDX1), mRNA
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Sbjct 398 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 350
>ref|XM_004285744.1| PREDICTED: Orcinus orca peroxiredoxin 1, transcript variant 2
(PRDX1), mRNA
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Sbjct 385 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 337
>ref|XM_004285743.1| PREDICTED: Orcinus orca peroxiredoxin 1, transcript variant 1
(PRDX1), mRNA
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Sbjct 377 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 329
>dbj|AK392161.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10053G10, expressed in hypothalamus
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Sbjct 379 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 331
>dbj|AK346969.1| Sus scrofa mRNA, clone:MLN010083E09, expressed in mesenteric
lymph nodes
Length=942
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Sbjct 383 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 335
>dbj|AK352082.1| Sus scrofa mRNA, clone:UTR010002G06, expressed in uterus
Length=958
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Sbjct 378 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 330
>dbj|AK231993.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010061H12, expressed in lung
Length=1021
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Sbjct 407 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 359
>dbj|AK231390.1| Sus scrofa mRNA, clone:ITT010053C08, expressed in intestine
Length=1878
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Sbjct 376 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 328
>dbj|AK230806.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010046F04, expressed in alveolar macrophage
Length=1350
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 49
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Sbjct 772 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 724
>gb|AF305561.1| Bos taurus peroxiredoxin 1 mRNA, complete cds
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Query 4 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 49
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Sbjct 361 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 316
>ref|NM_174431.1| Bos taurus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=883
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Query 4 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 49
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Sbjct 361 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 316
>gb|AY610415.1| Sus scrofa clone rjej19b_l15.y1.abd, mRNA sequence
Length=642
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Query 1 GGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 49
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Sbjct 349 GGTCTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGCTTCTT 301
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG
>ref|NM_002574.3| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 1, mRNA
Length=1263
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 50
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Sbjct 72 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 121
>ref|NM_181696.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 2, mRNA
Length=1237
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Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 121
>emb|AL355480.22| Human DNA sequence from clone RP4-697E16 on chromosome 1, complete
sequence
Length=106171
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Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 50
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Sbjct 1139 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 1090
>gb|DQ297142.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, complete cds
Length=14187
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Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 50
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Sbjct 1353 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 1402
>emb|X72296.1| H.sapiens pagA gene promoter region and exon 1
Length=342
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Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 50
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Sbjct 285 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGG 334
>ref|XM_003308062.3| PREDICTED: Pan troglodytes peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1078
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Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGA 43
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Sbjct 146 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGA 188
>ref|XM_003812781.2| PREDICTED: Pan paniscus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=1077
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGA 43
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 146 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGA 188
>ref|NM_181697.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 3, mRNA
Length=1043
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGA 43
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 72 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGA 114
>dbj|AK311898.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92164, highly similar to Homo sapiens peroxiredoxin
1 (PRDX1), mRNA
Length=667
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Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGA 43
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Sbjct 18 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGA 60
>gb|BC007063.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:12514 IMAGE:3961375),
complete cds
Length=973
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Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGA 43
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Sbjct 18 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGA 60
>gb|BC021683.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:24196 IMAGE:3681912),
complete cds
Length=980
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Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGA 43
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Sbjct 24 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGA 66
>dbj|AK131049.1| Homo sapiens cDNA FLJ29015 fis, clone MPE08581, highly similar
to Peroxiredoxin 1
Length=946
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Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGA 43
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Sbjct 20 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGA 62
>emb|X67951.1| H.sapiens mRNA for proliferation-associated gene (pag)
Length=937
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGA 43
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Sbjct 11 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGA 53
>gb|L19184.1|HUMNKEFA Human natural killer cell enhancing factor (NKEFA) mRNA, complete
cds
Length=829
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGA 43
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Sbjct 18 GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGA 60
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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reads
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1 1 45980416 45980516 100M GGCCTGGCCTTAGTGAGGAGGCCCCTGCATAAAGGAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGC
1 1 45980423 45980523 100M CCTTAGTGAGGAGGCCCCTGCATAAGGGAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGG
1 1 45980443 45980543 100M CATAAAGGAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATA
1 1 45980450 45980550 100M GAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAAC
1 1 45980457 45980557 100M ATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGC
1 1 45980461 45980561 100M CAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTC
1 1 45980465 45980565 100M GAGTCTATACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCA
1 1 45980472 45980572 100M TACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTA
1 1 45980477 45980577 100M ATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACC
1 1 45980481 45980581 100M GGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCAT
1 1 45980495 45980595 100M TCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATG
1 1 45980503 45980603 100M AAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATAAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTA
1 1 45980511 45980611 100M TCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTG
1 1 45980518 45980618 100M ACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAA
1 1 45980521 45980621 100M GGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGG
1 1 45980524 45980624 100M TACTTGTCCTGATGACATACCTTAACGAGATGGCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAAT
1 1 45980528 45980628 100M TGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTC
1 1 45980539 45980639 100M CATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAG
1 1 45980543 45980643 100M CCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCT
1 1 45980546 45980646 100M GAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCT
1 1 45980549 45980649 100M CGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGAGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGT
1 1 45980552 45980652 100M GATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTC
1 1 45980555 45980655 100M GCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA
1 1 45980558 45980658 100M TTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT
1 1 45980561 45980661 100M ATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGTGTA
1 1 45980564 45987529 91M45987539F9m AGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGT
1 1 45980564 45987529 91M45987539F9m AGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGT
1 1 45980564 45987529 91M45987539F9m AGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGT
1 1 45980564 45987529 91M45987539F9m AGCCTTTAAGGCCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGT
1 1 45980566 45987527 89M45987539F11m CCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTTGGTGG
1 1 45980567 45987526 88M45987539F12m CTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGT
1 1 45980568 45987525 87M45987539F13m ATTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTT
1 1 45980568 45987525 87M45987539F13m ATTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTT
1 1 45980569 45987524 86M45987539F14m TTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTA
1 1 45980571 45987522 84M45987539F16m AAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGT
1 1 45980572 45987521 83M45987539F17m AGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTT
1 1 45980572 45987521 83M45987539F17m AGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTT
1 1 45980573 45987520 82M45987539F18m GACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTT
1 1 45980574 45987519 81M45987539F19m ACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTC
1 1 45980574 45987519 81M45987539F19m ACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTC
1 1 45980575 45987518 80M45987539F20m CCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCT
1 1 45980576 45987517 79M45987539F21m CCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATTGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTG
1 1 45980576 45987517 79M45987539F21m CCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATTGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTG
1 1 45980576 45987517 79M45987539F21m CCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTG
1 1 45980577 45987516 78M45987539F22m CCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGC
1 1 45980578 45987515 77M45987539F23m CATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCG
1 1 45980578 45987515 77M45987539F23m CATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCG
1 1 45980580 45987513 75M45987539F25m TAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGAC
1 1 45980589 45987504 66M45987539F34m GCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGG
1 1 45980593 45987500 62M45987539F38m TGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACT
1 1 45980593 45987500 62M45987539F38m TGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACT
1 1 45980596 45984723 59M45987539F39m2774n2m TGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980598 45984721 57M45987539F39m2774n4m CGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980607 45984712 48M45987539F39m2774n13m TCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980608 45984711 47M45987539F39m2774n14m CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980630 45984689 25M45987539F39m2774n36m GGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980651 45984668 4M45987539F39m2774n57m TTTG GGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987546 45984672 53m2774n47m TCTTGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGATA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987543 45984669 56m2774n44m TGCCTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGATAGGAAGA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987540 45984659 59m2781n41m CTGGTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGAAGATGTCTTCAGGAAA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987537 45984656 62m2781n38m GTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGAAGATGTCTTCAGGAAATGCTAA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987534 45984660 65m2774n35m TCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGCTGATAGGAAGATGTCTTCAGGAAATGCTA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987531 45984650 32m2781n68m GTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987528 45984647 29m2781n71m GTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987525 45984651 26m2774n74m AGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987522 45984648 23m2774n77m TTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987519 45984638 20m2781n80m TGCGACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987516 45984635 17m2781n83m GACTTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987513 45984639 14m2774n86m TTGTGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987510 45984636 11m2774n89m TGTTGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987507 45984626 8m2781n92m TGGGACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987504 45981441 5m2774n93m3189n2m GACTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987501 45984627 2m2774n98m TG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987498 45987398 100m TGAGTGTGGGCAGTGCGGCCCCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTG
1 1 45987495 45987395 100m GTGTGGGCAGTGCGGCCCCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCGTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGG
1 1 45987491 45987391 100m GGGCAGTGCGGCCCCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGC
1 1 45987486 45987386 100m GTGCGGCCCCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGGGCTGTGA
1 1 45987483 45987383 100m CGGCCCCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGC
1 1 45987478 45987378 100m CCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAG
1 1 45987473 45987373 100m GGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGC
1 1 45987470 45987370 100m GTGAGGCGCGGCGCGTCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGG
1 1 45987466 45987366 100m GGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGGCGGGGGA
1 1 45987463 45987363 100m GCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGGTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGC
1 1 45987460 45987360 100m GCGCGCCCTTCTTGCCTCTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCG
1 1 45987457 45987357 100m CGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGAAG
1 1 45987451 45987351 100m TCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAG
1 1 45987447 45987347 100m GCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTG
1 1 45987444 45987344 100m TGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTT
1 1 45987440 45987340 100m GCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGGAC
1 1 45987436 45987336 100m CTTCCCCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTG
1 1 45987431 45987331 100m TCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCAC
1 1 45987428 45987328 100m TCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCAGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACC
1 1 45987425 45987325 100m TGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCG
1 1 45987421 45987321 100m CGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCN
1 1 45987418 45987318 100m GGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGG
1 1 45987415 45987315 100m CCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCC
1 1 45987411 45987311 100m CCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCCCCCC
1 1 45987407 45984723 98m2584n2m GCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCCCCCCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987403 45987303 100m GGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCCCCCCACGTAGGT
1 1 45987400 45987300 100m TGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCCCCCCACGTAGGTGCG
1 1 45987397 45984717 92m2580n8m GAGCGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCCCCCCACGTAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 45987390 45984706 81m2584n19m GTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCCCCCCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT
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Sbjct 514 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 465
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Sbjct 514 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 465
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Sbjct 514 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 465
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Sbjct 514 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 465
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Sbjct 514 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 465
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Sbjct 514 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 465
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1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 514 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 465
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Sbjct 380 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 331
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6 (PRDX1), mRNA
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5 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 443 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 394
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Sbjct 660 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 611
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Sbjct 634 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 585
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Sbjct 440 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 391
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gene for peroxiredoxin 1, without stop codon, in Flexi system
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Sbjct 328 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 279
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FLJ08078AAAF
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Sbjct 319 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 270
>dbj|AB451262.1| Homo sapiens PRDX1 mRNA for peroxiredoxin 1, complete cds, clone:
FLJ08078AAAN
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Sbjct 319 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 270
>emb|CU675526.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100016760
3' read PRDX1 mRNA
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Sbjct 297 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 346
>emb|CU675525.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100016760
5' read PRDX1 mRNA
Length=1094
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Query 1 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 50
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Sbjct 335 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 286
>dbj|AK311898.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92164, highly similar to Homo sapiens peroxiredoxin
1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 386 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 337
>gb|DQ896472.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010932; FLH194619.01L;
RZPDo839D0470D peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, encodes
complete protein
Length=640
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Sbjct 341 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 292
>gb|DQ893173.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005803; FLH194623.01X; RZPDo839D0480D
peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, encodes complete protein
Length=640
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Query 1 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 50
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Sbjct 341 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 292
>gb|AY650294.1| Macaca fascicularis peroxiredoxin 1 mRNA, partial cds
Length=565
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Sbjct 304 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 255
>gb|BT019740.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 mRNA, complete cds
Length=600
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Sbjct 319 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 270
>gb|BC007063.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:12514 IMAGE:3961375),
complete cds
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Query 1 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 50
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Sbjct 386 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 337
>gb|BC021683.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:24196 IMAGE:3681912),
complete cds
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Query 1 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 50
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Sbjct 392 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 343
>emb|AL451136.11| Human DNA sequence from clone RP11-291L19 on chromosome 1, complete
sequence
Length=137143
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>emb|CR407652.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H022D
for gene PRDX1, peroxiredoxin 1 complete cds, without stopcodon
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Sbjct 319 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 270
>dbj|AK131049.1| Homo sapiens cDNA FLJ29015 fis, clone MPE08581, highly similar
to Peroxiredoxin 1
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Sbjct 388 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 339
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Sbjct 379 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 330
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>gb|AY888454.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH007269.01X peroxiredoxin
1 (PRDX1) mRNA, complete cds
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Sbjct 319 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 270
>gb|AY892934.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH141378.01L peroxiredoxin
1 (PRDX1) mRNA, partial cds
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Sbjct 319 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 270
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cds
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(LOC104652265), misc_RNA
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mRNA
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Sbjct 388 CTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 339
>ref|XM_010363061.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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variant X3, mRNA
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Sbjct 817 CTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 768
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variant X2, mRNA
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Sbjct 410 CTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 361
>ref|XM_002750759.3| PREDICTED: Callithrix jacchus peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 508 CTGATATCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 459
>ref|XM_008699284.1| PREDICTED: Ursus maritimus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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>ref|NM_001285050.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101867473 (LOC101867473),
mRNA
dbj|AB170361.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10484, similar to
human peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 3, mRNA, RefSeq:
NM_181697.1
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Sbjct 389 TACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 344
>ref|XM_008837624.1| PREDICTED: Nannospalax galili peroxiredoxin 1 (Prdx1), mRNA
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Sbjct 461 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 412
>ref|XM_008574881.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 379 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 330
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Sbjct 325 CTGACACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 276
>ref|XR_505152.1| PREDICTED: Tarsius syrichta peroxiredoxin-1 pseudogene (LOC103272826),
misc_RNA
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Sbjct 319 CTGATACTAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 270
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Sbjct 415 CTGATACTAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 366
>ref|XM_007610735.1| PREDICTED: Cricetulus griseus peroxiredoxin 1 (Prdx1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 441 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAATCCTCCTTGTTTCTTGGGT 392
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mRNA
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Sbjct 435 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 386
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(LOC102905546), mRNA
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Sbjct 817 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAATCCTCCTTGTTTCTTGGGT 768
>ref|XM_006986564.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii peroxiredoxin 1 (Prdx1),
mRNA
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Sbjct 421 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAATCCTCCTTGTTTCTTGGGT 372
>ref|XM_003990035.2| PREDICTED: Felis catus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 436 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 387
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mRNA
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Sbjct 371 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 322
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(LOC102733104), misc_RNA
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Sbjct 319 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 270
>ref|XR_434361.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii peroxiredoxin 1 pseudogene
(LOC102728539), misc_RNA
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Sbjct 371 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 322
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Sbjct 319 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 270
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(LOC102733237), misc_RNA
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Sbjct 358 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 309
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mRNA
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Sbjct 304 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 255
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mRNA
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Sbjct 369 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 320
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mRNA
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Sbjct 356 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 307
>ref|XM_004782699.1| PREDICTED: Mustela putorius furo peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Sbjct 439 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 390
>ref|XM_004748181.1| PREDICTED: Mustela putorius furo peroxiredoxin 1 (LOC101686626),
mRNA
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Sbjct 361 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 312
>ref|XR_187076.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens peroxiredoxin-1-like (LOC101369041),
misc_RNA
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Sbjct 319 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 270
>ref|XR_177709.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys peroxiredoxin 1 pseudogene (LOC101175774),
misc_RNA
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Query 7 CCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 50
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Sbjct 371 CCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 328
>ref|XM_003803536.1| PREDICTED: Otolemur garnettii peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
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Query 1 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 50
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Sbjct 359 CTGACACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCCTGTTTCTTAGGT 310
>ref|NM_001246765.1| Cricetulus griseus peroxiredoxin 1 (Prdx1), mRNA
gb|AF221841.1| Cricetulus griseus thioredoxin peroxidase II mRNA, complete cds
Length=600
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Query 1 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 50
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Sbjct 319 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAATCCTCCTTGTTTCTTGGGT 270
>ref|XR_187428.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens peroxiredoxin-1-like (LOC101364083),
misc_RNA
Length=877
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Query 1 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 46
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Sbjct 318 CTGATACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 273
>ref|XM_002715138.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=1012
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Query 1 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 50
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Sbjct 432 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 383
>ref|XM_007946671.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=763
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 50
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Sbjct 326 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAACCCTCCTTGTTTCTTGGGT 277
>ref|NM_001290946.1| Bubalus bubalis peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=687
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT 50
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Sbjct 347 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 298
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(LOC103001666), mRNA
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Sbjct 331 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 282
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1 (PRDX1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 437 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 388
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1 (PRDX1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 472 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 423
>ref|XM_006052558.1| PREDICTED: Bubalus bubalis peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 451 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 402
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Sbjct 374 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 325
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Sbjct 395 CTGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 346
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Sbjct 369 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 320
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Sbjct 355 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 306
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mRNA
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Sbjct 347 CTGATATCAACGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 298
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X1, mRNA
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Sbjct 598 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 549
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mRNA
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Sbjct 404 CTGATACCAAGGGAATATTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 355
>ref|XM_004001919.1| PREDICTED: Ovis aries peroxiredoxin 1, transcript variant 2 (PRDX1),
mRNA
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Sbjct 348 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 299
>ref|XM_004001918.1| PREDICTED: Ovis aries peroxiredoxin 1, transcript variant 1 (PRDX1),
mRNA
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Sbjct 370 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 321
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Sbjct 347 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 298
>gb|BC148009.1| Bos taurus peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:166223 IMAGE:8826513),
complete cds
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Sbjct 352 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 303
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Sbjct 361 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 312
>gb|DQ082848.1| Bubalus bubalis peroxiredoxin 1 gene, exon 4 and partial cds
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Sbjct 914 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 865
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Sbjct 361 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 312
>gb|BT021073.1| Bos taurus peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA, complete cds
Length=884
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Sbjct 349 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 300
>dbj|AB099055.1| Bos taurus mRNA for similar to peroxiredoxin 1, partial cds,
clone: ORCS12998
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Sbjct 353 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 304
>dbj|AB098940.1| Bos taurus mRNA for similar to peroxiredoxin 1, partial cds,
clone: ORCS10695
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Sbjct 354 CTGATATCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTGGGT 305
>ref|XR_682142.1| PREDICTED: Pan troglodytes peroxiredoxin-1-like (LOC100615743),
misc_RNA
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Sbjct 370 CCAAAGGAATGTTCCTGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 328
>ref|XM_009244447.1| PREDICTED: Pongo abelii peroxiredoxin-1-like (LOC100459667),
mRNA
Length=631
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Query 7 CCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 49
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Sbjct 328 CCAAAGGAATGTTCCTGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 286
>ref|XM_004598937.1| PREDICTED: Ochotona princeps peroxiredoxin 1 (PRDX1), mRNA
Length=757
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Sbjct 323 CTGACACCAAGGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 278
>ref|XR_186874.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens peroxiredoxin-1-like (LOC101378346),
misc_RNA
Length=511
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Query 1 CTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 46
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Sbjct 359 CTGATACCAAGGGAATATTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTT 314
>ref|XR_175396.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla peroxiredoxin 1 pseudogene
(LOC101139461), misc_RNA
Length=1170
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Query 7 CCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 49
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Sbjct 373 CCAAAGGAATGTTCCTGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 331
>ref|NG_001201.3| Homo sapiens thioredoxin-dependent peroxide reductase 2 (TDPX2)
pseudogene on chromosome 9
Length=1147
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Query 7 CCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 49
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Sbjct 477 CCAAAGGAATGTTCCTGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 435
>emb|AL161449.7| Human DNA sequence from clone RP11-382H24 on chromosome 9p22.1-23,
complete sequence
Length=169660
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Sbjct 12859 CCAAAGGAATGTTCCTGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 12901
>gb|AF197013.1|AF197013 Pan troglodytes proliferation-associated gene (Pag) pseudogene,
partial sequence
Length=883
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Sbjct 375 CCAAAGGAATGTTCCTGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 333
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partial sequence
Length=883
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Query 7 CCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 49
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Sbjct 377 CCAAAGGAATGTTCCTGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 335
>emb|X72297.1| H.sapiens pagA/pagB pseudogene
Length=1082
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Query 7 CCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 49
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Sbjct 486 CCAAAGGAATGTTCCTGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGG 444
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGC
>ref|NM_002574.3| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 1, mRNA
Length=1263
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Query 1 GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGC 50
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Sbjct 81 GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGC 130
>ref|NM_181696.2| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1), transcript variant 2, mRNA
Length=1237
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Query 1 GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGC 130
>emb|AL355480.22| Human DNA sequence from clone RP4-697E16 on chromosome 1, complete
sequence
Length=106171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGC 50
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Sbjct 1130 GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGC 1081
>gb|DQ297142.1| Homo sapiens peroxiredoxin 1 (PRDX1) gene, complete cds
Length=14187
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGC 50
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Sbjct 1362 GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGGC 1411
>emb|X72296.1| H.sapiens pagA gene promoter region and exon 1
Length=342
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGG 49
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Sbjct 294 GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTGGTGAGTGTGGGCAGTGCGG 342
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
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1 1 45980393 45980493 100M GGACTGGTCTCCACACTCCTACTGGCCTGGCCTTAGTGAGGAGGCCCCTGCATAAAGGAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATC
1 1 45980396 45980496 100M CTGGTCTCCACACTCCTACTGGCCTGGCCTTAGTGAGGAGGCCCCTGCATAAAGGAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCT
1 1 45980402 45980502 100M TCCACACTCCTACTGGCCTGGCCTTAGTGAGGAGGCCCCTGCATAAAGGAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAAT
1 1 45980410 45980510 100M CCTACTGGCCTGGCCTTAGTGAGGAGGCCCCTGCATAAAGGAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCT
1 1 45980416 45980516 100M GGCCTGGCCTTAGTGAGGAGGCCCCTGCATAAAGGAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGC
1 1 45980423 45980523 100M CCTTAGTGAGGAGGCCCCTGCATAAGGGAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGG
1 1 45980443 45980543 100M CATAAAGGAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATA
1 1 45980450 45980550 100M GAATGAAATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAAC
1 1 45980457 45980557 100M ATGACAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGC
1 1 45980461 45980561 100M CAAGGAGTCTCTACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTC
1 1 45980465 45980565 100M GAGTCTATACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCA
1 1 45980472 45980572 100M TACAGATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTA
1 1 45980477 45980577 100M ATCAGGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACC
1 1 45980481 45980581 100M GGGCTCTAGATCTCTCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCAT
1 1 45980495 45980595 100M TCCAAATAAAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATG
1 1 45980503 45980603 100M AAAGGCTTTCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATAAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTA
1 1 45980511 45980611 100M TCAGCCAACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTG
1 1 45980518 45980618 100M ACTGGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAA
1 1 45980521 45980621 100M GGATACTTGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGG
1 1 45980524 45980624 100M TACTTGTCCTGATGACATACCTTAACGAGATGGCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAAT
1 1 45980528 45980628 100M TGTCCTGATGACATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTC
1 1 45980539 45980639 100M CATACCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAG
1 1 45980543 45980643 100M CCTGAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCT
1 1 45980546 45980646 100M GAACGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCT
1 1 45980549 45980649 100M CGAGATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGAGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGT
1 1 45980552 45980652 100M GATGCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTC
1 1 45980555 45980655 100M GCCTTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTA
1 1 45980558 45980658 100M TTCATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT
1 1 45980561 45980661 100M ATCAGCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGTGTA
1 1 45980562 45987525 96M45987530F4m ACAGCCTTTAAGACCACATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT GGTT
1 1 45980565 45980665 100M GCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGTGTATTGA
1 1 45980565 45987522 93M45987530F7m GCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT GGTTAGT
1 1 45980565 45987522 93M45987530F7m GCCTTTAAGACCCCATAATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT GGTTAGT
1 1 45980582 45987505 76M45987530F24m ATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTG
1 1 45980582 45987505 76M45987530F24m ATCCTGAGCAATGGTGCGCTTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTG
1 1 45980601 45984712 57M45987530F30m2774n13m TTCGGGTCTGATACCAAAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT GGGTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980617 45984696 41M45987530F30m2774n29m AAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980617 45984696 41M45987530F30m2774n29m AAGGAATGTTCATGGGTCCCAGTCCTCCTTGTTTCTTAGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980653 45984660 5M45987530F30m2774n65m TCGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980653 45984660 5M45987530F30m2774n65m TCGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984652 4M45987530F30m2781n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984652 4M45987530F30m2781n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980654 45984659 4M45987530F30m2774n66m CGGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGG GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45980655 45984658 3M45987530F30m2774n67m GGT GGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987537 45984656 38m2781n62m GTGTCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987534 45984660 35m2774n65m TCGGTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987531 45984650 32m2781n68m GTGGTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987528 45984647 29m2781n71m GTTAGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987525 45984651 26m2774n74m AGTTTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987522 45984648 23m2774n77m TTCTGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987519 45984638 20m2781n80m TGCGACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987516 45984635 17m2781n83m GACTTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987513 45984639 14m2774n86m TTGTGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987510 45984636 11m2774n89m TGTTGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987507 45984626 8m2781n92m TGGGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987504 45981441 5m2774n93m3189n2m GACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987501 45984627 2m2774n98m TG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987498 45987398 100m TGAGTGTGGGCAGTGCGGCCCCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTG
1 1 45987495 45987395 100m GTGTGGGCAGTGCGGCCCCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCGTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGG
1 1 45987491 45987391 100m GGGCAGTGCGGCCCCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGC
1 1 45987486 45987386 100m GTGCGGCCCCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGGGCTGTGA
1 1 45987483 45987383 100m CGGCCCCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGC
1 1 45987478 45987378 100m CCTGCGGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAG
1 1 45987473 45987373 100m GGAGTGAGGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGC
1 1 45987470 45987370 100m GTGAGGCGCGGCGCGTCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGG
1 1 45987466 45987366 100m GGCGCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGGCGGGGGA
1 1 45987463 45987363 100m GCGGCGCGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGGTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGC
1 1 45987460 45987360 100m GCGCGCCCTTCTTGCCTCTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCG
1 1 45987457 45987357 100m CGCCCTTCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGAAG
1 1 45987451 45987351 100m TCTTGCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAG
1 1 45987447 45987347 100m GCCTGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTG
1 1 45987444 45987344 100m TGTTGCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTT
1 1 45987440 45987340 100m GCCTCTTCCTCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGGAC
1 1 45987436 45987336 100m CTTCCCCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTG
1 1 45987431 45987331 100m TCCTCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCAC
1 1 45987428 45987328 100m TCCTGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCAGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACC
1 1 45987425 45987325 100m TGTCCGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCG
1 1 45987421 45987321 100m CGGGGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCN
1 1 45987418 45987318 100m GGCCCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGG
1 1 45987415 45987315 100m CCGCCCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCC
1 1 45987411 45987311 100m CCGCGCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCCCCCC
1 1 45987407 45984723 98m2584n2m GCTCGGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCCCCCCAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 45987403 45987303 100m GGGTGGGGGTGCTGTGATGCGTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCCCCCCACGTAGGT
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1 1 45987383 45984703 78m2580n22m GTGAGGCAGCCGGGGGAGGCCCGGAGTCCGAGACTGCTTGAGCGCTGCGCACACCCCTCTCGTGGGCCCCCCACGTAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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sapiens plasticity related gene 1 (LPPR4), mRNA
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plasticity related gene 1 (LPPR4) mRNA, encodes complete
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to Cavia porcellus phosphatidic acid phosphatase 2a (PAP2a)
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4 mRNA, complete cds
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partial cds
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complete sequence
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protein 1 mRNA, complete cds
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protein type 4 (LPPR4), mRNA
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protein type 4 (LOC103224382), mRNA
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protein type 4-like (LOC102144589), transcript variant
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Sbjct 1791 GGTGCTTATGTTTTCCTGAGTCTCCTCAGGGATGTGCACCAATTGTGAGG 1742
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protein type 4-like (LOC102144589), transcript variant
X1, mRNA
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protein type 4-like (LOC716103), mRNA
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Sbjct 1616 GGTGCTTATGTTTTCCTGAGTCTCCTCAGGGATGTGCACCAATTGTGAGG 1567
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1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC
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protein type 4 (LOC101050775), transcript
variant X2, mRNA
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protein type 4 (LOC101050775), transcript
variant X1, mRNA
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protein type 4 (LOC104665976), transcript variant
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protein type 4 (LOC104665976), transcript variant
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protein type 4 (LOC469389), mRNA
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type 4 (LOC100462043), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1876 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1925
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protein type 4-like (LOC490146), transcript variant
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protein type 4-like (LOC102144589), transcript variant
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Sbjct 2020 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 2069
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protein type 4-like (LOC102144589), transcript variant
X1, mRNA
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protein type 4-like, transcript variant 2 (LOC101375654),
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protein type 4-like, transcript variant 1 (LOC101375654),
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protein type 4-like (LOC100606282), mRNA
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protein type 4-like, transcript variant 2 (LOC101147038),
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Sbjct 1845 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1894
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protein type 4-like (LOC100478665), mRNA
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protein type 4-like (LOC716103), mRNA
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4 (LPPR4), transcript variant 1, mRNA
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sapiens plasticity related gene 1 (LPPR4), mRNA
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sapiens plasticity related gene 1 (LPPR4), mRNA
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gene for plasticity related gene 1, complete cds, without
stop codon, in Flexi system
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sapiens brain-specific phosphatidic acid phosphatase-like
protein 1 mRNA
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plasticity related gene 1 (LPPR4) mRNA, encodes complete
protein
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Sbjct 1901 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1950
>dbj|AK056665.1| Homo sapiens cDNA FLJ32103 fis, clone OCBBF2001210, weakly similar
to Cavia porcellus phosphatidic acid phosphatase 2a (PAP2a)
mRNA
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Sbjct 2032 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 2081
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4 mRNA, complete cds
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Sbjct 1973 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 2022
>dbj|AB007924.3| Homo sapiens mRNA for KIAA0455 protein, partial cds
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Sbjct 2021 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 2070
>emb|AL139425.8| Human DNA sequence from clone RP4-788L13 on chromosome 1p21.1-21.3,
complete sequence
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>gb|AF357013.1| Homo sapiens brain-specific phosphatidic acid phosphatase-like
protein 1 mRNA, complete cds
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Sbjct 1798 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1847
>emb|AL834390.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp761A0623 (from clone DKFZp761A0623)
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Sbjct 1538 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1587
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type 4 (LOC100968878), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1663 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCATCCAC 1712
>ref|XM_003808460.2| PREDICTED: Pan paniscus lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4 (LOC100968878), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1845 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCATCCAC 1894
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type 4 (LOC100968878), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2019 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCATCCAC 2068
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protein type 4-like (LOC102729831), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 1844 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATTCAGATCCCGTCCAC 1893
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protein type 4-like (LOC102729831), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 2018 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATTCAGATCCCGTCCAC 2067
>ref|XM_004752533.1| PREDICTED: Mustela putorius furo lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC101691312), transcript variant
X2, mRNA
ref|XM_004822280.1| PREDICTED: Mustela putorius furo lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC101691312), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 2059 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCATCCAC 2108
>ref|XM_004752532.1| PREDICTED: Mustela putorius furo lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC101691312), transcript variant
X1, mRNA
ref|XM_004822279.1| PREDICTED: Mustela putorius furo lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC101691312), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 2233 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCATCCAC 2282
>ref|XM_004420793.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like, transcript variant 2 (LOC101396598),
mRNA
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Sbjct 1841 GTTGAGGCTCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1890
>ref|XM_004420792.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like, transcript variant 1 (LOC101396598),
mRNA
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Sbjct 2015 GTTGAGGCTCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 2064
>gb|BC042963.1| Homo sapiens plasticity related gene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5287060),
partial cds
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Sbjct 1843 GTTGAGGCTCACACAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1892
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phosphatase-related protein type 4-like (LOC103007111), mRNA
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Sbjct 1825 GTTGAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCGTCATACAAATCCCGTCCAC 1874
>ref|XM_006053086.1| PREDICTED: Bubalus bubalis lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC102407503), mRNA
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Sbjct 1824 GTTGAGGCCCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1873
>ref|XM_006919553.1| PREDICTED: Pteropus alecto lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC102879352), transcript variant X2,
mRNA
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Sbjct 1687 GAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCATCCAC 1733
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protein type 4-like (LOC102879352), transcript variant X1,
mRNA
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Sbjct 1861 GAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCATCCAC 1907
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protein type 4-like (LOC102514265), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1684 GAGGCTCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1730
>ref|XM_006190929.1| PREDICTED: Camelus ferus lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC102514265), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2014 GAGGCTCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 2060
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type 4-like (LOC102269687), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1644 GTTGAGGCCCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1693
>ref|XM_005906507.1| PREDICTED: Bos mutus lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like (LOC102269687), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1821 GTTGAGGCCCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1870
>ref|XM_005678057.1| PREDICTED: Capra hircus lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like (LOC102179619), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1644 GTTGAGGCCCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1693
>ref|XM_005678056.1| PREDICTED: Capra hircus lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like (LOC102179619), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1863 GTTGAGGCCCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1912
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type 4-like (LOC513388), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1408 GTTGAGGCCCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1457
>ref|XM_003581971.2| PREDICTED: Bos taurus lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like (LOC513388), transcript variant X1, mRNA
ref|XM_003585864.2| PREDICTED: Bos taurus lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like (LOC513388), mRNA
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Sbjct 2045 GTTGAGGCCCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 2094
>ref|XM_005007825.1| PREDICTED: Cavia porcellus lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC100729034), mRNA
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Query 4 GAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 50
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Sbjct 2040 GAGGCTCACCCAGAGAACAACAGGCCCATCATCCAGATCCCGTCCAC 2086
>ref|XM_004002222.1| PREDICTED: Ovis aries lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like, transcript variant 2 (LOC101110549), mRNA
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Sbjct 1644 GTTGAGGCCCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1693
>ref|XM_004002221.1| PREDICTED: Ovis aries lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like, transcript variant 1 (LOC101110549), mRNA
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Sbjct 1821 GTTGAGGCCCACCCGGAGAACAACAGGCCCATCATACAGATCCCGTCCAC 1870
>ref|NM_001128199.1| Felis catus lipid phosphate phosphatase-related protein type
4 (LPPR4), mRNA
gb|EU661868.1| Felis catus plasticity related gene 1 (LPPR4) mRNA, complete
cds
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protein type 4-like (LOC102407503), mRNA
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protein type 4-like (LOC102345010), transcript variant
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protein type 4-like (LOC102345010), transcript variant
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protein type 4-like (LOC100606282), mRNA
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type 4-like, transcript variant 1 (LOC101110549), mRNA
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Sbjct 1761 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1712
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4 (LPPR4), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 1791 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1742
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4 (LPPR4), transcript variant 1, mRNA
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sapiens plasticity related gene 1 (LPPR4), mRNA
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Sbjct 1535 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1486
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sapiens plasticity related gene 1 (LPPR4), mRNA
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Sbjct 1588 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1539
>dbj|AB384482.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KA0455, Homo sapiens KIAA0455
gene for plasticity related gene 1, complete cds, without
stop codon, in Flexi system
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Sbjct 1816 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1767
>dbj|AK291369.1| Homo sapiens cDNA FLJ75364 complete cds, highly similar to Homo
sapiens brain-specific phosphatidic acid phosphatase-like
protein 1 mRNA
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Sbjct 1765 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1716
>gb|BC148348.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100015268, MGC:182963
plasticity related gene 1 (LPPR4) mRNA, encodes complete
protein
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Sbjct 1841 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1792
>dbj|AK056665.1| Homo sapiens cDNA FLJ32103 fis, clone OCBBF2001210, weakly similar
to Cavia porcellus phosphatidic acid phosphatase 2a (PAP2a)
mRNA
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Sbjct 1810 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1761
>gb|AF541281.1| Homo sapiens plasticity related gene 1 mRNA, complete cds
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Sbjct 1972 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1923
>gb|AY304518.1| Homo sapiens lipid phosphate phosphatase-related protein type
4 mRNA, complete cds
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Sbjct 1913 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1864
>gb|BC042963.1| Homo sapiens plasticity related gene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5287060),
partial cds
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Sbjct 1783 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1734
>dbj|AB007924.3| Homo sapiens mRNA for KIAA0455 protein, partial cds
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Sbjct 1961 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1912
>emb|AL139425.8| Human DNA sequence from clone RP4-788L13 on chromosome 1p21.1-21.3,
complete sequence
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Sbjct 14050 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 14001
>gb|AF357013.1| Homo sapiens brain-specific phosphatidic acid phosphatase-like
protein 1 mRNA, complete cds
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Sbjct 1738 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1689
>emb|AL834390.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp761A0623 (from clone DKFZp761A0623)
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Sbjct 1478 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1429
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protein type 4 (LPPR4), mRNA
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Sbjct 1960 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACGCCC 1911
>ref|XM_005906508.1| PREDICTED: Bos mutus lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like (LOC102269687), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1584 AGGAGACTGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1535
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type 4-like (LOC102269687), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1761 AGGAGACTGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1712
>ref|XM_005678057.1| PREDICTED: Capra hircus lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like (LOC102179619), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1584 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTACTTTGGAGGACACCC 1535
>ref|XM_005678056.1| PREDICTED: Capra hircus lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like (LOC102179619), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1803 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTACTTTGGAGGACACCC 1754
>ref|XM_005542622.1| PREDICTED: Macaca fascicularis lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC102144589), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 1960 AGGAGACCGTGCTGCCTTCCGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1911
>ref|XM_005542621.1| PREDICTED: Macaca fascicularis lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC102144589), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 1785 AGGAGACCGTGCTGCCTTCCGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1736
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type 4-like (LOC513388), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1348 AGGAGACTGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1299
>ref|XM_003581971.2| PREDICTED: Bos taurus lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like (LOC513388), transcript variant X1, mRNA
ref|XM_003585864.2| PREDICTED: Bos taurus lipid phosphate phosphatase-related protein
type 4-like (LOC513388), mRNA
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Sbjct 1985 AGGAGACTGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1936
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protein type 4-like (LOC716103), mRNA
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Sbjct 1785 AGGAGACCGTGCTGCCTTCCGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACACCC 1736
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type 4-like (LOC100158146), mRNA
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Sbjct 2181 AGGAGACCGTGCTGCCCTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACGCCC 2132
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protein type 4-like (LOC490146), transcript variant
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Sbjct 1772 AGGAGACCGTGCTACCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACGCCC 1723
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protein type 4-like (LOC101691312), transcript variant
X2, mRNA
ref|XM_004822280.1| PREDICTED: Mustela putorius furo lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC101691312), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 1999 AGGAGACTGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACGCCC 1950
>ref|XM_004752532.1| PREDICTED: Mustela putorius furo lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC101691312), transcript variant
X1, mRNA
ref|XM_004822279.1| PREDICTED: Mustela putorius furo lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC101691312), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 2173 AGGAGACTGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACGCCC 2124
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protein type 4-like, transcript variant 2 (LOC101319062),
mRNA
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Sbjct 1621 AGGAGACCGTACTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACGCCC 1572
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protein type 4-like, transcript variant 1 (LOC101319062),
mRNA
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Sbjct 1950 AGGAGACCGTACTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACGCCC 1901
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protein type 4-like, transcript variant 2 (LOC101147038),
mRNA
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Sbjct 1785 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTACTTTGGAGTACACCC 1736
>ref|XM_004026186.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like, transcript variant 1 (LOC101147038),
mRNA
Length=5024
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Sbjct 1965 AGGAGACCGTGCTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTACTTTGGAGTACACCC 1916
>ref|XM_007120572.1| PREDICTED: Physeter catodon lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC102977960), transcript variant X2,
mRNA
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Sbjct 1621 AGGAGACTGTACTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACGCCC 1572
>ref|XM_007120571.1| PREDICTED: Physeter catodon lipid phosphate phosphatase-related
protein type 4-like (LOC102977960), transcript variant X1,
mRNA
Length=2435
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Sbjct 1950 AGGAGACTGTACTGCCTTCAGTGTTCTTGGGGCTGCTTTGGAGGACGCCC 1901
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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gene for plasticity related gene 1, complete cds, without
stop codon, in Flexi system
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sapiens brain-specific phosphatidic acid phosphatase-like
protein 1 mRNA
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plasticity related gene 1 (LPPR4) mRNA, encodes complete
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>dbj|AK056665.1| Homo sapiens cDNA FLJ32103 fis, clone OCBBF2001210, weakly similar
to Cavia porcellus phosphatidic acid phosphatase 2a (PAP2a)
mRNA
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4 mRNA, complete cds
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>gb|BC042963.1| Homo sapiens plasticity related gene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5287060),
partial cds
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Sbjct 2159 TGCGGAGAAAGGGCAATATCATTCTAATCCCTGAAAGAAGCAACAGCCCC 2208
>dbj|AB007924.3| Homo sapiens mRNA for KIAA0455 protein, partial cds
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>emb|AL139425.8| Human DNA sequence from clone RP4-788L13 on chromosome 1p21.1-21.3,
complete sequence
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protein 1 mRNA, complete cds
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Sbjct 2114 TGCGGAGAAAGGGCAATATCATTCTAATCCCTGAAAGAAGCAACAGCCCC 2163
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Sbjct 1854 TGCGGAGAAAGGGCAATATCATTCTAATCCCTGAAAGAAGCAACAGCCCC 1903
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protein type 4 (LOC469389), mRNA
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Sbjct 2348 TGCGGAGAAAGGGCAACATCATTCTAATCCCTGAAAGAAGCAACAGCCCC 2397
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type 4 (LOC100462043), transcript variant X2, mRNA
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type 4 (LOC100462043), transcript variant X1, mRNA
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type 4 (LOC100968878), transcript variant X3, mRNA
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type 4 (LOC100968878), transcript variant X2, mRNA
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protein type 4 (LPPR4), mRNA
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protein type 4-like (LOC100606282), mRNA
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protein type 4 (LOC104665976), transcript variant
X2, mRNA
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protein type 4 (LOC104665976), transcript variant
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type 4 (LOC101000306), mRNA
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Sbjct 2336 TGCGGAGAAAGGGCAACATCATTCTAATCCCTGAAAGAAGCAACAGCCC 2384
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protein type 4-like (LOC102144589), transcript variant
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protein type 4-like (LOC102144589), transcript variant
X1, mRNA
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protein type 4-like (LOC716103), mRNA
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protein type 4-like, transcript variant 1 (LOC101147038),
mRNA
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Query 4 GGAGAAAGGGCAATATCATTCTAATCCCTGAAAGAAGCAACAGCCCC 50
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Lambda K H
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>ref|NW_001838594.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188410, whole genome shotgun sequence
gb|DS486078.1| Homo sapiens SCAF_1103279188410 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>gb|CH471122.1| Homo sapiens 211000035831403 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
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2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1527 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1576
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1506 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1555
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2 (MAN1A2), mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1538 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1587
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 438 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 487
>ref|XM_007977411.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus mannosidase, alpha, class 1A,
member 2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1445 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1494
>ref|XM_006710302.1| PREDICTED: Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1516 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1565
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 511 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 560
>ref|XM_005542190.1| PREDICTED: Macaca fascicularis mannosidase, alpha, class 1A,
member 2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1271 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1320
>ref|XM_005542189.1| PREDICTED: Macaca fascicularis mannosidase, alpha, class 1A,
member 2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1388 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1437
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member 2 (Man1a2), mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1379 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1428
>ref|XM_004885643.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber mannosidase, alpha, class 1A,
member 2 (Man1a2), transcript variant X4, mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1368 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1417
>ref|XM_004885642.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber mannosidase, alpha, class 1A,
member 2 (Man1a2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1368 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1417
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1368 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1417
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member 2 (Man1a2), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1368 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1417
>ref|XM_003267854.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys mannosidase, alpha, class 1A,
member 2 (MAN1A2), mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 967 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1016
>ref|XM_004026429.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla mannosidase, alpha, class
1A, member 2 (MAN1A2), mRNA
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Sbjct 1461 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1510
>ref|NM_001261288.1| Macaca mulatta mannosidase, alpha, class 1A, member 2 (MAN1A2),
mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1403 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1452
>dbj|AB385126.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5584, Homo sapiens MAN1A2
gene for mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase IB,
complete cds, without stop codon, in Flexi system
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Sbjct 734 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 783
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mRNA
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Sbjct 1446 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1495
>dbj|AK023308.1| Homo sapiens cDNA FLJ13246 fis, clone OVARC1000682, highly similar
to PROCESSING ALPHA-1,2-MANNOSIDASE (EC 3.2.1.-)
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 613 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 662
>gb|BC052954.1| Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member 2, mRNA (cDNA
clone IMAGE:5264139), partial cds
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1462 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1511
>gb|BC063300.1| Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member 2, mRNA (cDNA
clone MGC:71683 IMAGE:5263292), complete cds
Length=5054
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1444 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1493
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sequence
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Sbjct 56049 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 56098
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Sbjct 1245 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1294
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Sbjct 144 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 193
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2 (Man1a2), mRNA
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Sbjct 1308 AATTCCTAGATGGGCAAAGGTGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1357
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1A, member 2 (MAN1A2), mRNA
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Sbjct 1450 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAATCTTGATTTCAGTGTG 1499
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2 (MAN1A2), mRNA
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Sbjct 777 AATTCCTAGATGGGCAAAAATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 826
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member 2 (Man1a2), transcript variant X2, misc_RNA
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Sbjct 1278 AATTCCTAGATGGGCAAAGGTGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1327
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member 2 (Man1a2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1278 AATTCCTAGATGGGCAAAGGTGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1327
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class 1A, member 2 (MAN1A2), mRNA
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Sbjct 1270 AATTTCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTAGATTTCAGTGTG 1319
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2 (MAN1A2), mRNA
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Sbjct 1414 AATTTCTAGATGGGCAAAAATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1463
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2 (MAN1A2), partial mRNA
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Sbjct 90 AATTCCGAGATGGGCAAAAATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 139
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class 1A, member 2 (Man1a2), mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1357 AATTCATGGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1406
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2 (MAN1A2), mRNA
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Sbjct 1260 AATTCCGAGATGGGCAAAAATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1309
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2 (MAN1A2), mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1147 AATTCATAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTTAGTGTG 1196
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IB-like (LOC100066466), mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1305 AATTCCGAGATGGGCAAAAATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1354
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class 1A, member 2 (Man1a2), mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 799 AATTTCTAGATGGACAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 848
>ref|XM_004420607.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum mannosidase, alpha, class
1A, member 2 (MAN1A2), mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1436 AATTCCGAGATGGGCAAAAATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1485
>ref|NM_001106452.1| Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 1A, member 2 (Man1a2),
mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1088 AATTCATGGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1137
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IB-like (LOC103603485), mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGT 49
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Sbjct 1297 AATTCCAAGATGGACAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGT 1345
>ref|XM_004667515.1| PREDICTED: Jaculus jaculus mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (Man1a2), mRNA
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Query 8 AGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 737 AGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 779
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member 2 (MAN1A2), mRNA
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Query 3 TTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1460 TTCCGAGATGGGCAAAAATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1507
>ref|XM_004771062.1| PREDICTED: Mustela putorius furo mannosidase, alpha, class 1A,
member 2 (MAN1A2), mRNA
Length=8444
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469 TTCCGAGATGGGCAAAAATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1516
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2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1251 AATTCCGAGATGGGCAGAAATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1300
>ref|XM_008710367.1| PREDICTED: Ursus maritimus mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
Length=4831
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1251 AATTCCGAGATGGGCAGAAATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1300
>ref|XM_007613628.1| PREDICTED: Cricetulus griseus mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (Man1a2), mRNA
Length=5827
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1199 AATTCATGGATGGGCAAAGGTGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1248
>ref|XM_003500612.2| PREDICTED: Cricetulus griseus mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (Man1a2), mRNA
Length=5764
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1140 AATTCATGGATGGGCAAAGGTGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1189
>ref|XM_005357099.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster mannosidase, alpha, class 1A,
member 2 (Man1a2), transcript variant X2, mRNA
Length=4485
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1111 AATTCATGGATGGGCAGAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1160
>ref|XM_005357098.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster mannosidase, alpha, class 1A,
member 2 (Man1a2), transcript variant X1, mRNA
Length=4557
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 1183 AATTCATGGATGGGCAGAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 1232
>ref|XM_004714870.1| PREDICTED: Echinops telfairi mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (MAN1A2), mRNA
Length=2271
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 50
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Sbjct 725 AATTCCGAGATGGGAAAAAATGGATTGAAGACAACCTTGATTTCAGTGTG 774
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Length=1494
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Query 1 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGAT 41
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Sbjct 1454 AATTCCTAGATGGGCAAAGATGGATTGAAGACAACCTTGAT 1494
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG
>ref|XM_009428373.1| PREDICTED: Pan troglodytes mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
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Sbjct 1105 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 1154
>ref|XM_513685.4| PREDICTED: Pan troglodytes mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
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Sbjct 1105 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 1154
>ref|XM_009245736.1| PREDICTED: Pongo abelii mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (MAN1A2), mRNA
Length=5559
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
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Sbjct 355 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 404
>ref|XM_003806289.2| PREDICTED: Pan paniscus mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (MAN1A2), mRNA
Length=8656
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
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Sbjct 1116 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 1165
>ref|XM_006710302.1| PREDICTED: Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
Length=8320
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
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Sbjct 1094 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 1143
>ref|XM_004026429.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla mannosidase, alpha, class
1A, member 2 (MAN1A2), mRNA
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
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Sbjct 1039 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 1088
>dbj|AB385126.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5584, Homo sapiens MAN1A2
gene for mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase IB,
complete cds, without stop codon, in Flexi system
Length=1940
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 361
>dbj|AK307842.1| Homo sapiens cDNA, FLJ97790
Length=1494
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 1081
>ref|NM_006699.3| Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member 2 (MAN1A2),
mRNA
Length=5388
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
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Sbjct 1024 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 1073
>gb|BC052954.1| Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member 2, mRNA (cDNA
clone IMAGE:5264139), partial cds
Length=6263
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
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Sbjct 1040 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 1089
>gb|BC063300.1| Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member 2, mRNA (cDNA
clone MGC:71683 IMAGE:5263292), complete cds
Length=5054
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
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Sbjct 1022 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 1071
>emb|AL358072.21| Human DNA sequence from clone RP11-188D8 on chromosome 1, complete
sequence
Length=129725
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
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Sbjct 43453 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 43502
>gb|AF027156.1|AF027156 Homo sapiens alpha 1,2-mannosidase IB mRNA, complete cds
Length=2792
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAAGAGGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 50
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2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Gapped
Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTATCAGGAGAGGAG
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1A, member 2 (MAN1A2), mRNA
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2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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IB-like (LOC101012649), mRNA
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 592 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTATCAGGAGAGGAG 641
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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1A, member 2 (MAN1A2), mRNA
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Sbjct 1542 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTATCAGGAGAGGAG 1591
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mRNA
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Sbjct 1484 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTATCAGGAGAGGAG 1533
>dbj|AB385126.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5584, Homo sapiens MAN1A2
gene for mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase IB,
complete cds, without stop codon, in Flexi system
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mRNA
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Sbjct 1527 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTATCAGGAGAGGAG 1576
>dbj|AK023308.1| Homo sapiens cDNA FLJ13246 fis, clone OVARC1000682, highly similar
to PROCESSING ALPHA-1,2-MANNOSIDASE (EC 3.2.1.-)
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Sbjct 694 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTATCAGGAGAGGAG 743
>dbj|AK001970.1| Homo sapiens cDNA FLJ11108 fis, clone PLACE1005804, highly similar
to Mannosyl-oligosaccharide1,2-alpha-mannosidase IB (EC
3.2.1.113)
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>gb|BC052954.1| Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member 2, mRNA (cDNA
clone IMAGE:5264139), partial cds
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Sbjct 1543 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTATCAGGAGAGGAG 1592
>gb|BC063300.1| Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member 2, mRNA (cDNA
clone MGC:71683 IMAGE:5263292), complete cds
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>emb|AL358072.21| Human DNA sequence from clone RP11-188D8 on chromosome 1, complete
sequence
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IB-like (LOC103603485), mRNA
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member 2 (MAN1A2), mRNA
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Sbjct 1336 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTTTCAGGAGAGGAG 1385
>ref|XM_007461625.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (MAN1A2), mRNA
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Sbjct 1329 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTTTCAGGAGAGGAG 1378
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class 1A, member 2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1649 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTTTCAGGAGAGGAG 1698
>ref|XM_007169316.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni mannosidase, alpha,
class 1A, member 2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1649 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTTTCAGGAGAGGAG 1698
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2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1425 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTTTCAGGAGAGGAG 1474
>ref|XM_007109150.1| PREDICTED: Physeter catodon mannosidase, alpha, class 1A, member
2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1425 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTTTCAGGAGAGGAG 1474
>ref|XM_004380347.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris mannosidase, alpha,
class 1A, member 2 (MAN1A2), mRNA
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Sbjct 1334 TTCGATTTATTGGAGGCCTACTTGCAGCATATTACCTTTCAGGAGAGGAG 1383
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mRNA
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>gb|BC063300.1| Homo sapiens mannosidase, alpha, class 1A, member 2, mRNA (cDNA
clone MGC:71683 IMAGE:5263292), complete cds
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>emb|AL358072.21| Human DNA sequence from clone RP11-188D8 on chromosome 1, complete
sequence
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class 1A, member 2 (MAN1A2), mRNA
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IB-like (LOC101012649), mRNA
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2 (Man1a2), mRNA
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IB-like (LOC103603485), mRNA
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X3, mRNA
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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member 2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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2 (MAN1A2), mRNA
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member 2 (MAN1A2), mRNA
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2 (MAN1A2), mRNA
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Sbjct 959 GGAAGAAGAAGAACGTCTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 1008
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mRNA
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IB-like (LOC103259417), partial mRNA
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member 2 (MAN1A2), mRNA
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>ref|XM_004380347.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris mannosidase, alpha,
class 1A, member 2 (MAN1A2), mRNA
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1A, member 2 (MAN1A2), mRNA
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2 (MAN1A2), mRNA
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member 2 (MAN1A2), mRNA
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member 2 (MAN1A2), mRNA
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2 (MAN1A2), mRNA
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class 1A, member 2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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(MAN1A2), mRNA
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member 2 (MAN1A2), transcript variant 2, misc_RNA
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Sbjct 854 GGAAGAAGAAGAACGTCTGCGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 903
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member 2 (MAN1A2), transcript variant 1, mRNA
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2 (MAN1A2), mRNA
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>dbj|AK238362.1| Sus scrofa mRNA, clone:TCH010092A01, expressed in trachea
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Sbjct 984 GGAAGAAGAAGAACGTTTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 1033
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2 (MAN1A2), transcript variant X2, mRNA
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2 (MAN1A2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 923 GAAGAAGAAGAACGTTTGAGAAATAAAATTCGAGCTGATCATGAGAAGG 971
>ref|XM_008057327.1| PREDICTED: Tarsius syrichta mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase
IB (LOC103259674), mRNA
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3, transcript variant 3 (CELF3), mRNA
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3, transcript variant 2 (CELF3), mRNA
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3, transcript variant 1 (CELF3), mRNA
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MGC:57297 IMAGE:4820737), complete cds
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sequence
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cds
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cds
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member 3 (CELF3), transcript variant X2, mRNA
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>ref|XM_003941923.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis CUGBP, Elav-like family
member 3 (CELF3), transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X7, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 11 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 60
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 11 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 60
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 11 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 60
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3 (CELF3), mRNA
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Sbjct 24 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 73
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 43 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 92
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 166 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 215
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transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 50
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Sbjct 166 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 215
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variant 5, mRNA
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variant 4, mRNA
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Sbjct 165 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 214
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variant 3, mRNA
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Sbjct 165 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 214
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variant 1, mRNA
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Sbjct 165 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 214
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3, transcript variant 4 (CELF3), mRNA
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Sbjct 171 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 220
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3, transcript variant 3 (CELF3), mRNA
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Sbjct 171 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 220
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Sbjct 171 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 220
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3, transcript variant 1 (CELF3), mRNA
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Sbjct 171 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 220
>gb|AC200334.3| Pongo abelii BAC clone CH276-308M5 from chromosome 1, complete
sequence
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Sbjct 79000 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 79049
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Sbjct 140 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 189
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sequence
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Sbjct 39031 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 38982
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Sbjct 1049 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 1098
>gb|AY165003.1| Homo sapiens CUG-BP and ETR-3 like factor 3 (CELF3) mRNA, complete
cds
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Sbjct 159 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCCATC 208
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3 (CELF3), transcript variant X12, mRNA
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Sbjct 28 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGAAGCCCTGCCGCCATC 77
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3 (CELF3), transcript variant X11, mRNA
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Sbjct 30 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGAAGCCCTGCCGCCATC 79
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3 (CELF3), transcript variant X10, mRNA
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Sbjct 140 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGAAGCCCTGCCGCCATC 189
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3 (CELF3), transcript variant X9, mRNA
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Sbjct 159 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGAAGCCCTGCCGCCATC 208
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3 (CELF3), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 6 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGAAGCCCTGCCGCCATC 55
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3 (CELF3), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 6 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGAAGCCCTGCCGCCATC 55
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3 (CELF3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 6 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGAAGCCCTGCCGCCATC 55
>ref|XM_005541862.1| PREDICTED: Macaca fascicularis CUGBP, Elav-like family member
3 (CELF3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 6 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGAAGCCCTGCCGCCATC 55
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3 (Celf3), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 153 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCCGGAGCCCTGCCGCCATC 202
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3 (Celf3), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 153 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCCGGAGCCCTGCCGCCATC 202
>ref|XM_005414559.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera CUGBP, Elav-like family member
3 (Celf3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 153 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCCGGAGCCCTGCCGCCATC 202
>ref|XM_003800364.1| PREDICTED: Otolemur garnettii CUGBP, Elav-like family member
3 (CELF3), mRNA
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Sbjct 168 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCCGGAGCCCTGCCGCCATC 217
>gb|AC238858.3| Chlorocebus aethiops BAC clone CH252-182C24 from chromosome 1,
complete sequence
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Sbjct 52910 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGAAGCCCTGCCGCCATC 52861
>ref|XM_004436022.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum CUGBP, Elav-like family
member 3, transcript variant 1 (CELF3), mRNA
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Query 1 CTGAAGGGGGGCGGCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCC 47
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Sbjct 159 CTGAAGGGGGGCGTCAGGGCAAAAGGGACCCCTGGAGCCCTGCCGCC 205
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 126708933 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 126708982
>gb|CH003448.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CACTGTA-GCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 126525774 CACTGTAGGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 126525824
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT
>ref|NC_000001.11| Homo sapiens chromosome 1, GRCh38 Primary Assembly
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Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 153670197 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 153670148
>ref|NT_004487.20| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR1_CTG31
gb|GL000016.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 10485610 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 10485561
>ref|NC_018912.2| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001609.2| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 155038662 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 155038613
>ref|NW_004929293.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150077.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 10485949 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 10485900
>gb|KE141256.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold174, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 3933432 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 3933383
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Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 125005177 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 125005128
>gb|GL583120.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_140, whole genome
shotgun sequence
Length=5737141
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 1976650 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 1976699
>gb|DS990787.1| Homo sapiens SCAF_1112675837283 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 3823776 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 3823727
>gb|CH003448.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=221336263
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 126530696 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 126530647
>ref|NW_001838529.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188338, whole genome shotgun sequence
gb|DS486149.1| Homo sapiens SCAF_1103279188338 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 3823840 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 3823791
>gb|CH471121.2| Homo sapiens 211000035830426 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=11514521
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Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3750680 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 3750631
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000462.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 125006009 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 125005960
>gb|CM000252.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=222388987
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Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
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Sbjct 126713854 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 126713805
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA
>ref|XM_010364784.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana interleukin enhancer binding
factor 2 (ILF2), mRNA
Length=1635
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 646 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 597
>ref|XM_001142785.4| PREDICTED: Pan troglodytes interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), mRNA
Length=1642
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 620 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 571
>ref|XM_009243848.1| PREDICTED: Pongo abelii interleukin enhancer binding factor 2
(ILF2), transcript variant X1, mRNA
Length=1671
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 645 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 596
>ref|XM_003892687.2| PREDICTED: Papio anubis interleukin enhancer binding factor 2
(ILF2), mRNA
Length=1643
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 569
>ref|XM_003817148.2| PREDICTED: Pan paniscus interleukin enhancer binding factor 2
(ILF2), mRNA
Length=1661
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 596
>gb|KJ891471.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00865 ILF2
gene, encodes complete protein
Length=1302
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 535
>ref|XM_007977048.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), transcript variant X3, mRNA
Length=1440
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 547
>ref|XM_007977047.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), transcript variant X2, mRNA
Length=1625
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 555
>ref|XM_007977046.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), transcript variant X1, mRNA
Length=1617
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 547
>ref|XR_492921.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus interleukin enhancer-binding factor
2 pseudogene (LOC103221234), misc_RNA
Length=1562
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 531
>ref|XM_005541757.1| PREDICTED: Macaca fascicularis interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), transcript variant X3, mRNA
Length=1656
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 588
>ref|XM_005541756.1| PREDICTED: Macaca fascicularis interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), transcript variant X2, mRNA
Length=1637
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 569
>ref|XM_005541755.1| PREDICTED: Macaca fascicularis interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), transcript variant X1, mRNA
Length=1601
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 533
>ref|XM_004093136.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys interleukin enhancer binding factor
2, 45kDa (ILF2), mRNA
Length=1787
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 486
>ref|XM_004026821.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla interleukin enhancer binding
factor 2, 45kDa (ILF2), mRNA
Length=2341
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 573
>ref|NM_001267809.1| Homo sapiens interleukin enhancer binding factor 2 (ILF2), transcript
variant 2, mRNA
Length=1953
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 595
>ref|NM_004515.3| Homo sapiens interleukin enhancer binding factor 2 (ILF2), transcript
variant 1, mRNA
Length=1934
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 625 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 576
>ref|NM_001266173.1| Macaca mulatta interleukin enhancer binding factor 2, 45kDa (ILF2),
mRNA
Length=1549
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 607 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 558
>dbj|AK305669.1| Pan troglodytes mRNA for interleukin enhancer-binding factor
2, complete cds, clone: PtsC-34-5_B06
Length=2018
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 906 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 857
>gb|HQ322262.1| Homo sapiens cell-line BEAS-2B NF45 mRNA, complete cds
Length=1173
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 519 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 470
>gb|HQ322261.1| Homo sapiens cell-line A549 NF45 mRNA, complete cds
Length=1173
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 519 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 470
>dbj|AB528994.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KE0931, Homo sapiens ILF2
gene for interleukin enhancer binding factor 2, 45kDa, without
stop codon, in Flexi system
Length=1187
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 528 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 479
>dbj|AK302214.1| Homo sapiens cDNA FLJ51660 complete cds, highly similar to Interleukin
enhancer-binding factor 2
Length=1361
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 588 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 539
>dbj|AK313364.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93892, Homo sapiens interleukin enhancer
binding factor 2, 45kDa (ILF2),mRNA
Length=1238
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 535
>dbj|AK310615.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17657
Length=1019
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 934 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 885
>gb|AC192200.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-51C10 from chromosome 1, complete
sequence
Length=180611
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165188 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 165237
>gb|DQ977452.1| Pan troglodytes ILF2 gene, partial sequence
Length=4668
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 2708 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 2659
>gb|DQ977157.1| Macaca nemestrina ILF2 gene, partial sequence
Length=2676
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 1843 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 1794
>gb|DQ894555.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009015; FLH176352.01L;
RZPDo839C05121D interleukin enhancer binding factor
2, 45kDa (ILF2) gene, encodes complete protein
Length=1213
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 541 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 492
>gb|DQ891378.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004008; FLH176356.01X; RZPDo839C05122D
interleukin enhancer binding factor 2, 45kDa (ILF2)
gene, encodes complete protein
Length=1213
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 541 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 492
>gb|DQ977300.1| Pan paniscus ILF2 gene, partial sequence
Length=4651
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 2722 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 2673
>gb|DQ976567.1| Gorilla gorilla ILF2 gene, partial sequence
Length=4274
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 2282 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 2233
>gb|BC000382.2| Homo sapiens interleukin enhancer binding factor 2, 45kDa, mRNA
(cDNA clone MGC:8391 IMAGE:2820505), complete cds
Length=1587
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 550 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 501
>dbj|AK223326.1| Homo sapiens mRNA for interleukin enhancer binding factor 2 variant,
clone: TMS08247
Length=1580
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Sbjct 545 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 496
>emb|AL592150.7| Human DNA sequence from clone XX-0780 on chromosome 1q21.1-21.3
Contains the SNAPAP gene for SNAP-associated protein and
the 3' end of the ILF2 gene for interleukin enhancer binding
factor 2, 45kDa, complete sequence
Length=15450
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 15340 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 15389
>emb|AL713889.19| Human DNA sequence from clone RP11-354A16 on chromosome 1, complete
sequence
Length=54184
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Sbjct 1890 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 1939
>ref|NM_001132083.1| Pongo abelii interleukin enhancer binding factor 2 (ILF2), mRNA
emb|CR858754.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469J1839 (from clone DKFZp469J1839)
Length=1692
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 526 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 477
>ref|NM_001135265.1| Pongo abelii DKFZP469C1132 protein (DKFZP469C1132), mRNA
emb|CR857165.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469C1132 (from clone DKFZp469C1132)
Length=1652
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 611 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 562
>gb|AY099265.1| Homo sapiens interleukin enhancer binding factor 2 (ILF2) gene,
complete cds
Length=8924
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Sbjct 5688 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 5639
>gb|AF113702.1|AF113702 Homo sapiens clone FLC1353 PRO3063 mRNA, complete cds
Length=1628
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 592 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 543
>gb|U10323.1|HSU10323 Human nuclear factor NF45 mRNA, complete cds
Length=1552
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 558 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 509
>ref|XM_010329638.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis interleukin enhancer
binding factor 2 (ILF2), transcript variant X2, mRNA
Length=1607
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 618 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 569
>ref|XM_003941877.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis interleukin enhancer
binding factor 2 (ILF2), transcript variant X1, mRNA
Length=1635
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 646 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 597
>ref|XM_003735130.2| PREDICTED: Callithrix jacchus interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), mRNA
Length=1937
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Sbjct 715 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 666
>ref|XR_087411.3| PREDICTED: Callithrix jacchus interleukin enhancer-binding factor
2 pseudogene (LOC100408364), misc_RNA
Length=1465
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 406 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 357
>ref|XM_008567612.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus interleukin enhancer binding
factor 2 (ILF2), mRNA
Length=1634
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 620 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 571
>ref|XM_008058009.1| PREDICTED: Tarsius syrichta interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), mRNA
Length=1635
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 620 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 571
>ref|XM_007458041.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), transcript variant X2, mRNA
Length=1892
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 645 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 596
>ref|XM_007458040.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), transcript variant X1, mRNA
Length=1873
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 626 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 577
>ref|XM_007178545.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni interleukin enhancer
binding factor 2 (ILF2), mRNA
Length=1622
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 600 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 551
>ref|XM_007130262.1| PREDICTED: Physeter catodon interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), mRNA
Length=1633
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 605 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 556
>ref|XM_006159817.1| PREDICTED: Tupaia chinensis interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), mRNA
Length=1667
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 687 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTCGTCAGCA 638
>ref|XM_004317336.1| PREDICTED: Tursiops truncatus interleukin enhancer binding factor
2, transcript variant 2 (ILF2), mRNA
Length=1899
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 642 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 593
>ref|XM_004317335.1| PREDICTED: Tursiops truncatus interleukin enhancer binding factor
2, transcript variant 1 (ILF2), mRNA
Length=1880
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 623 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 574
>ref|XM_004284703.1| PREDICTED: Orcinus orca interleukin enhancer binding factor 2,
transcript variant 2 (ILF2), mRNA
Length=1901
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 645 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 596
>ref|XM_004284702.1| PREDICTED: Orcinus orca interleukin enhancer binding factor 2,
transcript variant 1 (ILF2), mRNA
Length=1882
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 626 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 577
>ref|XR_012925.2| PREDICTED: Macaca mulatta interleukin enhancer-binding factor
2-like (LOC707106), miscRNA
Length=1632
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 592 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 543
>gb|DQ976774.1| Lagothrix lagotricha ILF2 (ILF2) gene, partial cds
Length=2056
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1203 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 1154
>gb|DQ976632.1| Ateles geoffroyi ILF2 (ILF2) gene, partial cds
Length=2610
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 1739 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 1690
>dbj|AB169557.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QflA-12847, similar to
human interleukin enhancer binding factor 2, 45kDa (ILF2),mRNA,
RefSeq: NM_004515.2
Length=1624
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
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Sbjct 587 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 538
>ref|XR_746186.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis interleukin enhancer-binding
factor 2 pseudogene (LOC101042838), misc_RNA
Length=864
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 349 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTTAGCA 300
>ref|XM_008855337.1| PREDICTED: Nannospalax galili interleukin enhancer binding factor
2 (Ilf2), mRNA
Length=2140
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 611 CACAGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTGGTCAGCA 562
>ref|XM_006895874.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii interleukin enhancer binding
factor 2 (ILF2), mRNA
Length=1596
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 585 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTAGTCAGCA 536
>ref|XM_005331266.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus interleukin enhancer
binding factor 2 (Ilf2), mRNA
Length=1689
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 620 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAACCAGTTTCATTGGTCAGCA 571
>ref|XM_004619239.1| PREDICTED: Sorex araneus interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), mRNA
Length=1167
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 510 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCATTAGTCAGCA 461
>ref|XR_011149.2| PREDICTED: Macaca mulatta interleukin enhancer-binding factor
2-like (LOC698228), miscRNA
Length=1167
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGT 45
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACCGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGT 475
>ref|XM_005411438.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera interleukin enhancer binding factor
2 (Ilf2), transcript variant X2, mRNA
Length=1544
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 541 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAACCAGTTTCATTAGTCAGCA 492
>ref|XM_005411437.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera interleukin enhancer binding factor
2 (Ilf2), transcript variant X1, mRNA
Length=1605
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 602 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAACCAGTTTCATTAGTCAGCA 553
>ref|XM_003475365.2| PREDICTED: Cavia porcellus interleukin enhancer binding factor
2 (Ilf2), mRNA
Length=1419
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 604 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAACCAGTTTCATTAGTCAGCA 555
>ref|XM_004871424.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber interleukin enhancer binding
factor 2 (Ilf2), mRNA
Length=1616
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 611 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAACCAGTTTCATTAGTCAGCA 562
>ref|XM_004892130.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber interleukin enhancer binding
factor 2 (Ilf2), mRNA
Length=1488
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 483 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAACCAGTTTCATTAGTCAGCA 434
>ref|XM_004714735.1| PREDICTED: Echinops telfairi interleukin enhancer binding factor
2 (ILF2), mRNA
Length=897
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 618 CACTGTGGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCACTGGTCAGCA 569
>ref|XM_004629950.1| PREDICTED: Octodon degus interleukin enhancer binding factor
2 (Ilf2), mRNA
Length=829
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 538 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAACCAGTTTCATTAGTCAGCA 489
>ref|XR_160065.2| PREDICTED: Papio anubis interleukin enhancer-binding factor 2
pseudogene (LOC101022880), misc_RNA
Length=1741
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTG 43
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 CACCGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTG 622
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT
>ref|XM_004475040.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus interleukin enhancer-binding
factor 2-like (LOC101429174), mRNA
Length=548
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCTTTTAGCATCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 39 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTGCCAGTTTTTAGCATCT 88
>gb|DQ977300.1| Pan paniscus ILF2 gene, partial sequence
Length=4651
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCT 40
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGGGTGAGTACCAGCT 316
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
1 1 153637411 153637511 100M AAAATTCCA
1 1 153637416 153637516 100M AAAATTCCACTAGC
1 1 153637421 153637521 100M AAAATTCCACTAGCAAGCT
1 1 153637424 153637524 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGAT
1 1 153637427 153637527 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGATAAA
1 1 153637433 153637533 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGATAAACTATTT
1 1 153637436 153637536 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGATAAACTATTTCCA
1 1 153637444 153637544 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGATAAACTATTTCCAAATTACAG
1 1 153637447 153637547 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGATAAACTATTTCCAAATTACAGAGG
1 1 153637454 153637554 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGATAAACTATTTCCAAATTACAGAGGGAGAGAG
1 1 153637473 153637573 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGATAAACTATTTCCAAATTACAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCT
1 1 153637477 153637577 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGATAAACTATTTCCAAATTACAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGT
1 1 153637483 153637583 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGATAAACTATTTCCAAATTACAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCA
1 1 153637488 153637588 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGATAAACTATTTCCAAATTACAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCC
1 1 153637501 153637601 100M AAAATTCCACTAGCAAGCTGATAAACTATTTCCAAATTACAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCAT
1 1 153637504 153637604 100M AATTCCGCTAGCAAGCTGATAAACTATTTCCAAATTACAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAACCCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTG
1 1 153637509 153637609 100M CACTAGCAAGCTGATAAACTATTTCCAAATTACAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATA
1 1 153637515 153637615 100M CAAGCTGATAAACTATTTCCAAATTACAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACA
1 1 153637518 153637618 100M GCTGATAAACTATTTCCAAATTGCAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAAC
1 1 153637523 153637623 100M TAAACTATTTCCAAATTACAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAACTAAGT
1 1 153637532 153637632 100M TCCAAATTACAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAGCTAAGTAAACTAAAC
1 1 153637535 153637635 100M AAATTACAGAGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAGCTAAGTAAACTAAACAGC
1 1 153637544 153637644 100M AGGGAGAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAGCTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACC
1 1 153637549 153637649 100M GAGAGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAACTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACCATGTT
1 1 153637552 153637652 100M AGCAAAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAGCTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACCATGTTTTG
1 1 153637556 153637656 100M AAGTTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAGCTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACCATGTTTTGAATA
1 1 153637559 153637659 100M TTCAGAATAAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAACTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACCATGTTTTGAATATCC
1 1 153637567 153637667 100M AAACCTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAACTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACCATGTTTTGAATATCCCCTAAATT
1 1 153637571 153637671 100M CTAAGTTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAACTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACAATGTTTTGAATATCCCCTAAATTTTCC
1 1 153637576 153637676 100M TTCTTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAGCTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACCATGTTTTGAATATCCCCTAAATTTTCCAGCAA
1 1 153637579 153637679 100M TTCAATTCCCAGGAAGCTGCATGTGGAATAGCAACAAGCTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACCATGTTTTGAATATCCCCTAAATTTTCCAGCAATGG
1 1 153637593 153637693 100M AGCTGCATGTGGAATAGCAACAAACTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACCATGTTTTGAATATCCCCTAAATTTTCCAGCAATGGAAAAAAAAGAACTA
1 1 153637602 153637702 100M TGGAATAGCAACAAGCTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACCATGTTTTGAATATCCCCTAAATTTTCCAGCAATGGAAAAAAAAGAACTAACAATGGAG
1 1 153637615 153637714 64M1I35M AGCTAAGTAAACTAAACAGCAACAATACCATGTTTTGAATATCCCCTAAATTTTCCAGCAATGGAAAAAAAAGAACTAACAATGGAGTTCTGGATCCAG
1 1 153637622 153637721 57M1I42M TAAACTAAACAGCAACAATACCATGTTTTGAATATCCCCTAAATTTTCCAGCAATGGAAAAAAAAGAACTAACAATGGAGTTCTGGATCCAGTTTTCGA
1 1 153637627 153637727 100M TAAACAGCAACAATACCATGTTTTGAATATCCCCTAAATTTTCCAGCAATGGAAAAAAAAGAACTAACAATGGAGTTCTGGATCCAGTTTTCGAAGATTG
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1 1 153637653 153637753 100M ATATCCCCTAAATTTTCCAGCAATGGAAAAAAAAGAACTAACAATGGAGTTCTGGATCCAGTTTTCGAAGATTGGGCTGCACTGTTGTAATGAGAATCTT
1 1 153637662 153637762 100M AAATTTTCCAGCAATGGAAAAAAAAGAACTAACAATGGAGTTCTGGATCCAGTTTTCGAAGATTGGGTGGCACTGTTGTAATGAGAATCTTGACTGTAGC
1 1 153637666 153637765 13M1I86M TTTCCAGCAATGGAAAAAAAAGAACTAACAATGGAGTTCTGGATCCAGTTTTCGAAGATTGGGTGGCACTGTTGTAATGAGAATCTTCACTGTAGCATC
1 1 153637670 153637770 100M CAGCAATGGAAAAAAAAGAACTAACAATGGAGTTCTGGATCCAGTTTTCGAAGATTGGGTGGCACTGTTGTAATGAGAATCTTCACTGTAGCATCAGAAG
1 1 153637680 153637780 100M AAAAAAAGAACTAACAATGGAGTTCTGGATCCAGTTTTCGAAGATTGGGTGGCACTGTTGTAATGAGAATCTTCACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTC
1 1 153637689 153637789 100M ACTAACAATGGAGTTCTGGATCCAGTTTTCGAAGATTGGGTGGCACTGTTGTAATGAGAATCTTCACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGT
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1 1 153637731 153642352 72M153642673F27m292n1m GCACTGTTGTAATGAGAATCTTCACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153637739 153642344 64M153642673F27m292n9m GTAATGAGAATCTTCACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153637749 153642334 54M153642673F27m292n19m TCTTCACTGTAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153637758 153642325 45M153642673F27m292n28m TAGCATCAGAAGAACTGATTTCAAAGCCAGTTTCGTTGGTCAGCA TGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642680 153641010 35m292n43m1278n22m GGGCGCTTTGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642677 153641007 32m292n43m1278n25m CGCTTTGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642674 153641004 29m292n43m1278n28m TTTGGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642671 153641001 26m292n43m1278n31m GGTTCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642668 153640998 23m292n43m1278n34m TCCAGAGGAGGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642665 153640995 20m292n43m1278n37m AGAGGAGGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642662 153640992 17m292n43m1278n40m GGAGGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642659 153640989 14m292n43m1278n43m GGCCCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642656 153640986 11m292n43m1278n46m CCAGGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642653 153640983 8m292n43m1278n49m GGAGGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642650 153640980 5m292n43m1278n52m GGAGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642647 153640977 2m292n43m1278n55m GG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 1 153642636 153642536 100m AGCTTTTAGCATCTCTGCACTTGGTTGTTAGTTTCTGCTTGTCATCTAAATAGGAGTTTTAGAGTAGACTAATGTCACTTGGTTTTGCGAGAGCCAACTG
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1 1 153642565 153642465 100m ATGTCACTTGGTTTTGCGAGAGCCAACTGTGGTCTTTTCCTGCACTCCTGTTAAATGAATTTGGCCCCACTATGCTAAGAATGATTCTTTCCCTCCCCGG
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1 1 153642465 153642365 100m AGACTTTGTCACTCATTCTGAGGACTGACATGTTTTCAAAATTGTTGGCGTGTTATTTACATCTCGCTTGATTCCTACCTAGGGAATAATT
1 1 153642453 153642353 100m TCATTCTGAGGACTGACATGTTTTCAAAATTGTTGGCGTGTTATTTACATCTCGCTTGATTCCTACCTAGGGAATAATT
1 1 153642409 153642309 100m TTACATCTCGCTTGATTCCTACCTAGGGAATAATT
10 pairs
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2296:4900
2547:4968
2547:4968
MDT-AP-0369_MB-0369_Primary_A14804 |
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1 |
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ENSG00000225670 |
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|
|
2 |
<-------- --------> |
Left flanking sequence | Right flanking sequence |
GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT | CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA |
blast search - genome
left flanking sequence - GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT
>ref|NC_000001.11| Homo sapiens chromosome 1, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000663.2| Homo sapiens chromosome 1, GRCh38 reference primary assembly
Length=248956422
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 159203928 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 159203879
>ref|NT_004487.20| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR1_CTG31
gb|GL000016.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=80374348
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16019341 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 16019292
>ref|NC_018912.2| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001609.2| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 160569148 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 160569099
>ref|NW_004929293.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150077.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=62793477
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 16016435 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 16016386
>gb|KE141256.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold174, whole genome
shotgun sequence
Length=11932540
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9644897 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 9644848
>gb|CM000491.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=219474137
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130530076 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 130530027
>gb|GL583122.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_142, whole genome
shotgun sequence
Length=5730267
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2224155 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 2224204
>gb|CH003496.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=223056964
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HuRef SCAF_1103279187601, whole genome shotgun sequence
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Lambda K H
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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>gb|GL583122.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_142, whole genome
shotgun sequence
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>gb|DS990761.1| Homo sapiens SCAF_1112675836546 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>ref|NW_001838531.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187601, whole genome shotgun sequence
gb|DS486123.1| Homo sapiens SCAF_1103279187601 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>gb|CH471121.2| Homo sapiens 211000035830426 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000462.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 130531051 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 130531100
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Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT
>ref|XM_001170629.4| PREDICTED: Pan troglodytes atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
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>ref|XM_003820979.2| PREDICTED: Pan paniscus atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 136 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 87
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(ACKR1), RefSeqGene on chromosome 1
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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>gb|AY663427.1| Homo sapiens isolate fa0152 immunoglobulin superfamily member
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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>gb|AY663423.1| Homo sapiens isolate fa0141 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 47074 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 47025
>gb|AY663420.1| Homo sapiens isolate fa0138 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Sbjct 47072 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 47023
>gb|AY663419.1| Homo sapiens isolate fa0137 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 47072 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 47023
>gb|AY663418.1| Homo sapiens isolate fa0134 immunoglobulin superfamily member
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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>gb|AY663417.1| Homo sapiens isolate fa0150 immunoglobulin superfamily member
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 47076 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 47027
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gene, complete cds, alternatively spliced
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>gb|DQ181559.1| Homo sapiens isolate fa1191 immunoglobulin superfamily member
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gene, complete cds, alternatively spliced
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>gb|DQ181558.1| Homo sapiens isolate fa1190 immunoglobulin superfamily member
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Sbjct 47069 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 47020
>gb|DQ181557.1| Homo sapiens isolate fa1016 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Sbjct 47076 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 47027
>gb|DQ181556.1| Homo sapiens isolate fa1015 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47072 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 47023
>gb|DQ181555.1| Homo sapiens isolate fa1014 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47076 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 47027
>gb|DQ181554.1| Homo sapiens isolate fa1013 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 47067 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 47018
>gb|DQ181553.1| Homo sapiens isolate fa1012 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 47076 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 47027
>emb|AL035403.10| Human DNA sequence from clone CTA-134P22 on chromosome 1q21.2-22,
complete sequence
Length=118951
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 74705 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 74656
>dbj|AB045365.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, clone:622b6, complete
sequence
Length=126549
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 12972 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 12923
>dbj|AP002535.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, CD1 region, section
4/4
Length=239684
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 126107 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 126058
>gb|AF055992.1|AF055992 Homo sapiens Duffy antigen/chemokine receptor (FY) gene, FY*X
allele, complete cds
Length=2772
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 242 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 193
>emb|Y14873.1| Homo sapiens DARC gene, 5'UTR
Length=1795
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 761 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 712
>ref|XM_004027056.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla Duffy blood group, chemokine
receptor, transcript variant 1 (DARC), mRNA
Length=2999
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 886 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCCCATT 837
>ref|XM_002809955.3| PREDICTED: Pongo abelii atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
Length=2274
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 239 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCTAAGCCCATT 190
>ref|XM_007976583.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus atypical chemokine receptor 1
(Duffy blood group) (ACKR1), mRNA
Length=3812
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Query 1 GAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATT 50
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Sbjct 1783 GAGAGAAAGAGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCTAAGCCCATT 1734
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA
>ref|XM_001170629.4| PREDICTED: Pan troglodytes atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
Length=3841
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Sbjct 1943 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 1992
>ref|XM_003820979.2| PREDICTED: Pan paniscus atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
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Sbjct 330 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 379
>ref|NM_002036.3| Homo sapiens atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)
(ACKR1), transcript variant 2, mRNA
Length=2024
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Sbjct 110 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 159
>ref|NG_011626.1| Homo sapiens atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)
(ACKR1), RefSeqGene on chromosome 1
Length=8781
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4403 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 4452
>dbj|AK291593.1| Homo sapiens cDNA FLJ75122 complete cds, highly similar to Homo
sapiens Duffy blood group, chemokine receptor, mRNA
Length=2006
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Sbjct 110 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 159
>gb|AY663433.1| Homo sapiens isolate fa0190 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47266 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47315
>gb|AY663432.1| Homo sapiens isolate fa0180 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47266 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47315
>gb|AY663431.1| Homo sapiens isolate fa0178 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82952
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Sbjct 47257 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47306
>gb|AY663430.1| Homo sapiens isolate fa0175 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82953
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Sbjct 47251 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47300
>gb|AY663429.1| Homo sapiens isolate fa0173 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82953
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Sbjct 47251 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47300
>gb|AY663428.1| Homo sapiens isolate fa0154 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47272 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47321
>gb|AY663427.1| Homo sapiens isolate fa0152 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82968
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Sbjct 47266 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47315
>gb|AY663426.1| Homo sapiens isolate fa0149 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47264 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47313
>gb|AY663425.1| Homo sapiens isolate fa0148 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47256 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47305
>gb|AY663424.1| Homo sapiens isolate fa0144 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Sbjct 47268 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47317
>gb|AY663423.1| Homo sapiens isolate fa0141 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 50
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Sbjct 47258 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47307
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47266 CCACTTCATATGCAAGAGGCATGCACTGAGCCCATAGGTGGCTAGGCAAA 47315
>gb|AY663421.1| Homo sapiens isolate fa0142 immunoglobulin superfamily member
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genes, complete cds, alternatively spliced
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>dbj|AB045365.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, clone:622b6, complete
sequence
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>dbj|AP002535.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, CD1 region, section
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allele, complete cds
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receptor, transcript variant 1 (DARC), mRNA
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>gb|HQ285843.1| Gorilla gorilla Duffy antigen/chemokine receptor (DARC) gene,
complete cds
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>ref|XM_002809955.3| PREDICTED: Pongo abelii atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
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HuRef SCAF_1103279187601, whole genome shotgun sequence
gb|DS486123.1| Homo sapiens SCAF_1103279187601 genomic scaffold, whole genome
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sequence
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 9280788 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 9280739
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shotgun sequence
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 130530862 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 130530813
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Lambda K H
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right flanking sequence - CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG
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>ref|NT_004487.20| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR1_CTG31
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assembly
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>ref|NC_018912.2| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Sbjct 160569514 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 160569563
>ref|NW_004929293.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150077.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 16016801 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 16016850
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shotgun sequence
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Sbjct 9645263 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 9645312
>gb|CM000491.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 130530442 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 130530491
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Sbjct 133015034 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 133015083
>gb|DS990761.1| Homo sapiens SCAF_1112675836546 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 2235228 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 2235179
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Sbjct 132045382 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 132045431
>ref|NW_001838531.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187601, whole genome shotgun sequence
gb|DS486123.1| Homo sapiens SCAF_1103279187601 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 2235234 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 2235185
>gb|CH471121.2| Homo sapiens 211000035830426 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=11514521
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Sbjct 9281149 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 9281198
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000462.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 130531223 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 130531272
>gb|CM000252.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=222388987
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 132244323 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 132244372
>gb|GL583122.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_142, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 2223789 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAAYGTACACAGAG 2223740
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC
>ref|XM_001170629.4| PREDICTED: Pan troglodytes atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
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Sbjct 1754 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 1705
>ref|XM_003820979.2| PREDICTED: Pan paniscus atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
Length=2171
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 141 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 92
>ref|XM_004027056.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla Duffy blood group, chemokine
receptor, transcript variant 1 (DARC), mRNA
Length=2999
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 891 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 842
>ref|NG_011626.1| Homo sapiens atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)
(ACKR1), RefSeqGene on chromosome 1
Length=8781
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 4214 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 4165
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genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47077 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47028
>gb|AY663432.1| Homo sapiens isolate fa0180 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82964
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47077 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47028
>gb|AY663431.1| Homo sapiens isolate fa0178 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82952
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47068 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47019
>gb|AY663430.1| Homo sapiens isolate fa0175 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47062 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47013
>gb|AY663429.1| Homo sapiens isolate fa0173 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47062 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47013
>gb|AY663428.1| Homo sapiens isolate fa0154 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47083 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47034
>gb|AY663427.1| Homo sapiens isolate fa0152 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47077 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47028
>gb|AY663426.1| Homo sapiens isolate fa0149 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47075 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47026
>gb|AY663425.1| Homo sapiens isolate fa0148 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47067 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47018
>gb|AY663424.1| Homo sapiens isolate fa0144 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82968
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47079 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47030
>gb|AY663423.1| Homo sapiens isolate fa0141 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47069 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47020
>gb|AY663422.1| Homo sapiens isolate fa0140 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47077 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47028
>gb|AY663421.1| Homo sapiens isolate fa0142 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47079 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47030
>gb|AY663420.1| Homo sapiens isolate fa0138 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82960
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47077 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47028
>gb|AY663419.1| Homo sapiens isolate fa0137 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82960
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47077 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47028
>gb|AY663418.1| Homo sapiens isolate fa0134 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47077 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47028
>gb|AY663417.1| Homo sapiens isolate fa0150 immunoglobulin superfamily member
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genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47081 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47032
>gb|AY663416.1| Homo sapiens isolate fa0176 immunoglobulin superfamily member
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genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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>gb|DQ181566.1| Homo sapiens isolate fa1311 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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>gb|DQ181564.1| Homo sapiens isolate fa1308 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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>gb|DQ181563.1| Homo sapiens isolate fa1306 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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>gb|DQ181561.1| Homo sapiens isolate fa1194 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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>gb|DQ181560.1| Homo sapiens isolate fa1193 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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>gb|DQ181559.1| Homo sapiens isolate fa1191 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47079 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47030
>gb|DQ181558.1| Homo sapiens isolate fa1190 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47074 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47025
>gb|DQ181557.1| Homo sapiens isolate fa1016 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47081 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47032
>gb|DQ181556.1| Homo sapiens isolate fa1015 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47077 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47028
>gb|DQ181555.1| Homo sapiens isolate fa1014 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47081 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47032
>gb|DQ181554.1| Homo sapiens isolate fa1013 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47072 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47023
>gb|DQ181553.1| Homo sapiens isolate fa1012 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
Length=82984
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 47081 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 47032
>emb|AL035403.10| Human DNA sequence from clone CTA-134P22 on chromosome 1q21.2-22,
complete sequence
Length=118951
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 74710 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 74661
>dbj|AB045365.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, clone:622b6, complete
sequence
Length=126549
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 12977 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 12928
>dbj|AP002535.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, CD1 region, section
4/4
Length=239684
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 126112 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 126063
>gb|AF055992.1|AF055992 Homo sapiens Duffy antigen/chemokine receptor (FY) gene, FY*X
allele, complete cds
Length=2772
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 247 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 198
>emb|Y14873.1| Homo sapiens DARC gene, 5'UTR
Length=1795
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 766 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 717
>ref|XM_002809955.3| PREDICTED: Pongo abelii atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
Length=2274
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 244 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCTAAGC 195
>ref|XM_007976583.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus atypical chemokine receptor 1
(Duffy blood group) (ACKR1), mRNA
Length=3812
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Query 1 CAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC 50
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Sbjct 1788 CAGCAGAGAGAAAGAGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCTAAGC 1739
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG
>ref|XM_001170629.4| PREDICTED: Pan troglodytes atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
Length=3841
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 2115 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 2164
>ref|XM_003820979.2| PREDICTED: Pan paniscus atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
Length=2171
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 502 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 551
>ref|XM_004027056.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla Duffy blood group, chemokine
receptor, transcript variant 1 (DARC), mRNA
Length=2999
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 1252 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 1301
>gb|HQ285843.1| Gorilla gorilla Duffy antigen/chemokine receptor (DARC) gene,
complete cds
Length=2830
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 224 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 273
>ref|NM_002036.3| Homo sapiens atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)
(ACKR1), transcript variant 2, mRNA
Length=2024
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 282 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 331
>ref|NG_011626.1| Homo sapiens atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)
(ACKR1), RefSeqGene on chromosome 1
Length=8781
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 4575 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 4624
>dbj|AK291593.1| Homo sapiens cDNA FLJ75122 complete cds, highly similar to Homo
sapiens Duffy blood group, chemokine receptor, mRNA
Length=2006
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 282 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 331
>gb|AY663433.1| Homo sapiens isolate fa0190 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82958
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 47438 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 47487
>gb|AY663432.1| Homo sapiens isolate fa0180 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 47438 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 47487
>gb|AY663431.1| Homo sapiens isolate fa0178 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82952
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 47429 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 47478
>gb|AY663430.1| Homo sapiens isolate fa0175 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82953
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Sbjct 47423 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 47472
>gb|AY663429.1| Homo sapiens isolate fa0173 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 47423 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 47472
>gb|AY663428.1| Homo sapiens isolate fa0154 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47444 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 47493
>gb|AY663427.1| Homo sapiens isolate fa0152 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47438 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 47487
>gb|AY663426.1| Homo sapiens isolate fa0149 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 47436 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 47485
>gb|AY663425.1| Homo sapiens isolate fa0148 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47428 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 47477
>gb|AY663423.1| Homo sapiens isolate fa0141 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82951
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 47430 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 47479
>gb|AY663422.1| Homo sapiens isolate fa0140 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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Sbjct 47438 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 47487
>gb|AY663421.1| Homo sapiens isolate fa0142 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAG 50
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>emb|AL035403.10| Human DNA sequence from clone CTA-134P22 on chromosome 1q21.2-22,
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>dbj|AB045365.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, clone:622b6, complete
sequence
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>dbj|AP002535.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, CD1 region, section
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1 1 159173813 159173713 100m TTCTACTGGGGGACATAAAGTCTCTGGAACTGTTTCATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGA
1 1 159173810 159173710 100m TACTGGGGGACATAAAGTCTCTGGAACTGTTTCATTGTCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAA
1 1 159173807 159173707 100m TGGGGGACATAAAGTCTCTGGAACTGTTTCATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGG
1 1 159173804 159173704 100m GGGACATAAAGTCTCTGGAACTGTTTCATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCA
1 1 159173801 159173701 100m ACATAAAGTCTCTGGAACTGTTTCATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCT
1 1 159173798 159173698 100m TAAAGTCTCTGGAACTGTTTCATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACC
1 1 159173795 159173695 100m AGTCTCTGGAACTGTTTCATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTG
1 1 159173792 159173692 100m CTCTGGAACTGTTTCATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGTCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAG
1 1 159173789 159173689 100m TGGAACTGTTTCATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCA
1 1 159173786 159173686 100m AACTGTTTCATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGC
1 1 159173783 159173683 100m TGTTTCATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGA
1 1 159173780 159173680 100m TTCATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTC
1 1 159173777 159173677 100m ATTGGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCC
1 1 159173774 159173674 100m GGCCAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCAAA
1 1 159173771 159173671 100m CAGGCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGCGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCA
1 1 159173768 159173668 100m GCATCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACAT
1 1 159173765 159173665 100m TCTTAGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGCACATTTC
1 1 159173761 159174094 89m159174084F11M AGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATAC
1 1 159173761 159174094 89m159174084F11M AGCAATATGTAAAGTTTCTCACTGAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATAT
1 1 159173738 159174117 66m159174084F34M GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACA
1 1 159173738 159174117 66m159174084F34M GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGTCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATAGACA
1 1 159173738 159174117 66m159174084F34M GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACA
1 1 159173738 159174117 66m159174084F34M GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACA
1 1 159173735 159174120 63m159174084F37M GGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCA
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1 1 159173727 159174128 55m159174084F45M CTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACA
1 1 159173724 159174131 52m159174084F48M GCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAG
1 1 159173723 159174132 51m159174084F49M CCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGA
1 1 159173720 159174135 48m159174084F52M GCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTT
1 1 159173719 159174136 47m159174084F53M CAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAGTTC
1 1 159173718 159174137 46m159174084F54M AGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCA
1 1 159173692 159174163 20m159174084F80M GCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACG
1 1 159173692 159174163 20m159174084F80M GCAGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACG
1 1 159173690 159174165 18m159174084F82M AGGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACCCAGCAGACGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTG
1 1 159173689 159174166 17m159174084F83M GGCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGC
1 1 159173688 159174167 16m159174084F84M GCCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCA
1 1 159173687 159174168 15m159174084F85M CCGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCAC
1 1 159173686 159174169 14m159174084F86M CGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACA
1 1 159173686 159174169 14m159174084F86M CGATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACA
1 1 159173685 159174170 13m159174084F87M GATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACAC
1 1 159173685 159174170 13m159174084F87M GATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACAC
1 1 159173685 159174170 13m159174084F87M GATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACAC
1 1 159173684 159174171 12m159174084F88M ATTCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACA
1 1 159173682 159174173 10m159174084F90M TCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACC
1 1 159173682 159174173 10m159174084F90M TCTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACC
1 1 159173681 159174174 9m159174084F91M CTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCC
1 1 159173681 159174174 9m159174084F91M CTCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCC
1 1 159173680 159174175 8m159174084F92M TCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCC
1 1 159173680 159174175 8m159174084F92M TCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCC
1 1 159173680 159174175 8m159174084F92M TCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCC
1 1 159173680 159174175 8m159174084F92M TCCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCC
1 1 159173679 159174176 7m159174084F93M CCCAAGC CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAACTGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCT
1 1 159174074 159174174 100M CCGCCAAGCCCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCC
1 1 159174077 159174177 100M CCAAGCCCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTC
1 1 159174080 159174180 100M AGCCCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGT
1 1 159174083 159174183 100M CCCTCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGG
1 1 159174086 159174186 100M TCACATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGGGAC
1 1 159174089 159174189 100M CATACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTAGACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGGGACAGA
1 1 159174092 159174192 100M ACAGATATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTT
1 1 159174095 159174195 100M GATATGTGCACAATGATACACAGCAAACGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGAC
1 1 159174098 159174198 100M ATGTGCACAATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTACACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCAC
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1 1 159174107 159174207 100M ATGATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTT
1 1 159174110 159174210 100M ATACACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTTT
1 1 159174113 159174213 100M CACAGCAAATGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTTTCCC
1 1 159174116 159174216 100M AGCAAACGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACGCACCCCTCAGTTGGGTCAGAGTTGACCACCACCACCTTTCTCCCAAA
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1 1 159174122 159174222 100M TGTACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTTTCCCAAACACATG
1 1 159174125 159174225 100M ACACAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTCTCCCAAACACATGGCT
1 1 159174128 159174228 100M CAGAGTTCAGTACACACAAAGAGCTCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTTTCCCAAACACATGGCTTTT
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1 1 159174152 159174252 100M TCACGCCCACGTGCACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTCTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGT
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1 1 159174161 159174261 100M CGTGCACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACAACCACCTTTCTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGA
1 1 159174164 159174264 100M GCACACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTTTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGG
1 1 159174167 159174267 100M CACACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTTTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGG
1 1 159174170 159174270 100M ACCCCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTTTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGC
1 1 159174173 159174273 100M CCTCAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTTTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGT
1 1 159174176 159174276 100M CAGTTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTTTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAG
1 1 159174179 159174279 100M TTGGGACAGAGTTGACCACCACCACCTTTTTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGACCAGTGAGAGT
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1 1 159174188 159174288 100M AGTTGACCACCACCACCTTTCTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAGAGTCAGCCGCCA
1 1 159174191 159174291 100M TGACCACCACCACCTTTCTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAGAGTCAGCCGCCCTTC
1 1 159174194 159174294 100M CCACCACCACCTTTCTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAGAGTCAGCCGCCCTTCCAC
1 1 159174197 159174297 100M CCACCACCTTTTTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAGAGTCAGCCGCCCTTCCACTCC
1 1 159174200 159174300 100M CCACCTTTTTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAGAGTCAGCCGCCCTTCCACTCCAAT
1 1 159174203 159174303 100M CCTTTTTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAGAGTCAGCCGCCCTTCCACTCCAATTTC
1 1 159174206 159174306 100M TTTTCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAGAGTCAGCCGCCCTTCCACTCCAATTTCCCA
1 1 159174209 159174309 100M TCCCAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAGAGTCAGCCGCCCTTCCACTCCAATTTCCCAGCA
1 1 159174212 159174312 100M CAAACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAGAGTCAGCCGCCCTTCCACTCCAATTTCCCAGCACCT
1 1 159174215 159174315 100M ACACATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAGAGTCAGCCGCCCTTCCACTCCAATTTCCCAGCACCTCCC
1 1 159174218 159174318 100M CATGGCTTTTGAACTGCCTTTCCTTGGATCCAGTTCAAGGGGATGGAGGAGCAGTGAGAGTCAGCCGCCCTTCCACTCCAATTTCCCAGCACCTCCCTTA
38 pairs
0:15
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19:-174
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456:396
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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shotgun sequence
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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assembly
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genome shotgun sequence
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150077.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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shotgun sequence
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 9645224 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 9645273
>gb|CM000491.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=219474137
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 130530403 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 130530452
>gb|GL583122.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_142, whole genome
shotgun sequence
Length=5730267
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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>gb|CH003496.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 133014995 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 133015044
>gb|DS990761.1| Homo sapiens SCAF_1112675836546 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 2235267 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 2235218
>gb|CH003448.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=221336263
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 132045343 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 132045392
>ref|NW_001838531.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187601, whole genome shotgun sequence
gb|DS486123.1| Homo sapiens SCAF_1103279187601 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=6712842
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 2235273 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 2235224
>gb|CH471121.2| Homo sapiens 211000035830426 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=11514521
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Length=219475005
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 130531184 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 130531233
>gb|CM000252.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=222388987
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 132244284 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 132244333
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Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG
>ref|XM_001170629.4| PREDICTED: Pan troglodytes atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
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blood group) (ACKR1), mRNA
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Sbjct 260 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 211
>ref|XM_003820979.2| PREDICTED: Pan paniscus atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Sbjct 157 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 108
>ref|XM_004027056.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla Duffy blood group, chemokine
receptor, transcript variant 1 (DARC), mRNA
Length=2999
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Sbjct 907 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 858
>ref|NG_011626.1| Homo sapiens atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)
(ACKR1), RefSeqGene on chromosome 1
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Sbjct 4230 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 4181
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Sbjct 47093 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 47044
>gb|AY663431.1| Homo sapiens isolate fa0178 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82952
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47084 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 47035
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82953
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Sbjct 47078 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 47029
>gb|AY663429.1| Homo sapiens isolate fa0173 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82953
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Sbjct 47078 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 47029
>gb|AY663428.1| Homo sapiens isolate fa0154 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82975
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Sbjct 47095 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 47046
>gb|DQ181558.1| Homo sapiens isolate fa1190 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Sbjct 47090 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 47041
>gb|DQ181557.1| Homo sapiens isolate fa1016 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47097 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 47048
>gb|DQ181556.1| Homo sapiens isolate fa1015 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
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Sbjct 47093 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 47044
>gb|DQ181555.1| Homo sapiens isolate fa1014 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47097 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 47048
>gb|DQ181554.1| Homo sapiens isolate fa1013 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
Length=82962
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47088 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 47039
>gb|DQ181553.1| Homo sapiens isolate fa1012 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
Length=82984
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47097 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 47048
>emb|AL035403.10| Human DNA sequence from clone CTA-134P22 on chromosome 1q21.2-22,
complete sequence
Length=118951
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74726 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 74677
>dbj|AB045365.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, clone:622b6, complete
sequence
Length=126549
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12993 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 12944
>dbj|AP002535.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, CD1 region, section
4/4
Length=239684
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 126128 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 126079
>gb|AF055992.1|AF055992 Homo sapiens Duffy antigen/chemokine receptor (FY) gene, FY*X
allele, complete cds
Length=2772
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 214
>emb|Y14873.1| Homo sapiens DARC gene, 5'UTR
Length=1795
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 733
>ref|XM_002760156.2| PREDICTED: Callithrix jacchus atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), transcript variant X1, mRNA
Length=2360
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGGGCAGAGCTGGCCAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 GAGGGGCAGAGCTGGCAAGCAGAGAGAAAGGGCATCTACCCTGCAGGCAG 314
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC
>ref|XM_001170629.4| PREDICTED: Pan troglodytes atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
Length=3841
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2076 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 2125
>ref|XM_003820979.2| PREDICTED: Pan paniscus atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
Length=2171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 463 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 512
>ref|XM_004027056.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla Duffy blood group, chemokine
receptor, transcript variant 1 (DARC), mRNA
Length=2999
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 1262
>gb|HQ285843.1| Gorilla gorilla Duffy antigen/chemokine receptor (DARC) gene,
complete cds
Length=2830
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 234
>ref|NM_002036.3| Homo sapiens atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)
(ACKR1), transcript variant 2, mRNA
Length=2024
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 292
>ref|NG_011626.1| Homo sapiens atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)
(ACKR1), RefSeqGene on chromosome 1
Length=8781
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4536 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 4585
>dbj|AK291593.1| Homo sapiens cDNA FLJ75122 complete cds, highly similar to Homo
sapiens Duffy blood group, chemokine receptor, mRNA
Length=2006
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 292
>gb|AY663433.1| Homo sapiens isolate fa0190 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82958
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 47399 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 47448
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Sbjct 47401 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 47450
>gb|DQ181558.1| Homo sapiens isolate fa1190 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 47396 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 47445
>gb|DQ181557.1| Homo sapiens isolate fa1016 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Sbjct 47403 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 47452
>gb|DQ181556.1| Homo sapiens isolate fa1015 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 47399 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 47448
>gb|DQ181555.1| Homo sapiens isolate fa1014 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 47402 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 47451
>gb|DQ181554.1| Homo sapiens isolate fa1013 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
Length=82962
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 47394 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 47443
>gb|DQ181553.1| Homo sapiens isolate fa1012 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
Length=82984
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 47402 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 47451
>emb|AL035403.10| Human DNA sequence from clone CTA-134P22 on chromosome 1q21.2-22,
complete sequence
Length=118951
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 75032 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 75081
>dbj|AB045365.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, clone:622b6, complete
sequence
Length=126549
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 13299 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 13348
>dbj|AP002535.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, CD1 region, section
4/4
Length=239684
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 126434 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 126483
>gb|AF055992.1|AF055992 Homo sapiens Duffy antigen/chemokine receptor (FY) gene, FY*X
allele, complete cds
Length=2772
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 569 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 618
>emb|Y14873.1| Homo sapiens DARC gene, 5'UTR
Length=1795
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 1088 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 1137
>ref|XM_007976583.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus atypical chemokine receptor 1
(Duffy blood group) (ACKR1), mRNA
Length=3812
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2110 ACCTAGAGATAGCCAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 2159
>gb|HQ285854.1| Mandrillus sphinx Duffy antigen/chemokine receptor (DARC) gene,
complete cds
Length=2764
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 ACCTAGAGATAGCCAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 233
>gb|HQ285853.1| Mandrillus leucophaeus Duffy antigen/chemokine receptor (DARC)
gene, complete cds
Length=2764
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 184 ACCTAGAGATAGCCAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 233
>gb|HQ285852.1| Macaca thibetana Duffy antigen/chemokine receptor (DARC) gene,
complete cds
Length=2886
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 ACCTAGAGATAGCCAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 233
>gb|HQ285851.1| Macaca nigra Duffy antigen/chemokine receptor (DARC) gene, complete
cds
Length=2891
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTAGAGATAGCTAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 50
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Sbjct 184 ACCTAGAGATAGCCAGACACACCCAGACACCCGCCAAGCCCCTCACATAC 233
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 9281494 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 9281540
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shotgun sequence
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Sbjct 132244668 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 132244714
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG
>ref|XM_001170629.4| PREDICTED: Pan troglodytes atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
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>ref|XM_003820979.2| PREDICTED: Pan paniscus atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
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receptor, transcript variant 1 (DARC), mRNA
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complete cds
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>ref|NM_002036.3| Homo sapiens atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)
(ACKR1), transcript variant 2, mRNA
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(ACKR1), RefSeqGene on chromosome 1
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sapiens Duffy blood group, chemokine receptor, mRNA
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genes, complete cds, alternatively spliced
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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genes, complete cds, alternatively spliced
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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>gb|AY663426.1| Homo sapiens isolate fa0149 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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>gb|AY663425.1| Homo sapiens isolate fa0148 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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>gb|AY663423.1| Homo sapiens isolate fa0141 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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>gb|AY663422.1| Homo sapiens isolate fa0140 immunoglobulin superfamily member
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genes, complete cds, alternatively spliced
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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>gb|AY663420.1| Homo sapiens isolate fa0138 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47482 TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 47433
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Sbjct 47486 TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 47437
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Sbjct 47482 TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 47433
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Query 1 TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 50
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Sbjct 47477 TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 47428
>emb|AL035403.10| Human DNA sequence from clone CTA-134P22 on chromosome 1q21.2-22,
complete sequence
Length=118951
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 50
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Sbjct 75115 TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 75066
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complete cds
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Sbjct 223 TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 174
>dbj|AB045365.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, clone:622b6, complete
sequence
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4/4
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(Duffy blood group) (ACKR1), mRNA
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gene, complete cds
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cds
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complete cds
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complete cds
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gene, complete cds
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Sbjct 267 TGTACGTTTGCTGTGTATCAGTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 218
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complete cds
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gene, complete cds
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Sbjct 267 TGTACGTTTGCTGTGTATCAGTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 218
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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>gb|AY663416.1| Homo sapiens isolate fa0176 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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>gb|DQ181564.1| Homo sapiens isolate fa1308 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47483 TGTACATTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 47434
>gb|DQ181555.1| Homo sapiens isolate fa1014 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47485 TGTACATTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 47436
>gb|DQ181553.1| Homo sapiens isolate fa1012 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47485 TGTACATTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 47436
>gb|HQ285854.1| Mandrillus sphinx Duffy antigen/chemokine receptor (DARC) gene,
complete cds
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Query 1 TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 50
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Sbjct 267 TGTACGTTTGCTGTGTATCAGTRTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 218
>gb|HQ285849.1| Macaca mulatta Duffy antigen/chemokine receptor (DARC) gene,
complete cds
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Query 1 TGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 50
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Sbjct 267 TGTACGTTTGCTGTGTATCAGTGTGCACRTATCTGTATGTGAGGGGCTTG 218
>gb|HQ285844.1| Cercocebus galeritus Duffy antigen/chemokine receptor (DARC)
gene, complete cds
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Sbjct 260 TGTATGTTTGCTGTGTATCAGTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG 211
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC
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blood group) (ACKR1), mRNA
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Sbjct 2460 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 2506
>ref|XM_003820979.2| PREDICTED: Pan paniscus atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
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allele, complete cds, alternatively spliced
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allele, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 120 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 166
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719delG allele, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 60 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 109
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 120 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 166
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(DARC) gene, partial cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
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(DARC) gene, partial cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
>gb|KF618493.1| Pan troglodytes schweinfurthii isolate UBpts2039 duffy antigen
(DARC) gene, partial cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
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cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
>gb|KF618486.1| Pan troglodytes ellioti isolate SYpte56 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
>gb|KF618485.1| Pan troglodytes ellioti isolate SYpte44 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
>gb|KF618484.1| Pan troglodytes ellioti isolate SYpte38 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
>gb|KF618472.1| Pan troglodytes ellioti isolate KMpte5 duffy antigen (DARC) gene,
partial cds
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Sbjct 228 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 277
>gb|KF618482.1| Pan troglodytes troglodytes isolate SLptt964 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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Sbjct 228 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 277
>gb|KF618479.1| Pan troglodytes ellioti isolate MGpte13 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
>gb|KF618478.1| Pan troglodytes ellioti isolate MGpte11 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
>gb|KF618476.1| Pan paniscus isolate LKpp684 duffy antigen (DARC) gene, partial
cds
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>gb|KF618475.1| Pan paniscus isolate LKpp657 duffy antigen (DARC) gene, partial
cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
>gb|KF618473.1| Pan paniscus isolate KRpp64 duffy antigen (DARC) gene, partial
cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
>gb|KF618483.1| Pan troglodytes ellioti isolate SYpte11 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 228 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 277
>gb|KF618471.1| Pan troglodytes ellioti isolate KMpte8 duffy antigen (DARC) gene,
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>gb|KF618470.1| Pan troglodytes ellioti isolate KMpte4 duffy antigen (DARC) gene,
partial cds
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>gb|KF618467.1| Pan troglodytes schweinfurthii isolate KApts1680 duffy antigen
(DARC) gene, partial cds
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cds
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gene, partial cds
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>gb|KF618463.1| Pan troglodytes troglodytes isolate GTptt314 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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>gb|KF618460.1| Pan troglodytes troglodytes isolate EKptt1109 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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>gb|KF618456.1| Pan troglodytes troglodytes isolate DPptt95 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
>gb|KF618455.1| Pan troglodytes troglodytes isolate DPptt942 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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Sbjct 243 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 292
>gb|KF618451.1| Pan troglodytes troglodytes isolate BQptt194 duffy antigen (DARC)
gene, partial cds
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Sbjct 246 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 295
>emb|HG764172.1| Homo sapiens DARC (FY) gene for Duffy antigen/chemokine receptor,
allele FY*A allele
gb|KF784871.1| Homo sapiens duffy antigen receptor for chemokine glycoprotein
(DARC) gene, DARC-FY*01W.02 allele, complete cds, alternatively
spliced
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Sbjct 148 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 194
>ref|NM_002036.3| Homo sapiens atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)
(ACKR1), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 627 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 673
>ref|NG_011626.1| Homo sapiens atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)
(ACKR1), RefSeqGene on chromosome 1
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Sbjct 4920 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 4966
>dbj|AK291593.1| Homo sapiens cDNA FLJ75122 complete cds, highly similar to Homo
sapiens Duffy blood group, chemokine receptor, mRNA
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Sbjct 567 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 616
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 627 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 673
>gb|AY663433.1| Homo sapiens isolate fa0190 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47723 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47772
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47783 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47829
>gb|AY663432.1| Homo sapiens isolate fa0180 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47723 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47772
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47783 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47829
>gb|AY663431.1| Homo sapiens isolate fa0178 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47774 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47820
>gb|AY663430.1| Homo sapiens isolate fa0175 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47768 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47814
>gb|AY663429.1| Homo sapiens isolate fa0173 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47708 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47757
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47768 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47814
>gb|AY663428.1| Homo sapiens isolate fa0154 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47729 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47778
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47789 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47835
>gb|AY663427.1| Homo sapiens isolate fa0152 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47783 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47829
>gb|AY663426.1| Homo sapiens isolate fa0149 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47721 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47770
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47781 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47827
>gb|AY663425.1| Homo sapiens isolate fa0148 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47773 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47819
>gb|AY663424.1| Homo sapiens isolate fa0144 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
Length=82968
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Sbjct 47723 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47772
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47783 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47829
>gb|AY663423.1| Homo sapiens isolate fa0141 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47775 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47821
>gb|AY663422.1| Homo sapiens isolate fa0140 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47723 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47772
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47783 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47829
>gb|AY663421.1| Homo sapiens isolate fa0142 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47785 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47831
>gb|AY663420.1| Homo sapiens isolate fa0138 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
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Sbjct 47723 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47772
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47783 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47829
>gb|AY663419.1| Homo sapiens isolate fa0137 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47723 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47772
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47783 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47829
>gb|AY663418.1| Homo sapiens isolate fa0134 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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>gb|AY663416.1| Homo sapiens isolate fa0176 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
genes, complete cds, alternatively spliced
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4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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>gb|DQ181566.1| Homo sapiens isolate fa1311 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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>gb|DQ181565.1| Homo sapiens isolate fa1310 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47771 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47817
>gb|DQ181564.1| Homo sapiens isolate fa1308 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47784 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47830
>gb|DQ181563.1| Homo sapiens isolate fa1306 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47780 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47826
>gb|DQ181562.1| Homo sapiens isolate fa1197 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47778 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47824
>gb|DQ181561.1| Homo sapiens isolate fa1194 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47723 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47772
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47783 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47829
>gb|DQ181560.1| Homo sapiens isolate fa1193 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 47725 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47774
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47785 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47831
>gb|DQ181559.1| Homo sapiens isolate fa1191 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47785 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47831
>gb|DQ181558.1| Homo sapiens isolate fa1190 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47720 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47769
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47780 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47826
>gb|DQ181557.1| Homo sapiens isolate fa1016 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47727 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47776
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47787 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47833
>gb|DQ181556.1| Homo sapiens isolate fa1015 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47723 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47772
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47783 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47829
>gb|DQ181555.1| Homo sapiens isolate fa1014 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
Length=82985
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47726 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47775
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47786 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47832
>gb|DQ181554.1| Homo sapiens isolate fa1013 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
Length=82962
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47718 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47767
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47778 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47824
>gb|DQ181553.1| Homo sapiens isolate fa1012 immunoglobulin superfamily member
4B (IGSF4B) gene, complete cds; and Duffy blood group (FY)
gene, complete cds, alternatively spliced
Length=82984
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47726 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47775
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 47786 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 47832
>emb|AL035403.10| Human DNA sequence from clone CTA-134P22 on chromosome 1q21.2-22,
complete sequence
Length=118951
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 75356 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 75405
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 75416 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 75462
>gb|S76830.1| glycoprotein D=Duffy group antigen [human, blood, Genomic DNA,
3068 nt]
Length=3068
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 221 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 270
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 281 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 327
>emb|BX537430.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686D15198 (from clone DKFZp686D15198);
complete cds
Length=1924
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 464 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 513
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 524 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 570
>dbj|AB045365.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, clone:622b6, complete
sequence
Length=126549
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 13623 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 13672
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 13683 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 13729
>dbj|AP002535.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 1q22-q23, CD1 region, section
4/4
Length=239684
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 126758 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 126807
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 126818 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 126864
>gb|AF055992.1|AF055992 Homo sapiens Duffy antigen/chemokine receptor (FY) gene, FY*X
allele, complete cds
Length=2772
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 893 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 942
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
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Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 953 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 999
>emb|Y14873.1| Homo sapiens DARC gene, 5'UTR
Length=1795
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 1412 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 1461
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 4 AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 1472 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 1518
>emb|X85785.1| H.sapiens DARC gene
Length=2489
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
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cds
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Sbjct 306 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 352
>ref|XM_004027056.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla Duffy blood group, chemokine
receptor, transcript variant 1 (DARC), mRNA
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Sbjct 1597 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 1643
>gb|HQ285843.1| Gorilla gorilla Duffy antigen/chemokine receptor (DARC) gene,
complete cds
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Sbjct 569 AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 615
>ref|XM_002809955.3| PREDICTED: Pongo abelii atypical chemokine receptor 1 (Duffy
blood group) (ACKR1), mRNA
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Query 1 AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCC 50
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Sbjct 890 AAGAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCACTTTCC 939
>gb|AF100634.1|AF100634 Homo sapiens Duffy antigen/Receptor for chemokines (DARC) gene,
DARC-Fya allele, partial cds
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1 1 159174310 159174210 100m GGTGCTGGGAAATTGGAGTGGAAGGGCGGCTGACTCTCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGG
1 1 159174307 159174207 100m GCTGGGAAATTGGAGTGGAAGGGCGGCTGACTCTCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAA
1 1 159174304 159174204 100m GGGAAATTGGAGTGGAAGGGCGGCTGACTCTCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAA
1 1 159174301 159174201 100m AAATTGGAGTGGAAGGGCGGCTGACTCTCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGT
1 1 159174298 159174198 100m TTGGAGTGGAAGGGCGGCTGACTCTCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGT
1 1 159174295 159174195 100m GAGTGGAAGGGCGGCTGACTCTCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAGAAAGGTGGTGGT
1 1 159174292 159174192 100m TGGAAGGGCGGCTGACTCTCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGT
1 1 159174289 159174189 100m AAGGGCGGCTGACTCTCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAA
1 1 159174286 159174186 100m GGCGGCTGACTCTCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTC
1 1 159174283 159174183 100m GGCTGACTCTCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGT
1 1 159174280 159174180 100m TGACTCTCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCC
1 1 159174277 159174177 100m CTCTAACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAAC
1 1 159174274 159174174 100m TCACTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGA
1 1 159174271 159174171 100m CTGCTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGG
1 1 159174268 159174168 100m CTCCTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTG
1 1 159174265 159174165 100m CTCCATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGT
1 1 159174262 159174162 100m CATCCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCA
1 1 159174259 159174159 100m CCCCTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGT
1 1 159174256 159174156 100m CTTGAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGG
1 1 159174253 159174153 100m GAACTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGT
1 1 159174250 159174150 100m CTGGATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAGAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAG
1 1 159174247 159174147 100m GATCCAAGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTC
1 1 159174244 159174144 100m CCAAGGAAAGGAAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTT
1 1 159174241 159174141 100m AGGAAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAGAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTG
1 1 159174238 159174138 100m AAAGGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGT
1 1 159174235 159174135 100m GGCAGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACT
1 1 159174232 159174132 100m AGTTCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAA
1 1 159174229 159174129 100m TCAAAAGCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTC
1 1 159174226 159174126 100m AAAGCCATGTGTTTGGGAGAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGT
1 1 159174223 159174123 100m GCCATGTGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTA
1 1 159174220 159174120 100m ATGTGTTTGGGAGAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACGT
1 1 159174217 159174117 100m TGTTTGGGAAAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACATTTG
1 1 159174214 159174114 100m TTGGGAGAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACGTTTGCTG
1 1 159174211 159174111 100m GGAGAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACGTTTGCTGTGT
1 1 159174208 159174108 100m AAAAGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACATTTGCTGTGTATC
1 1 159174205 159174105 100m AGGTGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACATTTGCTGTGTATCATT
1 1 159174202 159174102 100m TGGTGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACATTTGCTGTGTATCATTGTG
1 1 159174199 159174099 100m TGGTGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCAC
1 1 159174196 159174096 100m TGGTCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACATTTGCTGTGTATCATTGTGCACATA
1 1 159174193 159174093 100m TCAACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACATTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCT
1 1 159174190 159174090 100m ACTCTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACATTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTA
1 1 159174187 159174087 100m CTGTCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACATTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGT
1 1 159174184 159174084 100m TCCCAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAG
1 1 159174181 159174081 100m CAACTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACATTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGG
1 1 159174178 159174078 100m CTGAGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACATTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTT
1 1 159174175 159174075 100m AGGGGTGTGTGCACGTGGGCGTGAGCTCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACATTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTGGC
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1 1 159174149 159174396 72m159174369F28M TCTTTGTGTGTACTGAACTCTGTGTACGTTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCC
1 1 159174135 159174410 58m159174369F42M GAACTCTGTGTACATTTGCTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGTGCTTG AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCT
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1 1 159174117 159174428 40m159174369F60M CTGTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAA
1 1 159174115 159174430 38m159174369F62M GTGTATCATTGTGCACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAA
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1 1 159174102 159174443 25m159174369F75M CACATATCTGTATGTGAGGGGCTTG AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTG
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1 1 159174094 159174451 17m159174369F83M TGTATGTGAGGGGCTTG AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCC
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1 1 159174086 159174459 9m159174369F91M AGGGGCTTG AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTT
1 1 159174359 159174459 100M TTGTGCTTGAAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCGCTTGTTTT
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1 1 159174365 159174465 100M TTGAAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAAT
1 1 159174368 159174468 100M AAGAATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTC
1 1 159174371 159174471 100M AATCTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCT
1 1 159174374 159174474 100M CTCTCCTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTC
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1 1 159174383 159174483 100M CTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGT
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1 1 159174389 159174489 100M AGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAAACTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATG
1 1 159174392 159174492 100M CCCCTGTTTTCTCAATCTCGCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCC
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1 1 159174398 159174498 100M TTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTC
1 1 159174401 159174501 100M TCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGG
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1 1 159174407 159174507 100M TCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCA
1 1 159174410 159174510 100M CCCTTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCT
1 1 159174413 159174513 100M TTTCCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCACACTTTCTGGTCCCCACCTTTT
1 1 159174416 159174516 100M CCACTTCGGTAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGTCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCC
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1 1 159174425 159174525 100M TAAAATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAG
1 1 159174428 159174528 100M AATCTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTACAATGCCCACTTTCTGGTCCCTACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCC
1 1 159174431 159174531 100M CTCTACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAA
1 1 159174434 159174534 100M TACTTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCA
1 1 159174437 159174537 100M TTGCTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCA
1 1 159174440 159174540 100M CTGGAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAA
1 1 159174443 159174543 100M GAAAGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCC
1 1 159174446 159174546 100M AGCCCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAAC
1 1 159174449 159174549 100M CCCCTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTC
1 1 159174452 159174552 100M CTGTTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCATCCTCAAA
1 1 159174455 159174555 100M TTTTCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTCAAAACA
1 1 159174458 159174558 100M TCTCAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTCAAAACAGGA
1 1 159174461 159174561 100M CAATCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTCAAAACAGGAAGA
1 1 159174464 159174564 100M TCTCCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTCAAAACAGGAAGACCC
1 1 159174467 159174567 100M CCCTTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTCAAAACAGGAAGACCCAAG
1 1 159174470 159174570 100M TTTCCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTCAAAACAGGAAGACCCAAGGCC
1 1 159174473 159174573 100M CCACTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTCAAAACAGGAAGACCCAAGGCCAGT
1 1 159174476 159174576 100M CTTCGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTCAAAACAGGAAGACCCAAGGCTAGTGAC
1 1 159174479 159174579 100M CGGTAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGGAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTCAAAACAGGAAGACCCAAGGCCAGTGACCCC
1 1 159174482 159174582 100M TAAAATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTCAAAACAGGAAGACCCAAGGCCAGTGACCCCCAT
1 1 159174485 159174585 100M AATGCCCACTTTCTGGTCCCCACCTTTTTCCTGAGTGTAGTCCCAACCAGCCAAATCCAACCTCAAAACAGGAAGACCCAAGGCCAGTGACCCCCATAGG
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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>ref|NW_001838951.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
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sequence
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 78250041 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 78250087
>ref|AC_000153.1| Homo sapiens chromosome 21, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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>ref|AC_000145.1| Homo sapiens chromosome 13, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 4 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 35729566 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 35729612
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Length=176344326
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Query 4 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 78947801 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 78947847
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Length=33216610
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 11917825 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 11917776
>gb|CM000264.1| Homo sapiens chromosome 13, whole genome shotgun sequence
Length=95789532
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Strand=Plus/Plus
Query 4 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 36001990 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 36002036
>ref|NC_000014.9| Homo sapiens chromosome 14, GRCh38 Primary Assembly
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 47201069 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 47201118
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HSCHR14_CTG1
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assembly
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 28977546 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 28977595
>ref|NC_018925.2| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 47608879 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 47608928
>ref|NW_004929393.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150177.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold chr14_scaf, whole
genome shotgun sequence
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Sbjct 28608879 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 28608928
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shotgun sequence
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Sbjct 59882589 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 59882540
>gb|GL583015.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_35, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 5484499 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 5484450
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 27787968 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 27788017
>gb|DS990679.1| Homo sapiens SCAF_1112675836899 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=25156120
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 6488865 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 6488914
>gb|CH003509.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
Length=88496718
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 27388805 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 27388854
>gb|CH003461.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
Length=87839096
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 27421386 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 27421435
>emb|AL954800.2| Human chromosome 14 complete sequence
Length=87191216
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 27590310 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 27590359
>gb|CH471078.2| Homo sapiens 211000035833619 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=33050393
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 27472923 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 27472972
>ref|NW_001838111.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187954, whole genome shotgun sequence
gb|DS486041.1| Homo sapiens SCAF_1103279187954 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=25156336
Score = 82.4 bits (44), Expect = 1e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 6488978 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 6489027
>ref|AC_000146.1| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000475.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
Length=87444462
Score = 82.4 bits (44), Expect = 1e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 27787988 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 27788037
>gb|CM000265.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
Length=87316725
Score = 82.4 bits (44), Expect = 1e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 27530801 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 27530850
>ref|NC_000012.12| Homo sapiens chromosome 12, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000674.2| Homo sapiens chromosome 12, GRCh38 reference primary assembly
Length=133275309
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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assembly
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Sbjct 24167914 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCGTCTTCGCCAGCCGCT 24167963
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genome shotgun sequence
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 31370273 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCGTCTTCGCCAGCCGCT 31370322
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 24131422 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCGTCTTCGCCAGCCGCT 24131471
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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shotgun sequence
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 47
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shotgun sequence
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Sbjct 3483793 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCGTCTTCGCCAGCCGCT 3483744
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shotgun sequence
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 31158945 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCGTCTTCGCCAGCCGCT 31158994
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 11226430 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCGTCTTCGCCAGCCGCT 11226479
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA
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>ref|NT_030059.14| Homo sapiens chromosome 10 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR10_CTG5
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assembly
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Sbjct 55057061 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 55057110
>ref|NC_018921.2| Homo sapiens chromosome 10, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
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Sbjct 98792173 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 98792222
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 49431735 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 49431784
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Sbjct 92139499 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 92139548
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Sbjct 1980048 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 1979999
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Sbjct 95794265 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 95794314
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sequence
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Sbjct 9255533 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 9255582
>ref|NW_001838005.2| Homo sapiens chromosome 10 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188123, whole genome shotgun sequence
gb|DS486079.1| Homo sapiens SCAF_1103279188123 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 1980014 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 1979965
>ref|AC_000142.1| Homo sapiens chromosome 10, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 92139808 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 92139857
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
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Sbjct 92252716 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 92252765
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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Sbjct 49490817 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 49490864
>ref|NT_011109.17| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR19_CTG3_1
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assembly
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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>ref|NC_018930.2| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001627.2| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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Sbjct 49995348 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 49995395
>ref|NW_004929415.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150199.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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Sbjct 21868748 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 21868795
>gb|KE141360.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold353, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 1601204 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 1601251
>gb|GL583333.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_353, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 594811 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 594764
>gb|CM000509.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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Sbjct 46371938 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 46371985
>gb|DS990877.1| Homo sapiens SCAF_1112675837161 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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Sbjct 609804 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 609757
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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Sbjct 51718755 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 51718802
>gb|CH003466.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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Sbjct 47599571 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 47599618
>gb|CH471177.1| Homo sapiens 211000035830420 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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Sbjct 1536756 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 1536803
>ref|NW_001838497.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188216, whole genome shotgun sequence
gb|DS486239.1| Homo sapiens SCAF_1103279188216 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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Sbjct 609758 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 609711
>ref|AC_000151.1| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000480.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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Sbjct 46371613 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 46371660
>gb|CM000270.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 48
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shotgun sequence
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HSCHR14_CTG1
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 35980428 CTGGACTGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGATAAGAA 35980477
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Sbjct 36153234 CTGGACTGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGATAAGAA 36153283
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sequence
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>ref|NW_001838111.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187954, whole genome shotgun sequence
gb|DS486041.1| Homo sapiens SCAF_1103279187954 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 15097756 CTGGACTGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGATAAGAA 15097805
>ref|AC_000146.1| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 36396766 CTGGACTGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGATAAGAA 36396815
>gb|CM000265.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
Length=87316725
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Sbjct 36282534 CTGGACTGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGATAAGAA 36282583
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT
>ref|XR_170662.2| PREDICTED: Pan troglodytes 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC101058343), misc_RNA
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Sbjct 54 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 5
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(LOC743697), misc_RNA
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Sbjct 76 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 27
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(LOC100936439), misc_RNA
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Sbjct 60 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 11
>ref|XR_654198.1| PREDICTED: Pongo abelii 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100443580), misc_RNA
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 58 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 9
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(LOC100975598), misc_RNA
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Sbjct 65 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 16
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mRNA
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Sbjct 55 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 6
>ref|XR_122927.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100606191), misc_RNA
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
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Sbjct 84 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 35
>ref|XM_004061165.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L13a, transcript
variant 7 (RPL13A), mRNA
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Sbjct 112 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 63
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variant 3 (RPL13A), mRNA
Length=755
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Sbjct 106 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 57
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variant 1 (RPL13A), mRNA
Length=1323
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 57
>ref|XM_004054569.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla 60S ribosomal protein L13a-like
(LOC101139383), mRNA
Length=726
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 14
>ref|NR_073024.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a (RPL13A), transcript variant
3, non-coding RNA
Length=1186
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 112 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 63
>ref|NM_001270491.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a (RPL13A), transcript variant
2, mRNA
Length=1120
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Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 112 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 63
>ref|NM_012423.3| Homo sapiens ribosomal protein L13a (RPL13A), transcript variant
1, mRNA
Length=1196
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 112 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 63
>ref|NR_026712.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a pseudogene 5 (RPL13AP5),
non-coding RNA
Length=658
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 9
>dbj|AK297859.1| Homo sapiens cDNA FLJ51256 complete cds, highly similar to 60S
ribosomal protein L13a
Length=929
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 9
>dbj|AK291120.1| Homo sapiens cDNA FLJ75551 complete cds, highly similar to Homo
sapiens ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA
Length=1124
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 9
>gb|AC191221.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-653E5 from chromosome 7, complete
sequence
Length=188280
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26692 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 26643
>gb|BC105605.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:111166
IMAGE:6726477), complete cds
Length=680
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 13
>gb|BC070223.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:88204
IMAGE:6736442), complete cds
Length=1153
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 9
>gb|AC146032.2| Pan troglodytes BAC clone RP43-14B10 from chromosome 7, complete
sequence
Length=181694
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30322 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 30371
>dbj|AK056837.1| Homo sapiens cDNA FLJ32275 fis, clone PROST2000053, moderately
similar to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L13A
Length=2315
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 9
>emb|AL358235.16| Human DNA sequence from clone RP11-196N24 on chromosome 10, complete
sequence
Length=106506
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 80903 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 80854
>dbj|AK130605.1| Homo sapiens cDNA FLJ27095 fis, clone SPL04438, highly similar
to 60S ribosomal protein L13A
Length=1125
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 10
>emb|X56932.1| H.sapiens mRNA for 23 kD highly basic protein
Length=672
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 4
>ref|XM_004061160.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L13a, transcript
variant 2 (RPL13A), mRNA
Length=1272
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 7
>dbj|AB168305.1| Macaca fascicularis testis cDNA clone: QtsA-11103, similar to
human ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA, RefSeq: NM_012423.2
Length=680
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 10
>ref|XM_512821.5| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA
Length=1181
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 71
>ref|XR_675029.1| PREDICTED: Pan troglodytes 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC454185), misc_RNA
Length=692
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 22
>ref|XR_673844.1| PREDICTED: Pan troglodytes 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC452746), misc_RNA
Length=675
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 4
>ref|XR_673439.1| PREDICTED: Pan troglodytes 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC465277), misc_RNA
Length=667
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 53 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGCCAGCCGCT 4
>ref|XM_002825857.3| PREDICTED: Pongo abelii 60S ribosomal protein L13a (LOC100460321),
mRNA
Length=660
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 58 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 9
>ref|XM_003814327.2| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA
Length=1176
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 112 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 66
>ref|NG_009777.3| Homo sapiens ribosomal protein L13a pseudogene 7 (RPL13AP7) on
chromosome 21
Length=1330
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 113
>ref|XR_175687.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC101133922), misc_RNA
Length=673
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 TCGACCATCAAGCACCGGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 24
>ref|NM_001132338.2| Pongo abelii ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA
Length=771
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 58 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 9
>ref|NG_012730.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a pseudogene 25 (RPL13AP25)
on chromosome 13
Length=860
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 155 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 109
>ref|NG_010902.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a pseudogene 14 (RPL13AP14)
on chromosome 5
Length=802
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 87
>gb|AC205924.3| Pongo abelii BAC clone CH276-441G3 from chromosome 12, complete
sequence
Length=216710
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81919 TCGACCATCAAACACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 81968
>gb|AC093286.3| Homo sapiens chromosome 5 clone RP11-456A14, complete sequence
Length=145047
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9342 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 9388
>emb|AL356120.10| Human DNA sequence from clone RP11-365K22 on chromosome 13, complete
sequence
Length=83727
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13746 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 13792
>emb|CR859183.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469O181 (from clone DKFZp469O181)
Length=772
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 59 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 10
>gb|AC020899.6| Homo sapiens chromosome 5 clone CTC-484M2, complete sequence
Length=164286
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143619 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 143665
>gb|BC032107.2| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone IMAGE:4644246)
Length=1139
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 1
>dbj|AP001693.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 21q, section 37/105
Length=340000
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107904 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 107855
>dbj|AP001340.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 21q21.1-q21.2 clone:B2289H10,
LL56-APP region, complete sequence
Length=58771
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 44713 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 44664
>ref|XM_010369473.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ribosomal protein L13a (RPL13A),
transcript variant X4, mRNA
Length=650
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 58 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCATCTTCGGCAGCCGC 10
>ref|XM_010369471.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ribosomal protein L13a (RPL13A),
transcript variant X3, mRNA
Length=709
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 107 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCATCTTCGGCAGCCGC 59
>ref|XM_010369469.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ribosomal protein L13a (RPL13A),
transcript variant X1, mRNA
Length=1315
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 73 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCATCTTCGGCAGCCGC 25
>ref|XM_009194963.1| PREDICTED: Papio anubis ribosomal protein L13a (RPL13A), transcript
variant X2, mRNA
Length=1169
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 112 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 64
>ref|XM_009194962.1| PREDICTED: Papio anubis ribosomal protein L13a (RPL13A), transcript
variant X1, mRNA
Length=1174
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 59
>ref|XM_008988394.1| PREDICTED: Callithrix jacchus ribosomal protein L13a (RPL13A),
transcript variant X2, mRNA
Length=648
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 56 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGGAGCCGC 8
>ref|XM_002762345.3| PREDICTED: Callithrix jacchus ribosomal protein L13a (RPL13A),
transcript variant X1, mRNA
Length=801
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 200 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGGAGCCGC 152
>ref|XR_614628.1| PREDICTED: Callithrix jacchus 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100404842), misc_RNA
Length=1137
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 59 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGGAGCCGC 11
>ref|XM_005589919.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865290 (LOC101865290),
transcript variant X4, mRNA
Length=1169
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 112 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 64
>ref|XM_005589916.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865290 (LOC101865290),
transcript variant X1, mRNA
Length=1295
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 228 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 180
>ref|XM_003257834.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys 60S ribosomal protein L13a-like
(LOC100595911), mRNA
Length=1140
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 CGACCGTCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 12
>dbj|AB170257.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-11018, similar to
human ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA, RefSeq: NM_012423.2
Length=1088
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 10
>ref|XM_001093017.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L13a-like (LOC698713),
mRNA
Length=678
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 5
>gb|BC065236.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:70840
IMAGE:6161599), complete cds
Length=663
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGC 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGC 1
>ref|XR_674051.1| PREDICTED: Pan troglodytes 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC104002027), misc_RNA
Length=660
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 103 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 54
>ref|XR_610934.1| PREDICTED: Pan paniscus 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100982281), misc_RNA
Length=671
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 50 ACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCAGCAGCCGCT 4
>ref|NG_002538.5| Homo sapiens ribosomal protein L13a pseudogene 2 (RPL13AP2) on
chromosome 14
Length=773
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 153 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 104
>ref|XM_005586079.1| PREDICTED: Macaca fascicularis 60S ribosomal protein L13a-like
(LOC102143207), mRNA
Length=676
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 GACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 10
>ref|XR_120980.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100604258), misc_RNA
Length=677
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 70 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCACCATCTTTGGCAGCCGCT 21
>emb|AL157792.3| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-388M7 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=194760
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 115717 TCGACCATCAAGCACCAAGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCAGCT 115766
>ref|XR_161296.2| PREDICTED: Papio anubis 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC101021272), misc_RNA
Length=1123
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 TCGACCATGGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 3
>ref|XR_610962.1| PREDICTED: Pan paniscus 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100979118), misc_RNA
Length=646
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGC 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 46 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGCCAGC 1
>ref|XM_008002294.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus 60S ribosomal protein L13a-like
(LOC103237908), transcript variant X1, mRNA
Length=1162
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 99 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAACCGC 51
>ref|XM_007997565.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ribosomal protein L13a (RPL13A),
transcript variant X1, mRNA
Length=1295
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 228 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAACCGC 180
>gb|BC071921.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6423605, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1357
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGG 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGG 666
>gb|AF109186.1| Homo sapiens FWP004 mRNA, complete cds
Length=1247
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGG 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 624 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGG 583
>gb|BC071929.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:88614
IMAGE:5808487), complete cds
Length=1126
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGG 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGG 1
>ref|XR_156318.2| PREDICTED: Pan paniscus 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100995486), misc_RNA
Length=631
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Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCG 41
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCG 1
>ref|XR_122641.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys 60S ribosomal protein L13a-like
(LOC100601324), misc_RNA
Length=1212
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 141 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCTGTCTTCGGCTGCCGCT 92
>ref|NG_028922.1| Homo sapiens soc-2 suppressor of clear homolog (C. elegans) (SHOC2),
RefSeqGene (LRG_753) on chromosome 10
Length=101125
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 47
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 22656 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCATCTTCGGCTGCC 22702
>ref|NG_010172.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a pseudogene 22 (RPL13AP22)
on chromosome 12
Length=2095
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||
Sbjct 1344 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCGTCTTCGCCAGCCGCT 1295
>ref|NR_026715.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a pseudogene 6 (RPL13AP6),
non-coding RNA
Length=653
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 47
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 58 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCATCTTCGGCTGCC 12
>gb|BC000514.2| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:8547
IMAGE:2822802), complete cds
Length=1125
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCG 41
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCG 1
>emb|AL158163.11| Human DNA sequence from clone RP11-348N5 on chromosome 10, complete
sequence
Length=204908
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCC 47
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 54726 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCATCTTCGGCTGCC 54772
>gb|AC024940.39| Homo sapiens 12 BAC RP11-627K11 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=205952
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||
Sbjct 94782 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCGTCTTCGCCAGCCGCT 94733
>gb|AC012156.14|AC012156 Homo sapiens 12p11-37.2-54.4 BAC RP11-433D24 (Rosewell Park Cancer
Institute Human Bac Library) complete sequence
Length=162200
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||
Sbjct 94556 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCTGCCGTCTTCGCCAGCCGCT 94605
>ref|XM_003940354.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ribosomal protein
L13a (RPL13A), transcript variant X2, mRNA
Length=708
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Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 106 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGAGAGCCGC 58
>ref|XM_003940355.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ribosomal protein
L13a (RPL13A), transcript variant X1, mRNA
Length=710
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 106 TCGACCATCGAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGAGAGCCGC 58
>ref|XR_620425.1| PREDICTED: Callithrix jacchus ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100400646), misc_RNA
Length=684
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGACCATCAAGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGCAGCCGC 49
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 54 TCGACCATCGCGCACCAGGACCTGCACCTCCGCCATCTTCGGAAGCCGC 6
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA
>ref|XM_512821.5| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA
Length=1181
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 425
>ref|XR_675029.1| PREDICTED: Pan troglodytes 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC454185), misc_RNA
Length=692
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 376
>ref|XR_673439.1| PREDICTED: Pan troglodytes 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC465277), misc_RNA
Length=667
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 379
>ref|XR_681206.1| PREDICTED: Pan troglodytes 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC743697), misc_RNA
Length=1148
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 384
>ref|XR_612964.1| PREDICTED: Pan paniscus 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100975598), misc_RNA
Length=1137
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 373
>ref|XM_003814327.2| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA
Length=1176
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 420
>ref|XR_156318.2| PREDICTED: Pan paniscus 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100995486), misc_RNA
Length=631
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 338
>gb|KJ906094.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15764 RPL13A
gene, encodes complete protein
Length=741
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 409
>gb|KJ898501.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_07895 RPL13A
gene, encodes complete protein
Length=741
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 409
>gb|KJ893391.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_02785 RPL13A
gene, encodes complete protein
Length=741
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 409
>ref|XM_004054569.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla 60S ribosomal protein L13a-like
(LOC101139383), mRNA
Length=726
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 371
>ref|NR_073024.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a (RPL13A), transcript variant
3, non-coding RNA
Length=1186
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 410
>ref|NM_001270491.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a (RPL13A), transcript variant
2, mRNA
Length=1120
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 344
>ref|NM_012423.3| Homo sapiens ribosomal protein L13a (RPL13A), transcript variant
1, mRNA
Length=1196
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 420
>gb|HQ447707.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100071035; CCSB013763_03
ribosomal protein L13a (RPL13A) gene, encodes complete
protein
Length=711
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 394
>dbj|AB529025.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB3388, Homo sapiens RPL13A
gene for ribosomal protein L13a, without stop codon, in Flexi
system
Length=626
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 353
>ref|NR_026712.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a pseudogene 5 (RPL13AP5),
non-coding RNA
Length=658
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 366
>gb|EU831455.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100066484; DKFZo008E0717
ribosomal protein L13a protein (RPL13A) gene, encodes
complete protein
Length=655
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 366
>gb|EU831542.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100066571; DKFZo004E0718
ribosomal protein L13a protein (RPL13A) gene, encodes
complete protein
Length=655
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 366
>emb|CU687556.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100022338
5' read RPL13A mRNA
Length=1374
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 360
>dbj|AK291120.1| Homo sapiens cDNA FLJ75551 complete cds, highly similar to Homo
sapiens ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA
Length=1124
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 366
>gb|AC191221.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-653E5 from chromosome 7, complete
sequence
Length=188280
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26951 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 27000
>gb|BC105605.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:111166
IMAGE:6726477), complete cds
Length=680
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 360
>gb|BC071921.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6423605, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1357
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 966 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 1015
>gb|BC021568.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3343061, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2530
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2171 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 2220
>gb|AF109186.1| Homo sapiens FWP004 mRNA, complete cds
Length=1247
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 932
>gb|BC070223.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:88204
IMAGE:6736442), complete cds
Length=1153
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 366
>gb|BC065236.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:70840
IMAGE:6161599), complete cds
Length=663
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 354
>gb|BC000514.2| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:8547
IMAGE:2822802), complete cds
Length=1125
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 349
>gb|AC146032.2| Pan troglodytes BAC clone RP43-14B10 from chromosome 7, complete
sequence
Length=181694
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30063 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 30014
>gb|BC013230.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone IMAGE:3462928)
Length=658
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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partial cds
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Sbjct 291 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 340
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sequence
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>dbj|AK130605.1| Homo sapiens cDNA FLJ27095 fis, clone SPL04438, highly similar
to 60S ribosomal protein L13A
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IMAGE:5808487), complete cds
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Sbjct 301 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 350
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>gb|BC062537.1| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:71249
IMAGE:4908022), complete cds
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>gb|BC001675.2| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:2546
IMAGE:2961667), complete cds
gb|BC001836.2| Homo sapiens ribosomal protein L13a, mRNA (cDNA clone MGC:4241
IMAGE:2961667), complete cds
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(LOC452746), misc_RNA
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>ref|XR_610934.1| PREDICTED: Pan paniscus 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100982281), misc_RNA
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Sbjct 313 TGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 361
>emb|CU687557.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100022338
3' read RPL13A mRNA
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Sbjct 331 GGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 284
>dbj|AK056837.1| Homo sapiens cDNA FLJ32275 fis, clone PROST2000053, moderately
similar to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L13A
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>gb|AC010619.7| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-3148I10, complete sequence
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Sbjct 77988 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 78035
>dbj|AB028893.1| Homo sapiens RPL13A, U32, U33, U34, U35, RPS11, U35 genes for
ibosomal protein L13a and S11, U32, U33, U34, U35, and U35
snoRNA, complete cds and sequence
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Sbjct 3997 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 4044
>emb|X94600.1| H.sapiens U34 small nucleolar RNA gene
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Sbjct 13 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 60
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pseudogene (LOC104675236), misc_RNA
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Sbjct 303 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 352
>ref|XR_749522.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S ribosomal protein L13a
pseudogene (LOC104673527), misc_RNA
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Sbjct 374 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 423
>ref|XM_010369473.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ribosomal protein L13a (RPL13A),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 307 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 356
>ref|XM_010369471.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ribosomal protein L13a (RPL13A),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 366 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 415
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(LOC101058343), misc_RNA
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Sbjct 302 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACAGCCCTACGACAAGAA 351
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mRNA
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Sbjct 317 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTATGACAAGAA 366
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variant X2, mRNA
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Sbjct 361 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 410
>ref|XM_009194962.1| PREDICTED: Papio anubis ribosomal protein L13a (RPL13A), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 366 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 415
>ref|XR_610962.1| PREDICTED: Pan paniscus 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100979118), misc_RNA
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Sbjct 305 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCTCTACGACAAGAA 354
>ref|XM_005589919.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865290 (LOC101865290),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 361 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 410
>ref|XM_005589918.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865290 (LOC101865290),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 382 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 431
>ref|XM_005589917.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865290 (LOC101865290),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 323 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 372
>ref|XM_005589916.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865290 (LOC101865290),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 487 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 536
>ref|XM_005586079.1| PREDICTED: Macaca fascicularis 60S ribosomal protein L13a-like
(LOC102143207), mRNA
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Sbjct 311 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 360
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(LOC100601324), misc_RNA
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Sbjct 386 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 435
>ref|XM_003257834.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys 60S ribosomal protein L13a-like
(LOC100595911), mRNA
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Sbjct 320 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 369
>ref|XR_122927.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100606191), misc_RNA
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Sbjct 345 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 394
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variant 7 (RPL13A), mRNA
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Sbjct 295 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCACCCTACGACAAGAA 344
>ref|XM_004061164.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L13a, transcript
variant 6 (RPL13A), mRNA
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Sbjct 198 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCACCCTACGACAAGAA 247
>ref|XM_004061163.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L13a, transcript
variant 5 (RPL13A), mRNA
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Sbjct 154 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCACCCTACGACAAGAA 203
>ref|XM_004061162.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L13a, transcript
variant 4 (RPL13A), mRNA
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Sbjct 500 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCACCCTACGACAAGAA 549
>ref|XM_004061161.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L13a, transcript
variant 3 (RPL13A), mRNA
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Sbjct 365 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCACCCTACGACAAGAA 414
>ref|XM_004061160.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L13a, transcript
variant 2 (RPL13A), mRNA
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Sbjct 314 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCACCCTACGACAAGAA 363
>ref|XM_004061159.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L13a, transcript
variant 1 (RPL13A), mRNA
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Sbjct 365 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCACCCTACGACAAGAA 414
>ref|NM_001132338.2| Pongo abelii ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA
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Sbjct 317 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTATGACAAGAA 366
>ref|XR_095841.2| PREDICTED: Pongo abelii 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100435626), misc_RNA
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Sbjct 313 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 362
>ref|NM_001195419.1| Macaca mulatta ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA
Length=646
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Sbjct 303 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 352
>emb|FM208094.1| Macaca mulatta partial mRNA for ribosomal protein L13A (RPL13a
gene)
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Sbjct 112 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 161
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human ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA, RefSeq: NM_012423.2
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Sbjct 384 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 433
>dbj|AB170257.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-11018, similar to
human ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA, RefSeq: NM_012423.2
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mRNA
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human ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA, RefSeq: NM_012423.2
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Sbjct 317 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 366
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DMC05308
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Sbjct 318 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTATGACAAGAA 367
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cds
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L13a pseudogene (LOC104651035), misc_RNA
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on chromosome 13
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Sbjct 418 TGGACCGTCTCAAGGTGTCTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 466
>emb|AL356120.10| Human DNA sequence from clone RP11-365K22 on chromosome 13, complete
sequence
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 304 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 351
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 332 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 379
>ref|XM_004092900.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein L13a (RPL13A),
mRNA
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Sbjct 314 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAG 361
>ref|XR_748945.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S ribosomal protein L13a
pseudogene (LOC104669142), misc_RNA
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Sbjct 301 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTAACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 350
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(LOC100459167), misc_RNA
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Sbjct 292 CTGGACCGCCTCCAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 341
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(LOC100443580), misc_RNA
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Sbjct 317 CTGGACCGTCTCAGGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACCACAAGAA 366
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(LOC100995884), misc_RNA
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Sbjct 331 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTGCGACAAGAA 380
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 352 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTATGACAAGAA 401
>ref|XM_007997565.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ribosomal protein L13a (RPL13A),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 487 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTATGACAAGAA 536
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(LOC101176549), misc_RNA
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Sbjct 299 CTGGACTGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 348
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(LOC101128254), misc_RNA
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Sbjct 310 CTGGACCGCCTGAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 359
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(LOC101151385), mRNA
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Sbjct 315 CTGGACCGCCTCAGGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 364
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(LOC101136197), misc_RNA
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Sbjct 1138 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACGAGAA 1187
>ref|XR_174662.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC101129774), misc_RNA
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Sbjct 311 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTAGGACAAGAA 360
>ref|XR_009762.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L13a-like (LOC693856),
miscRNA
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Sbjct 295 CTGGACCGCCTCCAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 344
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on chromosome 5
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Sbjct 395 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTAGGACAAGAA 444
>ref|NR_003932.2| Homo sapiens ribosomal protein L13a pseudogene 20 (RPL13AP20),
non-coding RNA
Length=660
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 317 CTGGACTGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 366
>gb|AC093286.3| Homo sapiens chromosome 5 clone RP11-456A14, complete sequence
Length=145047
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 9080 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTAGGACAAGAA 9031
>gb|AC007688.15| Homo sapiens 12 BAC RPCI11-392P7 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=161577
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
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Sbjct 131601 CTGGACTGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 131552
>gb|AC020899.6| Homo sapiens chromosome 5 clone CTC-484M2, complete sequence
Length=164286
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
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Sbjct 143357 CTGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTAGGACAAGAA 143308
>ref|XM_003940354.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ribosomal protein
L13a (RPL13A), transcript variant X2, mRNA
Length=708
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 2 TGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 366 TGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTATGACAAGAA 414
>ref|XM_003940355.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ribosomal protein
L13a (RPL13A), transcript variant X1, mRNA
Length=710
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 366 TGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTATGACAAGAA 414
>ref|XR_746022.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis 60S ribosomal protein
L13a pseudogene (LOC101032233), misc_RNA
Length=626
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 TGGACTGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 358
>ref|XR_746101.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis 60S ribosomal protein
L13a pseudogene (LOC101028422), misc_RNA
Length=465
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 116 TGGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTATGACAAGAA 164
>ref|XR_024781.3| PREDICTED: Pan troglodytes 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC452925), misc_RNA
Length=1539
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 TGGACTGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 348
>ref|XR_158483.2| PREDICTED: Pan paniscus 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100985088), misc_RNA
Length=1515
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 TGGACTGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 348
>dbj|AK297859.1| Homo sapiens cDNA FLJ51256 complete cds, highly similar to 60S
ribosomal protein L13a
Length=929
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACG 359
>ref|XM_008002295.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus 60S ribosomal protein L13a-like
(LOC103237908), transcript variant X2, mRNA
Length=1114
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 312 GGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCGTACGACAAGAA 359
>ref|XM_008002294.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus 60S ribosomal protein L13a-like
(LOC103237908), transcript variant X1, mRNA
Length=1162
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 360 GGACCGCCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCGTACGACAAGAA 407
>ref|XR_094928.2| PREDICTED: Pongo abelii 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100455700), misc_RNA
Length=1555
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 CTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307 CTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAA 347
>ref|XR_093491.3| PREDICTED: Pongo abelii 60S ribosomal protein L13a pseudogene
(LOC100443372), misc_RNA
Length=629
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2645 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2596
>ref|XR_127214.2| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma 2 pseudogene (LOC100615335), misc_RNA
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Sbjct 398 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 349
>ref|XM_009246647.1| PREDICTED: Pongo abelii eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 3038 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2989
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4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2470 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2421
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factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2744 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2695
>ref|NM_001082379.2| Oryctolagus cuniculus eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2525 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2476
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factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2933 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2884
>ref|XM_005380528.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (Eif4g2), mRNA
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Sbjct 2600 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2551
>ref|XM_003465755.2| PREDICTED: Cavia porcellus eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (Eif4g2), mRNA
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Sbjct 2480 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2431
>ref|XM_004418652.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2597 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2548
>ref|XM_003254938.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 1 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2438 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2389
>ref|XM_004050709.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 4 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2880 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2831
>ref|XM_004050708.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 3 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2441 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2392
>ref|XM_004050707.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2597 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2548
>ref|XM_004050706.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 1 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2711 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2662
>ref|XM_003781515.1| PREDICTED: Otolemur garnettii eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 1037 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 988
>dbj|AK306591.1| Pan troglodytes mRNA for eukaryotic translation initiation factor
4 gamma 2, complete cds, clone: PtsC-14-5_D09
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Sbjct 1460 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 1411
>ref|XM_003254940.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 3 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2754 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2705
>ref|NM_001172705.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2 (EIF4G2), transcript variant 3, mRNA
Length=4028
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Sbjct 2753 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2704
>dbj|AK302886.1| Homo sapiens cDNA FLJ59571 complete cds, highly similar to Eukaryotic
translation initiation factor 4gamma 2
Length=3045
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Sbjct 2464 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2415
>ref|NM_001418.3| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2 (EIF4G2), transcript variant 1, mRNA
Length=3911
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Sbjct 2636 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2587
>ref|NM_001042559.2| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2 (EIF4G2), transcript variant 2, mRNA
Length=3797
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Sbjct 2522 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2473
>gb|BC111415.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:133054 IMAGE:40008735), complete cds
Length=3460
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Sbjct 2309 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2260
>gb|BC018975.2| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:20099 IMAGE:3951907), complete cds
Length=3789
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Sbjct 2503 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2454
>gb|BC018746.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:31927 IMAGE:4299481), complete cds
Length=3799
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Sbjct 2514 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2465
>gb|BC065276.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:75160 IMAGE:6164568), complete cds
Length=4015
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2730 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2681
>gb|BC014930.2| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3919749), partial cds
Length=1838
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 556 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 507
>dbj|AB073654.1| Homo sapiens primary neuroblastoma cDNA, clone:Nbla00315, full
insert sequence
Length=1639
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 170 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 121
>gb|BC043149.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:41891 IMAGE:5295212), complete cds
Length=3814
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2532 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2483
>dbj|AK223548.1| Homo sapiens mRNA for eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 variant, clone: FCC126E04
Length=3840
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2557 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2508
>dbj|AB209267.1| Homo sapiens mRNA for eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 variant protein
Length=3781
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2514 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2465
>emb|CR860116.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459D102 (from clone DKFZp459D102)
Length=3810
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2525 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2476
>emb|CR858801.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459G247 (from clone DKFZp459G247)
Length=3808
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2526 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2477
>gb|AC116535.9| Homo sapiens chromosome 11, clone RP11-685M7, complete sequence
Length=192490
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 131993 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 132042
>emb|X89713.1| H.sapiens mRNA for death associated protein 5
Length=3560
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2258 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2209
>gb|BC111548.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:133053 IMAGE:40008727), complete cds
Length=3346
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2195 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2146
>gb|AY513274.1| Homo sapiens aging-associated protein 1 (AAG1) mRNA, complete
cds
Length=3825
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2520 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2471
>emb|BX647799.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L178 (from clone DKFZp686L178)
Length=6862
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 5578 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 5529
>gb|BC039851.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:48877 IMAGE:6066795), complete cds
Length=3875
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2519 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2470
>dbj|AB063323.1| Homo sapiens mRNA for eukaryotic translation initiation factor
4 gamma 2, complete cds
Length=1474
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 187 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 138
>gb|U76113.1|OCU76113 Oryctolagus cuniculus translation repressor NAT1 mRNA, complete
cds
Length=3789
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2525 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2476
>gb|U76111.1|HSU76111 Human translation repressor NAT1 mRNA, complete cds
Length=3786
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2526 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2477
>gb|U73824.1|HSU73824 Human p97 mRNA, complete cds
Length=3820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2525 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2476
>ref|XM_009007766.1| PREDICTED: Callithrix jacchus eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3679
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2408 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAAAAACTCAG 2359
>ref|XM_008711943.1| PREDICTED: Ursus maritimus eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3813
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2546 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGAAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2497
>ref|XM_008542493.1| PREDICTED: Equus przewalskii eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=4254
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2987 TGCTTCAACAGTTCCTTTTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2938
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factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2516 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACT 2470
>ref|XM_008069290.1| PREDICTED: Tarsius syrichta eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACT 47
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Sbjct 2311 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACT 2265
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initiation factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2753 TGCTTTAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2704
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factor 4 gamma 2-like (LOC102986567), mRNA
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Sbjct 2570 TGCTTTAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2521
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factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2354 TGCTTCAACAATTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2305
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4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2426 TGCTTCAACAATTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2377
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factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2495 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGAAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2446
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factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2699 TGCTTCAACAATTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2650
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4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 3062 TGCTTTAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 3013
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4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2408 TGCTTTAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2359
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4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2852 TGCTTCAACAGTTCCTTTTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2803
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factor 4 gamma, 2 (Eif4g2), mRNA
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Sbjct 3020 TGCTTCAATAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2971
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factor 4 gamma, 2 (Eif4g2), mRNA
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Sbjct 2342 TGCTTCAATAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2293
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factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2531 TGCTTCAGCAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2482
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factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2531 TGCTTCAGCAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2482
>ref|XM_004650677.1| PREDICTED: Jaculus jaculus eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (Eif4g2), mRNA
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Sbjct 2444 TGCTTCAATAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2395
>ref|XM_004394628.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens eukaryotic translation
initiation factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2756 TGCTTCAACAGCTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2707
>ref|XR_186301.1| PREDICTED: Tursiops truncatus eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma 2-like (LOC101337359), partial misc_RNA
Length=2485
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Sbjct 2170 TGCTTTAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2121
>ref|XM_004279270.1| PREDICTED: Orcinus orca eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3735
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Sbjct 2468 TGCTTTAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 2419
>ref|XM_007521172.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), partial mRNA
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACTCAG 50
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Sbjct 2297 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAGGAAGCTCAG 2248
>ref|XM_007497293.1| PREDICTED: Monodelphis domestica eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), partial mRNA
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACT 47
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Sbjct 2738 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGAAGTGGGAACAAGAAACT 2692
>ref|XM_004593840.1| PREDICTED: Ochotona princeps eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3913
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAA 44
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Sbjct 2636 TGCTTCAAAAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAA 2593
>ref|XM_003773611.1| PREDICTED: Sarcophilus harrisii eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3687
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
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Query 1 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGGAGTGGGAATAAGAAACT 47
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Sbjct 2414 TGCTTCAACAGTTCCTTCTCCAATTTGAGAAGTGGGAACAAGAAACT 2368
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT
>ref|XM_003951834.2| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X3, mRNA
Length=3864
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Sbjct 2285 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2334
>ref|XM_009459946.1| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 1661 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 1710
>ref|XM_009459945.1| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X1, mRNA
Length=3912
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2333 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2382
>ref|XR_127214.2| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma 2 pseudogene (LOC100615335), misc_RNA
Length=674
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 86 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 135
>ref|XM_009246647.1| PREDICTED: Pongo abelii eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=4309
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2726 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2775
>ref|XM_008971421.1| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3741
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2158 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2207
>ref|XM_003254938.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 1 (EIF4G2), mRNA
Length=3713
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2126 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2175
>ref|XM_004050709.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 4 (EIF4G2), mRNA
Length=4155
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2568 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2617
>ref|XM_004050708.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 3 (EIF4G2), mRNA
Length=3716
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2129 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2178
>ref|XM_004050707.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3872
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2285 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2334
>ref|XM_004050706.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 1 (EIF4G2), mRNA
Length=3986
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2399 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2448
>dbj|AK306591.1| Pan troglodytes mRNA for eukaryotic translation initiation factor
4 gamma 2, complete cds, clone: PtsC-14-5_D09
Length=2126
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 1148 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 1197
>ref|XM_003254940.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2, transcript variant 3 (EIF4G2), mRNA
Length=4029
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2442 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2491
>ref|NM_001172705.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2 (EIF4G2), transcript variant 3, mRNA
Length=4028
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2490
>dbj|AK302886.1| Homo sapiens cDNA FLJ59571 complete cds, highly similar to Eukaryotic
translation initiation factor 4gamma 2
Length=3045
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2201
>ref|NM_001418.3| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2 (EIF4G2), transcript variant 1, mRNA
Length=3911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2324 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2373
>ref|NM_001042559.2| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2 (EIF4G2), transcript variant 2, mRNA
Length=3797
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2259
>gb|BC111415.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:133054 IMAGE:40008735), complete cds
Length=3460
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2046
>gb|BC018975.2| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:20099 IMAGE:3951907), complete cds
Length=3789
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2191 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2240
>gb|BC018746.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:31927 IMAGE:4299481), complete cds
Length=3799
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2202 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2251
>gb|BC065276.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:75160 IMAGE:6164568), complete cds
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2418 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2467
>gb|BC014930.2| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3919749), partial cds
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 244 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 293
>gb|BC043149.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:41891 IMAGE:5295212), complete cds
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Sbjct 2220 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2269
>dbj|AK223548.1| Homo sapiens mRNA for eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 variant, clone: FCC126E04
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Sbjct 2245 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2294
>dbj|AB209267.1| Homo sapiens mRNA for eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 variant protein
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Sbjct 2202 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2251
>emb|CR860116.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459D102 (from clone DKFZp459D102)
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Sbjct 2213 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2262
>emb|CR858801.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459G247 (from clone DKFZp459G247)
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Sbjct 2214 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2263
>gb|AC116535.9| Homo sapiens chromosome 11, clone RP11-685M7, complete sequence
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Sbjct 132638 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 132589
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Sbjct 1946 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 1995
>gb|BC111548.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:133053 IMAGE:40008727), complete cds
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Sbjct 1883 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 1932
>gb|AY513274.1| Homo sapiens aging-associated protein 1 (AAG1) mRNA, complete
cds
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Sbjct 2208 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2257
>emb|BX647799.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L178 (from clone DKFZp686L178)
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Sbjct 4933 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 4982
>gb|BC039851.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4 gamma,
2, mRNA (cDNA clone MGC:48877 IMAGE:6066795), complete cds
Length=3875
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Sbjct 2207 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2256
>gb|U76111.1|HSU76111 Human translation repressor NAT1 mRNA, complete cds
Length=3786
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Sbjct 2214 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2263
>gb|U73824.1|HSU73824 Human p97 mRNA, complete cds
Length=3820
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Sbjct 2213 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2262
>ref|XM_010592312.1| PREDICTED: Loxodonta africana eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2303 TCCCTTTGGTGAAATCTTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2352
>ref|XM_007956733.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3819
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2237 TCCCTTTGGTGAAATCTTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2286
>ref|XM_006873029.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3680
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2099 TCCCTTTGGTGAAATCTTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2148
>ref|XM_006728524.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X3, mRNA
Length=3504
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 1926 TCCCCTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 1975
>ref|XM_006728523.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X2, mRNA
Length=3282
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 1704 TCCCCTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 1753
>ref|XM_006728522.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X1, mRNA
Length=2937
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 1359 TCCCCTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 1408
>ref|XM_004815903.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2219 TCCCTTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2268
>ref|XM_004752172.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3367
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2219 TCCCTTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2268
>ref|XM_004458452.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3817
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2240 TCCCCTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2289
>ref|XM_004394628.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens eukaryotic translation
initiation factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=4022
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2444 TCCCCTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2493
>ref|XM_004369822.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris eukaryotic translation
initiation factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3581
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 1997 TCCCTTTGGTGAAATCTTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2046
>ref|XM_010615379.1| PREDICTED: Fukomys damarensis eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (Eif4g2), mRNA
Length=3290
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2129 TCCCTTTGGTGAAATCATACTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2178
>ref|XM_003920388.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis eukaryotic translation
initiation factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=4237
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2660 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2709
>ref|XM_010384854.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=4145
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2552 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2601
>ref|XM_009186587.1| PREDICTED: Papio anubis eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X3, mRNA
Length=3863
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2280 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2329
>ref|XM_009186586.1| PREDICTED: Papio anubis eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X2, mRNA
Length=3911
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2328 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2377
>ref|XM_009186584.1| PREDICTED: Papio anubis eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X1, mRNA
Length=3514
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 1931 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 1980
>ref|XM_009007766.1| PREDICTED: Callithrix jacchus eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3679
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2096 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2145
>ref|XM_008711943.1| PREDICTED: Ursus maritimus eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3813
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2234 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2283
>ref|XM_008151094.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3892
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2309 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2358
>ref|XM_008069291.1| PREDICTED: Tarsius syrichta eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X2, mRNA
Length=3786
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2204 TCCCCTTGGTGAAATCGTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2253
>ref|XM_008069290.1| PREDICTED: Tarsius syrichta eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), transcript variant X1, mRNA
Length=3581
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 1999 TCCCCTTGGTGAAATCGTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2048
>ref|XM_008006752.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3817
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2238 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2287
>ref|XM_007083297.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3620
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2091
>ref|XM_006937149.1| PREDICTED: Felis catus eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3692
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2114 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2163
>ref|XM_006905684.1| PREDICTED: Pteropus alecto eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3764
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2183 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2232
>ref|XM_006885592.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3753
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2921 TCCCCTTGGTGAAATCTTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2970
>ref|XM_006167460.1| PREDICTED: Tupaia chinensis eukaryotic translation initiation
factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3966
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2387 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2436
>ref|NM_001082379.2| Oryctolagus cuniculus eukaryotic translation initiation factor
4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
Length=3815
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TCCCTTTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 50
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Sbjct 2213 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2262
>ref|XM_006089686.1| PREDICTED: Myotis lucifugus eukaryotic translation initiation
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Sbjct 2171 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2220
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4 gamma, 2, transcript variant 2 (EIF4G2), mRNA
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Sbjct 2563 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2612
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Sbjct 2213 TCCCCTTGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2262
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Sbjct 2138 TCCCATTGGTGAAATCCTATTTAGCACAGTTTGCAGCCCGTGCCATTATT 2187
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Sbjct 2028 TCCCCTCGGTGAAATCATATTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2077
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factor 4 gamma, 2 (EIF4G2), partial mRNA
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Sbjct 1985 TCCCCTTGGTGAAATCATACTTAGCACAGTTTGCAGCTCGTGCCATCATT 2034
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4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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factor 4 gamma, 2 (Eif4g2), mRNA
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4 gamma, 2 (EIF4G2), mRNA
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assembly
Length=33453128
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 10974305 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 10974354
>ref|NC_018922.2| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001619.2| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=134889443
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 65150842 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 65150891
>ref|NW_004929380.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150164.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 10590426 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 10590475
>gb|KE141110.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold5, whole genome
shotgun sequence
Length=12743646
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 10434531 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 10434580
>gb|GL583008.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_28, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 12850795 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 12850746
>gb|CM000501.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 61593288 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 61593337
>gb|DS990792.1| Homo sapiens SCAF_1112675837086 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=4754558
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Sbjct 3808932 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 3808883
>gb|CH003506.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=137609055
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 63686694 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 63686743
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=131853179
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Sbjct 63770949 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 63770998
>gb|CH471076.1| Homo sapiens 211000035835228 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=33348968
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 10941205 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 10941254
>ref|NW_001838025.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188141, whole genome shotgun sequence
gb|DS486154.1| Homo sapiens SCAF_1103279188141 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=4754575
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Sbjct 3808942 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 3808893
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130895506
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Sbjct 61593943 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 61593992
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=132164248
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 62593129 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 62593178
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
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Sbjct 1355 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 1306
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
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Sbjct 76 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 27
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
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Sbjct 520 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 471
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
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Sbjct 520 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 471
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
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Sbjct 75 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 26
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
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Sbjct 754 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 705
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 24
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
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Sbjct 64990 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 64941
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
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Sbjct 696 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 745
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
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Sbjct 59 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 10
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
Length=7159
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1373 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCGCCCTCAGCAGAAGCCCC 1324
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
Length=7179
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCTGCCCCCTCAGCAGAAGCCCC 50
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 85 ACTTATCTGCGGTTTCCTCAAGCTCCGCCCGCGCCCTCAGCAGAAGCCCC 36
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
Length=7159
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 1636 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 1685
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
Length=7179
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 348 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 397
>tpe|LK938852.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473537.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=480
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 387
>tpe|LK938849.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473534.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=794
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 564 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 613
>gb|AC241892.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-1187322I23 from chromosome 11,
complete sequence
Length=44739
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 16134 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 16085
>gb|FJ209305.1| Homo sapiens MALAT1 mRNA, complete sequence
Length=7072
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 335 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 384
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 1618 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 1667
>gb|BC104662.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6106210
Length=820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 239
>dbj|AK022287.1| Homo sapiens cDNA FLJ12225 fis, clone MAMMA1001139, weakly similar
to SRE-2 PROTEIN
Length=2766
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 154
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 339 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 388
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 783 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 832
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 783 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 832
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 338 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 387
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 1066
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 385
>emb|AJ535462.1| Homo sapiens partial mRNA for TFEB transcription factor (AlphaTFEB
gene), tumor 2
Length=238
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 74
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 50
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Sbjct 65253 GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGAC 65302
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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11 11 65266547 65266938 11m65266850F89M GCAGAAGCCCC GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGACTTAAACAGCTTAAAGTTTAGTTTAAAAGTTGTAGGTGAT
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11 11 65266546 65266939 10m65266850F90M CAGAAGCCCC GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGACTTAAACAGCTTAAAGTTTAGTTTAAAAGTTGTAGGTGATT
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11 11 65266545 65266940 9m65266850F91M AGAAGCCCC GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGACTTAAACAGCTTAAAGTTTAGTTTAAAAGTTGTAGGTGATTA
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11 11 65266544 65266941 8m65266850F92M GAAGCCCC GAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGAGACTTAAACAGCTTAAAGTTTAGTTTAAAAGTTGTAGGTGATTAA
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11 11 65266840 65266940 100M CAGAGCCCCGAATTAATACCAATAGAAGGGCAATGCTTTTAGATTAAAATGAAGGTGACTTAAACAGCTTAAAGTTTAGTTTAAAAGTTGTAGGTGATTA
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Sbjct 10941132 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 10941181
>ref|NW_001838025.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188141, whole genome shotgun sequence
gb|DS486154.1| Homo sapiens SCAF_1103279188141 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 3809015 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 3808966
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 61593870 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 61593919
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 62593056 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 62593105
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCAT-GGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 63770875 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 63770925
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
Length=7179
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 124 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 75
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gene), lincRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 114 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 65
>tpe|LK938851.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473536.1 (MALAT1
gene), lincRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 114 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 65
>tpe|LK938850.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473535.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=352
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 114 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 65
>tpe|LK938849.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473534.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=794
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 340 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 291
>gb|AC241892.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-1187322I23 from chromosome 11,
complete sequence
Length=44739
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 16358 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 16407
>gb|FJ209305.1| Homo sapiens MALAT1 mRNA, complete sequence
Length=7072
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Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 111 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 62
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 1394 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 1345
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
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Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 115 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 66
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
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Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 559 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 510
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
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Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 559 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 510
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
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Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 114 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 65
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
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Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 793 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 744
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 112 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 63
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 65029 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 64980
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 657 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 706
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 98 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG 49
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
Length=7159
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTATCTGCG 50
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Sbjct 1412 AAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGTGAAAAAAACTTATCTGCG 1363
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
Length=7159
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 1563 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 1612
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
Length=7179
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 275 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 324
>tpe|LK938852.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473537.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=480
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 265 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 314
>tpe|LK938849.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473534.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=794
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 491 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 540
>ref|XR_175802.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla uncharacterized LOC101147172
(LOC101147172), misc_RNA
Length=2084
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 692 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 741
>gb|AC241892.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-1187322I23 from chromosome 11,
complete sequence
Length=44739
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 16207 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 16158
>gb|FJ209305.1| Homo sapiens MALAT1 mRNA, complete sequence
Length=7072
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 262 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 311
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 1545 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 1594
>gb|BC104662.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6106210
Length=820
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 117 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 166
>dbj|AK022287.1| Homo sapiens cDNA FLJ12225 fis, clone MAMMA1001139, weakly similar
to SRE-2 PROTEIN
Length=2766
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 32 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 81
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 266 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 315
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 710 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 759
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 710 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 759
>gb|AF187554.1| Homo sapiens sperm antigen-36 mRNA, complete cds
Length=3046
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 2846 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 2797
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 265 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 314
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 944 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 993
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 263 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 312
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 65180 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 65229
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 506 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 457
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 50
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Sbjct 249 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATT 298
>ref|XR_656034.1| PREDICTED: Pongo abelii uncharacterized LOC100171914 (LOC100171914),
misc_RNA
Length=4355
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGT-AAAAAATGTATTTAAAAGAAAAT 49
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Sbjct 278 GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAAATGTATTTGAAAGAAAAT 327
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11 11 65266605 65266846 30m65266777F70M ATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGAG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGC
11 11 65266605 65266846 30m65266777F70M ATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGAG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGC
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11 11 65266602 65266849 27m65266777F73M TTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCC
11 11 65266602 65266849 27m65266777F73M TTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCC
11 11 65266602 65266849 27m65266777F73M TTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCC
11 11 65266601 65266850 26m65266777F74M TTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCG
11 11 65266601 65266850 26m65266777F74M TTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCG
11 11 65266601 65266850 26m65266777F74M TTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCG
11 11 65266601 65266850 26m65266777F74M TTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCG
11 11 65266601 65266850 26m65266777F74M TTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGGGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCG
11 11 65266601 65266850 26m65266777F74M TTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCG
11 11 65266600 65266851 25m65266777F75M TCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGA
11 11 65266600 65266851 25m65266777F75M TCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGG
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11 11 65266599 65266852 24m65266777F76M CAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTGAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAA
11 11 65266598 65266853 23m65266777F77M GAAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGCATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAAT
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11 11 65266597 65266854 22m65266777F78M AAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGGAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAATT
11 11 65266597 65266854 22m65266777F78M AAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAATT
11 11 65266597 65266854 22m65266777F78M AAGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAATT
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11 11 65266596 65266855 21m65266777F79M AGAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAATTA
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11 11 65266595 65266856 20m65266777F80M GAGAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAATTAA
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11 11 65266593 65266858 18m65266777F82M AAAAAAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAATTAATA
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11 11 65266589 65266862 14m65266777F86M AAAACTTATCTGCG GTTGAGTTGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAATTAATACCAC
11 11 65266589 65266861 14m65266777F39M1I46M AAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAATTAATACCA
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11 11 65266589 65266862 14m65266777F86M AAAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAATTAATACCAA
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11 11 65266588 65266863 13m65266777F87M AAACTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAATTAATACCAAT
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11 11 65266585 65266866 10m65266777F90M CTTATCTGCG GTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACTACAGAGCCCCGAATTAATACCAATAGA
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Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 10590208 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 10590159
>gb|KE141110.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold5, whole genome
shotgun sequence
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 10434313 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 10434264
>gb|GL583008.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_28, whole genome
shotgun sequence
Length=19949113
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 12851013 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 12851062
>gb|CM000501.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 61593070 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 61593021
>gb|DS990792.1| Homo sapiens SCAF_1112675837086 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 3809150 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 3809199
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Sbjct 63686476 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 63686427
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=131853179
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 63770729 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 63770680
>gb|CH471076.1| Homo sapiens 211000035835228 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=33348968
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 10940987 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 10940938
>ref|NW_001838025.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188141, whole genome shotgun sequence
gb|DS486154.1| Homo sapiens SCAF_1103279188141 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 3809160 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 3809209
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 61593725 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 61593676
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 62592911 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 62592862
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG
>ref|NC_000011.10| Homo sapiens chromosome 11, GRCh38 Primary Assembly
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
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Sbjct 65499254 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 65499303
>ref|NT_167190.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR11_CTG3_1
gb|GL000103.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=33453128
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
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Sbjct 10974180 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 10974229
>ref|NC_018922.2| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001619.2| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=134889443
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
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Sbjct 65150717 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 65150766
>ref|NW_004929380.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150164.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=41610155
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
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Sbjct 10590301 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 10590350
>gb|GL583008.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_28, whole genome
shotgun sequence
Length=19949113
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
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Sbjct 12850920 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 12850871
>gb|CM000501.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130894309
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
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Sbjct 61593163 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 61593212
>gb|DS990792.1| Homo sapiens SCAF_1112675837086 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=4754558
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3809057 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 3809008
>gb|CH003506.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=137609055
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
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Sbjct 63686569 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 63686618
>gb|CH471076.1| Homo sapiens 211000035835228 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=33348968
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
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Sbjct 10941080 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 10941129
>ref|NW_001838025.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188141, whole genome shotgun sequence
gb|DS486154.1| Homo sapiens SCAF_1103279188141 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=4754575
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
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Sbjct 3809067 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 3809018
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130895506
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61593818 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 61593867
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=132164248
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62593004 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 62593053
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=131853179
Score = 89.8 bits (48), Expect = 8e-16
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGAC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63770822 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGAC 63770869
>gb|KE141110.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold5, whole genome
shotgun sequence
Length=12743646
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 10434406 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAGAACATGACGG 10434455
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
Length=7179
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 130 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 81
>tpe|LK938852.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473537.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=480
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 71
>tpe|LK938851.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473536.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=394
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 71
>tpe|LK938850.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473535.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 71
>tpe|LK938849.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473534.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=794
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 297
>gb|AC241892.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-1187322I23 from chromosome 11,
complete sequence
Length=44739
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16352 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 16401
>gb|FJ209305.1| Homo sapiens MALAT1 mRNA, complete sequence
Length=7072
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 117 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 68
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 1400 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 1351
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 121 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 72
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 565 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 516
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 565 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 516
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 120 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 71
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 799 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 750
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 69
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 65035 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 64986
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 700
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
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Sbjct 104 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA 55
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
Length=7159
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1418 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGTGAAAAAAACTTA 1369
>gb|AF187554.1| Homo sapiens sperm antigen-36 mRNA, complete cds
Length=3046
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGaaaaaaaCTTA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2991 TTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTGAAAGAGAAAAAAACTTA 3040
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG
>ref|XR_175802.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla uncharacterized LOC101147172
(LOC101147172), misc_RNA
Length=2084
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 640 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 689
>gb|AC241892.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-1187322I23 from chromosome 11,
complete sequence
Length=44739
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16259 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 16210
>gb|FJ209305.1| Homo sapiens MALAT1 mRNA, complete sequence
Length=7072
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 259
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 1542
>gb|BC104662.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6106210
Length=820
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 114
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 263
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 707
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 707
>gb|AF187554.1| Homo sapiens sperm antigen-36 mRNA, complete cds
Length=3046
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2898 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 2849
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 262
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 892 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 941
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65128 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 65177
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 509
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 246
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 GAAGAGTAGCATGAGAAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 260
>ref|XR_656034.1| PREDICTED: Pongo abelii uncharacterized LOC100171914 (LOC100171914),
misc_RNA
Length=4355
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Plus
Query 2 AAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGAT-AAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 50
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 226 AAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAAGGTTTCTAAAACATGACGG 275
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
11 11 65267049 65266616 96m333n4m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTG
11 11 65266836 65266677 1m60n63m1i35m T||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CCTTTCTCTCAATTTTCTTTTAAATACATTTTTTTACTCCATGAAGAAGCTTCATCTCAACCTCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCC
11 11 65266814 65266713 88m1d12m AAATACATTTTTACTCCATGAAGAAGCTTCATCTCAACCTCCGTCATATTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTDTCTAAGTCTTCA
11 11 65266811 65266711 100m TACATTTTTTACTCCATGAAGAAGCTTCATCTCAACCTCCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATA
11 11 65266808 65266708 100m ATTTTTTACTCCATGAAGAAGCTTCATCTCAACCTCCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTT
11 11 65266805 65266705 100m TTTTCCTCCATGAAGAAGCTTCATCTCAACCTCCGTCATGTTTTAGAACCCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCT
11 11 65266802 65266702 100m TACTCCATGAAGAAGCTTCATCTCAACCTCCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTT
11 11 65266799 65266698 80m1d20m TCCATGAAGAAGCTTCATCCAACCTCCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTDCTTCATATTTTCTCTTAAAA
11 11 65266796 65266695 66m1d34m ATGAAGAAGCTTCATCTCAACCTCCGTCATGTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTADCTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCT
11 11 65266793 65266693 100m AAGAAGCTTCATCTCAACCTCCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTA
11 11 65266790 65266690 100m AAGCTTCATCTCAACCTCCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGC
11 11 65266787 65266687 100m CTTCATCTCAACCTCCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTAT
11 11 65266784 65266684 100m CATCTCAACCTCCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAA
11 11 65266781 65266681 100m CTCAACCTCCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAAT
11 11 65266778 65266678 100m AACCTCCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTAC
11 11 65266775 65266675 100m CTCCGTCATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTT
11 11 65266772 65266671 90m1d10m CGTCATGTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATDTACGTTAAAA
11 11 65266769 65266669 100m CATGTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAAC
11 11 65266766 65266666 100m GTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCGCTTAAAATCTTAAGCTTTTAAAATTACGTTAAAAACTTA
11 11 65266763 65266663 100m TTAGAAACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACG
11 11 65266760 65266659 11m1d89m GAAACCTTTTADTCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAACTTAACGCTAA
11 11 65266757 65266657 100m ACCTTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGC
11 11 65266754 65266654 100m TTTTATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAAT
11 11 65266751 65266651 100m TATCTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATC
11 11 65266748 65266648 100m CTTTTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTA
11 11 65266745 65266645 100m TTCCTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTA
11 11 65266742 65266641 66m1d34m CTTCCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTDAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCT
11 11 65266739 65266639 100m CCTCATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTCAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTAT
11 11 65266736 65266636 100m CATGCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGA
11 11 65266733 65266633 100m GCTACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTA
11 11 65266730 65266630 100m ACTCTTCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATAT
11 11 65266727 65266627 100m CATCTAAGTCTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTT
11 11 65266724 65266622 8m2d92m CTAAGTCTDDTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATTTTTTAAG
11 11 65266721 65266620 87m1d13m AGTCTTCATATTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTADTATTTTTTAAGTA
11 11 65266718 65266618 100m CTTCATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGT
11 11 65266715 65266615 100m CATATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGT
11 11 65266712 65266611 59m1d41m ATTTTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAACTTAACGCTAAGCAATATDCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTA
11 11 65266709 65266609 100m TTCTCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAAT
11 11 65266706 65266606 100m TCTTAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTC
11 11 65266703 65266603 100m TAAAATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTAT
11 11 65266700 65266600 100m AATCTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTT
11 11 65266697 65266597 100m CTTAAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCA
11 11 65266694 65266594 100m AAGCTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAG
11 11 65266691 65266591 100m CTATTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGA
11 11 65266688 65266588 100m TTAAAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAA
11 11 65266685 65266585 100m AAATTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAA
11 11 65266682 65266582 100m TTACGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTT
11 11 65266679 65266579 100m CGTTAAAAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATC
11 11 65266676 65266575 10m1d90m TAAAAACTTADACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAACTTATCTGCG
11 11 65266673 65266573 100m AAACTTAACGCTAAGCAATATCTTAGTAACCTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTATCTGCGGT
11 11 65266636 65266769 55m65266725F45M CTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACAT
11 11 65266630 65266775 49m65266725F51M TTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGA
11 11 65266630 65266775 49m65266725F51M TTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGA
11 11 65266628 65266777 47m65266725F53M TTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGG
11 11 65266626 65266779 45m65266725F55M TAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGAGAAAAAAACTTA GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTT
11 11 65266586 65266820 5m65266725F78M1D17M ACTTA GAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTDAAAAATGTATTTAAAAG
11 11 65266715 65266815 100M GAAGACTTAGAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTT
11 11 65266718 65266818 100M GACTTAGAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAA
11 11 65266721 65266821 100M TTAGAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGA
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11 11 65266727 65266827 100M GAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAATAAATGTATTTAAAAGAAAATTG
11 11 65266730 65266830 100M TAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGA
11 11 65266733 65266833 100M CATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAA
11 11 65266736 65266836 100M GAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGTAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGG
11 11 65266739 65266839 100M GAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGAGGAAAAAATGTATTTAAAAGAAAATTGAGAGAAAGGACT
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Sbjct 10941106 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 10941155
>ref|NW_001838025.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188141, whole genome shotgun sequence
gb|DS486154.1| Homo sapiens SCAF_1103279188141 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
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Sbjct 3809041 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 3808992
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130895506
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
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Sbjct 61593844 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 61593893
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=132164248
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
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Sbjct 62593030 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 62593079
>gb|KE141110.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold5, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
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Sbjct 10434432 TAAAAGGTTTCTAGAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 10434481
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGA-CGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGG 49
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Sbjct 63770848 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACCGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGG 63770897
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
Length=7179
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 142 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 93
>tpe|LK938852.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473537.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=480
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 132 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 83
>tpe|LK938851.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473536.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=394
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 132 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 83
>tpe|LK938850.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473535.1 (MALAT1
gene), lincRNA
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Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 132 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 83
>tpe|LK938849.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473534.1 (MALAT1
gene), lincRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 358 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 309
>gb|AC241892.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-1187322I23 from chromosome 11,
complete sequence
Length=44739
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 16340 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 16389
>gb|FJ209305.1| Homo sapiens MALAT1 mRNA, complete sequence
Length=7072
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Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 129 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 80
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 1412 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 1363
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 133 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 84
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 577 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 528
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 577 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 528
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 132 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 83
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 811 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 762
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 130 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 81
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65047 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 64998
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 639 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 688
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 116 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 67
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
Length=7159
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAG 49
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Sbjct 1430 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAG 1382
>ref|XR_175802.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla uncharacterized LOC101147172
(LOC101147172), misc_RNA
Length=2084
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 559 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCCATCTTTCAAAGA 510
>gb|AF187554.1| Homo sapiens sperm antigen-36 mRNA, complete cds
Length=3046
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTCAAAGA 50
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Sbjct 2979 CTATTGACTATATTTTTTAAGTAGTTGTATTAATCTCTATCTTTGAAAGA 3028
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA
>ref|XR_175802.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla uncharacterized LOC101147172
(LOC101147172), misc_RNA
Length=2084
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 715
>gb|AC241892.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-1187322I23 from chromosome 11,
complete sequence
Length=44739
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
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Sbjct 16233 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 16184
>gb|FJ209305.1| Homo sapiens MALAT1 mRNA, complete sequence
Length=7072
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
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Sbjct 236 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 285
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1519 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 1568
>gb|BC104662.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6106210
Length=820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 91 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 140
>dbj|AK022287.1| Homo sapiens cDNA FLJ12225 fis, clone MAMMA1001139, weakly similar
to SRE-2 PROTEIN
Length=2766
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 55
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 289
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
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Sbjct 684 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 733
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
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Sbjct 684 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 733
>gb|AF187554.1| Homo sapiens sperm antigen-36 mRNA, complete cds
Length=3046
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 2823
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
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Sbjct 239 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 288
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
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Sbjct 918 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 967
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 286
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65154 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 65203
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 483
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 272
>ref|XR_656034.1| PREDICTED: Pongo abelii uncharacterized LOC100171914 (LOC100171914),
misc_RNA
Length=4355
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 AAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 253 AAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 301
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
Length=7159
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAAAAGGTTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537 TAAAAGATTTCTAAAACATGACGGAGGTTGAGATGAAGCTTCTTCATGGA 1586
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62593388 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 62593437
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1639 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 1590
>gb|BC104662.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6106210
Length=820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 162
>dbj|AK022287.1| Homo sapiens cDNA FLJ12225 fis, clone MAMMA1001139, weakly similar
to SRE-2 PROTEIN
Length=2766
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 126 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 77
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 311
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 804 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 755
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 804 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 755
>gb|AF187554.1| Homo sapiens sperm antigen-36 mRNA, complete cds
Length=3046
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2752 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 2801
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 310
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1038 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 989
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 308
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65274 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 65225
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 461
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCAATTT 294
>emb|AJ535462.1| Homo sapiens partial mRNA for TFEB transcription factor (AlphaTFEB
gene), tumor 2
Length=238
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Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46 GCCCTTCTATTGGTATTAATTCGGGGCTCTGTAGTCCTTTCTCTCA 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 1926
>gb|BC104662.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6106210
Length=820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 498
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 647
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 1091
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 1091
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 646
>gb|AF130094.1|AF130094 Homo sapiens clone FLC0165 mRNA sequence
Length=1548
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 1348
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1276 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 1325
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 644
>emb|AJ535465.1| Homo sapiens partial mRNA (non-coding TFEBAlpha gene), tumor
2
Length=376
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 366
>emb|AJ535463.1| Homo sapiens partial AlphaTFEB gene for TFEB, exon 2, tumor 3
Length=707
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 102
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65512 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 65561
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 125
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 630
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
Length=7159
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1892 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACAGGAA 1941
>ref|XR_175802.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla uncharacterized LOC101147172
(LOC101147172), misc_RNA
Length=2084
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1024 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACAGGAA 1073
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
Length=7179
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTAC 45
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 GGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTAC 646
>ref|XR_656034.1| PREDICTED: Pongo abelii uncharacterized LOC100171914 (LOC100171914),
misc_RNA
Length=4355
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 49/51 (96%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGAAGAT-AGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAA 50
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 609 GGAGAAGATGAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACAGGAA 659
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
11 11 65267059 65266959 100m CGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAA
11 11 65267056 65266956 100m TTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGA
11 11 65267053 65266952 53m1d47m GTAAATGCGTTAACTAAGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTDCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGC
11 11 65267050 65266900 68m50n32m AATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTTATCAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CCACAACTTTTAAACTAAACTTTAAGCTGTTT
11 11 65267047 65266947 100m GCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCA
11 11 65267044 65266944 100m TTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAAT
11 11 65267041 65266941 100m ACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTAT
11 11 65267038 65266938 100m AGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTT
11 11 65267035 65266935 100m CTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAAT
11 11 65267032 65266932 100m TAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCAC
11 11 65267029 65266929 100m ATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTA
11 11 65267026 65266925 63m1d37m ACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTDAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAAC
11 11 65267023 65266922 84m1d16m CAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTDAATCACCTACAACTTT
11 11 65267020 65266919 20m1d80m TTCTCCCTGCGTCATGGATTDCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAA
11 11 65267017 65266917 100m TCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAAC
11 11 65267014 65266914 100m CTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTCCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAA
11 11 65267011 65266911 100m CGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAAACT
11 11 65267008 65266908 100m CATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAAACTTTA
11 11 65267005 65266905 100m GGATTTCAAGGTCCTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAAACTTTAAGC
11 11 65267002 65266902 100m TTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAAACTTTAAGCTGT
11 11 65266999 65266899 100m CAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAAACTTTAAGCTGTTTA
11 11 65266996 65266896 100m GGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGT
11 11 65266993 65266892 79m1d21m CTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAADCTTTAAGCTGTTTAAGTCACC
11 11 65266990 65266890 100m TTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTT
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11 11 65266984 65266883 70m1d30m ACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAADCTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTA
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831:985
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genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 3808892 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 3808941
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shotgun sequence
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Lambda K H
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assembly
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genome shotgun sequence
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Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
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shotgun sequence
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Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
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shotgun sequence
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Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
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Sbjct 12850560 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 12850511
>gb|CM000501.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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>gb|DS990792.1| Homo sapiens SCAF_1112675837086 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
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Length=137609055
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Length=131853179
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Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
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>gb|CH471076.1| Homo sapiens 211000035835228 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=33348968
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Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
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Sbjct 10941440 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 10941489
>ref|NW_001838025.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188141, whole genome shotgun sequence
gb|DS486154.1| Homo sapiens SCAF_1103279188141 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
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>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Length=130895506
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Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
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Sbjct 61594178 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 61594227
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=132164248
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Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
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Sbjct 62593364 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 62593413
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1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
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>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
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Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
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Sbjct 398 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 349
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gene), lincRNA
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Sbjct 388 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 339
>tpe|LK938849.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473534.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=794
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Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
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Sbjct 614 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 565
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complete sequence
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Sbjct 16084 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 16133
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Length=7072
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Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
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Sbjct 385 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 336
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
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Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
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Sbjct 1668 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 1619
>gb|BC104662.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6106210
Length=820
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
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Sbjct 240 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 191
>dbj|AK022287.1| Homo sapiens cDNA FLJ12225 fis, clone MAMMA1001139, weakly similar
to SRE-2 PROTEIN
Length=2766
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 155 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 106
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 389 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 340
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 784
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 784
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
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Sbjct 388 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 339
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 1018
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 337
>emb|AJ535462.1| Homo sapiens partial mRNA for TFEB transcription factor (AlphaTFEB
gene), tumor 2
Length=238
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 26
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
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Sbjct 65303 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 65254
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
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Sbjct 383 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 432
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 372 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 323
>ref|XR_495878.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus uncharacterized LOC103228978 (LOC103228978),
ncRNA
Length=4088
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Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907 TCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 1954
>ref|XR_656034.1| PREDICTED: Pongo abelii uncharacterized LOC100171914 (LOC100171914),
misc_RNA
Length=4355
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 402 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTACTGGTATTAATT 353
>gb|AF187554.1| Homo sapiens sperm antigen-36 mRNA, complete cds
Length=3046
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2723 AGTCACCTTCATTTTAATGTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT 2772
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
Length=7179
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 627
>gb|AC241892.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-1187322I23 from chromosome 11,
complete sequence
Length=44739
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15899 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 15850
>gb|FJ209305.1| Homo sapiens MALAT1 mRNA, complete sequence
Length=7072
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 619
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1853 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 1902
>gb|BC104662.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6106210
Length=820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 474
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 623
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 1067
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 1067
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 622
>gb|AF130094.1|AF130094 Homo sapiens clone FLC0165 mRNA sequence
Length=1548
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1421 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 1372
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 1301
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 620
>emb|AJ535465.1| Homo sapiens partial mRNA (non-coding TFEBAlpha gene), tumor
2
Length=376
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 342
>emb|AJ535463.1| Homo sapiens partial AlphaTFEB gene for TFEB, exon 2, tumor 3
Length=707
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 29 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 78
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65488 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 65537
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 198 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 149
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 606
>tpe|LK938850.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473535.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=352
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 GGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 309
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
Length=7159
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1868 GGGAGTGGTAGGATGAAACGATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 1917
>emb|AJ535461.1| Homo sapiens partial AlphaTFEB gene for TFEB, exons 2-3, tumor
1
Length=608
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAGGTGGAA 53
>ref|XR_656034.1| PREDICTED: Pongo abelii uncharacterized LOC100171914 (LOC100171914),
misc_RNA
Length=4355
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 AGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGAT-AGAAGTTTGAAGTGGAA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 588 AGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATGAGAAGTTTGAAGTGGAA 635
>ref|XR_175802.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla uncharacterized LOC101147172
(LOC101147172), misc_RNA
Length=2084
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 50
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000 GGGAGTGGTAGGTTGAAACAGTTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAA 1049
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
11 11 65267140 65267040 100m TCCAGTTTTCCACTTCAAACTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAA
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11 11 65267131 65267031 100m CCACTTCAACCTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCCCTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTT
11 11 65267128 65267027 24m1d76m CTTCAAACTTCTATCTTCTCCAAADTTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAATGCGTTAACTAGGCTTTAAAT
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11 11 65267113 65267012 39m1d61m TTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTDTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCT
11 11 65267110 65267010 100m TCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGC
11 11 65267107 65267007 100m AAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTC
11 11 65267104 65267004 100m TTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATG
11 11 65267101 65267001 100m TTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGAT
11 11 65267098 65266997 68m1d32m CGTCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAADATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCA
11 11 65267095 65266994 71m1d29m CCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGDCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGG
11 11 65267092 65266992 100m ACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTC
11 11 65267089 65266989 100m ACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTT
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11 11 65267083 65266983 100m AATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCA
11 11 65267080 65266931 1m50n46m1i52m T||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACC
11 11 65267077 65266976 41m1d59m TCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGDGCTTTAAATGACGCAATTTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGG
11 11 65267074 65266973 15m1d85m TTCCATTTTCGTCTGDCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTCTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTAATCACCTTCGGTTT
11 11 65267071 65266971 100m CATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCCCCTTCGGTTTAA
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11 11 65267065 65266964 53m1d47m CGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTTCCCTGDCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTT
11 11 65267062 65266962 100m CTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTT
11 11 65267059 65266959 100m CGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAA
11 11 65267056 65266956 100m TTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGA
11 11 65267053 65266952 47m1d53m GTAAATGCGTTAACTAAGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCADTGGATTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGC
11 11 65267050 65266900 32m50n68m AATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTTATCACCCACAACTTTTAAACTAAACTTTAAGCTGTTT
11 11 65267047 65266947 100m GCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCA
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11 11 65267035 65266935 100m CTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAAT
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11 11 65266889 65267144 40m65267085F60M ATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTATTAATT GGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA
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genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
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Sbjct 404 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 355
>tpe|LK938852.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473537.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=480
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 394 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 345
>tpe|LK938849.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473534.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=794
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 571
>gb|AC241892.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-1187322I23 from chromosome 11,
complete sequence
Length=44739
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16078 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 16127
>gb|FJ209305.1| Homo sapiens MALAT1 mRNA, complete sequence
Length=7072
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 391 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 342
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 1625
>gb|BC104662.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6106210
Length=820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 246 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 197
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 346
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 790
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 790
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 394 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 345
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 1024
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 392 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 343
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65309 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 65260
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 426
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 378 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 329
>ref|XR_656034.1| PREDICTED: Pongo abelii uncharacterized LOC100171914 (LOC100171914),
misc_RNA
Length=4355
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 408 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTACTGGTA 359
>ref|XR_495878.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus uncharacterized LOC103228978 (LOC103228978),
ncRNA
Length=4088
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1899 TGTTTAAATCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 1948
>emb|AJ535462.1| Homo sapiens partial mRNA for TFEB transcription factor (AlphaTFEB
gene), tumor 2
Length=238
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 TTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 TTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 32
>dbj|AK022287.1| Homo sapiens cDNA FLJ12225 fis, clone MAMMA1001139, weakly similar
to SRE-2 PROTEIN
Length=2766
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 AAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 156 AAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA 112
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
Length=7179
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 637
>tpe|LK938850.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000473535.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 319
>gb|AC241892.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-1187322I23 from chromosome 11,
complete sequence
Length=44739
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15889 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 15840
>gb|FJ209305.1| Homo sapiens MALAT1 mRNA, complete sequence
Length=7072
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 629
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1863 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 1912
>gb|BC104662.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6106210
Length=820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 484
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 633
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 1077
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 1077
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 632
>gb|AF130094.1|AF130094 Homo sapiens clone FLC0165 mRNA sequence
Length=1548
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 1362
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 1311
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 630
>emb|AJ535465.1| Homo sapiens partial mRNA (non-coding TFEBAlpha gene), tumor
2
Length=376
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 352
>emb|AJ535463.1| Homo sapiens partial AlphaTFEB gene for TFEB, exon 2, tumor 3
Length=707
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 88
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65498 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 65547
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 139
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 567 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 616
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
Length=7159
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1878 GGATGAAACGATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 1927
>emb|AJ535461.1| Homo sapiens partial AlphaTFEB gene for TFEB, exons 2-3, tumor
1
Length=608
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 14 GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAGGTGGAAAACTGGAAGA 63
>ref|XR_175802.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla uncharacterized LOC101147172
(LOC101147172), misc_RNA
Length=2084
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 TGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 50
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 TGAAACAGTTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGA 1059
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
11 11 65267138 65267037 16m1d84m CAGTTTTCCACTTAAADCTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTA
11 11 65267135 65267035 100m TTTTCCACTTCAAACTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGG
11 11 65267132 65267030 48m2d52m TCCACTTCAAACTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCDDATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTA
11 11 65267129 65267029 100m ACTTCAAACTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAA
11 11 65267126 65267026 100m TCAAACTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATG
11 11 65267123 65266963 5m60n95m ATCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTT
11 11 65267120 65267020 100m TTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAA
11 11 65267117 65267016 65m1d35m TATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGDTAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCT
11 11 65267114 65267013 62m1d38m CTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGDTAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCC
11 11 65267111 65267011 100m CTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTG
11 11 65267108 65267008 100m CAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGT
11 11 65267105 65267004 16m1d84m ATTGTTTCATCCTACADCTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATG
11 11 65267102 65267002 100m GTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGA
11 11 65267099 65266999 100m TCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTT
11 11 65267096 65266996 100m TCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAA
11 11 65267093 65266992 4m1d96m TACCDCTCCCAATTAAGCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTC
11 11 65267090 65266990 100m CACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTT
11 11 65267087 65266987 100m TCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTA
11 11 65267084 65266983 32m1d68m CAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGDTAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCA
11 11 65267081 65266981 100m TTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACC
11 11 65267078 65266977 26m1d74m ATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGDTAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCG
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11 11 65267072 65266972 100m CCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTA
11 11 65267069 65266969 100m TTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATC
11 11 65267066 65266966 100m TCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCT
11 11 65267063 65266963 100m TCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTT
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11 11 65267018 65266917 44m1d56m CTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTDAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACGTACAACTTTTAAAC
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11 11 65266967 65266867 100m TTTTTAAAAGATCGCCCTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCC
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11 11 65266961 65266861 100m AAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTACAACTTTTAAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTA
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11 11 65266885 65267164 30m65267095F70M TAATCTAAAAGCATTGCCCTTCTATTGGTA GGATGAAACAATTTGGAGAAGATAGAAGTTTGAAGTGGAAAACTGGAAGACAGAAGTACGGGAAGGCGAA
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sequence
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sequence
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
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>gb|DS990792.1| Homo sapiens SCAF_1112675837086 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
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Length=131853179
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sequence
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Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
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Sbjct 10941419 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 10941468
>ref|NW_001838025.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188141, whole genome shotgun sequence
gb|DS486154.1| Homo sapiens SCAF_1103279188141 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
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shotgun sequence
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Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
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Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
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complete sequence
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Sbjct 262 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 213
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Length=733
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Sbjct 411 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 362
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transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
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Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
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Sbjct 855 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 806
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
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Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
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Sbjct 855 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 806
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 361
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 1040
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 359
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65325 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 65276
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 410
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 394 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 345
>ref|XR_672920.1| PREDICTED: Pan troglodytes uncharacterized LOC104001214 (LOC104001214),
ncRNA
Length=7159
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1708 AAAGTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 1659
>ref|XR_656034.1| PREDICTED: Pongo abelii uncharacterized LOC100171914 (LOC100171914),
misc_RNA
Length=4355
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 AAAGTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 375
>gb|AF187554.1| Homo sapiens sperm antigen-36 mRNA, complete cds
Length=3046
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2701 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATGTAAAAGCAT 2750
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
Length=7179
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 TAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 TAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCAT 371
>ref|XR_175802.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla uncharacterized LOC101147172
(LOC101147172), misc_RNA
Length=2084
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAACTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAATCTAAAAGCA 49
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 837 AAAGTAAACTTTAAGCTGTTTAAGTCACCTTCATTTTAACCTAAAAGCA 789
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA
>ref|NR_002819.2| Homo sapiens metastasis associated lung adenocarcinoma transcript
1 (non-protein coding) (MALAT1), long non-coding RNA
gb|EF177381.1| Homo sapiens nuclear enriched abundant transcript 2 (NEAT2) mRNA,
complete sequence
tpe|HG503868.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000389143.1 (MALAT1
gene), lincRNA
Length=8708
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 1881
>gb|BC104662.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6106210
Length=820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 453
>gb|BC025986.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3935402
Length=733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 602
>tpg|BK001418.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 long isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 1046
>tpg|BK001411.1| TPA_exp: Homo sapiens metastasis associated in lung adenocarcinoma
transcript 1 short isoform, transcribed non-coding RNA,
complete sequence
Length=8110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 1046
>emb|BX640764.1| Homo sapiens genomic DNA; cDNA DKFZp686J04183 (from clone DKFZp686J04183)
Length=4593
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 601
>gb|AF130094.1|AF130094 Homo sapiens clone FLC0165 mRNA sequence
Length=1548
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 1393
>gb|AF203815.1|AF203815 Homo sapiens alpha gene sequence
Length=8586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 1280
>emb|BX538238.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0790 (from clone DKFZp686B0790);
complete cds
Length=4612
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 599
>emb|AJ535465.1| Homo sapiens partial mRNA (non-coding TFEBAlpha gene), tumor
2
Length=376
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 321
>emb|AJ535463.1| Homo sapiens partial AlphaTFEB gene for TFEB, exon 2, tumor 3
Length=707
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 57
>dbj|AP000769.5| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:CMB9-22P13, complete
sequence
Length=114793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65467 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 65516
>gb|BC020337.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3856788
Length=783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 170
>dbj|D87666.1| Homo sapiens heart mRNA for heat shock protein 90, partial cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 585
>ref|XR_608892.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC103783329 (LOC103783329),
ncRNA
Length=7179
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGAAAATGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 ACGAAAATGGAAAGATTAGTTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 606
>ref|XR_495878.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus uncharacterized LOC103228978 (LOC103228978),
ncRNA
Length=4088
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 49/52 (94%), Gaps = 2/52 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACG-AAAAT-GGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1733 ACGAAAAATAGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATCTGGAGA 1682
>gb|DQ148151.1| Macaca mulatta clone ss1_f16_t7_366 metastasis associated lung
adenocarcinoma transcript 1 (MALAT1) noncoding RNA, partial
sequence
Length=409
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 49/52 (94%), Gaps = 2/52 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACG-AAAAT-GGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATTTGGAGA 50
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 322 ACGAAAAATAGGAAAGATTAATTGGGAGTGGTAGGATGAAACAATCTGGAGA 373
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
11 11 65267140 65267040 100m TCCAGTTTTCCACTTCAAACTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAA
11 11 65267137 65266977 99m60n1m
11 11 65267134 65267034 100m TTTCCACTTCAAACTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGC
11 11 65267131 65267031 100m CCACTTCAACCTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCCCTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTT
11 11 65267128 65267027 24m1d76m CTTCAAACTTCTATCTTCTCCAAADTTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAATGCGTTAACTAGGCTTTAAAT
11 11 65267125 65267025 100m CAAACTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGA
11 11 65267122 65267022 100m ACTTCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGC
11 11 65267119 65267019 100m TCTATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAAT
11 11 65267116 65267016 100m ATCTTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCT
11 11 65267113 65267012 39m1d61m TTCTCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTDTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCT
11 11 65267110 65267010 100m TCCAAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGC
11 11 65267107 65267007 100m AAATTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTC
11 11 65267104 65267004 100m TTGTTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATG
11 11 65267101 65267001 100m TTTCATCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGAT
11 11 65267098 65266997 68m1d32m CGTCCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAADATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCA
11 11 65267095 65266994 71m1d29m CCTACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGDCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGG
11 11 65267092 65266992 100m ACCACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTC
11 11 65267089 65266989 100m ACTCCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTT
11 11 65267086 65266986 100m CCCAATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAA
11 11 65267083 65266983 100m AATTAATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCA
11 11 65267080 65266931 1m50n46m1i52m T||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AATCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACC
11 11 65267077 65266976 41m1d59m TCTTTCCATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGDGCTTTAAATGACGCAATTTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGG
11 11 65267074 65266973 15m1d85m TTCCATTTTCGTCTGDCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTCTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTAATCACCTTCGGTTT
11 11 65267071 65266971 100m CATTTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCCCCTTCGGTTTAA
11 11 65267068 65266968 100m TTTCGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCT
11 11 65267065 65266964 53m1d47m CGTCTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTTCCCTGDCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTT
11 11 65267062 65266962 100m CTGCGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTT
11 11 65267059 65266959 100m CGTTTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAA
11 11 65267056 65266956 100m TTAGTAAATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGA
11 11 65267053 65266952 47m1d53m GTAAATGCGTTAACTAAGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCADTGGATTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGC
11 11 65267050 65266900 32m50n68m AATGCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTTATCACCCACAACTTTTAAACTAAACTTTAAGCTGTTT
11 11 65267047 65266947 100m GCGTTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCA
11 11 65267044 65266944 100m TTAACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAAT
11 11 65267041 65266941 100m ACTAGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTAT
11 11 65267038 65266938 100m AGGCTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTT
11 11 65267035 65266935 100m CTTTAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAAT
11 11 65267032 65266932 100m TAAATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCAC
11 11 65267029 65266929 100m ATGACGCAATTCTCCCTGCGTCATGGATTTCAAGGTCTTTTAATCACCTTCGGTTTAATCTCTTTTTAAAAGATCGCCTTCAAATTATTTTAATCACCTA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188268, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 8983555 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 8983506
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shotgun sequence
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Lambda K H
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HSCHR11_CTG8
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assembly
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Sbjct 23908858 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 23908809
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genome shotgun sequence
gb|CM001619.2| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 111665558 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 111665509
>ref|NW_004929381.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 15344987 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 15344938
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shotgun sequence
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Sbjct 18045404 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 18045355
>gb|GL583021.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_41, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 4739579 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 4739628
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Sbjct 107705564 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 107705515
>gb|DS990670.1| Homo sapiens SCAF_1112675837213 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 8980483 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 8980532
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 108433760 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 108433711
>gb|CH471065.1| Homo sapiens 211000035833829 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 21804586 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 21804537
>ref|NW_001838042.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188268, whole genome shotgun sequence
gb|DS486032.1| Homo sapiens SCAF_1103279188268 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 8980625 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 8980674
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 107706384 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 107706335
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 108935686 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 108935637
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 681 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 632
>ref|XM_010382342.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 769 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 720
>ref|XM_003952027.2| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 681 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 632
>ref|XM_009424148.1| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 668 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 619
>ref|XM_508752.3| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 765 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 716
>ref|XM_009247045.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X6, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 797 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 748
>ref|XM_009247044.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X5, mRNA
Length=920
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 719 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 670
>ref|XM_009247043.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 860 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 811
>ref|XM_009247042.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 705 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 656
>ref|XM_009247041.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 749 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 700
>ref|XM_009247040.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1005
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 804 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 755
>ref|XM_008971343.1| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 668 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 619
>ref|XM_003805460.2| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 737 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 688
>ref|XM_003805459.2| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1105
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 904 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 855
>gb|KJ896648.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06042 CRYAB
gene, encodes complete protein
Length=657
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 533 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 484
>ref|XM_008020848.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
Length=970
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 769 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 720
>ref|XM_008020847.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 764 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 715
>ref|NM_001289808.1| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
3, mRNA
Length=993
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 770 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 721
>ref|NM_001289807.1| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
2, mRNA
Length=964
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 741 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 692
>ref|NM_001885.2| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
1, mRNA
Length=998
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 775 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 726
>ref|XM_004090563.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=737
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 478 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 429
>ref|XM_004090562.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=829
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 570 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 521
>ref|XM_004090561.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=1001
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 742 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 693
>ref|XM_003253132.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B, transcript
variant 1 (CRYAB), mRNA
Length=1030
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 771 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 722
>ref|NG_033080.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 2 (HSPB2), RefSeqGene on
chromosome 11
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Sbjct 1089 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 1138
>ref|NG_009824.2| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), RefSeqGene on chromosome
11
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Sbjct 19899 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 19850
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variant 2 (CRYAB), mRNA
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Sbjct 741 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 692
>ref|XM_004052117.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla crystallin, alpha B, transcript
variant 1 (CRYAB), mRNA
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Sbjct 768 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 719
>ref|NM_001132445.2| Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
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Sbjct 514 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 465
>ref|NM_001260901.1| Macaca mulatta crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
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Sbjct 501 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 452
>ref|XM_003253133.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B, transcript
variant 2 (CRYAB), mRNA
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Sbjct 907 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 858
>dbj|AB528831.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KE0447, Homo sapiens CRYAB
gene for crystallin, alpha B, without stop codon, in Flexi
system
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Sbjct 477 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 428
>gb|FJ876064.1| Homo sapiens clone CRYAB090401 alpha B crystallin (CRYAB) mRNA,
complete cds
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Sbjct 468 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 419
>gb|EF444955.1| Homo sapiens alpha crystallin B chain (CRYAB) and heat-shock
protein beta-2 (HSPB2) genes, complete cds
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Sbjct 3201 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 3250
>dbj|AK314029.1| Homo sapiens cDNA, FLJ94689, Homo sapiens crystallin, alpha B
(CRYAB), mRNA
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Sbjct 513 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 464
>gb|AC192350.9| Rhesus Macaque BAC CH250-169D9 () complete sequence
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Sbjct 63768 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 63817
>gb|DQ895729.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010189; FLH187085.01L;
RZPDo839D0862D crystallin, alpha B (CRYAB) gene, encodes
complete protein
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Sbjct 490 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 441
>gb|DQ892517.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005147; FLH187089.01X; RZPDo839D0872D
crystallin, alpha B (CRYAB) gene, encodes complete
protein
Length=568
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Sbjct 490 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 441
>ref|NM_001285062.1| Macaca fascicularis crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
dbj|AB170174.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10616, similar to
human crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA, RefSeq: NM_001885.1
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Sbjct 513 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 464
>emb|AM392549.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002123 for hypothetical
protein (CRYAB gene)
Length=567
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Sbjct 488 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 439
>emb|AM393027.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002124 for hypothetical
protein (CRYAB gene)
Length=567
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 488 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 439
>gb|BC007008.1| Homo sapiens crystallin, alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:12326
IMAGE:3933748), complete cds
Length=744
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Sbjct 514 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 465
>gb|BT007909.1| Synthetic construct Homo sapiens crystallin, alpha B mRNA, partial
cds
Length=528
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 468 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 419
>gb|BT006770.1| Homo sapiens crystallin, alpha B mRNA, complete cds
Length=528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 468 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 419
>gb|S45630.1| alpha B-crystallin=Rosenthal fiber component [human, glioma cell
line, mRNA, 691 nt]
gb|FJ224314.1| Homo sapiens epididymis secretory protein Li 101 (HEL-S-101)
mRNA, complete cds
Length=691
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 493 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 444
>emb|CR859387.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468D2015 (from clone DKFZp468D2015)
Length=786
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 515 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 466
>dbj|AB125159.1| Macaca fascicularis CRYAB mRNA for crystallin, alpha B, complete
cds
Length=733
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 513 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 464
>gb|AY890056.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH026848.01X crystallin
alpha B (CRYAB) mRNA, complete cds
Length=528
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 468 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 419
>gb|AY892534.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH026844.01L crystallin
alpha B (CRYAB) mRNA, partial cds
Length=528
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 468 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 419
>gb|AY892533.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH026843.01L crystallin
alpha B (CRYAB) mRNA, partial cds
Length=528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 468 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 419
>dbj|AP000907.6| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:RP11-708L7, complete
sequence
Length=176273
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 10441 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 10490
>gb|AF007162.1|AF007162 Homo sapiens unknown mRNA, complete cds
Length=661
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 497 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 448
>gb|M24906.1|HUMRFP Homo sapiens Rosenthal fiber protein (alpha-B-crystallin) mRNA,
3' end
Length=348
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 150 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 101
>gb|M28638.1|HUMCRYABA Human alpha-B-crystallin gene, 5' end
Length=4206
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 3897 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 3848
>ref|XM_010610684.1| PREDICTED: Fukomys damarensis crystallin, alpha B (Cryab), mRNA
Length=653
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 549 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTCAGGACCCCAT 500
>ref|XM_010334575.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis crystallin, alpha
B (CRYAB), transcript variant X2, mRNA
Length=874
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 CTCAGGGCCAGTGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 624
>ref|XM_010334574.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis crystallin, alpha
B (CRYAB), transcript variant X1, mRNA
Length=936
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 735 CTCAGGGCCAGTGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 686
>ref|XM_009006787.1| PREDICTED: Callithrix jacchus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X4, mRNA
Length=933
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 CTCTGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 685
>ref|XM_003734101.2| PREDICTED: Callithrix jacchus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
Length=936
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 CTCTGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 688
>ref|XM_002754383.3| PREDICTED: Callithrix jacchus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
Length=880
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 681 CTCTGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 632
>ref|XM_002754382.3| PREDICTED: Callithrix jacchus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1099
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 CTCTGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 851
>ref|NM_001279857.2| Heterocephalus glaber crystallin, alpha B (Cryab), mRNA
gb|HQ326656.2| Heterocephalus glaber alpha-crystallin B chain mRNA, complete
cds
Length=734
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 527 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTCAGGACCCCAT 478
>ref|XM_008832795.1| PREDICTED: Nannospalax galili crystallin, alpha B (Cryab), mRNA
Length=970
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 722
>ref|XM_008527257.1| PREDICTED: Equus przewalskii crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=821
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 623 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 574
>ref|XM_006065260.1| PREDICTED: Bubalus bubalis crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=769
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 CTCAGGGCCGGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 520
>gb|KJ174932.1| Camelus dromedarius alpha-crystallin B (CRYAB) mRNA, complete
cds
Length=527
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 468 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 419
>ref|XM_006972342.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii crystallin, alpha B
(Cryab), mRNA
Length=993
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 794 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 745
>ref|XM_006912821.1| PREDICTED: Pteropus alecto crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=971
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 768 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 719
>ref|XM_006190373.1| PREDICTED: Camelus ferus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=704
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 508 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 459
>ref|XM_001501779.3| PREDICTED: Equus caballus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 627 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 578
>ref|XM_004604685.1| PREDICTED: Sorex araneus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=704
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 505 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 456
>emb|AJ272441.1| Spalax ehrenbergi partial mRNA for alphaB-crystallin (cryab gene)
Length=511
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 468 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 419
>emb|AJ293658.1| Spalax judaei mRNA for alpha-B-crystallin
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Sbjct 468 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 419
>ref|NM_012935.4| Rattus norvegicus crystallin, alpha B (Cryab), mRNA
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Sbjct 797 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 748
>ref|XM_008690086.1| PREDICTED: Ursus maritimus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
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Sbjct 654 CTCAGGGCCAGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 605
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variant X4, mRNA
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Sbjct 1049 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 1000
>ref|XM_007620925.1| PREDICTED: Cricetulus griseus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 1471 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 1422
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1526 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 1477
>ref|XM_007629298.1| PREDICTED: Cricetulus griseus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X5, mRNA
ref|XM_007620927.1| PREDICTED: Cricetulus griseus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X5, mRNA
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||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 626
>ref|XM_007629291.1| PREDICTED: Cricetulus griseus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 1055 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 1006
>ref|XM_007629284.1| PREDICTED: Cricetulus griseus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 1473 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 1424
>ref|XM_007629280.1| PREDICTED: Cricetulus griseus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 1381 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 1332
>ref|XM_007629274.1| PREDICTED: Cricetulus griseus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 1534 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 1485
>ref|XM_007128267.1| PREDICTED: Physeter catodon crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
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Sbjct 768 CTCAGGGCCGGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACGCCAT 719
>ref|XM_007074859.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
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Sbjct 922 CTCAGGGCCAGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 873
>ref|XM_003992343.2| PREDICTED: Felis catus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
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Sbjct 923 CTCAGGGCCAGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 874
>ref|XM_006739206.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 702 CTCAGGGCCAGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 653
>ref|XM_006739205.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 718 CTCAGGGCCAGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 669
>ref|XM_006739204.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X2, mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 CTCAGGGCCAGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 737
>ref|XM_006739203.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X1, mRNA
Length=962
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 762 CTCAGGGCCAGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 713
>ref|NM_001289785.1| Mus musculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript variant
4, mRNA
Length=874
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 673 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 624
>ref|NM_001289784.1| Mus musculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript variant
3, mRNA
Length=885
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 684 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 635
>ref|NM_009964.3| Mus musculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript variant
2, mRNA
Length=975
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 774 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 725
>ref|NM_001289782.1| Mus musculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript variant
1, mRNA
Length=1117
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 916 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 867
>ref|XM_006509970.1| PREDICTED: Mus musculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X1, mRNA
Length=1048
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 847 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 798
>ref|XM_006217871.1| PREDICTED: Vicugna pacos crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=704
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTTCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 459
>ref|XM_005967491.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X2, mRNA
Length=974
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 774 CTCAGGGCCGGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 725
>ref|XM_005967490.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X1, mRNA
Length=938
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 CTCAGGGCCGGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 689
>ref|XM_005689436.1| PREDICTED: Capra hircus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=826
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 626 CTCAGGGCCGGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 577
>ref|XM_005378100.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera crystallin, alpha B (Cryab), mRNA
Length=1133
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 932 CTCAGGGACAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTCAGGACCCCAT 883
>ref|XM_005334235.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus crystallin, alpha B
(Cryab), mRNA
Length=1154
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 955 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 906
>ref|XM_004646355.1| PREDICTED: Octodon degus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X3, mRNA
Length=845
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 647 CTCAGGGACAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTCAGGACCCCAT 598
>ref|XM_004646354.1| PREDICTED: Octodon degus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X2, mRNA
Length=835
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 637 CTCAGGGACAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTCAGGACCCCAT 588
>ref|XM_004646353.1| PREDICTED: Octodon degus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X1, mRNA
Length=1116
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 918 CTCAGGGACAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTCAGGACCCCAT 869
>ref|XM_004413585.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
Length=963
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 762 CTCAGGGCCAGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 713
>gb|JN963489.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Hspb2:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38735
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 10668 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 10717
>gb|JN963050.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Cryab:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=40000
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 24473 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 24424
>gb|JN960322.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Cryab:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=39955
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 24473 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 24424
>gb|JN953818.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Hspb2:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38759
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 10668 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 10717
>gb|JN951046.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Fdxacb1:tm1(KOMP)Ucd;
transgenic
Length=37222
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2799 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 2750
>gb|FJ439506.1| Ailuropoda melanoleuca crystallin alpha-B gene, complete cds
Length=3189
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3129 CTCAGGGCCAGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 3080
>gb|FJ169483.1| Ailuropoda melanoleuca alpha B-crystallin protein (CRYAB) mRNA,
complete cds
Length=534
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 CTCAGGGCCAGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 425
>ref|XM_002921092.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca alpha-crystallin B chain-like
(LOC100479594), mRNA
Length=1001
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 797 CTCAGGGCCAGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 748
>emb|FQ222897.1| Rattus norvegicus TL0ADA18YD24 mRNA sequence
Length=728
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 512 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 463
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Sbjct 511 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 462
>emb|FQ222316.1| Rattus norvegicus TL0ADA25YD19 mRNA sequence
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Sbjct 510 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 461
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Sbjct 424 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 375
>emb|FQ222161.1| Rattus norvegicus TL0ADA27YN09 mRNA sequence
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Sbjct 511 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 462
>emb|FQ228589.1| Rattus norvegicus TL0ADA6YG14 mRNA sequence
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Sbjct 511 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 462
>emb|FQ228448.1| Rattus norvegicus TL0ADA8YE23 mRNA sequence
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Sbjct 510 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 461
>emb|FQ224782.1| Rattus norvegicus TL0ACA54YK09 mRNA sequence
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Sbjct 511 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 462
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Sbjct 511 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 462
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Sbjct 512 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 463
>emb|FQ221154.1| Rattus norvegicus TL0ADA39YO21 mRNA sequence
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Sbjct 501 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 452
>emb|FQ221038.1| Rattus norvegicus TL0ADA40YG06 mRNA sequence
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Sbjct 510 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 461
>emb|FQ217655.1| Rattus norvegicus TL0ACA20YN03 mRNA sequence
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Sbjct 513 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 464
>emb|FQ220162.1| Rattus norvegicus TL0ADA43YP16 mRNA sequence
Length=728
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Sbjct 512 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 463
>emb|FQ223053.1| Rattus norvegicus TL0ADA15YP15 mRNA sequence
Length=729
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Sbjct 510 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 461
>emb|FQ220032.1| Rattus norvegicus TL0ADA44YH07 mRNA sequence
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Sbjct 770 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 721
>emb|FQ217150.1| Rattus norvegicus TL0ACA33YO16 mRNA sequence
Length=727
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Sbjct 511 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 462
>gb|AC123614.6| Mus musculus chromosome 9, clone RP23-446P16, complete sequence
Length=210060
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Sbjct 101950 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 101901
>gb|BC010768.1| Mus musculus crystallin, alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:18591
IMAGE:4238233), complete cds
Length=848
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Sbjct 635 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 586
>gb|BC102745.1| Bos taurus crystallin, alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:128019 IMAGE:7962636),
complete cds
Length=730
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Sbjct 515 CTCAGGGCCGGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 466
>dbj|AK168999.1| Mus musculus 16 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I920072H09 product:crystallin, alpha B,
full insert sequence
Length=708
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Sbjct 513 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 464
>dbj|AK146556.1| Mus musculus 17 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I920026G09 product:crystallin, alpha B,
full insert sequence
Length=847
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 652 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 603
>emb|CT010341.1| Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0752D
for gene Cryab, Crystallin, alpha B; complete cds, incl. stopcodon
Length=528
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 468 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 419
>gb|S77142.1| alpha B-crystallin [rats, heart, mRNA, 704 nt]
Length=704
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 473 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 424
>gb|S77138.1| alpha B-crystallin [rats, lens, mRNA, 706 nt]
Length=706
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 488 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 439
>gb|S74229.1| alpha B-crystallin [rats, heart, mRNA, 671 nt]
Length=671
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 474 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 425
>gb|BC094033.1| Mus musculus crystallin, alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:102521
IMAGE:4934471), complete cds
Length=1136
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 916 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 867
>ref|NM_174290.2| Bos taurus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
gb|AF029793.2|AF029793 Bos taurus alpha B-crystallin (CRYAB) mRNA, complete cds
Length=632
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 468 CTCAGGGCCGGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 419
>gb|U04320.1|RRU04320 Rattus norvegicus Wistar alpha B-crystallin gene, complete cds
Length=6806
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 5767 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 5718
>gb|M24092.1|RATCRYABA Rat alpha-B-crystallin mRNA, 3' end
Length=236
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 52 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 3
>gb|M55534.1|RATCRYAB Rat alpha-crystallin B chain mRNA, complete cds
Length=1247
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 1050 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 1001
>gb|M63170.1|MUSCRYABA Mouse alpha-B crystallin mRNA
Length=666
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 468 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 419
>gb|M73741.1|MUSALPBCRY Mouse alpha-B2-crystallin gene, complete cds
Length=4181
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 3884 CTCAGGGCCAGACACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 3835
>emb|X60351.1| R.rattus mRNA for alpha B-crystallin (ocular lens tissue)
Length=689
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 480 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 431
>emb|X60352.1| R.rattus mRNA for alpha B-crystallin (adult heart)
Length=687
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 465 CTCAGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACTCCAT 416
>ref|XM_008065587.1| PREDICTED: Tarsius syrichta crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=971
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 TCAGGGCCAGGGCCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 720
>ref|XM_008577610.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X2, mRNA
Length=589
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 388 CTCAGAGCCAGGGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 339
>ref|XM_008577609.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X1, mRNA
Length=926
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 CTCAGAGCCAGGGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 673
>ref|XM_007537847.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=975
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 778 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACACCAT 729
>ref|XM_006150984.1| PREDICTED: Tupaia chinensis crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=886
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTCAGGGCCTGGGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 618
>ref|XM_005901534.1| PREDICTED: Bos mutus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=708
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 CTCGGGGCCGGAGGCCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 459
>ref|XM_005667320.1| PREDICTED: Sus scrofa crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
Length=949
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTCTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 700
>ref|XM_005667319.1| PREDICTED: Sus scrofa crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=935
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTCTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 686
>ref|XM_857165.3| PREDICTED: Canis lupus familiaris crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant 5, mRNA
Length=863
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 CTCAGGGCCTGAGGCCTGCTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 613
>ref|XM_004666484.1| PREDICTED: Jaculus jaculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X2, mRNA
Length=836
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
|||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 CTCAGGTCCAGAGGCCTGTTTTCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 586
>ref|XM_004666483.1| PREDICTED: Jaculus jaculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X1, mRNA
Length=1117
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
|||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 CTCAGGTCCAGAGGCCTGTTTTCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 867
>ref|XM_004324738.1| PREDICTED: Tursiops truncatus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=918
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGA 44
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 CTCAGGGCCCGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGA 672
>ref|XM_004273414.1| PREDICTED: Orcinus orca crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
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Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGA 44
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Sbjct 715 CTCAGGGCCCGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGA 672
>dbj|AK391992.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10040F12, expressed in hypothalamus
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTCTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 465
>dbj|AK344985.1| Sus scrofa mRNA, clone:ITT010029G03, expressed in small intestine
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
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Sbjct 517 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTCTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 468
>gb|EU518771.1| Sus scrofa CRYAB (CRYAB) gene, CRYAB-CRYA2 allele, complete cds
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3246 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTCTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 3197
>dbj|AK232704.1| Sus scrofa mRNA, clone:LVRM10009H10, expressed in liver
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Query 1 CTCAGGGCCAGAGACCTGTTTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 50
||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 CTCGGGGCCAGAGGCCTGTCTCCTTGGTCCATTCACAGTGAGGACCCCAT 666
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA
>ref|XM_003952027.2| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 184 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 233
>ref|XM_009424148.1| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 171 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 220
>ref|XM_508752.3| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=966
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 268 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 317
>ref|XM_008971343.1| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 171 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 220
>ref|XM_003805460.2| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 289
>ref|XM_003805459.2| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 407 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 456
>ref|NM_001289808.1| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
3, mRNA
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 273 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 322
>ref|NM_001289807.1| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
2, mRNA
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 244 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 293
>ref|NM_001885.2| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
1, mRNA
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 278 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 327
>ref|NG_033080.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 2 (HSPB2), RefSeqGene on
chromosome 11
Length=8358
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 4019 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 3970
>ref|NG_009824.2| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), RefSeqGene on chromosome
11
Length=22097
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16969 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 17018
>ref|XM_004052118.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla crystallin, alpha B, transcript
variant 2 (CRYAB), mRNA
Length=999
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 244 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 293
>ref|XM_004052117.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla crystallin, alpha B, transcript
variant 1 (CRYAB), mRNA
Length=1026
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Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 271 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 320
>dbj|AK295498.1| Homo sapiens cDNA FLJ57064 complete cds, highly similar to Alpha
crystallin B chain (Alpha(B)-crystallin)
Length=981
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 63 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 112
>gb|EF444984.1| Homo sapiens heat-shock protein beta-2 (HSPB2) gene, complete
cds
Length=7851
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 2513 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 2464
>gb|EF444955.1| Homo sapiens alpha crystallin B chain (CRYAB) and heat-shock
protein beta-2 (HSPB2) genes, complete cds
Length=9147
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6131 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 6082
>dbj|AK314029.1| Homo sapiens cDNA, FLJ94689, Homo sapiens crystallin, alpha B
(CRYAB), mRNA
Length=573
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 16 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 65
>gb|BC007008.1| Homo sapiens crystallin, alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:12326
IMAGE:3933748), complete cds
Length=744
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 17 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 66
>gb|AY208910.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 2 (HSPB2) gene, complete
cds
Length=4421
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 873 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 824
>dbj|AP000907.6| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:RP11-708L7, complete
sequence
Length=176273
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13371 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 13322
>gb|M28638.1|HUMCRYABA Human alpha-B-crystallin gene, 5' end
Length=4206
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 969 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 1018
>ref|XM_009247045.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X6, mRNA
Length=998
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CAGCTGACCCCTCATACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 349
>ref|XM_009247044.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X5, mRNA
Length=920
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 CAGCTGACCCCTCATACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 271
>ref|XM_009247043.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X4, mRNA
Length=1061
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 CAGCTGACCCCTCATACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 412
>ref|XM_009247042.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
Length=906
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 208 CAGCTGACCCCTCATACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 257
>ref|XM_009247041.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
Length=950
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 CAGCTGACCCCTCATACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 301
>ref|XM_009247040.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1005
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307 CAGCTGACCCCTCATACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 356
>ref|XM_008020848.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
Length=970
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 CAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 321
>ref|XM_008020847.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=965
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 267 CAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 316
>ref|XM_007936553.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
Length=956
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTC-ACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 267 CAGCTGACCCCTCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 317
>ref|XM_006150984.1| PREDICTED: Tupaia chinensis crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=886
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 170 CAGCTTACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 219
>ref|XM_004090562.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=829
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 CAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 122
>ref|XM_004090561.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=1001
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245 CAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 294
>ref|XM_003253132.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B, transcript
variant 1 (CRYAB), mRNA
Length=1030
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 CAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 323
>ref|NM_001132445.2| Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=785
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 17 CAGCTGACCCCTCATACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 66
>ref|NM_001260901.1| Macaca mulatta crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=700
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 CAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 53
>ref|XM_003253133.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B, transcript
variant 2 (CRYAB), mRNA
Length=1166
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 CAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 459
>gb|AC192350.9| Rhesus Macaque BAC CH250-169D9 () complete sequence
Length=191054
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66685 CAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 66636
>ref|NM_001285062.1| Macaca fascicularis crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
dbj|AB170174.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10616, similar to
human crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA, RefSeq: NM_001885.1
Length=694
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 CAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 65
>emb|CR859387.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468D2015 (from clone DKFZp468D2015)
Length=786
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18 CAGCTGACCCCTCATACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 67
>dbj|AB125159.1| Macaca fascicularis CRYAB mRNA for crystallin, alpha B, complete
cds
Length=733
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 16 CAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 65
>gb|S45630.1| alpha B-crystallin=Rosenthal fiber component [human, glioma cell
line, mRNA, 691 nt]
gb|FJ224314.1| Homo sapiens epididymis secretory protein Li 101 (HEL-S-101)
mRNA, complete cds
Length=691
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 GACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 1 GACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 45
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B (CRYAB), transcript variant X2, mRNA
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 176 CAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 225
>ref|XM_010334574.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis crystallin, alpha
B (CRYAB), transcript variant X1, mRNA
Length=936
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 238 CAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 287
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 184 CAGCTGACCCCCCACACTGACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 233
>ref|XM_010382342.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X1, mRNA
Length=967
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 272 CAGCTGACCCCCCACACTGACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 321
>ref|XM_009006787.1| PREDICTED: Callithrix jacchus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X4, mRNA
Length=933
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 237 CAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 286
>ref|XM_003734101.2| PREDICTED: Callithrix jacchus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
Length=936
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 240 CAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 289
>ref|XM_002754383.3| PREDICTED: Callithrix jacchus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 184 CAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 233
>ref|XM_002754382.3| PREDICTED: Callithrix jacchus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1099
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 403 CAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 452
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Length=971
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Strand=Plus/Plus
Query 4 CTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 275 CTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 321
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mRNA
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Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
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Sbjct 425 CAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 474
>ref|XM_003992343.2| PREDICTED: Felis catus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=1127
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426 CAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 475
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transcript variant X4, mRNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 205 CAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 254
>ref|XM_006739205.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X3, mRNA
Length=918
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Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 CAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 270
>ref|XM_006739204.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X2, mRNA
Length=986
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Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 CAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 338
>ref|XM_006739203.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X1, mRNA
Length=962
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Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265 CAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 314
>ref|XM_004791497.1| PREDICTED: Mustela putorius furo crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
Length=906
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Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 208 CAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 257
>ref|XM_004749799.1| PREDICTED: Mustela putorius furo crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
Length=911
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 CAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 262
>ref|XM_004689273.1| PREDICTED: Condylura cristata crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=702
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 CAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 60
>ref|XM_004413585.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
Length=963
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265 CAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 314
>emb|FM872400.1| Panthera leo bleyenberghi partial cryab gene for putative crystallin,
alpha B, exons 1-2
Length=1742
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 CAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 143
>emb|AJ617823.1| Felis catus partial cryab gene for HspB5 protein and partial
mkbp gene for HspB2 protein
Length=1281
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 49/51 (96%), Gaps = 2/51 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 CAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 158
>ref|XM_007537847.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=975
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 CAGCTGACCCACAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 330
>ref|XM_007464652.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=972
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 CAGCTGAGTCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 321
>ref|XM_007128267.1| PREDICTED: Physeter catodon crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=971
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 CAGCTGAGTCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 326
>ref|XM_857165.3| PREDICTED: Canis lupus familiaris crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant 5, mRNA
Length=863
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGA-CCCCTCACACTC-ACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 CAGCTGACCCCCTC-CACTCAACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 214
>ref|XM_004585056.1| PREDICTED: Ochotona princeps crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
Length=1119
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 48/51 (94%), Gaps = 2/51 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTG-ACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CAGCTGAACCCCT-ACAATCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 470
>ref|XM_004585055.1| PREDICTED: Ochotona princeps crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
Length=854
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 48/51 (94%), Gaps = 2/51 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTG-ACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 156 CAGCTGAACCCCT-ACAATCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 205
>ref|XM_004585054.1| PREDICTED: Ochotona princeps crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=838
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTG-ACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140 CAGCTGAACCCCT-ACAATCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 189
>ref|XM_004324738.1| PREDICTED: Tursiops truncatus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=918
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 CAGCTGAGTCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 267
>ref|XM_004273414.1| PREDICTED: Orcinus orca crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=918
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 CAGCTGAGTCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 267
>emb|AJ617825.1| Talpa europaea partial cryab gene for HspB5 protein and partial
mkbp gene for HspB2 protein
Length=1180
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 80 CAGCTGACCCACAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 31
>emb|AJ617822.1| Ochotona princeps partial cryab gene for HspB5 protein and partial
mkbp gene for HspB2 protein
Length=1287
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 48/51 (94%), Gaps = 2/51 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCTG-ACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
|||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 CAGCTGAACCCCT-ACAATCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 158
>emb|AJ617821.1| Oryctolagus cuniculus partial cryab gene for HspB5 protein and
partial mkbp gene for HspB2 protein
Length=1287
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 207 CAGCTGACCCCCGACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCTATCCACCA 158
>gb|AF007162.1|AF007162 Homo sapiens unknown mRNA, complete cds
Length=661
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 11 CTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10 CTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCCATCCACCA 49
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
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Sbjct 107702712 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 107702761
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shotgun sequence
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 8983335 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 8983286
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188268, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 8983477 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 8983428
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shotgun sequence
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 107703532 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 107703581
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Lambda K H
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right flanking sequence - TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC
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>ref|NT_033899.9| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR11_CTG8
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assembly
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Sbjct 23908866 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 23908817
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genome shotgun sequence
gb|CM001619.2| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 111665566 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 111665517
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 15344995 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 15344946
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shotgun sequence
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Sbjct 18045412 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 18045363
>gb|GL583021.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_41, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 4739571 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 4739620
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Sbjct 107705572 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 107705523
>gb|DS990670.1| Homo sapiens SCAF_1112675837213 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 8980475 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 8980524
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=131853179
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Sbjct 108433768 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 108433719
>gb|CH471065.1| Homo sapiens 211000035833829 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=44976370
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
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Sbjct 21804594 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 21804545
>ref|NW_001838042.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188268, whole genome shotgun sequence
gb|DS486032.1| Homo sapiens SCAF_1103279188268 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
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Sbjct 8980617 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 8980666
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
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Sbjct 107706392 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 107706343
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Length=132164248
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
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Sbjct 108935694 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 108935645
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA
>ref|NM_001289808.1| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
3, mRNA
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 692 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 643
>ref|NM_001289807.1| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
2, mRNA
Length=964
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 614
>ref|NM_001885.2| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
1, mRNA
Length=998
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 648
>ref|NG_033080.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 2 (HSPB2), RefSeqGene on
chromosome 11
Length=8358
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 1216
>ref|NG_009824.2| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), RefSeqGene on chromosome
11
Length=22097
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19821 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 19772
>dbj|AB528831.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KE0447, Homo sapiens CRYAB
gene for crystallin, alpha B, without stop codon, in Flexi
system
Length=542
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 399 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 350
>gb|FJ876064.1| Homo sapiens clone CRYAB090401 alpha B crystallin (CRYAB) mRNA,
complete cds
Length=528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 341
>gb|EF444955.1| Homo sapiens alpha crystallin B chain (CRYAB) and heat-shock
protein beta-2 (HSPB2) genes, complete cds
Length=9147
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3279 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 3328
>dbj|AK314029.1| Homo sapiens cDNA, FLJ94689, Homo sapiens crystallin, alpha B
(CRYAB), mRNA
Length=573
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 386
>gb|DQ895729.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010189; FLH187085.01L;
RZPDo839D0862D crystallin, alpha B (CRYAB) gene, encodes
complete protein
Length=568
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 363
>gb|DQ892517.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005147; FLH187089.01X; RZPDo839D0872D
crystallin, alpha B (CRYAB) gene, encodes complete
protein
Length=568
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 363
>emb|AM392549.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002123 for hypothetical
protein (CRYAB gene)
Length=567
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 361
>emb|AM393027.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002124 for hypothetical
protein (CRYAB gene)
Length=567
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 361
>gb|BC007008.1| Homo sapiens crystallin, alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:12326
IMAGE:3933748), complete cds
Length=744
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 387
>gb|BT007909.1| Synthetic construct Homo sapiens crystallin, alpha B mRNA, partial
cds
Length=528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 341
>gb|BT006770.1| Homo sapiens crystallin, alpha B mRNA, complete cds
Length=528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 341
>gb|S45630.1| alpha B-crystallin=Rosenthal fiber component [human, glioma cell
line, mRNA, 691 nt]
gb|FJ224314.1| Homo sapiens epididymis secretory protein Li 101 (HEL-S-101)
mRNA, complete cds
Length=691
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 366
>gb|AY890056.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH026848.01X crystallin
alpha B (CRYAB) mRNA, complete cds
Length=528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 341
>gb|AY892534.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH026844.01L crystallin
alpha B (CRYAB) mRNA, partial cds
Length=528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 341
>gb|AY892533.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH026843.01L crystallin
alpha B (CRYAB) mRNA, partial cds
Length=528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 341
>dbj|AP000907.6| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:RP11-708L7, complete
sequence
Length=176273
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10519 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 10568
>gb|AF007162.1|AF007162 Homo sapiens unknown mRNA, complete cds
Length=661
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 370
>gb|M24906.1|HUMRFP Homo sapiens Rosenthal fiber protein (alpha-B-crystallin) mRNA,
3' end
Length=348
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 72 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 23
>gb|M28638.1|HUMCRYABA Human alpha-B-crystallin gene, 5' end
Length=4206
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3819 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 3770
>ref|XM_003952027.2| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 603 AGGGTCTACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 554
>ref|XM_009424148.1| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 590 AGGGTCTACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 541
>ref|XM_508752.3| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 687 AGGGTCTACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 638
>ref|XM_009247045.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X6, mRNA
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Sbjct 719 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 670
>ref|XM_009247044.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 641 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 592
>ref|XM_009247043.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X4, mRNA
Length=1061
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 782 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 733
>ref|XM_009247042.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 627 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 578
>ref|XM_009247041.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 671 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 622
>ref|XM_009247040.1| PREDICTED: Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 726 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 677
>ref|XM_008971343.1| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 590 AGGGTCTACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 541
>ref|XM_003805460.2| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 659 AGGGTCTACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 610
>ref|XM_003805459.2| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1105
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 826 AGGGTCTACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 777
>ref|XM_005378100.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera crystallin, alpha B (Cryab), mRNA
Length=1133
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 854 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 805
>ref|XM_004052118.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla crystallin, alpha B, transcript
variant 2 (CRYAB), mRNA
Length=999
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 663 AGGGTCTACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 614
>ref|XM_004052117.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla crystallin, alpha B, transcript
variant 1 (CRYAB), mRNA
Length=1026
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 690 AGGGTCTACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 641
>ref|NM_001132445.2| Pongo abelii crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=785
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 436 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 387
>emb|CR859387.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468D2015 (from clone DKFZp468D2015)
Length=786
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Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 437 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 388
>ref|NM_001082407.1| Oryctolagus cuniculus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
emb|X95383.1| O.cuniculus mRNA for alpha-B-crystallin
Length=548
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 410 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 361
>ref|XM_010610684.1| PREDICTED: Fukomys damarensis crystallin, alpha B (Cryab), mRNA
Length=653
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 AGGGTCCACATCCGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 422
>ref|XM_010382343.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X2, mRNA
Length=879
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 554
>ref|XM_010382342.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X1, mRNA
Length=967
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 642
>ref|XM_008020848.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
Length=970
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 642
>ref|XM_008020847.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=965
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 686 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 637
>gb|KJ174932.1| Camelus dromedarius alpha-crystallin B (CRYAB) mRNA, complete
cds
Length=527
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 390 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 341
>ref|XM_007074859.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
Length=1126
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 844 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 795
>ref|XM_003992343.2| PREDICTED: Felis catus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=1127
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 845 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 796
>ref|XM_006190373.1| PREDICTED: Camelus ferus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=704
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 430 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 381
>ref|XM_005667320.1| PREDICTED: Sus scrofa crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
Length=949
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 671 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 622
>ref|XM_005667319.1| PREDICTED: Sus scrofa crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=935
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 657 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 608
>ref|XM_004791497.1| PREDICTED: Mustela putorius furo crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
Length=906
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 627 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 578
>ref|XM_004749799.1| PREDICTED: Mustela putorius furo crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
Length=911
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 632 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 583
>ref|XM_004646355.1| PREDICTED: Octodon degus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X3, mRNA
Length=845
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 AGGGTCCACATCTGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 520
>ref|XM_004646354.1| PREDICTED: Octodon degus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X2, mRNA
Length=835
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 AGGGTCCACATCTGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 510
>ref|XM_004646353.1| PREDICTED: Octodon degus crystallin, alpha B (Cryab), transcript
variant X1, mRNA
Length=1116
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 AGGGTCCACATCTGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 791
>ref|XM_004585056.1| PREDICTED: Ochotona princeps crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
Length=1119
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 AGGGTCCACGTCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 791
>ref|XM_004585055.1| PREDICTED: Ochotona princeps crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
Length=854
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 575 AGGGTCCACGTCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 526
>ref|XM_004585054.1| PREDICTED: Ochotona princeps crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=838
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 AGGGTCCACGTCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 510
>ref|XM_004382499.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris crystallin, alpha B
(CRYAB), mRNA
Length=709
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 430 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 381
>ref|XM_004090563.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=737
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 351
>ref|XM_004090562.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=829
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 443
>ref|XM_004090561.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=1001
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 615
>ref|XM_003253132.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B, transcript
variant 1 (CRYAB), mRNA
Length=1030
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 644
>ref|NM_001260901.1| Macaca mulatta crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=700
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 374
>dbj|AK391992.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10040F12, expressed in hypothalamus
Length=731
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 436 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 387
>ref|XM_003253133.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B, transcript
variant 2 (CRYAB), mRNA
Length=1166
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 780
>gb|HQ326655.1| Fukomys anselli alpha-crystallin B chain mRNA, complete cds
Length=723
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 AGGGTCCACATCCGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 390
>dbj|AK344985.1| Sus scrofa mRNA, clone:ITT010029G03, expressed in small intestine
Length=736
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 439 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 390
>gb|EU518771.1| Sus scrofa CRYAB (CRYAB) gene, CRYAB-CRYA2 allele, complete cds
Length=3420
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3168 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 3119
>gb|AC192350.9| Rhesus Macaque BAC CH250-169D9 () complete sequence
Length=191054
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 63846 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 63895
>ref|NM_001285062.1| Macaca fascicularis crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
dbj|AB170174.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10616, similar to
human crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA, RefSeq: NM_001885.1
Length=694
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 386
>dbj|AK232704.1| Sus scrofa mRNA, clone:LVRM10009H10, expressed in liver
Length=941
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 637 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 588
>dbj|AB125159.1| Macaca fascicularis CRYAB mRNA for crystallin, alpha B, complete
cds
Length=733
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 AGGGTCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 386
>ref|XM_008690086.1| PREDICTED: Ursus maritimus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=858
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 576 AGGGTCCACATCGGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 527
>ref|XM_008577610.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X2, mRNA
Length=589
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 AGGATCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 261
>ref|XM_008577609.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X1, mRNA
Length=926
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 AGGATCCACATCAGCTGGGACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 595
>ref|XM_008065587.1| PREDICTED: Tarsius syrichta crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=971
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 AGGGTCCACATCAGCTGGAACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 642
>ref|XM_006065260.1| PREDICTED: Bubalus bubalis crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=769
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 491 AGGGTCCACGTCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 442
>ref|XM_006912821.1| PREDICTED: Pteropus alecto crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=971
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 690 AGGGTCCACATCTGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 641
>ref|XM_006739206.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X4, mRNA
Length=902
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 624 AGGGTCCACATCGGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 575
>ref|XM_006739205.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X3, mRNA
Length=918
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 640 AGGGTCCACATCGGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 591
>ref|XM_006739204.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X2, mRNA
Length=986
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 708 AGGGTCCACATCGGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 659
>ref|XM_006739203.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X1, mRNA
Length=962
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
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Sbjct 684 AGGGTCCACATCGGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 635
>ref|XM_006150984.1| PREDICTED: Tupaia chinensis crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=886
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 AGGGTCCACATCAGCTGGAACCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 540
>ref|XM_005901534.1| PREDICTED: Bos mutus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=708
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 430 AGGGTCCACGTCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 381
>ref|XM_005334235.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus crystallin, alpha B
(Cryab), mRNA
Length=1154
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 AGGATCCACATCAGCTGGGATTCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 828
>ref|XM_004427339.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
Length=918
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 636 AGGGTCCACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCTCGGGAGA 587
>ref|XM_004413585.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
Length=963
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 684 AGGGTCCACATCGGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 635
>gb|FJ439506.1| Ailuropoda melanoleuca crystallin alpha-B gene, complete cds
Length=3189
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3051 AGGGTCCACATCGGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 3002
>gb|FJ169483.1| Ailuropoda melanoleuca alpha B-crystallin protein (CRYAB) mRNA,
complete cds
Length=534
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 396 AGGGTCCACATCGGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 347
>ref|XM_002921092.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca alpha-crystallin B chain-like
(LOC100479594), mRNA
Length=1001
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 719 AGGGTCCACATCGGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 670
>gb|BC102745.1| Bos taurus crystallin, alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:128019 IMAGE:7962636),
complete cds
Length=730
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 437 AGGGTCCACGTCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 388
>ref|NM_174290.2| Bos taurus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
gb|AF029793.2|AF029793 Bos taurus alpha B-crystallin (CRYAB) mRNA, complete cds
Length=632
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGA 50
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 390 AGGGTCCACGTCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCGGGAGA 341
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC
>ref|XM_003952027.2| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
Length=882
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 225
>ref|XM_009424148.1| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
Length=869
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 212
>ref|XM_508752.3| PREDICTED: Pan troglodytes crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=966
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 260 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 309
>ref|XM_008971343.1| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X3, mRNA
Length=869
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 212
>ref|XM_003805460.2| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X2, mRNA
Length=938
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 232 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 281
>ref|XM_003805459.2| PREDICTED: Pan paniscus crystallin, alpha B (CRYAB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1105
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 399 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 448
>ref|NM_001289808.1| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
3, mRNA
Length=993
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 314
>ref|NM_001289807.1| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
2, mRNA
Length=964
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 285
>ref|NM_001885.2| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), transcript variant
1, mRNA
Length=998
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 319
>ref|NG_033080.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 2 (HSPB2), RefSeqGene on
chromosome 11
Length=8358
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4027 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 3978
>ref|NG_009824.2| Homo sapiens crystallin, alpha B (CRYAB), RefSeqGene on chromosome
11
Length=22097
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16961 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 17010
>dbj|AK295498.1| Homo sapiens cDNA FLJ57064 complete cds, highly similar to Alpha
crystallin B chain (Alpha(B)-crystallin)
Length=981
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 104
>gb|EF444984.1| Homo sapiens heat-shock protein beta-2 (HSPB2) gene, complete
cds
Length=7851
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 2472
>gb|EF444955.1| Homo sapiens alpha crystallin B chain (CRYAB) and heat-shock
protein beta-2 (HSPB2) genes, complete cds
Length=9147
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6139 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 6090
>dbj|AK314029.1| Homo sapiens cDNA, FLJ94689, Homo sapiens crystallin, alpha B
(CRYAB), mRNA
Length=573
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 57
>gb|BC007008.1| Homo sapiens crystallin, alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:12326
IMAGE:3933748), complete cds
Length=744
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 58
>gb|AY208910.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 2 (HSPB2) gene, complete
cds
Length=4421
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 832
>dbj|AP000907.6| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:RP11-708L7, complete
sequence
Length=176273
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
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Sbjct 13379 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 13330
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Sbjct 961 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 1010
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variant X2, mRNA
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Sbjct 264 TGACCAGCCAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 313
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variant X1, mRNA
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Sbjct 259 TGACCAGCCAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 308
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mRNA
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Sbjct 259 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 309
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Sbjct 162 TGACCAGCCAGCTTACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 211
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variant 2 (CRYAB), mRNA
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Sbjct 236 TGATCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 285
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variant 1 (CRYAB), mRNA
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Sbjct 263 TGATCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 312
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Sbjct 66693 TGACCAGCCAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 66644
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dbj|AB170174.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10616, similar to
human crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA, RefSeq: NM_001885.1
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Sbjct 8 TGACCAGCCAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 57
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cds
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Sbjct 8 TGACCAGCCAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 57
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B (CRYAB), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 168 TGACCAGCCAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 217
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B (CRYAB), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 230 TGACCAGCCAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 279
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variant X4, mRNA
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Sbjct 229 TGACCAGCCAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 278
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variant X3, mRNA
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Sbjct 232 TGACCAGCCAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 281
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variant X2, mRNA
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Sbjct 176 TGACCAGCCAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 225
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variant X1, mRNA
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Sbjct 395 TGACCAGCCAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 444
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Sbjct 264 TGACCAGCCAACTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 313
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mRNA
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Sbjct 417 TGACCAGCCAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 466
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Sbjct 418 TGACCAGCCAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 467
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transcript variant X4, mRNA
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCC-TCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
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Sbjct 197 TGACCAGCCAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 246
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCC-TCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 TGACCAGCCAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 262
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCC-TCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
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Sbjct 281 TGACCAGCCAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 330
>ref|XM_006739203.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii crystallin, alpha B (CRYAB),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 257 TGACCAGCCAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 306
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mRNA
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Sbjct 200 TGACCAGCCAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 249
>ref|XM_004749799.1| PREDICTED: Mustela putorius furo crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCC-TCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
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Sbjct 205 TGACCAGCCAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 254
>ref|XM_004413585.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens crystallin, alpha B (CRYAB),
mRNA
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCC-TCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
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Sbjct 257 TGACCAGCCAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 306
>ref|XM_004090562.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 TGACTAGCCAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 114
>ref|XM_004090561.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 TGACTAGCCAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 286
>ref|XM_003253132.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B, transcript
variant 1 (CRYAB), mRNA
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 TGACTAGCCAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 315
>ref|XM_003253133.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys crystallin, alpha B, transcript
variant 2 (CRYAB), mRNA
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
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Sbjct 402 TGACTAGCCAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 451
>emb|FM872400.1| Panthera leo bleyenberghi partial cryab gene for putative crystallin,
alpha B, exons 1-2
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCC-TCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 TGACCAGCCAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 135
>emb|AJ617823.1| Felis catus partial cryab gene for HspB5 protein and partial
mkbp gene for HspB2 protein
Length=1281
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCC-TCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215 TGACCAGCCAGCTGACCCCCTC-CACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 166
>ref|NM_001260901.1| Macaca mulatta crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
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Query 6 AGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGCCAGCTGACCCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 45
>ref|XM_007537847.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 TGACCAGCCAGCTGACCCACAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 322
>ref|XM_007464652.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=972
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 TGACCAGCCAGCTGAGTCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 313
>ref|XM_007128267.1| PREDICTED: Physeter catodon crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=971
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269 TGACCAGCCAGCTGAGTCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 318
>ref|XM_004689273.1| PREDICTED: Condylura cristata crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=702
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
|||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 TGACTAGCCAGCTGACCCCCAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 52
>ref|XM_004324738.1| PREDICTED: Tursiops truncatus crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=918
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 TGACCAGCCAGCTGAGTCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 259
>ref|XM_004273414.1| PREDICTED: Orcinus orca crystallin, alpha B (CRYAB), mRNA
Length=918
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 TGACCAGCCAGCTGAGTCCCCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 259
>emb|AJ617825.1| Talpa europaea partial cryab gene for HspB5 protein and partial
mkbp gene for HspB2 protein
Length=1180
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 TGACCAGCCAGCTGACCCACAACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGCC 39
>emb|AJ617821.1| Oryctolagus cuniculus partial cryab gene for HspB5 protein and
partial mkbp gene for HspB2 protein
Length=1287
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
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Query 1 TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGC 49
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Sbjct 215 TGACCCGCCAGCTGACCCCCGACACTCACCTAGCCACCATGGACATCGC 167
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Lambda K H
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11 11 111779459 111779559 100M TTAAAAAATGCAATTCAAGAAAGGGCATCTATTTCTTGGGGGCTGCGGTGACAGCAGGCTTCTCTTCACGGGTGAGGGGAATGGTGCGCTCAGGGCCAGG
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11 11 111779623 111782437 52M111782486F48m AGAGGGTCTACATCAGCTGGGATCCGGTATTTCCTGTGGAACTCCCTGGAGC TGACCAGCCAGCTGACCCCTCACACTCACCTAGCCACCATGGACATCG
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11 11 111782451 111782351 100m CACCATGGACATCGCCATCCACCACCCCTGGATCCGCCGCCCCTTCTTTCCTTTCCACTCACCCAGCCGCCTCTTTGACCAGTTCTTCGGAGAGCACCTG
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AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC | TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA |
blast search - genome
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HSCHR11_CTG8
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assembly
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genome shotgun sequence
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 122816680 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 122816729
>ref|NW_004929381.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 118871815 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 118871864
>gb|DS990767.1| Homo sapiens SCAF_1112675837137 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 132579941 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 132579892
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 119581561 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 119581610
>gb|CH471065.1| Homo sapiens 211000035833829 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 32958917 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 32958966
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HuRef SCAF_1103279188192, whole genome shotgun sequence
gb|DS486129.1| Homo sapiens SCAF_1103279188192 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 3742281 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 3742232
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 118872767 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 118872816
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 120090017 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 120090066
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA
>ref|NC_000011.10| Homo sapiens chromosome 11, GRCh38 Primary Assembly
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
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Sbjct 123062107 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 123062058
>ref|NT_033899.9| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
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assembly
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
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Sbjct 35059211 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 35059162
>ref|NC_018922.2| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001619.2| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
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Sbjct 122818807 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 122818758
>ref|NW_004929381.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150165.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
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Sbjct 26498236 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 26498187
>gb|GL583038.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_58, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
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Sbjct 1049100 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 1049051
>gb|CM000501.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130894309
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
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Sbjct 118873942 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 118873893
>gb|DS990767.1| Homo sapiens SCAF_1112675837137 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
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Sbjct 3740131 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 3740180
>gb|CH003506.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=137609055
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
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Sbjct 132577814 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 132577863
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=131853179
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119583688 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 119583639
>gb|CH471065.1| Homo sapiens 211000035833829 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=44976370
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
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Sbjct 32961044 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 32960995
>ref|NW_001838043.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188192, whole genome shotgun sequence
gb|DS486129.1| Homo sapiens SCAF_1103279188192 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5927939
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3740154 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 3740203
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130895506
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
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Sbjct 118874894 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 118874845
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=132164248
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
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Sbjct 120092144 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 120092095
>gb|KE141133.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold1, whole genome
shotgun sequence
Length=41706555
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Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 29448715 TTTTTGTGGCTTCTTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 29448666
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC
>ref|XM_003313393.3| PREDICTED: Pan troglodytes heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8),
mRNA
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 885 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 836
>ref|XM_009247182.1| PREDICTED: Pongo abelii heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC103891930), mRNA
Length=1622
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 426 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 377
>ref|XM_009247181.1| PREDICTED: Pongo abelii heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript
variant X2, mRNA
Length=2187
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 570
>ref|XM_009247180.1| PREDICTED: Pongo abelii heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript
variant X1, mRNA
Length=2460
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 892 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 843
>ref|XR_609502.1| PREDICTED: Pan paniscus heat shock cognate 71 kDa protein pseudogene
(LOC100968349), misc_RNA
Length=2276
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 648
>ref|XM_008973388.1| PREDICTED: Pan paniscus heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), mRNA
Length=2460
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 841
>gb|KJ905785.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15455 HSPA8
gene, encodes complete protein
Length=2070
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 629
>gb|KJ901499.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_10893 HSPA8
gene, encodes complete protein
Length=1890
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 498 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 449
>gb|KJ897016.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06410 HSPA8
gene, encodes complete protein
Length=2070
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 629
>ref|NM_001132311.2| Pongo abelii heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), mRNA
Length=2361
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 684
>ref|XM_006718831.1| PREDICTED: Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript
variant X1, mRNA
Length=2191
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 621 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 572
>gb|FJ224294.1| Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 72p
(HEL-S-72p) mRNA, complete cds
Length=2276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 642
>ref|NM_153201.3| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
2, mRNA
Length=2014
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 841
>ref|NM_006597.5| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
1, mRNA
Length=2473
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 890 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 841
>ref|XM_003253302.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys heat shock 70kDa protein 8, transcript
variant 1 (HSPA8), mRNA
Length=2404
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 829 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 780
>dbj|AK305352.1| Pan troglodytes mRNA for heat shock cognate 71 kDa protein, complete
cds, clone: PtsC-51-5_G07
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Sbjct 723 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 674
>ref|NG_029473.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), RefSeqGene on
chromosome 11
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Sbjct 7157 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 7108
>ref|XM_003253303.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys heat shock 70kDa protein 8, transcript
variant 2 (HSPA8), mRNA
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Sbjct 829 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 780
>dbj|AB527307.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5306, Homo sapiens HSPA8
gene for heat shock 70kDa protein 8, without stop codon, in
Flexi system
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Sbjct 622 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 573
>dbj|AK300404.1| Homo sapiens cDNA FLJ59163 complete cds, highly similar to Heat
shock cognate 71 kDa protein
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Sbjct 851 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 802
>dbj|AK303935.1| Homo sapiens cDNA FLJ55485 complete cds, highly similar to Heat
shock cognate 71 kDa protein
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Sbjct 461 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 412
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Sbjct 762 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 713
>dbj|AK292067.1| Homo sapiens cDNA FLJ77848 complete cds
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Sbjct 320 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 271
>gb|DQ894325.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008785; FLH169716.01L;
RZPDo839F0595D heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8)
gene, encodes complete protein
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Sbjct 635 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 586
>gb|DQ891145.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003775; FLH169720.01X; RZPDo839F0596D
heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8) gene, encodes
complete protein
Length=1981
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 635 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 586
>gb|BC042163.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4862437),
**** WARNING: chimeric clone ****
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 885 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 836
>gb|BC009338.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4128333, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2741
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 1151 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 1102
>gb|BC016660.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:9495
IMAGE:3923981), complete cds
gb|EU668349.1| Homo sapiens epididymis luminal protein 33 (HEL-33) mRNA, complete
cds
Length=2259
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 671 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 622
>gb|BC016179.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:17984
IMAGE:3920744), complete cds
Length=2276
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 671 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 622
>gb|BC019816.2| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:29929
IMAGE:2899894), complete cds
Length=2250
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 671 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 622
>gb|BC007276.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:3162067),
partial cds
Length=2031
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 438 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 389
>dbj|AK096100.1| Homo sapiens cDNA FLJ38781 fis, clone LIVER2000216, highly similar
to HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
Length=2229
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 616 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 567
>dbj|AB073886.1| Homo sapiens primary neuroblastoma cDNA, clone:Nbla02874, full
insert sequence
Length=2142
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 568 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 519
>dbj|AK222785.1| Homo sapiens mRNA for heat shock 70kDa protein 8 isoform 1 variant,
clone: HEP02822
Length=2068
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 688 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 639
>dbj|AK222628.1| Homo sapiens mRNA for heat shock 70kDa protein 8 isoform 2 variant,
clone: CBL04813
Length=1812
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 688 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 639
>emb|CR925990.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459M2220 (from clone DKFZp459M2220)
Length=2297
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 710 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 661
>emb|CR861166.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459P2416 (from clone DKFZp459P2416)
Length=2324
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 738 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 689
>emb|CR860584.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L1519 (from clone DKFZp459L1519)
Length=2041
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 463 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 414
>emb|CR859135.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459D1928 (from clone DKFZp459D1928)
Length=2362
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 734 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 685
>dbj|AK129885.1| Homo sapiens cDNA FLJ26375 fis, clone HRT06292, highly similar
to Heat shock cognate 71 kDa protein
Length=2261
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 692 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 643
>gb|AF352832.1|AF352832 Homo sapiens constitutive heat shock protein 70 (HSC70) mRNA,
complete cds
Length=2085
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 677 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 628
>emb|Y00371.1| Human hsc70 gene for 71 kd heat shock cognate protein
Length=5408
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 2385 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 2336
>dbj|AP000926.6| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:RP11-762B21, complete
sequence
Length=196972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 37891 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 37940
>dbj|AB034951.1| Homo sapiens HSC54 mRNA for heat shock cognate protein 54, complete
cds
Length=1534
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 654 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 605
>emb|X73685.1| C.aethiops hsp70 mRNA
Length=2177
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
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Sbjct 614 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 565
>ref|XM_004052309.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 70kDa protein 8,
transcript variant 2 (HSPA8), mRNA
Length=2004
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 890 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACATTTCTTTCTGCTCCAACC 841
>ref|XM_004052308.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 70kDa protein 8,
transcript variant 1 (HSPA8), mRNA
Length=2476
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACGTTTCTTTCTGCTCCAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 890 AAGTGCCACCTCCCAGGTCAAAGATGAGCACATTTCTTTCTGCTCCAACC 841
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA
>ref|NG_029473.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), RefSeqGene on
chromosome 11
Length=11645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5030 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 5079
>emb|Y00371.1| Human hsc70 gene for 71 kd heat shock cognate protein
Length=5408
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 310
>dbj|AP000926.6| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:RP11-762B21, complete
sequence
Length=196972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40018 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAGGTAAAA 39969
>gb|FJ224294.1| Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 72p
(HEL-S-72p) mRNA, complete cds
Length=2276
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 73
>ref|NM_153201.3| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
2, mRNA
Length=2014
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 272
>ref|NM_006597.5| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
1, mRNA
Length=2473
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 44
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Sbjct 229 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 272
>dbj|AK303935.1| Homo sapiens cDNA FLJ55485 complete cds, highly similar to Heat
shock cognate 71 kDa protein
Length=1846
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 73
>dbj|AK310467.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17509
Length=1509
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 44
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Sbjct 101 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 144
>gb|BC019816.2| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:29929
IMAGE:2899894), complete cds
Length=2250
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 53
>dbj|AK096100.1| Homo sapiens cDNA FLJ38781 fis, clone LIVER2000216, highly similar
to HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
Length=2229
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 TTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG 73
>dbj|AK222785.1| Homo sapiens mRNA for heat shock 70kDa protein 8 isoform 1 variant,
clone: HEP02822
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assembly
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188192, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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HSCHRX_CTG14
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genome shotgun sequence
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Sbjct 120249504 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 120249553
>ref|NW_004929446.1| Homo sapiens chromosome X genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 3772336 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 3772287
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shotgun sequence
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Sbjct 243026 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 242977
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Sbjct 109714295 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 109714344
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shotgun sequence
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Sbjct 508079 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 508128
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Sbjct 90482514 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 90482465
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Sbjct 114999487 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 114999536
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Sbjct 119369770 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 119369819
>gb|CH471107.2| Homo sapiens 211000035845310 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 925648 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 925697
>ref|NW_001842397.1| Homo sapiens chromosome X genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188247, whole genome shotgun sequence
gb|DS486159.1| Homo sapiens SCAF_1103279188247 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 508080 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 508129
>ref|AC_000155.1| Homo sapiens chromosome X, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 109714230 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 109714279
>gb|CM000274.1| Homo sapiens chromosome X, whole genome shotgun sequence
Length=155407050
Score = 82.4 bits (44), Expect = 1e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 120720073 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 120720122
>ref|NC_000007.14| Homo sapiens chromosome 7, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000669.2| Homo sapiens chromosome 7, GRCh38 reference primary assembly
Length=159345973
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 10451685 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 10451636
>ref|NT_007819.18| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR7_CTG1
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assembly
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 10441685 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 10441636
>ref|NC_018918.2| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001615.2| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=159147065
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 10490890 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 10490841
>ref|NW_004929329.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150113.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 10480890 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 10480841
>gb|KE141248.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold159, whole genome
shotgun sequence
Length=15870744
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 12291827 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 12291876
>gb|CH236948.1| Homo sapiens chromosome 7 Scaffold02, whole genome shotgun sequence
Length=22661731
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 19201860 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 19201909
>gb|GL583150.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_170, whole genome
shotgun sequence
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Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 2771904 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 2771855
>gb|CM000497.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=152869804
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 10349233 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 10349184
>gb|DS990667.1| Homo sapiens SCAF_1112675837322 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=33027370
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 4192040 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 4191991
>gb|CH003502.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=147693610
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 8988235 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 8988186
>gb|CH003454.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=154169609
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 10577705 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 10577656
>tpg|BL000002.1| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158409401
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 10201649 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 10201600
>ref|NW_001839003.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188377, whole genome shotgun sequence
gb|DS486029.1| Homo sapiens SCAF_1103279188377 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=33027203
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 4192122 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 4192073
>gb|CH471073.1| Homo sapiens 211000035839577 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=37175744
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 3637404 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 3637355
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000468.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=152870189
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 10348897 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 10348848
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158329839
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 10545068 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 10545019
>gb|CM000258.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=153561227
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 10466539 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 10466490
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG
>ref|NC_000011.10| Homo sapiens chromosome 11, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000673.2| Homo sapiens chromosome 11, GRCh38 reference primary assembly
Length=135086622
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 123062132 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 123062083
>ref|NT_033899.9| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR11_CTG8
gb|GL000104.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=47073726
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 35059236 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 35059187
>ref|NC_018922.2| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001619.2| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=134889443
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 122818832 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 122818783
>ref|NW_004929381.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150165.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=38508872
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26498261 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 26498212
>gb|GL583038.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_58, whole genome
shotgun sequence
Length=12952740
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 1049125 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 1049076
>gb|CM000501.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130894309
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 118873967 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 118873918
>gb|DS990767.1| Homo sapiens SCAF_1112675837137 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5927926
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 3740106 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 3740155
>gb|CH003506.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=137609055
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 132577789 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 132577838
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=131853179
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 119583713 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 119583664
>gb|CH471065.1| Homo sapiens 211000035833829 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=44976370
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 32961069 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 32961020
>ref|NW_001838043.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188192, whole genome shotgun sequence
gb|DS486129.1| Homo sapiens SCAF_1103279188192 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5927939
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 3740129 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 3740178
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130895506
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 118874919 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 118874870
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=132164248
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
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Sbjct 120092169 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 120092120
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC
>ref|XM_006718831.1| PREDICTED: Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript
variant X1, mRNA
Length=2191
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 381 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 332
>gb|FJ224294.1| Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 72p
(HEL-S-72p) mRNA, complete cds
Length=2276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 451 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 402
>ref|NM_153201.3| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
2, mRNA
Length=2014
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 650 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 601
>ref|NM_006597.5| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
1, mRNA
Length=2473
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 650 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 601
>ref|NG_029473.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), RefSeqGene on
chromosome 11
Length=11645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 6506 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 6457
>dbj|AB527307.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5306, Homo sapiens HSPA8
gene for heat shock 70kDa protein 8, without stop codon, in
Flexi system
Length=1955
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 382 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 333
>dbj|AK300404.1| Homo sapiens cDNA FLJ59163 complete cds, highly similar to Heat
shock cognate 71 kDa protein
Length=1017
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 524 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 475
>dbj|AK310467.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17509
Length=1509
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 522 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 473
>gb|DQ894325.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008785; FLH169716.01L;
RZPDo839F0595D heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8)
gene, encodes complete protein
Length=1981
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 395 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 346
>gb|DQ891145.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003775; FLH169720.01X; RZPDo839F0596D
heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8) gene, encodes
complete protein
Length=1981
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 395 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 346
>gb|BC042163.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4862437),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=2468
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 645 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 596
>gb|BC009338.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4128333, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2741
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 911 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 862
>gb|BC016660.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:9495
IMAGE:3923981), complete cds
gb|EU668349.1| Homo sapiens epididymis luminal protein 33 (HEL-33) mRNA, complete
cds
Length=2259
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 431 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 382
>gb|BC016179.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:17984
IMAGE:3920744), complete cds
Length=2276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 431 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 382
>gb|BC019816.2| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:29929
IMAGE:2899894), complete cds
Length=2250
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 431 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 382
>gb|BC007276.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:3162067),
partial cds
Length=2031
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 198 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 149
>dbj|AK096100.1| Homo sapiens cDNA FLJ38781 fis, clone LIVER2000216, highly similar
to HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
Length=2229
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 376 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 327
>dbj|AB073886.1| Homo sapiens primary neuroblastoma cDNA, clone:Nbla02874, full
insert sequence
Length=2142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 328 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 279
>dbj|AK222785.1| Homo sapiens mRNA for heat shock 70kDa protein 8 isoform 1 variant,
clone: HEP02822
Length=2068
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 448 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 399
>dbj|AK222628.1| Homo sapiens mRNA for heat shock 70kDa protein 8 isoform 2 variant,
clone: CBL04813
Length=1812
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 448 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 399
>dbj|AK129885.1| Homo sapiens cDNA FLJ26375 fis, clone HRT06292, highly similar
to Heat shock cognate 71 kDa protein
Length=2261
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 450 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 401
>gb|AF352832.1|AF352832 Homo sapiens constitutive heat shock protein 70 (HSC70) mRNA,
complete cds
Length=2085
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 437 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 388
>emb|Y00371.1| Human hsc70 gene for 71 kd heat shock cognate protein
Length=5408
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 1734 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 1685
>dbj|AP000926.6| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:RP11-762B21, complete
sequence
Length=196972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 38542 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 38591
>dbj|AB034951.1| Homo sapiens HSC54 mRNA for heat shock cognate protein 54, complete
cds
Length=1534
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 414 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 365
>ref|XM_003313393.3| PREDICTED: Pan troglodytes heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8),
mRNA
Length=2455
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 645 TCAGAACCATAGAGGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 596
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(LOC100968349), misc_RNA
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Sbjct 457 TCAGAACCATAGAGGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 408
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transcript variant 2 (HSPA8), mRNA
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Sbjct 650 TCAGAACCATAGAGGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 601
>ref|XM_004052308.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 70kDa protein 8,
transcript variant 1 (HSPA8), mRNA
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Sbjct 650 TCAGAACCATAGAGGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 601
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cds, clone: PtsC-51-5_G07
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Sbjct 483 TCAGAACCATAGAGGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 434
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Sbjct 380 TCAGAACCATAGAGGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 331
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(LOC708240), miscRNA
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Sbjct 301 TCAGAACCATAGAGGACACCTCCTCTGGATAGAAGCNTTTGGTCTCTCCC 252
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(HSPA8), mRNA
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Sbjct 602 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 553
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pseudogene (LOC465840), misc_RNA
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Sbjct 390 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 341
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(LOC103891930), mRNA
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Sbjct 186 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 137
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variant X2, mRNA
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Sbjct 379 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 330
>ref|XM_009247180.1| PREDICTED: Pongo abelii heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 652 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 603
>ref|XM_003919027.2| PREDICTED: Papio anubis heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC101021277), mRNA
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Sbjct 451 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 402
>ref|XM_009187541.1| PREDICTED: Papio anubis heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), mRNA
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Sbjct 508 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 459
>ref|NM_001132311.2| Pongo abelii heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), mRNA
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Sbjct 493 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 444
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 645 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 596
>ref|XM_008021264.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8),
transcript variant X3, mRNA
Length=2457
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 645 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 596
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 503 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 454
>ref|XM_008021262.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8),
transcript variant X1, mRNA
Length=2457
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 645 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 596
>ref|XM_006878645.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC102859726), transcript variant X2, mRNA
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Query 3 AGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCC 49
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Sbjct 371 AGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAACTTTTGGTCTCTCC 325
>ref|XM_006878644.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC102859726), transcript variant X1, mRNA
Length=1941
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Strand=Plus/Minus
Query 3 AGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 371 AGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAACTTTTGGTCTCTCC 325
>ref|XM_005579979.1| PREDICTED: Macaca fascicularis heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8),
transcript variant X4, mRNA
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Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 645 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 596
>ref|XM_005579977.1| PREDICTED: Macaca fascicularis heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8),
transcript variant X2, mRNA
Length=2267
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 449 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 400
>ref|XM_005579976.1| PREDICTED: Macaca fascicularis heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8),
transcript variant X1, mRNA
Length=2457
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 596
>ref|XM_004427191.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum heat shock 70kDa protein
8, transcript variant 2 (HSPA8), mRNA
Length=1720
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 378 TCAAAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCC 329
>ref|XM_004427190.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum heat shock 70kDa protein
8, transcript variant 1 (HSPA8), mRNA
Length=2179
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 378 TCAAAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCC 329
>ref|NM_001261657.2| Macaca mulatta heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), mRNA
Length=2267
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 454 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 405
>ref|NG_001144.5| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 pseudogene 1 (HSPA8P1)
on chromosome X
Length=2450
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 502
>ref|XM_002799869.1| PREDICTED: Macaca mulatta putative uncharacterized protein YAL004W-like
(LOC100423663), mRNA
Length=427
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 39 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 88
>gb|AC200274.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-415L2 from chromosome 14, complete
sequence
Length=169556
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 156626 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 156675
>dbj|AB170103.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10235, similar to
human heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant1,
mRNA, RefSeq: NM_006597.3
Length=1581
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 54 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 5
>gb|AC192393.1| Pan troglodytes BAC clone CH251-66L11 from chromosome x, complete
sequence
Length=150989
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 61252 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 61301
>emb|CR861166.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459P2416 (from clone DKFZp459P2416)
Length=2324
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 498 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 449
>emb|CR860584.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L1519 (from clone DKFZp459L1519)
Length=2041
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 174
>emb|CR859135.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459D1928 (from clone DKFZp459D1928)
Length=2362
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 445
>gb|AC002377.1|AC002377 Human PAC clone RP1-222H5 from Xq25-q26, complete sequence
Length=141779
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
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Sbjct 121117 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 121166
>emb|X73685.1| C.aethiops hsp70 mRNA
Length=2177
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 374 TCAGAACCATAGATGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 325
>gb|M12119.1|HUMDMHSP Human DNA region with homology to D.melanogaster heat shock protein
(hsp70) genes
Length=2851
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 TCAGAACCATAGAGGACACATCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 708
>ref|XR_746868.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana heat shock cognate 71 kDa
protein pseudogene (LOC104654620), misc_RNA
Length=2237
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 CAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 396
>emb|CR925990.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459M2220 (from clone DKFZp459M2220)
Length=2297
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 CAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 421
>ref|XM_010356591.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana heat shock cognate 71 kDa
protein-like (LOC104656894), mRNA
Length=1594
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCT 47
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 473 TCAGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCT 427
>ref|XR_747969.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana heat shock cognate 71 kDa
protein pseudogene (LOC104662293), misc_RNA
Length=2167
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 TCAGAACCATAGAGGGTACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 330
>ref|XR_169759.2| PREDICTED: Pan troglodytes heat shock cognate 71 kDa protein
pseudogene (LOC472599), misc_RNA
Length=2256
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 392
>ref|XR_612951.1| PREDICTED: Pan paniscus heat shock cognate 71 kDa protein pseudogene
(LOC100981595), misc_RNA
Length=2188
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 324
>ref|XR_616466.1| PREDICTED: Callithrix jacchus heat shock cognate 71 kDa protein
pseudogene (LOC100398700), misc_RNA
Length=2992
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 AGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCC 49
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 AGAACCATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCC 1138
>ref|XM_004413538.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens heat shock 70kDa protein
8, transcript variant 2 (HSPA8), mRNA
Length=2389
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 583 TCAAAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCC 534
>ref|XM_004413537.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens heat shock 70kDa protein
8, transcript variant 1 (HSPA8), mRNA
Length=2413
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 583 TCAAAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCC 534
>ref|XR_180352.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC101177741), misc_RNA
Length=1889
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
|||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 TCAGCACCATAGAGGACACCTTCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 390
>ref|XR_175017.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 70kDa protein 8
pseudogene (LOC101154214), misc_RNA
Length=2271
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 395
>ref|NG_005513.3| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 pseudogene 8 (HSPA8P8)
on chromosome 7
Length=2465
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 501
>gb|AC217031.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-543K23 from chromosome 7, complete
sequence
Length=204437
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 115579 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 115530
>gb|AC009945.2| Homo sapiens BAC clone CTD-2060L22 from 7, complete sequence
Length=75517
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47260 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 47309
>gb|BC002644.2| Homo sapiens hypothetical protein MGC4859 similar to HSPA8, mRNA
(cDNA clone IMAGE:3605453), partial cds
Length=3142
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 TCAGAACAATAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 1302
>ref|XR_192858.1| PREDICTED: Octodon degus heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC101589118), misc_RNA
Length=1939
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCC 49
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 376 TCAGCACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTCTTTGTCTCTCC 328
>ref|XR_013267.2| PREDICTED: Macaca mulatta heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC709412), miscRNA
Length=2188
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 50
|||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 CAGAACCACAGAGGATACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC 363
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG
>ref|NM_153201.3| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
2, mRNA
Length=2014
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 253
>ref|NM_006597.5| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
1, mRNA
Length=2473
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 253
>ref|NG_029473.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), RefSeqGene on
chromosome 11
Length=11645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5005 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 5054
>dbj|AK303935.1| Homo sapiens cDNA FLJ55485 complete cds, highly similar to Heat
shock cognate 71 kDa protein
Length=1846
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 54
>dbj|AK310467.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17509
Length=1509
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 125
>dbj|AK096100.1| Homo sapiens cDNA FLJ38781 fis, clone LIVER2000216, highly similar
to HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
Length=2229
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 54
>dbj|AK222785.1| Homo sapiens mRNA for heat shock 70kDa protein 8 isoform 1 variant,
clone: HEP02822
Length=2068
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 51
>dbj|AK129885.1| Homo sapiens cDNA FLJ26375 fis, clone HRT06292, highly similar
to Heat shock cognate 71 kDa protein
Length=2261
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 54
>dbj|AP000926.6| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:RP11-762B21, complete
sequence
Length=196972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40043 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 39994
>dbj|AK222628.1| Homo sapiens mRNA for heat shock 70kDa protein 8 isoform 2 variant,
clone: CBL04813
Length=1812
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2 TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTACCTTCGTTATTGG 51
>emb|Y00371.1| Human hsc70 gene for 71 kd heat shock cognate protein
Length=5408
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 48/51 (94%), Gaps = 3/51 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGAACTCGC-CTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 50
||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 TTGAACT-GCGCTGCAGCTCTT-GGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGG 285
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
11 11 122930877 122931301 99M324N1M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
11 11 122930880 122931304 96M324N4M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTC
11 11 122930914 122931338 62M324N38M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTG
11 11 122930919 122931343 57M324N43M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGA
11 11 122930928 122931352 48M324N52M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCGTCTTTGTCAGAACCATAGAA
11 11 122930931 122931355 45M324N55M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAGCCATAGAAGAC
11 11 122930949 122931373 27M324N73M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTACCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAG
11 11 122930968 122932835 8M324N88M122932840F4m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC TCGA
11 11 122931008 122931108 100M AAATGTAAATTACTGTGTAAT
11 11 122931015 122931115 100M AAATGTAAATTACTGTGTAATTGTCAAG
11 11 122931022 122931122 100M AAATGTAAATTACTGTGTAATTGTCAAGATTCACT
11 11 122931035 122931135 100M AAATGTAAATTACTGTGTAATTGTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTT
11 11 122931043 122931143 100M AAATGTAAATTACTGTGTAATTGTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACC
11 11 122931052 122931152 100M AAATGTAAATTACTGTGTAATTGTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCT
11 11 122931056 122931156 100M AAATGTAAATTACTGTGTAATTGTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAG
11 11 122931061 122931161 100M AAATGTAAATTACTGTGTAATTGTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCT
11 11 122931067 122931167 100M AAATGTAAATTACTGTGTAATTGTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCA
11 11 122931078 122931178 100M AAATGTAAATTACTGTGTAATTGTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCAC
11 11 122931088 122931188 100M AATGTAAATTACTGTGTAATTGTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCACGTGGTCTTAA
11 11 122931115 122931215 100M ATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCC
11 11 122931124 122931224 100M TTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCC
11 11 122931132 122931232 100M GTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCA
11 11 122931143 122931243 100M CATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGG
11 11 122931167 122931267 100M CTGTTGGGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGGAGTCATCGGGCTTTTAACTACTCC
11 11 122931173 122931273 100M GGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGGAGGCATCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATG
11 11 122931181 122931281 100M GTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGGAGTCATCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCAT
11 11 122931198 122931298 100M AGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGGAGTCATCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTC
11 11 122931220 122931320 100M CGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGGAGTCATCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTG
11 11 122931227 122931327 100M TGCCAGTGCCCCCGGGAGTCATCTGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTC
11 11 122931230 122931330 100M CAGTGCCCCCGGGAGTCATCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTT
11 11 122931248 122931348 100M TCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCAT
11 11 122931253 122931353 100M CTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAG
11 11 122931257 122931357 100M TAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACAC
11 11 122931260 122931360 100M CTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTC
11 11 122931277 122931377 100M CCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTT
11 11 122931284 122931384 100M GAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTC
11 11 122931288 122931388 100M AACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC
11 11 122931300 122932827 88M122932840F12m CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC TTGAACTCGCCT
11 11 122931310 122932817 78M122932840F22m TAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTG
11 11 122931343 122932784 45M122932840F55m ACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCA TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCA
11 11 122931343 122932784 45M122932840F55m ACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCA
11 11 122931343 122932784 45M122932840F55m ACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCA
11 11 122931343 122932784 45M122932840F55m ACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC TTGAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCA
11 11 122932837 122932003 67m734n33m GAACTCGCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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11 11 122932828 122931994 58m734n42m TGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 11 122932825 122931991 55m734n45m AGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACCCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 11 122932822 122931988 48m734n52m TCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGCCTACACC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188247, whole genome shotgun sequence
gb|DS486159.1| Homo sapiens SCAF_1103279188247 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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shotgun sequence
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 12291849 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 12291895
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 954038 CTCTGGATAGAAGATTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 953989
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shotgun sequence
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Sbjct 8988213 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 8988167
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shotgun sequence
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Sbjct 447358 CTCTGGATAGAAGATTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 447407
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Sbjct 10201627 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 10201581
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sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 10730661 CTCTGGATAGAAGATTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 10730710
>ref|NW_001839003.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188377, whole genome shotgun sequence
gb|DS486029.1| Homo sapiens SCAF_1103279188377 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 4192100 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 4192054
>ref|NW_001842393.1| Homo sapiens chromosome X genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188363, whole genome shotgun sequence
gb|DS486305.1| Homo sapiens SCAF_1103279188363 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 447358 CTCTGGATAGAAGATTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 447407
>gb|CH471073.1| Homo sapiens 211000035839577 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 47
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Sbjct 3637382 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 3637336
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 47
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Sbjct 10348875 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 10348829
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 47
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Sbjct 10545046 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 10545000
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Length=153561227
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 47
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Sbjct 10466517 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 10466471
>ref|NC_000003.12| Homo sapiens chromosome 3, GRCh38 Primary Assembly
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
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Sbjct 137880651 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 137880603
>ref|NT_005612.17| Homo sapiens chromosome 3 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR3_CTG2_1
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assembly
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Sbjct 44175077 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 44175029
>ref|NC_018914.2| Homo sapiens chromosome 3, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001611.2| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 137563392 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 137563344
>ref|NW_004929311.1| Homo sapiens chromosome 3 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150095.1| Homo sapiens chromosome 3 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 44004833 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 44004785
>gb|KE141177.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold75, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 7836227 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 7836179
>gb|CM000493.1| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 134974727 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 134974679
>gb|GL583057.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_77, whole genome
shotgun sequence
Length=10404037
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
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Sbjct 8997881 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 8997929
>gb|DS990653.1| Homo sapiens SCAF_1112675837330 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
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Sbjct 56453732 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 56453780
>gb|CH003450.1| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
Length=196156484
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
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Sbjct 135416731 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 135416683
>ref|NW_001838884.2| Homo sapiens chromosome 3 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188385, whole genome shotgun sequence
gb|DS486015.1| Homo sapiens SCAF_1103279188385 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
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Sbjct 56454614 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 56454662
>gb|CH471052.2| Homo sapiens 211000035835664 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
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Sbjct 44209822 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 44209774
>ref|AC_000135.1| Homo sapiens chromosome 3, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000464.1| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
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Sbjct 134974417 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 134974369
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
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Sbjct 136024152 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 136024104
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gb|CM000663.2| Homo sapiens chromosome 1, GRCh38 reference primary assembly
Length=248956422
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 247230291 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 247230242
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HSCHR1_CTG32_1
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assembly
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 23621356 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 23621307
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genome shotgun sequence
gb|CM001609.2| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 248665848 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 248665799
>ref|NW_004929294.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150078.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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shotgun sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 1301953 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 1302002
>gb|CM000491.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 217786443 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 217786394
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shotgun sequence
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Sbjct 138531 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 138482
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shotgun sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 594127 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 594078
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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sequence
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>ref|NW_001838554.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188199, whole genome shotgun sequence
gb|DS486252.1| Homo sapiens SCAF_1103279188199 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 594048 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 593999
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 217787391 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 217787342
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC
>ref|NC_000011.10| Homo sapiens chromosome 11, GRCh38 Primary Assembly
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Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 123062124 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 123062075
>ref|NT_033899.9| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR11_CTG8
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assembly
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 35059228 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 35059179
>ref|NC_018922.2| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 122818824 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 122818775
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150165.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 26498253 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 26498204
>gb|GL583038.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_58, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 1049117 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 1049068
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Length=130894309
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 118873959 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 118873910
>gb|DS990767.1| Homo sapiens SCAF_1112675837137 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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>gb|CH003506.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Length=131853179
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Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 119583705 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 119583656
>gb|CH471065.1| Homo sapiens 211000035833829 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=44976370
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32961061 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 32961012
>ref|NW_001838043.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188192, whole genome shotgun sequence
gb|DS486129.1| Homo sapiens SCAF_1103279188192 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5927939
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 3740137 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 3740186
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130895506
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Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 118874911 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 118874862
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=132164248
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Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 120092161 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 120092112
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG
>ref|XR_747969.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana heat shock cognate 71 kDa
protein pseudogene (LOC104662293), misc_RNA
Length=2167
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 357 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 308
>ref|XM_003313393.3| PREDICTED: Pan troglodytes heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8),
mRNA
Length=2455
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 623 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 574
>ref|XM_009247182.1| PREDICTED: Pongo abelii heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC103891930), mRNA
Length=1622
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 164 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 115
>ref|XM_009247181.1| PREDICTED: Pongo abelii heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript
variant X2, mRNA
Length=2187
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 357 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 308
>ref|XM_009247180.1| PREDICTED: Pongo abelii heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript
variant X1, mRNA
Length=2460
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 630 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 581
>ref|XR_609502.1| PREDICTED: Pan paniscus heat shock cognate 71 kDa protein pseudogene
(LOC100968349), misc_RNA
Length=2276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 386
>ref|XM_008973388.1| PREDICTED: Pan paniscus heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), mRNA
Length=2460
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 628 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 579
>gb|KJ905785.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15455 HSPA8
gene, encodes complete protein
Length=2070
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 367
>gb|KJ901499.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_10893 HSPA8
gene, encodes complete protein
Length=1890
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 187
>gb|KJ897016.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06410 HSPA8
gene, encodes complete protein
Length=2070
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 367
>ref|NM_001132311.2| Pongo abelii heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), mRNA
Length=2361
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 422
>ref|XM_006718831.1| PREDICTED: Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript
variant X1, mRNA
Length=2191
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 310
>gb|FJ224294.1| Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 72p
(HEL-S-72p) mRNA, complete cds
Length=2276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 380
>ref|NM_153201.3| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
2, mRNA
Length=2014
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 628 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 579
>ref|NM_006597.5| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
1, mRNA
Length=2473
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 628 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 579
>ref|XR_180352.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC101177741), misc_RNA
Length=1889
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 417 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 368
>ref|XR_180216.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC100585080), misc_RNA
Length=2260
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 365 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 316
>ref|XM_004052309.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 70kDa protein 8,
transcript variant 2 (HSPA8), mRNA
Length=2004
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 628 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 579
>ref|XM_004052308.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 70kDa protein 8,
transcript variant 1 (HSPA8), mRNA
Length=2476
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 628 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 579
>dbj|AK305352.1| Pan troglodytes mRNA for heat shock cognate 71 kDa protein, complete
cds, clone: PtsC-51-5_G07
Length=2304
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 461 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 412
>ref|NG_029473.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), RefSeqGene on
chromosome 11
Length=11645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 6484 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 6435
>ref|XR_013267.2| PREDICTED: Macaca mulatta heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC709412), miscRNA
Length=2188
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 390 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 341
>dbj|AB527307.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5306, Homo sapiens HSPA8
gene for heat shock 70kDa protein 8, without stop codon, in
Flexi system
Length=1955
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 360 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 311
>dbj|AK300404.1| Homo sapiens cDNA FLJ59163 complete cds, highly similar to Heat
shock cognate 71 kDa protein
Length=1017
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 502 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 453
>dbj|AK310467.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17509
Length=1509
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 500 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 451
>gb|DQ894325.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008785; FLH169716.01L;
RZPDo839F0595D heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8)
gene, encodes complete protein
Length=1981
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 373 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 324
>gb|DQ891145.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003775; FLH169720.01X; RZPDo839F0596D
heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8) gene, encodes
complete protein
Length=1981
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 373 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 324
>gb|BC042163.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4862437),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=2468
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 623 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 574
>gb|BC009338.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4128333, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2741
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 889 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 840
>gb|BC016660.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:9495
IMAGE:3923981), complete cds
gb|EU668349.1| Homo sapiens epididymis luminal protein 33 (HEL-33) mRNA, complete
cds
Length=2259
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 409 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 360
>gb|BC016179.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:17984
IMAGE:3920744), complete cds
Length=2276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 409 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 360
>gb|BC019816.2| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:29929
IMAGE:2899894), complete cds
Length=2250
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 409 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 360
>gb|BC007276.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:3162067),
partial cds
Length=2031
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 176 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 127
>dbj|AK096100.1| Homo sapiens cDNA FLJ38781 fis, clone LIVER2000216, highly similar
to HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
Length=2229
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 354 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 305
>dbj|AB073886.1| Homo sapiens primary neuroblastoma cDNA, clone:Nbla02874, full
insert sequence
Length=2142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 306 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 257
>dbj|AK222785.1| Homo sapiens mRNA for heat shock 70kDa protein 8 isoform 1 variant,
clone: HEP02822
Length=2068
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 426 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 377
>dbj|AK222628.1| Homo sapiens mRNA for heat shock 70kDa protein 8 isoform 2 variant,
clone: CBL04813
Length=1812
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 426 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 377
>emb|CR925990.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459M2220 (from clone DKFZp459M2220)
Length=2297
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 448 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 399
>emb|CR861166.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459P2416 (from clone DKFZp459P2416)
Length=2324
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 476 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 427
>emb|CR860584.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L1519 (from clone DKFZp459L1519)
Length=2041
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 201 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 152
>emb|CR859135.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459D1928 (from clone DKFZp459D1928)
Length=2362
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 472 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 423
>dbj|AK129885.1| Homo sapiens cDNA FLJ26375 fis, clone HRT06292, highly similar
to Heat shock cognate 71 kDa protein
Length=2261
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 428 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 379
>gb|AF352832.1|AF352832 Homo sapiens constitutive heat shock protein 70 (HSC70) mRNA,
complete cds
Length=2085
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 415 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 366
>emb|Y00371.1| Human hsc70 gene for 71 kd heat shock cognate protein
Length=5408
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 1712 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 1663
>dbj|AP000926.6| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:RP11-762B21, complete
sequence
Length=196972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 38564 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 38613
>dbj|AB034951.1| Homo sapiens HSC54 mRNA for heat shock cognate protein 54, complete
cds
Length=1534
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 392 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 343
>ref|XR_166142.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis heat shock cognate
71 kDa protein pseudogene (LOC101041123), misc_RNA
Length=1931
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 303
>ref|XR_174252.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock cognate 71 kDa
protein-like (LOC101142964), misc_RNA
Length=2183
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 309
>ref|XR_170812.2| PREDICTED: Pan troglodytes heat shock cognate 71 kDa protein
pseudogene (LOC465840), misc_RNA
Length=1999
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 368 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 321
>ref|NG_001144.5| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 pseudogene 1 (HSPA8P1)
on chromosome X
Length=2450
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 529 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 482
>ref|XR_012732.2| PREDICTED: Macaca mulatta heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC708240), miscRNA
Length=1863
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 279 CTCTGGATAGAAGCNTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 230
>ref|XR_014314.2| PREDICTED: Macaca mulatta heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC716667), miscRNA
Length=1926
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 CTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 305
>gb|AC192393.1| Pan troglodytes BAC clone CH251-66L11 from chromosome x, complete
sequence
Length=150989
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61274 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 61321
>emb|Y00481.1| Homo sapiens Hsc 70 pseudogene
Length=2186
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 311
>gb|AC002377.1|AC002377 Human PAC clone RP1-222H5 from Xq25-q26, complete sequence
Length=141779
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 121139 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 121186
>gb|M12119.1|HUMDMHSP Human DNA region with homology to D.melanogaster heat shock protein
(hsp70) genes
Length=2851
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 688
>ref|XM_010356455.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana heat shock 70kDa protein 8
(HSPA8), mRNA
Length=2423
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 580 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTATATTCTACTTGGACCTTGG 531
>ref|XR_020917.4| PREDICTED: Pan troglodytes heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC741801), misc_RNA
Length=2198
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 CTCTGGATAGAAGATTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 313
>ref|XR_169759.2| PREDICTED: Pan troglodytes heat shock cognate 71 kDa protein
pseudogene (LOC472599), misc_RNA
Length=2256
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 373
>ref|XM_003919027.2| PREDICTED: Papio anubis heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC101021277), mRNA
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(LOC100981595), misc_RNA
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mRNA
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(LOC100410607), misc_RNA
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pseudogene (LOC100390045), misc_RNA
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Sbjct 623 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTATATTCTACTTGGACCTTGG 574
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 623 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTATATTCTACTTGGACCTTGG 574
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(HSPA8), mRNA
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Sbjct 382 CTCTGGATAGAAACTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 333
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on chromosome X
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Sbjct 529 CTCTGGATAGAAGATTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 480
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variant X1, mRNA
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Sbjct 460 CTCTGGATAGAAACTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 411
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variant X2, mRNA
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Sbjct 378 CTCTGGATAGAAACTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 329
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 623 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTATATTCTACTTGGACCTTGG 574
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 427 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTATATTCTACTTGGACCTTGG 378
>ref|XM_005579976.1| PREDICTED: Macaca fascicularis heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 623 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTATATTCTACTTGGACCTTGG 574
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(LOC101602058), misc_RNA
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Sbjct 391 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 342
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 353 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 304
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 356 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 307
>ref|XM_004667344.1| PREDICTED: Jaculus jaculus heat shock 70kDa protein 8 (Hspa8),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 356 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 307
>ref|XR_120787.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC100587762), misc_RNA
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Sbjct 451 CTCTGGACAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 402
>ref|XR_175017.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 70kDa protein 8
pseudogene (LOC101154214), misc_RNA
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Sbjct 422 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 376
>ref|NM_001261657.2| Macaca mulatta heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), mRNA
Length=2267
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Sbjct 432 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTATATTCTACTTGGACCTTGG 383
>emb|AL590097.17| Human DNA sequence from clone RP11-117C7 on chromosome X, complete
sequence
Length=179438
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Sbjct 122839 CTCTGGATAGAAGATTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 122790
>ref|XM_002799869.1| PREDICTED: Macaca mulatta putative uncharacterized protein YAL004W-like
(LOC100423663), mRNA
Length=427
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Sbjct 61 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTATATTCTACTTGGACCTTGG 110
>ref|NG_005513.3| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 pseudogene 8 (HSPA8P8)
on chromosome 7
Length=2465
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Sbjct 528 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 482
>ref|NG_012082.1| Homo sapiens 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2C, G protein-coupled
(HTR2C), RefSeqGene on chromosome X
Length=333074
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Sbjct 197434 CTCTGGATAGAAGATTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 197483
>gb|AC200274.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-415L2 from chromosome 14, complete
sequence
Length=169556
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Sbjct 156648 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTATATTCTACTTGGACCTTGG 156697
>gb|AC217031.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-543K23 from chromosome 7, complete
sequence
Length=204437
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Sbjct 115557 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 115511
>gb|AC196249.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-316O8 from chromosome x, complete
sequence
Length=162970
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 70306 CTCTGGATAGAAGATTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 70257
>gb|AC009945.2| Homo sapiens BAC clone CTD-2060L22 from 7, complete sequence
Length=75517
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Sbjct 47282 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 47328
>gb|BC002644.2| Homo sapiens hypothetical protein MGC4859 similar to HSPA8, mRNA
(cDNA clone IMAGE:3605453), partial cds
Length=3142
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 47
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Sbjct 1275 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCT 1321
>gb|AF142571.1|AF142571 Saguinus oedipus intracellular vitamin D binding protein 1 (IDBP1)
mRNA, complete cds
Length=2260
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 419 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 370
>gb|AC004822.1| Homo sapiens PAC clone RP1-170D19 from Xq23, complete sequence
Length=127824
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20070 CTCTGGATAGAAGATTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 20021
>emb|X73685.1| C.aethiops hsp70 mRNA
Length=2177
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 352 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTATATTCTACTTGGACCTTGG 303
>ref|XR_642122.1| PREDICTED: Papio anubis heat shock cognate 71 kDa protein pseudogene
(LOC101014296), misc_RNA
Length=1933
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 CTCTGGATAGAAGCTTT-GGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 302
>ref|XR_160244.2| PREDICTED: Papio anubis heat shock cognate 71 kDa protein pseudogene
(LOC101012676), misc_RNA
Length=2123
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 CTCTGGATAGAAGCTTT-GGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 301
>ref|XR_177253.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 70kDa protein 8
pseudogene (LOC101125842), misc_RNA
Length=2177
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 CTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 304
>ref|NG_022275.2| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 pseudogene 9 (HSPA8P9)
on chromosome 3
Length=1683
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 494
>gb|AC117478.3| Homo sapiens 3 BAC RP11-598P12 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=77155
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 49
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14357 CTCTGGATAGAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG 14405
>ref|XR_010499.2| PREDICTED: Macaca mulatta heat shock cognate 71 kDa protein-like
(HSPA8), miscRNA
Length=2189
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 304
>ref|XR_167358.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis heat shock cognate
71 kDa protein pseudogene (LOC101036472), misc_RNA
Length=1942
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 305
>ref|XM_003923578.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis heat shock 70kDa protein
8 (HSPA8), mRNA
Length=2455
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 625 CTCTGGATAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 576
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protein pseudogene (LOC104654620), misc_RNA
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Sbjct 423 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTAGTCTACTTGGATCTTGG 374
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(LOC101003304), misc_RNA
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Sbjct 351 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTGTTCCACTTGGACCTTGG 302
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 451 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 402
>ref|XM_008689947.1| PREDICTED: Ursus maritimus heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 459 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 410
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mRNA
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Sbjct 461 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 412
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(LOC103230925), mRNA
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Sbjct 483 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 434
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protein-like (LOC102739252), mRNA
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Sbjct 421 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 372
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protein-like (LOC102731213), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 420 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 371
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protein-like (LOC102731213), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 420 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 371
>ref|XM_004802926.1| PREDICTED: Mustela putorius furo heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC101675035), mRNA
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Sbjct 358 CTCTGGATAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 309
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mRNA
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Sbjct 466 CTCTGGATAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 417
>ref|XM_004737424.1| PREDICTED: Mustela putorius furo heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC101675035), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 351 CTCTGGATAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 302
>ref|XM_004737423.1| PREDICTED: Mustela putorius furo heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC101675035), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 351 CTCTGGATAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 302
>ref|XR_187353.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens heat shock cognate 71
kDa protein-like (LOC101380755), misc_RNA
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Sbjct 495 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 446
>ref|XM_003253302.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys heat shock 70kDa protein 8, transcript
variant 1 (HSPA8), mRNA
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Sbjct 567 CTCTGGATAAAAGCTTTTAGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 518
>ref|XR_173822.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 70kDa protein 8
pseudogene (LOC101153302), misc_RNA
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Sbjct 351 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 302
>ref|NM_001081778.2| Equus caballus heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), mRNA
Length=2249
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Sbjct 425 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 376
>ref|NG_022834.2| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 pseudogene (LOC343165)
on chromosome 1
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Sbjct 540 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 491
>ref|XM_003253303.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys heat shock 70kDa protein 8, transcript
variant 2 (HSPA8), mRNA
Length=1942
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Sbjct 567 CTCTGGATAAAAGCTTTTAGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 518
>ref|XR_014663.2| PREDICTED: Macaca mulatta heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC721841), miscRNA
Length=1476
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 351 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTGTTCCACTTGGACCTTGG 302
>gb|EU588986.1| Mirounga leonina heat shock cognate protein 70 mRNA, partial
cds
Length=533
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Sbjct 249 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 200
>dbj|AB292109.1| Equus caballus HSPA8 mRNA for heat shock 70kDa protein 8, complete
cds
Length=2250
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 426 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 377
>emb|AL390728.37| Human DNA sequence from clone RP11-488L18 on chromosome 1, complete
sequence
Length=123668
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 120402 CTCTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCCACTTGGACCTTGG 120353
>gb|U13889.1|MVU13889 Mustela vison heat shock cognate 70 mRNA, partial cds
Length=288
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Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 121 CTCTGGATAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 72
>ref|XR_434502.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii heat shock 70kDa protein 8
pseudogene (LOC102729059), misc_RNA
Length=2188
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 2 TCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 350 TCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 302
>ref|XR_329690.1| PREDICTED: Myotis lucifugus heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC102440238), misc_RNA
Length=1988
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 398 TCTGGATAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 350
>ref|XM_005883148.1| PREDICTED: Myotis brandtii heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC102263698), mRNA
Length=1401
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
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Sbjct 290 TCTGGATAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 242
>ref|XR_642146.1| PREDICTED: Papio anubis heat shock cognate 71 kDa protein pseudogene
(LOC101016199), misc_RNA
Length=1940
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTC-TGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 CTCTTGGGTAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 304
>ref|XM_004413538.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens heat shock 70kDa protein
8, transcript variant 2 (HSPA8), mRNA
Length=2389
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 514
>ref|XM_004413537.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens heat shock 70kDa protein
8, transcript variant 1 (HSPA8), mRNA
Length=2413
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 561 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 514
>ref|XR_186779.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens heat shock cognate 71
kDa protein-like (LOC101365574), misc_RNA
Length=1992
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 426 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 379
>dbj|AK397952.1| Sus scrofa mRNA, clone: TCH010039B01, expressed in trachea
Length=2266
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 423 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 376
>dbj|AK399549.1| Sus scrofa mRNA, clone: DCI010031A03, expressed in dendritic
cells (immature)
Length=2273
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 426 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 379
>dbj|AK399450.1| Sus scrofa mRNA, clone: AMP010057F01, expressed in alveolar macrophage
Length=2261
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 427 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 380
>dbj|AK397124.1| Sus scrofa mRNA, clone: PTG010095E12, expressed in pituitary
gland
Length=2040
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 200 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 153
>dbj|AK392423.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10072H03, expressed in hypothalamus
Length=2310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 430 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 383
>dbj|AK392393.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10070D12, expressed in hypothalamus
Length=2257
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 430 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 383
>dbj|AK392234.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10059B08, expressed in hypothalamus
Length=2317
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 428 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 381
>dbj|AK392041.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10046C06, expressed in hypothalamus
Length=2323
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 429 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 382
>dbj|AK391930.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10034E07, expressed in hypothalamus
Length=2250
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 424 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 377
>dbj|AK391768.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10021C11, expressed in hypothalamus
Length=2255
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 431 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 384
>dbj|AK391436.1| Sus scrofa mRNA, clone: DCI010078G12, expressed in dendritic
cells (immature)
Length=2306
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 457 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 410
>dbj|AK391307.1| Sus scrofa mRNA, clone: DCI010035C10, expressed in dendritic
cells (immature)
Length=2270
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 426 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 379
>dbj|AK233535.1| Sus scrofa mRNA, clone:LVRM10169A12, expressed in liver
Length=2259
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 422 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 375
>ref|NM_001243907.1| Sus scrofa heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), mRNA
dbj|AK239554.1| Sus scrofa mRNA, clone:THY010112C08, expressed in thymus
Length=2264
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 426 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 379
>dbj|AK231144.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010100E02, expressed in alveolar macrophage
Length=2260
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 366
>dbj|AK230909.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010062G01, expressed in alveolar macrophage
Length=2273
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 48
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Sbjct 426 CTCTGGATAGAAACTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTT 379
>ref|XM_006105426.1| PREDICTED: Myotis lucifugus heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC102426882), transcript variant X4, mRNA
Length=1752
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 TCTGGGTAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 337
>ref|XM_006105425.1| PREDICTED: Myotis lucifugus heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC102426882), transcript variant X3, mRNA
Length=2206
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 TCTGGGTAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 335
>ref|XM_006105424.1| PREDICTED: Myotis lucifugus heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC102426882), transcript variant X2, mRNA
Length=2215
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 TCTGGGTAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 335
>ref|XM_006105423.1| PREDICTED: Myotis lucifugus heat shock cognate 71 kDa protein-like
(LOC102426882), transcript variant X1, mRNA
Length=2209
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 TCTGGGTAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 335
>ref|XM_005883130.1| PREDICTED: Myotis brandtii heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8),
mRNA
Length=2199
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 50
||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 TCTGGGTAAAAGCTTTTTGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG 335
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC
>ref|NM_153201.3| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
2, mRNA
Length=2014
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 212 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 261
>ref|NM_006597.5| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), transcript variant
1, mRNA
Length=2473
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 212 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 261
>ref|NG_029473.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8 (HSPA8), RefSeqGene on
chromosome 11
Length=11645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 5013 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 5062
>dbj|AK303935.1| Homo sapiens cDNA FLJ55485 complete cds, highly similar to Heat
shock cognate 71 kDa protein
Length=1846
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 13 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 62
>dbj|AK310467.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17509
Length=1509
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 84 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 133
>dbj|AK096100.1| Homo sapiens cDNA FLJ38781 fis, clone LIVER2000216, highly similar
to HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
Length=2229
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 13 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 62
>dbj|AK222785.1| Homo sapiens mRNA for heat shock 70kDa protein 8 isoform 1 variant,
clone: HEP02822
Length=2068
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 10 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 59
>dbj|AK129885.1| Homo sapiens cDNA FLJ26375 fis, clone HRT06292, highly similar
to Heat shock cognate 71 kDa protein
Length=2261
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 13 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 62
>dbj|AP000926.6| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:RP11-762B21, complete
sequence
Length=196972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 40035 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 39986
>dbj|AK222628.1| Homo sapiens mRNA for heat shock 70kDa protein 8 isoform 2 variant,
clone: CBL04813
Length=1812
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 10 GCCTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTACCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 59
>gb|AF352832.1|AF352832 Homo sapiens constitutive heat shock protein 70 (HSC70) mRNA,
complete cds
Length=2085
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 TGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 2 TGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 48
>emb|Y00371.1| Human hsc70 gene for 71 kd heat shock cognate protein
Length=5408
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTGCAGCTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 247 CTGCAGCTCTT-GGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 293
>gb|BC016660.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:9495
IMAGE:3923981), complete cds
gb|EU668349.1| Homo sapiens epididymis luminal protein 33 (HEL-33) mRNA, complete
cds
Length=2259
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 9 CTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
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Sbjct 1 CTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 42
>gb|BC016179.1| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:17984
IMAGE:3920744), complete cds
Length=2276
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 9 CTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 42
>gb|BC019816.2| Homo sapiens heat shock 70kDa protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:29929
IMAGE:2899894), complete cds
Length=2250
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 9 CTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCTTGGGTTTTTTGTGGCTTCCTTCGTTATTGGAGCCAGGC 42
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
11 11 122930877 122931301 99M324N1M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
11 11 122930880 122931304 96M324N4M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTC
11 11 122930914 122931338 62M324N38M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTG
11 11 122930919 122931343 57M324N43M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGA
11 11 122930928 122931352 48M324N52M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCGTCTTTGTCAGAACCATAGAA
11 11 122930931 122931355 45M324N55M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAGCCATAGAAGAC
11 11 122930949 122931373 27M324N73M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTACCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAG
11 11 122930974 122931398 2M324N98M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTA
11 11 122931015 122931115 100M GTCAAG
11 11 122931022 122931122 100M GTCAAGATTCACT
11 11 122931035 122931135 100M GTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTT
11 11 122931043 122931143 100M GTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACC
11 11 122931052 122931152 100M GTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCT
11 11 122931056 122931156 100M GTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAG
11 11 122931061 122931161 100M GTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCT
11 11 122931067 122931167 100M GTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCA
11 11 122931078 122931178 100M GTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCAC
11 11 122931088 122931188 100M GTCAAGATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCACGTGGTCTTAA
11 11 122931115 122931215 100M ATTCACTGGTTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCC
11 11 122931124 122931224 100M TTTCTGGTGTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCC
11 11 122931132 122931232 100M GTTGACAGACCCATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCA
11 11 122931143 122931243 100M CATCTACCTAGAGAGCCTAGGGCACTGTTGGGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGG
11 11 122931167 122931267 100M CTGTTGGGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGGAGTCATCGGGCTTTTAACTACTCC
11 11 122931173 122931273 100M GGCACGTGGTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGGAGGCATCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATG
11 11 122931181 122931281 100M GTCTTAACCCTGAGCTGAGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGGAGTCATCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCAT
11 11 122931198 122931298 100M AGCCCCATCTGTTCCCCTCCCTCGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGGAGTCATCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTC
11 11 122931220 122931320 100M CGCCAGGTGCCAGTGCCCCCGGGAGTCATCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTG
11 11 122931227 122931327 100M TGCCAGTGCCCCCGGGAGTCATCTGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTC
11 11 122931230 122931330 100M CAGTGCCCCCGGGAGTCATCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTT
11 11 122931248 122931348 100M TCGGGCTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCAT
11 11 122931253 122931353 100M CTTTTAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAG
11 11 122931257 122931357 100M TAACTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACAC
11 11 122931260 122931360 100M CTACTCCGGAATGCACCCCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTC
11 11 122931277 122931377 100M CCATACTGAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTT
11 11 122931284 122931384 100M GAAAAACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTC
11 11 122931288 122931388 100M AACCAACCTCACCTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCC
11 11 122931300 122931400 100M CTTCCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACT
11 11 122931303 122931403 100M CCCAAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGG
11 11 122931306 122931406 100M AAGGTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTATCTCCATTGTATTCTACTTGGACC
11 11 122931309 122931409 100M GTAGGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTG
11 11 122931312 122931412 100M GGCTTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGGGC
11 11 122931315 122931415 100M TTCTGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGGGCCTG
11 11 122931318 122931418 100M TGCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGGGCCTGCCA
11 11 122931319 122932822 91M122932832F9m GCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG GCCTGCAGC
11 11 122931319 122932822 91M122932832F9m GCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG GCCTGCAGC
11 11 122931319 122932822 91M122932832F9m GCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG GCCTGCAGC
11 11 122931319 122932822 91M122932832F9m GCAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG GCCTGCAGC
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11 11 122931320 122932821 90M122932832F10m CAATTTCCTTCATCTTTGTCAGAACCATAGAAGACACCTCCTCTGGATAGAAGCTTTTGGTCTCTCCCTTGTATTCTACTTGGACCTTGG GCCTGCAGCT
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188192, whole genome shotgun sequence
gb|DS486129.1| Homo sapiens SCAF_1103279188192 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 1937154 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 1937105
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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blast search - nt
left flanking sequence - CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG
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receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 103 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 54
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3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 103 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 54
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X7,
mRNA
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Sbjct 4526 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 4477
>ref|XM_008021352.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X6,
mRNA
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Sbjct 4525 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 4476
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X5,
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>ref|XM_008021350.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X4,
mRNA
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Sbjct 4526 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 4477
>ref|XM_008021349.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X3,
mRNA
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Sbjct 4527 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 4478
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X2,
mRNA
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Sbjct 4530 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 4481
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X1,
mRNA
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Sbjct 4529 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 4480
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X2,
mRNA
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Sbjct 86 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 37
>ref|XM_004052351.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla roundabout, axon guidance
receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Query 1 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 50
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Sbjct 102 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 53
>ref|XM_001106913.2| PREDICTED: Macaca mulatta roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 64 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 15
>ref|NG_016214.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), RefSeqGene on chromosome 11
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Query 1 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 50
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Sbjct 5086 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 5037
>ref|NM_022370.3| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), mRNA
Length=4554
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Query 1 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 50
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Sbjct 86 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 37
>gb|AC195101.6| Rhesus Macaque BAC CH250-420G14 () complete sequence
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Query 1 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 50
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Sbjct 149721 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 149770
>gb|AY509035.1| Homo sapiens roundabout-like protein 3 (ROBO3) mRNA, complete
cds
Length=4569
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Query 1 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 50
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Sbjct 109 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 60
>dbj|AK056544.1| Homo sapiens cDNA FLJ31982 fis, clone NT2RP7008550, highly similar
to Mus musculus rig-1 protein mRNA
Length=3384
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Query 1 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 50
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Sbjct 86 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 37
>dbj|AP003501.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11q, clone:RP11-664I21,
complete sequence
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Query 1 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 50
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Sbjct 574 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 525
>dbj|AP000866.4| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11q, clone:RP11-677M14,
complete sequence
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Query 1 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 50
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Sbjct 184111 CTCCACAGCCTCTGCGCGCTGCGGCAGCCACGGTGCCGCTCTCCTGCCGG 184062
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right flanking sequence - GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG
>ref|XM_010597177.1| PREDICTED: Loxodonta africana roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 63 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 112
>ref|XM_010384622.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana roundabout, axon guidance
receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 249 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 298
>ref|XM_003313406.3| PREDICTED: Pan troglodytes roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 160 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 209
>ref|XM_009187572.1| PREDICTED: Papio anubis roundabout, axon guidance receptor, homolog
3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 160 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 209
>ref|XM_003819932.2| PREDICTED: Pan paniscus roundabout, axon guidance receptor, homolog
3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X7,
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X6,
mRNA
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Sbjct 4671 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 4720
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X5,
mRNA
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X4,
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X1,
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Sbjct 4675 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 4724
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receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 248 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 297
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(ROBO3), RefSeqGene on chromosome 11
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Sbjct 5232 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 5281
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(ROBO3), mRNA
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Sbjct 232 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 281
>dbj|AK291045.1| Homo sapiens cDNA FLJ76806 complete cds, highly similar to Homo
sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), mRNA
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Sbjct 166 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 215
>gb|BC148593.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100015636, MGC:183138
roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3) mRNA, encodes complete protein
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Sbjct 97 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 146
>gb|AY509035.1| Homo sapiens roundabout-like protein 3 (ROBO3) mRNA, complete
cds
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Sbjct 255 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 304
>dbj|AK056544.1| Homo sapiens cDNA FLJ31982 fis, clone NT2RP7008550, highly similar
to Mus musculus rig-1 protein mRNA
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Sbjct 232 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 281
>dbj|AP003501.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11q, clone:RP11-664I21,
complete sequence
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Query 1 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 50
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Sbjct 720 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 769
>dbj|AP000866.4| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11q, clone:RP11-677M14,
complete sequence
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Query 1 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 50
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Sbjct 184257 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 184306
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Query 2 GACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTG 49
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Sbjct 64 GACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTG 111
>ref|XM_009247199.1| PREDICTED: Pongo abelii roundabout, axon guidance receptor, homolog
3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 50
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Sbjct 249 GGACACCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 298
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receptor, homolog 3 (Drosophila) (Robo3), mRNA
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Sbjct 63 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTCGGCTTCAACTCCTCGCTGG 112
>ref|XM_003923553.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis roundabout, axon guidance
receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTC 45
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Sbjct 399 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTC 443
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receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTC 45
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Sbjct 399 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTC 443
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homolog 3 (Drosophila) (Robo3), mRNA
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Query 1 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 50
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Sbjct 360 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTCAGCTTCAACTCCTCGCTGG 409
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homolog 3 (Drosophila) (Robo3), mRNA
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Query 1 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTCCTCGCTGG 50
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Sbjct 225 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTCGGCTTCAACTCTTCGCTGG 274
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Query 1 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTC 42
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Sbjct 330 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTGGGCTTCAACTC 371
>ref|XM_005378445.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (Robo3), mRNA
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Query 1 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTT-G--GGCTTCAACTCCTCGCTGG 50
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Sbjct 240 GGACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTCGGCGGCTTCAACTCCTCGCTGG 292
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Query 2 GACATCTCCAACTCCAGCGAGCTGCTCTTG---GGCTTCAACTCCTCGCTGG 50
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Query 1 AGGGCCCGTCCCGGGGGGTCTGAACCCCACTGGGGCAGAGATGGCTTACC 50
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Lambda K H
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>gb|DS990767.1| Homo sapiens SCAF_1112675837137 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>gb|CH471065.1| Homo sapiens 211000035833829 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 34776432 TCCCTTTCCTTTGCTGGCCTCTTCAGGCTCTCCGTCCCCAACGCTCACCT 34776481
>ref|NW_001838043.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188192, whole genome shotgun sequence
gb|DS486129.1| Homo sapiens SCAF_1103279188192 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 120689711 TCCCTTTCCTTTGCTGGCCTCTTCAGGCTCTCCGTCCCCAACGCTCACCT 120689760
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blast search - nt
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(ROBO3), RefSeqGene on chromosome 11
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mRNA (cDNA clone IMAGE:5762826), with apparent retained
intron
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Query 1 AGGGCCCGTCCCGGGGGGTCTGAACCCCACTGGGGCAGAGATGGCTTACC 50
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Sbjct 768 AGGGCCCGTCCCGGGGGGTCTGAACCCCACTGGGGCAGAGATGGCTTACC 719
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complete sequence
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Query 1 AGGGCCCGTCCCGGGGGGTCTGAACCCCACTGGGGCAGAGATGGCTTACC 50
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Lambda K H
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right flanking sequence - TCCCTTTCCTTTGCTGGCCTCTTCAGGCTCTCCGTCCCCAACGCTCACCT
>ref|NG_016214.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), RefSeqGene on chromosome 11
Length=23066
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Sbjct 17049 TCCCTTTCCTTTGCTGGCCTCTTCAGGCTCTCCGTCCCCAACGCTCACCT 17098
>gb|BC008623.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila),
mRNA (cDNA clone IMAGE:4177689), complete cds
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Sbjct 70 TCCCTTTCCTTTGCTGGCCTCTTCAGGCTCTCCGTCCCCAACGCTCACCT 119
>gb|BC113744.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila),
mRNA (cDNA clone IMAGE:5762826), with apparent retained
intron
Length=3296
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TCCCTTTCCTTTGCTGGCCTCTTCAGGCTCTCCGTCCCCAACGCTCACCT 50
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Sbjct 992 TCCCTTTCCTTTGCTGGCCTCTTCAGGCTCTCCGTCCCCAACGCTCACCT 1041
>dbj|AP003501.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11q, clone:RP11-664I21,
complete sequence
Length=186971
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Query 1 TCCCTTTCCTTTGCTGGCCTCTTCAGGCTCTCCGTCCCCAACGCTCACCT 50
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Sbjct 12537 TCCCTTTCCTTTGCTGGCCTCTTCAGGCTCTCCGTCCCCAACGCTCACCT 12586
>gb|AC195101.6| Rhesus Macaque BAC CH250-420G14 () complete sequence
Length=166439
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Query 1 TCCCTTTCCTTTGCTGGCCTCTTCAGGCTCTCCGTCCCCAACGCTCACCT 50
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Sbjct 137714 TCCCTTTCCTTTGCTGGCCTCTTCAGGCGCTCCGTCCCCAACGCTCACCT 137665
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11 11 124747318 124747218 100m GGTGGTGTTGGGGTGGGAGGTGGCCATGCTCCCTCCACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGG
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11 11 124747312 124747212 100m GTTGGGGTGGGAGGTGGCCATGCTCCCTCCACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAG
11 11 124747309 124747209 100m GGGGTGGGAGGTGGCCATGCTCCCTCCACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGA
11 11 124747306 124747206 100m GTGGGAGGTGGCCATGCTCCCTCCACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATT
11 11 124747303 124747203 100m GGAGGTGGCCATGCTCCCTCCACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACC
11 11 124747300 124747200 100m GGTGGCCATGCTCCCTCCACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGG
11 11 124747297 124747197 100m GGCCATGCTCCCTCCACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAAC
11 11 124747294 124747194 100m CATGCTCCCTCCACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGG
11 11 124747291 124747191 100m GCTCCCTCCACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTC
11 11 124747288 124747188 100m CCCTCCACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAG
11 11 124747285 124747185 100m TCCACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGA
11 11 124747282 124747182 100m ACCTGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGC
11 11 124747279 124747179 100m TGGGGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCT
11 11 124747276 124747176 100m GGCGTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTG
11 11 124747273 124747173 100m GTCAGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTCCCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGT
11 11 124747270 124747170 100m AGCGGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGGGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCG
11 11 124747267 124747167 100m GGGGCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGA
11 11 124747264 124747164 100m GCGGAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGG
11 11 124747261 124747161 100m GAAGAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACA
11 11 124747258 124747158 100m GAAGAGTGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTG
11 11 124747255 124747155 100m GAGTGGACTGTCGGTGGAGGACATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGG
11 11 124747252 124747152 100m TGGCCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAA
11 11 124747249 124747149 100m CCTGTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATG
11 11 124747246 124747146 100m GTCGGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGG
11 11 124747243 124747143 100m GGTGGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGG
11 11 124747240 124747140 100m GGAGGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGA
11 11 124747237 124747137 100m GGTCATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATG
11 11 124747234 124747134 100m CATCCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGT
11 11 124747231 124747131 100m CCTGAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGTGAG
11 11 124747228 124747128 100m GAGGAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGTGAGAGA
11 11 124747225 124747125 100m GAAATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGTGAGAGAAGG
11 11 124747222 124747122 100m ATGGGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGTGAGAGAAGGGCC
11 11 124747219 124747119 100m GGCTAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGTGAGAGAAGGGCCCGT
11 11 124747216 124747116 100m TAAGAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGTGAGAGAAGGGCCCGTCCC
11 11 124747213 124747113 100m GAGAATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGTGAGAGAAGGGCCCGTCCCGGG
11 11 124747210 124747110 100m AATTACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGTGAGAGAAGGGCCCGTCCCGGGGGG
11 11 124747207 124747107 100m TACCTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGTGAGAGAAGGGCCCGTCCCGGGGGGTCT
11 11 124747204 124747103 69m1d31m CTGGAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGDGAGAGAAGGGCCCGTCCCGGGGGGTCTGAAC
11 11 124747201 124747100 66m1d34m GAACTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGDGAGAGAAGGGCCCGTCCCGGGGGGTCTGAACCCC
11 11 124747198 124747098 100m CTGGCTCCAGAGAGGCCCTCTGAGTGCGGGAAGGACACTGGGGAAAATGAGGGGGCGAATGAGTGAGAGAAGGGCCCGTCCCGGGGGGTCTGAACCCCAC
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Sbjct 1924798 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 1924847
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Sbjct 120690250 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 120690201
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Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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HSCHR11_CTG8
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assembly
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 36875414 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 36875463
>ref|NC_018922.2| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001619.2| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 124634316 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 124634365
>ref|NW_004929381.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 28313745 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 28313794
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shotgun sequence
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 31310946 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 31310995
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shotgun sequence
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 2859112 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 2859161
>gb|CM000501.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 120689534 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 120689583
>gb|DS990767.1| Homo sapiens SCAF_1112675837137 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 1924539 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 1924490
>gb|CH003506.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 130768063 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 130768014
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 121396049 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 121396098
>gb|CH471065.1| Homo sapiens 211000035833829 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 34777285 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 34777334
>ref|NW_001838043.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188192, whole genome shotgun sequence
gb|DS486129.1| Homo sapiens SCAF_1103279188192 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 1924484 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 1924435
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130895506
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 120690564 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 120690613
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=132164248
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 121908385 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 121908434
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG
>ref|XM_003313406.3| PREDICTED: Pan troglodytes roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Sbjct 3122 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 3073
>ref|XM_003819932.2| PREDICTED: Pan paniscus roundabout, axon guidance receptor, homolog
3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Sbjct 3232 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 3183
>ref|XM_004052351.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla roundabout, axon guidance
receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
Length=4552
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Sbjct 3231 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 3182
>ref|NG_016214.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), RefSeqGene on chromosome 11
Length=23066
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Sbjct 17588 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 17539
>ref|NM_022370.3| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), mRNA
Length=4554
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Sbjct 3215 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 3166
>dbj|AK298792.1| Homo sapiens cDNA FLJ55947 complete cds, highly similar to Roundabout
homolog 3 precursor
Length=1645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Sbjct 315 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 266
>dbj|AK295475.1| Homo sapiens cDNA FLJ59894 complete cds, moderately similar to
Roundabout homolog 3 precursor
Length=1047
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Sbjct 633 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 584
>dbj|AK291045.1| Homo sapiens cDNA FLJ76806 complete cds, highly similar to Homo
sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), mRNA
Length=4479
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Sbjct 3149 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 3100
>gb|BC148593.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100015636, MGC:183138
roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3) mRNA, encodes complete protein
Length=4222
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3080 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 3031
>dbj|AK225076.1| Homo sapiens mRNA for roundabout, axon guidance receptor, homolog
3 variant, clone: CAE11659
Length=1796
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 403
>gb|BC086878.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila),
mRNA (cDNA clone IMAGE:6500722), with apparent retained
intron
Length=2235
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 841
>gb|BC008623.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila),
mRNA (cDNA clone IMAGE:4177689), complete cds
Length=1532
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Sbjct 331 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 282
>gb|AY509035.1| Homo sapiens roundabout-like protein 3 (ROBO3) mRNA, complete
cds
Length=4569
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3238 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 3189
>gb|BC113744.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila),
mRNA (cDNA clone IMAGE:5762826), with apparent retained
intron
Length=3296
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1531 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 1482
>dbj|AK056544.1| Homo sapiens cDNA FLJ31982 fis, clone NT2RP7008550, highly similar
to Mus musculus rig-1 protein mRNA
Length=3384
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
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Sbjct 3215 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 3166
>dbj|AK024697.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21044 fis, clone CAE11659
Length=1796
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 403
>dbj|AP003501.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11q, clone:RP11-664I21,
complete sequence
Length=186971
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13076 CCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGCTAGATACAGGGAG 13027
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG
>ref|XM_003923553.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis roundabout, axon guidance
receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript
variant X2, mRNA
Length=4635
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 3527 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3576
>ref|XM_010334403.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis roundabout, axon guidance
receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript
variant X1, mRNA
Length=4608
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3527 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3576
>ref|XM_003313406.3| PREDICTED: Pan troglodytes roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
Length=4451
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3270 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3319
>ref|XM_009247199.1| PREDICTED: Pongo abelii roundabout, axon guidance receptor, homolog
3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X1, mRNA
Length=4550
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 3380 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3429
>ref|XM_003819932.2| PREDICTED: Pan paniscus roundabout, axon guidance receptor, homolog
3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
Length=4561
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3380 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3429
>ref|XM_005339528.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus roundabout, axon guidance
receptor, homolog 3 (Drosophila) (Robo3), mRNA
Length=4396
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 3383 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3432
>ref|XM_004052351.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla roundabout, axon guidance
receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
Length=4552
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 3379 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3428
>ref|NG_016214.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), RefSeqGene on chromosome 11
Length=23066
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 17902 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 17951
>ref|NM_022370.3| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), mRNA
Length=4554
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Sbjct 3363 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3412
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homolog 3 precursor
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Sbjct 463 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 512
>dbj|AK295475.1| Homo sapiens cDNA FLJ59894 complete cds, moderately similar to
Roundabout homolog 3 precursor
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>dbj|AK291045.1| Homo sapiens cDNA FLJ76806 complete cds, highly similar to Homo
sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), mRNA
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Sbjct 3297 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3346
>gb|BC148593.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100015636, MGC:183138
roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3) mRNA, encodes complete protein
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Sbjct 3228 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3277
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3 variant, clone: CAE11659
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Sbjct 600 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 649
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mRNA (cDNA clone IMAGE:6500722), with apparent retained
intron
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Sbjct 1038 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 1087
>gb|AY509035.1| Homo sapiens roundabout-like protein 3 (ROBO3) mRNA, complete
cds
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Sbjct 3386 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3435
>gb|BC113744.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila),
mRNA (cDNA clone IMAGE:5762826), with apparent retained
intron
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Sbjct 1679 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 1728
>ref|NM_001131720.1| Pongo abelii roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), mRNA
emb|CR858154.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G0223 (from clone DKFZp468G0223)
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Sbjct 508 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 557
>dbj|AK024697.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21044 fis, clone CAE11659
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Sbjct 600 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 649
>dbj|AP003501.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11q, clone:RP11-664I21,
complete sequence
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homolog 3 (Drosophila) (Robo3), mRNA
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Sbjct 2996 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGAAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3045
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receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 3380 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3429
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 3458 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCTTCTCTGAACTGG 3507
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mRNA
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Sbjct 7779 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 7828
>ref|XM_008021352.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X6,
mRNA
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Sbjct 7802 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 7851
>ref|XM_008021351.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X5,
mRNA
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Sbjct 7817 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 7866
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X4,
mRNA
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Sbjct 7818 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 7867
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X3,
mRNA
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Sbjct 7840 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 7889
>ref|XM_008021348.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X2,
mRNA
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 7846 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 7895
>ref|XM_008021347.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X1,
mRNA
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 7857 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 7906
>ref|XM_009187572.1| PREDICTED: Papio anubis roundabout, axon guidance receptor, homolog
3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 3291 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTCAACTGG 3340
>ref|XM_006101766.1| PREDICTED: Myotis lucifugus roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 1877 GCAAAGCGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTCAACTGG 1926
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X3,
mRNA
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Sbjct 3194 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTCAACTGG 3243
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homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X2,
mRNA
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 3363 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTCAACTGG 3412
>ref|XM_005580037.1| PREDICTED: Macaca fascicularis roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X1,
mRNA
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 3194 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTCAACTGG 3243
>gb|AC195101.6| Rhesus Macaque BAC CH250-420G14 () complete sequence
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 136864 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTCAACTGG 136815
>dbj|AB174553.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QtrA-17875, similar to
human retinoblastoma inhibiting gene 1 (RBIG1), mRNA, RefSeq:
XM_370663.2
Length=1924
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 732 GCAGAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTCAACTGG 781
>ref|XM_006915256.1| PREDICTED: Pteropus alecto roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Query 3 AAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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>ref|XM_008577332.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 3194 GCAAAGTAAAGCTTCTAGGAAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 3243
>ref|XM_007952135.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
Length=4125
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 3194 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAAATGCCTTCTCTAAACTGG 3243
>ref|XM_006775106.1| PREDICTED: Myotis davidii roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), partial mRNA
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Query 1 GCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGG 50
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Sbjct 2801 GCAAAGCGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCCCTCAACTGG 2850
>ref|XM_005870928.1| PREDICTED: Myotis brandtii roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), partial mRNA
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188192, whole genome shotgun sequence
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Lambda K H
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right flanking sequence - CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCC
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assembly
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genome shotgun sequence
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Sbjct 124634238 CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCC 124634287
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150165.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 28313667 CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCC 28313716
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 2859034 CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCC 2859083
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>gb|DS990767.1| Homo sapiens SCAF_1112675837137 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 121395971 CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCC 121396020
>gb|CH471065.1| Homo sapiens 211000035833829 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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>ref|NW_001838043.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188192, whole genome shotgun sequence
gb|DS486129.1| Homo sapiens SCAF_1103279188192 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 1924562 CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCC 1924513
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 120690486 CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCC 120690535
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Sbjct 121908307 CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCC 121908356
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1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT
>ref|XM_003313406.3| PREDICTED: Pan troglodytes roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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>ref|XM_003819932.2| PREDICTED: Pan paniscus roundabout, axon guidance receptor, homolog
3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 3251 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 3202
>ref|XM_004052351.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla roundabout, axon guidance
receptor, homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 3250 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 3201
>ref|NG_016214.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), RefSeqGene on chromosome 11
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Sbjct 17607 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 17558
>ref|NM_022370.3| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), mRNA
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Sbjct 3234 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 3185
>dbj|AK298792.1| Homo sapiens cDNA FLJ55947 complete cds, highly similar to Roundabout
homolog 3 precursor
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Sbjct 334 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 285
>dbj|AK295475.1| Homo sapiens cDNA FLJ59894 complete cds, moderately similar to
Roundabout homolog 3 precursor
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Sbjct 652 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 603
>dbj|AK291045.1| Homo sapiens cDNA FLJ76806 complete cds, highly similar to Homo
sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), mRNA
Length=4479
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Query 1 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 50
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Sbjct 3168 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 3119
>gb|BC148593.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100015636, MGC:183138
roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3) mRNA, encodes complete protein
Length=4222
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Query 1 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 50
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Sbjct 3099 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 3050
>dbj|AK225076.1| Homo sapiens mRNA for roundabout, axon guidance receptor, homolog
3 variant, clone: CAE11659
Length=1796
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Query 1 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 50
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Sbjct 471 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 422
>gb|BC086878.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila),
mRNA (cDNA clone IMAGE:6500722), with apparent retained
intron
Length=2235
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Query 1 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 50
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Sbjct 909 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 860
>gb|BC008623.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila),
mRNA (cDNA clone IMAGE:4177689), complete cds
Length=1532
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 50
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Sbjct 350 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 301
>gb|AY509035.1| Homo sapiens roundabout-like protein 3 (ROBO3) mRNA, complete
cds
Length=4569
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Query 1 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 50
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Sbjct 3257 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 3208
>gb|BC113744.1| Homo sapiens roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila),
mRNA (cDNA clone IMAGE:5762826), with apparent retained
intron
Length=3296
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 50
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Sbjct 1550 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 1501
>dbj|AK056544.1| Homo sapiens cDNA FLJ31982 fis, clone NT2RP7008550, highly similar
to Mus musculus rig-1 protein mRNA
Length=3384
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Query 1 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 50
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Sbjct 3234 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 3185
>dbj|AK024697.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21044 fis, clone CAE11659
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Sbjct 471 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 422
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Sbjct 13095 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT 13046
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3 (Drosophila) (ROBO3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3251 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCGGGCCGT 3202
>ref|XM_003253511.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys roundabout, axon guidance receptor,
homolog 3 (Drosophila) (ROBO3), mRNA
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Sbjct 2999 ATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCGGGCCGT 2950
>ref|NM_001131720.1| Pongo abelii roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila)
(ROBO3), mRNA
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right flanking sequence - CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCC
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(ROBO3), RefSeqGene on chromosome 11
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Roundabout homolog 3 precursor
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Sbjct 869 CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCC 918
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Sbjct 13312 CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCC 13361
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11 11 124747963 124747863 100m GATGTGGGGGGAAGCCCCCATGGAAGGTCTGCAGCTCCTCCCCCGCTGGGTCAATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCATGGC
11 11 124747960 124747860 100m GTTGGGGGAAGCCCCCAGGGAAGGTCTGCAGCTCCTCCCCCGCTGGGTCAATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT
11 11 124747957 124747857 100m GGGGGAAGCCCCCATGGAAGGTCTGCAGCTCCTCCCCCGCTGGGTCAATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTG
11 11 124747954 124747854 100m GGAACCCCCCATGGAAGGTCTGCAGCTCCTCCCCCGCTGGGTCAATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGTCTGAGC
11 11 124747953 124748134 93m124748128F7M GAAGCCCCCATGGAAGGTCTGCAGCTCCTCCCCCGCTGGGTCAATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGACCCTGGCCGT CTGACGT
11 11 124747932 124748155 72m124748128F28M CAGCTCCTCCCCCGCTGGGTCAATGGTGCTATAGACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCC
11 11 124747899 124748188 39m124748128F61M GACAGGACCCTCGCCAGGGGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCCATCCTATTCTC
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11 11 124747881 124748206 21m124748128F79M GGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCCATCCTATTCTCCTCAGGAGCCAAGGGAGG
11 11 124747881 124748206 21m124748128F79M GGCGGCCGGGCCCCTGGCCGT CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGCTCTCCGGGTGTCCCCATCCTATTCTCCTCAGGAGCCAAGGGAGG
11 11 124747881 124748206 21m124748128F79M GGCGGCCGTGCCCCTGGCCGT CTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCCATCCTATTCTCCTCAGGAGCCAAGGGAGG
11 11 124748118 124748218 100M CACTTCCTTCTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCCATCCTATTCTCCTCAGGAGCCAAGGGAGGCAAAGTGAAGCT
11 11 124748121 124748221 100M TTCCTTCTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCCATCCTATTCTCCTCAGGAGCCAAGGGAGGCAAAGTGAAGCTTCT
11 11 124748124 124748224 100M CTTCTGACCTGTCTCATCTCTGGCTCTTTCCTGCCTGTTCTCCGGGTGTCCCCATCCTATTCTCCTCAGGAGCCAAGGGAGGCAAGGTGAAGCTTCTGGG
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11 11 124748184 124748284 100M TCTCCTCAGGAGCCAAGGGAGGCAAAGTGAAGCTTCTGGGGAAACCTGTGCAGATGCCCTCTCTGAACTGGCCAGAAGCCCTGCCCCCACCTCCTCCTTC
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Sbjct 35823 GGTTGTTTAGAATCCAGAATCATCAAAAGCCATGTGGTATGAGGAAGTAA 35774
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Human Bac Library) complete sequence
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Sbjct 31675 GGTTGTTTAGAATCCAGAATCATCAAAAGCCATGTGGTATGAGGAAGTAA 31724
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apparent retained intron
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mRNA
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Sbjct 961 GGTTGTTTAGAATCCAGAATCATCAAAAGCCATGCGGTATGAGGAAGTAA 912
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human cyclin D2 (CCND2), mRNA, RefSeq: NM_001759.2
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Lambda K H
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right flanking sequence - AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTCTTTTGACAGGT
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Sbjct 36001 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTCTTTTGACAGGT 36050
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(LOC101143667), mRNA
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mRNA
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mRNA
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Sbjct 1139 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTCTTTTGACAGGT 1188
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Sbjct 5902 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTCTTTTGACAGGT 5951
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Sbjct 31429 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTCTTTTGACAGGT 31478
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Human Bac Library) complete sequence
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Sbjct 31497 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTCTTTTGACAGGT 31448
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Sbjct 582 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTCTTTTGACAGGT 631
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Sbjct 5843 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTATTTTGACAGGT 5892
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Sbjct 5964 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTATTTTGACAGGT 6013
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Sbjct 5831 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTATTTTGACAGGT 5880
>ref|XM_004778282.1| PREDICTED: Mustela putorius furo cyclin D2 (CCND2), mRNA
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Sbjct 5886 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTATTTTGACAGGT 5935
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Query 1 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTATCCAATGTCTTTTGACAGGT 50
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Sbjct 5796 AGTGCCTTACTGACTGTAGCCATTACAGTAGCCAGTGTATTTTGACAGGT 5845
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12 12 4413870 4413770 100m GGATGCAGGCTGCAGCTACAGCATGCACGTACACATTTGCTGATGGCTTCTCAAAACCTGAGCCGAGAATAGGGTCTGATAGCCCAGCCAAGTTTAAAAG
12 12 4413867 4413767 100m TGCAGGCTGCAGCTACAGCATGCACGTACACATTTGCTGATGGCTTCTCAAAACCTGAGCCGAGAATAGGGTCTGATAGCCCAGCCAAGTTTAAAAGCAG
12 12 4413864 4413764 100m AGGCTGCAGCTACAGCATGCACGTACACAGTTGCTGATGGCTTCTCAAAACCTGAGCCGAGAATAGGGTCTGATAGCCCAGCCAAGTTTAAAAGCAGACA
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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HSCHR12_CTG1
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 6891336 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 6891385
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>gb|DS990921.1| Homo sapiens SCAF_1112675836748 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
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Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
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Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
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>gb|CH471116.2| Homo sapiens 211000035838052 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
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Sbjct 6773204 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 6773253
>ref|NW_001838050.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187803, whole genome shotgun sequence
gb|DS486283.1| Homo sapiens SCAF_1103279187803 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
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Sbjct 1361287 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 1361336
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Length=130617856
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Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
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Sbjct 6806061 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 6806110
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Length=133516800
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Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
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1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA
>ref|XM_009424715.1| PREDICTED: Pan troglodytes guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 1068 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 1019
>ref|XM_003820278.2| PREDICTED: Pan paniscus guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X2,
mRNA
Length=2623
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 1067 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 1018
>ref|XM_008973675.1| PREDICTED: Pan paniscus guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X1,
mRNA
Length=2196
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 1067 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 1018
>ref|NM_001297571.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant 2, mRNA
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 164 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 115
>ref|NM_002075.3| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant 1, mRNA
Length=1760
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 164 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 115
>ref|XM_005569964.1| PREDICTED: Macaca fascicularis guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
Length=2614
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 1051 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 1002
>ref|NG_033740.1| Homo sapiens leprecan-like 2 (LEPREL2), RefSeqGene on chromosome
12
Length=18482
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 17645 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 17596
>ref|XM_004052595.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
Length=2197
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 354 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 305
>dbj|AB593099.1| Homo sapiens GNB3 mRNA for guanine nucleotide-binding protein
G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, complete cds, clone: HP06683-RBb32F07
Length=1652
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 89 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 40
>dbj|AB593098.1| Homo sapiens GNB3 mRNA for guanine nucleotide-binding protein
G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, complete cds, clone: HP06683-RBb29B08
Length=1653
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 90 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 41
>gb|AC195634.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-621J19 from chromosome 12, complete
sequence
Length=221431
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 159829 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 159780
>ref|NG_009100.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3), RefSeqGene on chromosome 12
Length=14183
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5807 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 5758
>gb|BC000115.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:3116 IMAGE:3351520),
complete cds
Length=1688
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 77 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 28
>gb|AY631872.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3) gene, complete cds
Length=10429
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 2045 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 1996
>gb|BC002454.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:1738 IMAGE:3342882),
complete cds
Length=1715
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 35
>dbj|AB209283.1| Homo sapiens mRNA for guanine nucleotide-binding protein, beta-3
subunit variant protein
Length=2870
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 1064 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 1015
>emb|CR932777.1| Human DNA sequence from clone XX-NCIH2171_7H20, complete sequence
Length=115459
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 65007 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 65056
>gb|U47924.1|HSU47924 Human chromosome 12p13 sequence, complete sequence
Length=222930
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 53027 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 52978
>gb|U47930.1|HSU47930 Human G-protein beta-3 subunit mRNA, partial cds
Length=510
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 359 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 310
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beta3 subunit, exon 2
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Sbjct 215 TCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 168
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protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 159 CCTCGGCCAGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 110
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protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript
variant X2, mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 353 CCTCGGCCAGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 304
>ref|XM_010385906.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 159 CCTCGGCCAGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 110
>ref|XM_002822838.3| PREDICTED: Pongo abelii guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X2,
mRNA
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 942 CCTCAGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 893
>ref|XM_009247385.1| PREDICTED: Pongo abelii guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X1,
mRNA
Length=2071
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 CCTCAGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 893
>ref|XM_003905882.2| PREDICTED: Papio anubis guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 585 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGAAGCCTCCTTACTCCCTCA 536
>ref|XM_007967408.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
X2, mRNA
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
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Sbjct 1039 CCTCGGCCGGATTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 990
>ref|XM_007967407.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
X1, mRNA
Length=2602
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 CCTCGGCCGGATTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA 990
>dbj|AK313091.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93574
Length=1110
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Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACT 44
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Sbjct 44 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACT 1
>gb|BC015920.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:20430 IMAGE:4648399),
complete cds
Length=1510
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTAC 43
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Sbjct 43 CCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTAC 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT
>ref|XM_010385908.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript
variant X3, mRNA
Length=1721
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 458
>ref|XM_010385907.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript
variant X2, mRNA
Length=1916
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 652
>ref|XM_010385906.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript
variant X1, mRNA
Length=1724
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Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 458
>ref|XM_009424715.1| PREDICTED: Pan troglodytes guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
Length=2626
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 1367
>ref|XM_002822838.3| PREDICTED: Pongo abelii guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X2,
mRNA
Length=2509
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Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
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Sbjct 1192 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 1241
>ref|XM_009247385.1| PREDICTED: Pongo abelii guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X1,
mRNA
Length=2071
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 1241
>ref|XM_003820278.2| PREDICTED: Pan paniscus guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X2,
mRNA
Length=2623
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 1366
>ref|XM_008973675.1| PREDICTED: Pan paniscus guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X1,
mRNA
Length=2196
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 1366
>ref|XM_002752265.2| PREDICTED: Callithrix jacchus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
Length=1913
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 612 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 661
>ref|NM_001297571.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant 2, mRNA
Length=1757
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 463
>ref|NM_002075.3| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant 1, mRNA
Length=1760
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 463
>gb|KJ904467.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_13861 GNB3
gene, encodes complete protein
Length=1023
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 318
>ref|XM_007967408.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
X2, mRNA
Length=2515
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 1251
>ref|XM_007967407.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
X1, mRNA
Length=2602
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1289 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 1338
>ref|XM_005569964.1| PREDICTED: Macaca fascicularis guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
Length=2614
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 1350
>ref|XM_003273769.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3, transcript variant 2 (GNB3),
mRNA
Length=1650
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 253
>ref|XM_003273768.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3, transcript variant 1 (GNB3),
mRNA
Length=1779
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 253
>ref|XM_004052595.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
Length=2197
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 653
>ref|NM_001266130.1| Macaca mulatta guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
Length=1553
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 329
>dbj|AB593099.1| Homo sapiens GNB3 mRNA for guanine nucleotide-binding protein
G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, complete cds, clone: HP06683-RBb32F07
Length=1652
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 388
>dbj|AB593098.1| Homo sapiens GNB3 mRNA for guanine nucleotide-binding protein
G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, complete cds, clone: HP06683-RBb29B08
Length=1653
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 340 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 389
>gb|AC195634.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-621J19 from chromosome 12, complete
sequence
Length=221431
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 161979 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 162028
>ref|NG_009100.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3), RefSeqGene on chromosome 12
Length=14183
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7964 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 8013
>dbj|AK313091.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93574
Length=1110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 343
>gb|DQ895149.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009609; FLH181833.01L;
RZPDo839H08135D guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3) gene, encodes complete
protein
Length=1063
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 226 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 275
>gb|DQ891959.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004589; FLH181837.01X; RZPDo839H08136D
guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3) gene, encodes complete protein
Length=1063
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 226 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 275
>gb|BC000115.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:3116 IMAGE:3351520),
complete cds
Length=1688
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 376
>gb|AY631872.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3) gene, complete cds
Length=10429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4204 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 4253
>gb|BC015920.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:20430 IMAGE:4648399),
complete cds
Length=1510
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 342
>gb|BT009800.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 mRNA, complete cds
Length=1023
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 253
>gb|BC002454.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:1738 IMAGE:3342882),
complete cds
Length=1715
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCT 383
>dbj|AB209283.1| Homo sapiens mRNA for guanine nucleotide-binding protein, beta-3
subunit variant protein
Length=2870
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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nucleotide binding protein beta polypeptide 3 (GNB3) mRNA, complete
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nucleotide binding protein beta polypeptide 3 (GNB3) mRNA, complete
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protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X1,
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protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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binding protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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>gb|DQ672621.1| Canis familiaris GTP-binding protein beta-3 subunit short isoform
(GNB3) mRNA, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 576 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACA 622
>gb|AY751537.1| Canis lupus familiaris GTP-binding protein beta-3 subunit (GNB3)
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>ref|NM_001003004.1| Canis lupus familiaris guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3-like (LOC100475485), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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Sbjct 1076 TGCTAGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACA 1120
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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Sbjct 318 TGCTAGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACA 362
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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Sbjct 231 GCTGTTGGTAAGCGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACA 277
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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Query 1 GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACA 47
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Sbjct 231 GCTGTTGGTAAGCGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACA 277
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protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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Sbjct 778 GCTGTTGGTAAGCGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACA 824
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beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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Sbjct 204 GCTGTTGGTAAGCGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACA 250
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12 12 6952127 6950147 12m1328n39m552n49m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGA
12 12 6950771 6950427 23m244n77m CACT
12 12 6950768 6950143 20m241n78m284n2m CA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CT
12 12 6950765 6950424 17m241n83m CACTCTG
12 12 6950762 6950421 14m241n86m CACTCTGGCT
12 12 6950759 6950186 3m249n87m224n10m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTG
12 12 6950756 6950191 8m241n87m224n5m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGG
12 12 6950753 6950188 5m241n87m224n8m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTC
12 12 6950750 6950182 2m244n84m224n14m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTG
12 12 6950529 6950429 100m CA
12 12 6950526 6950426 100m CACTC
12 12 6950523 6950423 100m CACTCTGG
12 12 6950520 6950420 100m CACTCTGGCTC
12 12 6950517 6950417 100m CACTCTGGCTCCTG
12 12 6950514 6950190 94m224n6m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGC
12 12 6950511 6950187 91m224n9m CACTCTGGCCC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCT
12 12 6950508 6950184 88m224n12m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGC
12 12 6950505 6950181 85m224n15m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGG
12 12 6950502 6950178 82m224n18m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACC
12 12 6950499 6950175 79m224n21m CACTCTGTCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCG
12 12 6950496 6950172 76m224n24m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCC
12 12 6950493 6950169 73m224n27m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGG
12 12 6950490 6950166 70m224n30m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGGCCTCGGCCGGGTTT
12 12 6950487 6950163 67m224n33m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCA
12 12 6950484 6950160 64m224n36m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCT
12 12 6950481 6950157 61m224n39m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCG
12 12 6950478 6950154 58m224n42m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTT
12 12 6950475 6950151 55m224n45m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCT
12 12 6950472 6950148 52m224n48m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGG
12 12 6950469 6950145 49m224n51m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGC
12 12 6950466 6950142 46m224n54m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTC
12 12 6950463 6950139 43m224n57m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTT
12 12 6950460 6950136 40m224n60m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACT
12 12 6950457 6950133 37m224n63m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCC
12 12 6950454 6950130 34m224n66m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA
12 12 6950451 6950127 31m224n69m CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCAGCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CATTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGCCCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CTCTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTCCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950451 6952340 31m224n66m6952338F3M CACTCTGACTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCT
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950450 6952341 30m224n66m6952338F4M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTG
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGGTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTAGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCATCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCATCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCACCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950449 6952342 29m224n66m6952338F5M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGCCCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGC
12 12 6950448 6952343 28m224n66m6952338F6M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCG
12 12 6950448 6952343 28m224n66m6952338F6M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCG
12 12 6950448 6952343 28m224n66m6952338F6M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCG
12 12 6950448 6952343 28m224n66m6952338F6M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTACGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCG
12 12 6950448 6952343 28m224n66m6952338F6M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCA
12 12 6950448 6952343 28m224n66m6952338F6M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCG
12 12 6950447 6952344 27m224n66m6952338F7M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCACA GCTGCCG
12 12 6950445 6952346 25m224n66m6952338F9M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCTGGT
12 12 6950443 6952348 23m224n66m6952338F11M CACTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCTGGTAA
12 12 6950440 6950340 100m CACTCTGGCTCCTGCCAGGAACATGGGGTCGGTGTTGAGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAA
12 12 6950437 6950337 100m CACTCTGGCTCCTGCCAGGAACATGGGGTCGGTGTTGAGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGAC
12 12 6950434 6950334 100m CACTCTGGCTCCTGCCAGGAACATGGGGTCGGTGTTGAGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACA
12 12 6950431 6950331 100m CACTCTGGTTCCTGCCAGGAACATGGGGTCGGTGTTGAGGAACCCCCCTCCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGG
12 12 6950429 6952362 9m224n66m6952338F25M CTCTGGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGAT
12 12 6950426 6950326 100m TGGCTCCTGCCAGGAACATGGGGTCGGTGTTGAGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACG
12 12 6950423 6950323 100m CTCCTGCCAGGAACATGGGGTCGGTGTTGAGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACT
12 12 6950420 6950320 100m CTGCCAGGAACATGGGGTCGGTGTTGAGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAGCGACTGGG
12 12 6950417 6950317 100m CCAGGAACATGGGGTCGGTGTTGAGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGG
12 12 6950414 6950314 100m GGAACATGGGGTCGGTGTTGAGGAACCCCCCCCCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTG
12 12 6950410 6950310 100m CATGGGGTCGGTGTTGAGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACC
12 12 6950406 6950306 100m GGGTCGGTGTTGAGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCT
12 12 6950403 6950303 100m GGGGTGTTGAGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCC
12 12 6950400 6950300 100m GTGTTGAGGACCCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAG
12 12 6950397 6950297 100m TTGAGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTA
12 12 6950394 6950294 100m AGGAACCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGC
12 12 6950391 6950291 100m ACCCCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCT
12 12 6950388 6950288 100m CCCCCACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCA
12 12 6950384 6950284 100m CACCAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTT
12 12 6950381 6950281 100m CAGGCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGA
12 12 6950378 6950278 100m GCTGTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACCCCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGT
12 12 6950375 6950275 100m GTGCTTCTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCT
12 12 6950372 6950272 100m CTTCTTCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTG
12 12 6950369 6950269 100m CTGCCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGT
12 12 6950366 6950266 100m CCCTTCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCA
12 12 6950362 6950262 100m TCGTGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCC
12 12 6950359 6950259 100m TGCCCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAG
12 12 6950356 6950256 100m CCACACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCT
12 12 6950353 6950253 100m CACCAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCC
12 12 6950350 6950250 100m CAGACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGA
12 12 6950347 6950247 100m ACTCCAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCC
12 12 6950343 6950243 100m CAAGACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGC
12 12 6950340 6950240 100m GACACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTG
12 12 6950337 6950237 100m ACAGGGAAACGACTGGGTGGCTGCCCCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGC
12 12 6950334 6950234 100m GGGAAACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCC
12 12 6950330 6950230 100m AACGACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCC
12 12 6950327 6950227 100m GACTGGGTGGCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAG
12 12 6950324 6950224 100m TGGGTGGCTGCACCCCCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAG
12 12 6950321 6950221 100m GTGGCTGCCCCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGC
12 12 6950318 6950218 100m GCTGCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGA
12 12 6950315 6950215 100m GCACCCTCTCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCC
12 12 6950312 6950212 100m CCCTCCCCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAG
12 12 6950309 6950209 100m TCTCCCCAGGTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCC
12 12 6950306 6950206 100m CCCCAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGC
12 12 6950303 6950203 100m CAGCTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCC
12 12 6950300 6950200 100m CTAGGCCCTCCAAGTTTGAGGCCCTTTGCGTCCATCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTC
12 12 6950297 6950197 100m GGCCCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTA
12 12 6950294 6950194 100m CCTCCAAGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTT
12 12 6950291 6950191 100m CCAAGTTTGATGTCTTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGG
12 12 6950288 6950188 100m AGTTTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTC
12 12 6950285 6950185 100m TTGAGGTCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGG
12 12 6950282 6950182 100m AGGTCATTGGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTG
12 12 6950279 6950179 100m TCCTTTGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGAC
12 12 6950276 6950176 100m TTCGCGTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTC
12 12 6950271 6950171 100m GTCCAGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCG
12 12 6950267 6950167 100m AGCCCCAGCCTGCCTGAGCCCTTCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTT
12 12 6950264 6950164 100m CCCAGCCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCC
12 12 6950259 6950159 100m CCTGCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTC
12 12 6950256 6950156 100m GCCTGAGCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGG
12 12 6950253 6950153 100m TGAGCCCTGCCTGCGCCCCAACCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTAGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTC
12 12 6950250 6950150 100m GCCCTGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGGGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTG
12 12 6950246 6950146 100m TGCCTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAG
12 12 6950243 6950143 100m CTGCGCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCT
12 12 6950239 6950139 100m GCCCCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTT
12 12 6950236 6950136 100m CCAGCCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACT
12 12 6950233 6950133 100m ACCCAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCCCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCC
12 12 6950230 6950130 100m CAGGAGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA
12 12 6950226 6950126 100m AGAGCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCAGCTG
12 12 6950223 6950123 100m GCAGAGCCCAGGCCAGCTCCCTCTTACTTGGGCTCTGGCTGGACCTCGGCCGGGTGTCCAGCGCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCAGCTGCGA
12 12 6950187 6952380 57m6952338F43M GGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTAA GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGG
12 12 6950187 6952380 57m6952338F43M GGCTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTAA GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGG
12 12 6950185 6952382 55m6952338F45M CTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGA
12 12 6950185 6952382 55m6952338F45M CTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTAA GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGA
12 12 6950185 6952382 55m6952338F45M CTGGACCTCGGCCGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGA
12 12 6950173 6952394 43m6952338F57M CGGGTTTCCAGCTCCGGTTCCTGGGAGCCTCCTTACTCCCTCA GCTGCTGGTAAGTGCCTCGCAAGATGGGAAGCTGATCGTGTGGGACAGCTACACCAC
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sequence
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Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
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HuRef SCAF_1103279187803, whole genome shotgun sequence
gb|DS486283.1| Homo sapiens SCAF_1103279187803 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 1361618 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 1361569
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shotgun sequence
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Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
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Lambda K H
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HSCHR12_CTG1
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assembly
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Sbjct 6833668 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 6833717
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genome shotgun sequence
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>ref|NW_004929382.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 6891830 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 6891879
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 50
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>gb|DS990921.1| Homo sapiens SCAF_1112675836748 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 50
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Sbjct 1361795 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 1361844
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Sbjct 6920531 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 6920580
>gb|CH003459.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
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Query 1 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 50
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Sbjct 7025950 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 7025999
>gb|CH471116.2| Homo sapiens 211000035838052 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=12881912
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Query 1 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 50
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Sbjct 6773698 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 6773747
>ref|NW_001838050.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187803, whole genome shotgun sequence
gb|DS486283.1| Homo sapiens SCAF_1103279187803 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 50
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Sbjct 1361781 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 1361830
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000473.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=130617856
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Query 1 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 50
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Sbjct 6806555 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 6806604
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Query 1 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 50
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Sbjct 8570116 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 8570165
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA
>ref|XM_010385908.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
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Sbjct 615 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 566
>ref|XM_010385907.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript
variant X2, mRNA
Length=1916
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 760
>ref|XM_010385906.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript
variant X1, mRNA
Length=1724
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 615 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 566
>ref|XM_009424715.1| PREDICTED: Pan troglodytes guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
Length=2626
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 1475
>ref|XM_002822838.3| PREDICTED: Pongo abelii guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X2,
mRNA
Length=2509
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 1349
>ref|XM_009247385.1| PREDICTED: Pongo abelii guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X1,
mRNA
Length=2071
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 1349
>ref|XM_003820278.2| PREDICTED: Pan paniscus guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X2,
mRNA
Length=2623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1523 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 1474
>ref|XM_008973675.1| PREDICTED: Pan paniscus guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant X1,
mRNA
Length=2196
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1523 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 1474
>ref|NM_001297571.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant 2, mRNA
Length=1757
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
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Sbjct 620 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 571
>ref|NM_002075.3| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant 1, mRNA
Length=1760
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 571
>gb|KJ904467.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_13861 GNB3
gene, encodes complete protein
Length=1023
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
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Sbjct 475 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 426
>dbj|AB593099.1| Homo sapiens GNB3 mRNA for guanine nucleotide-binding protein
G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, complete cds, clone: HP06683-RBb32F07
Length=1652
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
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Sbjct 545 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 496
>dbj|AB593098.1| Homo sapiens GNB3 mRNA for guanine nucleotide-binding protein
G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, complete cds, clone: HP06683-RBb29B08
Length=1653
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 497
>gb|AC195634.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-621J19 from chromosome 12, complete
sequence
Length=221431
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162310 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 162261
>ref|NG_009100.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3), RefSeqGene on chromosome 12
Length=14183
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8295 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 8246
>dbj|AK313091.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93574
Length=1110
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 451
>gb|DQ895149.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009609; FLH181833.01L;
RZPDo839H08135D guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3) gene, encodes complete
protein
Length=1063
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
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Sbjct 432 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 383
>gb|DQ891959.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004589; FLH181837.01X; RZPDo839H08136D
guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3) gene, encodes complete protein
Length=1063
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 383
>gb|BC000115.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:3116 IMAGE:3351520),
complete cds
Length=1688
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
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Sbjct 533 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 484
>gb|AY631872.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3) gene, complete cds
Length=10429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4535 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 4486
>gb|BC015920.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:20430 IMAGE:4648399),
complete cds
Length=1510
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 450
>gb|BT009800.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 mRNA, complete cds
Length=1023
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 361
>gb|BC002454.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:1738 IMAGE:3342882),
complete cds
Length=1715
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
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Sbjct 540 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 491
>dbj|AB209283.1| Homo sapiens mRNA for guanine nucleotide-binding protein, beta-3
subunit variant protein
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nucleotide binding protein beta polypeptide 3 (GNB3) mRNA, complete
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nucleotide binding protein beta polypeptide 3 (GNB3) mRNA, complete
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complete cds
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protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3, transcript variant 2 (GNB3),
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(G protein), beta polypeptide 3, transcript variant 1 (GNB3),
mRNA
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protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 3 (Gnb3), transcript variant
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protein (G protein), beta polypeptide 3 (Gnb3), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 494 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGCTATAGATGGA 448
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protein (G protein), beta polypeptide 3 (Gnb3), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGA 47
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Sbjct 539 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGCTATAGATGGA 493
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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Sbjct 1469 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGACTTGAGGCTGTAGATGGA 1423
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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Sbjct 1722 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGACTTGAGGCTGTAGATGGA 1676
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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(G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), transcript variant
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Sbjct 894 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGACTTGAGGCTGTAGATGGA 848
>ref|XM_004413920.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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Sbjct 811 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGACTTGAGGCTGTAGATGGA 765
>ref|XM_004387225.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris guanine nucleotide
binding protein (G protein), beta polypeptide 3 (GNB3), mRNA
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Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA 50
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Sbjct 410 CGGCTGATCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGCTATAGATGGAACA 361
>ref|NM_021858.3| Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (Gnb3), mRNA
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Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGAT 44
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Sbjct 521 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGCTGTAGAT 478
>gb|BC086422.1| Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:105437 IMAGE:7193131),
complete cds
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Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGAT 44
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Sbjct 524 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGCTGTAGAT 481
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beta 3 (Gnb3) mRNA, partial cds
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Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
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Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGAT 44
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Sbjct 331 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGCTGTAGAT 288
>gb|DQ120487.1| Rattus norvegicus strain WKY guanine nucleotide binding protein
beta 3 (Gnb3) mRNA, partial cds
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Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
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Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGAT 44
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Sbjct 331 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGCTGTAGAT 288
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Query 1 CGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGAT 44
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Lambda K H
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right flanking sequence - ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG
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beta polypeptide 3 (GNB3), RefSeqGene on chromosome 12
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>gb|AY631872.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 3 (GNB3) gene, complete cds
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Sbjct 4698 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTG 4747
>emb|CR932777.1| Human DNA sequence from clone XX-NCIH2171_7H20, complete sequence
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beta3 subunit, exon 8
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>gb|AC195634.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-621J19 from chromosome 12, complete
sequence
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Sbjct 162473 ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACGTTGCTG 162522
Lambda K H
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Lambda K H
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reads
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12 12 6952947 6952660 8m81n64m106n28m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGAC
12 12 6952944 6952657 5m81n64m106n31m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTT
12 12 6952941 6952629 2m78n67m134n31m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CACGTGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTG
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12 12 6952896 6952796 100m TCCCAAGCCCCAGCACCAGCAATGTTCAGCCTCACCACGTGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATA
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12 12 6952887 6952787 100m CCAGCACCAGCAATGTTCAGCCTCACCACGTGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAACCTGGAGG
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12 12 6952881 6952647 87m134n13m CCAGCAATGTTCAGCCTCACCACGTGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTGACATTGCCC
12 12 6952878 6952672 84m106n16m GCAATGTTCAGCCTCACCACGTGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAG
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12 12 6952872 6952666 78m106n22m TTCAGCCCCACCACGTGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCACCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCG
12 12 6952869 6952663 75m106n25m AGCCTCACCACGTGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCT
12 12 6952866 6952660 72m106n28m CTCACCACGTGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGAC
12 12 6952863 6952657 69m106n31m ACCACGTGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTT
12 12 6952860 6952654 66m106n34m ACGTGCTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGAC
12 12 6952857 6952651 63m106n37m TGGTGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATT
12 12 6952854 6952648 60m106n40m TGTCCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCC
12 12 6952851 6952645 57m106n43m CCCCCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTC
12 12 6952848 6952642 54m106n46m CCGAGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACG
12 12 6952845 6952639 51m106n49m AGCTGGTCACAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGA
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12 12 6952836 6952630 42m106n58m CAATATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTT
12 12 6952833 6952627 39m106n61m TATTGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTA
12 12 6952830 6952624 36m106n64m TGTTGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGAT
12 12 6952827 6952621 33m106n67m TGTCATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGA
12 12 6952824 6952618 30m106n70m CATCCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA
12 12 6952821 6952615 27m106n73m CCAGGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACACAT
12 12 6952818 6952612 24m106n76m GGAAGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACACATGTT
12 12 6952815 6952609 21m106n79m AGCGGCAGCAGGAGAGATAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACACATGTTGTC
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12 12 6952800 6952700 100m GATAACCTGGAGGCGGTTAGAAGGACAGTGCCCTGGCTGCAGAGCCACAGCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGG
12 12 6952797 6952697 100m AACCTGGAGGCGGTTAGAAGGACAGTGCCCTGGCTGCAGAGCCACAGCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCT
12 12 6952796 6952859 2m106n70m6952832F28M AC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTGTCAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCAC
12 12 6952793 6952693 100m TGGAGGCGGTTAGAAGGACAGTGCCCTGGCTGCAGAGCCACAGCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCC
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12 12 6952787 6952687 100m CGGTTAGAAGGACAGTGCCCTGGCTGCAGAGCCACAGCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACC
12 12 6952784 6952684 100m TTAGAAGGACAGTGCCCTGGCTGCAGAGCCACAGCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGT
12 12 6952781 6952681 100m GAAGGACAGTGCCCTGGCTGCAGAGCCACAGCCCCCTGGAAGCCCAGGGTTGCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTG
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12 12 6952769 6952669 100m CCTGGCTGCAGAGCCACAGCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTC
12 12 6952766 6952666 100m GGCTGCAGAGCCACAGCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCG
12 12 6952763 6952663 100m TGCAGAGCCACAGCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCT
12 12 6952760 6952660 100m AGAGCCACAGCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGAC
12 12 6952757 6952657 100m GCCACAGCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTT
12 12 6952754 6952654 100m ACAGCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGAC
12 12 6952751 6952651 100m GCCCACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATT
12 12 6952748 6952648 100m CACTGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGATCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCC
12 12 6952745 6952645 100m TGGAAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTC
12 12 6952742 6952642 100m AAGCCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACG
12 12 6952739 6952639 100m CCCAGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGA
12 12 6952736 6952636 100m AGGGTTCCCTGAACCCCTCAGGAAGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTT
12 12 6952733 6952633 100m GTTCCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAG
12 12 6952730 6952630 100m CCCTGAACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGCGATTTGAGGTT
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12 12 6952724 6952624 100m ACCCCTCAGGAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGAT
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12 12 6952715 6952615 100m GAGGGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGGCATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACACAT
12 12 6952712 6952612 100m GGGAGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTCTAGATGGAACACATGTT
12 12 6952709 6952609 100m AGGAGAGGGTCTCTCCCTCACCTGTGTGAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACACATGTTGTC
12 12 6952690 6952859 72m6952832F28M ACCTGTGTCAGCAGAAAGCTCCCGGCTGACCTTGACATTGCCCTCACGGGATTTGAGGTTGTAGATGGAACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCAC
12 12 6952639 6952910 21m6952832F79M TTTGAGGTTGTAGATGGAACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCT
12 12 6952639 6952910 21m6952832F79M TTTGAGGTTGTAGATGGAACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGGGTGGGCCCGGCCT
12 12 6952639 6952910 21m6952832F79M TTTGAGGTTGTAGATGGAACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGGGGGCCCGGCCT
12 12 6952624 6953003 6m6952832F31M78N63M GCAACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTG
12 12 6952623 6953004 5m6952832F31M78N64M CAACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGC
12 12 6952623 6953004 5m6952832F31M78N64M CAACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGC
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTTAGACTGGGCGGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCT
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953008 4m6952832F28M81N68M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
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12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGGCTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953008 4m6952832F28M81N68M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGCCACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGGATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953008 4m6952832F28M81N68M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTTTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCA
12 12 6952622 6953005 4m6952832F31M78N65M AACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTCACTGCT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGGATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953129 3m6952832F31M201N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCAAGCTCTGGGATGTGCGAGAGGGGACCTGCCGTCAGACTTTCACTGGCCACGAGTCGGACAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953009 3m6952832F28M81N69M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGAG
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCACAAGACTGTATTTGTGGGCCACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAG
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGGGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGGGACTGCAT
12 12 6952621 6953129 3m6952832F31M201N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCAAGCTCTGGGATGTGCGAGAGGGGACCTGCCGTCAGACTTTCACTGGCCACGAGTCGGACAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACAGCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGGGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M CCA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGAGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGCGACATTGAGACTGGGCAGCAGACGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGAAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
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12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
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12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGAGACTGCAT
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12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCGGCAGAAGACGGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGGATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGAAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952621 6953009 3m6952832F28M81N69M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGAG
12 12 6952621 6953006 3m6952832F31M78N66M ACA ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952822 6953000 40M78N60M ATGACAACAATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGA
12 12 6952825 6953006 34M81N66M ACAACAATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCAT
12 12 6952828 6952928 100M ACAATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCT
12 12 6952831 6953009 31M78N69M ATATTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGAG
12 12 6952834 6953012 28M78N72M TTGTGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGAGCCT
12 12 6952837 6953015 25M78N75M TGACCAGCTCGGGGGACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGAGCCTGGC
12 12 6952840 6952940 100M CCAGCTCGGGGGACACCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAG
12 12 6952843 6953024 16M81N84M GCTCGGGGGACACCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGAGCCTGGCTGTGTCTCC
12 12 6952846 6953027 13M81N87M CGGGGGACACCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGAGCCTGGCTGTGTCTCCTGA
12 12 6952849 6953030 10M81N90M GGGACACCAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGCGACTGCATGAGCCTGGCTGTGTCTCCTGACCT
12 12 6952852 6953030 10M78N90M ACACCACGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGAGCCTGGCTGTGTCTCCTGACTT
12 12 6952855 6952955 100M CCACGTGGTGAGGCTGAACATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACGT
12 12 6952858 6952958 100M CGTGGTGAGGCTGAACATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGGGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGA
12 12 6952861 6952961 100M GGTGAGGCTGAACATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGAC
12 12 6952864 6952964 100M GAGGCTGAACATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGG
12 12 6952867 6952967 100M GCTGAACATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGCGACTGGGCG
12 12 6952870 6952970 100M GAACATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCA
12 12 6952873 6952973 100M CATTGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAA
12 12 6952876 6952976 100M TGCTGGTGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGAC
12 12 6952879 6952979 100M TGGTGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGT
12 12 6952882 6952982 100M TGCTGGGGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATT
12 12 6952885 6952985 100M TGGGGCTTGGGAGGGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGT
12 12 6952888 6952988 100M GGCTTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGG
12 12 6952891 6952991 100M TTGGGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACA
12 12 6952894 6952994 100M GGAGTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACAC
12 12 6952897 6952997 100M GTGGGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGG
12 12 6952900 6953000 100M GGCCCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGA
12 12 6952903 6953003 100M CCGGCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTG
12 12 6952906 6953006 100M GCCTTTCTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACAGGGGTGACTGCAT
12 12 6952909 6953009 100M TTTCTCTAACAGTCTCCCTACATTTTGGCAGTGCCTTGGGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGAG
12 12 6952912 6953012 100M CTCTAACAGTCTCCCTCCATTTTGGCAGTGCCTTGTGGGACATTGAGACTGGGCAGCAGAAGACTGTATTTGTGGGACACACGGGTGACTGCATGAGCCT
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shotgun sequence
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Query 1 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 50
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Sbjct 6901661 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 6901612
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genome shotgun sequence
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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sequence
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HuRef SCAF_1103279187803, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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blast search - nt
left flanking sequence - TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT
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Query 1 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 50
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Sbjct 16919 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 16870
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FLH258371.01L atrophin 1 (ATN1) gene, encodes complete
protein
Length=3616
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Query 1 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 50
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Sbjct 1136 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1087
>ref|NM_001940.3| Homo sapiens atrophin 1 (ATN1), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 1344 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1295
>ref|NM_001007026.1| Homo sapiens atrophin 1 (ATN1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 1351 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1302
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Sbjct 1184 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1135
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Sbjct 94 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 45
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Human PAC Library) complete sequence
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Sbjct 20810 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 20761
>gb|U47924.1|HSU47924 Human chromosome 12p13 sequence, complete sequence
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Sbjct 148390 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 148341
>gb|BC051795.2| Homo sapiens atrophin 1, mRNA (cDNA clone MGC:57647 IMAGE:4181592),
complete cds
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Sbjct 1362 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1313
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Sbjct 1282 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1233
>dbj|D31840.1|HUMDRPLA1 Homo sapiens DRPLA mRNA, complete cds
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Sbjct 1352 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1303
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Sbjct 1147 TCATGGGGGGCGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1098
>ref|XM_008973660.1| PREDICTED: Pan paniscus atrophin 1 (ATN1), mRNA
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Sbjct 1276 TCATGGGGGGCGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1227
>ref|NM_001034165.1| Pan troglodytes atrophin 1 (ATN1), mRNA
gb|AY665258.1| Pan troglodytes DRPLA protein mRNA, complete cds
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Sbjct 1111 TCATGGGGGGCGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1062
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Sbjct 57 TCATGGGGGGCGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 8
>emb|AJ133270.1| Pan paniscus DRPLA gene, partial, exon 5
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Sbjct 98 TCATGGGGGGCGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 49
>ref|XM_003905892.2| PREDICTED: Papio anubis atrophin 1 (ATN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 1403 TCATGGGGGGTGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1354
>ref|XM_009180106.1| PREDICTED: Papio anubis atrophin 1 (ATN1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 1405 TCATGGGGGGTGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1356
>ref|XM_007967441.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus atrophin 1 (ATN1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 1365 TCATGGGGGGTGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1316
>ref|XM_007967440.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus atrophin 1 (ATN1), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 50
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Sbjct 1368 TCATGGGGGGTGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1319
>ref|XM_005569989.1| PREDICTED: Macaca fascicularis atrophin 1 (ATN1), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 50
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Sbjct 1865 TCATGGGGGGTGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1816
>ref|XM_005569988.1| PREDICTED: Macaca fascicularis atrophin 1 (ATN1), transcript
variant X1, mRNA
Length=4833
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Query 1 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 50
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Sbjct 1866 TCATGGGGGGTGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 1817
>ref|XM_001118307.2| PREDICTED: Macaca mulatta atrophin 1 (ATN1), mRNA
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Query 1 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 50
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Sbjct 1039 TCATGGGGGGTGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 990
>emb|AJ133274.1| Macaca fascicularis DRPLA gene, partial, exon 5
Length=862
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Query 1 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 50
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 57 TCATGGGGGGTGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 8
>emb|AJ133271.1| Gorilla gorilla DRPLA gene, partial, exon 5
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCATGGGGGGCGCTGGAGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 50
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Sbjct 98 TCATGGGAGGCGCTGGGGCAGAAGAGGAAGCAGGAGGCAGAGAGTGGGGT 49
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC
>ref|XM_010332877.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis atrophin 1 (ATN1),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2171 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 2220
>ref|XM_003944873.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis atrophin 1 (ATN1),
transcript variant X1, mRNA
Length=4686
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2173 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 2222
>ref|XM_009247393.1| PREDICTED: Pongo abelii atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=4135
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1634 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1683
>ref|XM_008973660.1| PREDICTED: Pan paniscus atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=4262
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1763 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1812
>ref|XM_003733714.2| PREDICTED: Callithrix jacchus atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=4310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1779 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1828
>ref|XM_008144872.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus atrophin 1 (ATN1), transcript variant
X3, mRNA
Length=4135
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1668 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1717
>ref|XM_008144871.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus atrophin 1 (ATN1), transcript variant
X2, mRNA
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1837 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1886
>ref|XM_008144870.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus atrophin 1 (ATN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=4292
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1824 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1873
>ref|XM_007089684.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=3507
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1781 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1830
>ref|XM_006933480.1| PREDICTED: Felis catus atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=4198
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1814 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1863
>ref|XM_006210880.1| PREDICTED: Vicugna pacos atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=4277
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1794 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1843
>ref|XM_006173014.1| PREDICTED: Camelus ferus atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=3366
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1650
>gb|KC951394.1| Homo sapiens clone FOS_0029, complete sequence
Length=39916
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 17478 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 17527
>ref|XM_003273777.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys atrophin 1 (ATN1), mRNA
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1752 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1801
>gb|AC231778.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC12-49204100K6 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=40848
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 14910 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 14861
>ref|NG_008047.1| Homo sapiens atrophin 1 (ATN1), RefSeqGene on chromosome 12
Length=24859
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 17418 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 17467
>gb|EU446506.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100070339; IMAGE:100011715;
FLH258371.01L atrophin 1 (ATN1) gene, encodes complete
protein
Length=3616
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1638 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1687
>ref|NM_001940.3| Homo sapiens atrophin 1 (ATN1), transcript variant 2, mRNA
Length=4360
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1843 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1892
>ref|NM_001007026.1| Homo sapiens atrophin 1 (ATN1), transcript variant 1, mRNA
Length=4367
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1850 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1899
>ref|NM_001034165.1| Pan troglodytes atrophin 1 (ATN1), mRNA
gb|AY665258.1| Pan troglodytes DRPLA protein mRNA, complete cds
Length=3561
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1650
>gb|U23851.1|HSU23851 Human atrophin-1 mRNA, complete cds
Length=4168
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 1668 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1717
>dbj|AB209345.1| Homo sapiens mRNA for atrophin-1 variant protein
Length=5522
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 459 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 508
>gb|AC006512.13| Homo sapiens 12 PAC RP3-461F17 (Roswell Park Cancer Institute
Human PAC Library) complete sequence
Length=155975
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 50
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Sbjct 21309 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 21358
>emb|AJ133272.1| Pongo pygmaeus DRPLA gene, partial, exon 5
Length=877
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Sbjct 2222 CTCTGAGACCCTATCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 2271
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Sbjct 2025 CTCTGAGACCCTATCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 2074
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Sbjct 1598 CTCTGAGACCCTATCCACCAGGGCCAGCACACCTGCCCCCACCTCACAGC 1647
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Sbjct 1660 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACATCTGCCTCCACCTCACA 1707
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Sbjct 1794 CTCTGAGGCCCTACCCACCAGGGCCAGCACATCTGCCTCCACCTCACA 1841
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sequence
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>gb|DS990921.1| Homo sapiens SCAF_1112675836748 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 6868660 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 6868709
>ref|NW_001838050.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187803, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 1457785 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 1457834
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000473.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 6902559 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 6902608
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Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2329 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 2280
>ref|XM_003944873.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis atrophin 1 (ATN1),
transcript variant X1, mRNA
Length=4686
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 2331 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 2282
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Sbjct 1792 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 1743
>ref|XM_008973660.1| PREDICTED: Pan paniscus atrophin 1 (ATN1), mRNA
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 1921 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 1872
>gb|KC951394.1| Homo sapiens clone FOS_0029, complete sequence
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Sbjct 17636 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 17587
>ref|XM_003273777.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=4252
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 1910 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 1861
>gb|AC231778.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC12-49204100K6 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=40848
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 14752 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 14801
>ref|NG_008047.1| Homo sapiens atrophin 1 (ATN1), RefSeqGene on chromosome 12
Length=24859
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Sbjct 17576 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 17527
>gb|EU446506.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100070339; IMAGE:100011715;
FLH258371.01L atrophin 1 (ATN1) gene, encodes complete
protein
Length=3616
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 1796 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 1747
>ref|NM_001940.3| Homo sapiens atrophin 1 (ATN1), transcript variant 2, mRNA
Length=4360
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 2001 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 1952
>ref|NM_001007026.1| Homo sapiens atrophin 1 (ATN1), transcript variant 1, mRNA
Length=4367
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 2008 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 1959
>ref|NM_001034165.1| Pan troglodytes atrophin 1 (ATN1), mRNA
gb|AY665258.1| Pan troglodytes DRPLA protein mRNA, complete cds
Length=3561
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 1759 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 1710
>gb|U23851.1|HSU23851 Human atrophin-1 mRNA, complete cds
Length=4168
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Sbjct 1826 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 1777
>dbj|AB209345.1| Homo sapiens mRNA for atrophin-1 variant protein
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 617 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 568
>gb|AC006512.13| Homo sapiens 12 PAC RP3-461F17 (Roswell Park Cancer Institute
Human PAC Library) complete sequence
Length=155975
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 21467 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 21418
>emb|AJ133272.1| Pongo pygmaeus DRPLA gene, partial, exon 5
Length=877
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 702 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 653
>emb|AJ133270.1| Pan paniscus DRPLA gene, partial, exon 5
Length=942
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 767 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 718
>emb|AJ133273.1| Hylobates lar DRPLA gene, partial, exon 5
Length=906
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 731 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 682
>emb|AJ133271.1| Gorilla gorilla DRPLA gene, partial, exon 5
Length=900
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 725 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 676
>emb|AJ133275.1| Cebus apella DRPLA gene, partial, exon 5
Length=486
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 311 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 262
>gb|U47924.1|HSU47924 Human chromosome 12p13 sequence, complete sequence
Length=222930
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 149047 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 148998
>gb|BC051795.2| Homo sapiens atrophin 1, mRNA (cDNA clone MGC:57647 IMAGE:4181592),
complete cds
Length=4382
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 2022 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 1973
>dbj|D38529.1|HUMDRPLA Homo sapiens mRNA for DRPLA protein, complete cds
Length=4267
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 1924 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 1875
>dbj|D31840.1|HUMDRPLA1 Homo sapiens DRPLA mRNA, complete cds
Length=4279
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGGGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 50
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Sbjct 1937 AAGGGGAGGGGTGGGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAAGTGGAAGAGGAA 1888
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Sbjct 1826 AAGGAGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAGGAGGAAGAGGAA 1777
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X2, mRNA
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Sbjct 1995 AAGGAGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAGGAGGAAGAGGAA 1946
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X1, mRNA
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Sbjct 1982 AAGGAGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAGGAGGAAGAGGAA 1933
>ref|XM_006210880.1| PREDICTED: Vicugna pacos atrophin 1 (ATN1), mRNA
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Sbjct 1949 AAGGAGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAGGAGGAAGAGGAA 1900
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Sbjct 1756 AAGGAGAGGGGTGTGAACATGGGTAGGACCCTTGAGAGGAGGAAGAGGAA 1707
Lambda K H
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Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG
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variant X3, mRNA
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Sbjct 2258 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2307
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variant X1, mRNA
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Sbjct 2255 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2304
>ref|XM_008973660.1| PREDICTED: Pan paniscus atrophin 1 (ATN1), mRNA
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Sbjct 2177 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2226
>ref|XM_003733714.2| PREDICTED: Callithrix jacchus atrophin 1 (ATN1), mRNA
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Sbjct 2193 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2242
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variant X2, mRNA
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Sbjct 2254 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2303
>ref|XM_007967440.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus atrophin 1 (ATN1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 2257 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2306
>ref|XM_005569989.1| PREDICTED: Macaca fascicularis atrophin 1 (ATN1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 2748 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2797
>ref|XM_005569988.1| PREDICTED: Macaca fascicularis atrophin 1 (ATN1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 2749 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2798
>gb|KC951394.1| Homo sapiens clone FOS_0029, complete sequence
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Sbjct 17892 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 17941
>gb|AC231778.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC12-49204100K6 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=40848
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Sbjct 14496 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 14447
>ref|XM_001118307.2| PREDICTED: Macaca mulatta atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=3460
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Sbjct 1922 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 1971
>ref|NG_008047.1| Homo sapiens atrophin 1 (ATN1), RefSeqGene on chromosome 12
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Sbjct 17832 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 17881
>gb|EU446506.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100070339; IMAGE:100011715;
FLH258371.01L atrophin 1 (ATN1) gene, encodes complete
protein
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Sbjct 2052 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2101
>ref|NM_001940.3| Homo sapiens atrophin 1 (ATN1), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 2257 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2306
>ref|NM_001007026.1| Homo sapiens atrophin 1 (ATN1), transcript variant 1, mRNA
Length=4367
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2264 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2313
>gb|U23851.1|HSU23851 Human atrophin-1 mRNA, complete cds
Length=4168
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Sbjct 2082 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2131
>dbj|AB209345.1| Homo sapiens mRNA for atrophin-1 variant protein
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Sbjct 873 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 922
>gb|AC006512.13| Homo sapiens 12 PAC RP3-461F17 (Roswell Park Cancer Institute
Human PAC Library) complete sequence
Length=155975
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Sbjct 21723 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 21772
>gb|U47924.1|HSU47924 Human chromosome 12p13 sequence, complete sequence
Length=222930
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 149303 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 149352
>gb|BC051795.2| Homo sapiens atrophin 1, mRNA (cDNA clone MGC:57647 IMAGE:4181592),
complete cds
Length=4382
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Sbjct 2278 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2327
>dbj|D38529.1|HUMDRPLA Homo sapiens mRNA for DRPLA protein, complete cds
Length=4267
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2180 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2229
>dbj|D31840.1|HUMDRPLA1 Homo sapiens DRPLA mRNA, complete cds
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2250 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2299
>gb|L10377.1|HUMRNAF Human (clone CTG-B37) mRNA sequence
Length=1475
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 1305 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 1354
>ref|XM_010332877.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis atrophin 1 (ATN1),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2585 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCAGGCTCGCCCACCGTG 2634
>ref|XM_003944873.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis atrophin 1 (ATN1),
transcript variant X1, mRNA
Length=4686
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2587 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCAGGCTCGCCCACCGTG 2636
>ref|XM_009247393.1| PREDICTED: Pongo abelii atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=4135
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2048 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCAGGCTCGCCCACCGTG 2097
>ref|XM_003905892.2| PREDICTED: Papio anubis atrophin 1 (ATN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 2298 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTTAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2347
>ref|XM_009180106.1| PREDICTED: Papio anubis atrophin 1 (ATN1), transcript variant
X1, mRNA
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2300 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTTAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2349
>ref|XM_006210880.1| PREDICTED: Vicugna pacos atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=4277
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2205 CCTCGCCGCCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2254
>ref|NM_001034165.1| Pan troglodytes atrophin 1 (ATN1), mRNA
gb|AY665258.1| Pan troglodytes DRPLA protein mRNA, complete cds
Length=3561
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2015 CCTCGCCACCTGCAGGCCCGGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2064
>ref|XM_007469393.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=3501
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 1988 CCTCGCCACCCGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACGGTG 2037
>ref|XM_006173014.1| PREDICTED: Camelus ferus atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=3366
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2012 CCTCGCCGCCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCCCCCACCGTG 2061
>ref|XM_004314759.1| PREDICTED: Tursiops truncatus atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=4095
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2027 CCTCGCCACCCGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACGGTG 2076
>ref|XM_004279074.1| PREDICTED: Orcinus orca atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=4133
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Query 1 CCTCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2064 CCTCGCCACCCGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACGGTG 2113
>ref|XM_008513994.1| PREDICTED: Equus przewalskii atrophin 1 (ATN1), transcript variant
X2, mRNA
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Query 3 TCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2252 TCGCCGCCCGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2299
>ref|XM_008513993.1| PREDICTED: Equus przewalskii atrophin 1 (ATN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=4340
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 2255 TCGCCGCCCGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 2302
>ref|XM_005611031.1| PREDICTED: Equus caballus atrophin 1 (ATN1), mRNA
Length=4108
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 3 TCGCCACCTGCAGGCCCAGGGACCTTCAAGCCGGGCTCGCCCACCGTG 50
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Sbjct 66 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 17
>gb|BC005272.1| Homo sapiens matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:12316 IMAGE:3930143),
complete cds
Length=661
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Query 1 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 17
>gb|AC007655.1| Homo sapiens 12p13 BAC RPCI11-233G1 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=180069
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96514 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 96563
>gb|DQ004248.1| Homo sapiens matrix Gla protein (MGP) gene, complete cds
Length=9926
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3104 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 3055
>gb|BC093078.1| Homo sapiens matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:111227
IMAGE:30405585), complete cds
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 17
>gb|AF067176.1|AF067176 Homo sapiens matrix GLA protein (MGP) gene, promoter region and
partial cds
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Sbjct 1906 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 1857
>gb|M55270.1|HUMMGPA Homo sapiens matrix Gla protein (MGP) gene, complete cds
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Sbjct 3457 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 3408
>ref|XM_010368463.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana matrix Gla protein (MGP),
mRNA
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Sbjct 80 CATGGTCTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 31
>ref|XM_009180273.1| PREDICTED: Papio anubis matrix Gla protein (MGP), mRNA
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Query 1 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 CATGGTCTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 234
>ref|XM_007967755.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus matrix Gla protein (MGP), mRNA
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|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 CATGGTCTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 186
>ref|XM_005570218.1| PREDICTED: Macaca fascicularis matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X2, mRNA
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|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 CATGGTCTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 141
>ref|XM_005570217.1| PREDICTED: Macaca fascicularis matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 218 CATGGTCTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 169
>ref|NM_001131542.1| Pongo abelii matrix Gla protein (MGP), mRNA
emb|CR857858.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468D0810 (from clone DKFZp468D0810)
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Query 1 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 CATGGTTTCCTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 16
>ref|XM_520764.4| PREDICTED: Pan troglodytes matrix Gla protein (MGP), mRNA
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Sbjct 132 CATAGTTTCTTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 83
>ref|XM_003816517.2| PREDICTED: Pan paniscus matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X2, mRNA
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||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 CATAGTTTCTTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 88
>ref|XM_003816518.2| PREDICTED: Pan paniscus matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 50
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 131 CATAGTTTCTTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 82
>ref|XM_004052791.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=1934
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Query 1 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 50
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 131 CATGGTTTCTTCCTGCGGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 82
>ref|XM_004052790.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=726
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Query 1 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 50
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 CATGGTTTCTTCCTGCGGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 88
>ref|XM_004052789.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=1802
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Query 1 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 50
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CATGGTTTCTTCCTGCGGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 25
>ref|XM_004052788.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=1865
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 50
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 CATGGTTTCTTCCTGCGGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAG 88
>emb|X53331.1| Human mRNA for matrix Gla protein
Length=603
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGT-CTTGTGTAGCAGCA 46
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 49 CATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTTCTTGTGTAGCAGCA 3
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG
>ref|XM_520764.4| PREDICTED: Pan troglodytes matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=689
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 388
>ref|XM_003816517.2| PREDICTED: Pan paniscus matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X2, mRNA
Length=694
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
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Sbjct 344 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 393
>ref|XM_003816518.2| PREDICTED: Pan paniscus matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X1, mRNA
Length=763
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
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Sbjct 413 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 462
>gb|KJ897187.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06581 MGP
gene, encodes complete protein
Length=441
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
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Sbjct 275 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 324
>ref|XM_003265543.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys matrix Gla protein, transcript
variant 4 (MGP), mRNA
Length=1731
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
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Sbjct 413 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 462
>ref|XM_004092109.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=710
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 393
>ref|XM_004052791.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=1934
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 462
>ref|XM_004052790.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=726
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 393
>ref|XM_004052789.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=1802
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 330
>ref|XM_004052788.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=1865
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 393
>ref|XM_003265540.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys matrix Gla protein, transcript
variant 1 (MGP), mRNA
Length=1662
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 393
>ref|NG_023331.1| Homo sapiens matrix Gla protein (MGP), RefSeqGene on chromosome
12
Length=11739
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8679 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 8728
>ref|NM_001190839.1| Homo sapiens matrix Gla protein (MGP), transcript variant 1,
mRNA
Length=1473
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 462
>ref|NM_000900.3| Homo sapiens matrix Gla protein (MGP), transcript variant 2,
mRNA
Length=1398
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 387
>dbj|AK312029.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92305, Homo sapiens matrix Gla protein
(MGP), mRNA
Length=375
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 322
>gb|DQ895707.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010167; FLH186829.01L;
RZPDo839A1262D matrix Gla protein (MGP) gene, encodes
complete protein
Length=352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 232 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 281
>gb|DQ892495.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005125; FLH186833.01X; RZPDo839A1272D
matrix Gla protein (MGP) gene, encodes complete
protein
Length=352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 232 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 281
>gb|BC070314.1| Homo sapiens matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:88316 IMAGE:6653229),
complete cds
Length=624
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 246 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 295
>gb|BT007968.1| Synthetic construct Homo sapiens matrix Gla protein mRNA, partial
cds
Length=312
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 259
>gb|BT006733.1| Homo sapiens matrix Gla protein mRNA, complete cds
Length=312
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 259
>gb|BC005272.1| Homo sapiens matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:12316 IMAGE:3930143),
complete cds
Length=661
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 322
>gb|AC007655.1| Homo sapiens 12p13 BAC RPCI11-233G1 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=180069
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92966 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 92917
>gb|DQ004248.1| Homo sapiens matrix Gla protein (MGP) gene, complete cds
Length=9926
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6652 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 6701
>gb|BC093078.1| Homo sapiens matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:111227
IMAGE:30405585), complete cds
Length=1363
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 322
>ref|NM_001131542.1| Pongo abelii matrix Gla protein (MGP), mRNA
emb|CR857858.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468D0810 (from clone DKFZp468D0810)
Length=749
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 321
>emb|CR450358.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C013D
for gene MGP, matrix Gla protein; complete cds; without stopcodon
Length=309
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 210 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 259
>gb|AY890046.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH025928.01X matrix Gla
protein (MGP) mRNA, complete cds
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 210 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 259
>gb|AY890045.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH025927.01X matrix Gla
protein (MGP) mRNA, complete cds
Length=312
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 210 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 259
>gb|AY892523.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH025923.01L matrix Gla
protein (MGP) mRNA, partial cds
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 210 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 259
>gb|AY542304.1| Homo sapiens GIG36 mRNA, complete cds
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Sbjct 221 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 270
>emb|X07362.1| Human mRNA for matrix Gla protein (MGP)
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Sbjct 216 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 265
>gb|M58549.1|HUMMGPCD Human matrix Gla protein (MGP) mRNA, complete cds
Length=585
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Sbjct 236 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 285
>gb|M55270.1|HUMMGPA Homo sapiens matrix Gla protein (MGP) gene, complete cds
Length=7734
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Sbjct 7064 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 7113
>emb|X53331.1| Human mRNA for matrix Gla protein
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Sbjct 256 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 305
>ref|XM_003934558.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis matrix Gla protein
(MGP), mRNA
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Sbjct 344 GGAAGCCTGTGATGACTACAAACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 393
>ref|XM_010368463.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana matrix Gla protein (MGP),
mRNA
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Sbjct 287 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTATGCCATGGTTTATG 336
>ref|XM_009180273.1| PREDICTED: Papio anubis matrix Gla protein (MGP), mRNA
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Sbjct 490 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTATGCCATGGTTTATG 539
>ref|XM_007967755.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus matrix Gla protein (MGP), mRNA
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Sbjct 442 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTATGCCATGGTTTATG 491
>ref|XM_006199891.1| PREDICTED: Vicugna pacos matrix Gla protein (MGP), mRNA
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Sbjct 213 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTCTATG 262
>ref|XM_005570218.1| PREDICTED: Macaca fascicularis matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 397 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTATGCCATGGTTTATG 446
>ref|XM_005570217.1| PREDICTED: Macaca fascicularis matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 500 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTATGCCATGGTTTATG 549
>ref|NM_001195379.1| Macaca mulatta matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=636
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Sbjct 288 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTATGCCATGGTTTATG 337
>gb|AC198104.5| MACACA MULATTA BAC clone CH250-357M16 from chromosome 11, complete
sequence
Length=153166
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Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
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Sbjct 96602 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTATGCCATGGTTTATG 96651
>ref|XM_006192108.1| PREDICTED: Camelus ferus matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=497
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Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
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Sbjct 213 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTATGCCATGGTCTATG 262
>ref|XM_003639976.2| PREDICTED: Canis lupus familiaris matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=652
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Query 1 GGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 50
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Sbjct 307 GGAAGCCTGTGATGACTTCAAGCTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG 356
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Lambda K H
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reads
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 14804609 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 14804560
>gb|DS990684.1| Homo sapiens SCAF_1112675837353 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=21675586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 5444189 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 5444140
>gb|CH003507.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=139801695
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 15876306 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 15876257
>gb|CH003459.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=131157419
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 18585466 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 18585417
>gb|CH471094.1| Homo sapiens 211000035840172 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=21456322
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 5294886 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 5294837
>ref|NW_001838052.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188408, whole genome shotgun sequence
gb|DS486046.1| Homo sapiens SCAF_1103279188408 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=21675488
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 5444153 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 5444104
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000473.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=130617856
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 14804670 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 14804621
>gb|CM000263.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=133516800
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 20180202 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 20180153
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG
>ref|XM_010368463.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=635
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
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Sbjct 72 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 23
>ref|XM_009180273.1| PREDICTED: Papio anubis matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=839
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
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Sbjct 275 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 226
>ref|XM_007967755.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=790
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 227 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 178
>ref|XM_005570218.1| PREDICTED: Macaca fascicularis matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X2, mRNA
Length=745
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
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Sbjct 182 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 133
>ref|XM_005570217.1| PREDICTED: Macaca fascicularis matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X1, mRNA
Length=848
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
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Sbjct 210 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 161
>ref|NG_023331.1| Homo sapiens matrix Gla protein (MGP), RefSeqGene on chromosome
12
Length=11739
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
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Sbjct 5123 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 5074
>ref|NM_001190839.1| Homo sapiens matrix Gla protein (MGP), transcript variant 1,
mRNA
Length=1473
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
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Sbjct 123 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 74
>ref|NM_000900.3| Homo sapiens matrix Gla protein (MGP), transcript variant 2,
mRNA
Length=1398
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 74
>dbj|AK312029.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92305, Homo sapiens matrix Gla protein
(MGP), mRNA
Length=375
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
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Sbjct 58 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 9
>dbj|AK310040.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17082
Length=1316
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
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Sbjct 58 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 9
>gb|BC005272.1| Homo sapiens matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:12316 IMAGE:3930143),
complete cds
Length=661
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
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Sbjct 58 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 9
>gb|AC007655.1| Homo sapiens 12p13 BAC RPCI11-233G1 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=180069
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96522 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 96571
>gb|DQ004248.1| Homo sapiens matrix Gla protein (MGP) gene, complete cds
Length=9926
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3096 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 3047
>gb|BC093078.1| Homo sapiens matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:111227
IMAGE:30405585), complete cds
Length=1363
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 9
>gb|AF067176.1|AF067176 Homo sapiens matrix GLA protein (MGP) gene, promoter region and
partial cds
Length=1910
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1898 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 1849
>gb|M55270.1|HUMMGPA Homo sapiens matrix Gla protein (MGP) gene, complete cds
Length=7734
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3449 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 3400
>ref|XM_520764.4| PREDICTED: Pan troglodytes matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=689
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 75
>ref|XM_003816517.2| PREDICTED: Pan paniscus matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X2, mRNA
Length=694
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 80
>ref|XM_003816518.2| PREDICTED: Pan paniscus matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X1, mRNA
Length=763
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 74
>ref|NM_001131542.1| Pongo abelii matrix Gla protein (MGP), mRNA
emb|CR857858.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468D0810 (from clone DKFZp468D0810)
Length=749
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 8
>ref|XM_003265543.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys matrix Gla protein, transcript
variant 4 (MGP), mRNA
Length=1731
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123 CGTCCTGCAGGTCAGGCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 74
>ref|XM_004092109.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=710
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 CGTCCTGCAGGTCAGGCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 80
>ref|XM_003265540.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys matrix Gla protein, transcript
variant 1 (MGP), mRNA
Length=1662
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 CGTCCTGCAGGTCAGGCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 80
>ref|NM_001195379.1| Macaca mulatta matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=636
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCGGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 24
>gb|AC198104.5| MACACA MULATTA BAC clone CH250-357M16 from chromosome 11, complete
sequence
Length=153166
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 93060 CGTCCTGCAGGTCAGTCTCGGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 93011
>ref|XM_004052791.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=1934
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCCTGCGGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 74
>ref|XM_004052790.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=726
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 TCCTGCGGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 80
>ref|XM_004052789.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=1802
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 TCCTGCGGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 17
>ref|XM_004052788.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=1865
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 TCCTGCGGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAGAG 80
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG
>ref|XM_520764.4| PREDICTED: Pan troglodytes matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=689
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 349
>ref|XM_003816517.2| PREDICTED: Pan paniscus matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X2, mRNA
Length=694
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 354
>ref|XM_003816518.2| PREDICTED: Pan paniscus matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X1, mRNA
Length=763
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 374 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 423
>gb|KJ897187.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06581 MGP
gene, encodes complete protein
Length=441
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 285
>ref|XM_003265543.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys matrix Gla protein, transcript
variant 4 (MGP), mRNA
Length=1731
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 374 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 423
>ref|XM_004092109.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=710
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 354
>ref|XM_004052791.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=1934
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 374 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 423
>ref|XM_004052790.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=726
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 354
>ref|XM_004052789.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla matrix Gla protein (MGP),
mRNA
Length=1802
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
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Sbjct 242 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 291
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mRNA
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 305 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 354
>ref|XM_003265540.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys matrix Gla protein, transcript
variant 1 (MGP), mRNA
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 305 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 354
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12
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 8640 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 8689
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mRNA
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Sbjct 374 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 423
>ref|NM_000900.3| Homo sapiens matrix Gla protein (MGP), transcript variant 2,
mRNA
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Sbjct 299 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 348
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(MGP), mRNA
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Sbjct 234 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 283
>gb|DQ895707.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010167; FLH186829.01L;
RZPDo839A1262D matrix Gla protein (MGP) gene, encodes
complete protein
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Sbjct 193 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 242
>gb|DQ892495.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005125; FLH186833.01X; RZPDo839A1272D
matrix Gla protein (MGP) gene, encodes complete
protein
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Sbjct 193 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 242
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complete cds
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 207 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 256
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cds
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Sbjct 171 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 220
>gb|BT006733.1| Homo sapiens matrix Gla protein mRNA, complete cds
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Sbjct 171 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 220
>gb|BC005272.1| Homo sapiens matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:12316 IMAGE:3930143),
complete cds
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 234 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 283
>gb|AC007655.1| Homo sapiens 12p13 BAC RPCI11-233G1 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
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Sbjct 93005 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 92956
>gb|DQ004248.1| Homo sapiens matrix Gla protein (MGP) gene, complete cds
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Sbjct 6613 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 6662
>gb|BC093078.1| Homo sapiens matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:111227
IMAGE:30405585), complete cds
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Sbjct 234 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 283
>emb|CR450358.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C013D
for gene MGP, matrix Gla protein; complete cds; without stopcodon
Length=309
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Sbjct 171 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 220
>gb|AY890046.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH025928.01X matrix Gla
protein (MGP) mRNA, complete cds
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Sbjct 171 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 220
>gb|AY890045.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH025927.01X matrix Gla
protein (MGP) mRNA, complete cds
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 171 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 220
>gb|AY892523.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH025923.01L matrix Gla
protein (MGP) mRNA, partial cds
Length=312
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 171 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 220
>gb|AY542304.1| Homo sapiens GIG36 mRNA, complete cds
Length=394
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 182 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 231
>emb|X07362.1| Human mRNA for matrix Gla protein (MGP)
Length=563
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 177 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 226
>gb|M58549.1|HUMMGPCD Human matrix Gla protein (MGP) mRNA, complete cds
Length=585
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Sbjct 197 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 246
>gb|M55270.1|HUMMGPA Homo sapiens matrix Gla protein (MGP) gene, complete cds
Length=7734
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 7025 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 7074
>emb|X53331.1| Human mRNA for matrix Gla protein
Length=603
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 217 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 266
>ref|XM_010368463.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana matrix Gla protein (MGP),
mRNA
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 248 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAACAGGGAAGCCTGTG 297
>ref|XM_007967755.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=790
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 403 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAACAGGGAAGCCTGTG 452
>ref|XM_005570218.1| PREDICTED: Macaca fascicularis matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X2, mRNA
Length=745
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 358 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAACAGGGAAGCCTGTG 407
>ref|XM_005570217.1| PREDICTED: Macaca fascicularis matrix Gla protein (MGP), transcript
variant X1, mRNA
Length=848
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 461 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAACAGGGAAGCCTGTG 510
>ref|NM_001195379.1| Macaca mulatta matrix Gla protein (MGP), mRNA
Length=636
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 249 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAACAGGGAAGCCTGTG 298
>gb|AC198104.5| MACACA MULATTA BAC clone CH250-357M16 from chromosome 11, complete
sequence
Length=153166
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 96563 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAACAGGGAAGCCTGTG 96612
>ref|NM_001131542.1| Pongo abelii matrix Gla protein (MGP), mRNA
emb|CR857858.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468D0810 (from clone DKFZp468D0810)
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Query 1 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTG 50
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Sbjct 233 GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAACTCAATAGGGAAGCCTGTG 282
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1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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12 12 15037174 15038778 5M1504N95M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CGCTAAGGCGGCCAGGATGGCAAGAAGGATCAGGCTCTTCATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTAGCAGCAGTAGGGAGAG
12 12 15037177 15038762 2M1485N98M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATAACACAAAGTTACTACCGCTAAGGCGGCCAGGATGGCAAGAAGGATCAGGCTCTTCATGGTTTCGTCCTGCAGGTCAGTCTCAGGGTCTTGTGTA
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12 12 15038765 15035128 15M15035213F85m GCAGTAGGGAGAGAG GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTT
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12 12 15038769 15035124 11M15035213F89m TAGGGAGAGAG GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATG
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12 12 15038770 15035123 10M15035213F90m AGGGAGAGAG GCTCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATGG
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12 12 15038772 15035121 8M15035213F92m GGAGAGAG GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATGGAT
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12 12 15038775 15035118 5M15035213F95m GAGAG GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATGGATACA
12 12 15038775 15035118 5M15035213F95m GAGAG GATCCGAGAACGCTCTAAGCCTGTCCACGAGCTCAATAGGGAAGCCTGTGATGACTACAGACTTTGCGAACGCTACGCCATGGTTTATGGATACA
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 43232624 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 43232673
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HSCHR5_CTG1
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assembly
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 43222624 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 43222673
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genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 43234056 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 43234105
>ref|NW_004929321.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150105.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=46395306
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 43224056 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 43224105
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shotgun sequence
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 3248719 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 3248670
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shotgun sequence
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 5585310 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 5585359
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 43183508 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 43183557
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shotgun sequence
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 7526057 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 7526106
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 44915861 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 44915910
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 42949412 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 42949461
>ref|NW_001838933.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188142, whole genome shotgun sequence
gb|DS486084.1| Homo sapiens SCAF_1103279188142 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 7525871 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 7525920
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sequence
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 8834166 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 8834215
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 43183260 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 43183309
>gb|CM000256.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=176344326
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 43123652 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 43123701
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC
>ref|NC_000012.12| Homo sapiens chromosome 12, GRCh38 Primary Assembly
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 49131369 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 49131320
>ref|NT_029419.13| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR12_CTG2_1
gb|GL000107.2| Homo sapiens chromosome 12 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 11896117 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 11896068
>ref|NC_018923.2| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001620.2| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=133671515
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 49490962 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 49490913
>ref|NW_004929384.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150168.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=71519448
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 11669285 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 11669236
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shotgun sequence
Length=17238403
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12099325 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 12099276
>gb|GL583119.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_139, whole genome
shotgun sequence
Length=5791483
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3641882 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 3641833
>gb|CM000502.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=130618000
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46556349 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 46556300
>gb|DS990715.1| Homo sapiens SCAF_1112675837139 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=12176006
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8988368 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 8988319
>gb|CH003507.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=139801695
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48135020 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 48134971
>gb|CH003459.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=131157419
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46747486 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 46747437
>gb|CH471111.1| Homo sapiens 211000035831639 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=15045545
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11865212 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 11865163
>ref|NW_001838057.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188194, whole genome shotgun sequence
gb|DS486077.1| Homo sapiens SCAF_1103279188194 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=12176042
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8988340 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 8988291
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000473.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=130617856
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46556069 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 46556020
>gb|CM000263.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=133516800
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48319306 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 48319257
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG
>ref|XM_010385409.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin alpha-1B chain (LOC104679722),
mRNA
Length=1752
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 719
>ref|XM_010385408.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin alpha-1A chain (LOC104679721),
mRNA
Length=1909
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 842
>ref|XM_010385407.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin, alpha 1c (TUBA1C),
mRNA
Length=1727
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 769
>ref|XR_748584.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin alpha-1B chain pseudogene
(LOC104666661), misc_RNA
Length=1130
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 561
>gb|KJ893019.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_02413 TUBA1B
gene, encodes complete protein
Length=1485
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 613 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 564
>tpe|HG504733.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000409017.1 (RP11-386G11.10
gene), antisense
Length=897
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 805
>tpe|HG504731.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000409015.1 (RP11-386G11.10
gene), antisense
Length=675
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 611
>emb|CU687193.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023159
3' read TUBA1B mRNA
Length=1193
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 871
>emb|CU687192.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023159
5' read TUBA1B mRNA
Length=1153
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 564 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 515
>gb|DQ894689.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009149; FLH177494.01L;
RZPDo839A11125D alpha tubulin (K-ALPHA-1) gene, encodes
complete protein
Length=1396
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 521
>gb|DQ891498.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004128; FLH177498.01X; RZPDo839A11126D
alpha tubulin (K-ALPHA-1) gene, encodes complete
protein
Length=1396
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 521
>gb|BC001209.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3502620, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3629
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2614 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 2565
>gb|BC021063.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3506521, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1862
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 47
>ref|NM_006082.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1771
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 769 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 720
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complete cds
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 627 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 578
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complete cds
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Sbjct 587 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 538
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complete cds
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Sbjct 629 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 580
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complete cds
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Sbjct 634 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 585
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Sbjct 633 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 584
>gb|BC009509.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4689 IMAGE:3533174),
complete cds
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Sbjct 630 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 581
>gb|BC009513.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4760 IMAGE:3537827),
complete cds
Length=1632
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 631 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 582
>gb|AC011603.37| Homo sapiens 12 BAC RP11-386G11 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=174400
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
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Sbjct 30152 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 30103
>dbj|AK098635.1| Homo sapiens cDNA FLJ25769 fis, clone TST06404, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 594
>dbj|AK098357.1| Homo sapiens cDNA FLJ25491 fis, clone CBR00773, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 594
>gb|BC071904.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:88583 IMAGE:6089096),
complete cds
Length=1641
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 585
>gb|BC008659.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:9918 IMAGE:3871729),
complete cds
Length=1601
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 557
>gb|BC009314.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:16616 IMAGE:4111591),
complete cds
Length=1627
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 628 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 579
>gb|BC018948.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone IMAGE:4130515)
Length=1635
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 580
>gb|BC006379.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:12832 IMAGE:4100566),
complete cds
Length=1627
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Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 580
>gb|BC011572.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:20231 IMAGE:4561240),
complete cds
Length=1648
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 580
>gb|BC006481.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4387 IMAGE:2905305),
complete cds
Length=1663
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 580
>gb|AF081484.1|AF081484 Homo sapiens alpha-tubulin isoform 1 mRNA, complete cds
Length=1356
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 499
>gb|KJ906037.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15707 TUBA1B
gene, encodes complete protein
Length=1485
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 613 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 564
>gb|KJ906036.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15706 TUBA1B
gene, encodes complete protein
Length=1485
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 613 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 564
>dbj|AB464324.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8265, Homo sapiens TUBA1B
gene for tubulin, alpha 1b, without stop codon, in Flexi system
Length=1370
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 557 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 508
>dbj|AK293337.1| Homo sapiens cDNA FLJ60097 complete cds, highly similar to Tubulin
alpha-ubiquitous chain
Length=1248
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 268 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 219
>emb|CU677793.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017297
5' read TUBA1B mRNA
Length=1192
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 564 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 515
>emb|CU679019.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017298
5' read TUBA1B mRNA
Length=997
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGG-TAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 565 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGGTAAATGGAGAACTCCAG 515
>dbj|AK289354.1| Homo sapiens cDNA FLJ78587 complete cds
Length=1623
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 643 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 594
>gb|BC008330.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3505537, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2519
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 1449
>gb|BC000431.1| Homo sapiens mRNA similar to tubulin alpha 1 (cDNA clone IMAGE:2819847)
Length=1828
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 829 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 780
>gb|BC080592.1| Homo sapiens tubulin, alpha 4a, mRNA (cDNA clone IMAGE:4541944),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=2519
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 1449
>gb|BC017004.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:22108 IMAGE:4430457),
complete cds
Length=1635
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 599 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 550
>gb|BC030820.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:23826 IMAGE:4277263),
complete cds
Length=1647
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 640 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 591
>dbj|AK094717.1| Homo sapiens cDNA FLJ37398 fis, clone BRAMY2027467, highly similar
to Tubulin alpha-ubiquitous chain
Length=3196
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 2167
>dbj|AK056693.1| Homo sapiens cDNA FLJ32131 fis, clone PEBLM2000267, highly similar
to Tubulin alpha-ubiquitous chain
Length=2531
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 1502
>dbj|AK098771.1| Homo sapiens cDNA FLJ25905 fis, clone CBR04587, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 643 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 594
>dbj|AK057773.1| Homo sapiens cDNA FLJ25044 fis, clone CBL03486, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 643 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 594
>dbj|AK026632.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22979 fis, clone KAT11379, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1645
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 643 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 594
>dbj|AK026516.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22863 fis, clone KAT01983, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1643
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 643 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 594
>gb|BC009512.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4753 IMAGE:3537301),
complete cds
Length=1645
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 627 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 578
>gb|K00558.1|HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA, complete cds
Length=1596
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 615 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCCGGGTAAATGGAGAACTCCAG 566
>ref|XR_647962.1| PREDICTED: Papio anubis tubulin alpha-1A chain-like (LOC103885071),
misc_RNA
Length=2031
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1703 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGAGTTAATGGAGAACTCCAG 1654
>ref|XR_092167.1| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin alpha-1B chain-like (LOC702433),
miscRNA
Length=860
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 536 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGAGTTAATGGAGAACTCCAG 487
>emb|CU679020.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017298
3' read TUBA1B mRNA
Length=1062
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 49/51 (96%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGA-GAACTCCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 824 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCGGGGTAAATGGAAGAACTCCAG 874
>ref|NG_024593.2| Homo sapiens tubulin, alpha 3e pseudogene (LOC100419036) on chromosome
5
Length=1544
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 650 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 601
>gb|AC114947.2| Homo sapiens chromosome 5 clone CTD-2636A23, complete sequence
Length=144405
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 24892 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 24941
>gb|AC106800.2| Homo sapiens chromosome 5 clone RP11-447H19, complete sequence
Length=177449
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGCTGGGTAAATGGAGAACTCCAG 50
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 41832 TCAACTACAGCTGTGGAAACCTGGGGTGGTGAGTAAATGGAGAACTGCAG 41783
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC
>ref|XM_010349772.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis tubulin alpha-1B chain
(LOC101046265), mRNA
Length=1666
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 65 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 114
>ref|XM_009425475.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X2, mRNA
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 148 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 197
>ref|XM_009425474.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X1, mRNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 148 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 197
>ref|XM_008951160.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 130 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 179
>tpe|HG504734.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000409018.1 (RP11-386G11.10
gene), antisense
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Sbjct 199 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 150
>ref|XM_004053078.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 3 (TUBA1B), mRNA
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 18 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 67
>ref|XM_004053077.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 2 (TUBA1B), mRNA
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 76
>ref|XM_004053076.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 1 (TUBA1B), mRNA
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 111 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 160
>dbj|AK305500.1| Pan troglodytes mRNA for tubulin alpha-ubiquitous chain, complete
cds, clone: PtsC-41-5_A05
Length=1648
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 76
>dbj|AK289354.1| Homo sapiens cDNA FLJ78587 complete cds
Length=1623
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 76
>gb|BC008330.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3505537, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2519
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 882 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 931
>gb|BC001209.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3502620, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 1998 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 2047
>gb|BC080592.1| Homo sapiens tubulin, alpha 4a, mRNA (cDNA clone IMAGE:4541944),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=2519
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 882 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 931
>ref|NM_006082.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1771
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 153 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 202
>gb|BC001128.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:2457 IMAGE:2964447),
complete cds
Length=1666
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 11 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 60
>gb|BC010494.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:17433 IMAGE:3445903),
complete cds
Length=1626
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 13 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 62
>gb|BC000696.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:2215 IMAGE:3349131),
complete cds
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 18 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 67
>gb|BC030820.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:23826 IMAGE:4277263),
complete cds
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 24 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 73
>gb|BC021564.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:31891 IMAGE:4579604),
complete cds
Length=1292
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 13 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 62
>gb|DQ400107.1| Homo sapiens alpha tubulin (K-ALPHA-1) mRNA, complete cds
Length=1616
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 17 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 66
>dbj|AK094717.1| Homo sapiens cDNA FLJ37398 fis, clone BRAMY2027467, highly similar
to Tubulin alpha-ubiquitous chain
Length=3196
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 76
>gb|BC009509.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4689 IMAGE:3533174),
complete cds
Length=1646
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 14 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 63
>ref|NM_001034095.1| Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
dbj|AB188283.1| Pan troglodytes verus k-alpha-1 mRNA for ubiquitous alpha-tubulin,
complete cds
Length=1645
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 76
>gb|BC009513.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4760 IMAGE:3537827),
complete cds
Length=1632
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 64
>gb|AC011603.37| Homo sapiens 12 BAC RP11-386G11 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=174400
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27549 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 27598
>dbj|AK098771.1| Homo sapiens cDNA FLJ25905 fis, clone CBR04587, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 76
>dbj|AK098635.1| Homo sapiens cDNA FLJ25769 fis, clone TST06404, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 76
>dbj|AK098357.1| Homo sapiens cDNA FLJ25491 fis, clone CBR00773, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 76
>dbj|AK057773.1| Homo sapiens cDNA FLJ25044 fis, clone CBL03486, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 76
>dbj|AK026632.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22979 fis, clone KAT11379, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 76
>dbj|AK026516.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22863 fis, clone KAT01983, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1643
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 76
>gb|BC071904.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:88583 IMAGE:6089096),
complete cds
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 18 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 67
>gb|BC009512.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4753 IMAGE:3537301),
complete cds
Length=1645
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 60
>gb|BC009314.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:16616 IMAGE:4111591),
complete cds
Length=1627
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 61
>gb|BC018948.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone IMAGE:4130515)
Length=1635
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 13 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 62
>gb|BC006379.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:12832 IMAGE:4100566),
complete cds
Length=1627
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 62
>gb|BC011572.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:20231 IMAGE:4561240),
complete cds
Length=1648
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 62
>gb|BC006481.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4387 IMAGE:2905305),
complete cds
Length=1663
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 62
>ref|XM_004088636.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1640
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 3 TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 37 TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 84
>ref|XM_004088635.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1653
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 95
>ref|XM_004088633.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1633
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 31 TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 78
>ref|XM_004088632.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1650
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 95
>ref|XM_010623612.1| PREDICTED: Fukomys damarensis tubulin alpha-1B chain (LOC104861955),
transcript variant X1, mRNA
Length=1653
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32 CTTGTCGAGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 81
>ref|XM_010385409.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin alpha-1B chain (LOC104679722),
mRNA
Length=1752
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 152 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGCCGCCTTCGC 201
>ref|XR_094568.3| PREDICTED: Pongo abelii tubulin alpha-1B chain-like (LOC100461286),
misc_RNA
Length=1446
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 21 CTTGTCGAGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 70
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Sbjct 41 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTT 87
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Sbjct 167 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGCCGCCTTCGC 216
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Sbjct 13 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGCCGCCTTCGC 62
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(LOC101716697), mRNA
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Sbjct 34 CTTGTCGAGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 83
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(LOC101367842), mRNA
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Sbjct 177 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTGCGC 226
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mRNA
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Sbjct 153 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTATCGCCTT 199
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Sbjct 147 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTACTCCTGCCGCCTTCGC 196
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Sbjct 67 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTCGC 116
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Sbjct 25 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTCGC 74
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(LOC100473308), mRNA
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Sbjct 49 CTTGTCAGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTGCGC 98
>dbj|AB171839.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QtrA-18920, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
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Sbjct 29 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTCGC 78
>dbj|AB171294.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-13980, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
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Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTCGC 76
>dbj|AB170788.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-10078, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
Length=1442
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 27 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTCGC 76
>dbj|AB169706.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-20727, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
Length=1692
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 68 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTCGC 117
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gene), antisense
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Query 8 GGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 897 GGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 855
>ref|XM_004428981.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum tubulin, alpha 1b (TUBA1B),
mRNA
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCT 46
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Sbjct 22 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTACTCCTGTCGCCT 67
>ref|XM_004428979.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum tubulin, alpha 1c, transcript
variant 2 (TUBA1C), mRNA
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCT 46
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Sbjct 409 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTACTCCTGTCGCCT 364
>ref|XM_010596383.1| PREDICTED: Loxodonta africana tubulin alpha-1B chain (LOC100670303),
mRNA
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 24 CTTGTCGAGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTTCCGTCGCCTTCGC 73
>ref|XM_008522082.1| PREDICTED: Equus przewalskii tubulin alpha-1C chain-like (LOC103552226),
mRNA
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGC 50
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Sbjct 28 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTACTCCTGTCGTCTGCGC 77
>ref|XM_006916907.1| PREDICTED: Pteropus alecto tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
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Query 1 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGC 44
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Sbjct 34 CTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTACTCCTGTCGC 77
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730:2863
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7 |
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genome shotgun sequence
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>ref|NW_004929384.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 3701609 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 3701658
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 46611059 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 46611108
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shotgun sequence
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 9043078 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 9043127
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Sbjct 48319288 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 48319239
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left flanking sequence - AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC
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Sbjct 783 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 734
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Sbjct 613 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 564
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Sbjct 676 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 627
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Sbjct 639 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 590
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 506 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 457
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 506 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 457
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 506 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 457
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Sbjct 507 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 458
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gene, encodes complete protein
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variant X1, mRNA
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Sbjct 782 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 733
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Sbjct 656 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 607
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Sbjct 468 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 419
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Sbjct 462 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 413
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Sbjct 553 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 504
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mRNA
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Sbjct 559 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 510
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mRNA
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Sbjct 219 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 170
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misc_RNA
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Sbjct 545 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 496
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mRNA
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Sbjct 504 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 455
>ref|XM_005896391.1| PREDICTED: Bos mutus tubulin alpha-1A chain-like (LOC102270390),
partial mRNA
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Sbjct 456 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 407
>ref|XM_005894710.1| PREDICTED: Bos mutus tubulin alpha-1C chain-like (LOC102270382),
mRNA
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Sbjct 450 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 401
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Sbjct 576 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 527
>ref|XM_005680002.1| PREDICTED: Capra hircus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
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Sbjct 566 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 517
>ref|XM_005680001.1| PREDICTED: Capra hircus tubulin, alpha 1c (TUBA1C), mRNA
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Sbjct 544 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 495
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Sbjct 532 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 483
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1341 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 1292
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Sbjct 782 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 733
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mRNA
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Sbjct 866 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 817
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mRNA
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Sbjct 786 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 737
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 547 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 498
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 489 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 440
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Sbjct 727 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 678
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Sbjct 664 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 615
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Sbjct 846 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 797
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Sbjct 547 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 498
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misc_RNA
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Sbjct 535 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 486
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Sbjct 563 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 514
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mRNA
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Sbjct 545 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 496
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mRNA
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Sbjct 558 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 509
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Sbjct 874 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 825
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mRNA
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Sbjct 538 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 489
>ref|XM_003252193.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like, transcript
variant 2 (LOC100604350), mRNA
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Sbjct 1341 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 1292
>ref|XM_004088632.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 555 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 506
>ref|XM_003252192.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like, transcript
variant 1 (LOC100604350), mRNA
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Sbjct 786 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 737
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mRNA
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Sbjct 922 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 971
>ref|XM_004088628.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys uncharacterized LOC101176789 (LOC101176789),
mRNA
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Sbjct 942 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 991
>ref|XM_004092856.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, alpha 1c (TUBA1C), mRNA
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 679 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 630
>ref|XM_004065266.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1c (TUBA1C),
mRNA
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Sbjct 595 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 546
>ref|XM_004053078.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 3 (TUBA1B), mRNA
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Sbjct 398 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 349
>ref|XM_004053077.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 2 (TUBA1B), mRNA
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 762 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 713
>ref|XM_004053076.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 1 (TUBA1B), mRNA
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 620 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 571
>ref|XM_004009118.1| PREDICTED: Ovis aries tubulin alpha chain-like (LOC101120326),
mRNA
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 486 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 437
>ref|XR_173135.1| PREDICTED: Ovis aries tubulin alpha-1C chain-like (LOC101119975),
misc_RNA
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 539 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 490
>ref|XM_004007416.1| PREDICTED: Ovis aries tubulin, alpha 1c (TUBA1C), mRNA
Length=1982
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 761 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 712
>ref|XM_004006382.1| PREDICTED: Ovis aries tubulin, alpha 4a (TUBA4A), mRNA
Length=1602
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 510 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 461
>ref|XM_004003805.1| PREDICTED: Ovis aries tubulin alpha-1C chain-like (LOC101121396),
mRNA
Length=1597
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 585 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 536
>ref|XM_003793608.1| PREDICTED: Otolemur garnettii uncharacterized LOC100946844 (LOC100946844),
mRNA
Length=1094
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 1028 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 1077
>ref|XM_003793607.1| PREDICTED: Otolemur garnettii uncharacterized LOC100946844 (LOC100946844),
mRNA
Length=1150
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 1084 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 1133
>ref|XM_003793606.1| PREDICTED: Otolemur garnettii uncharacterized LOC100946844 (LOC100946844),
mRNA
Length=1167
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 1101 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 1150
>ref|XM_003793605.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tubulin, alpha 1a, transcript variant
2 (TUBA1A), mRNA
Length=1886
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 787 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 738
>ref|XM_003793604.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tubulin, alpha 1a, transcript variant
1 (TUBA1A), mRNA
Length=2258
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 1159 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 1110
>dbj|AK305500.1| Pan troglodytes mRNA for tubulin alpha-ubiquitous chain, complete
cds, clone: PtsC-41-5_A05
Length=1648
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 536 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 487
>ref|NM_001195392.1| Macaca mulatta tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1639
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 534 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 485
>ref|NM_001195391.1| Macaca mulatta tubulin, alpha 1a (TUBA1A), mRNA
Length=1677
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 531 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 482
>ref|NM_001166505.1| Bos taurus tubulin, alpha 1a (TUBA1A), mRNA
Length=1921
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 783 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 734
>dbj|AK293589.1| Homo sapiens cDNA FLJ55956 complete cds, highly similar to Tubulin
alpha-6 chain
Length=1692
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 630
>dbj|AB464324.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8265, Homo sapiens TUBA1B
gene for tubulin, alpha 1b, without stop codon, in Flexi system
Length=1370
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 450 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 401
>emb|CU687192.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023159
5' read TUBA1B mRNA
Length=1153
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 457 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 408
>emb|CU676808.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017294
5' read TUBA1C mRNA
Length=1019
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 457 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 408
>emb|CU677793.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017297
5' read TUBA1B mRNA
Length=1192
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 457 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 408
>emb|CU678818.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100019456
5' read TUBA1C mRNA
Length=989
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 457 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 408
>emb|CU675203.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017296
5' read TUBA1C mRNA
Length=994
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 457 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 408
>dbj|AK289354.1| Homo sapiens cDNA FLJ78587 complete cds
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 536 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 487
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RZPDo839D0167D tubulin, alpha 6 (TUBA6) gene, encodes
complete protein
Length=1390
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 463 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 414
>gb|DQ894689.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009149; FLH177494.01L;
RZPDo839A11125D alpha tubulin (K-ALPHA-1) gene, encodes
complete protein
Length=1396
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 463 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 414
>gb|DQ892986.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005616; FLH191425.01X; RZPDo839D0177D
tubulin, alpha 6 (TUBA6) gene, encodes complete
protein
Length=1390
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 463 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 414
>gb|DQ891498.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004128; FLH177498.01X; RZPDo839A11126D
alpha tubulin (K-ALPHA-1) gene, encodes complete
protein
Length=1396
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 463 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 414
>dbj|AB171294.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-13980, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
Length=1640
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 536 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 487
>ref|NM_001284836.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925047 (LOC101925047),
mRNA
dbj|AB170378.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10558, similar to
human tubulin, alpha 3 (TUBA3), mRNA, RefSeq: NM_006009.2
Length=1525
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 446 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 397
>ref|NM_001283388.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865772 (LOC101865772),
mRNA
dbj|AB170311.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10272, similar to
human tubulin, alpha 3 (TUBA3), mRNA, RefSeq: NM_006009.2
Length=1621
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 541 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 492
>gb|BC008330.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3505537, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2519
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 1391 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 1342
>gb|BC001209.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3502620, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3629
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 2507 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 2458
>gb|BC000431.1| Homo sapiens mRNA similar to tubulin alpha 1 (cDNA clone IMAGE:2819847)
Length=1828
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 722 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 673
>gb|BC080592.1| Homo sapiens tubulin, alpha 4a, mRNA (cDNA clone IMAGE:4541944),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=2519
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 1391 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 1342
>ref|NM_006082.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1771
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 662 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 613
>gb|BC001128.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:2457 IMAGE:2964447),
complete cds
Length=1666
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 520 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 471
>gb|BC015883.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:10192 IMAGE:3909374),
complete cds
Length=1582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 480 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 431
>gb|BC017004.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:22108 IMAGE:4430457),
complete cds
Length=1635
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 492 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 443
>gb|BC010494.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:17433 IMAGE:3445903),
complete cds
Length=1626
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 522 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 473
>gb|BC000696.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:2215 IMAGE:3349131),
complete cds
Length=1634
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 527 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 478
>gb|BC030820.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:23826 IMAGE:4277263),
complete cds
Length=1647
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 484
>gb|DQ400107.1| Homo sapiens alpha tubulin (K-ALPHA-1) mRNA, complete cds
Length=1616
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 477
>dbj|AK094717.1| Homo sapiens cDNA FLJ37398 fis, clone BRAMY2027467, highly similar
to Tubulin alpha-ubiquitous chain
Length=3196
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2109 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 2060
>dbj|AK056693.1| Homo sapiens cDNA FLJ32131 fis, clone PEBLM2000267, highly similar
to Tubulin alpha-ubiquitous chain
Length=2531
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 1444 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 1395
>gb|BC009509.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4689 IMAGE:3533174),
complete cds
Length=1646
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 523 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 474
>ref|NM_001034204.1| Bos taurus tubulin, alpha 1c (TUBA1C), mRNA
gb|BC102116.1| Bos taurus tubulin, alpha 4a, mRNA (cDNA clone MGC:126961 IMAGE:7929132),
complete cds
Length=1570
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 496
>dbj|AB169706.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-20727, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
Length=1692
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 528
>dbj|AB169698.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-19314, similar to
human tubulin, alpha 3 (TUBA3), mRNA, RefSeq: NM_006009.2
Length=1702
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 506
>dbj|AK223024.1| Homo sapiens mRNA for tubulin alpha 6 variant, clone: JTH01540
Length=1574
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 492
>ref|NM_001034095.1| Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
dbj|AB188283.1| Pan troglodytes verus k-alpha-1 mRNA for ubiquitous alpha-tubulin,
complete cds
Length=1645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 487
>gb|BC009513.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4760 IMAGE:3537827),
complete cds
Length=1632
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 475
>gb|AF141923.2|AF141923 Macaca mulatta macula lutea alpha-tubulin mRNA, partial cds
Length=1404
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 365
>gb|AC125611.4| Homo sapiens 12 BAC RP11-161H23 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=194578
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 175255 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 175304
>gb|AC011603.37| Homo sapiens 12 BAC RP11-386G11 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=174400
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30045 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 29996
>dbj|AK098771.1| Homo sapiens cDNA FLJ25905 fis, clone CBR04587, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 536 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 487
>dbj|AK098635.1| Homo sapiens cDNA FLJ25769 fis, clone TST06404, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 487
>dbj|AK098357.1| Homo sapiens cDNA FLJ25491 fis, clone CBR00773, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 487
>dbj|AK057773.1| Homo sapiens cDNA FLJ25044 fis, clone CBL03486, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 487
>dbj|AK026632.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22979 fis, clone KAT11379, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 487
>dbj|AK026516.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22863 fis, clone KAT01983, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1643
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 487
>gb|AY892621.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH028896.01L tubulin
alpha 6 (TUBA6) mRNA, partial cds
Length=1350
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 392
>gb|BC071904.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:88583 IMAGE:6089096),
complete cds
Length=1641
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 527 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 478
>gb|BC063036.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:64889 IMAGE:4397636),
complete cds
Length=1614
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 563 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 514
>gb|BC008659.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:9918 IMAGE:3871729),
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Sbjct 527 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 480
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Sbjct 530 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 483
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mRNA
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Sbjct 563 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 516
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 453 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 406
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 502 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 455
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transcript variant X1, mRNA
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5' read TUBA1B mRNA
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Sbjct 509 AGAACCGGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 460
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Sbjct 587 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 538
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(LOC101047200), mRNA
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Sbjct 782 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 733
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(LOC101046265), mRNA
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Sbjct 574 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 525
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pseudogene (LOC101041981), misc_RNA
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Sbjct 453 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 404
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1331 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 1282
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misc_RNA
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Sbjct 550 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACAAAGAAGCCCTGAAGAC 501
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 621 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 572
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misc_RNA
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Sbjct 488 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 439
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mRNA
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Sbjct 778 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 729
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mRNA
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Sbjct 448 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 399
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Sbjct 530 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 481
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misc_RNA
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Sbjct 473 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 424
>ref|XR_087342.3| PREDICTED: Callithrix jacchus tubulin alpha-1B chain-like (LOC100393380),
misc_RNA
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Sbjct 508 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 459
>ref|XM_008832861.1| PREDICTED: Nannospalax galili tubulin alpha-1B chain-like (LOC103733937),
mRNA
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Sbjct 560 AGAGCCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 511
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(LOC103732184), misc_RNA
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Sbjct 435 AGAGCCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 386
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gene, encodes complete protein
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 577 AGAGCCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 528
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Sbjct 790 AGAACCAGTTCCCCCACCTAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 741
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1b (TUBA1B), mRNA
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Sbjct 561 AGAACCAGTTCCCCCACCTAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 512
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chain-like (LOC103020611), mRNA
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Sbjct 509 AGAACCAGTTCCCCCACCTAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 460
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partial mRNA
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Sbjct 537 AGAACCAGTTCCCCTACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 488
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 441 AGAAACAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 392
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variant X2, mRNA
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Sbjct 444 AGAACCAGTTCCCCCGCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 395
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variant X1, mRNA
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Sbjct 568 AGAACCAGTTCCCCCGCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 519
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Sbjct 735 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGCAGAC 686
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Sbjct 553 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGCAGAC 504
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mRNA
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Sbjct 468 AGAACCAGATCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 419
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mRNA
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Sbjct 435 AGAACCAGATCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 386
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mRNA
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Sbjct 787 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAGAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 738
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mRNA
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Sbjct 630 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCTTGAAGAC 581
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misc_RNA
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Sbjct 447 AGAACCAGTTCCCACACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 398
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transcript variant X11, mRNA
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Sbjct 538 AGAACCAGTTCCCCCGCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 489
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Sbjct 541 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 492
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mRNA
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Sbjct 582 AGAACCAGTTCCTCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 533
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mRNA
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Sbjct 443 AGAACCAGTTCCTCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 394
>ref|XR_219920.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus tubulin alpha-1A chain-like (LOC101832750),
partial misc_RNA
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Sbjct 534 AGAGCCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 485
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mRNA
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Sbjct 525 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAGGAAGCCCTGAAGAC 476
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variant 2 (TUBA1C), mRNA
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Sbjct 1086 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAGGAAGCCCTGAAGAC 1037
>ref|XM_004428978.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum tubulin, alpha 1c, transcript
variant 1 (TUBA1C), mRNA
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Sbjct 601 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAGGAAGCCCTGAAGAC 552
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mRNA
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Sbjct 639 AGAACCAGTTCCCCCACCGAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 590
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mRNA
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Sbjct 785 AGAACCAGTTCCCCCACCGAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 736
>ref|XM_003252486.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1A chain-like (LOC100585634),
partial mRNA
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Sbjct 141 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 92
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variant 4 (TUBA1A), mRNA
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Sbjct 623 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 574
>ref|XM_004053081.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1a, transcript
variant 3 (TUBA1A), mRNA
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 875 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 826
>ref|XM_004053080.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1a, transcript
variant 2 (TUBA1A), mRNA
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 1347 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 1298
>ref|XM_004053079.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1a, transcript
variant 1 (TUBA1A), mRNA
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 786 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 737
>ref|XR_175845.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin alpha-1C chain-like
(LOC101125264), misc_RNA
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Sbjct 448 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAA 402
>ref|XM_003825831.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin alpha-1C chain (LOC100970502),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 621 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 572
>ref|XM_003784632.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tubulin alpha-1B chain-like (LOC100947302),
mRNA
Length=1629
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 540 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAATCCCTGAAGAC 491
>ref|NM_001270400.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1a (TUBA1A), transcript variant 3,
mRNA
Length=2018
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 874 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 825
>ref|NM_001270399.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1a (TUBA1A), transcript variant 2,
mRNA
Length=2490
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1346 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 1297
>ref|NM_006009.3| Homo sapiens tubulin, alpha 1a (TUBA1A), transcript variant 1,
mRNA
Length=1930
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 786 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 737
>dbj|AB600202.1| Callithrix jacchus DNA, marmoset major histocompatibility complex
class I B, Caja-B segment 2
Length=755821
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 566226 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 566177
>ref|NG_029287.1| Homo sapiens tubulin, alpha pseudogene 2 (TUBAP2) on chromosome
11
Length=1741
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAA 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAA 590
>gb|AC243176.3| Callithrix jacchus BAC clone CH259-217M17 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=175055
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 136400 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 136449
>gb|AC243194.3| Callithrix jacchus BAC clone CH259-127H5 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=192360
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 23119 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 23168
>dbj|AB590174.1| Synthetic construct DNA, clone: pFN21AE1483, Homo sapiens TUBA1A
gene for tubulin, alpha 1a, without stop codon, in Flexi
system
Length=1370
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Sbjct 450 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 401
>ref|XM_002807980.1| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin alpha-1C chain-like (LOC710110),
mRNA
Length=1434
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 525 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 476
>ref|NG_008966.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1a (TUBA1A), RefSeqGene on chromosome
12
Length=11280
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Sbjct 8154 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 8105
>dbj|AK298838.1| Homo sapiens cDNA FLJ53743 complete cds, highly similar to Tubulin
alpha-3 chain
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Sbjct 396 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 347
>dbj|AK293337.1| Homo sapiens cDNA FLJ60097 complete cds, highly similar to Tubulin
alpha-ubiquitous chain
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Sbjct 161 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAGGAC 112
>emb|CU675419.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100019466
5' read TUBA1A mRNA
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Sbjct 457 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 408
>dbj|AK289483.1| Homo sapiens cDNA FLJ77713 complete cds, highly similar to Homo
sapiens tubulin, alpha 3 (TUBA3), mRNA
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Sbjct 713 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 664
>gb|EU176481.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011334; FLH164103.01L;
RZPDo839C02253D tubulin, alpha 1a (TUBA1A) gene, encodes
complete protein
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Sbjct 463 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 414
>ref|NM_001114856.1| Bos taurus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
gb|BC146060.1| Bos taurus tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:159749 IMAGE:8084431),
complete cds
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Sbjct 655 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCTTGAAGAC 606
>ref|NM_001098544.1| Pan troglodytes tubulin, alpha 1a (TUBA1A), mRNA
dbj|AB222119.1| Pan troglodytes verus tuba3 mRNA for tubulin, alpha 3, complete
cds, clone: PorA0409
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Sbjct 540 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 491
>gb|DQ890579.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003209; FLH164104.01X; RZPDo839C09162D
tubulin, alpha 3 (TUBA3) gene, encodes complete
protein
Length=1396
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Sbjct 463 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 414
>gb|AC187711.3| Callithrix jacchus BAC clone CH259-39H12 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=203487
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Sbjct 37750 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 37701
>gb|AY173017.1| Cricetulus griseus alpha tubulin (Calpha1) gene, partial cds
Length=1895
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 809 AGAGCCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 760
>dbj|AK091494.1| Homo sapiens cDNA FLJ34175 fis, clone FCBBF3016018, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN, BRAIN-SPECIFIC
Length=2990
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 1978 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 1929
>gb|BC057823.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5303872, containing frame-shift
errors
Length=1681
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 540 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 491
>gb|BC006468.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1a, mRNA (cDNA clone MGC:2321 IMAGE:3528520),
complete cds
Length=1639
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 495 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 446
>gb|AF141348.1|AF141348 Homo sapiens hum-a-tub1 alpha-tubulin mRNA, partial cds
Length=1197
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 73 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 24
>gb|AF141347.1|AF141347 Homo sapiens hum-a-tub2 alpha-tubulin mRNA, complete cds
Length=1657
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 520 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 471
>dbj|AK057842.1| Homo sapiens cDNA FLJ25113 fis, clone CBR05706, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1668
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 540 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 491
>gb|AF251146.1|AF251146 Ovis aries alpha-tubulin mRNA, partial cds
Length=699
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 75 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCTTGAAGAC 26
>emb|X01703.1| Human gene for alpha-tubulin (b alpha 1)
Length=4087
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 2953 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 2904
>gb|AY889806.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH016471.01X tubulin
alpha 3 (TUBA3) mRNA, complete cds
Length=1356
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 441 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 392
>gb|AY892273.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH016467.01L tubulin
alpha 3 (TUBA3) mRNA, partial cds
Length=1356
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 441 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 392
>gb|BC050637.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1a, mRNA (cDNA clone MGC:60126 IMAGE:6050536),
complete cds
Length=1706
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 525 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 476
>dbj|AB099045.1| Bos taurus mRNA for similar to alpha-tubulin isoform 1, partial
cds, clone: ORCS12775
Length=665
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCAC-CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 AGAACCAGTTCCCCCACACAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 240
>dbj|AP002364.4| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 11 clone:RP11-121L10, complete
sequence
Length=165703
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAA 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81936 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAA 81890
>gb|AC010173.27| Homo sapiens 12 BAC RP11-977B10 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=98085
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 29012 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 29061
>gb|K00557.1|HUMTUBAFB human alpha-tubulin mRNA, 3' end
Length=1246
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
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Sbjct 114 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGAC 65
>ref|NM_001243977.1| Cricetulus griseus tubulin, alpha 1C (Tuba1c), mRNA
gb|M12329.1|CRUTUBAC Chinese hamster alpha-tubulin III mRNA, complete cds
Length=1578
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 AGAGCCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 521
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC
>ref|XM_010349772.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis tubulin alpha-1B chain
(LOC101046265), mRNA
Length=1666
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 83 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 132
>ref|XM_009425475.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X2, mRNA
Length=2120
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 215
>ref|XM_009425474.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X1, mRNA
Length=1748
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 215
>ref|XR_094568.3| PREDICTED: Pongo abelii tubulin alpha-1B chain-like (LOC100461286),
misc_RNA
Length=1446
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 39 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 88
>ref|XM_008951160.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1730
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 148 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 197
>tpe|HG504734.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000409018.1 (RP11-386G11.10
gene), antisense
Length=418
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 132
>ref|XM_004088636.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1640
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 102
>ref|XM_004088635.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1653
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 113
>ref|XM_004088633.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1633
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 96
>ref|XM_004088632.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1650
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 113
>ref|XM_004053078.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 3 (TUBA1B), mRNA
Length=1493
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 85
>ref|XM_004053077.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 2 (TUBA1B), mRNA
Length=1857
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 45 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
>ref|XM_004053076.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 1 (TUBA1B), mRNA
Length=1715
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 178
>dbj|AK305500.1| Pan troglodytes mRNA for tubulin alpha-ubiquitous chain, complete
cds, clone: PtsC-41-5_A05
Length=1648
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 45 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
>dbj|AK289354.1| Homo sapiens cDNA FLJ78587 complete cds
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 45 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
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clone ****
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clone ****
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 2016 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 2065
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**** WARNING: chimeric clone ****
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 900 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 949
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complete cds
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Sbjct 29 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 78
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Sbjct 31 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 80
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Sbjct 36 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 85
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Sbjct 42 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 91
>gb|BC021564.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:31891 IMAGE:4579604),
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Sbjct 31 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 80
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Sbjct 35 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 84
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to Tubulin alpha-ubiquitous chain
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Sbjct 45 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
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Sbjct 32 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 81
>ref|NM_001034095.1| Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
dbj|AB188283.1| Pan troglodytes verus k-alpha-1 mRNA for ubiquitous alpha-tubulin,
complete cds
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Sbjct 45 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
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Sbjct 33 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 82
>gb|AC011603.37| Homo sapiens 12 BAC RP11-386G11 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 27567 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 27616
>dbj|AK098771.1| Homo sapiens cDNA FLJ25905 fis, clone CBR04587, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 45 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
>dbj|AK098635.1| Homo sapiens cDNA FLJ25769 fis, clone TST06404, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 45 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
>dbj|AK098357.1| Homo sapiens cDNA FLJ25491 fis, clone CBR00773, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 45 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
>dbj|AK057773.1| Homo sapiens cDNA FLJ25044 fis, clone CBL03486, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 45 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
>dbj|AK026632.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22979 fis, clone KAT11379, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 45 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
>dbj|AK026516.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22863 fis, clone KAT01983, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 45 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
>gb|BC071904.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:88583 IMAGE:6089096),
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 36 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 85
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complete cds
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 8 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 57
>gb|BC009512.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4753 IMAGE:3537301),
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 30 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 79
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 31 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 80
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 31 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 80
>ref|XR_093314.3| PREDICTED: Pongo abelii tubulin alpha-1B chain-like (LOC100445542),
misc_RNA
Length=1645
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Query 1 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 59 CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTTGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 108
>ref|XR_087342.3| PREDICTED: Callithrix jacchus tubulin alpha-1B chain-like (LOC100393380),
misc_RNA
Length=1603
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Query 3 GGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 50
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Sbjct 47 GGACCCAGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCAC 94
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12 12 49522681 49523482 24M49525134F54m1575n22m GGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC CGGGCCCCGGTGTCTGCGCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 12 49522701 49523462 4M49525134F54m1575n42m AGCC CGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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12 12 49525135 49525035 100m ACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGGTGAGTAAGCCGAGCGGCTCCCGGCTGCTTTCAGGGAAGCAGGG
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Sbjct 49545474 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49545522
>ref|NW_004929384.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 11918474 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 11918522
>ref|NW_001838057.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188194, whole genome shotgun sequence
gb|DS486077.1| Homo sapiens SCAF_1103279188194 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 9043049 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 9043097
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 46610778 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 46610826
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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>ref|NC_000011.10| Homo sapiens chromosome 11, GRCh38 Primary Assembly
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 90283093 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 90283045
>ref|NT_033899.9| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR11_CTG8
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assembly
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Sbjct 2280197 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 2280149
>ref|NC_018922.2| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001619.2| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 89899368 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 89899320
>ref|NW_004929380.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 35338952 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 35338904
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shotgun sequence
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Sbjct 220619 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 220571
>gb|GL583171.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_191, whole genome
shotgun sequence
Length=4112558
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 3855993 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 3856041
>gb|CM000501.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 86099971 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 86099923
>gb|DS990670.1| Homo sapiens SCAF_1112675837213 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 30586076 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 30586124
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 90451204 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 90451156
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 86863214 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 86863166
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sequence
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 185870 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 185822
>ref|NW_001838042.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188268, whole genome shotgun sequence
gb|DS486032.1| Homo sapiens SCAF_1103279188268 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=30784356
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 30586222 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 30586270
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130895506
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 86100787 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 86100739
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Length=132164248
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 87316970 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 87316922
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGGTGAG
>ref|NC_000012.12| Homo sapiens chromosome 12, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000674.2| Homo sapiens chromosome 12, GRCh38 reference primary assembly
Length=133275309
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGGTGAG 50
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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>ref|NW_001838042.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188268, whole genome shotgun sequence
gb|DS486032.1| Homo sapiens SCAF_1103279188268 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 30586699 GTGTCTGCTCCTGTCACCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGA 30586650
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 86100310 GTGTCTGCTCCTGTCACCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGA 86100359
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1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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blast search - nt
left flanking sequence - AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG
>ref|NM_032704.4| Homo sapiens tubulin, alpha 1c (TUBA1C), transcript variant 5,
mRNA
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Sbjct 622 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 573
>ref|NM_001303117.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c (TUBA1C), transcript variant 4,
mRNA
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Sbjct 795 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 746
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Sbjct 910 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 861
>ref|NM_001303114.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c (TUBA1C), transcript variant 1,
mRNA
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Sbjct 677 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 628
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Sbjct 659 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 610
>ref|XM_010385407.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin, alpha 1c (TUBA1C),
mRNA
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Sbjct 709 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 660
>ref|XR_748584.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin alpha-1B chain pseudogene
(LOC104666661), misc_RNA
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Sbjct 501 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 452
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 709 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 660
>ref|XM_009425484.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin alpha-1C chain (LOC451876),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 772 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 723
>ref|XM_009425475.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 1027 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 978
>ref|XM_009425474.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 655 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 606
>ref|XM_009247680.1| PREDICTED: Pongo abelii tubulin alpha-1C chain (LOC100446260),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 709 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 660
>ref|XM_002823184.3| PREDICTED: Pongo abelii tubulin alpha-1B chain (LOC100445003),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 660 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 611
>ref|XM_009180673.1| PREDICTED: Papio anubis tubulin, alpha 1c (TUBA1C), transcript
variant X2, mRNA
Length=1799
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 781 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 732
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variant X1, mRNA
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Sbjct 611 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 562
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1338 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 1289
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variant X1, mRNA
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Sbjct 780 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 731
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Sbjct 674 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 625
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Sbjct 637 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 588
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 504 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 455
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 504 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 455
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Sbjct 504 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 455
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Sbjct 504 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 455
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 505 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 456
>gb|KJ893019.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_02413 TUBA1B
gene, encodes complete protein
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Sbjct 504 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 455
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mRNA
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Sbjct 537 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 488
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1339 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 1290
>ref|XM_008003128.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus tubulin, alpha 1a (TUBA1A), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 780 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 731
>ref|XM_008003125.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
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Sbjct 654 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 605
>ref|NM_001285253.1| Macaca fascicularis Tubulin alpha-1B chain (TUBA1B), mRNA
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Sbjct 574 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 525
>ref|XM_005570757.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865495 (LOC101865495),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1339 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 1290
>ref|XM_005570756.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865495 (LOC101865495),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 780 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 731
>ref|XR_120812.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, alpha 1c pseudogene (LOC100586854),
misc_RNA
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Sbjct 533 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 484
>ref|XM_004088637.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 561 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 512
>ref|XM_004088636.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 543 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 494
>ref|XM_004088635.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 556 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 507
>ref|XM_004088634.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1969
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 872 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 823
>ref|XM_004088633.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1633
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 536 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 487
>ref|XM_003252193.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like, transcript
variant 2 (LOC100604350), mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 1339 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 1290
>ref|XM_004088632.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1650
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 553 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 504
>ref|XM_003252192.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like, transcript
variant 1 (LOC100604350), mRNA
Length=1881
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 784 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 735
>ref|XM_004065266.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1c (TUBA1C),
mRNA
Length=1615
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 593 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 544
>dbj|AK305500.1| Pan troglodytes mRNA for tubulin alpha-ubiquitous chain, complete
cds, clone: PtsC-41-5_A05
Length=1648
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 534 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 485
>ref|NM_001195392.1| Macaca mulatta tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1639
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 532 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 483
>ref|NM_001195391.1| Macaca mulatta tubulin, alpha 1a (TUBA1A), mRNA
Length=1677
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 529 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 480
>dbj|AK293589.1| Homo sapiens cDNA FLJ55956 complete cds, highly similar to Tubulin
alpha-6 chain
Length=1692
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 677 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 628
>dbj|AB464324.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8265, Homo sapiens TUBA1B
gene for tubulin, alpha 1b, without stop codon, in Flexi system
Length=1370
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 448 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 399
>emb|CU687192.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023159
5' read TUBA1B mRNA
Length=1153
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 455 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 406
>emb|CU676808.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017294
5' read TUBA1C mRNA
Length=1019
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 455 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 406
>emb|CU677793.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017297
5' read TUBA1B mRNA
Length=1192
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 455 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 406
>emb|CU678818.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100019456
5' read TUBA1C mRNA
Length=989
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 455 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 406
>emb|CU675203.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017296
5' read TUBA1C mRNA
Length=994
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 455 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 406
>dbj|AK289354.1| Homo sapiens cDNA FLJ78587 complete cds
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 534 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 485
>gb|DQ896235.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010695; FLH191421.01L;
RZPDo839D0167D tubulin, alpha 6 (TUBA6) gene, encodes
complete protein
Length=1390
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 461 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 412
>gb|DQ894689.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009149; FLH177494.01L;
RZPDo839A11125D alpha tubulin (K-ALPHA-1) gene, encodes
complete protein
Length=1396
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 461 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 412
>gb|DQ892986.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005616; FLH191425.01X; RZPDo839D0177D
tubulin, alpha 6 (TUBA6) gene, encodes complete
protein
Length=1390
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 461 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 412
>gb|DQ891498.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004128; FLH177498.01X; RZPDo839A11126D
alpha tubulin (K-ALPHA-1) gene, encodes complete
protein
Length=1396
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 461 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 412
>dbj|AB171294.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-13980, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
Length=1640
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 534 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 485
>ref|NM_001284836.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925047 (LOC101925047),
mRNA
dbj|AB170378.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10558, similar to
human tubulin, alpha 3 (TUBA3), mRNA, RefSeq: NM_006009.2
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Sbjct 444 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 395
>ref|NM_001283388.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865772 (LOC101865772),
mRNA
dbj|AB170311.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10272, similar to
human tubulin, alpha 3 (TUBA3), mRNA, RefSeq: NM_006009.2
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 539 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 490
>gb|BC008330.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3505537, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 1389 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 1340
>gb|BC001209.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3502620, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 2505 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 2456
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Sbjct 720 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 671
>gb|BC080592.1| Homo sapiens tubulin, alpha 4a, mRNA (cDNA clone IMAGE:4541944),
**** WARNING: chimeric clone ****
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Sbjct 1389 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 1340
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Sbjct 660 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 611
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complete cds
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Sbjct 518 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 469
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complete cds
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Sbjct 478 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 429
>gb|BC017004.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:22108 IMAGE:4430457),
complete cds
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Sbjct 490 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 441
>gb|BC010494.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:17433 IMAGE:3445903),
complete cds
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Sbjct 520 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 471
>gb|BC000696.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:2215 IMAGE:3349131),
complete cds
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Sbjct 525 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 476
>gb|BC030820.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:23826 IMAGE:4277263),
complete cds
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Sbjct 531 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 482
>gb|DQ400107.1| Homo sapiens alpha tubulin (K-ALPHA-1) mRNA, complete cds
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Sbjct 524 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 475
>dbj|AK094717.1| Homo sapiens cDNA FLJ37398 fis, clone BRAMY2027467, highly similar
to Tubulin alpha-ubiquitous chain
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Sbjct 2107 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 2058
>dbj|AK056693.1| Homo sapiens cDNA FLJ32131 fis, clone PEBLM2000267, highly similar
to Tubulin alpha-ubiquitous chain
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Sbjct 1442 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 1393
>gb|BC009509.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4689 IMAGE:3533174),
complete cds
Length=1646
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 521 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 472
>dbj|AB169706.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-20727, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 575 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 526
>dbj|AB169698.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-19314, similar to
human tubulin, alpha 3 (TUBA3), mRNA, RefSeq: NM_006009.2
Length=1702
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 553 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 504
>dbj|AK223024.1| Homo sapiens mRNA for tubulin alpha 6 variant, clone: JTH01540
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Sbjct 539 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 490
>ref|NM_001034095.1| Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
dbj|AB188283.1| Pan troglodytes verus k-alpha-1 mRNA for ubiquitous alpha-tubulin,
complete cds
Length=1645
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 534 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 485
>gb|BC009513.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4760 IMAGE:3537827),
complete cds
Length=1632
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 522 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 473
>gb|AF141923.2|AF141923 Macaca mulatta macula lutea alpha-tubulin mRNA, partial cds
Length=1404
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Sbjct 412 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 363
>gb|AC125611.4| Homo sapiens 12 BAC RP11-161H23 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=194578
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 175257 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 175306
>gb|AC011603.37| Homo sapiens 12 BAC RP11-386G11 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=174400
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 30043 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 29994
>dbj|AK098771.1| Homo sapiens cDNA FLJ25905 fis, clone CBR04587, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
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Sbjct 534 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 485
>dbj|AK098635.1| Homo sapiens cDNA FLJ25769 fis, clone TST06404, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 534 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 485
>dbj|AK098357.1| Homo sapiens cDNA FLJ25491 fis, clone CBR00773, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 534 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 485
>dbj|AK057773.1| Homo sapiens cDNA FLJ25044 fis, clone CBL03486, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 534 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 485
>dbj|AK026632.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22979 fis, clone KAT11379, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1645
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 534 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 485
>dbj|AK026516.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22863 fis, clone KAT01983, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1643
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 534 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 485
>gb|AY892621.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH028896.01L tubulin
alpha 6 (TUBA6) mRNA, partial cds
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 439 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 390
>gb|BC071904.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:88583 IMAGE:6089096),
complete cds
Length=1641
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 525 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 476
>gb|BC063036.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:64889 IMAGE:4397636),
complete cds
Length=1614
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 561 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 512
>gb|BC008659.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:9918 IMAGE:3871729),
complete cds
Length=1601
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 497 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 448
>gb|BC019298.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:4112 IMAGE:2905506),
complete cds
Length=1534
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 501 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 452
>gb|BC009512.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4753 IMAGE:3537301),
complete cds
Length=1645
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 518 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 469
>gb|BC009314.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:16616 IMAGE:4111591),
complete cds
Length=1627
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 519 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 470
>gb|BC018948.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone IMAGE:4130515)
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 520 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 471
>gb|BC006379.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:12832 IMAGE:4100566),
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Length=1627
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 520 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 471
>gb|BC051297.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:59688 IMAGE:3832363),
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Length=1566
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 515 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 466
>gb|BC021088.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:1754 IMAGE:3543481),
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 500 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 451
>gb|BC011790.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:19827 IMAGE:4025017),
complete cds
Length=1553
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Sbjct 662 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 614
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Sbjct 844 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 796
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Sbjct 944 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 992
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Sbjct 537 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 489
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Sbjct 759 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 711
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Sbjct 508 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 460
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Sbjct 583 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 535
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Sbjct 1030 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 1078
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Sbjct 1086 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 1134
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Sbjct 1103 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 1151
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2 (TUBA1A), mRNA
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Sbjct 785 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 737
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1 (TUBA1A), mRNA
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Sbjct 1157 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 1109
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Sbjct 781 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 733
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Sbjct 543 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 495
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 48
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Sbjct 506 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGAC 459
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(LOC101046265), mRNA
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Sbjct 572 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 523
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pseudogene (LOC101041981), misc_RNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 451 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 402
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misc_RNA
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Sbjct 486 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 437
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mRNA
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Sbjct 776 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 727
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mRNA
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Sbjct 446 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 397
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Sbjct 769 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 720
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misc_RNA
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Sbjct 528 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 479
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misc_RNA
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Sbjct 471 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 422
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misc_RNA
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Sbjct 506 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 457
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mRNA
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Query 3 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 556 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 510
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(LOC103732184), misc_RNA
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Query 3 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 431 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 385
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misc_RNA
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Query 3 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 440 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 394
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transcript variant X3, mRNA
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Query 3 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 573 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 527
>ref|XM_005570758.1| PREDICTED: Macaca fascicularis tubulin, alpha 1c (TUBA1C), mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 539 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 490
>ref|XR_219920.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus tubulin alpha-1A chain-like (LOC101832750),
partial misc_RNA
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Query 3 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 530 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 484
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class I B, Caja-B segment 2
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 566224 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 566175
>gb|AC243176.3| Callithrix jacchus BAC clone CH259-217M17 from chromosome unknown,
complete sequence
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 136402 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 136451
>gb|AC243194.3| Callithrix jacchus BAC clone CH259-127H5 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=192360
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 23121 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 23170
>ref|XM_002807980.1| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin alpha-1C chain-like (LOC710110),
mRNA
Length=1434
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 523 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 474
>dbj|AK293337.1| Homo sapiens cDNA FLJ60097 complete cds, highly similar to Tubulin
alpha-ubiquitous chain
Length=1248
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 159 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAGGACCG 110
>emb|CU679019.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017298
5' read TUBA1B mRNA
Length=997
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 455 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGGCCG 406
>gb|AC187711.3| Callithrix jacchus BAC clone CH259-39H12 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=203487
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCG 50
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Sbjct 37748 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCG 37699
>gb|AY173017.1| Cricetulus griseus alpha tubulin (Calpha1) gene, partial cds
Length=1895
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Query 3 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 805 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 759
>ref|NM_001243977.1| Cricetulus griseus tubulin, alpha 1C (Tuba1c), mRNA
gb|M12329.1|CRUTUBAC Chinese hamster alpha-tubulin III mRNA, complete cds
Length=1578
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Query 3 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 566 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 520
>ref|NM_001243978.1| Cricetulus griseus tubulin, alpha 1A (Tuba1a), mRNA
gb|M12253.1|CRUTUBAB Chinese hamster alpha-tubulin II mRNA, complete cds
Length=1654
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 3 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 534 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 488
>ref|NM_001243979.1| Cricetulus griseus tubulin, alpha 1B (Tuba1b), mRNA
gb|M12252.1|CRUTUBAA Chinese hamster alpha-tubulin I mRNA, complete cds
Length=1626
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 3 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 536 CCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 490
>ref|XR_775701.1| PREDICTED: Loxodonta africana tubulin alpha-1B chain-like (LOC100665312),
misc_RNA
Length=1504
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 507 AACCGGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 459
>ref|XM_010349774.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis tubulin alpha-1C chain
(LOC101046886), mRNA
Length=1606
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 585 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 537
>ref|XM_003939124.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis tubulin alpha-1A chain
(LOC101047200), mRNA
Length=1912
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 780 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 732
>ref|XM_009425473.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1a (TUBA1A), transcript
variant X1, mRNA
Length=2461
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 1329 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 1281
>ref|XM_008951161.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin alpha-1C chain (LOC100970502),
transcript variant X1, mRNA
Length=1641
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 619 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 571
>ref|XM_008704544.1| PREDICTED: Ursus maritimus tubulin alpha-1B chain-like (LOC103675459),
mRNA
Length=1509
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 534 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 486
>ref|XM_008704542.1| PREDICTED: Ursus maritimus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1587
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 489 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 441
>gb|KJ892437.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01831 TUBA1A
gene, encodes complete protein
Length=1485
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 504 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 456
>ref|XM_008145829.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus tubulin alpha-1C chain (LOC103289950),
mRNA
Length=1452
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 441 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 396
>ref|XR_508009.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus tubulin alpha-1B chain pseudogene
(LOC103287972), misc_RNA
Length=994
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 443 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 398
>ref|XM_008140639.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus tubulin alpha-1A chain (LOC103285264),
mRNA
Length=1906
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 779 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 734
>ref|XM_007452258.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer tubulin, alpha 1a (TUBA1A), mRNA
Length=1356
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 439 AACCAGTTCCCCCGCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 391
>ref|XM_007452257.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1380
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 463 AACCAGTTCCCCCGCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 415
>ref|XM_007456416.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer tubulin alpha-1B chain-like (LOC103086172),
mRNA
Length=1359
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 442 AACCAGTTCCCCCGCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 394
>ref|XM_007198387.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni tubulin, alpha
1a (TUBA1A), mRNA
Length=1915
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 788 AACCAGTTCCCCCACCTAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 740
>ref|XM_007179293.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni tubulin, alpha
1b (TUBA1B), mRNA
Length=1658
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 559 AACCAGTTCCCCCACCTAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 511
>ref|XM_007178588.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni tubulin alpha-1B
chain-like (LOC103020611), mRNA
Length=1334
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 507 AACCAGTTCCCCCACCTAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 459
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 535 AACCAGTTCCCCTACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 487
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Sbjct 543 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCTTGAAGACC 495
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 475 CAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 430
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 436 CAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 391
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mRNA
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Sbjct 439 AACCAGTTCCCCCACCAAAGTTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 391
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variant X2, mRNA
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Sbjct 442 AACCAGTTCCCCCGCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 394
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variant X1, mRNA
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Sbjct 566 AACCAGTTCCCCCGCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 518
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(LOC102954023), mRNA
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Sbjct 547 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 499
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(LOC102953141), mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 546 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 498
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Sbjct 552 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 504
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Sbjct 539 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 491
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Sbjct 530 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 482
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mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 479 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 431
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mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 540 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 492
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partial mRNA
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Sbjct 436 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 391
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 550 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 505
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 733 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGCAGACC 685
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 551 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGCAGACC 503
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mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 466 AACCAGATCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 418
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mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 433 AACCAGATCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 385
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mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 521 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 476
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variant X2, mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 466 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 421
>ref|XM_006091516.1| PREDICTED: Myotis lucifugus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 525 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 480
>ref|XM_005896392.1| PREDICTED: Bos mutus tubulin alpha-1A chain-like (LOC102270684),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 628 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCTTGAAGACC 580
>ref|XM_005877339.1| PREDICTED: Myotis brandtii tubulin, alpha 1a (TUBA1A), mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 528 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 483
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mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 561 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 516
>ref|XM_005867647.1| PREDICTED: Myotis brandtii tubulin alpha-1B chain-like (LOC102257200),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 451 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 406
>ref|XM_005867646.1| PREDICTED: Myotis brandtii tubulin alpha-1B chain-like (LOC102257200),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 500 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 455
>ref|XM_005867645.1| PREDICTED: Myotis brandtii tubulin alpha-1B chain-like (LOC102257200),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 46
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Sbjct 457 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAG 412
>ref|XR_310868.1| PREDICTED: Capra hircus tubulin, alpha 1a pseudogene (LOC102169134),
misc_RNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 445 AACCAGTTCCCACACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 397
>ref|XM_005636879.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris tubulin, alpha 1a (TUBA1A),
transcript variant X11, mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 536 AACCAGTTCCCCCGCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 488
>ref|XM_002684678.3| PREDICTED: Bos taurus tubulin alpha-1A chain-like (LOC782966),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 580 AACCAGTTCCTCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 532
>ref|XM_005198819.1| PREDICTED: Bos taurus tubulin alpha-1B chain-like (LOC785892),
partial mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 AACCAGTTCCTCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 303
>ref|XM_001251618.5| PREDICTED: Bos taurus tubulin alpha-1A chain-like (LOC782966),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 441 AACCAGTTCCTCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 393
>ref|XM_004822196.1| PREDICTED: Mustela putorius furo tubulin, alpha 1b (LOC101692890),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 482 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 434
>ref|XM_004805811.1| PREDICTED: Mustela putorius furo tubulin, alpha 1b (TUBA1B),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 920 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 872
>ref|XM_004778926.1| PREDICTED: Mustela putorius furo tubulin, alpha 1c (TUBA1C),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 527 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 479
>ref|XM_004833880.1| PREDICTED: Mustela putorius furo tubulin, alpha 1b (LOC101692890),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 481 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 433
>ref|XM_004428981.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum tubulin, alpha 1b (TUBA1B),
mRNA
Length=1620
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 523 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAGGAAGCCCTGAAGACC 475
>ref|XM_004428979.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum tubulin, alpha 1c, transcript
variant 2 (TUBA1C), mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 1084 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAGGAAGCCCTGAAGACC 1036
>ref|XM_004428978.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum tubulin, alpha 1c, transcript
variant 1 (TUBA1C), mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 599 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAGGAAGCCCTGAAGACC 551
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(LOC101367842), mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 684 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 636
>ref|XM_004400860.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens tubulin alpha-1B chain-like
(LOC101367544), mRNA
Length=1914
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 788 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 740
>ref|XM_004400859.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens tubulin, alpha 1c, transcript
variant 2 (TUBA1C), mRNA
Length=1476
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 454 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 406
>ref|XM_004400858.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens tubulin, alpha 1c, transcript
variant 1 (TUBA1C), mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 503 AACCAGTTCCCCCTCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 455
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mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 637 AACCAGTTCCCCCACCGAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 589
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mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 783 AACCAGTTCCCCCACCGAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 735
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Sbjct 788 AACCAGTTCCCCCGCCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 740
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partial mRNA
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Sbjct 139 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 91
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variant 4 (TUBA1A), mRNA
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Sbjct 621 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 573
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variant 3 (TUBA1A), mRNA
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Sbjct 873 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 825
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variant 2 (TUBA1A), mRNA
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Sbjct 1345 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 1297
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variant 1 (TUBA1A), mRNA
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Sbjct 784 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 736
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(LOC101125264), misc_RNA
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Sbjct 446 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 398
>ref|XM_003825831.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin alpha-1C chain (LOC100970502),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 619 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 571
>ref|XM_003784632.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tubulin alpha-1B chain-like (LOC100947302),
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 538 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAATCCCTGAAGACC 490
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mRNA
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Sbjct 872 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 824
>ref|NM_001270399.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1a (TUBA1A), transcript variant 2,
mRNA
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Sbjct 1344 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 1296
>ref|NM_006009.3| Homo sapiens tubulin, alpha 1a (TUBA1A), transcript variant 1,
mRNA
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 784 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACC 736
>ref|NG_029287.1| Homo sapiens tubulin, alpha pseudogene 2 (TUBAP2) on chromosome
11
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Query 1 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACC 49
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Sbjct 634 AACCAGTTCCCCCACCAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACC 586
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGGTGAG
>ref|XM_004053078.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 3 (TUBA1B), mRNA
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGGTGA 49
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Sbjct 45 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGGTGA 93
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(LOC101046265), mRNA
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Sbjct 92 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 142
>ref|XM_009425475.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 175 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 225
>ref|XM_009425474.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 175 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 225
>ref|XR_094568.3| PREDICTED: Pongo abelii tubulin alpha-1B chain-like (LOC100461286),
misc_RNA
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 48 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 98
>ref|XM_008951160.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1730
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Sbjct 157 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 207
>ref|XM_004088636.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 62 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 112
>ref|XM_004088635.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1653
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Sbjct 73 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 123
>ref|XM_004088633.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1633
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 56 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 106
>ref|XM_004088632.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1650
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 73 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 123
>ref|XM_004053076.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 1 (TUBA1B), mRNA
Length=1715
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 138 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 188
>dbj|AK305500.1| Pan troglodytes mRNA for tubulin alpha-ubiquitous chain, complete
cds, clone: PtsC-41-5_A05
Length=1648
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Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 54 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 104
>dbj|AK289354.1| Homo sapiens cDNA FLJ78587 complete cds
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 54 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 104
>gb|BC008330.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3505537, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2519
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 909 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 959
>gb|BC001209.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3502620, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3629
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 2025 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 2075
>gb|BC000431.1| Homo sapiens mRNA similar to tubulin alpha 1 (cDNA clone IMAGE:2819847)
Length=1828
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 240 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 290
>gb|BC080592.1| Homo sapiens tubulin, alpha 4a, mRNA (cDNA clone IMAGE:4541944),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=2519
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 909 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 959
>ref|NM_006082.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1771
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 180 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 230
>gb|BC001128.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:2457 IMAGE:2964447),
complete cds
Length=1666
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 38 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 88
>gb|BC017004.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:22108 IMAGE:4430457),
complete cds
Length=1635
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
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Sbjct 10 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 60
>gb|BC010494.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:17433 IMAGE:3445903),
complete cds
Length=1626
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 40 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 90
>gb|BC000696.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:2215 IMAGE:3349131),
complete cds
Length=1634
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 45 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 95
>gb|BC030820.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:23826 IMAGE:4277263),
complete cds
Length=1647
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 51 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 101
>gb|BC021564.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:31891 IMAGE:4579604),
complete cds
Length=1292
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 40 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 90
>gb|DQ400107.1| Homo sapiens alpha tubulin (K-ALPHA-1) mRNA, complete cds
Length=1616
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 44 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 94
>gb|BC009509.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4689 IMAGE:3533174),
complete cds
Length=1646
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 41 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 91
>ref|NM_001034095.1| Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
dbj|AB188283.1| Pan troglodytes verus k-alpha-1 mRNA for ubiquitous alpha-tubulin,
complete cds
Length=1645
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 54 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 104
>gb|BC009513.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4760 IMAGE:3537827),
complete cds
Length=1632
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 42 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATGCGTGAG 92
>dbj|AK098771.1| Homo sapiens cDNA FLJ25905 fis, clone CBR04587, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
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sequence
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Query 1 GTGTCTGCTCCTGTCGCCTTCGCCTCCTAATCCCTAGCCACTATG-GTGA 49
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(LOC101125632), mRNA
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human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
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>dbj|AB169706.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-20727, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
Length=1692
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>ref|NW_004929384.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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sequence
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 11918489 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCCGTGCACTGGTCGGCC 11918538
>ref|NW_001838057.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188194, whole genome shotgun sequence
gb|DS486077.1| Homo sapiens SCAF_1103279188194 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 9043064 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCCGTGCACTGGTCGGCC 9043113
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000473.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 46610793 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCCGTGCACTGGTCGGCC 46610842
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Length=133516800
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 48372583 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCCGTGCACTGGTCGGCC 48372632
>ref|NC_000011.10| Homo sapiens chromosome 11, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000673.2| Homo sapiens chromosome 11, GRCh38 reference primary assembly
Length=135086622
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 90283078 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 90283029
>ref|NT_033899.9| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR11_CTG8
gb|GL000104.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=47073726
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 2280182 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 2280133
>ref|NC_018922.2| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001619.2| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=134889443
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 89899353 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 89899304
>ref|NW_004929380.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150164.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 35338937 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 35338888
>gb|KE141215.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold154, whole genome
shotgun sequence
Length=4200284
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 220604 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 220555
>gb|GL583171.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_191, whole genome
shotgun sequence
Length=4112558
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 3856008 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 3856057
>gb|CM000501.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130894309
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 86099956 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 86099907
>gb|DS990670.1| Homo sapiens SCAF_1112675837213 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=30784128
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 30586091 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 30586140
>gb|CH003506.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=137609055
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||
Sbjct 90451189 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 90451140
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=131853179
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||
Sbjct 86863199 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 86863150
>gb|CH471065.1| Homo sapiens 211000035833829 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=44976370
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 185855 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 185806
>ref|NW_001838042.2| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188268, whole genome shotgun sequence
gb|DS486032.1| Homo sapiens SCAF_1103279188268 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=30784356
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 30586237 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 30586286
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=130895506
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 86100772 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAAACCAGTGCACTGGTTAGCC 86100723
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=132164248
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Gapped
Lambda K H
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assembly
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Sbjct 11896119 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 11896070
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genome shotgun sequence
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 49490964 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 49490915
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 11669287 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 11669238
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shotgun sequence
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 12099327 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 12099278
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shotgun sequence
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 3641884 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 3641835
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 46556351 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 46556302
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shotgun sequence
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Sbjct 8988370 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 8988321
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Sbjct 48135022 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 48134973
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 46747488 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 46747439
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sequence
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Sbjct 11865214 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 11865165
>ref|NW_001838057.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188194, whole genome shotgun sequence
gb|DS486077.1| Homo sapiens SCAF_1103279188194 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 8988342 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 8988293
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 46556071 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 46556022
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 48319308 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 48319259
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC
>ref|NM_032704.4| Homo sapiens tubulin, alpha 1c (TUBA1C), transcript variant 5,
mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 607 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 558
>ref|NM_001303117.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c (TUBA1C), transcript variant 4,
mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 780 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 731
>ref|NM_001303115.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c (TUBA1C), transcript variant 2,
mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 895 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 846
>ref|NM_001303114.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c (TUBA1C), transcript variant 1,
mRNA
Length=1707
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 662 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 613
>ref|NM_001303116.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c (TUBA1C), transcript variant 3,
mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 777 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 728
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mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 644 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 595
>ref|XM_010385407.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin, alpha 1c (TUBA1C),
mRNA
Length=1727
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 694 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 645
>ref|XM_009425485.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin alpha-1C chain (LOC451876),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 645
>ref|XM_009425484.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin alpha-1C chain (LOC451876),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 708
>ref|XM_009425475.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X2, mRNA
Length=2120
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 963
>ref|XM_009425474.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X1, mRNA
Length=1748
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 640 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 591
>ref|XM_009247680.1| PREDICTED: Pongo abelii tubulin alpha-1C chain (LOC100446260),
mRNA
Length=1729
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 694 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 645
>ref|XM_002823184.3| PREDICTED: Pongo abelii tubulin alpha-1B chain (LOC100445003),
mRNA
Length=1749
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 596
>ref|XM_009180673.1| PREDICTED: Papio anubis tubulin, alpha 1c (TUBA1C), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 717
>ref|XM_009180672.1| PREDICTED: Papio anubis tubulin, alpha 1c (TUBA1C), transcript
variant X1, mRNA
Length=1629
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 547
>ref|XM_003906321.2| PREDICTED: Papio anubis tubulin, alpha 1a (TUBA1A), transcript
variant X2, mRNA
Length=2470
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 1274
>ref|XM_009180670.1| PREDICTED: Papio anubis tubulin, alpha 1a (TUBA1A), transcript
variant X1, mRNA
Length=1912
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 716
>ref|XM_009180669.1| PREDICTED: Papio anubis tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1767
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 610
>ref|XM_008951160.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 573
>gb|KJ906373.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_16043 TUBA1C
gene, encodes complete protein
Length=1479
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 440
>gb|KJ906372.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_16042 TUBA1C
gene, encodes complete protein
Length=1479
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 440
>gb|KJ906037.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15707 TUBA1B
gene, encodes complete protein
Length=1485
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 440
>gb|KJ906036.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15706 TUBA1B
gene, encodes complete protein
Length=1485
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 440
>gb|KJ899828.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_09222 TUBA1C
gene, encodes complete protein
Length=1480
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 441
>gb|KJ893019.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_02413 TUBA1B
gene, encodes complete protein
Length=1485
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 440
>ref|XM_008003130.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus tubulin alpha-1C chain (LOC103238262),
mRNA
Length=1555
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 522 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 473
>ref|XM_008003129.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus tubulin, alpha 1a (TUBA1A), transcript
variant X2, mRNA
Length=2471
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 1275
>ref|XM_008003128.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus tubulin, alpha 1a (TUBA1A), transcript
variant X1, mRNA
Length=1912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 765 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 716
>ref|NM_001285253.1| Macaca fascicularis Tubulin alpha-1B chain (TUBA1B), mRNA
Length=1691
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 559 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 510
>ref|XM_005570757.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865495 (LOC101865495),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 1324 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 1275
>ref|XM_005570756.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865495 (LOC101865495),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 765 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 716
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misc_RNA
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 469
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mRNA
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Sbjct 546 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 497
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mRNA
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Sbjct 528 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 479
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mRNA
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Sbjct 541 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 492
>ref|XM_004088634.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
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Sbjct 857 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 808
>ref|XM_004088633.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
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Sbjct 521 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 472
>ref|XM_003252193.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like, transcript
variant 2 (LOC100604350), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 1324 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 1275
>ref|XM_004088632.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like (LOC100604350),
mRNA
Length=1650
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 538 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 489
>ref|XM_003252192.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin alpha-1C chain-like, transcript
variant 1 (LOC100604350), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 769 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 720
>dbj|AK305500.1| Pan troglodytes mRNA for tubulin alpha-ubiquitous chain, complete
cds, clone: PtsC-41-5_A05
Length=1648
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 470
>ref|NM_001195391.1| Macaca mulatta tubulin, alpha 1a (TUBA1A), mRNA
Length=1677
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 514 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 465
>dbj|AK293589.1| Homo sapiens cDNA FLJ55956 complete cds, highly similar to Tubulin
alpha-6 chain
Length=1692
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 662 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 613
>dbj|AB464324.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8265, Homo sapiens TUBA1B
gene for tubulin, alpha 1b, without stop codon, in Flexi system
Length=1370
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 433 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 384
>emb|CU687192.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023159
5' read TUBA1B mRNA
Length=1153
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 440 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 391
>emb|CU676808.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017294
5' read TUBA1C mRNA
Length=1019
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 440 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 391
>emb|CU677793.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017297
5' read TUBA1B mRNA
Length=1192
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 440 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 391
>emb|CU678818.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100019456
5' read TUBA1C mRNA
Length=989
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 440 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 391
>emb|CU675203.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017296
5' read TUBA1C mRNA
Length=994
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 440 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 391
>dbj|AK289354.1| Homo sapiens cDNA FLJ78587 complete cds
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 470
>gb|DQ896235.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010695; FLH191421.01L;
RZPDo839D0167D tubulin, alpha 6 (TUBA6) gene, encodes
complete protein
Length=1390
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 446 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 397
>gb|DQ894689.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009149; FLH177494.01L;
RZPDo839A11125D alpha tubulin (K-ALPHA-1) gene, encodes
complete protein
Length=1396
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 446 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 397
>gb|DQ892986.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005616; FLH191425.01X; RZPDo839D0177D
tubulin, alpha 6 (TUBA6) gene, encodes complete
protein
Length=1390
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 446 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 397
>gb|DQ891498.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004128; FLH177498.01X; RZPDo839A11126D
alpha tubulin (K-ALPHA-1) gene, encodes complete
protein
Length=1396
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 446 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 397
>dbj|AB171294.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-13980, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
Length=1640
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 470
>ref|NM_001284836.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925047 (LOC101925047),
mRNA
dbj|AB170378.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10558, similar to
human tubulin, alpha 3 (TUBA3), mRNA, RefSeq: NM_006009.2
Length=1525
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 429 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 380
>ref|NM_001283388.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865772 (LOC101865772),
mRNA
dbj|AB170311.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10272, similar to
human tubulin, alpha 3 (TUBA3), mRNA, RefSeq: NM_006009.2
Length=1621
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 475
>gb|BC008330.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3505537, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2519
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 1374 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 1325
>gb|BC001209.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3502620, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3629
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 2490 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 2441
>gb|BC000431.1| Homo sapiens mRNA similar to tubulin alpha 1 (cDNA clone IMAGE:2819847)
Length=1828
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 705 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 656
>gb|BC080592.1| Homo sapiens tubulin, alpha 4a, mRNA (cDNA clone IMAGE:4541944),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=2519
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 1325
>ref|NM_006082.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1771
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 645 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 596
>gb|BC001128.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:2457 IMAGE:2964447),
complete cds
Length=1666
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 503 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 454
>gb|BC015883.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:10192 IMAGE:3909374),
complete cds
Length=1582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 463 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 414
>gb|BC017004.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:22108 IMAGE:4430457),
complete cds
Length=1635
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 475 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 426
>gb|BC010494.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:17433 IMAGE:3445903),
complete cds
Length=1626
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 505 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 456
>gb|BC000696.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:2215 IMAGE:3349131),
complete cds
Length=1634
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 510 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 461
>gb|BC030820.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:23826 IMAGE:4277263),
complete cds
Length=1647
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 516 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 467
>gb|DQ400107.1| Homo sapiens alpha tubulin (K-ALPHA-1) mRNA, complete cds
Length=1616
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 509 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 460
>dbj|AK056693.1| Homo sapiens cDNA FLJ32131 fis, clone PEBLM2000267, highly similar
to Tubulin alpha-ubiquitous chain
Length=2531
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 1427 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 1378
>gb|BC009509.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4689 IMAGE:3533174),
complete cds
Length=1646
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 506 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 457
>dbj|AB169706.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-20727, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
Length=1692
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 560 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 511
>dbj|AB169698.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-19314, similar to
human tubulin, alpha 3 (TUBA3), mRNA, RefSeq: NM_006009.2
Length=1702
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 538 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 489
>dbj|AK223024.1| Homo sapiens mRNA for tubulin alpha 6 variant, clone: JTH01540
Length=1574
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 524 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 475
>ref|NM_001034095.1| Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
dbj|AB188283.1| Pan troglodytes verus k-alpha-1 mRNA for ubiquitous alpha-tubulin,
complete cds
Length=1645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 470
>gb|BC009513.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4760 IMAGE:3537827),
complete cds
Length=1632
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 507 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 458
>gb|AC125611.4| Homo sapiens 12 BAC RP11-161H23 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=194578
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 175272 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 175321
>gb|AC011603.37| Homo sapiens 12 BAC RP11-386G11 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=174400
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 30028 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 29979
>dbj|AK098771.1| Homo sapiens cDNA FLJ25905 fis, clone CBR04587, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 470
>dbj|AK098635.1| Homo sapiens cDNA FLJ25769 fis, clone TST06404, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 470
>dbj|AK098357.1| Homo sapiens cDNA FLJ25491 fis, clone CBR00773, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 470
>dbj|AK057773.1| Homo sapiens cDNA FLJ25044 fis, clone CBL03486, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 470
>dbj|AK026632.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22979 fis, clone KAT11379, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 470
>dbj|AK026516.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22863 fis, clone KAT01983, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1643
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 470
>gb|AY892621.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH028896.01L tubulin
alpha 6 (TUBA6) mRNA, partial cds
Length=1350
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 424 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 375
>gb|BC071904.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:88583 IMAGE:6089096),
complete cds
Length=1641
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 510 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 461
>gb|BC063036.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:64889 IMAGE:4397636),
complete cds
Length=1614
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 546 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 497
>gb|BC008659.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:9918 IMAGE:3871729),
complete cds
Length=1601
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 482 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 433
>gb|BC019298.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:4112 IMAGE:2905506),
complete cds
Length=1534
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 486 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 437
>gb|BC009512.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4753 IMAGE:3537301),
complete cds
Length=1645
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 503 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 454
>gb|BC009314.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:16616 IMAGE:4111591),
complete cds
Length=1627
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 504 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 455
>gb|BC018948.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone IMAGE:4130515)
Length=1635
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 505 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 456
>gb|BC006379.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:12832 IMAGE:4100566),
complete cds
Length=1627
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 505 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 456
>gb|BC051297.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:59688 IMAGE:3832363),
complete cds
Length=1566
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 500 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 451
>gb|BC021088.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:1754 IMAGE:3543481),
complete cds
Length=1542
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 485 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 436
>gb|BC011790.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:19827 IMAGE:4025017),
complete cds
Length=1553
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 505 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 456
>gb|BC011572.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:20231 IMAGE:4561240),
complete cds
Length=1648
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 505 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 456
>gb|BC006481.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4387 IMAGE:2905305),
complete cds
Length=1663
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 505 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 456
>gb|BC005946.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:14580 IMAGE:4134187),
complete cds
Length=1582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 524 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 475
>gb|BC004949.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1c, mRNA (cDNA clone MGC:10851 IMAGE:3617714),
complete cds
Length=1558
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 504 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 455
>gb|AF081484.1|AF081484 Homo sapiens alpha-tubulin isoform 1 mRNA, complete cds
Length=1356
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 424 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 375
>ref|XM_004065266.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1c (TUBA1C),
mRNA
Length=1615
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGC 49
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Sbjct 578 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGC 530
>ref|XR_775701.1| PREDICTED: Loxodonta africana tubulin alpha-1B chain-like (LOC100665312),
misc_RNA
Length=1504
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 492 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 443
>ref|XR_748584.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin alpha-1B chain pseudogene
(LOC104666661), misc_RNA
Length=1130
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 486 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGGGCACTGGTCAGCC 437
>ref|XR_094568.3| PREDICTED: Pongo abelii tubulin alpha-1B chain-like (LOC100461286),
misc_RNA
Length=1446
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 513 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCAGTGCACTGGTCAGCC 464
>dbj|AB853091.1| Canis lupus familiaris TUBA1A mRNA for alpha-tubulin, complete
cds
Length=1356
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 424 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 375
>ref|XR_614929.1| PREDICTED: Callithrix jacchus tubulin alpha-1B chain-like (LOC100395649),
misc_RNA
Length=1590
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 471 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 422
>ref|XR_089904.3| PREDICTED: Callithrix jacchus tubulin alpha-1A chain-like (LOC100399496),
misc_RNA
Length=1576
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 424 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 375
>ref|XM_002752432.3| PREDICTED: Callithrix jacchus tubulin alpha-1A chain (LOC100392817),
mRNA
Length=1907
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 761 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 712
>ref|XM_009003725.1| PREDICTED: Callithrix jacchus tubulin alpha-1C chain-like (LOC100409161),
mRNA
Length=1468
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 431 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 382
>ref|XM_009003724.1| PREDICTED: Callithrix jacchus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1858
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 754 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 705
>ref|XR_619088.1| PREDICTED: Callithrix jacchus tubulin alpha-1A chain-like (LOC100388664),
misc_RNA
Length=1599
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 456 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 407
>ref|XR_087342.3| PREDICTED: Callithrix jacchus tubulin alpha-1B chain-like (LOC100393380),
misc_RNA
Length=1603
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 491 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 442
>ref|XM_008832860.1| PREDICTED: Nannospalax galili tubulin alpha-1B chain (LOC103733936),
mRNA
Length=1653
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 538 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 489
>ref|XR_607072.1| PREDICTED: Nannospalax galili tubulin alpha-1B chain-like (LOC103729670),
misc_RNA
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Sbjct 523 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 474
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misc_RNA
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(LOC103194448), misc_RNA
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transcript variant X1, mRNA
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variant X2, mRNA
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Sbjct 451 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 402
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variant X1, mRNA
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Sbjct 445 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 396
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Sbjct 424 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 375
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Sbjct 448 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 399
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mRNA
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Sbjct 427 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 378
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1c (TUBA1C), mRNA
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Sbjct 536 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 487
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mRNA
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Sbjct 542 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 493
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mRNA
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Sbjct 202 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 153
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partial mRNA
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Sbjct 520 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 471
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 463 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 414
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 424 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 375
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variant X2, mRNA
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Sbjct 427 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 378
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variant X1, mRNA
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Sbjct 551 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 502
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(LOC102927592), mRNA
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Sbjct 525 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 476
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(LOC102916060), mRNA
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Sbjct 527 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 478
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(LOC102726633), misc_RNA
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Sbjct 515 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 466
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mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 464 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 415
>ref|XM_006752359.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii tubulin, alpha 1a (TUBA1A),
mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 525 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 476
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(LOC102737022), partial mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 437 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 388
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mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 418 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 369
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misc_RNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 528 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 479
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mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 487 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 438
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partial mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 439 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 390
>ref|XM_005894710.1| PREDICTED: Bos mutus tubulin alpha-1C chain-like (LOC102270382),
mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 433 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 384
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misc_RNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 430 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 381
>ref|XM_005680002.1| PREDICTED: Capra hircus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 549 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 500
>ref|XM_005680001.1| PREDICTED: Capra hircus tubulin, alpha 1c (TUBA1C), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 527 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 478
>ref|XM_005709398.1| PREDICTED: Capra hircus tubulin, alpha 1a (TUBA1A), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 515 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 466
>ref|XM_005655549.1| PREDICTED: Sus scrofa uncharacterized LOC100135051 (LOC100135051),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 700 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 651
>ref|XM_005655548.1| PREDICTED: Sus scrofa uncharacterized LOC100135051 (LOC100135051),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 762 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 713
>ref|XM_005655547.1| PREDICTED: Sus scrofa uncharacterized LOC100135051 (LOC100135051),
transcript variant X1, mRNA
Length=1610
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 469 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 420
>ref|XM_005655546.1| PREDICTED: Sus scrofa uncharacterized LOC100127131 (LOC100127131),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 657 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 608
>ref|XM_005655545.1| PREDICTED: Sus scrofa uncharacterized LOC100127131 (LOC100127131),
transcript variant X2, mRNA
Length=1686
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 658 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 609
>ref|XM_003355375.2| PREDICTED: Sus scrofa uncharacterized LOC100127131 (LOC100127131),
transcript variant X1, mRNA
Length=1606
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 578 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 529
>ref|XM_005636879.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris tubulin, alpha 1a (TUBA1A),
transcript variant X11, mRNA
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 521 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 472
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Sbjct 525 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 476
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mRNA
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Sbjct 532 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 483
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Sbjct 524 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 475
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Sbjct 849 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 800
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mRNA
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Sbjct 598 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 549
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mRNA
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Sbjct 769 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 720
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Sbjct 530 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 481
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Sbjct 472 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 423
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variant X2, mRNA
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Sbjct 710 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 661
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variant X1, mRNA
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Sbjct 647 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 598
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variant X1, mRNA
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Sbjct 829 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 780
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Sbjct 565 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 516
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Sbjct 336 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 287
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mRNA
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Sbjct 530 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 481
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mRNA
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Sbjct 426 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 377
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partial misc_RNA
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Sbjct 517 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 468
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mRNA
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Sbjct 467 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 418
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mRNA
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Sbjct 905 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 856
>ref|XM_004805810.1| PREDICTED: Mustela putorius furo tubulin, alpha 1c (TUBA1C),
mRNA
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Sbjct 507 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 458
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mRNA
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Sbjct 512 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 463
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mRNA
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Sbjct 466 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 417
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(LOC101378791), misc_RNA
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Sbjct 442 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 393
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(LOC101367842), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 669 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 620
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(LOC101367544), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 773 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 724
>ref|XM_004400859.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens tubulin, alpha 1c, transcript
variant 2 (TUBA1C), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 439 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 390
>ref|XM_004400858.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens tubulin, alpha 1c, transcript
variant 1 (TUBA1C), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 488 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 439
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mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 470
>ref|XM_004274368.1| PREDICTED: Orcinus orca tubulin, alpha 1a (TUBA1A), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 773 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 724
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mRNA
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Sbjct 939 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCAGTGCACTGGTCAGCC 988
>ref|XM_004088628.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys uncharacterized LOC101176789 (LOC101176789),
mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 959 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCAGTGCACTGGTCAGCC 1008
>ref|XM_004092856.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, alpha 1c (TUBA1C), mRNA
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Sbjct 662 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCAGTGCACTGGTCAGCC 613
>ref|XM_004053078.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 3 (TUBA1B), mRNA
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Sbjct 381 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCAGTGCACTGGTCAGCC 332
>ref|XM_004053077.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 2 (TUBA1B), mRNA
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Sbjct 745 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCAGTGCACTGGTCAGCC 696
>ref|XM_004053076.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 1 (TUBA1B), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 603 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCAGTGCACTGGTCAGCC 554
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mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 469 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 420
>ref|XR_173135.1| PREDICTED: Ovis aries tubulin alpha-1C chain-like (LOC101119975),
misc_RNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 522 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 473
>ref|XM_004007416.1| PREDICTED: Ovis aries tubulin, alpha 1c (TUBA1C), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 744 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 695
>ref|XM_004006382.1| PREDICTED: Ovis aries tubulin, alpha 4a (TUBA4A), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 493 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 444
>ref|XM_003793608.1| PREDICTED: Otolemur garnettii uncharacterized LOC100946844 (LOC100946844),
mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 1045 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 1094
>ref|XM_003793607.1| PREDICTED: Otolemur garnettii uncharacterized LOC100946844 (LOC100946844),
mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 1101 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 1150
>ref|XM_003793606.1| PREDICTED: Otolemur garnettii uncharacterized LOC100946844 (LOC100946844),
mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 1118 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 1167
>ref|XM_003793605.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tubulin, alpha 1a, transcript variant
2 (TUBA1A), mRNA
Length=1886
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 770 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 721
>ref|XM_003793604.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tubulin, alpha 1a, transcript variant
1 (TUBA1A), mRNA
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 1142 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 1093
>dbj|AK396527.1| Sus scrofa mRNA, clone: PST010046D08, expressed in prostate
Length=1600
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 557 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 508
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Sbjct 557 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCCGTGCACTGGTCAGCC 508
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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lobe)
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Sbjct 521 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 472
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 522 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 473
>dbj|AK398124.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010008D02, expressed in testis
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK398119.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010004D03, expressed in testis
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
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cells (immature)
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 569 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 520
>dbj|AK399541.1| Sus scrofa mRNA, clone: DCI010021C10, expressed in dendritic
cells (immature)
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 470
>dbj|AK399526.1| Sus scrofa mRNA, clone: DCI010005B05, expressed in dendritic
cells (immature)
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 521 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 472
>dbj|AK399478.1| Sus scrofa mRNA, clone: AMP010091D04, expressed in alveolar macrophage
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 516 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 467
>dbj|AK399373.1| Sus scrofa mRNA, clone: THY010069H03, expressed in thymus
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK396000.1| Sus scrofa mRNA, clone: PBL010004H07, expressed in peripheral
blood lymphocytes
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK401024.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010110E12, expressed in testis
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK401018.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010099F10, expressed in testis
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK401009.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010086F08, expressed in testis
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK401006.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010080A04, expressed in testis
Length=1654
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 522 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 473
>dbj|AK401005.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010079C01, expressed in testis
Length=1651
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK401002.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010075B10, expressed in testis
Length=1648
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK400996.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010065E01, expressed in testis
Length=1647
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK400994.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010062F07, expressed in testis
Length=1652
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK400992.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010060E10, expressed in testis
Length=1646
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 470
>dbj|AK400990.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010058C05, expressed in testis
Length=1646
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK400976.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010030E11, expressed in testis
Length=1668
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 531 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 482
>dbj|AK400965.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010014H12, expressed in testis
Length=1646
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK400955.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010002D05, expressed in testis
Length=1642
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK400851.1| Sus scrofa mRNA, clone: PST010064H01, expressed in prostate
Length=1666
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Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK400767.1| Sus scrofa mRNA, clone: PCT010025B05, expressed in placenta
Length=1646
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 518 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 469
>dbj|AK389611.1| Sus scrofa mRNA, clone: AMP010004G12, expressed in alveolar macrophage
Length=1778
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 610 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 561
>dbj|AK392964.1| Sus scrofa mRNA, clone: ITT010052D09, expressed in intestine
Length=1630
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 584 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 535
>dbj|AK392448.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10074H08, expressed in hypothalamus
Length=1730
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 517 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 468
>dbj|AK392302.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10064F09, expressed in hypothalamus
Length=1642
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 519 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 470
>dbj|AK391677.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10015B05, expressed in hypothalamus
Length=1662
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 517 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 468
>dbj|AK394737.1| Sus scrofa mRNA, clone: MLTL10081G04, expressed in longissimus
muscle
Length=2092
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1040 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 991
>dbj|AB600202.1| Callithrix jacchus DNA, marmoset major histocompatibility complex
class I B, Caja-B segment 2
Length=755821
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 566209 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 566160
>gb|AC243176.3| Callithrix jacchus BAC clone CH259-217M17 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=175055
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 136417 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 136466
>gb|AC243194.3| Callithrix jacchus BAC clone CH259-127H5 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=192360
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 23136 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGGAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 23185
>ref|NM_001195392.1| Macaca mulatta tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
Length=1639
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 517 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTACACTGGTCAGCC 468
>ref|XM_002927186.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca hypothetical protein LOC100473568
(LOC100473568), mRNA
Length=1301
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCGGTGCACTGGTCAGCC 50
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Sbjct 1106 CAAAGCTGTGGAAAACCAAGAAGCCCTGAAGACCTGTGCACTGGTCAGCC 1155
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC
>ref|XM_010349772.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis tubulin alpha-1B chain
(LOC101046265), mRNA
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 63 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 112
>ref|XM_009425475.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 146 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 195
>ref|XM_009425474.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 146 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 195
>ref|XM_008951160.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 128 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 177
>tpe|HG504734.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000409018.1 (RP11-386G11.10
gene), antisense
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 201 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 152
>ref|XM_004053078.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 3 (TUBA1B), mRNA
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 16 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 65
>ref|XM_004053077.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 2 (TUBA1B), mRNA
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 74
>ref|XM_004053076.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, alpha 1b, transcript
variant 1 (TUBA1B), mRNA
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Sbjct 109 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 158
>dbj|AK305500.1| Pan troglodytes mRNA for tubulin alpha-ubiquitous chain, complete
cds, clone: PtsC-41-5_A05
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Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 74
>dbj|AK289354.1| Homo sapiens cDNA FLJ78587 complete cds
Length=1623
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 74
>gb|BC008330.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3505537, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 880 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 929
>gb|BC001209.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3502620, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 1996 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 2045
>gb|BC080592.1| Homo sapiens tubulin, alpha 4a, mRNA (cDNA clone IMAGE:4541944),
**** WARNING: chimeric clone ****
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 929
>ref|NM_006082.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 151 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 200
>gb|BC001128.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:2457 IMAGE:2964447),
complete cds
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 58
>gb|BC010494.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:17433 IMAGE:3445903),
complete cds
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 60
>gb|BC000696.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:2215 IMAGE:3349131),
complete cds
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 65
>gb|BC030820.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:23826 IMAGE:4277263),
complete cds
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 22 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 71
>gb|BC021564.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:31891 IMAGE:4579604),
complete cds
Length=1292
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 60
>gb|DQ400107.1| Homo sapiens alpha tubulin (K-ALPHA-1) mRNA, complete cds
Length=1616
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 64
>dbj|AK094717.1| Homo sapiens cDNA FLJ37398 fis, clone BRAMY2027467, highly similar
to Tubulin alpha-ubiquitous chain
Length=3196
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 74
>gb|BC009509.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4689 IMAGE:3533174),
complete cds
Length=1646
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 61
>ref|NM_001034095.1| Pan troglodytes tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
dbj|AB188283.1| Pan troglodytes verus k-alpha-1 mRNA for ubiquitous alpha-tubulin,
complete cds
Length=1645
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 74
>gb|BC009513.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4760 IMAGE:3537827),
complete cds
Length=1632
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 62
>gb|AC011603.37| Homo sapiens 12 BAC RP11-386G11 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=174400
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27547 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 27596
>dbj|AK098771.1| Homo sapiens cDNA FLJ25905 fis, clone CBR04587, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 74
>dbj|AK098635.1| Homo sapiens cDNA FLJ25769 fis, clone TST06404, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 74
>dbj|AK098357.1| Homo sapiens cDNA FLJ25491 fis, clone CBR00773, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 74
>dbj|AK057773.1| Homo sapiens cDNA FLJ25044 fis, clone CBL03486, highly similar
to TUBULIN ALPHA-1 CHAIN
Length=1623
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 74
>dbj|AK026632.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22979 fis, clone KAT11379, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1645
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 74
>dbj|AK026516.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22863 fis, clone KAT01983, highly similar
to HUMTUBAK human alpha-tubulin mRNA
Length=1643
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 74
>gb|BC071904.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:88583 IMAGE:6089096),
complete cds
Length=1641
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 65
>gb|BC009512.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4753 IMAGE:3537301),
complete cds
Length=1645
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 58
>gb|BC009314.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:16616 IMAGE:4111591),
complete cds
Length=1627
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 59
>gb|BC018948.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone IMAGE:4130515)
Length=1635
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 60
>gb|BC006379.2| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:12832 IMAGE:4100566),
complete cds
Length=1627
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 60
>gb|BC011572.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:20231 IMAGE:4561240),
complete cds
Length=1648
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 60
>gb|BC006481.1| Homo sapiens tubulin, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:4387 IMAGE:2905305),
complete cds
Length=1663
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 60
>ref|XR_093314.3| PREDICTED: Pongo abelii tubulin alpha-1B chain-like (LOC100445542),
misc_RNA
Length=1645
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTT 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTT 87
>ref|XM_004400861.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens tubulin alpha-1B chain-like
(LOC101367842), mRNA
Length=1780
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCT 222
>ref|XM_010623612.1| PREDICTED: Fukomys damarensis tubulin alpha-1B chain (LOC104861955),
transcript variant X1, mRNA
Length=1653
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 AGCTTGTCGAGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 79
>ref|XM_010385409.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin alpha-1B chain (LOC104679722),
mRNA
Length=1752
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 150 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGCCGCCTTC 199
>ref|XR_094568.3| PREDICTED: Pongo abelii tubulin alpha-1B chain-like (LOC100461286),
misc_RNA
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Sbjct 19 AGCTTGTCGAGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 68
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Sbjct 165 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGCCGCCTTC 214
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Sbjct 11 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGCCGCCTTC 60
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(LOC101716697), mRNA
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Sbjct 32 AGCTTGTCGAGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 81
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mRNA
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Sbjct 151 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTATCGCCTT 199
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Sbjct 34 AGC-TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 82
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Sbjct 45 AGC-TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 93
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Sbjct 28 AGC-TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 76
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mRNA
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Sbjct 45 AGC-TGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 93
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mRNA
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Sbjct 20 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTACTCCTGTCGCCT 67
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variant 2 (TUBA1C), mRNA
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Sbjct 411 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTACTCCTGTCGCCT 364
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(LOC100473308), mRNA
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Sbjct 47 AGCTTGTCAGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCT 94
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Sbjct 145 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTACTCCTGCCGCCTTC 194
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Sbjct 65 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTC 114
>ref|NM_001195392.1| Macaca mulatta tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
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Sbjct 23 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTC 72
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human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
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Sbjct 27 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTC 76
>dbj|AB171294.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-13980, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
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Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTC 74
>dbj|AB170788.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-10078, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
Length=1442
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Sbjct 25 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTC 74
>dbj|AB169706.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-20727, similar to
human tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1), mRNA, RefSeq:
NM_006082.1
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 66 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTTCCGCCTTC 115
>ref|XM_006916907.1| PREDICTED: Pteropus alecto tubulin, alpha 1b (TUBA1B), mRNA
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGC 46
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Sbjct 32 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTACTCCTGTCGC 77
>ref|XM_008522082.1| PREDICTED: Equus przewalskii tubulin alpha-1C chain-like (LOC103552226),
mRNA
Length=1587
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCG 45
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Sbjct 26 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTACTCCTGTCG 70
>ref|XM_010596383.1| PREDICTED: Loxodonta africana tubulin alpha-1B chain (LOC100670303),
mRNA
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Query 1 AGCTTGTCGGGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 22 AGCTTGTCGAGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTTCCGTCGCCTTC 71
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gene), antisense
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Query 10 GGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 50
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Sbjct 897 GGGACGGTAACCGGGACCCGGTGTCTGCTCCTGTCGCCTTC 857
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Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188147, whole genome shotgun sequence
gb|DS486061.1| Homo sapiens SCAF_1103279188147 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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shotgun sequence
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 1728 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1679
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(DTX3), transcript variant X5, mRNA
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(DTX3), transcript variant X4, mRNA
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(DTX3), transcript variant X3, mRNA
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1221 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1172
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1083 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1034
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1202 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1153
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ligase (DTX3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1408 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1359
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ligase (DTX3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1501 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1452
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1335 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1286
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 986 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 937
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(DTX3), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1381 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1332
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(DTX3), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1364 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1315
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1385 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1336
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(DTX3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1367 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1318
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mRNA
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Sbjct 1193 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1144
>ref|NM_178502.3| Homo sapiens deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3), transcript
variant 1, mRNA
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Sbjct 1358 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1309
>ref|NM_001286245.1| Homo sapiens deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3), transcript
variant 3, mRNA
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Sbjct 1178 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1129
>ref|NM_001286246.1| Homo sapiens deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3), transcript
variant 2, mRNA
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Sbjct 1197 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1148
>ref|XM_005674381.1| PREDICTED: Sus scrofa probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3-like
(LOC100521724), mRNA
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Sbjct 1074 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1025
>ref|XM_005663931.1| PREDICTED: Sus scrofa deltex homolog 3 (Drosophila) (DTX3), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 990 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 941
>ref|XM_005663930.1| PREDICTED: Sus scrofa deltex homolog 3 (Drosophila) (DTX3), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 1817 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1768
>ref|XM_003355494.3| PREDICTED: Sus scrofa deltex homolog 3 (Drosophila) (DTX3), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 1177 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1128
>ref|XR_282004.1| PREDICTED: Macaca fascicularis deltex homolog 3 (Drosophila)
(DTX3), transcript variant X7, misc_RNA
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Sbjct 1387 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1338
>ref|XM_005571365.1| PREDICTED: Macaca fascicularis deltex homolog 3 (Drosophila)
(DTX3), transcript variant X6, mRNA
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(DTX3), transcript variant X4, mRNA
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(DTX3), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1048 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 999
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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(DTX3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1029 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 980
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transcript variant X7, mRNA
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1118 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1069
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1215 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1166
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transcript variant 2 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1169 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1120
>ref|XM_004429325.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum deltex homolog 3 (Drosophila),
transcript variant 1 (DTX3), mRNA
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Sbjct 969 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 920
>ref|XM_004316341.1| PREDICTED: Tursiops truncatus deltex homolog 3 (Drosophila) (DTX3),
mRNA
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Sbjct 1083 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1034
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variant 2 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1083 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1034
>ref|XM_004276550.1| PREDICTED: Orcinus orca deltex homolog 3 (Drosophila), transcript
variant 1 (DTX3), mRNA
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Sbjct 969 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 920
>ref|XM_004053452.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla deltex homolog 3 (Drosophila)
(DTX3), mRNA
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Sbjct 900 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 851
>ref|XM_003252766.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys deltex homolog 3 (Drosophila),
transcript variant 2 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1472 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1423
>ref|XM_003252765.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys deltex homolog 3 (Drosophila),
transcript variant 1 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1648 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1599
>ref|XM_001116189.2| PREDICTED: Macaca mulatta protein deltex-3-like, transcript variant
4 (LOC715175), mRNA
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Sbjct 1166 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1117
>ref|XM_001116208.2| PREDICTED: Macaca mulatta protein deltex-3-like, transcript variant
6 (LOC715175), mRNA
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Sbjct 1340 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1291
>dbj|AB463566.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6446, Homo sapiens DTX3
gene for deltex 3 homolog, without stop codon, in Flexi system
Length=1058
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Sbjct 831 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 782
>gb|AC193651.6| Rhesus Macaque BAC CH250-333F6 () complete sequence
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Sbjct 54813 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 54764
>gb|BC114498.1| Homo sapiens deltex homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone
MGC:138863 IMAGE:40083763), complete cds
gb|BC114441.1| Homo sapiens deltex homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone
MGC:138864 IMAGE:40083764), complete cds
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Sbjct 1087 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1038
>gb|AY225126.1| Homo sapiens deltex 3 (DTX3) mRNA, complete cds
Length=1118
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Sbjct 871 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 822
>gb|AC025165.27| Homo sapiens 12 BAC RP11-571M6 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=211544
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 2510 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 2461
>dbj|AK128752.1| Homo sapiens cDNA FLJ44795 fis, clone BRACE3040239, highly similar
to Protein deltex-3
Length=3199
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Sbjct 2326 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 2277
>dbj|AK094385.1| Homo sapiens cDNA FLJ37066 fis, clone BRACE2015132, weakly similar
to Drosophila melanogaster Oregon R cytoplasmic basic
protein (deltex) mRNA
Length=1852
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Sbjct 967 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 918
>dbj|AK092085.1| Homo sapiens cDNA FLJ34766 fis, clone NT2NE2002651, weakly similar
to Basic protein, cytosolic
Length=2029
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Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 50
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Sbjct 1159 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1110
>ref|NM_001131384.1| Pongo abelii deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3), mRNA
emb|CR857565.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468F1823 (from clone DKFZp468F1823)
Length=2075
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Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 50
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Sbjct 1188 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1139
>ref|XM_008844061.1| PREDICTED: Nannospalax galili deltex 3, E3 ubiquitin ligase (Dtx3),
transcript variant X4, mRNA
Length=2099
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Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCG 48
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Sbjct 1274 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCG 1227
>ref|XM_008844060.1| PREDICTED: Nannospalax galili deltex 3, E3 ubiquitin ligase (Dtx3),
transcript variant X3, mRNA
Length=2082
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCG 48
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Sbjct 1257 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCG 1210
>ref|XM_008844059.1| PREDICTED: Nannospalax galili deltex 3, E3 ubiquitin ligase (Dtx3),
transcript variant X2, mRNA
Length=2445
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCG 48
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Sbjct 1277 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCG 1230
>ref|XM_008844058.1| PREDICTED: Nannospalax galili deltex 3, E3 ubiquitin ligase (Dtx3),
transcript variant X1, mRNA
Length=2428
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCG 48
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Sbjct 1260 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCG 1213
>ref|XM_010388949.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), transcript variant X5, mRNA
Length=2087
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 50
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Sbjct 1214 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1165
>ref|XM_010388948.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), transcript variant X4, mRNA
Length=2128
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 50
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Sbjct 1255 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1206
>ref|XM_010388947.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), transcript variant X3, mRNA
Length=2456
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1534
>ref|XM_010388945.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), transcript variant X2, mRNA
Length=2109
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 50
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Sbjct 1236 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1187
>ref|XM_010388944.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), transcript variant X1, mRNA
Length=2068
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 50
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Sbjct 1195 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1146
>ref|XM_008684055.1| PREDICTED: Ursus maritimus deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
mRNA
Length=2183
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 50
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Sbjct 1456 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 1407
>ref|XM_008533530.1| PREDICTED: Equus przewalskii deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
transcript variant X5, mRNA
Length=2397
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 50
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Sbjct 1922 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1873
>ref|XM_008533529.1| PREDICTED: Equus przewalskii deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
transcript variant X4, mRNA
Length=2744
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 50
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Sbjct 1890 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1841
>ref|XM_008533528.1| PREDICTED: Equus przewalskii deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
transcript variant X3, mRNA
Length=2361
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 1187 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGGTACCGAA 1138
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Sbjct 1473 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1424
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1513 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1464
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Sbjct 1460 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1411
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(DTX3), transcript variant X6, mRNA
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(DTX3), transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 1613 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1564
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(DTX3), transcript variant X5, mRNA
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(DTX3), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 1594 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1545
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(DTX3), transcript variant X4, mRNA
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(DTX3), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1548 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1499
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(DTX3), transcript variant X3, mRNA
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(DTX3), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1613 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1564
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1529 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1480
>ref|XM_004773233.1| PREDICTED: Mustela putorius furo deltex homolog 3 (Drosophila)
(DTX3), transcript variant X1, mRNA
ref|XM_004800723.1| PREDICTED: Mustela putorius furo deltex homolog 3 (Drosophila)
(DTX3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1594 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1545
>ref|XM_004379870.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris deltex homolog 3 (Drosophila),
transcript variant 2 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1162 CTCAGGGCAGTCAGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1113
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transcript variant 1 (DTX3), mRNA
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Sbjct 969 CTCAGGGCAGTCAGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 920
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transcript variant 2 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1185 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1136
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transcript variant 1 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1161 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTGCCAGGATACCGAA 1112
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Sbjct 1201 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTGCCAGGATACCG 1154
>ref|XM_006908960.1| PREDICTED: Pteropus alecto deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1214 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTGCCAGGATACCG 1167
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1103 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTGCCAGGATACCG 1056
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(DTX3), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1204 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTTCCAGGATACCGAA 1155
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1778 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTTCCAGGATACCGAA 1729
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(DTX3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1035 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTTCCAGGATACCGAA 986
>ref|XM_007950040.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 863 CTCAGGGCAGTCAGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGGTACCGAA 814
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(DTX3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 831 CTCAGGGCAGTCAGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGGTACCGAA 782
>ref|XM_007633033.1| PREDICTED: Cricetulus griseus deltex 3, E3 ubiquitin ligase (Dtx3),
transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 1068 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 1019
>ref|XM_007633032.1| PREDICTED: Cricetulus griseus deltex 3, E3 ubiquitin ligase (Dtx3),
transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 951 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 902
>ref|XM_007633031.1| PREDICTED: Cricetulus griseus deltex 3, E3 ubiquitin ligase (Dtx3),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1108 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 1059
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1661 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 1612
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transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 956 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 907
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 50
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Sbjct 1689 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 1640
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1670 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 1621
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Sbjct 886 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 837
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ligase (Dtx3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 984 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 935
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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(DTX3), transcript variant X1, mRNA
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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(DTX3), transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 961 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGAGTAGTGCCAGGATACCGAA 912
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1437 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGAGTAGTGCCAGGATACCGAA 1388
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1437 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGAGTAGTGCCAGGATACCGAA 1388
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mRNA
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Sbjct 858 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGGTACCGAA 809
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(DTX3), partial mRNA
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Sbjct 723 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGGTACCGAA 674
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(Dtx3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1511 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGGTACCGAA 1462
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(Dtx3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1492 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGGTACCGAA 1443
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(Dtx3), mRNA
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Sbjct 987 CTCCGGGCAATCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 938
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(Dtx3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1354 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 1305
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(Dtx3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1360 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 1311
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(Dtx3), mRNA
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Sbjct 870 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGATACCGAA 821
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mRNA
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Sbjct 1087 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGGTACCGAA 1038
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transcript variant 2 (DTX3), mRNA
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Sbjct 2377 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGGGTGGTGCCAGGATAGCGAA 2328
>ref|XM_004401738.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens deltex homolog 3 (Drosophila),
transcript variant 1 (DTX3), mRNA
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Sbjct 975 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGGGTGGTGCCAGGATAGCGAA 926
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(DTX3), mRNA
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Sbjct 948 CTCGGGGCAGTCTGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTGCCAGGATACCGAA 899
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mRNA
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Sbjct 750 CTCAGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCTTGTGGTACCAGGATACCGAA 701
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 2170 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 2121
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 2191 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 2142
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2015 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 1966
>ref|XM_006241492.2| PREDICTED: Rattus norvegicus deltex 3, E3 ubiquitin ligase (Dtx3),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2173 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 2124
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transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 1208 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 1159
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transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 904 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 855
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1227 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 1178
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1084 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 1035
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 984 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 935
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1208 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 1159
>gb|JN962422.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Pip4k2c:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=38852
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Sbjct 37807 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 37758
>gb|JN958532.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Pip4k2c:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=38806
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Sbjct 37761 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 37712
>ref|NM_001191989.1| Rattus norvegicus deltex 3, E3 ubiquitin ligase (Dtx3), mRNA
Length=1558
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Sbjct 1135 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 1086
>gb|BC138304.1| Mus musculus deltex 3 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone
MGC:169928 IMAGE:8861323), complete cds
Length=1725
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Sbjct 1015 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 966
>gb|BC158027.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:9007331
Length=1710
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Sbjct 716 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 765
>gb|BC157899.1| Mus musculus deltex 3 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone
MGC:189904 IMAGE:9088091), complete cds
Length=1719
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Sbjct 1017 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 968
>gb|BC044779.2| Mus musculus cDNA clone IMAGE:5319988, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2276
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Sbjct 1116 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 1067
>gb|AC144852.3| Mus musculus BAC clone RP24-341K21 from chromosome 10, complete
sequence
Length=169565
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Sbjct 116554 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 116505
>ref|NM_030714.2| Mus musculus deltex 3 homolog (Drosophila) (Dtx3), mRNA
gb|BC099687.1| Mus musculus deltex 3 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone
MGC:106339 IMAGE:6311735), complete cds
Length=2030
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Sbjct 1136 CTCGGGGCAGTCCGGGAGGTAGGCCACCCGTGTGGTACCAGGGTACCGAA 1087
>dbj|AK148444.1| Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:G370150I16 product:deltex 3 homolog (Drosophila),
full insert sequence
Length=1996
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Sbjct 1744 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1793
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Sbjct 1451 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1500
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Sbjct 1291 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1340
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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(DTX3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1527 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1576
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Sbjct 1053 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1102
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variant 1, mRNA
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variant 3, mRNA
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variant 2, mRNA
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Sbjct 988 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1037
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Sbjct 988 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1037
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(LOC100521724), mRNA
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variant X3, mRNA
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Sbjct 1080 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1129
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1907 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1956
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1267 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1316
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(Dtx3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1601 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1650
>ref|XM_005397398.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera deltex homolog 3 (Drosophila)
(Dtx3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1582 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1631
>ref|XM_005335686.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus deltex homolog 3 (Drosophila)
(Dtx3), mRNA
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Sbjct 1077 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1126
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transcript variant X7, mRNA
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Sbjct 1623 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1672
>ref|XM_005268700.1| PREDICTED: Homo sapiens deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1604 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1653
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1724 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1773
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1951 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 2000
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(DTX3), transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 1703 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1752
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(DTX3), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 1684 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1733
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(DTX3), transcript variant X4, mRNA
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(DTX3), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1638 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1687
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(DTX3), transcript variant X3, mRNA
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(DTX3), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1703 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1752
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1619 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1668
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(DTX3), transcript variant X1, mRNA
ref|XM_004800723.1| PREDICTED: Mustela putorius furo deltex homolog 3 (Drosophila)
(DTX3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1684 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1733
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mRNA
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Sbjct 1177 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1226
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1052 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1101
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1056 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1105
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mRNA
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Sbjct 1109 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1158
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transcript variant 2 (DTX3), mRNA
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Sbjct 2467 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 2516
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transcript variant 1 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1065 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1114
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transcript variant 2 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1252 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1301
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transcript variant 1 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1059 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1108
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mRNA
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Sbjct 1173 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1222
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variant 2 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1173 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1222
>ref|XM_004276550.1| PREDICTED: Orcinus orca deltex homolog 3 (Drosophila), transcript
variant 1 (DTX3), mRNA
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 1059 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1108
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(DTX3), mRNA
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Sbjct 990 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1039
>ref|XM_003252766.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys deltex homolog 3 (Drosophila),
transcript variant 2 (DTX3), mRNA
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Sbjct 1562 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1611
>ref|XM_003252765.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys deltex homolog 3 (Drosophila),
transcript variant 1 (DTX3), mRNA
Length=2522
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Sbjct 1738 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1787
>ref|XM_002916046.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca protein deltex-3-like (LOC100465821),
mRNA
Length=1220
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 840 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 889
>dbj|AB463566.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6446, Homo sapiens DTX3
gene for deltex 3 homolog, without stop codon, in Flexi system
Length=1058
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 921 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 970
>gb|BC114498.1| Homo sapiens deltex homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone
MGC:138863 IMAGE:40083763), complete cds
gb|BC114441.1| Homo sapiens deltex homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone
MGC:138864 IMAGE:40083764), complete cds
Length=1556
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 1177 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1226
>gb|AY225126.1| Homo sapiens deltex 3 (DTX3) mRNA, complete cds
Length=1118
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 961 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1010
>gb|AC025165.27| Homo sapiens 12 BAC RP11-571M6 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=211544
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 2600 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 2649
>dbj|AK128752.1| Homo sapiens cDNA FLJ44795 fis, clone BRACE3040239, highly similar
to Protein deltex-3
Length=3199
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 2416 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 2465
>dbj|AK094385.1| Homo sapiens cDNA FLJ37066 fis, clone BRACE2015132, weakly similar
to Drosophila melanogaster Oregon R cytoplasmic basic
protein (deltex) mRNA
Length=1852
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 1057 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1106
>dbj|AK092085.1| Homo sapiens cDNA FLJ34766 fis, clone NT2NE2002651, weakly similar
to Basic protein, cytosolic
Length=2029
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 1249 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1298
>ref|NM_001131384.1| Pongo abelii deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3), mRNA
emb|CR857565.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468F1823 (from clone DKFZp468F1823)
Length=2075
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 1278 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1327
>ref|XM_007534944.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), mRNA
Length=1396
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 2 GTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 1265 GTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1313
>ref|XM_006171888.1| PREDICTED: Tupaia chinensis deltex homolog 3 (Drosophila) (DTX3),
mRNA
Length=1849
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 2 GTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 1062 GTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1110
>ref|XM_004692607.1| PREDICTED: Condylura cristata deltex homolog 3 (Drosophila) (DTX3),
mRNA
Length=1135
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
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Query 2 GTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 983 GTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1031
>ref|XM_004601645.1| PREDICTED: Sorex araneus deltex homolog 3 (Drosophila) (DTX3),
transcript variant X2, mRNA
Length=1122
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Query 2 GTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 964 GTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1012
>ref|XM_004601644.1| PREDICTED: Sorex araneus deltex homolog 3 (Drosophila) (DTX3),
transcript variant X1, mRNA
Length=1165
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 2 GTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 1034 GTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1082
>ref|XM_010598313.1| PREDICTED: Loxodonta africana deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 1053 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1102
>ref|XM_010598308.1| PREDICTED: Loxodonta africana deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
transcript variant X2, mRNA
Length=1763
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1471
>ref|XM_010598304.1| PREDICTED: Loxodonta africana deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
transcript variant X1, mRNA
Length=1398
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1106
>ref|XM_010388949.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), transcript variant X5, mRNA
Length=2087
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1353
>ref|XM_010388948.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), transcript variant X4, mRNA
Length=2128
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1345 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1394
>ref|XM_010388947.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), transcript variant X3, mRNA
Length=2456
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1722
>ref|XM_010388945.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), transcript variant X2, mRNA
Length=2109
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1375
>ref|XM_010388944.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana deltex 3, E3 ubiquitin ligase
(DTX3), transcript variant X1, mRNA
Length=2068
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1334
>ref|XM_009181082.1| PREDICTED: Papio anubis deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
transcript variant X6, mRNA
Length=2469
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1689 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1738
>ref|XM_003906670.2| PREDICTED: Papio anubis deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
transcript variant X5, mRNA
Length=2451
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 1671 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1720
>ref|XM_009181081.1| PREDICTED: Papio anubis deltex 3, E3 ubiquitin ligase (DTX3),
transcript variant X4, mRNA
Length=2628
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 1074 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1123
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1046 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1095
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Sbjct 1050 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1099
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Sbjct 1025 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1074
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(DTX3), transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 1759 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1808
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(DTX3), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 1138 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1187
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(DTX3), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1119 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1168
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(DTX3), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1138 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1187
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(DTX3), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 50
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Sbjct 1761 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1810
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(DTX3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1119 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1168
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1447 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1496
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1430 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1479
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(Dtx3), mRNA
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Sbjct 960 TGTCATCACGTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1009
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(Dtx3), transcript variant X3, mRNA
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(Dtx3), transcript variant X2, mRNA
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(Dtx3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2424 TGTCATCACCTGGAACGACATTCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 2473
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(Dtx3), mRNA
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Sbjct 1305 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1354
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mutant allele Pip4k2c:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
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Pip4k2c:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
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Sbjct 37851 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 37900
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Sbjct 1225 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1274
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4 (LOC715175), mRNA
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Sbjct 1256 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1305
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6 (LOC715175), mRNA
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Sbjct 1430 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1479
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Sbjct 1105 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1154
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Sbjct 626 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 577
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MGC:189904 IMAGE:9088091), complete cds
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Sbjct 1107 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1156
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gb|BC153272.1| Bos taurus deltex homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:179581
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Sbjct 1051 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1100
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Sbjct 54903 TGTCATCACCTGGAATGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 54952
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sequence
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Sbjct 116644 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 116693
>ref|NM_030714.2| Mus musculus deltex 3 homolog (Drosophila) (Dtx3), mRNA
gb|BC099687.1| Mus musculus deltex 3 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone
MGC:106339 IMAGE:6311735), complete cds
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Sbjct 1226 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1275
>dbj|AK148444.1| Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:G370150I16 product:deltex 3 homolog (Drosophila),
full insert sequence
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Sbjct 26 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 75
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Sbjct 1208 TGTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1257
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transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 2013 GTCATCACCTGGAACGATATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 2061
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Sbjct 1981 GTCATCACCTGGAACGATATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 2029
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1598 GTCATCACCTGGAACGATATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1646
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Sbjct 1545 GTCATCACCTGGAACGATATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1593
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Sbjct 1990 GTCATCACCTGGAACGATATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 2038
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ligase (Dtx3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 977 GTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1025
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ligase (Dtx3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1075 GTCATCACTTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1123
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Sbjct 1546 GTCATCACCTGGAACGATATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1594
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1534 GTCATCACCTGGAACGATATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1582
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transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 1564 GTCATCACCTGGAACGATATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1612
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1604 GTCATCACCTGGAACGATATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGAC 1652
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12 12 58002327 58002898 4m58002464F57M339N39M CGAA TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGACCCCAGCT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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12 12 58002327 58002898 4m58002464F57M339N39M CGAA TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGACCCCAGCT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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12 12 58002327 58002898 4m58002464F57M339N39M CGAA TGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGACCCCAGCT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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12 12 58002454 58002893 66M339N34M GAGACCGAATGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGACCCCAGCT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 12 58002457 58002557 100M ACCGAATGTCATCACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGACCCCAGCTGTGCGACCCCTCTTCATTTCCTTTCCCTTGGCTCCTC
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12 12 58002469 58002908 51M339N49M CACCTGGAACGACATCCACCACAAGACCAGCTGCACAGGGGGACCCCAGCT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>gb|DS990764.1| Homo sapiens SCAF_1112675837335 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>gb|CH471054.1| Homo sapiens 211000035840223 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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>ref|NW_001838064.2| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188390, whole genome shotgun sequence
gb|DS486126.1| Homo sapiens SCAF_1103279188390 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000473.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
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>gb|CM000263.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=133516800
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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>ref|NW_001838064.2| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188390, whole genome shotgun sequence
gb|DS486126.1| Homo sapiens SCAF_1103279188390 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Gapped
Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC
>ref|NG_027722.2| Homo sapiens ubiquitin C (UBC), RefSeqGene on chromosome 12
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1375 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1328
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1831 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1784
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 917 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 870
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1373 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1326
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 917 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 870
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1145 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1098
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1373 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1326
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1601 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1554
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Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 461 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 414
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 917 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 870
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1145 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1098
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1373 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1326
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1601 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1554
>dbj|AB643787.1| Homo sapiens UbC gene for ubiquitin C, complete cds, clone: MKS7
Length=1602
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Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 235 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 186
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1373 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1326
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 461 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 414
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 689 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 642
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 917 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 870
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 1145 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1098
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Sbjct 461 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 414
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Sbjct 917 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 870
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1145 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1098
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1373 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1326
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1601 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1554
>dbj|AB643785.1| Homo sapiens UbC gene for ubiquitin C, complete cds, clone: BHP7
Length=1602
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Sbjct 235 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 186
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1375 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1326
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 461 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 414
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 689 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 642
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 917 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 870
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1145 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1098
>dbj|AK291539.1| Homo sapiens cDNA FLJ75516 complete cds, highly similar to Xenopus
tropicalis ubiquitin C, mRNA
Length=1963
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Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 302 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 253
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1668 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1621
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 756 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 709
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 984 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 937
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1212 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1165
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1440 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1393
>gb|AY819759.1| Homo sapiens ubiquitin C splice variant (UBC) mRNA, complete
cds, alternatively spliced
Length=718
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 253 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 204
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 479 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 432
>gb|AY732488.1| Homo sapiens ubiquitin C splice variant (UBC) mRNA, complete
cds, alternatively spliced
Length=490
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 253 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 204
>gb|BC080583.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:2822684, partial cds
Length=2187
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 276 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 227
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1870 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1823
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 502 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 455
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 958 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 911
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1186 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1139
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1414 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1367
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1642 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1595
>gb|BC039193.1| Homo sapiens ubiquitin C, mRNA (cDNA clone MGC:14624 IMAGE:4076286),
complete cds
Length=2222
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 254
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1897 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1850
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 529 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 482
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 985 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 938
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1213 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1166
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1394
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1622
>gb|BC000449.2| Homo sapiens ubiquitin C, mRNA (cDNA clone IMAGE:2821375)
Length=2201
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 239
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1882 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1835
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 514 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 467
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 970 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 923
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1198 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1151
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1379
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1607
>gb|BC008955.2| Homo sapiens ubiquitin C, mRNA (cDNA clone IMAGE:3030313), partial
cds
Length=1728
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 227
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1416 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1367
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1139
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 502 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 455
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 958 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 911
>dbj|AK097415.1| Homo sapiens cDNA FLJ40096 fis, clone TESTI2004080, highly similar
to Homo sapiens mRNA for polyubiquitin UbC
Length=1864
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1522
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 429 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 382
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 885 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 838
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1113 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1066
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1294
>dbj|AK092983.1| Homo sapiens cDNA FLJ35664 fis, clone SPLEN2017687, highly similar
to Polyubiquitin 9
Length=2784
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 2442
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1805 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1758
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2033 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1986
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2261 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 2214
>dbj|AB209782.1| Homo sapiens mRNA for ubiquitin C variant protein
Length=3996
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 234
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3703 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 3654
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 965 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 918
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Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1146
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1421 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1374
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1649 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1602
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Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1877 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1830
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 2105 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 2058
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2333 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 2286
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 2561 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 2514
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 509 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 462
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 2789 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 2742
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 3017 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 2970
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 3245 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 3198
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 3473 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 3426
>gb|BC093445.1| Homo sapiens ubiquitin C, mRNA (cDNA clone IMAGE:5284302)
Length=2207
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 302 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 253
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1898 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1849
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 528 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 481
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 984 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 937
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1212 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1165
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1440 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1393
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1668 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1621
>dbj|AK129749.1| Homo sapiens cDNA FLJ26238 fis, clone CBR05440, highly similar
to Rattus norvegicus ubiquitin C (Ubc)
Length=2191
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 302 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 253
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1898 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1849
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 528 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 481
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 984 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 937
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1212 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1165
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1440 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1393
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1668 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1621
>dbj|AB089613.1| Homo sapiens UbC gene for polyubiquitin C, complete cds
Length=2058
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 235 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 186
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1831 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1782
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 461 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 414
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 917 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 870
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1145 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1098
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1373 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1326
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1554
>gb|AC126309.8| Homo sapiens 12 BAC RP11-592O2 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=121984
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 104278 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 104327
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105874 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 105923
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104508 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 104555
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104736 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 104783
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 104964 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 105011
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 105192 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 105239
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 105648 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 105695
>dbj|AK098827.1| Homo sapiens cDNA FLJ25961 fis, clone TST09043, highly similar
to Polyubiquitin UbC
Length=2191
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 253
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1212 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1165
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1849
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 528 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 481
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 984 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 937
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1440 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1393
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1621
>dbj|AK026846.1| Homo sapiens cDNA: FLJ23193 fis, clone REC00306, highly similar
to AF052164 Homo sapiens clone 24683 mRNA sequence
Length=1082
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 314 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 265
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 721
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 540 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 493
>dbj|AB009010.1| Homo sapiens UbC1 mRNA for polyubiquitin UbC, complete cds
Length=2192
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 254
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1897 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1850
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 529 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 482
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 985 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 938
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1213 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1166
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1394
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1669 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1622
>dbj|AB003730.1| Homo sapiens gene for polyubiquitin, complete cds
Length=2291
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 610
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 2025 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1978
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 885 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 838
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1341 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1294
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Sbjct 582 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 535
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X2, mRNA
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Sbjct 1889 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1842
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Sbjct 1205 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGAGTAGACTCTTTC 1158
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X1, mRNA
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 811 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 764
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1495 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGAGTGGACTCTTTC 1448
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1723 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1676
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1039 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGAGTAGACTCTTTC 992
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X2, mRNA
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Sbjct 1041 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 994
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 585 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 538
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 813 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 766
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1269 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1222
>ref|XM_003907362.2| PREDICTED: Papio anubis ubiquitin C (UBC), transcript variant
X1, mRNA
Length=2010
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1485 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1438
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1029 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 982
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1713 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1666
>ref|XM_005572602.1| PREDICTED: Macaca fascicularis ubiquitin C (UBC), transcript
variant X2, mRNA
Length=2026
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1729 TGCATCCCACCTCTGAGGCGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1682
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1043 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 996
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Sbjct 1727 TGCATCCCACCTCTGAGGCGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1680
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1955 TGCATCCCACCTCTGAGGCGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1908
>ref|XM_004054142.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla polyubiquitin-B-like, transcript
variant 9 (LOC101151508), mRNA
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 610 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 563
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 838 TGCATTCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 791
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1066 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1019
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variant 8 (LOC101151508), mRNA
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 753 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 706
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 981 TGCATTCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 934
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1209 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1162
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variant 7 (LOC101151508), mRNA
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1059 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1012
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variant 6 (LOC101151508), mRNA
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Sbjct 1478 TGCATTCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1431
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Sbjct 1706 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1659
>dbj|AK306392.1| Pan troglodytes mRNA for ubiquitin, complete cds, clone: PtsC-41-5_F04
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Sbjct 579 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 532
>dbj|AK306071.1| Pan troglodytes mRNA for ubiquitin, complete cds, clone: PtsC-51-5_D12
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Sbjct 555 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 508
>ref|XM_002798835.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical protein LOC100426778 (LOC100426778),
mRNA
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1379 TGCATCCCACCTCTGAGGCGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1426
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variant 9 (LOC712934), mRNA
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Sbjct 816 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 769
>ref|XM_002798831.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC712934, transcript
variant 8 (LOC712934), mRNA
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Sbjct 538 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 491
>ref|XM_002798830.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC712934, transcript
variant 7 (LOC712934), mRNA
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Sbjct 522 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 475
>ref|XM_002798829.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC712934, transcript
variant 6 (LOC712934), mRNA
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Sbjct 572 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 525
>ref|XM_002798828.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC712934, transcript
variant 5 (LOC712934), mRNA
Length=1563
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Sbjct 577 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 530
>ref|XM_002798827.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC712934, transcript
variant 4 (LOC712934), mRNA
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Sbjct 484 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 437
>ref|XM_002798826.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC712934, transcript
variant 3 (LOC712934), mRNA
Length=1504
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Sbjct 518 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 471
>ref|XM_001102090.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC712934, transcript
variant 1 (LOC712934), mRNA
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Sbjct 523 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 476
>ref|XM_002798825.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC712934, transcript
variant 2 (LOC712934), mRNA
Length=1474
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Sbjct 488 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 441
>gb|BC014880.1| Homo sapiens ubiquitin C, mRNA (cDNA clone IMAGE:3907070), complete
cds
Length=1122
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Sbjct 808 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 761
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Sbjct 124 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 77
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Sbjct 352 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 305
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 580 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 533
>dbj|AB089616.1| Pongo pygmaeus UbC gene for polyubiquitin C, complete cds
Length=2286
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Sbjct 233 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 186
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1829 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1782
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 2057 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 2010
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 461 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 414
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 689 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 642
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Sbjct 1373 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGAGTGGACTCTTTC 1326
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Sbjct 1601 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1554
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 917 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGAGTAGACTCTTTC 870
>dbj|AB089615.1| Gorilla gorilla UbC gene for polyubiquitin C, complete cds
Length=1830
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Minus
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Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 917 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 870
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Sbjct 1145 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1098
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 1373 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 1326
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Sbjct 233 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 186
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Sbjct 1601 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1554
>ref|NM_001135606.1| Pan troglodytes ubiquitin C (UBC), mRNA
dbj|AB089614.1| Pan troglodytes UbC gene for polyubiquitin C, complete cds
Length=2286
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Sbjct 233 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 186
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 2057 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 2010
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Sbjct 1147 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1098
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Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 461 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 414
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Sbjct 917 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 870
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1373 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1326
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 1601 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 1554
>emb|AL117514.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434K0435 (from clone DKFZp434K0435);
partial cds
Length=796
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Sbjct 491 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 444
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 263 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 216
>gb|AF052164.1|AF052164 Homo sapiens clone 24683 mRNA sequence
Length=1168
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 842 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 795
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 158 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 111
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 386 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 339
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 614 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 567
>gb|M17597.1|HUMUB Human poly-ubiquitin mRNA, complete cds
Length=824
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 581 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 534
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 125 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 78
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 353 TGCATCCCACCTCTAAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 306
>ref|XM_009440510.1| PREDICTED: Pan troglodytes polyubiquitin-B-like (LOC101058448),
mRNA
Length=1297
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Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 607 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 558
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 377 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 330
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 833 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 786
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X4, mRNA
Length=665
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 370 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 321
>ref|XM_008971121.1| PREDICTED: Pan paniscus ubiquitin C (UBC), transcript variant
X3, mRNA
Length=829
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 534 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 485
>ref|XM_008971120.1| PREDICTED: Pan paniscus ubiquitin C (UBC), transcript variant
X2, mRNA
Length=862
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 567 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 518
>ref|XM_008971119.1| PREDICTED: Pan paniscus ubiquitin C (UBC), transcript variant
X1, mRNA
Length=977
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 682 TTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 633
>ref|XM_008574288.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus ubiquitin C (UBC), mRNA
Length=1450
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Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 236 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 189
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 464 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 417
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 692 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 645
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 920 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 873
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1148 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 1101
>ref|XM_008570801.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=709
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 335 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAAGGTGGACTCTTTC 288
>ref|XM_008005182.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ubiquitin C (UBC), mRNA
Length=870
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 573 TGCATCCCACCTCTGAGGCGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 526
>ref|XM_004668457.1| PREDICTED: Jaculus jaculus uncharacterized LOC101595486 (LOC101595486),
mRNA
Length=711
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 245 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCCTTC 198
>gb|AC198435.4| MACACA MULATTA BAC clone CH250-163A12 from chromosome 11, complete
sequence
Length=179732
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Strand=Plus/Plus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65660 TGCATCCCACCTCTGAGGCGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 65707
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Plus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66344 TGCATCCCACCTCTGAGGCGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 66391
>dbj|AK056939.1| Homo sapiens cDNA FLJ32377 fis, clone SKMUS1000014, highly similar
to Polyubiquitin 9
Length=1300
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 438 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 391
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC 50
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Sbjct 894 TGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC 847
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG
>ref|NG_027722.2| Homo sapiens ubiquitin C (UBC), RefSeqGene on chromosome 12
Length=10396
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 50
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Sbjct 5433 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 5482
>gb|AC126309.8| Homo sapiens 12 BAC RP11-592O2 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=121984
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106946 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 106897
>gb|KJ796484.1| Cloning vector dCas9-3xNLS-VP64, complete sequence
Length=13567
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 50
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Sbjct 2986 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTTGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 3035
>gb|EU048696.1| Shuttle vector pLV.mMyoD::ERT2.eGFP, complete sequence
Length=12603
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 50
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Sbjct 2752 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTTGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 2801
>dbj|D63791.1|HUMPOLYUBI Homo sapiens UbC gene for polyubiquitin, exon1-2, partial cds
Length=6605
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3936 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTTGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 3985
>ref|XM_004054139.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla polyubiquitin-B-like, transcript
variant 6 (LOC101151508), mRNA
Length=1410
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 50
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 TGGATCGTTGTGATCGCCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 91
>ref|XM_004054137.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla polyubiquitin-B-like, transcript
variant 4 (LOC101151508), mRNA
Length=2237
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 50
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 764 TGGATCGTTGTGATCGCCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 813
>ref|XM_002823971.3| PREDICTED: Pongo abelii ubiquitin C (UBC), transcript variant
X2, mRNA
Length=2414
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATCGCTGTGATCGTCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 50
||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 TGGGTCGCTGTAATCGCCACTTGGTGAGTAGCGGGCTGCTGGGCTGGCCG 323
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
12 12 125397101 125397885 28M684N72M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCGCCAG
12 12 125397116 125397900 13M684N87M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGCCGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTC
12 12 125397226 125398010 98M684N2M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TT
12 12 125397519 125397847 11M228N89M ACCAGTCAGGGTCTTC
12 12 125397585 125399145 53M456N38M125399155F9m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTG TGGATTGCT
12 12 125397732 125397832 100M A
12 12 125397735 125397835 100M ACCA
12 12 125397738 125397838 100M ACCAGTC
12 12 125397741 125397841 100M ACCAGTCAGG
12 12 125397744 125397844 100M ACCAGTCAGGGTC
12 12 125397747 125397847 100M ACCAGTCAGGGTCTTC
12 12 125397750 125397850 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACG
12 12 125397753 125397853 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAG
12 12 125397756 125397856 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATC
12 12 125397759 125397859 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGC
12 12 125397762 125397862 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATC
12 12 125397765 125397865 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCA
12 12 125397768 125397868 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCT
12 12 125397771 125397871 100M ACCAGTCAGGGCCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTG
12 12 125397774 125397874 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGA
12 12 125397777 125397877 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGG
12 12 125397780 125397880 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGC
12 12 125397783 125397883 100M AGCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACC
12 12 125397786 125397886 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGG
12 12 125397789 125397889 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGC
12 12 125397792 125397892 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGG
12 12 125397795 125397895 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTA
12 12 125397798 125397898 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGAC
12 12 125397801 125397901 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCT
12 12 125397804 125397904 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTC
12 12 125397807 125397907 100M ACCAGTCAGGGTCTTCAAGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGG
12 12 125397810 125397910 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATG
12 12 125397813 125397913 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCCCCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTCTGGATGTTG
12 12 125397816 125397916 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAG
12 12 125397819 125397919 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCA
12 12 125397822 125397922 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGAC
12 12 125397825 125397925 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGG
12 12 125397828 125397928 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTG
12 12 125397831 125397931 100M ACCAGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGC
12 12 125397834 125397934 100M AGTCAGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCA
12 12 125397837 125397937 100M CGGGGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCCTCT
12 12 125397840 125397940 100M GGTCTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCC
12 12 125397843 125397943 100M CTTCACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGC
12 12 125397846 125397946 100M CACGAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGC
12 12 125397849 125397949 100M GAAGATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTT
12 12 125397852 125397952 100M GATCTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCG
12 12 125397855 125397955 100M CTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCA
12 12 125397858 125397958 100M CATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAG
12 12 125397861 125397961 100M CCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATC
12 12 125397864 125397964 100M AACTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAAC
12 12 125397867 125397967 100M TCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTC
12 12 125397870 125397970 100M GAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGC
12 12 125397873 125397973 100M ACGGAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGG
12 12 125397876 125397976 100M GAGCACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCA
12 12 125397879 125397979 100M CACCAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGA
12 12 125397882 125397982 100M CAGGTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGA
12 12 125397885 125397985 100M GTGCAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATG
12 12 125397888 125397988 100M CAGGGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCT
12 12 125397891 125397991 100M GGTAGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCC
12 12 125397894 125397994 100M AGACTCTTTCTGGATGGTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCATTCCTTG
12 12 125397897 125397997 100M CTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCC
12 12 125397900 125398000 100M TTTCTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGG
12 12 125397903 125398003 100M CTGGATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATC
12 12 125397906 125398006 100M GATGTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATATTT
12 12 125397909 125398009 100M GTTGTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCTTGGATCTTTGCT
12 12 125397912 125398012 100M GTAGTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTG
12 12 125397915 125398015 100M GTCAGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACG
12 12 125397918 125398018 100M AGACAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTC
12 12 125397921 125398021 100M CAGGGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCG
12 12 125397924 125398024 100M GGTGCGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTTACGTTCTCGATG
12 12 125397927 125398027 100M GTGCCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTG
12 12 125397930 125398030 100M CCCATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCA
12 12 125397933 125398033 100M ATCTTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTG
12 12 125397936 125398036 100M TTCCAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGC
12 12 125397939 125398039 100M CAGCTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCG
12 12 125397942 125398042 100M CTGCTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACC
12 12 125397945 125398045 100M CTTTCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCCACCTCA
12 12 125397948 125398048 100M TCCGGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGG
12 12 125397951 125398051 100M GGCAAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCCACCTCAAGGGTG
12 12 125397954 125398054 100M AAAGATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATG
12 12 125397957 125398057 100M GATCAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTC
12 12 125397960 125398060 100M CAACCTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGTTGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTG
12 12 125397963 125398063 100M CTTCTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCA
12 12 125397966 125398066 100M CTGCTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTG
12 12 125397969 125398069 100M CTGGTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCCACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGT
12 12 125397972 125398072 100M GTCAGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTC
12 12 125397975 125398075 100M AGGAGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCCACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTC
12 12 125397978 125398078 100M AGGAATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACG
12 12 125397981 125398081 100M AATGCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAG
12 12 125397984 125398084 100M GCCTTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCCACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATT
12 12 125397987 125398087 100M TTCCTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGC
12 12 125397990 125398090 100M CTTGTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTAAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATC
12 12 125397993 125398093 100M GTCCTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCCACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCA
12 12 125397996 125398096 100M CTGGATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCCACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCT
12 12 125397999 125398099 100M GATCTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCCACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTG
12 12 125398002 125398102 100M CTTTGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGA
12 12 125398005 125398105 100M TGCTTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGG
12 12 125398008 125398108 100M TTTGACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGC
12 12 125398011 125398111 100M GACGTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACC
12 12 125398014 125398114 100M GTTCTCGATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGG
12 12 125398017 125398117 100M CTCGATGGTGTCACTGGGCTCCACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGC
12 12 125398020 125398120 100M GATGGTGTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGG
12 12 125398023 125398123 100M GGTGTCACTGGGCTCCACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTG
12 12 125398026 125398126 100M GTCACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGAC
12 12 125398029 125398129 100M ACTGGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCT
12 12 125398032 125398132 100M GGGCTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC
12 12 125398035 125398135 100M CTCGACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTCTGG
12 12 125398038 125398138 100M GACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTCTGGATG
12 12 125398041 125399145 91M125399155F9m CTCAAGGGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTG TGGATTGCT
12 12 125398047 125399139 85M125399155F15m GGTGATGGTCTTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC TGGATCGCTGTGATC
12 12 125398057 125398317 75M125399155F23m812n2m TTGCCAGTGAGTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC TGGATCGCTGTGATCGTCACTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 12 125398067 125398307 65M125399155F23m812n12m GTGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC TGGATTGCTGTGATCGTCACTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 12 125398068 125398306 64M125399155F23m812n13m TGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC TGGATTGCTGTGATCGTCACTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 12 125398068 125398306 64M125399155F23m812n13m TGTCTTCACGAAGATTTGCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC TGGATTGCTGTGATCGTCACTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 12 125398085 125398289 47M125399155F23m812n30m GCATCCCACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC TGGATTGCTGTGATCGTCACTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 12 125398091 125398283 41M125399155F23m812n36m CACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC TGGATCTCTGTGATCGTCACTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 12 125398091 125398283 41M125399155F23m812n36m CACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC TGGATCGCTGTGATCGTCACTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 12 125398091 125398283 41M125399155F23m812n36m CACCTCTGAGACGGAGCACCAGGTGCAGGGTGGACTCTTTC TGGATCGCTGTGATCGTCACTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>ref|NW_001838987.1| Homo sapiens chromosome 6 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188274:60646-25191606, whole genome shotgun
sequence
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sequence
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 49
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shotgun sequence
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 49
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 49
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Sbjct 145262095 AAGGATGTCCTTGATTTGTTTTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 145262143
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genome shotgun sequence
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>ref|NW_004929321.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>gb|DS486056.1| Homo sapiens SCAF_1103279188406 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 31791881 AAGGATGTGCTTGACATGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 31791832
>ref|NW_001838929.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188406:7331849-20130985, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 10515251 AAGGATGTGCTTGACATGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 10515202
>gb|CH471118.1| Homo sapiens 211000035844875 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=12667399
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Sbjct 10352220 AAGGATGTGCTTGACATGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 10352171
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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>ref|NW_004929328.1| Homo sapiens chromosome 6 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 49
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Sbjct 48856613 AAGGATGTCCTTGATTTGTTTTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 48856661
>gb|GL582981.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_1, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 49
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shotgun sequence
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 49
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Sbjct 13037813 AAGGATGTCCTTGATTTGTTTTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 13037765
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HuRef SCAF_1103279188145, whole genome shotgun sequence
gb|DS486018.1| Homo sapiens SCAF_1103279188145 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 49
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Lambda K H
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HSCHR13_CTG1
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assembly
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genome shotgun sequence
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 26862830 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 26862781
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 26706608 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 26706559
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HuRef SCAF_1103279188117, whole genome shotgun sequence
gb|DS486093.1| Homo sapiens SCAF_1103279188117 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 80495 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 80544
>ref|AC_000145.1| Homo sapiens chromosome 13, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 26716397 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 26716348
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Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 499 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 450
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tumor protein pseudogene (LOC101053384), misc_RNA
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Sbjct 490 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 441
>ref|XM_003934362.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 675 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 626
>ref|XR_750528.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana translationally-controlled
tumor protein pseudogene (LOC104680995), misc_RNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 362 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 313
>ref|XM_010374969.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana TPT1-like protein (LOC104671468),
mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 851 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 802
>ref|XM_010368051.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 676 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 627
>ref|XM_009440523.1| PREDICTED: Pan troglodytes tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 534 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 485
>ref|XM_001139202.4| PREDICTED: Pan troglodytes translationally-controlled tumor protein
(LOC735922), mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 491 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 442
>ref|XR_674242.1| PREDICTED: Pan troglodytes translationally-controlled tumor protein
pseudogene (LOC741416), misc_RNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 490 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 441
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(LOC100442178), partial mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 456 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 407
>ref|XM_002824239.3| PREDICTED: Pongo abelii tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 680 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 631
>ref|XR_656432.1| PREDICTED: Pongo abelii translationally-controlled tumor protein
pseudogene (LOC100447734), misc_RNA
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Sbjct 510 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 461
>ref|XR_655582.1| PREDICTED: Pongo abelii translationally-controlled tumor protein
pseudogene (LOC100442185), misc_RNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 511 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 462
>ref|XM_002815461.2| PREDICTED: Pongo abelii translationally-controlled tumor protein-like
(LOC100447053), partial mRNA
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Sbjct 373 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 324
>ref|XM_009197797.1| PREDICTED: Papio anubis TPT1-like protein (LOC101017377), mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 748 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 699
>ref|XM_009191883.1| PREDICTED: Papio anubis tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 674 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 625
>ref|XR_159881.2| PREDICTED: Papio anubis translationally-controlled tumor protein
pseudogene (LOC101013755), misc_RNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 488 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 439
>ref|XR_158125.2| PREDICTED: Pan paniscus translationally-controlled tumor protein
pseudogene (LOC100968081), misc_RNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 487 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 438
>ref|XR_091160.3| PREDICTED: Callithrix jacchus translationally-controlled tumor
protein pseudogene (LOC100385944), misc_RNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 422 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 373
>ref|XR_614460.1| PREDICTED: Callithrix jacchus translationally-controlled tumor
protein pseudogene (LOC100407629), misc_RNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 485 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 436
>ref|XR_613368.1| PREDICTED: Callithrix jacchus translationally-controlled tumor
protein pseudogene (LOC100401303), misc_RNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 487 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 438
>ref|XM_003807670.2| PREDICTED: Pan paniscus tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 677 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 628
>ref|XM_003806279.2| PREDICTED: Pan paniscus translationally-controlled tumor protein
(LOC100973098), mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 495 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 446
>ref|XR_619374.1| PREDICTED: Callithrix jacchus translationally-controlled tumor
protein pseudogene (LOC100386275), misc_RNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 484 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 435
>ref|XR_087228.3| PREDICTED: Callithrix jacchus translationally-controlled tumor
protein pseudogene (LOC100390458), misc_RNA
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gene, encodes complete protein
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mRNA
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Sbjct 462 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 413
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Sbjct 519 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 470
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Sbjct 344 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 295
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tumor protein-like (LOC102959110), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 344 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 295
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1 (TPT1), transcript variant X2, misc_RNA
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Sbjct 501 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 452
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Sbjct 460 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 411
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Sbjct 485 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 436
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Sbjct 485 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 436
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1 (TPT1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 347 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 298
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1 (TPT1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 347 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 298
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protein-like (LOC102324709), mRNA
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Sbjct 463 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 414
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 284 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 235
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(LOC102269822), mRNA
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Sbjct 378 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 329
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Sbjct 593 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 544
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transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 593 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 544
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transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 519 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 470
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(LOC102179679), mRNA
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Sbjct 296 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 247
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 609 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 560
>ref|XM_005585783.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101866841 (LOC101866841),
mRNA
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protein-like (LOC102124126), mRNA
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Sbjct 342 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 293
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protein-like (LOC102131552), mRNA
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Sbjct 485 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 436
>ref|XM_005340365.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus tumor protein, translationally-controlled
1 (Tpt1), mRNA
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Sbjct 488 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 439
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(LOC100297647), mRNA
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(LOC100297647), mRNA
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Sbjct 246 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 197
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1, transcript variant 2 (TPT1), mRNA
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Sbjct 439 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 390
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1, transcript variant 1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 535 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 486
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 492 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 443
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1, transcript variant 3 (TPT1), mRNA
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Sbjct 678 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 629
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1, transcript variant 2 (TPT1), mRNA
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Sbjct 483 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 434
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1, transcript variant 1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 678 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 629
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protein-like (LOC100590754), mRNA
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Sbjct 504 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 455
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 550 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 501
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 550 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 501
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 550 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 501
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 550 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 501
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(LOC101103097), mRNA
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Sbjct 267 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 218
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(LOC101102075), misc_RNA
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Sbjct 537 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 488
>ref|XM_004011040.1| PREDICTED: Ovis aries translationally-controlled tumor protein-like
(LOC101116579), mRNA
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Sbjct 467 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 418
>ref|NG_021634.2| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1 pseudogene
9 (TPT1P9) on chromosome 9
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Sbjct 571 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 522
>ref|NM_001280680.1| Ovis aries tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
mRNA
gb|JX534529.1| Ovis aries tumor protein translationally-controlled 1 (TCTP)
mRNA, complete cds
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Sbjct 477 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 428
>ref|NM_001082129.2| Oryctolagus cuniculus tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 494 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 445
>ref|NM_001098546.2| Pan troglodytes tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
mRNA
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Sbjct 491 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 442
>ref|NM_001266379.1| Macaca mulatta tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
mRNA
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Sbjct 476 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 427
>ref|NG_029987.1| Bos taurus tumor protein, translationally-controlled 1 pseudogene
(LOC100337367) on chromosome 25
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Sbjct 579 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 530
>gb|JF432827.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100074146 tumor
protein, translationally-controlled 1 (TPT1) gene, encodes complete
protein
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Sbjct 428 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 379
>gb|HQ326687.1| Fukomys anselli translationally-controlled tumor protein 1 mRNA,
complete cds
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 553 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 504
>ref|XM_002805821.1| PREDICTED: Macaca mulatta translationally-controlled tumor protein-like,
transcript variant 2 (LOC702001), mRNA
Length=713
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 325 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 276
>ref|XM_001090279.2| PREDICTED: Macaca mulatta translationally-controlled tumor protein-like,
transcript variant 1 (LOC702001), mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 358 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 309
>ref|XR_012638.2| PREDICTED: Macaca mulatta translationally-controlled tumor protein-like
(TPT1), miscRNA
Length=898
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 506 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 457
>ref|XM_002802007.1| PREDICTED: Macaca mulatta tumor protein, translationally-controlled
1, transcript variant 2 (TPT1), mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 432 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 383
>ref|XM_001112392.2| PREDICTED: Macaca mulatta tumor protein, translationally-controlled
1, transcript variant 1 (TPT1), mRNA
Length=859
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 504 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 455
>emb|CU692615.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100022050
3' read TPT1 mRNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 157 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 206
>emb|CU692614.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100022050
5' read TPT1 mRNA
Length=1371
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 292 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 243
>emb|CU680325.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100020621
3' read TPT1 mRNA
Length=1212
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 157 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 206
>emb|CU680324.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100020621
5' read TPT1 mRNA
Length=1207
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 394 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 345
>gb|EU370543.1| Ovis aries translationally-controlled 1 mRNA, partial cds
Length=337
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 196 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 147
>dbj|AK312951.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93407, Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1),mRNA
Length=633
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 492 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 443
>gb|EF564271.1| Capra hircus translationally-controlled 1 mRNA, partial cds
Length=563
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 473 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 424
>dbj|AB222130.1| Pan troglodytes verus tpt1 mRNA for tumor protein, translationally-controlled
1, complete cds, clone: PorA0848
Length=859
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 493 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 444
>dbj|AB173185.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-21442, similar to
human tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1), mRNA,
RefSeq: NM_003295.1
Length=862
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 492 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 443
>dbj|AB170187.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10679, similar to
human tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1), mRNA,
RefSeq: NM_003295.1
Length=1101
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 473 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 424
>gb|BC007842.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4128378, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1833
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 482 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 433
>gb|AY952884.2| Homo sapiens antigen MMSA-4 mRNA sequence
Length=931
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 443 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 492
>gb|BC002747.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone IMAGE:3630774)
Length=1446
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 1078 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 1029
>gb|BC052333.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:61507 IMAGE:6058799), complete cds
Length=858
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 482 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 433
>gb|BC012431.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:9981 IMAGE:3880559), complete cds
Length=818
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 452 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 403
>gb|BC003352.2| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:5308 IMAGE:2899964), complete cds
Length=840
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 476 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 427
>gb|BC022436.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:24736 IMAGE:4281364), complete cds
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 447 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 398
>gb|BC040008.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone IMAGE:5219529), complete cds
Length=1892
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 780 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 731
>gb|AY334563.1| Homo sapiens cell-type eosinophil TCTP mRNA, complete cds
Length=519
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Sbjct 378 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 329
>gb|BC104562.1| Bos taurus tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:128232 IMAGE:7948168), complete cds
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Sbjct 488 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 439
>dbj|AB169537.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QflA-10115, similar to
human tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),mRNA,
RefSeq: NM_003295.1
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Sbjct 887 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 838
>gb|AY121805.1| Homo sapiens BJ-HCC-24 tumor antigen mRNA, complete cds
Length=1488
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Sbjct 1099 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 1050
>emb|AL138963.20| Human DNA sequence from clone RP11-290D2 on chromosome 13, complete
sequence
Length=161297
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Sbjct 145299 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 145348
>emb|AL445663.10| Human DNA sequence from clone RP11-442A13 on chromosome 9, complete
sequence
Length=192226
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Sbjct 131176 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 131225
>gb|DQ000539.1| Synthetic construct clone PSF:107903 TPT1 gene, complete cds
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Sbjct 450 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 401
>emb|CR457036.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0415D
for gene TPT1, tumor protein, translationally-controlled 1;
complete cds, incl. stopcodon
Length=519
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Sbjct 378 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 329
>dbj|AK130847.1| Homo sapiens cDNA FLJ27337 fis, clone TMS09488, highly similar
to Translationally controlled tumor protein
Length=841
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Sbjct 492 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 443
>gb|AY117678.1| Homo sapiens p02 protein mRNA, complete cds
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 493 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 444
>emb|AJ277093.1| Oryctolagus cuniculus mRNA for translationally controlled tumor
protein 4
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Sbjct 498 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 449
>emb|AJ277092.1| Oryctolagus cuniculus mRNA for translationally controlled tumor
protein 3
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Sbjct 495 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 446
>emb|AJ400717.1| Homo sapiens TPT1 gene for translationally controlled tumor protein
(TCTP), exons 1-6
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Sbjct 2777 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 2728
>dbj|AK000037.1| Homo sapiens cDNA FLJ20030 fis, clone ADSU02156
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Sbjct 1099 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 1050
>emb|AJ131951.1| Oryctolagus cuniculus mRNA for translationally controlled tumor
protein (TCTP)
Length=1164
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Sbjct 494 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 445
>emb|AJ225898.1| Oryctolagus cuniculus TCTP gene
Length=5020
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 2749 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 2700
>emb|Z46805.1| O.cuniculus mRNA for tumour associated protein
Length=844
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 492 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 443
>emb|X16064.1| Human mRNA for translationally controlled tumor protein
Length=830
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 472 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 423
>ref|NM_001014388.1| Bos taurus tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
mRNA
gb|BT021036.1| Bos taurus tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
mRNA, complete cds
Length=832
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 479 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 430
>dbj|AB099031.1| Bos taurus mRNA for similar to translationally controlled tumor
protein, partial cds, clone: ORCS12571
Length=570
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 483 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 434
>dbj|AB098782.1| Bos taurus mRNA for similar to tumor protein, translationally-controlled
1, partial cds, clone: ORCS12375
Length=700
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 385 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 434
>dbj|AB098755.1| Bos taurus mRNA for similar to translationally controlled tumor
protein, partial cds, clone: ORCS10822
Length=647
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 345 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 394
>emb|AJ131955.1| Oryctolagus cuniculus pseudogene tpt1-ps4
Length=1316
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 619 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 570
>emb|AJ131954.1| Oryctolagus cuniculus pseudogene tpt1-ps3
Length=1516
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 699 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 650
>emb|AJ131953.1| Oryctolagus cuniculus pseudogene tpt1-ps2
Length=1197
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 692 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 643
>emb|AJ131952.1| Oryctolagus cuniculus pseudogene tpt1-ps1
Length=1207
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 703 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 654
>gb|L13806.1|HUMCH13C4A Homo sapiens (clone 04) translationally controlled tumor protein
mRNA, 3' end
Length=563
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 164
>emb|X64899.1| H.sapiens mRNA homologous to mouse P21 mRNA
Length=819
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 464 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 415
>ref|XR_155067.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tumor protein, translationally-controlled
1 pseudogene (LOC100962460), misc_RNA
Length=834
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 2 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 433
>ref|XR_154149.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tumor protein, translationally-controlled
1 pseudogene (LOC100946227), misc_RNA
Length=727
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 329
>ref|XR_154070.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tumor protein, translationally-controlled
1 pseudogene (LOC100941997), misc_RNA
Length=714
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 2 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 317
>ref|XR_154040.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tumor protein, translationally-controlled
1 pseudogene (LOC100960296), misc_RNA
Length=1075
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 2 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 349
>ref|XM_003790356.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
Length=1342
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 595
>ref|XR_646199.1| PREDICTED: Papio anubis translationally-controlled tumor protein
pseudogene (LOC103883830), misc_RNA
Length=677
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTAC 48
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Sbjct 350 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTAC 303
>ref|XM_003313187.3| PREDICTED: Pan troglodytes translationally-controlled tumor protein
(LOC466689), mRNA
Length=841
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 489 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTCACTC 440
>ref|XR_651843.1| PREDICTED: Papio anubis translationally-controlled tumor protein
pseudogene (LOC101006672), misc_RNA
Length=547
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 328 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCCGTCATAAAAGGTTTTACTC 279
>ref|XR_161319.2| PREDICTED: Papio anubis translationally-controlled tumor protein
pseudogene (LOC101009879), misc_RNA
Length=862
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 500 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCGTGTCATAAAAGGTTTTACTC 451
>ref|XM_008145560.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), transcript variant X2, mRNA
Length=1105
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 444 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 395
>ref|XM_008145559.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), transcript variant X1, mRNA
Length=827
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 483 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 434
>ref|XM_008070923.1| PREDICTED: Tarsius syrichta translationally-controlled tumor
protein (LOC103273489), mRNA
Length=845
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 AAGGATGCGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 440
>ref|XM_007466459.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer translationally-controlled tumor
protein-like (LOC103077765), mRNA
Length=840
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 AAGGATATGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 439
>ref|XM_007186821.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni translationally-controlled
tumor protein-like (LOC103006911), mRNA
Length=731
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377 AAGGATATGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 328
>ref|XM_007129789.1| PREDICTED: Physeter catodon translationally-controlled tumor
protein-like (LOC102985341), transcript variant X2, mRNA
Length=778
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426 AAGGATATGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 377
>ref|XM_007129788.1| PREDICTED: Physeter catodon translationally-controlled tumor
protein-like (LOC102985341), transcript variant X1, mRNA
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1 pseudogene (LOC102327320), misc_RNA
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tumor protein-like (LOC101976996), misc_RNA
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Sbjct 378 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 329
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Sbjct 518 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 469
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1 (TPT1), transcript variant X3, misc_RNA
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Sbjct 367 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 318
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Sbjct 518 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 469
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1 (TPT1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 518 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 469
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Sbjct 485 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTGACTC 436
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 459 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGATTTTACTC 410
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tumor protein-like (LOC101400647), misc_RNA
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Sbjct 525 AAGGATGTGCTTGATTTGTCCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 476
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Sbjct 504 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 455
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Sbjct 462 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 413
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 538 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 489
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tumor protein-like (LOC101380512), mRNA
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Sbjct 497 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 448
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1 pseudogene (LOC101345249), misc_RNA
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Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 473 AAGGATGTGCTTGATTTATTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 424
>ref|XR_185698.1| PREDICTED: Tursiops truncatus translationally-controlled tumor
protein-like (LOC101317231), misc_RNA
Length=1042
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AAGGATATGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 312
>ref|XM_004274576.1| PREDICTED: Orcinus orca tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
Length=899
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 540 AAGGATATGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 491
>ref|NG_030180.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1 pseudogene
6 (TPT1P6) on chromosome 6
Length=905
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 571 AAGGATGTGTTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 522
>ref|XR_011226.2| PREDICTED: Macaca mulatta translationally-controlled tumor protein-like
(LOC699013), miscRNA
Length=740
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Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTA 47
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Sbjct 378 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTA 332
>ref|XM_001088644.2| PREDICTED: Macaca mulatta translationally-controlled tumor protein-like
(LOC697631), mRNA
Length=767
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 306 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCCGTCATAAAAGGTTTTACTC 257
>ref|NM_001173082.1| Cavia porcellus tumor protein, translationally-controlled 1 (Tpt1),
mRNA
gb|EU330893.1| Cavia porcellus TPT1 (TPT1) mRNA, complete cds
Length=1147
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 475 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAACGGTTTTACTC 426
>gb|AC211722.5| Macaca mulatta BAC CH250-408G3 (Children's Hospital Oakland Research
Institute Rhesus macaque Adult Male BAC Library) complete
sequence
Length=161562
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Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTA 47
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Sbjct 107800 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTA 107846
>gb|AC193522.9| Rhesus Macaque BAC CH250-110H20 () complete sequence
Length=177619
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTA 47
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Sbjct 30237 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTA 30191
>emb|AL135903.12| Human DNA sequence from clone RP11-30P6 on chromosome 6, complete
sequence
Length=170232
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 142028 AAGGATGTGTTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 142077
>dbj|AB098973.1| Bos taurus mRNA for similar to tumor protein, translationally-controlled
1, partial cds, clone: ORCS11485
Length=548
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTT-TTACTC 50
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Sbjct 470 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTGTTACTC 420
>ref|XM_008706830.1| PREDICTED: Ursus maritimus tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
Length=628
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Strand=Plus/Minus
Query 2 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 276 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 228
>ref|XM_008564800.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus translationally-controlled
tumor protein-like (LOC103583503), partial mRNA
Length=532
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Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455 AGGATGTGCTTCATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 407
>ref|XR_153715.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tumor protein, translationally-controlled
1 pseudogene (LOC100944199), misc_RNA
Length=869
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Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 ATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 492 ATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 447
>ref|XM_002914966.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca translationally-controlled
tumor protein-like (LOC100481229), mRNA
Length=1212
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 531 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 483
>ref|XM_001097510.2| PREDICTED: Macaca mulatta tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
Length=614
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Strand=Plus/Minus
Query 3 GGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 376 GGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAAGTTTTACTC 329
>ref|XM_003203326.2| PREDICTED: Meleagris gallopavo tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 385 AAGGATGTGTTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 336
>ref|XM_007526606.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus translationally-controlled tumor
protein (LOC103116664), transcript variant X2, mRNA
Length=1099
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 445 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCCGTCATAAAGGGTTTTACTC 396
>ref|XM_007526605.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus translationally-controlled tumor
protein (LOC103116664), transcript variant X1, mRNA
Length=829
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 484 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCCGTCATAAAGGGTTTTACTC 435
>ref|XM_006727679.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii translationally-controlled
tumor protein-like (LOC102729480), mRNA
Length=834
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 487 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGACTTTACTC 438
>ref|XM_006757177.1| PREDICTED: Myotis davidii tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
Length=1019
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 357 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATGAAAGGCTTTACTC 308
>ref|XM_006085523.1| PREDICTED: Myotis lucifugus translationally-controlled tumor
protein-like (LOC102418627), mRNA
Length=744
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 449 AAGGATGTGCGTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 400
>ref|XM_005858719.1| PREDICTED: Myotis brandtii translationally-controlled tumor protein-like
(LOC102251756), mRNA
Length=648
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 392 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCACAAAAGGCTTTACTC 343
>ref|XM_005633903.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
Length=1202
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 527 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAGGGCTTTACTC 478
>ref|XM_004868988.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber translationally-controlled tumor
protein-like (LOC101700407), partial mRNA
Length=514
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 424 AAGGATGTGTTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGATTTACTC 375
>ref|XM_004698763.1| PREDICTED: Echinops telfairi translationally-controlled tumor
protein-like (LOC101656331), mRNA
Length=841
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 485 AAGGATGTTCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 436
>ref|XM_004471269.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus translationally-controlled tumor
protein-like (LOC101435405), mRNA
Length=591
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 432 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTGATAAAAGATTTTACTC 383
>ref|XR_152690.1| PREDICTED: Otolemur garnettii tumor protein, translationally-controlled
1 pseudogene (LOC100944657), misc_RNA
Length=857
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTT 45
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Sbjct 494 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTT 451
>ref|NM_001279828.1| Heterocephalus glaber tumor protein, translationally-controlled
1 (Tpt1), mRNA
gb|HQ326688.1| Heterocephalus glaber translationally-controlled tumor protein
1 mRNA, complete cds
Length=914
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 544 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCCGTCATAAAAGGCTTTACTC 495
>ref|XM_009644772.1| PREDICTED: Egretta garzetta tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
Length=645
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 AGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 275 AGGATGTGTTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTACTC 227
>ref|NG_022331.2| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1 pseudogene
4 (TPT1P4) on chromosome 6
Length=1018
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 49
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 AAGGATGTCCTTGATTTGTTTTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 522
>emb|AL135917.15| Human DNA sequence from clone RP1-83M4 on chromosome 6, complete
sequence
Length=104228
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 49
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Sbjct 49260 AAGGATGTCCTTGATTTGTTTTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACT 49308
>ref|XR_748470.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana translationally-controlled
tumor protein pseudogene (LOC104665860), misc_RNA
Length=704
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 9 GCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 GCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 328
>ref|XM_008827730.1| PREDICTED: Nannospalax galili tumor protein, translationally-controlled
1 (Tpt1), mRNA
Length=890
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 542 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCAGTCATAAAGGGCTTTACTC 493
>ref|XM_007462846.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer translationally-controlled tumor
protein-like (LOC103072502), mRNA
Length=519
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 378 AAGGATATTCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTCCTC 329
>ref|XM_006166522.1| PREDICTED: Tupaia chinensis translationally-controlled tumor
protein-like (LOC102472694), mRNA
Length=728
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 375 AAGAATATGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAATGGTTTTACTC 326
>ref|XM_006140922.1| PREDICTED: Tupaia chinensis translationally-controlled tumor
protein-like (LOC102490383), mRNA
Length=549
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 386 AAGAATATGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAATGGTTTTACTC 337
>ref|XM_005374671.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera translationally-controlled tumor
protein-like (LOC102011172), mRNA
Length=630
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
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Sbjct 477 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCTTGTCATAAATGGCTTTACTC 428
>ref|XM_004860537.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber translationally-controlled tumor
protein-like (LOC101696572), mRNA
Length=498
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTA 47
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 378 AAGGATGTGCTTGTTTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTA 332
>ref|XM_004895084.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber translationally-controlled tumor
protein-like (LOC101700407), partial mRNA
Length=509
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 424 AAGGATATGTTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGATTTACTC 375
>ref|XM_004892172.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber translationally-controlled tumor
protein-like (LOC101696572), mRNA
Length=666
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTA 47
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 378 AAGGATGTGCTTGTTTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGCTTTA 332
>ref|XR_504842.1| PREDICTED: Tarsius syrichta translationally-controlled tumor
protein-like (LOC103268796), misc_RNA
Length=694
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||
Sbjct 343 AAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCC-GTCATAAAGGATTTTACTC 295
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA
>ref|XM_009440523.1| PREDICTED: Pan troglodytes tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), transcript variant X1, mRNA
Length=1195
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 228
>ref|XM_003313187.3| PREDICTED: Pan troglodytes translationally-controlled tumor protein
(LOC466689), mRNA
Length=841
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 60 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 109
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(LOC735922), mRNA
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Sbjct 62 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 111
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pseudogene (LOC741416), misc_RNA
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Sbjct 61 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 110
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pseudogene (LOC100968081), misc_RNA
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Sbjct 59 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 108
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 248 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 297
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(LOC100973098), mRNA
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Sbjct 66 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 115
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transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 164 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 213
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transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 164 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 213
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transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 164 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 213
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gene), antisense
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Sbjct 526 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 477
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 121 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 170
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 121 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 170
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 121 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 170
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1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 121 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 170
>ref|NM_001098546.2| Pan troglodytes tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
mRNA
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Sbjct 62 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 111
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Sbjct 63 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 112
>dbj|AK296587.1| Homo sapiens cDNA FLJ57738 complete cds, highly similar to Translationally-controlled
tumor protein
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Sbjct 63 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 112
>dbj|AK312951.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93407, Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1),mRNA
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Sbjct 63 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 112
>dbj|AB222130.1| Pan troglodytes verus tpt1 mRNA for tumor protein, translationally-controlled
1, complete cds, clone: PorA0848
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Sbjct 64 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 113
>gb|BC007842.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4128378, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 53 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 102
>gb|AY952884.2| Homo sapiens antigen MMSA-4 mRNA sequence
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 872 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 823
>gb|BC002747.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone IMAGE:3630774)
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 649 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 698
>gb|BC052333.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:61507 IMAGE:6058799), complete cds
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 53 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 102
>gb|BC012431.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:9981 IMAGE:3880559), complete cds
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 23 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 72
>gb|BC003352.2| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:5308 IMAGE:2899964), complete cds
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Sbjct 47 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 96
>gb|BC022436.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:24736 IMAGE:4281364), complete cds
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 92 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 141
>gb|BC040008.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone IMAGE:5219529), complete cds
Length=1892
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Sbjct 34 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 83
>emb|AL138963.20| Human DNA sequence from clone RP11-290D2 on chromosome 13, complete
sequence
Length=161297
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 146902 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 146853
>dbj|AK130847.1| Homo sapiens cDNA FLJ27337 fis, clone TMS09488, highly similar
to Translationally controlled tumor protein
Length=841
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 63 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 112
>gb|AY117678.1| Homo sapiens p02 protein mRNA, complete cds
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 64 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 113
>emb|AJ400717.1| Homo sapiens TPT1 gene for translationally controlled tumor protein
(TCTP), exons 1-6
Length=5373
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Sbjct 1177 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 1226
>dbj|D28408.1|HUMTCT67 Homo sapiens mRNA for translationally controlled tumor protein,
5'UTR region
Length=120
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 63 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 112
>emb|X16064.1| Human mRNA for translationally controlled tumor protein
Length=830
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Query 1 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 50
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Sbjct 43 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 92
>gb|AF072098.1| Homo sapiens HDCMB21P mRNA, complete cds
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Sbjct 44 TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCGTCGTCGTCTCCCTTCAGTCGCCA 93
>emb|X64899.1| H.sapiens mRNA homologous to mouse P21 mRNA
Length=819
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Lambda K H
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13 13 45912909 45915228 2M720N71M45915256F27m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGTAGTTTTTGAAATTAGCAAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCG
13 13 45912909 45915228 2M720N71M45915256F27m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGTAGTTTTTGAAATTAGCAAGGATGTGCTTGATTTGTTCTGCAGCCCCTGTCATAAAAGGTTTTACTC TTTCAGGCTCGTGCTAAGCTAGCGCCG
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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right flanking sequence - TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCGGCTGCACCGCGC
blast search - nt
left flanking sequence - TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA
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1 (TPT1), mRNA
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tumor protein pseudogene (LOC101036004), misc_RNA
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1 (TPT1), transcript variant X1, mRNA
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pseudogene (LOC741416), misc_RNA
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pseudogene (LOC100968081), misc_RNA
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Sbjct 501 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 452
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Sbjct 337 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 288
>ref|XR_547716.1| PREDICTED: Equus przewalskii tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), transcript variant X2, misc_RNA
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Sbjct 336 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 287
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1 (TPT1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 336 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 287
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gene, encodes complete protein
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>gb|KJ892313.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01707 TPT1
gene, encodes complete protein
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>gb|KJ892312.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01706 TPT1
gene, encodes complete protein
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Sbjct 267 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 218
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(LOC102410700), partial mRNA
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Sbjct 313 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 264
>ref|XM_006072535.1| PREDICTED: Bubalus bubalis tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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>ref|XM_006040109.1| PREDICTED: Bubalus bubalis translationally-controlled tumor protein-like
(LOC102414579), partial mRNA
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protein-like (LOC102980353), transcript variant X2, mRNA
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>ref|XM_007107985.1| PREDICTED: Physeter catodon translationally-controlled tumor
protein-like (LOC102980353), transcript variant X1, mRNA
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(LOC102533001), mRNA
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Sbjct 284 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 235
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1 (TPT1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 309 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 260
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1 (TPT1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 309 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 260
>ref|XR_338053.1| PREDICTED: Camelus ferus tumor protein, translationally-controlled
1 pseudogene (LOC102521213), misc_RNA
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Sbjct 282 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 233
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1 (TPT1), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 171 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 122
>ref|XM_006187355.1| PREDICTED: Camelus ferus tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 171 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 122
>ref|XM_005974545.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii translationally-controlled tumor
protein-like (LOC102329193), mRNA
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Sbjct 311 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 262
>ref|XM_005968007.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 100 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 51
>ref|XM_005961081.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii translationally-controlled tumor
protein-like (LOC102324709), mRNA
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Sbjct 287 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 238
>ref|XM_005896750.1| PREDICTED: Bos mutus tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 108 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 59
>ref|NM_001286272.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 417 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 368
>ref|NM_003295.3| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 417 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 368
>ref|NM_001286273.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 343 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 294
>tpe|HG505585.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000471968.1 (RP11-290D2.6
gene), antisense
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Sbjct 47 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 96
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(LOC102179679), mRNA
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Sbjct 120 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 71
>ref|XM_005679501.1| PREDICTED: Capra hircus tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 319 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 270
>ref|XM_001491304.3| PREDICTED: Equus caballus tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 433 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 384
>ref|XM_005566465.1| PREDICTED: Macaca fascicularis translationally-controlled tumor
protein-like (LOC102124126), mRNA
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Sbjct 166 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 117
>ref|XM_004433639.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum tumor protein, translationally-controlled
1, transcript variant 2 (TPT1), mRNA
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Sbjct 263 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 214
>ref|XM_004433638.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum tumor protein, translationally-controlled
1, transcript variant 1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 359 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 310
>ref|XM_004054467.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 374 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 325
>ref|XM_004054466.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 374 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 325
>ref|XM_004054465.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 374 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 325
>ref|XM_004054464.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
Length=1684
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Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 374 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 325
>ref|XR_173260.1| PREDICTED: Ovis aries translationally-controlled tumor protein-like
(LOC101102075), misc_RNA
Length=885
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 361 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 312
>ref|NM_001280680.1| Ovis aries tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
mRNA
gb|JX534529.1| Ovis aries tumor protein translationally-controlled 1 (TCTP)
mRNA, complete cds
Length=834
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 301 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 252
>ref|NM_001098546.2| Pan troglodytes tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
mRNA
Length=857
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 315 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 266
>ref|NG_029987.1| Bos taurus tumor protein, translationally-controlled 1 pseudogene
(LOC100337367) on chromosome 25
Length=1036
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 403 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 354
>gb|JF432827.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100074146 tumor
protein, translationally-controlled 1 (TPT1) gene, encodes complete
protein
Length=618
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 252 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 203
>dbj|AK296952.1| Homo sapiens cDNA FLJ57742 complete cds
Length=902
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 843 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 794
>dbj|AK296587.1| Homo sapiens cDNA FLJ57738 complete cds, highly similar to Translationally-controlled
tumor protein
Length=751
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 316 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 267
>emb|CU692615.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100022050
3' read TPT1 mRNA
Length=1273
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 333 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 382
>emb|CU692614.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100022050
5' read TPT1 mRNA
Length=1371
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 116 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 67
>emb|CU680325.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100020621
3' read TPT1 mRNA
Length=1212
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 333 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 382
>emb|CU680324.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100020621
5' read TPT1 mRNA
Length=1207
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 218 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 169
>dbj|AK312951.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93407, Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1),mRNA
Length=633
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 316 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 267
>gb|EF564271.1| Capra hircus translationally-controlled 1 mRNA, partial cds
Length=563
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 248
>dbj|AB222130.1| Pan troglodytes verus tpt1 mRNA for tumor protein, translationally-controlled
1, complete cds, clone: PorA0848
Length=859
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 317 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 268
>gb|BC007842.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4128378, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1833
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 306 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 257
>gb|AY952884.2| Homo sapiens antigen MMSA-4 mRNA sequence
Length=931
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 619 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 668
>gb|BC002747.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone IMAGE:3630774)
Length=1446
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 902 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 853
>gb|BC052333.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:61507 IMAGE:6058799), complete cds
Length=858
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 306 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 257
>gb|BC003352.2| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:5308 IMAGE:2899964), complete cds
Length=840
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 300 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 251
>gb|BC022436.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:24736 IMAGE:4281364), complete cds
Length=1134
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 222
>gb|BC040008.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone IMAGE:5219529), complete cds
Length=1892
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 164
>gb|AY334563.1| Homo sapiens cell-type eosinophil TCTP mRNA, complete cds
Length=519
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 153
>gb|BC104562.1| Bos taurus tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:128232 IMAGE:7948168), complete cds
Length=861
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 312 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 263
>emb|AL138963.20| Human DNA sequence from clone RP11-290D2 on chromosome 13, complete
sequence
Length=161297
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145866 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 145915
>gb|DQ000539.1| Synthetic construct clone PSF:107903 TPT1 gene, complete cds
Length=591
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 225
>emb|CR457036.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0415D
for gene TPT1, tumor protein, translationally-controlled 1;
complete cds, incl. stopcodon
Length=519
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 153
>dbj|AK130847.1| Homo sapiens cDNA FLJ27337 fis, clone TMS09488, highly similar
to Translationally controlled tumor protein
Length=841
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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1, partial cds, clone: ORCS12375
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1, partial cds, clone: ORCS10811
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(LOC466689), mRNA
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1 (TPT1), mRNA
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pseudogene (LOC101013755), misc_RNA
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1 (TPT1), mRNA
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protein-like (LOC103077765), mRNA
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protein-like (LOC102985341), transcript variant X2, mRNA
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protein-like (LOC102985341), transcript variant X1, mRNA
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protein-like (LOC102977416), mRNA
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tumor protein-like (LOC102734546), transcript variant X3, mRNA
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tumor protein-like (LOC102734546), transcript variant X2, mRNA
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tumor protein-like (LOC102734546), transcript variant X1, mRNA
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1 (TPT1), mRNA
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(LOC102770098), mRNA
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(LOC102168398), misc_RNA
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mRNA
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>ref|XM_005340365.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus tumor protein, translationally-controlled
1 (Tpt1), mRNA
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1 (TPT1), mRNA
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protein-like (LOC101318198), mRNA
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1 (TPT1), mRNA
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1 pseudogene (LOC100603998), misc_RNA
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1, transcript variant 3 (TPT1), mRNA
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1, transcript variant 2 (TPT1), mRNA
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1, transcript variant 1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 502 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGACCTTCAGCGGAGGCA 453
>ref|XM_004011040.1| PREDICTED: Ovis aries translationally-controlled tumor protein-like
(LOC101116579), mRNA
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Sbjct 291 TGATTACTGTGCTTTCCGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 242
>ref|NM_001266379.1| Macaca mulatta tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),
mRNA
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Sbjct 300 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCTGGGCCTTCAGCGGAGGCA 251
>dbj|AK394426.1| Sus scrofa mRNA, clone: MLN010030A08, expressed in mesenteric
lymph node
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Sbjct 349 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 300
>dbj|AK397982.1| Sus scrofa mRNA, clone: TCH010051G09, expressed in trachea
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Sbjct 501 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 452
>dbj|AK397966.1| Sus scrofa mRNA, clone: TCH010043B11, expressed in trachea
Length=865
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Sbjct 318 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 269
>dbj|AK399254.1| Sus scrofa mRNA, clone: SMG010090E06, expressed in submaxillary
gland
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Sbjct 317 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 268
>dbj|AK397472.1| Sus scrofa mRNA, clone: SMG010024A10, expressed in submaxillary
gland
Length=927
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Sbjct 353 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 304
>dbj|AK400690.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVRT10130D01, expressed in ovary
Length=920
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Sbjct 367 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 318
>dbj|AK398932.1| Sus scrofa mRNA, clone: LVR010068A08, expressed in liver
Length=1174
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Sbjct 627 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 578
>dbj|AK398783.1| Sus scrofa mRNA, clone: ADR010072B01, expressed in adrenal gland
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Sbjct 858 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 809
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Length=1169
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 328 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 279
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transcript variant 2 (LOC702001), mRNA
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Sbjct 149 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGTGGAGGCA 100
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transcript variant 1 (LOC702001), mRNA
Length=746
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 182 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGTGGAGGCA 133
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human tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1), mRNA,
RefSeq: NM_003295.1
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Sbjct 316 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCTGGGCCTTCAGCGGAGGCA 267
>dbj|AB170187.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10679, similar to
human tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1), mRNA,
RefSeq: NM_003295.1
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Sbjct 297 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCTGGGCCTTCAGCGGAGGCA 248
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Sbjct 319 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 270
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Sbjct 347 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 298
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Sbjct 316 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 267
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>dbj|AK234636.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010102A09, expressed in ovary
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Sbjct 316 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 267
>dbj|AK234306.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010042A03, expressed in ovary
Length=1369
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Sbjct 822 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 773
>dbj|AB169537.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QflA-10115, similar to
human tumor protein, translationally-controlled 1 (TPT1),mRNA,
RefSeq: NM_003295.1
Length=1842
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Sbjct 317 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCTGGGCCTTCAGCGGAGGCA 268
>ref|NM_214373.1| Sus scrofa translationally controlled tumor protein (TCTP), mRNA
gb|AY072784.1| Sus scrofa translationally controlled tumor protein (TCTP) mRNA,
complete cds
Length=849
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Sbjct 302 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGCCCTTCAGCGGAGGCA 253
>dbj|AB098755.1| Bos taurus mRNA for similar to translationally controlled tumor
protein, partial cds, clone: ORCS10822
Length=647
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Sbjct 520 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGG-CTTCAGCGGAGGCA 568
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tumor protein pseudogene (LOC104665860), misc_RNA
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Sbjct 202 TGATTACTGTGCTTTCCCTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 153
>ref|XR_651843.1| PREDICTED: Papio anubis translationally-controlled tumor protein
pseudogene (LOC101006672), misc_RNA
Length=547
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 152 TGATTACTGCGCTTTAGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 103
>ref|XR_613368.1| PREDICTED: Callithrix jacchus translationally-controlled tumor
protein pseudogene (LOC100401303), misc_RNA
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Sbjct 311 TGACTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCGGCGGAGGCA 262
>ref|XR_623235.1| PREDICTED: Callithrix jacchus translationally-controlled tumor
protein pseudogene (LOC100413585), misc_RNA
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Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 321 TGACTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCGGCGGAGGCA 272
>ref|XM_002749028.3| PREDICTED: Callithrix jacchus tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
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Sbjct 430 TGACTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCGGCGGAGGCA 381
>ref|XR_087680.3| PREDICTED: Callithrix jacchus translationally-controlled tumor
protein pseudogene (LOC100398453), misc_RNA
Length=770
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Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 296 TGACTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCGGCGGAGGCA 247
>ref|XR_619374.1| PREDICTED: Callithrix jacchus translationally-controlled tumor
protein pseudogene (LOC100386275), misc_RNA
Length=825
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 308 TGACTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCGGCGGAGGCA 259
>ref|XM_007186821.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni translationally-controlled
tumor protein-like (LOC103006911), mRNA
Length=731
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 TGACTACTGTGCCTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 152
>ref|XM_007101653.1| PREDICTED: Physeter catodon translationally-controlled tumor
protein-like (LOC102974820), mRNA
Length=672
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 217 TGATTACTGTGCAGTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 168
>ref|XM_005633903.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
Length=1202
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
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Sbjct 351 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCCGGGCCTTCCGCGGAGGCA 302
>ref|XM_004457859.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), mRNA
Length=1126
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 TGATGACTGTACTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 234
>ref|XR_187352.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens translationally-controlled
tumor protein-like (LOC101375342), misc_RNA
Length=879
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 328 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCTGGGCCTTCAGCGGAAGCA 279
>ref|XM_004414494.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens translationally-controlled
tumor protein-like (LOC101380275), mRNA
Length=797
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 286 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCTGGGCCTTCAGCGGAAGCA 237
>ref|XR_185698.1| PREDICTED: Tursiops truncatus translationally-controlled tumor
protein-like (LOC101317231), misc_RNA
Length=1042
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 TGATTACTGTGCAGTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 136
>ref|XM_001088644.2| PREDICTED: Macaca mulatta translationally-controlled tumor protein-like
(LOC697631), mRNA
Length=767
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 128 TGATTACTGCGCTTTAGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 79
>ref|NM_001173082.1| Cavia porcellus tumor protein, translationally-controlled 1 (Tpt1),
mRNA
gb|EU330893.1| Cavia porcellus TPT1 (TPT1) mRNA, complete cds
Length=1147
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 TGATTACTGTGCTTTCTGTGCCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 250
>gb|BC012431.1| Homo sapiens tumor protein, translationally-controlled 1, mRNA
(cDNA clone MGC:9981 IMAGE:3880559), complete cds
Length=818
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 276 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCACCGTAGGCA 227
>ref|XM_004018609.1| PREDICTED: Ovis aries translationally-controlled tumor protein-like
(LOC101103097), mRNA
Length=632
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGC 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 91 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGC 49
>ref|XM_008062135.1| PREDICTED: Tarsius syrichta tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), transcript variant X2, mRNA
Length=955
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 ACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 224 ACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGTCCTTCAGCGGAGGCA 180
>ref|XM_008062134.1| PREDICTED: Tarsius syrichta tumor protein, translationally-controlled
1 (TPT1), transcript variant X1, mRNA
Length=1067
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 ACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 224 ACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGTCCTTCAGCGGAGGCA 180
>emb|FQ222296.1| Rattus norvegicus TL0ADA25YH17 mRNA sequence
Length=836
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||
Sbjct 299 TGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCCGGACCTTCAGCGGAAGCA 250
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCGGCTGCACCGCGC
reads
13 13 45913966 45914066 100M CATATTATAGAAAAGCAACCACTCTTTTCCGTGAACTCATTAATAAAAAAGCAAGGACTTTCACAAAAGTATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGT
13 13 45913970 45914070 100M TATTATAGAAAAGCAACCACTCTTTTCCGTGAACTCATTAATAAAAAAGCAAGGACTTTCACAAAAGTATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGC
13 13 45913975 45914075 100M TAGAAAAGCAACCACTCTTTTCCGTGAACTCATTAATAAAAAAGCAAGGACTTTCACAAAAGTATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATC
13 13 45913979 45914079 100M AAAGCAACCACTCTTTTCCGTGAACTCATTAATAAAAAAGCAAGGACTTTCACAAAAGTATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTA
13 13 45913983 45914083 100M CAACCACTCTTTTCCGTGAACTCATTAATAAAAAAGCAAGGACTTTCACAAAAGTATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATC
13 13 45913989 45914089 100M CTCTTTTCCGTGAACTCATTAATAAAAAAGCAAGGACTTTCACAAAAGTATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAA
13 13 45913996 45914096 100M CCGTGAACTCATTAATAAAAAAGCAAGGACTTTCACAAAAGTATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTA
13 13 45914003 45914103 100M CTCATTAATAAAAAAGCAAGGACTTTCACAAAAGTATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCA
13 13 45914009 45914109 100M AATAAAAAAGCAAGGACTTTCACAAAAGTATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGG
13 13 45914014 45914114 100M AAAAGCAAGGACTTTCACAAAAGTATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTG
13 13 45914017 45914117 100M AGCAAGGACTTTCACAAAAGTATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCA
13 13 45914022 45914122 100M GGACTTTCACAAAAGGATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATC
13 13 45914037 45914137 100M TATACCCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATG
13 13 45914042 45914142 100M CCACTGCGAAAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAAACCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATC
13 13 45914051 45914151 100M AAGAACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTA
13 13 45914054 45914154 100M AACCTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTT
13 13 45914057 45914157 100M CTCAAAAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTT
13 13 45914062 45914162 100M AAGTTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGG
13 13 45914065 45914165 100M TTAGCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCTAGCATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTT
13 13 45914068 45914168 100M GCCAATCTTTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTT
13 13 45914076 45914176 100M TTAAATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTTCTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAA
13 13 45914079 45914179 100M AATCCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTT
13 13 45914082 45914182 100M CCTGTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTT
13 13 45914085 45914185 100M GTAAGATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGCAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCC
13 13 45914090 45914190 100M ATTCTAGACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAG
13 13 45914097 45914197 100M ACATCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGG
13 13 45914100 45914200 100M TCAGCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTC
13 13 45914103 45914203 100M GCTAGGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATG
13 13 45914107 45914207 100M GGTACTGCCAGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAA
13 13 45914111 45914211 100M CTGCCAGTATCACTTCCGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATC
13 13 45914116 45914216 100M AGTATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACAC
13 13 45914119 45914219 100M ATCACTTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAG
13 13 45914124 45914224 100M TTACGATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATT
13 13 45914128 45914228 100M GATTTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTG
13 13 45914131 45914231 100M TTCATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGC
13 13 45914134 45914234 100M ATGTAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTTTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTCTGCTTT
13 13 45914137 45914237 100M TAATCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGG
13 13 45914140 45914240 100M TCTTTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTAC
13 13 45914143 45914243 100M TTGATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTT
13 13 45914146 45914246 100M ATGTACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGC
13 13 45914149 45914249 100M TACTTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCT
13 13 45914152 45914252 100M TTCTTGTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGG
13 13 45914155 45914255 100M TTTTAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGC
13 13 45914158 45914258 100M TAGGCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTT
13 13 45914161 45914261 100M GCTTCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCACGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAG
13 13 45914164 45914264 100M TCTTTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGG
13 13 45914167 45914267 100M TTTGTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGG
13 13 45914170 45914270 100M GTGAAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCAT
13 13 45914173 45914273 100M AAACTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCATTTC
13 13 45914176 45914276 100M CTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCATTTCCAC
13 13 45914176 45915308 93M45915316F7m CTTGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTGGCCCTCGGGGCCTTCAGTGGAGGCA TTTCCGC
13 13 45914178 45915306 91M45915316F9m TGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCT TTTCCGCCC
13 13 45914178 45915306 91M45915316F9m TGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCT TTTCCGCCC
13 13 45914178 45915306 91M45915316F9m TGTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCT TTTCCGCCC
13 13 45914179 45915305 90M45915316F10m GTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCG
13 13 45914179 45915305 90M45915316F10m GTTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCG
13 13 45914180 45915304 89M45915316F11m TTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGC
13 13 45914180 45915304 89M45915316F11m TTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGC
13 13 45914180 45915304 89M45915316F11m TTTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGC
13 13 45914181 45915303 88M45915316F12m TTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTTCCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCT TTTCCGCCCGCT
13 13 45914181 45915303 88M45915316F12m TTCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCT
13 13 45914182 45915302 87M45915316F13m TCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTC
13 13 45914182 45915302 87M45915316F13m TCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTC
13 13 45914182 45915302 87M45915316F13m TCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTC
13 13 45914182 45915302 87M45915316F13m TCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTC
13 13 45914182 45915302 87M45915316F13m TCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCT TTTCCGCCCGCTC
13 13 45914182 45915302 87M45915316F13m TCCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTC
13 13 45914183 45915301 86M45915316F14m CCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCC
13 13 45914183 45915301 86M45915316F14m CCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCC
13 13 45914183 45915301 86M45915316F14m CCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCC
13 13 45914183 45915301 86M45915316F14m CCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCC
13 13 45914183 45915301 86M45915316F14m CCTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCC
13 13 45914184 45915300 85M45915316F15m CTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCC
13 13 45914184 45915300 85M45915316F15m CTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCC
13 13 45914184 45915300 85M45915316F15m CTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCC
13 13 45914184 45915300 85M45915316F15m CTGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCC
13 13 45914185 45915299 84M45915316F16m TGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCC
13 13 45914185 45915299 84M45915316F16m TGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCC
13 13 45914185 45915299 84M45915316F16m TGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCC
13 13 45914185 45915299 84M45915316F16m TGCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCC
13 13 45914186 45915298 83M45915316F17m GCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCC
13 13 45914186 45915298 83M45915316F17m GCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCT TTTCCGCCCGCTCCCCC
13 13 45914186 45915298 83M45915316F17m GCAGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCC
13 13 45914188 45915296 81M45915316F19m GGGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCT
13 13 45914189 45915295 80M45915316F20m GGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTC
13 13 45914189 45915295 80M45915316F20m GGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTACTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCACTC
13 13 45914189 45915295 80M45915316F20m GGTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTC
13 13 45914190 45915294 79M45915316F21m GTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCACCCGCTCCCCCCTCC
13 13 45914190 45915294 79M45915316F21m GTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCACCGGAGGCT TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCC
13 13 45914190 45915294 79M45915316F21m GTGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCC
13 13 45914191 45915293 78M45915316F22m TGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGAACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCC
13 13 45914191 45915293 78M45915316F22m TGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCC
13 13 45914191 45915293 78M45915316F22m TGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCC
13 13 45914191 45915293 78M45915316F22m TGATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCC
13 13 45914193 45915291 76M45915316F24m ATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCC
13 13 45914193 45915291 76M45915316F24m ATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCC
13 13 45914193 45915291 76M45915316F24m ATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCC
13 13 45914193 45915291 76M45915316F24m ATGGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCACCCGCTCCCCCCTCCCCC
13 13 45914195 45915289 74M45915316F26m GGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCG
13 13 45914195 45915289 74M45915316F26m GGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCG
13 13 45914195 45915289 74M45915316F26m GGTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCACCCGCTCCCCCCTCCCCCCG
13 13 45914196 45915288 73M45915316F27m GTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCATTCGGTACCTTCGCCCTCGAGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGA
13 13 45914196 45915288 73M45915316F27m GTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCACCCGCTCCCCCCTCCCCCCGA
13 13 45914196 45915288 73M45915316F27m GTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGA
13 13 45914196 45915288 73M45915316F27m GTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGA
13 13 45914196 45915288 73M45915316F27m GTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCGCCCCCCGA
13 13 45914196 45915288 73M45915316F27m GTTCATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGA
13 13 45914199 45915285 70M45915316F30m CATGACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCG
13 13 45914202 45915282 67M45915316F33m GACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCACCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCG
13 13 45914202 45915282 67M45915316F33m GACAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCG
13 13 45914204 45915280 65M45915316F35m CAATATCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCT
13 13 45914205 45915279 64M45915316F36m AATACCGACACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCC TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTC
13 13 45914208 45915276 61M45915316F39m ATCGACACCAGTGATTACTTTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCGG
13 13 45914213 45915271 56M45915316F44m CACCAGTGATTACTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCT TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCGGCTGCA
13 13 45914215 45915269 54M45915316F46m CCAGTGATTATTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCGGCTGCACC
13 13 45914224 45915260 45M45915316F55m TCTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCGGCTGCACCGCGCTCGCT
13 13 45914225 45915259 44M45915316F56m CTGTGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCGGCTGCACCGCGCTCGCTC
13 13 45914226 45915258 43M45915316F57m TGGGCTTTCGGTACCTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCGCCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCGGCTGCACCGCGCTCGCTCC
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13 13 45914240 45915244 29M45915316F71m CTTCGCCCTCGGGGCCTTCAGCGGAGGCA TTTCCACCCGCTCCCCCCTCCCCCCGAGCGCCGCTCCGGCTGCACCGCGCTCGCTCCGAGTTTCAGGCTCG
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HSCHR14_CTG1
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assembly
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Sbjct 2232442 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 2232491
>ref|NC_018925.2| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001622.2| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 20925504 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 20925553
>ref|NW_004929393.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150177.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold chr14_scaf, whole
genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>gb|DS486024.1| Homo sapiens SCAF_1103279188393 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 734567 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 734616
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Sbjct 665528 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 665577
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Sbjct 721593 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 721642
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Sbjct 844252 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 844301
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sequence
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Sbjct 727396 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 727445
>ref|NW_001838110.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188393:1-20987734, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 734567 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 734616
>ref|AC_000146.1| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000475.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 1045743 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 1045792
>gb|CM000265.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 785274 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 785323
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG
>ref|XM_005267582.2| PREDICTED: Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 67 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 18
>ref|XM_005267581.2| PREDICTED: Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1505
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 66 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 17
>ref|XM_004054821.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 58 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 9
>ref|XM_004054820.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
Length=1513
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Sbjct 145 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 96
>ref|XM_004054819.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 145 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 96
>ref|NM_001244249.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 4, mRNA
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 145 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 96
>ref|NM_080649.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 145 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 96
>ref|NM_080648.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 2, mRNA
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 145 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 96
>ref|NM_001641.3| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 1, mRNA
Length=1563
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 145 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 96
>ref|NG_008718.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), RefSeqGene on chromosome 14
Length=9637
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 5145 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 5096
>dbj|AK291100.1| Homo sapiens cDNA FLJ76713 complete cds, highly similar to Homo
sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 2, mRNA
Length=1456
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 54 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 5
>gb|BC095428.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:110965 IMAGE:30709297), complete cds
Length=1439
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 75 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 26
>gb|AF488551.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
(APEX) gene, complete cds
Length=4187
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 852 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 803
>dbj|AK098588.1| Homo sapiens cDNA FLJ25722 fis, clone TST05409, highly similar
to DNA-(APURINIC OR APYRIMIDINIC SITE) LYASE (EC 4.2.99.18)
Length=1431
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 85 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 36
>emb|AL355075.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-203M5 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=204654
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 64690 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 64739
>dbj|AB047823.1| Homo sapiens OSGEP gene for O-sialoglycoprotein endopeptidase,
complete cds
Length=8336
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 120 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 169
>dbj|D13370.1|HUMAPEXN Homo sapiens APX gene encoding APEX nuclease, complete cds
Length=3730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 1036 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 987
>gb|M92444.1|HUMHAP Homo sapiens apurinic/apyrimidinic endonuclease (HAP1) gene,
complete cds
Length=3046
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 477 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 428
>gb|M99703.1|HUMAPEB Homo sapiens class II AP endonuclease (APE) gene, partial CDS
Length=3019
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 476 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 427
>emb|X66133.1| H.sapiens HAP1 gene for AP endonuclease 1
Length=2957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 468 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 419
>ref|XM_010377095.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), partial mRNA
Length=507
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 25
>ref|XM_010369241.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase-like (LOC104667059), mRNA
Length=604
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 2
>ref|XM_009427358.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
Length=1488
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 140 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAGAAG 91
>ref|XM_009427357.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
Length=1508
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 70 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAGAAG 21
>ref|XM_009427356.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1544
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 140 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAGAAG 91
>ref|XM_009211045.1| PREDICTED: Papio anubis APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X6, mRNA
Length=1360
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 14
>ref|XM_003901488.2| PREDICTED: Papio anubis APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X4, mRNA
Length=1492
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 140 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 91
>ref|XM_009211042.1| PREDICTED: Papio anubis APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
Length=1507
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 65 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 16
>ref|XM_009211041.1| PREDICTED: Papio anubis APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 65 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 16
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Sbjct 140 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 91
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Sbjct 140 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 91
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site) lyase (LOC103231340), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 140 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 91
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transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 141 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 92
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Sbjct 55 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 6
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Sbjct 59 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 10
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 141 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 92
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 144 GCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAGAAG 96
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Query 2 GCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 144 GCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAGAAG 96
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 57 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAGAAG 8
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 145 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAGAAG 96
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 145 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAGAAG 96
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 84 CCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 39
>ref|XM_008964114.1| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Query 5 CCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 82 CCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAGAAG 37
>ref|XM_005560691.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X5, mRNA
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Query 5 CCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
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Sbjct 71 CCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 26
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCAC 43
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Sbjct 43 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCAC 1
>ref|XM_009248855.1| PREDICTED: Pongo abelii APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 TGCACTGGTCTGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 29
>ref|XM_002824508.3| PREDICTED: Pongo abelii APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
Length=1488
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145 TGCACTGGTCTGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 96
>ref|XM_003778254.2| PREDICTED: Pongo abelii APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1544
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 50
||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145 TGCACTGGTCTGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG 96
>dbj|AB171726.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QtrA-16063, similar to
human APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1(APEX1),
transcript variant 1, mRNA, RefSeq: NM_001641.2
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCAC 43
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Sbjct 45 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCAC 3
>dbj|AB171333.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-14188, similar to
human APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1(APEX1),
transcript variant 1, mRNA, RefSeq: NM_001641.2
Length=1320
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
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Query 1 TGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCAC 43
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43 TGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCAC 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC
>ref|XM_009427358.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 430
>ref|XM_009427357.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 401 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 450
>ref|XM_009427356.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 486
>ref|XM_009248855.1| PREDICTED: Pongo abelii APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 458
>ref|XM_002824508.3| PREDICTED: Pongo abelii APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
Length=1488
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 386 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 435
>ref|XM_003778254.2| PREDICTED: Pongo abelii APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1544
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 442 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 491
>ref|XM_008964114.1| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 308
>ref|XM_003811730.2| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 435
>ref|XM_003811729.2| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 491
>ref|XM_009005659.1| PREDICTED: Callithrix jacchus APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
Length=1366
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 256 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 305
>ref|XM_009005658.1| PREDICTED: Callithrix jacchus APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1550
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 489
>gb|KJ896440.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05834 APEX1
gene, encodes complete protein
Length=1086
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 224
>gb|KJ890683.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00077 APEX1
gene, encodes complete protein
Length=1086
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 224
>ref|XM_005267582.2| PREDICTED: Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
Length=1542
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 483
>ref|XM_005267581.2| PREDICTED: Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1505
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 446
>ref|XM_003280890.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 212 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 261
>ref|XM_003280891.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 388 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 437
>ref|XM_004091923.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 279 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 328
>ref|XM_003280889.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 386 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 435
>ref|XM_003280888.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 442 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 491
>ref|NM_001244249.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 4, mRNA
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Sbjct 437 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 486
>ref|NM_080649.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 386 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 435
>ref|NM_080648.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 376 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 425
>ref|NM_001641.3| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 442 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 491
>ref|NG_008718.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), RefSeqGene on chromosome 14
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Sbjct 5835 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 5884
>dbj|AB463413.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6453, Homo sapiens APEX1
gene for APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, without stop codon, in Flexi system
Length=971
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Sbjct 119 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 168
>emb|CU675935.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018887
5' read APEX1 mRNA
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Sbjct 126 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 175
>emb|CU678840.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017021
5' read APEX1 mRNA
Length=1244
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Sbjct 126 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 175
>dbj|AK311548.1| Homo sapiens cDNA, FLJ18590
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Sbjct 497 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 546
>dbj|AK291100.1| Homo sapiens cDNA FLJ76713 complete cds, highly similar to Homo
sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 2, mRNA
Length=1456
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Sbjct 351 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 400
>ref|NM_001081485.1| Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 110 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 159
>gb|DQ977332.1| Pan troglodytes APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1796
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 417 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 466
>gb|DQ977483.1| Pongo pygmaeus APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1773
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Sbjct 405 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 454
>gb|DQ894998.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009458; FLH180181.01L;
RZPDo839H02131D APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1) gene, encodes complete protein
Length=997
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Sbjct 132 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 181
>gb|DQ891814.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004444; FLH180185.01X; RZPDo839H02132D
APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1) gene, encodes complete protein
Length=997
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 132 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 181
>gb|DQ977185.1| Pan paniscus APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1801
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 417 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 466
>gb|DQ976454.1| Gorilla gorilla APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1759
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 415 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 464
>gb|BC007306.1| Homo sapiens 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP
cyclohydrolase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3352215)
Length=3422
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 1148 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 1099
>gb|BT020133.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 mRNA, complete cds
Length=957
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 110 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 159
>gb|BC004979.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:3855 IMAGE:2905681), complete cds
Length=1364
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 239 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 288
>gb|BC019291.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:4057 IMAGE:2823545), complete cds
Length=1450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 327 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 376
>gb|BC008145.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:17277 IMAGE:4180383), complete cds
Length=1448
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 325 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 374
>gb|BC095428.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:110965 IMAGE:30709297), complete cds
Length=1439
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 316 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 365
>gb|BT008224.1| Synthetic construct Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 mRNA, partial cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 110 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 159
>gb|BT007236.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 mRNA, complete cds
Length=957
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 110 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 159
>gb|AF488551.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
(APEX) gene, complete cds
Length=4187
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 1543 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 1592
>gb|S43127.1| ref-1=redox factor [human, mRNA, 1441 nt]
Length=1441
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 333 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 382
>dbj|AK098588.1| Homo sapiens cDNA FLJ25722 fis, clone TST05409, highly similar
to DNA-(APURINIC OR APYRIMIDINIC SITE) LYASE (EC 4.2.99.18)
Length=1431
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 326 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 375
>gb|U79268.1|HSU79268 Human apurinic/apyrimidinic endonuclease mRNA, complete cds
Length=1414
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 288 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 337
>gb|AY890279.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024754.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 110 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 159
>gb|AY890278.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024753.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 110 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 159
>gb|AY888658.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH010269.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 110 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 159
>gb|AY888657.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH010268.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 110 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 159
>gb|AY889611.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH030144.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 110 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 159
>gb|AY892759.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024749.01L APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, partial cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 110 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 159
>gb|AY892060.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH030139.01L APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, partial cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 110 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 159
>gb|BC002338.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:8338 IMAGE:2819505), complete cds
Length=1459
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 327 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 376
>emb|BX161454.1| human full-length cDNA clone CS0DI036YP02 of Placenta of Homo
sapiens (human)
Length=1351
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 276 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 325
>emb|AL355075.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-203M5 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=204654
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 64000 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 63951
>dbj|D13370.1|HUMAPEXN Homo sapiens APX gene encoding APEX nuclease, complete cds
Length=3730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 1726 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 1775
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complete cds
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Sbjct 1167 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 1216
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Sbjct 1166 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 1215
>gb|M81955.1|HUMAPEA Human apurinic/apyrimidinic endonuclease (HAP1h) mRNA, complete
cds
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Sbjct 320 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 369
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Sbjct 319 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 368
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), partial mRNA
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site) lyase-like (LOC104667059), mRNA
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X6, mRNA
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X5, mRNA
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 381 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 430
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 396 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 445
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 387 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 436
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 437 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 486
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site) lyase (LOC103231343), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 279 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 328
>ref|XM_007990660.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase (LOC103231343), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 308 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 357
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site) lyase (LOC103231343), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 364 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 413
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site) lyase (LOC103231340), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 267 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 316
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site) lyase (LOC103231340), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 381 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 430
>ref|XM_007990653.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase (LOC103231340), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 437 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 486
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repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 196 CAGCAGGAGAGGGGCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 245
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repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 314 CAGCAGGAGAGGGGCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 363
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transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 245 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 294
>ref|XM_005560691.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 248 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 297
>ref|XM_005560690.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 382 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 431
>ref|XM_005560689.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 285 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 334
>ref|XM_005560688.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 381 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 430
>ref|XM_005560687.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 438 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 487
>ref|XM_004054822.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 212 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAGACC 261
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 389 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAGACC 438
>ref|XM_004054820.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 386 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAGACC 435
>ref|XM_004054819.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 442 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAGACC 491
>ref|NM_001258109.1| Macaca mulatta APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 132 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 181
>dbj|AB171726.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QtrA-16063, similar to
human APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1(APEX1),
transcript variant 1, mRNA, RefSeq: NM_001641.2
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Sbjct 231 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 280
>dbj|AB171333.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-14188, similar to
human APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1(APEX1),
transcript variant 1, mRNA, RefSeq: NM_001641.2
Length=1320
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 340 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 389
>gb|AC189967.4| Rhesus Macaque BAC CH250-266O12 () complete sequence
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 105034 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCCGATCAGAAAACC 104985
>gb|AF064685.1| Ateles paniscus chamek APEX nuclease (APX) gene, partial cds
Length=787
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 2 CAGCAGGAGAGGGCCCATCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 51
>dbj|D90373.1|HUMAPX Homo sapiens mRNA for apurinic/apyrimidinic endonuclease, complete
cds
Length=1420
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 315 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCACAAAACC 364
>ref|XM_008683671.1| PREDICTED: Ursus maritimus APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 197 CAGCAGGAGAGGGACCAGTCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 246
>ref|XM_008683670.1| PREDICTED: Ursus maritimus APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
Length=1299
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 200 CAGCAGGAGAGGGACCAGTCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 249
>ref|XM_008683669.1| PREDICTED: Ursus maritimus APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1424
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 325 CAGCAGGAGAGGGACCAGTCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 374
>ref|XM_006191226.1| PREDICTED: Camelus ferus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
Length=1358
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 50
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Sbjct 221 CAGCAGGAGAGGGAGCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACC 270
>ref|XM_006191225.1| PREDICTED: Camelus ferus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1404
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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9 |
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shotgun sequence
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sequence
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>ref|NW_001838110.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188393:1-20987734, whole genome shotgun
sequence
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>ref|AC_000146.1| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG
>ref|XM_005267582.2| PREDICTED: Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 69 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 20
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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>ref|XM_004054819.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 148 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 99
>ref|NM_001244249.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 4, mRNA
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1 (APEX1), transcript variant 3, mRNA
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>ref|NM_080648.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 148 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 99
>ref|NM_001641.3| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 148 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 99
>ref|NG_008718.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), RefSeqGene on chromosome 14
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Sbjct 5148 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 5099
>dbj|AK291100.1| Homo sapiens cDNA FLJ76713 complete cds, highly similar to Homo
sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 57 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 8
>gb|BC095428.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:110965 IMAGE:30709297), complete cds
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Sbjct 78 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 29
>gb|AF488551.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
(APEX) gene, complete cds
Length=4187
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Sbjct 855 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 806
>dbj|AK098588.1| Homo sapiens cDNA FLJ25722 fis, clone TST05409, highly similar
to DNA-(APURINIC OR APYRIMIDINIC SITE) LYASE (EC 4.2.99.18)
Length=1431
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Sbjct 88 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 39
>emb|AL355075.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-203M5 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=204654
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 64687 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 64736
>dbj|AB047823.1| Homo sapiens OSGEP gene for O-sialoglycoprotein endopeptidase,
complete cds
Length=8336
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 117 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 166
>dbj|D13370.1|HUMAPEXN Homo sapiens APX gene encoding APEX nuclease, complete cds
Length=3730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 1039 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 990
>gb|M92444.1|HUMHAP Homo sapiens apurinic/apyrimidinic endonuclease (HAP1) gene,
complete cds
Length=3046
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 480 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 431
>gb|M99703.1|HUMAPEB Homo sapiens class II AP endonuclease (APE) gene, partial CDS
Length=3019
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Sbjct 479 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 430
>emb|X66133.1| H.sapiens HAP1 gene for AP endonuclease 1
Length=2957
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>ref|XM_010377095.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), partial mRNA
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>ref|XM_010369241.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase-like (LOC104667059), mRNA
Length=604
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 54 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 5
>ref|XM_009427358.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 143 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAG 94
>ref|XM_009427357.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
Length=1508
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Sbjct 73 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAG 24
>ref|XM_009427356.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1544
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Sbjct 143 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAG 94
>ref|XM_009211045.1| PREDICTED: Papio anubis APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X6, mRNA
Length=1360
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 66 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 17
>ref|XM_003901488.2| PREDICTED: Papio anubis APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X4, mRNA
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 143 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 94
>ref|XM_009211042.1| PREDICTED: Papio anubis APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
Length=1507
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 68 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 19
>ref|XM_009211041.1| PREDICTED: Papio anubis APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 68 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 19
>ref|XM_003901487.2| PREDICTED: Papio anubis APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 143 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 94
>ref|XM_007990661.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase (LOC103231343), transcript variant X3, mRNA
Length=1384
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 96 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 47
>ref|XM_007990660.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase (LOC103231343), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 70 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 21
>ref|XM_007990659.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase (LOC103231343), transcript variant X1, mRNA
Length=1469
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 70 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 21
>ref|XM_007990655.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase (LOC103231340), transcript variant X3, mRNA
Length=1372
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 84 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 35
>ref|XM_007990654.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase (LOC103231340), transcript variant X2, mRNA
Length=1486
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 143 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 94
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site) lyase (LOC103231340), transcript variant X1, mRNA
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||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 94
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transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 62 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 13
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 144 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 95
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 62 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 13
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 144 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 95
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Sbjct 105715 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 105764
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 148 ATCCGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAG 99
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 148 ATCCGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAG 99
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 60 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAG 11
>ref|XM_003280889.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 148 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAG 99
>ref|XM_003280888.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 148 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAG 99
>dbj|AB171726.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QtrA-16063, similar to
human APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1(APEX1),
transcript variant 1, mRNA, RefSeq: NM_001641.2
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Sbjct 48 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCAC 3
>dbj|AB171333.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-14188, similar to
human APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1(APEX1),
transcript variant 1, mRNA, RefSeq: NM_001641.2
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Query 1 ATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCAC 46
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Sbjct 46 ATCTGCACCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCAC 1
>ref|XM_009211044.1| PREDICTED: Papio anubis APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X5, mRNA
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Query 8 CCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 84 CCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 42
>ref|XM_008964114.1| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Query 8 CCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 82 CCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAACACAAAG 40
>ref|XM_005560691.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X5, mRNA
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Query 8 CCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 50
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Sbjct 71 CCGGTCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG 29
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC
>ref|XM_009427358.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 365 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 414
>ref|XM_009427357.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 385 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 434
>ref|XM_009427356.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 421 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 470
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 393 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 442
>ref|XM_002824508.3| PREDICTED: Pongo abelii APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 419
>ref|XM_003778254.2| PREDICTED: Pongo abelii APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 426 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 475
>ref|XM_008964114.1| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 243 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 292
>ref|XM_003811730.2| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 370 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 419
>ref|XM_003811729.2| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 426 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 475
>gb|KJ896440.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05834 APEX1
gene, encodes complete protein
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Sbjct 159 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 208
>gb|KJ890683.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00077 APEX1
gene, encodes complete protein
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Sbjct 159 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 208
>ref|XM_005267582.2| PREDICTED: Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 418 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 467
>ref|XM_005267581.2| PREDICTED: Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 381 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 430
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Sbjct 196 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 245
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 263 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 312
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 370 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 419
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 426 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 475
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 196 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 245
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 373 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 422
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 370 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 419
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 426 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 475
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1 (APEX1), transcript variant 4, mRNA
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Sbjct 421 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 470
>ref|NM_080649.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 3, mRNA
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Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 370 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 419
>ref|NM_080648.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 2, mRNA
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 360 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 409
>ref|NM_001641.3| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 1, mRNA
Length=1563
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 426 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 475
>ref|NG_008718.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), RefSeqGene on chromosome 14
Length=9637
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 5819 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 5868
>dbj|AB463413.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6453, Homo sapiens APEX1
gene for APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, without stop codon, in Flexi system
Length=971
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 103 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 152
>emb|CU675935.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018887
5' read APEX1 mRNA
Length=1209
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 110 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 159
>emb|CU678840.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017021
5' read APEX1 mRNA
Length=1244
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 110 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 159
>dbj|AK311548.1| Homo sapiens cDNA, FLJ18590
Length=924
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 481 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 530
>dbj|AK291100.1| Homo sapiens cDNA FLJ76713 complete cds, highly similar to Homo
sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 2, mRNA
Length=1456
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 335 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 384
>ref|NM_001081485.1| Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), mRNA
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 94 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 143
>gb|DQ977332.1| Pan troglodytes APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1796
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Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 401 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 450
>gb|DQ977483.1| Pongo pygmaeus APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1773
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 389 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 438
>gb|DQ894998.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009458; FLH180181.01L;
RZPDo839H02131D APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1) gene, encodes complete protein
Length=997
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Sbjct 116 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 165
>gb|DQ891814.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004444; FLH180185.01X; RZPDo839H02132D
APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1) gene, encodes complete protein
Length=997
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 116 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 165
>gb|DQ977185.1| Pan paniscus APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1801
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 401 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 450
>gb|DQ976454.1| Gorilla gorilla APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1759
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 399 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 448
>gb|BC007306.1| Homo sapiens 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP
cyclohydrolase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3352215)
Length=3422
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 1164 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 1115
>gb|BT020133.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 94 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 143
>gb|BC004979.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:3855 IMAGE:2905681), complete cds
Length=1364
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 223 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 272
>gb|BC019291.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:4057 IMAGE:2823545), complete cds
Length=1450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 311 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 360
>gb|BC008145.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:17277 IMAGE:4180383), complete cds
Length=1448
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 309 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 358
>gb|BC095428.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:110965 IMAGE:30709297), complete cds
Length=1439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 300 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 349
>gb|BT008224.1| Synthetic construct Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 mRNA, partial cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 94 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 143
>gb|BT007236.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 94 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 143
>gb|AF488551.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
(APEX) gene, complete cds
Length=4187
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 1527 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 1576
>gb|S43127.1| ref-1=redox factor [human, mRNA, 1441 nt]
Length=1441
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 317 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 366
>dbj|AK098588.1| Homo sapiens cDNA FLJ25722 fis, clone TST05409, highly similar
to DNA-(APURINIC OR APYRIMIDINIC SITE) LYASE (EC 4.2.99.18)
Length=1431
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 310 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 359
>gb|U79268.1|HSU79268 Human apurinic/apyrimidinic endonuclease mRNA, complete cds
Length=1414
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 272 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 321
>gb|AY890279.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024754.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 94 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 143
>gb|AY890278.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024753.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 94 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 143
>gb|AY888658.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH010269.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 94 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 143
>gb|AY888657.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH010268.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 94 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 143
>gb|AY889611.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH030144.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 94 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 143
>gb|AY892759.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024749.01L APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, partial cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 94 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 143
>gb|AY892060.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH030139.01L APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, partial cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 94 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 143
>gb|BC002338.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:8338 IMAGE:2819505), complete cds
Length=1459
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 311 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 360
>emb|BX161454.1| human full-length cDNA clone CS0DI036YP02 of Placenta of Homo
sapiens (human)
Length=1351
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 260 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 309
>emb|AL355075.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-203M5 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=204654
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 64016 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 63967
>dbj|D90373.1|HUMAPX Homo sapiens mRNA for apurinic/apyrimidinic endonuclease, complete
cds
Length=1420
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 299 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 348
>dbj|D13370.1|HUMAPEXN Homo sapiens APX gene encoding APEX nuclease, complete cds
Length=3730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 1710 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 1759
>gb|M92444.1|HUMHAP Homo sapiens apurinic/apyrimidinic endonuclease (HAP1) gene,
complete cds
Length=3046
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 1151 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 1200
>gb|M99703.1|HUMAPEB Homo sapiens class II AP endonuclease (APE) gene, partial CDS
Length=3019
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 1150 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 1199
>gb|M81955.1|HUMAPEA Human apurinic/apyrimidinic endonuclease (HAP1h) mRNA, complete
cds
Length=1438
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 304 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 353
>gb|M80261.1|HUMAPE Human apurinic endonuclease (APE) mRNA, complete cds
Length=1279
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 216 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 265
>emb|X59764.1| Human HAP1 mRNA
Length=1437
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 303 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 352
>emb|X66133.1| H.sapiens HAP1 gene for AP endonuclease 1
Length=2957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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Sbjct 1141 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 1190
>ref|XM_010377095.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), partial mRNA
Length=507
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 50
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1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 116 AAAAATGACAAGGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 165
>dbj|AB171726.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QtrA-16063, similar to
human APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1(APEX1),
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Sbjct 215 AAAAATGACAAGGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 264
>dbj|AB171333.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-14188, similar to
human APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1(APEX1),
transcript variant 1, mRNA, RefSeq: NM_001641.2
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Sbjct 324 AAAAATGACAAGGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCC 373
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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14 14 20923491 20923391 100m CTTGCCGTTCAGACTGCCAGCGAAGCCCCTCTTATGAGCAAAAGAGCAACCCCGTATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCA
14 14 20923487 20923387 100m CCGTTCAGACTGCCAGCGAAGCCCCTCTTATGAGCAAAAGAGCAACCCCGTATCTGCACCGGCCCGATGGCAACCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAA
14 14 20923483 20923383 100m TCAGACTGCCAGCGAAGCCCCTCTTATGAGCAAAAGAGCAACCCCGTATCTGCACCGGCCCGATGGCAACCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAGAAG
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14 14 20923460 20924133 74m20924108F26M TTATGAGCAAAAGAGCAACCCCGTATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGA
14 14 20923443 20924150 57m20924108F43M ACCCCGTATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATG
14 14 20923443 20924150 57m20924108F43M ACCCCGTATCTGCACCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATG
14 14 20923429 20924164 43m20924108F57M CCGGCCCGATGGCAGCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG AAAGATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGAT
14 14 20923415 20924178 29m20924108F71M GCCTAGCTCCTCCTAACCCGAGCACAAAG AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACCTCACC
14 14 20923401 20924192 15m20924108F85M AACCCGAGCACAAAG AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACCTCACCCAGTGGCAAACCTG
14 14 20923398 20924195 12m20924108F88M CCGAGCACAAAG AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACCTCACCCAGTGGCAAACCTGCCA
14 14 20923397 20924196 11m20924108F89M CGAGCACAAAG AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACCTCACCCAGTGGCAAACCTGCCAC
14 14 20923397 20924196 11m20924108F89M CGAGCACAAAG AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACCTCACCCAGTGGCAAACCTGCCAC
14 14 20923395 20924198 9m20924108F91M AGCACAAAG AAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACCTCACCCAGTGGCAAACCTGCCACAC
14 14 20924098 20924198 100M GCCGCAAAGAAAAATTACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGACCCCCCAGATCAGAAAACCTCACCCAGTGGCAAACCTGCCACAC
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sequence
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sequence
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Lambda K H
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 735937 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 735986
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Sbjct 666898 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 666947
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Sbjct 722963 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 723012
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Sbjct 845622 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 845671
>gb|CH471078.2| Homo sapiens 211000035833619 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
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Sbjct 728766 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 728815
>ref|NW_001838110.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188393:1-20987734, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
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Sbjct 735937 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 735986
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shotgun sequence
gb|CM000475.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
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Sbjct 1047113 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1047162
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Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
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Sbjct 786644 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 786693
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1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 787 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 738
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repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 807 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 758
>ref|XM_009427356.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 843 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 794
>ref|XM_009248855.1| PREDICTED: Pongo abelii APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 815 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 766
>ref|XM_002824508.3| PREDICTED: Pongo abelii APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 792 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 743
>ref|XM_003778254.2| PREDICTED: Pongo abelii APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 848 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 799
>ref|XM_008964114.1| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 665 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 616
>ref|XM_003811730.2| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 792 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 743
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 848 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 799
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gene, encodes complete protein
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 581 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 532
>gb|KJ890683.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00077 APEX1
gene, encodes complete protein
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 581 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 532
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 840 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 791
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 803 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 754
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 618 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 569
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 794 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 745
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 685 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 636
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 792 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 743
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 848 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 799
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 618 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 569
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 795 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 746
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 792 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 743
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 848 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 799
>ref|NM_001244249.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 4, mRNA
Length=1558
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 843 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 794
>ref|NM_080649.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 3, mRNA
Length=1507
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 792 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 743
>ref|NM_080648.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 2, mRNA
Length=1497
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 733
>ref|NM_001641.3| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 1, mRNA
Length=1563
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 848 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 799
>ref|NG_008718.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), RefSeqGene on chromosome 14
Length=9637
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 6937 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 6888
>dbj|AB463413.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6453, Homo sapiens APEX1
gene for APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, without stop codon, in Flexi system
Length=971
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 525 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 476
>emb|CU686590.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018887
3' read APEX1 mRNA
Length=1181
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 457 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 506
>dbj|AK291100.1| Homo sapiens cDNA FLJ76713 complete cds, highly similar to Homo
sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 2, mRNA
Length=1456
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 757 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 708
>ref|NM_001081485.1| Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), mRNA
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 516 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 467
>gb|DQ977332.1| Pan troglodytes APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1796
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 1245 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 1196
>gb|DQ977483.1| Pongo pygmaeus APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1773
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 1231 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 1182
>gb|DQ894998.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009458; FLH180181.01L;
RZPDo839H02131D APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1) gene, encodes complete protein
Length=997
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 538 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 489
>gb|DQ891814.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004444; FLH180185.01X; RZPDo839H02132D
APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1) gene, encodes complete protein
Length=997
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 538 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 489
>gb|DQ977185.1| Pan paniscus APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1801
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 1252 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 1203
>gb|DQ976454.1| Gorilla gorilla APEX1 (APEX1) gene, complete cds
Length=1759
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1207 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 1158
>gb|BC007306.1| Homo sapiens 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP
cyclohydrolase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3352215)
Length=3422
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 742 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 791
>gb|BT020133.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 516 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 467
>gb|BC004979.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:3855 IMAGE:2905681), complete cds
Length=1364
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 645 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 596
>gb|BC019291.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:4057 IMAGE:2823545), complete cds
Length=1450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 733 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 684
>gb|BC008145.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:17277 IMAGE:4180383), complete cds
Length=1448
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 731 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 682
>gb|BC095428.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:110965 IMAGE:30709297), complete cds
Length=1439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 722 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 673
>gb|BT008224.1| Synthetic construct Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 mRNA, partial cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 516 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 467
>gb|BT007236.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 516 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 467
>gb|AF488551.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
(APEX) gene, complete cds
Length=4187
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 2645 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 2596
>gb|S43127.1| ref-1=redox factor [human, mRNA, 1441 nt]
Length=1441
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 739 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 690
>dbj|AK098588.1| Homo sapiens cDNA FLJ25722 fis, clone TST05409, highly similar
to DNA-(APURINIC OR APYRIMIDINIC SITE) LYASE (EC 4.2.99.18)
Length=1431
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 732 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 683
>gb|U79268.1|HSU79268 Human apurinic/apyrimidinic endonuclease mRNA, complete cds
Length=1414
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 694 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 645
>gb|AY890279.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024754.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 516 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 467
>gb|AY890278.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024753.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 516 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 467
>gb|AY888658.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH010269.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 516 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 467
>gb|AY888657.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH010268.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 467
>gb|AY889611.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH030144.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 467
>gb|AY892759.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024749.01L APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, partial cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 467
>gb|AY892060.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH030139.01L APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, partial cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 516 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 467
>gb|BC002338.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:8338 IMAGE:2819505), complete cds
Length=1459
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 684
>emb|BX161454.1| human full-length cDNA clone CS0DI036YP02 of Placenta of Homo
sapiens (human)
Length=1351
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 633
>emb|AL355075.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-203M5 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=204654
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62898 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 62947
>dbj|D90373.1|HUMAPX Homo sapiens mRNA for apurinic/apyrimidinic endonuclease, complete
cds
Length=1420
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 672
>dbj|D13370.1|HUMAPEXN Homo sapiens APX gene encoding APEX nuclease, complete cds
Length=3730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2828 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 2779
>gb|M92444.1|HUMHAP Homo sapiens apurinic/apyrimidinic endonuclease (HAP1) gene,
complete cds
Length=3046
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 2220
>gb|M99703.1|HUMAPEB Homo sapiens class II AP endonuclease (APE) gene, partial CDS
Length=3019
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2268 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 2219
>gb|M81955.1|HUMAPEA Human apurinic/apyrimidinic endonuclease (HAP1h) mRNA, complete
cds
Length=1438
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 726 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 677
>gb|M80261.1|HUMAPE Human apurinic endonuclease (APE) mRNA, complete cds
Length=1279
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 638 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 589
>emb|X59764.1| Human HAP1 mRNA
Length=1437
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 676
>emb|X66133.1| H.sapiens HAP1 gene for AP endonuclease 1
Length=2957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2258 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 2209
>ref|XM_010346284.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), mRNA
Length=1418
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCAC 48
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Sbjct 706 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCAC 659
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DNA repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 662 TACATACGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 613
>ref|XM_009005658.1| PREDICTED: Callithrix jacchus APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1550
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 846 TACATACGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 797
>gb|BC015601.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4653915, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2858
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Sbjct 2139 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCAGAATCACCC 2090
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site) lyase (LOC104659208), partial mRNA
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Sbjct 75 TACATACGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACGATCACCC 26
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 655 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 606
>ref|XM_009211044.1| PREDICTED: Papio anubis APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 667 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 618
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 787 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 738
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 802 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 753
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 793 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 744
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enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 843 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 794
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site) lyase (LOC103231343), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 685 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 636
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site) lyase (LOC103231343), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 714 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 665
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site) lyase (LOC103231343), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 770 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 721
>ref|XM_007990655.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase (LOC103231340), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 673 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 624
>ref|XM_007990654.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase (LOC103231340), transcript variant X2, mRNA
Length=1486
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 787 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 738
>ref|XM_007990653.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DNA-(apurinic or apyrimidinic
site) lyase (LOC103231340), transcript variant X1, mRNA
Length=1542
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 843 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 794
>ref|XM_005560692.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X6, mRNA
Length=1356
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 651 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 602
>ref|XM_005560691.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X5, mRNA
Length=1359
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 654 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 605
>ref|XM_005560690.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X4, mRNA
Length=1493
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 788 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 739
>ref|XM_005560689.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X3, mRNA
Length=1396
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Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 691 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 642
>ref|XM_005560688.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X2, mRNA
Length=1492
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 787 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 738
>ref|XM_005560687.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926821 (LOC101926821),
transcript variant X1, mRNA
Length=1549
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 844 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 795
>ref|NM_001258109.1| Macaca mulatta APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), mRNA
Length=1163
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
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Sbjct 538 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 489
>dbj|AB171726.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QtrA-16063, similar to
human APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1(APEX1),
transcript variant 1, mRNA, RefSeq: NM_001641.2
Length=1303
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 588
>dbj|AB171333.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-14188, similar to
human APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1(APEX1),
transcript variant 1, mRNA, RefSeq: NM_001641.2
Length=1320
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 49/51 (96%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TACATA-TGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 747 TACATACTGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 697
>gb|AC189967.4| Rhesus Macaque BAC CH250-266O12 () complete sequence
Length=192029
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 50
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 103999 TACATACGTTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCC 104048
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT
>ref|XM_009427358.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
Length=1488
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1104
>ref|XM_009427357.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
Length=1508
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1124
>ref|XM_009427356.1| PREDICTED: Pan troglodytes APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1544
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1160
>ref|XM_008964114.1| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X3, mRNA
Length=1366
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Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 933 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 982
>ref|XM_003811730.2| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
Length=1493
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1109
>ref|XM_003811729.2| PREDICTED: Pan paniscus APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1549
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1165
>gb|KJ896440.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05834 APEX1
gene, encodes complete protein
Length=1086
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 898
>gb|KJ890683.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00077 APEX1
gene, encodes complete protein
Length=1086
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 898
>ref|XM_005267582.2| PREDICTED: Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X2, mRNA
Length=1542
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1157
>ref|XM_005267581.2| PREDICTED: Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair
enzyme) 1 (APEX1), transcript variant X1, mRNA
Length=1505
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1120
>ref|NM_001244249.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 4, mRNA
Length=1558
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1160
>ref|NM_080649.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 3, mRNA
Length=1507
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1109
>ref|NM_080648.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 2, mRNA
Length=1497
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1099
>ref|NM_001641.3| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), transcript variant 1, mRNA
Length=1563
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1165
>ref|NG_008718.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1), RefSeqGene on chromosome 14
Length=9637
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7205 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 7254
>dbj|AB463413.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6453, Homo sapiens APEX1
gene for APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, without stop codon, in Flexi system
Length=971
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 842
>emb|CU686590.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018887
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Sbjct 189 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 140
>emb|CU678841.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017021
3' read APEX1 mRNA
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Sbjct 189 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 140
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sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
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1 (APEX1), mRNA
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Sbjct 784 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 833
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>gb|DQ894998.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009458; FLH180181.01L;
RZPDo839H02131D APEX nuclease (multifunctional DNA
repair enzyme) 1 (APEX1) gene, encodes complete protein
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>gb|DQ891814.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004444; FLH180185.01X; RZPDo839H02132D
APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 (APEX1) gene, encodes complete protein
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Sbjct 806 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 855
>gb|DQ977185.1| Pan paniscus APEX1 (APEX1) gene, complete cds
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Sbjct 1520 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1569
>gb|BC015601.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4653915, **** WARNING: chimeric
clone ****
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>gb|BC007306.1| Homo sapiens 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP
cyclohydrolase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3352215)
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Sbjct 474 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 425
>gb|BT020133.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 mRNA, complete cds
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Sbjct 784 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 833
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1, mRNA (cDNA clone MGC:3855 IMAGE:2905681), complete cds
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Sbjct 913 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 962
>gb|BC019291.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:4057 IMAGE:2823545), complete cds
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Sbjct 1001 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1050
>gb|BC008145.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:17277 IMAGE:4180383), complete cds
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Sbjct 999 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1048
>gb|BC095428.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:110965 IMAGE:30709297), complete cds
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Sbjct 990 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1039
>gb|BT008224.1| Synthetic construct Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional
DNA repair enzyme) 1 mRNA, partial cds
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Sbjct 784 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 833
>gb|BT007236.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1 mRNA, complete cds
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Sbjct 784 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 833
>gb|AF488551.1| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
(APEX) gene, complete cds
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Sbjct 2913 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 2962
>gb|S43127.1| ref-1=redox factor [human, mRNA, 1441 nt]
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Sbjct 1007 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1056
>dbj|AK098588.1| Homo sapiens cDNA FLJ25722 fis, clone TST05409, highly similar
to DNA-(APURINIC OR APYRIMIDINIC SITE) LYASE (EC 4.2.99.18)
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Sbjct 1000 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1049
>gb|U79268.1|HSU79268 Human apurinic/apyrimidinic endonuclease mRNA, complete cds
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Sbjct 962 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1011
>gb|AY890279.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024754.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
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Sbjct 784 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 833
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1 (APEX1) mRNA, complete cds
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Sbjct 784 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 833
>gb|AY888658.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH010269.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
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Sbjct 784 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 833
>gb|AY888657.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH010268.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
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Sbjct 784 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 833
>gb|AY889611.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH030144.01X APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, complete cds
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Sbjct 784 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 833
>gb|AY892759.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024749.01L APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, partial cds
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Sbjct 784 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 833
>gb|AY892060.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH030139.01L APEX nuclease
1 (APEX1) mRNA, partial cds
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Sbjct 784 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 833
>gb|BC002338.2| Homo sapiens APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme)
1, mRNA (cDNA clone MGC:8338 IMAGE:2819505), complete cds
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Sbjct 1001 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1050
>emb|BX161454.1| human full-length cDNA clone CS0DI036YP02 of Placenta of Homo
sapiens (human)
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Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
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Sbjct 950 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 999
>emb|AL355075.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-203M5 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=204654
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Query 1 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 50
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Sbjct 62630 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 62581
>dbj|D90373.1|HUMAPX Homo sapiens mRNA for apurinic/apyrimidinic endonuclease, complete
cds
Length=1420
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Sbjct 989 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1038
>dbj|D13370.1|HUMAPEXN Homo sapiens APX gene encoding APEX nuclease, complete cds
Length=3730
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Sbjct 3096 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 3145
>gb|M92444.1|HUMHAP Homo sapiens apurinic/apyrimidinic endonuclease (HAP1) gene,
complete cds
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Sbjct 2537 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 2586
>gb|M99703.1|HUMAPEB Homo sapiens class II AP endonuclease (APE) gene, partial CDS
Length=3019
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Sbjct 2536 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 2585
>gb|M81955.1|HUMAPEA Human apurinic/apyrimidinic endonuclease (HAP1h) mRNA, complete
cds
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Sbjct 994 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1043
>gb|M80261.1|HUMAPE Human apurinic endonuclease (APE) mRNA, complete cds
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Sbjct 906 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 955
>emb|X59764.1| Human HAP1 mRNA
Length=1437
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Sbjct 993 TATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGATCCAAGAATGT 1042
>emb|X66133.1| H.sapiens HAP1 gene for AP endonuclease 1
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14 14 20925370 20925270 100m GAAGGTCAATTTCTTCATGTGCCACATTGAGGTCTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCA
14 14 20925367 20925267 100m GGTCAATTTCTTCATGTGCCACATTGAGGTCTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCG
14 14 20925364 20925264 100m CAATTTCTTCCTGTGCCACATTGAGGTCTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTG
14 14 20925361 20925261 100m TTTCTTCATGTGCCACATTGAGGTCTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCG
14 14 20925358 20925258 100m CTTCATGTGCCACATTGAGGTCTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTA
14 14 20925355 20925255 100m CATGTGCCACATTGAGGTCTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTC
14 14 20925352 20925252 100m GTGCCACATTGAGGTCTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAG
14 14 20925349 20925249 100m CCACATTGAGGTCTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCG
14 14 20925346 20925246 100m CATTGAGGTCTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTAC
14 14 20925343 20925243 100m TGAGGTCTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAG
14 14 20925340 20925240 100m GGTCTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACC
14 14 20925337 20925237 100m CTCCACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACATGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCG
14 14 20925334 20925234 100m CACACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCTTCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCC
14 14 20925331 20925231 100m ACAGCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGC
14 14 20925328 20925228 100m GCACAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATT
14 14 20925325 20925225 100m CAAGGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGG
14 14 20925322 20925222 100m GGGGCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTAC
14 14 20925319 20925219 100m GCTTTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATA
14 14 20925316 20925216 100m TTCGGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGC
14 14 20925313 20925213 100m GGGAAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGT
14 14 20925310 20925210 100m AAGCCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTAC
14 14 20925307 20925207 100m CCAGGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAG
14 14 20925304 20925204 100m GGCCCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCAC
14 14 20925301 20925201 100m CCTTCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCACAAA
14 14 20925298 20925198 100m TCAGGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCACAAACGA
14 14 20925295 20925195 100m GGAACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTC
14 14 20925292 20925192 100m ACTTGCGAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAA
14 14 20925289 20925189 100m TGCAAAAGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGCTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTC
14 14 20925286 20925186 100m GAAAGGCCTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGC
14 14 20925283 20925183 100m AGGCTTCATCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCAC
14 14 20925280 20925180 100m CTTCACCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCATAAT
14 14 20925277 20925177 100m CAGCCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCAC
14 14 20925274 20925174 100m CCCAGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGCCCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCCG
14 14 20925271 20925171 100m AGCGCTGCCGGTACTCCAGTCGTACCAGACCTCGGCCTGCATTAGGTACATATGCTGTTACCAGCACAAACGAGTCAAATTCAGCCACAATCACCCGGCC
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shotgun sequence
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Sbjct 3657831 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 3657782
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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shotgun sequence
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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shotgun sequence
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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sequence
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 4357278 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 4357327
>ref|NW_001838110.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188393:1-20987734, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 4354436 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 4354485
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shotgun sequence
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 4665612 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 4665661
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 4415156 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 4415205
Lambda K H
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Lambda K H
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right flanking sequence - CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC
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Sbjct 24084630 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 24084581
>ref|NT_026437.13| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR14_CTG1
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assembly
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Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 5861107 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 5861058
>ref|NC_018925.2| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 24552514 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 24552465
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 5552514 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 5552465
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shotgun sequence
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Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 83345273 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 83345322
>gb|GL583092.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_112, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 3654671 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 3654720
>gb|CM000504.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 4668544 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 4668495
>gb|DS990662.1| Homo sapiens SCAF_1112675837338 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4357352 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 4357303
>gb|DS486024.1| Homo sapiens SCAF_1103279188393 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=42876610
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Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 4357596 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 4357547
>emb|AL954800.2| Human chromosome 14 complete sequence
Length=87191216
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Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 4473967 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 4473918
>gb|CH471078.2| Homo sapiens 211000035833619 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=33050393
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4360438 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 4360389
>ref|NW_001838110.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188393:1-20987734, whole genome shotgun
sequence
Length=20987734
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 4357596 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 4357547
>ref|AC_000146.1| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000475.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
Length=87444462
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4668772 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 4668723
>gb|CM000265.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
Length=87316725
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4418316 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 4418267
>gb|CH003509.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGG-AGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4192956 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGGAGCCTTCAGTC 4192906
>gb|CH003461.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
Length=87839096
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGG-AGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4355914 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGGAGCCTTCAGTC 4355864
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT
>ref|XM_009427558.1| PREDICTED: Pan troglodytes neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 614 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 565
>ref|XM_001166039.3| PREDICTED: Pan troglodytes neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X2, mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 751
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transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 739 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 690
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variant X4, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 800 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 751
>ref|XM_008961225.1| PREDICTED: Pan paniscus neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 1201 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 1152
>ref|XM_008961224.1| PREDICTED: Pan paniscus neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 1025 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 976
>ref|XM_003809083.2| PREDICTED: Pan paniscus neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 740 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 691
>ref|XM_008539525.1| PREDICTED: Equus przewalskii neural retina leucine zipper (NRL),
partial mRNA
Length=777
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 573 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 524
>ref|XM_007447861.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer neural retina leucine zipper (NRL),
mRNA
Length=714
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 431
>ref|XM_006720154.1| PREDICTED: Homo sapiens neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 421 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 372
>ref|XM_005267710.2| PREDICTED: Homo sapiens neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 510 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 461
>ref|XM_005267709.2| PREDICTED: Homo sapiens neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 1025 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 976
>ref|XM_005267708.2| PREDICTED: Homo sapiens neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 736 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 687
>ref|XM_006144538.1| PREDICTED: Tupaia chinensis neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 1224 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 1175
>ref|XM_006144537.1| PREDICTED: Tupaia chinensis neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 1146 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 1097
>ref|XM_006144536.1| PREDICTED: Tupaia chinensis neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 882 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 833
>ref|XM_001925854.2| PREDICTED: Sus scrofa neural retina leucine zipper (NRL), mRNA
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Sbjct 515 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 466
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(NRL), transcript variant 4, mRNA
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Sbjct 561 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 512
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(NRL), transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 617 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 568
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(NRL), transcript variant 2, mRNA
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(NRL), transcript variant 1, mRNA
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mRNA
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 431
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Sbjct 622 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 573
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protein, complete cds, clone: HP06819-RBdS104O14
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protein, complete cds, clone: HP06819-RBd29E02
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Sbjct 622 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 573
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protein, complete cds, clone: HP06819-RBd23F08
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Sbjct 278 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 229
>dbj|AB593102.1| Homo sapiens NRL mRNA for neural retina-specific leucine zipper
protein, complete cds, clone: HP06819-RBd06E01
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Sbjct 624 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 575
>dbj|AB593101.1| Homo sapiens NRL mRNA for neural retina-specific leucine zipper
protein, complete cds, clone: HP06819-RBd02D05
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Sbjct 366 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 317
>ref|NG_011697.1| Homo sapiens neural retina leucine zipper (NRL), RefSeqGene on
chromosome 14
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Sbjct 8154 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 8105
>dbj|AB463924.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8905, Homo sapiens NRL gene
for neural retina leucine zipper, without stop codon, in
Flexi system
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Sbjct 489 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 440
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mRNA
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 431
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Sbjct 611 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 562
>gb|BC012395.1| Homo sapiens neural retina leucine zipper, mRNA (cDNA clone MGC:9557
IMAGE:3866588), complete cds
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Sbjct 613 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 564
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mRNA, partial cds
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 431
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 431
>gb|AY891520.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH110218.01L neural retina
leucine zipper (NRL) mRNA, partial cds
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 431
>gb|AY891519.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH110217.01L neural retina
leucine zipper (NRL) mRNA, partial cds
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 431
>gb|AY888905.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH110222.01X neural retina
leucine zipper (NRL) mRNA, complete cds
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 431
>gb|AY888904.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH110221.01X neural retina
leucine zipper (NRL) mRNA, complete cds
Length=714
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 431
>emb|BX161522.1| human full-length cDNA clone CS0DL011YH17 of B cells (Ramos cell
line) of Homo sapiens (human)
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Sbjct 924 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 875
>emb|BX161381.1| human full-length cDNA clone CS0DB006YD07 of Neuroblastoma of
Homo sapiens (human)
Length=2102
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Sbjct 799 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 750
>emb|AL136295.3| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-468E2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=194815
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Sbjct 128562 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 128513
>gb|U95012.1|HSU95012 Homo sapiens neural retinal-specific leucine zipper protein (NRL)
gene, complete cds
Length=4940
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Sbjct 3543 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 3494
>gb|M95925.1|HUMSTS46E Human leucine zipper on the D14S46E locus mRNA, complete cds
Length=1931
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 597 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 548
>gb|M81840.1|HUMNRLGP Human NRL gene product mRNA, complete cds
Length=1251
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 611 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 562
>ref|XM_002824600.2| PREDICTED: Pongo abelii neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 941 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGACCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 892
>ref|XM_002824601.3| PREDICTED: Pongo abelii neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X1, mRNA
Length=1254
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 623 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGACCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 574
>ref|XM_008572351.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus neural retina leucine zipper
(NRL), transcript variant X2, mRNA
Length=1137
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 528 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTCAGCT 479
>ref|XM_008572350.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus neural retina leucine zipper
(NRL), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 625 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTCAGCT 576
>ref|XM_002718089.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus neural retina leucine zipper
(NRL), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 622 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTCAGCT 573
>ref|XM_008269399.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus neural retina leucine zipper
(NRL), transcript variant X2, mRNA
Length=2199
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 866 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTCAGCT 817
>ref|XM_008269398.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus neural retina leucine zipper
(NRL), transcript variant X1, mRNA
Length=2334
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Sbjct 1001 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTCAGCT 952
>ref|XM_007986282.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X8, mRNA
Length=1525
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Sbjct 893 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 844
>ref|XM_007986281.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X7, mRNA
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||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 460
>ref|XM_007986280.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X6, mRNA
Length=1291
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 610
>ref|XM_007986279.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X5, mRNA
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 1070
>ref|XM_007986278.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X4, mRNA
Length=1517
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 885 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 836
>ref|XM_007986277.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X3, mRNA
Length=1367
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 735 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 686
>ref|XM_007986275.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X2, mRNA
Length=1850
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 1218 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 1169
>ref|XM_007986274.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X1, mRNA
Length=1656
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 1024 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 975
>ref|XM_007537603.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus neural retina leucine zipper (NRL),
mRNA
Length=1064
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 818 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTCAGCT 769
>ref|XM_006077708.1| PREDICTED: Bubalus bubalis neural retina leucine zipper (NRL),
mRNA
Length=1173
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 569 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGTCGGTTTAGCT 520
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mRNA
Length=714
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCCCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 431
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mRNA
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Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 621 CAGCCGCAGTGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 572
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGTCGGTTTAGCT 431
>ref|XM_547742.4| PREDICTED: Canis lupus familiaris neural retina leucine zipper
(NRL), mRNA
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 610 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTGAGCT 561
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transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 659 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 610
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1025 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 976
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transcript variant X3, mRNA
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 789 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 740
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1296 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 1247
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transcript variant X1, mRNA
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 885 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 836
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mRNA
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTCAGCT 431
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(NRL), mRNA
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Sbjct 606 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTGAGCT 557
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zipper (NRL), mRNA
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Sbjct 606 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTGAGCT 557
>ref|XM_004091898.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys neural retina leucine zipper,
transcript variant 2 (NRL), mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 1038 CAGCCGCAGGGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 989
>ref|XM_003260671.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys neural retina leucine zipper,
transcript variant 1 (NRL), mRNA
Length=2620
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Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264 CAGCCGCAGGGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 1215
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mRNA
Length=1227
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Sbjct 611 CAGCCGCAGCGCTTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 562
>ref|XM_002921082.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca neural retina-specific leucine
zipper protein-like (LOC100477149), mRNA
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Sbjct 606 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTGAGCT 557
>ref|XM_599808.4| PREDICTED: Bos taurus neural retina leucine zipper (NRL), mRNA
ref|XM_002690538.1| PREDICTED: Bos taurus neural retina leucine zipper (NRL), mRNA
Length=795
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
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Sbjct 480 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGTCGGTTTAGCT 431
>ref|XM_001111646.2| PREDICTED: Macaca mulatta neural retina leucine zipper, transcript
variant 3 (NRL), mRNA
Length=1534
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 850
>ref|XM_001111563.2| PREDICTED: Macaca mulatta neural retina leucine zipper, transcript
variant 1 (NRL), mRNA
Length=1562
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGTCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 878
>ref|XM_008839843.1| PREDICTED: Nannospalax galili neural retina leucine zipper (Nrl),
mRNA
Length=693
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 459 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCCGCCGGTTGAGCT 410
>ref|XM_005370450.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster neural retina leucine zipper
(Nrl), mRNA
Length=1158
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 624 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTCAGCT 575
>ref|XM_005085592.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus neural retina leucine zipper
(Nrl), mRNA
Length=711
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 477 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTCAGCT 428
>ref|XM_004801095.1| PREDICTED: Mustela putorius furo neural retina leucine zipper
(NRL), mRNA
Length=711
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 477 CAGCCGCAGGGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTGAGCT 428
>ref|XM_004755277.1| PREDICTED: Mustela putorius furo neural retina leucine zipper
(NRL), mRNA
Length=714
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 480 CAGCCGCAGGGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTGAGCT 431
>ref|XM_004698912.1| PREDICTED: Echinops telfairi neural retina leucine zipper (NRL),
mRNA
Length=717
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 483 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCGCGCAGCTGCCGGTTGAGCT 434
>ref|XM_006251937.2| PREDICTED: Rattus norvegicus neural retina leucine zipper (Nrl),
transcript variant X3, mRNA
Length=1023
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 742 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 698
>ref|XM_006251935.2| PREDICTED: Rattus norvegicus neural retina leucine zipper (Nrl),
transcript variant X2, mRNA
Length=1043
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 718
>ref|XM_008770672.1| PREDICTED: Rattus norvegicus neural retina leucine zipper (Nrl),
transcript variant X1, mRNA
Length=946
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 621
>ref|XM_006518688.1| PREDICTED: Mus musculus neural retina leucine zipper gene (Nrl),
transcript variant X1, mRNA
Length=1511
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 193
>ref|NM_001271917.1| Mus musculus neural retina leucine zipper gene (Nrl), transcript
variant 4, mRNA
Length=2377
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 566 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 522
>ref|NM_001271916.1| Mus musculus neural retina leucine zipper gene (Nrl), transcript
variant 3, mRNA
Length=2504
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 649
>ref|NM_001136074.2| Mus musculus neural retina leucine zipper gene (Nrl), transcript
variant 2, mRNA
Length=2484
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 629
>ref|NM_008736.3| Mus musculus neural retina leucine zipper gene (Nrl), transcript
variant 1, mRNA
Length=2483
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 672 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 628
>gb|JN953279.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Cpne6:tm1a(KOMP)Ucd; transgenic
Length=40423
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30113 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 30157
>gb|JN945394.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Cpne6:tm1e(KOMP)Ucd; transgenic
Length=40351
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30041 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 30085
>ref|NM_001106036.2| Rattus norvegicus neural retina leucine zipper (Nrl), mRNA
Length=717
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 439
>gb|L14935.1| Mus musculus leucine zipper protein (Nrl) mRNA, complete cds
Length=2422
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 567
>gb|AC159002.2| Mus musculus BAC clone RP23-203D7 from chromosome 14, complete
sequence
Length=181842
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 37249 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 37205
>gb|BC051241.1| Mus musculus neural retina leucine zipper gene, mRNA (cDNA clone
IMAGE:6491690), with apparent retained intron
Length=4983
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3704 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 3660
>dbj|AK044316.1| Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:A930007D20 product:neural retina leucine zipper
gene, full insert sequence
Length=1927
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 656 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 612
>dbj|AK044275.1| Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:A930005A17 product:neural retina leucine zipper
gene, full insert sequence
Length=1954
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 593
>dbj|AK044244.1| Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:A930003A02 product:neural retina leucine zipper
gene, full insert sequence
Length=1965
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 650
>gb|AC174678.2| Mus musculus BAC clone RP23-11O22 from chromosome 14, complete
sequence
Length=224638
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140376 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 140332
>gb|BC031440.1| Mus musculus neural retina leucine zipper gene, mRNA (cDNA clone
MGC:25369 IMAGE:4527590), complete cds
Length=1982
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 45
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 CAGCCGCAGAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTT 613
>ref|XM_004694619.1| PREDICTED: Condylura cristata neural retina leucine zipper (NRL),
mRNA
Length=714
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CAGCCGCAGTGCCTCGTCACGGCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 431
>ref|XM_004609456.1| PREDICTED: Sorex araneus neural retina leucine zipper (NRL),
mRNA
Length=714
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 480 CAGCCGCAAAGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTAAGCT 431
>ref|XM_003755880.1| PREDICTED: Sarcophilus harrisii neural retina leucine zipper
(NRL), mRNA
Length=684
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Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 AGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 50
|||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482 AGCCGCAGAGCCTCATCCCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCT 434
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC
>ref|XM_010363794.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana neural retina leucine zipper
(NRL), transcript variant X1, mRNA
Length=1254
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 6 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 55
>ref|XM_001166004.3| PREDICTED: Pan troglodytes neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X1, mRNA
Length=2102
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 171
>ref|XM_002824601.3| PREDICTED: Pongo abelii neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X1, mRNA
Length=1254
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 6 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 55
>ref|XM_009211274.1| PREDICTED: Papio anubis neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X6, mRNA
Length=2381
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 408 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 457
>ref|XM_009211273.1| PREDICTED: Papio anubis neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X5, mRNA
Length=3339
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 1366 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 1415
>ref|XM_003901619.2| PREDICTED: Papio anubis neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X4, mRNA
Length=2079
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 123 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 172
>ref|XM_009211271.1| PREDICTED: Papio anubis neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X2, mRNA
Length=2165
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 209 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 258
>ref|XM_009211270.1| PREDICTED: Papio anubis neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X1, mRNA
Length=2263
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 290 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 339
>ref|XM_008961225.1| PREDICTED: Pan paniscus neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X3, mRNA
Length=2542
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 633
>ref|XM_008961224.1| PREDICTED: Pan paniscus neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X2, mRNA
Length=2366
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 408 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 457
>ref|XM_003809083.2| PREDICTED: Pan paniscus neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X1, mRNA
Length=2047
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 123 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 172
>ref|XM_007986279.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X5, mRNA
Length=1751
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 551
>ref|XM_007986278.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X4, mRNA
Length=1517
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 268 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 317
>ref|XM_007986277.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X3, mRNA
Length=1367
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 167
>ref|XM_007986274.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X1, mRNA
Length=1656
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 407 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 456
>ref|XM_006720154.1| PREDICTED: Homo sapiens neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X4, mRNA
Length=3191
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 119 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 168
>ref|XM_005267709.2| PREDICTED: Homo sapiens neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X2, mRNA
Length=3802
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 408 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 457
>ref|XM_005267708.2| PREDICTED: Homo sapiens neural retina leucine zipper (NRL), transcript
variant X1, mRNA
Length=3506
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 168
>ref|XM_005560919.1| PREDICTED: Macaca fascicularis neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X4, mRNA
Length=2611
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 457
>ref|XM_005560918.1| PREDICTED: Macaca fascicularis neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X3, mRNA
Length=2375
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 172 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 221
>ref|XM_005560917.1| PREDICTED: Macaca fascicularis neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X2, mRNA
Length=2882
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 679 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 728
>ref|XM_005560916.1| PREDICTED: Macaca fascicularis neural retina leucine zipper (NRL),
transcript variant X1, mRNA
Length=2471
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 268 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 317
>dbj|AB593106.1| Homo sapiens NRL mRNA for neural retina-specific leucine zipper
protein, complete cds, clone: HP06819-RBdS156L24
Length=1984
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 54
>dbj|AB593104.1| Homo sapiens NRL mRNA for neural retina-specific leucine zipper
protein, complete cds, clone: HP06819-RBd29E02
Length=1251
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
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Sbjct 5 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 54
>dbj|AB593102.1| Homo sapiens NRL mRNA for neural retina-specific leucine zipper
protein, complete cds, clone: HP06819-RBd06E01
Length=1257
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 56
>ref|NG_011697.1| Homo sapiens neural retina leucine zipper (NRL), RefSeqGene on
chromosome 14
Length=11517
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4994 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 5043
>emb|AL136295.3| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-468E2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=194815
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125402 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 125451
>gb|U95012.1|HSU95012 Homo sapiens neural retinal-specific leucine zipper protein (NRL)
gene, complete cds
Length=4940
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 CCCTGGAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 425
>gb|BC012395.1| Homo sapiens neural retina leucine zipper, mRNA (cDNA clone MGC:9557
IMAGE:3866588), complete cds
Length=1254
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Plus
Query 6 GAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 45
>ref|NM_006177.3| Homo sapiens neural retina leucine zipper (NRL), mRNA
Length=1974
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 GCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 43
>gb|M81840.1|HUMNRLGP Human NRL gene product mRNA, complete cds
Length=1251
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 GCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCTGAGCAGAGGCACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTC 43
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
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14 14 24550493 24550593 100M AGCCGGTCACAGCGAGCCTTGTAGAGATCGCGCTCCCGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGG
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14 14 24550499 24550599 100M TCACAGCGAGCCTTGTAGAGATCGCGCTCCCGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCCGCCTCCC
14 14 24550502 24550602 100M CAGCGAGCCTTGTAGAGATCGCGCTCCCGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCC
14 14 24550505 24550605 100M CGAGCCTTGTAGAGATCGCGCTCCCGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGC
14 14 24550508 24550608 100M GCCTTGTAGAGATCGCGCTCCCGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCC
14 14 24550511 24550611 100M TTGTAGAGATCGCGCTCCCGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCT
14 14 24550514 24550614 100M TAGAGATCGCGCTCCCGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCT
14 14 24550517 24550617 100M AGATCGCGCTCCCGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCCGCCCGCGCCGCTGCTGCA
14 14 24550520 24550620 100M TCGCGCTCCCGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCC
14 14 24550523 24550623 100M CGCTCCCGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCT
14 14 24550526 24550626 100M TCCCGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCCGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGGCGCTTGG
14 14 24550529 24550629 100M CGGGCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCGGCTGCAGCCGCTTGGAGC
14 14 24550532 24550632 100M GCCAGGCGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTACTGCAGCCGCTTGGCGCGAC
14 14 24550535 24550635 100M AGGCGGGCCACCTAGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGG
14 14 24550538 24550638 100M CGGGCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTTGAGCGACAGGCCT
14 14 24550541 24550641 100M GCCACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCG
14 14 24550544 24550644 100M ACCTCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGGGCGACAGGCCTGCGCGG
14 14 24550547 24550647 100M TCGGCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGC
14 14 24550550 24550650 100M GCCCGCAGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGC
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14 14 24550556 24550656 100M AGCGCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCT
14 14 24550559 24550659 100M GCGTCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCA
14 14 24550562 24550662 100M TCCAGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGGTCTTCTGCG
14 14 24550565 24550665 100M AGCTGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGGGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGGTCTTCAGCGTGC
14 14 24550568 24550668 100M TGGGCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGC
14 14 24550571 24550671 100M GCGGCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCC
14 14 24550574 24550674 100M GCCAGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCT
14 14 24550577 24550677 100M AGGCGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGGTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCT
14 14 24550580 24550680 100M NGGGCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCTTCA
14 14 24550583 24550683 100M GCGCGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGGTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCTTCAGCC
14 14 24550586 24550686 100M CGCTCGGCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCTTCAGCCGCA
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14 14 24550592 24550692 100M GCCTCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCTTCAGCCGCAGCGCCT
14 14 24550595 24550695 100M TCCAGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCTTCAGCCGCAGCGCCTCGT
14 14 24550598 24550698 100M AGCCCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCTTCAGCCGCAGCGCCTCGTCGC
14 14 24550601 24550701 100M CCGCGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCTTCAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCC
14 14 24550604 24550704 100M CGCCGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCTTCAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGC
14 14 24550607 24550707 100M CGCTGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCTTCAGCCGCAGCGCCTCGGTGCGCCCGCAGC
14 14 24550610 24550710 100M TGCTGCAGCCGCTTGGAGCGACAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCTTCAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCC
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14 14 24550631 24550731 100M CAGGCCTGCGCGTAGCCGCGGTTCTTCAGCGTGCGGCGCCTCTGCTTCAGCCGCAGCGCCTCGTCGCGCCCGCAGCCCCGCAGCTGCCGGTTTAGCTCCC
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14 14 24553819 24552075 92m1644n8m CACCAGGCCCTGCTCCATGGAGCCTTCAGTCTCCTGGGAAGCTGTGCCTGTCTGGCTCTGGCACTGACCACATCCTCTCGGCCATTTCTGAA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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sequence
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HuRef SCAF_1103279187954, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 16134466 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 16134515
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shotgun sequence
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 37433476 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 37433525
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Lambda K H
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HSCHR14_CTG1
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assembly
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Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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Sbjct 38586912 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 38586863
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genome shotgun sequence
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Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150177.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold chr14_scaf, whole
genome shotgun sequence
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Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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Sbjct 38215874 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 38215825
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shotgun sequence
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Sbjct 50095794 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50095843
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shotgun sequence
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Sbjct 3564070 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 3564119
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Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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Sbjct 37441766 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 37441717
>gb|DS990679.1| Homo sapiens SCAF_1112675836899 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 16142663 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 16142614
>gb|CH003509.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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Sbjct 37165604 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 37165555
>gb|CH003461.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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Sbjct 37020228 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 37020179
>emb|AL954800.2| Human chromosome 14 complete sequence
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Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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Sbjct 37197194 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 37197145
>gb|CH471061.1| Homo sapiens 211000035836695 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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Sbjct 4081196 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 4081147
>ref|NW_001838111.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187954, whole genome shotgun sequence
gb|DS486041.1| Homo sapiens SCAF_1103279187954 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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Sbjct 16142657 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 16142608
>ref|AC_000146.1| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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Sbjct 37441667 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 37441618
>gb|CM000265.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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Sbjct 37326666 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 37326617
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA
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Sbjct 668 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 619
>ref|XM_010368143.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 645 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 596
>ref|XM_010368142.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 803 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 754
>ref|XM_010368141.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 568 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 519
>ref|XM_010368139.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 669 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 620
>ref|XM_001163118.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 648 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 599
>ref|XM_001163193.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 618 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 569
>ref|XM_001163043.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 672 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 623
>ref|XM_002824775.3| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 645 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 596
>ref|XM_009249103.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 796 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 747
>ref|XM_009211595.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 542 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 493
>ref|XM_009211594.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 847 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 798
>ref|XM_009211593.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 759 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 710
>ref|XM_003901851.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2204
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 670 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 621
>ref|XM_003901850.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2187
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 650 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 601
>ref|XR_609415.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X8, misc_RNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 462 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 413
>ref|XM_008957032.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X7, mRNA
Length=2056
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 519 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 470
>ref|XM_003831674.2| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X6, mRNA
Length=2182
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 645 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 596
>ref|XM_003831673.2| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
Length=2142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 605 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 556
>ref|XM_008957031.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
Length=2140
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 603 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 554
>ref|XM_008957030.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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gene, encodes complete protein
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 802 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 753
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 669 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 620
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variant X3, mRNA
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Sbjct 642 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 593
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variant X2, mRNA
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Sbjct 795 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 746
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variant X1, mRNA
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Sbjct 666 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 617
>ref|XM_005605205.1| PREDICTED: Equus caballus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 562 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 513
>ref|XM_004426189.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 4 (OTX2), mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 644 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 595
>ref|XM_004426188.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 558 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 509
>ref|XM_004426187.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 582 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 533
>ref|XM_004426186.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 1 (OTX2), mRNA
Length=2207
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 668 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 619
>ref|XM_004404903.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 3 (OTX2), mRNA
Length=2180
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 643 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 594
>ref|XM_004404902.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 790 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 741
>ref|XM_004404901.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 1 (OTX2), mRNA
Length=2204
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 667 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 618
>ref|XM_004055214.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2206
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 669 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 620
>ref|XM_004055213.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2205
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 668 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 619
>ref|XM_004055212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2182
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 645 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 596
>ref|XM_004055211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2105
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 568 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 519
>ref|XM_003831676.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2206
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 669 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 620
>ref|XM_002824773.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2206
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 620
>ref|XM_002824774.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
Length=2205
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 619
>ref|XM_003778306.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2105
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 568 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 519
>ref|NR_073036.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
7, non-coding RNA
Length=1966
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 416 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 367
>ref|NR_073034.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
6, non-coding RNA
Length=2043
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 493 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 444
>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
Length=2142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 592 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 543
>ref|NM_001270524.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
4, mRNA
Length=2348
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 798 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 749
>ref|NM_001270523.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
3, mRNA
Length=2195
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 645 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 596
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
Length=2118
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 568 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 519
>ref|NM_021728.3| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
1, mRNA
Length=2219
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 620
>dbj|AB593058.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS105G21
Length=2204
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 620
>dbj|AB593057.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS104I06
Length=1873
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 338 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 289
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
Length=1954
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 419 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 370
>dbj|AB528450.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB7603, Homo sapiens OTX2
gene for orthodenticle homeobox protein 2, without stop codon,
in Flexi system
Length=908
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 394 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 345
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14
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Sbjct 13223 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 13174
>dbj|AK314271.1| Homo sapiens cDNA, FLJ95024, Homo sapiens orthodenticle homolog
2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 701 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 652
>gb|EU176492.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011617; FLH263901.01L;
RZPDo839A02246D orthodenticle homeobox 2 (OTX2) gene,
encodes complete protein
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Sbjct 407 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 358
>gb|DQ890875.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003505; FLH166702.01X; RZPDo839C0488D
orthodenticle homolog 2 (Drosophila) (OTX2) gene,
encodes complete protein
Length=934
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 407 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 358
>gb|AF298117.1|AF298117 Homo sapiens homeobox protein OTX2 gene, complete cds
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Sbjct 4639 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 4590
>gb|BC032579.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:45000
IMAGE:5493541), complete cds
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 670 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 621
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=208102
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 160557 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 160508
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=242832
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 63333 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 63284
>ref|XM_004087142.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTG 49
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Sbjct 657 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTG 609
>ref|XM_010341058.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 795 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 746
>ref|XM_009006079.1| PREDICTED: Callithrix jacchus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 675 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 626
>ref|XM_008702003.1| PREDICTED: Ursus maritimus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 593 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 544
>ref|XM_008701996.1| PREDICTED: Ursus maritimus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 617 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 568
>ref|XM_006894332.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 563 CTTCCCGAGCTGGTGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 514
>ref|XM_006894331.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2144
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 587 CTTCCCGAGCTGGTGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 538
>ref|XM_006736049.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 567 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 518
>ref|XM_006736048.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2123
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 591 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 542
>ref|XM_006199744.1| PREDICTED: Vicugna pacos orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 556 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 507
>ref|XM_006199743.1| PREDICTED: Vicugna pacos orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 640 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 591
>ref|XM_006199742.1| PREDICTED: Vicugna pacos orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 793 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 744
>ref|XM_006199741.1| PREDICTED: Vicugna pacos orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 580 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 531
>ref|XM_006199740.1| PREDICTED: Vicugna pacos orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 664 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 615
>ref|XM_006180809.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
Length=2088
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 556 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 507
>ref|XM_006180808.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
Length=2172
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 640 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 591
>ref|XM_006180807.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2325
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 744
>ref|XM_006180806.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2112
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 580 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 531
>ref|XM_006180805.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2196
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 664 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 615
>ref|XM_005659993.1| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
Length=2186
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 662 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 613
>ref|XM_003353491.2| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2098
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 574 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 525
>ref|XM_005659992.1| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2210
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 686 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 637
>ref|XM_003121824.3| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2147
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 623 CTTCCCGAGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 574
>ref|XM_547830.4| PREDICTED: Canis lupus familiaris orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 361 CTTCCCGGGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
>ref|XM_003435139.2| PREDICTED: Canis lupus familiaris orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=1213
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 385 CTTCCCGGGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 336
>ref|XM_005561341.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2388
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 849 CTTCCCGAGCTGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 800
>ref|XM_005561340.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2413
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 874 CTTCCCGAGCTGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 825
>ref|XM_005561339.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=3457
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 909 CTTCCCGAGCTGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 860
>ref|XM_005322736.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus orthodenticle homeobox
2 (Otx2), transcript variant X4, mRNA
Length=2187
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 651 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGA 602
>ref|XM_005322735.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus orthodenticle homeobox
2 (Otx2), transcript variant X3, mRNA
Length=2346
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 810 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGA 761
>ref|XM_005322734.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus orthodenticle homeobox
2 (Otx2), transcript variant X2, mRNA
Length=2219
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 683 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGA 634
>ref|XM_005322733.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus orthodenticle homeobox
2 (Otx2), transcript variant X1, mRNA
Length=2211
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 675 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGA 626
>ref|XM_005355354.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X4, mRNA
Length=2166
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 654 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 605
>ref|XM_005355353.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2194
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 605 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 556
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 739 CTTCCCGAGCTGGCGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 690
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transcript variant 2, mRNA
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transcript variant 1, mRNA
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2, transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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2, transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 796 CTTCCCGAGCTGGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 747
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2, transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 669 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 620
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2 (OTX2), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 668 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 619
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2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 645 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 596
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2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 568 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 519
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transcript variant 2 (LOC100467291), mRNA
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Sbjct 385 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 336
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transcript variant 1 (LOC100467291), mRNA
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Sbjct 361 CTTCCCGAGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
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miscRNA
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Sbjct 428 CTTCCCGAGCTGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 379
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 385 CTTCCCGAGCTGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 336
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Sbjct 361 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 312
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mRNA
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Sbjct 290 CTTCCCGAGCAGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 241
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1028 CTTCCCGAGCAGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 979
>ref|XM_007192915.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 564 CTTCCCGAGCAGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 515
>ref|XM_007192914.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 560 CTTCCCGAGCAGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 511
>ref|XM_007192913.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
Length=2152
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 633 CTTCCCGAGCAGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 584
>ref|XM_006048688.1| PREDICTED: Bubalus bubalis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
Length=2297
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 756 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 707
>ref|XM_007101679.1| PREDICTED: Physeter catodon orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 361 CTTCCCGAGCAGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
>ref|XM_007101678.1| PREDICTED: Physeter catodon orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=894
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 385 CTTCCCGAGCAGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 336
>ref|XM_007089030.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 361 CTTCCCGGGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
>ref|XM_007089029.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=994
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 385 CTTCCCGGGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 336
>ref|XM_006932891.1| PREDICTED: Felis catus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=976
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 361 CTTCCCGGGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
>ref|XM_003987680.2| PREDICTED: Felis catus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=1000
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 385 CTTCCCGGGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 336
>ref|XM_005968621.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=1317
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
>ref|XM_005968620.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2129
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 536
>ref|XM_005968619.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2215
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 622
>ref|XR_318712.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii homeobox protein OTX2-like (LOC102341606),
misc_RNA
Length=1311
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
>ref|XR_318632.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii homeobox protein OTX2-like (LOC102329232),
misc_RNA
Length=1311
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
>ref|XM_005898777.1| PREDICTED: Bos mutus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2190
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 647 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 598
>ref|XM_005898776.1| PREDICTED: Bos mutus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2340
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 797 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 748
>ref|XM_005898775.1| PREDICTED: Bos mutus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2214
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 622
>ref|XM_005685903.1| PREDICTED: Capra hircus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=870
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
>ref|XM_005685902.1| PREDICTED: Capra hircus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=894
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 385 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 336
>ref|XM_005399198.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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mRNA
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variant X1, mRNA
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variant 1 (OTX2), mRNA
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variant 3 (OTX2), mRNA
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variant 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 566 CTTCCCGAGCAGGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 517
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variant 1 (OTX2), mRNA
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Sbjct 319 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 270
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cds
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Sbjct 4102 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 4053
>ref|XM_003472486.1| PREDICTED: Cavia porcellus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant 2, mRNA
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Sbjct 385 CTTCCCGGGCTGGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 336
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variant 1, mRNA
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Sbjct 361 CTTCCCGGGCTGGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
>ref|NM_001193201.1| Bos taurus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 361 CTTCCCGGGCAGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTG 49
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Sbjct 561 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGACAGGCCTCACTTTGTTTTG 513
>ref|XM_004698606.1| PREDICTED: Echinops telfairi orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTG 49
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transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 529 CTTCCCGGGCCGGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 480
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transcript variant X5, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 535 CTTCCCGGGCCGGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 486
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 667 CTTCCCGGGCCGGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 618
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 666 CTTCCCGGGCCGGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 617
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 907 CTTCCCGGGCCGGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 858
>ref|XM_010641420.1| PREDICTED: Fukomys damarensis orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X16, mRNA
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Sbjct 865 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 816
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transcript variant X15, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 1085 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 1036
>ref|XM_006251838.2| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X14, mRNA
Length=2452
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 922 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 873
>ref|XM_003751455.3| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X13, mRNA
Length=3618
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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>ref|XM_006251835.2| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X12, mRNA
Length=3647
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 2117 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 2068
>ref|XM_008770624.1| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X11, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 2184 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 2135
>ref|XM_008770623.1| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X10, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 2298 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 2249
>ref|XR_596094.1| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X9, misc_RNA
Length=3657
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Sbjct 2210 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 2161
>ref|XM_008770622.1| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X8, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 973 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 924
>ref|XM_008770621.1| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X7, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 1077 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 1028
>ref|XM_008770620.1| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X6, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 1091 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 1042
>ref|XM_008770619.1| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X5, mRNA
Length=3857
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 2327 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 2278
>ref|XM_008770618.1| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X4, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 1019 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 970
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 1932 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 1883
>ref|XM_008770616.1| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X2, mRNA
Length=2560
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 1030 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 981
>ref|XM_008770615.1| PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492),
transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X12, mRNA
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transcript variant X11, mRNA
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transcript variant X10, mRNA
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transcript variant X9, mRNA
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transcript variant X7, mRNA
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transcript variant X6, misc_RNA
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transcript variant X5, mRNA
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 774 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 725
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1744 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 1695
>ref|XM_008269706.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 484 CTTCCCGAGCCGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 435
>ref|XM_002718264.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 699 CTTCCCGAGCCGGCGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 650
>ref|XM_006144859.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2091
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Sbjct 555 CTTCCCGAGCCGGCGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 506
>ref|XM_006144858.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2165
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 629 CTTCCCGAGCCGGCGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 580
>ref|XM_006144857.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2259
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 723 CTTCCCGAGCCGGCGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 674
>ref|XM_004624819.1| PREDICTED: Octodon degus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2210
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Sbjct 662 CTTCCCTGGCTGGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 613
>ref|XM_004624818.1| PREDICTED: Octodon degus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2130
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 582 CTTCCCTGGCTGGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 533
>ref|NM_001100566.1| Rattus norvegicus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), mRNA
Length=2339
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 806 CTTCCCGAGCTGGGGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 757
>gb|AY575213.1| Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox protein 2 (Otx2)
mRNA, partial cds
Length=960
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Query 1 CTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
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Sbjct 160 CTTCCCGAGCCGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGA 111
>ref|XR_090006.3| PREDICTED: Callithrix jacchus homeobox protein OTX2 pseudogene
(LOC100399502), misc_RNA
Length=1808
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 8 AGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 50
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 AGCTGGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA 312
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA
>ref|XM_001163118.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2185
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
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Sbjct 45 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 94
>ref|XM_001163043.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2209
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 45 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 94
>ref|XM_003831674.2| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X6, mRNA
Length=2182
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 91
>ref|XM_004055214.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2206
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 91
>ref|XM_004055213.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2205
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 45 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 94
>ref|XM_004055212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2182
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 91
>ref|XM_003831676.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2206
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 91
>ref|NR_073034.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
6, non-coding RNA
Length=2043
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 91
>ref|NM_001270524.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
4, mRNA
Length=2348
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 91
>ref|NM_001270523.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
3, mRNA
Length=2195
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 91
>ref|NM_021728.3| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
1, mRNA
Length=2219
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 91
>dbj|AB593058.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS105G21
Length=2204
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 91
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
Length=16760
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5032 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 5081
>gb|BC032579.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:45000
IMAGE:5493541), complete cds
Length=2220
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 92
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=208102
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 152366 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 152415
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=242832
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55142 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 55191
>ref|XM_002824775.3| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
Length=2182
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 42 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCACCA 91
>ref|XM_009249103.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2333
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 42 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCACCA 91
>ref|XM_003901851.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2204
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 47 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCACCA 96
>ref|XM_003901850.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2187
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 47 CCTCCACTGTGATTAAAAATAAAAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCACCA 96
>ref|XM_007986786.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
Length=2177
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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14 14 57277130 57276877 38m153n62m AAATTGCTAGAGCAGCCCTCACTCGCCACATCTACTTT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GATAGCTGGCTATTTGGAATTTAAAGGATATTTGACTTTTTCTAACCTCCCATGAGGCTGTA
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shotgun sequence
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sequence
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Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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blast search - nt
left flanking sequence - GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG
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Sbjct 836 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 787
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Sbjct 748 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 699
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Sbjct 659 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 610
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variant X1, mRNA
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Sbjct 639 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 590
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Sbjct 451 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 402
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variant X7, mRNA
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Sbjct 508 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 459
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variant X6, mRNA
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Sbjct 634 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 585
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variant X5, mRNA
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Sbjct 594 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 545
>ref|XM_008957031.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 592 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 543
>ref|XM_008957030.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 485 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 436
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variant X1, mRNA
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Sbjct 510 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 461
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Sbjct 761 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 712
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Sbjct 799 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 750
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 785 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 736
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 439 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 390
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 629 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 580
>ref|XM_007986785.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 622 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 573
>ref|XM_007986783.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 791 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 742
>ref|XM_007986782.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 653 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 604
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 784 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 735
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variant X1, mRNA
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variant X4, mRNA
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Sbjct 569 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 520
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Sbjct 653 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 604
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misc_RNA
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misc_RNA
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
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variant X4, mRNA
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Sbjct 651 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 602
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variant X2, mRNA
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Sbjct 563 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 514
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variant X3, mRNA
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Sbjct 675 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 626
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variant X1, mRNA
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Sbjct 612 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 563
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 374 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
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transcript variant 4 (OTX2), mRNA
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Sbjct 633 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 584
>ref|XM_004426188.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 547 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 498
>ref|XM_004426187.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 571 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 522
>ref|XM_004426186.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 657 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 608
>ref|XM_004404903.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 632 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 583
>ref|XM_004404902.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 779 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 730
>ref|XM_004404901.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 656 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 607
>ref|XM_004055214.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2206
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
>ref|XM_004055213.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2205
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 657 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 608
>ref|XM_004055212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2182
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 634 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 585
>ref|XM_004055211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2105
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 557 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 508
>ref|XM_003831676.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
>ref|XM_002824773.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2206
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
>ref|XM_002824774.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
Length=2205
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 657 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 608
>ref|XM_003778306.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2105
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 557 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 508
>ref|NR_073036.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
7, non-coding RNA
Length=1966
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 405 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 356
>ref|NR_073034.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
6, non-coding RNA
Length=2043
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 482 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 433
>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
Length=2142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 581 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 532
>ref|NM_001270524.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
4, mRNA
Length=2348
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 787 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 738
>ref|NM_001270523.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
3, mRNA
Length=2195
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 634 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 585
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
Length=2118
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 557 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 508
>ref|NM_021728.3| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
1, mRNA
Length=2219
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
>dbj|AB593058.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS105G21
Length=2204
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
>dbj|AB593057.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS104I06
Length=1873
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 327 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 278
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
Length=1954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 408 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 359
>dbj|AB528450.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB7603, Homo sapiens OTX2
gene for orthodenticle homeobox protein 2, without stop codon,
in Flexi system
Length=908
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 383 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 334
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
Length=16760
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 13212 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 13163
>dbj|AK314271.1| Homo sapiens cDNA, FLJ95024, Homo sapiens orthodenticle homolog
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orthodenticle homolog 2 (Drosophila) (OTX2) gene,
encodes complete protein
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Sbjct 396 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 347
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from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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(LOC100399502), misc_RNA
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Sbjct 350 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
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mRNA
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Sbjct 664 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 615
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variant X2, mRNA
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Sbjct 582 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 533
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variant X1, mRNA
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Sbjct 606 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 557
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Sbjct 379 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 330
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Sbjct 563 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 514
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Sbjct 567 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 518
>ref|XM_008536583.1| PREDICTED: Equus przewalskii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 707 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 658
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Sbjct 634 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 588
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Sbjct 785 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 739
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 612
>ref|XM_007447950.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1017 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 968
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 553 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 504
>ref|XM_007192914.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 549 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 500
>ref|XM_007192913.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 622 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 573
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Sbjct 745 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 696
>ref|XM_007101679.1| PREDICTED: Physeter catodon orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 350 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
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transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 374 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 350 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_007089029.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 374 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>ref|XM_006932891.1| PREDICTED: Felis catus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_003987680.2| PREDICTED: Felis catus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=1000
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 374 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>ref|XM_006894332.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2120
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 549 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 503
>ref|XM_006894331.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2144
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 527
>ref|XM_006736049.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2099
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 556 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 507
>ref|XM_006736048.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2123
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 531
>ref|XM_005968621.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=1317
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 301
>ref|XM_005968620.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2129
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 574 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 525
>ref|XM_005968619.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2215
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 660 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 611
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variant X2, mRNA
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Sbjct 646 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 597
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Sbjct 663 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 614
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2 (Otx2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 640 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 591
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2 (Otx2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 799 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 750
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2 (Otx2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 672 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 623
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2 (Otx2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 664 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 615
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Sbjct 643 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 594
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 671 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 622
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 594 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 545
>ref|XM_005355351.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X1, mRNA
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variant X2, mRNA
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Sbjct 687 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 638
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Sbjct 712 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 663
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Sbjct 723 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 674
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Sbjct 729 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 680
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 635 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 586
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 779 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 730
>ref|XM_004681843.1| PREDICTED: Condylura cristata orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 659 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 610
>ref|XM_004624819.1| PREDICTED: Octodon degus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 651 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 602
>ref|XM_004624818.1| PREDICTED: Octodon degus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 571 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 522
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variant X2, mRNA
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Sbjct 691 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 645
>ref|XM_004649215.1| PREDICTED: Jaculus jaculus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 575 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 529
>ref|XM_004452980.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant 4, mRNA
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 2920 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 2874
>ref|XM_004452979.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant 3, mRNA
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 725 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 679
>ref|XM_004452978.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant 2, mRNA
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 652 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 606
>ref|XM_004452977.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant 1, mRNA
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 2944 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 2898
>ref|XM_004370893.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris orthodenticle homeobox
2, transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 633 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 584
>ref|XM_004370892.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris orthodenticle homeobox
2, transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 785 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 736
>ref|XM_004370891.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris orthodenticle homeobox
2, transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 657 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 608
>ref|XM_004314868.1| PREDICTED: Tursiops truncatus orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 3 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 555 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 506
>ref|XM_004314867.1| PREDICTED: Tursiops truncatus orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 635 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 586
>ref|XM_004314866.1| PREDICTED: Tursiops truncatus orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 1 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 659 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 610
>ref|XM_004279317.1| PREDICTED: Orcinus orca orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 3 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 586
>ref|XM_004279316.1| PREDICTED: Orcinus orca orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 2 (OTX2), mRNA
Length=2104
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 506
>ref|XM_004279315.1| PREDICTED: Orcinus orca orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 1 (OTX2), mRNA
Length=2208
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 659 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 610
>ref|XM_004087142.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=1447
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 646 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGGCCTCCATTCTG 597
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Sbjct 308 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 259
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2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 658 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
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2 (OTX2), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 657 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 608
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2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 634 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 585
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2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 557 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 508
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cds
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Sbjct 4091 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 4042
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variant 2, mRNA
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Sbjct 374 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
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variant 1, mRNA
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Sbjct 374 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>ref|XM_002913007.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca homeobox protein OTX2-like,
transcript variant 1 (LOC100467291), mRNA
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Sbjct 350 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 301
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miscRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 417 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 368
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 374 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>gb|AF093138.1|AF093138 Homo sapiens homeodomain protein OTX2 (OTX2) mRNA, complete cds
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCTCCATTCTG 301
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 598 GATGTCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 552
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transcript variant X2, mRNA
ref|XM_004792432.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 843 GATGTCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 797
>ref|XM_004738835.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
ref|XM_004792431.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 622 GATGTCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 576
>ref|XM_004020412.1| PREDICTED: Ovis aries homeobox protein OTX2-like (LOC101106129),
mRNA
Length=2104
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 550 GGAGATATCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 501
>ref|XM_003794403.1| PREDICTED: Otolemur garnettii orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 2 (OTX2), mRNA
Length=2308
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 759 GGAGATGTCTTCTTCTTAGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 710
>ref|XM_003794402.1| PREDICTED: Otolemur garnettii orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 1 (OTX2), mRNA
Length=2103
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554 GGAGATGTCTTCTTCTTAGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 505
>ref|XM_008269706.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=1984
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 473 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCACCATTCTG 424
>ref|XM_002718264.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2143
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 632 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCACCATTCTG 583
>ref|XM_006144860.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
Length=2235
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Strand=Plus/Minus
Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 642
>ref|XM_006144859.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2091
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Strand=Plus/Minus
Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 498
>ref|XM_006144858.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2165
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 612 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 572
>ref|XM_006144857.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2259
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 666
>gb|AY575213.1| Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox protein 2 (Otx2)
mRNA, partial cds
Length=960
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 149 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCACCATTCTG 100
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG
>ref|XM_001163193.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2155
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 114
>ref|XR_609415.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X8, misc_RNA
Length=1999
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 110
>ref|XM_003831673.2| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
Length=2142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 52 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 101
>ref|NR_073036.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
7, non-coding RNA
Length=1966
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 64
>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
Length=2142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 64
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
Length=2118
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 64
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
Length=1954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 67
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
Length=16760
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9818 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 9867
>gb|AF298117.1|AF298117 Homo sapiens homeobox protein OTX2 gene, complete cds
Length=10728
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 1283
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=208102
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157152 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 157201
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=242832
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59928 CTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 59977
>ref|XM_004055211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2105
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 TGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 64
>ref|XM_003778306.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2105
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 TGGAAAGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 64
>ref|XM_010368141.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2101
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 AACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19 AACGTGGAAGAACTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 64
>ref|XM_007986785.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2170
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 AACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 AACGTGGAAGAACTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 129
>ref|XM_004426188.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 3 (OTX2), mRNA
Length=2097
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG 50
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 10 TGGAACGTGGAAAAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCACCTCTG 58
>ref|XM_004426187.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279187954, whole genome shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 785 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 736
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 439 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 390
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 629 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 580
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 622 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 573
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 791 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 742
>ref|XM_007986782.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 631 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 582
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Sbjct 784 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 735
>ref|XM_006920148.1| PREDICTED: Pteropus alecto orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 655 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 606
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variant X5, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 545 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 496
>ref|XM_006199743.1| PREDICTED: Vicugna pacos orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 629 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 580
>ref|XM_006199742.1| PREDICTED: Vicugna pacos orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 782 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 733
>ref|XM_006199741.1| PREDICTED: Vicugna pacos orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 569 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 520
>ref|XM_006199740.1| PREDICTED: Vicugna pacos orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 653 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 604
>ref|XM_006180809.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 545 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 496
>ref|XM_006180808.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 629 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 580
>ref|XM_006180807.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 782 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 733
>ref|XM_006180806.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 569 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 520
>ref|XM_006180805.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2196
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 653 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 604
>ref|XR_318712.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii homeobox protein OTX2-like (LOC102341606),
misc_RNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XR_318632.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii homeobox protein OTX2-like (LOC102329232),
misc_RNA
Length=1311
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_005659993.1| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 651 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 602
>ref|XM_003353491.2| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 563 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 514
>ref|XM_005659992.1| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 675 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 626
>ref|XM_003121824.3| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2147
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 612 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 563
>ref|XM_547830.4| PREDICTED: Canis lupus familiaris orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_003435139.2| PREDICTED: Canis lupus familiaris orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 374 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>ref|XM_004426189.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 4 (OTX2), mRNA
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
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Sbjct 657 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 608
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variant X2, mRNA
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Sbjct 557 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 508
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7, non-coding RNA
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Sbjct 405 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 356
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6, non-coding RNA
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Sbjct 482 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 433
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5, mRNA
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Sbjct 581 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 532
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4, mRNA
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Sbjct 787 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 738
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3, mRNA
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Sbjct 634 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 585
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2, mRNA
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Sbjct 557 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 508
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1, mRNA
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
>dbj|AB593058.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS105G21
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
>dbj|AB593057.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS104I06
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Sbjct 327 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 278
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
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Sbjct 408 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 359
>dbj|AB528450.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB7603, Homo sapiens OTX2
gene for orthodenticle homeobox protein 2, without stop codon,
in Flexi system
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Sbjct 383 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 334
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
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Sbjct 13212 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 13163
>dbj|AK314271.1| Homo sapiens cDNA, FLJ95024, Homo sapiens orthodenticle homolog
2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 690 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 641
>gb|EU176492.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011617; FLH263901.01L;
RZPDo839A02246D orthodenticle homeobox 2 (OTX2) gene,
encodes complete protein
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Sbjct 396 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 347
>gb|DQ890875.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003505; FLH166702.01X; RZPDo839C0488D
orthodenticle homolog 2 (Drosophila) (OTX2) gene,
encodes complete protein
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Sbjct 396 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 347
>gb|AF298117.1|AF298117 Homo sapiens homeobox protein OTX2 gene, complete cds
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Sbjct 4628 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 4579
>gb|BC032579.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:45000
IMAGE:5493541), complete cds
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Sbjct 659 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 610
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=208102
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Sbjct 160546 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 160497
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=242832
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 63322 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 63273
>ref|XM_010641425.1| PREDICTED: Fukomys damarensis orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 518 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 469
>ref|XM_010641424.1| PREDICTED: Fukomys damarensis orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X5, mRNA
Length=2060
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 524 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 475
>ref|XM_010641423.1| PREDICTED: Fukomys damarensis orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X4, mRNA
Length=2192
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 656 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 607
>ref|XM_010641422.1| PREDICTED: Fukomys damarensis orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2191
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 655 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 606
>ref|XM_010641421.1| PREDICTED: Fukomys damarensis orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2432
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 896 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 847
>ref|XM_010641420.1| PREDICTED: Fukomys damarensis orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2166
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 630 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 581
>ref|XM_010341058.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
Length=2333
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 735
>ref|XR_090006.3| PREDICTED: Callithrix jacchus homeobox protein OTX2 pseudogene
(LOC100399502), misc_RNA
Length=1808
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 350 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_009006079.1| PREDICTED: Callithrix jacchus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2211
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 615
>ref|XM_008702003.1| PREDICTED: Ursus maritimus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=1102
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 582 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 533
>ref|XM_008701996.1| PREDICTED: Ursus maritimus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=1126
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 606 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 557
>ref|XM_008536586.1| PREDICTED: Equus przewalskii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
Length=2686
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 563 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 514
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transcript variant X2, mRNA
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 374 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
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Sbjct 350 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 374 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
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variant X3, mRNA
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Sbjct 350 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
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variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 374 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
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Sbjct 549 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 503
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 573 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 527
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Sbjct 556 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 507
>ref|XM_006736048.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 580 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 531
>ref|XM_005968621.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 301
>ref|XM_005968620.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 574 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 525
>ref|XM_005968619.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 660 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 611
>ref|XM_005898777.1| PREDICTED: Bos mutus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 636 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 587
>ref|XM_005898776.1| PREDICTED: Bos mutus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 786 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 737
>ref|XM_005898775.1| PREDICTED: Bos mutus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 660 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 611
>ref|XM_005685903.1| PREDICTED: Capra hircus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 301
>ref|XM_005685902.1| PREDICTED: Capra hircus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 374 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 325
>ref|XM_005605205.1| PREDICTED: Equus caballus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 551 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 502
>ref|XM_005561341.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 838 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 789
>ref|XM_005561340.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 863 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 814
>ref|XM_005561339.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 898 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 849
>ref|XM_005399198.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2190
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 639 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 590
>ref|XM_005399197.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2197
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 646 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 597
>ref|XM_005399196.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 663 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 614
>ref|XM_005322736.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus orthodenticle homeobox
2 (Otx2), transcript variant X4, mRNA
Length=2187
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 640 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 591
>ref|XM_005322735.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus orthodenticle homeobox
2 (Otx2), transcript variant X3, mRNA
Length=2346
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 799 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 750
>ref|XM_005322734.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus orthodenticle homeobox
2 (Otx2), transcript variant X2, mRNA
Length=2219
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 672 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 623
>ref|XM_005322733.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus orthodenticle homeobox
2 (Otx2), transcript variant X1, mRNA
Length=2211
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 664 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 615
>ref|XM_005355354.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X4, mRNA
Length=2166
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 594
>ref|XM_005355353.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2194
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 622
>ref|XM_005355352.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2111
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 594 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 545
>ref|XM_005355351.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 687 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 638
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variant X1, mRNA
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transcript variant 3, mRNA
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transcript variant 2, mRNA
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transcript variant 1, mRNA
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2, transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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>ref|XM_004370892.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris orthodenticle homeobox
2, transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 785 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 736
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2, transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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variant 3 (OTX2), mRNA
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variant 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 635 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 586
>ref|XM_004314866.1| PREDICTED: Tursiops truncatus orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 1 (OTX2), mRNA
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variant 3 (OTX2), mRNA
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Sbjct 635 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 586
>ref|XM_004279316.1| PREDICTED: Orcinus orca orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 555 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 506
>ref|XM_004279315.1| PREDICTED: Orcinus orca orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 1 (OTX2), mRNA
Length=2208
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Sbjct 659 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 610
>ref|XM_004087142.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Sbjct 646 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGGCCTCCATTCTG 597
>ref|XM_004011036.1| PREDICTED: Ovis aries orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
Length=828
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Sbjct 308 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 259
>ref|XM_003930496.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 658 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
>ref|XM_003930495.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X5, mRNA
Length=2206
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Sbjct 657 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 608
>ref|XM_003930494.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
Length=2183
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 585
>ref|XM_003930493.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
Length=2106
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 508
>gb|JN581044.1| Ovis aries breed Texel homeobox protein OTX2 (OTX2) gene, complete
cds
Length=4777
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Sbjct 4091 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 4042
>ref|XM_003472486.1| PREDICTED: Cavia porcellus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant 2, mRNA
Length=894
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Sbjct 374 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>ref|XM_003472485.1| PREDICTED: Cavia porcellus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant 1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 350 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_002913008.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca homeobox protein OTX2-like,
transcript variant 2 (LOC100467291), mRNA
Length=1186
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||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 374 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>ref|XM_002913007.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca homeobox protein OTX2-like,
transcript variant 1 (LOC100467291), mRNA
Length=1162
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|NM_001193201.1| Bos taurus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
Length=1317
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 301
>ref|XR_092259.1| PREDICTED: Macaca mulatta homeobox protein OTX2-like (LOC100428479),
miscRNA
Length=1967
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 368
>ref|NM_001177645.1| Macaca mulatta orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
Length=1924
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 374 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>gb|AF093138.1|AF093138 Homo sapiens homeodomain protein OTX2 (OTX2) mRNA, complete cds
Length=870
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_004738837.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
ref|XM_004792433.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2139
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 GATGTCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 552
>ref|XM_004738836.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
ref|XM_004792432.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2384
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 843 GATGTCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 797
>ref|XM_004738835.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
ref|XM_004792431.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2163
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 GATGTCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 576
>ref|XM_004020412.1| PREDICTED: Ovis aries homeobox protein OTX2-like (LOC101106129),
mRNA
Length=2104
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 550 GGAGATATCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 501
>ref|XM_003794403.1| PREDICTED: Otolemur garnettii orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 2 (OTX2), mRNA
Length=2308
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 759 GGAGATGTCTTCTTCTTAGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 710
>ref|XM_003794402.1| PREDICTED: Otolemur garnettii orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 1 (OTX2), mRNA
Length=2103
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 554 GGAGATGTCTTCTTCTTAGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 505
>ref|XM_008269706.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 473 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCACCATTCTG 424
>ref|XM_002718264.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2143
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 632 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCACCATTCTG 583
>ref|XM_006144860.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
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Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
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Sbjct 682 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 642
>ref|XM_006144859.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
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Sbjct 538 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 498
>ref|XM_006144858.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 612 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 572
>ref|XM_006144857.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2259
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Strand=Plus/Minus
Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
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Sbjct 706 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 666
>gb|AY575213.1| Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox protein 2 (Otx2)
mRNA, partial cds
Length=960
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 149 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCACCATTCTG 100
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA
>ref|XM_001163193.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2155
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
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Sbjct 48 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 97
>ref|XR_609415.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X8, misc_RNA
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Query 1 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
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Sbjct 44 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 93
>ref|XM_003831673.2| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
Length=2142
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 35 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 84
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
Length=1954
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Query 1 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
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Sbjct 1 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
Length=16760
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
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Sbjct 9801 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 9850
>gb|AF298117.1|AF298117 Homo sapiens homeobox protein OTX2 gene, complete cds
Length=10728
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
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Sbjct 1217 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 1266
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=208102
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157135 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 157184
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=242832
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
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Sbjct 59911 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 59960
>ref|NR_073036.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
7, non-coding RNA
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Strand=Plus/Plus
Query 4 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 47
>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
Length=2142
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Strand=Plus/Plus
Query 4 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 47
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
Length=2118
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 4 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 47
>ref|XM_004055211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
Length=2105
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Query 4 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTTTAAGTTAGTGGTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 47
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
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14 14 57268793 57268893 100M TGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCT
14 14 57268796 57268896 100M GATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGC
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14 14 57268802 57268902 100M ACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGT
14 14 57268805 57268905 100M TCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGG
14 14 57268808 57268908 100M GCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATGGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGAC
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14 14 57268817 57268917 100M AAGAGGAGGTGGGCAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCT
14 14 57268820 57268920 100M AGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGA
14 14 57268823 57268923 100M AGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGG
14 14 57268826 57268926 100M TGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGG
14 14 57268829 57268929 100M ACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGT
14 14 57268832 57268932 100M AGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAA
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14 14 57268838 57268938 100M CTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCC
14 14 57268841 57268941 100M ACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACT
14 14 57268844 57268944 100M GTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGT
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14 14 57268868 57268968 100M AGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGGGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCG
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14 14 57268874 57268974 100M ACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGTCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGG
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14 14 57268933 57272372 89M57272384F11m TGGCCCCTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGGCCTCCATTCTG CTCTTTTTAAG
14 14 57268935 57272370 87M57272384F13m GCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCTCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG CTCTTTTTAAGTT
14 14 57268937 57272368 85M57272384F15m CACTTGTTCCACTCTCTGAACTTACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTTTG CTCTTTTTAAGTTAG
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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>ref|NW_001838111.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187954, whole genome shotgun sequence
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variant X4, mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X6, mRNA
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variant X5, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 594 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 545
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variant X4, mRNA
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variant X2, mRNA
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Sbjct 784 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 735
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Sbjct 629 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 580
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variant X3, mRNA
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Sbjct 782 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 733
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Sbjct 569 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 520
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variant X1, mRNA
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variant X4, mRNA
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Sbjct 629 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 580
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variant X3, mRNA
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Sbjct 782 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 733
>ref|XM_006180806.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 569 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 520
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variant X1, mRNA
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Sbjct 653 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 604
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misc_RNA
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XR_318632.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii homeobox protein OTX2-like (LOC102329232),
misc_RNA
Length=1311
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_005659993.1| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 651 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 602
>ref|XM_003353491.2| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 563 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 514
>ref|XM_005659992.1| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 675 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 626
>ref|XM_003121824.3| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 612 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 563
>ref|XM_547830.4| PREDICTED: Canis lupus familiaris orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_003435139.2| PREDICTED: Canis lupus familiaris orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 374 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>ref|XM_004426189.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 4 (OTX2), mRNA
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Sbjct 633 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 584
>ref|XM_004426188.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 547 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 498
>ref|XM_004426187.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 571 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 522
>ref|XM_004426186.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 657 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 608
>ref|XM_004404903.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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Sbjct 632 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 583
>ref|XM_004404902.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 779 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 730
>ref|XM_004404901.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 656 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 607
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mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
>ref|XM_004055213.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Sbjct 657 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 608
>ref|XM_004055212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 634 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 585
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mRNA
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Sbjct 557 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 508
>ref|XM_003831676.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
>ref|XM_002824773.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 609
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variant X5, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 657 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 608
>ref|XM_003778306.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2105
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 557 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 508
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7, non-coding RNA
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6, non-coding RNA
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1, mRNA
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clone: HP05226-RBdS105G21
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clone: HP05226-RBdS104I06
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clone: HP05226-RBb05D05
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>dbj|AB528450.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB7603, Homo sapiens OTX2
gene for orthodenticle homeobox protein 2, without stop codon,
in Flexi system
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14
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2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
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>gb|EU176492.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011617; FLH263901.01L;
RZPDo839A02246D orthodenticle homeobox 2 (OTX2) gene,
encodes complete protein
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>gb|DQ890875.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003505; FLH166702.01X; RZPDo839C0488D
orthodenticle homolog 2 (Drosophila) (OTX2) gene,
encodes complete protein
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Sbjct 396 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 347
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IMAGE:5493541), complete cds
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Sbjct 659 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 610
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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Sbjct 160546 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 160497
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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transcript variant X6, mRNA
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transcript variant X5, mRNA
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 630 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 581
>ref|XM_010341058.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 784 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 735
>ref|XR_090006.3| PREDICTED: Callithrix jacchus homeobox protein OTX2 pseudogene
(LOC100399502), misc_RNA
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Sbjct 350 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_009006079.1| PREDICTED: Callithrix jacchus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Sbjct 664 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 615
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variant X2, mRNA
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Sbjct 582 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 533
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variant X1, mRNA
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Sbjct 606 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 557
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 379 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 330
>ref|XM_008536585.1| PREDICTED: Equus przewalskii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 563 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 514
>ref|XM_008536584.1| PREDICTED: Equus przewalskii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 567 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 518
>ref|XM_008536583.1| PREDICTED: Equus przewalskii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
ref|XM_008536587.1| PREDICTED: Equus przewalskii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 707 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 658
>ref|XM_007951863.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 634 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 588
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
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Sbjct 785 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 739
>ref|XM_007951861.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
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Sbjct 658 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 612
>ref|XM_007447950.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Sbjct 279 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 230
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1017 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 968
>ref|XM_007192915.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 553 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 504
>ref|XM_007192914.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 549 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 500
>ref|XM_007192913.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 622 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 573
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Sbjct 745 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 696
>ref|XM_007101679.1| PREDICTED: Physeter catodon orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 350 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_007101678.1| PREDICTED: Physeter catodon orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 374 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 325
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 646 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 597
>ref|XM_005399196.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
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Sbjct 663 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 614
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2 (Otx2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 640 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 591
>ref|XM_005322735.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus orthodenticle homeobox
2 (Otx2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 799 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 750
>ref|XM_005322734.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus orthodenticle homeobox
2 (Otx2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 672 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 623
>ref|XM_005322733.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus orthodenticle homeobox
2 (Otx2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 664 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTATTTTGACCTCCATTCTG 615
>ref|XM_005355354.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 643 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 594
>ref|XM_005355353.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 671 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 622
>ref|XM_005355352.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 594 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 545
>ref|XM_005355351.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2190
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 667 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 618
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variant X2, mRNA
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Sbjct 687 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 638
>ref|XM_005211839.1| PREDICTED: Bos taurus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 712 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 663
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mRNA
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Sbjct 723 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 674
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mRNA
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Sbjct 729 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 680
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 635 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 586
>ref|XM_004681844.1| PREDICTED: Condylura cristata orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 779 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 730
>ref|XM_004681843.1| PREDICTED: Condylura cristata orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 659 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 610
>ref|XM_004624819.1| PREDICTED: Octodon degus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 651 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 602
>ref|XM_004624818.1| PREDICTED: Octodon degus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 571 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 522
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variant X2, mRNA
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Sbjct 691 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 645
>ref|XM_004649215.1| PREDICTED: Jaculus jaculus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 575 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 529
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transcript variant 4, mRNA
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 2920 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 2874
>ref|XM_004452979.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant 3, mRNA
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 725 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 679
>ref|XM_004452978.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant 2, mRNA
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transcript variant 1, mRNA
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variant 1 (OTX2), mRNA
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mRNA
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2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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2 (OTX2), transcript variant X5, mRNA
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2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 634 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 585
>ref|XM_003930493.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 557 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 508
>gb|JN581044.1| Ovis aries breed Texel homeobox protein OTX2 (OTX2) gene, complete
cds
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variant 2, mRNA
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>ref|XM_003472485.1| PREDICTED: Cavia porcellus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant 1, mRNA
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Sbjct 350 GGAGAAGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
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transcript variant 2 (LOC100467291), mRNA
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Sbjct 374 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>ref|XM_002913007.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca homeobox protein OTX2-like,
transcript variant 1 (LOC100467291), mRNA
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Sbjct 350 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
>ref|NM_001193201.1| Bos taurus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 301
>ref|XR_092259.1| PREDICTED: Macaca mulatta homeobox protein OTX2-like (LOC100428479),
miscRNA
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Sbjct 417 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 368
>ref|NM_001177645.1| Macaca mulatta orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 374 GGAGACGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>gb|AF093138.1|AF093138 Homo sapiens homeodomain protein OTX2 (OTX2) mRNA, complete cds
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Sbjct 350 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCTCCATTCTG 301
>ref|XM_004738837.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
ref|XM_004792433.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 598 GATGTCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 552
>ref|XM_004738836.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
ref|XM_004792432.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2384
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 843 GATGTCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 797
>ref|XM_004738835.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
ref|XM_004792431.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2163
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Query 4 GATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 622 GATGTCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 576
>ref|XM_004020412.1| PREDICTED: Ovis aries homeobox protein OTX2-like (LOC101106129),
mRNA
Length=2104
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Sbjct 550 GGAGATATCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTG 501
>ref|XM_003794403.1| PREDICTED: Otolemur garnettii orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 2 (OTX2), mRNA
Length=2308
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
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Sbjct 759 GGAGATGTCTTCTTCTTAGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 710
>ref|XM_003794402.1| PREDICTED: Otolemur garnettii orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 1 (OTX2), mRNA
Length=2103
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554 GGAGATGTCTTCTTCTTAGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 505
>ref|XM_008269706.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=1984
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Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 473 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCACCATTCTG 424
>ref|XM_002718264.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2143
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 632 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCACCATTCTG 583
>ref|XM_006144860.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
Length=2235
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 642
>ref|XM_006144859.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2091
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 498
>ref|XM_006144858.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2165
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 612 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 572
>ref|XM_006144857.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2259
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 7 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706 GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATT 666
>gb|AY575213.1| Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox protein 2 (Otx2)
mRNA, partial cds
Length=960
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 149 GGAGAGGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTCTGACCACCATTCTG 100
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CAAGTCCTTTAAAAGCCTCTGCCTCGCCTAGTCCGTGCTCTTTTTAAGTT
>ref|XM_001163193.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2155
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAGTCCTTTAAAAGCCTCTGCCTCGCCTAGTCCGTGCTCTTTTTAAGTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 CAAGTCCTTTAAAAGCCTCTGCCTCGCCTAGTCCGTGCTCTTTTTAAGTT 60
>ref|XR_609415.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X8, misc_RNA
Length=1999
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAGTCCTTTAAAAGCCTCTGCCTCGCCTAGTCCGTGCTCTTTTTAAGTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 CAAGTCCTTTAAAAGCCTCTGCCTCGCCTAGTCCGTGCTCTTTTTAAGTT 56
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
Length=16760
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAGTCCTTTAAAAGCCTCTGCCTCGCCTAGTCCGTGCTCTTTTTAAGTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9764 CAAGTCCTTTAAAAGCCTCTGCCTCGCCTAGTCCGTGCTCTTTTTAAGTT 9813
>gb|AF298117.1|AF298117 Homo sapiens homeobox protein OTX2 gene, complete cds
Length=10728
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAGTCCTTTAAAAGCCTCTGCCTCGCCTAGTCCGTGCTCTTTTTAAGTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 CAAGTCCTTTAAAAGCCTCTGCCTCGCCTAGTCCGTGCTCTTTTTAAGTT 1229
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=208102
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAGTCCTTTAAAAGCCTCTGCCTCGCCTAGTCCGTGCTCTTTTTAAGTT 50
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14 14 57272298 57272198 100m CCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTTCCAGCTGGGTACCCCCGATTTGGGCCGA
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sequence
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Lambda K H
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genome shotgun sequence
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Sbjct 38211108 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 38211059
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sequence
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>ref|NW_001838111.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187954, whole genome shotgun sequence
gb|DS486041.1| Homo sapiens SCAF_1103279187954 genomic scaffold, whole genome
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blast search - nt
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transcript variant X2, mRNA
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variant X6, mRNA
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Sbjct 478 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 429
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variant X1, mRNA
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(LOC100399502), misc_RNA
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mRNA
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gene, encodes complete protein
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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variant X4, mRNA
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Sbjct 644 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 595
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variant X2, mRNA
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Sbjct 556 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 507
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variant X3, mRNA
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Sbjct 668 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 619
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variant X1, mRNA
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Sbjct 605 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 556
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 831 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 782
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 856 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 807
>ref|XM_005561339.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 891 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 842
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mRNA
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Sbjct 651 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 602
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mRNA
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Sbjct 650 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 601
>ref|XM_004055212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Sbjct 627 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 578
>ref|XM_004055211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X5, mRNA
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>ref|XM_003778306.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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7, non-coding RNA
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Sbjct 398 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 349
>ref|NR_073034.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
6, non-coding RNA
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Sbjct 475 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 426
>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
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Sbjct 574 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 525
>ref|NM_001270524.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
4, mRNA
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Sbjct 780 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 731
>ref|NM_001270523.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
3, mRNA
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2, mRNA
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Sbjct 651 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 602
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clone: HP05226-RBdS104I06
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clone: HP05226-RBb05D05
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miscRNA
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gene for orthodenticle homeobox protein 2, without stop codon,
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2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
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RZPDo839A02246D orthodenticle homeobox 2 (OTX2) gene,
encodes complete protein
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>gb|DQ890875.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003505; FLH166702.01X; RZPDo839C0488D
orthodenticle homolog 2 (Drosophila) (OTX2) gene,
encodes complete protein
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Sbjct 389 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 340
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>gb|BC032579.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:45000
IMAGE:5493541), complete cds
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Sbjct 652 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 603
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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Sbjct 160539 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT 160490
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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transcript variant X5, mRNA
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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>ref|XM_008589222.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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mRNA
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>ref|XM_007192916.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1010 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 962
>ref|XM_007192915.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 546 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 498
>ref|XM_007192914.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 542 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 494
>ref|XM_007192913.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni orthodenticle
homeobox 2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 615 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 567
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 343 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 295
>ref|XM_007101678.1| PREDICTED: Physeter catodon orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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variant X5, mRNA
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Sbjct 538 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 490
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variant X4, mRNA
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Sbjct 622 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 574
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variant X3, mRNA
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Sbjct 775 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 727
>ref|XM_006199741.1| PREDICTED: Vicugna pacos orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X5, mRNA
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Sbjct 538 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 490
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variant X4, mRNA
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Sbjct 622 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 574
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variant X3, mRNA
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Sbjct 775 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 727
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variant X2, mRNA
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Sbjct 562 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 514
>ref|XM_006180805.1| PREDICTED: Camelus ferus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2196
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 646 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 598
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misc_RNA
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Sbjct 343 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 295
>ref|XR_318632.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii homeobox protein OTX2-like (LOC102329232),
misc_RNA
Length=1311
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Sbjct 628 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 580
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variant 1 (OTX2), mRNA
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Sbjct 777 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGCTGT 728
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Sbjct 651 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGCTGT 602
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2 (OTX2), transcript variant X5, mRNA
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2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 627 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGCTGT 578
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2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 777 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 729
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variant X1, mRNA
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Sbjct 648 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 600
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 343 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGCTGTTG 295
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Sbjct 567 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGCTGTTG 519
>ref|XM_005968619.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 653 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGCTGTTG 605
>ref|XM_005898777.1| PREDICTED: Bos mutus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 629 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGCTGTTG 581
>ref|XM_005898776.1| PREDICTED: Bos mutus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 779 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGCTGTTG 731
>ref|XM_005898775.1| PREDICTED: Bos mutus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 653 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGCTGTTG 605
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variant X2, mRNA
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Sbjct 343 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGCTGTTG 295
>ref|XM_005685902.1| PREDICTED: Capra hircus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 367 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGCTGTTG 319
>ref|XM_547830.4| PREDICTED: Canis lupus familiaris orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 343 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 295
>ref|XM_003435139.2| PREDICTED: Canis lupus familiaris orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 367 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 319
>ref|XM_005211840.1| PREDICTED: Bos taurus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 680 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGCTGTTG 632
>ref|XM_005211839.1| PREDICTED: Bos taurus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 705 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGCTGTTG 657
>ref|XM_004681845.1| PREDICTED: Condylura cristata orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 628 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 580
>ref|XM_004681844.1| PREDICTED: Condylura cristata orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 772 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 724
>ref|XM_004681843.1| PREDICTED: Condylura cristata orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2204
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 652 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 604
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variant X2, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 687 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 639
>ref|XM_004649215.1| PREDICTED: Jaculus jaculus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 571 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 523
>ref|XM_004452980.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant 4, mRNA
Length=4557
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 2916 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 2868
>ref|XM_004452979.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant 3, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 721 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 673
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transcript variant 1, mRNA
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transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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2, transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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mRNA
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cds
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mRNA
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Sbjct 639 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGGCCTCCATTCTGCTGCTGT 590
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 372 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGTTGTTG 324
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Sbjct 556 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGTTGTTG 508
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Sbjct 560 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGTTGTTG 512
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Sbjct 627 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTTTGTTGTTG 579
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Sbjct 778 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTTTGTTGTTG 730
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Sbjct 651 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTTTGTTGTTG 603
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 504 TCTTCTTTTTGGCAGGTCGAACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 456
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Sbjct 619 TCTTCTTTTTGGCAGGTCGAACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 571
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 343 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 367 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
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variant X3, mRNA
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Sbjct 343 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
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variant X2, mRNA
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Sbjct 367 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 545 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 503
>ref|XM_006894331.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 569 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 527
>ref|XM_006736049.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 549 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 507
>ref|XM_006736048.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 573 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 531
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 681 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTTTGTTGTTG 633
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 537 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTTTGTTGTTG 489
>ref|XM_006144858.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 611 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTTTGTTGTTG 563
>ref|XM_006144857.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 705 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTTTGTTGTTG 657
>ref|XM_005605205.1| PREDICTED: Equus caballus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 544 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCGTTCTGTTGTTG 496
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transcript variant X4, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 636 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 594
>ref|XM_005355353.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 664 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 622
>ref|XM_005355352.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 587 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 545
>ref|XM_005355351.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 660 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 618
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2, transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 625 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 583
>ref|XM_004404902.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 772 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 730
>ref|XM_004404901.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 649 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 607
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transcript variant 2 (LOC100467291), mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 325
>ref|XM_002913007.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca homeobox protein OTX2-like,
transcript variant 1 (LOC100467291), mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 343 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 301
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cds
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 191 TCTTCTTTTTGGCAGGTCGAACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 143
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 594 TCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 552
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 839 TCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 797
>ref|XM_004738835.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
ref|XM_004792431.1| PREDICTED: Mustela putorius furo orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 43
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Sbjct 618 TCTTCTTTTTTGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTG 576
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variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Sbjct 752 TCTTCTTCTTAGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGTTGTTG 704
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variant 1 (OTX2), mRNA
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Query 1 TCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTG 49
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Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC
>ref|XM_001163193.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 63 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 112
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Query 1 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
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Sbjct 59 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 108
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variant X5, mRNA
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Query 1 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
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Sbjct 50 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 99
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7, non-coding RNA
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Sbjct 13 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 62
>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 62
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
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Query 1 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
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Sbjct 13 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 62
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
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Query 1 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
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Sbjct 16 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 65
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
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Query 1 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
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Sbjct 9816 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 9865
>gb|AF298117.1|AF298117 Homo sapiens homeobox protein OTX2 gene, complete cds
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Query 1 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
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Sbjct 1232 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 1281
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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Query 1 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
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Sbjct 157150 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 157199
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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Query 1 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59926 TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 59975
>ref|XM_004055211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Query 4 TGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
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Sbjct 16 TGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 62
>ref|XM_003778306.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2105
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Query 4 TGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 TGGAAAGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 62
>ref|XM_010368141.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 7 AACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19 AACGTGGAAGAACTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 62
>ref|XM_007986785.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2170
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Query 7 AACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 AACGTGGAAGAACTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 127
>ref|XM_004426188.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 3 (OTX2), mRNA
Length=2097
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Query 4 TGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 10 TGGAACGTGGAAAAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCACCTC 56
>ref|XM_004426187.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 4 TGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTC 50
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 10 TGGAACGTGGAAAAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCACCTC 56
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
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14 14 57268455 57268975 87M420N13M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGA
14 14 57268458 57268978 84M420N16M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGAT
14 14 57268500 57268963 99M363N1M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||T
14 14 57268506 57268969 93M363N7M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGA
14 14 57268509 57268972 90M363N10M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCT
14 14 57268515 57268978 84M363N16M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGAT
14 14 57268518 57268981 81M363N19M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTC
14 14 57268522 57268985 77M363N23M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCT
14 14 57268529 57268992 70M363N30M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGC
14 14 57268532 57268995 67M363N33M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGG
14 14 57268535 57268998 64M363N36M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCT
14 14 57268538 57269001 61M363N39M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCAC
14 14 57268548 57269011 51M363N49M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA
14 14 57268553 57268999 63M346N37M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTC
14 14 57268566 57269012 50M346N50M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGAC
14 14 57268569 57269032 30M363N70M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGC
14 14 57268569 57272365 30M363N67M57272369F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGC
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14 14 57268686 57268786 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTA
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14 14 57268692 57268792 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTC
14 14 57268695 57268795 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATG
14 14 57268698 57268798 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGA
14 14 57268701 57268801 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAG
14 14 57268704 57268804 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGAC
14 14 57268707 57268807 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTC
14 14 57268710 57268810 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGC
14 14 57268713 57268813 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATG
14 14 57268716 57268816 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAG
14 14 57268719 57268819 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAA
14 14 57268722 57268822 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAG
14 14 57268725 57268825 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAG
14 14 57268728 57268828 100M GCCCCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTG
14 14 57268731 57268831 100M CCCAAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGAC
14 14 57268734 57268834 100M AAAGTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAG
14 14 57268737 57268837 100M GTAGGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGA
14 14 57268740 57268840 100M GGAAGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCT
14 14 57268743 57268843 100M AGTTGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGAC
14 14 57268746 57268846 100M TGAGCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGT
14 14 57268749 57268849 100M GCCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGG
14 14 57268752 57268852 100M AGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAG
14 14 57268755 57268855 100M ATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATG
14 14 57268758 57268858 100M TCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAA
14 14 57268761 57268861 100M TTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCT
14 14 57268764 57268864 100M ACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGG
14 14 57268767 57268867 100M ATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTC
14 14 57268770 57268870 100M ACCTGAAGCCTGAGTATAGGTGATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGGGATGGAAGCTGGGCTCCAG
14 14 57268773 57268873 100M TGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATA
14 14 57268776 57268876 100M AGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGAC
14 14 57268779 57268879 100M CTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACA
14 14 57268782 57268882 100M AGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGA
14 14 57268785 57268885 100M ATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCA
14 14 57268788 57268888 100M GGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTG
14 14 57268791 57268891 100M CATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTG
14 14 57268794 57268894 100M GGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTG
14 14 57268797 57268897 100M ATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCA
14 14 57268800 57268900 100M GGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATG
14 14 57268803 57268903 100M CCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGGGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTC
14 14 57268806 57268906 100M CTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGG
14 14 57268809 57268909 100M CATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGGCGGGACT
14 14 57268812 57268912 100M GCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAG
14 14 57268815 57268915 100M GGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTG
14 14 57268818 57268918 100M AGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGGGCTA
14 14 57268821 57268921 100M GGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGTCTGAGGTGCTAGAG
14 14 57268824 57268924 100M GGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGG
14 14 57268827 57268927 100M GGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGA
14 14 57268830 57268930 100M CAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTG
14 14 57268833 57268933 100M GGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGTGGAGGGAAT
14 14 57268836 57268936 100M ATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGGGGGAATTGG
14 14 57268839 57268939 100M TGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCA
14 14 57268842 57268942 100M CAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTT
14 14 57268845 57268945 100M CGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTT
14 14 57268848 57268948 100M GGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCA
14 14 57268851 57268951 100M GATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTC
14 14 57268854 57268954 100M GGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGCAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCCCT
14 14 57268857 57268957 100M AGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGATTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAA
14 14 57268860 57268960 100M TGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTC
14 14 57268863 57268963 100M GCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACT
14 14 57268866 57268966 100M CCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCCGAACTCACTTCC
14 14 57268869 57268969 100M GATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGA
14 14 57268872 57268972 100M AGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCT
14 14 57268875 57268975 100M CACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTTCACTCTCTGAACTCACTTCCAGAGCTGGA
14 14 57268878 57268978 100M AGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGGGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGAT
14 14 57268881 57268981 100M AGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTC
14 14 57268884 57268984 100M ACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTC
14 14 57268887 57268987 100M GCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTT
14 14 57268890 57268990 100M GCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTG
14 14 57268893 57268993 100M GGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCA
14 14 57268896 57268996 100M AATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGT
14 14 57268899 57268999 100M GGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTC
14 14 57268902 57269002 100M CGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACT
14 14 57268905 57269005 100M GACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGGCTCACTTTG
14 14 57268908 57269008 100M TGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTT
14 14 57268911 57269011 100M GGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA
14 14 57268914 57269014 100M GCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCT
14 14 57268917 57269017 100M AGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCA
14 14 57268920 57269020 100M GGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTC
14 14 57268923 57269023 100M GGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGC
14 14 57268926 57269026 100M AGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGT
14 14 57268929 57269029 100M GAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT
14 14 57268932 57269032 100M TTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGC
14 14 57268935 57269035 100M GCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCATGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGT
14 14 57268935 57272362 94M57272369F6m GCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTAG TGCTGG
14 14 57268938 57269037 46M1I53M ACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTG
14 14 57268938 57272359 91M57272369F9m ACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAAC
14 14 57268938 57272359 91M57272369F9m ACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAAC
14 14 57268939 57272358 90M57272369F10m CTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACG
14 14 57268940 57272357 89M57272369F11m TTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGT
14 14 57268940 57272357 89M57272369F11m TTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGT
14 14 57268941 57272356 88M57272369F12m TGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTG
14 14 57268944 57272353 85M57272369F15m TCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAA
14 14 57268949 57272348 80M57272369F20m TCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCT
14 14 57268949 57272348 80M57272369F20m TCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCT
14 14 57268949 57272348 80M57272369F20m TCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCT
14 14 57268949 57272348 80M57272369F20m TCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTAG TGCTGGAACGTGGAAGAGCT
14 14 57268949 57272348 80M57272369F20m TCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCT
14 14 57268950 57272347 79M57272369F21m CTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTG
14 14 57268950 57272347 79M57272369F21m CTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTG
14 14 57268952 57272345 77M57272369F23m CTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCT
14 14 57268952 57272345 77M57272369F23m CTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCT
14 14 57268952 57272345 77M57272369F23m CTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCT
14 14 57268953 57272344 76M57272369F24m TGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGTAACGTGGAAGAGCTGCTG
14 14 57268953 57272344 76M57272369F24m TGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGTAACGTGGAAGAGCTGCTG
14 14 57268953 57272344 76M57272369F24m TGAACTCACTTACCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTG
14 14 57268954 57272343 75M57272369F25m GAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGG TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGC
14 14 57268956 57272341 73M57272369F27m ACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTGTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTCCTGCCT
14 14 57268957 57272340 72M57272369F28m CTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTC
14 14 57268960 57272337 69M57272369F31m ACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGA
14 14 57268960 57272337 69M57272369F31m ACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGA
14 14 57268960 57272337 69M57272369F31m ACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTAG TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGA
14 14 57268963 57272334 66M57272369F34m TCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTAG TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGC
14 14 57268964 57272333 65M57272369F35m CCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA
14 14 57268968 57272329 61M57272369F39m AGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTAG TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAA
14 14 57268971 57272326 58M57272369F42m TGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACC
14 14 57268974 57272323 55M57272369F45m AGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGC
14 14 57268981 57272316 48M57272369F52m TTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGCCCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTG
14 14 57268982 57272315 47M57272369F53m TCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTTTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGT
14 14 57268983 57272314 46M57272369F54m CTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTT
14 14 57268991 57272306 38M57272369F62m CAGGTCTCACTTTGTTTTGCCCTCCATTCTGCTGTTGT TGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTT
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>ref|NT_026437.13| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR14_CTG1
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assembly
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Sbjct 38582052 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 38582003
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genome shotgun sequence
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Sbjct 57211032 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 57210983
>ref|NW_004929393.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150177.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold chr14_scaf, whole
genome shotgun sequence
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Sbjct 38211032 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 38210983
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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>ref|NW_001838111.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187954, whole genome shotgun sequence
gb|DS486041.1| Homo sapiens SCAF_1103279187954 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 16137798 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 16137749
>ref|AC_000146.1| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000475.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 37436808 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 37436759
>gb|CM000265.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 37321806 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 37321757
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG
>ref|XM_010368144.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 628 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 579
>ref|XM_010368143.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 605 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 556
>ref|XM_010368142.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 763 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 714
>ref|XM_010368141.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 528 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 479
>ref|XM_010368139.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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variant X3, mRNA
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Sbjct 608 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 559
>ref|XM_001163193.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
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Sbjct 578 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 529
>ref|XM_001163043.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 605 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 556
>ref|XM_009249103.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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variant X5, mRNA
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Sbjct 502 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 453
>ref|XM_009211594.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 807 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 758
>ref|XM_009211593.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 719 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 670
>ref|XM_003901851.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 630 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 581
>ref|XM_003901850.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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variant X8, misc_RNA
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>ref|XM_008957032.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X7, mRNA
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>ref|XM_003831674.2| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X6, mRNA
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Sbjct 605 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 556
>ref|XM_003831673.2| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 565 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 516
>ref|XM_008957031.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 563 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 514
>ref|XM_008957030.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 456 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 407
>ref|XM_008957029.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 481 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 432
>gb|KJ891734.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01128 OTX2
gene, encodes complete protein
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 809 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 760
>ref|XM_005561340.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 834 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 785
>ref|XM_005561339.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 869 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 820
>ref|XM_003831676.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 629 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 580
>ref|XM_002824773.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 629 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 580
>ref|XM_002824774.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
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variant X2, mRNA
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6, non-coding RNA
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clone: HP05226-RBdS104I06
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clone: HP05226-RBb05D05
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miscRNA
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gene for orthodenticle homeobox protein 2, without stop codon,
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2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
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RZPDo839A02246D orthodenticle homeobox 2 (OTX2) gene,
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>gb|DQ890875.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003505; FLH166702.01X; RZPDo839C0488D
orthodenticle homolog 2 (Drosophila) (OTX2) gene,
encodes complete protein
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IMAGE:5493541), complete cds
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from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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>ref|XM_007986783.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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variant X4, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X1, mRNA
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mRNA
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mRNA
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mRNA
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Sbjct 605 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCATTTAG 556
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mRNA
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Sbjct 528 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCATTTAG 479
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(LOC100399502), misc_RNA
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Sbjct 321 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAG 272
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mRNA
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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1.33 0.621 1.12
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG
>ref|XM_010368144.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X5, mRNA
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transcript variant X4, mRNA
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>ref|XM_010368142.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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>ref|XM_010368141.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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variant X3, mRNA
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Sbjct 169 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 218
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Sbjct 139 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 188
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variant X1, mRNA
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Sbjct 169 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 218
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mRNA
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mRNA
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Sbjct 189 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 238
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Sbjct 166 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 215
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mRNA
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Sbjct 89 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 138
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variant X3, mRNA
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Sbjct 166 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 215
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7, non-coding RNA
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Sbjct 89 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 138
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6, non-coding RNA
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Sbjct 166 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 215
>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
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Sbjct 89 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 138
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4, mRNA
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Sbjct 319 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 368
>ref|NM_001270523.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
3, mRNA
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Sbjct 166 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 215
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
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Sbjct 89 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 138
>ref|NM_021728.3| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
1, mRNA
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Sbjct 166 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 215
>dbj|AB593058.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS105G21
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Sbjct 166 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 215
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
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Sbjct 92 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 141
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 9892 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 9941
>dbj|AK314271.1| Homo sapiens cDNA, FLJ95024, Homo sapiens orthodenticle homolog
2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 222 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 271
>gb|AF298117.1|AF298117 Homo sapiens homeobox protein OTX2 gene, complete cds
Length=10728
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 1308 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 1357
>gb|BC032579.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:45000
IMAGE:5493541), complete cds
Length=2220
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 167 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 216
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=208102
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 157226 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 157275
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=242832
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 60002 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 60051
>ref|XM_002824775.3| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
Length=2182
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCC 49
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Sbjct 166 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCC 214
>ref|XM_009249103.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2333
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCC 365
>ref|XM_002824773.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2206
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCC 49
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Sbjct 166 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCC 214
>ref|XM_002824774.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
Length=2205
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCC 49
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Sbjct 189 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCC 237
>ref|XM_003778306.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2105
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCC 49
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Sbjct 89 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCC 137
>ref|XM_009211595.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
Length=2076
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 63 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCG 112
>ref|XM_009211594.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
Length=2381
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 368 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCG 417
>ref|XM_009211593.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2293
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 280 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCG 329
>ref|XM_003901851.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2204
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 191 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCG 240
>ref|XM_003901850.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2187
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 171 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCG 220
>ref|XM_007986786.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
Length=2177
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 161 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCG 210
>ref|XM_007986785.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2170
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 154 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCG 203
>ref|XM_007986783.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2339
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 323 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCG 372
>ref|XM_007986782.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2201
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 161 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCG 210
>ref|XM_005561341.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2388
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCG 50
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Sbjct 370 TTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCG 419
>ref|XM_005561340.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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gb|DS486041.1| Homo sapiens SCAF_1103279187954 genomic scaffold, whole genome
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG
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gene, encodes complete protein
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transcript variant X1, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 629 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 580
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variant X5, mRNA
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7, non-coding RNA
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Sbjct 376 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 327
>ref|NR_073034.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
6, non-coding RNA
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5, mRNA
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4, mRNA
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Sbjct 758 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 709
>ref|NM_001270523.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
3, mRNA
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Sbjct 605 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 556
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
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Sbjct 528 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 479
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1, mRNA
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Sbjct 629 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 580
>dbj|AB593058.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS105G21
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Sbjct 629 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 580
>dbj|AB593057.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS104I06
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 298 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 249
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
Length=1954
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miscRNA
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gene for orthodenticle homeobox protein 2, without stop codon,
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2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
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orthodenticle homolog 2 (Drosophila) (OTX2) gene,
encodes complete protein
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IMAGE:5493541), complete cds
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from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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variant X4, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X1, mRNA
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mRNA
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mRNA
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mRNA
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(LOC100399502), misc_RNA
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Sbjct 321 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAG 272
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mRNA
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Lambda K H
1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC
>ref|XM_010368141.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 82 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 131
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variant X2, mRNA
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variant X8, misc_RNA
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Sbjct 128 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 177
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variant X5, mRNA
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Sbjct 119 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 168
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mRNA
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variant X2, mRNA
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Sbjct 82 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 131
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7, non-coding RNA
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Sbjct 82 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 131
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5, mRNA
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Sbjct 82 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 131
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2, mRNA
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Sbjct 82 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 131
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
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Query 1 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
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Sbjct 85 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 134
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
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Query 1 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
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Sbjct 9885 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 9934
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Length=10728
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Query 1 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
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Sbjct 1301 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 1350
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=208102
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Query 1 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157219 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 157268
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=242832
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
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Sbjct 59995 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 60044
>ref|XM_007986785.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2170
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 147 CCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 196
>ref|XM_008957032.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X7, mRNA
Length=2056
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Strand=Plus/Plus
Query 5 TAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 TAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 58
>ref|XM_010368144.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X5, mRNA
Length=2201
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Plus
Query 6 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 231
>ref|XM_010368143.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
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variant X4, mRNA
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mRNA
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mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X5, mRNA
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Sbjct 187 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 231
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6, non-coding RNA
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4, mRNA
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3, mRNA
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1, mRNA
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Sbjct 164 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 208
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clone: HP05226-RBdS105G21
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Sbjct 164 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 208
>dbj|AK314271.1| Homo sapiens cDNA, FLJ95024, Homo sapiens orthodenticle homolog
2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
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IMAGE:5493541), complete cds
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Sbjct 165 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 209
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variant X2, mRNA
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Sbjct 16 GTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 59
>ref|XM_008957029.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 7 GTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
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Sbjct 17 GTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 60
>ref|XM_003930493.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 82 CCCTTAGTTCCACTGCTCCATTCCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 131
>ref|XM_009211595.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 60 TAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 105
>ref|XM_009211594.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 366 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 410
>ref|XM_009211593.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2293
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Query 6 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
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Sbjct 278 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 322
>ref|XM_003901851.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 189 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 233
>ref|XM_003901850.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 169 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 213
>ref|XM_007986786.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 159 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 203
>ref|XM_007986783.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2339
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 6 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 321 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 365
>ref|XM_007986782.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2201
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 6 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 159 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 203
>ref|XM_005561341.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2388
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Query 6 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 368 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 412
>ref|XM_005561340.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 6 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
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Sbjct 369 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 413
>ref|XM_005561339.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=3457
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 6 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
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Sbjct 404 AGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTC 448
>ref|XM_005968620.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 2 CCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
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Sbjct 76 CCTTAGTTCCACCACTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAATCTGTC 124
>ref|XM_004020412.1| PREDICTED: Ovis aries homeobox protein OTX2-like (LOC101106129),
mRNA
Length=2104
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Query 2 CCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC 50
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Sbjct 76 CCTTAGTTCCACCACTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAATCTGTC 124
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Lambda K H
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>gb|CH471061.1| Homo sapiens 211000035836695 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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>ref|NW_001838111.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187954, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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>ref|AC_000146.1| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG
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>ref|XM_009211594.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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variant X3, mRNA
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>ref|XM_003901851.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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gene, encodes complete protein
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transcript variant X1, mRNA
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variant X3, mRNA
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Sbjct 629 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 580
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variant X5, mRNA
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variant X2, mRNA
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7, non-coding RNA
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6, non-coding RNA
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>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
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4, mRNA
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3, mRNA
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2, mRNA
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1, mRNA
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Sbjct 629 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 580
>dbj|AB593058.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS105G21
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Sbjct 629 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 580
>dbj|AB593057.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS104I06
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Sbjct 298 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 249
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
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Sbjct 379 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 330
>ref|XR_092259.1| PREDICTED: Macaca mulatta homeobox protein OTX2-like (LOC100428479),
miscRNA
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Sbjct 388 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 339
>ref|NM_001177645.1| Macaca mulatta orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
Length=1924
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Sbjct 345 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 296
>dbj|AB528450.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB7603, Homo sapiens OTX2
gene for orthodenticle homeobox protein 2, without stop codon,
in Flexi system
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Sbjct 354 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 305
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
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Sbjct 13183 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 13134
>dbj|AK314271.1| Homo sapiens cDNA, FLJ95024, Homo sapiens orthodenticle homolog
2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 661 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 612
>gb|EU176492.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011617; FLH263901.01L;
RZPDo839A02246D orthodenticle homeobox 2 (OTX2) gene,
encodes complete protein
Length=934
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Sbjct 367 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 318
>gb|DQ890875.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003505; FLH166702.01X; RZPDo839C0488D
orthodenticle homolog 2 (Drosophila) (OTX2) gene,
encodes complete protein
Length=934
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 367 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 318
>gb|AF298117.1|AF298117 Homo sapiens homeobox protein OTX2 gene, complete cds
Length=10728
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 4599 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 4550
>gb|BC032579.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:45000
IMAGE:5493541), complete cds
Length=2220
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 630 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 581
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=208102
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 160517 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 160468
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=242832
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 63293 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 63244
>ref|XM_007986786.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
Length=2177
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTT 48
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Sbjct 600 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTT 553
>ref|XM_007986785.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2170
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTT 48
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Sbjct 593 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTT 546
>ref|XM_007986783.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2339
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTT 48
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Sbjct 762 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTT 715
>ref|XM_007986782.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2201
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTT 48
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Sbjct 624 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTT 577
>ref|XM_005659993.1| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
Length=2186
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 622 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAG 573
>ref|XM_003353491.2| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2098
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 534 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAG 485
>ref|XM_005659992.1| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2210
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 646 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAG 597
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variant X1, mRNA
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Sbjct 583 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAG 534
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mRNA
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Query 1 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 50
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Sbjct 629 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCATTTAG 580
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mRNA
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Sbjct 628 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCATTTAG 579
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mRNA
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Sbjct 605 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCATTTAG 556
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Sbjct 528 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCATTTAG 479
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Sbjct 321 TTTGTTCTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG 272
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(LOC100399502), misc_RNA
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Sbjct 321 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAG 272
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mRNA
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Sbjct 635 TTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAG 586
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Lambda K H
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right flanking sequence - CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA
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variant X2, mRNA
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Sbjct 48 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 97
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Sbjct 44 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 93
>ref|XM_003831673.2| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
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Sbjct 35 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 84
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clone: HP05226-RBb05D05
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Sbjct 1 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
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Sbjct 9801 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 9850
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Sbjct 1217 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 1266
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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Sbjct 157135 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 157184
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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Sbjct 59911 CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 59960
>ref|NR_073036.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
7, non-coding RNA
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Sbjct 1 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 47
>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
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Query 4 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
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Sbjct 1 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 47
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
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Query 4 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 50
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Sbjct 1 TTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 47
>ref|XM_004055211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Sbjct 1 TTTTTAAGTTAGTGGTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCA 47
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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14 14 57268515 57268978 84M363N16M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGAT
14 14 57268518 57268981 81M363N19M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTC
14 14 57268522 57268985 77M363N23M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCT
14 14 57268529 57268992 70M363N30M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGC
14 14 57268532 57268995 67M363N33M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGG
14 14 57268535 57268998 64M363N36M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCT
14 14 57268538 57269001 61M363N39M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCAC
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14 14 57268585 57269048 14M363N86M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGGCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCGGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACT
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14 14 57268591 57272380 8M363N89M57272384F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTC
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14 14 57268663 57268763 100M CCAGCATATCCTT
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14 14 57268723 57268823 100M CCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGACATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGG
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14 14 57268729 57268829 100M CCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGG
14 14 57268732 57268832 100M CCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACA
14 14 57268735 57268835 100M CCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGG
14 14 57268738 57268838 100M CCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGAT
14 14 57268741 57268841 100M CCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTG
14 14 57268744 57268844 100M CCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACA
14 14 57268747 57268847 100M CCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTG
14 14 57268750 57268850 100M CCAGCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGGGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGG
14 14 57268753 57268853 100M GCATATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGA
14 14 57268756 57268856 100M TATCCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGG
14 14 57268759 57268859 100M CCTTGACTATAACCTGAAGCCTGAGAATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAG
14 14 57268762 57268862 100M TGACTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTG
14 14 57268765 57268865 100M CTATAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGC
14 14 57268768 57268868 100M TAACCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCC
14 14 57268771 57268871 100M CCTGAAGCCTGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGA
14 14 57268774 57268874 100M GAAGCCTGAGTATAGGTGATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGGGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAG
14 14 57268777 57268877 100M GCCTTAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACA
14 14 57268780 57268880 100M TGAGTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAG
14 14 57268783 57268883 100M GTATAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAG
14 14 57268786 57268886 100M TAGGTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCAC
14 14 57268789 57268889 100M GTCATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGC
14 14 57268792 57268892 100M ATGGGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGC
14 14 57268795 57268895 100M GGATAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGG
14 14 57268798 57268898 100M TAGGACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAA
14 14 57268801 57268901 100M GACCTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGG
14 14 57268804 57268904 100M CTCTGCATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCG
14 14 57268807 57268907 100M TGCATGCAGGAAGAGGAGGGGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGA
14 14 57268810 57268910 100M ATGCAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTG
14 14 57268813 57268913 100M CAGGAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGG
14 14 57268816 57268916 100M GAAGAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGC
14 14 57268819 57268919 100M GAGGAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAG
14 14 57268822 57268922 100M GAGGTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGG
14 14 57268825 57268925 100M GTGGACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGG
14 14 57268828 57268928 100M GACAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGGG
14 14 57268831 57268931 100M AAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGGGA
14 14 57268834 57268934 100M GGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATT
14 14 57268837 57268937 100M TCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTAGC
14 14 57268840 57268940 100M GACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCAC
14 14 57268843 57268943 100M AGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTG
14 14 57268846 57268946 100M GGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTC
14 14 57268849 57268949 100M GGGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCAC
14 14 57268852 57268952 100M ATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCT
14 14 57268855 57268955 100M GAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTG
14 14 57268858 57268958 100M GCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAAC
14 14 57268861 57268961 100M GGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCA
14 14 57268864 57268964 100M CTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTT
14 14 57268867 57268967 100M CAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCC
14 14 57268870 57268970 100M ATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAG
14 14 57268873 57268973 100M GACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTG
14 14 57268876 57268976 100M ACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAG
14 14 57268879 57268979 100M GGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATG
14 14 57268882 57268982 100M GCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCT
14 14 57268885 57268985 100M CTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCT
14 14 57268888 57268988 100M CTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGGGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTT
14 14 57268891 57268991 100M CTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGG
14 14 57268894 57268994 100M GTAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAG
14 14 57268897 57268997 100M ATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTC
14 14 57268900 57269000 100M GTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCA
14 14 57268903 57269003 100M GGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTT
14 14 57268906 57269006 100M ACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGT
14 14 57268909 57269009 100M GAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTT
14 14 57268912 57269012 100M GTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGAC
14 14 57268915 57269015 100M CTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTAACTTTGTTTTGACCTC
14 14 57268918 57269018 100M GAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCAT
14 14 57268921 57269021 100M GGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCT
14 14 57268924 57269024 100M GGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCT
14 14 57268927 57269027 100M GTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTT
14 14 57268930 57269030 100M AATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTT
14 14 57268933 57269033 100M TGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGGCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCT
14 14 57268936 57269036 100M CCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGGCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTTTTGCTGTT
14 14 57268939 57269039 100M CTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTT
14 14 57268942 57269042 100M GTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGATCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGC
14 14 57268945 57269045 100M CCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGC
14 14 57268948 57269048 100M CTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACT
14 14 57268951 57269051 100M TCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG
14 14 57268954 57269054 100M GAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTC
14 14 57268955 57272380 29M1I67M57272384F3m AACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTGG CTC
14 14 57268958 57269058 100M TCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCG
14 14 57268960 57272374 91M57272384F9m ACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTCTTA
14 14 57268962 57272372 89M57272384F11m TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAG
14 14 57268963 57272371 88M57272384F12m TCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGT
14 14 57268966 57272368 85M57272384F15m CGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAG
14 14 57268967 57272367 84M57272384F16m GAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGT
14 14 57268969 57272365 82M57272384F18m GCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGC
14 14 57268969 57272365 82M57272384F18m GCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGC
14 14 57268969 57272365 82M57272384F18m GCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCACGTCTCACTTTGTTTTGTCCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGC
14 14 57268970 57272364 81M57272384F19m CTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCT
14 14 57268970 57272364 81M57272384F19m GTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTTTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCT
14 14 57268971 57272363 80M57272384F20m TGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCTG
14 14 57268971 57272363 80M57272384F20m TGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCTG
14 14 57268977 57272357 74M57272384F26m TGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGT
14 14 57268977 57272357 74M57272384F26m TGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGT
14 14 57268985 57272349 66M57272384F34m TTTTGGCAGGTCTCCCTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGC
14 14 57268986 57272348 65M57272384F35m TTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTGG CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCT
14 14 57268995 57272339 56M57272384F44m TCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCC
14 14 57268995 57272339 56M57272384F44m TCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCC
14 14 57268999 57272335 52M57272384F48m ACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAG
14 14 57269018 57272316 33M57272384F67m TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAACCCAGCCCCTCTG
14 14 57269029 57272305 22M57272384F78m TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTGAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTCCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTT
14 14 57269029 57272305 22M57272384F78m TGCTGTTGTTGGGGGCACTTAG CTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAACCCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTT
14 14 57272391 57272291 100m AGTCCGTGCTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGT
14 14 57272388 57272288 100m CCGTGCTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCC
14 14 57272385 57272285 100m TGCTCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGATCCACT
14 14 57272382 57272282 100m TCTTTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCT
14 14 57272379 57272279 100m TTTTAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCA
14 14 57272376 57272276 100m TAAGTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAAC
14 14 57272373 57272273 100m GTTAGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCA
14 14 57272370 57272270 100m AGTGCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCC
14 14 57272367 57272267 100m GCTGGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACC
14 14 57272364 57272264 100m GGAACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAG
14 14 57272361 57272261 100m ACGTGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGAC
14 14 57272358 57272258 100m TGGAAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCT
14 14 57272355 57272255 100m AAGAGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAA
14 14 57272352 57272252 100m CGCTGCTGCCTCCGAAGCAGTAACCCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCT
14 14 57272349 57272249 100m TGCTGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTC
14 14 57272346 57272246 100m TGCCTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCAC
14 14 57272343 57272243 100m CTCCGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCC
14 14 57272340 57272240 100m CGAAGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGG
14 14 57272337 57272237 100m AGCAGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGC
14 14 57272334 57272234 100m AGTAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATC
14 14 57272331 57272231 100m AAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAG
14 14 57272328 57272228 100m CCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCTCCAAACCCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATC
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left flanking sequence - TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT
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Sbjct 551 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 502
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gene, encodes complete protein
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variant X1, mRNA
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Sbjct 617 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 568
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variant X5, mRNA
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Sbjct 616 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 567
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7, non-coding RNA
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Sbjct 364 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 315
>ref|NR_073034.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
6, non-coding RNA
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Sbjct 441 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 392
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5, mRNA
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Sbjct 540 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 491
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4, mRNA
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Sbjct 746 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 697
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3, mRNA
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Sbjct 593 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 544
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2, mRNA
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Sbjct 516 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 467
>ref|NM_021728.3| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
1, mRNA
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Sbjct 617 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 568
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clone: HP05226-RBdS105G21
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Sbjct 617 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 568
>dbj|AB593057.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS104I06
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Query 1 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 50
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Sbjct 286 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 237
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clone: HP05226-RBb05D05
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miscRNA
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gene for orthodenticle homeobox protein 2, without stop codon,
in Flexi system
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2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
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RZPDo839A02246D orthodenticle homeobox 2 (OTX2) gene,
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orthodenticle homolog 2 (Drosophila) (OTX2) gene,
encodes complete protein
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Sbjct 355 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 306
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IMAGE:5493541), complete cds
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from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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Sbjct 160505 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 160456
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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transcript variant X5, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 612 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTTGCTCTTCGATTCT 563
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variant X4, mRNA
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Sbjct 610 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 561
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variant X2, mRNA
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Sbjct 522 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 473
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variant X3, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 571 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 522
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mRNA
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Sbjct 617 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCATTTAGCTCTTCGATTCT 568
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Sbjct 616 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCATTTAGCTCTTCGATTCT 567
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Sbjct 593 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCATTTAGCTCTTCGATTCT 544
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mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 743 TCCATTCTGTTGTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 694
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Sbjct 619 TCCATTCTGTTGTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 570
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mRNA
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 508 TCCATTCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 459
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 581 TCCATTCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 532
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 50
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Sbjct 309 TCCATTCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 260
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 333 TCCATTCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 284
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 590 TCCATTCTGTTGTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 541
>ref|XM_006864612.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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misc_RNA
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transcript variant X4, mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X1, mRNA
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transcript variant 4 (OTX2), mRNA
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transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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Sbjct 616 TCCATTCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 567
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Sbjct 267 TCCGTTCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 218
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cds
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Sbjct 4050 TCCGTTCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 4001
>gb|JN960686.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Otx2:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
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Sbjct 25096 TCCATTCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 25047
>ref|NM_001193201.1| Bos taurus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
Length=1317
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Sbjct 309 TCCGTTCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 260
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clone MGC:38894 IMAGE:5362013), complete cds
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Sbjct 605 TCCATTCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 556
>gb|BC027104.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA
clone MGC:38809 IMAGE:5359966), complete cds
Length=1697
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Sbjct 601 TCCATTCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 552
>gb|AC166574.1| Mus musculus BAC clone RP23-131O4 from chromosome 14, complete
sequence
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>dbj|AK087527.1| Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:E130311M15 product:HOMEOBOX PROTEIN OTX2
homolog [Mus musculus], full insert sequence
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Sbjct 557 TCCATTCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 508
>dbj|AK081535.1| Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:C130035B17 product:HOMEOBOX PROTEIN OTX2
homolog [Mus musculus], full insert sequence
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Sbjct 560 TCCATTCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 511
>dbj|AK053741.1| Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:E130306E05 product:HOMEOBOX PROTEIN OTX2,
full insert sequence
Length=2144
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Sbjct 556 TCCATTCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 507
>gb|BC017609.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA
clone MGC:27657 IMAGE:4527414), complete cds
Length=1737
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Sbjct 641 TCCATTCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCT 592
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCT
>ref|XM_010368141.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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>ref|XM_001163193.3| PREDICTED: Pan troglodytes orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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>ref|XR_609415.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X8, misc_RNA
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>ref|XM_003831673.2| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
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>ref|XM_007986785.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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>ref|XM_004055211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Query 1 TAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCT 50
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>ref|XM_003778306.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2105
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Query 1 TAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCT 50
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Sbjct 49 TAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCT 98
>ref|NR_073036.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
7, non-coding RNA
Length=1966
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Query 1 TAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCT 50
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Sbjct 49 TAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCT 98
>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
Length=2142
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Query 1 TAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCT 50
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Sbjct 49 TAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCT 98
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
Length=2118
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Query 1 TAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCT 50
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Sbjct 49 TAAACCAGCCCCTCTGTTTGTTTGTTTGCTTTGCCCTTAGTTCCACTGCT 98
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
Length=1954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
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Lambda K H
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blast search - nt
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variant X7, mRNA
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Sbjct 588 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 539
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variant X5, mRNA
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>ref|XM_008957030.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
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Sbjct 439 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 390
>ref|XM_008957029.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
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Sbjct 464 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 415
>gb|KJ891734.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01128 OTX2
gene, encodes complete protein
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Sbjct 792 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 743
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 852 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 803
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Sbjct 611 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 562
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7, non-coding RNA
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Sbjct 359 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 310
>ref|NR_073034.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
6, non-coding RNA
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5, mRNA
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Sbjct 535 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 486
>ref|NM_001270524.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
4, mRNA
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Query 1 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 50
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Sbjct 741 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 692
>ref|NM_001270523.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
3, mRNA
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Query 1 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 50
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Sbjct 588 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 539
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
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Sbjct 511 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 462
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1, mRNA
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Sbjct 612 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 563
>dbj|AB593058.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS105G21
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Sbjct 612 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 563
>dbj|AB593057.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS104I06
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Sbjct 281 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 232
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
Length=1954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 50
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Sbjct 362 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 313
>ref|XR_092259.1| PREDICTED: Macaca mulatta homeobox protein OTX2-like (LOC100428479),
miscRNA
Length=1967
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Query 1 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 50
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Sbjct 371 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 322
>ref|NM_001177645.1| Macaca mulatta orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
Length=1924
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Query 1 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 50
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Sbjct 328 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 279
>dbj|AB528450.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB7603, Homo sapiens OTX2
gene for orthodenticle homeobox protein 2, without stop codon,
in Flexi system
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encodes complete protein
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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variant X5, mRNA
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misc_RNA
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mRNA
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Sbjct 677 TCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 628
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mRNA
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Sbjct 683 TCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 634
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Sbjct 605 TCTGCTGTTGCTGCTGTTGCTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 556
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variant 3 (OTX2), mRNA
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Sbjct 589 TCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 540
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variant 2 (OTX2), mRNA
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variant 1 (OTX2), mRNA
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Sbjct 613 TCTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 564
>ref|XM_004011036.1| PREDICTED: Ovis aries orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
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cds
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variant 2, mRNA
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variant 1, mRNA
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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>ref|XM_006144858.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2165
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Sbjct 567 TGTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 523
>ref|XM_006144857.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2259
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Sbjct 661 TGTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 617
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2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X1, mRNA
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mRNA
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4, mRNA
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2, mRNA
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3, mRNA
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1, mRNA
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Sbjct 738 TCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 689
>ref|XM_005880553.1| PREDICTED: Myotis brandtii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 574 TCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 525
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Sbjct 505 TCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 456
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variant X2, mRNA
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Sbjct 648 TCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 599
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variant X1, mRNA
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Sbjct 532 TCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 483
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transcript variant 4 (OTX2), mRNA
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Sbjct 587 TCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 538
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transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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Sbjct 501 TCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 452
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transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 525 TCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 476
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transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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Sbjct 611 TCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 562
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2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 612 TCTGCTGCTGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 563
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2 (OTX2), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 611 TCTGCTGCTGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 562
>ref|XM_003930494.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 588 TCTGCTGCTGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 539
>ref|XM_003930493.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
Length=2106
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Query 1 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 50
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Sbjct 511 TCTGCTGCTGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 462
>gb|JN960686.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Otx2:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=38386
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Sbjct 25091 TCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 25042
>gb|BC029667.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA
clone MGC:38894 IMAGE:5362013), complete cds
Length=1701
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Sbjct 600 TCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 551
>gb|BC027104.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA
clone MGC:38809 IMAGE:5359966), complete cds
Length=1697
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 50
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Sbjct 596 TCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 547
>gb|AC166574.1| Mus musculus BAC clone RP23-131O4 from chromosome 14, complete
sequence
Length=220918
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Sbjct 26969 TCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 27018
>dbj|AK087527.1| Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:E130311M15 product:HOMEOBOX PROTEIN OTX2
homolog [Mus musculus], full insert sequence
Length=1638
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Sbjct 552 TCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 503
>dbj|AK081535.1| Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:C130035B17 product:HOMEOBOX PROTEIN OTX2
homolog [Mus musculus], full insert sequence
Length=1986
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Query 1 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 50
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Sbjct 555 TCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 506
>dbj|AK053741.1| Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:E130306E05 product:HOMEOBOX PROTEIN OTX2,
full insert sequence
Length=2144
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 50
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Sbjct 551 TCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 502
>gb|BC017609.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA
clone MGC:27657 IMAGE:4527414), complete cds
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 50
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Sbjct 636 TCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC 587
Lambda K H
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Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 182 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 231
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 340 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 389
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 105 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 154
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 182 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 231
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variant X3, mRNA
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
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Sbjct 185 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 234
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variant X8, misc_RNA
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
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Sbjct 151 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 200
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variant X7, mRNA
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
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Sbjct 32 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 81
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variant X6, mRNA
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Sbjct 182 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 231
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variant X5, mRNA
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
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Sbjct 142 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 191
>ref|XM_008957031.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
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Sbjct 116 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 165
>ref|XM_008957030.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 33 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 82
>ref|XM_008957029.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
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Sbjct 34 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 83
>ref|XM_004055214.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 231
>ref|XM_004055213.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 205 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 254
>ref|XM_004055212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 231
>ref|XM_004055211.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 154
>ref|XM_003831676.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 231
>ref|NR_073036.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
7, non-coding RNA
Length=1966
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 154
>ref|NR_073034.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
6, non-coding RNA
Length=2043
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 231
>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 154
>ref|NM_001270524.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
4, mRNA
Length=2348
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 384
>ref|NM_001270523.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
3, mRNA
Length=2195
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 231
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
Length=2118
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 154
>ref|NM_021728.3| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
1, mRNA
Length=2219
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 231
>dbj|AB593058.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS105G21
Length=2204
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 231
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
Length=1954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 157
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
Length=16760
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9908 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 9957
>dbj|AK314271.1| Homo sapiens cDNA, FLJ95024, Homo sapiens orthodenticle homolog
2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
Length=1210
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
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Sbjct 238 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 287
>gb|AF298117.1|AF298117 Homo sapiens homeobox protein OTX2 gene, complete cds
Length=10728
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 1373
>gb|BC032579.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:45000
IMAGE:5493541), complete cds
Length=2220
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Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 232
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=208102
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157242 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 157291
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=242832
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60018 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 60067
>ref|XM_010341058.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
Length=2333
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 332 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCCGGCGCATCAAGATCTT 381
>ref|XM_002824775.3| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
Length=2182
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 182 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCTGGCGCATCAAGATCTT 231
>ref|XM_009249103.1| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2333
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 333 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCTGGCGCATCAAGATCTT 382
>ref|XM_009211595.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
Length=2076
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 CCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 128
>ref|XM_009211594.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
Length=2381
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 CCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 433
>ref|XM_009211593.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
Length=2293
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 CCACCCACCAAGGAGTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 345
>ref|XM_003901851.2| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2204
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACCCACCAAGGACTCTGAACCTGTCCACCCCGGGCGCATCAAGATCTT 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279187954, whole genome shotgun sequence
gb|DS486041.1| Homo sapiens SCAF_1103279187954 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>ref|AC_000146.1| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 37321709 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 37321660
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC
>ref|XM_010368144.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 555 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 506
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Sbjct 582 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 533
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variant X3, mRNA
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Sbjct 479 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 430
>ref|XM_009211594.1| PREDICTED: Papio anubis orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 587 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 538
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variant X8, misc_RNA
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variant X7, mRNA
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>ref|XM_003831674.2| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X6, mRNA
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Sbjct 582 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 533
>ref|XM_003831673.2| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 542 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 493
>ref|XM_008957031.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 540 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 491
>ref|XM_008957030.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 433 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 384
>ref|XM_008957029.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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gene, encodes complete protein
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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>ref|XM_005561339.1| PREDICTED: Macaca fascicularis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 846 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 797
>ref|XM_003831676.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 606 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 557
>ref|XM_002824773.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 606 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 557
>ref|XM_002824774.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 605 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 556
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variant X2, mRNA
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7, non-coding RNA
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6, non-coding RNA
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4, mRNA
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3, mRNA
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2, mRNA
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1, mRNA
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clone: HP05226-RBdS105G21
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Sbjct 606 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 557
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clone: HP05226-RBdS104I06
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>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
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miscRNA
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Sbjct 365 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 316
>ref|NM_001177645.1| Macaca mulatta orthodenticle homeobox 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 322 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 273
>dbj|AB528450.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB7603, Homo sapiens OTX2
gene for orthodenticle homeobox protein 2, without stop codon,
in Flexi system
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Sbjct 331 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 282
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
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Sbjct 13160 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 13111
>dbj|AK314271.1| Homo sapiens cDNA, FLJ95024, Homo sapiens orthodenticle homolog
2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 638 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 589
>gb|EU176492.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011617; FLH263901.01L;
RZPDo839A02246D orthodenticle homeobox 2 (OTX2) gene,
encodes complete protein
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Sbjct 344 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 295
>gb|DQ890875.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003505; FLH166702.01X; RZPDo839C0488D
orthodenticle homolog 2 (Drosophila) (OTX2) gene,
encodes complete protein
Length=934
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Sbjct 344 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 295
>gb|AF298117.1|AF298117 Homo sapiens homeobox protein OTX2 gene, complete cds
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Sbjct 4576 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 4527
>gb|BC032579.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:45000
IMAGE:5493541), complete cds
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Sbjct 607 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 558
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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Sbjct 160494 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 160445
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
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>gb|AF093138.1|AF093138 Homo sapiens homeodomain protein OTX2 (OTX2) mRNA, complete cds
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>ref|XM_004087142.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
mRNA
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>ref|XM_010588656.1| PREDICTED: Loxodonta africana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 584 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 535
>ref|XM_003408666.2| PREDICTED: Loxodonta africana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 732 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 683
>ref|XM_003408667.2| PREDICTED: Loxodonta africana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 608 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 559
>ref|XM_006864613.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 579 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 530
>ref|XM_006864612.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 603 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 554
>ref|XM_006144860.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 636 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 587
>ref|XM_006144859.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 492 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 443
>ref|XM_006144858.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 566 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 517
>ref|XM_006144857.1| PREDICTED: Tupaia chinensis orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 660 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 611
>ref|XM_005659993.1| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 599 GTTGTTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 550
>ref|XM_003353491.2| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 511 GTTGTTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 462
>ref|XM_005659992.1| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 623 GTTGTTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 574
>ref|XM_003121824.3| PREDICTED: Sus scrofa orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2147
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 560 GTTGTTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 511
>ref|XM_008839528.1| PREDICTED: Nannospalax galili orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
mRNA
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Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 702 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 658
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transcript variant X6, mRNA
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 466 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCACACC 417
>ref|XM_010641424.1| PREDICTED: Fukomys damarensis orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X5, mRNA
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 472 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCACACC 423
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transcript variant X4, mRNA
Length=2192
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 604 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCACACC 555
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 603 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCACACC 554
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transcript variant X2, mRNA
Length=2432
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Query 1 GTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 844 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCACACC 795
>ref|XM_010641420.1| PREDICTED: Fukomys damarensis orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2166
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Sbjct 730 GTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 681
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Sbjct 298 GTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 249
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misc_RNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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transcript variant 4, mRNA
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transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 603 GTTGCTGCTGTTGTTGGCGACACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 554
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transcript variant 1, mRNA
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transcript variant 4 (OTX2), mRNA
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Sbjct 581 GTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 532
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transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 519 GTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 470
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transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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Sbjct 605 GTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 556
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Sbjct 256 GTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 207
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cds
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Sbjct 4039 GTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 3990
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Sbjct 298 GTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 249
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2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 730 TGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 683
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 639 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 595
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 317 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 273
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 293 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 249
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 317 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 273
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variant X3, mRNA
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Sbjct 293 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 249
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variant X2, mRNA
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Sbjct 317 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 273
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variant X6, mRNA
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Sbjct 2864 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 2820
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variant X5, mRNA
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Sbjct 797 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 753
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variant X4, mRNA
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variant X3, mRNA
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Sbjct 593 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 549
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variant X2, mRNA
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Sbjct 2896 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 2852
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variant X1, mRNA
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Sbjct 829 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 785
>ref|NM_001286483.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Otx2), transcript variant
4, mRNA
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Sbjct 543 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 499
>ref|NM_001286482.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Otx2), transcript variant
2, mRNA
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Sbjct 703 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 659
>ref|NM_144841.4| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Otx2), transcript variant
3, mRNA
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Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 625 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 581
>ref|NM_001286481.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Otx2), transcript variant
1, mRNA
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Sbjct 727 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 683
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 586 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGGTTCTTAAACCATACC 542
>ref|XM_005355353.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 614 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGGTTCTTAAACCATACC 570
>ref|XM_005355352.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 537 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGGTTCTTAAACCATACC 493
>ref|XM_005355351.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X1, mRNA
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Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 610 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGGTTCTTAAACCATACC 566
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transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 584 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGGTTCTTAAACCATACC 540
>ref|XM_005085741.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X4, mRNA
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Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 749 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGGTTCTTAAACCATACC 705
>ref|XM_005085740.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2110
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Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 537 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGGTTCTTAAACCATACC 493
>ref|XM_005085739.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X2, mRNA
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Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 505 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGGTTCTTAAACCATACC 461
>ref|XM_005085738.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2183
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Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 608 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGGTTCTTAAACCATACC 564
>ref|XM_003930496.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
Length=2207
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Query 3 TGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 604 TGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 557
>ref|XM_003930495.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X5, mRNA
Length=2206
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Query 3 TGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 603 TGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 556
>ref|XM_003930494.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
Length=2183
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 TGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 533
>ref|XM_003930493.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
Length=2106
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 3 TGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503 TGTTGTTGTTGCTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 456
>gb|JN960686.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Otx2:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=38386
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
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Sbjct 25080 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 25036
>gb|BC029667.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA
clone MGC:38894 IMAGE:5362013), complete cds
Length=1701
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 545
>gb|BC027104.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA
clone MGC:38809 IMAGE:5359966), complete cds
Length=1697
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 541
>gb|AC166574.1| Mus musculus BAC clone RP23-131O4 from chromosome 14, complete
sequence
Length=220918
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Strand=Plus/Plus
Query 6 TGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 50
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26980 TGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC 27024
>dbj|AK087527.1| Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:E130311M15 product:HOMEOBOX PROTEIN OTX2
homolog [Mus musculus], full insert sequence
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full insert sequence
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Sbjct 583 GTTGCTGCTGCTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCACACC 534
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variant X4, mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X5, mRNA
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variant X2, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 258 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 307
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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mRNA
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mRNA
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Sbjct 286 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 335
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mRNA
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Sbjct 263 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 312
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mRNA
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Sbjct 186 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 235
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2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 263 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 312
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2 (OTX2), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 286 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 335
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2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 263 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 312
>ref|XM_003930493.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis orthodenticle homeobox
2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 186 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 235
>ref|XM_003831676.1| PREDICTED: Pan paniscus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 263 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 312
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variant X1, mRNA
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 263 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 312
>ref|XM_002824774.2| PREDICTED: Pongo abelii orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X5, mRNA
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 286 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 335
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variant X2, mRNA
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Sbjct 186 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 235
>ref|NR_073036.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
7, non-coding RNA
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Sbjct 186 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 235
>ref|NR_073034.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
6, non-coding RNA
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 263 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 312
>ref|NM_001270525.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
5, mRNA
Length=2142
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Sbjct 186 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 235
>ref|NM_001270524.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
4, mRNA
Length=2348
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 416 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 465
>ref|NM_001270523.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
3, mRNA
Length=2195
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 263 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 312
>ref|NM_172337.2| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
2, mRNA
Length=2118
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 186 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 235
>ref|NM_021728.3| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript variant
1, mRNA
Length=2219
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 312
>dbj|AB593058.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBdS105G21
Length=2204
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 312
>dbj|AB593056.1| Homo sapiens OTX2 mRNA for homeobox protein OTX2, complete cds,
clone: HP05226-RBb05D05
Length=1954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 238
>ref|NG_008204.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2 (OTX2), RefSeqGene on chromosome
14
Length=16760
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9989 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 10038
>dbj|AK314271.1| Homo sapiens cDNA, FLJ95024, Homo sapiens orthodenticle homolog
2 (Drosophila) (OTX2),transcript variant 2, mRNA
Length=1210
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 368
>gb|AF298117.1|AF298117 Homo sapiens homeobox protein OTX2 gene, complete cds
Length=10728
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 1454
>gb|BC032579.1| Homo sapiens orthodenticle homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:45000
IMAGE:5493541), complete cds
Length=2220
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 313
>emb|AL162831.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1077A2 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=208102
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157323 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 157372
>emb|AL161757.4| Human chromosome 14 DNA sequence BAC R-1085N6 of library RPCI-11
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete sequence
Length=242832
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60099 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 60148
>ref|XM_010588656.1| PREDICTED: Loxodonta africana orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X3, mRNA
Length=2187
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 265 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 314
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transcript variant X3, mRNA
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X4, mRNA
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 182 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 231
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 178 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 227
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homeobox 2 (OTX2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 251 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 300
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Sbjct 374 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 423
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 260 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 309
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 260 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 309
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Sbjct 181 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 230
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Sbjct 181 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 230
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Sbjct 185 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 234
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 185 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 234
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Sbjct 317 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 366
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 149 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 198
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Sbjct 223 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 272
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 317 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 366
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Sbjct 174 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 223
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Sbjct 258 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 307
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 411 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 460
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variant X2, mRNA
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 174 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 223
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variant X1, mRNA
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variant X5, mRNA
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Sbjct 174 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 223
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variant X4, mRNA
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Sbjct 258 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 307
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 268 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 317
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 251 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 300
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 268 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 317
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 272 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 321
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transcript variant X3, mRNA
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>ref|XM_005355352.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
transcript variant X2, mRNA
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>ref|XM_005355351.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster orthodenticle homeobox 2 (Otx2),
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Sbjct 272 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 321
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variant X2, mRNA
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Sbjct 316 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 365
>ref|XM_005211839.1| PREDICTED: Bos taurus orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 317 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 366
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 264 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 313
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 408 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 457
>ref|XM_004681843.1| PREDICTED: Condylura cristata orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 264 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 313
>ref|XM_004698607.1| PREDICTED: Echinops telfairi orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 179 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 228
>ref|XM_004698606.1| PREDICTED: Echinops telfairi orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 179 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 228
>ref|XM_004624819.1| PREDICTED: Octodon degus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 280 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 329
>ref|XM_004624818.1| PREDICTED: Octodon degus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 176 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 225
>ref|XM_004649216.1| PREDICTED: Jaculus jaculus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 323 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 372
>ref|XM_004649215.1| PREDICTED: Jaculus jaculus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 183 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 232
>ref|XM_004404903.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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Sbjct 261 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 310
>ref|XM_004404902.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Sbjct 408 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 457
>ref|XM_004404901.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens orthodenticle homeobox
2, transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 261 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 310
>ref|XM_004314868.1| PREDICTED: Tursiops truncatus orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 3 (OTX2), mRNA
Length=2104
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 184 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 233
>ref|XM_004314867.1| PREDICTED: Tursiops truncatus orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 313
>ref|XM_004314866.1| PREDICTED: Tursiops truncatus orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 1 (OTX2), mRNA
Length=2208
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 313
>ref|XM_004279317.1| PREDICTED: Orcinus orca orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 3 (OTX2), mRNA
Length=2184
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 313
>ref|XM_004279316.1| PREDICTED: Orcinus orca orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 2 (OTX2), mRNA
Length=2104
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 233
>ref|XM_004279315.1| PREDICTED: Orcinus orca orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 1 (OTX2), mRNA
Length=2208
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 313
>ref|XM_004020412.1| PREDICTED: Ovis aries homeobox protein OTX2-like (LOC101106129),
mRNA
Length=2104
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 179 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACTGCCTT 228
>gb|JN581044.1| Ovis aries breed Texel homeobox protein OTX2 (OTX2) gene, complete
cds
Length=4777
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 970 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 1019
>ref|XR_092259.1| PREDICTED: Macaca mulatta homeobox protein OTX2-like (LOC100428479),
miscRNA
Length=1967
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
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2 (Otx2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 397 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 446
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mRNA
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variant X5, mRNA
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variant X4, mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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2, mRNA
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3, mRNA
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1, mRNA
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2 (Otx2), transcript variant X4, mRNA
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2 (Otx2), transcript variant X3, mRNA
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2 (Otx2), transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X5, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 352 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 401
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mRNA
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Sbjct 352 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 401
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variant X2, mRNA
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Sbjct 173 TGCGCCTCCGAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 222
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variant X1, mRNA
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Sbjct 173 TGCGCCTCCGAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 222
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transcript variant 4, mRNA
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Sbjct 2552 TGCGCCTTCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 2601
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transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 333 TGCGCCTTCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 382
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transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 260 TGCGCCTTCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 309
>ref|XM_004452977.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 2552 TGCGCCTTCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 2601
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transcript variant 4 (OTX2), mRNA
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Sbjct 268 TCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 311
>ref|XM_004426188.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 3 (OTX2), mRNA
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Sbjct 182 TCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 225
>ref|XM_004426187.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 2 (OTX2), mRNA
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Query 7 TCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 182 TCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 225
>ref|XM_004426186.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum orthodenticle homeobox 2,
transcript variant 1 (OTX2), mRNA
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Query 7 TCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 268 TCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 311
>gb|JN960686.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Otx2:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=38386
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Sbjct 14747 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 14796
>ref|NM_001100566.1| Rattus norvegicus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), mRNA
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Sbjct 424 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 473
>gb|BC029667.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA
clone MGC:38894 IMAGE:5362013), complete cds
Length=1701
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Sbjct 251 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 300
>gb|BC027104.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA
clone MGC:38809 IMAGE:5359966), complete cds
Length=1697
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 247 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 296
>gb|AC166574.1| Mus musculus BAC clone RP23-131O4 from chromosome 14, complete
sequence
Length=220918
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Sbjct 30259 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 30210
>dbj|AK087527.1| Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:E130311M15 product:HOMEOBOX PROTEIN OTX2
homolog [Mus musculus], full insert sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 227 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 276
>dbj|AK081535.1| Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:C130035B17 product:HOMEOBOX PROTEIN OTX2
homolog [Mus musculus], full insert sequence
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 230 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 279
>dbj|AK053741.1| Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:E130306E05 product:HOMEOBOX PROTEIN OTX2,
full insert sequence
Length=2144
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 226 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 275
>gb|BC017609.1| Mus musculus orthodenticle homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA
clone MGC:27657 IMAGE:4527414), complete cds
Length=1737
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 311 TGCGCCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTAAAGCAACCGCCTT 360
>ref|XM_006920150.1| PREDICTED: Pteropus alecto orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X3, mRNA
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Query 7 TCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 266 TCCTAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 309
>ref|XM_006920149.1| PREDICTED: Pteropus alecto orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X2, mRNA
Length=2322
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Query 7 TCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 419 TCCTAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 462
>ref|XM_006920148.1| PREDICTED: Pteropus alecto orthodenticle homeobox 2 (OTX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=2193
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 TCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 TCCTAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 309
>ref|XM_004584849.1| PREDICTED: Ochotona princeps orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=2099
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 183 TGCGCCGCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTCAAGCAACCGCCTT 232
>ref|XM_004584848.1| PREDICTED: Ochotona princeps orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2123
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 183 TGCGCCGCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTCAAGCAACCGCCTT 232
>ref|XM_003794403.1| PREDICTED: Otolemur garnettii orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 2 (OTX2), mRNA
Length=2308
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 388 TGCGCCTACAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTCAAGCAACCGCCTT 437
>ref|XM_003794402.1| PREDICTED: Otolemur garnettii orthodenticle homeobox 2, transcript
variant 1 (OTX2), mRNA
Length=2103
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCACCTCCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 183 TGCGCCTACAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTCAAGCAACCGCCTT 232
>ref|XM_008269706.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X2, mRNA
Length=1984
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 8 CCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 109 CCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTCAAGCAACCGCCTT 151
>ref|XM_002718264.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus orthodenticle homeobox 2 (OTX2),
transcript variant X1, mRNA
Length=2143
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Query 8 CCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTTAAGCAACCGCCTT 50
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Sbjct 268 CCAAACAACCTTAGCATGATGTCTTATCTCAAGCAACCGCCTT 310
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14 14 57268830 57268930 100M CAAGGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTG
14 14 57268833 57268933 100M GGGATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGTGGAGGGAAT
14 14 57268836 57268936 100M ATCTGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGGGGGAATTGG
14 14 57268839 57268939 100M TGACAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCA
14 14 57268842 57268942 100M CAGTGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTT
14 14 57268845 57268945 100M CGGGGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTT
14 14 57268848 57268948 100M GGAGATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCA
14 14 57268851 57268951 100M GATGGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTC
14 14 57268854 57268954 100M GGAAGCTGGGCTCCAGATAGACACAGCAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCCCT
14 14 57268857 57268957 100M AGCTGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGATTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAA
14 14 57268860 57268960 100M TGGGCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTC
14 14 57268863 57268963 100M GCTCCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACT
14 14 57268866 57268966 100M CCAGATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCCGAACTCACTTCC
14 14 57268869 57268969 100M GATAGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGA
14 14 57268872 57268972 100M AGACACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCT
14 14 57268875 57268975 100M CACAGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTTCACTCTCTGAACTCACTTCCAGAGCTGGA
14 14 57268878 57268978 100M AGGAGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGGGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGAT
14 14 57268881 57268981 100M AGCACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTC
14 14 57268884 57268984 100M ACTGCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTC
14 14 57268887 57268987 100M GCTGCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTT
14 14 57268890 57268990 100M GCTGGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTG
14 14 57268893 57268993 100M GGCAATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCA
14 14 57268896 57268996 100M AATGGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGT
14 14 57268899 57268999 100M GGTCGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTC
14 14 57268902 57269002 100M CGGGACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACT
14 14 57268905 57269005 100M GACTGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGGCTCACTTTG
14 14 57268908 57269008 100M TGAGGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTT
14 14 57268911 57269011 100M GGTGCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGA
14 14 57268914 57269014 100M GCTAGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCT
14 14 57268917 57269017 100M AGAGGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCA
14 14 57268920 57269020 100M GGGGGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTC
14 14 57268923 57269023 100M GGGAGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGC
14 14 57268926 57269026 100M AGTGAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGT
14 14 57268929 57269029 100M GAATTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGT
14 14 57268932 57269032 100M TTGGCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGC
14 14 57268935 57269035 100M GCCACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCATGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGT
14 14 57268938 57269038 100M ACTTGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGT
14 14 57268941 57269041 100M TGTTCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGG
14 14 57268944 57269044 100M TCCACTCTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGG
14 14 57268947 57269047 100M ACTCTCGGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCAC
14 14 57268950 57269050 100M CTCTGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTA
14 14 57268953 57269053 100M TGAACTCACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCT
14 14 57268956 57269056 100M ACTCACTTCCCGAGCTGGTGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTT
14 14 57268959 57269059 100M CACTTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGA
14 14 57268962 57269062 100M TTCCCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTC
14 14 57268965 57269065 100M CCGAGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTA
14 14 57268968 57269068 100M AGCTGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAAC
14 14 57268971 57269071 100M TGGAGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCAT
14 14 57268974 57269074 100M AGATGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC
14 14 57268977 57269077 100M TGTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACCTGC
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCCCTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCCCTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCTATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m CTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTATTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m TTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCGTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATCCC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
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14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
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14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
14 14 57268978 57272191 96M57272196F4m GTCTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCA
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14 14 57268980 57272189 94M57272196F6m CTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCACC
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14 14 57268980 57272189 94M57272196F6m CTTCTTTTTGGCAGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCACC
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14 14 57268992 57272177 82M57272196F18m AGGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCACCTCCAAACAACCT
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14 14 57268993 57272176 81M57272196F19m GGTCTCACTTTGTTTTGACCTCCATTCTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGGCGGCACTTAGCTCTTCGATTCTTAAACCATACC TGCACCTCCAAACAACCTT
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188183, whole genome shotgun sequence
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>ref|AC_000146.1| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 57773743 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 57773792
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Lambda K H
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right flanking sequence - CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG
>ref|NC_000014.9| Homo sapiens chromosome 14, GRCh38 Primary Assembly
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>ref|NT_026437.13| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR14_CTG1
gb|GL000116.2| Homo sapiens chromosome 14 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
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Sbjct 58918222 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 58918173
>ref|NC_018925.2| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001622.2| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
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>ref|NW_004929393.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150177.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold chr14_scaf, whole
genome shotgun sequence
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Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
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Sbjct 58546498 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 58546449
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 3393989 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 3394038
>gb|CM000504.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 57775544 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 57775495
>gb|DS990675.1| Homo sapiens SCAF_1112675837128 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 18132283 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 18132332
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Sbjct 25520715 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 25520764
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Sbjct 57528129 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 57528080
>gb|CH471061.1| Homo sapiens 211000035836695 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=53999513
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Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
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Sbjct 24401214 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 24401165
>ref|NW_001838113.2| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188183, whole genome shotgun sequence
gb|DS486037.1| Homo sapiens SCAF_1103279188183 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 18132744 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 18132793
>ref|AC_000146.1| Homo sapiens chromosome 14, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
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Sbjct 57775798 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 57775749
>gb|CM000265.1| Homo sapiens chromosome 14, whole genome shotgun sequence
Length=87316725
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Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
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Sbjct 57646684 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 57646635
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC
>ref|XM_010382708.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
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Sbjct 252 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 203
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(ZDHHC22), transcript variant X10, misc_RNA
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 692 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 643
>ref|XR_649940.1| PREDICTED: Papio anubis zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X9, misc_RNA
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 692 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 643
>ref|XR_649939.1| PREDICTED: Papio anubis zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X8, misc_RNA
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 692 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 643
>ref|XR_649938.1| PREDICTED: Papio anubis zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X7, misc_RNA
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 692 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 643
>ref|XR_649937.1| PREDICTED: Papio anubis zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X6, misc_RNA
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 692 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 643
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(ZDHHC22), transcript variant X5, misc_RNA
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 692 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 643
>ref|XM_009212018.1| PREDICTED: Papio anubis zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X4, mRNA
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 443 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 394
>ref|XM_009212017.1| PREDICTED: Papio anubis zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 205 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 156
>ref|XM_009212016.1| PREDICTED: Papio anubis zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 603 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 554
>ref|XM_003902097.2| PREDICTED: Papio anubis zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
Length=3846
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 692 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 643
>ref|XM_007987387.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X3, mRNA
Length=2268
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 483 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 434
>ref|XM_007987386.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
Length=1849
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 64 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 15
>ref|XM_007987385.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 249 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 200
>ref|XM_006720120.1| PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 252 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 203
>ref|XM_006720119.1| PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 265 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 216
>ref|XM_005561875.1| PREDICTED: Macaca fascicularis zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 289 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 240
>ref|XM_005561874.1| PREDICTED: Macaca fascicularis zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 680 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 631
>ref|XM_003260795.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
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Sbjct 315 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 266
>ref|XM_004055507.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
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Sbjct 315 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 266
>ref|XM_002808465.1| PREDICTED: Macaca mulatta putative palmitoyltransferase ZDHHC22-like
(LOC706468), mRNA
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Sbjct 628 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 579
>dbj|AK294840.1| Homo sapiens cDNA FLJ56872 complete cds, highly similar to Rattus
norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22),
mRNA
Length=1368
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Sbjct 251 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 202
>ref|NM_174976.2| Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22 (ZDHHC22),
mRNA
Length=3408
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Sbjct 252 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 203
>gb|BC117676.2| Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22, mRNA (cDNA
clone MGC:134868 IMAGE:40069732), complete cds
Length=2307
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Sbjct 77 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 28
>dbj|AK095612.1| Homo sapiens cDNA FLJ38293 fis, clone FCBBF3009526
Length=3097
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Sbjct 252 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 203
>gb|AC007375.6|AC007375 Homo sapiens chromosome 14 clone RP11-463C8 containing POMT2
gene, partial cds; and unknown genes, complete sequence
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 22487 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 22536
>gb|KJ895966.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05360 ZDHHC22
gene, encodes complete protein
Length=924
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
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Sbjct 117 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 69
>ref|XM_009428193.1| PREDICTED: Pan troglodytes zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 260 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 211
>ref|XM_001163688.2| PREDICTED: Pan troglodytes zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
Length=3809
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 662 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 613
>ref|XM_008960969.1| PREDICTED: Pan paniscus zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X4, mRNA
Length=3881
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 661 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 612
>ref|XM_008960968.1| PREDICTED: Pan paniscus zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 115 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 66
>ref|XM_008960967.1| PREDICTED: Pan paniscus zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
Length=3583
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 443 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 394
>ref|XM_003808862.2| PREDICTED: Pan paniscus zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
Length=3799
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 659 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 610
>ref|XM_002807253.3| PREDICTED: Callithrix jacchus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=3461
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 282 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAAGGCCAGCATC 233
>ref|XM_008840035.1| PREDICTED: Nannospalax galili zinc finger, DHHC-type containing
22 (Zdhhc22), transcript variant X2, mRNA
Length=3435
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 345 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 296
>ref|XM_008840027.1| PREDICTED: Nannospalax galili zinc finger, DHHC-type containing
22 (Zdhhc22), transcript variant X1, mRNA
Length=3503
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 347 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 298
>ref|XM_008271996.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
Length=4106
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 245 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 196
>ref|XM_008271995.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
Length=4561
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 696 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 647
>ref|XM_006157075.1| PREDICTED: Tupaia chinensis zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=968
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 60 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 11
>ref|XM_004610227.1| PREDICTED: Sorex araneus zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), mRNA
Length=792
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 64 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 15
>ref|XM_004453562.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1181
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 345 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGGAGCCGCAGGGCCAGCATC 296
>ref|XM_009249350.1| PREDICTED: Pongo abelii zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), mRNA
Length=3176
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
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Sbjct 49 ACAAGAAGTAGGCGGGAGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 1
>ref|XM_005343391.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster zinc finger, DHHC-type containing
22 (Zdhhc22), mRNA
Length=2220
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Query 5 GAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 409 GAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 364
>ref|XM_005084002.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus zinc finger, DHHC-type containing
22 (Zdhhc22), mRNA
Length=995
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 GAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 248 GAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 203
>ref|XM_008590374.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
Length=7311
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 AAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 87 AAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 43
>ref|XM_008590370.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
Length=7371
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 AAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 147 AAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 103
>ref|XM_007632473.1| PREDICTED: Cricetulus griseus zinc finger, DHHC-type containing
22 (Zdhhc22), transcript variant X2, mRNA
Length=807
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 5 GAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
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Sbjct 45 GAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 1
>ref|XM_006990308.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii zinc finger, DHHC-type
containing 22 (Zdhhc22), mRNA
Length=792
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 5 GAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
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Sbjct 45 GAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 1
>ref|XM_003499666.1| PREDICTED: Cricetulus griseus zinc finger, DHHC-type containing
22 (Zdhhc22), transcript variant X1, mRNA
Length=792
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 GAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
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Sbjct 45 GAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 1
>ref|XM_008536424.1| PREDICTED: Equus przewalskii zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X3, mRNA
Length=3333
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 139 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 90
>ref|XM_008536419.1| PREDICTED: Equus przewalskii zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
Length=3617
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 423 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 374
>ref|XM_008536414.1| PREDICTED: Equus przewalskii zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
Length=3718
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 524 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 475
>ref|XM_007459765.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1365
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 252 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 203
>ref|XM_007184521.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni zinc finger, DHHC-type
containing 22 (ZDHHC22), mRNA
Length=2976
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 161 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 112
>ref|XM_006052875.1| PREDICTED: Bubalus bubalis zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X3, mRNA
Length=3290
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 177 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 128
>ref|XM_006052874.1| PREDICTED: Bubalus bubalis zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
Length=3391
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
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Sbjct 278 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 229
>ref|XM_006052873.1| PREDICTED: Bubalus bubalis zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
Length=3230
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 117 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 68
>ref|XM_007095022.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1423
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 50 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 1
>ref|XM_003987861.2| PREDICTED: Felis catus zinc finger, DHHC-type containing 22 (ZDHHC22),
mRNA
Length=1424
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 50 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 1
>ref|XM_006750569.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1355
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 253 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 204
>ref|XM_005686151.1| PREDICTED: Capra hircus zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), mRNA
Length=2285
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 64 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 15
>ref|XM_005623698.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
Length=3696
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 306 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 257
>ref|XM_003435090.3| PREDICTED: Canis lupus familiaris zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
Length=3734
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 344 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 295
>ref|XM_001493302.2| PREDICTED: Equus caballus zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
Length=3278
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 97 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 48
>ref|XM_005605369.1| PREDICTED: Equus caballus zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
Length=3320
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 139 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 90
>ref|XM_003472444.2| PREDICTED: Cavia porcellus zinc finger, DHHC-type containing
22 (Zdhhc22), mRNA
Length=1854
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 326 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 277
>ref|XM_004624728.1| PREDICTED: Octodon degus zinc finger, DHHC-type containing 22
(Zdhhc22), mRNA
Length=1149
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 247 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 198
>ref|XM_004426394.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1851
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 252 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 203
>ref|XM_004399325.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens zinc finger, DHHC-type
containing 22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1355
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 253 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 204
>ref|XM_002914715.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca putative palmitoyltransferase
ZDHHC22-like (LOC100477700), mRNA
Length=925
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 182 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 133
>ref|XM_008699331.1| PREDICTED: Ursus maritimus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1017
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 49 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCAT 1
>ref|XM_007106979.1| PREDICTED: Physeter catodon zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=792
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 49 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCAT 1
>ref|XM_005967572.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=2596
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 49 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCAT 1
>ref|XM_005899951.1| PREDICTED: Bos mutus zinc finger, DHHC-type containing 22 (ZDHHC22),
mRNA
Length=2092
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 49 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCAT 1
>ref|XM_004584376.1| PREDICTED: Ochotona princeps zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=792
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 49 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGAAGGGCCAGCAT 1
>ref|XM_004010808.1| PREDICTED: Ovis aries zinc finger, DHHC-type containing 22 (ZDHHC22),
mRNA
Length=786
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 49 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCAT 1
>ref|NM_001039325.1| Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22),
mRNA
gb|AY886537.1| Rattus norvegicus membrane-associated DHHC22 zinc finger protein
mRNA, complete cds
Length=1119
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 1/49 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 AAG-AAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 222 AAGAAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAAGGCCAGCATC 174
>ref|XM_008138796.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1357
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 252 ACAGGAAATAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 203
>ref|XM_006925475.1| PREDICTED: Pteropus alecto zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1341
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 252 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGTCTCAGGGCCAGCATC 203
>ref|XM_006184449.1| PREDICTED: Camelus ferus zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), mRNA
Length=1168
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 66 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCGAGCATC 17
>ref|XM_006086946.1| PREDICTED: Myotis lucifugus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1569
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 462 ACAGGAAATAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 413
>ref|XM_005860173.1| PREDICTED: Myotis brandtii zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=2186
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 195 ACAGGAAATAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCCAGCATC 146
>ref|XM_004319234.1| PREDICTED: Tursiops truncatus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1179
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 66 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTGAGGGCCAGCATC 17
>ref|XM_004262274.1| PREDICTED: Orcinus orca zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), mRNA
Length=1365
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 252 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTGAGGGCCAGCATC 203
>ref|XM_003786935.1| PREDICTED: Otolemur garnettii zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1068
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 252 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAACCTCAGGGCCAGCATC 203
>ref|XM_006206104.1| PREDICTED: Vicugna pacos zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), mRNA
Length=1436
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCAT 49
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 49 ACAGGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCTCAGGGCGAGCAT 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG
>ref|XM_006720120.1| PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
Length=880
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 96
>dbj|AK294840.1| Homo sapiens cDNA FLJ56872 complete cds, highly similar to Rattus
norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22),
mRNA
Length=1368
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 95
>ref|NM_174976.2| Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22 (ZDHHC22),
mRNA
Length=3408
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 96
>dbj|AK125200.1| Homo sapiens cDNA FLJ43210 fis, clone FEBRA2020582
Length=2315
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 1015
>dbj|AK095612.1| Homo sapiens cDNA FLJ38293 fis, clone FCBBF3009526
Length=3097
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 96
>gb|AC007375.6|AC007375 Homo sapiens chromosome 14 clone RP11-463C8 containing POMT2
gene, partial cds; and unknown genes, complete sequence
Length=180331
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24542 CTCCTCCCCACATCCCCGCTACTTGCCCAGTTCCCGAAGCGAAGCGCAGG 24493
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
14 14 77605841 77605941 100M CTGGCAGGCCCCCAGGTCGTCTGGGGAGTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGG
14 14 77605844 77605944 100M GCAGGCCCCCAGGTCGTCTGGGGAGTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCG
14 14 77605847 77605947 100M GGCCCCCAGGTCGTCTGGGGAGTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGC
14 14 77605850 77605950 100M CCCCAGGTCGTCTGGGGAGTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAG
14 14 77605853 77605953 100M CAGGTCGTCTGGGGAGTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAG
14 14 77605856 77605956 100M GTCGTCTGGGGAGTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGC
14 14 77605859 77605959 100M GTCTGGGGAGTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGG
14 14 77605862 77605962 100M TGGGGAGTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCG
14 14 77605865 77605965 100M GGGGTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCC
14 14 77605868 77605968 100M GTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCG
14 14 77605871 77605971 100M CTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGG
14 14 77605874 77605974 100M GATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGTCAGGCGGCCGCGGGGTCC
14 14 77605877 77605977 100M GACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCG
14 14 77605880 77605980 100M AAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGC
14 14 77605883 77605983 100M GACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATG
14 14 77605886 77605986 100M GTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGCTG
14 14 77605889 77605989 100M ATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGCTGGGC
14 14 77605892 77605992 100M GCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAACAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGCTGGGCAGG
14 14 77605895 77605995 100M CAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGCTGGGCAGGAAG
14 14 77605898 77605998 100M GGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTGGCGCATGCTGGGCAGGAAGAGG
14 14 77605901 77606001 100M GTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGCTGGGCAGGAAGAGGAAG
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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>ref|NW_001838113.2| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188183, whole genome shotgun sequence
gb|DS486037.1| Homo sapiens SCAF_1103279188183 genomic scaffold, whole genome
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shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
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(ZDHHC22), transcript variant X3, mRNA
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>ref|XM_009212016.1| PREDICTED: Papio anubis zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
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(ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 679 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 630
>ref|XM_008590374.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
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22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
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>ref|XM_007987387.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 470 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 421
>ref|XM_007987386.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 51 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 2
>ref|XM_007987385.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 236 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 187
>ref|XM_006720120.1| PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
Length=880
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 239 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 190
>ref|XM_006720119.1| PREDICTED: Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
Length=3421
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 252 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 203
>ref|XM_005561875.1| PREDICTED: Macaca fascicularis zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 276 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 227
>ref|XM_005561874.1| PREDICTED: Macaca fascicularis zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 667 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 618
>ref|XM_003260795.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
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Sbjct 302 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 253
>ref|XM_004055507.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
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Sbjct 302 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 253
>dbj|AK294840.1| Homo sapiens cDNA FLJ56872 complete cds, highly similar to Rattus
norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22),
mRNA
Length=1368
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 238 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 189
>ref|NM_174976.2| Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22 (ZDHHC22),
mRNA
Length=3408
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 239 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 190
>gb|BC117676.2| Homo sapiens zinc finger, DHHC-type containing 22, mRNA (cDNA
clone MGC:134868 IMAGE:40069732), complete cds
Length=2307
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 50
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Sbjct 64 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 15
>dbj|AK095612.1| Homo sapiens cDNA FLJ38293 fis, clone FCBBF3009526
Length=3097
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 50
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Sbjct 239 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 190
>gb|AC007375.6|AC007375 Homo sapiens chromosome 14 clone RP11-463C8 containing POMT2
gene, partial cds; and unknown genes, complete sequence
Length=180331
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 50
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Sbjct 22500 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 22549
>ref|XM_003924586.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis zinc finger, DHHC-type
containing 22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1490
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 50
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Sbjct 236 GGGGGCCACGACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 187
>ref|XM_008840035.1| PREDICTED: Nannospalax galili zinc finger, DHHC-type containing
22 (Zdhhc22), transcript variant X2, mRNA
Length=3435
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 50
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Sbjct 332 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTGGATTACATTC 283
>ref|XM_008840027.1| PREDICTED: Nannospalax galili zinc finger, DHHC-type containing
22 (Zdhhc22), transcript variant X1, mRNA
Length=3503
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 50
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Sbjct 334 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTGGATTACATTC 285
>ref|XM_008054014.1| PREDICTED: Tarsius syrichta zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=906
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 50
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Sbjct 51 GGGGGCCACCACGTTAAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 2
>ref|XM_006157075.1| PREDICTED: Tupaia chinensis zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=968
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Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACA 47
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Sbjct 47 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACA 1
>ref|XM_004610227.1| PREDICTED: Sorex araneus zinc finger, DHHC-type containing 22
(ZDHHC22), mRNA
Length=792
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 50
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Sbjct 51 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTGGATTACATTC 2
>ref|XM_004453562.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), mRNA
Length=1181
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 50
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Sbjct 332 GGGGGCCACCACGTTGAGGAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 283
>ref|XM_005084002.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus zinc finger, DHHC-type containing
22 (Zdhhc22), mRNA
Length=995
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 50/52 (96%), Gaps = 2/52 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATC--CTCGATTACATTC 50
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Sbjct 239 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCTCCTCGATTACATTC 188
>ref|XM_008271996.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X2, mRNA
Length=4106
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 50
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Sbjct 232 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTTGCTTACATTC 183
>ref|XM_008271995.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus zinc finger, DHHC-type containing
22 (ZDHHC22), transcript variant X1, mRNA
Length=4561
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC 50
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Sbjct 683 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTTGCTTACATTC 634
>ref|XM_005343391.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster zinc finger, DHHC-type containing
22 (Zdhhc22), mRNA
Length=2220
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTC 40
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Sbjct 400 GGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTC 361
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTCCAAAGAGCCTTGGGTAACCTGGTGAGGTCCCTGAGTGCTGCCCAAGA
reads
14 14 77605854 77605954 100M AGGTCGTCTGGGGAGTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCAAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGA
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14 14 77605863 77605963 100M GGGGAGTTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGG
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14 14 77605869 77605969 100M TTCTGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGG
14 14 77605872 77605972 100M TGGATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGT
14 14 77605875 77605975 100M ATGACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGGCCT
14 14 77605878 77605978 100M ACAAGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGC
14 14 77605881 77605981 100M AGGACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCA
14 14 77605884 77605984 100M ACGTAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGC
14 14 77605887 77605987 100M TAATTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGCTGG
14 14 77605890 77605990 100M TTGCCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGCTGGGCA
14 14 77605893 77605993 100M CCCAGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGCTGGGCAGGA
14 14 77605896 77605996 100M AGGGCGTTGGCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGCTGGGCAGGAAGA
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14 14 77605905 77606005 100M GCCGAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGCTGGGCAGGAAGAGGAAGAGCT
14 14 77605908 77606008 100M GAGAGGAATAGGAAGAGCGCCCCGTGGAGCAGGGCGGGCGAGAAGAGCCGGGCGGCCGCGGGGTCCTCGCGCATGCTGGGCAGGAAGAGGAAGAGCTGCA
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14 14 77605980 77606080 100M ATGCTGGGCAGGAAGAGGAAGAGCTGCAGCACGAAGGTCACCAGGGAGATGCACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCA
14 14 77605983 77606083 100M CTGGGCAGGAAGAGGAAGAGCTGCAGCACGAAGGTCACCAGGGAGATGCACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCC
14 14 77605986 77606086 100M GGCAGGAAGAGGAAGAGCTGCAGCACGAAGGTCACCAGGGAGATGCACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCG
14 14 77605989 77606089 100M AGGAAGAGGAAGAGCTGCAGCACGAAGGTCACCAGGGAGATGCACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATT
14 14 77605992 77606092 100M AAGAGGAAGAGCTGCAGCACGAAGGTCACCAGGGAGATGCACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACA
14 14 77605995 77606095 100M AGGAAGAGCTGCAGCACGAAGGTCACCAGGGAGATGCACAAGAAGTAGGCGGGGGCCACCACGTTGAGCAGCCGCAGGGCCAGCATCCTCGATTACATTC
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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variant X9, misc_RNA
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variant X7, misc_RNA
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variant X6, misc_RNA
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variant X5, misc_RNA
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non-coding RNA
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non-coding RNA
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non-coding RNA
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mRNA
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Sbjct 1413 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1364
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variant 2 (MOK), mRNA
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Sbjct 1308 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1259
>ref|XM_004055725.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla MOK protein kinase, transcript
variant 1 (MOK), mRNA
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 1413 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1364
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1413 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1364
>ref|NM_001280114.1| Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), mRNA
dbj|AK306740.1| Pan troglodytes mRNA for MAPK/MAK/MRK overlapping kinase, complete
cds, clone: PtsC-10-5_G05
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Sbjct 1177 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1128
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overlapping kinase (EC 2.7.11.22)
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Sbjct 1308 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1259
>dbj|AK312778.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93194, highly similar to Homo sapiens renal
tumor antigen (RAGE), mRNA
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Sbjct 1404 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1355
>gb|BC053536.1| Homo sapiens renal tumor antigen, mRNA (cDNA clone MGC:61453
IMAGE:5175851), complete cds
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Sbjct 2368 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 2319
>dbj|AK131542.1| Homo sapiens cDNA FLJ16778 fis, clone BRHIP3030064, moderately
similar to Homo sapiens renal tumor antigen (RAGE)
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Sbjct 3268 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 3219
>dbj|AK094747.1| Homo sapiens cDNA FLJ37428 fis, clone BRAWH2001662, highly similar
to Homo sapiens mRNA for MOK protein kinase
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Sbjct 2199 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 2150
>dbj|AK094003.1| Homo sapiens cDNA FLJ36684 fis, clone UTERU2007942
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Sbjct 1785 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1736
>gb|BC026069.1| Homo sapiens renal tumor antigen, mRNA (cDNA clone MGC:26281
IMAGE:4838296), complete cds
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Sbjct 1824 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1775
>gb|BC043179.1| Homo sapiens renal tumor antigen, mRNA (cDNA clone MGC:44179
IMAGE:5287879), complete cds
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Sbjct 2169 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 2120
>gb|AY888053.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH163744.01L renal tumor
antigen (RAGE) mRNA, partial cds
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Sbjct 1091 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1042
>emb|AL352978.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC C-3059L23 of library CalTech-D
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete
sequence
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 32063 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 32112
>emb|AL359402.3| Human chromosome 14 DNA sequence BAC C-2273N11 of library CalTech-D
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete
sequence
Length=119296
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 111574 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 111623
>dbj|AB022694.1| Homo sapiens mRNA for MOK protein kinase, complete cds
Length=1954
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 1407 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1358
>gb|U46193.1|HSU46193 Human renal cell carcinoma antigen RAGE-3 mRNA, complete putative
cds
Length=1235
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 693 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 644
>gb|U46192.1|HSU46192 Human renal cell carcinoma antigen RAGE-2 mRNA, complete putative
cds
Length=1168
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 636 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 587
>gb|U46191.1|HSU46191 Human renal cell carcinoma antigen RAGE-1 mRNA, complete putative
cds
Length=1118
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 586 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 537
>ref|XM_003276219.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys MOK protein kinase (RAGE), mRNA
Length=1848
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 1309 TTCTTGCTCGCAGGGACGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 1260
>ref|XM_010353624.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana MOK protein kinase (MOK),
transcript variant X2, mRNA
Length=1850
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 1316 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCGCTTTTCC 1267
>ref|XM_010353623.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana MOK protein kinase (MOK),
transcript variant X1, mRNA
Length=1940
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 1406 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCGCTTTTCC 1357
>ref|XM_009212273.1| PREDICTED: Papio anubis MAPK/MAK/MRK overlapping kinase-like
(LOC101011317), transcript variant X3, mRNA
Length=1243
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 598 TTCTTGGTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCGCTCTTCC 549
>ref|XM_003902291.2| PREDICTED: Papio anubis MAPK/MAK/MRK overlapping kinase-like
(LOC101011317), transcript variant X2, mRNA
Length=1347
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 792 TTCTTGGTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCGCTCTTCC 743
>ref|XM_009212272.1| PREDICTED: Papio anubis MAPK/MAK/MRK overlapping kinase-like
(LOC101011317), transcript variant X1, mRNA
Length=1437
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 792 TTCTTGGTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCGCTCTTCC 743
>ref|XM_005562239.1| PREDICTED: Macaca fascicularis MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X4, mRNA
Length=1877
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 1317 TTCTTGGTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCGCTCTTCC 1268
>ref|XM_005562236.1| PREDICTED: Macaca fascicularis MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X1, mRNA
Length=1967
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 1407 TTCTTGGTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCGCTCTTCC 1358
>ref|XM_001112517.2| PREDICTED: Macaca mulatta renal tumor antigen (RAGE), mRNA
Length=1937
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 1427 TTCTTGGTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCGCTCTTCC 1378
>ref|NM_001285112.1| Macaca fascicularis MOK protein kinase (MOK), mRNA
dbj|AB169545.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QflA-11131, similar to
human renal tumor antigen (RAGE), mRNA, RefSeq: NM_014226.1
Length=1917
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 1360 TTCTTGGTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCGCTCTTCC 1311
>dbj|AB168495.1| Macaca fascicularis testis cDNA clone: QtsA-12550, similar to
human renal tumor antigen (RAGE), mRNA, RefSeq: NM_014226.1
Length=1788
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Query 1 TTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC 50
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Sbjct 1228 TTCTTGGTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCGCTCTTCC 1179
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT
>ref|XM_009428404.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X15, mRNA
Length=1645
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 679 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 728
>ref|XM_009428403.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X14, mRNA
Length=1866
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 900 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 949
>ref|XM_009428402.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X13, mRNA
Length=2043
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 1077 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1126
>ref|XM_009428401.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X12, mRNA
Length=1339
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 990 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1039
>ref|XM_009428400.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X11, mRNA
Length=2008
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 1042 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1091
>ref|XM_009428399.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X10, mRNA
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 990 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1039
>ref|XM_009428398.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X9, mRNA
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 1167 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1216
>ref|XM_009428397.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X8, mRNA
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 990 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1039
>ref|XM_009428396.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X7, mRNA
Length=1853
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 887 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 936
>ref|XM_009428394.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X6, mRNA
Length=1866
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 900 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 949
>ref|XM_009428393.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X5, mRNA
Length=2037
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 987 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1036
>ref|XM_009428392.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 887 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 936
>ref|XM_009428391.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X3, mRNA
Length=2040
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 990 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1039
>ref|XM_009428390.1| PREDICTED: Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 981 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1030
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variant X1, mRNA
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variant X4, mRNA
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Sbjct 934 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 983
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variant X1, mRNA
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Sbjct 984 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1033
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non-coding RNA
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non-coding RNA
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Sbjct 385 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 434
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non-coding RNA
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Sbjct 301 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 350
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non-coding RNA
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Sbjct 338 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 387
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mRNA
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Sbjct 900 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 949
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mRNA
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Sbjct 990 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1039
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variant X1, mRNA
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Sbjct 990 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1039
>ref|NM_001280114.1| Pan troglodytes MOK protein kinase (MOK), mRNA
dbj|AK306740.1| Pan troglodytes mRNA for MAPK/MAK/MRK overlapping kinase, complete
cds, clone: PtsC-10-5_G05
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Sbjct 754 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 803
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Sbjct 886 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 935
>ref|XM_001112517.2| PREDICTED: Macaca mulatta renal tumor antigen (RAGE), mRNA
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Sbjct 1004 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1053
>dbj|AK302349.1| Homo sapiens cDNA FLJ52803 complete cds, highly similar to MAPK/MAK/MRK
overlapping kinase (EC 2.7.11.22)
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Sbjct 885 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 934
>gb|BC053536.1| Homo sapiens renal tumor antigen, mRNA (cDNA clone MGC:61453
IMAGE:5175851), complete cds
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Sbjct 1945 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1994
>dbj|AK131542.1| Homo sapiens cDNA FLJ16778 fis, clone BRHIP3030064, moderately
similar to Homo sapiens renal tumor antigen (RAGE)
Length=3794
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 83 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 132
>dbj|AK094747.1| Homo sapiens cDNA FLJ37428 fis, clone BRAWH2001662, highly similar
to Homo sapiens mRNA for MOK protein kinase
Length=2736
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 1776 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1825
>gb|BC026069.1| Homo sapiens renal tumor antigen, mRNA (cDNA clone MGC:26281
IMAGE:4838296), complete cds
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 1401 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1450
>gb|BC043179.1| Homo sapiens renal tumor antigen, mRNA (cDNA clone MGC:44179
IMAGE:5287879), complete cds
Length=2719
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 1746 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1795
>ref|NM_001285112.1| Macaca fascicularis MOK protein kinase (MOK), mRNA
dbj|AB169545.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QflA-11131, similar to
human renal tumor antigen (RAGE), mRNA, RefSeq: NM_014226.1
Length=1917
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 937 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 986
>dbj|AB168495.1| Macaca fascicularis testis cDNA clone: QtsA-12550, similar to
human renal tumor antigen (RAGE), mRNA, RefSeq: NM_014226.1
Length=1788
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 805 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 854
>gb|AY888053.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH163744.01L renal tumor
antigen (RAGE) mRNA, partial cds
Length=1170
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 668 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 717
>emb|AL352978.6| Human chromosome 14 DNA sequence BAC C-3059L23 of library CalTech-D
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete
sequence
Length=141450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 35248 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 35199
>emb|AL359402.3| Human chromosome 14 DNA sequence BAC C-2273N11 of library CalTech-D
from chromosome 14 of Homo sapiens (Human), complete
sequence
Length=119296
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 114759 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 114710
>dbj|AB022694.1| Homo sapiens mRNA for MOK protein kinase, complete cds
Length=1954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 984 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1033
>gb|U46194.1|HSU46194 Human renal cell carcinoma antigen RAGE-4 mRNA, complete putative
cds
Length=2050
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 324 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 373
>gb|U46193.1|HSU46193 Human renal cell carcinoma antigen RAGE-3 mRNA, complete putative
cds
Length=1235
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 385 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 434
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variant X6, mRNA
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Sbjct 956 TGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1002
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
ref|XM_004796673.1| PREDICTED: Mustela putorius furo MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 960 TGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1006
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Query 2 TTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 920 TTTGTCCCCGCAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 968
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Query 1 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGA 49
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Sbjct 1004 ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGAACGCAATGGTGGCCTATGA 1052
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Query 2 TTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 669 TTTGTCCCCGCAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 717
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(MOK), mRNA
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Query 2 TTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGA 49
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Sbjct 815 TTTGTCCCCGCAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGA 862
>ref|XM_004434383.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum MOK protein kinase (MOK),
mRNA
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Query 3 TTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 954 TTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTAGCCTATGAT 1001
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(LOC103556441), mRNA
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Query 4 TGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 1678 TGTCCCCACAGTGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1724
>ref|XM_008154792.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus MOK protein kinase (MOK), mRNA
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Query 4 TGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 983 TGTCCCCGCAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 1029
>ref|XM_005605463.1| PREDICTED: Equus caballus MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X2, mRNA
Length=2112
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Query 4 TGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 836 TGTCCCCACAGTGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 882
>ref|XM_005605462.1| PREDICTED: Equus caballus MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X1, mRNA
Length=2202
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Query 4 TGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 926 TGTCCCCACAGTGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 972
>ref|XM_004395622.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens MOK protein kinase (MOK),
mRNA
Length=1290
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Query 4 TGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 578 TGTCCTCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 624
>ref|XM_008684189.1| PREDICTED: Ursus maritimus MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X2, mRNA
Length=2599
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Query 2 TTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 50
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Sbjct 2088 TTTGTCCTCGCAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 2136
>ref|XM_008684188.1| PREDICTED: Ursus maritimus MOK protein kinase (MOK), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 905 TTTGTCCTCGCAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGAT 953
>ref|XM_006925587.1| PREDICTED: Pteropus alecto MOK protein kinase (MOK), mRNA
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Query 4 TGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGA 49
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Sbjct 855 TGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCCATGGTGGCCTATGA 900
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variant X8, mRNA
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variant X6, mRNA
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Sbjct 928 ATTTGTCCCCGCAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCTTATGA 976
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Stk30:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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>gb|JN945492.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Stk30:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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>gb|EF043939.1| Synthetic construct clone ATCC 10373616 Rage mRNA, complete cds
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Sbjct 945 ATTTGTCCCCGCAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCTTATGA 993
>ref|XM_005341012.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus MOK protein kinase (Mok),
mRNA
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>ref|XM_007095267.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica MOK protein kinase (MOK),
mRNA
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>ref|XM_003988032.2| PREDICTED: Felis catus MOK protein kinase (MOK), mRNA
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Lambda K H
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14 14 102695629 102695729 100M CTTCCGCCTTTCCGCACTATGGTGGGCAGGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGTCTGTCAAAGAAAAATTACAGACACAA
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14 14 102695635 102695825 68M90N32M CCTTTCCGCACTATGGTGGGCAGGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTC
14 14 102695638 102695738 100M TTCCGCACTATGGTGGGCAGGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGTCTGTCAAAGAAAAATTACAGACACAAAATTCAGTG
14 14 102695641 102695741 100M CGCACTATGGTGGGCAGGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGTCTGTCAAAGAAAAATTACAGACACAAAATTCAGTGGCG
14 14 102695644 102695744 100M ACTATGGTGGGCAGGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGTCTGTCAAAGAAAAATTACAAACACAAAATTCAGGGGCGGCC
14 14 102695647 102695747 100M ATGGTGGGCAGGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGTCTGTCAAAGAAAAATTACAGACACAAAATTCAGTGGCGGCCTGG
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14 14 102695656 102695846 47M90N53M AGGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCCAT
14 14 102695657 102698976 46M90N51M102698980F3m GGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATT
14 14 102695657 102698976 46M90N51M102698980F3m GGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATT
14 14 102695657 102698976 46M90N51M102698980F3m GGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATT
14 14 102695657 102698976 46M90N51M102698980F3m GGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTATGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATT
14 14 102695657 102698976 46M90N51M102698980F3m GGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATT
14 14 102695657 102698976 46M90N51M102698980F3m GGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATT
14 14 102695657 102698976 46M90N51M102698980F3m GGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATT
14 14 102695657 102698976 46M90N51M102698980F3m GGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATT
14 14 102695657 102698976 46M90N51M102698980F3m GGCGACACTGCGGCGGGGCAGGCTTAAGGGCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATT
14 14 102695657 102698976 46M90N51M102698980F3m GGCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCA ATT
14 14 102695658 102698975 45M90N51M102698980F4m GCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTT
14 14 102695658 102698975 45M90N51M102698980F4m GCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTT
14 14 102695658 102698975 45M90N51M102698980F4m GCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTT
14 14 102695658 102698975 45M90N51M102698980F4m GCGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTT
14 14 102695658 102698975 45M90N51M102698980F4m GTGACACGGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTT
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14 14 102695659 102698974 44M90N51M102698980F5m CGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTG
14 14 102695659 102698974 44M90N51M102698980F5m CGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTG
14 14 102695659 102698974 44M90N51M102698980F5m CGACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCAGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTG
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14 14 102695660 102698973 43M90N51M102698980F6m GACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGT
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14 14 102695660 102698973 43M90N51M102698980F6m GACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGT
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14 14 102695660 102698973 43M90N51M102698980F6m GACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGT
14 14 102695661 102698972 42M90N51M102698980F7m ACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTT
14 14 102695661 102698972 42M90N51M102698980F7m ACACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTC
14 14 102695663 102698970 40M90N51M102698980F9m ACTGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTCCC
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14 14 102695665 102698968 38M90N51M102698980F11m TGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTCCCCA
14 14 102695665 102698968 38M90N51M102698980F11m TGCTGCGGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTCCCCA
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14 14 102695671 102695771 100M GGGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGTCTGTCAAAGAAAAATTACAGACACAAAATTCAGTGGCGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTC
14 14 102695672 102698961 31M90N51M102698980F18m GGGCAGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTCCCCACAATGCC
14 14 102695675 102695775 100M CTGGCTTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGTCTGTCAAAGAAAAATTACAGACACAAAATTCAGTGGCGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAG
14 14 102695677 102698956 26M90N51M102698980F23m GGCTTAAGGTCCTTCTGCTGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCC
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14 14 102695680 102698953 23M90N51M102698980F26m TTAAGGTCCTTCTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTTCCCACAATGCCTCTCCCTC
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14 14 102695691 102698942 12M90N51M102698980F37m CTGCGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTTCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAAT
14 14 102695694 102695794 100M CGGATCTGTCTGTCAAAGAAAAATTACAGACACAAAATTCAGTGGCGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACC
14 14 102695694 102698939 9M90N51M102698980F40m CGGATCTGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGT
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14 14 102695700 102695800 100M TGTCTGTCAAAGAAAAATTACAGACACAAAATTCAGTGGCGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTG
14 14 102695703 102695803 100M CTGTCAAAGAAAAATTACAGACACAAAATTCAGTGTCGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCCCGCTACCTTCTTGCTC
14 14 102695706 102695806 100M TCAAAGAAAAATTACAGACACAAAATTCAGTGGCGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCA
14 14 102695709 102695809 100M AAGAAAAATTACAGACACAAAATTCAGTGGCGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGG
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14 14 102695727 102695827 100M AAAATTCAGTGGCGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTC
14 14 102695730 102695830 100M ATTCAGTGGCGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGC
14 14 102695733 102695833 100M CAGTGGCGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACC
14 14 102695736 102695836 100M TGGCGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGC
14 14 102695739 102695839 100M CGGCCTGGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACT
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14 14 102695745 102695845 100M GGGCTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCCA
14 14 102695748 102695848 100M CTGGGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCCATTT
14 14 102695751 102695851 100M GGTCGAAGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCCATTTGTT
14 14 102695757 102698966 87M102698980F13m AGAGCAGCGCCGTCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTTCCCACA
14 14 102695769 102698954 75M102698980F25m TCAGAGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCT
14 14 102695773 102698950 71M102698980F29m AGAAGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTG
14 14 102695776 102698947 68M102698980F32m AGCTGGTTCCGCGCTACCTTCTTGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTTCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCAC
14 14 102695798 102698925 46M102698980F54m TGCTCGCAGGGATGCACTTCAAGGGTCTCAGCACCGGCACTCTTCC ATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCG
14 14 102698987 102698887 100m AACAACCAATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCC
14 14 102698984 102698884 100m AACCAATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTAC
14 14 102698981 102698881 100m CAATTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCGGCACCCCTACTTC
14 14 102698978 102698878 100m TTTGTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAA
14 14 102698975 102698875 100m GTCCCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAA
14 14 102698972 102698872 100m CCCACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAG
14 14 102698969 102698869 100m ACAATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAGG
14 14 102698966 102693356 96m5510n4m ATGCCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 14 102698963 102692737 93m6126n7m CCTCTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 14 102698960 102693350 90m5510n10m CTCCCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 14 102698957 102698144 87m713n13m CCTCCTGCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATAAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCGGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 14 102698954 102692728 84m6126n16m CCTGCACGCAATGGAGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 14 102698951 102693341 81m5510n19m GCACGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 14 102698948 102693338 78m5510n22m CGCAATGGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 14 102698945 102692719 75m6126n25m AACAGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 14 102698942 102692716 72m6126n28m GGTGGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 14 102698939 102698126 69m713n31m GGCCTATGATCCCGATGAGAGAATCGCCGCCCACCAGGCCCTGCAGCACCCCTACTTCCAAGAACAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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assembly
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Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
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genome shotgun sequence
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Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
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Sbjct 46578952 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 46579001
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Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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gb|DS486022.1| Homo sapiens SCAF_1103279188396 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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sequence
Length=63105981
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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assembly
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genome shotgun sequence
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Query 2 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCC-TTT 50
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Sbjct 242433982 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 242433933
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shotgun sequence
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Sbjct 6312835 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 6312786
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shotgun sequence
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Sbjct 1297514 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 1297563
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shotgun sequence
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Sbjct 10663683 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 10663634
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Query 2 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCC-TTT 50
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Sbjct 216753559 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 216753510
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shotgun sequence
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Sbjct 10663681 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 10663632
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Sbjct 213975722 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 213975673
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sequence
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Query 2 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCC-TTT 50
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Sbjct 16999650 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 16999601
>ref|NW_001838549.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188217:1-11933214, whole genome shotgun
sequence
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Query 2 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCC-TTT 50
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Sbjct 10663681 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 10663632
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000462.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 2 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCC-TTT 50
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Sbjct 211620111 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 211620062
>gb|CM000252.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 2 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCC-TTT 50
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Sbjct 214418480 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 214418431
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG
>ref|NM_213725.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P1 (RPLP1), transcript
variant 2, mRNA
Length=437
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 56 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>dbj|AB061836.1| Homo sapiens RPP1 gene for ribosomal protein P1, complete cds
and sequence
Length=4816
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 1307 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 1258
>ref|NM_001003.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P1 (RPLP1), transcript
variant 1, mRNA
Length=512
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 56 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
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Length=512
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 56 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>ref|XM_009447612.1| PREDICTED: Pan troglodytes 60S acidic ribosomal protein P1 (LOC744608),
mRNA
Length=541
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Query 3 GCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 59 GCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 12
>dbj|BS000210.2| Pan troglodytes chromosome 22 clone:RP43-018H16, map 22, complete
sequences
Length=148120
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Strand=Plus/Minus
Query 3 GCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 40210 GCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 40163
>ref|XM_001174908.4| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein, large, P1 (RPLP1),
mRNA
Length=537
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 80 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 31
>ref|XR_654342.1| PREDICTED: Pongo abelii 60S acidic ribosomal protein P1 pseudogene
(LOC100453898), misc_RNA
Length=508
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 4
>ref|XM_003818535.2| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein, large, P1 (RPLP1),
mRNA
Length=524
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 18
>ref|XR_549705.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus 60S acidic ribosomal protein
P1 pseudogene (LOC103581906), misc_RNA
Length=223
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 ACGCAGCCTTAGCTCCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 29
>ref|XM_004090207.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys 60S acidic ribosomal protein P1-like,
transcript variant 3 (LOC100599102), mRNA
Length=498
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>ref|XM_003261234.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys 60S acidic ribosomal protein P1-like,
transcript variant 1 (LOC100599102), mRNA
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 26
>ref|XM_003267160.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P1,
transcript variant 4 (RPLP1), mRNA
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Sbjct 70 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 21
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transcript variant 3 (RPLP1), mRNA
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 97 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 48
>ref|XM_004087397.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys 60S acidic ribosomal protein P1-like,
transcript variant 3 (LOC100580239), mRNA
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Sbjct 59 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 10
>ref|XM_003261493.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys 60S acidic ribosomal protein P1-like,
transcript variant 1 (LOC100580239), mRNA
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Sbjct 77 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 28
>ref|NM_001007604.2| Rattus norvegicus ribosomal protein, large, P1 (Rplp1), mRNA
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>ref|NG_032858.1| Mus musculus predicted gene, 17511 (Gm17511) pseudogene on chromosome
7
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Sbjct 127 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 78
>ref|NG_030663.1| Mus musculus predicted pseudogene 10073 (Gm10073) on chromosome
8
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Sbjct 127 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 78
>gb|JN958294.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Rplp1:tm1(KOMP)Wtsi;
transgenic
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Sbjct 14550 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 14501
>gb|JN952426.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Kif23:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Sbjct 40330 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 40281
>gb|JN948456.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Kif23:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Sbjct 40356 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 40307
>emb|FQ210407.1| Rattus norvegicus TL0ABA29YD05 mRNA sequence
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ210375.1| Rattus norvegicus TL0ABA2YA07 mRNA sequence
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ216979.1| Rattus norvegicus TL0ACA38YE12 mRNA sequence
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Sbjct 58 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
>emb|FQ216959.1| Rattus norvegicus TL0ACA38YK16 mRNA sequence
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Sbjct 54 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 5
>emb|FQ216921.1| Rattus norvegicus TL0ACA39YJ21 mRNA sequence
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Sbjct 58 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
>emb|FQ216905.1| Rattus norvegicus TL0ACA39YO05 mRNA sequence
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Sbjct 59 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 10
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
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Sbjct 52 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 3
>emb|FQ222816.1| Rattus norvegicus TL0ADA19YK09 mRNA sequence
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ222805.1| Rattus norvegicus TL0ADA19YM13 mRNA sequence
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ222784.1| Rattus norvegicus TL0ADA19YP18 mRNA sequence
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ210237.1| Rattus norvegicus TL0ABA31YN02 mRNA sequence
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ209966.1| Rattus norvegicus TL0ABA37YB07 mRNA sequence
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 58 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
>emb|FQ222618.1| Rattus norvegicus TL0ADA20YP04 mRNA sequence
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 58 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
>emb|FQ222608.1| Rattus norvegicus TL0ADA21YC15 mRNA sequence
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 58 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
>emb|FQ222559.1| Rattus norvegicus TL0ADA21YM15 mRNA sequence
Length=518
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ229354.1| Rattus norvegicus TL0ADA48YD13 mRNA sequence
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 58 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
>emb|FQ229318.1| Rattus norvegicus TL0ADA48YF11 mRNA sequence
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ222468.1| Rattus norvegicus TL0ADA23YA21 mRNA sequence
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 57 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 8
>emb|FQ229050.1| Rattus norvegicus TL0ADA4YC07 mRNA sequence
Length=516
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ229009.1| Rattus norvegicus TL0ADA4YK03 mRNA sequence
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ228990.1| Rattus norvegicus TL0ADA4YO03 mRNA sequence
Length=523
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 62 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 13
>emb|FQ222178.1| Rattus norvegicus TL0ADA27YJ06 mRNA sequence
Length=511
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ228792.1| Rattus norvegicus TL0ADA51YL17 mRNA sequence
Length=518
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 58 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
>emb|FQ228650.1| Rattus norvegicus TL0ADA5YG16 mRNA sequence
Length=516
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ228640.1| Rattus norvegicus TL0ADA5YL10 mRNA sequence
Length=516
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 57 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 8
>emb|FQ228605.1| Rattus norvegicus TL0ADA6YD11 mRNA sequence
Length=525
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 59 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 10
>emb|FQ228539.1| Rattus norvegicus TL0ADA7YD04 mRNA sequence
Length=514
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ228528.1| Rattus norvegicus TL0ADA7YE22 mRNA sequence
Length=512
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 52 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 3
>emb|FQ228523.1| Rattus norvegicus TL0ADA7YF06 mRNA sequence
Length=517
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ222132.1| Rattus norvegicus TL0ADA28YG18 mRNA sequence
Length=137
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ222031.1| Rattus norvegicus TL0ADA29YN16 mRNA sequence
Length=516
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ221980.1| Rattus norvegicus TL0ADA2YG09 mRNA sequence
Length=535
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ221969.1| Rattus norvegicus TL0ADA2YH23 mRNA sequence
Length=516
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ228390.1| Rattus norvegicus TL0ADA9YB02 mRNA sequence
Length=516
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ228361.1| Rattus norvegicus TL0ADA9YH02 mRNA sequence
Length=517
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ228323.1| Rattus norvegicus TL0ADA9YM18 mRNA sequence
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Sbjct 58 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
>emb|FQ223445.1| Rattus norvegicus TL0ADA11YE01 mRNA sequence
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ223390.1| Rattus norvegicus TL0ADA11YO01 mRNA sequence
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ223388.1| Rattus norvegicus TL0ADA11YO03 mRNA sequence
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>emb|FQ223337.1| Rattus norvegicus TL0ADA12YI02 mRNA sequence
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ230089.1| Rattus norvegicus TL0ADA45YK24 mRNA sequence
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ220212.1| Rattus norvegicus TL0ADA43YM13 mRNA sequence
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Sbjct 57 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 8
>emb|FQ220167.1| Rattus norvegicus TL0ADA43YP09 mRNA sequence
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>emb|FQ217313.1| Rattus norvegicus TL0ACA2YG04 mRNA sequence
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ211097.1| Rattus norvegicus TL0ABA17YK19 mRNA sequence
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Sbjct 58 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
>emb|FQ210988.1| Rattus norvegicus TL0ABA19YG05 mRNA sequence
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>emb|FQ223016.1| Rattus norvegicus TL0ADA16YF09 mRNA sequence
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ223013.1| Rattus norvegicus TL0ADA16YF24 mRNA sequence
Length=515
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Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ222966.1| Rattus norvegicus TL0ADA17YA22 mRNA sequence
Length=511
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Sbjct 54 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 5
>emb|FQ222965.1| Rattus norvegicus TL0ADA17YA23 mRNA sequence
Length=530
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ210864.1| Rattus norvegicus TL0ABA20YN17 mRNA sequence
Length=522
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ217216.1| Rattus norvegicus TL0ACA32YD15 mRNA sequence
Length=519
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 58 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
>emb|FQ210632.1| Rattus norvegicus TL0ABA25YG07 mRNA sequence
Length=512
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 57 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 8
>gb|AC182013.3| Nomascus leucogenys clone CH271-409M22, complete sequence
Length=39013
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 12550 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 12599
>gb|BC058151.1| Rattus norvegicus ribosomal protein, large, P1, mRNA (cDNA clone
MGC:72935 IMAGE:6888011), complete cds
Length=522
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 10
>gb|BC058685.1| Mus musculus ribosomal protein, large, P1, mRNA (cDNA clone MGC:58068
IMAGE:6410847), complete cds
Length=550
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 20
>gb|AC151969.3| Mus musculus BAC clone RP24-255B1 from chromosome 9, complete
sequence
Length=192458
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 73388 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 73437
>gb|AC133494.4| Mus musculus BAC clone RP24-443B5 from chromosome 7, complete
sequence
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 73507 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 73556
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product:ribosomal protein, large, P1, full insert
sequence
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Sbjct 57 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 8
>dbj|AK010656.1| Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:2410042H16 product:ribosomal protein, large, P1, full
insert sequence
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Sbjct 59 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 10
>dbj|AK007832.1| Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:1810048O17 product:ribosomal protein,
large, P1, full insert sequence
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Sbjct 58 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
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Sbjct 102720 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 102769
>gb|U29402.1|MMU29402 Mus musculus acidic ribosomal phosphoprotein P1 mRNA, complete
cds
Length=495
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Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
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protein P1 (LOC101031966), mRNA
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Query 2 CGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 57 CGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 9
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(LOC739939), misc_RNA
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Sbjct 50 GCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 6
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(LOC100433007), misc_RNA
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Query 6 GCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 59 GCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 15
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(LOC100990261), misc_RNA
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Query 6 GCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 59 GCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 15
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protein P1 (RGD1564744), transcript variant X5, mRNA
ref|XM_006241134.2| PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 60S acidic ribosomal
protein P1 (RGD1564744), transcript variant X6, mRNA
ref|XM_006241135.2| PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 60S acidic ribosomal
protein P1 (RGD1564744), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 79 GCAGCCTTAGCTTCCTCAGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 32
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protein P1 (RGD1564744), transcript variant X3, mRNA
ref|XM_008776404.1| PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 60S acidic ribosomal
protein P1 (RGD1564744), transcript variant X4, mRNA
ref|XM_006241133.2| PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 60S acidic ribosomal
protein P1 (RGD1564744), transcript variant X3, mRNA
ref|XM_008765205.1| PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 60S acidic ribosomal
protein P1 (RGD1564744), transcript variant X4, mRNA
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Query 3 GCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 79 GCAGCCTTAGCTTCCTCAGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 32
>ref|XM_008776402.1| PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 60S acidic ribosomal
protein P1 (RGD1564744), transcript variant X2, mRNA
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Query 3 GCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
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Sbjct 79 GCAGCCTTAGCTTCCTCAGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 32
>ref|XM_001075612.4| PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 60S acidic ribosomal
protein P1 (RGD1564744), transcript variant X1, mRNA
ref|XM_234961.5| PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 60S acidic ribosomal
protein P1 (RGD1564744), transcript variant X1, mRNA
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Query 3 GCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 GCAGCCTTAGCTTCCTCAGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 32
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Length=517
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTG 48
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 57 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTG 10
>emb|FQ228490.1| Rattus norvegicus TL0ADA7YM22 mRNA sequence
Length=520
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Query 6 GCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 GCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 7
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protein P1 pseudogene (LOC101027583), misc_RNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 59 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCCTGGCGGCAGCTGAG 10
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P1 (RPLP1), mRNA
Length=542
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 85 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTCGCGGCAGCTGAG 36
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transcript variant X2, ncRNA
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Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 253 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCCGAG 204
>ref|XR_610984.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC100986528 (LOC100986528),
transcript variant X1, ncRNA
Length=1194
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 253 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCCGAG 204
>ref|XM_006751623.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii 60S acidic ribosomal protein
P1-like (LOC102737265), transcript variant X1, mRNA
Length=528
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 52 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTAGCGGCAGCTGAG 3
>ref|XM_006745116.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii ribosomal protein, large,
P1 (RPLP1), transcript variant X2, mRNA
Length=451
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 54 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTAGCGGCAGCTGAG 5
>ref|XM_006745115.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii ribosomal protein, large,
P1 (RPLP1), transcript variant X1, mRNA
Length=543
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 82 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTAGCGGCAGCTGAG 33
>ref|XM_005370729.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster 60S acidic ribosomal protein
P1-like (LOC101988888), transcript variant X1, mRNA
Length=487
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 52 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCAGAG 3
>ref|XM_004421754.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum ribosomal protein, large,
P1, transcript variant 2 (RPLP1), mRNA
Length=431
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTAGCGGCAGCTGAG 6
>ref|XM_004421753.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum ribosomal protein, large,
P1, transcript variant 1 (RPLP1), mRNA
Length=509
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 57 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTAGCGGCAGCTGAG 8
>ref|NG_009587.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P1 pseudogene 4 (RPLP1P4)
on chromosome 2
Length=711
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 156 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCAGCTTGGCGGCAGCTGAG 107
>ref|NG_029586.1| Mus musculus predicted gene 11942 (Gm11942) pseudogene on chromosome
4
Length=668
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 ACGCGGCCTTAGCTCCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 78
>emb|FQ222616.1| Rattus norvegicus TL0ADA21YA04 mRNA sequence
Length=529
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGATGAG 6
>emb|FQ221717.1| Rattus norvegicus TL0ADA32YL09 mRNA sequence
Length=517
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGTGGCAGCTGAG 6
>emb|FQ221137.1| Rattus norvegicus TL0ADA3YC01 mRNA sequence
Length=518
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCT 47
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCT 9
>emb|FQ217467.1| Rattus norvegicus TL0ACA25YL11 mRNA sequence
Length=517
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTAGGCGGCAGCTGAG 7
>emb|FQ223066.1| Rattus norvegicus TL0ADA15YN05 mRNA sequence
Length=514
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 57 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTTGCGGCAGCTGAG 8
>gb|AY581856.1| Pan troglodytes BRCA1 pseudogene, NBR1 testis isoform-like, and
NBR1 general isoform-like genes, complete sequence
Length=1703
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 506 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCCGAG 555
>dbj|AK088070.1| Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:E430003D18 product:ribosomal
protein, large, P1, full insert sequence
Length=497
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 57 ACGCGGCCTTAGCTCCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 8
>gb|AC016739.5| Homo sapiens BAC clone RP11-437N19 from 2, complete sequence
Length=90363
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 80710 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCAGCTTGGCGGCAGCTGAG 80661
>emb|AL772288.12| Mouse DNA sequence from clone RP23-360H6 on chromosome 4, complete
sequence
Length=132015
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49130 ACGCGGCCTTAGCTCCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 49081
>ref|XM_003752945.2| PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein P1-like (LOC100360522),
transcript variant X1, mRNA
Length=1085
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCG-AAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 596
>emb|FQ227410.1| Rattus norvegicus TL0AEA13YH03 mRNA sequence
Length=1113
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCG-AAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 602
>gb|AY581858.1| Hylobates lar NBR1 testis isoform-like and NBR1 general isoform-like
genes, complete sequence
Length=1706
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 CGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 506 CGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCCGAG 554
>gb|AY303789.1| Homo sapiens acidic ribosomal phosphoprotein P1 mRNA, complete
cds
Length=531
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGC 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 57 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGC 15
>ref|XM_004611822.1| PREDICTED: Sorex araneus kinesin family member 23 (KIF23), mRNA
Length=3276
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTG 48
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3268 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGAGGCAGCTG 3221
>ref|XM_004087396.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys 60S acidic ribosomal protein P1-like,
transcript variant 2 (LOC100580239), mRNA
Length=539
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAG 45
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAG 11
>emb|FQ222582.1| Rattus norvegicus TL0ADA21YH10 mRNA sequence
Length=514
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAG 45
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAG 12
>ref|XM_004412244.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens ribosomal protein, large,
P1 (RPLP1), mRNA
Length=549
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 82 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTAGCGGCAACTGAG 33
>ref|XM_004331954.1| PREDICTED: Tursiops truncatus 60S acidic ribosomal protein P1-like,
transcript variant 1 (LOC101333655), mRNA
Length=477
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 59 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTAGCGGAAGCTGAG 10
>ref|NG_010867.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P1 pseudogene 12 (RPLP1P12)
on chromosome 19
Length=657
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 156 ACGCGGCCTTGGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCAGCAGCTGAG 107
>emb|FQ228327.1| Rattus norvegicus TL0ADA9YM01 mRNA sequence
Length=527
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 56 ACGCGGCGTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCGGAG 7
>emb|FQ221384.1| Rattus norvegicus TL0ADA37YB04 mRNA sequence
Length=523
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 56 ACGCGGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTGGGCGGCAGCGGAG 7
>gb|AC008753.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-3022G6, complete sequence
Length=147330
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 44257 ACGCGGCCTTGGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCAGCAGCTGAG 44208
>ref|XM_005316738.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus ribosomal protein, large,
P1 (Rplp1), transcript variant X2, mRNA
Length=405
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 54 ACGCGGCCTTAGCTTC-TCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCACCTGAG 6
>ref|XM_005316737.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus ribosomal protein, large,
P1 (Rplp1), transcript variant X1, mRNA
Length=501
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 54 ACGCGGCCTTAGCTTC-TCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCACCTGAG 6
>gb|AC200331.2| Pongo abelii BAC clone CH276-364M3 from chromosome 19, complete
sequence
Length=212089
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG 50
|||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 77669 ACGC-GGCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCAGCAGCTGAG 77717
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT
>ref|XM_006071026.1| PREDICTED: Bubalus bubalis ribosomal protein, large, P1 (RPLP1),
transcript variant X1, mRNA
Length=544
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 267
>ref|XM_006060462.1| PREDICTED: Bubalus bubalis 60S acidic ribosomal protein P1-like
(LOC102400341), transcript variant X1, mRNA
Length=524
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 205 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 254
>ref|XM_006060232.1| PREDICTED: Bubalus bubalis 60S acidic ribosomal protein P1-like
(LOC102407878), transcript variant X1, mRNA
Length=506
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 236
>ref|XM_005980320.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii 60S acidic ribosomal protein
P1-like (LOC102319909), transcript variant X1, mRNA
Length=573
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 250
>ref|XM_005979968.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ribosomal protein, large, P1
(RPLP1), mRNA
Length=423
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 97 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 146
>ref|XM_005972156.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii 60S acidic ribosomal protein
P1-like (LOC102315533), transcript variant X1, mRNA
Length=517
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 251
>ref|XM_005969860.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii 60S acidic ribosomal protein
P1-like (LOC102324778), transcript variant X1, mRNA
Length=540
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 250
>ref|XM_005957084.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii 60S acidic ribosomal protein
P1-like (LOC102326472), transcript variant X1, mRNA
Length=339
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 122
>ref|XM_005909682.1| PREDICTED: Bos mutus 60S acidic ribosomal protein P1-like (LOC102287882),
transcript variant X1, mRNA
Length=514
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 255
>ref|XM_005902307.1| PREDICTED: Bos mutus 60S acidic ribosomal protein P1-like (LOC102268634),
mRNA
Length=330
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 125
>ref|XM_005888886.1| PREDICTED: Bos mutus 60S acidic ribosomal protein P1-like (LOC102281485),
mRNA
Length=345
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 125
>ref|XM_004010270.1| PREDICTED: Ovis aries ribosomal protein, large, P1, transcript
variant 1 (RPLP1), mRNA
Length=549
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 266
>ref|NM_001025340.2| Bos taurus ribosomal protein, large, P1 (RPLP1), mRNA
Length=513
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 255
>dbj|AB529036.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB3432, Homo sapiens RPLP1
gene for ribosomal protein, large, P1, without stop codon,
in Flexi system
Length=359
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 134
>emb|CU678440.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100016677
5' read RPLP1 mRNA
Length=1013
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 141
>dbj|AK311456.1| Homo sapiens cDNA, FLJ18498
Length=907
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 520
>gb|BC082259.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6455860, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1995
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1650 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 1699
>gb|BC053844.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3864103)
Length=2149
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1747 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 1796
>gb|BC021006.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3831548, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4992
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 242
>gb|AY170823.1| Homo sapiens transformation-related protein 2 mRNA, complete
cds
Length=2302
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 297
>gb|BC003369.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P1, mRNA (cDNA clone MGC:5215
IMAGE:2900846), complete cds
Length=526
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 237
>gb|AY303789.1| Homo sapiens acidic ribosomal phosphoprotein P1 mRNA, complete
cds
Length=531
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 255
>gb|BC102695.1| Bos taurus ribosomal protein, large, P1, mRNA (cDNA clone MGC:127703
IMAGE:7955197), complete cds
Length=602
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 208 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 257
>gb|AC027237.8| Homo sapiens chromosome 15, clone RP11-253M7, complete sequence
Length=157448
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46211 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 46162
>gb|BC007590.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P1, mRNA (cDNA clone MGC:15616
IMAGE:3343021), complete cds
Length=504
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 225
>gb|AY911313.1| Bos taurus clone IMAGE:7961452 ribosomal protein P1 isoform 1-like
mRNA, complete cds
Length=515
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 256
>emb|CR542209.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A0225D
for gene RPLP1, ribosomal protein, large, P1; complete cds,
incl. stopcodon
Length=345
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 125
>emb|CR450339.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C112D
for gene RPLP1, ribosomal protein, large, P1; complete cds;
without stopcodon
Length=342
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 125
>dbj|AK130958.1| Homo sapiens cDNA FLJ27448 fis, clone DMC07139
Length=515
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 208 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 257
>dbj|AK026579.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22926 fis, clone KAT06984, highly similar
to HUMPPARP1 Human acidic ribosomal phosphoprotein P1 mRNA
Length=548
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 205 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 254
>dbj|AB061836.1| Homo sapiens RPP1 gene for ribosomal protein P1, complete cds
and sequence
Length=4816
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2082 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 2131
>ref|NM_001003.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P1 (RPLP1), transcript
variant 1, mRNA
Length=512
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 205 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 254
>gb|M17886.1|HUMPPARP1 Human acidic ribosomal phosphoprotein P1 mRNA, complete cds
Length=512
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 205 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTT 254
>ref|XM_010330494.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis 60S acidic ribosomal
protein P1 (LOC101031966), mRNA
Length=524
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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mRNA
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(LOC100433007), misc_RNA
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(LOC100453898), misc_RNA
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mRNA
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(LOC100386161), mRNA
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pseudogene (LOC100400127), misc_RNA
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protein P1-like (LOC103018013), mRNA
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protein P1-like (LOC102997298), transcript variant X1,
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large, P1 (RPLP1), mRNA
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mRNA
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(LOC102127370), transcript variant X1, mRNA
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mRNA
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transcript variant 1 (LOC101332824), mRNA
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transcript variant 1 (LOC101273308), mRNA
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variant 1 (RPLP1), mRNA
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transcript variant 3 (LOC100580239), mRNA
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Sbjct 208 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 257
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transcript variant 2 (LOC100580239), mRNA
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Sbjct 204 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 253
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transcript variant 1 (LOC100580239), mRNA
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Sbjct 226 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 275
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P1, transcript variant 2 (RPLP1), mRNA
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Sbjct 246 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 295
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P1, transcript variant 1 (RPLP1), mRNA
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Sbjct 246 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 295
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P1-like (LOC101137667), mRNA
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Sbjct 230 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 279
>ref|NG_009587.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P1 pseudogene 4 (RPLP1P4)
on chromosome 2
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Sbjct 305 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 354
>ref|NM_001193574.1| Macaca mulatta ribosomal protein, large, P1 (RPLP1), mRNA
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Sbjct 207 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 256
>ref|XM_002798082.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S acidic ribosomal protein P1-like,
transcript variant 2 (LOC706108), mRNA
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Sbjct 217 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 266
>ref|XM_001094450.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S acidic ribosomal protein P1-like,
transcript variant 1 (LOC706108), mRNA
Length=560
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Sbjct 193 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 242
>gb|AY347938.1| Macaca radiata acidic ribosomal phosphoprotein-like mRNA, partial
sequence
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Sbjct 9 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 58
>gb|AY347935.1| Macaca radiata ribosomal protein P1 mRNA, partial cds
Length=328
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Sbjct 9 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 58
>dbj|BS000210.2| Pan troglodytes chromosome 22 clone:RP43-018H16, map 22, complete
sequences
Length=148120
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Sbjct 40361 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 40410
>gb|AC016739.5| Homo sapiens BAC clone RP11-437N19 from 2, complete sequence
Length=90363
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 80859 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 80908
>ref|XR_746058.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis 60S acidic ribosomal
protein P1 pseudogene (LOC101034987), misc_RNA
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Sbjct 198 GATAAGAACAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 247
>ref|XM_009242196.1| PREDICTED: Pongo abelii 60S acidic ribosomal protein P1-like
(LOC100434134), transcript variant X1, mRNA
Length=398
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 76 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGTTGAACCTTT 125
>ref|XR_621129.1| PREDICTED: Callithrix jacchus 60S acidic ribosomal protein P1
pseudogene (LOC100414403), misc_RNA
Length=420
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 111 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGTTGAACCTTT 160
>ref|XR_087440.3| PREDICTED: Callithrix jacchus 60S acidic ribosomal protein P1
pseudogene (LOC100397225), misc_RNA
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Sbjct 73 GATAAAATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 122
>ref|XR_620301.1| PREDICTED: Callithrix jacchus 60S acidic ribosomal protein P1
pseudogene (LOC100413370), misc_RNA
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Sbjct 211 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGTCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 260
>ref|XM_008563974.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus 60S acidic ribosomal protein
P1-like (LOC103582355), mRNA
Length=434
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 175 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGTTGAACCTTT 224
>ref|XM_008528726.1| PREDICTED: Equus przewalskii 60S acidic ribosomal protein P1-like
(LOC103556570), mRNA
Length=395
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Sbjct 82 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTCGAACCTTT 131
>ref|XM_008538826.1| PREDICTED: Equus przewalskii 60S acidic ribosomal protein P1
(LOC103563441), partial mRNA
Length=451
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
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transcript variant X1, mRNA
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mRNA
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pseudogene (LOC103234603), misc_RNA
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mRNA
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protein P1-like (LOC103002073), transcript variant X1,
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mRNA
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(LOC102513045), transcript variant X1, mRNA
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(LOC102423862), mRNA
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(LOC102248128), mRNA
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Sbjct 139 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGTTGAACCTTT 188
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P1-like (LOC102156895), mRNA
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Sbjct 208 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTCGAACCTTT 257
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transcript variant 1, mRNA
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(LOC102129928), transcript variant X1, mRNA
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P1-like (LOC101438944), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 161 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGTTGAACCTTT 210
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(RPLP1), mRNA
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Sbjct 205 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGTTGAACCTTT 254
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large, P1, transcript variant 1 (RPLP1), mRNA
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Sbjct 204 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAACGTTGAACCTTT 253
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transcript variant 1 (LOC101333655), mRNA
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Sbjct 208 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCCGTGTAAATGTTGAACCTTT 257
>ref|XM_004327557.1| PREDICTED: Tursiops truncatus 60S acidic ribosomal protein P1-like,
transcript variant 1 (LOC101335139), mRNA
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Sbjct 76 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGTTGAACCTTT 125
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transcript variant 3 (RPLP1), mRNA
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Sbjct 246 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTCGAACCTTT 295
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on chromosome 6
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Sbjct 313 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGTTGAACCTTT 362
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(LOC100958470), misc_RNA
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Sbjct 194 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGTTGAACCTTT 243
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transcript variant 2 (LOC713991), mRNA
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Sbjct 218 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTGAATGTTGAACCTTT 267
>emb|CU984591.11| Pig DNA sequence from clone CH242-288L4 on chromosome 2, complete
sequence
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Sbjct 80490 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCAGGTGTAAAATGTTGAGCCTTT 80440
>dbj|AK232011.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010064C06, expressed in lung
Length=1119
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Sbjct 254 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCAGGTGTAAAATGTTGAGCCTTT 204
>emb|AL023284.1| Human DNA sequence from clone RP3-406A7 on chromosome 6q23-24,
complete sequence
Length=167691
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Sbjct 53935 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGTTGAACCTTT 53984
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mRNA
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Sbjct 680 ATAAGATCAAGGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTT 728
>ref|XM_007450767.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer 60S acidic ribosomal protein P1-like
(LOC103086712), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 77 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCAGTGTAAATGTTGAACCTTT 125
>ref|XM_005863348.1| PREDICTED: Myotis brandtii 60S acidic ribosomal protein P1-like
(LOC102245899), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 77 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGTTGAACCTTT 125
>ref|XM_004398398.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens 60S acidic ribosomal protein
P1-like, transcript variant 1 (LOC101383940), mRNA
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Sbjct 76 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCAGGTGTAAATGTTGAACCTT 124
>ref|NG_006638.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P1 pseudogene 2 (RPLP1P2)
on chromosome 1
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Sbjct 250 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 299
>emb|AL590682.9| Human DNA sequence from clone RP11-435F13 on chromosome 1, complete
sequence
Length=155156
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Query 2 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCC-TTT 50
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Sbjct 81577 ATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAACCCTTT 81528
>ref|XR_747087.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S acidic ribosomal protein
P1 pseudogene (LOC104656186), misc_RNA
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Sbjct 205 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGCGAATGTTGAACCTTT 254
>ref|XM_010363649.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ribosomal protein, large,
P1 (RPLP1), mRNA
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Sbjct 234 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCGGGTGTGAATGTTGAACCTTT 283
>ref|XM_009196060.1| PREDICTED: Papio anubis 60S acidic ribosomal protein P1 (LOC100999326),
mRNA
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Sbjct 211 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTGAATGTGGAACCTTT 260
>ref|XR_640946.1| PREDICTED: Papio anubis 60S acidic ribosomal protein P1 pseudogene
(LOC101009855), misc_RNA
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Sbjct 185 GATGAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTGAATGTTGAACCTTT 234
>ref|XM_008708532.1| PREDICTED: Ursus maritimus ribosomal protein, large, P1 (RPLP1),
mRNA
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Sbjct 196 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCGGGTGTGAATGTTGAACCTTT 245
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(LOC103296777), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 76 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTAAATGCTGAACCTTT 125
>ref|XM_007622292.1| PREDICTED: Cricetulus griseus ribosomal protein, large, P1 (Rplp1),
mRNA
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Sbjct 199 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTCAATGTTGAACCTTT 248
>ref|XM_007612996.1| PREDICTED: Cricetulus griseus 60S acidic ribosomal protein P1-like
(LOC100767529), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 151 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTCAATGTTGAACCTTT 200
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(LOC100771356), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 147 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTCAATGTTGAACCTTT 196
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(LOC100751171), mRNA
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Sbjct 128 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTCAATGTTGAACCTTT 177
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(LOC100771356), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 435 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCTGGTGTCAATGTTGAACCTTT 484
>ref|XM_003506482.2| PREDICTED: Cricetulus griseus 60S acidic ribosomal protein P1
(LOC100751171), mRNA
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mRNA
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(LOC100767529), transcript variant X1, mRNA
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protein P1-like (LOC103002291), transcript variant X1,
mRNA
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P1 (RPLP1), transcript variant X1, mRNA
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P1-like (LOC101997844), mRNA
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transcript variant 1 (LOC101273469), mRNA
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transcript variant 2 (LOC100593525), mRNA
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transcript variant 1 (LOC100593525), mRNA
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transcript variant 1 (LOC100599102), mRNA
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sequence
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Sbjct 56264 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCAGGTGTAAATGCTGAGCC 56218
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complete cds
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P1-like (LOC100478480), mRNA
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Sbjct 226 GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCGGGTGTGAATGTTGAACCTTT 275
>emb|CU582972.4| Pig DNA sequence from clone CH242-312D13 on chromosome X, complete
sequence
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>gb|EF631972.1| Ailuropoda melanoleuca acidic ribosomal phosphoprotein P1 (RPLP1)
mRNA, complete cds
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(LOC104677634), mRNA
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15 15 69745292 69745192 100m GGCCATGGCGCGGGCGAGTGTAGGGCTGGCGCTGCCGGACGCGGTGCTAGTCGCCGGATGAAGTGAGGGCCTCACCCCAACGCAGCCTTAGCTTCCTCGG
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15 15 69745265 69745165 100m GGCGCTGCCGGACGCGGTGCTAGTCGCCGGATGAAGTGAGGGCCTCACCCCAACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTG
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15 15 69745258 69745158 100m CCGGACGCGGTGCTAGTCGCCGGATGAAGTGAGGGCCTCACCCCAACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAGGAAAG
15 15 69745254 69745154 100m ACGCGGTGCTAGTCGCCGGATGAAGTGAGGGCCTCACCCCAACGCAGCCTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAGGAAAGGGGC
15 15 69745215 69746036 52m69745989F48M CAACGCAGCCTTAGCTTCCGCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCT
15 15 69745206 69746045 43m69745989F57M CTTAGCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTTTTGGCCT
15 15 69745202 69746049 39m69745989F61M GCTTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG GAAAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTTTTGGCCTGGCT
15 15 69745200 69746051 37m69745989F63M TTCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTTTTGGCCTGGCTTG
15 15 69745199 69746052 36m69745989F64M TCCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTCAATGTTGAGCCTTTTTGGCCTGGCTTGT
15 15 69745198 69746053 35m69745989F65M CCTCGGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG TATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTTTTGGCCTCGCTTGTT
15 15 69745194 69746057 31m69745989F69M GGAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTTTTGGCCTGGCTTGTTTGCA
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15 15 69745193 69746058 30m69745989F70M GAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTTTTGGCCTGGCTTGTTTGCAA
15 15 69745193 69746058 30m69745989F70M GAAGGACCGAGCACCTTGGCGGCAGCTGAG GATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTTTTGGCCTGGCTTGTTTGCAA
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sequence
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shotgun sequence
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assembly
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 6187763 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATCCCCAGACAGCT 6187809
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sequence
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>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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>ref|XM_006720570.1| PREDICTED: Homo sapiens pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2081 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2032
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complete cds
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Sbjct 1979 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1930
>ref|XM_005254443.1| PREDICTED: Homo sapiens pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 1984 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1935
>ref|NM_001206799.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript variant
7, mRNA
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Sbjct 1927 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1878
>ref|NM_001206798.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript variant
6, mRNA
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Sbjct 2047 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1998
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5, mRNA
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Sbjct 1800 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1751
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4, mRNA
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Sbjct 2359 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2310
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3, mRNA
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Sbjct 2022 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1973
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2, mRNA
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Sbjct 2238 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2189
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1, mRNA
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Sbjct 2022 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1973
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kinase isozymes M1/M2 (EC 2.7.1.40)
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Sbjct 1604 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1555
>dbj|AK299413.1| Homo sapiens cDNA FLJ53645 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozyme M1 (EC 2.7.1.40)
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Sbjct 1764 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1715
>dbj|AK300800.1| Homo sapiens cDNA FLJ54554 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozymes M1/M2 (EC 2.7.1.40)
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Sbjct 1851 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1802
>dbj|AK307855.1| Homo sapiens cDNA, FLJ97803
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Sbjct 1828 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1779
>gb|BC051346.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6461886, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 1225 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1176
>gb|BC035487.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone IMAGE:4779421),
with apparent retained intron
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Sbjct 2526 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2477
>gb|BC035198.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:9369
IMAGE:3859987), complete cds
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Sbjct 1792 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1743
>gb|BC007640.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:15908
IMAGE:3533876), complete cds
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Sbjct 1826 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1777
>gb|BC023328.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone IMAGE:4510296)
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Sbjct 1210 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1161
>gb|BC019265.2| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone IMAGE:3503708),
partial cds
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Sbjct 1174 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1125
>gb|BC000481.2| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:8698
IMAGE:2964687), complete cds
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Sbjct 1842 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1793
>gb|BC007952.2| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:14360
IMAGE:4299213), complete cds
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 1838 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1789
>gb|BC012811.2| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:3932
IMAGE:2958817), complete cds
Length=2336
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 1838 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1789
>dbj|AK123345.1| Homo sapiens cDNA FLJ41351 fis, clone BRAWH2012749
Length=2790
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2311 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2262
>dbj|AK092369.1| Homo sapiens cDNA FLJ35050 fis, clone OCBBF2018167, highly similar
to Pyruvate kinase isozyme M1 (EC 2.7.1.40)
Length=2486
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2010 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1961
>gb|AY352517.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle (PKM2) gene, complete cds
Length=34172
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 33641 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 33592
>gb|BC094767.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:104654
IMAGE:5296639), complete cds
Length=1879
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 1387 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1338
>dbj|AK222927.1| Homo sapiens mRNA for pyruvate kinase 3 isoform 1 variant, clone:
HRC08174
Length=2247
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 1826 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1777
>gb|AC020779.10| Homo sapiens chromosome 15, clone RP11-2I17, complete sequence
Length=171123
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 136399 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 136448
>gb|BC096823.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone IMAGE:30558692)
Length=2522
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2027 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1978
>emb|X56494.1| H.sapiens M gene for M1-type and M2-type pyruvate kinase
Length=10368
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 9874 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 9825
>emb|BX648597.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G12209 (from clone DKFZp686G12209)
Length=2325
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 1829 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1780
>gb|BC023592.2| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone IMAGE:4646848)
Length=2305
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1739
>gb|AF025439.1|AF025439 Homo sapiens Opa-interacting protein OIP3 mRNA, partial cds
Length=1158
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 637 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 588
>gb|M26252.1|HUMTCBA Human TCB gene encoding cytosolic thyroid hormone-binding protein,
complete cds
Length=2306
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 1827 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1778
>gb|M23725.1|HUMPKM2L Human M2-type pyruvate kinase mRNA, complete cds
Length=2287
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 1847 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1798
>ref|XM_004056439.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla pyruvate kinase, muscle, transcript
variant 5 (PKM), mRNA
Length=2561
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Strand=Plus/Minus
Query 3 GCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2078 GCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2031
>ref|XM_004056438.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla pyruvate kinase, muscle, transcript
variant 4 (PKM), mRNA
Length=2408
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1878
>ref|XM_004056437.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla pyruvate kinase, muscle, transcript
variant 3 (PKM), mRNA
Length=2491
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2008 GCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1961
>ref|XM_004056436.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla pyruvate kinase, muscle, transcript
variant 2 (PKM), mRNA
Length=2300
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 1817 GCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1770
>ref|XM_004056435.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla pyruvate kinase, muscle, transcript
variant 1 (PKM), mRNA
Length=2271
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 GCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1741
>ref|XM_009429485.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X10, mRNA
Length=2172
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 1693 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1644
>ref|XM_009429484.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X9, mRNA
Length=2334
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1806
>ref|XM_001175057.3| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X8, mRNA
Length=2501
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2022 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1973
>ref|XM_001175100.3| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X7, mRNA
Length=2501
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2022 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1973
>ref|XM_009429483.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X6, mRNA
Length=2525
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2046 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1997
>ref|XM_009429482.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X5, mRNA
Length=2525
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2046 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1997
>ref|XM_003952689.2| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X4, mRNA
Length=2512
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2033 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1984
>ref|XM_009429481.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X3, mRNA
Length=2512
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2033 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1984
>ref|XM_003314742.3| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2359 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2310
>ref|XM_009429480.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2081 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2032
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variant X8, mRNA
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Sbjct 1693 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1644
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variant X7, mRNA
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Sbjct 1855 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1806
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variant X6, mRNA
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Sbjct 2021 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1972
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variant X5, mRNA
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Sbjct 2021 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1972
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variant X4, mRNA
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Sbjct 2070 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2021
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variant X3, mRNA
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2067 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2018
>ref|XM_003818555.2| PREDICTED: Pan paniscus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2358 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2309
>ref|XM_008971883.1| PREDICTED: Pan paniscus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2080 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 2031
>dbj|AK305453.1| Pan troglodytes mRNA for pyruvate kinase isozymes M1/M2, complete
cds, clone: PtsC-51-5_H07
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 2034 AGGCGTTGATCTTCCTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 1985
>ref|NM_001133611.1| Pongo abelii pyruvate kinase, muscle (PKM), mRNA
emb|CR925988.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459E1620 (from clone DKFZp459E1620)
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
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Sbjct 1918 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAGCCCACCAGTGCCACATTACA 1869
>emb|CR861086.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459J1115 (from clone DKFZp459J1115)
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Query 1 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA 50
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||
Sbjct 1886 AGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAGCCCACCAGTGCCACATTACA 1837
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT
>ref|XR_748791.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana pyruvate kinase PKM pseudogene
(LOC104668212), misc_RNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1422 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1471
>ref|XM_010364801.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana pyruvate kinase, muscle (PKM),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1618 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1667
>ref|XM_010364800.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana pyruvate kinase, muscle (PKM),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1611 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1660
>ref|XM_009429485.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X10, mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1289 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1338
>ref|XM_009429484.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X9, mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1451 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1500
>ref|XM_001175057.3| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X8, mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1667
>ref|XM_001175100.3| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X7, mRNA
Length=2501
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1667
>ref|XM_009429483.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X6, mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1642 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1691
>ref|XM_009429482.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X5, mRNA
Length=2525
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1642 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1691
>ref|XM_003952689.2| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1629 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1678
>ref|XM_009429481.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X3, mRNA
Length=2512
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1678
>ref|XM_003314742.3| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X2, mRNA
Length=2838
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1955 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 2004
>ref|XM_009429480.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X1, mRNA
Length=2560
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1726
>ref|XM_009210538.1| PREDICTED: Papio anubis pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X5, mRNA
Length=2189
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1289 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1338
>ref|XM_009210537.1| PREDICTED: Papio anubis pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1898
>ref|XM_003901150.2| PREDICTED: Papio anubis pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X3, mRNA
Length=2749
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1898
>ref|XM_009210536.1| PREDICTED: Papio anubis pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X2, mRNA
Length=2529
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1678
>ref|XM_009210535.1| PREDICTED: Papio anubis pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X1, mRNA
Length=2529
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1678
>ref|XM_008971888.1| PREDICTED: Pan paniscus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X8, mRNA
Length=2172
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1289 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1338
>ref|XM_008971887.1| PREDICTED: Pan paniscus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X7, mRNA
Length=2334
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1500
>ref|XM_003818551.2| PREDICTED: Pan paniscus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X6, mRNA
Length=2500
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1617 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1666
>ref|XM_008971886.1| PREDICTED: Pan paniscus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X5, mRNA
Length=2500
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1666
>ref|XM_008971885.1| PREDICTED: Pan paniscus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X4, mRNA
Length=2549
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1666 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1715
>ref|XM_008971884.1| PREDICTED: Pan paniscus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X3, mRNA
Length=2546
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1663 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1712
>ref|XM_003818555.2| PREDICTED: Pan paniscus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X2, mRNA
Length=2837
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1954 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 2003
>ref|XM_008971883.1| PREDICTED: Pan paniscus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X1, mRNA
Length=2559
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1725
>gb|KJ905271.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_14768 PKM2
gene, encodes complete protein
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1448
>gb|KJ891817.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01211 PKM2
gene, encodes complete protein
Length=1725
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1448
>ref|XM_007964863.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus pyruvate kinase PKM (LOC103217002),
mRNA
Length=2345
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1425 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1474
>ref|XM_005254445.2| PREDICTED: Homo sapiens pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X3, mRNA
Length=2725
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1842 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1891
>ref|XM_006720570.1| PREDICTED: Homo sapiens pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X4, mRNA
Length=2560
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1677 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1726
>gb|EU794631.1| Homo sapiens epididymis secretory protein Li 30 (HEL-S-30) mRNA,
complete cds
Length=2479
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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misc_RNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1580 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1629
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variant 5 (PKM), mRNA
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Sbjct 1676 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1725
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variant 4 (PKM), mRNA
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Sbjct 1523 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1572
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variant 3 (PKM), mRNA
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Sbjct 1606 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1655
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variant 2 (PKM), mRNA
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Sbjct 1415 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1464
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variant 1 (PKM), mRNA
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Sbjct 1386 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1435
>dbj|AK305453.1| Pan troglodytes mRNA for pyruvate kinase isozymes M1/M2, complete
cds, clone: PtsC-51-5_H07
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Sbjct 1630 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1679
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7, mRNA
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Sbjct 1523 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1572
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6, mRNA
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Sbjct 1643 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1692
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5, mRNA
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Sbjct 1396 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1445
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4, mRNA
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Sbjct 1955 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 2004
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3, mRNA
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Sbjct 1618 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1667
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2, mRNA
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Sbjct 1834 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1883
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1, mRNA
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Sbjct 1618 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1667
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variant 9 (PKM2), mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1634 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1683
>ref|XR_011777.2| PREDICTED: Macaca mulatta pyruvate kinase isozymes M1/M2-like
(PKM2), miscRNA
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Sbjct 1432 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1481
>dbj|AB528306.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB9947, Homo sapiens PKM2
gene for pyruvate kinase, muscle, without stop codon, in Flexi
system
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1343 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1392
>dbj|AK297951.1| Homo sapiens cDNA FLJ53368 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozymes M1/M2 (EC 2.7.1.40)
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1200 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1249
>dbj|AK299413.1| Homo sapiens cDNA FLJ53645 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozyme M1 (EC 2.7.1.40)
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1360 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1409
>dbj|AK294315.1| Homo sapiens cDNA FLJ56065 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozyme M1 (EC 2.7.1.40)
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1682 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1731
>dbj|AK300800.1| Homo sapiens cDNA FLJ54554 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozymes M1/M2 (EC 2.7.1.40)
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1447 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1496
>gb|EU832358.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067387; DKFZo008H1227
pyruvate kinase, muscle protein (PKM2) gene, encodes
complete protein
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Sbjct 1356 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1405
>gb|EU832443.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067472; DKFZo004H1228
pyruvate kinase, muscle protein (PKM2) gene, encodes
complete protein
Length=1639
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1356 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1405
>dbj|AK308264.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98212
Length=1568
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1447 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1496
>dbj|AK307855.1| Homo sapiens cDNA, FLJ97803
Length=2027
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1424 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1473
>dbj|AK309781.1| Homo sapiens cDNA, FLJ99822
Length=1808
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1525 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1574
>dbj|AK312253.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92548, highly similar to Homo sapiens pyruvate
kinase, muscle (PKM2), mRNA
Length=1684
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1422 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1471
>gb|EU176742.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011510; FLH189256.01L;
RZPDo839G10255D pyruvate kinase, muscle (PKM2) gene,
encodes complete protein
Length=1636
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1356 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1405
>gb|DQ892739.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005369; FLH189257.01X; RZPDo839D0374D
pyruvate kinase, muscle (PKM2) gene, encodes complete
protein
Length=1636
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1356 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1405
>dbj|AB170544.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-11373, similar to
human pyruvate kinase, muscle (PKM2), transcript variant 3,
mRNA, RefSeq: NM_182471.1
Length=1490
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1269 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1318
>dbj|AB170080.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10118, similar to
human pyruvate kinase, muscle (PKM2), transcript variant 3,
mRNA, RefSeq: NM_182471.1
Length=1857
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1422 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1471
>gb|BC051346.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6461886, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1728
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 821 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 870
>gb|BC035487.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone IMAGE:4779421),
with apparent retained intron
Length=3057
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 2122 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 2171
>gb|BC035198.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:9369
IMAGE:3859987), complete cds
Length=2286
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1388 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1437
>gb|BC007640.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:15908
IMAGE:3533876), complete cds
Length=2332
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1422 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1471
>gb|BC023328.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone IMAGE:4510296)
Length=1702
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 806 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 855
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Sbjct 770 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 819
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IMAGE:2964687), complete cds
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Sbjct 1438 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1487
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IMAGE:4299213), complete cds
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IMAGE:2958817), complete cds
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Sbjct 1434 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1483
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to Pyruvate kinase isozyme M1 (EC 2.7.1.40)
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Sbjct 1606 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1655
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Sbjct 32520 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 32569
>gb|BC094767.1| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:104654
IMAGE:5296639), complete cds
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Sbjct 983 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1032
>dbj|AB169642.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-10634, similar to
human pyruvate kinase, muscle (PKM2), transcript variant 3,mRNA,
RefSeq: NM_182471.1
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Sbjct 1472 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1521
>dbj|AK222927.1| Homo sapiens mRNA for pyruvate kinase 3 isoform 1 variant, clone:
HRC08174
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Sbjct 1422 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1471
>gb|AC020779.10| Homo sapiens chromosome 15, clone RP11-2I17, complete sequence
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Sbjct 137520 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 137471
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Sbjct 1623 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1672
>ref|NM_001133611.1| Pongo abelii pyruvate kinase, muscle (PKM), mRNA
emb|CR925988.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459E1620 (from clone DKFZp459E1620)
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Sbjct 1514 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1563
>emb|CR861086.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459J1115 (from clone DKFZp459J1115)
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Sbjct 1482 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1531
>gb|AY335562.1| Synthetic construct Homo sapiens pyruvate kinase, muscle (PKM2)
mRNA, partial cds
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Sbjct 1334 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1383
>dbj|AK098360.1| Homo sapiens cDNA FLJ25494 fis, clone CBR01476
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Sbjct 317 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 268
>emb|X56494.1| H.sapiens M gene for M1-type and M2-type pyruvate kinase
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Sbjct 9385 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 9434
>emb|BX648597.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686G12209 (from clone DKFZp686G12209)
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Sbjct 1425 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1474
>gb|BC023592.2| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle, mRNA (cDNA clone IMAGE:4646848)
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Sbjct 1384 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1433
>gb|AF025439.1|AF025439 Homo sapiens Opa-interacting protein OIP3 mRNA, partial cds
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Sbjct 233 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 282
>gb|M26252.1|HUMTCBA Human TCB gene encoding cytosolic thyroid hormone-binding protein,
complete cds
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1423 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1472
>gb|M23725.1|HUMPKM2L Human M2-type pyruvate kinase mRNA, complete cds
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1443 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1492
>ref|XM_003929667.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis pyruvate kinase, muscle
(PKM), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1623 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1672
>ref|XM_003929666.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis pyruvate kinase, muscle
(PKM), transcript variant X1, mRNA
Length=2496
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1623 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1672
>ref|XM_004088302.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys pyruvate kinase, muscle (PKM),
mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1287 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGAAATCCCCAGACAGCTCGT 1336
>ref|XM_004088301.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys pyruvate kinase, muscle (PKM),
mRNA
Length=2227
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1349 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGAAATCCCCAGACAGCTCGT 1398
>ref|XM_004088300.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys pyruvate kinase, muscle (PKM),
mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1114 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGAAATCCCCAGACAGCTCGT 1163
>ref|XM_003267174.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys pyruvate kinase, muscle, transcript
variant 2 (PKM), mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1289 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGAAATCCCCAGACAGCTCGT 1338
>ref|XM_003267173.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys pyruvate kinase, muscle, transcript
variant 1 (PKM), mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1430 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGAAATCCCCAGACAGCTCGT 1479
>ref|XM_003784664.1| PREDICTED: Otolemur garnettii pyruvate kinase, muscle (PKM),
mRNA
Length=1587
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCG 49
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Sbjct 1325 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATCCCCAGACAGCTCG 1373
>ref|XR_674498.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase PKM pseudogene (LOC104002294),
misc_RNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCT 47
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Sbjct 1311 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATCCCCAGACAGCT 1357
>ref|XR_642560.1| PREDICTED: Papio anubis pyruvate kinase PKM pseudogene (LOC101020231),
misc_RNA
Length=2294
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1407 GCCCACATGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGTTCGT 1456
>ref|XM_002753304.2| PREDICTED: Callithrix jacchus pyruvate kinase, muscle (PKM),
transcript variant X3, mRNA
Length=2160
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1289 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATGCCCAGACAGCTCGT 1338
>ref|XM_009005182.1| PREDICTED: Callithrix jacchus pyruvate kinase, muscle (PKM),
transcript variant X2, mRNA
Length=2499
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1628 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATGCCCAGACAGCTCGT 1677
>ref|XM_009005181.1| PREDICTED: Callithrix jacchus pyruvate kinase, muscle (PKM),
transcript variant X1, mRNA
Length=2330
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1459 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATGCCCAGACAGCTCGT 1508
>ref|XR_621948.1| PREDICTED: Callithrix jacchus pyruvate kinase PKM pseudogene
(LOC100403086), misc_RNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
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Sbjct 1414 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATGCCCAGACAGCTCGT 1463
>ref|XR_619453.1| PREDICTED: Callithrix jacchus pyruvate kinase PKM pseudogene
(LOC100389879), misc_RNA
Length=2293
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1422 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATGCCCAGACAGCTCGT 1471
>ref|XR_087022.3| PREDICTED: Callithrix jacchus pyruvate kinase PKM pseudogene
(LOC100412425), misc_RNA
Length=2049
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1474 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATGCCCAGACAGCTCGT 1523
>ref|NG_022800.2| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle pseudogene 1 (PKMP1) on
chromosome 1
Length=1761
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCT 47
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1468 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATCCCCAGACAGCT 1514
>ref|XR_179180.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys pyruvate kinase isozymes M1/M2-like
(LOC100588959), misc_RNA
Length=1534
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGT 50
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1272 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACATGGAATCCCCAGACAGCTCGT 1321
>ref|XR_173649.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla pyruvate kinase isozymes M1/M2-like
(LOC101145858), misc_RNA
Length=1678
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCT 47
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1359 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATCCCCAGACAGCT 1405
>emb|AL390241.19| Human DNA sequence from clone RP11-343L14 on chromosome 1, complete
sequence
Length=123501
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCT 47
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 77085 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACGGAATCCCCAGACAGCT 77131
>ref|XM_006922661.1| PREDICTED: Pteropus alecto pyruvate kinase, muscle (PKM), mRNA
Length=2292
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCG 49
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1410 GCCCCCGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1458
>ref|XM_004711955.1| PREDICTED: Echinops telfairi pyruvate kinase, muscle (PKM), mRNA
Length=1485
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCG 49
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1223 GCCCACGCGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACGGCTCG 1271
>ref|XR_012269.2| PREDICTED: Macaca mulatta pyruvate kinase isozymes M1/M2-like
(LOC710694), miscRNA
Length=1716
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCT 47
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 1448 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACACAGAATCCCCAGACAGCT 1494
>ref|XM_008527050.1| PREDICTED: Equus przewalskii pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X3, mRNA
Length=2391
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCG 49
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Sbjct 1581 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1629
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Sbjct 1436 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1484
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Sbjct 1295 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1343
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Sbjct 1582 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1630
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Sbjct 1604 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1652
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Sbjct 1595 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1643
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Sbjct 1487 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1535
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Sbjct 1570 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1618
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Sbjct 1585 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1633
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Sbjct 2009 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 2057
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Sbjct 2450 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 2498
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Sbjct 3584 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 3632
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Sbjct 3587 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 3635
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Sbjct 3648 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 3696
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Sbjct 3603 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 3651
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Sbjct 3803 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 3851
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Sbjct 3647 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 3695
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1292 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1340
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1517 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1565
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transcript variant X5, mRNA
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transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 1555 GCCCCCGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACTGCTCG 1603
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1553 GCCCCCGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACTGCTCG 1601
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1289 GCCCCCGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACTGCTCG 1337
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1455 GCCCCCGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACTGCTCG 1503
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1543 GCCCCCGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACTGCTCG 1591
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transcript variant 6 (PKM), mRNA
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transcript variant 5 (PKM), mRNA
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Sbjct 1535 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1583
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Sbjct 1119 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1167
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transcript variant 3 (PKM), mRNA
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Sbjct 1366 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1414
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Sbjct 1366 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1414
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Sbjct 1366 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1414
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mRNA
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Sbjct 1588 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1636
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Sbjct 1436 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1484
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3 (PKM), mRNA
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Sbjct 1112 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1160
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Sbjct 1468 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1516
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1 (PKM), mRNA
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Sbjct 1589 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1637
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5 (PKM), mRNA
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Sbjct 1112 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1160
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4 (PKM), mRNA
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Sbjct 1432 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1480
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Sbjct 1295 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1343
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2 (PKM), mRNA
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Sbjct 1395 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1443
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1 (PKM), mRNA
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Sbjct 1527 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1575
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muscle
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Sbjct 404 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 452
>dbj|AK394669.1| Sus scrofa mRNA, clone: MLTL10044F02, expressed in longissimus
muscle
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Sbjct 518 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 566
>dbj|AK394600.1| Sus scrofa mRNA, clone: MLTL10011E09, expressed in longissimus
muscle
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Sbjct 1406 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1454
>dbj|AK399984.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10113F08, expressed in hypothalamus
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Sbjct 1473 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1521
>dbj|AK398287.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010096B04, expressed in testis
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Sbjct 692 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 740
>dbj|AK390709.1| Sus scrofa mRNA, clone: BKFL10051B09, expressed in backfat
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Sbjct 507 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 555
>dbj|AK390609.1| Sus scrofa mRNA, clone: BKFL10005C09, expressed in backfat
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCG 49
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Sbjct 1551 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1599
>dbj|AK399587.1| Sus scrofa mRNA, clone: DCI010092H11, expressed in dendritic
cells (immature)
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Sbjct 1434 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1482
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Sbjct 1435 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1483
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Sbjct 1436 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1484
>dbj|AK394756.1| Sus scrofa mRNA, clone: MLTL10089G01, expressed in longissimus
muscle
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Sbjct 565 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 613
>ref|XM_002919702.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca pyruvate kinase, muscle (PKM2),
mRNA
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCG 49
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Sbjct 1392 GCCCCCGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACTGCTCG 1440
>ref|NM_001143794.1| Equus caballus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript variant
2, mRNA
dbj|AB355735.1| Equus caballus PKM mRNA for M2-type pyruvate kinase, complete
cds
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Sbjct 1492 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1540
>ref|NM_001159690.1| Equus caballus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript variant
1, mRNA
dbj|AB355734.1| Equus caballus PKM mRNA for M1-type pyruvate kinase, complete
cds
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Sbjct 1436 GCCCCCGGGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1484
>dbj|AK239164.1| Sus scrofa mRNA, clone:THY010069E04, expressed in thymus
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCG 49
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Sbjct 1092 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1140
>dbj|AK235858.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10120G10, expressed in ovary
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Query 1 GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCG 49
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Sbjct 1440 GCCCCCGAGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCACCAGACAGCTCG 1488
>dbj|AK235447.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10083A01, expressed in ovary
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15 15 72491603 72491703 100M AACTCTTGCTGGCTGTTTCTTGACCCCAAGCCAGGGTTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAA
15 15 72491606 72491706 100M TCTTGCTGGCTGTTTCTTGACCCCAAGCCAGGGGTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCT
15 15 72491609 72491709 100M TGCTGGCTGTTTCTTGACCCCAAGCCAGGGTTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGGACACACAGGAAAGGAAGCTGTC
15 15 72491612 72491712 100M TGGCTGTTTCTTGACCCCAAGCCAGGGTTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACC
15 15 72491615 72491715 100M CTGTTTCTTGACCCCAAGCCAGGGTTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTC
15 15 72491618 72491718 100M TTTCTTGACCCCAAGCCAGGGTTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTG
15 15 72491621 72491721 100M CTTGACCCCAAGCCAGGGTTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCA
15 15 72491624 72491724 100M GACCCCAAGCCAGGGTTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCAATCT
15 15 72491627 72491727 100M CCCAAGCCAGGGTTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGC
15 15 72491630 72491730 100M AAGCCAGGGTTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCC
15 15 72491633 72491733 100M CCAGGGTTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGAACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCAAGG
15 15 72491636 72491736 100M GGGTTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGC
15 15 72491639 72491739 100M TTGGGAGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTC
15 15 72491642 72491742 100M GGGGTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAG
15 15 72491645 72491745 100M GTCCTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCC
15 15 72491648 72491748 100M CTCTGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGC
15 15 72491651 72491751 100M TGGGCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATT
15 15 72491654 72491754 100M GCATCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCT
15 15 72491657 72491757 100M TCCATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCT
15 15 72491660 72491760 100M ATTTTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCT
15 15 72491663 72491763 100M TTTTCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCATCCTTCTTCC
15 15 72491666 72491766 100M TCTAAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTT
15 15 72491669 72491769 100M AAAGGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGAT
15 15 72491672 72491772 100M GGAACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGG
15 15 72491675 72491775 100M ACTGGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTG
15 15 72491678 72491778 100M GGACAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGG
15 15 72491681 72491781 100M CAGAGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCA
15 15 72491684 72491784 100M AGTACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCGCAT
15 15 72491687 72491787 100M ACACACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGAT
15 15 72491690 72491790 100M CACAGGAAAGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGG
15 15 72491693 72491793 100M AGGANNGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAG
15 15 72491696 72491796 100M AACGGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCA
15 15 72491699 72491799 100M GGAAGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGC
15 15 72491702 72491802 100M AGCTGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCT
15 15 72491705 72491805 100M TGTCACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGG
15 15 72491708 72491808 100M CACCCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTGCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTG
15 15 72491711 72491811 100M CCTCTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCC
15 15 72491714 72491814 100M CTTGCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCAC
15 15 72491717 72491817 100M GCCATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAG
15 15 72491720 72491820 100M ATCTGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGC
15 15 72491723 72491823 100M TGGCTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGG
15 15 72491726 72491826 100M CTCCAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTG
15 15 72491729 72491829 100M CAGGGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCCTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAA
15 15 72491732 72491832 100M GGGCCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACA
15 15 72491735 72491835 100M CCTCCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAG
15 15 72491738 72491838 100M CCAGTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCA
15 15 72491741 72491841 100M GTCCAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGT
15 15 72491744 72491844 100M CAGCATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTC
15 15 72491747 72491847 100M CATTCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGT
15 15 72491750 72491850 100M TCCTCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGGTGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAG
15 15 72491753 72491853 100M TCCTTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCG
15 15 72491756 72491856 100M TTCTTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTG
15 15 72491759 72491859 100M TTCCCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATC
15 15 72491762 72491862 100M CCTTGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTC
15 15 72491765 72491865 100M TGATTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTC
15 15 72491768 72491868 100M TTGGGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCT
15 15 72491771 72491871 100M GGTGGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGT
15 15 72491774 72491874 100M GGGGCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTC
15 15 72491777 72491877 100M GCCACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCA
15 15 72491780 72491880 100M ACATGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGGTGTTCTTCCCTGGTGTCCCAACC
15 15 72491783 72491883 100M TGATGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTAC
15 15 72491786 72491886 100M TGGGCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAG
15 15 72491789 72491889 100M GCAGCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCCGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGC
15 15 72491792 72491892 100M GCCAGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCAC
15 15 72491795 72491895 100M AGGCTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTT
15 15 72491798 72491898 100M CTCTGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA
15 15 72491801 72491901 100M TGGGCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACAGCC
15 15 72491804 72491904 100M GCTGTCCCACTAGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACAGCCCAG
15 15 72491815 72492952 83M72492970F17m AGAGCCGGCTGCTAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA GCCCACGTGCCCCCATC
15 15 72491815 72492952 83M72492970F17m AGAGCAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA GCCCACGTGCCCCCATC
15 15 72491817 72492950 81M72492970F19m AGGAGGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGCCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA GCCCACGTGCCCCCATCAT
15 15 72491821 72492946 77M72492970F23m GGCTGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA GCCCACGTGCCCCCATCATTGCT
15 15 72491824 72492943 74M72492970F26m TGCAAACACAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTG
15 15 72491824 72492943 74M72492970F26m TGCAAACCCAGCCATGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTG
15 15 72491838 72492929 60M72492970F40m TGTTTCAGTGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTACCAACCTACCAGTGCCACGTTACA GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCA
15 15 72491846 72492921 52M72492970F48m TGAGGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTC
15 15 72491849 72492918 49M72492970F51m GGCGTTGATCTTCTTCCCTGGTGTCCCAACCTACCAGTGCCACGTTACA GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTC
15 15 72491891 72492876 7M72492970F93m CGTTACA GCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGG
15 15 72492977 72492877 100m CAGATCCCGCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAG
15 15 72492974 72492874 100m ATACCGCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGAAC
15 15 72492971 72492871 100m CCGCCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCA
15 15 72492968 72492868 100m CCCACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTC
15 15 72492965 72492865 100m ACGTGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAG
15 15 72492962 72492862 100m TGCCCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGGCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAG
15 15 72492959 72492859 100m CCCCATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCC
15 15 72492956 72492856 100m CATCATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGG
15 15 72492953 72492853 100m CATTGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCT
15 15 72492950 72492850 100m TGCTGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAG
15 15 72492947 72492847 100m TGTGACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGAC
15 15 72492944 72492844 100m GACCCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTG
15 15 72492941 72492841 100m CCGGAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGAC
15 15 72492938 72492838 100m GAATCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTC
15 15 72492935 72492835 100m TCCCCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGG
15 15 72492932 72492832 100m CCAGACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTG
15 15 72492929 72492829 100m GACAGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAAC
15 15 72492926 72492826 100m AGCTCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTT
15 15 72492923 72492823 100m TCGTCAGGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCC
15 15 72492920 72492820 100m TCAGGCCCCCCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATG
15 15 72492917 72492817 100m GGCCCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATGAAT
15 15 72492914 72492814 100m CCACCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATGAATGTT
15 15 72492911 72492094 98m717n2m CCTGTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATGAATGTTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 15 72492908 72492091 95m717n5m GTACCGTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATGAATGTTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 15 72492903 72492086 90m717n10m GTGGCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATGAATGTTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 15 72492900 72492083 87m717n13m GCATCTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATGAATGTTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 15 72492896 72492796 100m CTTCCCTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATGAATGTTGGTACGTGGCTGGAGCAG
15 15 72492891 72492074 78m717n22m CTGTGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATGAATGTTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 15 72492888 72492071 75m717n25m TGCTGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATGAATGTTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 15 72492885 72492068 72m717n28m TGTGCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATGAATGTTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 15 72492882 72492065 69m717n31m GCAAGGACCCAGTCCAGGAGGCCTGGGCTGAGGACGTGGACCTCCGGGTGAACTTTGCCATGAATGTTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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gene, encodes complete protein
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 895 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 846
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variant X4, mRNA
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complete cds
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variant 2 (PKM), mRNA
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Sbjct 911 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 862
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variant 1 (PKM), mRNA
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cds, clone: PtsC-51-5_H07
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7, mRNA
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6, mRNA
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5, mRNA
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Sbjct 892 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 843
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4, mRNA
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Sbjct 1451 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 1402
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3, mRNA
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>ref|NM_182470.2| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript variant
2, mRNA
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1, mRNA
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Sbjct 1114 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 1065
>dbj|AB528306.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB9947, Homo sapiens PKM2
gene for pyruvate kinase, muscle, without stop codon, in Flexi
system
Length=1610
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Sbjct 839 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 790
>dbj|AK297951.1| Homo sapiens cDNA FLJ53368 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozymes M1/M2 (EC 2.7.1.40)
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Sbjct 696 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 647
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Sbjct 2304 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 2255
>dbj|AK299413.1| Homo sapiens cDNA FLJ53645 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozyme M1 (EC 2.7.1.40)
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Sbjct 856 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 807
>dbj|AK294315.1| Homo sapiens cDNA FLJ56065 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozyme M1 (EC 2.7.1.40)
Length=2004
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 1178 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 1129
>dbj|AK300800.1| Homo sapiens cDNA FLJ54554 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozymes M1/M2 (EC 2.7.1.40)
Length=2254
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Sbjct 943 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 894
>gb|EU832358.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067387; DKFZo008H1227
pyruvate kinase, muscle protein (PKM2) gene, encodes
complete protein
Length=1639
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Sbjct 852 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 803
>gb|EU832443.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067472; DKFZo004H1228
pyruvate kinase, muscle protein (PKM2) gene, encodes
complete protein
Length=1639
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 852 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 803
>dbj|AK308264.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98212
Length=1568
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 943 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 894
>dbj|AK307855.1| Homo sapiens cDNA, FLJ97803
Length=2027
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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pyruvate kinase, muscle (PKM2) gene, encodes complete
protein
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Sbjct 930 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 881
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to Pyruvate kinase isozyme M1 (EC 2.7.1.40)
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HRC08174
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mRNA, partial cds
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complete cds
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>ref|XM_003929666.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis pyruvate kinase, muscle
(PKM), transcript variant X1, mRNA
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misc_RNA
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Sbjct 903 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 854
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variant X5, mRNA
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variant X4, mRNA
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variant X3, mRNA
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Sbjct 1345 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 1296
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1125 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 1076
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variant X1, mRNA
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mRNA
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Sbjct 921 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 872
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Sbjct 1227 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 1178
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Sbjct 1227 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 1178
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1071 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 1022
>ref|XM_005559963.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865678 (LOC101865678),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1076 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 1027
>ref|XM_005559962.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865678 (LOC101865678),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1112 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 1063
>ref|XM_005559961.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865678 (LOC101865678),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1112 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 1063
>ref|XR_275678.1| PREDICTED: Macaca fascicularis pyruvate kinase PKM-like (LOC102125474),
misc_RNA
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Sbjct 912 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 863
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mRNA
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Sbjct 783 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 734
>ref|XM_004088301.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys pyruvate kinase, muscle (PKM),
mRNA
Length=2227
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Query 1 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT 50
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Sbjct 845 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 796
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mRNA
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variant 2 (PKM), mRNA
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variant 1 (PKM), mRNA
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mRNA
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variant 9 (PKM2), mRNA
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(LOC100427163), miscRNA
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mRNA
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(PKM2), miscRNA
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human pyruvate kinase, muscle (PKM2), transcript variant 3,
mRNA, RefSeq: NM_182471.1
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human pyruvate kinase, muscle (PKM2), transcript variant 3,
mRNA, RefSeq: NM_182471.1
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Sbjct 918 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTTCTTTCCCTT 869
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emb|CR925988.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459E1620 (from clone DKFZp459E1620)
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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(LOC100406845), misc_RNA
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(LOC100389879), misc_RNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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variant 2 (PKM2), mRNA
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Sbjct 861 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTCGTTTCCCTT 812
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variant 1 (PKM2), mRNA
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Sbjct 950 ACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATTATCTTGATGTCGTTTCCCTT 901
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 985 TCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTT-CCCTT 943
>ref|XM_008836420.1| PREDICTED: Nannospalax galili pyruvate kinase, muscle (Pkm),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 982 TCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTT-CCCTT 940
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC
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pseudogene (LOC101032756), misc_RNA
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>ref|XR_748791.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana pyruvate kinase PKM pseudogene
(LOC104668212), misc_RNA
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Sbjct 504 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 553
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 700 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 749
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 693 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 742
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variant X10, mRNA
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Sbjct 371 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 420
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Sbjct 533 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 582
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variant X8, mRNA
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Sbjct 700 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 749
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variant X7, mRNA
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Sbjct 700 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 749
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variant X6, mRNA
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Sbjct 724 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 773
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variant X5, mRNA
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Sbjct 724 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 773
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variant X4, mRNA
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Sbjct 711 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 760
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variant X3, mRNA
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Sbjct 711 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 760
>ref|XM_003314742.3| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 1037 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 1086
>ref|XM_009429480.1| PREDICTED: Pan troglodytes pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 759 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 808
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variant X5, mRNA
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Sbjct 371 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 420
>ref|XM_009210537.1| PREDICTED: Papio anubis pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 931 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 980
>ref|XM_003901150.2| PREDICTED: Papio anubis pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 931 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 980
>ref|XM_009210536.1| PREDICTED: Papio anubis pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 711 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 760
>ref|XM_009210535.1| PREDICTED: Papio anubis pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 711 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 760
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variant X8, mRNA
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Sbjct 371 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 420
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variant X7, mRNA
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Sbjct 533 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 582
>ref|XM_003818551.2| PREDICTED: Pan paniscus pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript
variant X6, mRNA
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Sbjct 699 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 748
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variant X5, mRNA
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Sbjct 699 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 748
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variant X4, mRNA
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Sbjct 748 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 797
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variant X3, mRNA
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Sbjct 745 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 794
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1036 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 1085
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variant X1, mRNA
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Sbjct 758 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 807
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(LOC100412425), misc_RNA
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Sbjct 555 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 604
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 481 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 530
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 481 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 530
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variant X3, mRNA
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Sbjct 924 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 973
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variant X4, mRNA
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Sbjct 759 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 808
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complete cds
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Sbjct 657 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 706
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 197 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 246
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 416 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 465
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transcript variant X7, mRNA
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Sbjct 1131 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 1180
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transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 813 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 862
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transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 813 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 862
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transcript variant X4, mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 657 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 706
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 662 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 711
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 698 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 747
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transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 698 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 747
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variant X1, mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 662 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 711
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variant 5 (PKM), mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 758 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 807
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variant 4 (PKM), mRNA
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Sbjct 605 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 654
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variant 3 (PKM), mRNA
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Sbjct 688 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 737
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variant 2 (PKM), mRNA
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Sbjct 497 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 546
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variant 1 (PKM), mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 468 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 517
>dbj|AK305453.1| Pan troglodytes mRNA for pyruvate kinase isozymes M1/M2, complete
cds, clone: PtsC-51-5_H07
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 712 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 761
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7, mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 605 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 654
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6, mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 725 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 774
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5, mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 478 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 527
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4, mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 1037 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 1086
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3, mRNA
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Sbjct 700 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 749
>ref|NM_182470.2| Homo sapiens pyruvate kinase, muscle (PKM), transcript variant
2, mRNA
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Sbjct 916 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 965
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1, mRNA
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Sbjct 700 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 749
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mRNA
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Sbjct 478 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 429
>ref|XM_001091427.2| PREDICTED: Macaca mulatta pyruvate kinase, muscle, transcript
variant 9 (PKM2), mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 716 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 765
>ref|XM_002799389.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical protein LOC100429691 (LOC100429691),
mRNA
Length=681
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 170 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 121
>ref|XM_002799385.1| PREDICTED: Macaca mulatta pyruvate kinase, muscle, transcript
variant 2 (PKM2), mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 447 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 496
>ref|XM_001099473.2| PREDICTED: Macaca mulatta pyruvate kinase, muscle, transcript
variant 1 (PKM2), mRNA
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 536 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 585
>dbj|AB528306.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB9947, Homo sapiens PKM2
gene for pyruvate kinase, muscle, without stop codon, in Flexi
system
Length=1610
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 425 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 474
>dbj|AK297951.1| Homo sapiens cDNA FLJ53368 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozymes M1/M2 (EC 2.7.1.40)
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 282 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 331
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 1890 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 1939
>dbj|AK299413.1| Homo sapiens cDNA FLJ53645 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozyme M1 (EC 2.7.1.40)
Length=2240
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 442 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 491
>dbj|AK294315.1| Homo sapiens cDNA FLJ56065 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozyme M1 (EC 2.7.1.40)
Length=2004
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 764 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 813
>dbj|AK300800.1| Homo sapiens cDNA FLJ54554 complete cds, highly similar to Pyruvate
kinase isozymes M1/M2 (EC 2.7.1.40)
Length=2254
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 529 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 578
>gb|EU832358.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067387; DKFZo008H1227
pyruvate kinase, muscle protein (PKM2) gene, encodes
complete protein
Length=1639
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pyruvate kinase, muscle protein (PKM2) gene, encodes
complete protein
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kinase, muscle (PKM2), mRNA
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RZPDo839G10255D pyruvate kinase, muscle (PKM2) gene,
encodes complete protein
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pyruvate kinase, muscle (PKM2) gene, encodes complete
protein
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Sbjct 438 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 487
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human pyruvate kinase, muscle (PKM2), transcript variant 3,
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human pyruvate kinase, muscle (PKM2), transcript variant 3,
mRNA, RefSeq: NM_182471.1
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human pyruvate kinase, muscle (PKM2), transcript variant 3,
mRNA, RefSeq: NM_182471.1
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Sbjct 470 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 519
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Sbjct 516 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 565
>dbj|AK092369.1| Homo sapiens cDNA FLJ35050 fis, clone OCBBF2018167, highly similar
to Pyruvate kinase isozyme M1 (EC 2.7.1.40)
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Sbjct 688 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 737
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Sbjct 23326 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 23375
>dbj|AB169642.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-10634, similar to
human pyruvate kinase, muscle (PKM2), transcript variant 3,mRNA,
RefSeq: NM_182471.1
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Sbjct 554 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 603
>dbj|AK222927.1| Homo sapiens mRNA for pyruvate kinase 3 isoform 1 variant, clone:
HRC08174
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Sbjct 504 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 553
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Sbjct 146713 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 146664
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Sbjct 705 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 754
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mRNA, partial cds
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Sbjct 416 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 465
>emb|X56494.1| H.sapiens M gene for M1-type and M2-type pyruvate kinase
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Sbjct 2166 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 2215
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Sbjct 466 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 515
>gb|M26252.1|HUMTCBA Human TCB gene encoding cytosolic thyroid hormone-binding protein,
complete cds
Length=2306
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Sbjct 505 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 554
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Sbjct 525 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 574
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 371 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAGAAGTGTGACGAGAAC 420
>ref|XM_009005182.1| PREDICTED: Callithrix jacchus pyruvate kinase, muscle (PKM),
transcript variant X2, mRNA
Length=2499
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Sbjct 710 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAGAAGTGTGACGAGAAC 759
>ref|XM_009005181.1| PREDICTED: Callithrix jacchus pyruvate kinase, muscle (PKM),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 541 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAGAAGTGTGACGAGAAC 590
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(LOC100389879), misc_RNA
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Sbjct 504 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAGAAGTGTGACGAGAAC 553
>ref|XM_008017401.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus pyruvate kinase, muscle (PKM),
mRNA
Length=2366
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 578 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGATGAGAAC 627
>ref|XM_007964863.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus pyruvate kinase PKM (LOC103217002),
mRNA
Length=2345
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 507 CTCTCAGAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 556
>ref|XR_011777.2| PREDICTED: Macaca mulatta pyruvate kinase isozymes M1/M2-like
(PKM2), miscRNA
Length=2355
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 4 TCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 TCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 563
>ref|NM_001133611.1| Pongo abelii pyruvate kinase, muscle (PKM), mRNA
emb|CR925988.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459E1620 (from clone DKFZp459E1620)
Length=2411
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Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 596 CTCTCAAAATCACACTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 645
>ref|XR_275678.1| PREDICTED: Macaca fascicularis pyruvate kinase PKM-like (LOC102125474),
misc_RNA
Length=2324
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 CTCTC-AAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 547
>ref|XR_621948.1| PREDICTED: Callithrix jacchus pyruvate kinase PKM pseudogene
(LOC100403086), misc_RNA
Length=2260
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 496 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAGAAGTGTGACAAGAAC 545
>ref|XR_122787.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys pyruvate kinase isozymes M1/M2-like
(LOC100596259), misc_RNA
Length=2300
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 487 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACGTGGAAACGTGTGACGAGAAC 536
>emb|CR861086.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459J1115 (from clone DKFZp459J1115)
Length=2382
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 564 CTCTCAAAATCACACTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGGCGAGAAC 613
>ref|XM_007197768.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni pyruvate kinase,
muscle (PKM), transcript variant X2, mRNA
Length=2354
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 CTCAAGATCACCCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 582
>ref|XM_007197767.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni pyruvate kinase,
muscle (PKM), transcript variant X1, mRNA
Length=2487
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 CTCAAGATCACCCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 715
>ref|XM_004325353.1| PREDICTED: Tursiops truncatus pyruvate kinase, muscle (PKM),
mRNA
Length=2495
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 3 CTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 672 CTCAAGATCACCCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 719
>ref|XM_004276266.1| PREDICTED: Orcinus orca pyruvate kinase, muscle, transcript variant
4 (PKM), mRNA
Length=2345
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 3 CTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520 CTCAAGATCACCCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 567
>ref|XM_004276265.1| PREDICTED: Orcinus orca pyruvate kinase, muscle, transcript variant
3 (PKM), mRNA
Length=2020
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 3 CTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 196 CTCAAGATCACCCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 243
>ref|XM_004276264.1| PREDICTED: Orcinus orca pyruvate kinase, muscle, transcript variant
2 (PKM), mRNA
Length=2377
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 50
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Sbjct 552 CTCAAGATCACCCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTGTGACGAGAAC 599
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15 15 72499579 72502157 39M1343N56M72502163F5m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCGAACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT CTCTC
15 15 72499579 72502157 39M1343N56M72502163F5m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCGAACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT CTCTC
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15 15 72499580 72502156 38M1343N56M72502163F6m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCGAACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT CTCTCA
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15 15 72499614 72502122 4M1343N56M72502163F40m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCGAACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTG
15 15 72499614 72502122 4M1343N56M72502163F40m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCGAACCCCCTCATGATTCTCGATTTTGCTGATAATCTTGATGTTCTTTCCCTT CTCTCAAAATCACGCTGGATAACGCCTACATGGAAAAGTG
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 128485 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 128436
>ref|AC_000148.1| Homo sapiens chromosome 16, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000477.1| Homo sapiens chromosome 16, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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HSCHR6_CTG1
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assembly
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 42667516 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 42667561
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genome shotgun sequence
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 42697755 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 42697800
>ref|NW_004929326.1| Homo sapiens chromosome 6 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 42637755 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 42637800
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shotgun sequence
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 15016661 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 15016616
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shotgun sequence
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 8966528 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 8966573
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 42413674 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 42413719
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shotgun sequence
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 14854395 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 14854350
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 43092324 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 43092369
>ref|NW_001838981.2| Homo sapiens chromosome 6 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188350, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 14854420 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 14854375
>gb|CH471081.1| Homo sapiens 211000035843014 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 15711827 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 15711872
>ref|AC_000138.1| Homo sapiens chromosome 6, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 42413478 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 42413523
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
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Sbjct 44247506 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 44247551
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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blast search - nt
left flanking sequence - GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG
>ref|NM_001694.3| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c (ATP6V0C), transcript variant 1, mRNA
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Query 1 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
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Sbjct 190 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 141
>gb|BC007759.2| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c, mRNA (cDNA clone MGC:12873 IMAGE:4127653), complete
cds
Length=1069
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Query 1 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
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Sbjct 62 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 13
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c, mRNA (cDNA clone MGC:16271 IMAGE:3831016), complete
cds
Length=1134
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 29
>gb|BC004537.2| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c, mRNA (cDNA clone MGC:3723 IMAGE:3618755), complete cds
Length=1077
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
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Sbjct 74 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 25
>gb|AC093525.3| Homo sapiens chromosome 16 clone RP11-20I23, complete sequence
Length=157518
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Query 1 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79181 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 79230
>gb|BC009290.2| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c, mRNA (cDNA clone MGC:16615 IMAGE:4111426), complete
cds
Length=1113
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 95 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 46
>dbj|AB046575.1| Homo sapiens ATP6 gene for V-ATPase subunit c, promoter and exon
1, partial cds
Length=2207
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1948 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 1899
>gb|M62762.1|HUMPCHSUCA Human vacuolar H+ ATPase proton channel subunit mRNA, complete
cds
Length=1162
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 186 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 137
>ref|XM_510748.4| PREDICTED: Pan troglodytes ATPase, H+ transporting, lysosomal
16kDa, V0 subunit c (ATP6V0C), mRNA
Length=1318
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 GAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 296
>ref|XM_004057017.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ATPase, H+ transporting, lysosomal
16kDa, V0 subunit c, transcript variant 3 (ATP6V0C),
mRNA
Length=1001
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 344 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCGCGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 295
>ref|XM_004057016.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ATPase, H+ transporting, lysosomal
16kDa, V0 subunit c, transcript variant 2 (ATP6V0C),
mRNA
Length=1104
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 344 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCGCGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 295
>ref|XM_004057015.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ATPase, H+ transporting, lysosomal
16kDa, V0 subunit c, transcript variant 1 (ATP6V0C),
mRNA
Length=1335
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 344 GCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCGCGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 295
>gb|AC194531.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-680G12 from chromosome 16, complete
sequence
Length=202929
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166818 GAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG 166772
>ref|XM_003269178.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ATPase, H+ transporting, lysosomal
16kDa, V0 subunit c, transcript variant 1 (ATP6V0C), mRNA
Length=1117
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC
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16kDa, V0 subunit c (ATP6V0C), mRNA
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V0 subunit c (ATP6V0C), mRNA
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V0 subunit c (ATP6V0C), mRNA
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V0 subunit c (ATP6V0C), mRNA
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gene, encodes complete protein
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protein, encodes complete protein
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 349 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 398
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16kDa, V0 subunit c (ATP6V0C), mRNA
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mRNA
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16kDa, V0 subunit c, transcript variant 3 (ATP6V0C),
mRNA
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Sbjct 672 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 721
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16kDa, V0 subunit c, transcript variant 2 (ATP6V0C),
mRNA
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Sbjct 672 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 721
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16kDa, V0 subunit c, transcript variant 1 (ATP6V0C),
mRNA
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Sbjct 672 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 721
>gb|JF432578.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100073814 ATPase,
H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit c (ATP6V0C) gene,
encodes complete protein
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Sbjct 334 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 383
>gb|JF432559.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100073789 ATPase,
H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit c (ATP6V0C) gene,
encodes complete protein
Length=567
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Sbjct 334 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 383
>ref|NM_001198569.1| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c (ATP6V0C), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 359 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 408
>ref|NM_001694.3| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c (ATP6V0C), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 518 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 567
>ref|XM_001085529.2| PREDICTED: Macaca mulatta v-type proton ATPase 16 kDa proteolipid
subunit-like (LOC696918), mRNA
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Sbjct 284 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 333
>gb|AC194531.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-680G12 from chromosome 16, complete
sequence
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Sbjct 172281 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 172330
>dbj|AB463422.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8261, Homo sapiens ATP6V0C
gene for ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c, without stop codon, in Flexi system
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Sbjct 293 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 342
>gb|BC010147.1| Homo sapiens mRNA similar to ATPase, H+ transporting, lysosomal
(vacuolar proton pump) 16kD (cDNA clone IMAGE:4329609)
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>gb|BC007759.2| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c, mRNA (cDNA clone MGC:12873 IMAGE:4127653), complete
cds
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>gb|BC007389.2| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c, mRNA (cDNA clone MGC:16271 IMAGE:3831016), complete
cds
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Sbjct 406 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 455
>gb|BT007459.1| Synthetic construct Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal
16kDa, V0 subunit c mRNA, partial cds
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Sbjct 284 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 333
>gb|BT007155.1| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c mRNA, complete cds
Length=468
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Sbjct 284 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 333
>gb|BC004537.2| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c, mRNA (cDNA clone MGC:3723 IMAGE:3618755), complete cds
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Sbjct 402 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 451
>emb|CR541951.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0134D
for gene ATP6V0C, ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa,
V0 subunit c; complete cds, without stopcodon
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Sbjct 284 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 333
>emb|CR541930.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B0334D
for gene ATP6V0C, ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa,
V0 subunit c; complete cds, incl. stopcodon
Length=468
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Sbjct 284 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 333
>gb|AC093525.3| Homo sapiens chromosome 16 clone RP11-20I23, complete sequence
Length=157518
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Sbjct 73679 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 73630
>gb|AY889986.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH014566.01X ATPase lysosomal
V0 subunit c (ATP6V0C) mRNA, complete cds
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Sbjct 284 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 333
>gb|AY892471.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH014562.01L ATPase H+
transporting lysosomal 16kDa V0 subunit c (ATP6V0C) mRNA,
partial cds
Length=468
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Sbjct 284 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 333
>gb|BC009290.2| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit
c, mRNA (cDNA clone MGC:16615 IMAGE:4111426), complete
cds
Length=1113
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Sbjct 423 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 472
>gb|M62762.1|HUMPCHSUCA Human vacuolar H+ ATPase proton channel subunit mRNA, complete
cds
Length=1162
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Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 563
>ref|XM_010387894.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ATPase, H+ transporting, lysosomal
16kDa, V0 subunit c (ATP6V0C), mRNA
Length=1167
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 GGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 560
>ref|XM_003269178.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ATPase, H+ transporting, lysosomal
16kDa, V0 subunit c, transcript variant 1 (ATP6V0C), mRNA
Length=1117
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
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Sbjct 674 GGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 721
>ref|XM_009241881.1| PREDICTED: Pongo abelii V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid
subunit-like (LOC103890896), mRNA
Length=1086
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 401 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 446
>ref|NG_009176.1| Homo sapiens peripherin 2 (retinal degeneration, slow) (PRPH2),
RefSeqGene on chromosome 6
Length=33026
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 60
>emb|AL049843.18| Human DNA sequence from clone RP3-392M17 on chromosome 6p12.3-21.2,
complete sequence
Length=110900
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12639 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 12594
>ref|XM_008251991.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus ATPase, H+ transporting, lysosomal
16kDa, V0 subunit c (ATP6V0C), mRNA
Length=1193
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 583 GGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCTGGCTTTGCCATCGGC 630
>ref|XM_007574223.1| PREDICTED: Poecilia formosa ATPase, H+ transporting, lysosomal
16kDa, V0 subunit c (atp6v0c), mRNA
Length=1611
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGC 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 464 CCGGACTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTCGCCATCGGC 513
>ref|XR_127831.3| PREDICTED: Pan troglodytes V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid
subunit-like (LOC100615320), misc_RNA
Length=1479
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCAT 46
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 807 CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGCCACCCGGCTTTGCCAT 852
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
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16 16 2564167 2564067 100m CGGCCGAGGCGCCCATGACGGCGAAAAACGAAGCATACTCGGGGCCGCTCTTGGACTCGGACATGTCTGCGGGTGGGGAGGGGGCAAGCTCTGCGGGCCG
16 16 2564164 2564064 100m CCGAGGCGCCCATGACGGCGAAAAACGAAGCATACTCGGGGCCGCTCTTGGACTCGGACATGTCTGCGGGTGGGGAGGGGGCAAGCTCTGCGGGCCGAGG
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16 16 2564120 2564020 100m CTCTTGGACTCGGACATGTCTGCGGGTGGGGAGGGGGCAAGCTCTGCGGGCCGAGGCGGTGGCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTT
16 16 2564117 2564017 100m TTGGACTCGGACATGTCTGCGGGTGGGGAGGGGGCAAGCTCTGCGGGCCGAGGCGGTGGCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCG
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16 16 2564108 2564008 100m GACATGTCTGCGGGTGGGGAGGGGGCAAGCTCTGCGGGCCGAGGCGGTGGCGGAGGCGGGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCGG
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16 16 2564050 2569620 41m2569562F59M GGGGCGAGGACGGGCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGG
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16 16 2564037 2569633 28m2569562F72M GCCGGGCACGAAGGTTTGCGGGCGGGCG CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCCGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGC
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16 16 2564026 2569644 17m2569562F83M AGGTTTGCGGGCGGGCG CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGGACCGCC
16 16 2564022 2569648 13m2569562F87M TTGCGGGCGGGCG CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGCACCGCCCAGC
16 16 2564019 2569651 10m2569562F90M CGGGCGGGCG CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGCACCGCCCAGCAGC
16 16 2569552 2569652 100M AGCTGGGCGCCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGGACCGCCCAGCAGGC
16 16 2569555 2569655 100M TGGGCGCCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGCACCGCCCAGCAGCCCCG
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16 16 2569561 2569661 100M CCGGCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGGACCGCCCAGCAGCCCCGGCTATT
16 16 2569564 2569664 100M GCCTGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGCACCGCCCAGCAGCCCCGACTATTCGT
16 16 2569567 2569667 100M TGAGCGTGGGCCTGAGCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGCACCGCCCAGCAGCCCCGACTATTCGTGGG
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16 16 2569582 2569682 100M GCGGCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGCACCGCCCAGCAGCCCCGACTATTCGTGGGCATGATCCTGATTCT
16 16 2569585 2569685 100M GCCTGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGCACCGCCCAGCAGCCCCGACTATTCGTGGGCATGATCCTGATTCTCAT
16 16 2569588 2569688 100M TGGCAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGCACCGCCCAGCAGCCCCGACTATTCGTGGGCATGATCCTGATTCTCATCTT
16 16 2569591 2569691 100M CAGCCGGCTTTGCCATCGGCATCGTGGGGGACGCTGGCGTGCGGGGCACCGCCCAGCAGCCCCGACTATTCGTGGGCATGATCCTGATTCTCATCTTCGC
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Sbjct 1049177 CTCGAGTGATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 1049226
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 17039054 CTCGAGTGATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 17039005
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=77819263
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Sbjct 18226313 CTCGAGTGATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 18226264
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AGGACCCAGTCTCCCTCACCTCCTGCGCAGGAAAACAGCCGAGCGGAAAG
right flanking sequence - CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC
>ref|XM_004058156.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L13 (RPL13),
mRNA
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Sbjct 773 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 822
>ref|NM_001243131.1| Homo sapiens ribosomal protein L13 (RPL13), transcript variant
4, mRNA
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Sbjct 432 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 481
>ref|NM_001243130.1| Homo sapiens ribosomal protein L13 (RPL13), transcript variant
3, mRNA
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Sbjct 516 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 565
>ref|NM_033251.2| Homo sapiens ribosomal protein L13 (RPL13), transcript variant
2, mRNA
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Sbjct 746 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 795
>ref|NM_000977.3| Homo sapiens ribosomal protein L13 (RPL13), transcript variant
1, mRNA
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Sbjct 573 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 622
>dbj|AB527633.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5366, Homo sapiens RPL13
gene for ribosomal protein L13, without stop codon, in Flexi
system
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Sbjct 506 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 555
>dbj|AK297198.1| Homo sapiens cDNA FLJ53059 complete cds, moderately similar to
60S ribosomal protein L13
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Sbjct 408 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 457
>dbj|AK294655.1| Homo sapiens cDNA FLJ52458 complete cds, weakly similar to 60S
ribosomal protein L13
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Sbjct 429 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 478
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3' read RPL13 mRNA
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Sbjct 155 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 106
>emb|CU680489.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023431
3' read RPL13 mRNA
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Sbjct 155 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 106
>emb|CU680488.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023431
5' read RPL13 mRNA
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Sbjct 513 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 562
>emb|CU678823.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018019
3' read RPL13 mRNA
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Sbjct 155 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 106
>dbj|AK308545.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98586
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Sbjct 388 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 437
>dbj|AK290893.1| Homo sapiens cDNA FLJ78590 complete cds
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Sbjct 548 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 597
>gb|DQ894636.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009096; FLH177119.01L;
RZPDo839D04123D ribosomal protein L13 (RPL13) gene,
encodes complete protein
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Sbjct 519 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 568
>gb|DQ891459.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004089; FLH177122.01X; RZPDo839D04124D
ribosomal protein L13 (RPL13) gene, encodes complete
protein
Length=676
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Sbjct 519 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 568
>gb|BC080536.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4903971, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2106
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Sbjct 1905 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 1954
>gb|BC004120.1| Homo sapiens mRNA similar to ribosomal protein S2 (cDNA clone
IMAGE:3925714)
Length=1693
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Sbjct 218 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 169
>gb|BC106058.1| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:117342
IMAGE:4992467), complete cds
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Sbjct 573 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 622
>gb|BC063378.1| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:71373
IMAGE:3542514), complete cds
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Sbjct 537 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 586
>gb|BC006179.1| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone IMAGE:4054812)
Length=736
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Sbjct 536 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 585
>gb|BC007805.2| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:14332
IMAGE:4298327), complete cds
Length=954
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Sbjct 534 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 583
>gb|BC010994.2| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:15073
IMAGE:3842093), complete cds
Length=1091
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Sbjct 529 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 578
>gb|BC007563.1| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:15490
IMAGE:2989021), complete cds
Length=914
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Sbjct 734 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 783
>gb|BC000851.1| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone IMAGE:3458439)
Length=738
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Sbjct 526 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 575
>gb|AC092123.4| Homo sapiens chromosome 16 clone RP11-104N10, complete sequence
Length=112519
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Sbjct 22838 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 22789
>gb|BC004954.1| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:10897
IMAGE:3623320), complete cds
Length=743
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Sbjct 536 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 585
>gb|BC020804.1| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:23822
IMAGE:4276103), complete cds
Length=934
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Sbjct 746 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 795
>dbj|AK127579.1| Homo sapiens cDNA FLJ45674 fis, clone D9OST2004417, highly similar
to 60S ribosomal protein L13
Length=2188
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Sbjct 550 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 599
>dbj|AK093246.1| Homo sapiens cDNA FLJ35927 fis, clone TESTI2010793
Length=2049
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 412 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 461
>gb|AC010538.9| Homo sapiens chromosome 16 clone RP11-368I7, complete sequence
Length=210031
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 178771 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 178722
>gb|BC066320.1| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:87209
IMAGE:5300601), complete cds
Length=1101
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 548 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 597
>gb|BC014167.2| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:20892
IMAGE:4550361), complete cds
Length=714
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 534 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 583
>gb|BC013078.1| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:17534
IMAGE:3459415), complete cds
Length=1087
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 534 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 583
>gb|BC093063.1| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:111169
IMAGE:30401947), complete cds
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 550 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 599
>dbj|AK130964.1| Homo sapiens cDNA FLJ27454 fis, clone TST08579, highly similar
to 60S ribosomal protein L13
Length=587
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 418 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 467
>dbj|AK130963.1| Homo sapiens cDNA FLJ27453 fis, clone TMS02992
Length=631
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 469 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 518
>dbj|AK026501.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22848 fis, clone KAIA897
Length=2383
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 2241 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 2290
>dbj|AK025405.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21752 fis, clone COLF6324, highly similar
to HSBBC1 Homo sapiens BBC1 mRNA
Length=761
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 567 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 616
>gb|AY889983.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH030462.01X ribosomal
protein L13 (RPL13) mRNA, complete cds
Length=636
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 497 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 546
>gb|AY892464.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH030459.01L ribosomal
protein L13 (RPL13) mRNA, partial cds
Length=636
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 497 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 546
>gb|BC007345.2| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:15415
IMAGE:3688320), complete cds
Length=866
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 538 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 587
>dbj|AB062392.1| Homo sapiens OK/SW-cl.46 mRNA for ribosomal protein L13, complete
cds
Length=915
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 522 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 571
>gb|BC027463.1| Homo sapiens ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:34920
IMAGE:5111302), complete cds
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mRNA
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Sbjct 554 CTCGAGTGATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 603
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chromosome 17
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Sbjct 551 CTCGAGTGATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 600
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Sbjct 600 CGAGTCATCACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 647
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Sbjct 759 CGAGTCATCACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 806
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(LOC100404320), misc_RNA
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Sbjct 562 CGAGTCATCACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 609
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(LOC100395054), misc_RNA
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Sbjct 579 CGAGTCATCACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 626
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pseudogene (LOC104658394), misc_RNA
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Sbjct 521 CTCGAGTCATGACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 570
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mRNA
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Sbjct 606 CTCGAGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 655
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Sbjct 623 CTCGAGTGATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGCCTC 672
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(LOC103218934), misc_RNA
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Sbjct 558 CTCGAGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 607
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mRNA
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Sbjct 626 CTCGAGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 675
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mRNA
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Sbjct 620 CTCGAGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 669
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mRNA
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Sbjct 534 CTCGAGTCATCACTGAGGGGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 583
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variant 7 (RPL13), mRNA
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Sbjct 528 CTCGAGTCATCACTGAGGGGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 577
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mRNA
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Sbjct 539 CTCGAGTCATCACTGAGGGGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 588
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variant 8 (RPL13), mRNA
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Sbjct 539 CTCGAGTCATCACTGAGGGGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 588
>ref|XM_003280616.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein L13, transcript
variant 1 (RPL13), mRNA
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Sbjct 582 CTCGAGTCATCACTGAGGGGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 631
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miscRNA
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Sbjct 1055 CTCGAGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 1006
>ref|XM_001092801.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L13-like, transcript
variant 1 (LOC700603), mRNA
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Sbjct 528 CTCGAGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 577
>ref|XM_002802599.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L13-like, transcript
variant 5 (LOC700603), mRNA
Length=930
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 545 CTCGAGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 594
>ref|XM_002802598.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L13-like, transcript
variant 4 (LOC700603), mRNA
Length=927
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 542 CTCGAGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 591
>ref|XM_002802597.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L13-like, transcript
variant 3 (LOC700603), mRNA
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 538 CTCGAGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 587
>ref|XM_002802596.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L13-like, transcript
variant 2 (LOC700603), mRNA
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 531 CTCGAGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 580
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5' read RPL13 mRNA
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 513 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAA-TTCATAGCCTTCGCTAGTCTC 561
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 600 CTCGGGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 649
>ref|XR_648761.1| PREDICTED: Papio anubis 60S ribosomal protein L13 pseudogene
(LOC101005957), misc_RNA
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Query 1 CTCGAGTCATCACTGAGGAAGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 50
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Sbjct 542 CTCGGGTCATTACTGAGGAGGAGAAGAATTTCAAAGCCTTCGCTAGTCTC 591
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Lambda K H
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188371, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT
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8 (PRPF8), mRNA
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8-like (LOC455022), partial mRNA
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Sbjct 4079 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 4030
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8 (LOC468374), mRNA
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Sbjct 6151 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6102
>ref|XM_003912066.2| PREDICTED: Papio anubis pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
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>ref|XM_003816849.2| PREDICTED: Pan paniscus pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
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>ref|XM_008009786.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
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Sbjct 6187 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6138
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mRNA
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Sbjct 6175 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6126
>ref|XM_004404110.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens PRP8 pre-mRNA processing
factor 8 homolog (S. cerevisiae) (PRPF8), mRNA
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Sbjct 6108 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6059
>ref|XM_003280343.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys PRP8 pre-mRNA processing factor
8 homolog (S. cerevisiae) (PRPF8), mRNA
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Sbjct 5922 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 5873
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on chromosome 17
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Sbjct 1161 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 1112
>ref|XM_004058248.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla PRP8 pre-mRNA processing factor
8 homolog (S. cerevisiae) (PRPF8), mRNA
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Sbjct 5790 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 5741
>ref|XM_002826810.2| PREDICTED: Pongo abelii pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
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Sbjct 6174 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6125
>ref|XM_001117328.2| PREDICTED: Macaca mulatta PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog
(S. cerevisiae) (PRPF8), mRNA
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Sbjct 6114 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6065
>ref|NG_009118.1| Homo sapiens pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8), RefSeqGene
on chromosome 17
Length=41254
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Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
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Sbjct 35945 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 35896
>dbj|AK296344.1| Homo sapiens cDNA FLJ57882 complete cds, highly similar to Pre-mRNA-processing-splicing
factor 8
Length=3390
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Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
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Sbjct 2276 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 2227
>dbj|AB174670.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QtrA-18576, similar to
human PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog (yeast)(PRPF8),
mRNA, RefSeq: NM_006445.2
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Sbjct 253 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 204
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Sbjct 6180 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6131
>gb|BC064370.1| Homo sapiens PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog (S. cerevisiae),
mRNA (cDNA clone MGC:74762 IMAGE:5587081), complete
cds
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Sbjct 6145 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6096
>gb|BC034545.1| Homo sapiens PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog (S. cerevisiae),
mRNA (cDNA clone IMAGE:4473590), with apparent retained
intron
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Sbjct 220 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 171
>dbj|AK126169.1| Homo sapiens cDNA FLJ44181 fis, clone THYMU2038301
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Sbjct 1045 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 996
>dbj|AK222905.1| Homo sapiens mRNA for U5 snRNP-specific protein variant, clone:
HRC03173
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Sbjct 256 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 207
>gb|AC130343.7| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-961A15, complete sequence
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Sbjct 103452 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 103501
>dbj|AK058034.1| Homo sapiens cDNA FLJ25305 fis, clone SYN00254, highly similar
to Homo sapiens mRNA for PRP8 protein
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Sbjct 783 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 734
>gb|AF092565.1|AF092565 Homo sapiens splicing factor Prp8 mRNA, complete cds
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Sbjct 6104 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6055
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Sbjct 10509 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 10460
>dbj|AB007510.1| Homo sapiens mRNA for PRP8 protein, complete cds
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Sbjct 6107 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6058
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factor 8 (PRPF8), mRNA
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Sbjct 6174 CTGCTGTGATGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6125
>ref|XM_008996376.1| PREDICTED: Callithrix jacchus pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
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Sbjct 6177 CTGCTGTGATGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6128
>ref|XM_008537719.1| PREDICTED: Equus przewalskii pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
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Sbjct 6161 CTGCTGTGACGGTGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6112
>ref|XM_008147879.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
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Sbjct 6073 CTGCTGTGACGGTGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6024
>ref|XM_007123542.1| PREDICTED: Physeter catodon pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
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Sbjct 6160 CTGCTGTGATGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6111
>ref|XM_003996419.2| PREDICTED: Felis catus pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
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Sbjct 6156 CTGCTGTGATGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6107
>ref|XM_006925066.1| PREDICTED: Pteropus alecto pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 6103 CTGCTGTGAAGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6054
>ref|XM_006925065.1| PREDICTED: Pteropus alecto pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 6119 CTGCTGTGAAGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6070
>ref|XM_006741402.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii pre-mRNA processing factor
8 (PRPF8), mRNA
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Sbjct 5739 CTGCTGTGAGGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 5690
>ref|XM_006214470.1| PREDICTED: Vicugna pacos pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
Length=7065
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Sbjct 5952 CTGCTGTGACGGTGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 5903
>ref|XM_006184989.1| PREDICTED: Camelus ferus pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
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Sbjct 6173 CTGCTGTGACGGTGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6124
>ref|XM_001504332.2| PREDICTED: Equus caballus pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
Length=7273
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Sbjct 6146 CTGCTGTGACGGTGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6097
>ref|XM_006099181.1| PREDICTED: Myotis lucifugus pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
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Sbjct 6150 CTGCTGTGACGGTGCAGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAAT 6103
>ref|XM_005858318.1| PREDICTED: Myotis brandtii pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
mRNA
Length=7229
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAAT 48
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Sbjct 6150 CTGCTGTGACGGTGCAGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAAT 6103
>ref|XM_007454215.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
transcript variant X2, mRNA
Length=7335
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Sbjct 6218 CTGCTGTGATGGTGCAGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6169
>ref|XM_007454214.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8),
transcript variant X1, mRNA
Length=7291
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Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
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Sbjct 6174 CTGCTGTGATGGTGCAGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6125
>ref|XM_007183799.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni pre-mRNA processing
factor 8 (PRPF8), mRNA
Length=7258
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
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Sbjct 6140 CTGCTGTGATGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATATCTCGAATTT 6091
>ref|XM_007076115.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica pre-mRNA processing factor
8 (PRPF8), mRNA
Length=7277
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 6156 CTGCTGTGATGGTGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6107
>ref|XM_004807372.1| PREDICTED: Mustela putorius furo PRP8 pre-mRNA processing factor
8 homolog (S. cerevisiae) (PRPF8), mRNA
Length=7306
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
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Sbjct 6184 CTGCTGCGATGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6135
>ref|XM_004746869.1| PREDICTED: Mustela putorius furo PRP8 pre-mRNA processing factor
8 homolog (S. cerevisiae) (PRPF8), mRNA
Length=7306
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
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Sbjct 6184 CTGCTGCGATGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6135
>ref|XM_004332629.1| PREDICTED: Tursiops truncatus PRP8 pre-mRNA processing factor
8 homolog (S. cerevisiae) (PRPF8), mRNA
Length=6586
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
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Sbjct 5469 CTGCTGTGATGGTGCAGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 5420
>ref|XM_004267064.1| PREDICTED: Orcinus orca PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog
(S. cerevisiae), transcript variant 2 (PRPF8), mRNA
Length=7381
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
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Sbjct 6264 CTGCTGTGATGGTGCAGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6215
>ref|XM_004267063.1| PREDICTED: Orcinus orca PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog
(S. cerevisiae), transcript variant 1 (PRPF8), mRNA
Length=7297
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
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Sbjct 6180 CTGCTGTGATGGTGCAGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6131
>ref|XM_003799095.1| PREDICTED: Otolemur garnettii PRP8 pre-mRNA processing factor
8 homolog (S. cerevisiae) (PRPF8), mRNA
Length=7291
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
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Sbjct 6174 CTGCTGTGATGGTGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6125
>ref|XM_004684795.1| PREDICTED: Condylura cristata PRP8 pre-mRNA processing factor
8 homolog (S. cerevisiae) (PRPF8), mRNA
Length=7261
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6168 CTGCTGTGATGGCGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 6119
>dbj|AK389744.1| Sus scrofa mRNA, clone: AMP010058C11, expressed in alveolar macrophage
Length=2471
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
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Sbjct 1320 CTGCTGTGATGGTGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGGATTT 1271
>dbj|AK389227.1| Sus scrofa mRNA, clone: ADR010020G05, expressed in adrenal gland
Length=1219
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 82 CTGCTGTGATGGTGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGGATTT 33
>ref|XM_003131826.3| PREDICTED: Sus scrofa pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8), partial
mRNA
Length=6884
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5763 CTGCTGTGATGGTGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGGATTT 5714
>dbj|AK239104.1| Sus scrofa mRNA, clone:THY010063H06, expressed in thymus
Length=1208
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGCTGTGACGGTGCCGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGAATTT 50
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 73 CTGCTGTGATGGTGCTGAGATCTCCATACCCAGGATGATGTCTCGGATTT 24
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTGATTCTGCGTGCCCTACATGTGAACAACGATCGGGCAAAAGTGATCCT
>ref|NG_009118.1| Homo sapiens pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8), RefSeqGene
on chromosome 17
Length=41254
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATTCTGCGTGCCCTACATGTGAACAACGATCGGGCAAAAGTGATCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34358 CTGATTCTGCGTGCCCTACATGTGAACAACGATCGGGCAAAAGTGATCCT 34407
>dbj|AK296344.1| Homo sapiens cDNA FLJ57882 complete cds, highly similar to Pre-mRNA-processing-splicing
factor 8
Length=3390
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATTCTGCGTGCCCTACATGTGAACAACGATCGGGCAAAAGTGATCCT 50
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Sbjct 2022 CTGATTCTGCGTGCCCTACATGTGAACAACGATCGGGCAAAAGTGATCCT 2071
>ref|NM_006445.3| Homo sapiens pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8), mRNA
Length=7311
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATTCTGCGTGCCCTACATGTGAACAACGATCGGGCAAAAGTGATCCT 50
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Sbjct 5926 CTGATTCTGCGTGCCCTACATGTGAACAACGATCGGGCAAAAGTGATCCT 5975
>gb|BC064370.1| Homo sapiens PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog (S. cerevisiae),
mRNA (cDNA clone MGC:74762 IMAGE:5587081), complete
cds
Length=7276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATTCTGCGTGCCCTACATGTGAACAACGATCGGGCAAAAGTGATCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5891 CTGATTCTGCGTGCCCTACATGTGAACAACGATCGGGCAAAAGTGATCCT 5940
>dbj|AK222905.1| Homo sapiens mRNA for U5 snRNP-specific protein variant, clone:
HRC03173
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transcript variant X1, mRNA
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17 17 1558793 1558693 100m ACAACGATCGGGCAAAAGTGATCCTGAAGCCAGACAAGACTACTATTACAGAACCACACCACATCTGGCCCACTCTGACTGACGAAGAATGGATCAAGGT
17 17 1558790 1558690 100m ACGATCGGGCAACAGTGATCCTGAAGCCAGACAAGACTACTATTACAGACCCACACCACATCTGGCCCACTCTGACTGACGAAGAATGGATCAAGGTCGA
17 17 1558787 1558687 100m ATCGGGCAAAAGTGATCCTGAAGCCAGACAAGACTACTATTACAGAACCACACCACATCTGGCCCACTCTGACTGACGAAGAATGGATCAAGGTCGAGGT
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HuRef SCAF_1103279188371, whole genome shotgun sequence
gb|DS486071.1| Homo sapiens SCAF_1103279188371 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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shotgun sequence
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A, 220kDa (POLR2A), mRNA
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220kDa (POLR2A), RefSeqGene on chromosome 17
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220kDa (POLR2A), mRNA
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220kDa, mRNA (cDNA clone MGC:168851 IMAGE:9021228), complete
cds
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RNA polymerase II largest subunit (EC 2.7.7.6)
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RNA polymerase II largest subunit (EC 2.7.7.6)
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polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA
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Sbjct 5360 TGAGTAGCTGGGTGACGTTGGTGAATAGCTGGGTGATGTGGGACTATAGT 5311
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A, 220kDa (POLR2A), mRNA
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Query 1 TGAGTAGCTGGGTGACGTTGGCGAATAGCTGGGTGATGTGGGACTATAGT 50
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polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA
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Query 1 TGAGTAGCTGGGTGACGTTGGCGAATAGCTGGGTGATGTGGGACTATAGT 50
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Sbjct 5353 TGAGTAGCTGGGTGATGTTGGCGAATAGCTGGGTGATGTGGGACTATAGT 5304
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC
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(DNA directed) polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA
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polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA
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Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5823 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5872
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polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA
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Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5683 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5732
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A, 220kDa (POLR2A), mRNA
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Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5857 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5906
>ref|XM_008962447.1| PREDICTED: Pan paniscus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide
A, 220kDa (POLR2A), mRNA
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Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5849 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5898
>ref|XM_002747961.3| PREDICTED: Callithrix jacchus polymerase (RNA) II (DNA directed)
polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA
Length=6733
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Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5834 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5883
>ref|XM_008010707.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus polymerase (RNA) II (DNA directed)
polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA
Length=6029
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Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5124 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5173
>ref|XM_005583168.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101866538 (LOC101866538),
mRNA
Length=6378
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Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5470 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5519
>gb|KF456236.1| Homo sapiens chromosome 17 WGS contig WGS_LWK_AC113189.11_163850
genomic sequence
Length=387
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 136 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 185
>ref|XM_003274618.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys polymerase (RNA) II (DNA directed)
polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA
Length=6752
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5844 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5893
>ref|XM_004058487.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla polymerase (RNA) II (DNA directed)
polypeptide A, 220kDa, transcript variant 2 (POLR2A),
mRNA
Length=6493
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5732 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5781
>ref|XM_004058486.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla polymerase (RNA) II (DNA directed)
polypeptide A, 220kDa, transcript variant 1 (POLR2A),
mRNA
Length=6607
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5846 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5895
>ref|NG_027747.1| Homo sapiens polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A,
220kDa (POLR2A), RefSeqGene on chromosome 17
Length=37238
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 34330 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 34379
>ref|NM_000937.4| Homo sapiens polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A,
220kDa (POLR2A), mRNA
Length=6738
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5830 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5879
>ref|XM_001088769.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC700415 (LOC700415),
partial mRNA
Length=1445
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 611 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 660
>gb|BC137231.1| Homo sapiens polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A,
220kDa, mRNA (cDNA clone MGC:168851 IMAGE:9021228), complete
cds
Length=6266
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5646 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5695
>dbj|AK304882.1| Homo sapiens cDNA FLJ61585 complete cds, highly similar to DNA-directed
RNA polymerase II largest subunit (EC 2.7.7.6)
Length=6378
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5476 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5525
>dbj|AK293777.1| Homo sapiens cDNA FLJ53860 complete cds, highly similar to DNA-directed
RNA polymerase II largest subunit (EC 2.7.7.6)
Length=2971
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 2544 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 2593
>gb|AC113189.11| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-104H15, complete sequence
Length=184349
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163791 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 163840
>emb|X59442.1| M.sylvanus, RNA PolII-c-DNA
Length=1092
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 668 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 717
>emb|X59443.1| H.sapiens, RNA-PolII-cDNA
Length=1092
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 717
>ref|XM_007166395.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni polymerase (RNA)
II (DNA directed) polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA
Length=6547
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5645 CTCCCACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5694
>dbj|AB173199.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-21487, similar to
human polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A, 220kDa(POLR2A),
mRNA, RefSeq: NM_000937.2
Length=1705
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1599 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGGTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 1648
>emb|X63564.1| H.sapiens mRNA for RNA polymerase II largest subunit
Length=6732
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5830 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGTTCGCCCAGC 5879
>emb|X74870.1| H.sapiens gene for RNA pol II largest subunit, exons 23-29
Length=4058
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 2990 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGTTCGCCCAGC 3039
>ref|XM_007457771.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer polymerase (RNA) II (DNA directed)
polypeptide A, 220kDa (POLR2A), mRNA
Length=6731
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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Sbjct 5834 CTCCCACCTATACCCCGAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 5883
>ref|XM_007100655.1| PREDICTED: Physeter catodon polymerase (RNA) II (DNA directed)
polypeptide A, 220kDa (POLR2A), transcript variant X3, mRNA
Length=5742
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCAACCTATACCCCAAGCTCACCCAGCTACAGCCCCAGCTCGCCCAGC 50
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(ATP1B2), mRNA
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2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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>gb|HQ258155.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100072464 ATPase,
Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide (ATP1B2) gene, encodes
complete protein
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>ref|XM_001110335.2| PREDICTED: Macaca mulatta sodium/potassium-transporting ATPase
subunit beta-2-like (LOC716093), mRNA
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cds
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beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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(ATP1B2), mRNA
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gene, encodes complete protein
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2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide (ATP1B2) gene, encodes
complete protein
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subunit beta-2-like (LOC716093), mRNA
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>dbj|AK290143.1| Homo sapiens cDNA FLJ75609 complete cds, highly similar to Homo
sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide (ATP1B2),
mRNA
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Sbjct 791 TGGAGTCCTCAACTACCCCAAACGTGCCTGCCAATTCAACCGGACCCAGC 840
>gb|BC126175.1| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide,
mRNA (cDNA clone MGC:161453 IMAGE:8991891), complete cds
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mRNA, partial cds
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>ref|NM_001678.3| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide
(ATP1B2), mRNA
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2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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Sbjct 900 TGGAGTTCTCAACTACCCGAAACGTGCCTGCCAATTCAACCGGACCCAGC 949
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beta 2 polypeptide (Atp1b2), mRNA
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Query 1 TGGAGTCCTCAACTACCCCAAACGTGCCTGCCAATTCAACCGGACCCAGC 50
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Sbjct 1018 TGGGGTCCTCAACTACCCGAAACGTGCCTGCCAATTCAACCGGACCCAGC 1067
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beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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Sbjct 1067 TGGAGTTCTCAACTACCCGAAACGTGCCTGCCAATTCAACCGGACCCAGC 1116
>ref|XM_008530354.1| PREDICTED: Equus przewalskii ATPase, Na+/K+ transporting, beta
2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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Query 2 GGAGTCCTCAACTACCCCAAACGTGCCTGCCAATTCAACCGGACCCAGC 50
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2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
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Query 5 GTCCTCAACTACCCCAAACGTGCCTGCCAATTCAACCGGACCCAGC 50
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polypeptide (ATP1B2), mRNA
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Sbjct 319 GGAGTCCTCAACTATCCGAAACGTGCCTGCCAATTCAACCGGACCCAGC 367
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>ref|NT_010718.17| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR17_CTG2
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assembly
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
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Sbjct 7166833 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 7166784
>ref|NC_018928.2| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7568291 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 7568242
>ref|NW_004929405.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
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Sbjct 7162888 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 7162839
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shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
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Sbjct 4577399 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 4577350
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shotgun sequence
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Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
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Sbjct 8067448 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 8067399
>gb|CM000507.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
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Sbjct 7453248 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 7453199
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shotgun sequence
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Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
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Sbjct 7144409 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 7144360
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Sbjct 7754240 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 7754191
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Sbjct 7469523 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 7469474
>gb|CH471108.2| Homo sapiens 211000035838541 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
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Sbjct 7503016 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 7502967
>ref|NW_001838403.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188371, whole genome shotgun sequence
gb|DS486071.1| Homo sapiens SCAF_1103279188371 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 7144203 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 7144154
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
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Sbjct 7453033 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 7452984
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
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Sbjct 7585520 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 7585471
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA
>ref|NC_000017.11| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000679.2| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 reference primary assembly
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Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
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Sbjct 7656026 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7656075
>ref|NT_010718.17| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR17_CTG2
gb|GL000129.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=21503074
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7167039 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7167088
>ref|NC_018928.2| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=81289577
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7568497 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7568546
>ref|NW_004929405.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150189.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=21223664
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7163094 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7163143
>gb|KE141219.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold132, whole genome
shotgun sequence
Length=12682989
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4577605 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 4577654
>gb|GL583023.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_43, whole genome
shotgun sequence
Length=15831025
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8067654 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 8067703
>gb|CM000507.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76566745
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7453454 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7453503
>gb|DS990709.1| Homo sapiens SCAF_1112675837316 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=15049287
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7144615 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7144664
>gb|CH003512.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=81075739
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7754446 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7754495
>gb|CH003464.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=80652589
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7469729 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7469778
>gb|CH471108.2| Homo sapiens 211000035838541 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=15369037
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7503222 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7503271
>ref|NW_001838403.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188371, whole genome shotgun sequence
gb|DS486071.1| Homo sapiens SCAF_1103279188371 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=15048748
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7144409 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7144458
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7453239 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7453288
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=77819263
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7585726 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 7585775
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT
>ref|NM_001678.3| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide
(ATP1B2), mRNA
Length=3350
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 1332
>gb|AF007876.1|AF007876 Homo sapiens Na,K-ATPase beta 2 subunit gene, complete cds
Length=7894
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5882 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 5833
>gb|U45945.1|HSU45945 Human Na,K-ATPase beta 2 subunit (ATP1B2) mRNA, complete cds
Length=2397
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 834 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 785
>gb|M81181.1|HUMATPBII Human sodium/potassium ATPase beta-2 subunit (atpb2) mRNA, complete
cds
Length=2773
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 1156
>ref|XM_001171996.2| PREDICTED: Pan troglodytes ATPase, Na+/K+ transporting, beta
2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
Length=1524
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1420 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACATTGGGGGTCACAT 1371
>ref|XM_002826972.2| PREDICTED: Pongo abelii ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide
(ATP1B2), mRNA
Length=1610
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1167 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACATTGGGGGTCACAT 1118
>ref|XM_008962431.1| PREDICTED: Pan paniscus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide
(ATP1B2), mRNA
Length=3978
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2008 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACATTGGGGGTCACAT 1959
>ref|XM_003274632.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ATPase, Na+/K+ transporting, beta
2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
Length=3359
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1390 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACATTGGGGGTCACAT 1341
>ref|XM_004058512.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ATPase, Na+/K+ transporting,
beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
Length=2414
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1390 GGCGGCATTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACATTGGGGGTCACAT 1341
>ref|XM_007627035.1| PREDICTED: Cricetulus griseus ATPase, Na+/K+ transporting, beta
2 polypeptide (Atp1b2), transcript variant X2, mRNA
Length=849
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 774 GGCAGCGTTAATGCGGCATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 725
>gb|JN964617.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Trp53:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=40292
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 35616 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 35665
>gb|JN960690.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Trp53:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=40225
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 35549 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 35598
>gb|JN959122.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Atp1b2:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=39067
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24855 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 24806
>gb|JN955284.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Shbg:tm1(KOMP)Wtsi;
transgenic
Length=37222
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36332 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 36283
>gb|JN955083.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Atp1b2:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=39092
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24880 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 24831
>ref|XM_003497238.1| PREDICTED: Cricetulus griseus ATPase, Na+/K+ transporting, beta
2 polypeptide (Atp1b2), transcript variant X1, mRNA
Length=882
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 GGCAGCGTTAATGCGGCATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 758
>ref|NM_013415.5| Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide
(Atp1b2), mRNA
Length=2959
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 1337
>gb|BC058763.1| Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide,
mRNA (cDNA clone MGC:65256 IMAGE:6490870), complete cds
Length=2934
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 1295
>gb|BC042467.1| Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide,
mRNA (cDNA clone MGC:21650 IMAGE:4500972), complete cds
Length=2839
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 1206
>gb|BC034586.1| Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide,
mRNA (cDNA clone IMAGE:5365549), with apparent retained intron
Length=3765
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2169 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 2120
>dbj|AK141786.1| Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:D030069L06 product:ATPase, Na+/K+ transporting,
beta 2 polypeptide, full insert sequence
Length=2961
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 1338
>dbj|AK158321.1| Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:F930103H11 product:ATPase, Na+/K+ transporting,
beta 2 polypeptide, full insert sequence
Length=2551
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 1340
>emb|AL731687.13| Mouse DNA sequence from clone RP23-56I20 on chromosome 11 Contains
the 5' end of the gene for a novel protein similar to
dynein, the Efnb3 gene for ephrin B3, a novel gene, the Trp53
gene for transformation related protein 53, the Atp1b2 gene
for Na+/K+ transporting ATPase beta 2 polypeptide, the Shbg
gene for sex hormone binding globulin, the 5' end of the Sat2
gene for spermidine/spermine N1-acetyl transferase 2 and
two CpG islands, complete sequence
Length=116898
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
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Sbjct 95450 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 95499
>emb|X56007.1| MOUSE ATPB2 GENE
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Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6486 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 6437
>emb|X16645.1| Mouse mRNA for glial cell adhesion molecule (AMOG)
Length=1065
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Query 1 GGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 50
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 GGCAGCGTTGATGCGGCATTCAACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCACAT 893
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA
>ref|NM_001678.3| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide
(ATP1B2), mRNA
Length=3350
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
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Sbjct 1587 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 1636
>gb|AF007876.1|AF007876 Homo sapiens Na,K-ATPase beta 2 subunit gene, complete cds
Length=7894
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
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Sbjct 6088 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 6137
>gb|U45945.1|HSU45945 Human Na,K-ATPase beta 2 subunit (ATP1B2) mRNA, complete cds
Length=2397
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Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
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Sbjct 1040 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 1089
>gb|M81181.1|HUMATPBII Human sodium/potassium ATPase beta-2 subunit (atpb2) mRNA, complete
cds
Length=2773
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 50
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Sbjct 1411 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCCGTCA 1460
>ref|XM_002826972.2| PREDICTED: Pongo abelii ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide
(ATP1B2), mRNA
Length=1610
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Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCC 46
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Sbjct 1373 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCC 1418
>ref|XM_008962431.1| PREDICTED: Pan paniscus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide
(ATP1B2), mRNA
Length=3978
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCC 46
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Sbjct 2214 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCC 2259
>ref|XM_004058512.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ATPase, Na+/K+ transporting,
beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
Length=2414
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCC 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1596 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCC 1641
>ref|XM_003274632.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ATPase, Na+/K+ transporting, beta
2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
Length=3359
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCC 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598 TTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCC 1641
>ref|XM_008010189.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ATPase, Na+/K+ transporting, beta
2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
Length=2074
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCC 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1598 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGCTTCC 1643
>ref|XM_001110335.2| PREDICTED: Macaca mulatta sodium/potassium-transporting ATPase
subunit beta-2-like (LOC716093), mRNA
Length=1798
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTCC 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1567 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGCTTCC 1612
>ref|XM_003929189.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ATPase, Na+/K+ transporting,
beta 2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
Length=3401
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTC 45
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1627 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATGGCGGTTC 1671
>ref|XM_002747966.3| PREDICTED: Callithrix jacchus ATPase, Na+/K+ transporting, beta
2 polypeptide (ATP1B2), mRNA
Length=3342
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATTGCGGTTC 45
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1578 CCTTTTCCTTGACTTCTCAACCCAGCCTGAAGTCCATGGCGGTTC 1622
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
17 17 7559327 7559227 100m AAGTCATAGCTCTGTTATCAAAAATACCTTTGGGGTGGGTGAGGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGG
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17 17 7559315 7559215 100m TGTTATCAAAAATACCTTTGGGGTGGGTGAGGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGG
17 17 7559312 7559212 100m TATCAAAAATACCTTTGGGGTGGGTGAGGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCC
17 17 7559309 7559209 100m CAAAAATGCCTTTGGGGTGGGTGAGGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCA
17 17 7559306 7559206 100m AAATACCTTTGGGGTGGGTGAGGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGT
17 17 7559303 7559203 100m TACCTTTGGGGTGGGTGAGGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTT
17 17 7559300 7559200 100m CTTTGGGGTGGGTGAGGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTT
17 17 7559297 7559197 100m TGGGGGGGGTGAGGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGGCATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGAT
17 17 7559294 7559194 100m GGTGGGTGAGGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCG
17 17 7559291 7559191 100m GGGTGAGGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAG
17 17 7559288 7559188 100m TGAGGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTT
17 17 7559285 7559185 100m GGGAGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAA
17 17 7559282 7559182 100m AGGGATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGC
17 17 7559279 7559179 100m GATCAGGCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCAC
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17 17 7559273 7559173 100m GCAGGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCC
17 17 7559270 7559170 100m GGGTCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGCAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGC
17 17 7559267 7559167 100m TCAGGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAA
17 17 7559264 7559164 100m GGGACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTT
17 17 7559261 7559161 100m ACATTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTC
17 17 7559258 7559158 100m TTCCAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCG
17 17 7559255 7559155 100m CAGGAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTC
17 17 7559252 7559152 100m GAGCATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATC
17 17 7559249 7559149 100m CATCCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTC
17 17 7559246 7559146 100m CCACAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGT
17 17 7559243 7559143 100m CAGGAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGC
17 17 7559240 7559140 100m GAGAGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGAT
17 17 7559237 7559137 100m AGAGATGGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTT
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17 17 7559231 7559131 100m GGGGTGGGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGC
17 17 7559228 7559128 100m GTGGGAGCACGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTT
17 17 7559225 7559125 100m GGAGGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGAT
17 17 7559222 7559122 100m GGAAGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCG
17 17 7559219 7559119 100m AGGGGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACA
17 17 7559216 7559116 100m GGCCTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACATTC
17 17 7559213 7559113 100m CTCAGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACATTCTAC
17 17 7559210 7559110 100m AGGTTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATT
17 17 7559207 7559107 100m TTTTGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCAC
17 17 7559204 7559104 100m TGTTGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTC
17 17 7559201 7559101 100m TGATGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCAC
17 17 7559198 7559098 100m TGCGGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTT
17 17 7559195 7559095 100m GGAGTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGG
17 17 7559192 7559092 100m GTTTGAAGGCCACGCGGCCGGCGACCTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGT
17 17 7559189 7559089 100m TGAAGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCACCTCCACGTTGGGGGTCAC
17 17 7559186 7559086 100m AGGCCACGCGGCCGGCGAACTTGTCTCGCTCATCGTCTGTGGCGATGTTGGCGGCGTTGATGCGACATTCTACATTCCCCTCCACGTTGGGGGTCACATT
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 8161526 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 8161477
>ref|NT_010718.17| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR17_CTG2
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assembly
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 7672539 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 7672490
>ref|NC_018928.2| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 8073648 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 8073599
>ref|NW_004929405.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 7668245 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 7668196
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shotgun sequence
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Sbjct 5098735 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 5098686
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 8009688 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 8009639
>ref|NW_001838403.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188371, whole genome shotgun sequence
gb|DS486071.1| Homo sapiens SCAF_1103279188371 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 7651036 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 7650987
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 7959866 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 7959817
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Sbjct 8092192 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 8092143
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA
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(synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
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2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 737 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 688
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clone: FCC132D12
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Sbjct 737 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 688
>gb|BC019608.1| Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2), mRNA (cDNA clone MGC:24865 IMAGE:4508990), complete
cds
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Sbjct 719 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 670
>gb|BC033870.1| Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2), mRNA (cDNA clone MGC:45137 IMAGE:5203115), complete
cds
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Sbjct 725 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 676
>gb|AC129492.6| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-599B13, complete sequence
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Sbjct 155441 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 155490
>dbj|AK021522.1| Homo sapiens cDNA FLJ11460 fis, clone HEMBA1001569, highly similar
to SYNAPTOBREVIN 2
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Sbjct 1320 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 1271
>gb|AC104762.7| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-769H22, complete sequence
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Sbjct 155441 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 155490
>gb|AF135372.1|AF135372 Homo sapiens synaptobrevin 2 (VAMP2) gene, complete cds
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Sbjct 5108 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 5059
>emb|AL050223.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp586L1323 (from clone DKFZp586L1323)
Length=1503
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Query 1 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 50
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Sbjct 64 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 15
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protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Query 1 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGG-GGTGAAGGGAACCTCA 50
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Sbjct 749 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGAGGTGAAGGGAACCTCA 699
>ref|XM_002827000.3| PREDICTED: Pongo abelii vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGG-GGTGAAGGGAACCTCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 765 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGAGGTGAAGGGAACCTCA 715
>ref|XM_003912298.2| PREDICTED: Papio anubis vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=2171
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGG-GGTGAAGGGAACCTCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 770 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGAGGTGAAGGGAACCTCA 720
>ref|XM_003818056.2| PREDICTED: Pan paniscus vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
Length=2456
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGG-GGTGAAGGGAACCTCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1052 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGAGGTGAAGGGAACCTCA 1002
>ref|XM_008971314.1| PREDICTED: Pan paniscus vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
Length=2143
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGG-GGTGAAGGGAACCTCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 739 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGAGGTGAAGGGAACCTCA 689
>ref|XM_008010264.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=1683
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Sbjct 749 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGAGGTGAAGGGAACCTCA 699
>ref|XM_003274645.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2), transcript variant 1 (VAMP2), mRNA
Length=1978
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Sbjct 717 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGAGGTGAAGGGAACCTCA 667
>ref|XM_004058540.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla vesicle-associated membrane
protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=2149
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Query 1 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGG-GGTGAAGGGAACCTCA 50
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Sbjct 743 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGAGGTGAAGGGAACCTCA 693
>gb|AC193927.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-388K24 from chromosome 17, complete
sequence
Length=181857
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Query 1 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGG-GGTGAAGGGAACCTCA 50
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Sbjct 99458 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGAGGTGAAGGGAACCTCA 99508
>gb|BC002737.2| Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2), mRNA (cDNA clone MGC:3377 IMAGE:3628842), complete
cds
Length=918
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706 AAGAAAAGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGGGTGAAGGGAACCTCA 657
>ref|XM_009432798.1| PREDICTED: Pan troglodytes vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGG-GGTGAAGGGAACCTCA 50
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Sbjct 1073 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGAGGTGAAGAGAACCTCA 1023
>ref|XM_001156324.3| PREDICTED: Pan troglodytes vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGG-GGTGAAGGGAACCTCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 739 AAGAAAGGGAAAGGGAAGGAAGGCAAGAGAGAGGAGGTGAAGAGAACCTCA 689
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC
>ref|XM_010362420.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana vesicle-associated membrane
protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 388 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 437
>ref|XM_009432798.1| PREDICTED: Pan troglodytes vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
Length=2497
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 714 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 763
>ref|XM_002827000.3| PREDICTED: Pongo abelii vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=1298
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 405 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 454
>ref|XM_003912298.2| PREDICTED: Papio anubis vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=2171
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 408 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 457
>ref|XM_003818056.2| PREDICTED: Pan paniscus vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
Length=2456
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 693 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 742
>ref|XM_008971314.1| PREDICTED: Pan paniscus vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
Length=2143
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 380 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 429
>ref|XM_002747935.2| PREDICTED: Callithrix jacchus vesicle-associated membrane protein
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ncRNA
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2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
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2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 473 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 522
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2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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membrane protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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2 (synaptobrevin 2), transcript variant 1 (VAMP2), mRNA
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Sbjct 356 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 405
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protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 383 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 432
>ref|XM_001156324.3| PREDICTED: Pan troglodytes vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 380 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 429
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vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2) gene, encodes complete protein
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Sbjct 331 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 380
>ref|XM_002921170.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca vesicle-associated membrane
protein 2-like (LOC100479348), mRNA
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Sbjct 341 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 390
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sequence
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>dbj|AB464344.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6771, Homo sapiens VAMP2
gene for vesicle-associated membrane protein 2, without stop
codon, in Flexi system
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Sbjct 296 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 345
>ref|NM_014232.2| Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 377 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 426
>emb|CU676451.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017914
3' read VAMP2 mRNA
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Sbjct 86 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 37
>gb|EU192157.1| Felis catus VAMP2-like mRNA, partial sequence
Length=382
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Sbjct 136 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 185
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Sbjct 327 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 376
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sapiens vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2), mRNA
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Sbjct 350 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 399
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mRNA
dbj|AB173022.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-20639, similar to
human vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin2)
(VAMP2), mRNA, RefSeq: NM_014232.1
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Sbjct 350 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 399
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clone: FCC132D12
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Sbjct 377 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 426
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2), mRNA (cDNA clone MGC:24865 IMAGE:4508990), complete
cds
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2), mRNA (cDNA clone MGC:45137 IMAGE:5203115), complete
cds
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>dbj|AK021522.1| Homo sapiens cDNA FLJ11460 fis, clone HEMBA1001569, highly similar
to SYNAPTOBREVIN 2
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Sbjct 359 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 408
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mRNA
gb|BC074003.1| Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 2, mRNA
(cDNA clone MGC:91770 IMAGE:7097683), complete cds
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Sbjct 363 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 412
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Sbjct 156402 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 156353
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Sbjct 4147 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 4196
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2B
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Sbjct 347 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 396
>gb|BC002737.2| Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2), mRNA (cDNA clone MGC:3377 IMAGE:3628842), complete
cds
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Sbjct 346 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 395
>ref|NM_001032820.1| Macaca mulatta vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2), mRNA
gb|AF240769.1|AF240769 Macaca mulatta VAMP-2 mRNA, complete cds
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Sbjct 376 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 425
>emb|AJ225044.1| Homo sapiens mRNA for vesicle associated membrane protein 2 (VAMP2)
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Sbjct 281 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 330
>gb|M36204.1|HUMSYB2A4 Human synaptobrevin 2 (SYB2) gene, exon 4
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Sbjct 19 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 68
>gb|M24105.1|RATVAMPB Rat vesicle associated membrane protein (VAMP-2) mRNA, complete
cds
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Sbjct 301 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 350
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protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 329 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCAT 377
>ref|XM_010596683.1| PREDICTED: Loxodonta africana vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 491 AGATGATGATCATCCTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 540
>ref|XM_003929210.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis vesicle-associated
membrane protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 478 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 527
>ref|XM_010339826.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis vesicle-associated
membrane protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 295 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 344
>ref|XM_008855758.1| PREDICTED: Nannospalax galili vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (Vamp2), mRNA
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Sbjct 423 AGATGATGATAATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 472
>ref|XM_008539924.1| PREDICTED: Equus przewalskii vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 506 AGATGATGATCATTTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 555
>ref|XM_007634614.1| PREDICTED: Cricetulus griseus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (Vamp2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 302 AGATGATGATAATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 351
>ref|XM_003497226.2| PREDICTED: Cricetulus griseus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (Vamp2), transcript variant X1, partial
mRNA
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Sbjct 257 AGATGATGATAATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 306
>ref|XM_007457809.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 371 AGATGATGATTATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 420
>ref|XM_007166614.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni vesicle-associated
membrane protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 425 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 474
>ref|XM_007126640.1| PREDICTED: Physeter catodon vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 323 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 372
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membrane protein 2 (synaptobrevin 2) (Vamp2), mRNA
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Sbjct 404 AGATGATGATAATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 453
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2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 506 AGATGATGATCATTTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 555
>ref|XM_005399431.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (Vamp2), mRNA
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Sbjct 454 AGATGATGATAATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 503
>ref|XM_005332842.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus vesicle-associated membrane
protein 2 (synaptobrevin 2) (Vamp2), mRNA
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Sbjct 430 AGATGATGATAATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 479
>ref|XM_005349803.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (Vamp2), mRNA
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Sbjct 410 AGATGATGATAATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 459
>ref|XM_005067575.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (Vamp2), mRNA
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Sbjct 409 AGATGATGATAATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 458
>ref|XM_003466167.2| PREDICTED: Cavia porcellus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (Vamp2), mRNA
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Sbjct 515 AGATGATGATAATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 564
>ref|XM_004713007.1| PREDICTED: Echinops telfairi vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 344 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCTATCATCCTCATCATCATC 393
>ref|XM_004310619.1| PREDICTED: Tursiops truncatus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 416 AGATGATGATTATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 465
>ref|XM_004266874.1| PREDICTED: Orcinus orca vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 377 AGATGATGATTATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 426
>ref|XM_003791116.1| PREDICTED: Otolemur garnettii vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2), transcript variant 2 (VAMP2), mRNA
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Sbjct 461 AGATGATGATCATTTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 510
>ref|XM_003791115.1| PREDICTED: Otolemur garnettii vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2), transcript variant 1 (VAMP2), mRNA
Length=845
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 414 AGATGATGATCATTTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 463
>gb|AF262953.1| Oryctolagus cuniculus synaptobrevin-2 mRNA, partial cds
Length=243
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATC 47
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Sbjct 197 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATC 243
>ref|XM_006863403.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica vesicle-associated membrane
protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=822
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCAT 49
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Sbjct 327 AGATGATGATCATCTTAGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCAT 375
>gb|KM923926.1| Synthetic construct VAMP2:HRP gene, complete cds
Length=1380
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 281 AGATGATGATCATCCTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 330
>ref|XM_008581719.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus vesicle-associated membrane
protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=2241
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 467 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCGTCCTTATCATCATC 516
>ref|XM_006062897.1| PREDICTED: Bubalus bubalis vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
Length=2744
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 398 AGATGATGATCATCCTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 447
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Sbjct 402 AGATGATGATCATCCTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 451
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2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 545 AGATGATGATCATCCTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 594
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2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 452 AGATGATGATCATCCTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 501
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mRNA
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 668 AGATGATGATCATCCTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 717
>ref|XM_004594763.1| PREDICTED: Ochotona princeps vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Query 3 ATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCAT 49
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Sbjct 365 ATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCTATCATCCTCATCATCAT 411
>ref|XM_004013300.1| PREDICTED: Ovis aries vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2), mRNA
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 533 AGATGATGATCATCCTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 582
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2) (VAMP2), mRNA
emb|X76199.1| B.taurus mRNA for synaptobrevin
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Query 1 AGATGATGATCATCTTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATCATCATC 50
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Sbjct 428 AGATGATGATCATCCTGGGAGTGATTTGCGCCATCATCCTCATTATCATC 477
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HuRef SCAF_1103279188371, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Lambda K H
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>ref|NC_000017.11| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 Primary Assembly
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assembly
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genome shotgun sequence
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 50
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 50
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shotgun sequence
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 50
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blast search - nt
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2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
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>ref|XM_003818056.2| PREDICTED: Pan paniscus vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 615 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 566
>ref|XM_008971314.1| PREDICTED: Pan paniscus vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
Length=2143
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 268 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 219
>ref|XM_005256775.2| PREDICTED: Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
Length=2485
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 634 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 585
>ref|XM_001156324.3| PREDICTED: Pan troglodytes vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
Length=2163
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 302 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 253
>gb|HQ448696.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100072140; CCSB004137_02
vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2) gene, encodes complete protein
Length=450
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 253 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 204
>gb|AC193927.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-388K24 from chromosome 17, complete
sequence
Length=181857
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gene for vesicle-associated membrane protein 2, without stop
codon, in Flexi system
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Sbjct 218 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 169
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2) (VAMP2), mRNA
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3' read VAMP2 mRNA
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sapiens vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2), mRNA
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clone: FCC132D12
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Sbjct 299 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 250
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2), mRNA (cDNA clone MGC:24865 IMAGE:4508990), complete
cds
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2), mRNA (cDNA clone MGC:45137 IMAGE:5203115), complete
cds
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>dbj|AK021522.1| Homo sapiens cDNA FLJ11460 fis, clone HEMBA1001569, highly similar
to SYNAPTOBREVIN 2
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Sbjct 281 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 232
>gb|AC104762.7| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-769H22, complete sequence
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>gb|AF135372.1|AF135372 Homo sapiens synaptobrevin 2 (VAMP2) gene, complete cds
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>gb|BC002737.2| Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2), mRNA (cDNA clone MGC:3377 IMAGE:3628842), complete
cds
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Sbjct 268 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 219
>emb|AJ225044.1| Homo sapiens mRNA for vesicle associated membrane protein 2 (VAMP2)
Length=351
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Sbjct 203 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 154
>gb|M36203.1|HUMSYB2A3 Human synaptobrevin 2 (SYB2) gene, exon 3
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protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 310 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 261
>ref|XM_002827000.3| PREDICTED: Pongo abelii vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 327 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 278
>ref|XM_003912298.2| PREDICTED: Papio anubis vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 330 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 281
>ref|XM_008061155.1| PREDICTED: Tarsius syrichta vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 323 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCTGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 274
>ref|XM_008010264.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 310 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 261
>ref|XM_007972056.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus vesicle-associated membrane protein
2 (LOC103221223), mRNA
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 278 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 229
>ref|XM_007457809.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 293 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 244
>ref|XM_007166614.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni vesicle-associated
membrane protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 347 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 298
>ref|XM_007126640.1| PREDICTED: Physeter catodon vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=1939
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Sbjct 245 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 196
>ref|XM_004310619.1| PREDICTED: Tursiops truncatus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=519
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 338 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 289
>ref|XM_004266874.1| PREDICTED: Orcinus orca vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=2083
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 299 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 250
>ref|XM_003274645.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2), transcript variant 1 (VAMP2), mRNA
Length=1978
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 278 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 229
>ref|XM_004058540.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla vesicle-associated membrane
protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=2149
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 305 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCGGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 256
>emb|CU676450.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017914
5' read VAMP2 mRNA
Length=1260
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 219 TCTGCACGGTAGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 170
>ref|NM_001285213.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101864935 (LOC101864935),
mRNA
dbj|AB173022.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-20639, similar to
human vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin2)
(VAMP2), mRNA, RefSeq: NM_014232.1
Length=2123
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Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 272 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 223
>ref|NM_001032820.1| Macaca mulatta vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2), mRNA
gb|AF240769.1|AF240769 Macaca mulatta VAMP-2 mRNA, complete cds
Length=533
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 298 TCTGCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 249
>ref|XM_008153480.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Query 4 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 291 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 245
>ref|XM_006217795.1| PREDICTED: Vicugna pacos vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=354
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 4 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 203 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 157
>ref|XM_006176955.1| PREDICTED: Camelus ferus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=354
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 203 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 157
>gb|KM923926.1| Synthetic construct VAMP2:HRP gene, complete cds
Length=1380
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 4 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 200 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAAGACCTT 154
>ref|XM_006062897.1| PREDICTED: Bubalus bubalis vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
Length=2744
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 317 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAAGACCTT 271
>ref|XM_006062896.1| PREDICTED: Bubalus bubalis vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
Length=2141
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 321 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAAGACCTT 275
>ref|XM_006761713.1| PREDICTED: Myotis davidii vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=1122
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 7 CGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 296 CGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 253
>ref|XM_006642006.1| PREDICTED: Lepisosteus oculatus synaptobrevin-like (LOC102694715),
mRNA
Length=612
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 7 CGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 221 CGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCTCTCCAGGACCTT 178
>ref|XM_005894834.1| PREDICTED: Bos mutus vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2), mRNA
Length=642
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 371 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAAGACCTT 325
>ref|XM_005878843.1| PREDICTED: Myotis brandtii vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), partial mRNA
Length=964
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 7 CGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 155 CGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGGACCTT 112
>ref|XM_005514402.1| PREDICTED: Columba livia vesicle-associated membrane protein
3 (VAMP3), mRNA
Length=762
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 GCACGGTCGTCCAGTTCTGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 238
>ref|XM_004594763.1| PREDICTED: Ochotona princeps vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=768
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 282 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAGAACCTT 236
>ref|NM_174483.2| Bos taurus vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2), mRNA
emb|X76199.1| B.taurus mRNA for synaptobrevin
Length=585
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCTCGCTCCAGGACCTT 50
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Sbjct 347 GCACGGTCGTCCAGCTCCGACAGCTTCTGGTCCCGCTCCAAGACCTT 301
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT
>ref|XM_007457809.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 3 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 52
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protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 50
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Sbjct 15 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 64
>ref|XM_001156324.3| PREDICTED: Pan troglodytes vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 12 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 61
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sequence
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Sbjct 101866 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 101817
>ref|NM_014232.2| Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 9 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 58
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clone: FCC132D12
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Sbjct 9 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 58
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Sbjct 157843 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 157794
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Sbjct 157843 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 157794
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2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 41 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 88
>ref|XM_005657043.1| PREDICTED: Sus scrofa vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 36 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 83
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(synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 40 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGTCGCCGCCGCCAT 89
>ref|XM_002747935.2| PREDICTED: Callithrix jacchus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 76 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCTGCCGCCAT 125
>ref|XM_004684620.1| PREDICTED: Condylura cristata vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGC 47
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Sbjct 3 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGC 49
>ref|XM_004266874.1| PREDICTED: Orcinus orca vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 50
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Sbjct 9 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCTAGCCGCCGCCGCCAT 58
>gb|BC033870.1| Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2), mRNA (cDNA clone MGC:45137 IMAGE:5203115), complete
cds
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Sbjct 1 CGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 46
>gb|AF135372.1|AF135372 Homo sapiens synaptobrevin 2 (VAMP2) gene, complete cds
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 50
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Sbjct 2708 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGC-GCCGCCGCCAT 2756
>gb|M36201.1|HUMSYB2A1 Human synaptobrevin 2 (SYB2) gene, exon 1
Length=954
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 50
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Sbjct 861 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGC-GCCGCCGCCAT 909
>ref|XM_010362420.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana vesicle-associated membrane
protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Sbjct 23 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCC 67
>ref|XM_002827000.3| PREDICTED: Pongo abelii vesicle-associated membrane protein 2
(synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCC 45
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Sbjct 40 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCC 84
>ref|XM_006062897.1| PREDICTED: Bubalus bubalis vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 21 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCTCGAGCCGCCGCCGCC 68
>ref|XM_006062896.1| PREDICTED: Bubalus bubalis vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), transcript variant X1, mRNA
Length=2141
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 25 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCTCGAGCCGCCGCCGCC 72
>ref|XM_005349803.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (Vamp2), mRNA
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 27 GTCCCGGGCAGCCAGAGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 74
>ref|XM_005067575.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (Vamp2), mRNA
Length=2171
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 14 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGTGCGAGCCGCCGCCGCC 61
>gb|JN953234.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Vamp2:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=40459
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 14215 GTCCCGGGTAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 14262
>gb|JN951642.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Vamp2:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=40398
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 14215 GTCCCGGGTAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 14262
>gb|JN949181.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Per1:tm1(KOMP)Ucd;
transgenic
Length=37222
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 2142 GTCCCGGGTAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 2189
>ref|NM_009497.3| Mus musculus vesicle-associated membrane protein 2 (Vamp2), mRNA
Length=2164
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 2 GTCCCGGGTAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 49
>gb|BC055105.1| Mus musculus vesicle-associated membrane protein 2, mRNA (cDNA
clone MGC:58313 IMAGE:6596132), complete cds
Length=2192
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 2 GTCCCGGGTAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 49
>dbj|AK090178.1| Mus musculus 15 days embryo brain cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:G630012G02 product:vesicle-associated membrane
protein 2, full insert sequence
Length=2181
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 21 GTCCCGGGTAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 68
>emb|AL645527.20| Mouse DNA sequence from clone RP23-26L6 on chromosome 11, complete
sequence
Length=261224
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 5092 GTCCCGGGTAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 5139
>ref|NM_174483.2| Bos taurus vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2), mRNA
emb|X76199.1| B.taurus mRNA for synaptobrevin
Length=585
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 8 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCTCGAGCCGCCGCCGCC 55
>ref|XM_006246593.2| PREDICTED: Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein
2 (Vamp2), transcript variant X1, mRNA
Length=1428
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGC 47
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Sbjct 413 GTCCCGGGTAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGC 459
>ref|NM_001032820.1| Macaca mulatta vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2) (VAMP2), mRNA
gb|AF240769.1|AF240769 Macaca mulatta VAMP-2 mRNA, complete cds
Length=533
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 50
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Sbjct 11 CCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGTCGCCGCCGCCAT 57
>ref|XM_008010264.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus vesicle-associated membrane protein
2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=1683
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCC 45
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Sbjct 23 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGTCGCCGCC 67
>ref|XM_004398470.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens vesicle-associated membrane
protein 2 (synaptobrevin 2) (VAMP2), mRNA
Length=905
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCC 48
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Sbjct 3 GTCCTGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCTCCGCCGCC 50
>gb|BC019608.1| Homo sapiens vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin
2), mRNA (cDNA clone MGC:24865 IMAGE:4508990), complete
cds
Length=894
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Query 11 GCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 50
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Sbjct 1 GCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCAT 40
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
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17 17 8064791 8064974 51M83N49M TATGATGATGATGAGGATGATGGCGCAAATCACTCCCAAGATGATCATCAT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTGAGGTTTTTCCACCAGTATTTGCGCTTGAGCTTGGCTGCGCTTGTT
17 17 8064794 8064977 48M83N52M GATGATGATGAGGATGATGGCGCAAATCACTCCCAAGATGATCATCAT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTGAGGTTTTTCCACCAGTATTTGCGCTTGAGCTTGGCTGCGCTTGTTTCA
17 17 8064797 8064980 45M83N55M GATGATGAGGATGATGGCGCAAATCACTCCCAAGATGATCATCAT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTGAGGTTTTTCCACCAGTATTTGCGCTTGAGCTTGGCTGCGCTTGTTTCAAAC
17 17 8064800 8064983 42M83N58M GATGAGGATGATGGCGCAAATCACTCCCAAGATGATCATCAT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTGAGGTTTTTCCACCAGTATTTGCGCTTGAGCTTGGCTGCGCTTGTTTCAAACTGG
17 17 8064803 8064986 39M83N61M GAGGATGATGGCGCAAATCACTCCCAAGATGATCATCAT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTGAGGTTTTTCCACCAGTATTTGCGCTTGAGCTTGGCTGCGCTTGTTTCAAACTGGGAG
17 17 8064806 8064989 36M83N64M GATGATGGCGCAAATCACTCCCAAGATGATCATCAT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTGAGGTTTTTCCACCAGTATTTGCGCTTGAGCTTGGCTGCGCTTGTTTCAAACTGGGAGGCC
17 17 8064809 8064992 33M83N67M GATGGCGCAAATCACTCCCAAGATGATCATCAT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTGAGGTTTTTCCACCAGTATTTGCGCTTGAGCTTGGCTGCGCTTGTTTCAAACTGGGAGGCCCCC
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17 17 8064815 8064998 27M83N73M GCAAATCACTCCCAAGATGATCATCAT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTTGAGGTTTTTCCACCAGTATTTGCGCTTGAGCTTGGCTGCGCTTGATTCAAACTGGGAGGCCCCCGCCTGG
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17 17 8066282 8065674 88m508n12m CCCGGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCATCACTGCCGCTGCCAAGTCCTCCACCCGCTGCCCCCGCCAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 8066279 8065671 85m508n15m GGGCAGCCAGCGCCAGTCGGAGCCAGCGCGAGCCGCCGCCGCCATCACTGCCGCTGCCAAGTCCTCCACCCGCTGCCCCCGCCAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 8066252 8065644 58m508n42m GCGAGCCGCCGCCGCCATCACTGCCGCTGCCAAGTCCTCCACCCGCTGCCCCCGCCAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 8066243 8065635 49m508n51m CGCCGCCATCACTGCCGCTGCCAAGTCCTCCACCCGCTGCCCCCGCCAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 8066237 8065629 43m508n57m CATCACTGCCGCTGCCAAGTCCTCCACCCGCTGCCCCCGCCAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 8066234 8065626 40m508n60m CACTGCCGCTGCCAAGTCCTCCACCCGCTGCCACCGCCAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 8066228 8065620 34m508n66m CGCTGCCAAGTCCTCCACCCGCTGCCCCCGCCAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 8066225 8065617 31m508n69m TGCCAAGTCCTCCACCCGCTGCCCCCGCCAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 8066217 8065609 23m508n77m CCTCCACCCGCTGCCCCCGCCAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188371, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
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Sbjct 926 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 877
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X3, mRNA
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Sbjct 1061 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 1012
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X1, mRNA
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Sbjct 1205 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 1156
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gene, encodes complete protein
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Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 993 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 944
>ref|XM_004058577.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla recoverin (RCVRN), mRNA
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Sbjct 1011 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 962
>dbj|AB593156.1| Homo sapiens RCVRN mRNA for recoverin, complete cds, clone: HP09147-RBdS105M23
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Sbjct 651 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 602
>dbj|AB528320.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6876, Homo sapiens RCVRN
gene for recoverin, without stop codon, in Flexi system
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Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 574 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 525
>dbj|AK314129.1| Homo sapiens cDNA, FLJ94826, Homo sapiens recoverin (RCV1), mRNA
Length=1044
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Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 1006 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 957
>gb|DQ896068.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010528; FLH190033.01L;
RZPDo839D1065D recoverin (RCV1) gene, encodes complete
protein
Length=643
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Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 587 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 538
>gb|DQ892822.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005452; FLH190037.01X; RZPDo839D1075D
recoverin (RCV1) gene, encodes complete protein
Length=643
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Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 587 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 538
>ref|NM_002903.2| Homo sapiens recoverin (RCVRN), mRNA
Length=1217
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Sbjct 752 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 703
>gb|BC001720.1| Homo sapiens recoverin, mRNA (cDNA clone MGC:1649 IMAGE:3354566),
complete cds
Length=1101
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Sbjct 636 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 587
>gb|BT009838.1| Homo sapiens recoverin mRNA, complete cds
Length=603
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Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 565 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 516
>gb|S62028.1| recoverin [human, retina, mRNA, 1108 nt]
Length=1108
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Sbjct 649 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 600
>gb|S45545.1| cancer-associated retinopathy antigen [human, mRNA, 1101 nt]
Length=1101
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>gb|S43855.1| recoverin=photoreceptor protein [human, retina, mRNA, 1190 nt]
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Sbjct 752 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 703
>gb|AC026591.15| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-655D3, complete sequence
Length=153472
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Sbjct 71847 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 71798
>gb|AY889431.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH109935.01X recoverin
(RCV1) mRNA, complete cds
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Sbjct 565 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 516
>gb|AC005747.1|AC005747 Homo sapiens chromosome 17, clone hRPK.150_K_15, complete sequence
Length=166701
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Sbjct 13427 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 13476
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Sbjct 565 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 516
>ref|XM_003416925.2| PREDICTED: Loxodonta africana recoverin (RCVRN), mRNA
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Sbjct 626 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCAATG 577
>ref|XM_010614976.1| PREDICTED: Fukomys damarensis recoverin (Rcvrn), mRNA
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Sbjct 565 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCAATG 516
>ref|XM_002827027.2| PREDICTED: Pongo abelii recoverin (RCVRN), mRNA
Length=1435
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Sbjct 1010 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTTCCCTCAATG 961
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Length=1232
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Sbjct 817 CAAACTGAATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 768
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transcript variant X10, mRNA
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Sbjct 11388 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCAATG 11339
>ref|XM_004645163.1| PREDICTED: Octodon degus recoverin (Rcvrn), mRNA
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Sbjct 622 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCAATG 573
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Sbjct 991 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 942
>ref|XM_003912338.2| PREDICTED: Papio anubis recoverin (RCVRN), mRNA
Length=1454
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Sbjct 1060 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 1011
>ref|XM_008010350.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus recoverin (RCVRN), mRNA
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Sbjct 1069 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 1020
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Length=1458
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Sbjct 1064 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 1015
>ref|XM_003466216.2| PREDICTED: Cavia porcellus recoverin (Rcvrn), mRNA
Length=1038
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Sbjct 664 CAAACTGAATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCAATG 615
>ref|NM_001194602.1| Macaca mulatta recoverin (RCVRN), mRNA
Length=740
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Sbjct 676 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 627
>ref|NM_009038.2| Mus musculus recoverin (Rcvrn), mRNA
Length=1076
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Sbjct 656 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 607
>gb|BC110564.2| Mus musculus recoverin, mRNA (cDNA clone MGC:129468 IMAGE:40050126),
complete cds
Length=811
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Sbjct 649 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 600
>ref|NM_080901.1| Rattus norvegicus recoverin (Rcvrn), mRNA
gb|AY063482.1| Rattus norvegicus recoverin (Rcvrn) mRNA, complete cds
Length=861
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Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 565 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 516
>emb|X66196.1| M.musculus mRNA for 23 kDa photoreceptor cell-specific protein
Length=1062
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Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 664 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 615
>emb|AL646097.25| Mouse DNA sequence from clone RP23-338M9 on chromosome 11, complete
sequence
Length=212636
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 66547 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 66498
>ref|XM_008153457.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus recoverin (RCVRN), mRNA
Length=615
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Sbjct 565 CAAATTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 516
>ref|XM_006898561.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii recoverin (RCVRN), mRNA
Length=726
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 637 CAAATTGAATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCAATG 588
>ref|XM_006746825.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii recoverin (RCVRN), mRNA
Length=932
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Sbjct 615 CAAATTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGCGTCCCCTCGATG 566
>ref|XM_006099723.1| PREDICTED: Myotis lucifugus recoverin (RCVRN), mRNA
Length=615
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 565 CAAATTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 516
>ref|XM_005878804.1| PREDICTED: Myotis brandtii recoverin (RCVRN), mRNA
Length=841
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Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 565 CAAATTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 516
>ref|XM_004433062.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum recoverin (RCVRN), mRNA
Length=823
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 727 CAAATTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 678
>ref|XM_004398430.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens recoverin (RCVRN), mRNA
Length=931
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 613 CAAATTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 564
>ref|XM_002930427.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca recoverin-like (LOC100466048),
mRNA
Length=705
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAAACTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGTGTCCCCTCAATG 50
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Sbjct 615 CAAATTGGATCAGTCGCAGAATTTCCTTATTGGCCAGGGTCCCCTCGATG 566
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC
>ref|XM_009432756.1| PREDICTED: Pan troglodytes recoverin (RCVRN), transcript variant
X5, mRNA
Length=1300
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 470 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 519
>ref|XM_009432755.1| PREDICTED: Pan troglodytes recoverin (RCVRN), transcript variant
X4, mRNA
Length=1355
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 525 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 574
>ref|XM_009432754.1| PREDICTED: Pan troglodytes recoverin (RCVRN), transcript variant
X3, mRNA
Length=1425
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 595 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 644
>ref|XM_009432753.1| PREDICTED: Pan troglodytes recoverin (RCVRN), transcript variant
X2, mRNA
Length=1490
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 660 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 709
>ref|XM_511841.5| PREDICTED: Pan troglodytes recoverin (RCVRN), transcript variant
X1, mRNA
Length=1634
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 804 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 853
>ref|XM_002827027.2| PREDICTED: Pongo abelii recoverin (RCVRN), mRNA
Length=1435
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 609 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 658
>ref|XM_003818097.2| PREDICTED: Pan paniscus recoverin (RCVRN), mRNA
Length=1232
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 416 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 465
>gb|KJ891991.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01385 RCVRN
gene, encodes complete protein
Length=732
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 229 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 278
>ref|XM_008010350.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus recoverin (RCVRN), mRNA
Length=1461
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 668 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 717
>ref|XM_005582888.1| PREDICTED: Macaca fascicularis recoverin (RCVRN), mRNA
Length=1458
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 663 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 712
>ref|XM_003274674.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys recoverin (RCVRN), mRNA
Length=1409
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 592 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 641
>dbj|AB593156.1| Homo sapiens RCVRN mRNA for recoverin, complete cds, clone: HP09147-RBdS105M23
Length=1075
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 250 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 299
>ref|NM_001194602.1| Macaca mulatta recoverin (RCVRN), mRNA
Length=740
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 275 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 324
>dbj|AB528320.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6876, Homo sapiens RCVRN
gene for recoverin, without stop codon, in Flexi system
Length=617
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 173 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 222
>dbj|AK314129.1| Homo sapiens cDNA, FLJ94826, Homo sapiens recoverin (RCV1), mRNA
Length=1044
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 605 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 654
>gb|DQ896068.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010528; FLH190033.01L;
RZPDo839D1065D recoverin (RCV1) gene, encodes complete
protein
Length=643
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 186 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 235
>gb|DQ892822.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005452; FLH190037.01X; RZPDo839D1075D
recoverin (RCV1) gene, encodes complete protein
Length=643
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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complete cds
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Sbjct 235 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 284
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Sbjct 351 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 400
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Sbjct 64963 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 65012
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(RCV1) mRNA, complete cds
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Sbjct 164 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 213
>gb|AC005747.1|AC005747 Homo sapiens chromosome 17, clone hRPK.150_K_15, complete sequence
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Sbjct 20311 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 20262
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Sbjct 164 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 213
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Sbjct 659 AGTTCTTCCCTGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 708
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mRNA
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Sbjct 199 AGTTCTTCCCCGAGGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 248
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Sbjct 166 AGTTCTTCCCCGAGGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 215
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misc_RNA
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Sbjct 2705 AGTTCTTCCCCGAGGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 2754
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mRNA
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Sbjct 2705 AGTTCTTCCCCGAGGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 2754
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mRNA
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Sbjct 2486 AGTTCTTCCCCGAGGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 2535
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mRNA
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Sbjct 2245 AGTTCTTCCCCGAGGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 2294
>ref|XM_005669238.1| PREDICTED: Sus scrofa recoverin (RCVRN), transcript variant X3,
mRNA
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Sbjct 2558 AGTTCTTCCCCGAGGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 2607
>ref|XM_005669237.1| PREDICTED: Sus scrofa recoverin (RCVRN), transcript variant X2,
mRNA
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 2705 AGTTCTTCCCCGAGGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 2754
>ref|XM_007085958.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica recoverin (RCVRN), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCG 49
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Sbjct 277 AGTTCTTCCCCGAAGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCG 325
>ref|XM_007085957.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica recoverin (RCVRN), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCG 49
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Sbjct 277 AGTTCTTCCCCGAAGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCG 325
>ref|XM_003996209.2| PREDICTED: Felis catus recoverin (RCVRN), mRNA
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCG 49
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Sbjct 1878 AGTTCTTCCCCGAAGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCG 1926
>ref|XM_002747921.2| PREDICTED: Callithrix jacchus recoverin (RCVRN), mRNA
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 598 AGTTCTTCCCCGATGCTGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 647
>ref|XM_004398430.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens recoverin (RCVRN), mRNA
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Query 1 AGTTCTTCCCCGACACCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 50
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Sbjct 212 AGTTCTTCCCTGAGGCCGACCCCAAGGCCTACGCCCAGCATGTGTTCCGC 261
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16295254 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 16295303
>ref|NW_004929405.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150189.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 15889623 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 15889672
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Sbjct 15889851 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 15889900
>gb|CM000507.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 16152458 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 16152507
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16152686 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 16152735
>gb|DS990973.1| Homo sapiens SCAF_1112675837188 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=1100252
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 323845 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 323796
>gb|CH003512.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=81075739
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16887487 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 16887536
>gb|CH003464.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=80652589
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Sbjct 16159060 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 16159109
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16159288 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 16159337
>ref|NW_001838406.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188243, whole genome shotgun sequence
gb|DS486335.1| Homo sapiens SCAF_1103279188243 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=1100241
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 324103 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 324054
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 323875 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 323826
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16151869 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 16151918
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16152097 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 16152146
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=77819263
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16188212 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 16188261
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16188440 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 16188489
>ref|NC_000002.12| Homo sapiens chromosome 2, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000664.2| Homo sapiens chromosome 2, GRCh38 reference primary assembly
Length=242193529
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 136329848 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 136329801
>ref|NT_005403.18| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR2_CTG7_2
gb|GL000029.2| Homo sapiens chromosome 2 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=147687514
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 41833833 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 41833786
>ref|NC_018913.2| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001610.2| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=243205335
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 137092700 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 137092653
>ref|NW_004929304.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150088.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=39440891
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 26837144 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 26837097
>gb|KE141358.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold109, whole genome
shotgun sequence
Length=58306400
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 4042829 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 4042782
>gb|CM000492.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808386
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 129079912 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 129079865
>gb|GL582997.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_17, whole genome
shotgun sequence
Length=24303425
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 4058238 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 4058191
>gb|DS990703.1| Homo sapiens SCAF_1112675837104 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=17647168
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 12609489 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 12609536
>ref|NW_001838859.2| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188159, whole genome shotgun sequence
gb|DS486065.1| Homo sapiens SCAF_1103279188159 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=17647273
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 12609557 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 12609604
>ref|AC_000134.1| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000463.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808360
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 129079799 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 129079752
>gb|CH003449.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234033217
Score = 78.7 bits (42), Expect = 2e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 128224540 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATTACCCC 128224493
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC
>ref|NM_018955.3| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 1, mRNA
Length=1241
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 319
>ref|NG_023320.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), RefSeqGene on chromosome 17
Length=8688
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5112 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 5063
>dbj|AK300882.1| Homo sapiens cDNA FLJ51326 complete cds, highly similar to Homo
sapiens ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=704
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 25
>gb|BC014367.1| Homo sapiens mRNA similar to orosomucoid 1 (cDNA clone IMAGE:3934516)
Length=790
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 80 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 31
>gb|BC021067.1| Homo sapiens cyclin A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3510175), ****
WARNING: chimeric clone ****
Length=4562
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3685 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 3636
>gb|BC038999.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:47606 IMAGE:4943285),
complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 32
>gb|BC046123.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:57581 IMAGE:3879581),
complete cds
Length=951
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 11
>gb|BC000379.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:8385 IMAGE:2820408),
complete cds
Length=989
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 112 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 63
>gb|BC031027.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:32826 IMAGE:4715377),
complete cds
Length=919
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 23
>gb|BC026301.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24729 IMAGE:4280629),
complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 21
>gb|AC093484.2| Homo sapiens chromosome , clone RP11-138I1, complete sequence
Length=170944
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 101953 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 101904
>dbj|AK129498.1| Homo sapiens cDNA FLJ25987 fis, clone CBR05488, highly similar
to Homo sapiens ubiquitin B (UBB)
Length=928
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 21
>gb|BC009301.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:16688 IMAGE:4126622),
complete cds
Length=943
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 9
>gb|BC015127.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24232 IMAGE:3929901),
complete cds
Length=965
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 25
>emb|AL356460.3| Homo sapiens chromosome 17 from PAC 84M10 map17p11.2 region D17S842-D17S953,
complete sequence
Length=161943
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8333 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 8382
>emb|X04803.2| Homo sapiens ubiquitin gene
Length=3107
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 1292
>ref|XM_003831161.2| PREDICTED: Pan paniscus ubiquitin (LOC100987088), transcript
variant X1, mRNA
Length=771
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 CCTGCGAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 314
>dbj|AK305078.1| Pan troglodytes mRNA for ubiquitin, complete cds, clone: PtsC-80-5_H11
Length=779
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 111 CCTGCGAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 62
>ref|NM_001009117.2| Pan troglodytes ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=841
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 50
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Sbjct 125 CCTGCGAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGCTCACC 76
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG
>ref|XM_002827072.3| PREDICTED: Pongo abelii ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=1226
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Sbjct 456 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 505
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 684 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATTCCTCCCG 733
>gb|KJ905333.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_14872 UBB
gene, encodes complete protein
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 359 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 408
>ref|NM_001281720.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 6, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 319 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 368
>ref|NM_001281718.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 4, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 475 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 524
>ref|NM_001281719.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 5, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 473 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 522
>ref|NM_001281717.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 3, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 515 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 564
>ref|NM_001281716.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 2, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 316 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 365
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 544 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 593
>ref|NM_018955.3| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 1, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 460 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 509
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 688 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 737
>ref|XM_004042218.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
7 (UBB), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 83 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 132
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 311 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 360
>ref|XM_004042217.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
6 (UBB), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 365
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 544 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 593
>ref|XM_004042216.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
5 (UBB), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 280 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 329
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 508 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 557
>ref|XM_004042215.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
4 (UBB), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 811 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 860
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 1039 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 1088
>ref|XM_004042214.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
3 (UBB), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 509
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 688 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 737
>ref|XM_004042213.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
2 (UBB), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 186 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 235
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 414 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 463
>ref|XM_004042212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
1 (UBB), mRNA
Length=1562
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 509
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 688 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 737
>ref|NG_023320.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), RefSeqGene on chromosome 17
Length=8688
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5921 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 5970
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 6149 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 6198
>dbj|AK300882.1| Homo sapiens cDNA FLJ51326 complete cds, highly similar to Homo
sapiens ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=704
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 215
>gb|BC014367.1| Homo sapiens mRNA similar to orosomucoid 1 (cDNA clone IMAGE:3934516)
Length=790
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 172 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 221
>gb|BC021067.1| Homo sapiens cyclin A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3510175), ****
WARNING: chimeric clone ****
Length=4562
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3777 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 3826
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 4005 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 4054
>gb|BC038999.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:47606 IMAGE:4943285),
complete cds
Length=957
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 222
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 401 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 450
>gb|BT020104.1| Homo sapiens ubiquitin B mRNA, complete cds
Length=690
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 115
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 343
>gb|BC046123.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:57581 IMAGE:3879581),
complete cds
Length=951
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 152 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 201
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 380 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 429
>gb|BC000379.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:8385 IMAGE:2820408),
complete cds
Length=989
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 253
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 432 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 481
>gb|BC031027.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:32826 IMAGE:4715377),
complete cds
Length=919
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 213
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 392 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 441
>gb|BC026301.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24729 IMAGE:4280629),
complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 211
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 390 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 439
>gb|AC093484.2| Homo sapiens chromosome , clone RP11-138I1, complete sequence
Length=170944
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102762 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 102811
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 102990 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 103039
>dbj|AK129498.1| Homo sapiens cDNA FLJ25987 fis, clone CBR05488, highly similar
to Homo sapiens ubiquitin B (UBB)
Length=928
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 211
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 390 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 439
>dbj|AB089620.1| Gorilla gorilla UbB gene for polyubiquitin B, complete cds
Length=690
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 343
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATTCCTCCCG 343
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 343
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B (UBB) mRNA, partial cds
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B (UBB) mRNA, complete cds
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 343
>gb|AY888190.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH021788.01X ubiquitin
B (UBB) mRNA, complete cds
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 343
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complete cds
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Sbjct 378 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 427
>gb|BC015127.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24232 IMAGE:3929901),
complete cds
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 166 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 215
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Sbjct 394 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 443
>emb|AL356460.3| Homo sapiens chromosome 17 from PAC 84M10 map17p11.2 region D17S842-D17S953,
complete sequence
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Sbjct 7296 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 7247
>emb|X04803.2| Homo sapiens ubiquitin gene
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Sbjct 2376 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 2425
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misc_RNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCC 49
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Sbjct 86 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCC 134
>ref|XM_010346193.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis polyubiquitin-like
(LOC101036343), mRNA
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Sbjct 330 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 379
>ref|XM_010387742.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ubiquitin B (UBB), mRNA
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Sbjct 690 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 739
>ref|XR_748887.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana polyubiquitin-like (LOC104668782),
misc_RNA
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Sbjct 161 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCTCCCCG 210
>ref|XM_009189742.1| PREDICTED: Papio anubis ubiquitin B (UBB), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 691 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCCCCCG 740
>ref|XM_009184993.1| PREDICTED: Papio anubis polyubiquitin-like (LOC101019797), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 87 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCTCCCCG 136
>ref|XM_008996775.1| PREDICTED: Callithrix jacchus ubiquitin B (UBB), transcript variant
X5, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 630 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 679
>ref|XM_002748070.3| PREDICTED: Callithrix jacchus ubiquitin B (UBB), transcript variant
X4, mRNA
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Sbjct 460 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 509
>ref|XM_008996774.1| PREDICTED: Callithrix jacchus ubiquitin B (UBB), transcript variant
X3, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 474 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 523
>ref|XM_008996773.1| PREDICTED: Callithrix jacchus ubiquitin B (UBB), transcript variant
X2, mRNA
Length=1049
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 494 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 543
>ref|XM_003732927.2| PREDICTED: Callithrix jacchus ubiquitin B (UBB), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 682 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 731
>ref|XM_008010471.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ubiquitin B (UBB), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 215 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 264
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCC 49
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Sbjct 443 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCAT-CCCCCC 490
>ref|XM_008010470.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ubiquitin B (UBB), transcript
variant X1, mRNA
Length=720
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 182 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 231
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCC 49
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Sbjct 410 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCAT-CCCCCC 457
>ref|XM_005653994.1| PREDICTED: Sus scrofa ubiquitin B (UBB), transcript variant X3,
mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 637 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 684
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 181 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 230
>ref|XM_005653993.1| PREDICTED: Sus scrofa ubiquitin B (UBB), transcript variant X2,
mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 357 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 406
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 585 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 632
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 129 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 178
>ref|XM_005653992.1| PREDICTED: Sus scrofa ubiquitin B (UBB), transcript variant X1,
mRNA
Length=860
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 324 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 373
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 552 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 599
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 96 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 145
>ref|XM_003282641.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys polyubiquitin-B-like, transcript
variant 4 (LOC100593565), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 316 CATCGAAAATGTGAAGGCTAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 365
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 544 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 593
>ref|XM_004092787.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys polyubiquitin-B-like (LOC100593565),
mRNA
Length=1749
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Sbjct 798 CATCGAAAATGTGAAGGCTAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 847
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 1026 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 1075
>ref|XM_003282639.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys polyubiquitin-B-like, transcript
variant 2 (LOC100593565), mRNA
Length=1228
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 277 CATCGAAAATGTGAAGGCTAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 326
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 505 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 554
>ref|XM_004092786.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys polyubiquitin-B-like (LOC100593565),
mRNA
Length=1242
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
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Sbjct 681 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 730
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mRNA
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Sbjct 453 CATCGAAAATGTGAAGGCTAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 502
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Sbjct 681 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 730
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Sbjct 505 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 554
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Sbjct 472 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 521
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2 (UBB), mRNA
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Sbjct 331 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 380
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Sbjct 340 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 389
>dbj|AK394511.1| Sus scrofa mRNA, clone: MLN010072G02, expressed in mesenteric
lymph node
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Sbjct 150 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 199
>dbj|AK394470.1| Sus scrofa mRNA, clone: MLN010049D03, expressed in mesenteric
lymph node
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Sbjct 459 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 508
>dbj|AK394386.1| Sus scrofa mRNA, clone: MLN010013B01, expressed in mesenteric
lymph node
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Sbjct 161 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 210
>dbj|AK398053.1| Sus scrofa mRNA, clone: TCH010079B08, expressed in trachea
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Sbjct 687 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 736
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Sbjct 915 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 962
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Sbjct 459 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 508
>dbj|AK399439.1| Sus scrofa mRNA, clone: AMP010051A07, expressed in alveolar macrophage
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Sbjct 423 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 472
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Sbjct 651 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 700
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Sbjct 195 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 244
>dbj|AK392357.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10068A06, expressed in hypothalamus
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Sbjct 623 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 670
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 167 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 216
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 353 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 402
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mRNA
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Sbjct 568 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 519
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 340 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 291
>ref|XM_002800315.1| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like (LOC696110), mRNA
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Sbjct 83 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 132
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Sbjct 311 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 360
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3 (LOC696110), mRNA
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Sbjct 400 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 449
>ref|XM_002800314.1| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like (LOC696110), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 404 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 453
>ref|XM_002800313.1| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like (LOC696110), mRNA
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Sbjct 427 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 476
>ref|XM_002800312.1| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like (LOC696110), mRNA
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Sbjct 186 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 235
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Sbjct 414 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 463
>ref|XM_001087796.2| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like, transcript variant
1 (LOC696110), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 171 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 220
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 399 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 448
>ref|XM_001087919.2| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like, transcript variant
2 (LOC696110), mRNA
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Sbjct 168 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 217
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 396 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 445
>dbj|AK346579.1| Sus scrofa mRNA, clone:MLN010014E03, expressed in mesenteric
lymph nodes
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 394 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 443
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 622 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 669
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Sbjct 166 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 215
>dbj|AK345386.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010019E01, expressed in lung
Length=948
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 394 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 443
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 622 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 669
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 166 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 215
>dbj|AK350322.1| Sus scrofa mRNA, clone:SPL010032H05, expressed in spleen
Length=1256
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Sbjct 702 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 751
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 930 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 977
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 474 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 523
>gb|EF688559.1| Sus scrofa ubiquitin B (UBB) gene, complete cds
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Sbjct 154 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 203
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Sbjct 1039 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 1088
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Sbjct 1267 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 1314
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Sbjct 811 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 860
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mRNA
dbj|AB170649.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-11953, similar to
human ubiquitin B (UBB), mRNA, RefSeq: NM_018955.2
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Sbjct 396 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 445
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human ubiquitin B (UBB), mRNA, RefSeq: NM_018955.2
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Sbjct 414 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 463
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lymph node
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Sbjct 166 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 215
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Sbjct 394 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 443
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Sbjct 622 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 669
>dbj|AK232073.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010075E06, expressed in lung
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Sbjct 659 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 708
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Sbjct 431 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 480
>dbj|AK231596.1| Sus scrofa mRNA, clone:ITT010103F07, expressed in intestine
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Sbjct 394 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 443
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Sbjct 622 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 669
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 166 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 215
>dbj|AB071067.1| Macaca fascicularis testis cDNA clone:QtsA-16192, similar to
human ubiquitin B precursor ( UBB ), mRNA, NM_018955.1
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Sbjct 102 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 151
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 330 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 379
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Sbjct 159 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 206
>ref|XM_005964568.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ubiquitin B (UBB), transcript
variant X5, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 411 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 458
>ref|XM_005964567.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ubiquitin B (UBB), transcript
variant X4, mRNA
Length=950
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 185 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 232
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 413 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 460
>ref|XM_005964566.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ubiquitin B (UBB), transcript
variant X3, mRNA
Length=982
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 217 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 264
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 445 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 492
>ref|XM_005964565.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ubiquitin B (UBB), transcript
variant X2, mRNA
Length=936
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 171 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 218
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 399 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 446
>ref|XM_005964564.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ubiquitin B (UBB), transcript
variant X1, mRNA
Length=973
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 208 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 255
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 436 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 483
>ref|XR_173995.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla polyubiquitin-B-like (LOC101138656),
misc_RNA
Length=711
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 165 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 212
>dbj|AK392400.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10071B02, expressed in hypothalamus
Length=719
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 395 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 442
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 167 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 216
>ref|NG_002284.3| Homo sapiens ubiquitin B pseudogene 1 (UBBP1) on chromosome 2
Length=903
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 255 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 302
>gb|AC112255.4| Homo sapiens BAC clone RP11-1193F23 from 2, complete sequence
Length=136713
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 111844 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 111797
>ref|NM_001009202.1| Ovis aries ubiquitin C (UBC), mRNA
gb|AF038129.1|AF038129 Ovis aries polyubiquitin mRNA, complete cds
Length=1102
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 161 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 208
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 389 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 436
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 664
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 845 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 892
>emb|X04801.1| Homo sapiens UBBP1 pseudogene for ubiquitin UBB
Length=918
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 264 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 311
>ref|XM_010339892.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ubiquitin B (UBB),
partial mRNA
Length=736
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 460 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCTCCCG 509
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCC 49
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Sbjct 688 CATCGAAAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCC 736
>ref|XM_009236537.1| PREDICTED: Pongo abelii polyubiquitin-B-like (LOC103889580),
mRNA
Length=778
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 380 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCCCCCG 429
>ref|XM_008956559.1| PREDICTED: Pan paniscus ubiquitin (LOC100987088), transcript
variant X2, mRNA
Length=532
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 216 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCTCCCG 265
>ref|XM_003831161.2| PREDICTED: Pan paniscus ubiquitin (LOC100987088), transcript
variant X1, mRNA
Length=771
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 455 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCTCCCG 504
>dbj|AK399318.1| Sus scrofa mRNA, clone: TCH010030E05, expressed in trachea
Length=1095
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 312 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 361
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 540 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 589
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 768 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 817
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Sbjct 66 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 113
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Sbjct 294 CATTGAGAATGTTAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 343
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variant X1, mRNA
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Sbjct 321 CATTGAGAATGTTAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 370
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misc_RNA
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Sbjct 161 CATCAAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 208
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Sbjct 178 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 225
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mRNA
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Sbjct 573 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 620
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Sbjct 634 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCAT-CCCCCC 681
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Sbjct 66 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 113
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Sbjct 178 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 225
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 406 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 453
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 352 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 392
>ref|XM_005525736.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis polyubiquitin-C-like (LOC102106187),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 519 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 559
>ref|XM_005525735.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis polyubiquitin-C-like (LOC102106187),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 619 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 659
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mRNA
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Sbjct 908 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 955
>ref|XM_005220294.1| PREDICTED: Bos taurus ubiquitin B (UBB), transcript variant X1,
mRNA
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Sbjct 737 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 784
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Sbjct 965 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 1012
>ref|XM_005195028.1| PREDICTED: Bos taurus polyubiquitin-B-like (LOC101902760), mRNA
ref|XM_005217976.1| PREDICTED: Bos taurus polyubiquitin-B-like (LOC101902760), mRNA
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Sbjct 159 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 206
>ref|XR_179943.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys polyubiquitin-B-like (LOC101177200),
misc_RNA
Length=724
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 45
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Sbjct 172 CATCAAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 216
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 400 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCAT-CCCCC 446
>gb|DQ386896.1| Ovis aries polyubiquitin (LOC443016) mRNA, partial cds
Length=167
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 6 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 53
>gb|BC114001.1| Bos taurus polyubiquitin, mRNA (cDNA clone MGC:133799 IMAGE:8064312),
complete cds
Length=1093
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 132
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 588
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 816
>ref|NM_001245837.1| Taeniopygia guttata ubiquitin C variant 14-like (LOC100190462),
mRNA
gb|DQ216253.1| Taeniopygia guttata clone 0058P0031B03 putative ubiquitin C variant
14 mRNA, complete cds
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Sbjct 818 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 865
>ref|NM_001245834.1| Taeniopygia guttata ubiquitin C-like (LOC100190461), mRNA
gb|DQ216250.1| Taeniopygia guttata clone 0058P0027F01 putative ubiquitin C variant
9 mRNA, complete cds
Length=1074
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 590 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 637
>gb|DQ216249.1| Taeniopygia guttata clone 0058P0031D03 putative ubiquitin C variant
9 mRNA, complete cds
Length=1327
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 818 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 865
>gb|DQ216247.1| Taeniopygia guttata clone 0058P0020E12 putative ubiquitin C variant
7 mRNA, complete cds
Length=1383
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 1046 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 1093
>gb|DQ216246.1| Taeniopygia guttata clone 0058P0016A01 putative ubiquitin C variant
7 mRNA, complete cds
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 1046 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 1093
>gb|M96687.1|BVDPP Bovine viral diarrhea virus strain Osloss polyprotein gene, complete
cds
Length=12480
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 5219 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 5266
>gb|AF268174.1| Bovine viral diarrhea virus type 2 strain BVDV2-Ms St T4529c
polyprotein gene, partial cds
Length=1908
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
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Sbjct 1356 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 1403
>dbj|AB099083.1| Bos taurus mRNA for similar to polyubiquitin, partial cds, clone:
ORCS13778
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Sbjct 144 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 191
>dbj|AB099044.1| Bos taurus mRNA for similar to polyubiquitin, partial cds, clone:
ORCS12767
Length=534
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
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Sbjct 89 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 136
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 317 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 364
>dbj|AB098769.1| Bos taurus mRNA for similar to polyubiquitin, partial cds, clone:
ORCS11653
Length=486
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Sbjct 308 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 261
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Sbjct 639 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 686
>emb|Z54176.1| Bovine viral diarrhea virus cpA2 RNA
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Sbjct 639 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 686
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Sbjct 477 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 524
>gb|M87812.1|BVDMSEQH Bovine viral diarrhea virus mRNA sequence
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 347 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 394
>gb|M62431.1|BVDCP1 Bovine viral diarrhea virus CP1 putative helcase/protease mRNA,
partial cds
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Sbjct 3033 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 3080
>gb|M62429.1|BOVPOUBA Bovine polyubiquitin mRNA, 3' end, clone rpub2
Length=636
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Sbjct 100 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 147
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Sbjct 328 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 375
>ref|NM_174133.2| Bos taurus ubiquitin B (UBB), mRNA
emb|Z18245.1| Bos taurus gene for polyubiquitin
Length=1144
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Sbjct 152 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 199
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Sbjct 608 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 655
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Sbjct 836 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 883
>ref|XM_003935104.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ubiquitin-like (LOC101030029),
mRNA
Length=425
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 114 CATCGAAAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCAT-CCCCC 160
>gb|KJ831562.1| Litopenaeus vannamei ubiquitin/ribosomal S27 fusion protein mRNA,
complete cds
Length=558
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Query 2 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 111 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGAATTCCCCC 157
>gb|KJ905334.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_14873 UBB
gene, encodes complete protein
Length=819
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Sbjct 359 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 408
>ref|XM_008270685.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=1255
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 260 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCTCCCG 309
>ref|XM_007124683.1| PREDICTED: Physeter catodon ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=468
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 166 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 215
>gb|JQ928718.1| Litopenaeus vannamei ubiquitin mRNA, complete cds
Length=530
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Sbjct 119 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGAATTCCCCC 165
>tpe|HG508724.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000445889.1 (RP11-138I1.4
gene), antisense
Length=461
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Sbjct 412 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 363
>ref|XM_005525737.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis polyubiquitin-C-like (LOC102106187),
transcript variant X3, mRNA
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Query 5 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 45
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Sbjct 87 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 127
>ref|XM_003793093.1| PREDICTED: Otolemur garnettii uncharacterized LOC100951153 (LOC100951153),
mRNA
Length=765
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Query 5 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 45
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Sbjct 70 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 110
>gb|GU179017.1| Aedes aegypti ubiquitin-L40 ribosomal fusion protein (UbL40)
gene, complete cds
Length=957
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Query 2 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 482 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGACAAGGAAGGAATTCCCCC 528
>ref|XM_001651978.1| Aedes aegypti anopheles stephensi ubiquitin partial mRNA
Length=619
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Query 2 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 136 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGACAAGGAAGGAATTCCCCC 182
>gb|AY433571.1| Aedes aegypti ASAP ID: 38413 cytosolic large ribosomal subunit
L40 mRNA sequence
Length=639
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Query 2 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 136 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGACAAGGAAGGAATTCCCCC 182
>ref|NM_001081862.1| Equus caballus ubiquitin C (UBC), mRNA
gb|AF506969.1| Equus caballus ubiquitin mRNA, complete cds
Length=1157
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 640 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATCCCCCCCG 689
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 868 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATCCCCCCCG 917
>dbj|AK430441.1| Brachypodium distachyon mRNA, clone: PL016C01-A-040_C18
Length=747
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Lambda K H
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17 17 16284723 16284623 100m GGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16382201 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 16382250
>ref|NT_010718.17| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR17_CTG2
gb|GL000129.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 15892986 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 15893035
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 15893214 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 15893263
>ref|NC_018928.2| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=81289577
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16295026 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 16295075
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16295254 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 16295303
>ref|NW_004929405.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150189.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 15889623 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 15889672
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 15889851 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 15889900
>gb|CM000507.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16152458 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 16152507
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16152686 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 16152735
>gb|DS990973.1| Homo sapiens SCAF_1112675837188 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=1100252
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 323845 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 323796
>gb|CH003512.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16887487 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 16887536
>gb|CH003464.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=80652589
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16159060 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 16159109
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16159288 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 16159337
>ref|NW_001838406.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188243, whole genome shotgun sequence
gb|DS486335.1| Homo sapiens SCAF_1103279188243 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 324103 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 324054
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 323875 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 323826
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16151869 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 16151918
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16152097 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 16152146
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=77819263
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16188212 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 16188261
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 16188440 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 16188489
>ref|NC_000002.12| Homo sapiens chromosome 2, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000664.2| Homo sapiens chromosome 2, GRCh38 reference primary assembly
Length=242193529
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 136329848 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 136329801
>ref|NT_005403.18| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR2_CTG7_2
gb|GL000029.2| Homo sapiens chromosome 2 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=147687514
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 41833833 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 41833786
>ref|NC_018913.2| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001610.2| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=243205335
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 137092700 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 137092653
>ref|NW_004929304.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150088.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=39440891
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 26837144 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 26837097
>gb|KE141358.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold109, whole genome
shotgun sequence
Length=58306400
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 4042829 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 4042782
>gb|CM000492.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808386
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 129079912 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 129079865
>gb|GL582997.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_17, whole genome
shotgun sequence
Length=24303425
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 4058238 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 4058191
>gb|DS990703.1| Homo sapiens SCAF_1112675837104 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=17647168
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 12609489 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 12609536
>ref|NW_001838859.2| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188159, whole genome shotgun sequence
gb|DS486065.1| Homo sapiens SCAF_1103279188159 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=17647273
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 12609557 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 12609604
>ref|AC_000134.1| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000463.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808360
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 129079799 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 129079752
>gb|CH003449.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234033217
Score = 78.7 bits (42), Expect = 2e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 128224540 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATTACCCC 128224493
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC
>ref|NM_018955.3| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 1, mRNA
Length=1241
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 381 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 332
>ref|NG_023320.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), RefSeqGene on chromosome 17
Length=8688
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 5125 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 5076
>dbj|AK300882.1| Homo sapiens cDNA FLJ51326 complete cds, highly similar to Homo
sapiens ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=704
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 87 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 38
>gb|BC014367.1| Homo sapiens mRNA similar to orosomucoid 1 (cDNA clone IMAGE:3934516)
Length=790
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 93 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 44
>gb|BC021067.1| Homo sapiens cyclin A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3510175), ****
WARNING: chimeric clone ****
Length=4562
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 3698 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 3649
>gb|BC038999.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:47606 IMAGE:4943285),
complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 94 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 45
>gb|BC046123.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:57581 IMAGE:3879581),
complete cds
Length=951
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 73 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 24
>gb|BC000379.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:8385 IMAGE:2820408),
complete cds
Length=989
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 125 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 76
>gb|BC031027.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:32826 IMAGE:4715377),
complete cds
Length=919
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 85 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 36
>gb|BC026301.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24729 IMAGE:4280629),
complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 83 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 34
>gb|AC093484.2| Homo sapiens chromosome , clone RP11-138I1, complete sequence
Length=170944
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 101966 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 101917
>dbj|AK129498.1| Homo sapiens cDNA FLJ25987 fis, clone CBR05488, highly similar
to Homo sapiens ubiquitin B (UBB)
Length=928
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 83 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 34
>gb|BC009301.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:16688 IMAGE:4126622),
complete cds
Length=943
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 71 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 22
>gb|BC015127.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24232 IMAGE:3929901),
complete cds
Length=965
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 87 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 38
>emb|AL356460.3| Homo sapiens chromosome 17 from PAC 84M10 map17p11.2 region D17S842-D17S953,
complete sequence
Length=161943
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 8320 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 8369
>emb|X04803.2| Homo sapiens ubiquitin gene
Length=3107
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 1354 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 1305
>ref|XM_003831161.2| PREDICTED: Pan paniscus ubiquitin (LOC100987088), transcript
variant X1, mRNA
Length=771
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 CGGATACCAGGATCCTGCGAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 327
>dbj|AK305078.1| Pan troglodytes mRNA for ubiquitin, complete cds, clone: PtsC-80-5_H11
Length=779
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 124 CGGATACCAGGATCCTGCGAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 75
>ref|NM_001009117.2| Pan troglodytes ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=841
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 50
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Sbjct 138 CGGATACCAGGATCCTGCGAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC 89
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG
>ref|XM_002827072.3| PREDICTED: Pongo abelii ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=1226
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 456 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 505
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 684 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATTCCTCCCG 733
>gb|KJ905333.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_14872 UBB
gene, encodes complete protein
Length=819
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 131 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 180
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 587 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 636
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 359 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 408
>ref|NM_001281720.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 6, mRNA
Length=872
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 91 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 140
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 319 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 368
>ref|NM_001281718.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 4, mRNA
Length=1028
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 247 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 296
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 475 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 524
>ref|NM_001281719.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 5, mRNA
Length=1026
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 245 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 294
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 473 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 522
>ref|NM_001281717.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 3, mRNA
Length=1068
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 287 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 336
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 515 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 564
>ref|NM_001281716.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 2, mRNA
Length=1097
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 316 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 365
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 544 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 593
>ref|NM_018955.3| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 1, mRNA
Length=1241
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 509
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 688 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 737
>ref|XM_004042218.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
7 (UBB), mRNA
Length=1185
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 132
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 311 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 360
>ref|XM_004042217.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
6 (UBB), mRNA
Length=1418
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 365
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 544 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 593
>ref|XM_004042216.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
5 (UBB), mRNA
Length=1382
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 329
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 508 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 557
>ref|XM_004042215.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
4 (UBB), mRNA
Length=1913
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 860
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 1039 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 1088
>ref|XM_004042214.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
3 (UBB), mRNA
Length=1123
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 509
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 688 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 737
>ref|XM_004042213.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
2 (UBB), mRNA
Length=1288
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 186 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 235
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 414 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 463
>ref|XM_004042212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
1 (UBB), mRNA
Length=1562
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 509
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 688 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 737
>ref|NG_023320.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), RefSeqGene on chromosome 17
Length=8688
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5921 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 5970
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 6149 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 6198
>dbj|AK300882.1| Homo sapiens cDNA FLJ51326 complete cds, highly similar to Homo
sapiens ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=704
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 166 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 215
>gb|BC014367.1| Homo sapiens mRNA similar to orosomucoid 1 (cDNA clone IMAGE:3934516)
Length=790
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 172 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 221
>gb|BC021067.1| Homo sapiens cyclin A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3510175), ****
WARNING: chimeric clone ****
Length=4562
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3777 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 3826
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 4005 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 4054
>gb|BC038999.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:47606 IMAGE:4943285),
complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 173 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 222
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 401 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 450
>gb|BT020104.1| Homo sapiens ubiquitin B mRNA, complete cds
Length=690
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 66 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 115
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 343
>gb|BC046123.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:57581 IMAGE:3879581),
complete cds
Length=951
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 152 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 201
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 380 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 429
>gb|BC000379.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:8385 IMAGE:2820408),
complete cds
Length=989
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 253
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 432 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 481
>gb|BC031027.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:32826 IMAGE:4715377),
complete cds
Length=919
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 213
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 392 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 441
>gb|BC026301.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24729 IMAGE:4280629),
complete cds
Length=957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 162 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 211
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Sbjct 390 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 439
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Sbjct 102990 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 103039
>dbj|AK129498.1| Homo sapiens cDNA FLJ25987 fis, clone CBR05488, highly similar
to Homo sapiens ubiquitin B (UBB)
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Sbjct 390 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 439
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATTCCTCCCG 343
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 343
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B (UBB) mRNA, partial cds
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 343
>gb|AY888785.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH017074.01X ubiquitin
B (UBB) mRNA, complete cds
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Sbjct 66 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 115
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 343
>gb|AY888190.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH021788.01X ubiquitin
B (UBB) mRNA, complete cds
Length=690
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Sbjct 66 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 115
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 343
>gb|BC009301.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:16688 IMAGE:4126622),
complete cds
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Sbjct 378 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 427
>gb|BC015127.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24232 IMAGE:3929901),
complete cds
Length=965
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Sbjct 166 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 215
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 394 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 443
>emb|AL356460.3| Homo sapiens chromosome 17 from PAC 84M10 map17p11.2 region D17S842-D17S953,
complete sequence
Length=161943
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Sbjct 7296 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 7247
>emb|X04803.2| Homo sapiens ubiquitin gene
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 2376 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 2425
>ref|XR_166932.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ubiquitin-like (LOC101047926),
misc_RNA
Length=323
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCC 49
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Sbjct 86 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCC 134
>ref|XM_010346193.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis polyubiquitin-like
(LOC101036343), mRNA
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Sbjct 330 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 379
>ref|XM_010387742.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=1231
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 462 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 511
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 690 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 739
>ref|XR_748887.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana polyubiquitin-like (LOC104668782),
misc_RNA
Length=708
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 161 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCTCCCCG 210
>ref|XM_009189742.1| PREDICTED: Papio anubis ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=1234
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 235 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 284
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 463 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCCCCCG 512
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 691 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCCCCCG 740
>ref|XM_009184993.1| PREDICTED: Papio anubis polyubiquitin-like (LOC101019797), mRNA
Length=549
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 87 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCTCCCCG 136
>ref|XM_008996775.1| PREDICTED: Callithrix jacchus ubiquitin B (UBB), transcript variant
X5, mRNA
Length=1185
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 630 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 679
>ref|XM_002748070.3| PREDICTED: Callithrix jacchus ubiquitin B (UBB), transcript variant
X4, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 460 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 509
>ref|XM_008996774.1| PREDICTED: Callithrix jacchus ubiquitin B (UBB), transcript variant
X3, mRNA
Length=1029
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 474 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 523
>ref|XM_008996773.1| PREDICTED: Callithrix jacchus ubiquitin B (UBB), transcript variant
X2, mRNA
Length=1049
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 494 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 543
>ref|XM_003732927.2| PREDICTED: Callithrix jacchus ubiquitin B (UBB), transcript variant
X1, mRNA
Length=1237
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 682 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 731
>ref|XM_008010471.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ubiquitin B (UBB), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 215 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 264
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCC 49
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Sbjct 443 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCAT-CCCCCC 490
>ref|XM_008010470.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ubiquitin B (UBB), transcript
variant X1, mRNA
Length=720
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 182 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 231
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 1/49 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCC 49
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Sbjct 410 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCAT-CCCCCC 457
>ref|XM_005653994.1| PREDICTED: Sus scrofa ubiquitin B (UBB), transcript variant X3,
mRNA
Length=945
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 409 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 458
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 684
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 181 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 230
>ref|XM_005653993.1| PREDICTED: Sus scrofa ubiquitin B (UBB), transcript variant X2,
mRNA
Length=893
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 406
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 585 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 632
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 129 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 178
>ref|XM_005653992.1| PREDICTED: Sus scrofa ubiquitin B (UBB), transcript variant X1,
mRNA
Length=860
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 324 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 373
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 552 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 599
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 96 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 145
>ref|XM_003282641.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys polyubiquitin-B-like, transcript
variant 4 (LOC100593565), mRNA
Length=1267
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 316 CATCGAAAATGTGAAGGCTAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 365
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 544 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 593
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Sbjct 1026 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 1075
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variant 2 (LOC100593565), mRNA
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mRNA
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mRNA
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Sbjct 681 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 730
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Sbjct 505 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 554
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2 (UBB), mRNA
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Sbjct 331 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 380
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Sbjct 340 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 389
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lymph node
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Sbjct 150 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 199
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lymph node
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Sbjct 459 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 508
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lymph node
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Sbjct 459 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 508
>dbj|AK399439.1| Sus scrofa mRNA, clone: AMP010051A07, expressed in alveolar macrophage
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Sbjct 423 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 472
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Sbjct 651 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 700
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 195 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 244
>dbj|AK392357.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10068A06, expressed in hypothalamus
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Sbjct 395 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 444
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Sbjct 623 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 670
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 167 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 216
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Sbjct 353 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 402
>ref|XM_001088768.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC700414 (LOC700414),
mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 340 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 291
>ref|XM_002800315.1| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like (LOC696110), mRNA
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Sbjct 83 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 132
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Sbjct 311 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 360
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3 (LOC696110), mRNA
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Sbjct 400 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 449
>ref|XM_002800314.1| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like (LOC696110), mRNA
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Sbjct 176 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 225
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Sbjct 404 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 453
>ref|XM_002800313.1| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like (LOC696110), mRNA
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Sbjct 427 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 476
>ref|XM_002800312.1| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like (LOC696110), mRNA
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Sbjct 186 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 235
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Sbjct 414 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 463
>ref|XM_001087796.2| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like, transcript variant
1 (LOC696110), mRNA
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Sbjct 171 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 220
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Sbjct 399 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 448
>ref|XM_001087919.2| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like, transcript variant
2 (LOC696110), mRNA
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Sbjct 168 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 217
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 396 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 445
>dbj|AK346579.1| Sus scrofa mRNA, clone:MLN010014E03, expressed in mesenteric
lymph nodes
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Sbjct 394 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 443
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 622 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 669
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 166 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 215
>dbj|AK345386.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010019E01, expressed in lung
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mRNA
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human ubiquitin B (UBB), mRNA, RefSeq: NM_018955.2
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>dbj|AB170212.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10815, similar to
human ubiquitin B (UBB), mRNA, RefSeq: NM_018955.2
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Sbjct 414 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 463
>dbj|AK233993.1| Sus scrofa mRNA, clone:MLN010089F05, expressed in mesenteric
lymph node
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Sbjct 622 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 669
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Sbjct 166 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 215
>dbj|AK232547.1| Sus scrofa mRNA, clone:LVR010067F09, expressed in liver
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Sbjct 394 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 443
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Sbjct 622 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 669
>dbj|AK232073.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010075E06, expressed in lung
Length=1215
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 431 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 480
>dbj|AK231596.1| Sus scrofa mRNA, clone:ITT010103F07, expressed in intestine
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Sbjct 394 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 443
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 622 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 669
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 166 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 215
>dbj|AB071067.1| Macaca fascicularis testis cDNA clone:QtsA-16192, similar to
human ubiquitin B precursor ( UBB ), mRNA, NM_018955.1
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 102 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAAATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 151
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 330 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 379
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Sbjct 159 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 206
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variant X5, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 411 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 458
>ref|XM_005964567.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ubiquitin B (UBB), transcript
variant X4, mRNA
Length=950
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 185 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 232
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 413 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 460
>ref|XM_005964566.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ubiquitin B (UBB), transcript
variant X3, mRNA
Length=982
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 445 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 492
>ref|XM_005964565.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ubiquitin B (UBB), transcript
variant X2, mRNA
Length=936
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Sbjct 171 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 218
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 399 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 446
>ref|XM_005964564.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ubiquitin B (UBB), transcript
variant X1, mRNA
Length=973
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Sbjct 208 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 255
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 436 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 483
>ref|XR_173995.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla polyubiquitin-B-like (LOC101138656),
misc_RNA
Length=711
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 165 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 212
>dbj|AK392400.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10071B02, expressed in hypothalamus
Length=719
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 395 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 442
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 167 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 216
>ref|NG_002284.3| Homo sapiens ubiquitin B pseudogene 1 (UBBP1) on chromosome 2
Length=903
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 255 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 302
>gb|AC112255.4| Homo sapiens BAC clone RP11-1193F23 from 2, complete sequence
Length=136713
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 111844 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 111797
>ref|NM_001009202.1| Ovis aries ubiquitin C (UBC), mRNA
gb|AF038129.1|AF038129 Ovis aries polyubiquitin mRNA, complete cds
Length=1102
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 161 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 208
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 389 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 436
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 617 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 664
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 845 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 892
>emb|X04801.1| Homo sapiens UBBP1 pseudogene for ubiquitin UBB
Length=918
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 264 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 311
>ref|XM_010339892.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ubiquitin B (UBB),
partial mRNA
Length=736
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 460 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCTCCCG 509
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCC 49
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Sbjct 688 CATCGAAAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCC 736
>ref|XM_009236537.1| PREDICTED: Pongo abelii polyubiquitin-B-like (LOC103889580),
mRNA
Length=778
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variant X2, mRNA
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Sbjct 216 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCTCCCG 265
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variant X1, mRNA
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Sbjct 455 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCTCCCG 504
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Sbjct 768 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATTCCCCCCG 817
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Sbjct 431 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 480
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Sbjct 454 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 503
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Sbjct 445 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 494
>dbj|AB089619.1| Pan troglodytes UbB gene for polyubiquitin B, complete cds
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Sbjct 294 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 343
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variant X5, mRNA
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Sbjct 294 CATTGAGAATGTTAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 343
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variant X4, mRNA
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Sbjct 66 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 113
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variant X3, mRNA
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Sbjct 294 CATTGAGAATGTTAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 343
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variant X2, mRNA
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Sbjct 66 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 113
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Sbjct 294 CATTGAGAATGTTAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 343
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variant X1, mRNA
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Sbjct 93 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 140
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Sbjct 321 CATTGAGAATGTTAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 370
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misc_RNA
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Sbjct 161 CATCAAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTACCCC 208
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Sbjct 178 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 225
>ref|XM_006074403.1| PREDICTED: Bubalus bubalis polyubiquitin-C-like (LOC102405146),
mRNA
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Sbjct 345 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 392
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Sbjct 573 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 620
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Sbjct 634 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCAT-CCCCCC 681
>ref|XM_005908816.1| PREDICTED: Bos mutus polyubiquitin-B-like (LOC102281112), mRNA
Length=373
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Sbjct 66 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 113
>ref|XM_005887255.1| PREDICTED: Bos mutus ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=583
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 372 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 419
>ref|XM_005693600.1| PREDICTED: Capra hircus ubiquitin B (UBB), mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 178 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 225
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 406 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 453
>ref|XM_005525738.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis polyubiquitin-C-like (LOC102106187),
transcript variant X4, mRNA
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 352 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 392
>ref|XM_005525736.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis polyubiquitin-C-like (LOC102106187),
transcript variant X2, mRNA
Length=1193
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Sbjct 287 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 334
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Query 5 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 45
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Sbjct 519 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 559
>ref|XM_005525735.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis polyubiquitin-C-like (LOC102106187),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 387 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 434
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Query 5 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 45
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Sbjct 619 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 659
>ref|XM_005220295.1| PREDICTED: Bos taurus ubiquitin B (UBB), transcript variant X2,
mRNA
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Sbjct 224 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 271
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 680 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 727
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 908 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 955
>ref|XM_005220294.1| PREDICTED: Bos taurus ubiquitin B (UBB), transcript variant X1,
mRNA
Length=1274
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 281 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 328
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Sbjct 737 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 784
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Sbjct 965 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 1012
>ref|XM_005195028.1| PREDICTED: Bos taurus polyubiquitin-B-like (LOC101902760), mRNA
ref|XM_005217976.1| PREDICTED: Bos taurus polyubiquitin-B-like (LOC101902760), mRNA
Length=390
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 159 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 206
>ref|XR_179943.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys polyubiquitin-B-like (LOC101177200),
misc_RNA
Length=724
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 45
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Sbjct 172 CATCAAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 216
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 400 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCAT-CCCCC 446
>gb|DQ386896.1| Ovis aries polyubiquitin (LOC443016) mRNA, partial cds
Length=167
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 53
>gb|BC114001.1| Bos taurus polyubiquitin, mRNA (cDNA clone MGC:133799 IMAGE:8064312),
complete cds
Length=1093
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 132
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 588
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 816
>ref|NM_001245837.1| Taeniopygia guttata ubiquitin C variant 14-like (LOC100190462),
mRNA
gb|DQ216253.1| Taeniopygia guttata clone 0058P0031B03 putative ubiquitin C variant
14 mRNA, complete cds
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 818 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 865
>ref|NM_001245834.1| Taeniopygia guttata ubiquitin C-like (LOC100190461), mRNA
gb|DQ216250.1| Taeniopygia guttata clone 0058P0027F01 putative ubiquitin C variant
9 mRNA, complete cds
Length=1074
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 637
>gb|DQ216249.1| Taeniopygia guttata clone 0058P0031D03 putative ubiquitin C variant
9 mRNA, complete cds
Length=1327
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 865
>gb|DQ216247.1| Taeniopygia guttata clone 0058P0020E12 putative ubiquitin C variant
7 mRNA, complete cds
Length=1383
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 1046 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 1093
>gb|DQ216246.1| Taeniopygia guttata clone 0058P0016A01 putative ubiquitin C variant
7 mRNA, complete cds
Length=1377
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1046 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 1093
>gb|M96687.1|BVDPP Bovine viral diarrhea virus strain Osloss polyprotein gene, complete
cds
Length=12480
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 5219 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 5266
>gb|AF268174.1| Bovine viral diarrhea virus type 2 strain BVDV2-Ms St T4529c
polyprotein gene, partial cds
Length=1908
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 1356 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 1403
>dbj|AB099083.1| Bos taurus mRNA for similar to polyubiquitin, partial cds, clone:
ORCS13778
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 144 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 191
>dbj|AB099044.1| Bos taurus mRNA for similar to polyubiquitin, partial cds, clone:
ORCS12767
Length=534
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 89 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 136
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 364
>dbj|AB098769.1| Bos taurus mRNA for similar to polyubiquitin, partial cds, clone:
ORCS11653
Length=486
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 308 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 261
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 639 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 686
>emb|Z54176.1| Bovine viral diarrhea virus cpA2 RNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 639 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 686
>gb|M87813.1|BVDMSEQI Bovine viral diarrhea virus mRNA sequence
Length=874
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 477 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 524
>gb|M87812.1|BVDMSEQH Bovine viral diarrhea virus mRNA sequence
Length=768
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 347 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 394
>gb|M62431.1|BVDCP1 Bovine viral diarrhea virus CP1 putative helcase/protease mRNA,
partial cds
Length=5688
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 3033 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 3080
>gb|M62429.1|BOVPOUBA Bovine polyubiquitin mRNA, 3' end, clone rpub2
Length=636
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 100 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 147
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 328 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 375
>ref|NM_174133.2| Bos taurus ubiquitin B (UBB), mRNA
emb|Z18245.1| Bos taurus gene for polyubiquitin
Length=1144
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 152 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 199
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 608 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 655
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 836 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 883
>ref|XM_003935104.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ubiquitin-like (LOC101030029),
mRNA
Length=425
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 1/48 (2%)
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 114 CATCGAAAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCAT-CCCCC 160
>gb|KJ831562.1| Litopenaeus vannamei ubiquitin/ribosomal S27 fusion protein mRNA,
complete cds
Length=558
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Strand=Plus/Plus
Query 2 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 111 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGAATTCCCCC 157
>gb|KJ905334.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_14873 UBB
gene, encodes complete protein
Length=819
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 359 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 408
>ref|XM_008270685.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=1255
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 260 CATCGAGAATGTCAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCTCCCG 309
>ref|XM_007124683.1| PREDICTED: Physeter catodon ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=468
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 166 CATCGAGAACGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATCCCCCCCG 215
>gb|JQ928718.1| Litopenaeus vannamei ubiquitin mRNA, complete cds
Length=530
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 2 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 119 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGAATTCCCCC 165
>tpe|HG508724.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000445889.1 (RP11-138I1.4
gene), antisense
Length=461
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 412 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG 363
>ref|XM_005525737.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis polyubiquitin-C-like (LOC102106187),
transcript variant X3, mRNA
Length=761
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 5 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 45
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 87 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 127
>ref|XM_003793093.1| PREDICTED: Otolemur garnettii uncharacterized LOC100951153 (LOC100951153),
mRNA
Length=765
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 45
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 GAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCC 110
>gb|GU179017.1| Aedes aegypti ubiquitin-L40 ribosomal fusion protein (UbL40)
gene, complete cds
Length=957
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 482 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGACAAGGAAGGAATTCCCCC 528
>ref|XM_001651978.1| Aedes aegypti anopheles stephensi ubiquitin partial mRNA
Length=619
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 136 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGACAAGGAAGGAATTCCCCC 182
>gb|AY433571.1| Aedes aegypti ASAP ID: 38413 cytosolic large ribosomal subunit
L40 mRNA sequence
Length=639
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 2 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCC 48
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Sbjct 136 ATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGACAAGGAAGGAATTCCCCC 182
>ref|NM_001081862.1| Equus caballus ubiquitin C (UBC), mRNA
gb|AF506969.1| Equus caballus ubiquitin mRNA, complete cds
Length=1157
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 640 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATCCCCCCCG 689
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 868 CATCGAGAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCATCCCCCCCG 917
>dbj|AK430441.1| Brachypodium distachyon mRNA, clone: PL016C01-A-040_C18
Length=747
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Query 1 CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCG 50
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Sbjct 140 CATCGACAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAGGGCAT-CCCCCCG 188
Lambda K H
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Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
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17 17 16285252 16284435 38m717n62m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACA
17 17 16285249 16284432 35m717n65m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACACAAACAAGC
17 17 16285246 16284707 32m439n68m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTC
17 17 16285243 16284704 29m439n71m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGT
17 17 16285239 16284700 25m439n75m AGAATCGTCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAAC
17 17 16285225 16284739 11m386n89m AG
17 17 16285224 16285319 10m717n57m16285287F33M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAA
17 17 16285218 16284679 4m439n96m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCC
17 17 16285215 16284676 1m439n99m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCG
17 17 16284838 16284738 100m AGA
17 17 16284834 16284734 100m AGAATCG
17 17 16284830 16284730 100m AGAATCGCCGA
17 17 16284827 16284727 100m AGAATCGCCGATCG
17 17 16284824 16284724 100m AGAATCGCCGATCGGTT
17 17 16284820 16284720 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGC
17 17 16284817 16284717 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTC
17 17 16284813 16284713 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTT
17 17 16284805 16284705 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCG
17 17 16284796 16284696 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGC
17 17 16284791 16284691 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCG
17 17 16284783 16284683 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACC
17 17 16284780 16284680 100m AGTATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCC
17 17 16284776 16284676 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCG
17 17 16284771 16284671 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCACCGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCC
17 17 16284766 16284666 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAG
17 17 16284760 16284660 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAAC
17 17 16284756 16284656 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGG
17 17 16284753 16284653 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCC
17 17 16284746 16284646 100m AGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCC
17 17 16284737 16284637 100m TCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGC
17 17 16284734 16284634 100m CCGATCGGTAAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCA
17 17 16284729 16284629 100m GGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCC
17 17 16284723 16284623 100m GGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCA
17 17 16284718 16284618 100m CCGTTAGGTTCCCTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCG
17 17 16284715 16284615 100m TTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCC
17 17 16284710 16284610 100m TTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCCTCCCC
17 17 16284700 16284600 100m GCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCCTCCCCTCCCCCACGC
17 17 16284688 16284588 100m CAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCCTCCCCTCCCCCACGCCCTCCCCTCAGC
17 17 16284653 16284553 100m ACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCCTCCCCTCCCCCACGCCCTCCCCTCAGCGGCCCACCCAACCCCAAGAAGCCTCCACCTTGACC
17 17 16284649 16284549 100m ACCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCCTCCCCTCCCCCACGCCCTCCCCTCAGCGGCCCACCCACCCCCAAGAAGCCTCCACCTTGACCTCAC
17 17 16284632 16284532 100m GCCGCGTCCCCTCGCCCTCCCCTCCCCCACGCCCTCCCCTCAGCGGCCCACCCAACCCCAAGAAGCCTCCACCTTGACCTCACCCATTCCCCCCTCTCAC
17 17 16284555 16284455 100m CCTCACCCATTCCCCCCTCTCACACCCCCCCAAGGTCGTTACGGCTGCGGGCCAGTACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTC
17 17 16284490 16285564 50m16285287F16M228N34M CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCG
17 17 16284488 16285566 48m16285287F38M228N14M GATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCATCCCTCCCGAC
17 17 16284472 16285582 32m16285287F38M228N30M CAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCT
17 17 16284467 16285587 27m16285287F16M228N57M ACCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTT
17 17 16284466 16285588 26m16285287F16M228N58M CCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTT
17 17 16284466 16285816 26m16285287F16M456N58M CCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 16284466 16285588 26m16285287F16M228N58M CCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTT
17 17 16284466 16285588 26m16285287F16M228N58M CCAACCACGTCCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTT
17 17 16284464 16285590 24m16285287F16M228N60M AACCACGTCCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTT
17 17 16284462 16285364 22m16285287F78M CCACGTCCACCCACAGTGACAC CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAA
17 17 16284462 16285364 22m16285287F78M CCACGTCCACCCACAGTGACAC CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAA
17 17 16284459 16285595 19m16285287F16M228N65M CGTCCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCAAGATCAAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTT
17 17 16284456 16285598 16m16285287F16M228N68M CCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCAAGATCAAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTT
17 17 16284456 16285826 16m16285287F16M228N44M228N24M CCACCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCAAGATCAAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAG||||||||||
17 17 16284453 16285601 13m16285287F16M228N71M CCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCAAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAAAGGCTCATCTTT
17 17 16284453 16285829 13m16285287F16M228N44M228N27M CCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCAAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAAAG||||||||||
17 17 16284453 16285601 13m16285287F16M228N71M CCCACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTT
17 17 16284450 16285604 10m16285287F16M228N74M ACAGGGACAC CATCGAAAATGTGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCAAGATCCAGGATAAAGACGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTT
17 17 16284450 16285604 10m16285287F16M228N74M ACAGGGACAC CATCGAAAATGGGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCAAGATCCAGGATAAAGAAGACATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTT
17 17 16285277 16285377 100M CAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGAT
17 17 16285280 16285380 100M TGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGC
17 17 16285283 16285383 100M CACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCAGCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGG
17 17 16285286 16285386 100M CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACT
17 17 16285289 16285389 100M CGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTT
17 17 16285292 16285392 100M AAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCT
17 17 16285295 16285395 100M TGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGAC
17 17 16285298 16285398 100M GAAGGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTAC
17 17 16285301 16285401 100M GGCCAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAAC
17 17 16285304 16285404 100M CAAGATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGGCTACAACATC
17 17 16285307 16285407 100M GATCCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTGTGACTACAACATCCAG
17 17 16285310 16285410 100M CCAGGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAG
17 17 16285313 16285413 100M GGATAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAG
17 17 16285316 16285416 100M TAAGGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCG
17 17 16285319 16285419 100M GGAAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACC
17 17 16285322 16285422 100M AGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGCTGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTG
17 17 16285325 16285425 100M CATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCAC
17 17 16285328 16285428 100M TCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTG
17 17 16285331 16285431 100M CCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTC
17 17 16285334 16285434 100M CGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTG
17 17 16285337 16285437 100M CCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGT
17 17 16285340 16285440 100M GCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTG
17 17 16285343 16285443 100M GAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGA
17 17 16285346 16285446 100M GCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGG
17 17 16285349 16285449 100M CATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGT
17 17 16285352 16285452 100M CTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGGGGTATG
17 17 16285355 16285455 100M TGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGGGGTATGCAG
17 17 16285358 16285458 100M AGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATC
17 17 16285361 16285461 100M CAAGCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTC
17 17 16285364 16285464 100M GCAGCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTG
17 17 16285367 16285467 100M GCTGGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAG
17 17 16285370 16285470 100M GGAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACC
17 17 16285373 16285473 100M AGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTG
17 17 16285376 16285476 100M TGGCCGGACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACC
17 17 16285379 16285479 100M CCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGC
17 17 16285382 16285482 100M TACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAG
17 17 16285385 16285485 100M TCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGCGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACC
17 17 16285388 16285488 100M TCCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTAGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATC
17 17 16285391 16285491 100M TGACTACAACATCCAGTAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGAGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACC
17 17 16285394 16285494 100M CTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTACTGCGTCTGAGAGGAGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTG
17 17 16285397 16285497 100M CCACGTCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAA
17 17 16285400 16285500 100M CATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTG
17 17 16285403 16285503 100M CCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAG
17 17 16285406 16285506 100M GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCC
17 17 16285409 16285509 100M GGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGT
17 17 16285412 16285512 100M GTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGAC
17 17 16285415 16285515 100M GACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACC
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genome shotgun sequence
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 19848061 GAAAGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 19848110
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CAGTACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA
>ref|NG_023320.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), RefSeqGene on chromosome 17
Length=8688
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5138 CAGTACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 5089
>gb|AC093484.2| Homo sapiens chromosome , clone RP11-138I1, complete sequence
Length=170944
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 101979 CAGTACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 101930
>emb|AL356460.3| Homo sapiens chromosome 17 from PAC 84M10 map17p11.2 region D17S842-D17S953,
complete sequence
Length=161943
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8307 CAGTACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 8356
>emb|X04803.2| Homo sapiens ubiquitin gene
Length=3107
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CAGTACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1367 CAGTACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 1318
>ref|NM_018955.3| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 1, mRNA
Length=1241
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 345
>dbj|AK300882.1| Homo sapiens cDNA FLJ51326 complete cds, highly similar to Homo
sapiens ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=704
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 51
>gb|BC014367.1| Homo sapiens mRNA similar to orosomucoid 1 (cDNA clone IMAGE:3934516)
Length=790
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 57
>gb|BC021067.1| Homo sapiens cyclin A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3510175), ****
WARNING: chimeric clone ****
Length=4562
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3707 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 3662
>gb|BC038999.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:47606 IMAGE:4943285),
complete cds
Length=957
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 103 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 58
>gb|BC046123.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:57581 IMAGE:3879581),
complete cds
Length=951
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 82 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 37
>gb|BC000379.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:8385 IMAGE:2820408),
complete cds
Length=989
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 134 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 89
>gb|BC031027.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:32826 IMAGE:4715377),
complete cds
Length=919
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 49
>gb|BC026301.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24729 IMAGE:4280629),
complete cds
Length=957
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 47
>dbj|AK129498.1| Homo sapiens cDNA FLJ25987 fis, clone CBR05488, highly similar
to Homo sapiens ubiquitin B (UBB)
Length=928
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 47
>gb|BC009301.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:16688 IMAGE:4126622),
complete cds
Length=943
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 80 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 35
>gb|BC015127.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24232 IMAGE:3929901),
complete cds
Length=965
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 5 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96 ACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA 51
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA
>ref|XM_010387742.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=1231
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 631
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 810 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 859
>ref|XM_009189742.1| PREDICTED: Papio anubis ubiquitin B (UBB), mRNA
Length=1234
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 860
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 583 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTATGCAGA 632
>gb|KJ905334.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_14873 UBB
gene, encodes complete protein
Length=819
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 251 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 300
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 479 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGCATGCAGA 528
>gb|KJ905333.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_14872 UBB
gene, encodes complete protein
Length=819
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 528
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 251 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGGGGTGGTATGCAGA 300
>ref|XM_008010470.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ubiquitin B (UBB), transcript
variant X1, mRNA
Length=720
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 351
>tpe|HG508724.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000445889.1 (RP11-138I1.4
gene), antisense
Length=461
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 243
>ref|NM_001281720.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 6, mRNA
Length=872
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 260
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 488
>ref|NM_001281718.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 4, mRNA
Length=1028
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 416
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 644
>ref|NM_001281719.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 5, mRNA
Length=1026
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 414
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 642
>ref|NM_001281717.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 3, mRNA
Length=1068
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 407 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 456
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 684
>ref|NM_001281716.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 2, mRNA
Length=1097
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 485
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 713
>ref|NM_018955.3| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), transcript variant 1, mRNA
Length=1241
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 629
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 857
>ref|XM_004042218.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
7 (UBB), mRNA
Length=1185
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 252
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 431 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 480
>ref|XM_004042217.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
6 (UBB), mRNA
Length=1418
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 485
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 713
>ref|XM_004042216.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
5 (UBB), mRNA
Length=1382
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 449
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 628 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 677
>ref|XM_004042215.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
4 (UBB), mRNA
Length=1913
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 931 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 980
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 1208
>ref|XM_004042214.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
3 (UBB), mRNA
Length=1123
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 629
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 857
>ref|XM_004042213.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
2 (UBB), mRNA
Length=1288
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 306 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 355
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 583
>ref|XM_004042212.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ubiquitin B, transcript variant
1 (UBB), mRNA
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Sbjct 808 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 857
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Sbjct 323 GAAGGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 372
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Sbjct 346 GAAGGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 395
>ref|NG_023320.1| Homo sapiens ubiquitin B (UBB), RefSeqGene on chromosome 17
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Sbjct 6269 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 6318
>dbj|AK300882.1| Homo sapiens cDNA FLJ51326 complete cds, highly similar to Homo
sapiens ubiquitin B (UBB), mRNA
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Sbjct 286 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 335
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Sbjct 337 GAAGGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 386
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Sbjct 292 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 341
>gb|BC021067.1| Homo sapiens cyclin A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3510175), ****
WARNING: chimeric clone ****
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Sbjct 4125 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 4174
>gb|BC038999.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:47606 IMAGE:4943285),
complete cds
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Sbjct 293 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 342
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Sbjct 521 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 570
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Sbjct 186 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 235
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Sbjct 414 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 463
>gb|BC046123.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:57581 IMAGE:3879581),
complete cds
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Sbjct 272 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 321
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Sbjct 500 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 549
>gb|BC000379.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:8385 IMAGE:2820408),
complete cds
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Sbjct 324 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 373
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 552 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 601
>gb|BC031027.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:32826 IMAGE:4715377),
complete cds
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Sbjct 284 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 333
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 512 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 561
>gb|BC026301.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24729 IMAGE:4280629),
complete cds
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Sbjct 282 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 331
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 510 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 559
>gb|AC093484.2| Homo sapiens chromosome , clone RP11-138I1, complete sequence
Length=170944
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Sbjct 102882 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 102931
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 103110 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 103159
>dbj|AK129498.1| Homo sapiens cDNA FLJ25987 fis, clone CBR05488, highly similar
to Homo sapiens ubiquitin B (UBB)
Length=928
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 282 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 331
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 510 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 559
>dbj|AB089620.1| Gorilla gorilla UbB gene for polyubiquitin B, complete cds
Length=690
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 186 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 235
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 414 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 463
>dbj|AB089619.1| Pan troglodytes UbB gene for polyubiquitin B, complete cds
Length=690
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 414 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 463
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 186 GAAGGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 235
>dbj|AB089617.1| Homo sapiens UbB gene for polyubiquitin B, complete cds
Length=690
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 186 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 235
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 414 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 463
>gb|AY891423.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH017070.01L ubiquitin
B (UBB) mRNA, partial cds
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 186 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 235
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 414 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 463
>gb|AY888785.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH017074.01X ubiquitin
B (UBB) mRNA, complete cds
Length=690
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 186 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 235
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 463
>gb|AY888190.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH021788.01X ubiquitin
B (UBB) mRNA, complete cds
Length=690
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 186 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 235
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 414 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 463
>gb|BC009301.2| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:16688 IMAGE:4126622),
complete cds
Length=943
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 319
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 498 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 547
>gb|BC015127.1| Homo sapiens ubiquitin B, mRNA (cDNA clone MGC:24232 IMAGE:3929901),
complete cds
Length=965
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 286 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 335
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 563
>emb|AL356460.3| Homo sapiens chromosome 17 from PAC 84M10 map17p11.2 region D17S842-D17S953,
complete sequence
Length=161943
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 7176 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 7127
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7404 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 7355
>emb|X04803.2| Homo sapiens ubiquitin gene
Length=3107
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2268 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 2317
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2496 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 2545
>ref|XR_677504.1| PREDICTED: Pan troglodytes polyubiquitin-B-like (LOC465227),
misc_RNA
Length=1226
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 805 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGAAGA 854
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578 GAAAGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 627
>ref|XM_009236537.1| PREDICTED: Pongo abelii polyubiquitin-B-like (LOC103889580),
mRNA
Length=778
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 GAAAGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 321
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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variant 4 (LOC100593565), mRNA
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mRNA
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variant 2 (LOC100593565), mRNA
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mRNA
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mRNA
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 397 GAAAGAGTCAACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 446
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Sbjct 364 GAAAGAGTCAACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 413
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2 (UBB), mRNA
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Sbjct 451 GAAGGAGTCGACCCTACACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 500
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Sbjct 223 GAAAGAGTCAACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 272
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Sbjct 460 GAAGGAGTCGACCCTACACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 509
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 232 GAAAGAGTCAACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 281
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 473 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTATGCAGA 522
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mRNA
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Sbjct 220 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTATGCAGA 171
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Sbjct 431 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTATGCAGA 480
>ref|XM_001088043.2| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like, transcript variant
3 (LOC696110), mRNA
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 520 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTATGCAGA 569
>ref|XM_002800314.1| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like (LOC696110), mRNA
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 524 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTATGCAGA 573
>ref|XM_002800313.1| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like (LOC696110), mRNA
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 547 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTATGCAGA 596
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Length=1001
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Sbjct 534 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTATGCAGA 583
>ref|XM_001087796.2| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like, transcript variant
1 (LOC696110), mRNA
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
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Sbjct 519 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTATGCAGA 568
>ref|XM_001087919.2| PREDICTED: Macaca mulatta ubiquitin D-like, transcript variant
2 (LOC696110), mRNA
Length=983
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 516 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTATGCAGA 565
>gb|BC070367.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6618390, containing frame-shift
errors
Length=1222
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 766 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGAAGA 815
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 GAAAGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 588
>gb|AY225193.1| Camelus dromedarius polyubiquitin gene, partial cds
Length=325
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 72 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGGGGTGGTATGCAGA 121
>dbj|AB071067.1| Macaca fascicularis testis cDNA clone:QtsA-16192, similar to
human ubiquitin B precursor ( UBB ), mRNA, NM_018955.1
Length=883
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 450 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTATGCAGA 499
>gb|AC138761.4| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-1109M24, complete sequence
Length=155327
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 48257 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGAAGA 48306
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 50
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48030 GAAAGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 48079
>dbj|AB089618.1| Pongo pygmaeus UbB gene for polyubiquitin B, complete cds
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Sbjct 186 GAAAGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 235
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Sbjct 167418 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGAAGA 167369
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Sbjct 167645 GAAAGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 167596
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(LOC101036343), mRNA
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Sbjct 222 GAAAGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGCGGTATGCAGA 271
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partial mRNA
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Sbjct 580 GAAAGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGCGGTATGCAGA 629
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Sbjct 330 GAAAGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 379
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Sbjct 836 GAAAGAGTCCACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 885
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X2, mRNA
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Sbjct 292 GAAAGAGTCAACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 341
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X1, mRNA
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Sbjct 290 GAAAGAGTCAACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 339
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Sbjct 299 GAAAGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGGGGTGGTATGCAGA 348
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Sbjct 298 GAAAGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGGGGCGGTATGCAGA 347
>dbj|AK127995.1| Homo sapiens cDNA FLJ46113 fis, clone TESTI2036285
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Sbjct 811 GAAAGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 860
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Sbjct 505 GAAAGAGTCGACCCTGCATCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGA 554
>ref|NM_001283983.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926775 (LOC101926775),
mRNA
dbj|AB170649.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-11953, similar to
human ubiquitin B (UBB), mRNA, RefSeq: NM_018955.2
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGT-ATGCAG 49
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Sbjct 516 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGAGGTGGTGATGCAG 565
>dbj|AB170212.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10815, similar to
human ubiquitin B (UBB), mRNA, RefSeq: NM_018955.2
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Query 1 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAG-AGGTGGTATG-CAGA 50
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Sbjct 534 GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGGAGGTGGTATGGCAGA 585
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Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
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17 17 16285725 16284452 45m717n54m456n1m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
17 17 16285306 16284489 8m717n92m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CACATTTTCGATGGTGTCACTGGGCTCCACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCGGTAAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTGACCTGTTAGC
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17 17 16285300 16284483 14m717n86m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGTGTCACTGGGCTCCACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCGGTAAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTGACCTGTTAGCGGATAC
17 17 16285297 16284480 17m717n83m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||ACTGGGCTCCACCTCAAGGGTGATGGTCTTGCCGGTAAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTGACCTGTTAGCGGATACCAG
17 17 16285291 16284474 23m717n77m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCAAGGGTGATGGTCTTGCCGGTAAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTGACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCT
17 17 16285288 16284471 26m717n74m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGTGATGGTCTTGCCGGTAAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTGACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCC
17 17 16285285 16284468 29m717n71m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGTCTTGCCGGTAAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTGACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAAT
17 17 16285282 16284465 32m717n68m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCGGTAAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTGACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCAC
17 17 16285279 16284462 35m717n65m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTGACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAA
17 17 16285276 16284459 38m717n62m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCACGAAGATCTGCATTTTGACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCA
17 17 16285273 16284456 41m717n59m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GAAGATCTGCATTTTGACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGT
17 17 16285270 16284453 44m717n56m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCATTTTGACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA
17 17 16285267 16284450 47m717n53m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTGCCCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCC
17 17 16285264 16284447 50m717n50m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACA
17 17 16285261 16284444 53m717n47m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCACCCACAGGG
17 17 16285258 16284719 56m439n44m AAATAAACTCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGCG
17 17 16285255 16284716 59m439n41m AAGTAAACTCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCC
17 17 16285252 16284713 62m439n38m |||TAAACTCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTT
17 17 16285246 16284707 68m439n32m |||||||||||||||AATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTC
17 17 16285243 16284704 71m439n29m |||||||||||||||||||||CGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGT
17 17 16285239 16284700 75m439n25m |||||||||||||||||||||||||||||TAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAAC
17 17 16285225 16284739 89m386n11m ||||AAACTCGACAG
17 17 16285218 16284679 96m439n4m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCC
17 17 16285217 16285459 3m717n44m16285407F53M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCT
17 17 16284846 16284746 100m AAGTAAAC
17 17 16284841 16284741 100m AAGTAAACTCGAC
17 17 16284838 16284738 100m AAGTAAACTCGACAGA
17 17 16284834 16284734 100m AAGTAAACTCGACAGAATCG
17 17 16284830 16284730 100m AAGTAAACTCGACAGAATCGCCGA
17 17 16284827 16284727 100m AAGTAAACTCGACAGAATCGCCGATCG
17 17 16284824 16284724 100m AAGTAAACTCGACAGAATCGCCGATCGGTT
17 17 16284820 16284720 100m AAGTAAACTCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGC
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17 17 16284805 16284705 100m AAGTAAACTCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCG
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17 17 16284783 16284683 100m AAGTAAACTCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACC
17 17 16284780 16284680 100m AAGTAAACTCGACAGTATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCC
17 17 16284776 16284676 100m AAGTAAACTCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCG
17 17 16284771 16284671 100m AAGTAAACTCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCACCGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCC
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17 17 16284760 16284660 100m AAGTAAACTCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAAC
17 17 16284756 16284656 100m AAGTAACCTCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGG
17 17 16284753 16284653 100m AGTAAACTCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCC
17 17 16284746 16284646 100m TCGACAGAATCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCC
17 17 16284737 16284637 100m TCGCCGATCGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGC
17 17 16284734 16284634 100m CCGATCGGTAAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCA
17 17 16284729 16284629 100m GGGTTAGGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCC
17 17 16284723 16284623 100m GGCGTCCGTTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCA
17 17 16284718 16284618 100m CCGTTAGGTTCCCTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCG
17 17 16284715 16284615 100m TTAGTTTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCC
17 17 16284710 16284610 100m TTCCGTCAACGCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCCTCCCC
17 17 16284700 16284600 100m GCGCGCGCGCGCCAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCCTCCCCTCCCCCACGC
17 17 16284688 16284588 100m CAACCGCCCTCGCCCCCCTCAGGTCAACAAGGCCCACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCCTCCCCTCCCCCACGCCCTCCCCTCAGC
17 17 16284653 16284553 100m ACTGTCCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCCTCCCCTCCCCCACGCCCTCCCCTCAGCGGCCCACCCAACCCCAAGAAGCCTCCACCTTGACC
17 17 16284649 16284549 100m ACCCGGAAAGGCCCAGCGCCGCGTCACCTCGCCCTCCCCTCCCCCACGCCCTCCCCTCAGCGGCCCACCCACCCCCAAGAAGCCTCCACCTTGACCTCAC
17 17 16284632 16284532 100m GCCGCGTCCCCTCGCCCTCCCCTCCCCCACGCCCTCCCCTCAGCGGCCCACCCAACCCCAAGAAGCCTCCACCTTGACCTCACCCATTCCCCCCTCTCAC
17 17 16284555 16284455 100m CCTCACCCATTCCCCCCTCTCACACCCCCCCAAGGTCGTTACGGCTGCGGGCCAGTACCTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTC
17 17 16284497 16285462 44m16285407F56M CTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCG
17 17 16284497 16285462 44m16285407F56M CTGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCG
17 17 16284496 16285463 43m16285407F57M TGTTAGCGGATACGAGGATCCTGCCAATCACCAACCCCGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGT
17 17 16284496 16285463 43m16285407F57M TGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGT
17 17 16284496 16285463 43m16285407F57M TGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGT
17 17 16284496 16285463 43m16285407F57M TGTTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGT
17 17 16284494 16285465 41m16285407F59M TTAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGA
17 17 16284493 16285466 40m16285407F60M TAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGGCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAA
17 17 16284493 16285466 40m16285407F60M TAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAA
17 17 16284493 16285466 40m16285407F60M TAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAAATCTTCGTGAA
17 17 16284493 16285466 40m16285407F60M TAGCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAA
17 17 16284491 16285468 38m16285407F62M GCGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGA
17 17 16284490 16285469 37m16285407F63M CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGAC
17 17 16284490 16285469 37m16285407F63M CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGAC
17 17 16284490 16285469 37m16285407F63M CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGAC
17 17 16284490 16285469 37m16285407F63M CGGATACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGAC
17 17 16284486 16285473 33m16285407F67M TACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTG
17 17 16284486 16285473 33m16285407F67M TACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTG
17 17 16284486 16285473 33m16285407F67M TACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTG
17 17 16284485 16285474 32m16285407F68M ACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGA
17 17 16284485 16285474 32m16285407F68M ACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGA
17 17 16284485 16285474 32m16285407F68M ACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGA
17 17 16284485 16285474 32m16285407F68M ACCAGGATCCTGCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGCCGACGCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGA
17 17 16284474 16285485 21m16285407F79M GCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACACTGACCGGCAAGACC
17 17 16284474 16285485 21m16285407F79M GCCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACC
17 17 16284473 16285486 20m16285407F80M CCAATCACCAACAACATCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCA
17 17 16284473 16285486 20m16285407F80M CCAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCA
17 17 16284472 16285487 19m16285407F81M CAATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCAT
17 17 16284471 16285488 18m16285407F82M AATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATC
17 17 16284471 16285488 18m16285407F82M AATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATC
17 17 16284470 16285489 17m16285407F83M ATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCA
17 17 16284470 16285489 17m16285407F83M ATCACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCA
17 17 16284468 16285491 15m16285407F85M CACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACC
17 17 16284468 16285491 15m16285407F85M CACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACC
17 17 16284468 16285491 15m16285407F85M CACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACC
17 17 16284467 16285492 14m16285407F86M ACCAACCACATCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCCCCC
17 17 16284467 16285492 14m16285407F86M ACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCC
17 17 16284467 16285492 14m16285407F86M ACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCC
17 17 16284467 16285492 14m16285407F86M ACCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAGGACCATCACCC
17 17 16284467 16285492 14m16285407F86M ACCAACCACATCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCTTCACCC
17 17 16284467 16285492 14m16285407F86M ACCAACCACATCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCC
17 17 16284466 16285493 13m16285407F87M CCAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCT
17 17 16284465 16285494 12m16285407F88M CAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTG
17 17 16284465 16285494 12m16285407F88M CAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTG
17 17 16284465 16285494 12m16285407F88M CAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTG
17 17 16284465 16285494 12m16285407F88M CAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCATCCTG
17 17 16284465 16285494 12m16285407F88M CAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTG
17 17 16284465 16285494 12m16285407F88M CAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGAACATCACCCCG
17 17 16284465 16285494 12m16285407F88M CAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACAATCACCCTG
17 17 16284465 16285494 12m16285407F88M CAACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACTCTGACCGGCAAGACCATCACCCTG
17 17 16284464 16285495 11m16285407F89M AACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGG
17 17 16284464 16285495 11m16285407F89M AACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGGGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGG
17 17 16284464 16285495 11m16285407F89M AACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGG
17 17 16284464 16285495 11m16285407F89M AACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGG
17 17 16284464 16285495 11m16285407F89M AACCACGTCCA GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGG
17 17 16284459 16285500 6m16285407F94M CGTCCA GAAGGAGAAGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTG
17 17 16285397 16285497 100M CCACGTCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAA
17 17 16285400 16285500 100M CATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTG
17 17 16285403 16285503 100M CCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAG
17 17 16285406 16285506 100M GAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCC
17 17 16285409 16285509 100M GGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGT
17 17 16285412 16285512 100M GTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGAC
17 17 16285415 16285515 100M GACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACC
17 17 16285418 16285518 100M CCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATC
17 17 16285421 16285521 100M GCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAA
17 17 16285424 16285524 100M CCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAAT
17 17 16285427 16285527 100M GGTCCTGCGTCTGAGAGGGGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTG
17 17 16285430 16285530 100M CCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGGGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAG
17 17 16285433 16285533 100M GCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCC
17 17 16285436 16285536 100M TCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAG
17 17 16285442 16285542 100M AGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAG
17 17 16285445 16285545 100M TGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGAT
17 17 16285448 16285548 100M TATGGAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGCGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAA
17 17 16285451 16285551 100M GCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCAGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAA
17 17 16285454 16285554 100M GATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGC
17 17 16285457 16285557 100M CTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATC
17 17 16285460 16285560 100M CGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCT
17 17 16285463 16285563 100M GAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCC
17 17 16285466 16285566 100M GACCCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGAC
17 17 16285469 16285569 100M CCTGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAG
17 17 16285472 16285572 100M GACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAACGCATCCCTCCCGACCAGCAG
17 17 16285475 16285575 100M CGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGG
17 17 16285478 16285578 100M CAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCGTCCCGACCAGCAGAGGCTC
17 17 16285481 16285581 100M GACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATC
17 17 16285484 16285584 100M CATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTT
17 17 16285487 16285587 100M CACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCA
17 17 16285490 16285590 100M CCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGGGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGC
17 17 16285493 16285593 100M GGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAG
17 17 16285496 16285596 100M AGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAG
17 17 16285499 16285599 100M GGAGCCCAGAGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTG
17 17 16285502 16285602 100M GCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAA
17 17 16285505 16285605 100M CAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGAT
17 17 16285508 16285608 100M TGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGC
17 17 16285511 16285611 100M CACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGC
17 17 16285514 16285614 100M CATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACT
17 17 16285517 16285617 100M CGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTT
17 17 16285520 16285620 100M AAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCT
17 17 16285523 16285623 100M TGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTGAC
17 17 16285526 16285626 100M GAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTGACTAC
17 17 16285529 16285629 100M GGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTGACTACAAC
17 17 16285532 16285632 100M CAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTGACTACAACATC
17 17 16285535 16285635 100M GATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTGACTACAACATCCAG
17 17 16285538 16285638 100M CCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAG
17 17 16285541 16285641 100M GGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGACGCACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGTAG
17 17 16285544 16285644 100M TAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCG
35 pairs
10:-27
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279187351, whole genome shotgun sequence
gb|DS486144.1| Homo sapiens SCAF_1103279187351 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
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Sbjct 3521837 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 3521788
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
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Sbjct 23084484 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 23084533
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Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
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Lambda K H
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right flanking sequence - GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC
>ref|NC_000017.11| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 Primary Assembly
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Sbjct 28552578 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 28552529
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HSCHR17_CTG4
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assembly
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 1616598 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 1616549
>ref|NC_018928.2| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 26941298 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 26941249
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 1615822 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 1615773
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shotgun sequence
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 2032077 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 2032126
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 23089011 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 23088962
>gb|DS990782.1| Homo sapiens SCAF_1112675836296 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 3517929 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 3517978
>gb|CH003512.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 24929737 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 24929688
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Length=80652589
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 23639824 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 23639775
>gb|CH471159.1| Homo sapiens 211000035829953 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=3673358
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 1605091 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 1605042
>ref|NW_001838430.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187351, whole genome shotgun sequence
gb|DS486144.1| Homo sapiens SCAF_1103279187351 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5126965
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 3517902 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 3517951
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 23088419 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 23088370
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=77819263
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 23738621 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 23738572
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG
>ref|XM_008582648.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus unc-119 homolog (C. elegans)
(UNC119), mRNA
Length=1132
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
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Sbjct 101 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 52
>gb|KJ892685.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_02079 UNC119
gene, encodes complete protein
Length=852
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
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Sbjct 348 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 299
>dbj|AB593014.1| Homo sapiens UNC119 mRNA for protein unc-119 homolog A, complete
cds, clone: HP02611-RBb24D07
Length=1653
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Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 308
>ref|NG_012302.1| Homo sapiens unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119), RefSeqGene
(LRG_341) on chromosome 17
Length=12922
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8986 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 8937
>ref|NM_054035.2| Homo sapiens unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119), transcript
variant 2, mRNA
Length=1665
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 305
>ref|NM_005148.3| Homo sapiens unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119), transcript
variant 1, mRNA
Length=1398
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 305
>dbj|AK292329.1| Homo sapiens cDNA FLJ77511 complete cds, highly similar to Homo
sapiens unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119), transcript
variant 2, mRNA
Length=884
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 278
>dbj|AK124531.1| Homo sapiens cDNA FLJ42540 fis, clone BRACE3004205, highly similar
to Unc-119 protein homolog
Length=4189
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3160 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 3111
>emb|CR936850.1| Human DNA sequence from clone XX-HCC1954_35G04, complete sequence
Length=118376
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12321 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 12370
>emb|BX648530.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686M0885 (from clone DKFZp686M0885)
Length=2096
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 708
>emb|BX641031.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E1393 (from clone DKFZp686E1393)
Length=4168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3083 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 3034
>gb|BC027176.1| Homo sapiens unc-119 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:17070
IMAGE:4341426), complete cds
Length=1394
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 328 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 279
>gb|AF125998.1|HSHRGUNC2 Homo sapiens retinal photoreceptor synaptic protein (UNC119/HRG4)
gene, exons 2 through 5 and complete cds
Length=2123
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 191 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 142
>gb|AF028789.1|AF028789 Homo sapiens UNC-119b (UNC-119) mRNA, alternative splice form,
complete cds
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Sbjct 286 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 237
>gb|AF028788.1|AF028788 Homo sapiens UNC-119 (UNC-119) mRNA, complete cds
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Sbjct 286 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 237
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Sbjct 109169 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 109120
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Sbjct 337 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 288
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elegans) (UNC119), mRNA
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Sbjct 1693 CCCGAATCTTAAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 1644
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mRNA
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Sbjct 388 CCCGAATCTTAAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 339
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mRNA
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Sbjct 390 CCCGAATCTTAAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 341
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mRNA
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Sbjct 1540 CCCGAATCTTAAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 1491
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mRNA
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Sbjct 395 CCCGAATCTTAAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 346
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(LOC100387810), misc_RNA
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Sbjct 567 CCCGAATCTTAAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 518
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 288 CCCGAATCTTAAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 239
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transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
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Sbjct 283 CCCGAATCTTAAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 234
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mRNA
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Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
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Sbjct 370 CCCGAATCTTAAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 321
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(UNC119), mRNA
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Sbjct 358 CCCGAATCTTAAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 309
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mRNA
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Sbjct 311 CCCGAATCTTGAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 262
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mRNA
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Sbjct 322 CCCGAATCTTGAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 273
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mRNA
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Sbjct 292 CCCGAATCTTGAACCTGACGAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 243
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mRNA
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Sbjct 346 CCCGAATCTTGAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCGGGG 297
>ref|XM_003358181.2| PREDICTED: Sus scrofa protein unc-119 homolog A-like (LOC100625256),
mRNA
Length=1376
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Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
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Sbjct 346 CCCGAATCTTGAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCGGGG 297
>ref|XM_003469732.2| PREDICTED: Cavia porcellus unc-119 homolog (C. elegans) (Unc119),
mRNA
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Query 1 CCCGAATCTTAAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 50
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Sbjct 362 CCCGGATCTTGAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCAGGG 313
>dbj|AK349586.1| Sus scrofa mRNA, clone:PTG010110H02, expressed in pituitary gland
Length=1409
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Sbjct 344 CCCGAATCTTGAACCTGACAAAGTCGATCTTGTAGATATTCTCCTCGGGG 295
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC
>ref|NG_012302.1| Homo sapiens unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119), RefSeqGene
(LRG_341) on chromosome 17
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 5051 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 5100
>ref|NM_054035.2| Homo sapiens unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119), transcript
variant 2, mRNA
Length=1665
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 51 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 100
>ref|NM_005148.3| Homo sapiens unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119), transcript
variant 1, mRNA
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Sbjct 51 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 100
>dbj|AK292329.1| Homo sapiens cDNA FLJ77511 complete cds, highly similar to Homo
sapiens unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119), transcript
variant 2, mRNA
Length=884
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 24 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 73
>emb|CR936850.1| Human DNA sequence from clone XX-HCC1954_35G04, complete sequence
Length=118376
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 16247 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 16198
>gb|BC027176.1| Homo sapiens unc-119 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:17070
IMAGE:4341426), complete cds
Length=1394
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 25 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 74
>gb|AF125997.1|HSHRGUNC1 Homo sapiens retinal photoreceptor synaptic protein (UNC119/HRG4)
gene, exon 1
Length=1072
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 748 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 797
>gb|AC005726.1| Homo sapiens chromosome 17, clone hRPK.192_H_23, complete sequence
Length=185215
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 105234 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 105283
>gb|U40998.1|HSU40998 Human retinal protein (HRG4) mRNA, complete cds
Length=1381
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 34 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 83
>ref|XM_001145903.4| PREDICTED: Pan troglodytes unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119),
mRNA
Length=1418
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 85 GAGCCGCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 134
>ref|XM_002827165.2| PREDICTED: Pongo abelii unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119),
mRNA
Length=1420
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 87 GAGCCGCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 136
>ref|XM_004042043.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla unc-119 homolog (C. elegans)
(UNC119), mRNA
Length=1390
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
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Sbjct 28 GAGCCGCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 77
>ref|XM_010372325.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana unc-119 homolog (C. elegans)
(UNC119), mRNA
Length=1420
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 87 GAGCCGCGGCCCGGCGAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 136
>ref|XM_009189947.1| PREDICTED: Papio anubis unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119),
transcript variant X2, mRNA
Length=1404
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 GAGCCGCGGCCCGGCGAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 125
>ref|XM_003912516.2| PREDICTED: Papio anubis unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119),
transcript variant X1, mRNA
Length=1415
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 GAGCCGCGGCCCGGCGAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 132
>ref|XM_008010789.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119),
transcript variant X2, mRNA
Length=779
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 GAGCCGCGGCCCGGCGAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 105
>ref|XM_008010788.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119),
transcript variant X1, mRNA
Length=1386
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 54 GAGCCGCGGCCCGGCGAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 103
>ref|XM_003131761.3| PREDICTED: Sus scrofa protein unc-119 homolog A-like (LOC100512369),
mRNA
Length=1375
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 43 GAGCCGCGGCCCCGCGAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGCGGGGC 92
>ref|XM_003358181.2| PREDICTED: Sus scrofa protein unc-119 homolog A-like (LOC100625256),
mRNA
Length=1376
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 43 GAGCCGCGGCCCCGCGAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGCGGGGC 92
>ref|XM_003358178.3| PREDICTED: Sus scrofa protein unc-119 homolog A-like (LOC100624794),
mRNA
Length=1288
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 36 GAGCCGCGGCCCCGCGAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGCGGGGC 85
>ref|XM_004385375.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris unc-119 homolog (C.
elegans) (UNC119), mRNA
Length=767
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 18 GAGCCTCGGGCCCGCGAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGCGGGGC 67
>dbj|AK349586.1| Sus scrofa mRNA, clone:PTG010110H02, expressed in pituitary gland
Length=1409
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGGGGC 50
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 41 GAGCCGCGGCCCCGCGAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGCGGGGC 90
>ref|XM_003277117.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys unc-119 homolog (C. elegans) (UNC119),
mRNA
Length=1091
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 44/46 (96%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 AGCCTCGGCCCCGCAAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGG 47
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 AGCCGCGGCCCCGCGAGGCCATGAAGGTGAAGAAGGGCGGCGGTGG 119
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Query 1 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 50
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genome shotgun sequence
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sequence
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(mouse), transcript variant 2 (SEZ6), mRNA
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(mouse), transcript variant 1 (SEZ6), mRNA
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variant 2, mRNA
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>ref|NM_178860.4| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 1, mRNA
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(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 50
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Sbjct 3745 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3696
>ref|XM_511368.2| PREDICTED: Pan troglodytes seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 3729 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3680
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Sbjct 565 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 516
>dbj|AK091522.1| Homo sapiens cDNA FLJ34203 fis, clone FCBBF3019784, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
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Sbjct 3581 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3532
>dbj|AK096473.1| Homo sapiens cDNA FLJ39154 fis, clone OCBBF2001938, highly similar
to Seizure related gene 6
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Sbjct 2978 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 2929
>dbj|AK054913.1| Homo sapiens cDNA FLJ30351 fis, clone BRACE2007641, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
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Sbjct 1606 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 1557
>dbj|AK055383.1| Homo sapiens cDNA FLJ30821 fis, clone FEBRA2001593, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
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Sbjct 2017 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 1968
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spliced
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Sbjct 3833 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3784
>gb|AY038048.1| Homo sapiens SEZ6 (SEZ6) mRNA, complete cds
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Sbjct 3736 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3687
>gb|AC024267.18| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-20B24, complete sequence
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Sbjct 3474 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3425
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(mouse) (SEZ6), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 3575 TGGGACAGGGCAGGAGGCGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3526
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(mouse) (SEZ6), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 3729 TGGGACAGGGCAGGAGGCGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3680
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(mouse) (SEZ6), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3745 TGGGACAGGGCAGGAGGCGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3696
>ref|XM_008010852.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 3727 TGGGACAGGGCAGGAGGCGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3678
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(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 3755 TGGGACAGGGCAGGAGGCGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3706
>ref|XM_008010849.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3772 TGGGACAGGGCAGGAGGCGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3723
>ref|XM_009189987.1| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 3500 TGGGACAGGGCAGGAGGTGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3451
>ref|XM_003912532.2| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 50
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Sbjct 3732 TGGGACAGGGCAGGAGGTGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3683
>ref|XM_003912531.2| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 50
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Sbjct 3748 TGGGACAGGGCAGGAGGTGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3699
>ref|XM_005583276.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 3730 TGGGACAGGGCAGGAGGTGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3681
>ref|XM_005583275.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X1, mRNA
Length=4230
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Query 1 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 50
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Sbjct 3746 TGGGACAGGGCAGGAGGTGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3697
>ref|XM_001110503.2| PREDICTED: Macaca mulatta seizure related 6 homolog (mouse),
transcript variant 3 (SEZ6), mRNA
Length=3532
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Query 1 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 50
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Sbjct 3510 TGGGACAGGGCAGGAGGTGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 3461
>gb|AC198613.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-438I8 from chromosome 16, complete
sequence
Length=137659
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Query 1 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 50
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Sbjct 24559 TGGGACAGGGCAGGAGGTGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 24510
>gb|AC198450.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-513M24 from chromosome 16, complete
sequence
Length=175329
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Query 1 TGGGACAGGGCAGGAGGCAGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 50
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Sbjct 128883 TGGGACAGGGCAGGAGGTGGAACTGTCCAGAACTTTAGAGAACTAGAGAC 128834
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC
>ref|NM_001290202.1| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 3, mRNA
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 3019 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3068
>ref|NM_001098635.1| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 2, mRNA
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 3167 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3216
>ref|NM_178860.4| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 1, mRNA
Length=4250
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 3183 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3232
>dbj|AK125377.1| Homo sapiens cDNA FLJ43387 fis, clone OCBBF2006764, highly similar
to Mus musculus seizure related gene 6 (Sez6)
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 3144 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3193
>dbj|AK091522.1| Homo sapiens cDNA FLJ34203 fis, clone FCBBF3019784, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
Length=3828
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 3019 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3068
>dbj|AK096473.1| Homo sapiens cDNA FLJ39154 fis, clone OCBBF2001938, highly similar
to Seizure related gene 6
Length=3470
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 2416 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 2465
>dbj|AK054913.1| Homo sapiens cDNA FLJ30351 fis, clone BRACE2007641, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
Length=2071
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 1044 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 1093
>dbj|AK055383.1| Homo sapiens cDNA FLJ30821 fis, clone FEBRA2001593, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
Length=2433
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 1455 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 1504
>dbj|AK223620.1| Homo sapiens mRNA for seizure related 6 homolog, clone: FCC134B11
Length=3369
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 3145 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3194
>gb|AF502130.1| Homo sapiens HSEZ6b protein isoform mRNA, complete cds; alternatively
spliced
Length=2095
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 1852 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 1901
>gb|AF502129.1| Homo sapiens HSEZ6b protein mRNA, complete cds; alternatively
spliced
Length=4306
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 3271 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3320
>gb|AY038048.1| Homo sapiens SEZ6 (SEZ6) mRNA, complete cds
Length=4227
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 3174 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3223
>gb|AC024267.18| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-20B24, complete sequence
Length=175020
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 149106 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 149057
>emb|AL834405.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp547N203 (from clone DKFZp547N203)
Length=4047
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 2912 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 2961
>ref|XM_008965139.1| PREDICTED: Pan paniscus seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X2, mRNA
Length=3966
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Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 2941 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGCCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 2990
>ref|XM_008965138.1| PREDICTED: Pan paniscus seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X1, mRNA
Length=3982
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2957 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGCCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3006
>ref|XM_004042029.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 2 (SEZ6), mRNA
Length=4214
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 3167 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGCCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3216
>ref|XM_004042028.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 1 (SEZ6), mRNA
Length=4230
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGTCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 50
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Sbjct 3183 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGCCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3232
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Sbjct 3167 CTCCATCTAGGTGGGGGCAGCCTAGGGAAGTCAACTCAGACTTGCACCAC 3216
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17 17 27282842 27282742 100m AAGAAGTTGTGCCCTTCCCCGCCTGCGATGCCCACCATGGCCTATTTTCTTGGTGTCATTGCCCACTTGGGGCCCTTCATTGGGCCCATGTCAGGCGGCA
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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sequence
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blast search - nt
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variant 3, mRNA
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gene for seizure related 6 homolog, without stop codon, in Flexi
system
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seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6) mRNA, encodes
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variant 2, mRNA
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variant 1, mRNA
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Sbjct 2647 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 2598
>dbj|AK125377.1| Homo sapiens cDNA FLJ43387 fis, clone OCBBF2006764, highly similar
to Mus musculus seizure related gene 6 (Sez6)
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Sbjct 2608 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 2559
>dbj|AK091522.1| Homo sapiens cDNA FLJ34203 fis, clone FCBBF3019784, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
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Sbjct 2483 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 2434
>dbj|AK096473.1| Homo sapiens cDNA FLJ39154 fis, clone OCBBF2001938, highly similar
to Seizure related gene 6
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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>dbj|AK223620.1| Homo sapiens mRNA for seizure related 6 homolog, clone: FCC134B11
Length=3369
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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spliced
Length=4306
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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>gb|AY038048.1| Homo sapiens SEZ6 (SEZ6) mRNA, complete cds
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2638 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 2589
>gb|AC024267.18| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-20B24, complete sequence
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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transcript variant X2, mRNA
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>ref|XM_008965138.1| PREDICTED: Pan paniscus seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2421 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCGTCAGCACAAAACC 2372
>ref|XM_008997297.1| PREDICTED: Callithrix jacchus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), mRNA
Length=4203
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2642 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCGTCAGCACAAAACC 2593
>ref|XM_004042029.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 2 (SEZ6), mRNA
Length=4214
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2647 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCGTCAGCACAAAACC 2598
>ref|XM_004042028.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 1 (SEZ6), mRNA
Length=4230
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2647 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCGTCAGCACAAAACC 2598
>ref|XM_003277064.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), mRNA
Length=4198
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2638 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCGTCAGCACAAAACC 2589
>ref|XM_001139913.1| PREDICTED: Pan troglodytes seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=4227
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2647 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCGTCAGCACAAAACC 2598
>ref|XM_511368.2| PREDICTED: Pan troglodytes seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4211
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2647 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCGTCAGCACAAAACC 2598
>dbj|AK054913.1| Homo sapiens cDNA FLJ30351 fis, clone BRACE2007641, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
Length=2071
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 508 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCGTCAGCACAAAACC 459
>dbj|AK055383.1| Homo sapiens cDNA FLJ30821 fis, clone FEBRA2001593, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
Length=2433
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 919 GCCTGGCGACCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 870
>ref|XM_010378325.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X3, mRNA
Length=4041
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2477 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2428
>ref|XM_010378324.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4195
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2647 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2598
>ref|XM_010378323.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X1, mRNA
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Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2647 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2598
>ref|XM_009189987.1| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X4, mRNA
Length=3994
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2402 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2353
>ref|XM_009189986.1| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X3, mRNA
Length=3239
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2650 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2601
>ref|XM_003912532.2| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X2, mRNA
Length=4226
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2650 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2601
>ref|XM_003912531.2| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X1, mRNA
Length=4242
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2650 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2601
>ref|XM_008010852.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X4, mRNA
Length=4212
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2629 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2580
>ref|XM_008010851.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X3, mRNA
Length=3227
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2675 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2626
>ref|XM_008010850.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4240
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2673 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2624
>ref|XM_008010849.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=4257
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2674 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2625
>ref|XM_005583277.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X3, mRNA
Length=3181
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2629 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2580
>ref|XM_005583276.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X2, mRNA
Length=4214
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2648 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2599
>ref|XM_005583275.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X1, mRNA
Length=4230
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2648 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2599
>ref|XM_001110503.2| PREDICTED: Macaca mulatta seizure related 6 homolog (mouse),
transcript variant 3 (SEZ6), mRNA
Length=3532
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2429 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 2380
>gb|AC198613.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-438I8 from chromosome 16, complete
sequence
Length=137659
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 22558 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 22509
>gb|AC198450.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-513M24 from chromosome 16, complete
sequence
Length=175329
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 126882 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGGTGCCCGTCAGCACAAAACC 126833
>ref|XM_010342067.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis seizure related 6
homolog (mouse) (SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=3939
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 2392 GCCTGACGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCGTGAGCACAAAACC 2343
>ref|XM_010342066.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis seizure related 6
homolog (mouse) (SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=3955
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2392 GCCTGACGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCGTGAGCACAAAACC 2343
>ref|XM_008566357.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X4, mRNA
Length=4196
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2671 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGTGCTACCCGTCAGCACAAAACC 2622
>ref|XM_008566356.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X3, mRNA
Length=4212
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2671 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGTGCTACCCGTCAGCACAAAACC 2622
>ref|XM_008566355.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4235
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2671 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGTGCTACCCGTCAGCACAAAACC 2622
>ref|XM_008566354.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=4251
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC 50
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Sbjct 2671 GCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGTGCTACCCGTCAGCACAAAACC 2622
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT
>ref|XM_008965139.1| PREDICTED: Pan paniscus seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X2, mRNA
Length=3966
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 1942
>ref|XM_008965138.1| PREDICTED: Pan paniscus seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X1, mRNA
Length=3982
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 1893 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 1942
>ref|NM_001290202.1| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 3, mRNA
Length=4075
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 1955 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2004
>ref|XM_004042029.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 2 (SEZ6), mRNA
Length=4214
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 2119 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2168
>ref|XM_004042028.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 1 (SEZ6), mRNA
Length=4230
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 2119 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2168
>dbj|AB527210.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB7331, Homo sapiens SEZ6
gene for seizure related 6 homolog, without stop codon, in Flexi
system
Length=2999
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 1934 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 1983
>gb|BC146292.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100015230, MGC:180254
seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6) mRNA, encodes
complete protein
Length=3046
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 1959 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2008
>ref|NM_001098635.1| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 2, mRNA
Length=4234
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2119 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2168
>ref|NM_178860.4| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 1, mRNA
Length=4250
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2119 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2168
>ref|XM_001139913.1| PREDICTED: Pan troglodytes seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=4227
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 2119 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2168
>ref|XM_511368.2| PREDICTED: Pan troglodytes seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4211
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 2119 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2168
>dbj|AK125377.1| Homo sapiens cDNA FLJ43387 fis, clone OCBBF2006764, highly similar
to Mus musculus seizure related gene 6 (Sez6)
Length=3939
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 2081 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2130
>dbj|AK091522.1| Homo sapiens cDNA FLJ34203 fis, clone FCBBF3019784, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
Length=3828
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 1955 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2004
>dbj|AK096473.1| Homo sapiens cDNA FLJ39154 fis, clone OCBBF2001938, highly similar
to Seizure related gene 6
Length=3470
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Sbjct 1368 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 1417
>dbj|AK055383.1| Homo sapiens cDNA FLJ30821 fis, clone FEBRA2001593, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
Length=2433
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 391 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 440
>dbj|AK223620.1| Homo sapiens mRNA for seizure related 6 homolog, clone: FCC134B11
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Sbjct 2081 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2130
>gb|AF502129.1| Homo sapiens HSEZ6b protein mRNA, complete cds; alternatively
spliced
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Sbjct 2207 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2256
>gb|AY038048.1| Homo sapiens SEZ6 (SEZ6) mRNA, complete cds
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Sbjct 2110 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 2159
>gb|AC024267.18| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-20B24, complete sequence
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Sbjct 152355 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 152306
>emb|AL834405.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp547N203 (from clone DKFZp547N203)
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Sbjct 1864 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 1913
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mRNA
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Sbjct 1824 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 1872
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(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1848 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGACGACCTGACGGCCCGGGT 1896
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(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1848 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGACGACCTGACGGCCCGGGT 1896
>ref|XM_006731605.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), partial mRNA
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Sbjct 1100 CTGGTGATGTGCTCACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 1148
>ref|XM_004399678.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 2 (SEZ6), mRNA
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Sbjct 2082 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGACGACCTGACGGCCCGGGT 2130
>ref|XM_004399677.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 1 (SEZ6), mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2082 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGACGACCTGACGGCCCGGGT 2130
>ref|XM_003277064.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), mRNA
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Sbjct 2110 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2158
>ref|XM_008147834.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1892 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGTT 1941
>ref|XM_008147833.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 1928 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGTT 1977
>ref|XM_008147831.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 2106 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGTT 2155
>ref|XM_008147830.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTT 50
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Sbjct 2106 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGTT 2155
>ref|XM_010642416.1| PREDICTED: Fukomys damarensis seizure related 6 homolog (mouse)
(Sez6), mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2108 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2156
>ref|XM_010378325.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 1949 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 1997
>ref|XM_010378324.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2119 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2167
>ref|XM_010378323.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2119 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2167
>ref|XM_009189987.1| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X4, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 1874 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 1922
>ref|XM_009189986.1| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 2122 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2170
>ref|XM_003912532.2| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2122 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2170
>ref|XM_003912531.2| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2122 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2170
>ref|XM_008064195.1| PREDICTED: Tarsius syrichta seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X4, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 1940 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 1988
>ref|XM_008064194.1| PREDICTED: Tarsius syrichta seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 1940 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 1988
>ref|XM_008064193.1| PREDICTED: Tarsius syrichta seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 1940 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 1988
>ref|XM_008064192.1| PREDICTED: Tarsius syrichta seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 1865 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 1913
>ref|XM_008010852.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X4, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2101 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2149
>ref|XM_008010851.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2147 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2195
>ref|XM_008010850.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2145 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2193
>ref|XM_008010849.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2146 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2194
>ref|XM_006925173.1| PREDICTED: Pteropus alecto seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), mRNA
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 1934 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 1982
>ref|XM_005657005.1| PREDICTED: Sus scrofa seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
mRNA
Length=2319
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2065 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGAGATGACCTGACAGCCCGGGT 2113
>ref|XM_005624875.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X4, mRNA
Length=4299
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2093 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGACGACCTGACAGCCCGGGT 2141
>ref|XM_005624874.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X3, mRNA
Length=4317
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2093 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGACGACCTGACAGCCCGGGT 2141
>ref|XM_005624873.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4338
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2093 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGACGACCTGACAGCCCGGGT 2141
>ref|XM_005624872.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=4356
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2093 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGACGACCTGACAGCCCGGGT 2141
>ref|XM_005583277.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X3, mRNA
Length=3181
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Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2101 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2149
>ref|XM_005583276.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X2, mRNA
Length=4214
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2120 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2168
>ref|XM_005583275.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X1, mRNA
Length=4230
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2120 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2168
>ref|XM_005402702.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera seizure related 6 homolog (mouse)
(Sez6), transcript variant X4, mRNA
Length=4063
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 49
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Sbjct 2036 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2084
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Sbjct 2026 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2074
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Sbjct 2098 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2146
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Sbjct 2153 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2201
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2107 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2155
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Sbjct 2107 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 2155
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transcript variant 3 (SEZ6), mRNA
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sequence
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Sbjct 20739 CTGGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 20787
>gb|AC198450.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-513M24 from chromosome 16, complete
sequence
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1869 GGTGATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGTT 1916
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Sbjct 1864 GATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 1907
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Sbjct 1944 GATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 1987
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Sbjct 1944 GATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 1987
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Sbjct 2025 GATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 2068
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(SEZ6), transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 2025 GATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 2068
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Sbjct 2025 GATGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGT 2068
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Sbjct 2143 CTGGTGATGTTCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCTCGGGT 2191
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Sbjct 2143 CTGGTGATGTTCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCTCGGGT 2191
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Sbjct 2143 CTGGTGATGTTCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCTCGGGT 2191
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(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2143 CTGGTGATGTTCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCTCGGGT 2191
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Sbjct 1880 CTGGTGACGTACTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACAGCCCGGGT 1928
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17 17 27284122 27284222 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTC
17 17 27284125 27284225 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGG
17 17 27284128 27284228 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGC
17 17 27284131 27284231 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACT
17 17 27284134 27284234 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAG
17 17 27284137 27284237 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACC
17 17 27284140 27284240 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATG
17 17 27284143 27284243 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCA
17 17 27284146 27284246 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGG
17 17 27284149 27284249 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTT
17 17 27284152 27284252 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCCGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAG
17 17 27284155 27284255 100M CACACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTG
17 17 27284158 27284258 100M ACGAGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTC
17 17 27284161 27284366 99M105N1M AGAAGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGGGCTGTTCCC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||G
17 17 27284164 27284369 96M105N4M AGTGGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAG
17 17 27284167 27284372 93M105N7M GGATGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACA
17 17 27284170 27284375 90M105N10M TGGTGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTT
17 17 27284173 27284378 87M105N13M TGGCCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGG
17 17 27284176 27284381 84M105N16M CCCCTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGC
17 17 27284179 27284384 81M105N19M CTGCTGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCG
17 17 27284182 27284387 78M105N22M CGGGGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTC
17 17 27284185 27284390 75M105N25M GGTGTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACT
17 17 27284188 27284393 72M105N28M GTAGCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGGCATTTAGGGGGCCGGTCACTCCA
17 17 27284191 27284396 69M105N31M GCTGCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGCGACATTTAGGGGCCCGGTCACCCCACTT
17 17 27284194 27284399 66M105N34M GCTTCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGG
17 17 27284197 27284402 63M105N37M TCTCAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCT
17 17 27284200 27284405 60M105N40M CAGGACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCC
17 17 27284203 27284408 57M105N43M GACTTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGC
17 17 27284206 27284411 54M105N46M TTCGGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTG
17 17 27284209 27284414 51M105N49M GGGCACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCG
17 17 27284212 27284417 48M105N52M CACCATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCAATCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATC
17 17 27284215 27284420 45M105N55M CATTCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATG
17 17 27284218 27284423 42M105N58M TCTCAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGGCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCA
17 17 27284221 27284426 39M105N61M CAGGGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGG
17 17 27284224 27284429 36M105N64M GGGCACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGGG
17 17 27284227 27284432 33M105N67M CACTGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGGGGAT
17 17 27284230 27284435 30M105N70M TGAGACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGAGGATGGA
17 17 27284233 27284438 27M105N73M GACCATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGAGGATGGGGCT
17 17 27284236 27284441 24M105N76M CATGGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGAGGATGGAGCTGCC
17 17 27284239 27284444 21M105N79M GGCATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGAGGATGGAGCTGCCCAT
17 17 27284242 27284447 18M105N82M ATGGCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCCGCCCATCAG
17 17 27284245 27284450 15M105N85M GCTTGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCAC
17 17 27284248 27284453 12M105N88M TGAGCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAA
17 17 27284251 27284456 9M105N91M GCTGTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAAAC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCCTCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAAAC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCGCTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCCCTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAACCC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTACCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGTTCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGGGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
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17 17 27284254 27286221 6M105N91M27286225F3m GTTCCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTG
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17 17 27284257 27286218 3M105N91M27286225F6m CCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTGGGC
17 17 27284257 27286218 3M105N91M27286225F6m CCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTGGTG
17 17 27284260 27284360 100M CTACAAAGCAGGCAGAGTGCAGTGAGGGTGTCATGCCCTTGGCCTCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACA
17 17 27284263 27284363 100M CAAAGCAGGCAGAGTGCAGTGAGGGTGTCATGCCCTTGGCCTCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTT
17 17 27284268 27284368 100M CAGGCAGAGTGCAGTGAGGGTGTCATGCCCTTGGCCTTCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGA
17 17 27284271 27284371 100M GCAGAGTGCAGTGAGGGTGTCATGCCCTTGGCCTCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGAC
17 17 27284274 27284374 100M GAGTGCAGTGAGGGTGTCATGCCCTTGGCCTCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATT
17 17 27284279 27284379 100M CAGTGAGGGTGTCATGCCCTTGGCCTCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGG
17 17 27284284 27284384 100M AGGGTGTCATGCCCTTGGCCTCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCG
17 17 27284287 27284387 100M GTGTCATGCCCTTGGCCTCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTC
17 17 27284292 27284392 100M ATGCCCTTGGCCTCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCC
17 17 27284295 27284395 100M CCCTTGGCCTCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACT
17 17 27284298 27284398 100M TTGGCCTCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGG
17 17 27284301 27284401 100M GCCTCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGC
17 17 27284304 27284404 100M TCCAGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGC
17 17 27284307 27284407 100M AGGGCAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAG
17 17 27284311 27284411 100M CAGCATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTG
17 17 27284314 27284414 100M CATCTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCG
17 17 27284317 27284417 100M CTTTTATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCCCTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATC
17 17 27284321 27284421 100M TATCTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGG
17 17 27284324 27284424 100M CTCCAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAG
17 17 27284327 27284427 100M CAGCTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGG
17 17 27284330 27284430 100M CTAGAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGG
17 17 27284333 27284433 100M GAGGTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATG
17 17 27284336 27284436 100M GTTTTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGGGAGGATGGAG
17 17 27284339 27284439 100M TTCCCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCACGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTG
17 17 27284342 27284442 100M CCTCCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCC
17 17 27284345 27284445 100M CCTACTCAATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATC
17 17 27284350 27284450 100M TCAATTGACACTTACGGAGACATTTTGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCAC
17 17 27284353 27284453 100M ATTGACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCCCAAA
17 17 27284356 27284456 100M GACACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC
17 17 27284359 27284459 100M ACTTACGGAGACATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACCCTG
17 17 27284362 27284462 100M TACGGAGACATTCAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACCCTGGTC
17 17 27284370 27286210 86M27286225F14m CATTTAGGGGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTGGTGATGTGCTT
17 17 27284378 27286202 78M27286225F22m GGCCCGGTCACTCCACTTGGGGCTGCCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTGGTGATGTGCTTACCTTCTA
17 17 27284384 27286196 72M27286225F28m GTCACTCCACTTGGGGCTGGCAGCCTGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGG
17 17 27284409 27286171 47M27286225F53m TGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTTCTG
17 17 27284409 27286171 47M27286225F53m TGGCGATCATGGCAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTTCTG
17 17 27284421 27286159 35M27286225F65m CAGGTGAGGATGGAGCTGCCCATCAGCACAAAACC CTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTTCTGGGCCAGTACTCA
17 17 27286232 27286132 100m CATAGGCCCTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTTCTGGGCCAGTACTCAGGGCCCCGTAGCCACTTCAAGCTCTTT
17 17 27286229 27286129 100m AGGCCCTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTTCTGGGCCAGTACTCAGGGCCCCGTAGCCACTTCAAGCTCTTTACC
17 17 27286226 27286126 100m CCCTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTTCTGGGCCAGTACTCAGGGCCCCGTAGCCACTTCAAGCTCTTTACCTCC
17 17 27286223 27286123 100m TGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTTCTGGGCCAGTACTCAGGGCCCCGTAGCCACTTCAAGCTCTTTACCTCCATG
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17 17 27286214 27286114 100m GCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTTCTGGGCCAGTACTCAGGGCCCCGTAGCCACTTCAAGCTCTTTACCTCCATGGCTGATGTC
17 17 27286211 27286111 100m TACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCCGGGTTCTGGGCCAGTACTCAGGGCCCCGTAGCCACTTCAAGCTCTTTACCTCCATGGCTGATGTCACC
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genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 27371486 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 27371437
>ref|NW_004929407.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150191.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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shotgun sequence
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>gb|GL583011.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_31, whole genome
shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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>ref|NW_001838430.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187351, whole genome shotgun sequence
gb|DS486144.1| Homo sapiens SCAF_1103279187351 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 23517159 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 23517110
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Sbjct 24168334 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 24168285
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT
>ref|XM_008965139.1| PREDICTED: Pan paniscus seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 563 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 514
>ref|XM_008965138.1| PREDICTED: Pan paniscus seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 563 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 514
>ref|NM_001290202.1| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 3, mRNA
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Sbjct 625 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 576
>ref|XM_004042029.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 2 (SEZ6), mRNA
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Sbjct 789 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>ref|XM_004042028.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 1 (SEZ6), mRNA
Length=4230
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Sbjct 789 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>dbj|AB527210.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB7331, Homo sapiens SEZ6
gene for seizure related 6 homolog, without stop codon, in Flexi
system
Length=2999
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Sbjct 604 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 555
>gb|BC146292.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100015230, MGC:180254
seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6) mRNA, encodes
complete protein
Length=3046
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Sbjct 629 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 580
>ref|NM_001098635.1| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 2, mRNA
Length=4234
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Sbjct 789 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>ref|NM_178860.4| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 1, mRNA
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Sbjct 789 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>ref|XM_001139913.1| PREDICTED: Pan troglodytes seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=4227
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Sbjct 789 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>ref|XM_511368.2| PREDICTED: Pan troglodytes seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4211
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Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 789 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>dbj|AK125377.1| Homo sapiens cDNA FLJ43387 fis, clone OCBBF2006764, highly similar
to Mus musculus seizure related gene 6 (Sez6)
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Sbjct 751 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 702
>dbj|AK091522.1| Homo sapiens cDNA FLJ34203 fis, clone FCBBF3019784, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
Length=3828
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Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 625 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 576
>dbj|AK096473.1| Homo sapiens cDNA FLJ39154 fis, clone OCBBF2001938, highly similar
to Seizure related gene 6
Length=3470
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 93 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 44
>dbj|AK223620.1| Homo sapiens mRNA for seizure related 6 homolog, clone: FCC134B11
Length=3369
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 751 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 702
>gb|AF502130.1| Homo sapiens HSEZ6b protein isoform mRNA, complete cds; alternatively
spliced
Length=2095
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Sbjct 877 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 828
>gb|AF502129.1| Homo sapiens HSEZ6b protein mRNA, complete cds; alternatively
spliced
Length=4306
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 877 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 828
>gb|AY038048.1| Homo sapiens SEZ6 (SEZ6) mRNA, complete cds
Length=4227
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 780 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 731
>gb|AC024267.18| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-20B24, complete sequence
Length=175020
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 174648 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 174697
>gb|AC024619.16| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-321A17, complete sequence
Length=198666
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 14633 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 14682
>emb|AL834405.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp547N203 (from clone DKFZp547N203)
Length=4047
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 534 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 485
>ref|XM_010378325.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X3, mRNA
Length=4041
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 619 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 570
>ref|XM_010378324.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4195
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>ref|XM_010378323.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=4211
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>ref|XM_009189987.1| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X4, mRNA
Length=3994
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 541 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 492
>ref|XM_009189986.1| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X3, mRNA
Length=3239
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>ref|XM_003912532.2| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X2, mRNA
Length=4226
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>ref|XM_003912531.2| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X1, mRNA
Length=4242
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>ref|XM_005583277.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X3, mRNA
Length=3181
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 716
>ref|XM_005583276.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X2, mRNA
Length=4214
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 735
>ref|XM_005583275.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X1, mRNA
Length=4230
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
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Sbjct 784 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 735
>ref|XM_003277064.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), mRNA
Length=4198
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 740
>ref|XM_001110503.2| PREDICTED: Macaca mulatta seizure related 6 homolog (mouse),
transcript variant 3 (SEZ6), mRNA
Length=3532
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 570
>gb|AC198450.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-513M24 from chromosome 16, complete
sequence
Length=175329
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 103570 CCTCTGGAACCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 103521
>ref|XM_008010852.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X4, mRNA
Length=4212
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCTCTGGAACCCATGGTCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 914
>ref|XM_008010851.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X3, mRNA
Length=3227
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CCTCTGGAACCCATGGTCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 765
>ref|XM_008010850.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4240
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 CCTCTGGAACCCATGGTCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 763
>ref|XM_008010849.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=4257
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 CCTCTGGAACCCATGGTCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 764
>dbj|AB171623.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-20047, similar to
human seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), mRNA, RefSeq:
NM_178860.2
Length=1267
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 50
|||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 CCTCTGGAGCCCATGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGGT 546
>ref|XM_006184946.1| PREDICTED: Camelus ferus seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
partial mRNA
Length=3987
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCTCTGCAACCCACGGCCTTCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGG 49
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Sbjct 550 CCTCTGGAGCCCACGGCCTGCCCATGTCTCCAGGACCCTCTTGGGTTGG 502
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC
>ref|XM_010342067.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis seizure related 6
homolog (mouse) (SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=3939
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 151
>ref|XM_010342066.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis seizure related 6
homolog (mouse) (SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=3955
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 151
>ref|XM_010378325.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X3, mRNA
Length=4041
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 236
>ref|XM_010378324.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4195
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>ref|XM_010378323.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana seizure related 6 homolog
(mouse) (SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=4211
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>ref|XM_009251470.1| PREDICTED: Pongo abelii seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
mRNA
Length=2881
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 149
>ref|XM_008965139.1| PREDICTED: Pan paniscus seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X2, mRNA
Length=3966
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 131 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 180
>ref|XM_008965138.1| PREDICTED: Pan paniscus seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X1, mRNA
Length=3982
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 131 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 180
>ref|NM_001290202.1| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 3, mRNA
Length=4075
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 242
>ref|XM_003277064.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), mRNA
Length=4198
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>dbj|AB527210.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB7331, Homo sapiens SEZ6
gene for seizure related 6 homolog, without stop codon, in Flexi
system
Length=2999
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 172 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 221
>gb|BC146292.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100015230, MGC:180254
seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6) mRNA, encodes
complete protein
Length=3046
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 246
>ref|NM_001098635.1| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 2, mRNA
Length=4234
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>ref|NM_178860.4| Homo sapiens seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6), transcript
variant 1, mRNA
Length=4250
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>ref|XM_001139913.1| PREDICTED: Pan troglodytes seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=4227
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>ref|XM_511368.2| PREDICTED: Pan troglodytes seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4211
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>dbj|AK125377.1| Homo sapiens cDNA FLJ43387 fis, clone OCBBF2006764, highly similar
to Mus musculus seizure related gene 6 (Sez6)
Length=3939
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 368
>dbj|AK091522.1| Homo sapiens cDNA FLJ34203 fis, clone FCBBF3019784, highly similar
to Mouse mRNA for seizure-related gene product 6 type
2 precursor
Length=3828
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 242
>dbj|AK223620.1| Homo sapiens mRNA for seizure related 6 homolog, clone: FCC134B11
Length=3369
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 368
>gb|AF502130.1| Homo sapiens HSEZ6b protein isoform mRNA, complete cds; alternatively
spliced
Length=2095
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 488
>gb|AF502129.1| Homo sapiens HSEZ6b protein mRNA, complete cds; alternatively
spliced
Length=4306
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 488
>gb|AY038048.1| Homo sapiens SEZ6 (SEZ6) mRNA, complete cds
Length=4227
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 391
>gb|AC024619.16| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-321A17, complete sequence
Length=198666
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15065 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 15016
>emb|AL834405.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp547N203 (from clone DKFZp547N203)
Length=4047
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 151
>ref|XM_008997297.1| PREDICTED: Callithrix jacchus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), mRNA
Length=4203
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 TCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 398
>ref|XM_004042029.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 2 (SEZ6), mRNA
Length=4214
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 TCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>ref|XM_004042028.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla seizure related 6 homolog
(mouse), transcript variant 1 (SEZ6), mRNA
Length=4230
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 TCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>ref|XM_009189987.1| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X4, mRNA
Length=3994
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 GTCCACTTTGTCACCACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 158
>ref|XM_009189986.1| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X3, mRNA
Length=3239
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GTCCACTTTGTCACCACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>ref|XM_003912532.2| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X2, mRNA
Length=4226
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GTCCACTTTGTCACCACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>ref|XM_003912531.2| PREDICTED: Papio anubis seizure related 6 homolog (mouse) (SEZ6),
transcript variant X1, mRNA
Length=4242
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GTCCACTTTGTCACCACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 406
>ref|XM_008010852.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X4, mRNA
Length=4212
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 531 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTACTCAACCACCACCC 580
>ref|XM_008010851.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X3, mRNA
Length=3227
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 382 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTACTCAACCACCACCC 431
>ref|XM_008010850.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X2, mRNA
Length=4240
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 380 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTACTCAACCACCACCC 429
>ref|XM_008010849.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus seizure related 6 homolog (mouse)
(SEZ6), transcript variant X1, mRNA
Length=4257
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 381 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTACTCAACCACCACCC 430
>ref|XM_005583277.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865998 (LOC101865998),
transcript variant X3, mRNA
Length=3181
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 50
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Sbjct 333 GTCCACTTTGTCACCACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 382
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Sbjct 103138 GTCCACTTTGTCACCACAGCCCCCACCTTGAAGCTGCTCAACCACCACCC 103187
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17 17 27308843 27308743 100m CAGCACTGCCCTTCCAGCCTGACCCACCTGCCCCCTTCACCCCAAGTCCCCTTCCCCGCCTGGCCAACCAGGACAGCCGCCCTGTCTTTACCAGCCCCAC
17 17 27308840 27308740 100m CCCTGCCCTTCCAGCCTGACCCACCTGCACCCTTCACCCCAAGGCCCCTTCCCCGCCTGGCCAACCAGGACAGCCGCCCTGTCTTTACCAGCCCCACTCC
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17 17 27308834 27308734 100m CCTTCCAGCCTGACCCACCTGCCCCCTTCACCCCAAGTCCCCTTCCCCGCCTGGCCAACCAGGACAGCCGCCCTGTCTTTACCAGCCCCACTCCAGCCAT
17 17 27308831 27308731 100m TCCAGCCTGACCCCCCTGCACCCTTCCCCCCAAGTCCCCTTCCCCGCCTGGCCAACCAGGACAGCCGCCCTGTCTTTACCAGCCCCACTCCAGCCATGGC
17 17 27308828 27308728 100m AGCCTGACCCACCTGCCCCCTTCACCCCAAGTCCCCTTCCCCGCCTGGCCAACCAGGACAGCCGCCCTGTCTTTACCAGCCCCACTCCAGCCATGGCTGC
17 17 27308825 27308725 100m CTGCCCCACCTGCACCCTTCACCCCACGTCCCCTTCCCCGCCTGGCCAACCAGGACAGCCGCCCTGTCTTTACCAGCCCCACTCCAGCCATGGCTGCGGT
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17 17 27308813 27308713 100m CACCCTTCCCCCCAAGTCCCCTCCCCCGCCTGGCCAACCAGGACAGCCGCCCTGTCTTTACCAGCCCCACTCCAGCCATGGCTGCGGTACCCACTCAGCC
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Sbjct 9231272 TTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 9231226
>gb|CH471053.2| Homo sapiens 211000035841913 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=86821413
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Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 9255508 TTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 9255462
>ref|NW_001838766.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187422, whole genome shotgun sequence
gb|DS486102.1| Homo sapiens SCAF_1103279187422 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 1503121 TTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 1503075
>ref|AC_000134.1| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000463.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 9257991 TTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 9257945
>gb|CM000253.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=236827137
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Sbjct 9323573 TTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 9323527
>ref|NC_000019.10| Homo sapiens chromosome 19, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000681.2| Homo sapiens chromosome 19, GRCh38 reference primary assembly
Length=58617616
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 4347723 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 4347676
>ref|NT_011295.12| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR19_CTG2
gb|GL000139.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCC 48
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Sbjct 4287723 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 4287676
>ref|NC_018930.2| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001627.2| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 4347422 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 4347375
>ref|NW_004929412.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150196.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 4287422 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 4287375
>gb|KE141240.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold179, whole genome
shotgun sequence
Length=7162969
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Sbjct 2794683 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 2794730
>gb|CM000509.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 4110185 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 4110138
>gb|DS990834.1| Homo sapiens SCAF_1112675837319 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 3081316 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 3081363
>gb|DS486196.1| Homo sapiens SCAF_1103279188374 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=3390404
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCC 48
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Sbjct 3081428 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 3081475
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Sbjct 2995847 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 2995800
>gb|CH003466.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=56718491
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Sbjct 4342940 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 4342893
>gb|CH471139.2| Homo sapiens 211000035834461 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=7929300
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Sbjct 3544696 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 3544649
>ref|NW_001838477.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188374:967380-3390404, whole genome shotgun
sequence
Length=2423025
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCC 48
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Sbjct 2114049 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 2114096
>ref|AC_000151.1| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000480.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=55419010
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCC 48
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Sbjct 4110193 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 4110146
>gb|CM000270.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=56142811
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCC 48
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Sbjct 4285972 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 4285925
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA
>ref|NG_009090.2| Homo sapiens junction plakoglobin (JUP), RefSeqGene on chromosome
17
Length=174273
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 102772 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 102821
>dbj|AK311862.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92128, Homo sapiens putative translation
initiation factor (SUI1), mRNA
Length=495
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 56 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 7
>dbj|AK311209.1| Homo sapiens cDNA, FLJ18251
Length=1488
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 52 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 3
>ref|NM_005801.3| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1 (EIF1),
mRNA
Length=1326
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 67 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 18
>gb|AC130686.15| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-415G19, complete sequence
Length=208462
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 24418 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 24467
>emb|AL050005.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp564A153 (from clone DKFZp564A153)
Length=2192
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 61 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 12
>gb|BC011740.1| Homo sapiens mRNA similar to eukaryotic translation initiation
factor 3, subunit 7 (zeta, 66/67kD) (cDNA clone IMAGE:3353208)
Length=4349
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTG 49
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Sbjct 3178 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTG 3226
>ref|XM_003942799.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis eukaryotic translation
initiation factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1378
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 116 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 67
>ref|XR_675671.1| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 1 pseudogene (LOC735805), misc_RNA
Length=685
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 62 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 13
>ref|XM_003315437.3| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1407
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 147 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 98
>ref|XR_609166.1| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation initiation factor
1 pseudogene (LOC100983620), misc_RNA
Length=679
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 61 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 12
>ref|XM_003813850.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=1405
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 147 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 98
>ref|XM_007535486.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=661
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 56 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 7
>ref|XM_007177620.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni eukaryotic translation
initiation factor 1-like (LOC103017827), mRNA
Length=674
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 76 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 27
>ref|XR_329233.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102393804), transcript variant X2, misc_RNA
Length=602
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 50 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 1
>ref|XM_006077607.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102393804), transcript variant X1, mRNA
Length=658
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 50 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 1
>ref|XM_006055785.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=670
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 64 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 15
>ref|XM_003996863.2| PREDICTED: Felis catus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=1323
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 66 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 17
>ref|XM_006924635.1| PREDICTED: Pteropus alecto eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1301
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 67 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 18
>ref|XM_006744367.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1358
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 103 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 54
>ref|XM_006219248.1| PREDICTED: Vicugna pacos eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=659
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 57 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 8
>ref|XM_006178698.1| PREDICTED: Camelus ferus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=659
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 57 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 8
>ref|XM_005976453.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102335779), mRNA
Length=659
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 53 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 4
>ref|XM_005899233.1| PREDICTED: Bos mutus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=660
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 58 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 9
>ref|XM_004772741.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X2, mRNA
ref|XM_004824880.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X2, mRNA
Length=1330
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 71 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 22
>ref|XM_004772740.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X1, mRNA
ref|XM_004824879.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X1, mRNA
Length=1851
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 25
>ref|XM_004410502.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens eukaryotic translation
initiation factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1355
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 103 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 54
>ref|XM_004041686.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 1, transcript variant 2 (EIF1), mRNA
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|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 67 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 18
>ref|XM_004041685.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 1, transcript variant 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 67 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 18
>ref|XM_004012907.1| PREDICTED: Ovis aries eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 67 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 18
>ref|NM_001131178.2| Pongo abelii eukaryotic translation initiation factor 1 (EIF1),
mRNA
Length=1322
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 55 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 6
>ref|XM_003786378.1| PREDICTED: Otolemur garnettii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC100942273), mRNA
Length=1442
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 152 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 103
>gb|BC005118.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:4056 IMAGE:2823520), complete cds
Length=1323
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAG 47
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Sbjct 47 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAG 1
>emb|CR857204.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G2016 (from clone DKFZp468G2016)
Length=1323
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 56 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 7
>ref|XM_005971946.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102325733), mRNA
Length=662
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Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTG 49
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Sbjct 49 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGTG 1
>ref|XM_004434488.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1324
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGT 48
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Sbjct 67 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCTCGGCGGCGGCTCAGT 20
>ref|XM_003799895.1| PREDICTED: Otolemur garnettii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC100957269), mRNA
Length=664
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA 50
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Sbjct 58 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAGTCCT-GGCGGCGGCTCAGTGA 10
>gb|AF083441.1|AF083441 Homo sapiens SUI1 isolog mRNA, complete cds
Length=1324
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 2/49 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTG 49
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Sbjct 50 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCG-CTC-GTG 4
>gb|BC008710.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:15684 IMAGE:3350981), complete cds
Length=1318
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCG 41
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Sbjct 41 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCG 1
>gb|L26247.1|HUMSUIISO Homo sapiens sui1iso1 mRNA, complete cds
Length=660
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGC 43
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 43 CGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGRCGGCGGC 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT
>ref|NG_009090.2| Homo sapiens junction plakoglobin (JUP), RefSeqGene on chromosome
17
Length=174273
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100868 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 100819
>dbj|AK311209.1| Homo sapiens cDNA, FLJ18251
Length=1488
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 395
>gb|BC011740.1| Homo sapiens mRNA similar to eukaryotic translation initiation
factor 3, subunit 7 (zeta, 66/67kD) (cDNA clone IMAGE:3353208)
Length=4349
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 2720 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 2671
>gb|BC008710.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:15684 IMAGE:3350981), complete cds
Length=1318
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 548
>gb|BC005118.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:4056 IMAGE:2823520), complete cds
Length=1323
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 505 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 554
>ref|NM_005801.3| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1 (EIF1),
mRNA
Length=1326
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 574
>gb|AC130686.15| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-415G19, complete sequence
Length=208462
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22514 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 22465
>gb|AF083441.1|AF083441 Homo sapiens SUI1 isolog mRNA, complete cds
Length=1324
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 557
>emb|AL050005.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp564A153 (from clone DKFZp564A153)
Length=2192
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 1421
>gb|AF100737.1|AF100737 Homo sapiens putative translation initiation factor A121/Sui1
(A121/SUI1) mRNA, complete cds
Length=1311
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 542
>gb|L26247.1|HUMSUIISO Homo sapiens sui1iso1 mRNA, complete cds
Length=660
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 549
>ref|XR_748669.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation initiation
factor 1 pseudogene (LOC104667403), misc_RNA
Length=670
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 496 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 545
>ref|XM_010386594.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1398
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 600 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 649
>ref|XR_675671.1| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 1 pseudogene (LOC735805), misc_RNA
Length=685
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 514 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 563
>ref|XM_003315437.3| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1407
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 606 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 655
>ref|XM_003913006.2| PREDICTED: Papio anubis eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=1398
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 598 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 647
>ref|XM_003813850.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=1405
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 606 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 655
>ref|XR_600950.1| PREDICTED: Rattus norvegicus predicted pseudogene 5471 (Gm5471),
misc_RNA
ref|XR_592413.1| PREDICTED: Rattus norvegicus predicted pseudogene 5471 (Gm5471),
misc_RNA
Length=660
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 499 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 548
>ref|XM_008701269.1| PREDICTED: Ursus maritimus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=646
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 489 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 538
>ref|XM_008585152.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus eukaryotic translation initiation
factor 1 (LOC103600816), mRNA
Length=540
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 373 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 422
>ref|XM_008571065.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus eukaryotic translation initiation
factor 1 (LOC103589170), mRNA
Length=1282
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 475 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 524
>ref|XM_008571063.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1306
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 499 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 548
>ref|XM_008541002.1| PREDICTED: Equus przewalskii eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1304
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 490 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 539
>ref|XM_008071934.1| PREDICTED: Tarsius syrichta eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1344
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 596 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 645
>ref|XM_008012710.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1331
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 531 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 580
>ref|XM_008006662.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC103240143), mRNA
Length=664
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 507 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 556
>ref|XM_007535486.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=661
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 504 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 553
>ref|XR_329233.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102393804), transcript variant X2, misc_RNA
Length=602
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 501 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 550
>ref|XM_006077607.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102393804), transcript variant X1, mRNA
Length=658
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 501 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 550
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Sbjct 512 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 561
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initiation factor 1 (Eif1), mRNA
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Sbjct 500 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 549
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initiation factor 1-like (LOC102919246), misc_RNA
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Sbjct 384 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 433
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factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 516 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 565
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factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 487 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTATCCCT 536
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1-like (LOC102543300), mRNA
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Sbjct 362 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 411
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Sbjct 505 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 554
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1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 497 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 546
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factor 1-like (LOC102335779), mRNA
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Sbjct 501 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 550
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factor 1-like (LOC102331936), mRNA
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Sbjct 484 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 533
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factor 1-like (LOC102325733), mRNA
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Sbjct 497 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 546
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(LOC102324879), mRNA
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Sbjct 703 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 752
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factor 1-like (LOC102325756), mRNA
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Sbjct 487 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 536
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1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 506 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 555
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1 (EIF1), partial mRNA
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Sbjct 340 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 389
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1-like (LOC100736981), mRNA
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Sbjct 543 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 592
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factor 1-like (LOC100687917), mRNA
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Sbjct 397 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 446
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1 (EIF1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 490 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 539
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factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 518 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 567
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factor 1-like (LOC102116629), mRNA
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Sbjct 502 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 551
>ref|XM_004772741.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X2, mRNA
ref|XM_004824880.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 522 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 571
>ref|XM_004772740.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X1, mRNA
ref|XM_004824879.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1043 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 1092
>ref|XM_004684188.1| PREDICTED: Condylura cristata eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 509 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 558
>ref|XM_004608767.1| PREDICTED: Sorex araneus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 498 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 547
>ref|XM_004410502.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens eukaryotic translation
initiation factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 551 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 600
>ref|XR_121017.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys uncharacterized LOC100590567 (LOC100590567),
misc_RNA
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Sbjct 1010 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTTTCCCT 1059
>ref|XM_004041686.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 1, transcript variant 2 (EIF1), mRNA
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Sbjct 519 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 568
>ref|XM_004041685.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 1, transcript variant 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 519 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 568
>ref|XM_004012907.1| PREDICTED: Ovis aries eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 515 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 564
>ref|NM_001131178.2| Pongo abelii eukaryotic translation initiation factor 1 (EIF1),
mRNA
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Sbjct 507 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 556
>dbj|AK391751.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10020C03, expressed in hypothalamus
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Sbjct 512 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 561
>ref|NG_030561.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, pseudogene
1 (Eif1-ps1) on chromosome 14
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 593 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 642
>gb|JN960224.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Gast:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Sbjct 389 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 438
>gb|JN953088.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Dnase1l1:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38782
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Sbjct 38567 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 38518
>gb|JN952946.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Rpl10:tm1(KOMP)Wtsi;
transgenic
Length=37222
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 4799 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 4848
>gb|JN952292.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Gast:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38383
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 389 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 438
>gb|JN949111.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Emd:tm1(KOMP)Wtsi;
transgenic
Length=37222
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 26200 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 26249
>ref|NG_030428.1| Mus musculus predicted gene 6900 (Gm6900) pseudogene on chromosome
7
Length=878
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 615 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 664
>ref|XM_002922116.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC100465669), mRNA
Length=1356
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 550 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 599
>emb|FQ228394.1| Rattus norvegicus TL0ADA9YA13 mRNA sequence
Length=679
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 502 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 551
>emb|FQ212688.1| Rattus norvegicus TL0AAA51YO06 mRNA sequence
Length=1300
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 500 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 549
>emb|FQ213689.1| Rattus norvegicus TL0AAA46YE23 mRNA sequence
Length=1161
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 357 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 406
>emb|FQ217644.1| Rattus norvegicus TL0ACA21YB12 mRNA sequence
Length=451
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Sbjct 266 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 315
>emb|FQ233399.1| Rattus norvegicus TL0AEA62YA17 mRNA sequence
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Sbjct 358 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 407
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1, transcript variant 3 (EIF1), mRNA
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Sbjct 519 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 568
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1-like, transcript variant 2 (LOC704606), mRNA
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Sbjct 488 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 537
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1-like, transcript variant 1 (LOC704606), mRNA
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Sbjct 518 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 567
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Sbjct 512 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 561
>gb|BC159406.1| Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1,
mRNA (cDNA clone MGC:188673 IMAGE:8361778), complete cds
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Sbjct 494 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 543
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(Eif1), mRNA
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Sbjct 508 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 557
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Sbjct 170 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 219
>dbj|AK235931.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10126F12, expressed in ovary
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Sbjct 524 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 573
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Sbjct 509 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 558
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Sbjct 509 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 558
>emb|CT573025.12| Mouse DNA sequence from clone RP23-36H17 on chromosome 14, complete
sequence
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Sbjct 48089 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 48138
>gb|AC159008.2| Mus musculus BAC clone RP23-14E14 from chromosome 7, complete
sequence
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Sbjct 238889 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 238840
>gb|BC096656.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:106922 IMAGE:5143414), complete cds
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Sbjct 482 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 531
>gb|BC081429.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:101938 IMAGE:5710951), complete cds
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Sbjct 494 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 543
>gb|BC010791.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:18846 IMAGE:4218816), complete cds
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Sbjct 485 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 534
>ref|NM_011508.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1 (Eif1),
mRNA
gb|BC003463.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:6503 IMAGE:2648657), complete cds
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Sbjct 507 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 556
>gb|AC091473.2| Mus musculus chromosome X clones RP21-114F21, RP21-430D6 complete
sequence
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Sbjct 182448 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 182497
>gb|AC138766.20| Mus musculus chromosome 5, clone RP23-444J3, complete sequence
Length=206494
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Sbjct 176810 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 176859
>dbj|AK151070.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830022H09 product:suppressor of initiator
codon mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae), full
insert sequence
Length=1222
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Sbjct 504 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 553
>dbj|AK168209.1| Mus musculus TIB-55 BB88 cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:I730066M18 product:emerin, full insert sequence
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Sbjct 1168 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 1217
>dbj|AK151575.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830031N24 product:suppressor of initiator
codon mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae), full
insert sequence
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Sbjct 506 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 555
>dbj|AK148032.1| Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:G270147E04 product:suppressor of initiator codon
mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae), full insert sequence
Length=657
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Sbjct 504 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 553
>dbj|AK150813.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830015K15 product:suppressor of initiator
codon mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae), full
insert sequence
Length=659
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Sbjct 506 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 555
>dbj|AK169763.1| Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:E430020I17 product:suppressor
of initiator codon mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae),
full insert sequence
Length=658
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Sbjct 505 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 554
>gb|BC103170.1| Bos taurus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA (cDNA
clone MGC:128453 IMAGE:7984251), complete cds
Length=677
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Sbjct 509 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 558
>dbj|AK207284.1| Mus musculus cDNA, clone:Y2G0107I10, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000049385,
based on BLAT
search
Length=400
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
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Sbjct 57 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 106
>emb|CR857204.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G2016 (from clone DKFZp468G2016)
Length=1323
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Sbjct 508 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 557
>emb|Z50159.1| M.musculus mRNA for Sui1
Length=355
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 250 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 299
>gb|AC109221.32| Mus musculus chromosome 7, clone RP23-207N2, complete sequence
Length=195657
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Sbjct 64008 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 63959
>gb|BC096691.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:106924 IMAGE:5256396), complete cds
Length=680
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 492 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 541
>gb|AC099599.6| Mus musculus chromosome 7, clone RP23-115D8, complete sequence
Length=209810
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 76216 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTATCCCT 76265
>gb|AC154698.2| Mus musculus BAC clone RP23-137A20 from 14, complete sequence
Length=197874
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 25291 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 25242
>gb|AC151720.2| Mus musculus BAC clone RP23-44P12 from 7, complete sequence
Length=233007
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 152429 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 152478
>emb|AL807376.4| Mouse DNA sequence from clone RP23-436K3 on chromosome X Contains
the Flna gene for filamin, alpha, the Emd gene for emerin,
a eukaryotic translation initiation factor 1B (Eif1b) pseudogene,
the Rpl10 gene for ribosomal protein 10, the Dnase1l1
gene for deoxyribonuclease 1- like 1, a small nuclear ribonucleoprotein
polypeptide G (Snrpg) pseudogene the Taz gene
for tafazzin, the Atp6ap1 gene for ATPase, H+ transporting
lysosomal accessory protein, the Gdi1 gene for guanosine diphosphate
(GDP dissociation inhibitor 1, five genes for novel
proteins, the Plxna3 gene for plexin A3, the Ubl4 gene for
ubiquitin-like 4, the Slc10a3 gene for solute carrier family
10, member 3, the 3' end of the G6pdx gene for glucose-6-phosphate
dehydrogenase X-linked and four CpG islands, complete
sequence
Length=203189
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 43781 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 43830
>emb|AL590968.8| Mouse DNA sequence from clone RP23-392I3 on chromosome 11, complete
sequence
Length=217092
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 38356 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 38405
>ref|XM_004783268.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101695803), mRNA
Length=539
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 387 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCC 435
>ref|NG_016803.1| Mus musculus predicted gene 7688 (Gm7688) pseudogene on chromosome
8
Length=537
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 448 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 496
>gb|AC117621.7| Mus musculus chromosome 8, clone RP23-114B10, complete sequence
Length=214933
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 42164 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 42116
>gb|AC162797.6| Mus musculus chromosome 8, clone RP23-293E17, complete sequence
Length=142444
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 69282 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 69234
>ref|XR_609166.1| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation initiation factor
1 pseudogene (LOC100983620), misc_RNA
Length=679
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 515 CTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 562
>gb|AC129083.4| Mus musculus chromosome 6 clone RP23-9E15, complete sequence
Length=193732
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 50439 CTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 50486
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sequence
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Sbjct 1387 CTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 1340
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initiation factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 585 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCCTCTGTCCCT 634
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initiation factor 1 pseudogene (LOC101044443), misc_RNA
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Sbjct 502 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATGTCCCTTCTGTCCCT 551
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factor 1 pseudogene (LOC104664405), misc_RNA
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Sbjct 512 AGCTTAAATGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 561
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1 pseudogene (LOC100438782), misc_RNA
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Sbjct 503 AGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 552
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factor 1 (Eif1), transcript variant X2, partial mRNA
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Sbjct 505 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTCCTGTCCCT 554
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initiation factor 1-like (LOC103014976), mRNA
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Sbjct 390 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTTCTGTCCCT 439
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LOC103007068 (LOC103007068), ncRNA
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Sbjct 290 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTTCTGTCCCT 339
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initiation factor 1-like (LOC103006280), partial mRNA
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Sbjct 343 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTTCTGTCCCT 392
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initiation factor 1-like (LOC103019547), mRNA
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Sbjct 390 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTTCTGTCCCT 439
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factor 1-like (LOC102413749), mRNA
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Sbjct 389 AGCTTAAGTGAGGCTTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 438
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factor 1-like (LOC102412619), mRNA
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Sbjct 423 AGCTTAAGAGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 472
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factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 500 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTTCTGTCCCT 549
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initiation factor 1-like (LOC102914029), mRNA
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Sbjct 484 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 527
>ref|XR_442911.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii uncharacterized LOC102918393
(LOC102918393), ncRNA
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Sbjct 115 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCGTTCTGTCCCT 164
>ref|XM_006543232.1| PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 5471 (Gm5471), mRNA
ref|XM_001473255.3| PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 5471 (Gm5471), mRNA
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Sbjct 365 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 408
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1-like (LOC102642049), mRNA
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Sbjct 370 AGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 419
>ref|XM_005321851.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus eukaryotic translation
initiation factor 1 (Eif1), mRNA
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Sbjct 524 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTCCCCTTCTGTCCCT 573
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factor 1-like (LOC101984536), mRNA
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Sbjct 477 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTCCTGTCCCT 526
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factor 1 (Eif1), mRNA
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Sbjct 507 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTCCTGTCCCT 556
>ref|XM_005363091.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101979421), mRNA
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Sbjct 396 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTCCTGTCCCT 445
>ref|XM_005082468.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101841387), mRNA
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Sbjct 361 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTCCTGTCCCT 410
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factor 1 (Eif1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 525 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCTGTCCCT 574
>ref|XM_004859390.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 990 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCTGTCCCT 1039
>ref|XM_004855336.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101699607), mRNA
Length=488
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Sbjct 420 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCTGTCCCT 469
>ref|XM_004884460.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), transcript variant X3, mRNA
Length=1174
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Sbjct 555 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCTGTCCCT 604
>ref|XM_004884459.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 525 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCTGTCCCT 574
>ref|XM_004884458.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 991 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCTGTCCCT 1040
>ref|XM_004434488.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 515 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCCCT 564
>ref|XM_004416911.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens eukaryotic translation
initiation factor 1-like (LOC101370496), mRNA
Length=719
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Sbjct 559 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTCCTGTCCCT 608
>ref|XM_004092701.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=960
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Sbjct 597 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAATAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 646
>ref|XM_003279435.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=2415
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Sbjct 597 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAATAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 646
>dbj|AP012458.1| Rattus norvegicus DNA, BAC clone: RNB1-396L07, strain: F344/Stm,
complete sequence
Length=102819
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Sbjct 7839 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAATAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 7888
>gb|JN945511.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Ddx3y:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=37960
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 34444 AGCTTAAGTGCGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 34493
>ref|NG_030427.1| Mus musculus predicted gene 16378 (Gm16378) pseudogene on chromosome
8
Length=871
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 615 AGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 664
>emb|CU695116.18| Pig DNA sequence from clone CH242-358M12 on chromosome X, complete
sequence
Length=150255
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 51345 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATCTCCCTTCTGTCCCT 51296
>gb|AC167359.4| Mus musculus BAC clone RP24-94F12 from chromosome 8, complete
sequence
Length=176523
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 166406 AGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 166455
>gb|AC102136.6| Mus musculus chromosome 3, clone RP23-269G19, complete sequence
Length=186659
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 110696 AGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 110647
>gb|AC158583.3| Mus musculus chromosome 3, clone RP24-318B11, complete sequence
Length=168986
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 128620 AGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 128571
>dbj|AK152194.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830054H24 product:suppressor of initiator
codon mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae), full
insert sequence
Length=659
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 506 AGCTTAAGTGGGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 555
>gb|AC154779.3| Mus musculus BAC clone RP24-461H19 from chromosome 17, complete
sequence
Length=188929
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 105920 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGAAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 105969
>gb|AC100733.16| Mus musculus chromosome 15, clone RP24-312H21, complete sequence
Length=151696
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 44
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Sbjct 82651 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 82694
>gb|AC093904.3| Homo sapiens BAC clone RP11-734K21 from 2, complete sequence
Length=191827
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 TTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 191562 TTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 191516
>gb|AC079782.6| Homo sapiens BAC clone RP11-385J23 from 2, complete sequence
Length=85411
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 4 TTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 1735 TTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 1689
>gb|AC006508.2|AC006508 Mus musculus Yp BAC GSMB-187H15 (Genome Systems Mouse BAC Library)
complete sequence
Length=185286
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 18436 AGCTTAAGTGCGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 18485
>ref|NM_001014884.1| Bos taurus eukaryotic translation initiation factor 1 (EIF1),
mRNA
gb|BT021082.1| Bos taurus putative translation initiation factor (SUI1), mRNA,
complete cds
Length=1283
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTC-TCCCT 50
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Sbjct 495 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGGTCCCT 545
>gb|AC145393.4| Mus musculus BAC clone RP24-208N6 from Y, complete sequence
Length=167299
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 75747 AGCTTAAGTGCGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 75698
>gb|AC132287.3| Mus musculus BAC clone RP24-302M13 from 8, complete sequence
Length=195405
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Sbjct 19618 AGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 19667
>gb|AF129888.1|AF129888 Mus musculus Sui1 homolog mRNA, complete cds
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Sbjct 492 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCC-TTCTGTCCCT 540
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factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 589 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCTGTCCCT 640
>ref|XM_007942126.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=656
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Sbjct 498 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCTGTCCCT 549
>ref|XM_004477702.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101429489), mRNA
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Sbjct 361 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCTGTCCCT 412
>ref|XR_188693.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant 3, misc_RNA
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Sbjct 504 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCTGTCCCT 555
>ref|XM_004471626.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 504 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCTGTCCCT 555
>ref|XM_004454778.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101410980), mRNA
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Sbjct 601 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 652
>gb|AC007292.1|AC007292 Homo sapiens chromosome 19, cosmid R31167, complete sequence
Length=39670
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCC 48
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Sbjct 10863 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCTGTCC 10816
>ref|XM_008068572.1| PREDICTED: Tarsius syrichta eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC103271106), mRNA
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 44
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Sbjct 509 AGCATAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 552
>ref|XM_003511406.2| PREDICTED: Cricetulus griseus eukaryotic translation initiation
factor 1 (LOC100766344), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 457 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTACCTCCTGTCCCT 506
>ref|XM_007185468.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni eukaryotic translation
initiation factor 1-like (LOC103004531), partial mRNA
Length=495
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Sbjct 343 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGCAGAATTTTCCTTCTGTCCCT 392
>ref|XM_006155983.1| PREDICTED: Tupaia chinensis eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=915
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Sbjct 452 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTCCCTTTCTGTCCCT 501
>ref|XR_257949.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus eukaryotic translation
initiation factor 1 pseudogene (LOC101975810), misc_RNA
Length=665
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 420 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTCCCCTTCGGTCCCT 469
>ref|XR_219843.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101828918), misc_RNA
Length=454
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 359 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGCATTTCCCTCCTTTCCCT 408
>ref|XM_004390324.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris eukaryotic translation
initiation factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1308
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Query 2 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAG--AATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 516 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCTGTCCCT 566
>ref|XM_004329646.1| PREDICTED: Tursiops truncatus eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101323185), mRNA
Length=664
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 507 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTCCTGTCCCT 556
>ref|XM_004282786.1| PREDICTED: Orcinus orca eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=662
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Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 505 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTCCTGTCCCT 554
>ref|XM_003786378.1| PREDICTED: Otolemur garnettii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC100942273), mRNA
Length=1442
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 600 AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCCTCTGTCCCT 649
>ref|XM_002764017.3| PREDICTED: Callithrix jacchus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1309
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Strand=Plus/Plus
Query 8 GTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 534 GTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 576
>ref|XR_619337.1| PREDICTED: Callithrix jacchus eukaryotic translation initiation
factor 1 pseudogene (LOC100397973), misc_RNA
Length=1262
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 GTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 477 GTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 519
>ref|XM_006901637.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=656
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Strand=Plus/Plus
Query 3 CTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAG--AATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 500 CTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCTGTCCCT 549
>ref|XM_004655393.1| PREDICTED: Jaculus jaculus eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), mRNA
Length=586
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 44/46 (96%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 TAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCT 50
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Sbjct 503 TAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATGTCCCTTCTGTCCCT 548
>emb|AL845274.17| Mouse DNA sequence from clone RP23-146F24 on chromosome 2, complete
sequence
Length=230151
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Sbjct 154492 AGC-TAAGTGAGAATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTGTCCCT 154444
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
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17 17 39845311 39845211 100m GGAGGTTCTGGATAGCGGACATACGATACGATTCCTTTTCCTCGGTGGAAACGGCCTGCGGAAGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGGAGAAGGCGGGCAGGGG
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17 17 39845265 39845165 100m GGAAACGGCCTGCGGAAGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTG
17 17 39845262 39845162 100m AACGGCCTGCGGAAGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAAT
17 17 39845259 39845159 100m GGCCGGCGGCAGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCT
17 17 39845256 39845156 100m CTGCGGAAGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGG
17 17 39845253 39845153 100m CGGAAGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGG
17 17 39845250 39845150 100m AAGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGG
17 17 39845247 39845147 100m GCGGCGGCGGCGGTGGCGGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTC
17 17 39845244 39845144 100m GCGGCGGCGGTGGCGGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGT
17 17 39845241 39845141 100m GCGGCGGTGGCGGGAGAAGGCGGGAAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGAC
17 17 39845197 39847141 55m39847097F45M GGAAGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTC
17 17 39845194 39847144 52m39847097F48M AGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA AGCTTAAGGGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCC
17 17 39845194 39847144 52m39847097F48M AGCGAGGGGGCTCAAGGGGGAGGCTGCTGAATCCTCGGCGGCGGCTCAGTGA AGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCC
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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Sbjct 3544700 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCT 3544653
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sequence
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Sbjct 20671355 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCACTGAGTAGAATTTCCCTTCT 20671402
>ref|NW_001838477.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188374:967380-3390404, whole genome shotgun
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Sbjct 2114045 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCT 2114092
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HuRef SCAF_1103279188157, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 23564500 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCACTGAGTAGAATTTCCCTTCT 23564453
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shotgun sequence
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Sbjct 4110197 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCT 4110150
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shotgun sequence
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>gb|CM000270.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=56142811
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4285976 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCT 4285929
>gb|CM000252.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Length=222388987
Score = 84.2 bits (45), Expect = 4e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 155416596 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCACTGAGTAGAATTTCCCTTCT 155416643
>ref|NC_000002.12| Homo sapiens chromosome 2, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000664.2| Homo sapiens chromosome 2, GRCh38 reference primary assembly
Length=242193529
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 9271270 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 9271223
>ref|NT_005334.17| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR2_CTG1
gb|GL000022.2| Homo sapiens chromosome 2 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=16135119
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9261270 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 9261223
>ref|NC_018913.2| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001610.2| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=243205335
Score = 78.7 bits (42), Expect = 2e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9341038 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 9340991
>ref|NW_004929298.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150082.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=11161004
Score = 78.7 bits (42), Expect = 2e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4292866 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 4292819
>gb|KE141358.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold109, whole genome
shotgun sequence
Length=58306400
Score = 78.7 bits (42), Expect = 2e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 54584392 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 54584439
>gb|CM000492.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808386
Score = 78.7 bits (42), Expect = 2e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9257878 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 9257831
>gb|GL583062.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_82, whole genome
shotgun sequence
Length=9848203
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6784110 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 6784157
>gb|DS990740.1| Homo sapiens SCAF_1112675836367 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=8347334
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503108 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 1503061
>gb|CH003497.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=248653822
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9497277 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 9497230
>gb|CH003449.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234033217
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9231279 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 9231232
>gb|CH471053.2| Homo sapiens 211000035841913 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=86821413
Score = 78.7 bits (42), Expect = 2e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9255515 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 9255468
>ref|NW_001838766.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279187422, whole genome shotgun sequence
gb|DS486102.1| Homo sapiens SCAF_1103279187422 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=8347242
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503128 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 1503081
>ref|AC_000134.1| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000463.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808360
Score = 78.7 bits (42), Expect = 2e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9257998 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 9257951
>gb|CM000253.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=236827137
Score = 78.7 bits (42), Expect = 2e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 9323580 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 9323533
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA
>ref|XR_675671.1| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 1 pseudogene (LOC735805), misc_RNA
Length=685
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 51
>ref|XR_609166.1| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation initiation factor
1 pseudogene (LOC100983620), misc_RNA
Length=679
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
>ref|XM_004092701.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=960
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 140
>ref|XM_003279435.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=2415
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 140
>ref|NG_009090.2| Homo sapiens junction plakoglobin (JUP), RefSeqGene on chromosome
17
Length=174273
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102734 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 102783
>ref|XM_004041686.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 1, transcript variant 2 (EIF1), mRNA
Length=959
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 56
>ref|XM_004041685.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 1, transcript variant 1 (EIF1), mRNA
Length=1731
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 56
>ref|NM_001131178.2| Pongo abelii eukaryotic translation initiation factor 1 (EIF1),
mRNA
Length=1322
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 93 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 44
>dbj|AK311862.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92128, Homo sapiens putative translation
initiation factor (SUI1), mRNA
Length=495
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 45
>dbj|AK311209.1| Homo sapiens cDNA, FLJ18251
Length=1488
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 41
>gb|BC011740.1| Homo sapiens mRNA similar to eukaryotic translation initiation
factor 3, subunit 7 (zeta, 66/67kD) (cDNA clone IMAGE:3353208)
Length=4349
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3140 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 3189
>gb|BC008710.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:15684 IMAGE:3350981), complete cds
Length=1318
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 30
>gb|BC005118.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:4056 IMAGE:2823520), complete cds
Length=1323
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 36
>ref|NM_005801.3| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1 (EIF1),
mRNA
Length=1326
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 56
>emb|CR857204.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G2016 (from clone DKFZp468G2016)
Length=1323
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 45
>gb|AC130686.15| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-415G19, complete sequence
Length=208462
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24380 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 24429
>gb|AF083441.1|AF083441 Homo sapiens SUI1 isolog mRNA, complete cds
Length=1324
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 39
>emb|AL050005.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp564A153 (from clone DKFZp564A153)
Length=2192
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
>emb|AJ012375.1| Homo sapiens mRNA for SUI1 protein translation initiation factor
Length=1350
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 71 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 22
>gb|AF100737.1|AF100737 Homo sapiens putative translation initiation factor A121/Sui1
(A121/SUI1) mRNA, complete cds
Length=1311
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 24
>gb|L26247.1|HUMSUIISO Homo sapiens sui1iso1 mRNA, complete cds
Length=660
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 32
>ref|XM_003315437.3| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1407
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAA-CGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 186 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 136
>ref|XM_003813850.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=1405
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAA-CGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 186 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 136
>ref|XM_003942799.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis eukaryotic translation
initiation factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1378
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGAACGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 50
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 GGGAGAAGGCGGGCAGGGGGGA-CGGAACGTCGGGAAGCGAGGGGGCTCA 105
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT
>ref|NG_009090.2| Homo sapiens junction plakoglobin (JUP), RefSeqGene on chromosome
17
Length=174273
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100872 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 100823
>dbj|AK311209.1| Homo sapiens cDNA, FLJ18251
Length=1488
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 391
>gb|BC011740.1| Homo sapiens mRNA similar to eukaryotic translation initiation
factor 3, subunit 7 (zeta, 66/67kD) (cDNA clone IMAGE:3353208)
Length=4349
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 2675
>gb|BC008710.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:15684 IMAGE:3350981), complete cds
Length=1318
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 544
>gb|BC005118.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:4056 IMAGE:2823520), complete cds
Length=1323
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 501 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 550
>ref|NM_005801.3| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1 (EIF1),
mRNA
Length=1326
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 521 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 570
>gb|AC130686.15| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-415G19, complete sequence
Length=208462
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
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Sbjct 22518 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 22469
>gb|AF083441.1|AF083441 Homo sapiens SUI1 isolog mRNA, complete cds
Length=1324
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
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Sbjct 504 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 553
>emb|AL050005.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp564A153 (from clone DKFZp564A153)
Length=2192
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
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Sbjct 1368 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 1417
>gb|AF100737.1|AF100737 Homo sapiens putative translation initiation factor A121/Sui1
(A121/SUI1) mRNA, complete cds
Length=1311
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
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Sbjct 489 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 538
>gb|L26247.1|HUMSUIISO Homo sapiens sui1iso1 mRNA, complete cds
Length=660
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
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Sbjct 496 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 545
>ref|XR_748669.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation initiation
factor 1 pseudogene (LOC104667403), misc_RNA
Length=670
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 539
>ref|XM_010386594.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1398
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 643
>ref|XR_675671.1| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 1 pseudogene (LOC735805), misc_RNA
Length=685
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 557
>ref|XM_003315437.3| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1407
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Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 602 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 649
>ref|XM_003913006.2| PREDICTED: Papio anubis eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=1398
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 594 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 641
>ref|XM_003813850.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=1405
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 602 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 649
>ref|XR_600950.1| PREDICTED: Rattus norvegicus predicted pseudogene 5471 (Gm5471),
misc_RNA
ref|XR_592413.1| PREDICTED: Rattus norvegicus predicted pseudogene 5471 (Gm5471),
misc_RNA
Length=660
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Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 495 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 542
>ref|XM_008701269.1| PREDICTED: Ursus maritimus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=646
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 485 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 532
>ref|XM_008585152.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus eukaryotic translation initiation
factor 1 (LOC103600816), mRNA
Length=540
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Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 369 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 416
>ref|XM_008571065.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus eukaryotic translation initiation
factor 1 (LOC103589170), mRNA
Length=1282
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 471 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 518
>ref|XM_008571063.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1306
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 542
>ref|XM_008071934.1| PREDICTED: Tarsius syrichta eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1344
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 639
>ref|XM_008012710.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1331
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 574
>ref|XM_008006662.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC103240143), mRNA
Length=664
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 550
>ref|XM_007535486.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=661
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 500 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 547
>ref|XR_329233.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102393804), transcript variant X2, misc_RNA
Length=602
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 544
>ref|XM_006077607.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102393804), transcript variant X1, mRNA
Length=658
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 544
>ref|XM_006055785.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=670
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 555
>ref|XM_006999010.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii eukaryotic translation
initiation factor 1-like (LOC102914029), mRNA
Length=621
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 527
>ref|XM_006992872.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii eukaryotic translation
initiation factor 1 (Eif1), mRNA
Length=665
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 543
>ref|XR_442707.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii eukaryotic translation
initiation factor 1-like (LOC102919246), misc_RNA
Length=543
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 380 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 427
>ref|XM_006924635.1| PREDICTED: Pteropus alecto eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1301
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 559
>ref|XM_006744367.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1358
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 547 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 594
>ref|XM_884867.5| PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 6155 (Gm6155), mRNA
Length=648
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 530
>ref|XM_006543232.1| PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 5471 (Gm5471), mRNA
ref|XM_001473255.3| PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 5471 (Gm5471), mRNA
Length=518
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 408
>ref|XM_006544220.1| PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 6155 (Gm6155), mRNA
Length=642
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 524
>ref|XM_006220033.1| PREDICTED: Vicugna pacos eukaryotic translation initiation factor
1-like (LOC102543300), mRNA
Length=509
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 405
>ref|XM_006219248.1| PREDICTED: Vicugna pacos eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=659
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 501 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 548
>ref|NM_001286937.1| Canis lupus familiaris eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=1303
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 540
>ref|XM_005976453.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102335779), mRNA
Length=659
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 544
>ref|XM_005973910.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102331936), mRNA
Length=637
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 527
>ref|XM_005971946.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102325733), mRNA
Length=662
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 540
>ref|XM_005964983.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii uncharacterized LOC102324879
(LOC102324879), mRNA
Length=1491
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 699 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 746
>ref|XM_005956333.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102325756), mRNA
Length=643
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 530
>ref|XM_005899233.1| PREDICTED: Bos mutus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
Length=660
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 549
>ref|XM_005694315.1| PREDICTED: Capra hircus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), partial mRNA
Length=1130
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 383
>ref|XM_003482982.2| PREDICTED: Sus scrofa eukaryotic translation initiation factor
1-like (LOC100736981), mRNA
Length=1319
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 586
>ref|XM_005639263.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC100687917), mRNA
Length=552
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 393 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 440
>ref|XM_005584190.1| PREDICTED: Macaca fascicularis eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 514 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 561
>ref|XM_005553285.1| PREDICTED: Macaca fascicularis eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102116629), mRNA
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Sbjct 498 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 545
>ref|XM_004783268.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101695803), mRNA
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Sbjct 383 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 430
>ref|XM_004772741.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X2, mRNA
ref|XM_004824880.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 518 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 565
>ref|XM_004772740.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X1, mRNA
ref|XM_004824879.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1039 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 1086
>ref|XM_004684188.1| PREDICTED: Condylura cristata eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 505 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 552
>ref|XM_004608767.1| PREDICTED: Sorex araneus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 494 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 541
>ref|XR_121017.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys uncharacterized LOC100590567 (LOC100590567),
misc_RNA
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Sbjct 1006 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 1053
>ref|XM_004041686.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 1, transcript variant 2 (EIF1), mRNA
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Sbjct 515 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 562
>ref|XM_004041685.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 1, transcript variant 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 515 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 562
>ref|XM_004012907.1| PREDICTED: Ovis aries eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 511 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 558
>dbj|AK391751.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10020C03, expressed in hypothalamus
Length=1309
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Sbjct 508 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 555
>ref|NG_030561.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, pseudogene
1 (Eif1-ps1) on chromosome 14
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Sbjct 589 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 636
>gb|JN960224.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Gast:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Sbjct 385 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 432
>gb|JN953088.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Dnase1l1:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Sbjct 38571 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 38524
>gb|JN952946.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Rpl10:tm1(KOMP)Wtsi;
transgenic
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Sbjct 4795 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 4842
>gb|JN952292.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Gast:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38383
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 385 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 432
>gb|JN949111.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Emd:tm1(KOMP)Wtsi;
transgenic
Length=37222
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Sbjct 26196 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 26243
>ref|NG_030428.1| Mus musculus predicted gene 6900 (Gm6900) pseudogene on chromosome
7
Length=878
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Sbjct 611 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 658
>ref|XM_002922116.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC100465669), mRNA
Length=1356
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 546 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 593
>emb|FQ228394.1| Rattus norvegicus TL0ADA9YA13 mRNA sequence
Length=679
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 498 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 545
>emb|FQ212688.1| Rattus norvegicus TL0AAA51YO06 mRNA sequence
Length=1300
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 496 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 543
>emb|FQ213689.1| Rattus norvegicus TL0AAA46YE23 mRNA sequence
Length=1161
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 353 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 400
>emb|FQ217644.1| Rattus norvegicus TL0ACA21YB12 mRNA sequence
Length=451
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 262 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 309
>emb|FQ233399.1| Rattus norvegicus TL0AEA62YA17 mRNA sequence
Length=1166
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 354 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 401
>ref|XM_001116333.2| PREDICTED: Macaca mulatta eukaryotic translation initiation factor
1, transcript variant 3 (EIF1), mRNA
Length=690
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 515 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 562
>ref|XM_002800467.1| PREDICTED: Macaca mulatta eukaryotic translation initiation factor
1-like, transcript variant 2 (LOC704606), mRNA
Length=1295
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 484 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 531
>ref|XM_001092971.2| PREDICTED: Macaca mulatta eukaryotic translation initiation factor
1-like, transcript variant 1 (LOC704606), mRNA
Length=1334
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 514 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 561
>dbj|AK351594.1| Sus scrofa mRNA, clone:THY010042H05, expressed in thymus
Length=1310
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 508 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 555
>gb|BC159406.1| Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1,
mRNA (cDNA clone MGC:188673 IMAGE:8361778), complete cds
Length=1298
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 490 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 537
>ref|NM_001105837.1| Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1
(Eif1), mRNA
Length=1074
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 504 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 551
>gb|BC134385.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:40135443
Length=751
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 166 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 213
>dbj|AK235931.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10126F12, expressed in ovary
Length=1319
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 520 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 567
>dbj|AK231518.1| Sus scrofa mRNA, clone:ITT010085C03, expressed in intestine
Length=1304
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 505 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 552
>dbj|AK234910.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10030A03, expressed in ovary
Length=1304
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 505 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 552
>emb|CT573025.12| Mouse DNA sequence from clone RP23-36H17 on chromosome 14, complete
sequence
Length=116550
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 48085 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48132
>gb|AC159008.2| Mus musculus BAC clone RP23-14E14 from chromosome 7, complete
sequence
Length=239149
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Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 238893 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 238846
>gb|BC096656.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:106922 IMAGE:5143414), complete cds
Length=1213
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 478 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 525
>gb|BC081429.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:101938 IMAGE:5710951), complete cds
Length=1227
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 490 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 537
>gb|BC010791.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:18846 IMAGE:4218816), complete cds
Length=657
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 481 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 528
>ref|NM_011508.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1 (Eif1),
mRNA
gb|BC003463.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:6503 IMAGE:2648657), complete cds
Length=1242
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 503 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 550
>gb|AC091473.2| Mus musculus chromosome X clones RP21-114F21, RP21-430D6 complete
sequence
Length=221860
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 182444 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 182491
>gb|AC138766.20| Mus musculus chromosome 5, clone RP23-444J3, complete sequence
Length=206494
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 176806 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 176853
>dbj|AK151070.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830022H09 product:suppressor of initiator
codon mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae), full
insert sequence
Length=1222
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 500 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 547
>dbj|AK168209.1| Mus musculus TIB-55 BB88 cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:I730066M18 product:emerin, full insert sequence
Length=1321
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 1164 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 1211
>dbj|AK151575.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830031N24 product:suppressor of initiator
codon mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae), full
insert sequence
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Sbjct 502 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 549
>dbj|AK148032.1| Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:G270147E04 product:suppressor of initiator codon
mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae), full insert sequence
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Sbjct 500 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 547
>dbj|AK150813.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830015K15 product:suppressor of initiator
codon mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae), full
insert sequence
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Sbjct 502 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 549
>dbj|AK169763.1| Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:E430020I17 product:suppressor
of initiator codon mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae),
full insert sequence
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Sbjct 501 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 548
>gb|BC103170.1| Bos taurus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA (cDNA
clone MGC:128453 IMAGE:7984251), complete cds
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Sbjct 505 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 552
>gb|AC100733.16| Mus musculus chromosome 15, clone RP24-312H21, complete sequence
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Sbjct 82647 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 82694
>dbj|AK207284.1| Mus musculus cDNA, clone:Y2G0107I10, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000049385,
based on BLAT
search
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Sbjct 53 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 100
>emb|Z50159.1| M.musculus mRNA for Sui1
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Sbjct 246 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 293
>gb|AC109221.32| Mus musculus chromosome 7, clone RP23-207N2, complete sequence
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Sbjct 64012 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 63965
>gb|BC096691.1| Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA
(cDNA clone MGC:106924 IMAGE:5256396), complete cds
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Sbjct 488 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 535
>gb|AC099599.6| Mus musculus chromosome 7, clone RP23-115D8, complete sequence
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Sbjct 76212 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 76259
>ref|NM_001014884.1| Bos taurus eukaryotic translation initiation factor 1 (EIF1),
mRNA
gb|BT021082.1| Bos taurus putative translation initiation factor (SUI1), mRNA,
complete cds
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Sbjct 491 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 538
>gb|AC154698.2| Mus musculus BAC clone RP23-137A20 from 14, complete sequence
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Sbjct 25295 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 25248
>gb|AC151720.2| Mus musculus BAC clone RP23-44P12 from 7, complete sequence
Length=233007
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Sbjct 152425 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 152472
>emb|AL807376.4| Mouse DNA sequence from clone RP23-436K3 on chromosome X Contains
the Flna gene for filamin, alpha, the Emd gene for emerin,
a eukaryotic translation initiation factor 1B (Eif1b) pseudogene,
the Rpl10 gene for ribosomal protein 10, the Dnase1l1
gene for deoxyribonuclease 1- like 1, a small nuclear ribonucleoprotein
polypeptide G (Snrpg) pseudogene the Taz gene
for tafazzin, the Atp6ap1 gene for ATPase, H+ transporting
lysosomal accessory protein, the Gdi1 gene for guanosine diphosphate
(GDP dissociation inhibitor 1, five genes for novel
proteins, the Plxna3 gene for plexin A3, the Ubl4 gene for
ubiquitin-like 4, the Slc10a3 gene for solute carrier family
10, member 3, the 3' end of the G6pdx gene for glucose-6-phosphate
dehydrogenase X-linked and four CpG islands, complete
sequence
Length=203189
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Sbjct 43777 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 43824
>emb|AL590968.8| Mouse DNA sequence from clone RP23-392I3 on chromosome 11, complete
sequence
Length=217092
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Sbjct 38352 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 38399
>ref|XM_008541002.1| PREDICTED: Equus przewalskii eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 487 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 533
>ref|XM_003362563.2| PREDICTED: Equus caballus eukaryotic translation initiation factor
1 (EIF1), transcript variant 1, mRNA
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Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 487 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 533
>ref|XM_004410502.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens eukaryotic translation
initiation factor 1 (EIF1), mRNA
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Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 548 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 594
>ref|NM_001131178.2| Pongo abelii eukaryotic translation initiation factor 1 (EIF1),
mRNA
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Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 504 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 550
>emb|CR857204.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G2016 (from clone DKFZp468G2016)
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Sbjct 505 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 551
>ref|XM_003942799.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis eukaryotic translation
initiation factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 581 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCCTCT 628
>ref|XR_746115.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis eukaryotic translation
initiation factor 1 pseudogene (LOC101044443), misc_RNA
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Sbjct 498 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATGTCCCTTCT 545
>ref|XR_748266.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation initiation
factor 1 pseudogene (LOC104664405), misc_RNA
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 508 CTGAAGCTTAAATGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 555
>ref|XR_656557.1| PREDICTED: Pongo abelii eukaryotic translation initiation factor
1 pseudogene (LOC100438782), misc_RNA
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Sbjct 499 CTGAAGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 546
>ref|XR_640037.1| PREDICTED: Papio anubis eukaryotic translation initiation factor
1 pseudogene (LOC101018146), misc_RNA
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Sbjct 525 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCACTGAGTAGAATTTCCCTTCT 572
>ref|XR_609166.1| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation initiation factor
1 pseudogene (LOC100983620), misc_RNA
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Sbjct 509 CTGAACCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 556
>ref|XM_008068572.1| PREDICTED: Tarsius syrichta eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC103271106), mRNA
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||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 505 CTGAAGCATAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 552
>ref|XM_007633275.1| PREDICTED: Cricetulus griseus eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), transcript variant X2, partial mRNA
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Sbjct 501 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCT 545
>ref|XM_007190982.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni eukaryotic translation
initiation factor 1-like (LOC103014976), mRNA
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Sbjct 386 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTTCT 433
>ref|XR_450593.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni uncharacterized
LOC103007068 (LOC103007068), ncRNA
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Sbjct 286 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTTCT 333
>ref|XM_007177645.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni eukaryotic translation
initiation factor 1-like (LOC103006280), partial mRNA
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Sbjct 339 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTTCT 386
>ref|XM_007173656.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni eukaryotic translation
initiation factor 1-like (LOC103019547), mRNA
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Sbjct 386 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTTCT 433
>ref|XM_006072661.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102400405), mRNA
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Sbjct 513 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAACGAGTAGAATTTCCCTTCT 560
>ref|XM_006050964.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102413749), mRNA
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 CTGAAGCTTAAGTGAGGCTTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 432
>ref|XM_006041820.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102412619), mRNA
Length=580
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 CTGAAGCTTAAGAGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 466
>ref|XM_007129072.1| PREDICTED: Physeter catodon eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 496 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCTTCT 543
>ref|XR_442911.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii uncharacterized LOC102918393
(LOC102918393), ncRNA
Length=209
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 111 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCGTTCT 158
>ref|XM_006544347.1| PREDICTED: Mus musculus eukaryotic translation initiation factor
1-like (LOC102642049), mRNA
Length=511
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 CTGAAGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 413
>ref|XM_005954578.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC102321149), mRNA
Length=574
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 475 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGGGTAGAATTTCCCTTCT 522
>ref|XM_005321851.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus eukaryotic translation
initiation factor 1 (Eif1), mRNA
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 520 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTCCCCTTCT 567
>ref|XR_257717.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus eukaryotic translation
initiation factor 1 pseudogene (LOC101973893), misc_RNA
Length=512
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 360 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAGTGAGTAGAATTTCCCTTCT 407
>ref|XM_005369426.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101984536), mRNA
Length=631
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCT 45
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Sbjct 473 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCT 517
>ref|XM_005368206.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), mRNA
Length=1266
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Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCT 45
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Sbjct 503 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCT 547
>ref|XM_005363091.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101979421), mRNA
Length=496
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCT 45
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Sbjct 392 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCT 436
>ref|XM_005082468.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101841387), mRNA
Length=506
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCT 45
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Sbjct 357 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCT 401
>ref|XM_004092701.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 593 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAATAGAATTTCCCTTCT 640
>ref|XM_003279435.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=2415
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 593 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAATAGAATTTCCCTTCT 640
>ref|XM_004028022.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla uncharacterized LOC101129727
(LOC101129727), mRNA
Length=859
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 690 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCACTGAGTAGAATTTCCCTTCT 737
>dbj|AP012458.1| Rattus norvegicus DNA, BAC clone: RNB1-396L07, strain: F344/Stm,
complete sequence
Length=102819
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 7835 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAATAGAATTTCCCTTCT 7882
>gb|JN945511.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Ddx3y:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=37960
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 34440 CTGAAGCTTAAGTGCGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 34487
>ref|NG_030427.1| Mus musculus predicted gene 16378 (Gm16378) pseudogene on chromosome
8
Length=871
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611 CTGAAGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 658
>emb|CU695116.18| Pig DNA sequence from clone CH242-358M12 on chromosome X, complete
sequence
Length=150255
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 51349 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATCTCCCTTCT 51302
>ref|NG_027543.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 1 pseudogene
3 (EIF1P3) on chromosome 1
Length=857
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 598 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCACTGAGTAGAATTTCCCTTCT 645
>ref|XM_001110096.2| PREDICTED: Macaca mulatta eukaryotic translation initiation factor
1-like (LOC717971), mRNA
Length=575
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 417 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCACTGAGTAGAATTTCCCTTCT 464
>ref|NG_018933.1| Mus musculus predicted gene, 18904 (Gm18904) pseudogene on chromosome
10
Length=705
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 623 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCACTGAGTAGAATTTCCCTTCT 670
>gb|AC167359.4| Mus musculus BAC clone RP24-94F12 from chromosome 8, complete
sequence
Length=176523
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 166402 CTGAAGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 166449
>gb|AC102136.6| Mus musculus chromosome 3, clone RP23-269G19, complete sequence
Length=186659
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 110700 CTGAAGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 110653
>gb|AC158583.3| Mus musculus chromosome 3, clone RP24-318B11, complete sequence
Length=168986
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 128624 CTGAAGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 128577
>gb|AC129083.4| Mus musculus chromosome 6 clone RP23-9E15, complete sequence
Length=193732
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 50433 CTGAAACTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 50480
>gb|AC160063.12| Mus musculus 10 BAC RP24-502H14 (Roswell Park Cancer Institute
(C57BL/6J Male) Mouse BAC Library) complete sequence
Length=158603
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 152933 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCACTGAGTAGAATTTCCCTTCT 152886
>dbj|AK152194.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830054H24 product:suppressor of initiator
codon mutations, related sequence 1 (S. cerevisiae), full
insert sequence
Length=659
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 502 CTGAAGCTTAAGTGGGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 549
>gb|AC154779.3| Mus musculus BAC clone RP24-461H19 from chromosome 17, complete
sequence
Length=188929
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 105916 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGAAGAATTTCCCTTCT 105963
>emb|AL513480.21| Human DNA sequence from clone RP11-416K24 on chromosome 1, complete
sequence
Length=80824
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 71822 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCACTGAGTAGAATTTCCCTTCT 71869
>gb|AC143330.4| Mus musculus BAC clone RP23-263D5 from chromosome 6, complete
sequence
Length=207749
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 1393 CTGAAACTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 1346
>gb|AC006508.2|AC006508 Mus musculus Yp BAC GSMB-187H15 (Genome Systems Mouse BAC Library)
complete sequence
Length=185286
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 18432 CTGAAGCTTAAGTGCGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 18479
>gb|AC160060.20| Mus musculus 10 BAC RP23-360L4 (Roswell Park Cancer Institute
(C57BL/6J Female) Mouse BAC Library) complete sequence
Length=229681
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 185022 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCACTGAGTAGAATTTCCCTTCT 185069
>gb|AC145393.4| Mus musculus BAC clone RP24-208N6 from Y, complete sequence
Length=167299
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 75751 CTGAAGCTTAAGTGCGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 75704
>gb|AC132287.3| Mus musculus BAC clone RP24-302M13 from 8, complete sequence
Length=195405
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19614 CTGAAGCTTAAGCGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 19661
>gb|AC007292.1|AC007292 Homo sapiens chromosome 19, cosmid R31167, complete sequence
Length=39670
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 10867 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCT 10820
>ref|XR_257949.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus eukaryotic translation
initiation factor 1 pseudogene (LOC101975810), misc_RNA
Length=665
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTC 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 416 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTCCCCTTC 462
>ref|XM_004859391.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), transcript variant X2, mRNA
Length=610
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 522 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCT 568
>ref|XM_004859390.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), transcript variant X1, mRNA
Length=1075
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 987 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCT 1033
>ref|XM_004855336.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101699607), mRNA
Length=488
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 417 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCT 463
>ref|XM_004884460.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), transcript variant X3, mRNA
Length=1174
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 552 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCT 598
>ref|XM_004884459.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), transcript variant X2, mRNA
Length=1144
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 522 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCT 568
>ref|XM_004884458.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 1 (Eif1), transcript variant X1, mRNA
Length=1610
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 988 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATATCCCTTCT 1034
>ref|XM_004434488.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1324
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 512 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCTTTCT 558
>ref|XM_004416911.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens eukaryotic translation
initiation factor 1-like (LOC101370496), mRNA
Length=719
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCT 45
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Sbjct 556 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCT 599
>gb|AF129888.1|AF129888 Mus musculus Sui1 homolog mRNA, complete cds
Length=1250
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 488 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCC-TTCT 534
>ref|XM_010594622.1| PREDICTED: Loxodonta africana eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=747
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 2/50 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAA--TTTCCCTTCT 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 585 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCT 634
>ref|XM_007942126.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=656
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 2/50 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAA--TTTCCCTTCT 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 494 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCT 543
>ref|XM_006155983.1| PREDICTED: Tupaia chinensis eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=915
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 2/50 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 448 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATT-CCCTT-TCT 495
>ref|XM_004477702.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101429489), mRNA
Length=440
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 2/50 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAA--TTTCCCTTCT 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 357 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCT 406
>ref|XR_188693.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant 3, misc_RNA
Length=1192
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 2/50 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAA--TTTCCCTTCT 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 500 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCT 549
>ref|XM_004471626.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), transcript variant 2, mRNA
Length=1317
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 2/50 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAA--TTTCCCTTCT 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 500 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCT 549
>ref|XM_004454778.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC101410980), mRNA
Length=780
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 2/50 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGA-A-TTTCCCTTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 597 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAGAATTTCCCTTCT 646
>ref|NG_016803.1| Mus musculus predicted gene 7688 (Gm7688) pseudogene on chromosome
8
Length=537
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 490
>gb|AC117621.7| Mus musculus chromosome 8, clone RP23-114B10, complete sequence
Length=214933
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Sbjct 42164 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 42122
>gb|AC162797.6| Mus musculus chromosome 8, clone RP23-293E17, complete sequence
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Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 69282 GCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 69240
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factor 1 (LOC100766344), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 453 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTACCT 497
>ref|XM_007185468.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni eukaryotic translation
initiation factor 1-like (LOC103004531), partial mRNA
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Sbjct 339 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGCAGAATTTTCCTTCT 386
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factor 1-like (LOC101323185), mRNA
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Sbjct 503 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCT 547
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1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 501 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCT 545
>ref|XM_003786378.1| PREDICTED: Otolemur garnettii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC100942273), mRNA
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Sbjct 596 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTTCCCT 641
>gb|AC093904.3| Homo sapiens BAC clone RP11-734K21 from 2, complete sequence
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Sbjct 191569 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 191522
>gb|AC079782.6| Homo sapiens BAC clone RP11-385J23 from 2, complete sequence
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1742 CTGTAGTTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 1695
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factor 1 (EIF1), mRNA
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Sbjct 525 CTGAAGCTT--GTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 570
>ref|XR_619337.1| PREDICTED: Callithrix jacchus eukaryotic translation initiation
factor 1 pseudogene (LOC100397973), misc_RNA
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Sbjct 468 CTGAAGCTT--GTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 513
>ref|XR_192273.1| PREDICTED: Sorex araneus eukaryotic translation initiation factor
1 pseudogene (LOC101545166), misc_RNA
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Query 2 TGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 501 TGAAGCTTAAGTGTGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCGTCT 547
>emb|AL845274.17| Mouse DNA sequence from clone RP23-146F24 on chromosome 2, complete
sequence
Length=230151
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 48
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Sbjct 154496 CTGAAGC-TAAGTGAGAATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCT 154450
>ref|XM_001364382.3| PREDICTED: Monodelphis domestica uncharacterized LOC100012315
(LOC100012315), mRNA
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAT--TTCCCTTCT 48
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Sbjct 801 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAAATTCCCTTCT 850
>ref|XM_006901637.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii eukaryotic translation initiation
factor 1 (EIF1), mRNA
Length=656
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAA--TTTCCCTTCT 48
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Sbjct 494 CTGAAACTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCT 543
>ref|XM_004390324.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris eukaryotic translation
initiation factor 1 (EIF1), mRNA
Length=1308
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAA--TTTCCCTTCT 48
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Sbjct 511 CTGACGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAATTTCCCTTCT 560
>ref|XM_003768225.1| PREDICTED: Sarcophilus harrisii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC100926922), mRNA
Length=1247
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAT--TTCCCTTCT 48
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Sbjct 393 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAAATTCCCTTCT 442
>ref|XM_003756130.1| PREDICTED: Sarcophilus harrisii eukaryotic translation initiation
factor 1-like (LOC100920855), mRNA
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Query 1 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAT--TTCCCTTCT 48
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Sbjct 512 CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAAAAATTCCCTTCT 561
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Lambda K H
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17 17 39845373 39845273 100m GCACGGAAGGCCCCGCTGCCCCACCCGGGCCCGCGACCTTTCCCATAGCTTACCGAAAGAGTGGAGGTTCTGGATAGCGGACATACGATACGATTCCTTT
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17 17 39845357 39845257 100m TGCCCCACCCGGGCCCGCGACCTTTCCCATAGCTTACCGAAAGAGTGGAGGTTCTGGATAGCGGACATACGATACGATTCCTTTTCCTCGGTGGAAACGG
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17 17 39845190 39847182 10m39847093F90M AGGGGGCTCA CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCTTGTCACAGGTTTAAAAACCTCACAGCTTGGATAATG
17 17 39845190 39847182 10m39847093F90M AGGGGGCTCA CTGAAGCTTAAGTGAGGATTTCCTTGCAATGAGTAGAATTTCCCTTCTCTCCCTTGTCACAGGTTTAAAAACCTCACAGCTTGTATAATG
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(ATP6V0A1), transcript variant 2, mRNA
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(ATP6V0A1), transcript variant 1, mRNA
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dehydrogenase type 1 (HSD17B1) gene, complete
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>dbj|AK125927.1| Homo sapiens cDNA FLJ43939 fis, clone TESTI4014159
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(ATP6V0A1), transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 2694 GTAGCATGGGGCACACGGCCCTCACAGGGACTCACTCTTCAAACTTCCCT 2645
>dbj|AK223554.1| Homo sapiens mRNA for ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit
a isoform 1 variant, clone: FCC126F11
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Sbjct 2661 GTAGCATGGGGCACACGGCCCTCACAGGGACTCACTCTTCAAACTTCCCT 2612
>gb|BC032398.1| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit a1,
mRNA (cDNA clone MGC:40328 IMAGE:5195776), complete cds
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Sbjct 2644 GTAGCATGGGGCACACGGCCCTCACAGGGACTCACTCTTCAAACTTCCCT 2595
>emb|CR627443.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781J1951 (from clone DKFZp781J1951)
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Sbjct 1620 GTAGCATGGGGCACACGGCCCTCACAGGGACTCACTCTTCAAACTTCCCT 1571
>emb|BX648978.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686N0561 (from clone DKFZp686N0561)
Length=4123
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>gb|AC067852.23| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-400F19, complete sequence
Length=179146
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Query 1 GTAGCATGGGGCACACGGCCCTCACAGGGACTCACTCTTCAAACTTCCCT 50
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Sbjct 156877 GTAGCATGGGGCACACGGCCCTCACAGGGACTCACTCTTCAAACTTCCCT 156926
>emb|AL137683.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434H202 (from clone DKFZp434H202);
partial cds
Length=2151
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Query 1 GTAGCATGGGGCACACGGCCCTCACAGGGACTCACTCTTCAAACTTCCCT 50
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Sbjct 708 GTAGCATGGGGCACACGGCCCTCACAGGGACTCACTCTTCAAACTTCCCT 659
>ref|XM_003279391.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ATPase, H+ transporting, lysosomal
V0 subunit a1 (ATP6V0A1), mRNA
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Query 3 AGCATGGGGCACACGGCCCTCACAGGGACTCACTCTTCAAACTTCCCT 50
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Sbjct 2746 AGCATGGGGCACACGGCCCTCACAGGGACTCACTCTTCAAACTTCCCT 2699
>ref|NM_001133189.1| Pongo abelii ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit a1
(ATP6V0A1), mRNA
emb|CR860731.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459J0327 (from clone DKFZp459J0327)
Length=4137
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 AGCATGGGGCACACGGCCCTCACAGGGACTCACTCTTCAAACTTCCCT 50
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V0 subunit a1 (ATP6V0A1), transcript variant X7, mRNA
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V0 subunit a1 (ATP6V0A1), transcript variant X1, mRNA
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subunit a1 (ATP6V0A1), transcript variant X4, mRNA
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subunit a1 (ATP6V0A1), transcript variant X5, mRNA
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subunit a1 (ATP6V0A1), transcript variant X3, mRNA
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>ref|XM_005257459.1| PREDICTED: Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal V0
subunit a1 (ATP6V0A1), transcript variant X1, mRNA
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V0 subunit a1 (ATP6V0A1), mRNA
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(ATP6V0A1), transcript variant 2, mRNA
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>ref|NM_001130020.1| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit a1
(ATP6V0A1), transcript variant 1, mRNA
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 3013 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 3062
>gb|DQ023266.1| Pan troglodytes HSD17B1P pseudogene, complete sequence; and 17beta-hydroxysteroid
dehydrogenase type 1 (HSD17B1) gene, complete
cds
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Sbjct 14401 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 14450
>dbj|AK125927.1| Homo sapiens cDNA FLJ43939 fis, clone TESTI4014159
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 3523 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 3572
>dbj|AK098213.1| Homo sapiens cDNA FLJ40894 fis, clone UTERU2002001
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 750 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 799
>ref|NM_005177.3| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit a1
(ATP6V0A1), transcript variant 3, mRNA
Length=4187
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Sbjct 2992 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 3041
>gb|BC032398.1| Homo sapiens ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit a1,
mRNA (cDNA clone MGC:40328 IMAGE:5195776), complete cds
Length=4137
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 2942 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 2991
>emb|CR627443.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781J1951 (from clone DKFZp781J1951)
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Sbjct 2975 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 3024
>gb|AC067852.23| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-400F19, complete sequence
Length=179146
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Sbjct 156579 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 156530
>emb|AL137683.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434H202 (from clone DKFZp434H202);
partial cds
Length=2151
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 1006 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 1055
>ref|XM_003279391.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ATPase, H+ transporting, lysosomal
V0 subunit a1 (ATP6V0A1), mRNA
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 3045 GTGCATTGTAGATGGACGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 3094
>emb|CR861438.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459K212 (from clone DKFZp459K212)
Length=4091
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 2922 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATACCATTCACATCTAGACTTTGA 2971
>ref|NM_001133189.1| Pongo abelii ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit a1
(ATP6V0A1), mRNA
emb|CR860731.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459J0327 (from clone DKFZp459J0327)
Length=4137
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 2963 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATACCATTCACATCTAGACTTTGA 3012
>ref|NM_001135397.1| Pongo abelii DKFZP459P201 protein (DKFZP459P201), mRNA
emb|CR860453.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459P201 (from clone DKFZp459P201)
Length=4094
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 2923 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATACCATTCACATCTAGACTTTGA 2972
>ref|XM_003913075.2| PREDICTED: Papio anubis ATPase, H+ transporting, lysosomal V0
subunit a1 (ATP6V0A1), transcript variant X4, mRNA
Length=4137
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 2995 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGACATTCATATCTAGACTTTGA 3044
>ref|XM_003913076.2| PREDICTED: Papio anubis ATPase, H+ transporting, lysosomal V0
subunit a1 (ATP6V0A1), transcript variant X3, mRNA
Length=4155
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 3013 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGACATTCATATCTAGACTTTGA 3062
>ref|XM_003913077.2| PREDICTED: Papio anubis ATPase, H+ transporting, lysosomal V0
subunit a1 (ATP6V0A1), transcript variant X2, mRNA
Length=4158
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 3016 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGACATTCATATCTAGACTTTGA 3065
>ref|XM_003913078.2| PREDICTED: Papio anubis ATPase, H+ transporting, lysosomal V0
subunit a1 (ATP6V0A1), transcript variant X1, mRNA
Length=4176
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 3034 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGACATTCATATCTAGACTTTGA 3083
>ref|XM_005585386.1| PREDICTED: Macaca fascicularis ATPase, H+ transporting, lysosomal
V0 subunit a1 (ATP6V0A1), mRNA
Length=4011
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 2872 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGACATTCATATCTAGACTTTGA 2921
>ref|XM_001095161.2| PREDICTED: Macaca mulatta lysosomal (H )-transporting ATPase
V0 subunit A isoform 1 (ATP6V0A1), mRNA
Length=4065
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Query 1 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGCCATTCACATCTAGACTTTGA 50
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Sbjct 2923 GTGCATTGTAGATGGAAGGAGCACCCATGACATTCATATCTAGACTTTGA 2972
>gb|DQ023263.1| Macaca mulatta 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 1 (HSD17B1)
gene, complete cds
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57 |
--------> <-------- |
Left flanking sequence | Right flanking sequence |
TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA | TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT |
blast search - genome
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HSCHR17_CTG4
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assembly
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 23262436 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 23262485
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genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 48340081 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 48340130
>ref|NW_004929407.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150191.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 23014605 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 23014654
>gb|KE141227.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold173, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 2712516 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 2712467
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shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 2587019 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 2587068
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Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 43644553 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 43644602
>gb|DS990712.1| Homo sapiens SCAF_1112675837225 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 3512225 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 3512274
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Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 47314814 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 47314863
>gb|CH003464.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 47444611 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 47444660
>gb|CH471109.2| Homo sapiens 211000035839605 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=15264114
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Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 2667648 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 2667697
>ref|NW_001838448.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188280, whole genome shotgun sequence
gb|DS486074.1| Homo sapiens SCAF_1103279188280 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 3512239 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 3512288
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 43644259 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 43644308
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
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Sbjct 44736626 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 44736675
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT
>ref|NC_000017.11| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000679.2| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 reference primary assembly
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 50201620 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50201571
>ref|NT_010783.16| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR17_CTG4
gb|GL000132.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=54806562
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 23265640 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 23265591
>ref|NC_018928.2| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=81289577
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Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 48343265 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 48343216
>ref|NW_004929407.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150191.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=54469784
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 23017789 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 23017740
>gb|KE141227.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold173, whole genome
shotgun sequence
Length=5430928
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 2709311 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 2709360
>gb|GL583042.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_62, whole genome
shotgun sequence
Length=12322275
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 2590217 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 2590168
>gb|CM000507.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76566745
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 43647738 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 43647689
>gb|DS990712.1| Homo sapiens SCAF_1112675837225 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=12891868
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3515410 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 3515361
>gb|CH003512.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=81075739
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 47318021 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 47317972
>gb|CH003464.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=80652589
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47447729 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 47447680
>gb|CH471109.2| Homo sapiens 211000035839605 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=15264114
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2670832 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 2670783
>ref|NW_001838448.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188280, whole genome shotgun sequence
gb|DS486074.1| Homo sapiens SCAF_1103279188280 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=12892099
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3515424 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 3515375
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43647444 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 43647395
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=77819263
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 44739810 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 44739761
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA
>ref|NG_007400.1| Homo sapiens collagen, type I, alpha 1 (COL1A1), RefSeqGene (LRG_1)
on chromosome 17
Length=24544
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8224 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 8175
>gb|AC015909.14| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-893F2, complete sequence
Length=217746
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171149 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 171100
>emb|X98705.1| H.sapiens DNA sequence of COL1A1 gene fused with intron 1 of
PDGFB gene
Length=16814
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5676 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 5627
>gb|AF017178.2| Homo sapiens pro alpha 1(I) collagen (COL1A1) gene, complete
cds
Length=18609
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3497 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 3448
>emb|Y15911.1| Homo sapiens DNA sequence for translocation break between COL1A1
gene and PDGFB
Length=607
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 52 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 3
>gb|M20789.1|HUMC1A1 Human, alpha 1 collagen type I gene, exons 1-25, clone RMS-8
Length=7616
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3187 TCCCCCTGCTGGCTCACCATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA 3138
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT
>ref|XM_010341887.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis collagen, type I,
alpha 1 (COL1A1), transcript variant X2, mRNA
Length=4558
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 99
>ref|XM_003931264.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis collagen, type I,
alpha 1 (COL1A1), transcript variant X1, mRNA
Length=4828
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 99
>ref|XM_009432810.1| PREDICTED: Pan troglodytes collagen, type I, alpha 1 (COL1A1),
transcript variant X3, mRNA
Length=5662
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 72
>ref|XM_009432809.1| PREDICTED: Pan troglodytes collagen, type I, alpha 1 (COL1A1),
transcript variant X2, mRNA
Length=5734
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 72
>ref|XM_001169409.4| PREDICTED: Pan troglodytes collagen, type I, alpha 1 (COL1A1),
transcript variant X1, mRNA
Length=5932
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 72
>ref|XM_009236618.1| PREDICTED: Pongo abelii collagen, type I, alpha 1 (COL1A1), mRNA
Length=5228
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 45 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 94
>ref|XM_009190252.1| PREDICTED: Papio anubis collagen, type I, alpha 1 (COL1A1), mRNA
Length=5839
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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(LOC102328226), mRNA
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1, transcript variant 1 (COL1A1), mRNA
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variant 1 (COL1A1), mRNA
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Sbjct 18 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 67
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variant 1 (COL1A1), mRNA
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Sbjct 18 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 67
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mRNA
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Sbjct 50 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 99
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transcript variant 1 (COL1A1), mRNA
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Sbjct 50 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 99
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Sbjct 12 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 61
>ref|XM_003786490.1| PREDICTED: Otolemur garnettii collagen, type I, alpha 1 (COL1A1),
mRNA
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Sbjct 20 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 69
>ref|XM_002923729.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca hypothetical protein LOC100476237
(LOC100476237), mRNA
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Sbjct 5 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 54
>gb|AC236832.1| Felis catus BAC clone FCAB-1H12 from chromosome unknown, complete
sequence
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Sbjct 86539 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 86588
>ref|NG_007400.1| Homo sapiens collagen, type I, alpha 1 (COL1A1), RefSeqGene (LRG_1)
on chromosome 17
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Sbjct 5020 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 5069
>ref|NM_000088.3| Homo sapiens collagen, type I, alpha 1 (COL1A1), mRNA
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Sbjct 20 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 69
>gb|AY590263.1| Synthetic construct mutant collagen alpha 1(I) chain (Col1a1)
gene, complete cds
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Sbjct 2306 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 2355
>gb|AC015909.14| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-893F2, complete sequence
Length=217746
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Sbjct 167945 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 167994
>gb|BC036531.2| Homo sapiens collagen, type I, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:33668
IMAGE:5264710), complete cds
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Sbjct 10 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 59
>gb|BC105184.1| Bos taurus collagen, type I, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:128258
IMAGE:7989286), complete cds
Length=4752
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Sbjct 13 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 62
>emb|X98705.1| H.sapiens DNA sequence of COL1A1 gene fused with intron 1 of
PDGFB gene
Length=16814
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Sbjct 2496 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 2545
>gb|AF017178.2| Homo sapiens pro alpha 1(I) collagen (COL1A1) gene, complete
cds
Length=18609
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Sbjct 313 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 362
>emb|AJ307029.1| Bos taurus partial COL1A1 gene for pro alpha 1(I) collagen, exon
1 and joined CDS
Length=5417
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Sbjct 3722 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 3771
>emb|Z74615.1| H.sapiens mRNA for prepro-alpha1(I) collagen
Length=6728
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Sbjct 13 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 62
>gb|J03559.1|HUMCOLAI1A Human alpha-1 collagen type I gene, exon 1, clone pUC19-E
Length=2256
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Sbjct 817 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 866
>gb|J02829.1|HUMCG1A1P Human alpha-1(I) collagen gene, exons 1 and 2 (partial)
Length=1950
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Sbjct 263 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 312
>gb|M20789.1|HUMC1A1 Human, alpha 1 collagen type I gene, exons 1-25, clone RMS-8
Length=7616
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 13 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 62
>ref|XM_010594342.1| PREDICTED: Loxodonta africana collagen, type I, alpha 1 (COL1A1),
mRNA
Length=5286
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 28 TTTCTCCTCGGGGTCTGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 77
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(COL1A1), mRNA
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Sbjct 20 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGCAGTGTGAGGCCACGCAT 69
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mRNA
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Sbjct 41 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGACTGTGAGGCCACGCAT 90
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mRNA
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Sbjct 22 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGACTGTGAGGCCACGCAT 71
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 24 TTTCTCCTTGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 73
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Sbjct 24 TTTCTCCTTGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 73
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Sbjct 24 TTTCTCCTTGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 73
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Sbjct 24 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 73
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Sbjct 24 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 73
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Sbjct 29 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 78
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Sbjct 29 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 78
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Sbjct 30 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 79
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Sbjct 29 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 78
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Sbjct 29 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 78
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(LOC101686788), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 29 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 78
>ref|XM_004764815.1| PREDICTED: Mustela putorius furo collagen alpha-1(I) chain-like
(LOC101686788), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 29 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 78
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(LOC101686788), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 29 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 78
>ref|XM_004764813.1| PREDICTED: Mustela putorius furo collagen alpha-1(I) chain-like
(LOC101686788), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 29 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 78
>ref|XM_001096194.2| PREDICTED: Macaca mulatta collagen, type I, alpha 1 (COL1A1),
mRNA
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Sbjct 32 TTTCTCCTTGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 81
>gb|AC192349.6| Rhesus Macaque BAC CH250-184F16 () complete sequence
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Sbjct 20359 TTTCTCCTTGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 20408
>gb|M10627.1|HUMCG1A1C Human alpha-1 collagen I gene, exon 1
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Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 286 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCCGAGTGTGAGGCCACGCAT 335
>ref|XM_007176431.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni collagen alpha-1(I)
chain-like (LOC103019929), mRNA
Length=5918
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Query 3 TCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 1 TCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCAGAGTGTGAGGCCACGCAT 48
>ref|XR_300525.1| PREDICTED: Sus scrofa collagen alpha-1(I) chain-like (LOC100738123),
misc_RNA
Length=4234
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Query 6 CCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 1 CCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 45
>ref|XM_008517986.1| PREDICTED: Equus przewalskii collagen, type I, alpha 1 (COL1A1),
mRNA
Length=5635
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Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 21 TTTCCCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGAGTGAGGCCACGCAT 70
>ref|XM_005597481.1| PREDICTED: Equus caballus collagen, type I, alpha 1 (COL1A1),
mRNA
Length=5209
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Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 21 TTTCCCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGAGTGAGGCCACGCAT 70
>ref|XM_004377940.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris collagen, type I, alpha
1, transcript variant 2 (COL1A1), mRNA
Length=5891
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19 TTTCTCCTCAGGGTCTGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 68
>dbj|AB209597.1| Homo sapiens mRNA for Collagen alpha 1 chain precursor variant
protein
Length=4721
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Query 7 CTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 1 CTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 44
>gb|AF034691.1|AF034691 Equus caballus procollagen alpha 1 (I) (COL1A1) mRNA, partial
cds
Length=1144
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Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
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Sbjct 10 TTTCCCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGAGTGAGGCCACGCAT 59
>ref|XM_008065247.1| PREDICTED: Tarsius syrichta collagen, type I, alpha 1 (COL1A1),
mRNA
Length=6720
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 20 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTG--AGGCCACGCAT 67
>ref|XM_006166190.1| PREDICTED: Tupaia chinensis collagen alpha-1(I) chain-like (LOC102469999),
mRNA
Length=5986
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 1 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 36 TTTCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTG--AGGCCACGCAT 83
>ref|XM_004859682.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber collagen, type I, alpha 1 (Col1a1),
mRNA
Length=4631
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 3 TCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 TCTCCCCGGGGTCGGAACAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 72
>ref|XM_004906096.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber collagen, type I, alpha 1 (Col1a1),
mRNA
Length=4631
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 3 TCTCCTCGGGGTCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 50
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 TCTCCCCGGGGTCGGAACAGGAGGCACGCGGAGTGTGAGGCCACGCAT 72
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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17 17 48275141 48275562 5M163N54M158N41M GCACCAGGGGGGCCAGGGAGACCACGAGGACCAGAGG
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17 17 48275314 48275799 49M158N45M227N6M GCACCAGGGGGGCCAGGGAGACCACGAGGACCAGAGGGACC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGGG
17 17 48275317 48275802 46M158N45M227N9M GCACCAGGGGGGCCAGGGAGACCACGAGGACCAGAGGGACC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGGGGCC
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17 17 48275344 48278977 19M158N45M227N33M48278981F3m GCACCAGGGGGGCCAGGGAGACCACGAGGACCAGAGGGACC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGGGGCCAGGCACGGAAATTCCTCCGGTTGA TTT
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Query 1 CCAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 326932 CCAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 326883
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shotgun sequence
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Query 1 CCAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 57949404 CCAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 57949453
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Query 1 CCAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 56970479 CCAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 56970528
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Lambda K H
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right flanking sequence - ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA
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HSCHR17_CTG4
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assembly
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Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
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>ref|NC_018928.2| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 37240856 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 37240807
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 9713288 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 9713337
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Sbjct 57951488 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 57951439
>gb|DS990789.1| Homo sapiens SCAF_1112675837183 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 324863 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 324912
>gb|CH003464.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
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Sbjct 61756377 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 61756328
>gb|CH471109.2| Homo sapiens 211000035839605 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
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Sbjct 14903568 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 14903519
>ref|NW_001838450.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188238, whole genome shotgun sequence
gb|DS486151.1| Homo sapiens SCAF_1103279188238 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
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Sbjct 324864 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 324913
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
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Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
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Sbjct 57951472 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 57951423
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=77819263
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Sbjct 56972546 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 56972497
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Gapped
Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - CCAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG
>ref|XM_003942464.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5 (DDX5), mRNA
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Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 549 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 501
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(DDX5), transcript variant X2, mRNA
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Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 623 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 575
>ref|XM_009251953.1| PREDICTED: Pongo abelii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2300
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Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 459 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 411
>ref|XM_008963791.1| PREDICTED: Pan paniscus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2458
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Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 618 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 570
>ref|XM_003811368.2| PREDICTED: Pan paniscus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2291
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 451 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 403
>ref|XM_008996916.1| PREDICTED: Callithrix jacchus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X3, mRNA
Length=3777
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 540
>ref|XM_008996915.1| PREDICTED: Callithrix jacchus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=3849
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 660 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 612
>ref|XM_002748148.3| PREDICTED: Callithrix jacchus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=3665
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 428
>ref|XR_429872.1| PREDICTED: Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X4, misc_RNA
Length=2814
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 572
>ref|XR_429871.1| PREDICTED: Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X3, misc_RNA
Length=3936
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 572
>ref|XM_006721738.1| PREDICTED: Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2445
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 556
>ref|XM_005257111.1| PREDICTED: Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2461
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 572
>ref|XM_003262629.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5, transcript variant 1 (DDX5), mRNA
Length=3898
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 659
>gb|EU599085.1| Homo sapiens DEAD box polypeptide 5/ets variant protein 4 fusion
protein (DDX5-ETV4 fusion) mRNA, complete cds
Length=1730
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 477 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 429
>ref|NM_004396.3| Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5), mRNA
Length=3769
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 554 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 506
>dbj|AB451382.1| Homo sapiens DDX5 mRNA for ATP-dependent RNA helicase DDX5, partial
cds, clone: FLJ08070AAAF
Length=1842
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 307 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 259
>dbj|AB451257.1| Homo sapiens DDX5 mRNA for ATP-dependent RNA helicase DDX5, complete
cds, clone: FLJ08070AAAN
Length=1845
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 307 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 259
>dbj|AK297753.1| Homo sapiens cDNA FLJ53366 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
Length=2114
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 444 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 396
>dbj|AB384902.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB4122, Homo sapiens DDX5
gene for ATP-dependent RNA helicase DDX5, complete cds, without
stop codon, in Flexi system
Length=1859
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 268
>dbj|AK310318.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17360
Length=1900
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 353 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 305
>gb|DQ893774.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008234; FLH165130.01L;
RZPDo839G05157D DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide
5 (DDX5) gene, encodes complete protein
Length=1885
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 329 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 281
>gb|DQ890687.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003317; FLH165134.01X; RZPDo839G05158D
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5)
gene, encodes complete protein
Length=1885
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 281
>gb|BC016027.1| Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone MGC:1516 IMAGE:3528578), complete cds
Length=2366
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 448 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 400
>gb|BT007642.1| Synthetic construct Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His)
box polypeptide 5 (RNA helicase, 68kDa) mRNA, partial cds
Length=1845
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 259
>gb|BT006943.1| Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 5 (RNA
helicase, 68kDa) mRNA, complete cds
Length=1845
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 259
>dbj|AB209919.1| Homo sapiens mRNA for Hypothetical protein DKFZp686J01190 variant
protein
Length=3539
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 461 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 413
>ref|NM_001133486.1| Pongo abelii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5), mRNA
emb|CR861259.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459M043 (from clone DKFZp459M043)
Length=3724
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 477 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 429
>emb|BX571764.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J01190 (from clone DKFZp686J01190)
Length=3572
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 478 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 430
>emb|X15729.1| Human mRNA for nuclear p68 protein
Length=2323
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 474 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 426
>emb|X52104.1| Human mRNA for p68 protein
Length=2330
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 482 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 434
>gb|AY890256.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024746.01X DEAD box
polypeptide 5 (DDX5) mRNA, complete cds
Length=1845
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 307 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 259
>gb|AY890255.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024745.01X DEAD box
polypeptide 5 (DDX5) mRNA, complete cds
Length=1845
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 259
>gb|AY892740.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024742.01L DEAD box
polypeptide 5 (DDX5) mRNA, partial cds
Length=1845
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 307 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 259
>ref|XM_010380000.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2310
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 CAGGGAAATTTGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 421
>ref|XM_010379999.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2510
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
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Sbjct 669 CAGGGAAATTTGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 621
>ref|XM_009191020.1| PREDICTED: Papio anubis DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2485
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 CAGGGAAATTAGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 596
>ref|XM_003913296.2| PREDICTED: Papio anubis DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2296
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455 CAGGGAAATTAGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 407
>ref|XM_008012079.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), mRNA
Length=2292
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 451 CAGGGAAATTAGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 403
>ref|XM_005584713.1| PREDICTED: Macaca fascicularis Probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5 (DDX5), transcript variant X3, mRNA
Length=3518
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 CAGGGAAATTAGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 484
>ref|XM_005584712.1| PREDICTED: Macaca fascicularis Probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2157
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 CAGGGAAATTAGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 484
>ref|NM_001258162.1| Macaca mulatta DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5),
mRNA
Length=3743
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 CAGGGAAATTAGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 489
>dbj|AB170341.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10430, similar to
human DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5), mRNA,
RefSeq: NM_004396.2
Length=1930
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 CAGGGAAATTAGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 429
>dbj|AB169223.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-18104, similar to
human DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5), mRNA,
RefSeq: NM_004396.2
Length=2182
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311 CAGGGAAATTAGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 263
>ref|NM_001284989.1| Macaca fascicularis Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5
(DDX5), mRNA
dbj|AB169157.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-17658, similar to
human DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5), mRNA,
RefSeq: NM_004396.2
Length=2416
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 50
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 CAGGGAAATTAGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG 511
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA
>ref|NM_004396.3| Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5), mRNA
Length=3769
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 127
>dbj|AK297905.1| Homo sapiens cDNA FLJ59357 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
Length=2080
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
>dbj|AK297753.1| Homo sapiens cDNA FLJ53366 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
Length=2114
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
>ref|NM_001144834.1| Pan troglodytes DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5),
mRNA
dbj|AB222120.1| Pan troglodytes verus ddx5 mRNA for DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
polypeptide 5, complete cds, clone: PorA0413
Length=2353
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
>emb|BX571764.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J01190 (from clone DKFZp686J01190)
Length=3572
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 51
>gb|AC138744.4| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-859E19, complete sequence
Length=177325
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 172172 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 172123
>emb|X52104.1| Human mRNA for p68 protein
Length=2330
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 54
>gb|AC009994.10| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-87N3, complete sequence
Length=188552
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146906 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 146955
>gb|AF015812.1|AF015812 Homo sapiens RNA helicase p68 (HUMP68) gene, complete cds
Length=7834
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 938 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 987
>dbj|AK297192.1| Homo sapiens cDNA FLJ59339 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
Length=2078
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 CTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 49
>ref|XM_004041210.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5, transcript variant 3 (DDX5), mRNA
Length=3670
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 238 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGTAGCTTCGGCTGGTGTCA 287
>ref|XM_004041209.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5, transcript variant 2 (DDX5), mRNA
Length=3697
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 238 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGTAGCTTCGGCTGGTGTCA 287
>ref|XM_004041208.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5, transcript variant 1 (DDX5), mRNA
Length=3907
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 238 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGTAGCTTCGGCTGGTGTCA 287
>emb|X15729.1| Human mRNA for nuclear p68 protein
Length=2323
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 TCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 47
>ref|NM_001133486.1| Pongo abelii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5), mRNA
emb|CR861259.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459M043 (from clone DKFZp459M043)
Length=3724
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCA 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1 ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTTGTGCTGCTTCTGCTGGTGTCA 50
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
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17 17 62499980 62500194 6M114N94M |||||||||||||AGACAATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGT
17 17 62499983 62500197 3M114N97M |||||||||||||AGACAATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCA
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17 17 62500001 62500101 100M CTCCCAAACTTACA
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17 17 62500033 62500133 100M CTCCCAAACTTACAGACAATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCAC
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17 17 62500051 62500151 100M CTCCCAAACTTACAGACAATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCC
17 17 62500061 62500161 100M CTCCCAAACTTACAGACAATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCA
17 17 62500068 62500168 100M CTCCCAAACTTACAGACAATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTACAGCAACTGGCC
17 17 62500074 62500174 100M CTCCCAAACTTACAGACAATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCT
17 17 62500085 62500185 100M CTCCCAAACTTACAGACAATGTTTCCACAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATA
17 17 62500090 62500190 100M CCAAACTTACAGACAATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGT
17 17 62500096 62500196 100M TTACAGACAATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTC
17 17 62500099 62500199 100M CAGACAATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGT
17 17 62500102 62500202 100M ACAATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAA
17 17 62500105 62500205 100M ATGTTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATT
17 17 62500108 62500208 100M TTTTCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTG
17 17 62500111 62500211 100M TCCCAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCT
17 17 62500114 62500214 100M CAGATCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGC
17 17 62500117 62500217 100M GTCCAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAAT
17 17 62500120 62500220 100M CAGTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAAC
17 17 62500123 62500223 100M TCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATC
17 17 62500126 62500226 100M GTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCAT
17 17 62500129 62500229 100M CCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGAC
17 17 62500132 62500232 100M CTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATT
17 17 62500135 62500340 99M105N1M CAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
17 17 62500138 62500343 96M105N4M CCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGG
17 17 62500141 62500346 93M105N7M TATCCAATCCACTTAGAGCAACTGACCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAA
17 17 62500144 62500349 90M105N10M CCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CGGGGAAATT
17 17 62500147 62500352 87M105N13M ATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGC
17 17 62500150 62500355 84M105N16M CACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTC
17 17 62500153 62500358 81M105N19M TTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATA
17 17 62500156 62500361 78M105N22M GAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAA
17 17 62500159 62500364 75M105N25M CAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATT
17 17 62500162 62500367 72M105N28M CTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAG
17 17 62500165 62500370 69M105N31M GCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAAC
17 17 62500168 62500373 66M105N34M ATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGG
17 17 62500171 62500376 63M105N37M CCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTT
17 17 62500174 62500379 60M105N40M GAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGG
17 17 62500177 62500382 57M105N43M CTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCA
17 17 62500180 62500385 54M105N46M GAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTT
17 17 62500183 62500388 51M105N49M TAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG
17 17 62500186 62500391 48M105N52M CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500186 62502403 48M105N49M62502407F3m CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACC
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m TGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m TGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m AGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m CGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m AGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m AGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m AGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m AGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m CGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m CGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m AGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m CGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m AGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m AGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAAAAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m GGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m GGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m TGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m TGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m CGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m AGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m AGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m GGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
17 17 62500187 62502402 47M105N49M62502407F4m AGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCT
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17 17 62500205 62502384 29M105N49M62502407F22m CTGTCTTGCGATAACATCTATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCTCATTCATTTCTACCGGTC
17 17 62500213 62502376 21M105N49M62502407F30m CAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG ACCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAG
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17 17 62502396 62502296 100m TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCA
17 17 62502393 62502293 100m CTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGGGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGGG
17 17 62502390 62502289 24m1d76m CCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCTDCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTT
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17 17 62502375 62502275 100m GCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTC
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17 17 62502366 62502266 100m GCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTT
17 17 62502363 62502263 100m GGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGT
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17 17 62502357 62502257 100m ATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCG
17 17 62502354 62502254 100m GGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCA
17 17 62502351 62502251 100m GTCCTTCCCCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACC
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17 17 62502333 62502233 100m CCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATG
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17 17 62502327 62502227 100m CAAGGCTTCCCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACCCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGT
17 17 62502324 62502224 100m GGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTAT
17 17 62502321 62502221 100m TTCGCAGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCG
17 17 62502318 62502218 100m GCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCTACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCACCCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGT
17 17 62502315 62502215 100m GTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGAC
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17 17 62502282 62500949 90m1233n10m GCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGCCAGGACCGAGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 62502279 62500946 87m1233n13m TTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGCCGGGACCGAGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 62502276 62500943 84m1233n16m CTATATCCTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGCCGGGACCGAGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 62502273 62500940 81m1233n19m TATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGCCGGGACCGAGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 62502267 62500934 75m1233n25m TCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGCCGGGACCGAGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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|
|
41 |
--------> <-------- |
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188238, whole genome shotgun sequence
gb|DS486151.1| Homo sapiens SCAF_1103279188238 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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assembly
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genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=81289577
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Sbjct 62566322 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 62566273
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150191.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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shotgun sequence
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>gb|GL583062.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_82, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 9713298 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 9713347
>gb|CM000507.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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>gb|DS990789.1| Homo sapiens SCAF_1112675837183 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>gb|CH003464.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=80652589
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Sbjct 61756367 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 61756318
>gb|CH471109.2| Homo sapiens 211000035839605 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=15264114
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Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 14903558 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 14903509
>ref|NW_001838450.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188238, whole genome shotgun sequence
gb|DS486151.1| Homo sapiens SCAF_1103279188238 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=4825045
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Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 324874 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 324923
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
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Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 57951462 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 57951413
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=77819263
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Sbjct 56972536 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 56972487
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1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG
>ref|XM_010380000.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 435 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 386
>ref|XM_010379999.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 635 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 586
>ref|XM_008012079.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), mRNA
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 417 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 368
>ref|XR_429872.1| PREDICTED: Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X4, misc_RNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 586 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 537
>ref|XR_429871.1| PREDICTED: Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X3, misc_RNA
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 586 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 537
>ref|XM_006721738.1| PREDICTED: Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2445
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 570 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 521
>ref|XM_005584713.1| PREDICTED: Macaca fascicularis Probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5 (DDX5), transcript variant X3, mRNA
Length=3518
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 498 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 449
>ref|XM_005584712.1| PREDICTED: Macaca fascicularis Probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2157
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 498 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 449
>ref|XM_005257111.1| PREDICTED: Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2461
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 586 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 537
>ref|NM_001258162.1| Macaca mulatta DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5),
mRNA
Length=3743
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 503 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 454
>gb|EU599085.1| Homo sapiens DEAD box polypeptide 5/ets variant protein 4 fusion
protein (DDX5-ETV4 fusion) mRNA, complete cds
Length=1730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 443 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 394
>ref|NM_004396.3| Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5), mRNA
Length=3769
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 520 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 471
>dbj|AB451382.1| Homo sapiens DDX5 mRNA for ATP-dependent RNA helicase DDX5, partial
cds, clone: FLJ08070AAAF
Length=1842
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 273 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 224
>dbj|AB451257.1| Homo sapiens DDX5 mRNA for ATP-dependent RNA helicase DDX5, complete
cds, clone: FLJ08070AAAN
Length=1845
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Sbjct 273 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 224
>dbj|AK297753.1| Homo sapiens cDNA FLJ53366 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
Length=2114
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 410 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 361
>dbj|AB384902.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB4122, Homo sapiens DDX5
gene for ATP-dependent RNA helicase DDX5, complete cds, without
stop codon, in Flexi system
Length=1859
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 282 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 233
>dbj|AK310318.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17360
Length=1900
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Sbjct 319 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 270
>gb|DQ893774.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008234; FLH165130.01L;
RZPDo839G05157D DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide
5 (DDX5) gene, encodes complete protein
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Sbjct 295 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 246
>gb|DQ890687.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003317; FLH165134.01X; RZPDo839G05158D
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5)
gene, encodes complete protein
Length=1885
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 295 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 246
>dbj|AB170341.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10430, similar to
human DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5), mRNA,
RefSeq: NM_004396.2
Length=1930
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Sbjct 443 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 394
>gb|BC016027.1| Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone MGC:1516 IMAGE:3528578), complete cds
Length=2366
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Sbjct 414 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 365
>gb|BT007642.1| Synthetic construct Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His)
box polypeptide 5 (RNA helicase, 68kDa) mRNA, partial cds
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Sbjct 273 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 224
>gb|BT006943.1| Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 5 (RNA
helicase, 68kDa) mRNA, complete cds
Length=1845
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Sbjct 273 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 224
>dbj|AB169223.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-18104, similar to
human DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5), mRNA,
RefSeq: NM_004396.2
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Sbjct 277 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 228
>ref|NM_001284989.1| Macaca fascicularis Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5
(DDX5), mRNA
dbj|AB169157.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-17658, similar to
human DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5), mRNA,
RefSeq: NM_004396.2
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Sbjct 525 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 476
>dbj|AB209919.1| Homo sapiens mRNA for Hypothetical protein DKFZp686J01190 variant
protein
Length=3539
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Sbjct 427 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 378
>gb|AC138744.4| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-859E19, complete sequence
Length=177325
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Sbjct 170139 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 170188
>emb|AJ010931.1| Homo sapiens ddx5 gene, exons 2 to 5, partial
Length=910
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Sbjct 474 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 425
>emb|X15729.1| Human mRNA for nuclear p68 protein
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Sbjct 440 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 391
>emb|X52104.1| Human mRNA for p68 protein
Length=2330
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Sbjct 448 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 399
>gb|AY890256.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024746.01X DEAD box
polypeptide 5 (DDX5) mRNA, complete cds
Length=1845
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Sbjct 273 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 224
>gb|AY890255.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024745.01X DEAD box
polypeptide 5 (DDX5) mRNA, complete cds
Length=1845
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 273 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 224
>gb|AY892740.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024742.01L DEAD box
polypeptide 5 (DDX5) mRNA, partial cds
Length=1845
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Sbjct 273 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 224
>gb|AC009994.10| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-87N3, complete sequence
Length=188552
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Sbjct 148939 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 148890
>gb|AF015812.1|AF015812 Homo sapiens RNA helicase p68 (HUMP68) gene, complete cds
Length=7834
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Sbjct 2995 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 2946
>gb|KM434334.1| Sus scrofa DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5) mRNA,
complete cds
Length=1845
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Sbjct 273 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 224
>ref|XM_009191020.1| PREDICTED: Papio anubis DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2485
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Sbjct 610 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTATATG 561
>ref|XM_003913296.2| PREDICTED: Papio anubis DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2296
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 421 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTATATG 372
>ref|XM_008963791.1| PREDICTED: Pan paniscus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2458
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 584 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTATATG 535
>ref|XM_003811368.2| PREDICTED: Pan paniscus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2291
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 417 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTATATG 368
>ref|XM_008996916.1| PREDICTED: Callithrix jacchus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X3, mRNA
Length=3777
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Sbjct 554 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATCTCCTTGCTTCTTCTGTATG 505
>ref|XM_008996915.1| PREDICTED: Callithrix jacchus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=3849
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 626 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATCTCCTTGCTTCTTCTGTATG 577
>ref|XM_002748148.3| PREDICTED: Callithrix jacchus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=3665
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 442 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATCTCCTTGCTTCTTCTGTATG 393
>ref|XM_008841605.1| PREDICTED: Nannospalax galili DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
Length=3571
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Sbjct 414 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 365
>ref|XM_008841604.1| PREDICTED: Nannospalax galili DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
Length=3707
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Sbjct 550 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 501
>ref|XM_008518272.1| PREDICTED: Equus przewalskii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), mRNA
Length=2616
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Sbjct 741 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 692
>ref|XM_008149415.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 440 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 391
>ref|XM_006049441.1| PREDICTED: Bubalus bubalis DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), mRNA
Length=2328
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Sbjct 453 CTTCGGGCAGTTATGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 404
>ref|XM_006912299.1| PREDICTED: Pteropus alecto DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), mRNA
Length=2366
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Sbjct 492 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 443
>ref|XM_006086750.1| PREDICTED: Myotis lucifugus probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5-like (LOC102419277), mRNA
Length=1833
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 261 CTTCGGGCAGTTGTGTCCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 212
>ref|XM_001495147.4| PREDICTED: Equus caballus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), mRNA
Length=2212
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 443 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 394
>ref|XR_186428.1| PREDICTED: Tursiops truncatus probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5-like (LOC101331159), partial misc_RNA
Length=2306
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 440 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 391
>ref|XM_003262629.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5, transcript variant 1 (DDX5), mRNA
Length=3898
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 673 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTATATG 624
>ref|XM_004041208.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5, transcript variant 1 (DDX5), mRNA
Length=3907
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 680 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTATATG 631
>dbj|AK399667.1| Sus scrofa mRNA, clone: BMWN10003B11, expressed in bone marrow
Length=2440
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 572 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 523
>dbj|AK306198.1| Pan troglodytes mRNA for probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5, complete cds, clone: PtsC-53-5_B06
Length=2422
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 532 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTATATG 483
>dbj|AK350880.1| Sus scrofa mRNA, clone:TCH010050D06, expressed in trachea
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Sbjct 532 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 483
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mRNA
dbj|AB222120.1| Pan troglodytes verus ddx5 mRNA for DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
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Sbjct 443 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTATATG 394
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Sbjct 525 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 476
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Sbjct 447 CTTTGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 398
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Sbjct 479 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTATATG 430
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Sbjct 480 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTATATG 431
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Sbjct 515 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATCTCCTTGCTTCTTCTATATG 466
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5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 421 CTTTGGGCAGTTGTGTCCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 372
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5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 566 CTTTGGGCAGTTGTGTCCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 517
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DDX5-like (LOC102421905), mRNA
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Sbjct 273 CTTTGGGCAGTTGTGTCCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 224
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5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 497 CTTTGGGCAGTTGTGTCCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 448
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5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 512 CTTTGGGCAGTTGTGTCCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 463
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DDX5-like (LOC102420663), mRNA
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Sbjct 322 CTTTGGGCAGTTGTGTCCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 273
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5 (DDX5), mRNA
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Sbjct 332 CTTTGGGCAGTTATGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 283
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 440 CTTCGGGCAATTATGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 391
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DDX5-like (LOC102246453), mRNA
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Sbjct 307 CTTTGGGCAGTTGTGTCCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 258
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5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 489 CTTTGGGCAGTTGTGTCCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 440
>ref|XM_005858671.1| PREDICTED: Myotis brandtii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 518 CTTTGGGCAGTTGTGTCCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 469
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(DDX5), mRNA
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Sbjct 267 CTTTGGGCAGTTATGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 218
>ref|XM_005328217.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5 (Ddx5), mRNA
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Sbjct 520 CTTTGGACAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 471
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5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 561 CTTCGGGCAATTATGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 512
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5 (Ddx5), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 442 CTTCGGACAGTTGTGACCTCTCACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 393
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5 (Ddx5), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 489 CTTCGGACAGTTGTGACCTCTCACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 440
>ref|XM_004870239.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 488 CTTCGGACAGTTGTGACCTCTCACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 439
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5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 483 CTTCGGACAGTTGTGACCTCTCACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 434
>ref|XM_004900841.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 436 CTTCGGACAGTTGTGACCTCTCACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 387
>ref|XM_004900840.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 489 CTTCGGACAGTTGTGACCTCTCACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 440
>ref|XM_004630171.1| PREDICTED: Octodon degus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), mRNA
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Sbjct 311 CTTTGGACAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 262
>ref|XM_004454070.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 473 CTTTGGGCAATTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 424
>ref|XM_004454069.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant 1, mRNA
Length=2574
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Sbjct 279 CTTTGGGCAATTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 230
>ref|XM_004013032.1| PREDICTED: Ovis aries DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5),
mRNA
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Sbjct 436 CTTTGGGCAGTTATGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 387
>ref|NM_001191395.1| Bos taurus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5), mRNA
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 581 CTTCGGGCAATTATGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 532
>gb|BC103318.1| Bos taurus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone IMAGE:7941432), partial cds
Length=2409
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 444 CTTCGGGCAATTATGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 395
>ref|XM_006532137.1| PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide
5 (Ddx5), transcript variant X3, mRNA
Length=3651
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 574 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 532
>ref|XM_006532136.1| PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide
5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
Length=3594
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 517 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 475
>ref|XM_006532135.1| PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide
5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
Length=3690
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 613 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 571
>gb|KF705682.1| Mus musculus molossinus clone MSMg01-329H21, complete sequence
Length=145577
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 4914 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 4956
>gb|JN961350.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Polg2:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38282
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 6602 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 6560
>gb|JN957412.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Polg2:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38244
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 6602 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 6560
>gb|JN952929.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Ddx5:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=39282
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 22443 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 22401
>gb|JN948996.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Ddx5:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=39214
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 22443 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 22401
>ref|NG_028997.1| Mus musculus predicted gene 12183 (Gm12183) pseudogene on chromosome
11
Length=2460
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 528 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 486
>ref|NM_007840.3| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (Ddx5),
mRNA
Length=3520
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 444 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 402
>gb|BC129873.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone MGC:150137 IMAGE:40110366), complete cds
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Sbjct 322 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 280
>gb|BC129874.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone MGC:150138 IMAGE:40110367), complete cds
Length=2015
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Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 325 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 283
>gb|BC086320.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone IMAGE:6466882), partial cds
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 367 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 325
>gb|BC062916.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone MGC:85999 IMAGE:6827275), complete cds
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Sbjct 429 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 387
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Probable RNA-dependent helicase p68
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Sbjct 444 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 402
>dbj|AK132779.1| Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:4922505M03 product:DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box polypeptide 5, full insert sequence
Length=2375
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Sbjct 491 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 449
>dbj|AK135173.1| Mus musculus 12 days embryo female ovary cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:6620402N06 product:DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box polypeptide 5, full insert sequence
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Sbjct 445 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 403
>dbj|AK166698.1| Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I1C0003N03 product:DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box polypeptide 5, full insert sequence
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 577 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 535
>dbj|AK166045.1| Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:G730030M03 product:DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box polypeptide 5, full insert sequence
Length=3521
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Strand=Plus/Minus
Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 445 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 403
>dbj|AK088887.1| Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:E430029P14 product:DEAD (aspartate-glutamate-alanine-aspartate)
box polypeptide 5, full
insert sequence
Length=2329
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 445 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 403
>dbj|AK076018.1| Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:2610035N22 product:DEAD (aspartate-glutamate-alanine-aspartate)
box polypeptide 5, full insert
sequence
Length=2338
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Strand=Plus/Minus
Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 446 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 404
>dbj|AK044792.1| Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:A930106P08 product:DEAD (aspartate-glutamate-alanine-aspartate)
box polypeptide 5, full insert sequence
Length=2329
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 444 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 402
>emb|AL645849.17| Mouse DNA sequence from clone RP23-14F5 on chromosome 11, complete
sequence
Length=202559
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 13172 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 13214
>emb|X65627.1| M.musculus mRNA TNZ2 for p68 RNA helicase
Length=2318
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 426 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 384
>gb|BC108369.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone MGC:118083 IMAGE:6312791), complete cds
Length=2236
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Sbjct 289 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 247
>gb|BC046554.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone IMAGE:4973650)
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 422 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 380
>emb|AL603664.16| Mouse DNA sequence from clone RP23-247J12 on chromosome 11, complete
sequence
Length=158098
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 142052 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 142094
>emb|AJ010936.1| Homo sapiens ddx5-ps1 gene, partial
Length=334
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Strand=Plus/Minus
Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 110 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 68
>emb|X94313.1| M.musculus Hlr1 gene
Length=4670
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Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 3839 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 3797
>ref|XM_007175738.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=3674
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 452 CTTTGGACAGTTGTGACCTCTGACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 403
>ref|XM_007175737.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=3727
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 505 CTTTGGACAGTTGTGACCTCTGACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 456
>ref|XM_007125951.1| PREDICTED: Physeter catodon DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2070
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 420 CTTTGGACAGTTGTGACCTCTGACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 371
>ref|XM_007125950.1| PREDICTED: Physeter catodon DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2449
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 574 CTTTGGACAGTTGTGACCTCTGACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 525
>ref|XM_005402162.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
Length=3674
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 CTTTGGACAGTTGTGACCTCTCACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 499
>ref|XM_005402161.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
Length=3622
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Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 CTTTGGACAGTTGTGACCTCTCACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 447
>ref|XM_004275628.1| PREDICTED: Orcinus orca DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5,
transcript variant 2 (DDX5), mRNA
Length=2440
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 CTTTGGACAGTTGTGACCTCTGACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 516
>ref|XM_004275627.1| PREDICTED: Orcinus orca DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5,
transcript variant 1 (DDX5), mRNA
Length=2513
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 CTTTGGACAGTTGTGACCTCTGACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 525
>ref|XM_004317166.1| PREDICTED: Tursiops truncatus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5, transcript variant 2 (DDX5), mRNA
Length=2440
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 558 CAGTTGTGACCTCTGACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 516
>ref|XM_004317165.1| PREDICTED: Tursiops truncatus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5, transcript variant 1 (DDX5), mRNA
Length=2513
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 8 CAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 50
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Sbjct 567 CAGTTGTGACCTCTGACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG 525
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT
>ref|NM_004396.3| Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5), mRNA
Length=3769
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 88 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 137
>dbj|AK297905.1| Homo sapiens cDNA FLJ59357 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
Length=2080
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Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 11 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 60
>dbj|AK297753.1| Homo sapiens cDNA FLJ53366 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
Length=2114
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Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 11 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 60
>dbj|AK297192.1| Homo sapiens cDNA FLJ59339 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
Length=2078
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Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 10 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 59
>emb|BX571764.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J01190 (from clone DKFZp686J01190)
Length=3572
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 12 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 61
>gb|AC138744.4| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-859E19, complete sequence
Length=177325
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 172162 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 172113
>emb|X15729.1| Human mRNA for nuclear p68 protein
Length=2323
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 8 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 57
>emb|X52104.1| Human mRNA for p68 protein
Length=2330
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 15 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 64
>gb|AC009994.10| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-87N3, complete sequence
Length=188552
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 146916 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 146965
>gb|AF015812.1|AF015812 Homo sapiens RNA helicase p68 (HUMP68) gene, complete cds
Length=7834
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
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Sbjct 948 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 997
>ref|NM_001144834.1| Pan troglodytes DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5),
mRNA
dbj|AB222120.1| Pan troglodytes verus ddx5 mRNA for DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
polypeptide 5, complete cds, clone: PorA0413
Length=2353
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 11 TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGCTGTCCT 60
>dbj|AB209919.1| Homo sapiens mRNA for Hypothetical protein DKFZp686J01190 variant
protein
Length=3539
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 CCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT 44
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
reads
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17 17 62500090 62500190 100M GTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGT
17 17 62500096 62500196 100M GTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTC
17 17 62500099 62500199 100M GTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGT
17 17 62500102 62500202 100M GTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAA
17 17 62500105 62500205 100M GTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATT
17 17 62500108 62500208 100M GTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTG
17 17 62500111 62500211 100M GTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCT
17 17 62500114 62500214 100M GTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGC
17 17 62500117 62500217 100M GTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAAT
17 17 62500120 62500220 100M GTCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAAC
17 17 62500123 62500223 100M TCTGTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATC
17 17 62500126 62500226 100M GTGCCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCAT
17 17 62500129 62500229 100M CCACTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGAC
17 17 62500132 62500232 100M CTCCAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATT
17 17 62500135 62500340 99M105N1M CAACCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
17 17 62500138 62500343 96M105N4M CCATATCCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGG
17 17 62500141 62500346 93M105N7M TATCCAATCCACTTAGAGCAACTGACCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAA
17 17 62500144 62500349 90M105N10M CCAATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CGGGGAAATT
17 17 62500147 62500352 87M105N13M ATCCACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGC
17 17 62500150 62500355 84M105N16M CACTTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTC
17 17 62500153 62500358 81M105N19M TTAGAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATA
17 17 62500156 62500361 78M105N22M GAGCAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAA
17 17 62500159 62500364 75M105N25M CAACTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATT
17 17 62500162 62500367 72M105N28M CTGGCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAG
17 17 62500165 62500370 69M105N31M GCCATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAAC
17 17 62500168 62500373 66M105N34M ATCCCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGG
17 17 62500171 62500376 63M105N37M CCTGAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTT
17 17 62500174 62500379 60M105N40M GAGCTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGG
17 17 62500177 62500382 57M105N43M CTTGAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCA
17 17 62500180 62500385 54M105N46M GAATAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTT
17 17 62500183 62500388 51M105N49M TAGCAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTG
17 17 62500186 62500391 48M105N52M CAGTGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACC
17 17 62500189 62500394 45M105N55M TGGGTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCT
17 17 62500192 62500397 42M105N58M GTTCAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAAC
17 17 62500195 62500400 39M105N61M CAGTGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGT
17 17 62500198 62500403 36M105N64M TGAAATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAAT
17 17 62500201 62500406 33M105N67M AATTCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTC
17 17 62500204 62500409 30M105N70M TCTGTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGACTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTT
17 17 62500207 62500412 27M105N73M GTCTTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCT
17 17 62500210 62500415 24M105N76M TTGCAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCT
17 17 62500213 62500418 21M105N79M CAATAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCT
17 17 62500216 62500421 18M105N82M TAACATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTA
17 17 62500219 62500424 15M105N85M CATCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATGT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m CCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATTACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
17 17 62500221 62502393 13M105N84M62502397F3m TCCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTT
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17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTATAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
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17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
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17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
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17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
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17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAACTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGAACTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
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17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTGGTGTCCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
17 17 62500222 62502392 12M105N84M62502397F4m CCATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTC
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17 17 62500223 62502391 11M105N84M62502397F5m CATGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCT
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17 17 62500225 62502389 9M105N84M62502397F7m TGACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCTAC
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17 17 62500226 62502388 8M105N84M62502397F8m GACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCCACC
17 17 62500226 62502388 8M105N84M62502397F8m GACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACTTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCTACT
17 17 62500226 62502388 8M105N84M62502397F8m GACATTTG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCCACC
17 17 62500229 62500329 100M ATTTGATATAATTAGTAACAGATATTTAGTAAAAATTAGTGATGCCAAGAAAAAGAGGGGGTAGGTGGAAACAAAAACACGGGTAGGTAGAACTGAAAAG
17 17 62500232 62502382 2M105N84M62502397F14m TG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCTACCGGTCTC
17 17 62500237 62500337 100M TAATTAGTAACAGATATTTAGTAAAAATTAGTGATGCCAAGAAAAAGAGGGGGTAGGTGGAAACAAAAACACGGGTAGGTAGAACTGAAAAGTAGCACTT
17 17 62500247 62500347 100M CAGATATTTAGTAAAAATTAGTGATGCCAAGAAAAAGAGGGGGTAGGTGGAAACAAAAACACGGGTAGGTAGAACTGAAAAGTAGCCCTTACCAGGGAAA
17 17 62500250 62500350 100M ATATTTAGTAAAAATTAGTGATGCCAAGAAAAAGAGGGGGTAGGTGGAAACAAAAACACGGGTAGGTAGAACTGAAAAGTAGCACTTACCAGGGAAATTG
17 17 62500259 62500359 100M AAAAATTAGTGATGCCAAGAAAAAGAGGGGGTAGGTGGAAACAAAAACACGGGTAGGTAGAACTGAAAAGTAGCACTTACCAGGGAAATTGGCTTCATAA
17 17 62500266 62500366 100M AGTGATGCCAAGAAAAAGAGGGGGTAGGTGGAAACAAAAACACGGGTAGGTAGAACTGAAAAGTAGCACTTACCAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTA
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17 17 62500292 62500392 100M GGTGGAAACAAAAACACGGGTAGGTAGAACTGAAAAGTAGCACTTACCAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCT
17 17 62500299 62500399 100M ACAAAAACACGGGTAGGTAGAACTGAAAAGTAGCACTTACCAGGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTG
17 17 62500341 62502378 82M62502397F18m GGGAAATTGGCTTCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCATGCTTCTTCTGTATG TTTCCACCGGTCTCTAGT
17 17 62500349 62502370 74M62502397F26m GGCTCCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCCACCGGTCTCTAGTAGTGCAGC
17 17 62500349 62502370 74M62502397F26m GGCTCCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCCACCGGTCTCTAGTAGTGCAGC
17 17 62500353 62502366 70M62502397F30m TCATAAAAATTTAGAACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCG
17 17 62500368 62502351 55M62502397F45m ACTGGCTTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGT
17 17 62500374 62502345 49M62502397F51m TTCGGGCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCCACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTT
17 17 62500379 62502340 44M62502397F56m GCAGTTGTGACCTCTAACTGTAATTTCCTTGCTTCTTCTGTATG TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCC
17 17 62502404 62502304 100m CTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGC
17 17 62502401 62502301 100m ATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGGGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCAT
17 17 62502396 62502296 100m TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCA
17 17 62502393 62502293 100m CTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGGGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGGG
17 17 62502390 62502289 76m1d24m CCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCTCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTDCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTT
17 17 62502387 62502287 100m GTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCCGCGACTTGT
17 17 62502384 62502284 100m TCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGC
17 17 62502381 62502281 100m AGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACG
17 17 62502378 62502278 100m AGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTT
17 17 62502375 62502275 100m GCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTC
17 17 62502372 62502272 100m GCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTAT
17 17 62502369 62502269 100m TCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATA
17 17 62502366 62502266 100m GCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTT
17 17 62502363 62502263 100m GGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGT
17 17 62502360 62502260 100m GTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCC
17 17 62502357 62502257 100m ATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCG
17 17 62502354 62502254 100m GGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCA
17 17 62502351 62502251 100m GTCCTTCCCCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACC
17 17 62502348 62502248 100m CTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCC
17 17 62502345 62502245 100m CCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACC
17 17 62502342 62502242 100m CCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATT
17 17 62502339 62502239 100m TGGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGAC
17 17 62502336 62502236 100m CCGCCCCCGAAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCC
17 17 62502333 62502233 100m CCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATG
17 17 62502330 62502230 100m CCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCG
17 17 62502327 62502227 100m CAAGGCTTCCCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACCCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGT
17 17 62502324 62502224 100m GGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTAT
17 17 62502321 62502221 100m TTCGCAGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCG
17 17 62502318 62502218 100m GCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCTACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCACCCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGT
17 17 62502315 62502215 100m GTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGAC
17 17 62502312 62502212 100m ATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCCCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGA
17 17 62502309 62502209 100m GAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGAC
17 17 62502306 62502206 100m GCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATCCTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGG
17 17 62502303 62502203 100m ATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGC
17 17 62502300 62502200 100m TCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGCCGG
17 17 62502297 62502197 100m AGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGCCGGGAC
17 17 62502294 62502194 100m GACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGCCGGGACCGA
17 17 62502291 62500958 1m1233n99m T||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 62502288 62500955 4m1233n96m TCGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 62502285 62500952 7m1233n93m CACGCTT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 62502282 62500949 10m1233n90m GCTTTTCTAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 62502279 62500946 13m1233n87m TTTCTATATACTT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 62502276 62500943 16m1233n84m CTATATCCTTCGTTCC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 62502273 62500940 19m1233n81m TATACTTCGTTCCCCGCCA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 62502270 62500937 22m1233n78m ACTTCGTTCCCCGCCAACCGCA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 62502261 62500928 31m1233n69m CCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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genome shotgun sequence
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sequence
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genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>gb|CH471109.2| Homo sapiens 211000035839605 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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>ref|NW_001838450.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188238, whole genome shotgun sequence
gb|DS486151.1| Homo sapiens SCAF_1103279188238 genomic scaffold, whole genome
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Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
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Sbjct 57951463 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 57951414
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Lambda K H
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blast search - nt
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>ref|XM_007959715.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 338 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 289
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(DDX5), transcript variant X4, misc_RNA
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>ref|XR_429871.1| PREDICTED: Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X3, misc_RNA
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Sbjct 484 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 435
>ref|XM_006721738.1| PREDICTED: Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X2, mRNA
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>ref|XM_005257111.1| PREDICTED: Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 484 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 435
>dbj|AK306198.1| Pan troglodytes mRNA for probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5, complete cds, clone: PtsC-53-5_B06
Length=2422
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 430 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 381
>gb|EU599085.1| Homo sapiens DEAD box polypeptide 5/ets variant protein 4 fusion
protein (DDX5-ETV4 fusion) mRNA, complete cds
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 341 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 292
>ref|NM_004396.3| Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5), mRNA
Length=3769
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 418 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 369
>dbj|AB451382.1| Homo sapiens DDX5 mRNA for ATP-dependent RNA helicase DDX5, partial
cds, clone: FLJ08070AAAF
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Sbjct 171 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 122
>dbj|AB451257.1| Homo sapiens DDX5 mRNA for ATP-dependent RNA helicase DDX5, complete
cds, clone: FLJ08070AAAN
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Sbjct 171 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 122
>dbj|AK297905.1| Homo sapiens cDNA FLJ59357 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
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Sbjct 341 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 292
>dbj|AK297192.1| Homo sapiens cDNA FLJ59339 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
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Sbjct 340 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 291
>dbj|AB384902.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB4122, Homo sapiens DDX5
gene for ATP-dependent RNA helicase DDX5, complete cds, without
stop codon, in Flexi system
Length=1859
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Sbjct 180 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 131
>dbj|AK310318.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17360
Length=1900
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Sbjct 217 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 168
>ref|NM_001144834.1| Pan troglodytes DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5),
mRNA
dbj|AB222120.1| Pan troglodytes verus ddx5 mRNA for DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
polypeptide 5, complete cds, clone: PorA0413
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Sbjct 341 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 292
>gb|DQ893774.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008234; FLH165130.01L;
RZPDo839G05157D DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide
5 (DDX5) gene, encodes complete protein
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Sbjct 193 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 144
>gb|DQ890687.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003317; FLH165134.01X; RZPDo839G05158D
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5)
gene, encodes complete protein
Length=1885
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 193 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 144
>gb|BC016027.1| Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone MGC:1516 IMAGE:3528578), complete cds
Length=2366
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Sbjct 312 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 263
>gb|BT007642.1| Synthetic construct Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His)
box polypeptide 5 (RNA helicase, 68kDa) mRNA, partial cds
Length=1845
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 171 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 122
>gb|BT006943.1| Homo sapiens DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 5 (RNA
helicase, 68kDa) mRNA, complete cds
Length=1845
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 171 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 122
>dbj|AB209919.1| Homo sapiens mRNA for Hypothetical protein DKFZp686J01190 variant
protein
Length=3539
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 325 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 276
>emb|BX571764.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J01190 (from clone DKFZp686J01190)
Length=3572
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 342 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 293
>gb|AC138744.4| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-859E19, complete sequence
Length=177325
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 170599 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 170648
>emb|X15729.1| Human mRNA for nuclear p68 protein
Length=2323
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 338 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 289
>emb|X52104.1| Human mRNA for p68 protein
Length=2330
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 346 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 297
>gb|AY890256.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024746.01X DEAD box
polypeptide 5 (DDX5) mRNA, complete cds
Length=1845
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 171 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 122
>gb|AY890255.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024745.01X DEAD box
polypeptide 5 (DDX5) mRNA, complete cds
Length=1845
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 171 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 122
>gb|AY892740.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024742.01L DEAD box
polypeptide 5 (DDX5) mRNA, partial cds
Length=1845
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 171 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 122
>gb|AC009994.10| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-87N3, complete sequence
Length=188552
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 148479 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 148430
>gb|AF015812.1|AF015812 Homo sapiens RNA helicase p68 (HUMP68) gene, complete cds
Length=7834
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 2545 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 2496
>ref|XM_003942464.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5 (DDX5), mRNA
Length=2393
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 413 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 364
>ref|XM_009251954.1| PREDICTED: Pongo abelii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2464
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 487 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 438
>ref|XM_009251953.1| PREDICTED: Pongo abelii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2300
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 323 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 274
>ref|XM_008996916.1| PREDICTED: Callithrix jacchus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X3, mRNA
Length=3777
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 452 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 403
>ref|XM_008996915.1| PREDICTED: Callithrix jacchus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=3849
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 524 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 475
>ref|XM_002748148.3| PREDICTED: Callithrix jacchus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=3665
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 340 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 291
>ref|XM_008768313.1| PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
Length=3461
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 313 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 264
>ref|XM_008768312.1| PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
Length=3538
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 390 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 341
>ref|XM_002719484.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), mRNA
Length=3517
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 333 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 284
>ref|XM_006970493.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5 (Ddx5), mRNA
Length=2375
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 394 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 345
>ref|XM_006912299.1| PREDICTED: Pteropus alecto DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), mRNA
Length=2366
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 390 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 341
>ref|XM_006776691.1| PREDICTED: Myotis davidii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2295
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 319 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 270
>ref|XM_006776690.1| PREDICTED: Myotis davidii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2440
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 464 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 415
>ref|XM_006532137.1| PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide
5 (Ddx5), transcript variant X3, mRNA
Length=3651
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 479 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 430
>ref|XM_006532136.1| PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide
5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
Length=3594
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 373
>ref|XM_006532135.1| PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide
5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
Length=3690
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 469
>ref|XM_006092443.1| PREDICTED: Myotis lucifugus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2371
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 395 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 346
>ref|XM_006092442.1| PREDICTED: Myotis lucifugus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2386
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 410 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 361
>ref|XM_005871481.1| PREDICTED: Myotis brandtii probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5-like (LOC102246453), mRNA
Length=1478
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 205 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 156
>ref|XM_005858672.1| PREDICTED: Myotis brandtii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 387 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 338
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5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 416 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 367
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Sbjct 5009 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 5058
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5 (Ddx5), mRNA
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Sbjct 392 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 343
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5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 481 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 432
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5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 426 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 377
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5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 333 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 284
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5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 418 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 369
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Sbjct 338 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 289
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5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 417 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 368
>ref|XM_004454070.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 371 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 322
>ref|XM_004454069.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 177 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 128
>ref|XM_004374211.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5 (DDX5), mRNA
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Sbjct 419 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 370
>ref|XM_004091501.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5, transcript variant 3 (DDX5), mRNA
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Sbjct 571 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 522
>ref|XM_004091500.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5, transcript variant 2 (DDX5), mRNA
Length=3688
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Sbjct 571 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 522
>ref|XM_003262629.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5, transcript variant 1 (DDX5), mRNA
Length=3898
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 571 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 522
>ref|XM_004041210.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5, transcript variant 3 (DDX5), mRNA
Length=3670
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 578 ATTCTTCTCGAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 529
>ref|XM_004041209.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5, transcript variant 2 (DDX5), mRNA
Length=3697
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 578 ATTCTTCTCGAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 529
>ref|XM_004041208.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5, transcript variant 1 (DDX5), mRNA
Length=3907
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 578 ATTCTTCTCGAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 529
>gb|JN961350.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Polg2:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38282
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 6143 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 6094
>gb|JN957412.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Polg2:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38244
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 6143 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 6094
>gb|JN952929.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Ddx5:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=39282
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 14873 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 14824
>gb|JN948996.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Ddx5:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=39214
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 14873 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 14824
>ref|NG_028997.1| Mus musculus predicted gene 12183 (Gm12183) pseudogene on chromosome
11
Length=2460
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 433 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 384
>gb|FJ168767.1| Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (Ddx5)
mRNA, partial cds
Length=1903
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 232 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 183
>ref|NM_007840.3| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (Ddx5),
mRNA
Length=3520
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 349 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 300
>gb|BC129873.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone MGC:150137 IMAGE:40110366), complete cds
Length=2012
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 227 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 178
>gb|BC129874.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone MGC:150138 IMAGE:40110367), complete cds
Length=2015
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 230 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 181
>gb|BC086320.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone IMAGE:6466882), partial cds
Length=2275
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 272 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 223
>gb|BC062916.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone MGC:85999 IMAGE:6827275), complete cds
Length=3645
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 334 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 285
>dbj|AK129022.1| Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3036683, highly similar to
Probable RNA-dependent helicase p68
Length=3602
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 349 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 300
>dbj|AK132779.1| Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:4922505M03 product:DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box polypeptide 5, full insert sequence
Length=2375
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 396 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 347
>dbj|AK135173.1| Mus musculus 12 days embryo female ovary cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:6620402N06 product:DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box polypeptide 5, full insert sequence
Length=3522
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 350 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 301
>dbj|AK166698.1| Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I1C0003N03 product:DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box polypeptide 5, full insert sequence
Length=2461
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 482 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 433
>dbj|AK166045.1| Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:G730030M03 product:DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box polypeptide 5, full insert sequence
Length=3521
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 350 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 301
>dbj|AK088887.1| Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:E430029P14 product:DEAD (aspartate-glutamate-alanine-aspartate)
box polypeptide 5, full
insert sequence
Length=2329
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 301
>dbj|AK076018.1| Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:2610035N22 product:DEAD (aspartate-glutamate-alanine-aspartate)
box polypeptide 5, full insert
sequence
Length=2338
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 302
>dbj|AK044792.1| Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:A930106P08 product:DEAD (aspartate-glutamate-alanine-aspartate)
box polypeptide 5, full insert sequence
Length=2329
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 300
>emb|AL645849.17| Mouse DNA sequence from clone RP23-14F5 on chromosome 11, complete
sequence
Length=202559
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 13267 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 13316
>emb|X65627.1| M.musculus mRNA TNZ2 for p68 RNA helicase
Length=2318
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 282
>gb|BC108369.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone MGC:118083 IMAGE:6312791), complete cds
Length=2236
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 194 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 145
>ref|NM_001007613.1| Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (Ddx5),
mRNA
gb|BC079036.1| Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA
(cDNA clone MGC:93965 IMAGE:7114313), complete cds
Length=2508
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 401 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 352
>gb|BC046554.1| Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone IMAGE:4973650)
Length=2321
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 327 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 278
>emb|AL603664.16| Mouse DNA sequence from clone RP23-247J12 on chromosome 11, complete
sequence
Length=158098
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 142511 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 142560
>emb|X94313.1| M.musculus Hlr1 gene
Length=4670
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 3381 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 3332
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5 (Ddx5), mRNA
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Sbjct 185 TTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 137
>ref|XM_008841605.1| PREDICTED: Nannospalax galili DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
Length=3571
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Sbjct 311 TTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 263
>ref|XM_008841604.1| PREDICTED: Nannospalax galili DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
Length=3707
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Sbjct 447 TTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 399
>ref|XM_005402162.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
Length=3674
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Strand=Plus/Minus
Query 2 TTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 445 TTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 397
>ref|XM_005402161.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
Length=3622
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Query 2 TTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 393 TTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 345
>gb|KM434334.1| Sus scrofa DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5) mRNA,
complete cds
Length=1845
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 171 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 124
>ref|XM_007456779.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2071
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 332 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 285
>ref|XM_007456778.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
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Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 472 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 425
>ref|XM_007175738.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=3674
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 350 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 303
>ref|XM_007175737.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=3727
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 403 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 356
>ref|XM_006049441.1| PREDICTED: Bubalus bubalis DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), mRNA
Length=2328
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 351 ATTCTTCTCAAACTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 304
>ref|XM_007125951.1| PREDICTED: Physeter catodon DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2070
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 318 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 271
>ref|XM_007125950.1| PREDICTED: Physeter catodon DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2449
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 472 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 425
>ref|XM_005887759.1| PREDICTED: Bos mutus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5),
transcript variant X2, mRNA
Length=2071
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333 ATTCTTCTCAAACTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 286
>ref|XM_005887758.1| PREDICTED: Bos mutus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5),
transcript variant X1, mRNA
Length=2315
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 338 ATTCTTCTCAAACTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 291
>ref|XM_005221055.1| PREDICTED: Bos taurus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide
5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2436
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 459 ATTCTTCTCAAACTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 412
>ref|XM_004317168.1| PREDICTED: Tursiops truncatus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5, transcript variant 4 (DDX5), mRNA
Length=2212
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 287
>ref|XM_004317167.1| PREDICTED: Tursiops truncatus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5, transcript variant 3 (DDX5), mRNA
Length=2120
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 382 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 335
>ref|XM_004317166.1| PREDICTED: Tursiops truncatus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5, transcript variant 2 (DDX5), mRNA
Length=2440
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 463 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 416
>ref|XM_004317165.1| PREDICTED: Tursiops truncatus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5, transcript variant 1 (DDX5), mRNA
Length=2513
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 472 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 425
>ref|XM_004275630.1| PREDICTED: Orcinus orca DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5,
transcript variant 4 (DDX5), mRNA
Length=2211
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 287
>ref|XM_004275629.1| PREDICTED: Orcinus orca DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5,
transcript variant 3 (DDX5), mRNA
Length=2070
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 285
>ref|XM_004275628.1| PREDICTED: Orcinus orca DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5,
transcript variant 2 (DDX5), mRNA
Length=2440
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 463 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 416
>ref|XM_004275627.1| PREDICTED: Orcinus orca DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5,
transcript variant 1 (DDX5), mRNA
Length=2513
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 425
>dbj|AK396121.1| Sus scrofa mRNA, clone: PBL010070H01, expressed in peripheral
blood lymphocytes
Length=2347
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 341 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 294
>dbj|AK399667.1| Sus scrofa mRNA, clone: BMWN10003B11, expressed in bone marrow
Length=2440
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 470 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 423
>ref|NM_001191395.1| Bos taurus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5), mRNA
Length=2460
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 479 ATTCTTCTCAAACTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 432
>dbj|AK350880.1| Sus scrofa mRNA, clone:TCH010050D06, expressed in trachea
Length=2427
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 430 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 383
>dbj|AK239448.1| Sus scrofa mRNA, clone:THY010104D08, expressed in thymus
Length=2424
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 423 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 376
>dbj|AK235519.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10089F12, expressed in ovary
Length=2338
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 345 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 298
>dbj|AK230829.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010050A10, expressed in alveolar macrophage
Length=2250
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 341 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 294
>gb|BC103318.1| Bos taurus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA
clone IMAGE:7941432), partial cds
Length=2409
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 ATTCTTCTCAAACTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 295
>ref|XM_009191020.1| PREDICTED: Papio anubis DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2485
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 459
>ref|XM_003913296.2| PREDICTED: Papio anubis DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2296
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 270
>ref|XM_008012079.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (DDX5), mRNA
Length=2292
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 266
>ref|XM_007088290.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=3630
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 325 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 276
>ref|XM_007088289.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=3707
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 402 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 353
>ref|XM_003997067.2| PREDICTED: Felis catus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=3658
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 352 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 303
>ref|XM_006940503.1| PREDICTED: Felis catus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X3, mRNA
Length=3677
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 371 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 322
>ref|XM_006940502.1| PREDICTED: Felis catus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=3714
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 408 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 359
>ref|XM_006737636.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X3, mRNA
Length=2073
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 333 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 284
>ref|XM_006737635.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2308
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 331 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 282
>ref|XM_006737634.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2373
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 396 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 347
>ref|NM_001286941.1| Canis lupus familiaris DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant 2, mRNA
Length=2333
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Sbjct 334 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 285
>ref|NM_001286940.1| Canis lupus familiaris DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), transcript variant 1, mRNA
Length=2403
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Sbjct 404 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 355
>ref|XM_005624263.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 360 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 311
>ref|XM_005584713.1| PREDICTED: Macaca fascicularis Probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5 (DDX5), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 396 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 347
>ref|XM_005584712.1| PREDICTED: Macaca fascicularis Probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 396 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 347
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RNA helicase DDX5-like (LOC101370822), misc_RNA
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 342 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 293
>ref|XR_187067.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens probable ATP-dependent
RNA helicase DDX5-like (LOC101374612), misc_RNA
Length=2318
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 333 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 284
>ref|XM_004405856.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5, transcript variant 3 (DDX5), mRNA
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 341 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 292
>ref|XM_004405855.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5, transcript variant 2 (DDX5), mRNA
Length=2079
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Sbjct 339 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 290
>ref|XM_004405854.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)
box helicase 5, transcript variant 1 (DDX5), mRNA
Length=2456
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 479 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 430
>ref|XM_004401898.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens probable ATP-dependent
RNA helicase DDX5-like (LOC101385384), mRNA
Length=2314
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 333 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 284
>ref|NM_001258162.1| Macaca mulatta DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5),
mRNA
Length=3743
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 401 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 352
>ref|XM_002924507.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
polypeptide 5 (DDX5), mRNA
Length=2381
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 398 ATTCTTCTCAAATTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTGACTA 349
>dbj|AB170341.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10430, similar to
human DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5), mRNA,
RefSeq: NM_004396.2
Length=1930
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Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 341 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 292
>ref|NM_001284989.1| Macaca fascicularis Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5
(DDX5), mRNA
dbj|AB169157.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-17658, similar to
human DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (DDX5), mRNA,
RefSeq: NM_004396.2
Length=2416
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 374
>ref|XM_010380000.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X2, mRNA
Length=2310
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
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Sbjct 333 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 286
>ref|XM_010379999.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
helicase 5 (DDX5), transcript variant X1, mRNA
Length=2510
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 486
>ref|XM_005694012.1| PREDICTED: Capra hircus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5
(DDX5), mRNA
Length=2142
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 118
>ref|XR_186428.1| PREDICTED: Tursiops truncatus probable ATP-dependent RNA helicase
DDX5-like (LOC101331159), partial misc_RNA
Length=2306
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 ATTCTTCTCAAATTTGGACAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 291
>ref|XM_004013032.1| PREDICTED: Ovis aries DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5),
mRNA
Length=3551
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 48
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334 ATTCTTCTCAAACTTGGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC 287
>ref|XM_004870241.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X4, mRNA
Length=2319
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 2 TTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
|||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339 TTCTTCTCGAATTTGGGTAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 291
>ref|XM_004870240.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X3, mRNA
Length=2366
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
|||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 TTCTTCTCGAATTTGGGTAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 338
>ref|XM_004870239.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
Length=2365
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 2 TTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
|||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 TTCTTCTCGAATTTGGGTAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 337
>ref|XM_004870238.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
Length=2360
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
|||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 380 TTCTTCTCGAATTTGGGTAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 332
>ref|XM_004900841.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X2, mRNA
Length=2313
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
|||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333 TTCTTCTCGAATTTGGGTAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 285
>ref|XM_004900840.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase
5 (Ddx5), transcript variant X1, mRNA
Length=2366
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 50
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Sbjct 386 TTCTTCTCGAATTTGGGTAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA 338
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC
>ref|NM_004396.3| Homo sapiens DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5), mRNA
Length=3769
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
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Sbjct 87 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 136
>dbj|AK297905.1| Homo sapiens cDNA FLJ59357 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
Length=2080
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
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Sbjct 10 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 59
>dbj|AK297753.1| Homo sapiens cDNA FLJ53366 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
Length=2114
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
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Sbjct 10 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 59
>dbj|AK297192.1| Homo sapiens cDNA FLJ59339 complete cds, highly similar to Probable
ATP-dependent RNA helicase DDX5 (EC 3.6.1.-)
Length=2078
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 58
>emb|BX571764.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J01190 (from clone DKFZp686J01190)
Length=3572
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
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Sbjct 11 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 60
>gb|AC138744.4| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-859E19, complete sequence
Length=177325
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 172163 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 172114
>emb|X15729.1| Human mRNA for nuclear p68 protein
Length=2323
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 56
>emb|X52104.1| Human mRNA for p68 protein
Length=2330
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 63
>gb|AC009994.10| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-87N3, complete sequence
Length=188552
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146915 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 146964
>gb|AF015812.1|AF015812 Homo sapiens RNA helicase p68 (HUMP68) gene, complete cds
Length=7834
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 947 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 996
>ref|NM_001144834.1| Pan troglodytes DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (DDX5),
mRNA
dbj|AB222120.1| Pan troglodytes verus ddx5 mRNA for DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box
polypeptide 5, complete cds, clone: PorA0413
Length=2353
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 10 ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGCTGTCC 59
>dbj|AB209919.1| Homo sapiens mRNA for Hypothetical protein DKFZp686J01190 variant
protein
Length=3539
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 CCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCC 43
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
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17 17 62500339 62500797 97M358N3M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGC
17 17 62500342 62500800 94M358N6M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGT
17 17 62500345 62500803 91M358N9M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCG
17 17 62500348 62500806 88M358N12M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCT
17 17 62500351 62500809 85M358N15M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGC
17 17 62500354 62500812 82M358N18M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAA
17 17 62500357 62500815 79M358N21M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATC
17 17 62500360 62500818 76M358N24M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGG
17 17 62500363 62500821 73M358N27M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTG
17 17 62500366 62500824 70M358N30M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTC
17 17 62500369 62500827 67M358N33M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTG
17 17 62500372 62500830 64M358N36M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATA
17 17 62500375 62500833 61M358N39M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAA
17 17 62500378 62500836 58M358N42M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATT
17 17 62500381 62500839 55M358N45M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTT
17 17 62500384 62500842 52M358N48M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTC
17 17 62500387 62500845 49M358N51M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAA
17 17 62500390 62500848 46M358N54M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTT
17 17 62500393 62500851 43M358N57M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGG
17 17 62500396 62500854 40M358N60M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAG
17 17 62500399 62500857 37M358N63M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTC
17 17 62500402 62500860 34M358N66M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATC
17 17 62500405 62500863 31M358N69M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAG
17 17 62500408 62500866 28M358N72M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATT
17 17 62500411 62500869 25M358N75M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCA
17 17 62500414 62500872 22M358N78M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTT
17 17 62500417 62500875 19M358N81M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTT
17 17 62500420 62500878 16M358N84M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTT
17 17 62500423 62500881 13M358N87M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAAC
17 17 62500425 62502393 7M362N89M62502398F4m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCGGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGATCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTC ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500428 62502394 8M358N89M62502398F3m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATT
17 17 62500429 62502393 7M358N89M62502398F4m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTCCTTTTTAACTA ATTT
17 17 62500429 62502393 7M358N89M62502398F4m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTT
17 17 62500429 62502393 7M358N89M62502398F4m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTT
17 17 62500429 62502393 7M358N89M62502398F4m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTT
17 17 62500429 62502393 7M358N89M62502398F4m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTT
17 17 62500429 62502393 7M358N89M62502398F4m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTT
17 17 62500429 62502393 7M358N89M62502398F4m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTT
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17 17 62500431 62502391 5M358N89M62502398F6m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCT
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17 17 62500431 62502391 5M358N89M62502398F6m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCT
17 17 62500431 62502391 5M358N89M62502398F6m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCT
17 17 62500431 62502391 5M358N89M62502398F6m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCT
17 17 62500431 62502391 5M358N89M62502398F6m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCT
17 17 62500432 62502390 4M358N89M62502398F7m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTA
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17 17 62500432 62502390 4M358N89M62502398F7m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTC
17 17 62500432 62502390 4M358N89M62502398F7m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTA
17 17 62500433 62502389 3M358N89M62502398F8m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTAC
17 17 62500433 62502389 3M358N89M62502398F8m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTAC
17 17 62500433 62502389 3M358N89M62502398F8m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTAC
17 17 62500434 62502388 2M358N89M62502398F9m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACC
17 17 62500434 62502388 2M358N89M62502398F9m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACC
17 17 62500434 62502388 2M358N89M62502398F9m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACC
17 17 62500434 62502388 2M358N89M62502398F9m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACC
17 17 62500434 62502388 2M358N89M62502398F9m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACC
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17 17 62500435 62502387 1M358N89M62502398F10m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCG
17 17 62500435 62502387 1M358N89M62502398F10m ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCG
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17 17 62500752 62500852 100M CGATCGAGTTACAGCCTGATGAAGCCACATGAATTTACTCACTGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGC
17 17 62500756 62500856 100M CGAGTTACAGCCTGATGAAGCCACATGAATTTACTCACTGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCT
17 17 62500761 62500861 100M TACAGCCTGATGAAGCCACATGAATTTACTCACTGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCA
17 17 62500768 62500868 100M TGATGAAGCCACATGAATTTACTCACTGCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCC
17 17 62500777 62500877 100M CACATGAATCTACTCACTGCTGTGCACCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTT
17 17 62500789 62500889 100M CTCACTGCTGTACGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTAATTTCT
17 17 62500794 62502386 89M62502398F11m TGCTGTGCGCCCAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGG
17 17 62500795 62502385 88M62502398F12m GCTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGT
17 17 62500795 62502385 88M62502398F12m GTTGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGT
17 17 62500797 62502383 86M62502398F14m TGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCT
17 17 62500797 62502383 86M62502398F14m TGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCT
17 17 62500797 62502383 86M62502398F14m TGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCT
17 17 62500797 62502383 86M62502398F14m TGTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCT
17 17 62500798 62502382 85M62502398F15m GTGTGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTC
17 17 62500798 62502382 85M62502398F15m GTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTC
17 17 62500798 62502382 85M62502398F15m GTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTC
17 17 62500798 62502382 85M62502398F15m GTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCCCTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTC
17 17 62500798 62502382 85M62502398F15m GTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCCCTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTC
17 17 62500798 62502382 85M62502398F15m GTGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTC
17 17 62500799 62502381 84M62502398F16m TGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCT
17 17 62500799 62502381 84M62502398F16m TGCGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCCCTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCT
17 17 62500800 62502380 83M62502398F17m GTGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTA
17 17 62500801 62502379 82M62502398F18m CGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTCTAG
17 17 62500801 62502379 82M62502398F18m CGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTCTAG
17 17 62500801 62502379 82M62502398F18m CGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAG
17 17 62500801 62502379 82M62502398F18m CGCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAG
17 17 62500802 62502378 81M62502398F19m GCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGT
17 17 62500802 62502378 81M62502398F19m GCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGT
17 17 62500802 62502378 81M62502398F19m GCCTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGT
17 17 62500803 62502377 80M62502398F20m CCCAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTA
17 17 62500804 62502376 79M62502398F21m CTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAG
17 17 62500804 62502376 79M62502398F21m CTAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAG
17 17 62500805 62502375 78M62502398F22m TAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGT
17 17 62500805 62502375 78M62502398F22m TAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCGTCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGT
17 17 62500805 62502375 78M62502398F22m TAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGT
17 17 62500805 62502375 78M62502398F22m TAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGT
17 17 62500805 62502375 78M62502398F22m TAGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGT
17 17 62500806 62502374 77M62502398F23m AGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTG
17 17 62500806 62502374 77M62502398F23m AGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTG
17 17 62500806 62502374 77M62502398F23m AGCCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCGAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTG
17 17 62500808 62502372 75M62502398F25m CCAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCA
17 17 62500808 62502372 75M62502398F25m CCAAATCAGGGTACTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCA
17 17 62500809 62502371 74M62502398F26m CAAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAAGTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTCTAGTAGTGCAG
17 17 62500810 62502370 73M62502398F27m AAATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGC
17 17 62500811 62502369 72M62502398F28m AATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCT
17 17 62500812 62502368 71M62502398F29m ATCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTT
17 17 62500813 62502367 70M62502398F30m TCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTC
17 17 62500813 62502367 70M62502398F30m TCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTC
17 17 62500813 62502367 70M62502398F30m TCAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTC
17 17 62500814 62502366 69M62502398F31m CAGGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCG
17 17 62500816 62502364 67M62502398F33m GGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGC
17 17 62500816 62502364 67M62502398F33m GGGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGC
17 17 62500817 62502363 66M62502398F34m GGTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCT
17 17 62500817 62502363 66M62502398F34m GGTGCTCTTGATAACAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCT
17 17 62500818 62502362 65M62502398F35m GTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTG
17 17 62500818 62502362 65M62502398F35m GTGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTG
17 17 62500819 62502361 64M62502398F36m TGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGG
17 17 62500819 62502361 64M62502398F36m TGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGG
17 17 62500819 62502361 64M62502398F36m TGCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGG
17 17 62500820 62502360 63M62502398F37m GCTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGT
17 17 62500821 62502359 62M62502398F38m CTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTG
17 17 62500821 62502359 62M62502398F38m CTCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTG
17 17 62500822 62502358 61M62502398F39m TCTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGT
17 17 62500823 62502357 60M62502398F40m CTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTC
17 17 62500823 62502357 60M62502398F40m CTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTC
17 17 62500823 62502357 60M62502398F40m CTTGATAAAAATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTC
17 17 62500832 62502348 51M62502398F49m AATTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTC
17 17 62500834 62502346 49M62502398F51m TTCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCT
17 17 62500835 62502345 48M62502398F52m TCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTT
17 17 62500835 62502345 48M62502398F52m TCTTCTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTT
17 17 62500839 62502341 44M62502398F56m CTCAAATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTC
17 17 62500843 62502337 40M62502398F60m AATTTAGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCT
17 17 62500848 62502332 35M62502398F65m AGGCAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGTTGCCCTTCCTCCGCTGCCGC
17 17 62500851 62502329 32M62502398F68m CAGCTCATCAAGATTCCACTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCC
17 17 62500856 62502324 27M62502398F73m CATCAAGATTCCCCTTCTTTTTAACTA ATTTCTCCCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAA
17 17 62500871 62502309 12M62502398F88m TCTTTTTAACTA ATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATC
17 17 62500877 62502303 6M62502398F94m TAACTA ATTTCTCCCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTAGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCC
17 17 62502405 62502305 100m CCTCATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGGGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGTCGTCATCGAGG
17 17 62502401 62502301 100m ATTCATTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGGGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCAT
17 17 62502396 62502296 100m TTTCTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCA
17 17 62502393 62502293 100m CTACCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGGGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGGG
17 17 62502390 62502289 24m1d76m CCGGTCTCTAGTAGTGCAGCTTCTDCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTT
17 17 62502387 62502287 100m GTCTCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCCGCGACTTGT
17 17 62502384 62502284 100m TCTAGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGC
17 17 62502381 62502281 100m AGTAGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACG
17 17 62502378 62502278 100m AGTGCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTT
17 17 62502375 62502275 100m GCAGCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTC
17 17 62502372 62502272 100m GCTTCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTAT
17 17 62502369 62502269 100m TCGGCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATA
17 17 62502366 62502266 100m GCTGGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTT
17 17 62502363 62502263 100m GGTGTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGT
17 17 62502360 62502260 100m GTCATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCC
17 17 62502357 62502257 100m ATCGGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCG
17 17 62502354 62502254 100m GGTGTCCTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCA
17 17 62502351 62502251 100m GTCCTTCCCCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACC
17 17 62502348 62502248 100m CTTCCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCC
17 17 62502345 62502245 100m CCTCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACC
17 17 62502342 62502242 100m CCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATT
17 17 62502339 62502239 100m TGGCCGCCCCCGCAAGGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGAC
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17 17 62502327 62502227 100m CAAGGCTTCCCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACCCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGT
17 17 62502324 62502224 100m GGCTTCGCCGTCATCGAGGCCATTTCCAGCGACTTGTCGCACGCTTTTCTATATACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAACCATTGACGCCATGTCGGGTTAT
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HuRef SCAF_1103279188168, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 50
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Sbjct 11 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 60
>gb|AC087289.9| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-552F3, complete sequence
Length=203765
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 50
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Sbjct 173618 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 173667
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
Length=1696
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 50
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Sbjct 11 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 60
>emb|BX537379.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2282 (from clone DKFZp686C2282);
complete cds
Length=2878
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 50
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Sbjct 12 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 61
>emb|Z48950.1| H.sapiens hH3.3B gene for histone H3.3
Length=3276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 50
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Sbjct 735 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 784
>emb|BX647280.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0399 (from clone DKFZp686O0399)
Length=1723
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 50
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Sbjct 10 CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 59
>gb|BC017558.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:9614 IMAGE:3910031), complete cds
Length=1119
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 50
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Sbjct 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 48
>gb|BC001124.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2161 IMAGE:2988279), complete cds
Length=896
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 GGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 50
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Sbjct 1 GGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 44
>gb|AF218029.1|AF218029 Homo sapiens clone PP781 unknown mRNA
Length=1693
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 11 GTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 50
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Sbjct 1 GTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGG 40
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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reads
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17 17 73774642 73774742 100M TTTACTACAAAACGCCATAAAAACTGCCTTCACTTAAGCTCTCTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTA
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17 17 73774648 73774748 100M ACAAAACGCCATAAAAACTGCCTTCACTTAAGCTCTCTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGG
17 17 73774651 73774751 100M AAACGCCATAAAAACTGCCTTCACTTAAGCTCTCTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATG
17 17 73774654 73774754 100M CGCCATAAAAACTGCCTTCACTTAAGCTCTCTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCA
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17 17 73774663 73774763 100M AACTGCCTTCACTTAAGCTCTCTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTG
17 17 73774666 73774766 100M TGCCTTCACTTAAGCTCTCTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTA
17 17 73774669 73774769 100M CTTCACTTAAGCTCTCTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCT
17 17 73774672 73774772 100M CACTTAAGCTCTCTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGAATGGCACACAGGTTGGTATCTTCG
17 17 73774675 73774775 100M TTAAGCTCTCTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAAC
17 17 73774678 73774778 100M AGCTCTCTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGA
17 17 73774681 73774781 100M TCTCTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCC
17 17 73774684 73774784 100M CTCTCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACC
17 17 73774687 73774787 100M TCCCCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGG
17 17 73774690 73774790 100M CCGTATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGGGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTAC
17 17 73774693 73774793 100M TATCCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTATTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGGATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCT
17 17 73774696 73774796 100M CCGGCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCG
17 17 73774699 73774799 100M GCGAGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTA
17 17 73774702 73774802 100M AGCCAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGACCAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCC
17 17 73774705 73774805 100M CAACTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTAC
17 17 73774708 73774808 100M CTGGATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTCCTGC
17 17 73774711 73774811 100M GATGTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTCCTGTTGA
17 17 73774714 73774814 100M GTCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTCCTGTTGAGGA
17 17 73774717 73774817 100M TTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTCCTGTTGAGGACGA
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17 17 73774726 73774912 78M86N22M GATGGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCG
17 17 73774729 73774915 75M86N25M GGTGACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTC
17 17 73774732 73774918 72M86N28M GACTCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTTTGA
17 17 73774735 73774921 69M86N31M TCTCTTAGCGTGGATGGCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAAC
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17 17 73774763 73775828 41M86N38M73775850F21m GTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGC
17 17 73774763 73775828 41M86N38M73775850F21m GTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGC
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17 17 73774766 73775825 38M86N38M73775850F24m TCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGT
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17 17 73774776 73775815 28M86N38M73775850F34m GACCCGCCCGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTT
17 17 73774776 73775815 28M86N38M73775850F34m GACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTT
17 17 73774776 73775815 28M86N38M73775850F34m GACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTT
17 17 73774777 73775814 27M86N38M73775850F35m ACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGAG CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTC
17 17 73774780 73774880 100M CACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTCCTGTTGAGGACGAGAGCCGCACTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAAGCC
17 17 73774781 73775810 23M86N38M73775850F39m ACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGAG CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC
17 17 73774781 73775810 23M86N38M73775850F39m ACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC
17 17 73774784 73774884 100M AGGTACGCTTCGCTAGCCTCCTGTTGAGGACGAGAGCCGCACTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTG
17 17 73774784 73775807 20M86N38M73775850F42m CGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTC
17 17 73774785 73775806 19M86N38M73775850F43m GGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCG
17 17 73774787 73775804 17M86N38M73775850F45m TACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGAC
17 17 73774788 73775803 16M86N38M73775850F46m ACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACT
17 17 73774789 73775802 15M86N38M73775850F47m CGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTG
17 17 73774789 73775802 15M86N38M73775850F47m CGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTG
17 17 73774791 73775800 13M86N38M73775850F49m CTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCG
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17 17 73774798 73775793 6M86N38M73775850F56m AGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTC
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17 17 73774800 73775791 4M86N38M73775850F58m CCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCT
17 17 73774801 73775790 3M86N38M73775850F59m CTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTC
17 17 73774802 73775789 2M86N38M73775850F60m TC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCG
17 17 73774803 73775784 1M90N34M73775850F65m C||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGT CGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAG
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Lambda K H
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sequence
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shotgun sequence
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Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
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Sbjct 31792248 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 31792201
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gb|GL000106.2| Homo sapiens chromosome 12 genomic contig, GRCh38 reference primary
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Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
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Sbjct 24707598 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 24707551
>ref|NC_018923.2| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001620.2| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=133671515
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 31911122 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 31911075
>ref|NW_004929383.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150167.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 24672271 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 24672224
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shotgun sequence
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Sbjct 2922966 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 2923013
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Length=130618000
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 31697784 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 31697737
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shotgun sequence
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Sbjct 2944993 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 2945040
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Length=139801695
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Sbjct 33103033 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 33102986
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Length=131157419
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 10241928 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 10241881
>gb|CH471116.2| Homo sapiens 211000035838052 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=12881912
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 9971586 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 9971539
>ref|NW_001838055.2| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188198, whole genome shotgun sequence
gb|DS486187.1| Homo sapiens SCAF_1103279188198 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 2944902 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 2944949
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000473.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=130617856
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Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
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Sbjct 31697836 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 31697789
>gb|CM000263.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=133516800
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Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
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Sbjct 11768004 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 11767957
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG
>ref|XM_003954377.2| PREDICTED: Pan troglodytes H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1082
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
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Sbjct 423 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 374
>ref|XM_008966307.1| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=549
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
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Sbjct 319 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 270
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gene, encodes complete protein
Length=537
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
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Sbjct 288 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 239
>gb|KJ891325.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00719 H3F3B
gene, encodes complete protein
Length=540
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
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Sbjct 291 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 242
>ref|XM_006145799.1| PREDICTED: Tupaia chinensis histone H3.3-like (LOC102487507),
transcript variant X2, mRNA
Length=1048
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 334
>ref|XM_006145798.1| PREDICTED: Tupaia chinensis histone H3.3-like (LOC102487507),
transcript variant X1, mRNA
Length=1047
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
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Sbjct 382 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 333
>gb|JQ812897.1| Metasiro americanus clone G08.G11 histone H3 gene, partial cds
Length=325
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 151
>ref|XM_004041019.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla H3 histone, family 3B (H3.3B)
(H3F3B), mRNA
Length=2848
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 464
>gb|JF432417.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100073623 histone
H3-like (LOC440093) gene, encodes complete protein
Length=507
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
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Sbjct 273 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 224
>gb|HQ873957.1| Homo sapiens histone variant H3.5 (H3F3C) mRNA, complete cds
Length=1070
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 249
>gb|HQ873956.1| Pan paniscus isolate Lusambo histone variant H3.5 (H3F3C) pseudogene,
complete sequence
Length=411
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 226 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 177
>gb|HQ873955.1| Gorilla gorilla isolate Rosalinde histone variant H3.5 (H3F3C)
gene, H3F3C-b allele, complete cds
Length=411
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 226 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 177
>gb|HQ873954.1| Gorilla gorilla isolate Rosalinde histone variant H3.5 (H3F3C)
pseudogene, H3F3C-a allele, complete sequence
Length=411
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 226 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 177
>dbj|AB463740.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8141, Homo sapiens H33 gene
for Histone H3.3, without stop codon, in Flexi system
Length=425
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 186
>dbj|AK304607.1| Homo sapiens cDNA FLJ52843 complete cds, highly similar to Histone
H3.3
Length=1582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 310
>ref|NM_001013699.2| Homo sapiens H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1071
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 249
>gb|EU446957.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100069932; IMAGE:100012166;
FLH257123.01L H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B)
gene, encodes complete protein
Length=451
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 199
>dbj|AK312762.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93172, highly similar to Homo sapiens H3
histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=545
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 311
>emb|AM393192.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002304 for hypothetical
protein (H3F3B gene)
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 246 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 197
>gb|BC013020.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3349652, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2338
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 1623
>gb|BC006497.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2160 IMAGE:2959756), complete cds
gb|BC012813.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:4123 IMAGE:2959756), complete cds
Length=1119
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 294
>gb|BC017558.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:9614 IMAGE:3910031), complete cds
Length=1119
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 347 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 298
>gb|BC001124.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2161 IMAGE:2988279), complete cds
Length=896
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 294
>ref|NM_005324.3| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=2753
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 310
>gb|AC087289.9| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-552F3, complete sequence
Length=203765
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174521 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 174472
>gb|BC066906.1| Homo sapiens histone H3-like, mRNA (cDNA clone MGC:87082 IMAGE:5267388),
complete cds
Length=1070
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 249
>gb|BC020466.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
IMAGE:3870030)
Length=601
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 2
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
Length=1696
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 310
>emb|BX537379.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2282 (from clone DKFZp686C2282);
complete cds
Length=2878
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 311
>gb|AC023050.36| Homo sapiens 12 BAC RP11-428G5 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=186864
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18154 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 18203
>gb|AF218029.1|AF218029 Homo sapiens clone PP781 unknown mRNA
Length=1693
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 290
>emb|Z48950.1| H.sapiens hH3.3B gene for histone H3.3
Length=3276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 1589
>gb|BC108701.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:131844 IMAGE:6144255), complete cds
Length=1098
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 273
>emb|BX647280.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0399 (from clone DKFZp686O0399)
Length=1723
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 309
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Length=1003
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCT 398
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(H3F3B), mRNA
Length=1854
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 CGATCTCCCTCACCAACCTTTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 467
>ref|XM_003913444.2| PREDICTED: Papio anubis H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
mRNA
Length=3176
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 837 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCG 788
>ref|XM_008965834.1| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
transcript variant X2, mRNA
Length=2618
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 CGATCTCCCTCACCAATCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 227
>ref|XM_003813276.2| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
transcript variant X1, mRNA
Length=2852
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 CGATCTCCCTCACCAATCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 461
>gb|KJ913372.1| Macaca mulatta isolate Rh23108 clone 4634 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
Length=12507
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1175 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCG 1224
>ref|XM_008011728.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus H3 histone, family 3B (H3.3B)
(H3F3B), mRNA
Length=1717
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 370 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCG 321
>gb|KJ457091.1| Macaca mulatta isolate Rh23717 clone 3190 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
Length=35269
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 23615 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCG 23664
>gb|KJ456959.1| Macaca mulatta isolate Rh23108 clone 2985 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
Length=36105
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 9974 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCG 10023
>ref|XM_005584981.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926276 (LOC101926276),
mRNA
Length=1139
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 373 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCG 324
>ref|XM_005553676.1| PREDICTED: Macaca fascicularis histone H3.3-like (LOC102118214),
mRNA
Length=882
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 351 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCG 302
>ref|XM_003279090.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys H3 histone, family 3B (H3.3B),
transcript variant 3 (H3F3B), mRNA
Length=1108
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
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Sbjct 836 CGATCTCCCTCACCAATCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 787
>ref|NM_001280448.1| Pan troglodytes H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
dbj|AK306632.1| Pan troglodytes mRNA for histone H3.3, complete cds, clone: PtsC-54-5_E11
Length=1699
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
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Sbjct 359 CGATCTCCCTCACCAATCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 310
>gb|HQ873953.1| Gorilla gorilla isolate Ukiwa histone variant H3.5 (H3F3C) pseudogene,
H3F3C-a allele, complete sequence
Length=1438
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
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Sbjct 544 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGACGAGCAGCTCG 495
>ref|XR_014302.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC719872), miscRNA
Length=1145
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
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Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCG 309
>ref|XM_002803979.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC100430466), mRNA
Length=1149
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCG 309
>ref|XM_002803657.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC711912), mRNA
Length=1076
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 327 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCG 278
>ref|XM_001104973.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
3 (LOC711912), mRNA
Length=1163
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 366 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCG 317
>ref|XM_001096496.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC708054, transcript
variant 1 (LOC708054), mRNA
Length=3410
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 950 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCG 901
>ref|XM_001099829.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
1 (LOC704104), mRNA
Length=2721
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 347 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCG 298
>ref|XM_001100109.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
2 (LOC704104), mRNA
Length=2750
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 376 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCG 327
>ref|XM_002800601.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC704104), mRNA
Length=2672
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 298 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCG 249
>ref|XM_002800600.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC704104), mRNA
Length=2729
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 355 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCG 306
>gb|AC197396.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-337K2 from chromosome 16, complete
sequence
Length=193060
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 57231 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCG 57182
>ref|XM_008019176.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus histone H3.3-like (LOC103247139),
mRNA
Length=1000
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
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Sbjct 334 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCG 286
>emb|FQ232852.1| Rattus norvegicus TL0AEA64YD08 mRNA sequence
Length=1001
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 310
>emb|FQ232671.1| Rattus norvegicus TL0AEA64YN10 mRNA sequence
Length=904
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
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Sbjct 356 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 308
>emb|FQ225528.1| Rattus norvegicus TL0AEA4YM02 mRNA sequence
Length=904
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
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Sbjct 356 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 308
>emb|FQ232451.1| Rattus norvegicus TL0AEA65YL02 mRNA sequence
Length=839
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
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Sbjct 292 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 244
>emb|FQ228569.1| Rattus norvegicus TL0ADA6YM05 mRNA sequence
Length=906
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 310
>emb|FQ225133.1| Rattus norvegicus TL0AEA55YA13 mRNA sequence
Length=1000
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 310
>emb|FQ235236.1| Rattus norvegicus TL0AEA55YP07 mRNA sequence
Length=1117
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 313
>emb|FQ227957.1| Rattus norvegicus TL0AEA11YB15 mRNA sequence
Length=1002
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 310
>emb|FQ215473.1| Rattus norvegicus TL0ACA48YB21 mRNA sequence
Length=1106
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
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Sbjct 356 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 308
>emb|FQ234408.1| Rattus norvegicus TL0AEA59YB15 mRNA sequence
Length=904
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
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Sbjct 356 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 308
>emb|FQ227260.1| Rattus norvegicus TL0AEA13YP20 mRNA sequence
Length=1117
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
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Sbjct 361 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 313
>emb|FQ234172.1| Rattus norvegicus TL0AEA59YO15 mRNA sequence
Length=1000
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 310
>emb|FQ227040.1| Rattus norvegicus TL0AEA15YI02 mRNA sequence
Length=1000
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
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Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 310
>emb|FQ226787.1| Rattus norvegicus TL0AEA1YG18 mRNA sequence
Length=905
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 356 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 308
>gb|AC130970.4| Rattus norvegicus BAC CH230-105L10 (Children's Hospital Oakland
Research Institute Rat (BN/SsNHsd/MCW) BAC library) complete
sequence
Length=222638
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 181531 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 181579
>ref|NM_053985.2| Rattus norvegicus H3 histone, family 3B (H3f3b), mRNA
gb|BC063159.1| Rattus norvegicus H3 histone, family 3B, mRNA (cDNA clone MGC:72729
IMAGE:6921452), complete cds
Length=1685
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 363 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 315
>dbj|AB128049.1| Macaca mulatta genes, MHC class I region, partial and complete
cds
Length=3284914
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2500726 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCG 2500678
>emb|X73683.1| R.norvegicus mRNA for histone H3.3
Length=1107
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 354 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 306
>gb|BC078759.1| Rattus norvegicus H3 histone, family 3B, mRNA (cDNA clone MGC:93264
IMAGE:7112262), complete cds
Length=1650
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 332 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGTAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 284
>ref|XM_003780001.2| PREDICTED: Pongo abelii histone H3.3-like (LOC100435774), mRNA
Length=642
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGC 47
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 281 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGC 235
>ref|XM_002823088.3| PREDICTED: Pongo abelii H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1126
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGC 47
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 368 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGC 322
>ref|XM_003131194.2| PREDICTED: Sus scrofa histone H3.3-like (LOC100521680), mRNA
Length=1726
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 385 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 337
>dbj|AK399768.1| Sus scrofa mRNA, clone: BMWN10073F03, expressed in bone marrow
Length=1744
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 949 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 901
>dbj|AK399371.1| Sus scrofa mRNA, clone: THY010068B03, expressed in thymus
Length=1162
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 373 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 325
>dbj|AK395637.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVRT10040F05, expressed in ovary
Length=1401
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 609 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 561
>dbj|AK348527.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10192H01, expressed in ovary
Length=1552
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 792 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 744
>emb|CU928968.5| Pig DNA sequence from clone CH242-19M24 on chromosome 12, complete
sequence
Length=119643
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 29081 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 29033
>dbj|AK234113.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010008D04, expressed in ovary
Length=1717
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 310
>dbj|AK239851.1| Sus scrofa mRNA, clone:UTR010004D12, expressed in uterus
Length=1024
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 310
>dbj|AK231974.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010059C08, expressed in lung
Length=2212
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 310
>dbj|AK235071.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10046F12, expressed in ovary
Length=2768
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 358 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 310
>dbj|AK231121.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010097F05, expressed in alveolar macrophage
Length=921
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 359 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 311
>ref|XM_006869571.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica histone H3.3-like (LOC102835853),
mRNA
Length=983
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 227 CGATCTCCCGCACCAGCCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAACTCG 178
>gb|DQ284188.1| Bufo asper histone H3a gene, partial cds
Length=328
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 50
||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 CGATCTCCCTCACCAGGCGCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG 154
>ref|XM_009420074.1| PREDICTED: Musa acuminata subsp. malaccensis histone H3.2 (LOC103998569),
mRNA
Length=644
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 49
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 285 CGATCTCCCGCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGCAACTC 237
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA
>ref|NM_005324.3| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=2753
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 99
>gb|AC087289.9| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-552F3, complete sequence
Length=203765
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173657 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 173706
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
Length=1696
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 99
>emb|BX537379.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2282 (from clone DKFZp686C2282);
complete cds
Length=2878
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 100
>gb|AF218029.1|AF218029 Homo sapiens clone PP781 unknown mRNA
Length=1693
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 79
>emb|Z48950.1| H.sapiens hH3.3B gene for histone H3.3
Length=3276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 774 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 823
>gb|BC108701.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:131844 IMAGE:6144255), complete cds
Length=1098
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 62
>emb|BX647280.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0399 (from clone DKFZp686O0399)
Length=1723
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 98
>ref|XM_003270553.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys uncharacterized LOC100603449 (LOC100603449),
mRNA
Length=1772
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107 GTCGGCTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 156
>ref|XM_004041019.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla H3 histone, family 3B (H3.3B)
(H3F3B), mRNA
Length=2848
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 GTCGACTGCGGCTCTTCTTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 253
>ref|NM_001133832.1| Pongo abelii H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
emb|CR858345.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A2130 (from clone DKFZp459A2130)
Length=2733
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 GTCGACTGCGGCTCTTTCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 98
>ref|XM_003954377.2| PREDICTED: Pan troglodytes H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1082
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 116 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 163
>ref|XM_002823088.3| PREDICTED: Pongo abelii H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1126
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 61 CGACTGAGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGAGGTCGGAGA 108
>ref|XM_003913444.2| PREDICTED: Papio anubis H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
mRNA
Length=3176
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 CGATTGCGGCTGTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 577
>ref|XM_008966307.1| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=549
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 12 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 59
>ref|XM_005584981.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926276 (LOC101926276),
mRNA
Length=1139
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 CGATTGCGGCTGTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 113
>gb|HQ873953.1| Gorilla gorilla isolate Ukiwa histone variant H3.5 (H3F3C) pseudogene,
H3F3C-a allele, complete sequence
Length=1438
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 237 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 284
>ref|XM_001096496.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC708054, transcript
variant 1 (LOC708054), mRNA
Length=3410
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 CGATTGCGGCTGTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 139
>ref|XM_001100109.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
2 (LOC704104), mRNA
Length=2750
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 54 CGATTGCGGCTGTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 101
>gb|AC197396.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-337K2 from chromosome 16, complete
sequence
Length=193060
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56373 CGATTGCGGCTGTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 56420
>dbj|AB168238.1| Macaca fascicularis testis cDNA clone: QtsA-10666, similar to
human H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA, RefSeq:
NM_005324.3
Length=953
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 52 CGATTGCGGCTGTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 99
>gb|AC023050.36| Homo sapiens 12 BAC RP11-428G5 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=186864
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 18458 CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGCGGAGGTCGGAGA 18411
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
17 17 73774751 73774937 53M86N47M GCACACAGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGGTTTGA
17 17 73774754 73774940 50M86N50M CACAGGTTGGTATCTTCGAACAAACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAAT
17 17 73774757 73774943 47M86N53M AGGTTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCT
17 17 73774760 73774946 44M86N56M TTGGTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCG
17 17 73774763 73774949 41M86N59M GTATCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGA
17 17 73774766 73774952 38M86N62M TCTTCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCT
17 17 73774769 73774869 100M TCGAACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTCCTGTTGAGGACGAGAGCCGCACTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCC
17 17 73774772 73774958 32M86N68M AACAGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCA
17 17 73774775 73774961 29M86N71M AGACCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCA
17 17 73774778 73774964 26M86N74M CCCACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACC
17 17 73774781 73774967 23M86N77M ACCAGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCATGAGCGATCTCCCTCACCAACCTCT
17 17 73774784 73774970 20M86N80M AGGTACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGA
17 17 73774787 73774973 17M86N83M TACGCTTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGG
17 17 73774790 73774976 14M86N86M GCCTCGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCA
17 17 73774793 73774979 11M86N89M ACGCTAGCCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCT
17 17 73774796 73774896 100M CTAGCCTCCTGTTGAGGACGAGAGCCGCACTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAG
17 17 73774799 73774899 100M GCCTCCTGTTGAGGACGAGAGCCGCACTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGC
17 17 73774802 73774999 2M97N98M GC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTC
17 17 73774805 73774905 100M TGTTGAGGACGAGAGCCGCACTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGAT
17 17 73774808 73774908 100M TGAGGACGAGACCCGCACTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGAGCACCGATGGC
17 17 73774811 73774911 100M GGACGAGAGCCGCACTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGC
17 17 73774814 73774914 100M CGAGAGCCGCACTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCT
17 17 73774819 73774919 100M GCCGCACTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCAATGGCTGCGCTCTGAA
17 17 73774822 73774922 100M GCACTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACC
17 17 73774825 73774925 100M CTATTAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTATCTTACCTGCAGCGCGCCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCA
17 17 73774829 73774929 100M TAATCCCACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTC
17 17 73774832 73774932 100M TCCCTCTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGTCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGT
17 17 73774835 73774935 100M CACTCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTT
17 17 73774838 73774938 100M TCGGGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAA
17 17 73774841 73774941 100M GGGAGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATC
17 17 73774844 73774944 100M AGCGGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTG
17 17 73774847 73774947 100M GGAAACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGC
17 17 73774850 73774950 100M AACCGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGCTTTGAAATCCTGCGCGAT
17 17 73774853 73774953 100M CGCCCAGCCCTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTC
17 17 73774857 73774957 100M CAGCCCTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTC
17 17 73774860 73774960 100M CCCTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACC
17 17 73774863 73774963 100M TCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAAC
17 17 73774866 73774966 100M CCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTC
17 17 73774869 73774969 100M GGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGGCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCACTCACCAACCTCTGG
17 17 73774872 73774972 100M TCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAG
17 17 73774875 73774975 100M AAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAGCCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGC
17 17 73774878 73774978 100M CCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGC
17 17 73774882 73774982 100M TGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCC
17 17 73774885 73774985 100M CTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGA
17 17 73774888 73774988 100M TCCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGA
17 17 73774891 73774991 100M TGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCA
17 17 73774894 73774994 100M AGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCT
17 17 73774897 73774997 100M GCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG
17 17 73774900 73775000 100M CCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCG
17 17 73774903 73775003 100M ATGGCTGCGCACTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCCACT
17 17 73774907 73775799 89M73775811F11m CTGCGCTTTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGG
17 17 73774909 73775797 87M73775811F13m GCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCT
17 17 73774909 73775797 87M73775811F13m GCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCT
17 17 73774909 73775797 87M73775811F13m GCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCT
17 17 73774910 73775796 86M73775811F14m CGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTC
17 17 73774910 73775796 86M73775811F14m CGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTC
17 17 73774912 73775794 84M73775811F16m CTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTT
17 17 73774912 73775794 84M73775811F16m CTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCTCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTT
17 17 73774916 73775790 80M73775811F20m GAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGCTCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTC
17 17 73774916 73775790 80M73775811F20m GAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTC
17 17 73774916 73775790 80M73775811F20m GAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTC
17 17 73774916 73775790 80M73775811F20m GAAACCCCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTC
17 17 73774917 73775789 79M73775811F21m AAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTCG
17 17 73774932 73775774 64M73775811F36m TTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGC
17 17 73774932 73775774 64M73775811F36m TTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGC
17 17 73774934 73775772 62M73775811F38m TGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC
17 17 73774937 73775769 59M73775811F41m AACCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGC
17 17 73774938 73775768 58M73775811F42m ATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCG
17 17 73774958 73775748 38M73775811F62m CCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAA
17 17 73774965 73775741 31M73775811F69m CTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGC
17 17 73774965 73775741 31M73775811F69m CTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGC
17 17 73774965 73775741 31M73775811F69m CTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTTCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGGCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGC
17 17 73774968 73775738 28M73775811F72m GAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTT
17 17 73774992 73775242 4M73775811F74m472n22m CTCG GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775818 73775246 18m472n82m TTTCGCTCGTCGACTGCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775815 73775243 21m472n79m CGCTCGTCGACTGCGGCTCTT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775811 73775239 25m472n75m CCTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775808 73775236 28m472n72m CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775805 73775233 31m472n69m CTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775802 73775230 34m472n66m CGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775797 73775225 39m472n61m CTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGAGGCGGTCGGAGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775794 73775222 42m472n58m CCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775791 73775219 45m472n55m CGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775788 73775216 48m472n52m GCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775785 73775213 51m472n49m GCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGGGT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775782 73775210 54m472n46m GAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGGGTGAAAGA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775779 73775207 57m472n43m GCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775776 73775204 60m472n40m GCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTTGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGGCCCGAA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775773 73775201 63m472n37m CGGCGGTCGGAGAAGTGGGCTAAAAGTTCGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGGCCCGAACCAAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775770 73775198 66m472n34m CGGTCGGAGAAGTCGCCTAAAACTTCGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGGCCCGAACCAAGCAGACTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775767 73775195 69m472n31m TCGGAGAAGTGGCCTAAAACTGCGGCGATGGGTGAAAGAAAATGGCCCGAACCAAGCAGACTGCTCGTA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775764 73775192 72m472n28m GAGAAGTGGCATAAAGCTTCGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGGCCCGAACCAAGCAGACTGCTCGTAAGTCCA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775761 73775189 75m472n25m AAGTGGCCTAAAACTTCGGGGTTGGGTGAAAGAAAATGGCCCGACCCAAGCAGACTGCTCGTAAGTCCACCGGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775758 73775185 27m1d51m472n22m TGGCCTAAAACTTCGGCGTTGGGTGAADAGAAAATGGCCCGAACCAAGCAGACTGCTCGTAAGTCCACCGGTGGAAAGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775755 73775182 19m1d62m472n19m CCTAAAACTTCGGCGTTGGDGTGAAAGAAAATGGCCCGAACCAAGCAGACTGCTCGTAAGTCCACCGGTGGGAAAGCCCCCT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775752 73775180 84m472n16m AAAACTTCGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGGCCCGAACCAAGCAGACTGCTCGTAAGTCCACCGGGGGGAAAGCCCCCCGCAAAC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775749 73775176 47m1d40m472n13m ACTTCGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGGCCCGAACCAAGCAGACTGCTDCGTAAGCCACCGGTGGGAAAGCCCCCCGCAAACAGCTGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775746 73775174 90m472n10m TCGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGGCCCGAACCAAGCAGACTGCTCGTATGTCCACCGGTGGGAAAGCCCCCCGCAAACAGCTGGCCACGA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775743 73775171 93m472n7m GCGTTGGGCGAAAGAAAATGGCCCGAACCAAGCAGACTGCTCGTAAGTCCACCGGTGGGAAAGCCCCCCGCAAACAGCTGGCCACGAAAGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775740 73775640 100m TTGGGTAGGCGTTCGTAGGTTTACCCGCGGCTTCAGGTTCTGCCAACCGTTGGCGCCGCGCGCCGCGGCCGTTGGGAGCCGAGCGGCGGGGGCTGCTCGG
17 17 73775737 73775637 100m GGTAGGCGTTCGTAGGTTTACCCGCGGCTTCAGGTTCTGCCAACCGTTGGCGCCGCGCGCCGCGGCCGTTGGGAGCCGAGCGGCGGGGGCTGCTCGGGCC
17 17 73775734 73775634 100m AGGCGTTCGTAGGTTTCCCCGCGGCTTCAGGTTCTGCCAACCGTTGGCGCCGCGCGCCGCGGCCGTTGGGAGCCGAGCGGCGGGGGCTGCTCGGGCCGCT
17 17 73775731 73775631 100m CTTTCGTAGGTTTACCCGCGGCTTCAGGTTCTGCCAACCGTTGCCGCCGCGCGCCGCGGCCGTTGGGAGCCGAGCGGCGGGGGCTGCTCGGGCCGCTGGC
17 17 73775728 73775628 100m TCGTAGGTTTCCCCGCGGCTTCAGGTTCTGCCAACCGTTGGCGCCGCGCGCCGCGGCCGTTGGGAGCCGAGCGGCGGGGGCTGCTCGGGCCGCTGGCGTC
17 17 73775725 73775625 100m TAGTTTTGCCCGCGGCTTCAGGTTCTGCCAACCGTTGGCGCCGCGCGCCGCGGCCGTTGGGAGCCGAGCGGCGGGGGCTGCTCGGGCCGCTGGCGTCGGG
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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gb|DS486076.1| Homo sapiens SCAF_1103279188168 genomic scaffold, whole genome
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Sbjct 1705865 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 1705914
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 69201357 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 69201308
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Sbjct 70365888 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 70365839
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG
>ref|XM_003954377.2| PREDICTED: Pan troglodytes H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
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gene, encodes complete protein
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gene, encodes complete protein
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 382 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 333
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 381 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 332
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Sbjct 199 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 150
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(H3F3B), mRNA
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Sbjct 512 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 463
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H3-like (LOC440093) gene, encodes complete protein
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Sbjct 272 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 223
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 297 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 248
>gb|HQ873956.1| Pan paniscus isolate Lusambo histone variant H3.5 (H3F3C) pseudogene,
complete sequence
Length=411
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 225 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 176
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gene, H3F3C-b allele, complete cds
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 225 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 176
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pseudogene, H3F3C-a allele, complete sequence
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 225 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 176
>dbj|AB463740.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8141, Homo sapiens H33 gene
for Histone H3.3, without stop codon, in Flexi system
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 234 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 185
>dbj|AK304607.1| Homo sapiens cDNA FLJ52843 complete cds, highly similar to Histone
H3.3
Length=1582
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 358 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 309
>ref|NM_001013699.2| Homo sapiens H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1071
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 297 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 248
>gb|EU446957.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100069932; IMAGE:100012166;
FLH257123.01L H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B)
gene, encodes complete protein
Length=451
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 247 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 198
>dbj|AK312762.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93172, highly similar to Homo sapiens H3
histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=545
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 359 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 310
>emb|AM393192.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002304 for hypothetical
protein (H3F3B gene)
Length=450
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 245 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 196
>gb|BC013020.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3349652, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2338
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 1671 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 1622
>gb|BC006497.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2160 IMAGE:2959756), complete cds
gb|BC012813.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:4123 IMAGE:2959756), complete cds
Length=1119
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 342 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 293
>gb|BC017558.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:9614 IMAGE:3910031), complete cds
Length=1119
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 346 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 297
>gb|BC001124.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2161 IMAGE:2988279), complete cds
Length=896
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 342 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 293
>ref|NM_005324.3| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=2753
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 358 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 309
>gb|AC087289.9| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-552F3, complete sequence
Length=203765
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 174520 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 174471
>gb|BC066906.1| Homo sapiens histone H3-like, mRNA (cDNA clone MGC:87082 IMAGE:5267388),
complete cds
Length=1070
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 297 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 248
>gb|BC020466.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
IMAGE:3870030)
Length=601
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Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 50 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 1
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
Length=1696
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 309
>emb|BX537379.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2282 (from clone DKFZp686C2282);
complete cds
Length=2878
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 310
>gb|AC023050.36| Homo sapiens 12 BAC RP11-428G5 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=186864
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 18155 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 18204
>gb|AF218029.1|AF218029 Homo sapiens clone PP781 unknown mRNA
Length=1693
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 289
>emb|Z48950.1| H.sapiens hH3.3B gene for histone H3.3
Length=3276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 1588
>gb|BC108701.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:131844 IMAGE:6144255), complete cds
Length=1098
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 321 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 272
>emb|BX647280.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0399 (from clone DKFZp686O0399)
Length=1723
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 308
>ref|XM_010387576.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana H3 histone, family 3B (H3.3B)
(H3F3B), mRNA
Length=1854
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 GATCTCCCTCACCAACCTTTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 466
>ref|XM_003913444.2| PREDICTED: Papio anubis H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
mRNA
Length=3176
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 836 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCGG 787
>ref|XM_008965834.1| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
transcript variant X2, mRNA
Length=2618
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 GATCTCCCTCACCAATCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 226
>ref|XM_003813276.2| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
transcript variant X1, mRNA
Length=2852
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509 GATCTCCCTCACCAATCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 460
>gb|KJ913372.1| Macaca mulatta isolate Rh23108 clone 4634 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
Length=12507
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1176 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCGG 1225
>ref|XM_008019176.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus histone H3.3-like (LOC103247139),
mRNA
Length=1000
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 334 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCGG 285
>ref|XM_008011728.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus H3 histone, family 3B (H3.3B)
(H3F3B), mRNA
Length=1717
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 369 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCGG 320
>gb|KJ457091.1| Macaca mulatta isolate Rh23717 clone 3190 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
Length=35269
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 23616 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCGG 23665
>gb|KJ456959.1| Macaca mulatta isolate Rh23108 clone 2985 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
Length=36105
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 9975 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCGG 10024
>ref|XM_005584981.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926276 (LOC101926276),
mRNA
Length=1139
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 372 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCGG 323
>ref|XM_005553676.1| PREDICTED: Macaca fascicularis histone H3.3-like (LOC102118214),
mRNA
Length=882
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 350 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCGG 301
>ref|XM_003279090.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys H3 histone, family 3B (H3.3B),
transcript variant 3 (H3F3B), mRNA
Length=1108
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 GATCTCCCTCACCAATCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 786
>ref|NM_001280448.1| Pan troglodytes H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
dbj|AK306632.1| Pan troglodytes mRNA for histone H3.3, complete cds, clone: PtsC-54-5_E11
Length=1699
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 GATCTCCCTCACCAATCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 309
>gb|HQ873953.1| Gorilla gorilla isolate Ukiwa histone variant H3.5 (H3F3C) pseudogene,
H3F3C-a allele, complete sequence
Length=1438
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 543 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGACGAGCAGCTCGG 494
>ref|XR_014302.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC719872), miscRNA
Length=1145
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 357 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCGG 308
>ref|XM_002803979.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC100430466), mRNA
Length=1149
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 357 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCGG 308
>ref|XM_002803657.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC711912), mRNA
Length=1076
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 326 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCGG 277
>ref|XM_001104973.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
3 (LOC711912), mRNA
Length=1163
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 365 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCGG 316
>ref|XM_001096496.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC708054, transcript
variant 1 (LOC708054), mRNA
Length=3410
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 949 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCGG 900
>ref|XM_001099829.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
1 (LOC704104), mRNA
Length=2721
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
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Sbjct 346 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCGG 297
>ref|XM_001100109.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
2 (LOC704104), mRNA
Length=2750
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 375 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCGG 326
>ref|XM_002800601.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC704104), mRNA
Length=2672
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 297 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCGG 248
>ref|XM_002800600.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC704104), mRNA
Length=2729
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 354 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCGG 305
>ref|XM_001097773.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC709263), mRNA
Length=1003
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCT 47
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Sbjct 444 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCT 398
>gb|AC197396.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-337K2 from chromosome 16, complete
sequence
Length=193060
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 57230 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGAATGAGCAGCTCGG 57181
>dbj|AB128049.1| Macaca mulatta genes, MHC class I region, partial and complete
cds
Length=3284914
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2500726 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCTCGG 2500677
>ref|XM_003780001.2| PREDICTED: Pongo abelii histone H3.3-like (LOC100435774), mRNA
Length=642
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 280 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCGCGG 231
>ref|XM_002823088.3| PREDICTED: Pongo abelii H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1126
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 367 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGAGGAGCAGCGCGG 318
>ref|XM_003131194.2| PREDICTED: Sus scrofa histone H3.3-like (LOC100521680), mRNA
Length=1726
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 48
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Sbjct 384 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 337
>dbj|AK399768.1| Sus scrofa mRNA, clone: BMWN10073F03, expressed in bone marrow
Length=1744
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 948 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 901
>dbj|AK399371.1| Sus scrofa mRNA, clone: THY010068B03, expressed in thymus
Length=1162
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 372 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 325
>dbj|AK395637.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVRT10040F05, expressed in ovary
Length=1401
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 48
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Sbjct 608 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 561
>dbj|AK348527.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10192H01, expressed in ovary
Length=1552
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 791 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 744
>emb|CU928968.5| Pig DNA sequence from clone CH242-19M24 on chromosome 12, complete
sequence
Length=119643
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 48
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Sbjct 29080 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 29033
>dbj|AK234113.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010008D04, expressed in ovary
Length=1717
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 48
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Sbjct 357 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 310
>dbj|AK239851.1| Sus scrofa mRNA, clone:UTR010004D12, expressed in uterus
Length=1024
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 48
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Sbjct 357 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 310
>dbj|AK231974.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010059C08, expressed in lung
Length=2212
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 357 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 310
>dbj|AK235071.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10046F12, expressed in ovary
Length=2768
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 357 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 310
>dbj|AK231121.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010097F05, expressed in alveolar macrophage
Length=921
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 358 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATCAGAAGCTC 311
>ref|XM_006869571.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica histone H3.3-like (LOC102835853),
mRNA
Length=983
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 226 GATCTCCCGCACCAGCCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAACTCGG 177
>gb|DQ284188.1| Bufo asper histone H3a gene, partial cds
Length=328
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 50
|||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 GATCTCCCTCACCAGGCGCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG 153
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG
>ref|NM_005324.3| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=2753
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 72
>gb|AC087289.9| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-552F3, complete sequence
Length=203765
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173630 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 173679
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
Length=1696
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 72
>emb|BX537379.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2282 (from clone DKFZp686C2282);
complete cds
Length=2878
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 73
>gb|AF218029.1|AF218029 Homo sapiens clone PP781 unknown mRNA
Length=1693
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 TCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG 52
>emb|Z48950.1| H.sapiens hH3.3B gene for histone H3.3
Length=3276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
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17 17 73775791 73775219 55m472n45m CGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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shotgun sequence
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705842 GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 1705891
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69201380 GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 69201331
>gb|CM000268.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=77819263
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70365911 GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 70365862
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG
>ref|XM_001096496.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC708054, transcript
variant 1 (LOC708054), mRNA
Length=3410
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG 50
|||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 783 CCCGCCCGGCCTACCTGTAACGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG 734
>gb|AC197396.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-337K2 from chromosome 16, complete
sequence
Length=193060
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG 50
|||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 57064 CCCGCCCGGCCTACCTGTAACGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG 57015
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC
>ref|NM_005324.3| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=2753
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 49
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
Length=1696
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 49
>emb|BX537379.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2282 (from clone DKFZp686C2282);
complete cds
Length=2878
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 GAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
>emb|BX647280.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0399 (from clone DKFZp686O0399)
Length=1723
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 AGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 48
>dbj|AK312762.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93172, highly similar to Homo sapiens H3
histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=545
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GAGCGCAG-AGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGCGCAGTAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
>ref|NM_001280448.1| Pan troglodytes H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
dbj|AK306632.1| Pan troglodytes mRNA for histone H3.3, complete cds, clone: PtsC-54-5_E11
Length=1699
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 1 GAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCAGTGCGGGTTTTTCGCTC 49
>ref|XM_003813276.2| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
transcript variant X1, mRNA
Length=2852
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 151 GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGTAGTGCGGGTTTTTCGCTC 200
>gb|BC013020.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3349652, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2338
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 AGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 AGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTC 1362
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
17 17 73774832 73774932 100M CTCCCCCGTCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGT
17 17 73774835 73774935 100M CTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTT
17 17 73774838 73774938 100M CTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAA
17 17 73774841 73774941 100M CTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATC
17 17 73774844 73774944 100M CTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTG
17 17 73774847 73774947 100M CTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGC
17 17 73774850 73774950 100M CTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGCTTTGAAATCCTGCGCGAT
17 17 73774853 73774953 100M CTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTC
17 17 73774857 73774957 100M CTCCCCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTC
17 17 73774860 73774960 100M CTCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACC
17 17 73774863 73774963 100M TCCCCCGGCTCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAAC
17 17 73774866 73774966 100M CCCGGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTC
17 17 73774869 73774969 100M GGCTCCAGGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGGCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCACTCACCAACCTCTGG
17 17 73774872 73774972 100M TCCAAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAG
17 17 73774875 73774975 100M AAGCCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAGCCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGC
17 17 73774878 73774978 100M CCTTTGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGC
17 17 73774882 73774982 100M TGTCTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCC
17 17 73774885 73774985 100M CTTACCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGA
17 17 73774888 73774988 100M TCCTGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGA
17 17 73774891 73774991 100M TGCAGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCA
17 17 73774894 73774994 100M AGCGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCT
17 17 73774897 73774997 100M GCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG
17 17 73774900 73775000 100M CCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCG
17 17 73774903 73775003 100M ATGGCTGCGCACTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCCACT
17 17 73774906 73775006 100M GCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCT
17 17 73774909 73775009 100M GCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGAT
17 17 73774912 73775012 100M CTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAAC
17 17 73774915 73775015 100M TGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGAC
17 17 73774918 73775018 100M AACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAA
17 17 73774921 73775021 100M CTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCT
17 17 73774924 73775024 100M TGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTC
17 17 73774927 73775027 100M TCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAA
17 17 73774930 73775030 100M GTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCG
17 17 73774933 73775033 100M TTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCA
17 17 73774936 73775036 100M AAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGG
17 17 73774939 73775039 100M TCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGGCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCCCGGTCC
17 17 73774942 73775042 100M TGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGG
17 17 73774945 73775128 99M83N1M GCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
17 17 73774948 73775131 96M83N4M ATCTCCCTCACCAACCTCTGGAGGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGT
17 17 73774951 73775134 93M83N7M TCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGC
17 17 73774954 73775137 90M83N10M CTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGAG
17 17 73774957 73775057 100M ACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAATCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAG
17 17 73774960 73775143 84M83N16M AACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGGCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CGGTAGCGATGAGGCT
17 17 73774963 73775146 81M83N19M CTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGAACCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCT
17 17 73774966 73775149 78M83N22M TGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCC
17 17 73774969 73775152 75M83N25M AAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCC
17 17 73774972 73775155 72M83N28M GGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGC
17 17 73774975 73775158 69M83N31M AGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGG
17 17 73774978 73775161 66M83N34M TTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCTGTAG
17 17 73774981 73775164 63M83N37M CGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGG
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GAG
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGGCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGTG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGCG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGACGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGA
17 17 73774983 73775857 61M83N36M73775861F3m GATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGA
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17 17 73774987 73775853 57M83N36M73775861F7m AGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGC
17 17 73774987 73775853 57M83N36M73775861F7m AGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGC
17 17 73774987 73775853 57M83N36M73775861F7m AGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGC
17 17 73774987 73775853 57M83N36M73775861F7m AGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGC
17 17 73774987 73775853 57M83N36M73775861F7m AGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGAAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGC
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17 17 73774987 73775853 57M83N36M73775861F7m AGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGC
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17 17 73774987 73775853 57M83N36M73775861F7m AGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGC
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17 17 73774988 73775852 56M83N36M73775861F8m GCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCT
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17 17 73774990 73775850 54M83N36M73775861F10m AGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGCCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGA
17 17 73774991 73775849 53M83N36M73775861F11m GCTCGGTCGACTTCTAATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAG
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17 17 73774993 73775847 51M83N36M73775861F13m TCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCG
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17 17 73774995 73775845 49M83N36M73775861F15m GGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGT
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17 17 73774996 73775844 48M83N36M73775861F16m GTCGACTTCTGATAACGACGAATCCCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTCCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTT
17 17 73774998 73775842 46M83N36M73775861F18m AGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTG
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17 17 73775000 73775840 44M83N36M73775861F20m ACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGT
17 17 73775000 73775840 44M83N36M73775861F20m ACTTCTGATAACGACGAATCCCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGT
17 17 73775000 73775840 44M83N36M73775861F20m ACTTCTGATAACGACGAATCCCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGT
17 17 73775004 73775104 100M CTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGC
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17 17 73775005 73775835 39M83N36M73775861F25m TGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCGGGCC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTC
17 17 73775005 73775835 39M83N36M73775861F25m TGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGCCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTC
17 17 73775007 73775833 37M83N36M73775861F27m ATACCGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGT
17 17 73775010 73775110 100M ACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGT
17 17 73775011 73775829 33M83N36M73775861F31m CGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGG
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17 17 73775014 73775826 30M83N36M73775861F34m CGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCGGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGG
17 17 73775016 73775824 28M83N36M73775861F36m AATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTG
17 17 73775018 73775822 26M83N36M73775861F38m TCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCT
17 17 73775021 73775121 100M CTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAGTGGAGGAGTGAGCGGACGCCGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCG
17 17 73775021 73775819 23M83N36M73775861F41m CTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGCTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGT
17 17 73775024 73775124 100M GAAGCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACC
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17 17 73775028 73775812 16M83N36M73775861F48m CGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGC
17 17 73775031 73775131 100M CACGGTCCCGGGCGTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGACCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGT
17 17 73775034 73775806 10M83N36M73775861F54m GGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCG
17 17 73775037 73775137 100M CCCGGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGAT
17 17 73775040 73775140 100M GGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTGCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAG
17 17 73775043 73775143 100M CCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCT
17 17 73775043 73775797 1M83N36M73775861F63m C|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGTAGCGATGGGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT
17 17 73775046 73775146 100M GCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCACCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCT
17 17 73775049 73775149 100M GCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCA
17 17 73775052 73775152 100M AGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCC
17 17 73775055 73775155 100M AGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGC
17 17 73775059 73775159 100M GAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGT
17 17 73775063 73775163 100M AGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG
17 17 73775066 73775166 100M GAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGA
17 17 73775070 73775170 100M GGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGC
17 17 73775126 73775797 37M73775861F63m CTTGTAGCGATGGGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT
17 17 73775140 73775783 23M73775861F77m GCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGC
17 17 73775147 73775776 16M73775861F84m CACCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCG
17 17 73775148 73775775 15M73775861F85m CCCCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGG
17 17 73775150 73775773 13M73775861F87m CCCGCCGGTAGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCG
17 17 73775159 73775764 4M73775861F96m AGAG GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCG
17 17 73775868 73775768 100m GGGGGCTTGGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCC
17 17 73775865 73775765 100m GGCTTGGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTC
17 17 73775860 73775760 100m GGAGCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCATCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGATA
17 17 73775857 73775757 100m GCGCAGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGT
17 17 73775854 73775754 100m ATGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGC
17 17 73775851 73775751 100m AGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAATCGCCTA
17 17 73775848 73775748 100m GGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAA
17 17 73775845 73775745 100m TTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTT
17 17 73775842 73775235 99m507n1m GTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGGCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775839 73775232 96m507n4m GTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTTGCCTAAAACTTCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775836 73775736 100m CGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGGAGTGGCCTAAAACTTCGGCGATGG
17 17 73775833 73775733 100m TGGGCGGTGCTGGTTTTTGGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGGGTG
17 17 73775830 73775730 100m GCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGACTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGGGTAGGC
17 17 73775827 73775255 91m472n9m GTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAAATTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775824 73775251 3m1d84m472n13m CTGDTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775821 73775249 85m472n15m GTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775818 73775246 18m472n82m TTTCGCTCGTCGACTGCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775815 73775243 21m472n79m CGCTCGTCGACTGCGGCTCTT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775811 73775239 25m472n75m CCTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775808 73775236 28m472n72m CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775805 73775233 31m472n69m CTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 73775797 73775225 39m472n61m CTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGAGGCGGTCGGAGAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775794 73775222 42m472n58m CCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 73775788 73775216 48m472n52m GCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 73775779 73775207 57m472n43m GCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775776 73775204 60m472n40m GCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTTGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGGCCCGAA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775773 73775201 63m472n37m CGGCGGTCGGAGAAGTGGGCTAAAAGTTCGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGGCCCGAACCAAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 73775749 73775176 47m1d40m472n13m ACTTCGGCGTTGGGTGAAAGAAAATGGCCCGAACCAAGCAGACTGCTDCGTAAGCCACCGGTGGGAAAGCCCCCCGCAAACAGCTGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 73775740 73775640 100m TTGGGTAGGCGTTCGTAGGTTTACCCGCGGCTTCAGGTTCTGCCAACCGTTGGCGCCGCGCGCCGCGGCCGTTGGGAGCCGAGCGGCGGGGGCTGCTCGG
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genome shotgun sequence
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Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 73269638 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 73269589
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sequence
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 10871274 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 10871225
>ref|NW_001838454.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188168, whole genome shotgun sequence
gb|DS486076.1| Homo sapiens SCAF_1103279188168 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 1705880 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 1705929
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shotgun sequence
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Sbjct 69201342 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 69201293
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Sbjct 70365873 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 70365824
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Sbjct 31792261 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 31792213
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HSCHR12_CTG2
gb|GL000106.2| Homo sapiens chromosome 12 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Sbjct 24707611 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 24707563
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genome shotgun sequence
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Sbjct 31911135 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 31911087
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 24672284 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 24672236
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shotgun sequence
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Sbjct 2922953 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 2923001
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Sbjct 31697797 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 31697749
>gb|DS990825.1| Homo sapiens SCAF_1112675837143 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 2944980 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 2945028
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Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 33103046 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 33102998
>gb|CH003459.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=131157419
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 10241941 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 10241893
>gb|CH471116.2| Homo sapiens 211000035838052 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=12881912
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Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 9971599 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 9971551
>ref|NW_001838055.2| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188198, whole genome shotgun sequence
gb|DS486187.1| Homo sapiens SCAF_1103279188198 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 2944889 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 2944937
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000473.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=130617856
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Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 31697849 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 31697801
>gb|CM000263.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=133516800
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Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 11768017 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 11767969
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT
>ref|XM_008965834.1| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
transcript variant X2, mRNA
Length=2618
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 109
>ref|XM_003813276.2| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
transcript variant X1, mRNA
Length=2852
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 392 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 343
>gb|KJ891325.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00719 H3F3B
gene, encodes complete protein
Length=540
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 124
>ref|XM_003279090.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys H3 histone, family 3B (H3.3B),
transcript variant 3 (H3F3B), mRNA
Length=1108
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 669
>ref|XM_004041019.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla H3 histone, family 3B (H3.3B)
(H3F3B), mRNA
Length=2848
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 395 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 346
>ref|NM_001280448.1| Pan troglodytes H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
dbj|AK306632.1| Pan troglodytes mRNA for histone H3.3, complete cds, clone: PtsC-54-5_E11
Length=1699
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 192
>dbj|AB463740.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8141, Homo sapiens H33 gene
for Histone H3.3, without stop codon, in Flexi system
Length=425
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 68
>dbj|AK304607.1| Homo sapiens cDNA FLJ52843 complete cds, highly similar to Histone
H3.3
Length=1582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 241 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 192
>gb|EU446957.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100069932; IMAGE:100012166;
FLH257123.01L H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B)
gene, encodes complete protein
Length=451
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 130 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 81
>dbj|AK312762.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93172, highly similar to Homo sapiens H3
histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=545
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 242 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 193
>emb|AM393192.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002304 for hypothetical
protein (H3F3B gene)
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 128 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 79
>gb|BC013020.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3349652, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2338
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 1554 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 1505
>gb|BC006497.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2160 IMAGE:2959756), complete cds
gb|BC012813.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:4123 IMAGE:2959756), complete cds
Length=1119
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 225 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 176
>gb|BC017558.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:9614 IMAGE:3910031), complete cds
Length=1119
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 180
>gb|BC001124.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2161 IMAGE:2988279), complete cds
Length=896
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 225 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 176
>ref|NM_005324.3| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=2753
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 192
>gb|AC087289.9| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-552F3, complete sequence
Length=203765
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174320 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 174271
>ref|NM_001133832.1| Pongo abelii H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
emb|CR858345.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A2130 (from clone DKFZp459A2130)
Length=2733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 191
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
Length=1696
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 192
>emb|BX537379.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2282 (from clone DKFZp686C2282);
complete cds
Length=2878
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 193
>gb|AF218029.1|AF218029 Homo sapiens clone PP781 unknown mRNA
Length=1693
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 172
>emb|Z48950.1| H.sapiens hH3.3B gene for histone H3.3
Length=3276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 1388
>gb|BC108701.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:131844 IMAGE:6144255), complete cds
Length=1098
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 204 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 155
>emb|BX647280.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0399 (from clone DKFZp686O0399)
Length=1723
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 191
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3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
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Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 398 CACCCCGCCGGTAGAGGGGGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 349
>ref|XM_010387576.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana H3 histone, family 3B (H3.3B)
(H3F3B), mRNA
Length=1854
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 398 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 349
>gb|KJ913372.1| Macaca mulatta isolate Rh23108 clone 4634 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
Length=12507
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 1293 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 1342
>ref|XM_008011728.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus H3 histone, family 3B (H3.3B)
(H3F3B), mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 252 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 203
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(LOC103017106), mRNA
Length=1876
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCCGCTTTCGTGGCCAGCT 191
>gb|KJ457091.1| Macaca mulatta isolate Rh23717 clone 3190 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
Length=35269
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 23733 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 23782
>gb|KJ456959.1| Macaca mulatta isolate Rh23108 clone 2985 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
Length=36105
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 10092 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 10141
>ref|XM_005584981.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926276 (LOC101926276),
mRNA
Length=1139
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 255 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 206
>ref|XM_005553676.1| PREDICTED: Macaca fascicularis histone H3.3-like (LOC102118214),
mRNA
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 233 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 184
>ref|XR_014302.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC719872), miscRNA
Length=1145
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 191
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Length=1149
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 191
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 209 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 160
>ref|XM_001104973.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
3 (LOC711912), mRNA
Length=1163
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 248 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 199
>ref|XM_001096496.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC708054, transcript
variant 1 (LOC708054), mRNA
Length=3410
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 749 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 700
>ref|XM_001099829.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
1 (LOC704104), mRNA
Length=2721
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 229 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 180
>ref|XM_001100109.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
2 (LOC704104), mRNA
Length=2750
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 258 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 209
>ref|XM_002800601.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC704104), mRNA
Length=2672
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 180 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 131
>ref|XM_002800600.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC704104), mRNA
Length=2729
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 237 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 188
>gb|AC197396.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-337K2 from chromosome 16, complete
sequence
Length=193060
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 57030 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 56981
>dbj|AB128049.1| Macaca mulatta genes, MHC class I region, partial and complete
cds
Length=3284914
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 2500609 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 2500560
>ref|XM_002823088.3| PREDICTED: Pongo abelii H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1126
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 250 CACCCCGCCGGTAGAGGGGGTGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 201
>ref|XM_003913444.2| PREDICTED: Papio anubis H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
mRNA
Length=3176
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 719 CACCCCGCCAGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 670
>ref|XM_002748743.3| PREDICTED: Callithrix jacchus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
mRNA
Length=1872
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 393 CACCCCGCCAGTAGAGGGGGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 344
>ref|XM_007454336.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer histone H3.3-like (LOC103076444),
transcript variant X2, mRNA
Length=871
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 112 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCCGCTTTAGTGGCCAGCT 63
>ref|XM_007454335.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer histone H3.3-like (LOC103076444),
transcript variant X1, mRNA
Length=1120
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 239 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCCGCTTTAGTGGCCAGCT 190
>ref|XM_003131194.2| PREDICTED: Sus scrofa histone H3.3-like (LOC100521680), mRNA
Length=1726
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 267 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 218
>ref|XM_005407480.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera histone H3.3-like (LOC102012783),
transcript variant X1, mRNA
Length=1134
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 251 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 202
>ref|XM_005388840.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera histone H3.3-like (LOC102022008),
mRNA
Length=1019
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 217 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 168
>ref|XM_004999610.1| PREDICTED: Cavia porcellus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3f3b),
transcript variant X3, mRNA
Length=669
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 223 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 174
>ref|XM_003461422.2| PREDICTED: Cavia porcellus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3f3b),
transcript variant X1, mRNA
Length=665
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 223 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 174
>ref|XM_004999609.1| PREDICTED: Cavia porcellus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3f3b),
transcript variant X2, mRNA
Length=2642
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 218 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 169
>dbj|AK399768.1| Sus scrofa mRNA, clone: BMWN10073F03, expressed in bone marrow
Length=1744
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 711 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 662
>dbj|AK399371.1| Sus scrofa mRNA, clone: THY010068B03, expressed in thymus
Length=1162
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 255 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 206
>dbj|AK395637.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVRT10040F05, expressed in ovary
Length=1401
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 491 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 442
>emb|CU928968.5| Pig DNA sequence from clone CH242-19M24 on chromosome 12, complete
sequence
Length=119643
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 28843 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 28794
>dbj|AK234113.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010008D04, expressed in ovary
Length=1717
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 191
>dbj|AK239851.1| Sus scrofa mRNA, clone:UTR010004D12, expressed in uterus
Length=1024
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 191
>dbj|AK231974.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010059C08, expressed in lung
Length=2212
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 191
>dbj|AK231121.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010097F05, expressed in alveolar macrophage
Length=921
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 241 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 192
>ref|NM_001282367.1| Chinchilla lanigera histone H3.3-like (LOC102012783), mRNA
gb|AY533212.1| Chinchilla lanigera histone H3.3B mRNA, complete cds
Length=727
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 270 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 221
>ref|XM_003780001.2| PREDICTED: Pongo abelii histone H3.3-like (LOC100435774), mRNA
Length=642
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 162 ACCCCGCCGGTAGAGGGGGTGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 114
>ref|XM_006912215.1| PREDICTED: Pteropus alecto histone H3.3-like (LOC102897761),
mRNA
Length=1725
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||
Sbjct 253 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCCTTAGTGGCCAGCT 204
>ref|XM_003786125.1| PREDICTED: Otolemur garnettii histone H3.3-like (LOC100946065),
mRNA
Length=1894
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 390 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTGGTAGCCAGCT 341
>ref|XM_006269242.1| PREDICTED: Alligator mississippiensis histone H3.3-like (LOC102562183),
mRNA
Length=1097
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 44/46 (96%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 CCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 208 CCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTGGTGGCCAGCT 163
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC
>ref|NM_005324.3| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=2753
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 38 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 87
>gb|AC087289.9| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-552F3, complete sequence
Length=203765
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 173645 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 173694
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
Length=1696
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 38 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 87
>emb|BX537379.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2282 (from clone DKFZp686C2282);
complete cds
Length=2878
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 39 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 88
>gb|AF218029.1|AF218029 Homo sapiens clone PP781 unknown mRNA
Length=1693
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 18 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 67
>emb|Z48950.1| H.sapiens hH3.3B gene for histone H3.3
Length=3276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 762 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 811
>gb|BC108701.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:131844 IMAGE:6144255), complete cds
Length=1098
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
>emb|BX647280.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0399 (from clone DKFZp686O0399)
Length=1723
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 37 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 86
>ref|XM_003813276.2| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
transcript variant X1, mRNA
Length=2852
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 189 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCGGCGGAAGCGGCGC 238
>ref|NM_001280448.1| Pan troglodytes H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
dbj|AK306632.1| Pan troglodytes mRNA for histone H3.3, complete cds, clone: PtsC-54-5_E11
Length=1699
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 38 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCGGCGGAAGCGGCGC 87
>ref|NM_001133832.1| Pongo abelii H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
emb|CR858345.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A2130 (from clone DKFZp459A2130)
Length=2733
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 37 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTTCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 86
>ref|XM_002823088.3| PREDICTED: Pongo abelii H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1126
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 48 GGTTTTTCGCTCG-CGACTGAGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 96
>ref|XM_003270553.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys uncharacterized LOC100603449 (LOC100603449),
mRNA
Length=1772
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 48/51 (94%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTC-GTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 94 GGTTCTTCGCTCAGTCGGCTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 144
>ref|XM_003954377.2| PREDICTED: Pan troglodytes H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1082
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
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Sbjct 103 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 151
>gb|HQ873953.1| Gorilla gorilla isolate Ukiwa histone variant H3.5 (H3F3C) pseudogene,
H3F3C-a allele, complete sequence
Length=1438
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 224 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 272
>gb|AC023050.36| Homo sapiens 12 BAC RP11-428G5 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
Length=186864
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC 50
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 18471 GGTTCTTCGCTCG-CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCAGCGC 18423
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
17 17 73774869 73774969 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGGCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCACTCACCAACCTCTGG
17 17 73774872 73774972 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAG
17 17 73774875 73774975 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAGCCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGC
17 17 73774878 73774978 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGC
17 17 73774882 73774982 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCC
17 17 73774885 73774985 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGA
17 17 73774888 73774988 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGA
17 17 73774891 73774991 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCA
17 17 73774894 73774994 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCT
17 17 73774897 73774997 100M GCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG
17 17 73774900 73775000 100M CCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCG
17 17 73774903 73775003 100M ATGGCTGCGCACTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCCACT
17 17 73774906 73775006 100M GCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCT
17 17 73774909 73775009 100M GCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGAT
17 17 73774912 73775012 100M CTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAAC
17 17 73774915 73775015 100M TGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGAC
17 17 73774918 73775018 100M AACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAA
17 17 73774921 73775021 100M CTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCT
17 17 73774924 73775024 100M TGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTC
17 17 73774927 73775027 100M TCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAA
17 17 73774930 73775030 100M GTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCG
17 17 73774933 73775033 100M TTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCA
17 17 73774936 73775036 100M AAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGG
17 17 73774939 73775039 100M TCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGGCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCCCGGTCC
17 17 73774942 73775042 100M TGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGG
17 17 73774945 73775128 99M83N1M GCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
17 17 73774948 73775131 96M83N4M ATCTCCCTCACCAACCTCTGGAGGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGT
17 17 73774951 73775134 93M83N7M TCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGC
17 17 73774954 73775137 90M83N10M CTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGAG
17 17 73774957 73775057 100M ACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAATCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAG
17 17 73774960 73775143 84M83N16M AACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGGCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CGGTAGCGATGAGGCT
17 17 73774963 73775146 81M83N19M CTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGAACCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCT
17 17 73774966 73775149 78M83N22M TGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCC
17 17 73774969 73775152 75M83N25M AAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCC
17 17 73774972 73775155 72M83N28M GGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGC
17 17 73774975 73775158 69M83N31M AGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGG
17 17 73774978 73775161 66M83N34M TTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCTGTAG
17 17 73774981 73775164 63M83N37M CGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGG
17 17 73774984 73775167 60M83N40M ATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAG
17 17 73774987 73775087 100M AGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAA
17 17 73774990 73775173 54M83N46M AGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTT
17 17 73774993 73775176 51M83N49M TCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCC
17 17 73774996 73775179 48M83N52M GTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGG
17 17 73774999 73775182 45M83N55M GACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGG
17 17 73775002 73775185 42M83N58M TTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTT
17 17 73775005 73775188 39M83N61M TGATAACGACGAGTCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCG
17 17 73775008 73775191 36M83N64M TAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGG
17 17 73775011 73775194 33M83N67M CGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCA
17 17 73775014 73775197 30M83N70M CGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT
17 17 73775017 73775200 27M83N73M ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTT
17 17 73775017 73775819 27M83N70M73775823F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGGAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCGAGCT GGT
17 17 73775017 73775819 27M83N70M73775823F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GGT
17 17 73775017 73775819 27M83N70M73775823F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GGT
17 17 73775018 73775818 26M83N70M73775823F4m TCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGGTTTCGGGGCCAGCT GGTT
17 17 73775018 73775818 26M83N70M73775823F4m TCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTACAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GGTT
17 17 73775021 73775204 23M83N77M CTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCG
17 17 73775024 73775124 100M GAAGCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACC
17 17 73775027 73775127 100M GCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTAC
17 17 73775031 73775131 100M CACGGTCCCGGGCGTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGACCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGT
17 17 73775034 73775134 100M GGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGC
17 17 73775037 73775137 100M CCCGGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGAT
17 17 73775040 73775140 100M GGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTGCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAG
17 17 73775043 73775143 100M CCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCT
17 17 73775046 73775146 100M GCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCACCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCT
17 17 73775049 73775149 100M GCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCA
17 17 73775052 73775152 100M AGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCC
17 17 73775055 73775155 100M AGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGC
17 17 73775059 73775159 100M GAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGT
17 17 73775063 73775163 100M AGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG
17 17 73775066 73775166 100M GAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGA
17 17 73775070 73775170 100M GGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGC
17 17 73775074 73775174 100M GCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTT
17 17 73775077 73775177 100M GCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCT
17 17 73775080 73775180 100M GCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGGAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGC
17 17 73775084 73775184 100M AAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCT
17 17 73775087 73775187 100M GCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGATCGCTTTTCCTGGCGGCTTTC
17 17 73775090 73775190 100M GGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCCGGCGGCTTTCATG
17 17 73775093 73775193 100M CACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCC
17 17 73775096 73775196 100M CGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGC
17 17 73775099 73775199 100M CGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGT
17 17 73775102 73775202 100M GCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTG
17 17 73775105 73775205 100M ATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCAGCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGG
17 17 73775129 73775790 68M73775823F32m GTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTC
17 17 73775132 73775787 65M73775823F35m GCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG
17 17 73775136 73775783 61M73775823F39m TGAGGCTTCTTCGCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGC
17 17 73775138 73775781 59M73775823F41m AGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGG
17 17 73775147 73775772 50M73775823F50m CCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGC
17 17 73775148 73775771 49M73775823F51m CCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCG
17 17 73775163 73775756 34M73775823F66m GCAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTG
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGGTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGGGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGGGGTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGACTAAAACTTTGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGGGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGGCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTATTCGTTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACCGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAAATTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCCTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775194 73775253 3M73775823F86m472n11m GCT GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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38 |
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gb|KE150191.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 1706555 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 1706506
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shotgun sequence
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT
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HSCHR17_CTG4
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assembly
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Sbjct 48843787 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 48843738
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genome shotgun sequence
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Sbjct 73840919 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 73840870
>ref|NW_004929407.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150191.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 48515443 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 48515394
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shotgun sequence
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Sbjct 8001265 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 8001216
>gb|GL583040.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_60, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 11976164 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 11976213
>gb|CM000507.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 69201303 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 69201254
>gb|DS990714.1| Homo sapiens SCAF_1112675837113 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
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Sbjct 1705886 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 1705935
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Query 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
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Sbjct 73269663 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 73269614
>gb|CH471099.1| Homo sapiens 211000035838146 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
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Sbjct 10871299 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 10871250
>ref|NW_001838454.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188168, whole genome shotgun sequence
gb|DS486076.1| Homo sapiens SCAF_1103279188168 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
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Sbjct 1705855 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 1705904
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
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Sbjct 69201367 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 69201318
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Sbjct 70365898 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 70365849
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT
>ref|XM_008965834.1| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 158 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 109
>ref|XM_003813276.2| PREDICTED: Pan paniscus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
transcript variant X1, mRNA
Length=2852
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 392 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 343
>gb|KJ891325.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00719 H3F3B
gene, encodes complete protein
Length=540
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 173 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 124
>ref|XM_003279090.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys H3 histone, family 3B (H3.3B),
transcript variant 3 (H3F3B), mRNA
Length=1108
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 718 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 669
>ref|XM_004041019.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla H3 histone, family 3B (H3.3B)
(H3F3B), mRNA
Length=2848
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 395 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 346
>ref|NM_001280448.1| Pan troglodytes H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
dbj|AK306632.1| Pan troglodytes mRNA for histone H3.3, complete cds, clone: PtsC-54-5_E11
Length=1699
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 192
>dbj|AB463740.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8141, Homo sapiens H33 gene
for Histone H3.3, without stop codon, in Flexi system
Length=425
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 117 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 68
>dbj|AK304607.1| Homo sapiens cDNA FLJ52843 complete cds, highly similar to Histone
H3.3
Length=1582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 241 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 192
>gb|EU446957.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100069932; IMAGE:100012166;
FLH257123.01L H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B)
gene, encodes complete protein
Length=451
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 130 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 81
>dbj|AK312762.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93172, highly similar to Homo sapiens H3
histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=545
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 242 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 193
>emb|AM393192.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002304 for hypothetical
protein (H3F3B gene)
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 128 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 79
>gb|BC013020.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3349652, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2338
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 1554 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 1505
>gb|BC006497.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2160 IMAGE:2959756), complete cds
gb|BC012813.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:4123 IMAGE:2959756), complete cds
Length=1119
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 225 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 176
>gb|BC017558.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:9614 IMAGE:3910031), complete cds
Length=1119
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 229 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 180
>gb|BC001124.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2161 IMAGE:2988279), complete cds
Length=896
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 225 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 176
>ref|NM_005324.3| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=2753
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 241 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 192
>gb|AC087289.9| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-552F3, complete sequence
Length=203765
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 174320 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 174271
>ref|NM_001133832.1| Pongo abelii H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
emb|CR858345.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A2130 (from clone DKFZp459A2130)
Length=2733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 191
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
Length=1696
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 241 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 192
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complete cds
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Sbjct 242 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 193
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MGC:131844 IMAGE:6144255), complete cds
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3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
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(H3F3B), mRNA
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Sbjct 398 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 349
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complex-B genomic sequence
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(H3F3B), mRNA
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Sbjct 252 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 203
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(LOC103017106), mRNA
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Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCCGCTTTCGTGGCCAGCT 191
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complex-B genomic sequence
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 23733 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 23782
>gb|KJ456959.1| Macaca mulatta isolate Rh23108 clone 2985 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
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Sbjct 10092 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 10141
>ref|XM_005584981.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926276 (LOC101926276),
mRNA
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Sbjct 255 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 206
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mRNA
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Sbjct 233 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 184
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Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 191
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 191
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Sbjct 209 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 160
>ref|XM_001104973.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
3 (LOC711912), mRNA
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Sbjct 248 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 199
>ref|XM_001096496.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC708054, transcript
variant 1 (LOC708054), mRNA
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Sbjct 749 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 700
>ref|XM_001099829.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
1 (LOC704104), mRNA
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 229 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 180
>ref|XM_001100109.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
2 (LOC704104), mRNA
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 258 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 209
>ref|XM_002800601.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC704104), mRNA
Length=2672
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 180 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 131
>ref|XM_002800600.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC704104), mRNA
Length=2729
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 237 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 188
>gb|AC197396.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-337K2 from chromosome 16, complete
sequence
Length=193060
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 57030 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 56981
>dbj|AB128049.1| Macaca mulatta genes, MHC class I region, partial and complete
cds
Length=3284914
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2500609 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 2500560
>ref|XM_002823088.3| PREDICTED: Pongo abelii H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1126
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 CACCCCGCCGGTAGAGGGGGTGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 201
>ref|XM_003913444.2| PREDICTED: Papio anubis H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
mRNA
Length=3176
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 719 CACCCCGCCAGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCT 670
>ref|XM_002748743.3| PREDICTED: Callithrix jacchus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
mRNA
Length=1872
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 393 CACCCCGCCAGTAGAGGGGGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 344
>ref|XM_007454336.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer histone H3.3-like (LOC103076444),
transcript variant X2, mRNA
Length=871
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 112 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCCGCTTTAGTGGCCAGCT 63
>ref|XM_007454335.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer histone H3.3-like (LOC103076444),
transcript variant X1, mRNA
Length=1120
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 239 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCCGCTTTAGTGGCCAGCT 190
>ref|XM_003131194.2| PREDICTED: Sus scrofa histone H3.3-like (LOC100521680), mRNA
Length=1726
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 267 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 218
>ref|XM_005407480.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera histone H3.3-like (LOC102012783),
transcript variant X1, mRNA
Length=1134
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 251 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 202
>ref|XM_005388840.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera histone H3.3-like (LOC102022008),
mRNA
Length=1019
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
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Sbjct 217 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 168
>ref|XM_004999610.1| PREDICTED: Cavia porcellus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3f3b),
transcript variant X3, mRNA
Length=669
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 223 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 174
>ref|XM_003461422.2| PREDICTED: Cavia porcellus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3f3b),
transcript variant X1, mRNA
Length=665
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 223 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 174
>ref|XM_004999609.1| PREDICTED: Cavia porcellus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3f3b),
transcript variant X2, mRNA
Length=2642
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 218 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 169
>dbj|AK399768.1| Sus scrofa mRNA, clone: BMWN10073F03, expressed in bone marrow
Length=1744
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 711 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 662
>dbj|AK399371.1| Sus scrofa mRNA, clone: THY010068B03, expressed in thymus
Length=1162
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 255 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 206
>dbj|AK395637.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVRT10040F05, expressed in ovary
Length=1401
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 491 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 442
>emb|CU928968.5| Pig DNA sequence from clone CH242-19M24 on chromosome 12, complete
sequence
Length=119643
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 28843 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 28794
>dbj|AK234113.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010008D04, expressed in ovary
Length=1717
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 191
>dbj|AK239851.1| Sus scrofa mRNA, clone:UTR010004D12, expressed in uterus
Length=1024
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 191
>dbj|AK231974.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010059C08, expressed in lung
Length=2212
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 240 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 191
>dbj|AK231121.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010097F05, expressed in alveolar macrophage
Length=921
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 241 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 192
>ref|NM_001282367.1| Chinchilla lanigera histone H3.3-like (LOC102012783), mRNA
gb|AY533212.1| Chinchilla lanigera histone H3.3B mRNA, complete cds
Length=727
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 270 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTAGTGGCCAGCT 221
>ref|XM_003780001.2| PREDICTED: Pongo abelii histone H3.3-like (LOC100435774), mRNA
Length=642
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 ACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 ACCCCGCCGGTAGAGGGGGTGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 114
>ref|XM_006912215.1| PREDICTED: Pteropus alecto histone H3.3-like (LOC102897761),
mRNA
Length=1725
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||
Sbjct 253 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCCTTAGTGGCCAGCT 204
>ref|XM_003786125.1| PREDICTED: Otolemur garnettii histone H3.3-like (LOC100946065),
mRNA
Length=1894
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||
Sbjct 390 CACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTGGTAGCCAGCT 341
>ref|XM_006269242.1| PREDICTED: Alligator mississippiensis histone H3.3-like (LOC102562183),
mRNA
Length=1097
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 44/46 (96%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 CCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 208 CCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCAGCTTTGGTGGCCAGCT 163
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT
>ref|NM_005324.3| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=2753
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 62
>gb|AC087289.9| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-552F3, complete sequence
Length=203765
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173620 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 173669
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
Length=1696
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 62
>emb|BX537379.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2282 (from clone DKFZp686C2282);
complete cds
Length=2878
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 63
>emb|Z48950.1| H.sapiens hH3.3B gene for histone H3.3
Length=3276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 786
>emb|BX647280.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0399 (from clone DKFZp686O0399)
Length=1723
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 61
>gb|BC001124.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2161 IMAGE:2988279), complete cds
Length=896
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 GGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 46
>gb|AF218029.1|AF218029 Homo sapiens clone PP781 unknown mRNA
Length=1693
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 9 GTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT 42
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
17 17 73774869 73774969 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGGCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCACTCACCAACCTCTGG
17 17 73774872 73774972 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAG
17 17 73774875 73774975 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAGCCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGC
17 17 73774878 73774978 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGC
17 17 73774882 73774982 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCC
17 17 73774885 73774985 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGA
17 17 73774888 73774988 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGA
17 17 73774891 73774991 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCA
17 17 73774894 73774994 100M CGCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCT
17 17 73774897 73774997 100M GCACCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGG
17 17 73774900 73775000 100M CCGATGGCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCG
17 17 73774903 73775003 100M ATGGCTGCGCACTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCCACT
17 17 73774906 73775006 100M GCTGCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCT
17 17 73774909 73775009 100M GCGCTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGAT
17 17 73774912 73775012 100M CTCTGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAAC
17 17 73774915 73775015 100M TGAAACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGAC
17 17 73774918 73775018 100M AACCTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAA
17 17 73774921 73775021 100M CTCAGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCT
17 17 73774924 73775024 100M TGGTCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTC
17 17 73774927 73775027 100M TCGGTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAA
17 17 73774930 73775030 100M GTTTTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCG
17 17 73774933 73775033 100M TTGAAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCA
17 17 73774936 73775036 100M AAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGG
17 17 73774939 73775039 100M TCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGGCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCCCGGTCC
17 17 73774942 73775042 100M TGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGG
17 17 73774945 73775128 99M83N1M GCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
17 17 73774948 73775131 96M83N4M ATCTCCCTCACCAACCTCTGGAGGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGT
17 17 73774951 73775134 93M83N7M TCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGC
17 17 73774954 73775137 90M83N10M CTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGAG
17 17 73774957 73775057 100M ACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAATCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAG
17 17 73774960 73775143 84M83N16M AACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGGCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CGGTAGCGATGAGGCT
17 17 73774963 73775146 81M83N19M CTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGAACCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCT
17 17 73774966 73775149 78M83N22M TGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCC
17 17 73774969 73775152 75M83N25M AAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCC
17 17 73774972 73775155 72M83N28M GGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGC
17 17 73774975 73775158 69M83N31M AGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGG
17 17 73774978 73775161 66M83N34M TTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCTGTAG
17 17 73774981 73775164 63M83N37M CGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGG
17 17 73774984 73775167 60M83N40M ATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAG
17 17 73774987 73775087 100M AGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAA
17 17 73774990 73775173 54M83N46M AGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTT
17 17 73774993 73775176 51M83N49M TCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCC
17 17 73774996 73775179 48M83N52M GTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGG
17 17 73774999 73775182 45M83N55M GACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGG
17 17 73775002 73775185 42M83N58M TTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTT
17 17 73775005 73775188 39M83N61M TGATAACGACGAGTCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCG
17 17 73775008 73775191 36M83N64M TAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGG
17 17 73775011 73775194 33M83N67M CGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCA
17 17 73775014 73775197 30M83N70M CGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT
17 17 73775017 73775200 27M83N73M ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTT
17 17 73775017 73775844 27M83N70M73775848F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTT
17 17 73775017 73775844 27M83N70M73775848F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTT
17 17 73775017 73775844 27M83N70M73775848F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGGAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTT
17 17 73775017 73775844 27M83N70M73775848F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTT
17 17 73775017 73775844 27M83N70M73775848F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGGTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTT
17 17 73775017 73775844 27M83N70M73775848F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTT
17 17 73775017 73775844 27M83N70M73775848F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATCAGGCTTCTTCACCCCGCCGGCAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTT
17 17 73775017 73775844 27M83N70M73775848F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTT
17 17 73775017 73775844 27M83N70M73775848F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCCGCT GTT
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17 17 73775017 73775844 27M83N70M73775848F3m ATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGTCTTTCGTGGCCAGCT GTT
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17 17 73775026 73775126 100M AGCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTA
17 17 73775026 73775835 18M83N70M73775848F12m AGCGCCAGGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTC
17 17 73775027 73775834 17M83N70M73775848F13m GCGCCAGGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCG
17 17 73775029 73775832 15M83N70M73775848F15m GCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTT
17 17 73775029 73775832 15M83N70M73775848F15m GCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTT
17 17 73775030 73775831 14M83N70M73775848F16m CCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTG
17 17 73775031 73775830 13M83N70M73775848F17m CACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGG
17 17 73775032 73775829 12M83N70M73775848F18m ACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGG
17 17 73775033 73775828 11M83N70M73775848F19m CGGCCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGC
17 17 73775034 73775827 10M83N70M73775848F20m GGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCG
17 17 73775036 73775825 8M83N70M73775848F22m TCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGT
17 17 73775038 73775823 6M83N70M73775848F24m CCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGC
17 17 73775038 73775823 6M83N70M73775848F24m CCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGGGGTGC
17 17 73775038 73775823 6M83N70M73775848F24m CCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGGGC
17 17 73775039 73775822 5M83N70M73775848F25m CGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCT
17 17 73775039 73775822 5M83N70M73775848F25m GGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCT
17 17 73775042 73775142 100M GCCTGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGC
17 17 73775042 73775819 2M83N70M73775848F28m GC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGG
17 17 73775045 73775145 100M TGCAGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGCCGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTC
17 17 73775048 73775148 100M AGCGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTC
17 17 73775051 73775151 100M GAGCAGGGGAGGAGTGAGGGAACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACC
17 17 73775054 73775154 100M CAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCG
17 17 73775057 73775157 100M GGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCG
17 17 73775060 73775160 100M AGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTA
17 17 73775063 73775163 100M AGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG
17 17 73775066 73775166 100M GAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGA
17 17 73775070 73775170 100M GGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGC
17 17 73775074 73775174 100M GCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTT
17 17 73775077 73775177 100M GCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCT
17 17 73775080 73775180 100M GCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGGAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGC
17 17 73775084 73775184 100M AAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCT
17 17 73775087 73775187 100M GCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGATCGCTTTTCCTGGCGGCTTTC
17 17 73775090 73775190 100M GGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCCGGCGGCTTTCATG
17 17 73775093 73775193 100M CACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCC
17 17 73775096 73775196 100M CGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGC
17 17 73775099 73775199 100M CGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGT
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17 17 73775129 73775815 68M73775848F32m GTAGCGATGAGGCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTT
17 17 73775131 73775813 66M73775848F34m AGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCG
17 17 73775133 73775811 64M73775848F36m CGATGAGGCTTCTCCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCT
17 17 73775135 73775809 62M73775848F38m ATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCG
17 17 73775137 73775807 60M73775848F40m GAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCATGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTC
17 17 73775139 73775805 58M73775848F42m GGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGA
17 17 73775140 73775804 57M73775848F43m CCTTCTTCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGAC
17 17 73775149 73775795 48M73775848F52m CCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCT
17 17 73775150 73775794 47M73775848F53m CCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTT
17 17 73775154 73775790 43M73775848F57m CCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTC
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17 17 73775154 73775790 43M73775848F57m CCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTC
17 17 73775157 73775787 40M73775848F60m GTAGGGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG
17 17 73775157 73775787 40M73775848F60m GTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTTGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGG
17 17 73775161 73775783 36M73775848F64m AGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGC
17 17 73775161 73775783 36M73775848F64m AGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGC
17 17 73775161 73775783 36M73775848F64m AGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGC
17 17 73775166 73775778 31M73775848F69m GCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGGTCTTCCTCGGGCAGCGGAAG
17 17 73775169 73775775 28M73775848F72m CTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGGCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGG
17 17 73775174 73775770 23M73775848F77m CCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCATCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGG
17 17 73775174 73775263 23M73775848F76m507n1m CCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCATCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775174 73775770 23M73775848F77m CCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGG
17 17 73775174 73775263 23M73775848F76m507n1m CCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCT GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775182 73775762 15M73775848F85m CTTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGA
17 17 73775183 73775761 14M73775848F86m TTTCGTGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGTGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAG
17 17 73775188 73775756 9M73775848F91m TGGCCAGCG GTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGGGAAGTG
17 17 73775854 73775754 100m ATGAGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGC
17 17 73775851 73775751 100m AGCGGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAATCGCCTA
17 17 73775848 73775748 100m GGTTTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAA
17 17 73775845 73775745 100m TTGGTCGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTT
17 17 73775842 73775235 1m507n99m G||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775839 73775232 4m507n96m GTTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775836 73775736 100m CGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGGAGTGGCCTAAAACTTCGGCGATGG
17 17 73775833 73775733 100m TGGGCGGTGCTGGTTTTTGGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGGGTG
17 17 73775830 73775730 100m GCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGACTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGGGTAGGC
17 17 73775827 73775255 9m472n91m GTGCTGGTT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775824 73775251 13m472n84m1d3m CTGTTTTTCGCTC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775821 73775249 15m472n85m GTTTTTCGCTCGTCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775818 73775246 82m472n18m TTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775815 73775243 79m472n21m CGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775811 73775239 75m472n25m CCTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775808 73775236 72m472n28m CGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775805 73775233 69m472n31m CTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCTTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775802 73775230 66m472n34m CGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775797 73775225 61m472n39m CTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGAGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775794 73775222 58m472n42m CCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775791 73775219 55m472n45m CGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775788 73775216 52m472n48m GCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775785 73775213 49m472n51m GCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775782 73775210 46m472n54m GAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775779 73775207 43m472n57m GCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775776 73775204 40m472n60m GCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTAAAACTTTGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775773 73775201 37m472n63m CGGCGGTCGGAGAAGTGGGCTAAAAGTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775770 73775198 34m472n66m CGGTCGGAGAAGTCGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775767 73775195 31m472n69m TCGGAGAAGTGGCCTAAAACTGCGGCGATGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775764 73775192 28m472n72m GAGAAGTGGCATAAAGCTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775761 73775189 25m472n75m AAGTGGCCTAAAACTTCGGGGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775758 73775185 22m472n51m1d27m TGGCCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775755 73775182 19m472n62m1d19m CCTAAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775752 73775180 16m472n84m AAAACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 73775749 73775176 13m472n40m1d47m ACTTCGGCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 73775743 73775171 7m472n93m GCGTTGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 73775722 73775622 100m TTTTCCCCGCGGCTTCAGGTTCTGCCAACCGTTGGCGCCGCGCGCCGCGGCCGTTGGGAGCCGAGCGGCGGGGGCTGCTCGGGCCGCTGGCGTCGGGTCG
17 17 73775719 73775619 100m TACCCGCGGCTTCAGGTTCTGCCAACCGTTGGCGCCGCGCGCCGCGGCCGTTGGGAGCCGAGCGGCGGGGGCTGCTCGGGCCGCTGGCGTCGGGTCGGGT
17 17 73775716 73775616 100m CCGCGGCTTCAGGTTCTGCCAACCGTTGGCGCCGCGCGCCGCGGCCGTTGGGAGCCGAGCGGCGGGGGCTGCTCGGGCCGCTGGCGTCGGGTCGGGTATG
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17 17 73775705 73775605 100m GGTTCTGCCAACCGTTGGCGCCGCGCGCCGCGGCCGTTGGGAGCCGAGCGGCGGGGGCTGCTCGGGCCGCTGGCGTCGGGTCGGGTATGGGGCCGGGAGG
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sequence
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genome shotgun sequence
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sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188168, whole genome shotgun sequence
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant 3 (H3F3B), mRNA
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(H3F3B), mRNA
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Sbjct 386 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 337
>ref|NM_001280448.1| Pan troglodytes H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
dbj|AK306632.1| Pan troglodytes mRNA for histone H3.3, complete cds, clone: PtsC-54-5_E11
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Sbjct 232 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 183
>dbj|AB463740.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8141, Homo sapiens H33 gene
for Histone H3.3, without stop codon, in Flexi system
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Sbjct 108 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 59
>dbj|AK304607.1| Homo sapiens cDNA FLJ52843 complete cds, highly similar to Histone
H3.3
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Sbjct 232 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 183
>gb|EU446957.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100069932; IMAGE:100012166;
FLH257123.01L H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B)
gene, encodes complete protein
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Sbjct 121 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 72
>dbj|AK312762.1| Homo sapiens cDNA, FLJ93172, highly similar to Homo sapiens H3
histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
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Sbjct 233 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 184
>emb|AM393192.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002304 for hypothetical
protein (H3F3B gene)
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Sbjct 119 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 70
>gb|BC013020.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3349652, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 1545 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 1496
>gb|BC006497.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2160 IMAGE:2959756), complete cds
gb|BC012813.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:4123 IMAGE:2959756), complete cds
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Sbjct 216 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 167
>gb|BC017558.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:9614 IMAGE:3910031), complete cds
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Sbjct 220 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 171
>gb|BC001124.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:2161 IMAGE:2988279), complete cds
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Sbjct 216 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 167
>ref|NM_005324.3| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
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Sbjct 232 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 183
>gb|AC087289.9| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-552F3, complete sequence
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Sbjct 174311 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 174262
>ref|NM_001133832.1| Pongo abelii H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
emb|CR858345.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A2130 (from clone DKFZp459A2130)
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Sbjct 231 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 182
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
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Sbjct 232 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 183
>emb|BX537379.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C2282 (from clone DKFZp686C2282);
complete cds
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Sbjct 233 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 184
>gb|AF218029.1|AF218029 Homo sapiens clone PP781 unknown mRNA
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Sbjct 212 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 163
>emb|Z48950.1| H.sapiens hH3.3B gene for histone H3.3
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Sbjct 1428 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 1379
>gb|BC108701.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:131844 IMAGE:6144255), complete cds
Length=1098
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Sbjct 195 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 146
>emb|BX647280.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O0399 (from clone DKFZp686O0399)
Length=1723
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Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 231 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 182
>ref|XM_010387576.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana H3 histone, family 3B (H3.3B)
(H3F3B), mRNA
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Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 389 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 340
>gb|KJ913372.1| Macaca mulatta isolate Rh23108 clone 4634 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
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Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 1302 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 1351
>gb|KJ457091.1| Macaca mulatta isolate Rh23717 clone 3190 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
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Sbjct 23742 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 23791
>gb|KJ456959.1| Macaca mulatta isolate Rh23108 clone 2985 major histocompatibility
complex-B genomic sequence
Length=36105
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Sbjct 10101 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 10150
>ref|XM_005584981.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926276 (LOC101926276),
mRNA
Length=1139
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Sbjct 246 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 197
>ref|XM_005553676.1| PREDICTED: Macaca fascicularis histone H3.3-like (LOC102118214),
mRNA
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Sbjct 224 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 175
>ref|XR_014302.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC719872), miscRNA
Length=1145
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Sbjct 231 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 182
>ref|XM_002803979.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC100430466), mRNA
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Sbjct 231 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 182
>ref|XM_002803657.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC711912), mRNA
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Sbjct 200 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 151
>ref|XM_001104973.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
3 (LOC711912), mRNA
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Sbjct 239 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 190
>ref|XM_001096496.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC708054, transcript
variant 1 (LOC708054), mRNA
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Sbjct 740 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 691
>ref|XM_001099829.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
1 (LOC704104), mRNA
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Sbjct 220 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 171
>ref|XM_001100109.2| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like, transcript variant
2 (LOC704104), mRNA
Length=2750
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Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 249 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 200
>ref|XM_002800601.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC704104), mRNA
Length=2672
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Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 171 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 122
>ref|XM_002800600.1| PREDICTED: Macaca mulatta histone H3.3-like (LOC704104), mRNA
Length=2729
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Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 228 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 179
>gb|AC197396.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-337K2 from chromosome 16, complete
sequence
Length=193060
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Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 57021 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 56972
>dbj|AB128049.1| Macaca mulatta genes, MHC class I region, partial and complete
cds
Length=3284914
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 2500600 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 2500551
>ref|XM_003913444.2| PREDICTED: Papio anubis H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
mRNA
Length=3176
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 2 GTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 709 GTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 661
>ref|XM_002748743.3| PREDICTED: Callithrix jacchus H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B),
mRNA
Length=1872
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Query 2 GTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 383 GTAGAGGGGGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 335
>ref|XM_003931727.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis H3 histone, family
3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
Length=1862
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 389 GGTAGAGGGGGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTACGGG 340
>ref|XM_003780001.2| PREDICTED: Pongo abelii histone H3.3-like (LOC100435774), mRNA
Length=642
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 154 GGTAGAGGGGGTGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 105
>ref|XM_002823088.3| PREDICTED: Pongo abelii H3 histone, family 3C (H3F3C), mRNA
Length=1126
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 241 GGTAGAGGGGGTGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 192
>ref|XM_008011728.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus H3 histone, family 3B (H3.3B)
(H3F3B), mRNA
Length=1717
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG 50
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Sbjct 243 GGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTTGTGGCCAGCTGCTTGCGGG 194
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG
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Sbjct 28 GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 77
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Sbjct 173635 GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 173684
>dbj|AK130772.1| Homo sapiens cDNA FLJ27262 fis, clone TMS00164, highly similar
to Histone H3.3
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Query 1 GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 50
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Sbjct 28 GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 77
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complete cds
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Sbjct 29 GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 78
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Query 1 GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 50
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Sbjct 752 GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 801
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Query 1 GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 50
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Sbjct 27 GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 76
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MGC:2160 IMAGE:2959756), complete cds
gb|BC012813.2| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:4123 IMAGE:2959756), complete cds
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Query 1 GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 50
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Sbjct 12 GGGCGGTGTTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 61
>ref|NM_001280448.1| Pan troglodytes H3 histone, family 3B (H3.3B) (H3F3B), mRNA
dbj|AK306632.1| Pan troglodytes mRNA for histone H3.3, complete cds, clone: PtsC-54-5_E11
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Query 1 GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 50
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Sbjct 28 GGGCAGTGCGGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCGGCG 77
>gb|BC108701.1| Homo sapiens H3 histone, family 3B (H3.3B), mRNA (cDNA clone
MGC:131844 IMAGE:6144255), complete cds
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Query 11 GGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCG 50
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17 17 73774936 73775036 100M AAATCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGG
17 17 73774939 73775039 100M TCCTGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGGCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCCCGGTCC
17 17 73774942 73775042 100M TGCGCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGG
17 17 73774945 73775128 99M83N1M GCGATCTCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
17 17 73774948 73775131 96M83N4M ATCTCCCTCACCAACCTCTGGAGGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGT
17 17 73774951 73775134 93M83N7M TCCCTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGC
17 17 73774954 73775137 90M83N10M CTCACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGAG
17 17 73774957 73775057 100M ACCAACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAATCGCCACGGTCCCGGGCCTGCAGCGAGCAG
17 17 73774960 73775143 84M83N16M AACCTCTGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGGCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CGGTAGCGATGAGGCT
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17 17 73774966 73775149 78M83N22M TGGAAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCC
17 17 73774969 73775152 75M83N25M AAGGGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCC
17 17 73774972 73775155 72M83N28M GGCAGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGC
17 17 73774975 73775158 69M83N31M AGCTTCCGGATGAGCAGCTCGGTCGACTTCTGATAACGACGAATCTCTCGAAGCGCCACGGTCCCGGGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGG
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17 17 73775050 73775150 100M CGAGCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCAC
17 17 73775053 73775153 100M GCAGGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGCCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCTCCCC
17 17 73775056 73775156 100M GGGGAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCC
17 17 73775059 73775159 100M GAGGAGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGT
17 17 73775063 73775163 100M AGTGAGCGGACGCTGCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAG
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17 17 73775077 73775177 100M GCCGCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCT
17 17 73775080 73775180 100M GCACAAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGGAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGC
17 17 73775084 73775184 100M AAAGCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCT
17 17 73775087 73775187 100M GCCGGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGATCGCTTTTCCTGGCGGCTTTC
17 17 73775090 73775190 100M GGCCACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCCGGCGGCTTTCATG
17 17 73775093 73775193 100M CACCGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCC
17 17 73775096 73775196 100M CGCCGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGC
17 17 73775099 73775199 100M CGGGCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGT
17 17 73775102 73775202 100M GCCATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTG
17 17 73775105 73775205 100M ATTGTTCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCAGCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGG
17 17 73775110 73775210 100M TCCCCCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGGGGGC
17 17 73775114 73775214 100M CCGCCCGACCTACCTGTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGGGGGCTTTC
17 17 73775129 73775809 77M73775833F23m GTAGCGATGAGGCTTCTTCACCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCG
17 17 73775141 73775797 65M73775833F35m CTTCTCCCCCCCGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCT
17 17 73775152 73775786 54M73775833F46m CGCCGGTAGAGGGAGCGCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGC
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17 17 73775168 73775770 38M73775833F62m GCTTTTCCTGGCGGCTTTCGTGGCCAGCTGTTTGCGGG GGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGG
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17 17 73775840 73775233 97m507n3m CGTTCGTTGGGCGGTGCTGGTTTTTCGCTCGTCGACTGCGGCTCTTCCTCGGGCAGCGGAAGCGGCGCGGCGGTCGGAGAAGTGGCCTCAAACTTCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188271, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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assembly
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genome shotgun sequence
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>ref|NW_004929378.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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sequence
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>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000472.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 1615894 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 1615941
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
Length=132164248
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>ref|NC_000003.12| Homo sapiens chromosome 3, GRCh38 Primary Assembly
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Sbjct 175978189 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 175978238
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HSCHR3_CTG2_1
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assembly
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 82272615 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 82272664
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genome shotgun sequence
gb|CM001611.2| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 175659416 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 175659465
>ref|NW_004929311.1| Homo sapiens chromosome 3 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150095.1| Homo sapiens chromosome 3 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 82100857 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 82100906
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shotgun sequence
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Sbjct 19733426 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 19733475
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Sbjct 173073782 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 173073831
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shotgun sequence
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Sbjct 17337818 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 17337867
>gb|DS990653.1| Homo sapiens SCAF_1112675837330 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 18354677 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 18354628
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Sbjct 173723732 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 173723781
>ref|NW_001838884.2| Homo sapiens chromosome 3 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188385, whole genome shotgun sequence
gb|DS486015.1| Homo sapiens SCAF_1103279188385 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 18355013 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 18354964
>gb|CH471052.2| Homo sapiens 211000035835664 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 82283763 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 82283812
>ref|AC_000135.1| Homo sapiens chromosome 3, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000464.1| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 173074018 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 173074067
>gb|CM000254.1| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 174098093 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 174098142
>ref|NC_000005.10| Homo sapiens chromosome 5, GRCh38 Primary Assembly
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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>ref|NT_034772.7| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR5_CTG1_1
gb|GL000049.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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sequence
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blast search - nt
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mRNA
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X2, mRNA
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X1, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 490 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 441
>gb|KJ904414.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_13808 ACTG1
gene, encodes complete protein
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Sbjct 490 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 441
>gb|KJ896370.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05764 ACTG1
gene, encodes complete protein
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 490 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 441
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Sbjct 318 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 269
>ref|XM_006941899.1| PREDICTED: Felis catus actin, cytoplasmic 2-like (LOC101098507),
mRNA
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Sbjct 403 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 354
>ref|XM_006722048.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 707 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 658
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Sbjct 280 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 231
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Sbjct 334 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 285
>ref|XM_005530673.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 504 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 455
>ref|XM_005521370.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC102110255), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 253
>ref|XM_005521369.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC102110255), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 502 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 453
>dbj|AB839002.1| Homo sapiens ACTG1 gene, DNA variation found in Japanese hearing
loss patients, c.485C>T: p.T162M
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Sbjct 67 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 18
>ref|XM_005056295.1| PREDICTED: Ficedula albicollis actin, gamma 1 (ACTG1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 328 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 279
>ref|XM_005056294.1| PREDICTED: Ficedula albicollis actin, gamma 1 (ACTG1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 329 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 280
>ref|XR_193681.1| PREDICTED: Echinops telfairi actin, cytoplasmic 2-like (LOC101659333),
misc_RNA
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Sbjct 457 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 408
>ref|XR_186995.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens actin, cytoplasmic 1-like
(LOC101372193), misc_RNA
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Sbjct 509 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 460
>ref|XM_004394150.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1842
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Sbjct 509 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 460
>ref|XM_002195880.2| PREDICTED: Taeniopygia guttata actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC100229883), mRNA
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 502 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 453
>gb|JF694322.1| Stygamoeba regulata strain ATCC 50892 clone 1 actin gene, partial
cds
Length=796
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 171 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 122
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 564 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 515
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 683 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 634
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 564 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 515
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 32080 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 32031
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 6237 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 6188
>gb|EU832621.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067650; DKFZo008B0831
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 447 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 398
>gb|EU832693.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067722; DKFZo004B0832
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 447 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 398
>emb|CU680176.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017126
5' read ACTG1 mRNA
Length=1134
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 441 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 392
>emb|CU676328.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100021914
5' read ACTG1 mRNA
Length=1161
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 441 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 392
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 497 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 448
>gb|EU176631.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011619; FLH263907.01L;
RZPDo839C03246D actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes
complete protein
Length=1168
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 447 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 398
>gb|DQ891374.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004004; FLH176328.01X; RZPDo839C01122D
actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes complete protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 447 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 398
>gb|BC021036.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3836590),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=3405
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 2086 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 2037
>gb|BC023606.1| Homo sapiens mRNA similar to actin, beta (cDNA clone IMAGE:4640691)
Length=2527
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 1235 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 1186
>gb|BC019044.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4635339, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2503
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 1214 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 1165
>gb|BC021033.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3832154, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 1235 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 1186
>gb|BC007442.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:4484 IMAGE:2962953),
complete cds
Length=1938
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 484 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 435
>gb|BC053572.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:61615 IMAGE:3865767),
complete cds
Length=1912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 477 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 428
>gb|BC000292.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:8332 IMAGE:2819345),
complete cds
Length=1940
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 490 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 441
>gb|BC012050.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:19847 IMAGE:4554944),
complete cds
Length=1936
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 484 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 435
>gb|BC023548.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4109821),
partial cds
Length=1525
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 91 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 42
>gb|BC063495.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5398241)
Length=1856
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 416 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 367
>gb|BC039144.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3866554),
with apparent retained intron
Length=1592
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 135 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 86
>gb|BC001920.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:3728 IMAGE:2820489),
complete cds
Length=1744
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 453 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 404
>gb|BC018774.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:32064 IMAGE:4869628),
complete cds
Length=1812
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 484 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 435
>gb|BC015779.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:23584 IMAGE:4856294),
complete cds
Length=1791
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 425 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 376
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enteric (ACTG2), mRNA
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mRNA
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5 (LOC104489878), transcript variant X2, mRNA
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5 (LOC104489878), transcript variant X1, mRNA
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partial mRNA
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mRNA
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misc_RNA
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I (LOC738413), transcript variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 324 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 275
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Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATAGCCGGGGTGTTGAAGGT 253
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(LOC102458214), mRNA
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Sbjct 466 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATAGCCGGGGTGTTGAAGGT 417
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Sbjct 539 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGCGTTGAAGGT 490
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Sbjct 505 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 456
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Sbjct 296 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 247
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 425 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 376
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Sbjct 547 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 498
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Sbjct 543 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 494
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 253
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 502 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 453
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Sbjct 4774 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 4823
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transcript variant X3, misc_RNA
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Sbjct 441 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 392
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 449 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 400
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 441 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 392
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mRNA
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Sbjct 442 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 393
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Sbjct 296 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 247
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Sbjct 470 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 421
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X2, mRNA
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Sbjct 236 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 187
>ref|XM_004621046.1| PREDICTED: Sorex araneus actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 383 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 334
>ref|XM_004617349.1| PREDICTED: Sorex araneus actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 429 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 380
>ref|XM_004040825.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, gamma 1, transcript
variant 2 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 683 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGAGTGTTGAAGGT 634
>ref|XM_004040824.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, gamma 1, transcript
variant 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 589 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGAGTGTTGAAGGT 540
>ref|XM_004032554.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla POTE ankyrin domain family
member I-like (LOC101139634), partial mRNA
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Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 1668 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 1619
>gb|JQ284425.1| Myotis laniger isolate SE actin beta (ACTB) mRNA, partial cds
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Sbjct 73 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 24
>gb|JQ284424.1| Nyctalus noctula isolate S actin beta (ACTB) mRNA, partial cds
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Sbjct 75 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 26
>gb|JQ284420.1| Hipposideros armiger isolate DMT actin beta (ACTB) mRNA, partial
cds
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Sbjct 123 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 74
>dbj|AK392362.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10068C07, expressed in hypothalamus
Length=2046
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Sbjct 521 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 472
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Sbjct 194 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 145
>gb|JF288784.1| Litopenaeus vannamei beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 214 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 165
>gb|JF830811.1| Bubalus bubalis beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 85 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 36
>gb|AC188702.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-300D15 from chromosome 2, complete
sequence
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Sbjct 101392 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 101343
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Sbjct 425 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 379
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358981.1| Homo sapiens clone HepG-17 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358980.1| Homo sapiens clone HepG-7 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358970.1| Homo sapiens clone Huh7-4 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358969.1| Homo sapiens clone Huh7-5 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358966.1| Homo sapiens clone Huh7-8 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358957.1| Homo sapiens clone Hep3-17 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>ref|XM_002931126.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca actin, cytoplasmic 2-like (LOC100466132),
mRNA
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Sbjct 1199 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 1150
>ref|XM_001110688.2| PREDICTED: Macaca mulatta actin, gamma 1, transcript variant
1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 341 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 292
>ref|XM_001110892.2| PREDICTED: Macaca mulatta actin, gamma 1, transcript variant
4 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 496 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 447
>gb|GU645247.1| Marsupenaeus japonicus isolate 14-69 actin mRNA, complete cds
gb|GU645581.1| Marsupenaeus japonicus isolate 0630 actin gene, complete cds
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645246.1| Marsupenaeus japonicus isolate 13 actin mRNA, complete cds
gb|GU645580.1| Marsupenaeus japonicus isolate 05 actin gene, complete cds
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645238.1| Marsupenaeus japonicus isolate 05 actin mRNA, complete cds
gb|GU645579.1| Marsupenaeus japonicus isolate 04 actin gene, complete cds
Length=1131
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645235.1| Marsupenaeus japonicus isolate 02 actin mRNA, complete cds
gb|GU645577.1| Marsupenaeus japonicus isolate 02 actin gene, complete cds
Length=1131
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645237.1| Marsupenaeus japonicus isolate 04 actin mRNA, complete cds
gb|GU645576.1| Marsupenaeus japonicus isolate 01 actin gene, complete cds
Length=1131
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|HM053699.1| Eriocheir sinensis beta actin mRNA, complete cds
Length=1478
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 621 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 572
>gb|GU645245.1| Marsupenaeus japonicus isolate 12 actin mRNA, complete cds
Length=1131
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645244.1| Marsupenaeus japonicus isolate 11 actin mRNA, complete cds
Length=1131
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645243.1| Marsupenaeus japonicus isolate 10 actin mRNA, complete cds
Length=1131
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645242.1| Marsupenaeus japonicus isolate 09 actin mRNA, complete cds
Length=1131
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645241.1| Marsupenaeus japonicus isolate 08 actin mRNA, complete cds
Length=1131
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645236.1| Marsupenaeus japonicus isolate 03 actin mRNA, complete cds
Length=1131
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645234.1| Marsupenaeus japonicus isolate 01 actin mRNA, complete cds
Length=1131
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU001950.1| Anguilla japonica beta actin mRNA, partial cds
Length=1527
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 401 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 352
>gb|FJ423112.1| Elephas maximus isolate 07-B beta actin-like mRNA, partial sequence
Length=612
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 393 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 344
>gb|FJ423085.1| Elephas maximus isolate 07-C beta actin-like mRNA, partial sequence
Length=620
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 393 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 344
>gb|FJ423084.1| Elephas maximus isolate 07-S beta actin-like mRNA, partial sequence
Length=602
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 384 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 335
>gb|FJ423083.1| Elephas maximus isolate 06-15 beta actin-like mRNA, partial sequence
Length=608
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 382 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 333
>gb|FJ423082.1| Elephas maximus isolate 06-8 beta actin-like mRNA, partial sequence
Length=998
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 351 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 302
>ref|XM_002408066.1| Ixodes scapularis actin, putative, mRNA
Length=1008
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAA 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAA 259
>gb|DQ212697.1| Phoca vitulina cytoplasmic beta actin mRNA, partial cds
Length=777
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 147 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 98
>dbj|AB270711.1| Camelus dromedarius mRNA for beta actin, partial cds
Length=544
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 189 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 140
>gb|AF300705.2| Litopenaeus vannamei beta-actin mRNA, complete cds
Length=1320
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 499 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 450
>gb|DQ661647.1| Bubalus bubalis beta-actin mRNA, complete cds
Length=1143
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 435 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 386
>gb|DQ845171.1| Sus scrofa beta-actin mRNA, partial cds
Length=802
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 91 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 42
>gb|AC184154.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-487P23 from chromosome 2, complete
sequence
Length=189773
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 36771 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 36820
>gb|AC182395.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-484N21 from chromosome 2, complete
sequence
Length=176398
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 86534 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 86485
>gb|AY651918.1| Macrobrachium rosenbergii beta-actin (c57) mRNA, complete cds
Length=1357
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 539 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 490
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Sbjct 512 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 463
>gb|AY486467.1| Litopenaeus vannamei clone Hmgi119-T3 actin E mRNA, partial cds
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 486 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 437
>gb|AY486466.1| Litopenaeus vannamei clone Hmgi149-T3 actin D mRNA, partial cds
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Sbjct 503 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 454
>ref|NM_001284724.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925802 (LOC101925802),
mRNA
dbj|AB169918.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QflA-11253, similar to
human actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA, RefSeq: NM_001614.2
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Sbjct 535 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 486
>gb|AY970464.1| Homo sapiens isolate 3T-16 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|AY970463.1| Homo sapiens isolate 3T-15 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|AY970461.1| Homo sapiens isolate 3T-13 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|AY970448.1| Homo sapiens isolate 3N-12 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|AY970392.1| Homo sapiens isolate 1T-9 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|AY970385.1| Homo sapiens isolate 1T-2 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>emb|AJ719605.1| Gallus gallus mRNA for hypothetical protein, clone 4h19
Length=728
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Sbjct 512 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 463
>gb|AC132479.2| Homo sapiens BAC clone RP11-769N11 from 2, complete sequence
Length=168824
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Sbjct 139515 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 139564
>gb|AC093838.3| Homo sapiens BAC clone RP11-433A19 from 2, complete sequence
Length=178029
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Sbjct 105556 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 105507
>gb|AY014272.1| Homo sapiens FKSG30 (FKSG30) mRNA, complete cds
Length=1401
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Sbjct 449 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 400
>gb|AC122731.16| Pan troglodytes clone rp43-14d7, complete sequence
Length=166903
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Sbjct 67833 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 67882
>dbj|AB107655.1| Lama glama mRNA for beta actin, partial cds
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Sbjct 197 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 148
>dbj|AB055975.1| Marsupenaeus japonicus mRNA for actin, complete cds
Length=1327
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 500 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 451
>dbj|AB035660.1| Branchiostoma belcheri BbNA1 mRNA for notochord actin, complete
cds
Length=1491
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 488 AGGGACAGGACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 439
>gb|AF199487.1|AF199487 Anolis carolinensis beta-actin mRNA, partial cds
Length=1020
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 362 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 313
>gb|M26111.1|GOOACTB Goose beta-actin mRNA, complete cds
Length=1994
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Strand=Plus/Minus
Query 4 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 497 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 451
>ref|XM_008160295.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X2, mRNA
ref|XM_008161633.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus beta-actin-like protein 2 (LOC103304846),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 49
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Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTCGAAGG 254
>ref|XM_008160294.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X1, mRNA
ref|XM_008161632.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus beta-actin-like protein 2 (LOC103304846),
transcript variant X1, mRNA
Length=1131
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 49
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTCGAAGG 380
>ref|XM_008056274.1| PREDICTED: Tarsius syrichta actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X2, mRNA
Length=1005
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 49
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Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGG 254
>ref|XM_008056273.1| PREDICTED: Tarsius syrichta actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X1, mRNA
Length=1411
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 49
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Sbjct 533 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGG 485
>ref|XM_005874162.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, beta-like 2 (ACTBL2), mRNA
Length=1065
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 49
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Sbjct 305 AGGGACAGCACCGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 257
>ref|NG_021768.2| Homo sapiens actin, beta pseudogene (LOC390029) on chromosome
11
Length=1700
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 609 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 562
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mRNA
Length=1204
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAG 48
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Sbjct 501 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAG 454
>ref|XM_006195314.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, cytoplasmic 2-like (LOC102514892),
mRNA
Length=1204
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAG 48
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Sbjct 501 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAG 454
>ref|XM_006192915.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, cytoplasmic 1-like (LOC102516333),
mRNA
Length=924
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAG 48
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Sbjct 224 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAG 177
>gb|JQ284421.1| Myotis ricketti isolate DZSE actin beta (ACTB) mRNA, partial
cds
Length=511
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 79 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACMTGGCGGGGGTGTTGAAGGT 30
>gb|FJ217207.1| Homarus americanus skeletal muscle actin 2 mRNA, complete cds
Length=1395
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAG 48
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAG 381
>gb|AC197591.3| Pongo abelii BAC clone CH276-259C3 from chromosome unknown, complete
sequence
Length=97563
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 42319 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 42366
>gb|AY970446.1| Homo sapiens isolate 3N-10 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 176 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|AC139143.5| Homo sapiens chromosome 11, clone CTD-3008O6, complete sequence
Length=55001
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 40997 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 40950
>gb|AC068580.23| Homo sapiens chromosome 11, clone RP11-295K3, complete sequence
Length=120298
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 3654 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 3607
>ref|XM_010181979.1| PREDICTED: Mesitornis unicolor actin, cytoplasmic 1-like (LOC104538689),
mRNA
Length=965
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62 AGGGACAGCACAGCCTGGATAGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 13
>ref|XR_719910.1| PREDICTED: Nestor notabilis actin, cytoplasmic 2-like (LOC104405277),
misc_RNA
Length=992
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 296 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTATTGAAGGT 247
>ref|XR_020997.4| PREDICTED: Pan troglodytes putative beta-actin-like protein 3
(LOC744297), misc_RNA
Length=2312
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1248 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTTCATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 1199
>ref|XM_009237602.1| PREDICTED: Pongo abelii POTE ankyrin domain family member I (LOC100436479),
transcript variant X2, mRNA
Length=3135
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2429 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 2383
>ref|XM_009098247.1| PREDICTED: Serinus canaria actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X2, mRNA
Length=1140
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 422 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGCGTGTTGAAGGT 373
>ref|XM_009098246.1| PREDICTED: Serinus canaria actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X1, mRNA
Length=1220
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 502 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGCGTGTTGAAGGT 453
>ref|XM_002712153.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus actin, cytoplasmic 1 (LOC100008822),
mRNA
Length=1372
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAA 47
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Sbjct 503 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAA 457
>ref|XM_007525056.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus actin, beta (ACTB), transcript
variant X2, mRNA
Length=963
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248 GACAGCACCGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 202
>ref|XM_007525054.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus actin, beta (ACTB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1172
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 457 GACAGCACCGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 411
>ref|XM_006940659.1| PREDICTED: Felis catus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1904
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 468 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 422
>ref|XM_006906563.1| PREDICTED: Pteropus alecto actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1825
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 519 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATCGCTGGGGTGTTGAAGGT 470
>ref|XM_006712538.1| PREDICTED: Homo sapiens POTE ankyrin domain family, member E
(POTEE), transcript variant X1, mRNA
Length=2816
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1348 AGGGACGGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 1299
>ref|XM_001120262.3| PREDICTED: Apis mellifera actin, indirect flight muscle-like
(LOC725851), mRNA
Length=1018
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 298 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGACTGTTGAAGGT 249
>ref|XM_006569904.1| PREDICTED: Apis mellifera actin, clone 205-like (LOC410075),
mRNA
Length=1283
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 318 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGACTGTTGAAGGT 269
>ref|XM_623616.4| PREDICTED: Apis mellifera actin, clone 205-like (LOC551176),
transcript variant X1, mRNA
Length=1959
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 572 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGACTGTTGAAGGT 523
>ref|XM_003251416.2| PREDICTED: Apis mellifera actin, clone 205-like (LOC551176),
transcript variant X2, mRNA
Length=2114
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 727 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGACTGTTGAAGGT 678
>ref|XM_006569903.1| PREDICTED: Apis mellifera actin, clone 205-like (LOC551369),
mRNA
Length=2125
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 735 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGACTGTTGAAGGT 686
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA
>ref|XM_006722049.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X2, mRNA
Length=779
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 50
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Sbjct 112 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 161
>ref|XM_006722048.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
Length=2129
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 50
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Sbjct 112 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 161
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 50
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Sbjct 88 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 137
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 50
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Sbjct 30866 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 30915
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 50
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Sbjct 5023 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 5072
>gb|AC137896.5| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-765O14, complete sequence
Length=107289
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 50
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Sbjct 7808 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 7759
>gb|AC139149.6| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-766D20, complete sequence
Length=81577
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 50
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Sbjct 18643 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 18692
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
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Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
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Sbjct 88 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 135
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
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Sbjct 88 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 135
>dbj|AK304637.1| Homo sapiens cDNA FLJ57283 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1387
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
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Sbjct 18 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 65
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
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Sbjct 21 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 68
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
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Sbjct 21 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 68
>gb|BC021036.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3836590),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=3405
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
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Sbjct 1610 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 1657
>gb|BC019044.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4635339, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2503
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
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Sbjct 738 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 785
>gb|BC007442.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:4484 IMAGE:2962953),
complete cds
Length=1938
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
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Sbjct 8 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 55
>gb|BC053572.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:61615 IMAGE:3865767),
complete cds
Length=1912
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
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Sbjct 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
>gb|BC012050.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:19847 IMAGE:4554944),
complete cds
Length=1936
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 55
>gb|BC018774.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:32064 IMAGE:4869628),
complete cds
Length=1812
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 55
>gb|BC015005.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:23578 IMAGE:4855463),
complete cds
Length=1778
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 50
>gb|BC010999.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:15377 IMAGE:3940861),
complete cds
Length=1934
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 54
>gb|BC015695.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:23184 IMAGE:4842665),
complete cds
Length=1924
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
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Sbjct 10 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 57
>gb|BC009848.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:15376 IMAGE:3939552),
complete cds
Length=1962
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 52
>emb|X04098.1| Homo sapiens mRNA for cytoskeletal gamma-actin (ACTG1 gene)
Length=1918
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
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Sbjct 22 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 69
>gb|M37130.1|HUMGACTA1 Human gamma-actin pseudogene, 5' end
Length=348
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 69
>gb|M19283.1|HUMACTGA Human cytoskeletal gamma-actin gene, complete cds
Length=3583
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 50
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCCCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTGA 546
>gb|BC000292.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:8332 IMAGE:2819345),
complete cds
Length=1940
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 48
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14 CTCGCACTCTGTTTTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGT 61
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
17 17 79478399 79478499 100M GCTCGGCCGTGGTGGTGAAGCTGTAGCCTCGCTCAGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCGGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTG
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17 17 79478408 79478508 100M TGGTGGTGAAGCTGTAGCCTCGCTCAGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCGGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGC
17 17 79478411 79478511 100M TGGTGAAGCTGTAGCCTCGCTCAGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCGGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTA
17 17 79478414 79478514 100M TGAAGCTGTAGCCTCGCTCAGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCGGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCC
17 17 79478417 79478517 100M AGCTGTAGCCTCGCTCAGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCGGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTG
17 17 79478420 79478520 100M TGTAGCCTCGCTCAGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCGGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTA
17 17 79478423 79478523 100M AGCCTCGCTCAGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCGGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGAT
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17 17 79478462 79478562 100M GGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGAC
17 17 79478465 79478565 100M CCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGGGGGGGAGGGGGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAAT
17 17 79478468 79478568 100M GGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCC
17 17 79478471 79478571 100M CAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGC
17 17 79478474 79478574 100M CCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGT
17 17 79478477 79478577 100M GGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCG
17 17 79478480 79478580 100M CCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCC
17 17 79478483 79478583 100M GACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGA
17 17 79478486 79478586 100M GCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGC
17 17 79478489 79478589 100M GGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTA
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17 17 79478528 79478628 100M CCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGG
17 17 79478531 79478631 100M TGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGT
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17 17 79478540 79478640 100M CCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGA
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17 17 79478550 79479794 90M79479805F10m AGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCGCACTCT
17 17 79478550 79479794 90M79479805F10m AGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCGCACTCT
17 17 79478552 79479792 88M79479805F12m AGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCGCACTCTGT
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17 17 79478584 79479760 56M79479805F44m GCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGC
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17 17 79479812 79479339 54m373n46m TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479809 79479336 51m373n49m CAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479806 79479333 48m373n52m CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479803 79479330 45m373n55m TCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479800 79479327 42m373n58m CACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 79479785 79479312 27m373n73m CCGCTCCGCCGTTGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479782 79479309 24m373n76m CTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 79479773 79479300 15m373n85m CGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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genome shotgun sequence
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Sbjct 17311933 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 17311982
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shotgun sequence
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Sbjct 32257 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 32208
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sequence
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Sbjct 298621 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 298572
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Sbjct 123139655 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 123139704
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Sbjct 124377423 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 124377374
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Sbjct 126108818 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 126108769
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>ref|NT_009237.19| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR11_CTG1
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assembly
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>ref|NC_018922.2| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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>ref|NW_004929378.1| Homo sapiens chromosome 11 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 1763853 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 1763900
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Sbjct 1546218 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 1546171
>gb|CM000501.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 1146802 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 1146849
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 1758180 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 1758227
>gb|CH471158.1| Homo sapiens 211000035842702 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 1442529 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 1442576
>ref|AC_000143.1| Homo sapiens chromosome 11, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 1615894 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 1615941
>gb|CM000262.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 1862773 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 1862820
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Sbjct 175978189 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 175978238
>ref|NT_005612.17| Homo sapiens chromosome 3 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR3_CTG2_1
gb|GL000035.2| Homo sapiens chromosome 3 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Sbjct 82272615 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGACTGGGGTGCTGAAGGT 82272664
>ref|NC_018914.2| Homo sapiens chromosome 3, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001611.2| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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assembly
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genome shotgun sequence
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blast search - nt
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(LOC104681871), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 501 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 452
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mRNA
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Sbjct 263 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 214
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mRNA
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Sbjct 185 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 136
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Sbjct 589 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 540
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X2, mRNA
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Sbjct 683 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 634
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X1, mRNA
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Sbjct 564 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 515
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Sbjct 539 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 490
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Sbjct 572 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 523
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 253
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 440 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 391
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 490 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 441
>gb|KJ904414.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_13808 ACTG1
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Sbjct 490 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 441
>gb|KJ896370.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05764 ACTG1
gene, encodes complete protein
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Sbjct 490 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 441
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Sbjct 318 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 269
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mRNA
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Sbjct 403 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 354
>ref|XM_006722048.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 707 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 658
>ref|XM_006173153.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 280 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 231
>ref|XM_005883637.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 334 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 285
>ref|XM_005530673.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 504 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 455
>ref|XM_005521370.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC102110255), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 253
>ref|XM_005521369.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC102110255), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 502 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 453
>dbj|AB839002.1| Homo sapiens ACTG1 gene, DNA variation found in Japanese hearing
loss patients, c.485C>T: p.T162M
Length=413
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 67 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 18
>ref|XM_005056295.1| PREDICTED: Ficedula albicollis actin, gamma 1 (ACTG1), transcript
variant X2, mRNA
Length=1060
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 328 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 279
>ref|XM_005056294.1| PREDICTED: Ficedula albicollis actin, gamma 1 (ACTG1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1566
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 329 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 280
>ref|XR_193681.1| PREDICTED: Echinops telfairi actin, cytoplasmic 2-like (LOC101659333),
misc_RNA
Length=1160
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 457 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 408
>ref|XR_186995.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens actin, cytoplasmic 1-like
(LOC101372193), misc_RNA
Length=1856
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 509 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 460
>ref|XM_004394150.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1842
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 509 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 460
>ref|XM_002195880.2| PREDICTED: Taeniopygia guttata actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC100229883), mRNA
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 502 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 453
>gb|JF694322.1| Stygamoeba regulata strain ATCC 50892 clone 1 actin gene, partial
cds
Length=796
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 171 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 122
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 564 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 515
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 683 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 634
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 564 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 515
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 32080 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 32031
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 6237 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 6188
>gb|EU832621.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067650; DKFZo008B0831
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 447 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 398
>gb|EU832693.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067722; DKFZo004B0832
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 447 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 398
>emb|CU680176.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017126
5' read ACTG1 mRNA
Length=1134
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 441 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 392
>emb|CU676328.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100021914
5' read ACTG1 mRNA
Length=1161
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 441 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 392
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 497 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 448
>gb|EU176631.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011619; FLH263907.01L;
RZPDo839C03246D actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes
complete protein
Length=1168
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 447 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 398
>gb|DQ891374.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004004; FLH176328.01X; RZPDo839C01122D
actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes complete protein
Length=1168
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 447 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 398
>gb|BC021036.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3836590),
**** WARNING: chimeric clone ****
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clone ****
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>gb|AC137896.5| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-765O14, complete sequence
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>gb|AC139149.6| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-766D20, complete sequence
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>gb|AY892296.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116867.01L actin gamma
1 (ACTG1) mRNA, partial cds
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Sbjct 425 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 376
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gb|AF035774.1|AF035774 Equus caballus beta actin mRNA, complete cds
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Sbjct 425 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 376
>gb|M19283.1|HUMACTGA Human cytoskeletal gamma-actin gene, complete cds
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Sbjct 443 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 395
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 380
>ref|XM_006108323.1| PREDICTED: Myotis lucifugus beta-actin-like protein 2-like (LOC102426276),
transcript variant X1, mRNA
Length=1131
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 49
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 380
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mRNA
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Sbjct 327 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 278
>ref|XM_010596269.1| PREDICTED: Loxodonta africana actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1836
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 511 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 462
>ref|XM_010390714.1| PREDICTED: Corvus cornix cornix actin, gamma 2, smooth muscle,
enteric (ACTG2), mRNA
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Sbjct 2113 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 2064
>ref|XM_010359323.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin (LOC104659174), partial
mRNA
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>ref|XM_010305162.1| PREDICTED: Balearica regulorum gibbericeps actin, beta (ACTB),
partial mRNA
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 107 AGGGACAGCACGGCCTGGATTGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 58
>ref|XM_010074039.1| PREDICTED: Pterocles gutturalis actin, cytoplasmic 2-like (LOC104459850),
mRNA
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 287 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 238
>ref|XM_010177440.1| PREDICTED: Caprimulgus carolinensis actin, cytoplasmic 1-like
(LOC104517934), partial mRNA
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 59 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 10
>ref|XM_010132087.1| PREDICTED: Buceros rhinoceros silvestris actin, cytoplasmic type
5 (LOC104489878), transcript variant X3, mRNA
Length=1017
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 253
>ref|XM_010132086.1| PREDICTED: Buceros rhinoceros silvestris actin, cytoplasmic type
5 (LOC104489878), transcript variant X2, mRNA
Length=1151
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 436 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 387
>ref|XM_010132085.1| PREDICTED: Buceros rhinoceros silvestris actin, cytoplasmic type
5 (LOC104489878), transcript variant X1, mRNA
Length=1151
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 436 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 387
>ref|XM_009951687.1| PREDICTED: Leptosomus discolor actin, cytoplasmic 2-like (LOC104341226),
partial mRNA
Length=1089
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>ref|XM_009940336.1| PREDICTED: Opisthocomus hoazin actin, cytoplasmic 2-like (LOC104334680),
mRNA
Length=1020
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Query 4 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 300 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 254
>ref|XR_696453.1| PREDICTED: Cariama cristata actin, cytoplasmic 1-like (LOC104156782),
misc_RNA
Length=1048
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 62 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 13
>ref|XR_683351.1| PREDICTED: Phalacrocorax carbo actin, clone 302-like (LOC104045636),
misc_RNA
Length=1129
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 287 AGGGACAGCACGGCCTGGATAGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 238
>ref|XM_009440062.1| PREDICTED: Pan troglodytes putative beta-actin-like protein 3
(LOC749155), mRNA
Length=2099
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 1025 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 976
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mRNA
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Sbjct 533 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 484
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Sbjct 512 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 463
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Sbjct 503 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 454
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Sbjct 449 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGAGTGTTGAAGGT 400
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Sbjct 426 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 377
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Sbjct 433 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 384
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mRNA
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Sbjct 324 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 275
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(LOC102458464), mRNA
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Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATAGCCGGGGTGTTGAAGGT 253
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(LOC102458214), mRNA
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Sbjct 466 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATAGCCGGGGTGTTGAAGGT 417
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Sbjct 539 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGCGTTGAAGGT 490
>ref|XM_005878947.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 505 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 456
>ref|XM_005870207.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, cytoplasmic 1-like (LOC102251030),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 296 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 247
>ref|XM_005870206.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, cytoplasmic 1-like (LOC102251030),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 425 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 376
>ref|XM_003357928.2| PREDICTED: Sus scrofa actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 547 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 498
>ref|XM_003124280.3| PREDICTED: Sus scrofa actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 543 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 494
>ref|XM_005430046.1| PREDICTED: Geospiza fortis actin, cytoplasmic type 5-like (LOC102043209),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 253
>ref|XM_005430045.1| PREDICTED: Geospiza fortis actin, cytoplasmic type 5-like (LOC102043209),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 502 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 453
>gb|KC951429.2| Homo sapiens clone FOS_0064, complete sequence
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Sbjct 4774 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 4823
>ref|XR_213364.1| PREDICTED: Gallus gallus actin, cytoplasmic 2-like (LOC776816),
transcript variant X3, misc_RNA
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Sbjct 441 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 392
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 449 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 400
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 441 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 392
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mRNA
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Sbjct 442 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 393
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X2, mRNA
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Sbjct 296 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 247
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X1, mRNA
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Sbjct 470 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 421
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X2, mRNA
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Sbjct 236 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 187
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X1, mRNA
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Sbjct 383 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 334
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Sbjct 429 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 380
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variant 2 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 683 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGAGTGTTGAAGGT 634
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variant 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 589 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGAGTGTTGAAGGT 540
>ref|XM_004032554.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla POTE ankyrin domain family
member I-like (LOC101139634), partial mRNA
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Sbjct 1668 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 1619
>gb|JQ284425.1| Myotis laniger isolate SE actin beta (ACTB) mRNA, partial cds
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Sbjct 73 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 24
>gb|JQ284424.1| Nyctalus noctula isolate S actin beta (ACTB) mRNA, partial cds
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Sbjct 75 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 26
>gb|JQ284420.1| Hipposideros armiger isolate DMT actin beta (ACTB) mRNA, partial
cds
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Sbjct 123 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 74
>dbj|AK392362.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10068C07, expressed in hypothalamus
Length=2046
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Sbjct 521 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 472
>emb|FR750355.1| Lithobius peregrinus partial mRNA for actin (act gene)
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Sbjct 194 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 145
>gb|JF288784.1| Litopenaeus vannamei beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 214 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 165
>gb|JF830811.1| Bubalus bubalis beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 85 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 36
>gb|AC188702.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-300D15 from chromosome 2, complete
sequence
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Sbjct 101392 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 101343
>gb|HQ682101.1| Ixodes ricinus beta actin mRNA, partial cds
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Sbjct 425 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|HM358990.1| Homo sapiens clone HepG-2 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358987.1| Homo sapiens clone HepG-13 actin-like mRNA, partial sequence
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358985.1| Homo sapiens clone HepG-14 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358981.1| Homo sapiens clone HepG-17 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358980.1| Homo sapiens clone HepG-7 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358970.1| Homo sapiens clone Huh7-4 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358969.1| Homo sapiens clone Huh7-5 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358966.1| Homo sapiens clone Huh7-8 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|HM358957.1| Homo sapiens clone Hep3-17 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>ref|XM_002931126.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca actin, cytoplasmic 2-like (LOC100466132),
mRNA
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Sbjct 1199 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 1150
>ref|XM_001110688.2| PREDICTED: Macaca mulatta actin, gamma 1, transcript variant
1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 341 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 292
>ref|XM_001110892.2| PREDICTED: Macaca mulatta actin, gamma 1, transcript variant
4 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 496 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 447
>gb|GU645247.1| Marsupenaeus japonicus isolate 14-69 actin mRNA, complete cds
gb|GU645581.1| Marsupenaeus japonicus isolate 0630 actin gene, complete cds
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645246.1| Marsupenaeus japonicus isolate 13 actin mRNA, complete cds
gb|GU645580.1| Marsupenaeus japonicus isolate 05 actin gene, complete cds
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645238.1| Marsupenaeus japonicus isolate 05 actin mRNA, complete cds
gb|GU645579.1| Marsupenaeus japonicus isolate 04 actin gene, complete cds
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645235.1| Marsupenaeus japonicus isolate 02 actin mRNA, complete cds
gb|GU645577.1| Marsupenaeus japonicus isolate 02 actin gene, complete cds
Length=1131
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645237.1| Marsupenaeus japonicus isolate 04 actin mRNA, complete cds
gb|GU645576.1| Marsupenaeus japonicus isolate 01 actin gene, complete cds
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|HM053699.1| Eriocheir sinensis beta actin mRNA, complete cds
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 621 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 572
>gb|GU645245.1| Marsupenaeus japonicus isolate 12 actin mRNA, complete cds
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645244.1| Marsupenaeus japonicus isolate 11 actin mRNA, complete cds
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645243.1| Marsupenaeus japonicus isolate 10 actin mRNA, complete cds
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645242.1| Marsupenaeus japonicus isolate 09 actin mRNA, complete cds
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645241.1| Marsupenaeus japonicus isolate 08 actin mRNA, complete cds
Length=1131
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645236.1| Marsupenaeus japonicus isolate 03 actin mRNA, complete cds
Length=1131
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU645234.1| Marsupenaeus japonicus isolate 01 actin mRNA, complete cds
Length=1131
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 379
>gb|GU001950.1| Anguilla japonica beta actin mRNA, partial cds
Length=1527
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Sbjct 401 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 352
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Sbjct 393 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 344
>gb|FJ423085.1| Elephas maximus isolate 07-C beta actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 393 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 344
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Sbjct 384 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 335
>gb|FJ423083.1| Elephas maximus isolate 06-15 beta actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 382 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 333
>gb|FJ423082.1| Elephas maximus isolate 06-8 beta actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 351 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 302
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Sbjct 305 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAA 259
>gb|DQ212697.1| Phoca vitulina cytoplasmic beta actin mRNA, partial cds
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Sbjct 147 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 98
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Length=544
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Sbjct 189 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 140
>gb|AF300705.2| Litopenaeus vannamei beta-actin mRNA, complete cds
Length=1320
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Sbjct 499 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 450
>gb|DQ661647.1| Bubalus bubalis beta-actin mRNA, complete cds
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Sbjct 435 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 386
>gb|DQ845171.1| Sus scrofa beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 91 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGGT 42
>gb|AC184154.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-487P23 from chromosome 2, complete
sequence
Length=189773
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Sbjct 36771 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 36820
>gb|AC182395.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-484N21 from chromosome 2, complete
sequence
Length=176398
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 86534 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 86485
>gb|AY651918.1| Macrobrachium rosenbergii beta-actin (c57) mRNA, complete cds
Length=1357
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 539 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 490
>gb|AY550069.1| Sus scrofa cytoskeletal beta actin mRNA, partial cds
Length=1862
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Sbjct 512 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 463
>gb|AY486467.1| Litopenaeus vannamei clone Hmgi119-T3 actin E mRNA, partial cds
Length=765
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 486 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 437
>gb|AY486466.1| Litopenaeus vannamei clone Hmgi149-T3 actin D mRNA, partial cds
Length=967
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 503 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 454
>ref|NM_001284724.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925802 (LOC101925802),
mRNA
dbj|AB169918.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QflA-11253, similar to
human actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA, RefSeq: NM_001614.2
Length=1971
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 535 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 486
>gb|AY970464.1| Homo sapiens isolate 3T-16 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|AY970463.1| Homo sapiens isolate 3T-15 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|AY970461.1| Homo sapiens isolate 3T-13 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|AY970448.1| Homo sapiens isolate 3N-12 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|AY970392.1| Homo sapiens isolate 1T-9 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>gb|AY970385.1| Homo sapiens isolate 1T-2 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 178 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
>emb|AJ719605.1| Gallus gallus mRNA for hypothetical protein, clone 4h19
Length=728
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 512 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCAGGGGTGTTGAAGGT 463
>gb|AC132479.2| Homo sapiens BAC clone RP11-769N11 from 2, complete sequence
Length=168824
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 139515 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 139564
>gb|AC093838.3| Homo sapiens BAC clone RP11-433A19 from 2, complete sequence
Length=178029
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 105556 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 105507
>gb|AY014272.1| Homo sapiens FKSG30 (FKSG30) mRNA, complete cds
Length=1401
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 449 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 400
>gb|AC122731.16| Pan troglodytes clone rp43-14d7, complete sequence
Length=166903
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 67833 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 67882
>dbj|AB107655.1| Lama glama mRNA for beta actin, partial cds
Length=900
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 197 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 148
>dbj|AB055975.1| Marsupenaeus japonicus mRNA for actin, complete cds
Length=1327
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 500 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 451
>dbj|AB035660.1| Branchiostoma belcheri BbNA1 mRNA for notochord actin, complete
cds
Length=1491
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 488 AGGGACAGGACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 439
>gb|AF199487.1|AF199487 Anolis carolinensis beta-actin mRNA, partial cds
Length=1020
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 362 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAGGT 313
>gb|M26111.1|GOOACTB Goose beta-actin mRNA, complete cds
Length=1994
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 451
>ref|XM_008160295.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X2, mRNA
ref|XM_008161633.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus beta-actin-like protein 2 (LOC103304846),
transcript variant X2, mRNA
Length=1005
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Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 49
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Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTCGAAGG 254
>ref|XM_008160294.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X1, mRNA
ref|XM_008161632.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus beta-actin-like protein 2 (LOC103304846),
transcript variant X1, mRNA
Length=1131
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 49
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTCGAAGG 380
>ref|XM_008056274.1| PREDICTED: Tarsius syrichta actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X2, mRNA
Length=1005
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 302 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGG 254
>ref|XM_008056273.1| PREDICTED: Tarsius syrichta actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X1, mRNA
Length=1411
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 533 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAAGG 485
>ref|XM_005874162.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, beta-like 2 (ACTBL2), mRNA
Length=1065
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 49
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 AGGGACAGCACCGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGG 257
>ref|NG_021768.2| Homo sapiens actin, beta pseudogene (LOC390029) on chromosome
11
Length=1700
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 609 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 562
>ref|XM_006195401.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, cytoplasmic 2-like (LOC102506464),
mRNA
Length=1204
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAG 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 501 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAG 454
>ref|XM_006195314.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, cytoplasmic 2-like (LOC102514892),
mRNA
Length=1204
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAG 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 501 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAG 454
>ref|XM_006192915.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, cytoplasmic 1-like (LOC102516333),
mRNA
Length=924
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAG 48
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 224 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAG 177
>gb|JQ284421.1| Myotis ricketti isolate DZSE actin beta (ACTB) mRNA, partial
cds
Length=511
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 79 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACMTGGCGGGGGTGTTGAAGGT 30
>gb|FJ217207.1| Homarus americanus skeletal muscle actin 2 mRNA, complete cds
Length=1395
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAG 48
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Sbjct 428 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGGGTGTTGAAG 381
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sequence
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Sbjct 42319 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 42366
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cds
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Query 3 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 176 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 129
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Length=55001
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Sbjct 40997 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGAGGTGTTGAAGGT 40950
>gb|AC068580.23| Homo sapiens chromosome 11, clone RP11-295K3, complete sequence
Length=120298
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Query 3 GGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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mRNA
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Sbjct 62 AGGGACAGCACAGCCTGGATAGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 13
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misc_RNA
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Sbjct 296 AGGGACAGCACAGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTATTGAAGGT 247
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(LOC744297), misc_RNA
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Sbjct 1248 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTTCATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 1199
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2429 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 2383
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variant X2, mRNA
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Sbjct 422 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGCGTGTTGAAGGT 373
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variant X1, mRNA
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Sbjct 502 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCGGGCGTGTTGAAGGT 453
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mRNA
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Sbjct 503 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGCGTGTTGAA 457
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variant X2, mRNA
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Sbjct 248 GACAGCACCGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 202
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variant X1, mRNA
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Sbjct 457 GACAGCACCGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 411
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Sbjct 468 GACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 422
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Sbjct 519 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATCGCTGGGGTGTTGAAGGT 470
>ref|XM_006712538.1| PREDICTED: Homo sapiens POTE ankyrin domain family, member E
(POTEE), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1348 AGGGACGGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCTGGGGTGTTGAAGGT 1299
>ref|XM_001120262.3| PREDICTED: Apis mellifera actin, indirect flight muscle-like
(LOC725851), mRNA
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 298 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGACTGTTGAAGGT 249
>ref|XM_006569904.1| PREDICTED: Apis mellifera actin, clone 205-like (LOC410075),
mRNA
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 318 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGACTGTTGAAGGT 269
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transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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>ref|XM_003251416.2| PREDICTED: Apis mellifera actin, clone 205-like (LOC551176),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 727 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGACTGTTGAAGGT 678
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mRNA
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Query 1 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT 50
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Sbjct 735 AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGACTGTTGAAGGT 686
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1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG
>ref|XM_006722049.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X2, mRNA
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Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 92 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 141
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X1, mRNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 92 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 141
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 68 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 117
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
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Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 68 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 117
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
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Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 68 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 117
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
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Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 5003 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 5052
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
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Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 2 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 51
>gb|AC139149.6| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-766D20, complete sequence
Length=81577
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Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 18623 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 18672
>gb|M37130.1|HUMGACTA1 Human gamma-actin pseudogene, 5' end
Length=348
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 51
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 30846 CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 30895
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
>gb|AC137896.5| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-765O14, complete sequence
Length=107289
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7828 CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 7779
>gb|M19283.1|HUMACTGA Human cytoskeletal gamma-actin gene, complete cds
Length=3583
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 477 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCCCTCCGCCG 526
>dbj|AK304637.1| Homo sapiens cDNA FLJ57283 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1387
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 4 AGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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Sbjct 1 AGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 47
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Gapped
Lambda K H
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17 17 79478447 79478547 100M TGAGGTAGTCGGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTC
17 17 79478450 79478550 100M GGTAGTCGGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGAGGGGCACCGTGTGGGGGACCCCGTCTCC
17 17 79478453 79478553 100M AGTCGGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGA
17 17 79478456 79478556 100M CGGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTC
17 17 79478459 79478559 100M TCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCAT
17 17 79478462 79478562 100M GGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGAC
17 17 79478465 79478565 100M CCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGGGGGGGAGGGGGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAAT
17 17 79478468 79478568 100M GGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCC
17 17 79478471 79478571 100M CAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGC
17 17 79478474 79478574 100M CCAGGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGT
17 17 79478477 79478577 100M GGTCCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCG
17 17 79478480 79478580 100M CCAGACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCC
17 17 79478483 79478583 100M GACGCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGA
17 17 79478486 79478586 100M GCAGGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGC
17 17 79478489 79478589 100M GGATGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTA
17 17 79478492 79478592 100M TGGCGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGGGAGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAG
17 17 79478495 79478595 100M CGTGGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGGGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGA
17 17 79478498 79478598 100M GGGGGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAG
17 17 79478501 79478601 100M GGAGGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGGGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCAC
17 17 79478504 79478604 100M GGGCGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGC
17 17 79478507 79478607 100M CGTAGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTG
17 17 79478510 79478610 100M AGCCCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCAGGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACGGCACGGCCTGGAT
17 17 79478513 79478613 100M CCTCGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGCCCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGC
17 17 79478516 79478616 100M CGTAGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGCGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCAC
17 17 79478519 79478619 100M AGATGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTA
17 17 79478522 79478622 100M TGGGCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACAT
17 17 79478525 79478625 100M GCACCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGGCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTAAATGGC
17 17 79478528 79478628 100M CCGTGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGG
17 17 79478531 79478631 100M TGTGGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGT
17 17 79478534 79478634 100M GGGTGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTT
17 17 79478537 79478637 100M TGACCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGGGTTGAA
17 17 79478540 79478640 100M CCCCGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGA
17 17 79478543 79478643 100M CGTCTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGGCTC
17 17 79478546 79478646 100M CTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGACTCAAA
17 17 79478546 79479818 94M79479825F6m CTCCAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGAGTTGAAGGT CTCAGT
17 17 79478549 79479815 91M79479825F9m CAGAGGCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGC
17 17 79478549 79479815 91M79479825F9m CAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGC
17 17 79478549 79479815 91M79479825F9m CAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCCCGGCCTGGACGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGC
17 17 79478549 79479815 91M79479825F9m CAGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGC
17 17 79478550 79479814 90M79479825F10m AGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGCGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCC
17 17 79478550 79479814 90M79479825F10m AGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCC
17 17 79478550 79479814 90M79479825F10m AGAGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCC
17 17 79478552 79479812 88M79479825F12m AGTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGC
17 17 79478553 79479811 87M79479825F13m GTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCT
17 17 79478553 79479811 87M79479825F13m GTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCT
17 17 79478553 79479811 87M79479825F13m GTCCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCT
17 17 79478555 79479809 85M79479825F15m CCATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGC
17 17 79478555 79479809 85M79479825F15m CCATGACAATGCCAGAGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGC
17 17 79478556 79479808 84M79479825F16m CATGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCC
17 17 79478558 79479806 82M79479825F18m TGACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAG
17 17 79478559 79479805 81M79479825F19m GACAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAAC
17 17 79478561 79479803 79M79479825F21m CAATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAACTC
17 17 79478563 79479801 77M79479825F23m ATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTC
17 17 79478563 79479801 77M79479825F23m ATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTC
17 17 79478563 79479801 77M79479825F23m ATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTC
17 17 79478563 79479801 77M79479825F23m ATGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTC
17 17 79478564 79479800 76M79479825F24m TGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCG
17 17 79478564 79479800 76M79479825F24m TGCCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCG
17 17 79478566 79479798 74M79479825F26m CCAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCA
17 17 79478567 79479797 73M79479825F27m CAGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCAC
17 17 79478568 79479796 72M79479825F28m AGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTGCATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACT
17 17 79478568 79479796 72M79479825F28m AGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACT
17 17 79478568 79479796 72M79479825F28m AGTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACT
17 17 79478569 79479795 71M79479825F29m GTGGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGTCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTC
17 17 79478571 79479793 69M79479825F31m GGTGCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTG
17 17 79478574 79479790 66M79479825F34m GCGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTC
17 17 79478575 79479789 65M79479825F35m CGCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCT
17 17 79478576 79479788 64M79479825F36m GCCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTT
17 17 79478579 79479785 61M79479825F39m CAGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATTGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCG
17 17 79478580 79479784 60M79479825F40m AGAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGC
17 17 79478581 79479783 59M79479825F41m GAGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCC
17 17 79478582 79479782 58M79479825F42m AGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCG
17 17 79478582 79479782 58M79479825F42m AGGCGTAGAGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCG
17 17 79478590 79479774 50M79479825F50m AGGGACAGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG
17 17 79478596 79479768 44M79479825F56m AGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGT
17 17 79478596 79479383 44M79479825F54m385n2m AGCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79478597 79479767 43M79479825F57m GCACGGCCTGGATGGCCACGTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTT
17 17 79478616 79479375 24M79479825F66m373n10m GTACATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79478619 79479372 21M79479825F66m373n13m CATGGCCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79478624 79479367 16M79479825F66m373n18m CCGGGGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCCCTGCCACCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79478628 79479363 12M79479825F66m373n22m GGTGTTGAAGGT CTCAGTCGCCGCTGCCACCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79478636 79479355 4M79479825F66m373n30m AGGT CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79478636 79479355 4M79479825F66m373n30m GGGT CTCAGCCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79478637 79479354 3M79479825F66m373n31m GGT CTCGGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479830 79479357 72m373n28m GTCGGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479827 79479354 69m373n31m GGTCTCGGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479824 79479351 66m373n34m CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479820 79479347 62m373n38m GCCGCCGCTGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479817 79479344 59m373n41m GCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479814 79479341 56m373n44m GCTGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479811 79479337 28m1d24m373n48m GCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCDCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479808 79479323 38m385n62m AGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479805 79479332 47m373n53m TCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479802 79479329 44m373n56m CGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479799 79479326 41m373n59m ACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479796 79479323 38m373n62m CTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479793 79479320 35m373n65m TTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479790 79479317 32m373n68m TTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479787 79479314 29m373n71m CGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479784 79479311 26m373n74m CGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479781 79479308 23m373n77m TCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479778 79479305 20m373n80m GCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479775 79479302 17m373n83m GTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479772 79479299 14m373n86m GCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 79479744 79479644 100m CCGGGGCCTGAGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAG
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17 17 79479734 79479380 95m254n5m AGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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shotgun sequence
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>gb|DS990810.1| Homo sapiens SCAF_1112675837216 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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sequence
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>ref|NW_001838951.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188395, whole genome shotgun sequence
gb|DS486048.1| Homo sapiens SCAF_1103279188395 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>ref|NW_001838849.2| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188271, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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>gb|CH471084.1| Homo sapiens 211000035840020 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 126188117 GCCACATGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 126188166
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>ref|AC_000134.1| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 7 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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HSCHR14_CTG1
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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HSCHR15_CTG8
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HSCHR22_CTG2
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Sbjct 567458 GCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 567409
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genome shotgun sequence
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Query 7 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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genome shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 19989277 GCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 19989326
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genome shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 35203594 GCCACACGGAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 35203643
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genome shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 16256897 GCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 16256946
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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Query 7 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 586131 GCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 586082
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 989277 GCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 989326
>ref|NW_004929398.1| Homo sapiens chromosome 15 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 6028044 GCCACACGGAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 6028093
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shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 912578 GCCACACACAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 912529
>gb|GL583246.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_266, whole genome
shotgun sequence
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Query 7 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 1546092 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1546049
>gb|GL583330.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_350, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 259114 GCCACACACAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 259163
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Query 7 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 1615996 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1616039
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 21105467 GCCACACACAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 21105516
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 11931169 GCCACACGGAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 11931218
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shotgun sequence
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Sbjct 30085559 GCCACACACAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 30085510
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shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 17311956 GCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 17312005
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 139116840 GCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 139116791
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Query 7 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 1146928 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1146971
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 22326537 GCCACACACAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 22326586
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 12570753 GCCACACGGAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 12570802
>gb|CH003458.1| Homo sapiens chromosome 11, whole genome shotgun sequence
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Query 7 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 1758306 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1758349
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Sbjct 20626327 GCCACACACAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 20626376
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 10989762 GCCACACGGAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 10989811
>gb|CH471082.1| Homo sapiens 211000035835546 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 269388 GCCACACACAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 269437
>ref|NW_001838859.2| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188159, whole genome shotgun sequence
gb|DS486065.1| Homo sapiens SCAF_1103279188159 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188258, whole genome shotgun sequence
gb|DS486033.1| Homo sapiens SCAF_1103279188258 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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shotgun sequence
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Query 7 CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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genome shotgun sequence
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 53162933 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 53162974
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 927676 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 927717
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shotgun sequence
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 2384355 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 2384314
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 50237777 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50237818
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 35330807 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 35330848
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 56307779 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 56307738
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 52530114 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 52530155
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sequence
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 163297 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 163338
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shotgun sequence
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 50237764 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50237805
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 57002059 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 57002100
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 139494107 GCCACATGCAGCTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 139494058
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 69023043 GCCACATGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 69022994
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 50058938 GCCACACGCAGTTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50058987
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HSCHR3_CTG2_1
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assembly
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 45788533 GCCACATGCAGCTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 45788484
>ref|NT_030059.14| Homo sapiens chromosome 10 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR10_CTG5
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assembly
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 27329522 GCCACATGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 27329473
>ref|NT_010498.16| Homo sapiens chromosome 16 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR16_CTG3_1
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assembly
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 3678256 GCCACACGCAGTTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 3678305
>ref|NC_018921.2| Homo sapiens chromosome 10, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001618.2| Homo sapiens chromosome 10, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 71064549 GCCACATGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 71064500
>ref|NC_018927.2| Homo sapiens chromosome 16, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001624.2| Homo sapiens chromosome 16, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 51500102 GCCACACGCAGTTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 51500151
>ref|NW_004929323.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39309634 GCCACATGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 39309683
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 5988613 CAGCTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 5988572
>ref|NW_004929376.1| Homo sapiens chromosome 10 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150160.1| Homo sapiens chromosome 10 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 21704111 GCCACATGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 21704062
>ref|NW_004929402.1| Homo sapiens chromosome 16 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150186.1| Homo sapiens chromosome 16 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 3707394 GCCACACGCAGTTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 3707443
>gb|KE141165.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold6, whole genome
shotgun sequence
Length=52036405
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20162921 GCCACATGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 20162872
>gb|KE141170.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold79, whole genome
shotgun sequence
Length=23432061
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 4820953 GCCACATGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 4821002
>gb|KE141270.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold197, whole genome
shotgun sequence
Length=9590013
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3694903 GCCACACGCAGTTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 3694952
>gb|KE141304.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold250, whole genome
shotgun sequence
Length=9214068
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229177 GCCACACGGAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 229226
>gb|GL582980.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_0, whole genome
shotgun sequence
Length=48689161
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 4851446 GCCACATGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 4851495
>gb|GL583013.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_33, whole genome
shotgun sequence
Length=18627076
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 15003386 GCCACACGCAGTTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 15003337
>gb|GL583144.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_164, whole genome
shotgun sequence
Length=4966260
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Sbjct 4624881 GCCACATGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 4624930
>gb|GL583180.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_200, whole genome
shotgun sequence
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Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Sbjct 225027 GCCACACGGAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 225076
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Length=128985077
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sequence
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sequence
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sequence
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sequence
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGT 49
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shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGT 49
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Sbjct 143629846 GCCACATGCAGCTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGT 143629798
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Sbjct 137028805 GCCACATGCAGCTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGT 137028757
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gb|DS486015.1| Homo sapiens SCAF_1103279188385 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGT 49
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Sbjct 54840628 GCCACATGCAGCTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGT 54840676
>ref|AC_000135.1| Homo sapiens chromosome 3, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGT 49
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Sbjct 136588403 GCCACATGCAGCTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGT 136588355
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shotgun sequence
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9587230 CAGCTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 9587189
>gb|GL583318.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_338, whole genome
shotgun sequence
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Query 9 CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102714 CAGCTTGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 102673
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC
>ref|NC_000017.11| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000679.2| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 reference primary assembly
Length=83257441
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Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81512801 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 81512752
>ref|NT_010783.16| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR17_CTG4
gb|GL000132.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=54806562
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 54576821 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 54576772
>ref|NC_018928.2| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=81289577
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 79566108 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTTTTCCGCCGCTCCGC 79566059
>ref|NW_004929407.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150191.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=54469784
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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gb|DS486315.1| Homo sapiens SCAF_1103279188205 genomic scaffold, whole genome
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shotgun sequence
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC
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mRNA
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partial mRNA
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mRNA
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muscle (ACTA1), mRNA
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Sbjct 169 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 120
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mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 308 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 259
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transcript variant X1, mRNA
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(ACTA1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 296 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 247
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 309 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 260
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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gene, encodes complete protein
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>gb|KJ904414.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_13808 ACTG1
gene, encodes complete protein
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 355 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 306
>gb|KJ896370.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05764 ACTG1
gene, encodes complete protein
Length=1257
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 355 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 306
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(ACTA1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 417 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 368
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misc_RNA
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Sbjct 514 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 465
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mRNA
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Sbjct 368 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 319
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variant X3, mRNA
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Sbjct 409 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 360
>ref|XM_961322.3| PREDICTED: Tribolium castaneum actin, muscle (LOC655409), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 433 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 384
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variant X1, mRNA
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Sbjct 419 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 370
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variant X1, mRNA
ref|XM_008161632.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus beta-actin-like protein 2 (LOC103304846),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 293 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 244
>ref|XM_008158627.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus actin, alpha 1, skeletal muscle (ACTA1),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 302 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 253
>ref|XM_008156007.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus actin, beta (ACTB), transcript variant
X2, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 293 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 244
>ref|XM_007959588.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer actin, gamma 1 (ACTG1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 295 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 246
>ref|XM_007635938.1| PREDICTED: Cricetulus griseus actin, gamma 1 (Actg1), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 65 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 16
>ref|XM_007613884.1| PREDICTED: Cricetulus griseus actin, gamma 1 (Actg1), transcript
variant X3, partial mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 361 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 312
>ref|XM_003510702.2| PREDICTED: Cricetulus griseus actin, gamma 1 (Actg1), transcript
variant X2, partial mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 361 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 312
>ref|XM_003496882.2| PREDICTED: Cricetulus griseus actin, gamma 1 (Actg1), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 364 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 315
>ref|XM_001514241.3| PREDICTED: Ornithorhynchus anatinus actin, alpha cardiac-like
(LOC100083726), partial mRNA
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Sbjct 259 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 210
>ref|XM_007664785.1| PREDICTED: Ornithorhynchus anatinus actin, alpha cardiac muscle
1-like (LOC100086207), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 373 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 324
>ref|XM_001515099.3| PREDICTED: Ornithorhynchus anatinus actin, cytoplasmic type 5
(LOC100092493), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 404 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 355
>ref|XM_007525054.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus actin, beta (ACTB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1172
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 325 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 276
>ref|XM_007497747.1| PREDICTED: Monodelphis domestica actin, alpha skeletal muscle
3-like (LOC100014836), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 196 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 147
>ref|XM_007099085.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 341 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 292
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Sbjct 336 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 287
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Sbjct 377 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 328
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X2, mRNA
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Sbjct 572 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 523
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X1, mRNA
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Sbjct 572 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 523
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 361 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 312
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mRNA
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Sbjct 387 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 338
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 293 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 244
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 293 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 244
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mRNA
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Sbjct 394 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 345
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Sbjct 404 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 355
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variant X1, mRNA
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Sbjct 324 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 275
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Sbjct 170 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 121
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protein (CCSAP), mRNA
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Sbjct 161 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 112
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(ACT-1) mRNA, complete cds
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Sbjct 353 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 304
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cds
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Sbjct 297 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 248
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cds
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Sbjct 408 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 359
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mRNA, complete cds
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Sbjct 344 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 295
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cds
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Sbjct 309 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 260
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mRNA, complete cds
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 327 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 278
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mRNA, complete cds
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Sbjct 309 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 260
>ref|XM_005780485.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 putative actin (ACT-5) mRNA, complete
cds
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 125 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 76
>ref|XM_005770879.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 actin/actin-related protein alternative
(ACT-7) mRNA, complete cds
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 353 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 304
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cds
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 351 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 302
>ref|XM_005766710.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 putative actin (ACT-10) mRNA, complete
cds
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 408 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 359
>ref|XM_005766708.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 putative actin (ACT-9) mRNA, complete
cds
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 415 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 366
>ref|XM_005621020.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 400 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 351
>ref|XM_005621019.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 400 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 351
>ref|XM_005618839.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris actin, alpha 1, skeletal muscle
(ACTA1), mRNA
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Sbjct 451 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 402
>ref|XM_005642601.1| Coccomyxa subellipsoidea C-169 Actin/actin-like protein (COCSUDRAFT_60601)
mRNA, complete cds
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 296 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 247
>ref|XM_005521369.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC102110255), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 367 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 318
>ref|XM_005430045.1| PREDICTED: Geospiza fortis actin, cytoplasmic type 5-like (LOC102043209),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 367 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 318
>ref|XM_005436348.1| PREDICTED: Falco cherrug actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 179 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 130
>ref|XM_005397842.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera actin, beta (Actb), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 405 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 356
>ref|XM_005320388.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus actin, alpha 1, skeletal
muscle (Acta1), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 384 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 335
>ref|XM_005320387.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus actin, alpha 1, skeletal
muscle (Acta1), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 379 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 330
>ref|XM_005320386.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus actin, alpha 1, skeletal
muscle (Acta1), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 397 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 348
>ref|XM_005237500.1| PREDICTED: Falco peregrinus actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 176 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 127
>ref|XM_005051584.1| PREDICTED: Ficedula albicollis actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC101808355), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 359 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 310
>ref|XM_005029859.1| PREDICTED: Anas platyrhynchos actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC101792739), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 323 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 274
>ref|XM_005020223.1| PREDICTED: Anas platyrhynchos actin, alpha 1, skeletal muscle
(ACTA1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 251 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 202
>ref|XM_004898171.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, alpha 1, skeletal muscle
(Acta1), mRNA
ref|XM_004854689.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, alpha 1, skeletal muscle
(Acta1), mRNA
Length=1356
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 382 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 333
>ref|XM_004811049.1| PREDICTED: Mustela putorius furo actin, gamma 1 (ACTG1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1966
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Sbjct 310 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 261
>ref|XM_004748712.1| PREDICTED: Mustela putorius furo actin, gamma 1 (ACTG1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1986
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 330 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 281
>ref|XM_004695506.1| PREDICTED: Condylura cristata actin, cytoplasmic 2-like (LOC101631398),
mRNA
Length=1161
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 307 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 258
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misc_RNA
Length=1171
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 290 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 241
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 295 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 246
>ref|XM_004621046.1| PREDICTED: Sorex araneus actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1096
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 248 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 199
>ref|XM_004617349.1| PREDICTED: Sorex araneus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1302
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Sbjct 294 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 245
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mRNA
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Sbjct 164 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 115
>ref|XM_004592850.1| PREDICTED: Ochotona princeps actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 164 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 115
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 385 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 336
>ref|XM_004453368.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus actin, alpha 1, skeletal muscle
(ACTA1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 334 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 285
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mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 364 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 315
>ref|XM_002195880.2| PREDICTED: Taeniopygia guttata actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC100229883), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 367 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 318
>ref|XM_003274823.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys actin, gamma 1, transcript variant
2 (ACTG1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 549 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 500
>ref|XM_003274822.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys actin, gamma 1, transcript variant
1 (ACTG1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 429 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 380
>ref|XM_004040825.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, gamma 1, transcript
variant 2 (ACTG1), mRNA
Length=3277
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 548 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 499
>ref|XM_004040824.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, gamma 1, transcript
variant 1 (ACTG1), mRNA
Length=3183
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 454 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 405
>gb|JN714258.1| Auxenochlorella protothecoides actin gene, complete cds
Length=3115
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 1555 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1506
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 429 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 380
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 548 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 499
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 429 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 380
>ref|NM_001195845.1| Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), mRNA
Length=2173
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 436 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 387
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 31669 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 31620
>ref|XM_002601891.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1181
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 302 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 253
>gb|FJ456915.1| Paulinella chromatophora strain FK01 actin gene, partial cds
Length=983
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 203 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 154
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 5826 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 5777
>dbj|AK304637.1| Homo sapiens cDNA FLJ57283 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1387
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 359 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 310
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 362 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 313
>gb|EU832621.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067650; DKFZo008B0831
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 312 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 263
>gb|EU832693.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067722; DKFZo004B0832
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 312 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 263
>emb|CU680176.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017126
5' read ACTG1 mRNA
Length=1134
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 306 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 257
>emb|CU676328.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100021914
5' read ACTG1 mRNA
Length=1161
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 306 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 257
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 362 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 313
>gb|EU176631.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011619; FLH263907.01L;
RZPDo839C03246D actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes
complete protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 312 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 263
>ref|XM_001518477.1| PREDICTED: Ornithorhynchus anatinus actin, alpha skeletal muscle
3 (LOC100088994), partial mRNA
Length=990
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 296 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 247
>ref|NM_001134769.1| Pan troglodytes actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
dbj|AB222159.1| Pan troglodytes verus actg1 mRNA for actin, gamma 1, complete
cds, clone: PstA5646
Length=1942
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 362 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 313
>gb|DQ891374.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004004; FLH176328.01X; RZPDo839C01122D
actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes complete protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 312 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 263
>gb|DQ356678.1| Caecitellus sp. KMT-2006 actin gene, partial cds
Length=861
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 108 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 59
>gb|DQ826531.1| Chinchilla lanigera beta-actin mRNA, partial cds
Length=351
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 268 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 219
>gb|BC021036.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3836590),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=3405
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 1951 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1902
>gb|BC023606.1| Homo sapiens mRNA similar to actin, beta (cDNA clone IMAGE:4640691)
Length=2527
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 1100 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1051
>gb|BC019044.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4635339, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2503
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1030
>gb|BC021033.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3832154, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1051
>gb|DQ211891.1| Epiphyas postvittana actin gene, partial cds
Length=854
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 116 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 67
>gb|BT019856.1| Homo sapiens actin, gamma 1 mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 290 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 241
>gb|BC007442.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:4484 IMAGE:2962953),
complete cds
Length=1938
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 349 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 300
>gb|BC053572.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:61615 IMAGE:3865767),
complete cds
Length=1912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 293
>gb|BC000292.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:8332 IMAGE:2819345),
complete cds
Length=1940
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 355 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 306
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Sbjct 349 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 300
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Sbjct 348 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 299
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Sbjct 351 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 302
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Sbjct 290 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 241
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Sbjct 256 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 207
>gb|S64192.1| type 5 actin [Emiliania huxleyi=Prymnesiophyte algae, CCMP379,
mRNA Partial, 629 nt]
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Sbjct 260 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 211
>gb|S64191.1| type 4 actin [Emiliania huxleyi=Prymnesiophyte algae, CCMP379,
mRNA Partial, 629 nt]
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Sbjct 260 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 211
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mRNA Partial, 629 nt]
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Sbjct 260 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 211
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mRNA Partial, 629 nt]
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Sbjct 260 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 211
>gb|S64188.1| type 1 actin {type 1} [Emiliania huxleyi=Prymnesiophyte algae,
CCMP379, mRNA Partial, 1095 nt]
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Sbjct 260 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 211
>emb|AJ719605.1| Gallus gallus mRNA for hypothetical protein, clone 4h19
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 377 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 328
>emb|AJ719332.1| Gallus gallus mRNA for hypothetical protein, clone 1h13
Length=1984
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 377 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 328
>gb|BC009848.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:15376 IMAGE:3939552),
complete cds
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Sbjct 346 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 297
>dbj|AB086243.1| Coryphaenoides yaquinae mRNA for skeletal alpha-actin type-2b,
complete cds
Length=1401
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Sbjct 296 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 247
>dbj|AB086241.1| Coryphaenoides armatus mRNA for skeletal alpha-actin type-2b,
complete cds
Length=1401
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 296 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 247
>gb|AF276076.1|AF276076 Ambystoma mexicanum cardiac actin mRNA, complete cds
Length=1565
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 349 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 300
>emb|Z70044.1| C.familiaris mRNA for beta-actin
Length=553
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 226 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 177
>emb|X00255.1| Gardner-Rasheed feline sarcoma virus (GR-FeSV) proviral genome
coding for P70 gag-fgr polyprotein Sequence is partially homologous
to actin and partially to the tyrosine-specific kinase
gene family
Length=2025
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 710 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 661
>emb|X04098.1| Homo sapiens mRNA for cytoskeletal gamma-actin (ACTG1 gene)
Length=1918
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 363 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 314
>gb|AC137896.5| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-765O14, complete sequence
Length=107289
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 7005 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 7054
>gb|AC139149.6| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-766D20, complete sequence
Length=81577
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 19446 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 19397
>gb|AY888398.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH020485.01X actin gamma
1 (ACTG1) mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 241
>gb|AY892296.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116867.01L actin gamma
1 (ACTG1) mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 241
>dbj|AB052654.2| Lethenteron camtschaticum LjMA2 mRNA for muscle actin, complete
cds
Length=2472
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 313
>dbj|AB051104.1| Felis catus mRNA for beta-actin, partial cds
Length=858
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 102 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 53
>ref|NM_001003349.1| Canis lupus familiaris actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
gb|AF021873.2|AF021873 Canis familiaris beta-actin mRNA, complete cds
Length=1714
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 241
>gb|AF038150.1|AF038150 Mustela putorius furo beta-actin mRNA, partial cds
Length=1685
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 69
>ref|NM_001081838.1| Equus caballus actin, beta (ACTB), mRNA
gb|AF035774.1|AF035774 Equus caballus beta actin mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 241
>gb|M26111.1|GOOACTB Goose beta-actin mRNA, complete cds
Length=1994
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 316
>gb|M19283.1|HUMACTGA Human cytoskeletal gamma-actin gene, complete cds
Length=3583
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1251
>emb|V00872.1| Rabbit alpha-actin messenger fragment (aa 72 to 145)
Length=226
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 30
>ref|XM_004603819.1| PREDICTED: Sorex araneus actin, cytoplasmic 2-like (LOC101545833),
mRNA
Length=1131
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 CCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 241
>gb|KC543633.1| Leptomonas pyrrhocoris clone C1022o2 hypothetical protein gene,
partial cds
Length=1113
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 244
>dbj|AB711086.1| Leishmania donovani gene for actin, complete cds
Length=1131
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 244
>ref|XM_003871839.1| Leishmania mexicana MHOM/GT/2001/U1103 actin (LMXM_04_1230) mRNA,
complete cds
Length=1083
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 196
>emb|FR799557.1| Leishmania mexicana MHOM/GT/2001/U1103 complete genome, chromosome
4
Length=438817
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434112 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 434159
>gb|GQ246784.1| Leishmania amazonensis isolate 714 clone 2 actin gene, complete
cds
Length=1146
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 253
>gb|GQ246783.1| Leishmania amazonensis isolate 714 clone 1 actin gene, complete
cds
Length=1146
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 253
>gb|GQ246777.1| Leishmania mexicana isolate 600 clone 2 actin gene, complete
cds
Length=1146
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 253
>gb|GQ246776.1| Leishmania mexicana isolate 600 clone 1 actin gene, complete
cds
Length=1146
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 253
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Query 3 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 291 CACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 244
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mRNA
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Sbjct 192 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 143
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(ACTC1), mRNA
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Sbjct 402 GCCACGCGGAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 353
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(ACTA1), mRNA
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Sbjct 305 GCCACGCGGAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 256
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Sbjct 324 GCCACGCGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 275
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Sbjct 290 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 241
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Sbjct 325 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTC 276
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muscle (ACTA1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 301 ACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 255
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(ACTA1), mRNA
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Sbjct 416 GCCACGCGGAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 367
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mRNA
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Sbjct 168 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAAATCTTCTCCATGTC 119
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mRNA
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Sbjct 227 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 178
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(ACTA1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 176 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 127
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variant X3, mRNA
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Sbjct 287 GCCACCCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 238
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variant X1, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 298 GCCACCCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 249
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transcript variant X1, mRNA
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Query 4 ACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 318 ACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 272
>ref|XM_009975437.1| PREDICTED: Tyto alba actin, alpha skeletal muscle-like (LOC104368162),
partial mRNA
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Query 4 ACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 95 ACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 49
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misc_RNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 161 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 112
>ref|XM_009940336.1| PREDICTED: Opisthocomus hoazin actin, cytoplasmic 2-like (LOC104334680),
mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 168 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 119
>ref|XM_009938018.1| PREDICTED: Opisthocomus hoazin actin, alpha 1, skeletal muscle
(ACTA1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 167 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 118
>ref|XM_009897974.1| PREDICTED: Picoides pubescens actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 167 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 118
>ref|XM_009644143.1| PREDICTED: Egretta garzetta actin, alpha 1, skeletal muscle (ACTA1),
transcript variant X1, mRNA
Length=1408
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 296 GCCACGCGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 247
>ref|XM_009575804.1| PREDICTED: Fulmarus glacialis actin, beta (ACTB), mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 161 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTC 112
>ref|XM_009575697.1| PREDICTED: Fulmarus glacialis actin, cytoplasmic type 5 (LOC104072104),
transcript variant X1, mRNA
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Query 4 ACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 302 ACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 256
>gb|KM191328.1| Haemaphysalis flava actin mRNA, complete cds
Length=1593
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 377 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 328
>gb|KJ398821.1| Syntrichia caninervis actin (ACT) mRNA, partial cds
Length=1131
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 296 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 247
>ref|XR_683351.1| PREDICTED: Phalacrocorax carbo actin, clone 302-like (LOC104045636),
misc_RNA
Length=1129
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 152 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTC 103
>ref|XR_677573.1| PREDICTED: Pan troglodytes POTE ankyrin domain family member
J-like (LOC458626), misc_RNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 2310
>ref|XM_009427441.1| PREDICTED: Pan troglodytes POTE ankyrin domain family member
E-like (LOC104001957), partial mRNA
Length=3879
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 2038
>ref|XR_169573.2| PREDICTED: Pan troglodytes actin, cytoplasmic 1-like (LOC101057446),
misc_RNA
Length=1756
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 331 GCCACGCGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 282
>ref|XM_009443317.1| PREDICTED: Pan troglodytes POTE ankyrin domain family member
E (LOC739395), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1861
>ref|XM_009443316.1| PREDICTED: Pan troglodytes POTE ankyrin domain family member
E (LOC739395), transcript variant X2, mRNA
Length=2953
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1987
>ref|XM_009443315.1| PREDICTED: Pan troglodytes POTE ankyrin domain family member
E (LOC739395), transcript variant X1, mRNA
Length=3316
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 2350
>ref|XM_009443297.1| PREDICTED: Pan troglodytes POTE ankyrin domain family member
I (LOC738413), transcript variant X4, mRNA
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1931 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1882
>ref|XM_009443296.1| PREDICTED: Pan troglodytes POTE ankyrin domain family member
I (LOC738413), transcript variant X3, mRNA
Length=3026
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2018 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1969
>ref|XM_009443294.1| PREDICTED: Pan troglodytes POTE ankyrin domain family member
I (LOC738413), transcript variant X2, mRNA
Length=3299
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 2242
>ref|XM_001143715.4| PREDICTED: Pan troglodytes POTE ankyrin domain family member
I (LOC738413), transcript variant X1, mRNA
Length=3398
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 2341
>ref|XR_020603.4| PREDICTED: Pan troglodytes putative beta-actin-like protein 3
(LOC741762), misc_RNA
Length=2925
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1339
>ref|XM_003308808.3| PREDICTED: Pan troglodytes actin, alpha 1, skeletal muscle (ACTA1),
mRNA
Length=1510
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 GCCACGCGAAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 369
>ref|XM_009466902.1| PREDICTED: Nipponia nippon actin, gamma 1 (ACTG1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1864
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 258 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTC 209
>ref|XM_009470796.1| PREDICTED: Nipponia nippon actin, alpha 1, skeletal muscle (ACTA1),
mRNA
Length=1299
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 191 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 142
>dbj|AB608018.1| Equus caballus ACTA1 mRNA for actin, alpha skeletal muscle, complete
cds
Length=1216
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 322 GCCACGCGGAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 273
>ref|XM_009199671.1| PREDICTED: Papio anubis actin, cytoplasmic 1-like (LOC100998182),
transcript variant X2, mRNA
Length=2170
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1204
>ref|XM_003919235.2| PREDICTED: Papio anubis actin, cytoplasmic 1-like (LOC100998182),
transcript variant X1, mRNA
Length=2241
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1275
>ref|XM_003893792.2| PREDICTED: Papio anubis actin, alpha 1, skeletal muscle (ACTA1),
mRNA
Length=1509
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 417 GCCACGCGGAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 368
>emb|LN598526.1| Cyprinus carpio genome assembly common carp genome ,scaffold
000001763
Length=273184
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 6705 GCCACGCGGAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 6754
>emb|LN590892.1| Cyprinus carpio genome assembly common carp genome ,scaffold
000000684
Length=795788
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 693949 GCCACGCGGAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 693998
>ref|XM_009098247.1| PREDICTED: Serinus canaria actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X2, mRNA
Length=1140
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 287 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAAAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 238
>ref|XM_009098246.1| PREDICTED: Serinus canaria actin, beta-like 2 (ACTBL2), transcript
variant X1, mRNA
Length=1220
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 367 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAAAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 318
>ref|XR_158233.2| PREDICTED: Pan paniscus POTE ankyrin domain family member E-like
(LOC100978345), misc_RNA
Length=2253
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 1317
>ref|XM_003824459.2| PREDICTED: Pan paniscus actin, alpha 1, skeletal muscle (ACTA1),
mRNA
Length=1504
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 412 GCCACGCGAAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 363
>ref|XR_156334.2| PREDICTED: Pan paniscus actin, cytoplasmic 1-like (LOC100968784),
misc_RNA
Length=1261
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Sbjct 428 GCCACGCGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 379
>ref|XM_008845773.1| PREDICTED: Nannospalax galili actin, alpha 1, skeletal muscle
(Acta1), mRNA
Length=1482
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 414 GCCACCCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 365
>ref|XM_002728532.4| PREDICTED: Rattus norvegicus POTE ankyrin domain family, member
F (Potef), mRNA
Length=1907
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 360 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 311
>ref|XM_002725322.4| PREDICTED: Rattus norvegicus POTE ankyrin domain family, member
F (Potef), mRNA
Length=1902
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 356 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 307
>ref|XM_008689526.1| PREDICTED: Ursus maritimus actin, alpha 1, skeletal muscle (ACTA1),
mRNA
Length=765
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 296 GCCACGCGGAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 247
>ref|XM_008631574.1| PREDICTED: Corvus brachyrhynchos actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=1876
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 437 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 388
>gb|AE014297.3| Drosophila melanogaster chromosome 3R
Length=32079331
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 15440908 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGATGCCAGATCTTCTCCATGTC 15440859
>ref|XM_008498596.1| PREDICTED: Calypte anna actin, cytoplasmic type 5 (LOC103532802),
transcript variant X3, mRNA
Length=1212
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCCACCCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 322
>ref|XM_008498594.1| PREDICTED: Calypte anna actin, cytoplasmic type 5 (LOC103532802),
transcript variant X1, mRNA
Length=1146
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 305 GCCACCCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 256
>gb|KJ585715.1| Neotyphodium sp. NI_201308 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585714.1| Neotyphodium sp. NI_201306 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585713.1| Neotyphodium sp. NI_201302 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585712.1| Neotyphodium sp. NI_201222 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585710.1| Neotyphodium sp. NI_201218 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585709.1| Neotyphodium sp. NI_201216 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585708.1| Neotyphodium sp. NI_201214 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585707.1| Neotyphodium sp. NI_201213 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585706.1| Neotyphodium sp. NI_201210 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585705.1| Neotyphodium sp. NI_201209 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585704.1| Neotyphodium sp. NI_201208 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
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Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585703.1| Neotyphodium sp. NI_201206 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585702.1| Neotyphodium sp. NI_201203 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KJ585701.1| Neotyphodium sp. NI_201201 actin (actA) gene, partial cds
Length=1523
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 670
>gb|KF903454.1| Sonderhenia eucalypticola strain CBS 112502 actin gene, partial
cds
gb|KF903596.1| Sonderhenia eucalypticola strain CPC 11251 actin gene, partial
cds
gb|KF903597.1| Sonderhenia eucalypticola strain CPC 11252 actin gene, partial
cds
Length=518
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 GCCACACGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 275
>ref|XM_008284974.1| PREDICTED: Stegastes partitus actin, alpha cardiac-like (LOC103359577),
mRNA
Length=1401
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 GCCACGCGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTC 247
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC
>ref|XM_006722049.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X2, mRNA
Length=779
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 139
>ref|XM_006722048.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
Length=2129
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 139
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
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Sbjct 66 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 115
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
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Sbjct 66 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 115
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
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Sbjct 66 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 115
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
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Sbjct 5001 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 5050
>gb|AC139149.6| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-766D20, complete sequence
Length=81577
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18621 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 18670
>emb|X04098.1| Homo sapiens mRNA for cytoskeletal gamma-actin (ACTG1 gene)
Length=1918
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 49
>gb|M37130.1|HUMGACTA1 Human gamma-actin pseudogene, 5' end
Length=348
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 49
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 48
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30844 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 30893
>gb|AC137896.5| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-765O14, complete sequence
Length=107289
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7830 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 7781
>gb|M19283.1|HUMACTGA Human cytoskeletal gamma-actin gene, complete cds
Length=3583
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 475 GTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCCCTCCGC 524
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 48
>dbj|AK304637.1| Homo sapiens cDNA FLJ57283 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1387
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 AGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 50
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC 45
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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17 17 79479827 79479354 31m373n69m GGTCTCGGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 79479820 79479347 38m373n62m GCCGCCGCTGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479817 79479344 41m373n59m GCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>ref|NW_001838951.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188395, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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>ref|NC_000015.10| Homo sapiens chromosome 15, GRCh38 Primary Assembly
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGA 47
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Sbjct 15721759 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGA 15721713
>ref|NT_167186.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR1_CTG32_1
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assembly
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGA 47
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>ref|NT_005403.18| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR2_CTG7_2
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assembly
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 123139990 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCATCCCAGTTGGTGA 123140036
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shotgun sequence
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sequence
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sequence
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sequence
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sequence
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sequence
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shotgun sequence
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>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
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Sbjct 200059440 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCATCCCAGTTGGTGA 200059486
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shotgun sequence
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HSCHR8_CTG5_1
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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assembly
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genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 64072783 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCATCCCAGTAGATGAC 64072736
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sequence
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>ref|NW_001838288.2| Homo sapiens chromosome 16 genomic scaffold, alternate assembly
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sequence
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCA 39
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sequence
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGAC 48
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Sbjct 18252894 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCATCCCAGTAGATGAC 18252847
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Sbjct 35981184 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCATCCCGGTTCGTGAC 35981231
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shotgun sequence
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGAC 48
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Sbjct 64784714 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCATCCCAGTAGATGAC 64784667
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCA 39
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGAC 48
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Sbjct 34605949 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCATCCCGGTTCGTGAC 34605996
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Gapped
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HSCHR17_CTG4
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assembly
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Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 54576807 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 54576758
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genome shotgun sequence
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Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 79566094 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTTTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 79566045
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
Length=54469784
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 54240618 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTTTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 54240569
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shotgun sequence
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Sbjct 13956817 TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 13956768
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shotgun sequence
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Sbjct 238681 TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 238730
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Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 74928379 TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 74928330
>gb|DS990953.1| Homo sapiens SCAF_1112675837150 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019544 TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 1019495
>ref|NW_001838458.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188205, whole genome shotgun sequence
gb|DS486315.1| Homo sapiens SCAF_1103279188205 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019607 TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 1019558
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
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Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 74928629 TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 74928580
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA
>ref|XM_003213989.2| PREDICTED: Meleagris gallopavo actin, cytoplasmic 2-like (LOC100544583),
mRNA
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 175 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 126
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Length=1126
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 215
>ref|XM_010642839.1| PREDICTED: Fukomys damarensis actin, beta (Actb), mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 258
>ref|XM_010342311.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis actin, gamma 1 (ACTG1),
mRNA
Length=1714
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 152 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 103
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(LOC104657250), mRNA
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Sbjct 1149 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 1100
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(LOC104655172), misc_RNA
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mRNA
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Sbjct 356 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 307
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mRNA
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variant X3, mRNA
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Sbjct 270 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 221
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Sbjct 281 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 232
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Sbjct 465 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 416
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Sbjct 387 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 338
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Sbjct 548 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 499
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mRNA
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Sbjct 363 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 314
>ref|XM_008933791.1| PREDICTED: Manacus vitellinus actin, cytoplasmic type 5 (LOC103766726),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 291 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 242
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Sbjct 368 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 319
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 356 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 307
>ref|XM_008614848.1| Saprolegnia diclina VS20 actin mRNA
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Sbjct 307 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 258
>ref|XM_008568830.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 292 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 243
>ref|XM_008520384.1| PREDICTED: Equus przewalskii actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 303 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 254
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 354 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 305
>ref|XM_008498594.1| PREDICTED: Calypte anna actin, cytoplasmic type 5 (LOC103532802),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 288 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 239
>gb|KF903676.1| Zasmidium citri strain CPC 15291 actin gene, partial cds
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Sbjct 261 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 212
>gb|KF903675.1| Phaeophleospora eugeniae strain CPC 15159 actin gene, partial
cds
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Sbjct 308 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 259
>gb|KF903674.1| Phaeophleospora eugeniae strain CPC 15143 actin gene, partial
cds
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Sbjct 308 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 259
>gb|KF903542.1| Mycosphaerella irregulari strain CBS 123242 actin gene, partial
cds
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Sbjct 330 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 281
>gb|KF903539.1| Austroafricana parva strain CBS 122892 actin gene, partial cds
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Sbjct 264 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 215
>gb|KF903481.1| Austroafricana parva strain CBS 116289 actin gene, partial cds
gb|KF903512.1| Austroafricana parva strain CBS 119901 actin gene, partial cds
gb|KF903612.1| Austroafricana parva strain CPC 12249 actin gene, partial cds
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Sbjct 330 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 281
>gb|KF903501.1| Septoria eucalyptorum strain CBS 118505 actin gene, partial cds
Length=526
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Sbjct 315 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 266
>gb|KF903495.1| Zasmidium eucalyptorum strain CBS 118500 actin gene, partial
cds
Length=520
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Sbjct 309 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 260
>gb|KF903453.1| Mycosphaerella madeirae strain CBS 112301 actin gene, partial
cds
Length=541
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Sbjct 330 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 281
>gb|KJ905681.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15351 ACTG1
gene, encodes complete protein
Length=1257
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Sbjct 338 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 289
>gb|KJ904414.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_13808 ACTG1
gene, encodes complete protein
Length=1256
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Sbjct 338 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 289
>gb|KJ896370.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05764 ACTG1
gene, encodes complete protein
Length=1257
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Sbjct 338 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 289
>ref|XM_008156007.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus actin, beta (ACTB), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 276 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 227
>ref|XM_008051419.1| PREDICTED: Tarsius syrichta actin, cytoplasmic 2 (LOC103252825),
mRNA
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Sbjct 186 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 137
>ref|XM_008036557.1| Trametes versicolor FP-101664 SS1 actin 1 partial mRNA
Length=1128
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
>ref|XM_008018962.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus actin-1 (LOC103246954), mRNA
Length=635
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Sbjct 389 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 340
>ref|XM_007969038.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus actin, cytoplasmic 1 (LOC103219323),
mRNA
Length=1816
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 351 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 302
>ref|XM_007884226.1| Pseudozyma flocculosa PF-1 hypothetical protein partial mRNA
Length=1128
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
>ref|XM_007864467.1| Gloeophyllum trabeum ATCC 11539 actin 1 partial mRNA
Length=1128
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
>ref|XM_001515099.3| PREDICTED: Ornithorhynchus anatinus actin, cytoplasmic type 5
(LOC100092493), mRNA
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Sbjct 387 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 338
>ref|XM_007525054.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus actin, beta (ACTB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1172
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Sbjct 308 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 259
>ref|XM_007447079.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1791
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Sbjct 291 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 242
>ref|XM_007186768.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni actin, beta (ACTB),
mRNA
Length=1765
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Sbjct 300 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 251
>ref|XM_007129304.1| PREDICTED: Physeter catodon actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1881
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 311 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 262
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Sbjct 296 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 247
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cds
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Sbjct 327 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 278
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Sbjct 391 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 342
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cds
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Sbjct 398 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 349
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 297 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 248
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Sbjct 391 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 342
>ref|XM_005621020.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 383 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 334
>ref|XM_005621019.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 383 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 334
>ref|XM_005642601.1| Coccomyxa subellipsoidea C-169 Actin/actin-like protein (COCSUDRAFT_60601)
mRNA, complete cds
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mRNA
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Sbjct 145 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 96
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(LOC102110255), transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 350 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 301
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Sbjct 388 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 339
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X1, mRNA
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Sbjct 397 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 348
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(LOC101808355), mRNA
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Sbjct 342 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 293
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(LOC101792739), mRNA
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Sbjct 306 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 257
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variant X2, mRNA
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Sbjct 304 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 255
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variant X1, mRNA
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Sbjct 307 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 258
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transcript variant X3, misc_RNA
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Sbjct 289 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 240
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 297 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 248
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 289 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 240
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variant X3, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 429 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 380
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Sbjct 429 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 380
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Sbjct 312 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 263
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Sbjct 315 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 266
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Sbjct 293 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 244
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Sbjct 309 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 260
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Sbjct 310 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 261
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variant X1, mRNA
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Sbjct 313 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 264
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mRNA
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Sbjct 290 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 241
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Sbjct 264 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 215
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misc_RNA
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
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Sbjct 278 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 229
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X1, mRNA
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Sbjct 231 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 182
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mRNA
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
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Sbjct 368 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 319
>ref|XM_004310959.1| PREDICTED: Tursiops truncatus actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 291 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 242
>ref|XM_004338010.1| Acanthamoeba castellanii str. Neff actin subfamily protein (ACA1_223930)
mRNA, complete cds
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Sbjct 825 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 776
>ref|XM_004337221.1| Acanthamoeba castellanii str. Neff actin-1, putative (ACA1_219820)
mRNA, complete cds
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
>ref|XM_004336600.1| Acanthamoeba castellanii str. Neff Actin1 (ACA1_066760) mRNA,
complete cds
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
>ref|XM_004365506.1| Capsaspora owczarzaki ATCC 30864 non-muscle actin (CAOG_00692)
mRNA, complete cds
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Sbjct 300 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 251
>ref|XM_004345558.1| Capsaspora owczarzaki ATCC 30864 non-muscle actin (CAOG_06018)
mRNA, complete cds
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Sbjct 301 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 252
>ref|XM_004268956.1| PREDICTED: Orcinus orca actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 357 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 308
>gb|KC248177.1| Valsa mali var. mali actin mRNA, partial cds
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Sbjct 93 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 44
>gb|JQ581521.1| Ditylum brightwellii strain B-326 actin mRNA, complete cds
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Sbjct 291 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 242
>ref|XM_002195880.2| PREDICTED: Taeniopygia guttata actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC100229883), mRNA
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Sbjct 350 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 301
>gb|JX902165.1| Septoria malagutii strain CBS 106.80 actin (act) gene, partial
cds
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Sbjct 325 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 276
>gb|JX902158.1| Septoria abeliceae strain CBS 128591 actin (act) gene, partial
cds
Length=543
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Sbjct 325 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 276
>gb|JX902123.1| Phaeophleospora eugeniae strain CPC 15159 actin (act) gene, partial
cds
Length=535
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Sbjct 317 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 268
>gb|JX902122.1| Phaeophleospora eugeniae strain CPC 15143 actin (act) gene, partial
cds
Length=535
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Sbjct 317 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 268
>gb|JX902114.1| Mycosphaerella latebrosa strain CBS 183.97 actin (act) gene,
partial cds
Length=556
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Sbjct 338 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 289
>gb|KC005765.1| Cercospora chrysanthemoides culture-collection CPC:20605 actin
(act) gene, partial cds
Length=600
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Sbjct 331 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 282
>gb|KC005764.1| Cercospora chrysanthemoides culture-collection CPC:20529 actin
(act) gene, partial cds
Length=602
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Sbjct 332 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 283
>ref|XM_003277926.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys actin, cytoplasmic 1-like (LOC100598411),
mRNA
Length=1218
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Sbjct 336 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 287
>ref|XM_003274823.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys actin, gamma 1, transcript variant
2 (ACTG1), mRNA
Length=3251
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Sbjct 532 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 483
>ref|XM_003274822.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys actin, gamma 1, transcript variant
1 (ACTG1), mRNA
Length=3131
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 412 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 363
>ref|XM_004045059.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
2 (ACTB), mRNA
Length=1945
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Sbjct 481 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 432
>ref|XM_004045058.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
1 (ACTB), mRNA
Length=1785
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Sbjct 321 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 272
>ref|XM_004040825.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, gamma 1, transcript
variant 2 (ACTG1), mRNA
Length=3277
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 531 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 482
>ref|XM_004040824.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, gamma 1, transcript
variant 1 (ACTG1), mRNA
Length=3183
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 437 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 388
>ref|XM_004013078.1| PREDICTED: Ovis aries actin (LOC443340), mRNA
Length=1952
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Sbjct 358 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 309
>gb|JX262507.1| Polarella glacialis actin mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 276 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 227
>gb|JX143273.1| Cercospora cf. zinniae CBS 132676 actin (act) gene, partial cds
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 340 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 291
>gb|JX143132.1| Cercospora kikuchii strain CBS 132633 actin (act) gene, partial
cds
Length=450
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Sbjct 340 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 291
>gb|JX143083.1| Cercospora cf. chenopodii CBS 132677 actin (act) gene, partial
cds
Length=450
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 340 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 291
>ref|XM_003754973.1| PREDICTED: Sarcophilus harrisii actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC100923807), mRNA
Length=1517
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Sbjct 276 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 227
>gb|JX046106.1| Capra hircus beta-actin (ACTB) mRNA, complete cds
Length=1147
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 281 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 232
>gb|JQ238613.1| Hypocrea orientalis strain EU7-22 actin gene, complete cds
Length=1600
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 678 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 629
>gb|JN558341.1| Polarella glacialis clone 4 actin 1 gene, partial sequence
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Sbjct 147 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 98
>ref|XM_003649706.1| Thielavia terrestris NRRL 8126 actin-like protein (THITE_2108647)
mRNA, complete cds
Length=1843
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 402 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 353
>ref|XM_003662111.1| Myceliophthora thermophila ATCC 42464 actin-like protein (MYCTH_2314852)
mRNA, complete cds
Length=2509
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Sbjct 455 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 406
>ref|NG_030530.1| Canis lupus familiaris actin, cytoplasmic 2 pseudogene (LOC610787)
on chromosome 3
Length=1335
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Sbjct 278 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 229
>gb|CP003003.1| Myceliophthora thermophila ATCC 42464 chromosome 2, complete
sequence
Length=5454242
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Sbjct 4459979 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 4460028
>gb|CP003009.1| Thielavia terrestris NRRL 8126 chromosome 1, complete sequence
Length=10101509
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Sbjct 4861662 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 4861711
>dbj|AK306863.1| Pan troglodytes mRNA for actin, cytoplasmic 1, complete cds,
clone: PtsC-1-5_F07
Length=1824
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Sbjct 357 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 308
>gb|JF303662.1| Trichoplusia ni actin mRNA, complete cds
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Sbjct 337 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 288
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
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Sbjct 412 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 363
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 531 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 482
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
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Sbjct 412 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 363
>ref|NM_001195845.1| Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), mRNA
Length=2173
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Sbjct 419 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 370
>ref|XM_003026104.1| Schizophyllum commune H4-8 Actin-1, mRNA
Length=1498
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Sbjct 369 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 320
>gb|HM140791.1| Hyalomma asiaticum actin mRNA, complete cds
Length=1131
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Sbjct 276 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 227
>ref|XM_002802729.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical protein LOC100430113 (LOC100430113),
mRNA
Length=671
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Sbjct 540 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 589
>ref|XM_002802726.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 4 (LOC100428865), mRNA
Length=1757
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Sbjct 271 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 222
>ref|XM_002802725.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 3 (LOC100428865), mRNA
Length=1874
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 388 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 339
>ref|XM_002802724.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 2 (LOC100428865), mRNA
Length=1857
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 371 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 322
>ref|XM_002802723.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 1 (LOC100428865), mRNA
Length=1854
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 368 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 319
>gb|FJ972820.1| Cleistogenes songorica actin mRNA, complete cds
Length=1602
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 406 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 357
>gb|FJ514819.1| Sporisorium scitamineum actin (ACT1) gene, complete cds
Length=2601
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 1450 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 1401
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 31652 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 31603
>ref|XM_002603087.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1131
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 276 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 227
>ref|XM_002610521.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1214
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 276 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 227
>ref|XM_002606026.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1811
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 297 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 248
>ref|XM_002591972.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1131
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 276 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 227
>ref|XM_002590479.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1134
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 276 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 227
>ref|XM_002590113.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=683
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 346 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 297
>emb|FN392558.1| Imantonia rotunda partial mRNA for actin, contig 15964
Length=545
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 328 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 377
>ref|XM_002503045.1| Micromonas sp. RCC299 chromosome 6 hypothetical protein (ACTIN)
mRNA, complete cds
Length=1457
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 351 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 302
>gb|CP001327.1| Micromonas sp. RCC299 chromosome 6, complete sequence
Length=1431126
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 87111 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 87160
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 5809 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 5760
>gb|EU343999.1| Candida savonica strain WM 07.62 actin gene, partial cds
Length=540
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 57 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 8
>gb|FJ205397.1| Cercospora bizzozeriana actin gene, partial cds
Length=818
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 75 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 26
>gb|EF437156.1| Globodera rostochiensis beta-actin (act-1) gene, complete cds
Length=2095
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 880 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 831
>gb|EU284024.1| Heterodera cynodontis isolate CD274 clone 1 actin gene, partial
cds
Length=903
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 74 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 25
>gb|EU284023.1| Heterodera cynodontis isolate CD274 clone 2 actin gene, partial
cds
Length=911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 78 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 29
>dbj|AK304637.1| Homo sapiens cDNA FLJ57283 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1387
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 342 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 293
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 345 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 296
>gb|EU832621.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067650; DKFZo008B0831
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 295 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 246
>gb|EU832693.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067722; DKFZo004B0832
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 295 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 246
>gb|EU514348.1| Stenella musae strain CBS 121385 actin (act) gene, partial cds
Length=540
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 330 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 281
>gb|EU514347.1| Stenella musae strain CBS 121384 actin (act) gene, partial cds
Length=540
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 330 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 281
>emb|CU680176.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017126
5' read ACTG1 mRNA
Length=1134
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 289 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 240
>emb|CU676328.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100021914
5' read ACTG1 mRNA
Length=1161
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 289 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 240
>dbj|AB374098.1| Ixodes persulcatus act mRNA for actin, complete cds
Length=1131
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 276 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 227
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 345 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 296
>gb|EU176631.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011619; FLH263907.01L;
RZPDo839C03246D actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes
complete protein
Length=1168
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Sbjct 295 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 246
>gb|EU046492.1| Neovison vison beta-actin mRNA, complete cds
Length=1435
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 357 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 308
>gb|BC142413.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:159611 IMAGE:8448844),
complete cds
Length=1845
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Sbjct 361 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 312
>ref|NM_001134769.1| Pan troglodytes actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
dbj|AB222159.1| Pan troglodytes verus actg1 mRNA for actin, gamma 1, complete
cds, clone: PstA5646
Length=1942
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Sbjct 345 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 296
>gb|BT030480.1| Bos taurus actin, beta (ACTB), mRNA, complete cds
Length=1776
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Sbjct 302 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 253
>gb|DQ891374.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004004; FLH176328.01X; RZPDo839C01122D
actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes complete protein
Length=1168
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Sbjct 295 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 246
>ref|NM_001285025.1| Macaca fascicularis actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB170391.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10647, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1729
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Sbjct 357 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 308
>gb|DQ233465.1| Cervus elaphus beta-actin mRNA, partial cds
Length=684
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Sbjct 156 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 107
>emb|CT837965.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) cDNA clone:OSIGCRA107C01,
full insert sequence
Length=1198
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Sbjct 298 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 249
>gb|DQ980417.1| Chrysochromulina sp. NIES-1333 actin gene, partial cds
Length=1036
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Sbjct 208 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 159
>gb|DQ980436.1| Apusomonas proboscidea clone apactin4rt actin mRNA, partial cds
Length=1050
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Sbjct 219 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 170
>gb|DQ980418.1| Chrysochromulina sp. NIES-1333 actin gene, partial cds
Length=1036
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Sbjct 208 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 159
>gb|DQ980438.1| Chrysochromulina sp. NIES-1333 actin mRNA, partial cds
Length=1036
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Sbjct 208 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 159
>gb|DQ980416.1| Apusomonas proboscidea clone apactin1g actin gene, partial cds
Length=1453
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Sbjct 305 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 256
>gb|DQ913895.1| Pseudozyma flocculosa actin gene, partial cds
Length=2612
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Sbjct 2241 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 2192
>gb|DQ826531.1| Chinchilla lanigera beta-actin mRNA, partial cds
Length=351
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Sbjct 251 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 202
>gb|DQ838049.1| Bos grunniens beta-actin mRNA, complete cds
Length=1128
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
>gb|DQ464112.1| Macaca fascicularis beta-actin (ACTB) mRNA, partial cds
Length=421
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 142 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 93
>gb|BC021036.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3836590),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=3405
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Sbjct 1934 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 1885
>gb|BC023606.1| Homo sapiens mRNA similar to actin, beta (cDNA clone IMAGE:4640691)
Length=2527
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Sbjct 1083 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 1034
>gb|BC019044.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4635339, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2503
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Sbjct 1062 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 1013
>gb|BC021033.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3832154, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2528
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 1083 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 1034
>gb|BT019856.1| Homo sapiens actin, gamma 1 mRNA, complete cds
Length=1128
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
>gb|BC007442.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:4484 IMAGE:2962953),
complete cds
Length=1938
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Sbjct 332 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 283
>gb|BC053572.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:61615 IMAGE:3865767),
complete cds
Length=1912
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Sbjct 325 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 276
>gb|BC000292.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:8332 IMAGE:2819345),
complete cds
Length=1940
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Sbjct 338 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 289
>gb|BC012050.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:19847 IMAGE:4554944),
complete cds
Length=1936
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 332 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 283
>ref|NM_001033084.1| Macaca mulatta actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1584
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 298 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 249
>gb|AY550069.1| Sus scrofa cytoskeletal beta actin mRNA, partial cds
Length=1862
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 360 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 311
>gb|AY141970.1| Bos taurus beta-actin (ACTB) mRNA, complete cds
Length=1804
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Sbjct 312 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 263
>gb|AY497558.1| Macaca mulatta beta-actin mRNA, partial cds
Length=838
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 109 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 60
>gb|BC063495.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5398241)
Length=1856
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 264 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 215
>gb|BC001920.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:3728 IMAGE:2820489),
complete cds
Length=1744
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 301 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 252
>gb|BC018774.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:32064 IMAGE:4869628),
complete cds
Length=1812
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 332 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 283
>gb|BC015779.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:23584 IMAGE:4856294),
complete cds
Length=1791
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 308 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 259
>gb|BC015005.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:23578 IMAGE:4855463),
complete cds
Length=1778
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 327 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 278
>gb|BC004223.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3533309),
complete cds
Length=1691
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 250 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 201
>gb|BC010999.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:15377 IMAGE:3940861),
complete cds
Length=1934
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 331 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 282
>ref|NM_173979.3| Bos taurus actin, beta (ACTB), mRNA
gb|BC102948.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:128179 IMAGE:7945368),
complete cds
Length=1948
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 365 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 316
>dbj|AB169683.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-17788, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1934
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 477 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 428
>emb|CR731624.2| Tetraodon nigroviridis full-length cDNA
Length=1385
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 310 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 261
>emb|CR724354.2| Tetraodon nigroviridis full-length cDNA
Length=1463
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 350 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 301
>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1850
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 386 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 337
>gb|BC015695.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:23184 IMAGE:4842665),
complete cds
Length=1924
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 334 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 285
>gb|AY090616.1| Calotes versicolor beta actin-like protein mRNA, partial cds
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Sbjct 151 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 102
>gb|AF484115.1| Canis familiaris beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
>gb|BC017450.1|BC017450 Homo sapiens, clone IMAGE:3538275, mRNA, partial cds
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Sbjct 239 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 190
>gb|AF156157.1|AF156157 Schizophyllum commune actin 1 (ACT1) gene, complete cds
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Sbjct 1048 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 999
>gb|S64189.1| type 2 actin [Emiliania huxleyi=Prymnesiophyte algae, CCMP379,
mRNA Partial, 629 nt]
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Sbjct 243 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 194
>emb|AJ719605.1| Gallus gallus mRNA for hypothetical protein, clone 4h19
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Sbjct 360 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 311
>emb|AJ719332.1| Gallus gallus mRNA for hypothetical protein, clone 1h13
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Sbjct 360 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 311
>gb|BC009848.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:15376 IMAGE:3939552),
complete cds
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Sbjct 329 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 280
>dbj|AB115328.1| Phanerochaete chrysosporium act mRNA for actin, partial cds
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Sbjct 252 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 203
>emb|Z70044.1| C.familiaris mRNA for beta-actin
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Sbjct 209 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 160
>emb|X75421.1| T.reesei (QM9414-Rut C30) gene for actin
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Sbjct 1157 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 1108
>emb|X04098.1| Homo sapiens mRNA for cytoskeletal gamma-actin (ACTG1 gene)
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Sbjct 346 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 297
>emb|V00002.1| Acanthamoeba castelani gene encoding actin I
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Sbjct 409 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 360
>emb|X07463.1| Thermomyces lanuginosus actin gene
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Sbjct 1393 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 1344
>emb|AM231150.1| Trichoderma harzianum partial actin gene for actin
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Sbjct 148 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 99
>gb|AC137896.5| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-765O14, complete sequence
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Sbjct 7022 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 7071
>gb|AC139149.6| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-766D20, complete sequence
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Sbjct 19429 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 19380
>gb|AY888398.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH020485.01X actin gamma
1 (ACTG1) mRNA, complete cds
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
>gb|AY892296.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116867.01L actin gamma
1 (ACTG1) mRNA, partial cds
Length=1128
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 273 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 224
>gb|AY443356.1| Heterodera cyperi actin gene, partial cds
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 81 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 32
>gb|AY443355.1| Heterodera ripae actin gene, partial cds
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Query 1 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 50
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Sbjct 81 GTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA 32
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT
>ref|XM_006722049.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X2, mRNA
Length=779
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Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 104 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 153
>ref|XM_006722048.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
Length=2129
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Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 104 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 153
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 80 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 129
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 80 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 129
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
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Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 80 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 129
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
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Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 5015 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 5064
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 13 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 62
>emb|X04098.1| Homo sapiens mRNA for cytoskeletal gamma-actin (ACTG1 gene)
Length=1918
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 14 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 63
>gb|AC139149.6| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-766D20, complete sequence
Length=81577
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 18635 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 18684
>gb|M37130.1|HUMGACTA1 Human gamma-actin pseudogene, 5' end
Length=348
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 14 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 63
>gb|BC007442.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:4484 IMAGE:2962953),
complete cds
Length=1938
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 1 GCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 49
>gb|BC010999.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:15377 IMAGE:3940861),
complete cds
Length=1934
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 1 CCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 48
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30858 TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 30907
>dbj|AK304637.1| Homo sapiens cDNA FLJ57283 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1387
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10 TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 59
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 62
>gb|BC000292.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:8332 IMAGE:2819345),
complete cds
Length=1940
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
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Sbjct 6 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTTTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 55
>gb|BC015695.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:23184 IMAGE:4842665),
complete cds
Length=1924
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 51
>gb|AC137896.5| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-765O14, complete sequence
Length=107289
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7816 TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 7767
>gb|M19283.1|HUMACTGA Human cytoskeletal gamma-actin gene, complete cds
Length=3583
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 489 TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCCCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 538
>gb|BC012050.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:19847 IMAGE:4554944),
complete cds
Length=1936
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 49
>gb|BC018774.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:32064 IMAGE:4869628),
complete cds
Length=1812
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 49
>gb|BC009848.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:15376 IMAGE:3939552),
complete cds
Length=1962
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 AGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 46
>gb|BC019044.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4635339, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2503
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CAGCT-CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 CAGCTCCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 779
>gb|BC015005.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:23578 IMAGE:4855463),
complete cds
Length=1778
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 44
>gb|BC021036.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3836590),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=3405
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 TCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 TCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 1651
>gb|BC053572.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:61615 IMAGE:3865767),
complete cds
Length=1912
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 9 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT 42
Lambda K H
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17 17 79479012 79479383 56M79479813F42m385n2m CTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA TGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479015 79479765 53M79479813F47m TTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTC
17 17 79479020 79479760 48M79479813F52m AGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGC
17 17 79479030 79479377 38M79479813F54m373n8m GTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479045 79479362 23M79479813F54m373n23m CATGTCGTCCCAGTTGGTGCCGA TGCCACCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479061 79479346 7M79479813F54m373n39m GTGACGA TGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTCCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479063 79479344 5M79479813F54m373n41m GACGA TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479064 79479343 4M79479813F54m373n42m ACGA TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGGTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGAGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGAGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTATGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGGCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479065 79479342 3M79479813F54m373n43m CGC TGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479820 79479347 62m373n38m GCCGCCGCTGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479817 79479344 59m373n41m GCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479814 79479341 56m373n44m GCTGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479811 79479337 28m1d24m373n48m GCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCDCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479808 79479323 38m385n62m AGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479805 79479332 47m373n53m TCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479802 79479329 44m373n56m CGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479799 79479326 41m373n59m ACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479796 79479323 38m373n62m CTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479793 79479320 35m373n65m TTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479790 79479317 32m373n68m TTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479787 79479314 29m373n71m CGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479784 79479311 26m373n74m CGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479781 79479308 23m373n77m TCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479778 79479305 20m373n80m GCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479775 79479302 17m373n83m GTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479772 79479299 14m373n86m GCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479769 79479296 11m373n89m TTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479766 79479293 8m373n92m CTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479761 79479288 3m373n97m CCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479758 79479658 100m GTGAGCGCCCCGCCCCGGGGCCTGAGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGCCCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTCC
17 17 79479755 79479655 100m ACCGCCCCGCCCCGGGGCCTGAGCTGGTCGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCC
17 17 79479750 79479650 100m CCCGCCCCGGGGCCTGAGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAA
17 17 79479747 79479647 100m GCCCCGGGGCCTGAGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAA
17 17 79479744 79479644 100m CCGGGGCCTGAGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAG
17 17 79479741 79479641 100m GGGCCTGGGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCG
17 17 79479737 79479383 98m254n2m CTGAGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479734 79479380 95m254n5m AGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479729 79479384 99m245n1m GACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGGGTGGGCCGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 79479720 79479620 100m GGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGGGTGGGCCGGGTCAGGCGGA
17 17 79479717 79479363 78m254n22m CTGCGCCCCCCGGCCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479714 79479360 75m254n25m CGCCCCCCGCCCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 79479701 79479342 57m259n43m CGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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sequence
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Sbjct 48229186 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGCCG-TGC 48229141
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assembly
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 5519257 GGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 5519304
>ref|NT_026437.13| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR14_CTG1
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assembly
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 1179119 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCC 1179166
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HSCHR22_CTG2
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assembly
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 567435 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCC 567388
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genome shotgun sequence
gb|CM001613.2| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 76515132 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCC 76515085
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 15450934 GGTGTGATGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTAGTGACGATGCCAT 15450885
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGC 47
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Sbjct 97107342 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGCCG-TGC 97107297
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 5568471 GGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 5568518
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genome shotgun sequence
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Sbjct 19586108 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCC 19586061
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 19989300 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCC 19989347
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genome shotgun sequence
gb|CM001630.2| Homo sapiens chromosome 22, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 16256920 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCC 16256967
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 27109826 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCC 27109779
>ref|NW_004929329.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 5558471 GGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 5558518
>ref|NW_004929393.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150177.1| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold chr14_scaf, whole
genome shotgun sequence
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Sbjct 586108 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCC 586061
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 989300 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCC 989347
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shotgun sequence
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Sbjct 8746178 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCC 8746225
>gb|GL583074.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_94, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 6245233 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCC 6245186
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>ref|NW_001838998.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
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sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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>ref|NC_000015.10| Homo sapiens chromosome 15, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000677.2| Homo sapiens chromosome 15, GRCh38 reference primary assembly
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Sbjct 43989916 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGGTGGTGACAATG 43989961
>ref|NT_006576.17| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR5_CTG1
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assembly
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Sbjct 15440954 GGTGTGATGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTAGTGACGATGCCAT 15440905
>ref|NT_010194.18| Homo sapiens chromosome 15 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR15_CTG8
gb|GL000121.2| Homo sapiens chromosome 15 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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>ref|NC_018926.2| Homo sapiens chromosome 15, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001623.2| Homo sapiens chromosome 15, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 44400381 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGGTGGTGACAATG 44400426
>ref|NW_004929321.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150105.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 15440934 GGTGTGATGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTAGTGACGATGCCAT 15440885
>ref|NW_004929398.1| Homo sapiens chromosome 15 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150182.1| Homo sapiens chromosome 15 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 15224831 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGGTGGTGACAATG 15224876
>gb|KE141135.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold61, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 14096742 GGTGTGATGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTAGTGACGATGCCAT 14096693
>gb|KE141304.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold250, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 229200 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATACCAT 229249
>gb|GL583035.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_55, whole genome
shotgun sequence
Length=13327032
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 11259438 GGTGTGATGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTAGTGACGATGCCAT 11259389
>gb|GL583180.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_200, whole genome
shotgun sequence
Length=3876381
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>gb|CM000505.1| Homo sapiens chromosome 15, whole genome shotgun sequence
Length=78530749
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Sbjct 11931192 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATACCAT 11931241
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Sbjct 21105490 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGGTGGTGACAATG 21105535
>gb|DS990721.1| Homo sapiens SCAF_1112675837201 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=10941625
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sequence
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>ref|NW_001838981.2| Homo sapiens chromosome 6 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188350, whole genome shotgun sequence
gb|DS486063.1| Homo sapiens SCAF_1103279188350 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 5 TGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 11371844 TGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTTGTGACGATGCCAT 11371889
>gb|CH471081.1| Homo sapiens 211000035843014 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=30372612
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Query 5 TGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 19189847 TGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTTGTGACGATGCCAT 19189802
>ref|AC_000138.1| Homo sapiens chromosome 6, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 5 TGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 45896054 TGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTTGTGACGATGCCAT 45896009
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Query 5 TGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 47725526 TGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTTGTGACGATGCCAT 47725481
>ref|NW_004929323.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 5988598 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGCCG-TGC 5988553
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shotgun sequence
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGC 47
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Sbjct 9587215 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGCCG-TGC 9587170
>gb|KE141446.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold476, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATG 46
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Sbjct 912555 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGGTGGTGACAATG 912510
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shotgun sequence
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGC 47
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Sbjct 102699 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGCCG-TGC 102654
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shotgun sequence
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATG 46
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Sbjct 259137 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGGTGGTGACAATG 259182
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shotgun sequence
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGC 47
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Sbjct 41108698 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGCCG-TGC 41108743
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shotgun sequence
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATG 46
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Sbjct 30085536 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGGTGGTGACAATG 30085491
>gb|CH471082.1| Homo sapiens 211000035835546 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATG 46
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Sbjct 269411 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGGTGGTGACAATG 269456
>ref|NW_001838952.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188412, whole genome shotgun sequence
gb|DS486020.1| Homo sapiens SCAF_1103279188412 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGC 47
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Sbjct 41108804 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGCCG-TGC 41108849
>ref|NW_001838218.2| Homo sapiens chromosome 15 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188258, whole genome shotgun sequence
gb|DS486033.1| Homo sapiens SCAF_1103279188258 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATG 46
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Sbjct 30085874 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGGTGGTGACAATG 30085829
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG
>ref|NC_000017.11| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000679.2| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 reference primary assembly
Length=83257441
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 81512782 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 81512733
>ref|NT_010783.16| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR17_CTG4
gb|GL000132.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 54576802 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 54576753
>gb|KE141166.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold101, whole genome
shotgun sequence
Length=15663743
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Query 2 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13956811 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 13956763
>gb|GL583196.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_216, whole genome
shotgun sequence
Length=3418688
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Query 2 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238687 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 238735
>gb|CM000507.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76566745
Score = 91.6 bits (49), Expect = 2e-16
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Query 2 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 74928373 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 74928325
>gb|DS990953.1| Homo sapiens SCAF_1112675837150 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=1243825
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Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 1019538 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 1019490
>ref|NW_001838458.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188205, whole genome shotgun sequence
gb|DS486315.1| Homo sapiens SCAF_1103279188205 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 1019601 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 1019553
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
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Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 74928623 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 74928575
>ref|NC_018928.2| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=81289577
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 79566089 GCTCTCGCACTCTGTTTTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 79566040
>ref|NW_004929407.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150191.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 54240613 GCTCTCGCACTCTGTTTTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 54240564
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT
>ref|XM_003831125.2| PREDICTED: Pan paniscus actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=1957
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 381 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 332
>gb|KJ905681.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15351 ACTG1
gene, encodes complete protein
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 332 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 283
>gb|KJ904414.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_13808 ACTG1
gene, encodes complete protein
Length=1256
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 332 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 283
>gb|KJ896370.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05764 ACTG1
gene, encodes complete protein
Length=1257
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 332 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 283
>ref|XM_006722049.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X2, mRNA
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 549 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 500
>ref|XM_006722048.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
Length=2129
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 549 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 500
>ref|XM_006210388.1| PREDICTED: Vicugna pacos actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1724
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 268 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 219
>ref|XM_006176094.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1734
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 275 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 226
>ref|XM_005521369.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC102110255), transcript variant X1, mRNA
Length=1446
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 344 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 295
>ref|XM_004840381.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, beta (Actb), transcript
variant X3, mRNA
Length=1819
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 354 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 305
>ref|XM_004840379.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, beta (Actb), transcript
variant X1, mRNA
Length=1888
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 423 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 374
>ref|XM_004894014.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, beta (Actb), transcript
variant X1, mRNA
Length=1885
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 423 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 374
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 406 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 357
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 525 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 476
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 406 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 357
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 31646 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 31597
>ref|XM_002610521.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1214
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 270 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 221
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 5803 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 5754
>dbj|AK304637.1| Homo sapiens cDNA FLJ57283 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1387
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 336 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 287
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 339 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 290
>gb|EU832621.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067650; DKFZo008B0831
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 289 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 240
>gb|EU832693.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067722; DKFZo004B0832
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 289 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 240
>emb|CU680176.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017126
5' read ACTG1 mRNA
Length=1134
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 283 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 234
>emb|CU676328.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100021914
5' read ACTG1 mRNA
Length=1161
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 283 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 234
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 339 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 290
>gb|EU176631.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011619; FLH263907.01L;
RZPDo839C03246D actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes
complete protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 289 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 240
>ref|NM_001134769.1| Pan troglodytes actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
dbj|AB222159.1| Pan troglodytes verus actg1 mRNA for actin, gamma 1, complete
cds, clone: PstA5646
Length=1942
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 339 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 290
>gb|DQ891374.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004004; FLH176328.01X; RZPDo839C01122D
actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes complete protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 289 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 240
>gb|BC021036.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3836590),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=3405
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 1928 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 1879
>gb|BC023606.1| Homo sapiens mRNA similar to actin, beta (cDNA clone IMAGE:4640691)
Length=2527
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 1077 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 1028
>gb|BC019044.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4635339, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2503
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 1056 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 1007
>gb|BC021033.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3832154, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 1077 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 1028
>gb|BT019856.1| Homo sapiens actin, gamma 1 mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 267 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 218
>gb|BC007442.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:4484 IMAGE:2962953),
complete cds
Length=1938
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 326 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 277
>gb|BC053572.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:61615 IMAGE:3865767),
complete cds
Length=1912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 319 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 270
>gb|BC000292.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:8332 IMAGE:2819345),
complete cds
Length=1940
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 332 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 283
>gb|BC012050.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:19847 IMAGE:4554944),
complete cds
Length=1936
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 326 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 277
>gb|BC063495.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5398241)
Length=1856
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 258 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 209
>gb|BC001920.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:3728 IMAGE:2820489),
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mRNA
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mRNA
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(LOC104655172), misc_RNA
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(LOC104676787), mRNA
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mRNA
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variant X1, mRNA
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mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 297 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 250
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 348 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 301
>ref|XM_008498594.1| PREDICTED: Calypte anna actin, cytoplasmic type 5 (LOC103532802),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 282 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 235
>emb|LK052943.1| Rhodosporidium toruloides strain CECT1137, genomic scaffold,
scaffold RHTO0S08
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X2, mRNA
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Sbjct 270 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
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mRNA
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Sbjct 383 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 336
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mRNA
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Sbjct 345 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 298
>ref|XM_007864467.1| Gloeophyllum trabeum ATCC 11539 actin 1 partial mRNA
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Sbjct 267 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 220
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variant X1, mRNA
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Sbjct 301 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 254
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Sbjct 288 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 241
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Sbjct 297 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 250
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Sbjct 288 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 241
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Sbjct 290 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 243
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cds
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Sbjct 385 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 338
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cds
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transcript variant X1, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 377 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 330
>ref|XM_005642601.1| Coccomyxa subellipsoidea C-169 Actin/actin-like protein (COCSUDRAFT_60601)
mRNA, complete cds
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mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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X1, mRNA
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(LOC101792739), mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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transcript variant X3, misc_RNA
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 283 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 236
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variant X1, mRNA
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Sbjct 287 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 240
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variant X1, mRNA
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Sbjct 307 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 260
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mRNA
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Sbjct 284 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 237
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>ref|XR_193143.1| PREDICTED: Jaculus jaculus actin, cytoplasmic 2-like (LOC101610818),
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X1, mRNA
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mRNA
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complete cds
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Sbjct 267 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 220
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mRNA, complete cds
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(LOC100229883), mRNA
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mRNA
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Sbjct 330 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 283
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2 (ACTB), mRNA
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Sbjct 475 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 428
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1 (ACTB), mRNA
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variant 2 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 525 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 478
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variant 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 431 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 384
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misc_RNA
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Sbjct 352 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 305
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(LOC100923807), mRNA
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Sbjct 270 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
>gb|JX046106.1| Capra hircus beta-actin (ACTB) mRNA, complete cds
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Sbjct 275 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 228
>gb|JN558341.1| Polarella glacialis clone 4 actin 1 gene, partial sequence
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Sbjct 141 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 94
>gb|JN558340.1| Polarella glacialis clone 3 actin 1 gene, partial sequence
Length=946
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Sbjct 141 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 94
>ref|NG_030530.1| Canis lupus familiaris actin, cytoplasmic 2 pseudogene (LOC610787)
on chromosome 3
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Sbjct 272 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 225
>dbj|AK306863.1| Pan troglodytes mRNA for actin, cytoplasmic 1, complete cds,
clone: PtsC-1-5_F07
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Sbjct 351 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 304
>gb|JF303662.1| Trichoplusia ni actin mRNA, complete cds
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Sbjct 331 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 284
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Sbjct 413 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 366
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mRNA
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Sbjct 546 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 593
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variant 4 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 265 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 218
>ref|XM_002802725.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 3 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 382 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 335
>ref|XM_002802724.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 2 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 365 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 318
>ref|XM_002802723.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 1 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 362 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 315
>ref|XM_002603087.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
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Sbjct 270 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
>ref|XM_002591972.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1131
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Sbjct 270 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
>ref|XM_002590479.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1134
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 270 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
>ref|XM_002590113.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=683
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 340 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 293
>emb|FN392558.1| Imantonia rotunda partial mRNA for actin, contig 15964
Length=545
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 334 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 381
>ref|XM_002503045.1| Micromonas sp. RCC299 chromosome 6 hypothetical protein (ACTIN)
mRNA, complete cds
Length=1457
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 345 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 298
>gb|CP001327.1| Micromonas sp. RCC299 chromosome 6, complete sequence
Length=1431126
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 87117 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 87164
>gb|EF437156.1| Globodera rostochiensis beta-actin (act-1) gene, complete cds
Length=2095
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 874 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 827
>gb|EU284024.1| Heterodera cynodontis isolate CD274 clone 1 actin gene, partial
cds
Length=903
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 68 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 21
>gb|EU284023.1| Heterodera cynodontis isolate CD274 clone 2 actin gene, partial
cds
Length=911
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 72 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 25
>dbj|AB374098.1| Ixodes persulcatus act mRNA for actin, complete cds
Length=1131
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 270 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
>gb|EU046492.1| Neovison vison beta-actin mRNA, complete cds
Length=1435
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 351 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 304
>gb|BC147868.1| Bos taurus actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:159646 IMAGE:8289805),
complete cds
Length=2024
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
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Sbjct 354 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 307
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Sbjct 103 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 56
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Sbjct 359 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 312
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Sbjct 364 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 317
>emb|CR731624.2| Tetraodon nigroviridis full-length cDNA
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Sbjct 304 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 257
>emb|CR724354.2| Tetraodon nigroviridis full-length cDNA
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Sbjct 344 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 297
>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
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Sbjct 380 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 333
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Sbjct 145 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 98
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Sbjct 267 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 220
>gb|S64189.1| type 2 actin [Emiliania huxleyi=Prymnesiophyte algae, CCMP379,
mRNA Partial, 629 nt]
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Sbjct 237 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 190
>emb|AJ719605.1| Gallus gallus mRNA for hypothetical protein, clone 4h19
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Sbjct 354 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 307
>emb|AJ719332.1| Gallus gallus mRNA for hypothetical protein, clone 1h13
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Sbjct 354 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 307
>emb|Z70044.1| C.familiaris mRNA for beta-actin
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Sbjct 203 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 156
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Sbjct 403 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 356
>gb|AY443356.1| Heterodera cyperi actin gene, partial cds
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Sbjct 75 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 28
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Sbjct 75 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 28
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Sbjct 75 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 28
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Sbjct 75 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 28
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Sbjct 75 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 28
>gb|AY443351.1| Heterodera latipons actin gene, partial cds
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Sbjct 111 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 64
>gb|AY161282.1| Heterodera glycines actin 1 gene, complete cds
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Sbjct 845 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 798
>gb|AY161281.1| Globodera rostochiensis actin 2 mRNA, complete cds
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Sbjct 270 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
>gb|AF539593.1| Globodera rostochiensis actin mRNA, complete cds
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Sbjct 270 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
>gb|AF318603.2| Heterodera glycines actin 1 mRNA, complete cds
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Sbjct 352 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 305
>dbj|AB060287.1| Lethenteron camtschaticum LjCA1 mRNA for cytoplasmic actin, complete
cds
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Sbjct 348 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 301
>dbj|AB035662.1| Branchiostoma belcheri BbNA3 mRNA for notochord actin, complete
cds
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Sbjct 316 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 269
>dbj|AB035661.1| Branchiostoma belcheri BbNA2 mRNA for notochord actin, complete
cds
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Sbjct 323 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 276
>dbj|AB035660.1| Branchiostoma belcheri BbNA1 mRNA for notochord actin, complete
cds
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Sbjct 330 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 283
>gb|AF191490.1|AF191490 Bos taurus beta actin mRNA, partial cds
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Sbjct 167 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 120
>ref|NM_001003349.1| Canis lupus familiaris actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
gb|AF021873.2|AF021873 Canis familiaris beta-actin mRNA, complete cds
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 267 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 220
>gb|AF038150.1|AF038150 Mustela putorius furo beta-actin mRNA, partial cds
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 95 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
>ref|NM_001081838.1| Equus caballus actin, beta (ACTB), mRNA
gb|AF035774.1|AF035774 Equus caballus beta actin mRNA, complete cds
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 267 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 220
>dbj|AB004047.1| Cercopithecus aethiops mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1138
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 277 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 230
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Sbjct 342 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 295
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(Acta1), mRNA
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Sbjct 414 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 365
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(ACTA1), mRNA
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Sbjct 393 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 344
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misc_RNA
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Sbjct 113 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 67
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misc_RNA
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Sbjct 308 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCAT 259
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mRNA
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Sbjct 588 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 539
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mRNA
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Sbjct 394 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 345
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misc_RNA
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Sbjct 515 GGTGTGATGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 466
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misc_RNA
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Sbjct 405 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCAT 356
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mRNA
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Sbjct 273 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 224
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Sbjct 402 GGTGTGGTGCCAGATCTTTTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 353
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mRNA
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Sbjct 389 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCAT 340
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(ACTA1), mRNA
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Sbjct 445 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 396
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muscle (Acta1), mRNA
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Sbjct 373 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 324
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(LOC102790079), mRNA
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Sbjct 361 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 312
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Sbjct 272 GGTGTGGTGCCAAATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 223
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mRNA
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Sbjct 339 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGCTGGTGACGATGCCAT 290
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(LOC102367545), mRNA
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Sbjct 401 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 352
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mRNA
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Sbjct 378 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 329
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gene), antisense
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Sbjct 1902 GGTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 1853
>ref|XM_005737287.1| PREDICTED: Pundamilia nyererei actin, alpha cardiac-like (LOC102197763),
mRNA
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Sbjct 382 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 333
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(ACTA1), mRNA
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 395 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 346
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 354 GGTGTGGTGCCAAATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 305
>ref|XM_005340038.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus actin, beta (Actb),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 346 GGTGTGGTGCCAAATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 297
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Query 2 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 48
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Sbjct 462 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 416
>ref|XM_004860926.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, gamma 1 (Actg1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1274
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 355 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCAT 306
>ref|XM_004898171.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, alpha 1, skeletal muscle
(Acta1), mRNA
ref|XM_004854689.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, alpha 1, skeletal muscle
(Acta1), mRNA
Length=1356
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Query 1 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT 50
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Sbjct 359 GGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCAT 310
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG
>ref|XM_006722049.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X2, mRNA
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 109 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 158
>ref|XM_006722048.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
Length=2129
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 109 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 158
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 85 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 134
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 85 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 134
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 85 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 134
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 5020 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 5069
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 18 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 67
>gb|BC007442.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:4484 IMAGE:2962953),
complete cds
Length=1938
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 5 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 54
>gb|BC010999.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:15377 IMAGE:3940861),
complete cds
Length=1934
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 4 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 53
>gb|BC009848.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:15376 IMAGE:3939552),
complete cds
Length=1962
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Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 2 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 51
>emb|X04098.1| Homo sapiens mRNA for cytoskeletal gamma-actin (ACTG1 gene)
Length=1918
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 19 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 68
>gb|AC139149.6| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-766D20, complete sequence
Length=81577
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 18640 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 18689
>gb|M37130.1|HUMGACTA1 Human gamma-actin pseudogene, 5' end
Length=348
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 19 GCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 68
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 2 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 30864 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 30912
>dbj|AK304637.1| Homo sapiens cDNA FLJ57283 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1387
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 2 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 16 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 64
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 2 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 19 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 67
>gb|BC012050.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:19847 IMAGE:4554944),
complete cds
Length=1936
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 2 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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Sbjct 6 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 54
>gb|BC018774.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:32064 IMAGE:4869628),
complete cds
Length=1812
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 2 CTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGG 50
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17 17 79479794 79479321 64m373n36m GTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCCGCGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479791 79479318 67m373n33m CTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCCGCGCTGGTCA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 79479785 79479312 73m373n27m CCGCTCCGCCGTTGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCCGCGCTGGTCATTGACAATGGCT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 27675345 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCC 27675299
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGC 46
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Sbjct 48229185 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGCCG-TGC 48229141
>ref|NT_007592.16| Homo sapiens chromosome 6 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
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assembly
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Query 4 TGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 46145238 TGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTTGTGACGATGCCATG 46145192
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assembly
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 5519258 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 5519304
>ref|NT_026437.13| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR14_CTG1
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assembly
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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>ref|NW_001838952.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188412, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGC 46
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HuRef SCAF_1103279188258, whole genome shotgun sequence
gb|DS486033.1| Homo sapiens SCAF_1103279188258 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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HSCHR17_CTG4
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assembly
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genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
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>ref|NW_004929407.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150191.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
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shotgun sequence
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>ref|NW_001838458.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188205, whole genome shotgun sequence
gb|DS486315.1| Homo sapiens SCAF_1103279188205 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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gene, encodes complete protein
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>gb|KJ904414.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_13808 ACTG1
gene, encodes complete protein
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Sbjct 331 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 282
>gb|KJ896370.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05764 ACTG1
gene, encodes complete protein
Length=1257
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Sbjct 331 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 282
>ref|XM_006722049.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X2, mRNA
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 548 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 499
>ref|XM_006722048.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
Length=2129
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 548 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 499
>ref|XM_006210388.1| PREDICTED: Vicugna pacos actin, beta (ACTB), mRNA
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 274 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 225
>ref|XM_006173153.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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>ref|XM_005521369.1| PREDICTED: Pseudopodoces humilis actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC102110255), transcript variant X1, mRNA
Length=1446
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 343 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 294
>ref|XM_004840381.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, beta (Actb), transcript
variant X3, mRNA
Length=1819
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 353 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 304
>ref|XM_004840379.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, beta (Actb), transcript
variant X1, mRNA
Length=1888
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 422 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 373
>ref|XM_004894014.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, beta (Actb), transcript
variant X1, mRNA
Length=1885
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 422 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 373
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 405 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 356
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 524 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 475
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 405 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 356
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 31645 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 31596
>ref|XM_002610521.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1214
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 220
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 5802 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 5753
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cytoplasmic 2
Length=1387
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 335 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 286
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 338 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 289
>gb|EU832621.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067650; DKFZo008B0831
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 288 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 239
>gb|EU832693.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067722; DKFZo004B0832
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 288 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 239
>emb|CU680176.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017126
5' read ACTG1 mRNA
Length=1134
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 233
>emb|CU676328.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100021914
5' read ACTG1 mRNA
Length=1161
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 233
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 289
>gb|EU176631.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011619; FLH263907.01L;
RZPDo839C03246D actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes
complete protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 288 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 239
>ref|NM_001134769.1| Pan troglodytes actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
dbj|AB222159.1| Pan troglodytes verus actg1 mRNA for actin, gamma 1, complete
cds, clone: PstA5646
Length=1942
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 338 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 289
>gb|DQ891374.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004004; FLH176328.01X; RZPDo839C01122D
actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes complete protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 288 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 239
>gb|BC021036.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3836590),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=3405
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 1927 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 1878
>gb|BC023606.1| Homo sapiens mRNA similar to actin, beta (cDNA clone IMAGE:4640691)
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clone ****
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misc_RNA
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mRNA
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(Acta1), mRNA
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mRNA
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(LOC104655172), misc_RNA
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(LOC104676787), mRNA
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mRNA
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(ACTA1), mRNA
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Sbjct 392 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 343
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Sbjct 458 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 412
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 220
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misc_RNA
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Sbjct 113 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 67
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variant X3, mRNA
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Sbjct 263 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 217
>ref|XM_010001331.1| PREDICTED: Chaetura pelagica actin-like 9 (ACTL9), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 274 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 228
>ref|XR_169573.2| PREDICTED: Pan troglodytes actin, cytoplasmic 1-like (LOC101057446),
misc_RNA
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Sbjct 307 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCATG 258
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mRNA
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Sbjct 587 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 538
>ref|XM_003895688.2| PREDICTED: Papio anubis actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 458 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 412
>ref|XM_003893792.2| PREDICTED: Papio anubis actin, alpha 1, skeletal muscle (ACTA1),
mRNA
Length=1509
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Sbjct 393 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 344
>ref|XR_651304.1| PREDICTED: Papio anubis actin, cytoplasmic 2-like (LOC103887265),
misc_RNA
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scaffold RHTO0S08
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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variant X1, mRNA
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mRNA, complete cds
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mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant 1, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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(Acta1), mRNA
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(Acta1), mRNA
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mRNA
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variant 1 (ACTG1), mRNA
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muscle, transcript variant 1 (ACTA1), mRNA
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complete cds
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mRNA, complete cds
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(LOC100229883), mRNA
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mRNA
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2 (ACTG1), mRNA
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1 (ACTG1), mRNA
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mRNA
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misc_RNA
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variant 1, mRNA
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variant 2, mRNA
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Sbjct 368 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 319
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on chromosome 1
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2 (ACTB), mRNA
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Sbjct 474 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 428
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1 (ACTB), mRNA
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Sbjct 314 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 268
>ref|XM_004040825.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, gamma 1, transcript
variant 2 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 524 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 478
>ref|XM_004040824.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, gamma 1, transcript
variant 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 430 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 384
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Sbjct 351 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 305
>ref|NR_027247.2| Homo sapiens POTE ankyrin domain family, member F pseudogene
(LOC100130331), non-coding RNA
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Sbjct 1901 GTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 1852
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
>ref|XM_003969468.1| PREDICTED: Takifugu rubripes actin, alpha skeletal muscle A-like
(LOC101069447), mRNA
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Sbjct 338 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 289
>ref|XM_003754973.1| PREDICTED: Sarcophilus harrisii actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC100923807), mRNA
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
>gb|JX046106.1| Capra hircus beta-actin (ACTB) mRNA, complete cds
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Sbjct 274 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 228
>gb|JN558341.1| Polarella glacialis clone 4 actin 1 gene, partial sequence
Length=946
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Sbjct 140 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 94
>gb|JN558340.1| Polarella glacialis clone 3 actin 1 gene, partial sequence
Length=946
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Sbjct 140 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 94
>ref|NG_030530.1| Canis lupus familiaris actin, cytoplasmic 2 pseudogene (LOC610787)
on chromosome 3
Length=1335
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Sbjct 271 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 225
>gb|JF410917.1| Malletia abyssorum clone 1 actin (MAC) gene, partial cds
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Sbjct 853 GTGTGATGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 804
>dbj|AK306863.1| Pan troglodytes mRNA for actin, cytoplasmic 1, complete cds,
clone: PtsC-1-5_F07
Length=1824
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 304
>emb|FQ311444.1| Sporisorium reilianum SRZ2 chromosome 22 complete DNA sequence
Length=385084
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 196989 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 196943
>gb|JF303662.1| Trichoplusia ni actin mRNA, complete cds
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 330 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 284
>ref|XM_009441732.1| PREDICTED: Pan troglodytes actin-like (LOC469722), mRNA
Length=3118
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 1902 GTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 1853
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cds
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mRNA
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Sbjct 356 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 405
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variant 4 (ACTA1), mRNA
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Sbjct 377 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 328
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variant 2 (ACTA1), mRNA
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Sbjct 399 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 350
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variant 1 (ACTA1), mRNA
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Sbjct 377 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 328
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Sbjct 462 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 416
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partial cds
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Sbjct 188 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 139
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
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Sbjct 339 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 293
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Sbjct 335 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 381
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mRNA, complete cds
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Sbjct 344 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 298
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Sbjct 87118 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 87164
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Sbjct 315 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 266
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Sbjct 873 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 827
>gb|EU284024.1| Heterodera cynodontis isolate CD274 clone 1 actin gene, partial
cds
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Sbjct 67 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 21
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cds
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Sbjct 71 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 25
>gb|AC202851.10| Macaca mulatta BAC CH250-309J8 (Children's Hospital Oakland Research
Institute Rhesus macaque Adult Male BAC Library) complete
sequence
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Sbjct 84103 GTGTGATGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 84054
>gb|BC164475.1| Danio rerio actin, alpha 1a, skeletal muscle, mRNA (cDNA clone
MGC:191650 IMAGE:100059959), complete cds
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Sbjct 306 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 257
>ref|XM_001840031.1| Coprinopsis cinerea okayama7#130 ### actin, mRNA
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Sbjct 266 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTAACGATGCCATG 217
>dbj|AB374098.1| Ixodes persulcatus act mRNA for actin, complete cds
Length=1131
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 223
>emb|AM411664.1| Plasmodiophora brassicae partial ORF1 and actI gene for actin
I, clone PbURM
Length=3734
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Sbjct 2533 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 2487
>gb|EU046492.1| Neovison vison beta-actin mRNA, complete cds
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Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 304
>gb|BC147868.1| Bos taurus actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:159646 IMAGE:8289805),
complete cds
Length=2024
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 363 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 317
>gb|BC142413.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:159611 IMAGE:8448844),
complete cds
Length=1845
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 354 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 308
>gb|AY668805.2| Uncultured bacterium clone abc48b09.x1 16S ribosomal RNA gene,
partial sequence
Length=424
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 363 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 412
>gb|AY667963.2| Uncultured bacterium clone abc21a02.x1 16S ribosomal RNA gene,
partial sequence
Length=428
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATG 50
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Sbjct 363 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATG 412
>gb|BT030480.1| Bos taurus actin, beta (ACTB), mRNA, complete cds
Length=1776
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 295 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 249
>gb|DQ661647.1| Bubalus bubalis beta-actin mRNA, complete cds
Length=1143
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 276 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 230
>ref|NM_001285025.1| Macaca fascicularis actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB170391.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10647, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1729
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 304
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG
>ref|XM_006722049.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X2, mRNA
Length=779
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 141
>ref|XM_006722048.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
Length=2129
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 141
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 117
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 117
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 117
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5003 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 5052
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
>emb|X04098.1| Homo sapiens mRNA for cytoskeletal gamma-actin (ACTG1 gene)
Length=1918
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 51
>gb|AC139149.6| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-766D20, complete sequence
Length=81577
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18623 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG 18672
>gb|M37130.1|HUMGACTA1 Human gamma-actin pseudogene, 5' end
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17 17 79479827 79479354 69m373n31m GGTCTCGGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479824 79479351 66m373n34m CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479820 79479347 62m373n38m GCCGCCGCTGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479817 79479344 59m373n41m GCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479814 79479341 56m373n44m GCTGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479811 79479337 48m373n24m1d28m GCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCCTCCGCCGTCGCGTTTCTCT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479808 79479323 62m385n38m AGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479805 79479332 53m373n47m TCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479802 79479329 56m373n44m CGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479799 79479326 59m373n41m ACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479796 79479323 62m373n38m CTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479793 79479320 65m373n35m TTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCCGCGCTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479790 79479317 68m373n32m TTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCCGCGCTGGTCATT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479787 79479314 71m373n29m CGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCCGCGCTGGTCATTGACAAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479784 79479311 74m373n26m CGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCCGCGCTGGTCATTGACAATGGCTCC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479781 79479308 77m373n23m TCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCCGCGCTGGTCATTGACAATGGCTCCGGCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479778 79479305 80m373n20m GCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCCGCGCTGGTCATTGACAATGGCTCCGGCATGTGCAAA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 79479772 79479299 86m373n14m GCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGAAGAGATCGCCGCGCTGGTCATTGACAATGGCTCCGGCATGTGCAAAGCTGGTTTTGCT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Length=177800000
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sequence
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Sbjct 17373967 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 17374016
>ref|NW_001838951.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
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Sbjct 6369744 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCGTGCTCAATGG 6369695
>ref|NW_001838859.2| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188159, whole genome shotgun sequence
gb|DS486065.1| Homo sapiens SCAF_1103279188159 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 17312100 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCCATGG 17312149
>gb|CH471058.2| Homo sapiens 211000035845015 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 298454 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCCATGG 298405
>gb|CH471084.1| Homo sapiens 211000035840020 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=28665942
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Sbjct 6374822 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCGTGCTCAATGG 6374773
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 72287853 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCGTGCTCAATGG 72287804
>ref|AC_000134.1| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 72974978 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCGTGCTCAATGG 72974929
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Sbjct 5529266 CCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 5529315
>ref|NC_000014.9| Homo sapiens chromosome 14, GRCh38 Primary Assembly
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Sbjct 18999125 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCCATGG 18999076
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Sbjct 19402651 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCCATGG 19402700
>ref|NC_000015.10| Homo sapiens chromosome 15, GRCh38 Primary Assembly
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Sbjct 34793435 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATACCATGCTCGATGG 34793484
>ref|NC_000022.11| Homo sapiens chromosome 22, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000684.2| Homo sapiens chromosome 22, GRCh38 reference primary assembly
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Sbjct 15721744 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCCATGG 15721695
>ref|NT_007819.18| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR7_CTG1
gb|GL000055.2| Homo sapiens chromosome 7 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Sbjct 5519266 CCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 5519315
>ref|NT_026437.13| Homo sapiens chromosome 14 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR14_CTG1
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assembly
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shotgun sequence
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Sbjct 5279235 CCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 5279284
>ref|NW_001838998.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
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sequence
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sequence
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>ref|NW_001838214.2| Homo sapiens chromosome 15 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188256, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 5481461 CCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 5481510
>ref|AC_000147.1| Homo sapiens chromosome 15, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 11931112 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATACCATGCTCGATGG 11931161
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
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Sbjct 5615242 CCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 5615291
>gb|CM000258.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 5528678 CCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 5528727
>gb|CM000266.1| Homo sapiens chromosome 15, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 11844983 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATACCATGCTCGATGG 11845032
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG
>ref|NC_000017.11| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000679.2| Homo sapiens chromosome 17, GRCh38 reference primary assembly
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Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 81512802 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 81512753
>ref|NT_010783.16| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR17_CTG4
gb|GL000132.2| Homo sapiens chromosome 17 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=54806562
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Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 54576822 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 54576773
>ref|NC_018928.2| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001625.2| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=81289577
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Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 79566109 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTTTTCCGCCGCTCCG 79566060
>ref|NW_004929407.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150191.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=54469784
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Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 54240633 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTTTTCCGCCGCTCCG 54240584
>gb|KE141166.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold101, whole genome
shotgun sequence
Length=15663743
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Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 13956832 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 13956783
>gb|GL583196.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_216, whole genome
shotgun sequence
Length=3418688
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Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 238666 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 238715
>gb|CM000507.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76566745
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Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 74928394 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 74928345
>gb|DS990953.1| Homo sapiens SCAF_1112675837150 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 1019559 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 1019510
>ref|NW_001838458.1| Homo sapiens chromosome 17 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188205, whole genome shotgun sequence
gb|DS486315.1| Homo sapiens SCAF_1103279188205 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 1019622 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 1019573
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000478.1| Homo sapiens chromosome 17, whole genome shotgun sequence
Length=76567021
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 74928644 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 74928595
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG
>ref|XM_003831125.2| PREDICTED: Pan paniscus actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=1957
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 372 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 323
>gb|KJ905681.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15351 ACTG1
gene, encodes complete protein
Length=1257
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 323 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 274
>gb|KJ904414.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_13808 ACTG1
gene, encodes complete protein
Length=1256
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 323 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 274
>gb|KJ896370.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05764 ACTG1
gene, encodes complete protein
Length=1257
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 323 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 274
>ref|XM_006722049.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X2, mRNA
Length=779
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 540 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 491
>ref|XM_006722048.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
Length=2129
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 540 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 491
>ref|XM_006210388.1| PREDICTED: Vicugna pacos actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1724
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 259 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 210
>ref|XM_006176094.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1734
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 266 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 217
>ref|XM_006173153.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=1713
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 113 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 64
>tpe|HG493361.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000095477.1 (RP11-193H5.1
gene), antisense
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 1893 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 1844
>ref|NG_008799.2| Homo sapiens ryanodine receptor 2 (cardiac) (RYR2), RefSeqGene
on chromosome 1
Length=930658
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 889686 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 889637
>ref|NR_027247.2| Homo sapiens POTE ankyrin domain family, member F pseudogene
(LOC100130331), non-coding RNA
Length=3148
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 1893 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 1844
>ref|XM_009441732.1| PREDICTED: Pan troglodytes actin-like (LOC469722), mRNA
Length=3118
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 1894 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 1845
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 397 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 348
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 516 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 467
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 397 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 348
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 31637 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 31588
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 5794 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 5745
>dbj|AK304637.1| Homo sapiens cDNA FLJ57283 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1387
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 327 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 278
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 281
>gb|EU832621.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067650; DKFZo008B0831
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 231
>gb|EU832693.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067722; DKFZo004B0832
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 231
>gb|AC202851.10| Macaca mulatta BAC CH250-309J8 (Children's Hospital Oakland Research
Institute Rhesus macaque Adult Male BAC Library) complete
sequence
Length=156151
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 84095 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 84046
>emb|CU680176.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017126
5' read ACTG1 mRNA
Length=1134
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 225
>emb|CU676328.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100021914
5' read ACTG1 mRNA
Length=1161
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 225
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 281
>gb|EU176631.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011619; FLH263907.01L;
RZPDo839C03246D actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes
complete protein
Length=1168
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 280 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 231
>ref|NM_001134769.1| Pan troglodytes actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
dbj|AB222159.1| Pan troglodytes verus actg1 mRNA for actin, gamma 1, complete
cds, clone: PstA5646
Length=1942
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 281
>gb|DQ891374.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004004; FLH176328.01X; RZPDo839C01122D
actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes complete protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 231
>gb|BC021036.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3836590),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=3405
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 1919 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 1870
>gb|BC023606.1| Homo sapiens mRNA similar to actin, beta (cDNA clone IMAGE:4640691)
Length=2527
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 1068 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 1019
>gb|BC019044.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4635339, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2503
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1047 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 998
>gb|BC021033.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3832154, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2528
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 1019
>gb|BT019856.1| Homo sapiens actin, gamma 1 mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 258 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 209
>gb|BC007442.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:4484 IMAGE:2962953),
complete cds
Length=1938
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 317 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 268
>gb|BC053572.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:61615 IMAGE:3865767),
complete cds
Length=1912
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 261
>gb|BC000292.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:8332 IMAGE:2819345),
complete cds
Length=1940
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 274
>gb|BC012050.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:19847 IMAGE:4554944),
complete cds
Length=1936
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 268
>gb|BC063495.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5398241)
Length=1856
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 200
>gb|BC001920.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:3728 IMAGE:2820489),
complete cds
Length=1744
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 286 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 237
>gb|BC018774.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:32064 IMAGE:4869628),
complete cds
Length=1812
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 268
>gb|BC015779.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:23584 IMAGE:4856294),
complete cds
Length=1791
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 293 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 244
>gb|BC015005.1| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:23578 IMAGE:4855463),
complete cds
Length=1778
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 312 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 263
>gb|BC004223.2| Homo sapiens actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3533309),
complete cds
Length=1691
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 235 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 186
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complete cds
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Sbjct 316 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 267
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complete cds
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Sbjct 319 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 270
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sequence
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Sbjct 224 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 175
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Sbjct 195 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 146
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complete cds
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Sbjct 314 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 265
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Sbjct 319 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 270
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1 (ACTG1) mRNA, complete cds
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>gb|AY892296.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116867.01L actin gamma
1 (ACTG1) mRNA, partial cds
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Sbjct 258 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 209
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Sbjct 331 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 282
>gb|M19283.1|HUMACTGA Human cytoskeletal gamma-actin gene, complete cds
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Sbjct 1268 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 1219
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Sbjct 292 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 243
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(LOC104834374), mRNA
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Sbjct 313 CCAGATCTTCTCCATGTCATCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 264
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misc_RNA
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Sbjct 291 CCAGATCTTCTCCATGTCATCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 242
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variant X1, mRNA
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mRNA
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Sbjct 313 CCAGATCTTCTCCATGTCATCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 264
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 266 CCAGATCTTCTCCATGTCATCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 217
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misc_RNA
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Sbjct 299 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCATGCTCAATGG 250
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Sbjct 363 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCAATGG 314
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Sbjct 422 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCGATGG 373
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misc_RNA
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Sbjct 506 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTGAATGG 457
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(LOC103803570), partial mRNA
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Sbjct 306 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCAATGG 257
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misc_RNA
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Sbjct 396 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCATGCTCAATGG 347
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Sbjct 277 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 228
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Sbjct 267 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 218
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Sbjct 300 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCGATGG 251
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(LOC102367545), mRNA
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variant X4, mRNA
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Sbjct 279 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 230
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variant X3, mRNA
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Sbjct 288 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 239
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variant X2, mRNA
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Sbjct 273 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 224
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variant X1, mRNA
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Sbjct 279 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 230
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Sbjct 281 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 232
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mRNA
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Sbjct 348 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 299
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 282 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 233
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variant X2, mRNA
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Sbjct 368 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 319
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variant X1, mRNA
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Sbjct 368 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 319
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mRNA
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Sbjct 294 CCAGATCTTCTCCATGTCATCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 245
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(LOC102110255), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 335 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCGATGG 286
>ref|XM_005340040.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus actin, beta (Actb),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 345 CCAAATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 296
>ref|XM_005340038.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus actin, beta (Actb),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 337 CCAAATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 288
>ref|XM_005225005.1| PREDICTED: Bos taurus actin, beta (ACTB), transcript variant
X1, mRNA
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transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 330 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCAATGG 281
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variant X3, mRNA
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Sbjct 345 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCGATGG 296
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variant X1, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 414 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCGATGG 365
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misc_RNA
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muscle, transcript variant 2 (ACTA1), mRNA
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Sbjct 350 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCAATGG 301
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muscle, transcript variant 1 (ACTA1), mRNA
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Sbjct 368 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCAATGG 319
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mRNA, complete cds
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Sbjct 285 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 236
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mRNA, complete cds
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Sbjct 286 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 237
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variant 2 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 516 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 467
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variant 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 422 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 373
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misc_RNA
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Sbjct 342 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCGATGG 293
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Sbjct 261 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 212
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(LOC101069447), mRNA
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Sbjct 330 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCAATGG 281
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Sbjct 258 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 209
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Sbjct 1894 CCACATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 1845
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Sbjct 132 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 83
>gb|JN558340.1| Polarella glacialis clone 3 actin 1 gene, partial sequence
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Sbjct 132 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 83
>ref|NG_030530.1| Canis lupus familiaris actin, cytoplasmic 2 pseudogene (LOC610787)
on chromosome 3
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Sbjct 263 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 214
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Sbjct 845 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCGATGG 796
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Sbjct 404 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 355
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Sbjct 261 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCGATGG 212
>gb|FJ713569.1| Hemibarbus mylodon muscle actin type 1 mRNA, complete cds
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Sbjct 307 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCAATGG 258
>gb|BC142413.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:159611 IMAGE:8448844),
complete cds
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Sbjct 346 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 297
>gb|BT030480.1| Bos taurus actin, beta (ACTB), mRNA, complete cds
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Sbjct 287 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 238
>gb|DQ661647.1| Bubalus bubalis beta-actin mRNA, complete cds
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Sbjct 268 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 219
>gb|DQ980436.1| Apusomonas proboscidea clone apactin4rt actin mRNA, partial cds
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Sbjct 204 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 155
>gb|DQ980416.1| Apusomonas proboscidea clone apactin1g actin gene, partial cds
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Sbjct 290 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 241
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Sbjct 340 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATACCATGCTCAATGG 291
>gb|DQ838049.1| Bos grunniens beta-actin mRNA, complete cds
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Sbjct 258 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 209
>gb|AY141970.1| Bos taurus beta-actin (ACTB) mRNA, complete cds
Length=1804
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Sbjct 297 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 248
>ref|NM_173979.3| Bos taurus actin, beta (ACTB), mRNA
gb|BC102948.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:128179 IMAGE:7945368),
complete cds
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Sbjct 350 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 301
>gb|AY646115.1| Spermophilus citellus beta-actin mRNA, complete cds
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Sbjct 265 CCAAATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 216
>gb|AY090616.1| Calotes versicolor beta actin-like protein mRNA, partial cds
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Sbjct 136 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 87
>gb|AF484115.1| Canis familiaris beta-actin mRNA, partial cds
Length=568
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Sbjct 258 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 209
>emb|Z70044.1| C.familiaris mRNA for beta-actin
Length=553
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Sbjct 194 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 145
>gb|BC071401.1| Danio rerio zgc:86725, mRNA (cDNA clone MGC:86725 IMAGE:6897544),
complete cds
Length=1381
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Sbjct 346 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCAATGG 297
>gb|AY443355.1| Heterodera ripae actin gene, partial cds
Length=902
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 66 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 17
>gb|AF191490.1|AF191490 Bos taurus beta actin mRNA, partial cds
Length=244
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 158 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAATGG 109
>gb|U38850.1|FRU38850 Fugu rubripes alpha-skeletal actin1 gene, complete cds
Length=4170
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 2047 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCAATGG 1998
>ref|XM_010621912.1| PREDICTED: Fukomys damarensis actin, alpha 1, skeletal muscle
(Acta1), mRNA
Length=1422
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAAT 48
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Sbjct 405 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCAAT 358
>ref|XM_004087398.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys uncharacterized LOC101179093 (LOC101179093),
mRNA
Length=807
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAAT 48
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 467 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGAGGATGCCATGCTCAAT 514
>ref|XR_121418.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys actin, cytoplasmic 1-like (LOC100584240),
misc_RNA
Length=1693
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAAT 48
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Sbjct 339 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGAGGATGCCATGCTCAAT 292
>gb|EU284024.1| Heterodera cynodontis isolate CD274 clone 1 actin gene, partial
cds
Length=903
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAAT 48
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Sbjct 59 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAAT 12
>gb|EU284023.1| Heterodera cynodontis isolate CD274 clone 2 actin gene, partial
cds
Length=911
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAAT 48
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Sbjct 63 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAAT 16
>gb|AF232730.3| Marmota monax beta-actin mRNA, partial cds
Length=855
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAAT 48
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Sbjct 48 CCAAATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAAT 1
>gb|AY443356.1| Heterodera cyperi actin gene, partial cds
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enteric (Actg2), transcript variant X1, mRNA
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(LOC104676787), mRNA
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mRNA
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mRNA
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5 (LOC104489878), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 269 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCGTGCTCAATGG 220
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misc_RNA
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variant X3, mRNA
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variant X1, mRNA
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mRNA
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misc_RNA
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mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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(Acta1), mRNA
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Sbjct 382 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 333
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Sbjct 206 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 157
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scaffold RHTO0S08
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mRNA
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variant X1, mRNA
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mRNA
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(ACTA1), mRNA
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Sbjct 181 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 132
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muscle (Acta1), mRNA
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Sbjct 364 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGCTCGATGG 315
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1
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Sbjct 442 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 393
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mRNA
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Sbjct 258 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTAACGATGCCGTGCTCAATGG 209
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Sbjct 288 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCGTGCTCAATGG 239
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mRNA
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Sbjct 132 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 83
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Sbjct 336 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 287
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 231 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 182
>ref|XM_006635160.1| PREDICTED: Lepisosteus oculatus actin, cytoplasmic 2-like (LOC102690749),
transcript variant X1, mRNA
Length=1131
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 261 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 212
>gb|KF724862.1| Mya arenaria actin mRNA, partial cds
Length=927
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 57 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACAATGCCGTGCTCAATGG 8
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mRNA
Length=2052
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 329 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 280
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Length=1842
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Sbjct 282 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 233
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mRNA
Length=1615
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Sbjct 157 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 108
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enteric (ACTG2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 532 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGTTCAATGG 483
>ref|XM_006129108.1| PREDICTED: Pelodiscus sinensis actin, gamma 2, smooth muscle,
enteric (ACTG2), transcript variant X1, mRNA
Length=1360
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Sbjct 383 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCATGTTCAATGG 334
>ref|XM_006128029.1| PREDICTED: Pelodiscus sinensis actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC102458214), mRNA
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Sbjct 299 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 250
>ref|XM_006096777.1| PREDICTED: Myotis lucifugus actin, gamma 2, smooth muscle, enteric
(ACTG2), transcript variant X1, mRNA
Length=1325
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Sbjct 381 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 332
>ref|XM_006087490.1| PREDICTED: Myotis lucifugus actin, alpha, cardiac muscle 1 (ACTC1),
transcript variant X1, mRNA
Length=1196
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Sbjct 264 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 215
>gb|KF410817.1| Rapana venosa actin (Act1) mRNA, complete cds
Length=1565
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Sbjct 372 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 323
>ref|XM_006034798.1| PREDICTED: Alligator sinensis actin, gamma 1 (ACTG1), transcript
variant X1, mRNA
Length=2016
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Sbjct 292 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 243
>ref|XM_005982877.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii actin, alpha 1, skeletal muscle
(ACTA1), mRNA
Length=1512
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Sbjct 399 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 350
>ref|XM_005963767.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii actin, gamma 1 (ACTG1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1894
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 289 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 240
>ref|XM_005905390.1| PREDICTED: Bos mutus actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=1884
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 281 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 232
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 397 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 348
>ref|XM_005896702.1| PREDICTED: Bos mutus actin, alpha 1, skeletal muscle (ACTA1),
transcript variant X1, mRNA
Length=1488
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 369 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 320
>ref|XM_005944026.1| PREDICTED: Haplochromis burtoni actin, alpha cardiac-like (LOC102305356),
mRNA
Length=1631
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 424 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 375
>ref|XM_005885780.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, alpha, cardiac muscle 1 (ACTC1),
mRNA
Length=1263
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 222 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 173
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 338 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCGATGG 289
>ref|XM_005870206.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, cytoplasmic 1-like (LOC102251030),
transcript variant X1, mRNA
Length=1453
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAA 47
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Sbjct 258 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTGCTCAA 212
>ref|XM_005869418.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, gamma 2, smooth muscle, enteric
(ACTG2), mRNA
Length=1307
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 367 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 318
>ref|XM_005845213.1| Chlorella variabilis hypothetical protein (CHLNCDRAFT_136976)
mRNA, complete cds
Length=1158
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 264 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTCACGATGCCGTGCTCAATGG 215
>ref|XM_005751673.1| PREDICTED: Pundamilia nyererei actin, alpha cardiac-like (LOC102195465),
mRNA
Length=1774
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Query 1 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG 50
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Sbjct 405 CCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTGCTCAATGG 356
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG
>ref|XM_006722049.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X2, mRNA
Length=779
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 89 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 138
>ref|XM_006722048.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant
X1, mRNA
Length=2129
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 89 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 138
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
Length=1855
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 65 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 114
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
Length=2123
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 65 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 114
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
Length=2004
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 65 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 114
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
Length=9829
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 5000 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 5049
>gb|AC139149.6| Homo sapiens chromosome 17, clone RP13-766D20, complete sequence
Length=81577
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 18620 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 18669
>emb|X04098.1| Homo sapiens mRNA for cytoskeletal gamma-actin (ACTG1 gene)
Length=1918
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 1 TCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 48
>gb|M37130.1|HUMGACTA1 Human gamma-actin pseudogene, 5' end
Length=348
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 1 TCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 48
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
Length=35898
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 30843 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 30892
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 47
>gb|AC137896.5| Homo sapiens chromosome 17, clone RP11-765O14, complete sequence
Length=107289
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 7831 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 7782
>gb|M19283.1|HUMACTGA Human cytoskeletal gamma-actin gene, complete cds
Length=3583
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 474 GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCCCTCCG 523
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
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Sbjct 1 CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 47
>dbj|AK304637.1| Homo sapiens cDNA FLJ57283 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1387
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 AGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCG 44
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
reads
17 17 79478842 79478942 100M AGAAACACTTAAATGTCAGAAATCAAGCCGGGCAGAAAATGACTGGGGAAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCT
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17 17 79478854 79478954 100M ATGTCAGAAATCAAGCCGGGCAGAAAATGACTGGGGAAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTGGGCCT
17 17 79478857 79478957 100M TCAGAAATCAAGCCGGGCAGAAAATGACTGGGGAAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGG
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17 17 79478863 79478963 100M ATCAAGCCGGGCAGAAAATGACTGGGGAAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCA
17 17 79478866 79478966 100M AAGCCGGGCAGAAAATGACTGGGGAAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGG
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17 17 79478872 79478972 100M GGCAGAAAATGACTGGGGAAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCT
17 17 79478875 79478975 100M AGAAAATGACTGGGGAAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGGCTCGG
17 17 79478878 79478978 100M AAATGACTGGGGAAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCA
17 17 79478881 79478981 100M TGACTGGGGAAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCA
17 17 79478884 79478984 100M CTGGGGAAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCA
17 17 79478887 79478987 100M GGGAAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTG
17 17 79478890 79478990 100M AAAGGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTTTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGT
17 17 79478893 79478993 100M GGACGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCT
17 17 79478896 79478996 100M CGGGAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCT
17 17 79478899 79478999 100M GAGGAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCG
17 17 79478902 79479002 100M GAGCACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGG
17 17 79478905 79479005 100M CACGGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCA
17 17 79478908 79479008 100M GGGCGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGC
17 17 79478911 79479011 100M CGTCGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCA
17 17 79478914 79479014 100M CGGCCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCT
17 17 79478917 79479017 100M CCGAGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGT
17 17 79478920 79479020 100M AGCCTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGT
17 17 79478923 79479023 100M CTCACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGA
17 17 79478926 79479026 100M ACCTGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGATCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGG
17 17 79478929 79479029 100M TGAGTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGT
17 17 79478932 79479032 100M GTCATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGT
17 17 79478935 79479035 100M ATCTTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCC
17 17 79478938 79479038 100M TTCTCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGA
17 17 79478941 79479041 100M TCTCTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCT
17 17 79478944 79479044 100M CTGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCT
17 17 79478947 79479047 100M TTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCA
17 17 79478950 79479050 100M GCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGT
17 17 79478953 79479053 100M TTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGT
17 17 79478956 79479056 100M GGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCC
17 17 79478959 79479059 100M TTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGT
17 17 79478962 79479062 100M AGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGG
17 17 79478965 79479065 100M GGGGCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGA
17 17 79478968 79479068 100M GCCTCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGA
17 17 79478971 79479071 100M TCGGTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGC
17 17 79478974 79479074 100M GTCAGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCAT
17 17 79478977 79479077 100M AGCAGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCT
17 17 79478980 79479080 100M AGCACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAA
17 17 79478983 79479083 100M ACTGGGTGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG
17 17 79478986 79479086 100M GGGGGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGGGGG
17 17 79478989 79479089 100M TGCTCCTCCGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGGGGTACT
17 17 79478997 79479813 86M79479828F14m CGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCG
17 17 79478997 79479813 86M79479828F14m CGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCG
17 17 79478997 79479813 86M79479828F14m CGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCG
17 17 79478997 79479813 86M79479828F14m CGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCG
17 17 79478997 79479813 86M79479828F14m CGGGGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCG
17 17 79479000 79479810 83M79479828F17m GGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTG
17 17 79479000 79479810 83M79479828F17m GGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTG
17 17 79479000 79479810 83M79479828F17m GGCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTG
17 17 79479001 79479809 82M79479828F18m GCCACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGC
17 17 79479004 79479806 79M79479828F21m ACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAA
17 17 79479004 79479806 79M79479828F21m ACGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAA
17 17 79479005 79479805 78M79479828F22m CGCGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGC
17 17 79479007 79479803 76M79479828F24m CGCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTC
17 17 79479008 79479802 75M79479828F25m GCAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCT
17 17 79479009 79479801 74M79479828F26m CAGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTC
17 17 79479010 79479800 73M79479828F27m AGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCG
17 17 79479010 79479800 73M79479828F27m AGCTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCG
17 17 79479012 79479798 71M79479828F29m CTCGTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCA
17 17 79479015 79479795 68M79479828F32m GTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGGTCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCGCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTC
17 17 79479015 79479795 68M79479828F32m GTTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTC
17 17 79479016 79479794 67M79479828F33m TTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCT
17 17 79479020 79479790 63M79479828F37m AGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTC
17 17 79479022 79479788 61M79479828F39m AAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTT
17 17 79479025 79479785 58M79479828F42m GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCG
17 17 79479029 79479781 54M79479828F46m GGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGC
17 17 79479046 79479764 37M79479828F63m ATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCT
17 17 79479060 79479377 23M79479828F69m373n8m GGTGACGATGCCATGCTCAATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479064 79479373 19M79479828F69m373n12m ACGATCCCATGCTCAATGG GGTCCCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479079 79479358 4M79479828F69m373n27m ATGG GGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479835 79479362 77m373n23m CCGCGGTCGGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479830 79479357 72m373n28m GTCGGTCTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479827 79479354 69m373n31m GGTCTCGGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479824 79479351 66m373n34m CTCAGTCGCCGCTGCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479820 79479347 38m373n62m GCCGCCGCTGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479817 79479344 41m373n59m GCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479814 79479341 56m373n44m GCTGCCAGCTCTCGCCCTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479811 79479337 28m1d24m373n48m GCCAACTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCDCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479808 79479323 38m385n62m AGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479805 79479332 47m373n53m TCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479802 79479329 44m373n56m CGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479799 79479326 41m373n59m ACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479796 79479323 38m373n62m CTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479793 79479320 35m373n65m TTCTTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479790 79479317 32m373n68m TTCCGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479787 79479314 29m373n71m CGCCGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479784 79479311 26m373n74m CGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479781 79479308 23m373n77m TCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479778 79479305 20m373n80m GCCGTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479775 79479302 17m373n83m GTCGCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479772 79479299 14m373n86m GCGTTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479769 79479296 11m373n89m TTTCTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479766 79479293 8m373n92m CTCTGCCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479761 79479288 3m373n97m CCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479758 79479658 100m GTGAGCGCCCCGCCCCGGGGCCTGAGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGCCCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTCC
17 17 79479755 79479655 100m ACCGCCCCGCCCCGGGGCCTGAGCTGGTCGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCC
17 17 79479750 79479650 100m CCCGCCCCGGGGCCTGAGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAA
17 17 79479747 79479647 100m GCCCCGGGGCCTGAGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAA
17 17 79479744 79479644 100m CCGGGGCCTGAGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAG
17 17 79479741 79479641 100m GGGCCTGGGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCG
17 17 79479737 79479383 98m254n2m CTGAGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479734 79479380 95m254n5m AGCTGGACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479729 79479384 99m245n1m GACGTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGGGTGGGCCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479726 79479626 100m GTCGCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGGGTGGGCCGGGTCA
17 17 79479723 79479369 84m254n16m GCAGGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479720 79479620 100m GGCCTGCGCCCCCCGACCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGGGTGGGCCGGGTCAGGCGGA
17 17 79479717 79479363 78m254n22m CTGCGCCCCCCGGCCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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17 17 79479711 79479611 100m CCCCCGGCCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGGGTGGGCCGGGTCAGGCGGACGGGGCTGG
17 17 79479707 79479353 68m254n32m CGCCCCCGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479704 79479350 65m254n35m CCCCGGCCGGCCCCGCTTCCAGGTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479701 79479342 57m259n43m CGGCTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 17 79479698 79479598 100m CTGGCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGGGTGGGCCGGGTCAGGCGGACGGGGCTGGGGGGGCGCCGGGG
17 17 79479695 79479341 56m254n44m GCCCCGCTTCCAGCTGCCGAGGCCTCGTCGCGCCTTCCCCGGGAACAAAAGGCGGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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variant 12 (TTR), mRNA
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Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 167 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 118
>ref|XM_004059299.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 11 (TTR), mRNA
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 167 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 118
>ref|XM_004059298.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 10 (TTR), mRNA
Length=707
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 167 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 118
>ref|XM_004059297.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 9 (TTR), mRNA
Length=736
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 208 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 159
>ref|XM_004059296.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 8 (TTR), mRNA
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Sbjct 167 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 118
>ref|XM_004059295.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 7 (TTR), mRNA
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Sbjct 167 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 118
>ref|XM_004059294.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 6 (TTR), mRNA
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Sbjct 182 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 133
>ref|XM_004059293.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 5 (TTR), mRNA
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Sbjct 182 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 133
>ref|XM_004059292.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 4 (TTR), mRNA
Length=741
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Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 182 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 133
>ref|XM_004059291.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 3 (TTR), mRNA
Length=742
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Sbjct 182 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 133
>ref|XM_004059290.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 2 (TTR), mRNA
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Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 182 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 133
>ref|XM_004059289.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 1 (TTR), mRNA
Length=943
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Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 182 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 133
>ref|NM_001133592.2| Pongo abelii transthyretin (TTR), mRNA
Length=699
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Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 57 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 8
>gb|BC005310.1| Homo sapiens transthyretin, mRNA (cDNA clone MGC:12385 IMAGE:4071761),
complete cds
gb|GU727633.1| Homo sapiens epididymis tissue sperm binding protein Li 4a mRNA,
complete cds
Length=644
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Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 57 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 8
>ref|NG_009490.1| Homo sapiens transthyretin (TTR), RefSeqGene on chromosome 18
Length=14258
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Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 5167 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 5118
>ref|NM_000371.3| Homo sapiens transthyretin (TTR), mRNA
Length=938
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Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 167 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 118
>dbj|AK312051.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92332, Homo sapiens transthyretin (prealbumin,
amyloidosis type I) (TTR),mRNA
Length=472
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 59 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 10
>gb|AC079096.4| Homo sapiens chromosome 18, clone RP11-75N4, complete sequence
Length=119927
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 98812 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 98763
>gb|AC017100.4| Homo sapiens BAC clone RP11-549B18 from 18, complete sequence
Length=202950
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 143595 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 143644
>emb|CR925931.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp470G1011 (from clone DKFZp470G1011)
Length=700
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 58 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 9
>emb|X59498.1| H.sapiens ttr mRNA for transthyretin
Length=483
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 52 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 3
>gb|BC020791.1| Homo sapiens transthyretin, mRNA (cDNA clone MGC:23689 IMAGE:4734010),
complete cds
Length=650
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 57 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 8
>dbj|D00096.1|HUMPALFAP Homo sapiens mRNA for prealbumin, complete cds
Length=615
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 57 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 8
>gb|M15515.1|HUMPALF01 Human mutant prealbumin gene directly linked to familial amyloidotic
polyneuropathy (FAP), exons 1 and 2
Length=1913
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 638 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 589
>gb|M11844.1|HUMPALD Human prealbumin gene, complete cds
Length=7616
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 638 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 589
>gb|M11518.1|HUMPALC Human serum prealbumin gene, complete cds
Length=7619
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 638 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 589
>gb|M10605.1|HUMPALB Human prealbumin mRNA, complete cds
Length=614
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 56 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 7
>gb|K02091.1|HUMPALA Human prealbumin mRNA, complete cds
Length=615
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 57 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 8
>ref|XM_010380812.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana transthyretin (TTR), mRNA
Length=741
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 182 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 133
>ref|XM_007974367.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus transthyretin (TTR), mRNA
Length=828
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 257 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 208
>ref|XM_004087732.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys transthyretin (TTR), mRNA
Length=686
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 208 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 159
>ref|XM_004087731.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys transthyretin (TTR), mRNA
Length=710
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 208 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 159
>ref|XM_004087730.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys transthyretin (TTR), mRNA
Length=731
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 208 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 159
>ref|XM_004087729.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys transthyretin (TTR), mRNA
Length=764
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 208 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 159
>ref|XM_003261963.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys transthyretin, transcript variant
1 (TTR), mRNA
Length=967
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 208 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 159
>ref|NM_001261679.1| Macaca mulatta transthyretin (TTR), mRNA
Length=705
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 147 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 98
>dbj|AB646982.1| Chlorocebus pygerythrus cynosurus TTR gene for transthyretin,
complete cds
Length=1295
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 71 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 22
>dbj|AB571988.1| Chlorocebus aethiops TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1295
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 71 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 22
>dbj|AB571987.1| Callithrix jacchus TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1191
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
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Sbjct 72 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 23
>dbj|AB571985.1| Macaca fuscata TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1284
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 72 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 23
>dbj|AB222105.1| Pan troglodytes verus ttr mRNA for transthyretin, complete cds,
clone: PccB1539
Length=759
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 54 GGCAGAGGAGAAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 5
>ref|NM_001009137.1| Pan troglodytes transthyretin (TTR), mRNA
gb|AY785261.1| Pan troglodytes transthyretin (TTR) mRNA, complete cds
Length=611
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 57 GGCAGAGGAGAAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 8
>ref|XM_010335467.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis transthyretin (TTR),
transcript variant X2, mRNA
Length=1171
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGT 47
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 GGCAGAGGAGGAGCAGATGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGT 35
>ref|XM_010335466.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis transthyretin (TTR),
transcript variant X1, mRNA
Length=637
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGT 47
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 80 GGCAGAGGAGGAGCAGATGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGT 34
>ref|XM_003914273.2| PREDICTED: Papio anubis transthyretin (TTR), mRNA
Length=733
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 177 GGCACAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 128
>dbj|AB613821.1| Papio hamadryas TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1295
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGTGGA 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 72 GGCACAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 23
>dbj|AB591809.1| Saimiri sciureus TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1159
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGT 47
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 91 GGCAGAGGAGGAGCAGATGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGT 45
>dbj|AB591808.1| Saimiri boliviensis TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1159
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGCAGAGGAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGT 47
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 91 GGCAGAGGAGGAGCAGATGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAATGAGT 45
>dbj|AB083330.2| Macaca fascicularis ttr mRNA for transthyretin, complete cds
Length=612
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human transthyretin (prealbumin, amyloidosis type I) (TTR),mRNA,
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Sbjct 57 GGCAGAGAAGGAGCAGACGATGAGAAGCCATCCTGCCAAGAACGAGTGGA 8
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variant 2, mRNA
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Lambda K H
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right flanking sequence - AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG
>ref|XM_010380812.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana transthyretin (TTR), mRNA
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gene, encodes complete protein
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variant 13 (TTR), mRNA
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variant 12 (TTR), mRNA
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variant 11 (TTR), mRNA
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variant 10 (TTR), mRNA
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variant 9 (TTR), mRNA
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Sbjct 453 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 502
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variant 8 (TTR), mRNA
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Sbjct 412 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 461
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variant 7 (TTR), mRNA
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Sbjct 412 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 461
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variant 6 (TTR), mRNA
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Sbjct 427 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 476
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variant 5 (TTR), mRNA
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Sbjct 427 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 476
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variant 4 (TTR), mRNA
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Sbjct 427 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 476
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variant 3 (TTR), mRNA
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Sbjct 427 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 476
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variant 2 (TTR), mRNA
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Sbjct 427 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 476
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variant 1 (TTR), mRNA
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Sbjct 427 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 476
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Sbjct 302 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 351
>gb|JF432547.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100073771 transthyretin
(TTR) gene, encodes complete protein
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Sbjct 326 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 375
>gb|BC005310.1| Homo sapiens transthyretin, mRNA (cDNA clone MGC:12385 IMAGE:4071761),
complete cds
gb|GU727633.1| Homo sapiens epididymis tissue sperm binding protein Li 4a mRNA,
complete cds
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Sbjct 302 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 351
>ref|NG_009490.1| Homo sapiens transthyretin (TTR), RefSeqGene on chromosome 18
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Sbjct 8429 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 8478
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Sbjct 412 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 461
>dbj|AK312051.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92332, Homo sapiens transthyretin (prealbumin,
amyloidosis type I) (TTR),mRNA
Length=472
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Sbjct 304 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 353
>gb|DQ839490.1| Homo sapiens clone BFC06109 transthyretin mRNA, complete cds
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Sbjct 276 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 325
>gb|DQ778081.1| Homo sapiens clone BFC06100 transthyretin mRNA, complete cds
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Sbjct 276 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 325
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Sbjct 387 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 436
>dbj|AB222105.1| Pan troglodytes verus ttr mRNA for transthyretin, complete cds,
clone: PccB1539
Length=759
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Sbjct 299 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 348
>gb|AY665292.1| Pan troglodytes transthyretin mRNA, partial cds
Length=364
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Sbjct 196 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 245
>ref|NM_001009137.1| Pan troglodytes transthyretin (TTR), mRNA
gb|AY785261.1| Pan troglodytes transthyretin (TTR) mRNA, complete cds
Length=611
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 351
>gb|BT007870.1| Synthetic construct Homo sapiens transthyretin (prealbumin, amyloidosis
type I) mRNA, partial cds
Length=444
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 325
>gb|BT007189.1| Homo sapiens transthyretin (prealbumin, amyloidosis type I) mRNA,
complete cds
Length=444
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 325
>gb|AC079096.4| Homo sapiens chromosome 18, clone RP11-75N4, complete sequence
Length=119927
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Query 1 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102074 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 102123
>gb|AC017100.4| Homo sapiens BAC clone RP11-549B18 from 18, complete sequence
Length=202950
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140333 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 140284
>gb|U19780.1|HSU19780 Homo sapiens transthyretin precursor, mRNA, complete cds
gb|EU794670.1| Homo sapiens epididymis luminal protein 111 (HEL111) mRNA, complete
cds
Length=572
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Query 1 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 325
>emb|CR925931.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp470G1011 (from clone DKFZp470G1011)
Length=700
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 352
>emb|CR456908.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B067D
for gene TTR, transthyretin (prealbumin, amyloidosis type I);
complete cds, incl. stopcodon
Length=444
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 325
>emb|X59498.1| H.sapiens ttr mRNA for transthyretin
Length=483
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
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>gb|AY890007.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH023201.01X transthyretin
(TTR) mRNA, complete cds
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>gb|AY892493.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH023197.01L transthyretin
(TTR) mRNA, partial cds
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complete cds
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Sbjct 3899 AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATG 3948
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18 18 29172046 29171946 100m TGGGTACCCTTGCCCTAGTAATAAAAGCTGGTTGGCAACGCTGGAAGGAGTCACTTCTACTTCATTTAGCGTGAATCTTAAATGTAGGAATGGGATGTCA
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18 18 29171850 29178564 5m29175158F61M3312N34M GTGGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29171849 29178565 4m29175158F61M3312N35M TGGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29171849 29178565 4m29175158F61M3312N35M TGGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29171849 29178565 4m29175158F61M3312N35M TGGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29171849 29178565 4m29175158F61M3312N35M TGTA AATAGACAGCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29171849 29178565 4m29175158F61M3312N35M TGGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29171849 29178565 4m29175158F61M3312N35M TGGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29171849 29178565 4m29175158F61M3312N35M TGGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29171849 29178565 4m29175158F61M3312N35M TGGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29171849 29178565 4m29175158F61M3312N35M TGGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29171848 29178566 3m29175158F61M3312N36M GGA AATAAACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCCTGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29171848 29178566 3m29175158F61M3312N36M GGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29171848 29178566 3m29175158F61M3312N36M GGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29171848 29178566 3m29175158F61M3312N36M GGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29171848 29178566 3m29175158F61M3312N36M GGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29171848 29178566 3m29175158F61M3312N36M GGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCTTCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29171848 29178566 3m29175158F61M3312N36M GGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29171848 29178566 3m29175158F61M3312N36M GGA AATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Sbjct 26028813 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 26028764
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 25979049 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 25979000
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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HSCHR18_CTG1_1
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assembly
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Sbjct 10683962 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 10684011
>ref|NC_018929.2| Homo sapiens chromosome 18, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Sbjct 29102439 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 29102488
>ref|NW_004929410.1| Homo sapiens chromosome 18 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 50
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Sbjct 10656455 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 10656504
>gb|KE141380.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold211, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 10850884 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 10850933
>gb|GL582995.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_15, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 50
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Sbjct 10611736 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 10611785
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Sbjct 26032132 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 26032181
>gb|DS990674.1| Homo sapiens SCAF_1112675837072 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 15368563 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 15368514
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Sbjct 29556438 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 29556487
>gb|CH003465.1| Homo sapiens chromosome 18, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 24889414 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 24889463
>gb|CH471088.1| Homo sapiens 211000035842260 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 10650652 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 10650701
>ref|NW_001838467.2| Homo sapiens chromosome 18 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188127, whole genome shotgun sequence
gb|DS486036.1| Homo sapiens SCAF_1103279188127 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 15368792 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 15368743
>ref|AC_000150.1| Homo sapiens chromosome 18, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000479.1| Homo sapiens chromosome 18, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 26032010 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 26032059
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Sbjct 25982247 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 25982296
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA
>ref|XM_004059302.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 14 (TTR), mRNA
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>ref|XM_004059301.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 13 (TTR), mRNA
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Sbjct 205 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 156
>ref|XM_004059300.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 12 (TTR), mRNA
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Sbjct 205 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 156
>ref|XM_004059299.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 11 (TTR), mRNA
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Sbjct 205 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 156
>ref|XM_004059298.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 10 (TTR), mRNA
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 205 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 156
>ref|XM_004059297.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 9 (TTR), mRNA
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 246 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 197
>ref|XM_004059296.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 8 (TTR), mRNA
Length=718
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 205 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 156
>ref|XM_004059295.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 7 (TTR), mRNA
Length=707
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 205 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 156
>ref|XM_004059294.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 6 (TTR), mRNA
Length=752
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 220 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 171
>ref|XM_004059293.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 5 (TTR), mRNA
Length=741
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 220 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 171
>ref|XM_004059292.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 4 (TTR), mRNA
Length=741
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 220 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 171
>ref|XM_004059291.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 3 (TTR), mRNA
Length=742
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 220 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 171
>ref|XM_004059290.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 2 (TTR), mRNA
Length=777
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 220 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 171
>ref|XM_004059289.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla transthyretin, transcript
variant 1 (TTR), mRNA
Length=943
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 220 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 171
>ref|NM_001133592.2| Pongo abelii transthyretin (TTR), mRNA
Length=699
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 95 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 46
>gb|JF432547.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100073771 transthyretin
(TTR) gene, encodes complete protein
Length=543
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 119 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 70
>gb|BC005310.1| Homo sapiens transthyretin, mRNA (cDNA clone MGC:12385 IMAGE:4071761),
complete cds
gb|GU727633.1| Homo sapiens epididymis tissue sperm binding protein Li 4a mRNA,
complete cds
Length=644
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 95 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 46
>ref|NG_009490.1| Homo sapiens transthyretin (TTR), RefSeqGene on chromosome 18
Length=14258
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 5205 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 5156
>ref|NM_000371.3| Homo sapiens transthyretin (TTR), mRNA
Length=938
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 205 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 156
>dbj|AK312051.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92332, Homo sapiens transthyretin (prealbumin,
amyloidosis type I) (TTR),mRNA
Length=472
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 97 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 48
>gb|DQ839490.1| Homo sapiens clone BFC06109 transthyretin mRNA, complete cds
Length=417
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 69 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 20
>gb|DQ778081.1| Homo sapiens clone BFC06100 transthyretin mRNA, complete cds
Length=555
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 69 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 20
>gb|BT007870.1| Synthetic construct Homo sapiens transthyretin (prealbumin, amyloidosis
type I) mRNA, partial cds
Length=444
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 69 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 20
>gb|BT007189.1| Homo sapiens transthyretin (prealbumin, amyloidosis type I) mRNA,
complete cds
Length=444
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 69 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 20
>gb|AC079096.4| Homo sapiens chromosome 18, clone RP11-75N4, complete sequence
Length=119927
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 98850 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 98801
>gb|AC017100.4| Homo sapiens BAC clone RP11-549B18 from 18, complete sequence
Length=202950
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 143557 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 143606
>gb|U19780.1|HSU19780 Homo sapiens transthyretin precursor, mRNA, complete cds
gb|EU794670.1| Homo sapiens epididymis luminal protein 111 (HEL111) mRNA, complete
cds
Length=572
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 69 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 20
>emb|CR925931.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp470G1011 (from clone DKFZp470G1011)
Length=700
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 96 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 47
>emb|CR456908.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B067D
for gene TTR, transthyretin (prealbumin, amyloidosis type I);
complete cds, incl. stopcodon
Length=444
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 69 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 20
>emb|X59498.1| H.sapiens ttr mRNA for transthyretin
Length=483
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 90 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 41
>gb|AY890008.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH023202.01X transthyretin
(TTR) mRNA, complete cds
Length=444
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 69 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 20
>gb|AY890007.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH023201.01X transthyretin
(TTR) mRNA, complete cds
Length=444
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 69 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 20
>gb|AY892493.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH023197.01L transthyretin
(TTR) mRNA, partial cds
Length=444
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 69 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 20
>gb|BC020791.1| Homo sapiens transthyretin, mRNA (cDNA clone MGC:23689 IMAGE:4734010),
complete cds
Length=650
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 95 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 46
>gb|AF162690.1|AF162690 Homo sapiens transthyretin precursor, mRNA, complete cds
Length=506
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 74 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 25
>dbj|D00096.1|HUMPALFAP Homo sapiens mRNA for prealbumin, complete cds
Length=615
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 95 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 46
>gb|M15515.1|HUMPALF01 Human mutant prealbumin gene directly linked to familial amyloidotic
polyneuropathy (FAP), exons 1 and 2
Length=1913
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 676 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 627
>gb|M11844.1|HUMPALD Human prealbumin gene, complete cds
Length=7616
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 676 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 627
>gb|M11518.1|HUMPALC Human serum prealbumin gene, complete cds
Length=7619
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 676 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 627
>gb|M10605.1|HUMPALB Human prealbumin mRNA, complete cds
Length=614
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 94 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 45
>gb|K02091.1|HUMPALA Human prealbumin mRNA, complete cds
Length=615
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 95 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 46
>ref|XM_003830255.2| PREDICTED: Pan paniscus transthyretin (TTR), mRNA
Length=741
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAG 48
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Sbjct 220 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAG 173
>dbj|AB222105.1| Pan troglodytes verus ttr mRNA for transthyretin, complete cds,
clone: PccB1539
Length=759
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAG 48
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Sbjct 92 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAG 45
>ref|NM_001009137.1| Pan troglodytes transthyretin (TTR), mRNA
gb|AY785261.1| Pan troglodytes transthyretin (TTR) mRNA, complete cds
Length=611
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAG 48
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Sbjct 95 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAG 48
>ref|XM_004087732.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys transthyretin (TTR), mRNA
Length=686
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 246 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 197
>ref|XM_004087731.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys transthyretin (TTR), mRNA
Length=710
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 246 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 197
>ref|XM_004087730.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys transthyretin (TTR), mRNA
Length=731
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 246 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 197
>ref|XM_004087729.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys transthyretin (TTR), mRNA
Length=764
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 246 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 197
>ref|XM_003261963.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys transthyretin, transcript variant
1 (TTR), mRNA
Length=967
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 246 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 197
>ref|XM_010335467.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis transthyretin (TTR),
transcript variant X2, mRNA
Length=1171
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 119 CGTATGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 70
>ref|XM_010335466.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis transthyretin (TTR),
transcript variant X1, mRNA
Length=637
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 118 CGTATGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 69
>ref|XM_007974367.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus transthyretin (TTR), mRNA
Length=828
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 295 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 246
>ref|NM_001261679.1| Macaca mulatta transthyretin (TTR), mRNA
Length=705
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 185 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 136
>dbj|AB646982.1| Chlorocebus pygerythrus cynosurus TTR gene for transthyretin,
complete cds
Length=1295
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 109 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 60
>ref|NM_001283593.1| Macaca fascicularis transthyretin (TTR), mRNA
dbj|AB613820.1| Macaca fascicularis TTR mRNA for transthyretin, complete cds
Length=479
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 74 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 25
>dbj|AB591813.1| Chlorocebus aethiops TTR mRNA for transthyretin, complete cds
Length=482
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 74 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 25
>dbj|AB591812.1| Macaca fuscata TTR mRNA for transthyretin, complete cds
Length=479
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 74 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 25
>dbj|AB591809.1| Saimiri sciureus TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1159
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 129 CGTATGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 80
>dbj|AB591808.1| Saimiri boliviensis TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1159
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 129 CGTATGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 80
>dbj|AB571988.1| Chlorocebus aethiops TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1295
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 109 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 60
>dbj|AB571987.1| Callithrix jacchus TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1191
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 110 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 61
>dbj|AB571985.1| Macaca fuscata TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1284
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 110 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 61
>gb|AY665247.1| Saimiri boliviensis transthyretin mRNA, partial cds
Length=432
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 66 CGTATGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 17
>ref|XM_010380812.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana transthyretin (TTR), mRNA
Length=741
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 218 TAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 171
>dbj|AB613822.1| Saguinus midas TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1044
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 GGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 124 GGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 80
>ref|NM_001267750.1| Callithrix jacchus transthyretin (TTR), mRNA
dbj|AB591811.1| Callithrix jacchus TTR mRNA for transthyretin, complete cds
Length=469
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 GGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 81 GGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 37
>dbj|AB591810.1| Chiropotes satanas TTR mRNA for transthyretin, complete cds
Length=461
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 GGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 72 GGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 28
>dbj|AB571986.1| Chiropotes satanas TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1261
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 GGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 119 GGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGGAGGA 75
>dbj|AB571984.1| Macaca fascicularis TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1285
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Sbjct 110 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAGAGSAGGA 61
>ref|XM_003914273.2| PREDICTED: Papio anubis transthyretin (TTR), mRNA
Length=733
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 215 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCACAGGAGGA 166
>ref|XM_008828839.1| PREDICTED: Nannospalax galili transthyretin (Ttr), mRNA
Length=641
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 114 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGCCCAGCGAGGCAAAGGAGGA 65
>ref|XM_002713486.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus transthyretin (TTR), mRNA
Length=615
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 AGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 105 AGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAAAGGAGGA 59
>ref|XM_004422421.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum transthyretin (TTR), mRNA
Length=921
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 AGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 202 AGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCAAAGGAGGA 156
>dbj|AB613821.1| Papio hamadryas TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1295
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 110 CGTAGGACCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCGAGGCACAGGAGGA 61
>dbj|AB169529.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-14396, similar to
human transthyretin (prealbumin, amyloidosis type I) (TTR),mRNA,
RefSeq: NM_000371.1
Length=630
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA 50
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Lambda K H
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right flanking sequence - ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA
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variant 13 (TTR), mRNA
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Sbjct 385 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 434
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variant 12 (TTR), mRNA
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variant 11 (TTR), mRNA
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variant 10 (TTR), mRNA
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variant 9 (TTR), mRNA
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Sbjct 426 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 475
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variant 8 (TTR), mRNA
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Sbjct 385 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 434
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variant 7 (TTR), mRNA
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Sbjct 385 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 434
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variant 6 (TTR), mRNA
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Sbjct 400 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 449
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variant 5 (TTR), mRNA
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Sbjct 400 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 449
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variant 4 (TTR), mRNA
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Sbjct 400 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 449
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variant 3 (TTR), mRNA
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variant 2 (TTR), mRNA
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Sbjct 400 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 449
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variant 1 (TTR), mRNA
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Sbjct 400 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 449
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Sbjct 275 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 324
>ref|NM_001261679.1| Macaca mulatta transthyretin (TTR), mRNA
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Sbjct 365 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 414
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complete cds
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Sbjct 670 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 719
>dbj|AB613821.1| Papio hamadryas TTR gene for transthyretin, complete cds
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Sbjct 675 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 724
>ref|NM_001283593.1| Macaca fascicularis transthyretin (TTR), mRNA
dbj|AB613820.1| Macaca fascicularis TTR mRNA for transthyretin, complete cds
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Sbjct 254 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 303
>dbj|AB591813.1| Chlorocebus aethiops TTR mRNA for transthyretin, complete cds
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Sbjct 254 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 303
>dbj|AB591812.1| Macaca fuscata TTR mRNA for transthyretin, complete cds
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Sbjct 254 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 303
>dbj|AB571988.1| Chlorocebus aethiops TTR gene for transthyretin, complete cds
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Sbjct 670 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 719
>dbj|AB571986.1| Chiropotes satanas TTR gene for transthyretin, complete cds
Length=1261
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Sbjct 635 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 684
>dbj|AB571985.1| Macaca fuscata TTR gene for transthyretin, complete cds
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Sbjct 663 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 712
>dbj|AB571984.1| Macaca fascicularis TTR gene for transthyretin, complete cds
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Sbjct 663 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 712
>gb|JF432547.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100073771 transthyretin
(TTR) gene, encodes complete protein
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Sbjct 299 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 348
>gb|BC005310.1| Homo sapiens transthyretin, mRNA (cDNA clone MGC:12385 IMAGE:4071761),
complete cds
gb|GU727633.1| Homo sapiens epididymis tissue sperm binding protein Li 4a mRNA,
complete cds
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Query 1 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 50
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Sbjct 275 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 324
>ref|NG_009490.1| Homo sapiens transthyretin (TTR), RefSeqGene on chromosome 18
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Sbjct 8402 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 8451
>ref|NM_000371.3| Homo sapiens transthyretin (TTR), mRNA
Length=938
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Query 1 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 50
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Sbjct 385 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 434
>dbj|AK312051.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92332, Homo sapiens transthyretin (prealbumin,
amyloidosis type I) (TTR),mRNA
Length=472
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Sbjct 277 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 326
>gb|DQ839490.1| Homo sapiens clone BFC06109 transthyretin mRNA, complete cds
Length=417
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Sbjct 249 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 298
>gb|DQ778081.1| Homo sapiens clone BFC06100 transthyretin mRNA, complete cds
Length=555
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Sbjct 249 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 298
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 50
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Sbjct 360 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 409
>dbj|AB083330.2| Macaca fascicularis ttr mRNA for transthyretin, complete cds
Length=612
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Sbjct 275 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 324
>dbj|AB222105.1| Pan troglodytes verus ttr mRNA for transthyretin, complete cds,
clone: PccB1539
Length=759
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Query 1 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 50
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Sbjct 272 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 321
>gb|AY665292.1| Pan troglodytes transthyretin mRNA, partial cds
Length=364
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 169 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 218
>ref|NM_001009137.1| Pan troglodytes transthyretin (TTR), mRNA
gb|AY785261.1| Pan troglodytes transthyretin (TTR) mRNA, complete cds
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Sbjct 275 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 324
>gb|BT007870.1| Synthetic construct Homo sapiens transthyretin (prealbumin, amyloidosis
type I) mRNA, partial cds
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Sbjct 249 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 298
>gb|BT007189.1| Homo sapiens transthyretin (prealbumin, amyloidosis type I) mRNA,
complete cds
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Sbjct 249 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 298
>dbj|AB169529.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-14396, similar to
human transthyretin (prealbumin, amyloidosis type I) (TTR),mRNA,
RefSeq: NM_000371.1
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Sbjct 275 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 324
>gb|AC079096.4| Homo sapiens chromosome 18, clone RP11-75N4, complete sequence
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Sbjct 102047 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 102096
>gb|AC017100.4| Homo sapiens BAC clone RP11-549B18 from 18, complete sequence
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Sbjct 140360 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 140311
>gb|U19780.1|HSU19780 Homo sapiens transthyretin precursor, mRNA, complete cds
gb|EU794670.1| Homo sapiens epididymis luminal protein 111 (HEL111) mRNA, complete
cds
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Sbjct 249 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 298
>emb|CR925931.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp470G1011 (from clone DKFZp470G1011)
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Sbjct 276 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 325
>emb|CR456908.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B067D
for gene TTR, transthyretin (prealbumin, amyloidosis type I);
complete cds, incl. stopcodon
Length=444
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Sbjct 249 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 298
>emb|X59498.1| H.sapiens ttr mRNA for transthyretin
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Sbjct 270 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 319
>gb|AY890008.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH023202.01X transthyretin
(TTR) mRNA, complete cds
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Sbjct 249 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 298
>gb|AY890007.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH023201.01X transthyretin
(TTR) mRNA, complete cds
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Sbjct 249 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 298
>gb|AY892493.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH023197.01L transthyretin
(TTR) mRNA, partial cds
Length=444
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Sbjct 249 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 298
>gb|BC020791.1| Homo sapiens transthyretin, mRNA (cDNA clone MGC:23689 IMAGE:4734010),
complete cds
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Sbjct 275 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 324
>gb|AF162690.1|AF162690 Homo sapiens transthyretin precursor, mRNA, complete cds
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Sbjct 254 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 303
>dbj|D00096.1|HUMPALFAP Homo sapiens mRNA for prealbumin, complete cds
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Sbjct 275 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 324
>gb|M11714.1|HUMTHYA Human transthyretin mRNA, partial cds
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Sbjct 161 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 210
>gb|M15516.1|HUMPALF02 Human mutant prealbumin gene directly linked to familial amyloidotic
polyneuropathy (FAP), exon 3
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Sbjct 446 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 495
>gb|M11844.1|HUMPALD Human prealbumin gene, complete cds
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Sbjct 3872 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 3921
>gb|M11518.1|HUMPALC Human serum prealbumin gene, complete cds
Length=7619
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Sbjct 3872 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 3921
>gb|M10605.1|HUMPALB Human prealbumin mRNA, complete cds
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Sbjct 274 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 323
>gb|K02091.1|HUMPALA Human prealbumin mRNA, complete cds
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Sbjct 275 ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGA 324
>ref|XM_006150573.1| PREDICTED: Tupaia chinensis transthyretin (TTR), mRNA
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18 18 29172891 29175146 34m924n50m29175131F16M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CGTAGGGCCAGCCTCAGACACAAATACCAGTCCAGCAAGGCAGAGGAGGA ATTTGTAGAAGGGATA
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18 18 29172110 29172010 100m TCAGTAAGCTCAGTGGAACTTCATTCTTTTTGAAGTTTGAATTAATTATATTAAAAATAGATGCTGGGTACCCTTGCCCTAGTAATAAAAGCTGGTTGGC
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18 18 29172065 29171965 100m TTATATTAAAAATAGATGCTGGGAACCCTTGCCCTAGTAATAAAAGCTGGTTGGCAAAGCTGGAAGGAGTCACTTCTACTTCATTTAGCGTGAATCTTAA
18 18 29172046 29171946 100m TGGGTACCCTTGCCCTAGTAATAAAAGCTGGTTGGCAACGCTGGAAGGAGTCACTTCTACTTCATTTAGCGTGAATCTTAAATGTAGGAATGGGATGTCA
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18 18 29171886 29178539 3m29175131F88M3312N9M GGA ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29171886 29178539 3m29175131F88M3312N9M GGA ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29171886 29178539 3m29175131F88M3312N9M GGA ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29175124 29178536 94M3312N6M GGAGGAATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29175127 29178539 91M3312N9M GGAATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29175130 29178542 88M3312N12M ATTTGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29175133 29178545 85M3312N15M TGTAGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29175136 29178548 82M3312N18M AGAAGGGATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29175142 29178554 76M3312N24M GATATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 18 29175145 29178557 73M3312N27M ATACAAAGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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18 18 29175151 29178563 67M3312N33M AGTGGAAATAGACACCAAATCTTACTGGAAGGCACTTGGCATCTCCCCATTCCATGAGCATGCAGAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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blast search - nt
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Sbjct 475 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 426
>ref|XM_005259619.1| PREDICTED: Homo sapiens basigin (Ok blood group) (BSG), transcript
variant X1, mRNA
Length=1663
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 130 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 81
>ref|NM_198589.2| Homo sapiens basigin (Ok blood group) (BSG), transcript variant
2, mRNA
Length=1759
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 203 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 154
>ref|NM_001728.3| Homo sapiens basigin (Ok blood group) (BSG), transcript variant
1, mRNA
Length=2107
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 203 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 154
>dbj|AK304941.1| Pan troglodytes mRNA for basigin precursor, complete cds, clone:
PtsC-6-5_C05
Length=1638
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 92 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 43
>dbj|AK297880.1| Homo sapiens cDNA FLJ52708 complete cds, highly similar to Basigin
precursor
Length=1468
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 61 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 12
>dbj|AK296858.1| Homo sapiens cDNA FLJ52516 complete cds, moderately similar to
Basigin precursor
Length=1120
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 61 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 12
>dbj|AK302231.1| Homo sapiens cDNA FLJ61188 complete cds, highly similar to Basigin
precursor
Length=1467
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 92 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 43
>ref|NG_007468.1| Homo sapiens basigin (Ok blood group) (BSG), RefSeqGene on chromosome
19
Length=19169
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 6332 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 6283
>gb|AY358113.1| Homo sapiens clone DNA173157 EMMPRIN (UNQ6505) mRNA, complete
cds
Length=1961
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 74 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 25
>dbj|AK093337.1| Homo sapiens cDNA FLJ36018 fis, clone TESTI2016337, highly similar
to BASIGIN PRECURSOR
Length=3712
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 2182 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 2133
>gb|BC009040.2| Homo sapiens basigin (Ok blood group), mRNA (cDNA clone MGC:17700
IMAGE:3867352), complete cds
Length=1622
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 66 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 17
>ref|NM_001135388.1| Pongo abelii basigin (Ok blood group) (BSG), mRNA
emb|CR860260.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468I1928 (from clone DKFZp468I1928)
Length=1606
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 61 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 12
>gb|AC005559.2|AC005559 Homo sapiens chromosome 19, cosmid F18382 (LLNLF-140D2) and 3'
overlapping restriction fragment, complete sequence
Length=38911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 480 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 431
>emb|X64364.1| H.sapiens mRNA for M6 antigen
Length=1638
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 79 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 30
>gb|AY942196.1| Homo sapiens basigin (OK blood group) (BSG) gene, complete cds
Length=14764
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 2136 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 2087
>dbj|AB085790.1| Homo sapiens mRNA for CD147, complete cds
Length=972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 61 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 12
>gb|AC009005.10| Homo sapiens chromosome 19 clone LLNLR-299A11, complete sequence
Length=31059
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 13925 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 13876
>gb|AF548371.1| Homo sapiens basigin long isoform (BSG) mRNA, complete cds; alternatively
spliced
Length=1730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 82 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 33
>gb|AF042848.1|HSEMMPR1 Homo sapiens EMMPRIN gene, promoter and exon 1
Length=1920
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 1001 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 952
>dbj|D45131.1|HUMBSG Homo sapiens BSG mRNA for basigin, complete cds
Length=1586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 50
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Sbjct 51 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGGTCCTACAAC 2
>gb|L20471.1|HUMEMMPRIN Human extracellular matrix metalloproteinase inducer gene, complete
cds
Length=1490
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGG 41
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 GCACGAACAGCGCAGCCGCCATGATTCCTATTCCTCGCCGG 27
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT
>ref|XM_005259619.1| PREDICTED: Homo sapiens basigin (Ok blood group) (BSG), transcript
variant X1, mRNA
Length=1663
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 509
>ref|NM_198590.2| Homo sapiens basigin (Ok blood group) (BSG), transcript variant
3, mRNA
Length=1814
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
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Sbjct 588 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 637
>ref|NM_198589.2| Homo sapiens basigin (Ok blood group) (BSG), transcript variant
2, mRNA
Length=1759
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 582
>ref|NM_001728.3| Homo sapiens basigin (Ok blood group) (BSG), transcript variant
1, mRNA
Length=2107
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 930
>ref|NM_198591.2| Homo sapiens basigin (Ok blood group) (BSG), transcript variant
4, mRNA
Length=1657
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 431 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 480
>gb|JF432780.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100074024 basigin
(Ok blood group) (BSG) gene, encodes complete protein
Length=909
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 451
>gb|GU557065.1| Homo sapiens basigin isoform 4 (BSG) mRNA, complete cds
Length=1624
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 447
>gb|GU557064.1| Homo sapiens basigin isoform 3 (BSG) mRNA, complete cds
Length=1781
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 604
>dbj|AB463434.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8270, Homo sapiens BSG gene
for basigin, without stop codon, in Flexi system
Length=824
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 410
>dbj|AK297880.1| Homo sapiens cDNA FLJ52708 complete cds, highly similar to Basigin
precursor
Length=1468
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 788
>dbj|AK302231.1| Homo sapiens cDNA FLJ61188 complete cds, highly similar to Basigin
precursor
Length=1467
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 471
>ref|NG_007468.1| Homo sapiens basigin (Ok blood group) (BSG), RefSeqGene on chromosome
19
Length=19169
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14366 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 14415
>gb|AY358113.1| Homo sapiens clone DNA173157 EMMPRIN (UNQ6505) mRNA, complete
cds
Length=1961
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 752 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 801
>dbj|AK095912.1| Homo sapiens cDNA FLJ38593 fis, clone HEART2000306, highly similar
to BASIGIN PRECURSOR
Length=2155
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 949 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 998
>dbj|AK093337.1| Homo sapiens cDNA FLJ36018 fis, clone TESTI2016337, highly similar
to BASIGIN PRECURSOR
Length=3712
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2512 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 2561
>gb|BC009040.2| Homo sapiens basigin (Ok blood group), mRNA (cDNA clone MGC:17700
IMAGE:3867352), complete cds
Length=1622
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 445
>gb|AC005559.2|AC005559 Homo sapiens chromosome 19, cosmid F18382 (LLNLF-140D2) and 3'
overlapping restriction fragment, complete sequence
Length=38911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8514 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 8563
>emb|X64364.1| H.sapiens mRNA for M6 antigen
Length=1638
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 458
>gb|AY942196.1| Homo sapiens basigin (OK blood group) (BSG) gene, complete cds
Length=14764
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10196 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 10245
>dbj|AB085790.1| Homo sapiens mRNA for CD147, complete cds
Length=972
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 391 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 440
>dbj|AB091680.1| Homo sapiens hEMMPRIN mRNA for cervical EMMPRIN, complete cds
Length=819
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 410
>dbj|AB091679.1| Bos taurus bEMMPRIN mRNA for EMMPRIN, partial cds
Length=624
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 410
>gb|AC009005.10| Homo sapiens chromosome 19 clone LLNLR-299A11, complete sequence
Length=31059
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 21959 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 22008
>gb|AF548371.1| Homo sapiens basigin long isoform (BSG) mRNA, complete cds; alternatively
spliced
Length=1730
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 760 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 809
>dbj|AB072923.1| Homo sapiens mRNA for EMMPRIN, complete cds
Length=824
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 50
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Sbjct 366 GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGT 415
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19 19 572608 581318 3m580690F93M532N4M AAC GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 572608 581318 3m580690F93M532N4M AAC GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 572608 581318 3m580690F93M532N4M AAC GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 572608 581318 3m580690F93M532N4M AAC GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 572608 581318 3m580690F93M532N4M AAC GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGGGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGAACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 572608 581318 3m580690F93M532N4M TAC GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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19 19 572608 581318 3m580690F93M532N4M AAC GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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19 19 572608 581318 3m580690F93M532N4M AGC GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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19 19 572608 581318 3m580690F93M532N4M AAC GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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19 19 572608 581318 3m580690F93M532N4M AAC GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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19 19 572608 581318 3m580690F93M532N4M AAC GAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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19 19 580683 581315 99M532N1M ATCAACGAGGGGGAGACGGCCATGCTGGTCTGCAAGTCAGAGTCCGTGCCACCTGTCACTGACTGGGCCTGGTACAAGATCACTGACTCTGAGGACAAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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assembly
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 3917974 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 3917925
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 3172767 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 3172718
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HuRef SCAF_1103279181064, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 3729262 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 3729213
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shotgun sequence
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 3740063 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 3740014
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 3914043 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 3913994
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG
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assembly
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 3922299 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 3922250
>ref|NC_018930.2| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001627.2| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 3981883 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 3981834
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150196.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 3921883 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 3921834
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shotgun sequence
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 3174805 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 3174854
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shotgun sequence
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 1950043 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 1949994
>gb|CM000509.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=55419394
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 3744380 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 3744331
>gb|DS990819.1| Homo sapiens SCAF_1112675830009 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 3733575 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 3733526
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Length=62385732
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 2638376 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 2638327
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Length=56718491
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 3973445 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 3973396
>gb|CH471139.2| Homo sapiens 211000035834461 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=7929300
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 3177096 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 3177047
>ref|NW_001838476.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279181064, whole genome shotgun sequence
gb|DS486181.1| Homo sapiens SCAF_1103279181064 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=3790315
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 3733592 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 3733543
>ref|AC_000151.1| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000480.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=55419010
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 3744393 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 3744344
>gb|CM000270.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=56142811
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 3918372 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 3918323
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC
>ref|XM_003819267.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3167
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2004 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2053
>ref|XM_008584403.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3166
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 1995 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2044
>gb|KJ896748.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06142 EEF2
gene, encodes complete protein
Length=2709
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 1980 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2029
>ref|XM_004093123.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=2328
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 1978 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2027
>gb|HQ258667.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100072697 eukaryotic
translation elongation factor 2 (EEF2) gene, encodes complete
protein
Length=2611
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 1931 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 1980
>gb|AC209310.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC10-45493300P2 from chromosome 19,
complete sequence
Length=36495
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 25252 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 25301
>gb|AC207439.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-41239200J13 from chromosome 19,
complete sequence
Length=37991
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30990 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 31039
>dbj|AB527843.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8492, Homo sapiens EEF2
gene for eukaryotic translation elongation factor 2, without
stop codon, in Flexi system
Length=2591
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 1970
>dbj|AK298498.1| Homo sapiens cDNA FLJ56548 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=2006
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 1168
>gb|BC126259.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:161537 IMAGE:8991975), complete cds
gb|BC136313.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:167923 IMAGE:9020300), complete cds
Length=2915
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1964 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2013
>gb|AC011488.7| Homo sapiens chromosome 19 clone CTB-171N13, complete sequence
Length=134308
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127545 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 127496
>gb|BC024689.1| Homo sapiens, Similar to Elongation factor 2b, clone IMAGE:4153410,
mRNA, partial cds
Length=2071
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 939
>emb|CR859604.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468K065 (from clone DKFZp468K065)
Length=3165
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2044
>ref|NM_001132075.1| Pongo abelii eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
emb|CR858745.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468M076 (from clone DKFZp468M076)
Length=3177
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Sbjct 1995 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2044
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Sbjct 1912 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 1961
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mRNA
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Sbjct 1995 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2044
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Sbjct 3006 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2957
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Sbjct 414 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 463
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Sbjct 1990 AAGTACGAGTGGGACGTGGCCGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2039
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factor 2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 2044 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCCCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2093
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2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 2016 AAGTACGAGTGGGACGTGGCCGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2065
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factor 2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 2016 AAGTACGAGTGGGACGTGGCCGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2065
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factor 2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 2016 AAGTACGAGTGGGACGTGGCAGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2065
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2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 2014 AAGTACGAGTGGGACGTGGCAGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2063
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factor 2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 1989 AAGTACGAGTGGGACGTGGCCGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2038
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2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 1988 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 2034
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mRNA
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Sbjct 2014 AAGTACGAGTGGGACGTGGCCGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2063
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elongation factor 2 (Eef2), mRNA
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Sbjct 2004 AAGTATGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2053
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factor 2 (Eef2), mRNA
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Sbjct 2009 AAGTACGAGTGGGACGTGGCCGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2058
>ref|XM_004595905.1| PREDICTED: Ochotona princeps eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 2008 AAGTACGAGTGGGACGTGGCCGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2057
>ref|XM_004378464.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris eukaryotic translation
elongation factor 2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 1989 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATATGGTGCTTTGGGCC 2038
>ref|XM_004277206.1| PREDICTED: Orcinus orca eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 1990 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 2036
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factor 2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 1993 TACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2039
>ref|XM_003788746.1| PREDICTED: Otolemur garnettii eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
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Sbjct 1990 AAGTACGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2039
>ref|NM_001265796.1| Macaca mulatta eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
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Sbjct 1987 AAGTACGAGTGGGACGTGGCCGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2036
>dbj|AK396570.1| Sus scrofa mRNA, clone: PST010055G12, expressed in prostate
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Sbjct 308 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 354
>dbj|AK399052.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVRM10087G09, expressed in ovary
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Sbjct 2043 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 2089
>dbj|AK395266.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVRM10157B09, expressed in ovary
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Sbjct 820 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 866
>dbj|AB171046.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-12032, similar to
human eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2), mRNA,
RefSeq: NM_001961.2
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Sbjct 778 AAGTACGAGTGGGACGTGGCCGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 827
>ref|XM_010634832.1| PREDICTED: Fukomys damarensis eukaryotic translation elongation
factor 2 (Eef2), mRNA
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Sbjct 2006 AAGTACGAGTGGGATGTGGCCGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2055
>ref|XM_008837075.1| PREDICTED: Nannospalax galili eukaryotic translation elongation
factor 2 (Eef2), mRNA
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 2005 AAGTATGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2054
>ref|XM_006179314.1| PREDICTED: Camelus ferus eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 47
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Sbjct 1988 AAGTACGAATGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 2034
>ref|XM_003354002.3| PREDICTED: Sus scrofa eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3212
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 47
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Sbjct 2015 AAGTACGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 2061
>ref|XM_005083407.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus eukaryotic translation elongation
factor 2 (Eef2), mRNA
Length=2909
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 1966 AAGTATGAGTGGGACGTGGCGGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 2015
>ref|XM_004714375.1| PREDICTED: Echinops telfairi eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), partial mRNA
Length=2571
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 1906 AAGTACGAGTGGGATGTGGCCGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 1955
>dbj|AK399289.1| Sus scrofa mRNA, clone: SPL010088G12, expressed in spleen
Length=1390
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 47
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Sbjct 174 AAGTACGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 220
>dbj|AK398899.1| Sus scrofa mRNA, clone: LNG010061F11, expressed in lung
Length=1318
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 47
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Sbjct 101 AAGTACGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 147
>dbj|AK398737.1| Sus scrofa mRNA, clone: ADR010011C04, expressed in adrenal gland
Length=2118
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 47
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Sbjct 905 AAGTACGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 951
>dbj|AK392703.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10095D06, expressed in hypothalamus
Length=3245
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 47
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Sbjct 1998 AAGTACGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 2044
>dbj|AK396899.1| Sus scrofa mRNA, clone: PTG010022B12, expressed in pituitary
gland
Length=2222
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 47
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Sbjct 999 AAGTACGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 1045
>dbj|AK398684.1| Sus scrofa mRNA, clone: UTR010087D09, expressed in uterus
Length=1424
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 47
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Sbjct 204 AAGTACGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 250
>dbj|AK394853.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVR010037B12, expressed in ovary
Length=3226
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 47
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Sbjct 1995 AAGTACGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 2041
>dbj|AK240374.1| Sus scrofa mRNA, clone:UTR010060E11, expressed in uterus
Length=3206
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 47
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Sbjct 1995 AAGTACGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 2041
>ref|XM_006738722.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3176
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1989 AAGTATGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTCGGGCC 2038
>ref|XM_005954445.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3175
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTT 44
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1989 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGTAAGATCTGGTGCTT 2032
>ref|XM_005682572.1| PREDICTED: Capra hircus eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3180
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTT 44
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1992 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGTAAGATCTGGTGCTT 2035
>ref|XM_533949.5| PREDICTED: Canis lupus familiaris eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3195
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
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Sbjct 2014 AAGTATGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTCGGGCC 2063
>ref|XM_004689344.1| PREDICTED: Condylura cristata eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=2654
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 47
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 AAGTATGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGG 2035
>ref|XM_004008604.1| PREDICTED: Ovis aries eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=2697
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTT 44
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1985 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGTAAGATCTGGTGCTT 2028
>gb|AC183582.20| Canis familiaris chromosome 20, clone XX-57E17, complete sequence
Length=215246
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 11849 AAGTATGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTCGGGCC 11898
>gb|AC189717.7| Canis familiaris, clone XX-115F18, complete sequence
Length=73967
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC 50
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 58789 AAGTATGAGTGGGATGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTCGGGCC 58838
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG
>ref|XM_004093123.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=2328
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 852 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 901
>ref|XM_004059743.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3542
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 865
>gb|HQ258667.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100072697 eukaryotic
translation elongation factor 2 (EEF2) gene, encodes complete
protein
Length=2611
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 806
>gb|AC209310.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC10-45493300P2 from chromosome 19,
complete sequence
Length=36495
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20924 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 20973
>gb|AC207439.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-41239200J13 from chromosome 19,
complete sequence
Length=37991
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26659 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 26708
>dbj|AB527843.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8492, Homo sapiens EEF2
gene for eukaryotic translation elongation factor 2, without
stop codon, in Flexi system
Length=2591
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 747 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 796
>dbj|AK299225.1| Homo sapiens cDNA FLJ58164 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=1740
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 817 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 866
>dbj|AK297398.1| Homo sapiens cDNA FLJ60696 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=1329
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 821 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 870
>gb|BC126259.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:161537 IMAGE:8991975), complete cds
gb|BC136313.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:167923 IMAGE:9020300), complete cds
Length=2915
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 790 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 839
>gb|BC068002.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6052873, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2241
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 803 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 852
>gb|BC006547.2| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone IMAGE:2963048), partial cds
Length=1818
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 806 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 855
>gb|AC011488.7| Homo sapiens chromosome 19 clone CTB-171N13, complete sequence
Length=134308
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 131870 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 131821
>emb|CR859604.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468K065 (from clone DKFZp468K065)
Length=3165
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 823 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 872
>ref|NM_001132075.1| Pongo abelii eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
emb|CR858745.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468M076 (from clone DKFZp468M076)
Length=3177
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 821 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 870
>emb|Z11692.1| H.sapiens mRNA for elongation factor 2
Length=3080
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 738 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 787
>emb|X51466.1| Human mRNA for elongation factor 2
Length=3075
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 787
>ref|NM_001961.3| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
Length=3163
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 870
>gb|AY942181.1| Homo sapiens elongation factor 2 mRNA, complete cds
Length=2582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 738 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 787
>gb|AC016586.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2622I13, complete sequence
Length=205642
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7336 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 7287
>ref|XM_003938806.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis eukaryotic translation
elongation factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3156
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTTGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 867
>ref|XM_010367265.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3135
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 865
>ref|XM_009434385.1| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3579
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TGCCGAACGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 889
>ref|XM_003819267.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3167
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 TGCCGAACGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 879
>ref|XM_008150620.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3167
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 863
>ref|XM_006105911.1| PREDICTED: Myotis lucifugus eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3181
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 950
>ref|XM_005858792.1| PREDICTED: Myotis brandtii eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3256
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 950
>ref|NM_001185044.1| Callithrix jacchus eukaryotic translation elongation factor 2
(EEF2), mRNA
gb|EF059744.1| Callithrix jacchus eukaryotic translation elongation factor 2
(EEF2) mRNA, complete cds
Length=3215
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 870
>ref|XM_004689344.1| PREDICTED: Condylura cristata eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=2654
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 GAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 GAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 864
>ref|XM_006904106.1| PREDICTED: Pteropus alecto eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3105
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 752 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 799
>ref|XM_003914670.2| PREDICTED: Papio anubis eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3162
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 TGCCGAGCGGGCCAAAAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 891
>ref|XM_008711253.1| PREDICTED: Ursus maritimus eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3119
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 752 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 801
>ref|XM_008584403.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3166
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 870
>ref|XM_007075155.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3220
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 891
>ref|XM_006738722.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3176
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 864
>ref|XM_006754060.1| PREDICTED: Myotis davidii eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3192
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 884
>ref|XM_533949.5| PREDICTED: Canis lupus familiaris eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3195
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 889
>ref|XM_005587540.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925103 (LOC101925103),
mRNA
Length=3164
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TGCCGAGCGGGCCAAAAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 889
>ref|XM_004771417.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
ref|XM_004809257.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3217
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 889
>ref|XM_004654930.1| PREDICTED: Jaculus jaculus eukaryotic translation elongation
factor 2 (Eef2), mRNA
Length=2674
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 TGCTGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 884
>ref|XM_004395337.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens eukaryotic translation
elongation factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3177
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 865
>ref|NM_001265796.1| Macaca mulatta eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
Length=3139
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 TGCCGAGCGGGCCAAAAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 862
>gb|JN947286.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Eef2:tm1(KOMP)Ucd;
transgenic
Length=37222
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Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23100 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 23146
>ref|XM_002928461.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3178
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 861
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mRNA
Length=3126
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 835 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 881
>gb|AC183582.20| Canis familiaris chromosome 20, clone XX-57E17, complete sequence
Length=215246
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Sbjct 8280 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 8329
>gb|AC189717.7| Canis familiaris, clone XX-115F18, complete sequence
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||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55220 TGCTGAGCGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 55269
>dbj|AB171046.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-12032, similar to
human eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2), mRNA,
RefSeq: NM_001961.2
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Sbjct 1853 TGCCGAGCGGGCCAAAAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 1902
>dbj|AB170191.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10718, similar to
human eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2), mRNA,
RefSeq: NM_001961.2
Length=1499
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 TGCCGAGCGGGCCAAAAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 870
>gb|BC007152.1| Mus musculus eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:6761 IMAGE:3600352), complete cds
Length=3111
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 819 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 865
>gb|BC060707.1| Mus musculus eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone IMAGE:6810450), partial cds
Length=2972
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Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 696 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 742
>dbj|AK128976.1| Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3016277, highly similar to
Elongation factor 2
Length=3073
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Sbjct 820 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 866
>gb|AC155932.6| Mus musculus BAC clone RP23-85K13 from chromosome 10, complete
sequence
Length=239525
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 138813 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 138859
>dbj|AK145545.1| Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I1C0013E23 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK145509.1| Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I1C0008O17 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=2932
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Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK134195.1| Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:5830470E07 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
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Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK151945.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830043K06 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK168874.1| Mus musculus 17 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I920062C16 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 814 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 860
>dbj|AK168827.1| Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920058H11
product:eukaryotic translation elongation factor
2, full insert sequence
Length=3072
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK168794.1| Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I920055J08 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
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Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK152826.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830086O05 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK152587.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830080H09 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK168659.1| Mus musculus 16 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I920042H11 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3073
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Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK168638.1| Mus musculus 16 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I920040J20 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3074
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK168615.1| Mus musculus 17 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I920038K05 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3073
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK152447.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830072H23 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
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Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK168527.1| Mus musculus 17 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I920029L03 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3069
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Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK150136.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:G530135N13 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3075
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Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK152146.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830050C12 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
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Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK159829.1| Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I420032E20 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK159806.1| Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I420031K23 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK149659.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:G530008F18 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=2475
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Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK144874.1| Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:G730046C15 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3074
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 823 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 869
>dbj|AK155325.1| Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN
full-length enriched library, clone:F630220G13 product:eukaryotic
translation elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK151812.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830038A06 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3022
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 817
>dbj|AK159514.1| Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I420022I05 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
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Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK159421.1| Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I420019L24 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3084
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK151487.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830030N18 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK159155.1| Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I420005L02 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3073
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 822 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 868
>dbj|AK167281.1| Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I1C0050C01 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 820 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 866
>dbj|AK167230.1| Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I1C0043E10 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK167221.1| Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I1C0041O03 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3072
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK167208.1| Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I1C0040H15 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3070
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 865
>dbj|AK167199.1| Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I1C0038L22 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=2931
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 867
>dbj|AK167115.1| Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I1C0031N20 product:eukaryotic translation
elongation factor 2, full insert sequence
Length=3079
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
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Sbjct 54 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 100
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based on BLAT
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Sbjct 54 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 100
>gb|BC013263.1| Mus musculus eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone IMAGE:3595704)
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Sbjct 807 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 853
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elongation factor 2 (Eef2), mRNA
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Sbjct 1615 GCCGAACGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 1663
>dbj|AK298498.1| Homo sapiens cDNA FLJ56548 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
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(LOC104496839), partial mRNA
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Sbjct 735 CCGAGCGTGCCAAGAAAGTCGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 782
>dbj|AK201728.1| Mus musculus cDNA, clone:Y1G0139C23, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000047864,
based on BLAT
search
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 54 GCCGAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTNTGGGG 100
>ref|XM_010634832.1| PREDICTED: Fukomys damarensis eukaryotic translation elongation
factor 2 (Eef2), mRNA
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 TGCAGAGCGGGCCAAGAAGGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 881
>ref|XM_009701601.1| PREDICTED: Cariama cristata elongation factor 2 (LOC104162785),
mRNA
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Sbjct 737 GAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 780
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misc_RNA
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|||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 TGCCAAGAGGGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 787
>ref|XM_007994869.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
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||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 TGCAGAGCGGGCCAAAAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 891
>ref|XR_187129.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens elongation factor 2-like
(LOC101370635), misc_RNA
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Query 1 TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 TGCTGAGCGTGCCAAGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 849
>gb|EU738709.1| Tyrannus tyrannus eukaryotic translation elongation factor 2
(EEF2) gene, exons 5 through 9 and partial cds
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Query 5 GAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 41 GAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 84
>gb|EU738618.1| Eudocimus albus eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2)
gene, exons 5 through 9 and partial cds
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Query 5 GAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 GAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 84
>gb|EU738593.1| Cariama cristata eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2)
gene, exons 5 through 9 and partial cds
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Query 5 GAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 GAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 84
>gb|EU738565.1| Anas platyrhynchos eukaryotic translation elongation factor 2
(EEF2) gene, exons 5 through 9 and partial cds
Length=1898
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Query 5 GAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 41 GAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 84
>emb|AL671968.17| Mouse DNA sequence from clone RP23-191E3 on chromosome 11, complete
sequence
Length=214546
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Strand=Plus/Minus
Query 5 GAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16416 GAGCGTGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 16373
>gb|U89415.1|MMU89415 Mus musculus strain BALB/c elongation factor 2 mRNA, partial
cds
Length=779
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Query 2 GCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 48
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Sbjct 716 GCCGAGCGTGCCAAGGAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG 762
>ref|XM_003788746.1| PREDICTED: Otolemur garnettii eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3172
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Query 5 GAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 50
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Sbjct 820 GAGCGGGCCAGGAAAGTGGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTG 865
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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19 19 3978107 3978007 100m CTCCAAGTCCCCCAACAAGCACAACCGGCTGTACATGAAGGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGT
19 19 3978104 3977938 91m66n9m CAAGTCCCCCAACAAGCACAACCGGCTGTACATGAAGGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGGGTCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GCCCGCAAG
19 19 3978101 3978001 100m GCCCCCCAACAAGCACAACCGGCTGTACATGAAGGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAG
19 19 3978098 3977998 100m CCCCAACAAGCACAACCGGCTGTACATGAAGGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTC
19 19 3978095 3977995 100m CAACAAGCACAACCGGCTGTACATGAAGGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAG
19 19 3978092 3977992 100m CAAGCACAACCGGCTGTACATGAAGGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAGCAG
19 19 3978089 3977989 100m GCACAACCGGCTGTACATGAAGGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAGCAGCGG
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19 19 3978077 3977977 100m GTACATGAAGGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAGCAGCGGGCGCGCTACCTG
19 19 3978074 3977974 100m CATGAAGGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAGCAGCGGGCGCGCTACCTGGCC
19 19 3978071 3977971 100m GAAGGCGCGCCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAGCAGCGGGCGCGCTACCTGGCCGAG
19 19 3978068 3977968 100m GGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAGCAGCGGGCGCGCTACCTGGCCGAGAAG
19 19 3978065 3977965 100m GCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAGCAGCGGGCGCGCTACCTGGCCGAGAAGTAC
19 19 3978062 3977962 100m GCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAGCAGCGGGCGCGCTACCTGGCCGAGAAGTACGAG
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19 19 3978056 3977956 100m CCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGCGAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAGCAGCGGGCGCGCTACCTGGCCGAGAAGTACGAGTGGGAC
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19 19 3977997 3982272 76m3982297F24m AGCAGCGGGCGCGCTACCTGGCCGAGAAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCCTTGGGGC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGA
19 19 3977993 3982268 72m3982297F28m GCGGGCGCGCTACCTGGCCGAGAAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGAC
19 19 3977991 3982266 70m3982297F30m GGGCGCGCTACCTGGCCGAGAAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACAT
19 19 3977990 3982265 69m3982297F31m GGCGCGCTACCTGGCCGAGAAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGGAGAGGGCATG
19 19 3977986 3982261 65m3982297F35m CGCTACCTGGCCGAGAAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGA
19 19 3977983 3982258 62m3982297F38m TACCTGGCCGAGAAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGCAGAGGACATGATGAAGA
19 19 3977977 3982252 56m3982297F44m GCCGAGAAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGT
19 19 3977973 3982248 52m3982297F48m AGAAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGG
19 19 3977965 3982240 44m3982297F56m GAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAGGT
19 19 3977965 3982047 44m3982297F54m193n2m GAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GT
19 19 3977964 3982046 43m3982297F54m193n3m AGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTA
19 19 3977964 3982046 43m3982297F54m193n3m AGTGGGACGGGGCTGAGGCCCGCAAGATCCGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTA
19 19 3977951 3982033 30m3982297F54m193n16m TGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAACC
19 19 3977950 3982032 29m3982297F54m193n17m GAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCA
19 19 3977948 3982030 27m3982297F54m193n19m GGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAAC
19 19 3977939 3982021 18m3982297F54m193n28m GATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTC
19 19 3977939 3982021 18m3982297F54m193n28m GATCTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTC
19 19 3977936 3982018 15m3982297F54m193n31m CTGGTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGC
19 19 3977933 3982015 12m3982297F54m193n34m GTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGCAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAG
19 19 3977933 3982015 12m3982297F54m193n34m GTGCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAG
19 19 3977932 3982014 11m3982297F54m193n35m TGATTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGT
19 19 3977931 3982013 10m3982297F54m193n36m GCTTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTC
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAG
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGGGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAG
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTGGGGTC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAG
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAA
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAC
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTGGGGCC TCCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAG
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAG
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAG
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAG
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCCGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAG
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAG
19 19 3977929 3982011 8m3982297F54m193n38m TTGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAG
19 19 3977928 3982010 7m3982297F54m193n39m TTGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGC
19 19 3977928 3982010 7m3982297F54m193n39m TGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGC
19 19 3977928 3982010 7m3982297F54m193n39m TGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGATATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGC
19 19 3977928 3982010 7m3982297F54m193n39m TGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGC
19 19 3977928 3982010 7m3982297F54m193n39m TGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGC
19 19 3977928 3982010 7m3982297F54m193n39m TGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGC
19 19 3977928 3982010 7m3982297F54m193n39m GGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGC
19 19 3977928 3982010 7m3982297F54m193n39m TGGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGC
19 19 3977927 3982009 6m3982297F54m193n40m GGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCC
19 19 3977927 3982009 6m3982297F54m193n40m GGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCC
19 19 3977927 3982009 6m3982297F54m193n40m GGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCC
19 19 3977927 3982009 6m3982297F54m193n40m GGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCC
19 19 3977927 3982009 6m3982297F54m193n40m GGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCC
19 19 3977927 3982009 6m3982297F54m193n40m GGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCC
19 19 3977927 3982009 6m3982297F54m193n40m GGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCC
19 19 3977927 3982009 6m3982297F54m193n40m GGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGCCCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCC
19 19 3977927 3982009 6m3982297F54m193n40m GGGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCC
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGACGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCG
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGGC TGCCTAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGATAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGAC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
19 19 3977926 3982008 5m3982297F54m193n41m GGGCC TGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAAGAAGCTGTGGGGTGACAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTACTTTGACCCAGCCAACGGCAAGTTCAGCAAGTCAGCCA
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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HSCHR19_CTG2
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279181064, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 3736717 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 3736668
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shotgun sequence
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Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
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Sbjct 3747518 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 3747469
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1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC
>ref|XM_009434385.1| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
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Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 552 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 503
>ref|XM_003819267.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
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Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 542 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 493
>gb|KJ896748.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06142 EEF2
gene, encodes complete protein
Length=2709
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Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 518 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 469
>gb|HQ258667.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100072697 eukaryotic
translation elongation factor 2 (EEF2) gene, encodes complete
protein
Length=2611
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 469 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 420
>gb|AC209310.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC10-45493300P2 from chromosome 19,
complete sequence
Length=36495
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 20254 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 20205
>gb|AC207439.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-41239200J13 from chromosome 19,
complete sequence
Length=37991
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 25989 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 25940
>dbj|AB527843.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8492, Homo sapiens EEF2
gene for eukaryotic translation elongation factor 2, without
stop codon, in Flexi system
Length=2591
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Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 459 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 410
>dbj|AK298498.1| Homo sapiens cDNA FLJ56548 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=2006
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 484
>dbj|AK299225.1| Homo sapiens cDNA FLJ58164 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=1740
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 480
>dbj|AK297398.1| Homo sapiens cDNA FLJ60696 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=1329
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 484
>gb|BC126259.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:161537 IMAGE:8991975), complete cds
gb|BC136313.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:167923 IMAGE:9020300), complete cds
Length=2915
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 502 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 453
>gb|BC068002.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6052873, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2241
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 466
>gb|AC011488.7| Homo sapiens chromosome 19 clone CTB-171N13, complete sequence
Length=134308
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 132540 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 132589
>emb|Z11692.1| H.sapiens mRNA for elongation factor 2
Length=3080
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 450 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 401
>emb|X51466.1| Human mRNA for elongation factor 2
Length=3075
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 450 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 401
>ref|NM_001961.3| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
Length=3163
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 533 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 484
>gb|AY942181.1| Homo sapiens elongation factor 2 mRNA, complete cds
Length=2582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 450 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 401
>gb|AC016586.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2622I13, complete sequence
Length=205642
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 8006 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 8055
>gb|BC006547.2| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone IMAGE:2963048), partial cds
Length=1818
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 517 CGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 469
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factor 2 (EEF2), mRNA
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 564 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGC 515
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factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3542
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 528 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCTGTCTGCACGCACACGC 479
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Length=3165
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 535 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGC 486
>ref|NM_001132075.1| Pongo abelii eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
emb|CR858745.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468M076 (from clone DKFZp468M076)
Length=3177
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 533 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGC 484
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factor 2 (EEF2), mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 528 GCGCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGC 479
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2 (EEF2), mRNA
Length=3162
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 554 GCGCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGC 505
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factor 2 (EEF2), mRNA
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Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 554 GCGCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGC 505
>ref|XM_005587540.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925103 (LOC101925103),
mRNA
Length=3164
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Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 552 GCGCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGC 503
>ref|XM_005083407.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus eukaryotic translation elongation
factor 2 (Eef2), mRNA
Length=2909
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 504 GCGCTCCGCAATGGCCTGACGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 455
>ref|XR_011759.2| PREDICTED: Macaca mulatta elongation factor 2-like (EEF2), miscRNA
Length=3147
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 500 GCGCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGC 451
>dbj|AB170191.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10718, similar to
human eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2), mRNA,
RefSeq: NM_001961.2
Length=1499
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 533 GCGCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGC 484
>dbj|AB171046.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-12032, similar to
human eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2), mRNA,
RefSeq: NM_001961.2
Length=1912
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Strand=Plus/Minus
Query 3 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 496 GCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGC 449
>ref|XM_004595905.1| PREDICTED: Ochotona princeps eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=2673
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC 50
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Sbjct 546 GCGCTCAGCGATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGC 497
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA
>ref|XM_009434385.1| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3579
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
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Sbjct 60 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 109
>ref|XM_003819267.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3167
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Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 99
>ref|XM_004093123.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=2328
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Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
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Sbjct 72 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 121
>gb|AC209310.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC10-45493300P2 from chromosome 19,
complete sequence
Length=36495
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
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Sbjct 17799 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 17848
>gb|AC207439.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-41239200J13 from chromosome 19,
complete sequence
Length=37991
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
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Sbjct 23534 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 23583
>dbj|AK298498.1| Homo sapiens cDNA FLJ56548 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=2006
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Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
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Sbjct 41 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 90
>dbj|AK299225.1| Homo sapiens cDNA FLJ58164 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=1740
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 37 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 86
>dbj|AK297398.1| Homo sapiens cDNA FLJ60696 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=1329
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 90
>gb|BC126259.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:161537 IMAGE:8991975), complete cds
gb|BC136313.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:167923 IMAGE:9020300), complete cds
Length=2915
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 59
>gb|BC068002.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6052873, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2241
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 72
>gb|BC006547.2| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone IMAGE:2963048), partial cds
Length=1818
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 75
>ref|NM_001961.3| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
Length=3163
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 90
>gb|AC016586.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2622I13, complete sequence
Length=205642
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10460 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 10411
>ref|XM_010367265.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3135
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36 TTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 85
>ref|XM_003914670.2| PREDICTED: Papio anubis eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3162
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62 TTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 111
>ref|XM_005587540.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925103 (LOC101925103),
mRNA
Length=3164
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 TTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 109
>ref|NM_001265796.1| Macaca mulatta eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
Length=3139
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 33 TTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 82
>ref|XR_011759.2| PREDICTED: Macaca mulatta elongation factor 2-like (EEF2), miscRNA
Length=3147
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14 TTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 63
>dbj|AB171046.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-12032, similar to
human eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2), mRNA,
RefSeq: NM_001961.2
Length=1912
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6 TTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 55
>dbj|AB170191.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10718, similar to
human eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2), mRNA,
RefSeq: NM_001961.2
Length=1499
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 TTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 90
>ref|XM_007994869.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3166
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 TCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 TCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 111
>ref|XM_008150620.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3167
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34 TTCTCTCGGATCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 83
>ref|XM_006754060.1| PREDICTED: Myotis davidii eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3192
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 TTCTCTCGGATCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 104
>ref|XM_006105911.1| PREDICTED: Myotis lucifugus eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3181
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTCTCTCGGATCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 170
>ref|XM_005858792.1| PREDICTED: Myotis brandtii eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3256
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTCTCTCGGATCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 170
>ref|NM_001185044.1| Callithrix jacchus eukaryotic translation elongation factor 2
(EEF2), mRNA
gb|EF059744.1| Callithrix jacchus eukaryotic translation elongation factor 2
(EEF2) mRNA, complete cds
Length=3215
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 TTCTTTCGGATCTACCTGGAAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 90
>ref|XM_003788746.1| PREDICTED: Otolemur garnettii eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3172
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 GGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43 GGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 85
>ref|XM_533949.5| PREDICTED: Canis lupus familiaris eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3195
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 TCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 TCGGATCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 109
>gb|AC183582.20| Canis familiaris chromosome 20, clone XX-57E17, complete sequence
Length=215246
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 TCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5086 TCGGATCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 5130
>gb|AC189717.7| Canis familiaris, clone XX-115F18, complete sequence
Length=73967
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 6 TCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 52026 TCGGATCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATGGTGA 52070
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
19 19 3977596 3982811 12M208N87M4907N1M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||G
19 19 3977843 3982850 60M4907N40M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAG
19 19 3977897 3982904 6M4907N94M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTCTGGTAGAGCTCCTCG
19 19 3977900 3982907 3M4907N97M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTCTGGTAGAGCTCCTCGGGC
19 19 3977952 3982827 83M4775N17M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGCCCATGGGGCCGC
19 19 3978001 3982876 34M4775N66M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGAT
19 19 3978008 3982883 27M4775N73M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGG
19 19 3978025 3982900 10M4775N90M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTCTGGTAGAGCTC
19 19 3978032 3982907 3M4775N97M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTCTGGTAGAGCTCCTCGGGC
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19 19 3982267 3985390 2M679N68M3985421F30m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACC
19 19 3982267 3985390 2M679N68M3985421F30m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACC
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19 19 3982389 3982871 33M382N67M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCC
19 19 3982392 3982874 30M382N70M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACG
19 19 3982395 3982877 27M382N73M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATG
19 19 3982398 3982880 24M382N76M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGC
19 19 3982401 3982883 21M382N79M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGG
19 19 3982404 3982886 18M382N82M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAA
19 19 3982407 3982889 15M382N85M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTC
19 19 3982410 3982892 12M382N88M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTCTGG
19 19 3982413 3982895 9M382N91M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTCTGGTAG
19 19 3982416 3982898 6M382N94M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTCTGGTAGAGC
19 19 3982419 3982901 3M382N97M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTCTGGTAGAGCTCC
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19 19 3982702 3982802 100M TCCAGTCCCCCTCAGCTCAACTCCACTCCCCACCGGCTCCTGCAGATCCCGCTGCGGCAAGCCCACCACCCAGCTAAGGAGGGCCGT
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19 19 3982786 3982886 100M AGCTAGGGAGGGCCGTACCATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAA
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19 19 3982888 3982988 100M CTGGTAGAGCTCCTCGGGCTCCAGCTGCAGCTCCAGCAGGGCGCGGTCCATCTTGTTCATCATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATGGCCTGCCGC
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19 19 3982921 3983021 100M CAGCAGGGCGCGGTCCATCTTGTTCATCATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCTGAC
19 19 3982935 3985401 81M3985421F19m CCATCTTGTTCATCATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC TTCTTTCGGTTCTACCTGG
19 19 3982942 3985394 74M3985421F26m GTTCATCATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATC
19 19 3982946 3985390 70M3985421F30m CTCATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACC
19 19 3982946 3985390 70M3985421F30m ATCATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACC
19 19 3983011 3984298 5M3985421F46m1027n49m CTCGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 3983011 3984298 5M3985421F46m1027n49m CTCGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 3983011 3984298 5M3985421F46m1027n49m CTCGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 3983011 3984298 5M3985421F46m1027n49m CTCGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 3983011 3984298 5M3985421F46m1027n49m CTCGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 3983013 3984296 3M3985421F46m1027n51m CGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 3983013 3984296 3M3985421F46m1027n51m CGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 3983013 3984296 3M3985421F46m1027n51m CGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 3983013 3984296 3M3985421F46m1027n51m CGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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19 19 3983013 3984296 3M3985421F46m1027n51m CGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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19 19 3983013 3984296 3M3985421F46m1027n51m CGC TTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACCATG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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13 |
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blast search - genome
left flanking sequence - GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT
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sequence
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HuRef SCAF_1103279181064, whole genome shotgun sequence
gb|DS486181.1| Homo sapiens SCAF_1103279181064 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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shotgun sequence
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HSCHR19_CTG2
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>gb|DS990819.1| Homo sapiens SCAF_1112675830009 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>gb|CH003466.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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>gb|CH471139.2| Homo sapiens 211000035834461 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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>ref|NW_001838476.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279181064, whole genome shotgun sequence
gb|DS486181.1| Homo sapiens SCAF_1103279181064 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>ref|AC_000151.1| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000480.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 3747525 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 3747476
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT
>ref|XM_009434385.1| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
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>ref|XM_003819267.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
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Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 540 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 491
>gb|KJ896748.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06142 EEF2
gene, encodes complete protein
Length=2709
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Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 516 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 467
>gb|HQ258667.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100072697 eukaryotic
translation elongation factor 2 (EEF2) gene, encodes complete
protein
Length=2611
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Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 467 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 418
>gb|AC209310.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC10-45493300P2 from chromosome 19,
complete sequence
Length=36495
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 20252 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 20203
>gb|AC207439.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-41239200J13 from chromosome 19,
complete sequence
Length=37991
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 25987 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 25938
>dbj|AB527843.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8492, Homo sapiens EEF2
gene for eukaryotic translation elongation factor 2, without
stop codon, in Flexi system
Length=2591
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 457 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 408
>dbj|AK298498.1| Homo sapiens cDNA FLJ56548 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=2006
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 531 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 482
>dbj|AK299225.1| Homo sapiens cDNA FLJ58164 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=1740
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 478
>dbj|AK297398.1| Homo sapiens cDNA FLJ60696 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=1329
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 482
>gb|BC126259.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:161537 IMAGE:8991975), complete cds
gb|BC136313.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:167923 IMAGE:9020300), complete cds
Length=2915
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Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 500 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 451
>gb|BC068002.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6052873, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2241
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 513 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 464
>gb|BC006547.2| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone IMAGE:2963048), partial cds
Length=1818
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 516 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 467
>gb|AC011488.7| Homo sapiens chromosome 19 clone CTB-171N13, complete sequence
Length=134308
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 132542 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 132591
>emb|Z11692.1| H.sapiens mRNA for elongation factor 2
Length=3080
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 448 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 399
>emb|X51466.1| Human mRNA for elongation factor 2
Length=3075
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 448 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 399
>ref|NM_001961.3| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
Length=3163
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Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 531 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 482
>gb|AY942181.1| Homo sapiens elongation factor 2 mRNA, complete cds
Length=2582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 448 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 399
>gb|AC016586.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2622I13, complete sequence
Length=205642
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 8008 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 8057
>ref|XM_004093123.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=2328
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 562 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGCCT 513
>ref|XM_004059743.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3542
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 526 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCTGTCTGCACGCACACGCCT 477
>emb|CR859604.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468K065 (from clone DKFZp468K065)
Length=3165
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 533 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGCCT 484
>ref|NM_001132075.1| Pongo abelii eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
emb|CR858745.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468M076 (from clone DKFZp468M076)
Length=3177
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 531 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGCCT 482
>ref|XM_010367265.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3135
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 526 GCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGCCT 477
>ref|XM_003914670.2| PREDICTED: Papio anubis eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3162
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
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Sbjct 552 GCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGCCT 503
>ref|XM_007994869.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3166
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 552 GCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGCCT 503
>ref|XM_005587540.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925103 (LOC101925103),
mRNA
Length=3164
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 550 GCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGCCT 501
>ref|XR_011759.2| PREDICTED: Macaca mulatta elongation factor 2-like (EEF2), miscRNA
Length=3147
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 498 GCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGCCT 449
>dbj|AB171046.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-12032, similar to
human eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2), mRNA,
RefSeq: NM_001961.2
Length=1912
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 496 GCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGCCT 447
>dbj|AB170191.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10718, similar to
human eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2), mRNA,
RefSeq: NM_001961.2
Length=1499
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCCT 50
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 531 GCTCCGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGCCT 482
>ref|XM_005083407.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus eukaryotic translation elongation
factor 2 (Eef2), mRNA
Length=2909
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCC 49
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 GCTCCGCAATGGCCTGACGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCC 454
>ref|XM_004595905.1| PREDICTED: Ochotona princeps eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=2673
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACGCACACGCC 49
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 544 GCTCAGCGATGGCCTGCCGCAGCACTGTCTCCGTCTGCACACACACGCC 496
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC
>ref|XM_009434385.1| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3579
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
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Sbjct 53 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 102
>ref|XM_003819267.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3167
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 92
>ref|XM_004093123.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=2328
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
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Sbjct 65 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 114
>gb|AC209310.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC10-45493300P2 from chromosome 19,
complete sequence
Length=36495
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
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Sbjct 17792 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 17841
>gb|AC207439.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-41239200J13 from chromosome 19,
complete sequence
Length=37991
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
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Sbjct 23527 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 23576
>dbj|AK298498.1| Homo sapiens cDNA FLJ56548 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=2006
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 83
>dbj|AK299225.1| Homo sapiens cDNA FLJ58164 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=1740
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 79
>dbj|AK297398.1| Homo sapiens cDNA FLJ60696 complete cds, highly similar to Elongation
factor 2
Length=1329
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 83
>gb|BC126259.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:161537 IMAGE:8991975), complete cds
gb|BC136313.1| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone MGC:167923 IMAGE:9020300), complete cds
Length=2915
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 52
>gb|BC068002.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6052873, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2241
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 65
>gb|BC006547.2| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA
(cDNA clone IMAGE:2963048), partial cds
Length=1818
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 68
>ref|NM_001961.3| Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
Length=3163
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 83
>gb|AC016586.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2622I13, complete sequence
Length=205642
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10467 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 10418
>ref|XM_010367265.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3135
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 29 GACTCGCTTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 78
>ref|XM_003914670.2| PREDICTED: Papio anubis eukaryotic translation elongation factor
2 (EEF2), mRNA
Length=3162
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 GACTCGCTTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 104
>ref|XM_005587540.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925103 (LOC101925103),
mRNA
Length=3164
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 GACTCGCTTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 102
>ref|NM_001265796.1| Macaca mulatta eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2),
mRNA
Length=3139
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26 GACTCGCTTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 75
>ref|XR_011759.2| PREDICTED: Macaca mulatta elongation factor 2-like (EEF2), miscRNA
Length=3147
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 GACTCGCTTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 56
>dbj|AB170191.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10718, similar to
human eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2), mRNA,
RefSeq: NM_001961.2
Length=1499
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34 GACTCGCTTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 83
>dbj|AB171046.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-12032, similar to
human eukaryotic translation elongation factor 2 (EEF2), mRNA,
RefSeq: NM_001961.2
Length=1912
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCGCTTCATTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 48
>ref|XM_007994869.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus eukaryotic translation elongation
factor 2 (EEF2), mRNA
Length=3166
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACTCGCTTCTTTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 50
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 GACTTGCTTCAGTCGGTTCTACCTGGGAGAATCCACCGCCATCCGCCACC 104
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
19 19 3982627 3982727 100M CAGTCCCCCT
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19 19 3982733 3982833 100M AACTCCACTCCCCACCGGCTCCTGCAGATCCCGCTGCGGCAAGCCCACCACCCAGCTAGGGAGGGCCGTACCATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGC
19 19 3982747 3982847 100M CCGGCTCCTGCAGATCCCGCTGCGGCAAGCCCACCACCCAGCTAGGGAGGGCCGTACCATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTG
19 19 3982757 3982857 100M CAGATCCCGCTGCGGCAAGCCCACCACCCAGCTAGGGAGGGCCGTACCATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGA
19 19 3982762 3982862 100M CCCGCTGCGGCAAGCCCACCACCCAGCTAGGGGGGGCCGTACCATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTC
19 19 3982767 3982867 100M TGCGGCAAGCCCACCACCCAGCTAGGGAGGGCCGTACCATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTT
19 19 3982786 3982886 100M AGCTAGGGAGGGCCGTACCATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAA
19 19 3982802 3982902 100M CCCATGATGTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTCTGGTAGAGCTCCT
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19 19 3982810 3982910 100M GTTGCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTCTTGTAGAGCTCCTCGGGCTCC
19 19 3982813 3982913 100M GCCCATGGGGCCGCTCTCGCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGTCTGGTACAGCTCCTCGGGCTCCAGC
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19 19 3982831 3982931 100M GCCCTCGCCGTAGGTGGAGATGATGACGTTCACGTTCTCCACGATGCGCTGGAAAGGCTGGTAGAGCTCCTCGGGCTCCAGCTGCAGATCCAGCAGGGCG
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19 19 3982873 3982973 100M GATGCGCTGGAAAGTCTGGTAGAGCTCCTCGGGCTCCAGCTGCAGCTCCAGCAGGGCGCGGTCCATCTTGTTCATCATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCG
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19 19 3982879 3982979 100M CTGGAAAGTCTGGTAGAGCTCCTCGGGCTCCAGCTGCAGCTCCAGCAGGGCGCGGTCCATCTTGTTCATCATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATG
19 19 3982882 3982982 100M GAAAGTCTGGTAGAGCTCCTCGGGCTCCAGCTGCAGCTCCAGCAGGGCGCGGTCCATCTTGTTCATCATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATGGCC
19 19 3982885 3982985 100M AGTCTGGTAGAGCTCCTCGGGCTCCAGCTGCAGCTCCAGCAGGGCGCGGTCCATCTTGTTCATCATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATGGCCTGC
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19 19 3982891 3982991 100M GTGGAGCTCCTCGGGCTCCAGCTGCAGCTCCAGCAGGGCGCGGTCCATCTTGTTCATCATCAGCACAGGCTTGATGCGCTCGGCAATGGCCTGCCGCAGC
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Sbjct 12801471 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 12801520
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG
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>ref|NT_011295.12| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR19_CTG2
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assembly
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Sbjct 12741792 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 12741743
>ref|NC_018930.2| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001627.2| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 12913085 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 12913036
>ref|NW_004929414.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150198.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 4176395 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 4176346
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shotgun sequence
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Sbjct 10108098 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 10108147
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Sbjct 12484393 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 12484344
>gb|DS990770.1| Homo sapiens SCAF_1112675837121 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 1791227 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 1791276
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Sbjct 14776800 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 14776751
>gb|CH003466.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 12961053 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 12961004
>gb|CH471106.1| Homo sapiens 211000035837249 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 4018560 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 4018511
>ref|NW_001838483.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188176, whole genome shotgun sequence
gb|DS486132.1| Homo sapiens SCAF_1103279188176 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 1791179 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 1791228
>ref|AC_000151.1| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000480.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 12484342 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 12484293
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Sbjct 12802314 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 12802265
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT
>ref|NM_005809.5| Homo sapiens peroxiredoxin 2 (PRDX2), mRNA
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Sbjct 404 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 355
>ref|NG_029901.1| Homo sapiens peroxiredoxin 2 (PRDX2), RefSeqGene on chromosome
19
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Sbjct 5932 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 5883
>dbj|AB528486.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB3606, Homo sapiens PRDX2
gene for peroxiredoxin 2, without stop codon, in Flexi system
Length=611
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 233 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 184
>dbj|AK293957.1| Homo sapiens cDNA FLJ60461 complete cds, highly similar to Peroxiredoxin-2
(EC 1.11.1.15)
Length=894
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 324 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 275
>emb|CU687853.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100022751
3' read PRDX2 mRNA
Length=1477
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 221 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 270
>emb|CU687852.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100022751
5' read PRDX2 mRNA
Length=1158
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 240 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 191
>dbj|AK289485.1| Homo sapiens cDNA FLJ76507 complete cds, highly similar to Homo
sapiens peroxiredoxin 2 (PRDX2), transcript variant 3, mRNA
Length=601
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 324 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 275
>gb|EU176327.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100006437; FLH184066.01X;
RZPDo839B07251D peroxiredoxin 2 (PRDX2) gene, encodes
complete protein
Length=637
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 246 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 197
>gb|DQ895403.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009863; FLH184059.01L;
RZPDo839B10143D peroxiredoxin 2 (PRDX2) gene, encodes
complete protein
Length=637
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 246 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 197
>gb|DQ231563.1| Homo sapiens peroxiredoxin 2 (PRDX2) gene, complete cds
Length=8427
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 2674 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 2625
>gb|BC064138.1| Homo sapiens peroxiredoxin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6176908)
Length=1762
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 283 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 234
>gb|BC003022.1| Homo sapiens peroxiredoxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:4104 IMAGE:2821457),
complete cds
gb|BC000452.2| Homo sapiens peroxiredoxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:8456 IMAGE:2821457),
complete cds
gb|EU668325.1| Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 2a
(HEL-S-2a) mRNA, complete cds
Length=948
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 283 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 234
>dbj|AK022395.1| Homo sapiens cDNA FLJ12333 fis, clone MAMMA1002198, highly similar
to THIOREDOXIN PEROXIDASE 1
Length=3180
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 903 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 854
>gb|BC039428.1| Homo sapiens peroxiredoxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:44699 IMAGE:5303023),
complete cds
Length=988
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 343 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 294
>gb|AC020934.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2265O21, complete sequence
Length=119347
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 35873 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 35922
>gb|AC018761.6| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2659N19, complete sequence
Length=147750
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 145668 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 145717
>gb|DQ000546.1| Synthetic construct clone PSF:108501 thioredoxin peroxidase 1-like
gene, complete cds
Length=669
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 296 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 247
>emb|CR541789.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H0930D
for gene PRDX2, peroxiredoxin 2; complete cds, incl. stopcodon
Length=597
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 224 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 175
>emb|CR450356.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834A083D
for gene PRDX2, peroxiredoxin 2; complete cds; without stopcodon
Length=594
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 224 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 175
>gb|AY890375.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH018658.01X peroxiredoxin
2 (PRDX2) mRNA, complete cds
Length=597
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 224 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 175
>gb|AY894116.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH130941.01L peroxiredoxin
2 (PRDX2) mRNA, partial cds
Length=597
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 224 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 175
>gb|AY893882.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH127890.01L peroxiredoxin
2 (PRDX2) mRNA, partial cds
Length=597
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 224 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 175
>gb|AY893434.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH127810.01X peroxiredoxin
2 (PRDX2) mRNA, complete cds
Length=597
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 224 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 175
>gb|AY892847.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH018654.01L peroxiredoxin
2 (PRDX2) mRNA, partial cds
Length=597
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 224 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 175
>emb|X82321.1| H.sapiens mRNA for thiol-specific antioxidant
Length=750
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 123 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 74
>gb|L19185.1|HUMNKEFB Human natural killer cell enhancing factor (NKEFB) mRNA, complete
cds
Length=1008
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 348 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 299
>ref|XM_524127.5| PREDICTED: Pan troglodytes peroxiredoxin 2 (PRDX2), mRNA
Length=966
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 332 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCGGCACGGTTGCT 283
>ref|XM_002761781.3| PREDICTED: Callithrix jacchus peroxiredoxin 2 (PRDX2), mRNA
Length=1071
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 439 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCGGCACGGTTGCT 390
>ref|XM_003814824.2| PREDICTED: Pan paniscus peroxiredoxin 2 (PRDX2), mRNA
Length=1156
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 522 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCGGCACGGTTGCT 473
>gb|KF928168.1| Callithrix jacchus peroxiredoxin-2-like protein mRNA, partial
cds
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 87 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCGGCACGGTTGCT 38
>ref|XM_003275663.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys uncharacterized LOC100599986 (LOC100599986),
mRNA
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Query 1 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCTGCACGGTTGCT 50
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Sbjct 698 ACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTCCGCACGGTTGCT 649
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 237 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 286
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 119 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 168
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 98 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 147
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 73 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 122
>ref|XM_004060096.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla peroxiredoxin 2 (PRDX2), mRNA
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 91 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 140
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19
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Sbjct 5089 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 5138
>ref|NG_012662.1| Homo sapiens ribonuclease H2, subunit A (RNASEH2A), RefSeqGene
(LRG_278) on chromosome 19
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Sbjct 179 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 130
>dbj|AK293957.1| Homo sapiens cDNA FLJ60461 complete cds, highly similar to Peroxiredoxin-2
(EC 1.11.1.15)
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 39 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 88
>dbj|AK289485.1| Homo sapiens cDNA FLJ76507 complete cds, highly similar to Homo
sapiens peroxiredoxin 2 (PRDX2), transcript variant 3, mRNA
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 39 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 88
>gb|DQ231563.1| Homo sapiens peroxiredoxin 2 (PRDX2) gene, complete cds
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 1831 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 1880
>dbj|AK022395.1| Homo sapiens cDNA FLJ12333 fis, clone MAMMA1002198, highly similar
to THIOREDOXIN PEROXIDASE 1
Length=3180
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 60 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 109
>gb|BC039428.1| Homo sapiens peroxiredoxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:44699 IMAGE:5303023),
complete cds
Length=988
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 58 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 107
>gb|AC020934.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2265O21, complete sequence
Length=119347
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Sbjct 36716 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 36667
>gb|AC018761.6| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2659N19, complete sequence
Length=147750
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 146511 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 146462
>gb|L19185.1|HUMNKEFB Human natural killer cell enhancing factor (NKEFB) mRNA, complete
cds
Length=1008
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 63 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 112
>ref|XM_524127.5| PREDICTED: Pan troglodytes peroxiredoxin 2 (PRDX2), mRNA
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCAC 49
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Sbjct 47 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCAC 95
>ref|XM_010361641.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana peroxiredoxin 2 (PRDX2), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 70 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCCTTGCCCACG 119
>ref|XM_010361640.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana peroxiredoxin 2 (PRDX2), transcript
variant X1, mRNA
Length=1036
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 119 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCCTTGCCCACG 168
>ref|XM_009252838.1| PREDICTED: Pongo abelii peroxiredoxin 2 (PRDX2), transcript variant
X1, mRNA
Length=1038
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
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Sbjct 119 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGAGTCTAGCCTTTGCCCACG 168
>ref|XR_641898.1| PREDICTED: Papio anubis peroxiredoxin-2 pseudogene (LOC101024926),
misc_RNA
Length=957
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 16 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCCTTGCCCACG 65
>ref|XM_003914995.2| PREDICTED: Papio anubis peroxiredoxin 2 (PRDX2), transcript variant
X2, mRNA
Length=1002
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 82 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCCTTGCCCACG 131
>ref|XM_009193614.1| PREDICTED: Papio anubis peroxiredoxin 2 (PRDX2), transcript variant
X1, mRNA
Length=1044
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 82 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCCTTGCCCACG 131
>ref|XM_007995427.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus peroxiredoxin 2 (PRDX2), mRNA
Length=1036
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 114 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCCTTGCCCACG 163
>ref|NM_001131877.2| Pongo abelii peroxiredoxin 2 (PRDX2), mRNA
Length=1069
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 9 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGAGTCTAGCCTTTGCCCACG 58
>gb|AC206800.4| MACACA MULATTA BAC clone CH250-165P22 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=186792
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 92945 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCCTTGCCCACG 92896
>gb|BC064138.1| Homo sapiens peroxiredoxin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6176908)
Length=1762
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 47
>gb|BC003022.1| Homo sapiens peroxiredoxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:4104 IMAGE:2821457),
complete cds
gb|BC000452.2| Homo sapiens peroxiredoxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:8456 IMAGE:2821457),
complete cds
gb|EU668325.1| Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 2a
(HEL-S-2a) mRNA, complete cds
Length=948
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 4 CGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 47
>emb|CR860893.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469H1520 (from clone DKFZp469H1520)
Length=2456
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 26 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGAGTCTAGCCTTTGCCCACG 75
>emb|CR858417.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468O2412 (from clone DKFZp468O2412)
Length=1070
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 10 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGAGTCTAGCCTTTGCCCACG 59
>tpe|HG510370.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000451506.1 (CTD-2659N19.10
gene), antisense
Length=296
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCC 47
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 239 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTGTGCCC 193
>emb|Z22548.1| H.sapiens thiol-specific antioxidant protein mRNA
Length=937
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 1 GAACGCGGGTCCACGCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 50
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 29 GAACGCGGGTGCA-GCGTGTGATCGTCCGTGCGTCTAGCCTTTGCCCACG 77
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
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19 19 12911039 12911755 74M616N26M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAAGCCAGGTGGGGGAACTGAGAGTC
19 19 12911042 12911758 71M616N29M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAAGCCAGGTGGGTGAACTGAGAGTCCAC
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19 19 12911048 12911764 65M616N35M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAAGCCAGGTGGGTGAACTGAGAGTCCACCGAGAC
19 19 12911051 12911767 62M616N38M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAAGCCAGGTGGGTGAACTGAGAGTCCACCGAGACGCC
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19 19 12911075 12911791 38M616N62M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAAGCCAGGTGGGTGAACTGAGAGTCCACCGAGACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTGGCG
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19 19 12911084 12911800 29M616N71M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CAAGCCAGGTGGGTGAACTGAGAGTCCACCGAGACGCCCAGCACTTCACAGCCCAGCTTGCGGAAGTCCTC
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19 19 12911533 12911633 100M CTCTATATACCAGGCAACTAGTTGTCAAATGCTAATTACTGTCATCATCCTTAAAGACTTGGGCGGCAATGTTTCCATTATTTTCACGATGGGGAAACGC
19 19 12911537 12911637 100M ATATACCAGGCAACTAGTTGTCAAATGCTAATTACTGTCATCATCCTTAAAGACTTGGGCGGCAATGTTTCCATTATTTTCACGATGGGGAAACGCAGGT
19 19 12911541 12911641 100M ACCAGGCAACTAGTTGTCAAATGCTAATTACTGTCATCATCCTTAAAGACTTGGGCGGCAATGTTTCCATTATTTTCACGATGGGGAAACGCAGGTTCCA
19 19 12911551 12911651 100M TAGTTGTCAAATGCTAATTACTGTCATCATCCTTAAAGACTTGGGCGGCAATGTTTCCATTATTTTCACGATGGGGAAACGCAGGTTCCAGAGGTTGAGC
19 19 12911554 12911654 100M TTGTCAAATGCTAATTACTGTCATCATCCTTAAAGACTTGGGCGGCAATGTTTCCATTATTTTCACGATGGGGAAACGCAGGTTCCAGAGGTTGAGCAAT
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shotgun sequence
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Query 1 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
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Sbjct 12621374 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 12621325
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Lambda K H
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right flanking sequence - GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG
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HSCHR19_CTG2
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assembly
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Sbjct 12879133 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 12879182
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genome shotgun sequence
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Sbjct 13050447 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 13050496
>ref|NW_004929414.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150198.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 4313757 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 4313806
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shotgun sequence
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Sbjct 12621906 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 12621955
>gb|DS990770.1| Homo sapiens SCAF_1112675837121 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 1653714 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 1653665
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Sbjct 14915026 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 14915075
>gb|CH003466.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 13099272 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 13099321
>gb|CH471106.1| Homo sapiens 211000035837249 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=15589000
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 4155926 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 4155975
>ref|NW_001838483.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188176, whole genome shotgun sequence
gb|DS486132.1| Homo sapiens SCAF_1103279188176 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 1653673 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 1653624
>ref|AC_000151.1| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000480.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=55419010
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 12621848 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 12621897
>gb|CM000270.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=56142811
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 12939680 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 12939729
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA
>ref|NG_029662.1| Homo sapiens calreticulin (CALR), RefSeqGene on chromosome 19
Length=12891
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Query 1 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
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Sbjct 5060 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 5011
>ref|NM_004343.3| Homo sapiens calreticulin (CALR), mRNA
Length=1929
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Query 1 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
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Sbjct 60 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 11
>dbj|AK304492.1| Homo sapiens cDNA FLJ58668 complete cds, highly similar to Calreticulin
precursor
Length=1762
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
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Sbjct 51 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 2
>dbj|AK295230.1| Homo sapiens cDNA FLJ53009 complete cds, highly similar to Calreticulin
precursor
Length=1425
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
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Sbjct 51 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 2
>gb|AC092069.2| Homo sapiens chromosome 19 clone CTC-425F1, complete sequence
Length=81621
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
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Sbjct 51018 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 51067
>gb|AD000092.1|CH19HHR23 Homo sapiens DNA from chromosome 19p13.2 cosmids R31240, R30272
and R28549 containing the EKLF, GCDH, CRTC, and RAD23A genes,
genomic sequence
Length=110096
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85228 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 85179
>ref|XM_003316146.3| PREDICTED: Pan troglodytes calreticulin (CALR), mRNA
Length=1932
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 87 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 39
>ref|XM_002828745.3| PREDICTED: Pongo abelii calreticulin (CALR), mRNA
Length=1941
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 87 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 39
>ref|XM_003814832.2| PREDICTED: Pan paniscus calreticulin (CALR), mRNA
Length=1940
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 44
>emb|X85727.1| H.sapiens calreticulin promoter region
Length=585
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 ACGCGGGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 522
>ref|XM_003919422.2| PREDICTED: Papio anubis calreticulin (CALR), mRNA
Length=1941
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 87 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCGGCGGCTCTGCAGTACGGA 39
>ref|XM_007995452.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus calreticulin (CALR), mRNA
Length=1916
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 59 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCGGCGGCTCTGCAGTACGGA 11
>ref|NM_001287610.1| Macaca fascicularis calreticulin (CALR), mRNA
dbj|AB169175.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-17783, similar to
human calreticulin (CALR), mRNA, RefSeq: NM_004343.2
Length=1952
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 79 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCGGCGGCTCTGCAGTACGGA 31
>gb|M84739.1|HUMCALRET Human autoantigen calreticulin mRNA, complete cds
Length=1958
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 89 ACGCGC-GGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 41
>ref|XM_010361622.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana calreticulin (CALR), mRNA
Length=1951
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 91 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGTGGCGGCTCTGCAGTACGGA 43
>emb|X59053.1| H.sapiens calreticulin gene 5'region
Length=593
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 1/47 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 CGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 CGC-GGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA 524
>gb|BC007911.1| Homo sapiens calreticulin, mRNA (cDNA clone MGC:14363 IMAGE:4299303),
complete cds
Length=1920
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGC 9
>gb|BC020493.1| Homo sapiens calreticulin, mRNA (cDNA clone MGC:10100 IMAGE:3898550),
complete cds
Length=1940
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 ACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGC 1
>gb|M32294.1|HUMROSSAA Human Ro ribonucleoprotein autoantigen (Ro/SS-A), complete cds
gb|FJ224311.1| Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 99n
(HEL-S-99n) mRNA, complete cds
Length=1890
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 1/46 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 CGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGG 49
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 45 CGC-GGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGG 1
>gb|AY901963.1| Cercopithecus aethiops calreticulin mRNA, complete cds
Length=2087
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTG 41
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 CGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTG 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG
>ref|XM_010361622.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana calreticulin (CALR), mRNA
Length=1951
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 252
>ref|XM_003316146.3| PREDICTED: Pan troglodytes calreticulin (CALR), mRNA
Length=1932
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 248
>ref|XM_002828745.3| PREDICTED: Pongo abelii calreticulin (CALR), mRNA
Length=1941
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 248
>ref|XM_003919422.2| PREDICTED: Papio anubis calreticulin (CALR), mRNA
Length=1941
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 248
>ref|XM_003814832.2| PREDICTED: Pan paniscus calreticulin (CALR), mRNA
Length=1940
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 253
>gb|KJ890816.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00210 CALR
gene, encodes complete protein
Length=1383
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 156 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 205
>ref|XM_007995452.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus calreticulin (CALR), mRNA
Length=1916
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 220
>ref|XM_003275597.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys calreticulin (CALR), mRNA
Length=1418
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 204 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 253
>ref|XM_004060119.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla calreticulin (CALR), mRNA
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 204 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 253
>ref|NM_001261131.1| Macaca mulatta calreticulin (CALR), mRNA
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Sbjct 134 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 183
>ref|NG_029662.1| Homo sapiens calreticulin (CALR), RefSeqGene on chromosome 19
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Sbjct 5534 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 5583
>ref|NM_004343.3| Homo sapiens calreticulin (CALR), mRNA
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Sbjct 171 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 220
>dbj|AB451408.1| Homo sapiens CALR mRNA for calreticulin precursor, partial cds,
clone: FLJ08113AAAF
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Sbjct 91 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 140
>dbj|AK304492.1| Homo sapiens cDNA FLJ58668 complete cds, highly similar to Calreticulin
precursor
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Sbjct 118 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 167
>dbj|AK295230.1| Homo sapiens cDNA FLJ53009 complete cds, highly similar to Calreticulin
precursor
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Sbjct 114 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 163
>dbj|AB385014.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5014, Homo sapiens CALR
gene for calreticulin precursor, complete cds, without stop
codon, in Flexi system
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Sbjct 100 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 149
>gb|BC072002.1| Homo sapiens calreticulin, mRNA (cDNA clone IMAGE:6262525), ****
WARNING: chimeric clone ****
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Sbjct 642 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 691
>gb|BC052621.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6578175, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2905
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Sbjct 1146 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 1195
>gb|BC007911.1| Homo sapiens calreticulin, mRNA (cDNA clone MGC:14363 IMAGE:4299303),
complete cds
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Sbjct 161 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 210
>dbj|AB232155.1| Macaca fuscata Crt mRNA for calreticulin, complete cds
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Sbjct 91 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 140
>gb|BT007448.1| Homo sapiens calreticulin mRNA, complete cds
Length=1254
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Sbjct 91 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 140
>ref|NM_001287610.1| Macaca fascicularis calreticulin (CALR), mRNA
dbj|AB169175.1| Macaca fascicularis testis cDNA, clone: QtsA-17783, similar to
human calreticulin (CALR), mRNA, RefSeq: NM_004343.2
Length=1952
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Sbjct 191 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 240
>dbj|AK223060.1| Homo sapiens mRNA for calreticulin precursor variant, clone:
JTH13773
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Sbjct 59 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 108
>gb|BC002500.2| Homo sapiens calreticulin, mRNA (cDNA clone MGC:2227 IMAGE:3050717),
complete cds
Length=1871
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 124 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 173
>gb|BC020493.1| Homo sapiens calreticulin, mRNA (cDNA clone MGC:10100 IMAGE:3898550),
complete cds
Length=1940
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Sbjct 153 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 202
>gb|AC092069.2| Homo sapiens chromosome 19 clone CTC-425F1, complete sequence
Length=81621
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 50544 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50495
>gb|AY047586.1| Homo sapiens calreticulin (CALR) mRNA, complete cds
Length=1402
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 144 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 193
>gb|AD000092.1|CH19HHR23 Homo sapiens DNA from chromosome 19p13.2 cosmids R31240, R30272
and R28549 containing the EKLF, GCDH, CRTC, and RAD23A genes,
genomic sequence
Length=110096
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 85702 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 85751
>gb|AY901963.1| Cercopithecus aethiops calreticulin mRNA, complete cds
Length=2087
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 152 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 201
>emb|CR457070.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834G0511D
for gene CALR, calreticulin; complete cds, incl. stopcodon
Length=1254
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 91 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 140
>gb|AY889952.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH023263.01X calreticulin
(CALR) mRNA, complete cds
Length=1254
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 91 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 140
>gb|AY889951.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH023262.01X calreticulin
(CALR) mRNA, complete cds
Length=1254
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 91 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 140
>gb|M32294.1|HUMROSSAA Human Ro ribonucleoprotein autoantigen (Ro/SS-A), complete cds
gb|FJ224311.1| Homo sapiens epididymis secretory sperm binding protein Li 99n
(HEL-S-99n) mRNA, complete cds
Length=1890
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 157 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 206
>gb|M84739.1|HUMCALRET Human autoantigen calreticulin mRNA, complete cds
Length=1958
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 199 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 248
>ref|XM_002761788.3| PREDICTED: Callithrix jacchus calreticulin (CALR), mRNA
Length=1916
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
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Query 4 GGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 170 GGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 216
>ref|XM_010329462.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis calreticulin (CALR),
mRNA
Length=1869
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 117 GGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCCGATTTTGG 163
>ref|XM_005336216.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus calreticulin (Calr),
mRNA
Length=1895
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 GACGAGTGGACCTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 213
>ref|XM_006730555.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii calreticulin (CALR), mRNA
Length=1919
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 168 GACGGGTGGACCGACCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 217
>ref|XM_862217.3| PREDICTED: Canis lupus familiaris calreticulin (CALR), transcript
variant 4, mRNA
Length=1926
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 176 GACGGGTGGACCGACCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 225
>ref|XM_004824191.1| PREDICTED: Mustela putorius furo calreticulin (CALR), transcript
variant X2, mRNA
Length=1928
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 180 GACGGGTGGACCAACCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 229
>ref|XM_004824190.1| PREDICTED: Mustela putorius furo calreticulin (CALR), transcript
variant X1, mRNA
Length=2019
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 181 GACGGGTGGACCAACCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 230
>ref|XM_004748325.1| PREDICTED: Mustela putorius furo calreticulin (CALR), transcript
variant X2, mRNA
Length=1929
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 GACGGGTGGACCAACCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 229
>ref|XM_004748324.1| PREDICTED: Mustela putorius furo calreticulin (CALR), transcript
variant X1, mRNA
Length=2020
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 181 GACGGGTGGACCAACCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 230
>ref|XR_187096.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens calreticulin-like (LOC101365017),
misc_RNA
Length=1888
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 50
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Sbjct 122 GACGGGTGGACCGACCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGG 171
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Lambda K H
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19 19 13049622 13049522 100m GCGTCGTCGGGGCGGCCTCGAGGCGGGACCAGGCGTTACCTCCGTCCAGAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAG
19 19 13049619 13049519 100m TCGTCGGGGCGGCCTCGAGGCGGGACCAGGCGTTACCTCCGTCCAGAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCC
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19 19 13049606 13049506 100m CTCGAGGCGGGACCAGGCGTTACCTCCGTCCAGAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGC
19 19 13049602 13049502 100m AGGCGGGACCAGGCGTTACCTCCGTCCAGAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGG
19 19 13049596 13049496 100m GACCAGGCGTTACCTCCGTCCAGAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGGGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCA
19 19 13049592 13049492 100m AGGCGTTACCTCCGTCCAGAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCAT
19 19 13049589 13049489 100m CGTTACCTCCGTCCAGAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCCCGGATAGCAGCATGGC
19 19 13049586 13049486 100m TACCTCCGTCCAGAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGG
19 19 13049583 13049483 100m CTCCGTCCAGAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCG
19 19 13049580 13049480 100m CGTCCAGAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGG
19 19 13049577 13049477 100m CCAGAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGG
19 19 13049574 13049474 100m GAAACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGG
19 19 13049571 13049471 100m ACTGCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAA
19 19 13049568 13049468 100m GCTCCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGC
19 19 13049565 13049465 100m CCTTGAAGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCG
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19 19 13049559 13049458 81m1d19m AGTAGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGDCGGCAACGCGCGGGCCCTT
19 19 13049556 13049456 100m AGACGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCGGGCCCTTTA
19 19 13049553 13049453 100m CGGCAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCGGGCCCTTTAAAA
19 19 13049550 13049450 100m CAGGCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCGGGCCCTTTAAAACGA
19 19 13049547 13049447 100m GCTCGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAACAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCC
19 19 13049544 13049444 100m CGGCGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCC
19 19 13049541 13049441 100m CGACGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGC
19 19 13049538 13049438 100m CGGCCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGC
19 19 13049535 13049434 45m1d55m CCAGGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGDGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCT
19 19 13049532 13049432 100m GGCCGAGGAGGCCGAGCAGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCT
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19 19 13049515 13049415 100m AGCAGCGGCACGGATAGCAGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGACGGACGC
19 19 13049497 13049971 75m13049947F25M AGCATGGCGGGCCGAGGGGGCGGCAACGCGCGGGCCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCG
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19 19 13049471 13049997 49m13049947F51M CTCGCGGGCCCTTTAAAACGCCCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGGC
19 19 13049463 13050005 41m13049947F59M CCCTTTAAAACGACCCTCCGGCAGCGGCTCTGCAGTACGGA GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGGCAAATTCGT
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19 19 13049438 13050030 16m13049947F84M GGCTCTGCAGTACGGA GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGGCAAATTCGTTCTCAGTTCCGGCAAGTTCTACGGT
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19 19 13049430 13050038 8m13049947F92M AGTACGGA GACGGGTGGACTTCCCGCTGGATCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGGCAAATTCGTTCTCAGTTCCGGCAAGTTCTACGGTGACGAGGA
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19 19 13049425 13050043 3m13049947F97M GGA GACGGGTGAACTTCCCGCTGGATCGAATCCGAACACAAGTCAGATTTTGGCAAATTCGTTCTCAGTTCCGGCAAGTTCTACGGTGACGAGGAGAAAG
19 19 13049425 13050043 3m13049947F97M GGA GACGGGTGGACTTCCCGCTGGCTCGAATCCAAACACAAGTCAGATTTTGGCAAATTCGTTCTCAGTTCCGGCAAGTTCTACGGTGACGAGGAGAACG
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19 19 13049973 13050265 76M192N24M TCCAAACACAAGTCAGATTTTGGCAAATTCGTTCTCAGTTCCGGCAAGTTCTACGGTGACGAGGAGAAAGATAAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
19 19 13049976 13050268 73M192N27M AAACACAAGTCAGATTTTGGCAAATTCGTTCTCAGTTCCGGCAAGTTCTACGGTGACGAGGAGAAAGATAAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
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19 19 13049985 13050277 64M192N36M TCAGATTTTGGCAAATTCGTTCTCAGTTCCGGCAAGTTCTACGGTGACGAGGAGAAAGATAAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
19 19 13049988 13050280 61M192N39M GATTTTGGCAAATTCGTTCTCAGTTCCGGCAAGTTCTACGGTGACGAGGAGAAAGATAAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
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19 19 13049994 13054655 1M4561N99M G|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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19 19 13050000 13050292 49M192N51M TTCGTTCTCAGTTCCGGCAAGTTCTACGGTGACGAGGAGAAAGATAAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
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19 19 13050030 13050322 19M192N81M GACGAGGAGAAAGATAAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
19 19 13050033 13050325 16M192N84M GAGGAGAAAGATAAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
19 19 13050036 13050328 13M192N87M GAGAAAGATAAGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
19 19 13050039 13050331 10M192N90M AAAGATAAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
19 19 13050042 13050334 7M192N93M GATAAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
19 19 13050045 13050337 4M192N96M AAAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
19 19 13050048 13050340 1M192N99M G||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTT
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188277, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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blast search - nt
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polypeptide (ATP1A3), mRNA
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gene, encodes complete protein
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>ref|XM_004060818.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide, transcript variant 2 (ATP1A3), mRNA
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>ref|XM_004060817.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide, transcript variant 1 (ATP1A3), mRNA
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Sbjct 2802 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2753
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(ATP1A3), transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 2842 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2793
>ref|NM_001256213.1| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide
(ATP1A3), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 2672 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2623
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(ATP1A3), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 2803 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2754
>gb|JF432325.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100073511 ATPase,
Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide (ATP1A3) gene, encodes
complete protein
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Sbjct 2653 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2604
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ATPase alpha-3 chain (EC 3.6.3.9)
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Sbjct 2789 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2740
>dbj|AK296557.1| Homo sapiens cDNA FLJ54717 complete cds, highly similar to Sodium/potassium-transporting
ATPase alpha-3 chain (EC 3.6.3.9)
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Sbjct 2672 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2623
>dbj|AK295833.1| Homo sapiens cDNA FLJ59543 complete cds, highly similar to Sodium/potassium-transporting
ATPase alpha-3 chain (EC 3.6.3.9)
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Sbjct 2657 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2608
>dbj|AK295078.1| Homo sapiens cDNA FLJ59513 complete cds, highly similar to Sodium/potassium-transporting
ATPase alpha-3 chain (EC 3.6.3.9)
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Sbjct 2796 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2747
>dbj|AK293784.1| Homo sapiens cDNA FLJ59485 complete cds, highly similar to Sodium/potassium-transporting
ATPase alpha-3 chain (EC 3.6.3.9)
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Sbjct 2454 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2405
>ref|NG_008015.1| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide
(ATP1A3), RefSeqGene on chromosome 19
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Sbjct 29711 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 29662
>emb|CU679344.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100020523
3' read ATP1A3 mRNA
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Sbjct 455 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 504
>dbj|AK307921.1| Homo sapiens cDNA, FLJ97869
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Sbjct 2750 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2701
>gb|BC013763.1| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide,
mRNA (cDNA clone IMAGE:3874001), with apparent retained intron
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Sbjct 2740 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2691
>dbj|AK122693.1| Homo sapiens cDNA FLJ16157 fis, clone BRAWH2006479, highly similar
to Sodium/potassium-transporting ATPase alpha-3 chain
(EC 3.6.3.9)
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Sbjct 1925 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 1876
>dbj|AK094628.1| Homo sapiens cDNA FLJ37309 fis, clone BRAMY2016611, highly similar
to Sodium/potassium-transporting ATPase alpha-3 chain
(EC 3.6.3.9)
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Sbjct 1507 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 1458
>dbj|AK054736.1| Homo sapiens cDNA FLJ30174 fis, clone BRACE2000975, highly similar
to Sodium/potassium-transporting ATPase alpha-3 chain
(EC 3.6.3.9)
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Sbjct 953 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 904
>dbj|AK223569.1| Homo sapiens mRNA for Na+/K+ -ATPase alpha 3 subunit variant,
clone: FCC129A02
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Sbjct 2754 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2705
>gb|M28290.1|HUMATPAS09 Homo sapiens Na+, K+ activated adenosine triphosphatase alpha
subunit (ATP1A1) gene, exon 14
emb|X12920.1| Human Na+,K+ ATPase gene exon 19 (alpha III isoform)
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Sbjct 146 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 97
>gb|AC010616.5|AC010616 Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2575K13, complete sequence
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Sbjct 130810 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 130859
>gb|BC015566.2| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide,
mRNA (cDNA clone MGC:13276 IMAGE:4097948), complete cds
gb|BC009394.2| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide,
mRNA (cDNA clone MGC:16769 IMAGE:4135506), complete cds
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Sbjct 2719 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2670
>gb|BC009282.2| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide,
mRNA (cDNA clone MGC:14215 IMAGE:4125669), complete cds
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Sbjct 2719 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2670
>emb|AL832884.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667L223 (from clone DKFZp667L223)
Length=1424
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Sbjct 342 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 293
>gb|M37453.1|HUMATPA19 Human Na+,K+ -ATPase catalytic subunit alpha-III isoform gene,
exon 19, clone lambda-NK-alpha-R3-2
Length=176
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Sbjct 76 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 27
>ref|XM_010331110.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (ATP1A3), mRNA
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Sbjct 2534 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCAAGAGC 2485
>ref|XM_010358994.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (ATP1A3), mRNA
Length=3448
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2655 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAACCACCGAGAGC 2606
>ref|XM_003915607.2| PREDICTED: Papio anubis ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3
polypeptide (ATP1A3), mRNA
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Sbjct 2476 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAACCACCGAGAGC 2427
>ref|XM_007996949.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 2798 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAACCACCGAGAGC 2749
>ref|XM_007996948.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 3007 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAACCACCGAGAGC 2958
>ref|XM_007996947.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
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Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2837 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAACCACCGAGAGC 2788
>ref|XM_005589417.1| PREDICTED: Macaca fascicularis ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2803 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAACCACCGAGAGC 2754
>ref|XM_005589416.1| PREDICTED: Macaca fascicularis ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2667 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAACCACCGAGAGC 2618
>ref|XM_004873051.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (Atp1a3), mRNA
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2787 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2738
>ref|XM_004883991.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (Atp1a3), transcript variant X4, mRNA
Length=3590
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2788 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2739
>ref|XM_004883990.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (Atp1a3), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2790 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2741
>ref|XM_004883989.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (Atp1a3), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2793 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2744
>ref|XM_004883988.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (Atp1a3), transcript variant X1, mRNA
Length=3695
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2886 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 2837
>ref|NM_001266472.1| Macaca mulatta ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide
(ATP1A3), mRNA
Length=3538
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2723 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAACCACCGAGAGC 2674
>ref|XM_004091006.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), mRNA
Length=3023
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2803 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCAAGAGC 2754
>ref|XM_010623294.1| PREDICTED: Fukomys damarensis ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (Atp1a3), mRNA
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2610 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCAAGAGC 2561
>ref|XM_002762181.3| PREDICTED: Callithrix jacchus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X3, mRNA
Length=3604
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2813 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCGCCAAGAGC 2764
>ref|XM_002762180.3| PREDICTED: Callithrix jacchus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
Length=3624
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2833 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCGCCAAGAGC 2784
>ref|XM_008988096.1| PREDICTED: Callithrix jacchus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
Length=3697
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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alpha 3 polypeptide (ATP1A3), mRNA
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(ATP1A3), mRNA
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polypeptide (ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2294 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCAAGAGC 2245
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polypeptide (ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
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polypeptide (ATP1A3), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1628 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCAAGAGC 1579
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polypeptide (ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2294 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCAAGAGC 2245
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(ATP1A3), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 2629 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCAAGAGC 2580
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(ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2645 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCAAGAGC 2596
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(ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2684 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCAAGAGC 2635
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(ATP1A3), transcript variant 1, mRNA
ref|XM_002695074.3| PREDICTED: Bos taurus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide
(ATP1A3), mRNA
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Sbjct 2805 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCACCAAGAGC 2756
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alpha 3 polypeptide (ATP1A3), mRNA
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Sbjct 5498 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAGCCGCCGAGAGC 5449
>gb|AC197796.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-403K14 from chromosome 19, complete
sequence
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Sbjct 24110 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAACCGCCGAGAGC 24159
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alpha 3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2616 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAAAAGAAGCCGCCGAGAGC 2567
>ref|XM_006731989.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2655 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAAAAGAAGCCGCCGAGAGC 2606
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alpha 3 polypeptide (Atp1a3), mRNA
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Sbjct 2550 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAAAAGCCACCAAGAGC 2501
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3 polypeptide (Atp1a3), mRNA
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Sbjct 2822 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAAAAGCCACCAAGAGC 2773
>ref|XM_004767736.1| PREDICTED: Mustela putorius furo ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
ref|XM_004827232.1| PREDICTED: Mustela putorius furo ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (ATP1A3), mRNA
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Sbjct 2675 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAAAAGAAGCCACCAAGAGC 2626
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alpha 3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2603 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAAAAGAAGCCACCAAGAGC 2554
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAG 47
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Sbjct 2630 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAACCACCGAG 2584
>ref|XM_004694153.1| PREDICTED: Condylura cristata ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAG 47
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Sbjct 2803 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAACCACCGAG 2757
>ref|XM_004694152.1| PREDICTED: Condylura cristata ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2842 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAGAAACCACCGAG 2796
>ref|XM_004316360.1| PREDICTED: Tursiops truncatus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide, transcript variant 3 (ATP1A3), mRNA
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Sbjct 2294 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAAAAGCCACCAAGAGC 2245
>ref|XM_004316359.1| PREDICTED: Tursiops truncatus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide, transcript variant 2 (ATP1A3), mRNA
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Sbjct 2808 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAAAAGCCACCAAGAGC 2759
>ref|XM_004316358.1| PREDICTED: Tursiops truncatus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide, transcript variant 1 (ATP1A3), mRNA
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Sbjct 2847 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAAAAGCCACCAAGAGC 2798
>ref|XM_004271227.1| PREDICTED: Orcinus orca ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3
polypeptide, transcript variant 3 (ATP1A3), mRNA
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2294 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAAAAGCCACCAAGAGC 2245
>ref|XM_004271226.1| PREDICTED: Orcinus orca ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3
polypeptide, transcript variant 2 (ATP1A3), mRNA
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2808 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAAAAGCCACCAAGAGC 2759
>ref|XM_004271225.1| PREDICTED: Orcinus orca ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3
polypeptide, transcript variant 1 (ATP1A3), mRNA
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2847 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAAAAGCCACCAAGAGC 2798
>gb|GU585524.1| Cavia porcellus Na(+)/K(+)-ATPase alpha 3 (ATP1a3) mRNA, partial
cds
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Query 1 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAAGAGAAGAAGCCACCGAGAGC 50
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Sbjct 2553 AAGCCATTTTCTGCCAGGATCACAAAGTAGGAGAAAAAGCCACCAAGAGC 2504
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA
>ref|XM_005258953.1| PREDICTED: Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3
polypeptide (ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 2453 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2502
>ref|NM_001256214.1| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide
(ATP1A3), transcript variant 3, mRNA
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Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2508 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2557
>ref|NM_001256213.1| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide
(ATP1A3), transcript variant 2, mRNA
Length=3504
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 2338 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2387
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(ATP1A3), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 2469 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2518
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Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide (ATP1A3) gene, encodes
complete protein
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Sbjct 2319 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2368
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ATPase alpha-3 chain (EC 3.6.3.9)
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Sbjct 2455 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2504
>dbj|AK296557.1| Homo sapiens cDNA FLJ54717 complete cds, highly similar to Sodium/potassium-transporting
ATPase alpha-3 chain (EC 3.6.3.9)
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Sbjct 2338 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2387
>dbj|AK295833.1| Homo sapiens cDNA FLJ59543 complete cds, highly similar to Sodium/potassium-transporting
ATPase alpha-3 chain (EC 3.6.3.9)
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Sbjct 2323 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2372
>dbj|AK295078.1| Homo sapiens cDNA FLJ59513 complete cds, highly similar to Sodium/potassium-transporting
ATPase alpha-3 chain (EC 3.6.3.9)
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Sbjct 2462 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2511
>dbj|AK293784.1| Homo sapiens cDNA FLJ59485 complete cds, highly similar to Sodium/potassium-transporting
ATPase alpha-3 chain (EC 3.6.3.9)
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Sbjct 2120 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2169
>ref|NG_008015.1| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide
(ATP1A3), RefSeqGene on chromosome 19
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Sbjct 28694 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 28743
>dbj|AK307921.1| Homo sapiens cDNA, FLJ97869
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Sbjct 2416 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2465
>gb|BC013763.1| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide,
mRNA (cDNA clone IMAGE:3874001), with apparent retained intron
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Sbjct 2406 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2455
>dbj|AK122693.1| Homo sapiens cDNA FLJ16157 fis, clone BRAWH2006479, highly similar
to Sodium/potassium-transporting ATPase alpha-3 chain
(EC 3.6.3.9)
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Sbjct 1591 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 1640
>dbj|AK094628.1| Homo sapiens cDNA FLJ37309 fis, clone BRAMY2016611, highly similar
to Sodium/potassium-transporting ATPase alpha-3 chain
(EC 3.6.3.9)
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Sbjct 1173 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 1222
>dbj|AK054736.1| Homo sapiens cDNA FLJ30174 fis, clone BRACE2000975, highly similar
to Sodium/potassium-transporting ATPase alpha-3 chain
(EC 3.6.3.9)
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Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 619 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 668
>dbj|AK223569.1| Homo sapiens mRNA for Na+/K+ -ATPase alpha 3 subunit variant,
clone: FCC129A02
Length=3338
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Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 2420 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2469
>gb|M28289.1|HUMATPAS08 Homo sapiens Na+, K+ activated adenosine triphosphatase alpha
subunit (ATP1A1) gene, exons 12 and 13
emb|X12919.1| Human Na+,K+ ATPase gene exons 17 - 18 (alpha III isoform)
Length=1619
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Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 1074 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 1123
>gb|AC010616.5|AC010616 Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2575K13, complete sequence
Length=171849
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 131827 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 131778
>gb|BC015566.2| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide,
mRNA (cDNA clone MGC:13276 IMAGE:4097948), complete cds
gb|BC009394.2| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide,
mRNA (cDNA clone MGC:16769 IMAGE:4135506), complete cds
Length=3549
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Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 2385 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2434
>gb|BC009282.2| Homo sapiens ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide,
mRNA (cDNA clone MGC:14215 IMAGE:4125669), complete cds
Length=3551
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 2385 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2434
>emb|AL832884.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp667L223 (from clone DKFZp667L223)
Length=1424
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 8 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 57
>gb|M37451.1|HUMATPA17 Human Na+,K+ -ATPase catalytic subunit alpha-III isoform gene,
exon 17, clone lambda-NK-alpha-R3-2
Length=185
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 21 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 70
>ref|XM_008964959.1| PREDICTED: Pan paniscus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3
polypeptide (ATP1A3), mRNA
Length=3118
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Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 1990 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATCGCCTACACCCTGACCAGCAA 2039
>ref|XM_007996949.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X3, mRNA
Length=3592
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2464 CTGATCTTCGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2513
>ref|XM_007996948.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
Length=3801
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2673 CTGATCTTCGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2722
>ref|XM_007996947.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
Length=3631
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2503 CTGATCTTCGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2552
>ref|XM_007942948.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X3, mRNA
Length=2814
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2260 CTGATCTTCGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2309
>ref|XM_007942947.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
Length=2946
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2290 CTGATCTTCGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2339
>ref|XM_007942946.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
Length=2955
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2299 CTGATCTTCGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2348
>ref|XM_005908986.1| PREDICTED: Bos mutus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide
(ATP1A3), transcript variant X3, mRNA
Length=3372
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CTGATCTTCGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2344
>ref|XM_005908985.1| PREDICTED: Bos mutus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide
(ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
Length=3199
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2311 CTGATCTTCGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2360
>ref|XM_005908984.1| PREDICTED: Bos mutus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide
(ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
Length=3244
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2350 CTGATCTTCGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2399
>ref|XM_004644354.1| PREDICTED: Octodon degus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3
polypeptide (Atp1a3), transcript variant X2, mRNA
Length=3596
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2463 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATCGCCTACACCCTGACCAGCAA 2512
>ref|XM_004644353.1| PREDICTED: Octodon degus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3
polypeptide (Atp1a3), transcript variant X1, mRNA
Length=3635
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2502 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATCGCCTACACCCTGACCAGCAA 2551
>ref|XM_004060819.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide, transcript variant 3 (ATP1A3), mRNA
Length=3136
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATCGCCTACACCCTGACCAGCAA 2381
>ref|XM_004060818.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide, transcript variant 2 (ATP1A3), mRNA
Length=3311
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2507 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATCGCCTACACCCTGACCAGCAA 2556
>ref|XM_004060817.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide, transcript variant 1 (ATP1A3), mRNA
Length=3272
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2468 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATCGCCTACACCCTGACCAGCAA 2517
>emb|X76108.1| A.anguilla mRNA for sodium/potassium ATPase, alpha subunit
Length=3307
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2408 CTGATCTTCGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2457
>ref|XM_010623294.1| PREDICTED: Fukomys damarensis ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (Atp1a3), mRNA
Length=3438
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2276 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATCGCCTACACTCTGACCAGCAA 2325
>ref|XM_002762181.3| PREDICTED: Callithrix jacchus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X3, mRNA
Length=3604
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2479 CTGATCTTTGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2528
>ref|XM_002762180.3| PREDICTED: Callithrix jacchus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
Length=3624
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2499 CTGATCTTTGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2548
>ref|XM_008988096.1| PREDICTED: Callithrix jacchus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X1, mRNA
Length=3697
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 CTGATCTTTGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2621
>gb|KJ175167.1| Osmerus mordax sodium potassium ATPase alpha 1 subunit a1-2 (NAKa1-2)
mRNA, partial cds
Length=2622
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAG 47
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2018 CTGATCTTCGACAACTTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAG 2064
>ref|XM_006041256.1| PREDICTED: Bubalus bubalis ATPase, Na+/K+ transporting, alpha
3 polypeptide (ATP1A3), mRNA
Length=3410
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2466 CTGATCTTTGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2515
>ref|XM_006731990.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii ATPase, Na+/K+ transporting,
alpha 3 polypeptide (ATP1A3), transcript variant X2, mRNA
Length=3421
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 50
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Sbjct 2282 CTGATCTTTGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2331
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3 polypeptide (ATP1A3), mRNA
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Sbjct 2336 CTGATCTTTGACAACCTGAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAA 2385
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19 19 42474684 42474584 100m TCTTCGACAACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAATATCCCGGAGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCC
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19 19 42474675 42474575 100m ACCTAAAGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAATATCCCGGAGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCAC
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19 19 42474669 42474569 100m AGAAGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAATATCCCGGAGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCAC
19 19 42474666 42474566 100m AGTCCATTGCCTACACCCTGACCAGCAATATCCCGGAGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCAC
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19 19 42474660 42474560 100m TTGCCTACACCCTGACCAGCAATATCCCGGAGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTG
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19 19 42474648 42474548 100m TGACCAGCAATCTCCCGGAGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGG
19 19 42474645 42474545 100m CCAGCAATATCCCGGAGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCAC
19 19 42474642 42474542 100m GCAATATCCCGGAGATCCCGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCCTCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGA
19 19 42474639 42474539 100m ATATCCCGGAGATCCCGCCCTTCCTGCGGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACAT
19 19 42474636 42474457 98m79n2m TCCCGGAGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GT
19 19 42474633 42474454 95m79n5m CGGAGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCCC
19 19 42474630 42474451 92m79n8m AGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCCCTGC
19 19 42474627 42474448 89m79n11m TCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCCCTGCCAT
19 19 42474624 42474445 86m79n14m CGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCCCTGCCATCTC
19 19 42474621 42474442 83m79n17m CCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCCCTGCCATCTCACT
19 19 42474618 42474439 80m79n20m TCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCCCTGCCATCTCACTGGC
19 19 42474615 42474436 77m79n23m TGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCCCTGCCATCTCACTGGCGTA
19 19 42474612 42474433 74m79n26m TGTTCATCATGGCCACCATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCCCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCCCTGCCATCTCACTGGCGTACGA
19 19 42474609 42474430 71m79n29m TCATCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCCCTGCCATCTCACTGGCGTACGAGGC
19 19 42474606 42474427 68m79n32m TCATGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCCCTGCCATCTCACTGGCGTACGAGGCTGC
19 19 42474603 42474424 65m79n35m TGGCCAACATCCCGCTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTCCCTGCCATCTCACTGGCGTACGAGGCTGCCGA
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sequence
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ibosomal protein L13a and S11, U32, U33, U34, U35, and U35
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mRNA
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19 19 50000861 50000761 100m TTACCAGAGAGGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGA
19 19 50000858 50000564 83m194n17m TTACCAGAGAGGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGA
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19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGACCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GCT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
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19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000845 50002784 70m194n27m50002782F3M GGATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCCTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GAT
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGTCC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GCGG
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19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GATG
19 19 50000844 50002785 69m194n27m50002782F4M GATCCGCCCTCGAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGACC GCGG
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19 19 50000833 50000733 100m GAATGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGC
19 19 50000830 50000730 100m TGGACACATTACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGT
19 19 50000828 50002801 53m194n27m50002782F20M GACACATTACCAGTGACGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGATC GGTGACATCGTCACAGTGGG
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19 19 50000821 50000721 100m TACCAGTGAAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAA
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19 19 50000813 50000713 100m AAGGGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGG
19 19 50000810 50000710 100m GGGCATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGC
19 19 50000807 50000707 100m CATTTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTG
19 19 50000804 50000704 100m TTCTTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCC
19 19 50000801 50000701 100m TTGTCAATGTAGGTGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCA
19 19 50000798 50002831 23m194n27m50002782F50M TCAATGTAGGTGCCCTCAATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGGTGTCTTGAAGCCCAGATC GGTGACATCGTCACAGTGGGCGAGTGCCGGCCTCTGAGCAAGACAGTGCG
19 19 50000795 50000695 100m ATGTAGGTGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAG
19 19 50000791 50000691 100m AGGTGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAAC
19 19 50000788 50000688 100m TGCCCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTAC
19 19 50000785 50000685 100m CCTCAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAAT
19 19 50000782 50000682 100m CAATAGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCC
19 19 50000781 50002848 6m194n27m50002782F67M AATAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTCCTTGGCTGTCTTGAAGCCCAGATC GGTGACATCGTCACAGTGGGCGAGTGCCGGCCTCTGAGCAAGACAGTGCGCTTCAACGTGCTCAAGG
19 19 50000778 50000678 100m AGCCTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGC
19 19 50000775 50000675 100m CTGAAAGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGC
19 19 50000770 50000670 100m AGGATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAG
19 19 50000767 50000667 100m ATAGGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAG
19 19 50000764 50000664 100m GGAAAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCA
19 19 50000761 50000661 100m AAGATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTCCAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTT
19 19 50000758 50000658 100m ATAAAGGAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGA
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19 19 50000752 50000652 100m GAGTGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGATGCAGG
19 19 50000749 50000649 100m TGAGCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATCCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGATGCAGGCAG
19 19 50000746 50000646 100m GCCTTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGATGCAGGCAGGGC
19 19 50000743 50000643 100m TTGGGCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGATGCAGGCAGGGCAAC
19 19 50000739 50000639 100m GCGGGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGATGCAGGCAGGGCAACTCGT
19 19 50000736 50000636 100m GGCGGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGATGCAGGCAGGGCAACTCGTCGT
19 19 50000733 50000633 100m GGTTCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGATGCAGGCAGGGCAACTCGTCGTGGG
19 19 50000730 50000630 100m TCCTTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGATGCAGGCAGGGCAACTCGTCGTGGGCAC
19 19 50000727 50000627 100m TTAAAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATCCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGATGCAGGCAGGGCAACTCGTCGTGGGCACACG
19 19 50000724 50000624 100m AAAGAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGATGCAGGCAGGGCAACTCGTCGTGGGCACACGTGC
19 19 50000721 50000621 100m GAGCCAGGGGCGTGGCCTCAGGGAAGCAACTACAATTCCCAGCAGCCCCAGAAGCCACTTAGATGCAGGCAGGGCAACTCGTCGTGGGCACACGTGCAGG
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188409, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 1245324 AAGCACACCACCGCACCGCACCTAAGCAAACCACCCGGTCACTGAGAAAG 1245373
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shotgun sequence
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Query 1 AAGCACACCGCCGCACCTCACCTAAGCAAACCACCCGGTCACTGAGAAAG 50
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Lambda K H
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alternate locus group ALT_REF_LOCI_9
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 181345 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 181394
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alternate locus group ALT_REF_LOCI_6
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 181345 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 181394
>ref|NW_003571058.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, GRCh38 alternate
locus group ALT_REF_LOCI_5 HSCHR19LRC_LRC_S_CTG3_1
gb|GL949750.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic contig, GRCh38 reference assembly
alternate locus group ALT_REF_LOCI_5
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 181345 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 181394
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locus group ALT_REF_LOCI_4 HSCHR19LRC_LRC_J_CTG3_1
gb|GL949749.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic contig, GRCh38 reference assembly
alternate locus group ALT_REF_LOCI_4
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 181345 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 181394
>ref|NW_003571056.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, GRCh38 alternate
locus group ALT_REF_LOCI_3 HSCHR19LRC_LRC_I_CTG3_1
gb|GL949748.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic contig, GRCh38 reference assembly
alternate locus group ALT_REF_LOCI_3
Length=1064304
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 181345 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 181394
>ref|NT_011109.17| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR19_CTG3_1
gb|GL000140.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 26965489 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 26965538
>ref|NC_018930.2| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001627.2| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 54711382 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 54711431
>ref|NW_004929415.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150199.1| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 26584782 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 26584831
>gb|KE141151.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold82, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 2638952 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 2639001
>gb|CM000509.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=55419394
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 51026568 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 51026617
>gb|DS990780.1| Homo sapiens SCAF_1112675837354 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 1239790 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 1239741
>gb|CH003514.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 58354294 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 58354245
>gb|CH003466.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=56718491
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 52340451 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 52340500
>ref|NT_086363.3|ENm007 Homo sapiens chromosome 19 sequence, ENCODE region ENm007
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 378459 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 378508
>gb|CH471135.1| Homo sapiens 211000035835035 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=8450095
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 4059191 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 4059240
>ref|NW_001838498.2| Homo sapiens chromosome 19 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188409, whole genome shotgun sequence
gb|DS486142.1| Homo sapiens SCAF_1103279188409 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 1239868 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 1239819
>ref|AC_000151.1| Homo sapiens chromosome 19, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000480.1| Homo sapiens chromosome 19, whole genome shotgun sequence
Length=55419010
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 51026038 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 51026087
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 51751907 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 51751956
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Lambda K H
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blast search - nt
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>ref|XM_010331961.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis ribosomal protein
S9 (RPS9), mRNA
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 493 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 542
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variant X3, misc_RNA
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 364 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 413
>ref|XM_009436367.1| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 376 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 425
>ref|XM_009436366.1| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X1, mRNA
Length=1014
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 665 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 714
>ref|XR_170672.2| PREDICTED: Pan troglodytes 40S ribosomal protein S9-like (LOC748263),
misc_RNA
Length=760
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 381 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 430
>ref|XM_002829733.3| PREDICTED: Pongo abelii ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
Length=831
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 482 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 531
>ref|XM_008955597.1| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 376 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 425
>ref|XM_008955596.1| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X1, mRNA
Length=831
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 482 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 531
>ref|XR_611047.1| PREDICTED: Pan paniscus 40S ribosomal protein S9-like (LOC100979463),
misc_RNA
Length=714
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 332 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 381
>ref|XR_623440.1| PREDICTED: Callithrix jacchus 40S ribosomal protein S9-like (LOC103795813),
misc_RNA
Length=2766
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 1414 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 1463
>ref|XR_088472.3| PREDICTED: Callithrix jacchus 40S ribosomal protein S9 pseudogene
(LOC100388574), misc_RNA
Length=725
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 380 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 429
>ref|XR_502429.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus 40S ribosomal protein S9 pseudogene
(LOC103246456), misc_RNA
Length=779
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 459
>ref|XR_431099.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X30, misc_RNA
Length=1093
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 482 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 531
>ref|XR_430911.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X32, misc_RNA
ref|XR_430953.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X5, misc_RNA
ref|XR_430986.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X3, misc_RNA
ref|XR_431006.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X3, misc_RNA
ref|XR_431025.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X3, misc_RNA
ref|XR_431056.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X3, misc_RNA
ref|XR_431067.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X3, misc_RNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 414
>ref|XM_005277316.2| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X15, mRNA
ref|XM_005259136.2| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X2, mRNA
ref|XM_006725877.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X2, mRNA
ref|XM_006725965.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X2, mRNA
ref|XM_006726064.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X2, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X2, mRNA
Length=744
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 444
>ref|XR_431090.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X19, misc_RNA
Length=976
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 365 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 414
>ref|XM_005277084.2| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X1, mRNA
Length=712
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 363 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 412
>ref|XR_254518.2| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X33, misc_RNA
Length=916
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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variant X34, misc_RNA
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variant X16, mRNA
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variant X17, mRNA
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Sbjct 482 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 531
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Sbjct 395 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 444
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Sbjct 361 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 410
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Sbjct 482 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 531
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variant X1, mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 361 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 410
>gb|AC245052.3| Homo sapiens BAC clone CH17-337D22 from chromosome 19, complete
sequence
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Sbjct 134903 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 134952
>ref|NM_001168878.1| Papio anubis ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
Length=585
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Sbjct 308 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 357
>gb|AC236057.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC12-46745800N2 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=41556
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Sbjct 25693 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 25742
>gb|AC237295.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC24-2447H11 from chromosome 19, complete
sequence
Length=39354
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Sbjct 26595 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 26546
>dbj|AK301380.1| Homo sapiens cDNA FLJ61636 complete cds, highly similar to 40S
ribosomal protein S9
Length=1750
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Sbjct 364 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 413
>dbj|AB464169.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6854, Homo sapiens RPS9
gene for ribosomal protein S9, without stop codon, in Flexi
system
Length=599
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 317 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 366
>gb|AC198523.3| Pongo abelii BAC clone CH276-34P13 from chromosome 19, complete
sequence
Length=193619
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 184501 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 184452
>emb|CU457734.2| Human DNA sequence from clone CH502-105G6 on chromosome 19, complete
sequence
Length=182001
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 53370 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 53419
>gb|BC141920.1| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone IMAGE:40131545),
partial cds
Length=340
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 125 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 174
>gb|DQ894383.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008843; FLH170100.01L;
RZPDo839B1097D ribosomal protein S9 (RPS9) gene, encodes
complete protein
Length=625
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 330 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 379
>gb|DQ891200.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003830; FLH170104.01X; RZPDo839B1098D
ribosomal protein S9 (RPS9) gene, encodes complete
protein
Length=625
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 379
>emb|CU151838.1| Human DNA sequence from clone CH501-111L9 on chromosome 19, complete
sequence
Length=125570
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53542 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 53591
>gb|AC163770.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-4E4 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=210071
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 65798 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 65749
>gb|BC021072.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:2961640, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4908
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 342 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 391
>gb|BC068055.1| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:78492
IMAGE:5454636), complete cds
Length=716
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 351 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 400
>gb|BC007410.2| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:2458
IMAGE:2964451), complete cds
gb|BC007434.2| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:4138
IMAGE:2964451), complete cds
Length=735
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 346 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 395
>gb|BC000802.1| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:5482
IMAGE:3452221), complete cds
Length=699
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 388
>gb|BC007857.2| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:14341
IMAGE:4298534), complete cds
Length=710
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 344 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 393
>gb|BC071941.1| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone IMAGE:6647283)
Length=974
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 348 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 397
>ref|NM_001013.3| Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
Length=753
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 413
>gb|BC020462.1| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone IMAGE:3856008)
Length=715
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 371 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 322
>gb|AC010492.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2337J16, complete sequence
Length=80427
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 18377 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 18426
>gb|BC058892.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5722004, partial cds
Length=1633
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 313 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 362
>gb|BC071940.1| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:88627
IMAGE:6258045), complete cds
Length=711
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 346 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 395
>gb|BC096756.1| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:104834
IMAGE:3507400), complete cds
Length=771
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 351 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 400
>gb|BC096822.1| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone IMAGE:30563301)
Length=890
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 319 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 368
>gb|AC153469.2| Homo sapiens chromosome 19 clone WI2-3011J2, complete sequence
Length=41786
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 2604 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 2653
>gb|AC012314.8| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-3093M3, complete sequence
Length=198017
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 183730 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 183779
>gb|AY889956.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH028295.01X ribosomal
protein S9 (RPS9) mRNA, complete cds
Length=585
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 308 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 357
>gb|AY892431.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH028292.01L ribosomal
protein S9 (RPS9) mRNA, partial cds
Length=585
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 308 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 357
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and sequence
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variant X2, misc_RNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 577 AGGATTTCTTAGAGAGACGTCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 626
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Sbjct 359 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 408
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mRNA
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Sbjct 433 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTTAAGCTGGGCTTG 482
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Sbjct 393 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 442
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Sbjct 93654 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTTAAGCTGGGCTTG 93605
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Sbjct 414 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 463
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Sbjct 404 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 453
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Sbjct 331 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 377
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S9 (RPS9), mRNA
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Sbjct 400 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 446
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Sbjct 427 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 473
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mRNA
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Sbjct 656 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 705
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Sbjct 398 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 447
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mRNA
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Sbjct 388 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 437
>ref|XM_006219341.1| PREDICTED: Vicugna pacos ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 341 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTAGGCTTG 390
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misc_RNA
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Sbjct 399 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 448
>ref|XR_330775.1| PREDICTED: Myotis lucifugus 40S ribosomal protein S9-like (LOC102441090),
misc_RNA
Length=716
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 397 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 446
>ref|XM_005911131.1| PREDICTED: Bos mutus ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 47
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Sbjct 359 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 405
>ref|XM_005879961.1| PREDICTED: Myotis brandtii ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 405 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 454
>ref|XM_005879960.1| PREDICTED: Myotis brandtii ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X1, mRNA
Length=746
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 399 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 448
>ref|XM_001488024.4| PREDICTED: Equus caballus ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 414 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 463
>ref|XM_005219765.1| PREDICTED: Bos taurus ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X1, mRNA
Length=791
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 47
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Sbjct 442 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 488
>ref|XM_004439062.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum ribosomal protein S9 (RPS9),
mRNA
Length=695
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 342 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 391
>ref|XM_004409554.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens 40S ribosomal protein
S9-like (LOC101367282), mRNA
Length=726
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 389 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 438
>ref|XM_004332149.1| PREDICTED: Tursiops truncatus ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
Length=701
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 47
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Sbjct 352 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 398
>ref|XM_004285671.1| PREDICTED: Orcinus orca ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
Length=675
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 47
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Sbjct 331 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 377
>ref|XM_004061415.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein S9, transcript
variant 2 (RPS9), mRNA
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 428 AGGATTTCTTAGAGAGACGTTTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 477
>ref|XM_004061414.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein S9, transcript
variant 1 (RPS9), mRNA
Length=849
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 493 AGGATTTCTTAGAGAGACGTTTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 542
>ref|NM_001101152.2| Bos taurus ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
Length=721
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 47
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Sbjct 364 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 410
>gb|HQ318016.1| Ailuropoda melanoleuca ribosomal protein S9 (RPS9) gene, complete
cds
Length=6193
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 5080 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 5129
>gb|HQ318015.1| Ailuropoda melanoleuca ribosomal protein S9 (RPS9) mRNA, complete
cds
Length=637
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 315 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 364
>ref|XM_002927959.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca 40S ribosomal protein S9-like
(LOC100464779), mRNA
Length=705
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
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Sbjct 343 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 392
>gb|EU638309.1| Tursiops truncatus S-9 mRNA, partial cds
Length=483
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 47
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Sbjct 288 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 334
>gb|EU638308.1| Lagenorhynchus obliquidens S-9 mRNA, partial cds
Length=380
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 47
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Sbjct 253 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 299
>gb|BC149631.1| Bos taurus cDNA clone IMAGE:8581169, containing frame-shift errors
Length=723
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 47
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Sbjct 362 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 408
>gb|BC148016.1| Bos taurus ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:179248
IMAGE:7946025), complete cds
Length=728
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 47
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 412
>gb|BC147956.1| Bos taurus ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:166013
IMAGE:8247047), complete cds
Length=722
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 47
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 AGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 411
>ref|XM_006907137.1| PREDICTED: Pteropus alecto ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X2, mRNA
Length=710
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 GATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 412
>ref|XM_006907136.1| PREDICTED: Pteropus alecto ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X1, mRNA
Length=734
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 50
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 389 GATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTG 436
>ref|XM_006144737.1| PREDICTED: Tupaia chinensis ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X2, mRNA
Length=710
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 47
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Sbjct 364 AGGATTTCTTGGAGAGGCGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGC 410
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19 19 54710257 54711292 73M935N27M CCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 54710260 54711295 70M935N30M AGGTCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 54710263 54711298 67M935N33M TCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCGGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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19 19 54710275 54710465 55M90N45M GCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CCCTCGGAGGTGATGGGTGTGAACTCACCCAGAGGGTACAGATTC
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 181339 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 181388
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genome shotgun sequence
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Sbjct 19552107 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTACAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 19552156
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1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AGAAAAAGCACACCGCCGCACCTCACCTAAGCAAACCACCCGGTCACTGA
right flanking sequence - AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG
>ref|XR_676052.1| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X3, misc_RNA
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>ref|XM_009436367.1| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 359 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 408
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Sbjct 388 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 437
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Sbjct 389 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 438
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variant X2, mRNA
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 389 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 438
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Sbjct 355 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 404
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 476 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 525
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variant X1, mRNA
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variant X1, mRNA
ref|XM_006726201.1| PREDICTED: Homo sapiens ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 355 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 404
>gb|AC245052.3| Homo sapiens BAC clone CH17-337D22 from chromosome 19, complete
sequence
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 134897 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 134946
>gb|AC236057.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC12-46745800N2 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=41556
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 25687 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 25736
>gb|AC237295.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC24-2447H11 from chromosome 19, complete
sequence
Length=39354
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 26601 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 26552
>dbj|AK301380.1| Homo sapiens cDNA FLJ61636 complete cds, highly similar to 40S
ribosomal protein S9
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 358 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 407
>dbj|AB464169.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6854, Homo sapiens RPS9
gene for ribosomal protein S9, without stop codon, in Flexi
system
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 311 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 360
>gb|AC198523.3| Pongo abelii BAC clone CH276-34P13 from chromosome 19, complete
sequence
Length=193619
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 184507 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 184458
>emb|CU457734.2| Human DNA sequence from clone CH502-105G6 on chromosome 19, complete
sequence
Length=182001
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 53364 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 53413
>gb|BC141920.1| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone IMAGE:40131545),
partial cds
Length=340
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 119 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 168
>gb|DQ894383.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008843; FLH170100.01L;
RZPDo839B1097D ribosomal protein S9 (RPS9) gene, encodes
complete protein
Length=625
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 324 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 373
>gb|DQ891200.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003830; FLH170104.01X; RZPDo839B1098D
ribosomal protein S9 (RPS9) gene, encodes complete
protein
Length=625
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 324 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 373
>emb|CU151838.1| Human DNA sequence from clone CH501-111L9 on chromosome 19, complete
sequence
Length=125570
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 53536 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 53585
>gb|AC163770.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-4E4 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=210071
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 65804 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 65755
>gb|BC021072.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:2961640, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4908
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 336 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 385
>gb|BC068055.1| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:78492
IMAGE:5454636), complete cds
Length=716
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 345 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 394
>gb|BC007410.2| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:2458
IMAGE:2964451), complete cds
gb|BC007434.2| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:4138
IMAGE:2964451), complete cds
Length=735
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 50
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Sbjct 340 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 389
>gb|BC000802.1| Homo sapiens ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:5482
IMAGE:3452221), complete cds
Length=699
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protein S9 (RPS9) mRNA, partial cds
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Sbjct 302 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 351
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and sequence
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S9 (RPS9), mRNA
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misc_RNA
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misc_RNA
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(LOC100602387), mRNA
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Sbjct 498 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTACAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 547
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variant 1 (RPS9), mRNA
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Sbjct 487 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTACAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 536
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(LOC101150457), partial mRNA
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Sbjct 131 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTACAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 180
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Sbjct 302 AGATCGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 351
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19
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Sbjct 458 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTACAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 507
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22
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Sbjct 458 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTACAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 507
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Sbjct 145590 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTACAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 145541
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sequence
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Sbjct 88735 AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTACAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 88784
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Sbjct 325 AGATTGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 374
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S9 (RPS9), mRNA
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Sbjct 394 AGATTGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 443
>ref|XM_006053433.1| PREDICTED: Bubalus bubalis ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
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Sbjct 421 AGATTGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 470
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Sbjct 353 AGATTGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 402
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Sbjct 353 AGATCGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 402
>ref|XM_533590.4| PREDICTED: Canis lupus familiaris ribosomal protein S9 (RPS9),
mRNA
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Sbjct 427 AGATCGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTTAAGCTG 476
>ref|XM_005219765.1| PREDICTED: Bos taurus ribosomal protein S9 (RPS9), transcript
variant X1, mRNA
Length=791
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Sbjct 436 AGATTGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 485
>ref|XM_004332149.1| PREDICTED: Tursiops truncatus ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
Length=701
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Sbjct 346 AGATTGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 395
>ref|XM_004285671.1| PREDICTED: Orcinus orca ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
Length=675
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Sbjct 325 AGATTGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 374
>ref|NM_001101152.2| Bos taurus ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
Length=721
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Sbjct 358 AGATTGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 407
>ref|NM_001265659.1| Macaca mulatta ribosomal protein S9 (RPS9), mRNA
Length=722
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Sbjct 363 AGATCGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTTTTCAAGCTG 412
>dbj|AK391892.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10031D02, expressed in hypothalamus
Length=754
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Sbjct 387 AGATCGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 436
>gb|EU638309.1| Tursiops truncatus S-9 mRNA, partial cds
Length=483
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Sbjct 282 AGATTGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 331
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Sbjct 360 AGATTGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 409
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Sbjct 359 AGATTGAGGATTTCTTGGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTG 408
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19 19 54705072 54710254 46m271n24m54710225F30M CTGCGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTAAGCAAACCACCCGGTCACTGA AGATAGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGC
19 19 54705072 54710254 46m271n24m54710225F30M CTGCGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTAAGCAAACCACCCGGTCACTGA AGCTTGAGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGC
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19 19 54710230 54710330 100M AGGATTTCTTAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG
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19 19 54710239 54711274 91M935N9M TAGAGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTCGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 54710242 54710342 100M AGAGACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAGGTACCACCTCGG
19 19 54710245 54711280 85M935N15M GACGCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGGCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 54710248 54710348 100M GCCTGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAGGTACCACCTCGGATGGGC
19 19 54710251 54711286 79M935N21M TGCAGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATTCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGGCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 54710254 54711289 76M935N24M AGACCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGGGCTGATCCGCCATCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 54710257 54711292 73M935N27M CCCAGGTCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 54710260 54711295 70M935N30M AGGTCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 54710263 54711298 67M935N33M TCTTCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCGGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 54710266 54710366 100M TCAAGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAGGTACCACCTCGGATGGGCACCTGAATCTTCCTCCAC
19 19 54710269 54710459 61M90N39M AGCTGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CCCTCGGAGGTGATGGGTGTGAACTCACCCAGAGGGTAC
19 19 54710272 54711307 58M935N42M TGGGCTTGGCCAAGTCCATCCACCACTCTCCCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 54710275 54710465 55M90N45M GCTTGGCCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CCCTCGGAGGTGATGGGTGTGAACTCACCCAGAGGGTACAGATTC
19 19 54710278 54711313 52M935N48M TGGCCAAGTCCATCCACCATGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 19 54710281 54710471 49M90N51M CCAAGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CCCTCGGAGGTGATGGGTGTGAACTCACCCAGAGGGTACAGATTCACCCTT
19 19 54710284 54710384 100M AGTCCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAGGTACCACCTCGGATGGGCACCTGAATCTTCCTCCACCTGCCCCTCTGATGGTTG
19 19 54710287 54710477 43M90N57M CCATCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCTAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CCCTCGGAGGTGATGGGTGTGAACTCACCCAGAGGGTACAGATTCACCCTTGCACAC
19 19 54710290 54710480 40M90N60M TCCACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CCCTCGGAGGTGATGGGTGTGAACTCACCCAGAGGGTACAGATTCACCCTTGCACACAGC
19 19 54710293 54710483 37M90N63M ACCACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CCCTCGGAGGTGATGGGTGTGAACTCACCCAGAGGGTACAGATTCACCCTTGCACACAGCTCA
19 19 54710296 54710486 34M90N66M ACGCTCGCGTGCTGATCCGCCAGCGCCATATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CCCTCGGAGGTGATGGGTGTGAACTCACCCAGAGGGTACAGATTCACCGTTGCACACAGCTCACCA
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188409, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG
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(LOC104671878), mRNA
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Sbjct 175 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 126
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Sbjct 175 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 126
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Sbjct 697 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 648
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(LOC103878317), misc_RNA
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mRNA
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Sbjct 159 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 110
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variant X1, mRNA
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mRNA
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Sbjct 88 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 39
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mRNA
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Sbjct 86 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 37
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mRNA
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Sbjct 86 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 37
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mRNA
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Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 84 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 35
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variant 3 (RPL28), mRNA
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Sbjct 86 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 37
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variant 1 (RPL28), mRNA
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Sbjct 1799 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 1750
>ref|XR_174701.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L28 pseudogene
(LOC101144207), misc_RNA
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Sbjct 87 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 38
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Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 85 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 36
>ref|XM_002800371.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical protein LOC100426964 (LOC100426964),
mRNA
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Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 485 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 534
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variant 1 (LOC714598), mRNA
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Sbjct 54 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 5
>ref|XM_002800370.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 8 (LOC714598), mRNA
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Sbjct 89 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 40
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variant 7 (LOC714598), mRNA
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Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 90 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 41
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variant 6 (LOC714598), mRNA
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Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 88 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 39
>ref|XM_002800367.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 5 (LOC714598), mRNA
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Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 88 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 39
>ref|XM_002800366.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 4 (LOC714598), mRNA
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Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 59 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 10
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Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 24
>ref|XM_002800364.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 2 (LOC714598), mRNA
Length=524
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 6
>ref|NM_001136137.1| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
5, mRNA
Length=682
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 35
>ref|NM_001136136.1| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
4, mRNA
Length=594
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 35
>ref|NM_001136135.1| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
3, mRNA
Length=934
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 35
>ref|NM_000991.4| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
2, mRNA
Length=4245
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 35
>ref|NM_001136134.1| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
1, mRNA
Length=4439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 35
>dbj|AK293736.1| Homo sapiens cDNA FLJ57954 complete cds, highly similar to 60S
ribosomal protein L28
Length=1204
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 82 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 33
>dbj|AK311760.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92020, Homo sapiens ribosomal protein L28
(RPL28), mRNA
Length=456
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 35
>ref|NM_001283996.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925497 (LOC101925497),
mRNA
dbj|AB172493.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-18366, similar to
human ribosomal protein L28 (RPL28), mRNA, RefSeq: NM_000991.3
Length=515
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 84 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 35
>gb|BC009885.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3959863, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1774
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 509
>gb|BC004230.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3546879, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1774
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 509
>gb|BC010173.2| Homo sapiens ribosomal protein L28, mRNA (cDNA clone MGC:20081
IMAGE:4054251), complete cds
Length=511
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 69 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 20
>gb|BC010182.2| Homo sapiens ribosomal protein L28, mRNA (cDNA clone MGC:20328
IMAGE:4301420), complete cds
Length=515
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 73 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 24
>dbj|AK096870.1| Homo sapiens cDNA FLJ39551 fis, clone RECTM2000220, highly similar
to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L28
Length=1983
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 1566 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 1517
>dbj|AB209627.1| Homo sapiens mRNA for ribosomal protein L28 variant protein
Length=5622
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 67 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 18
>gb|AC020922.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2105E13, complete sequence
Length=134793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 94682 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 94633
>gb|BC011582.1| Homo sapiens ribosomal protein L28, mRNA (cDNA clone MGC:20378
IMAGE:4561118), complete cds
Length=4222
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 63 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 14
>gb|U14969.1|HSU14969 Human ribosomal protein L28 mRNA, complete cds
Length=485
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
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Sbjct 69 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 20
>ref|XM_010379191.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ribosomal protein L28 (RPL28),
mRNA
Length=534
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGC 48
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Sbjct 115 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGC 68
>ref|XR_164862.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis 60S ribosomal protein
L28 pseudogene (LOC101046910), misc_RNA
Length=501
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 131 GGAACAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 82
>ref|XR_620272.1| PREDICTED: Callithrix jacchus 60S ribosomal protein L28 pseudogene
(LOC100395462), misc_RNA
Length=461
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 GGAGCAGTTCCGCAAGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 32
>ref|XR_490320.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus 60S ribosomal protein L28 pseudogene
(LOC103215820), misc_RNA
Length=507
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 95 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGGGCAGACATGGCGGCGG 46
>ref|XM_004711199.1| PREDICTED: Echinops telfairi 60S ribosomal protein L28-like (LOC101662164),
mRNA
Length=450
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 78 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCGG 29
>ref|XM_003262428.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys 60S ribosomal protein L28-like
(LOC100603865), mRNA
Length=509
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 57 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCACAGACATGGCGGCGG 8
>ref|NG_010782.1| Homo sapiens ribosomal protein L28 pseudogene 3 (RPL28P3) on
chromosome 5
Length=606
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 GGAGCAGTTCCTCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 93
>gb|AC113398.3| Homo sapiens chromosome 5 clone RP11-436H11, complete sequence
Length=172613
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163169 GGAGCAGTTCCTCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 163218
>gb|AC109464.2| Homo sapiens chromosome 5 clone RP11-284A20, complete sequence
Length=161641
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7471 GGAGCAGTTCCTCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG 7520
>ref|XM_006064023.1| PREDICTED: Bubalus bubalis ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X3, mRNA
Length=592
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 164 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCG 116
>ref|XM_006064022.1| PREDICTED: Bubalus bubalis ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X2, mRNA
Length=621
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 193 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCG 145
>ref|XM_006064021.1| PREDICTED: Bubalus bubalis ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X1, mRNA
Length=584
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 156 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCG 108
>ref|XM_006039577.1| PREDICTED: Bubalus bubalis 60S ribosomal protein L28-like (LOC102389113),
transcript variant X2, mRNA
Length=622
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 203 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCG 155
>ref|XM_006039576.1| PREDICTED: Bubalus bubalis 60S ribosomal protein L28-like (LOC102389113),
transcript variant X1, mRNA
Length=588
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 169 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCG 121
>ref|XM_005352516.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster 60S ribosomal protein L28-like
(LOC101983055), mRNA
Length=487
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 77 GGAGCAGTTCCGAACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 29
>ref|XM_005345906.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster RNA binding motif protein 34
(Rbm34), transcript variant X3, mRNA
Length=692
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 GGAGCAGTTCCGAACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 232
>ref|XM_005345905.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster RNA binding motif protein 34
(Rbm34), transcript variant X2, mRNA
Length=695
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 GGAGCAGTTCCGAACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 235
>ref|XM_005219718.1| PREDICTED: Bos taurus ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X3, mRNA
Length=995
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 551 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCG 503
>ref|XM_005219717.1| PREDICTED: Bos taurus ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X2, mRNA
Length=600
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 181 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCG 133
>ref|XM_005219716.1| PREDICTED: Bos taurus ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X1, mRNA
Length=970
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 551 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCG 503
>ref|XM_004672675.1| PREDICTED: Jaculus jaculus ribosomal protein L28 (Rpl28), mRNA
Length=515
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 98 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCG 50
>ref|NM_001035503.2| Bos taurus ribosomal protein L28 (RPL28), mRNA
Length=522
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 84 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCG 36
>dbj|AB464159.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6728, Homo sapiens RPL28
gene for ribosomal protein L28, without stop codon, in Flexi
system
Length=428
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCG 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCG 6
>gb|BC102344.1| Bos taurus ribosomal protein L28, mRNA (cDNA clone MGC:127438
IMAGE:7947058), complete cds
Length=523
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 85 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGCG 37
>ref|XM_008538030.1| PREDICTED: Equus przewalskii ribosomal protein L28 (RPL28), mRNA
Length=550
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGC 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 126 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGC 79
>ref|XM_007181352.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni ribosomal protein
L28 (RPL28), mRNA
Length=523
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGC 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 100 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGC 53
>ref|XM_001495765.3| PREDICTED: Equus caballus 60S ribosomal protein L28-like (LOC100050572),
mRNA
Length=569
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGC 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 146 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGC 99
>ref|XM_008846658.1| PREDICTED: Nannospalax galili ribosomal protein L28 (Rpl28),
mRNA
Length=555
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 136 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCCGACATGGCGGC 90
>ref|XM_007103238.1| PREDICTED: Physeter catodon ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X2, mRNA
Length=541
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 116 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGC 70
>ref|XM_007103237.1| PREDICTED: Physeter catodon ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X1, mRNA
Length=519
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 94 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGC 48
>ref|XM_006216272.1| PREDICTED: Vicugna pacos ribosomal protein L28 (RPL28), mRNA
Length=502
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 83 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGC 37
>ref|XM_006211785.1| PREDICTED: Vicugna pacos 60S ribosomal protein L28-like (LOC102541404),
mRNA
Length=450
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 77 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGC 31
>ref|XM_006187024.1| PREDICTED: Camelus ferus ribosomal protein L28 (RPL28), mRNA
Length=496
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGC 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 83 GAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCGGC 37
>gb|DQ896287.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010747; FLH192950.01L;
RZPDo839B0268D ribosomal protein L28 (RPL28) gene,
encodes complete protein
Length=454
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGG 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGG 21
>gb|DQ893043.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005673; FLH192954.01X; RZPDo839B0278D
ribosomal protein L28 (RPL28) gene, encodes complete
protein
Length=454
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGG 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGG 21
>gb|KJ897491.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06885 RPL28
gene, encodes complete protein
Length=543
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATG 65
>gb|KJ892038.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01432 RPL28
gene, encodes complete protein
Length=543
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATG 65
>ref|XM_005906129.1| PREDICTED: Bos mutus 60S ribosomal protein L28-like (LOC102287469),
mRNA
Length=501
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCG 46
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 78 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCGGACATGGCG 33
>ref|XM_005369325.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster ribosomal protein L28 (Rpl28),
transcript variant X2, mRNA
Length=808
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 GGAACAGTTCCGAACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 337
>ref|XM_005369324.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster ribosomal protein L28 (Rpl28),
transcript variant X1, mRNA
Length=646
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Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGAACAGTTCCGAACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 175
>ref|XM_005363964.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster 60S ribosomal protein L28-like
(LOC101989794), mRNA
Length=498
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 49
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 GGAGCAGTTCCGAACGGCCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCG 7
>ref|XM_004381764.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris ribosomal protein L28
(RPL28), mRNA
Length=485
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCG 46
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 78 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCCGACATGGCG 33
>emb|CR457024.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C0115D
for gene RPL28, ribosomal protein L28; complete cds, incl.
stopcodon
Length=414
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACAT 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACAT 1
>gb|AY891926.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH028792.01L ribosomal
protein L28 (RPL28) mRNA, partial cds
Length=414
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Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACAT 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACAT 1
>gb|AY889460.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH028795.01X ribosomal
protein L28 (RPL28) mRNA, complete cds
Length=414
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACAT 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 GGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACAT 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCGGTGAGTTTTGTCTGG
>ref|NM_001136136.1| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
4, mRNA
Length=594
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCGGTGAGTTTTGTCTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCGGTGAGTTTTGTCTGG 262
>dbj|AB209627.1| Homo sapiens mRNA for ribosomal protein L28 variant protein
Length=5622
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCGGTGAGTTTTGTCTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCGGTGAGTTTTGTCTGG 245
>gb|AC020922.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2105E13, complete sequence
Length=134793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCGGTGAGTTTTGTCTGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94942 CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCGGTGAGTTTTGTCTGG 94991
>ref|XM_003277336.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein L28 (RPL28),
mRNA
Length=1351
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCGGTGAGTTTTGTCTG 49
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 CAAAGGCGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCGGTGAGTTTTGTCTG 265
>ref|NM_001136137.1| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
5, mRNA
Length=682
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 2/49 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCG-GTGAGTTTTGTCT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 213 CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCGAGTGAGTTTT-TCT 260
>ref|XM_003316689.2| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X3, mRNA
Length=1026
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 1/45 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCG-GTGAGTTTT 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 304 CAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGGAGATCCGAGTGAGTTTT 348
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
19 19 55899298 55897962 2m1236n98m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAA
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19 19 55898667 55897976 16m591n84m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGT
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19 19 55898102 55898002 100m TGCCGGCTCCACGCC
19 19 55898097 55897997 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAT
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19 19 55898073 55897973 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGT
19 19 55898068 55897968 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGGGAATCAGTCCGTTGTAGCGG
19 19 55898065 55897965 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAG
19 19 55898062 55897962 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAA
19 19 55898059 55897959 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTG
19 19 55898056 55897956 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGG
19 19 55898053 55897953 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCC
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19 19 55898047 55897947 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAG
19 19 55898044 55897944 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTA
19 19 55898041 55897941 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTG
19 19 55898038 55897938 100m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGC
19 19 55898035 55897804 99m131n1m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||A
19 19 55898032 55897801 96m131n4m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTG
19 19 55898029 55897798 93m131n7m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTG
19 19 55898026 55897795 90m131n10m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATAGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAG
19 19 55898023 55897792 87m131n13m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTC
19 19 55898020 55897789 84m131n16m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGC
19 19 55898017 55897786 81m131n19m TGCCGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTA
19 19 55898014 55897783 78m131n22m CGGCTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTC
19 19 55898011 55897780 75m131n25m CTCCACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTCCTC
19 19 55898008 55897777 72m131n28m CACGCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTCCTCTTG
19 19 55898005 55897774 69m131n31m GCCCACAGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTCCTCTTGATC
19 19 55898002 55897771 66m131n34m CACAGTCTTTCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTCCTCTTGATCAGG
19 19 55897999 55897768 63m131n37m AGTCTTGCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGCAGGTCTGCTTATTCCTCTTGATCAGGAAA
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19 19 55897993 55897762 57m131n43m GCGGTGAATCAGTCCGTTGTAGCGGAAGGAACTGCGGGCCCTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTCCTCTTGATCAGGAAACTGGAG
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19 19 55897978 55897747 42m131n58m GTTGTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTCCTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACC
19 19 55897975 55897744 39m131n61m GTAGCGGAAGGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTCCTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATC
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19 19 55897966 55897735 30m131n70m GGAATTGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTCCTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTACAGA
19 19 55897963 55897732 27m131n73m ATGGCGGGCCTTCAAGTTATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTCCTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGC
19 19 55897959 55897728 23m131n77m CGGGCCTTTAAGTGATTGGGCTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTCCTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAG
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19 19 55897939 55898034 3m131n89m55898027F8M CTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGTGCTGTAGGTCTGCTTATTCCTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATGCGCAGACATGGCGGCGG CAAAGGTG
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 44787 CGCAAGAACAAGTACCGCCCCGACCTGCGCATGGTGAGCTGGGGTTTGGG 44738
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shotgun sequence
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1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG
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mRNA
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(LOC104671878), mRNA
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(LOC465479), misc_RNA
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Sbjct 102 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 53
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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Sbjct 192 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 143
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variant X1, mRNA
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Sbjct 192 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 143
>ref|XM_002829788.3| PREDICTED: Pongo abelii ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X2, mRNA
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>ref|XM_009233142.1| PREDICTED: Pongo abelii ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 714 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 665
>ref|XM_003916132.2| PREDICTED: Papio anubis ribosomal protein L28 (RPL28), mRNA
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Sbjct 1807 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 1758
>ref|XR_638465.1| PREDICTED: Papio anubis 60S ribosomal protein L28 pseudogene
(LOC103878317), misc_RNA
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Sbjct 122 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 73
>ref|XM_003807102.2| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 1643 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 1594
>ref|XM_008959152.1| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 277 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 228
>ref|XM_008959151.1| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X1, mRNA
Length=2238
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 1643 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 1594
>gb|KJ897491.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06885 RPL28
gene, encodes complete protein
Length=543
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 124 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 75
>gb|KJ892038.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01432 RPL28
gene, encodes complete protein
Length=543
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Sbjct 124 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 75
>ref|XR_490320.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus 60S ribosomal protein L28 pseudogene
(LOC103215820), misc_RNA
Length=507
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Sbjct 112 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 63
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mRNA
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Sbjct 176 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 127
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variant X1, mRNA
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Sbjct 101 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
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(LOC102134263), mRNA
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Sbjct 109 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 60
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mRNA
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Sbjct 95 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 46
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Sbjct 115 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 66
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(RPL28), mRNA
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Sbjct 95 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 46
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(LOC100603865), mRNA
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Sbjct 74 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 25
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mRNA
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Sbjct 105 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 56
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mRNA
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Sbjct 103 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 54
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mRNA
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Sbjct 103 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 54
>ref|XM_004089124.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein L28 (RPL28),
mRNA
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Sbjct 101 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
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variant 3 (RPL28), mRNA
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Sbjct 103 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 54
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variant 2 (RPL28), mRNA
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Sbjct 112 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 63
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variant 1 (RPL28), mRNA
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Sbjct 1816 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 1767
>ref|XR_174701.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L28 pseudogene
(LOC101144207), misc_RNA
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Sbjct 104 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 55
>ref|NM_001266119.1| Macaca mulatta ribosomal protein L28 (RPL28), mRNA
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Sbjct 102 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 53
>ref|XM_002800371.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical protein LOC100426964 (LOC100426964),
mRNA
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Sbjct 468 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 517
>ref|XM_001113291.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 1 (LOC714598), mRNA
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Sbjct 71 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 22
>ref|XM_002800370.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 8 (LOC714598), mRNA
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Sbjct 106 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 57
>ref|XM_002800369.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 7 (LOC714598), mRNA
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Sbjct 107 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 58
>ref|XM_002800368.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 6 (LOC714598), mRNA
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Sbjct 105 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 56
>ref|XM_002800367.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 5 (LOC714598), mRNA
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 105 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 56
>ref|XM_002800366.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 4 (LOC714598), mRNA
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Sbjct 76 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 27
>ref|XM_002800365.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 3 (LOC714598), mRNA
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 90 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 41
>ref|XM_002800364.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L28-like, transcript
variant 2 (LOC714598), mRNA
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 72 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 23
>ref|NM_001136137.1| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
5, mRNA
Length=682
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 101 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
>ref|NM_001136136.1| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
4, mRNA
Length=594
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 101 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
>ref|NM_001136135.1| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
3, mRNA
Length=934
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 101 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
>ref|NM_000991.4| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
2, mRNA
Length=4245
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 101 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
>ref|NM_001136134.1| Homo sapiens ribosomal protein L28 (RPL28), transcript variant
1, mRNA
Length=4439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 101 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
>dbj|AB464159.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6728, Homo sapiens RPL28
gene for ribosomal protein L28, without stop codon, in Flexi
system
Length=428
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 68 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 19
>dbj|AK293736.1| Homo sapiens cDNA FLJ57954 complete cds, highly similar to 60S
ribosomal protein L28
Length=1204
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 99 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
>dbj|AK311760.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92020, Homo sapiens ribosomal protein L28
(RPL28), mRNA
Length=456
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 101 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
>gb|DQ896287.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010747; FLH192950.01L;
RZPDo839B0268D ribosomal protein L28 (RPL28) gene,
encodes complete protein
Length=454
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 81 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 32
>gb|DQ893043.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005673; FLH192954.01X; RZPDo839B0278D
ribosomal protein L28 (RPL28) gene, encodes complete
protein
Length=454
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 81 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 32
>ref|NM_001283996.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925497 (LOC101925497),
mRNA
dbj|AB172493.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-18366, similar to
human ribosomal protein L28 (RPL28), mRNA, RefSeq: NM_000991.3
Length=515
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 101 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
>gb|BC009885.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3959863, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1774
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 443 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 492
>gb|BC004230.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3546879, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1774
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 443 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 492
>gb|BC010173.2| Homo sapiens ribosomal protein L28, mRNA (cDNA clone MGC:20081
IMAGE:4054251), complete cds
Length=511
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 86 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 37
>gb|BC010182.2| Homo sapiens ribosomal protein L28, mRNA (cDNA clone MGC:20328
IMAGE:4301420), complete cds
Length=515
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 90 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 41
>dbj|AK096870.1| Homo sapiens cDNA FLJ39551 fis, clone RECTM2000220, highly similar
to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L28
Length=1983
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 1534
>dbj|AB209627.1| Homo sapiens mRNA for ribosomal protein L28 variant protein
Length=5622
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 35
>emb|CR457024.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C0115D
for gene RPL28, ribosomal protein L28; complete cds, incl.
stopcodon
Length=414
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 10
>gb|AC020922.9| Homo sapiens chromosome 19 clone CTD-2105E13, complete sequence
Length=134793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 94699 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 94650
>gb|AY891926.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH028792.01L ribosomal
protein L28 (RPL28) mRNA, partial cds
Length=414
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 59 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 10
>gb|AY889460.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH028795.01X ribosomal
protein L28 (RPL28) mRNA, complete cds
Length=414
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IMAGE:4561118), complete cds
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Sbjct 80 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 31
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mRNA
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L28 pseudogene (LOC101046910), misc_RNA
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(LOC100395462), misc_RNA
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mRNA
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mRNA
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Sbjct 163 CTCTTGATCAGGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 114
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(LOC101983055), mRNA
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(Rbm34), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 297 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGAACGACCATCCATTGCAGATG 248
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(Rbm34), transcript variant X2, mRNA
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(LOC100581895), misc_RNA
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Sbjct 104 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCGTTGCAGATG 55
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chromosome 5
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Sbjct 159 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCTCACGACCATCCATTGCAGATG 110
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Sbjct 163152 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCTCACGACCATCCATTGCAGATG 163201
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Sbjct 7454 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCTCACGACCATCCATTGCAGATG 7503
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mRNA
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Sbjct 45 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGC 1
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 101 CTCTTGATGAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCACTGCAGATG 52
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 220 CTCTTGATGAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCACTGCAGATG 171
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mRNA
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Sbjct 100 CTCTTGATGAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCACTGCAGATG 51
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mRNA
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Sbjct 159 TTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCACTGCAGATG 113
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(LOC103091415), misc_RNA
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Sbjct 79 CTCTTGATCAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 30
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mRNA
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Sbjct 95 CTCTTGATCAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 46
>ref|XM_005363964.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster 60S ribosomal protein L28-like
(LOC101989794), mRNA
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Sbjct 72 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGAACGGCCATCCATTGCAGATG 23
>ref|XM_005219718.1| PREDICTED: Bos taurus ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 568 CTCTTGATCAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 519
>ref|XM_005219717.1| PREDICTED: Bos taurus ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 198 CTCTTGATCAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 149
>ref|XM_005219716.1| PREDICTED: Bos taurus ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 568 CTCTTGATCAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 519
>ref|NM_001035503.2| Bos taurus ribosomal protein L28 (RPL28), mRNA
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Sbjct 101 CTCTTGATCAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
>gb|BC102344.1| Bos taurus ribosomal protein L28, mRNA (cDNA clone MGC:127438
IMAGE:7947058), complete cds
Length=523
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 102 CTCTTGATCAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 53
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L28 (RPL28), mRNA
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Sbjct 114 TTGATCAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 68
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variant X3, mRNA
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Sbjct 181 CTCTTGATTAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 132
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variant X2, mRNA
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 210 CTCTTGATTAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 161
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variant X1, mRNA
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Sbjct 173 CTCTTGATTAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 124
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 220 CTCTTGATTAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 171
>ref|XM_006039576.1| PREDICTED: Bubalus bubalis 60S ribosomal protein L28-like (LOC102389113),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 186 CTCTTGATTAAGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 137
>ref|XM_007103238.1| PREDICTED: Physeter catodon ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 134 CTCTTGATCAAGAAGCTAGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 85
>ref|XM_007103237.1| PREDICTED: Physeter catodon ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X1, mRNA
Length=519
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 112 CTCTTGATCAAGAAGCTAGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 63
>ref|XM_007080623.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica ribosomal protein L28 (RPL28),
mRNA
Length=511
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAG 47
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Sbjct 111 CTCTTAATCAGGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAG 65
>ref|XM_003997396.2| PREDICTED: Felis catus ribosomal protein L28 (RPL28), mRNA
Length=543
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAG 47
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Sbjct 143 CTCTTAATCAGGAAGCTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAG 97
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Length=502
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
|||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 101 CTCTTGATCAAGAAGCTAGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
>ref|XM_006211785.1| PREDICTED: Vicugna pacos 60S ribosomal protein L28-like (LOC102541404),
mRNA
Length=450
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 95 CTCTTGATCAAGAAGCTAGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 46
>ref|XM_006187024.1| PREDICTED: Camelus ferus ribosomal protein L28 (RPL28), mRNA
Length=496
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 50
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Sbjct 101 CTCTTGATCAAGAAGCTAGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAGATG 52
>ref|XM_005370581.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster 60S ribosomal protein L28-like
(LOC101993308), mRNA
Length=454
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Query 1 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGCACGACCATCCATTGCAG 47
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 59 CTCTTGATCAGGAAACTGGAGCAGTTCCGAAAGACCATCCATTGCAG 13
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CGCAAGAACAAGTACCGCCCCGACCTGCGCATGGTGAGCTGGGGTTTGGG
>ref|XM_009436422.1| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein L28 (RPL28), transcript
variant X1, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 17448857 TGCATCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACAATGTCACTTTCACGAG 17448906
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Sbjct 17371482 TGCATCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACAATGTCACTTTCACGAG 17371531
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Lambda K H
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genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 38449502 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 38449551
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Sbjct 38550313 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 38550362
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HSCHR12_CTG2_1
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGT 41
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Sbjct 126342656 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGT 126342616
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGT 41
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Sbjct 117989106 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGT 117989066
>gb|CH471054.1| Homo sapiens 211000035840223 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGT 41
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Sbjct 67893903 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGT 67893863
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HuRef SCAF_1103279188105, whole genome shotgun sequence
gb|DS486080.1| Homo sapiens SCAF_1103279188105 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 9310412 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGT 9310372
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000473.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 117645506 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGT 117645466
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Length=133516800
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Sbjct 120270074 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGT 120270034
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG
>ref|XR_745419.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis 60S acidic ribosomal
protein P0 pseudogene (LOC101030327), misc_RNA
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Sbjct 78 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 29
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large, P0 (RPLP0), mRNA
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Sbjct 103 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 54
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P0 pseudogene (LOC104654804), misc_RNA
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Sbjct 87 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 38
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P0 pseudogene (LOC104662201), misc_RNA
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 16
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 163 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 114
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(LOC744940), mRNA
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Sbjct 79 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 30
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 72 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 23
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(LOC103877452), misc_RNA
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Sbjct 1031 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 982
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mRNA
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Sbjct 164 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 115
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(LOC103875584), mRNA
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Sbjct 62 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 13
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 163 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 114
>ref|XM_008970909.1| PREDICTED: Pan paniscus 60S acidic ribosomal protein P0-like
(LOC103785954), mRNA
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Sbjct 63 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 14
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(LOC100980640), misc_RNA
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Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 75 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 26
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pseudogene (LOC100391854), misc_RNA
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Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 59 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 10
>ref|XM_008004922.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1203
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Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 164 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 115
>ref|XM_003279963.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P0,
transcript variant 2 (RPLP0), mRNA
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Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 169 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 120
>ref|XR_178617.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P0 pseudogene
(LOC100596877), misc_RNA
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Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 84 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 35
>ref|XM_004053992.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein, large,
P0, transcript variant 3 (RPLP0), mRNA
Length=1018
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Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 168 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 119
>ref|XM_004053990.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein, large,
P0, transcript variant 1 (RPLP0), mRNA
Length=1217
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 168 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 119
>ref|NG_009952.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0 pseudogene 6 (RPLP0P6)
on chromosome 2
Length=1301
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 168 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 119
>ref|XM_003279962.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P0,
transcript variant 1 (RPLP0), mRNA
Length=1218
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 169 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 120
>dbj|AK304674.1| Homo sapiens cDNA FLJ51469 complete cds, highly similar to 60S
acidic ribosomal protein P0
Length=940
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 16
>dbj|AK291109.1| Homo sapiens cDNA FLJ75549 complete cds, highly similar to Homo
sapiens ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcript
variant 1, mRNA
Length=1095
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 67 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 18
>ref|NM_001283935.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101926257 (LOC101926257),
mRNA
dbj|AB170149.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10454, similar to
human ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcriptvariant
1, mRNA, RefSeq: NM_001002.2
Length=1066
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 68 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 19
>gb|BC071877.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5087581, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2735
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 1069 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 1118
>gb|BC033190.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone IMAGE:4622715),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=2238
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 1186 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 1137
>gb|BC070194.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:88175
IMAGE:6457312), complete cds
Length=932
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 63 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 14
>gb|BC000087.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:3280
IMAGE:3507437), complete cds
Length=1100
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 53 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 4
>dbj|AK222571.1| Homo sapiens mRNA for ribosomal protein P0 variant, clone: CAS03712
Length=1080
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 16
>dbj|AK222468.1| Homo sapiens mRNA for ribosomal protein P0 variant, clone: adKA01530
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 67 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 18
>gb|AY064377.1| Homo sapiens BLOCK 23 gene, complete cds
Length=1502
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 253 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 204
>dbj|AK129823.1| Homo sapiens cDNA FLJ26313 fis, clone DMC08902, highly similar
to 60S acidic ribosomal protein P0
Length=1104
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 68 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 19
>dbj|AK129754.1| Homo sapiens cDNA FLJ26243 fis, clone DMC00801, highly similar
to 60S acidic ribosomal protein P0
Length=1093
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 16
>gb|AC011247.10| Homo sapiens BAC clone RP11-541E12 from 2, complete sequence
Length=208655
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 39314 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 39265
>dbj|D28418.1|HUMRPP77 Homo sapiens mRNA for ribosomal phosphoprotein P0, 5'UTR region
Length=79
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 16
>gb|BC107717.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:111226
IMAGE:6736210), complete cds
Length=940
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 69 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 20
>ref|NM_001002.3| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcript
variant 1, mRNA
Length=1229
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 120
>ref|XM_010368283.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ribosomal protein, large,
P0 (RPLP0), mRNA
Length=1107
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 69 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTACCACGAG 20
>ref|XR_653099.1| PREDICTED: Pongo abelii 60S acidic ribosomal protein P0 pseudogene
(LOC100440667), misc_RNA
Length=1108
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 88 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGATGATGTCACTTCCACGAG 39
>ref|XR_642721.1| PREDICTED: Papio anubis 60S acidic ribosomal protein P0 pseudogene
(LOC101006894), misc_RNA
Length=863
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 78 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCTACGAG 29
>ref|XM_002753073.3| PREDICTED: Callithrix jacchus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1200
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 165 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGCTGTCACTTCCACGAG 116
>ref|XR_435988.1| PREDICTED: Myotis davidii 60S acidic ribosomal protein P0-like
(LOC102770790), misc_RNA
Length=850
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 59 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCCCACGAG 10
>ref|XM_006096553.1| PREDICTED: Myotis lucifugus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X2, mRNA
Length=899
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 60 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCCCACGAG 11
>ref|XM_006096552.1| PREDICTED: Myotis lucifugus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X1, mRNA
Length=1190
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 165 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCCCACGAG 116
>ref|XM_006081981.1| PREDICTED: Myotis lucifugus 60S acidic ribosomal protein P0-like
(LOC102431718), mRNA
Length=973
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 59 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCCCACGAG 10
>ref|XM_005636025.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris ribosomal protein, large, P0
(RPLP0), transcript variant X1, mRNA
Length=1183
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 150 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCCCACGAG 101
>ref|XR_175794.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein, large,
P0 pseudogene (LOC101133218), misc_RNA
Length=1376
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 TGCGTCACGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 35
>ref|XR_012192.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S acidic ribosomal protein P0-like
(LOC705501), miscRNA
Length=1086
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCATGAG 16
>ref|XR_014620.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S acidic ribosomal protein P0-like
(LOC718979), miscRNA
Length=1130
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 78 GTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 32
>gb|AC200148.4| Pongo abelii BAC clone CH276-525G20 from chromosome 19, complete
sequence
Length=218720
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 216329 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGATGATGTCACTTCCACGAG 216280
>gb|AC190416.1| Rhesus macaque BAC clone CH250-1H12 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=170052
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 149156 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGATGATGTCACTTCCACGAG 149205
>gb|BC071911.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6569344, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1514
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCAC 47
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Sbjct 468 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCAC 422
>gb|BC015690.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:23431
IMAGE:4660892), complete cds
Length=1112
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCAC 47
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Sbjct 55 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCAC 9
>gb|BC009867.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:16401
IMAGE:3940316), complete cds
Length=1094
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCAC 47
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Sbjct 47 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCAC 1
>ref|XM_005863772.1| PREDICTED: Myotis brandtii ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1122
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 90 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT-CCACGAG 42
>gb|BC008092.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:9343
IMAGE:3458803), complete cds
Length=1089
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCC 45
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Sbjct 45 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCC 1
>ref|XM_003419262.2| PREDICTED: Loxodonta africana ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1183
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 151 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 102
>ref|XM_010604063.1| PREDICTED: Fukomys damarensis ribosomal protein, large, P0 (Rplp0),
mRNA
Length=1153
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 117 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 68
>ref|XR_096394.3| PREDICTED: Pongo abelii 60S acidic ribosomal protein P0-like
(LOC100434403), misc_RNA
Length=1019
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 59 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAAATGATGTCACTTCCACGAG 10
>ref|XR_163370.2| PREDICTED: Papio anubis 60S acidic ribosomal protein P0 pseudogene
(LOC101011545), misc_RNA
Length=1141
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 131 TGCATCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCATGAG 82
>ref|XM_008507282.1| PREDICTED: Equus przewalskii ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1122
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 88 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 39
>ref|XM_008069297.1| PREDICTED: Tarsius syrichta ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1128
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 95 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 46
>ref|XR_503889.1| PREDICTED: Tarsius syrichta 60S acidic ribosomal protein P0 pseudogene
(LOC103253582), misc_RNA
Length=439
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 76 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 27
>ref|XM_006052971.1| PREDICTED: Bubalus bubalis ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1122
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 87 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 38
>ref|XM_003994717.2| PREDICTED: Felis catus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1116
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 81 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 32
>ref|XM_006745305.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii ribosomal protein, large,
P0 (RPLP0), mRNA
Length=1198
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 166 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 117
>ref|XM_006770295.1| PREDICTED: Myotis davidii ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1096
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 71 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGATGATGTCACTCCCACGAG 22
>ref|XM_006151539.1| PREDICTED: Tupaia chinensis ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X2, mRNA
Length=1130
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 83 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 34
>ref|XM_006151538.1| PREDICTED: Tupaia chinensis ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X1, mRNA
Length=1220
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 83 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 34
>ref|XM_006204803.1| PREDICTED: Vicugna pacos ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1091
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 16
>ref|XM_006192694.1| PREDICTED: Camelus ferus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X2, mRNA
Length=920
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 16
>ref|XM_006192693.1| PREDICTED: Camelus ferus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X1, mRNA
Length=1209
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 168 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 119
>ref|XR_319163.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii 60S acidic ribosomal protein
P0-like (LOC102340011), misc_RNA
Length=1133
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 66 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 17
>ref|XM_005961974.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ribosomal protein, large, P0
(RPLP0), transcript variant X2, mRNA
Length=918
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 70 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 21
>ref|XM_005961973.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii ribosomal protein, large, P0
(RPLP0), transcript variant X1, mRNA
Length=1186
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 152 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 103
>ref|XM_005891476.1| PREDICTED: Bos mutus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcript
variant X2, mRNA
Length=908
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 16
>ref|XM_005891475.1| PREDICTED: Bos mutus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcript
variant X1, mRNA
Length=1181
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 151 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 102
>ref|XM_005709526.1| PREDICTED: Capra hircus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1117
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 93 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 44
>ref|XM_005396518.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera ribosomal protein, large, P0 (Rplp0),
mRNA
Length=1181
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 150 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 101
>ref|XR_258343.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster 60S acidic ribosomal protein
P0-like (LOC101979271), misc_RNA
Length=1097
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 59 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCCAACGAG 10
>ref|XM_005344320.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster ribosomal protein, large, P0
(Rplp0), mRNA
Length=1201
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 165 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCCAACGAG 116
>ref|XM_003478381.2| PREDICTED: Cavia porcellus ribosomal protein, large, P0 (Rplp0),
mRNA
Length=1107
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 74 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 25
>ref|XM_004888153.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber ribosomal protein, large, P0
(Rplp0), mRNA
ref|XM_004843681.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber ribosomal protein, large, P0
(Rplp0), mRNA
Length=1131
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 100 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 51
>ref|XM_004798359.1| PREDICTED: Mustela putorius furo ribosomal protein, large, P0
(RPLP0), transcript variant X2, mRNA
Length=1129
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 93 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 44
>ref|XM_004464672.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus ribosomal protein, large, P0
(RPLP0), mRNA
Length=938
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 105 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 56
>ref|XM_004429920.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum ribosomal protein, large,
P0, transcript variant 2 (RPLP0), mRNA
Length=1089
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 69 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 20
>ref|XM_004429919.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum ribosomal protein, large,
P0, transcript variant 1 (RPLP0), mRNA
Length=1186
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Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 166 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 117
>ref|XM_004396673.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens ribosomal protein, large,
P0 (RPLP0), mRNA
Length=1109
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 77 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 28
>ref|XM_004379022.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris ribosomal protein,
large, P0, transcript variant 1 (RPLP0), mRNA
Length=1189
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 152 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 103
>ref|XR_121779.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P0 pseudogene
(LOC100599701), misc_RNA
Length=1118
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Strand=Plus/Minus
Query 4 GTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 66 GTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGATGATGTCACTTCCACGAG 20
>ref|XR_121589.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P0 pseudogene
(LOC100595617), misc_RNA
Length=1100
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 88 TGCGTCAGGGATTGCCGTGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 39
>dbj|AK398383.1| Sus scrofa mRNA, clone: THY010041C07, expressed in thymus
Length=1112
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 16
>dbj|AK394469.1| Sus scrofa mRNA, clone: MLN010048G01, expressed in mesenteric
lymph node
Length=1111
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 16
>dbj|AK399331.1| Sus scrofa mRNA, clone: TCH010050C06, expressed in trachea
Length=1123
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 67 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 18
>dbj|AK401004.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010077A05, expressed in testis
Length=1129
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 67 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 18
>dbj|AK400997.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010065F05, expressed in testis
Length=1113
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 16
>dbj|AK400933.1| Sus scrofa mRNA, clone: SKNB10070D11, expressed in skin
Length=1127
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 67 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 18
>dbj|AK393869.1| Sus scrofa mRNA, clone: LNG010064C12, expressed in lung
Length=1138
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 67 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 18
>dbj|AK393867.1| Sus scrofa mRNA, clone: LNG010064A04, expressed in lung
Length=880
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 201 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 152
>dbj|AK399013.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVR010041D07, expressed in ovary
Length=1119
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 16
>dbj|AK395674.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVRT10045H08, expressed in ovary
Length=1279
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 190 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 141
>dbj|AK398853.1| Sus scrofa mRNA, clone: ITT010058F03, expressed in intestine
Length=1122
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 67 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 18
>dbj|AK395376.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVRM10214B10, expressed in ovary
Length=1335
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 283 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 234
>dbj|AK393088.1| Sus scrofa mRNA, clone: ITT010098C11, expressed in intestine
Length=1290
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 232 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 183
>dbj|AK394975.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVR010082G07, expressed in ovary
Length=1125
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 16
>dbj|AK400321.1| Sus scrofa mRNA, clone: CLNT10004H11, expressed in colon
Length=1143
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 69 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 20
>ref|NM_001252576.1| Equus caballus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), mRNA
Length=1112
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 16
>ref|XM_002929970.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca 60S acidic ribosomal protein
P0-like (LOC100473228), mRNA
Length=1102
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 16
>dbj|AK347722.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010082B07, expressed in ovary
Length=1122
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 67 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 18
>gb|BC151695.1| Bos taurus ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:179358
IMAGE:8452393), complete cds
Length=1128
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 64 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 15
>ref|NM_001098598.1| Sus scrofa ribosomal phosphoprotein large PO subunit (LOC100049695),
mRNA
gb|DQ316319.1| Sus scrofa ribosomal phosphoprotein large PO subunit mRNA, complete
cds
Length=1148
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 88 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 39
>dbj|AK239428.1| Sus scrofa mRNA, clone:THY010103A05, expressed in thymus
Length=1171
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 16
>dbj|AK231505.1| Sus scrofa mRNA, clone:ITT010083C10, expressed in intestine
Length=1119
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 69 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 20
>dbj|AK234557.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010084G10, expressed in ovary
Length=1120
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 16
>dbj|AK234485.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010070H08, expressed in ovary
Length=1228
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 169 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 120
>ref|NM_001012682.1| Bos taurus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), mRNA
gb|BT021080.1| Bos taurus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), mRNA, complete
cds
Length=1084
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 52 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 3
>gb|BC102074.1| Bos taurus ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:127090
IMAGE:7942990), complete cds
Length=1114
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 66 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 17
>dbj|AB098998.1| Bos taurus mRNA for similar to acidic ribosomal phosphoprotein
PO, partial cds, clone: ORCS11784
Length=574
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 62 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 13
>ref|XM_003952316.2| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X2, mRNA
Length=1259
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 223 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 182
>ref|XM_008957785.1| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X2, mRNA
Length=1259
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 223 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 182
>ref|XM_008707681.1| PREDICTED: Ursus maritimus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1101
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 24
>ref|XR_505080.1| PREDICTED: Tarsius syrichta 60S acidic ribosomal protein P0 pseudogene
(LOC103271872), misc_RNA
Length=1076
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 56 CGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCACACGAG 9
>ref|XM_007622605.1| PREDICTED: Cricetulus griseus ribosomal protein, large, P0 (Rplp0),
transcript variant X3, mRNA
Length=1156
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 119 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 78
>ref|XM_007642837.1| PREDICTED: Cricetulus griseus 60S acidic ribosomal protein P0-like
(LOC100769096), mRNA
Length=832
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 44 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 3
>ref|XM_007448178.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X3, mRNA
Length=891
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 42 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 1
>ref|XM_007448177.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X2, mRNA
Length=1104
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 27
>ref|XM_007448176.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X1, mRNA
Length=1119
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 83 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
>ref|XR_452515.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni ribosomal protein,
large, P0 pseudogene (LOC102997507), misc_RNA
Length=961
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 47 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 6
>ref|XM_007129998.1| PREDICTED: Physeter catodon ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X2, mRNA
Length=1242
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 200 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 159
>ref|XM_007129997.1| PREDICTED: Physeter catodon ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X1, mRNA
Length=1118
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 76 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 35
>ref|XM_007093544.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica ribosomal protein, large,
P0 (RPLP0), mRNA
Length=1100
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 70 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 29
>ref|XR_257649.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus ribosomal protein, large,
P0 pseudogene (LOC101966657), misc_RNA
Length=1024
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 48 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 7
>ref|XM_004798358.1| PREDICTED: Mustela putorius furo ribosomal protein, large, P0
(RPLP0), transcript variant X1, mRNA
Length=1108
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 72 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 31
>ref|XM_004664138.1| PREDICTED: Jaculus jaculus ribosomal protein, large, P0 (Rplp0),
mRNA
Length=1104
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 76 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 35
>ref|XM_004379023.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris ribosomal protein,
large, P0, transcript variant 2 (RPLP0), mRNA
Length=1262
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 232 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 191
>ref|XM_004315938.1| PREDICTED: Tursiops truncatus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1194
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 152 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 111
>ref|XM_004281429.1| PREDICTED: Orcinus orca ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1186
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 147 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 106
>ref|XM_004089450.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1278
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 229 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 188
>ref|XM_004053991.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein, large,
P0, transcript variant 2 (RPLP0), mRNA
Length=1277
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 228 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 187
>ref|XM_004017413.1| PREDICTED: Ovis aries ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), mRNA
Length=1113
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 83 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
>ref|NG_030479.2| Canis lupus familiaris ribosomal protein, large, P0 pseudogene
(RPLP0P) on chromosome 35
Length=1269
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 1/46 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCA 46
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Sbjct 140 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT-CCA 96
>gb|AC193264.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-289J19 from chromosome 12, complete
sequence
Length=195004
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 80743 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 80784
>gb|BC003075.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3506537, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3473
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 2765 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 2806
>gb|BC021049.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3505381, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2567
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 1520 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 1479
>gb|BC003655.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:4770
IMAGE:3541947), complete cds
Length=1145
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 99 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 58
>dbj|AK001313.1| Homo sapiens cDNA FLJ10451 fis, clone NT2RP1000959, highly similar
to Human acidic ribosomal phosphoprotein P0 mRNA
Length=2593
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 321 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 280
>ref|NM_053275.3| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcript
variant 2, mRNA
Length=1289
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 229 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 188
>gb|BC019014.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone IMAGE:4583368)
Length=1170
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 110 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 69
>dbj|AB099058.1| Bos taurus mRNA for similar to acidic ribosomal phosphoprotein
PO, partial cds, clone: ORCS13112
Length=616
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 47 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 6
>gb|AC004263.1| Homo sapiens PAC clone 278C19 from 12q, complete sequence
Length=106921
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 42
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Sbjct 8511 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACT 8552
>ref|XM_007938215.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer ribosomal protein, large, P0
(RPLP0), transcript variant X2, mRNA
Length=910
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATACCACTCCCACGAG 16
>ref|XM_007938214.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer ribosomal protein, large, P0
(RPLP0), transcript variant X1, mRNA
Length=1096
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 65 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATACCACTCCCACGAG 16
>ref|XM_007528580.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X3, mRNA
Length=895
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 64 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGGAGTCACTCCCACGAG 15
>ref|XM_007528574.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X2, mRNA
Length=937
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 64 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGGAGTCACTCCCACGAG 15
>ref|XM_007528566.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X1, mRNA
Length=1193
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 165 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGGAGTCACTCCCACGAG 116
>tpe|HG506917.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000418442.1 (RP11-133K1.6
gene), lincRNA
Length=4020
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 684 TGCATCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACAATGTCACTTTCACGAG 733
>ref|XM_005336817.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus ribosomal protein, large,
P0 (Rplp0), mRNA
Length=1172
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 150 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGGTGTCACTCTCACGAG 101
>ref|XM_004406908.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens 60S acidic ribosomal protein
P0-like (LOC101374232), mRNA
Length=772
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 71 GTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTCTCACGAG 25
>ref|NG_010925.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0 pseudogene 10 (RPLP0P10)
on chromosome 15
Length=1279
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 165 TGCATCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACAATGTCACTTTCACGAG 116
>gb|BC001764.1| Homo sapiens Tax1 (human T-cell leukemia virus type I) binding
protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3352710), **** WARNING:
chimeric clone ****
Length=4833
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCAC 41
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Sbjct 3379 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCAC 3419
>gb|AC020658.6|AC020658 Homo sapiens chromosome 15 clone RP11-133K1 map 15q14, complete
sequence
Length=159007
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 151673 TGCATCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACAATGTCACTTTCACGAG 151722
>gb|BC000752.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:2461
IMAGE:2964581), complete cds
gb|BC001834.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:4141
IMAGE:2964581), complete cds
Length=1095
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCAC 41
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Sbjct 41 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCAC 1
>gb|BC005863.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:3679
IMAGE:2960918), complete cds
gb|BC000345.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:8574
IMAGE:2960918), complete cds
Length=1094
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCAC 41
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Sbjct 41 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCAC 1
>emb|BX537873.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp313N076 (from clone DKFZp313N076)
Length=4040
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 684 TGCATCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACAATGTCACTTTCACGAG 733
>dbj|AB098956.1| Bos taurus mRNA for similar to acidic ribosomal phosphoprotein
PO, partial cds, clone: ORCS10948
Length=487
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 48/51 (94%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGAC-GATGTCACTTCCACGAG 50
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Sbjct 51 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACAGATGTCACTCACACGAG 1
>gb|BC015173.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:10138
IMAGE:3903073), complete cds
Length=1055
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCAC 41
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCAC 1
>gb|M17885.1|HUMPPARP0 Human acidic ribosomal phosphoprotein P0 mRNA, complete cds
Length=1097
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 48/51 (94%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCA-GGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 50
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69 TGCGTCAGGGATTGCCACGAGGGGGTTTAAAGACGATGTCACTTCCACGAG 19
>ref|XM_007645191.1| PREDICTED: Cricetulus griseus ribosomal protein, large, P0 (Rplp0),
transcript variant X2, mRNA
Length=1032
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCA 40
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCA 1
>ref|XM_003495915.2| PREDICTED: Cricetulus griseus ribosomal protein, large, P0 (Rplp0),
transcript variant X1, mRNA
Length=1092
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCA 40
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCA 1
>ref|NM_001252137.1| Canis lupus familiaris ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1069
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCA 40
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCA 1
>ref|NM_001195428.1| Macaca mulatta ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), mRNA
Length=1090
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCA 40
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 TGCGTCAGGGATTGCCACGCAGGGTTTAAAGACGATGTCA 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC
>ref|XR_746897.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S acidic ribosomal protein
P0 pseudogene (LOC104654804), misc_RNA
Length=1136
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 424
>ref|XM_010368283.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ribosomal protein, large,
P0 (RPLP0), mRNA
Length=1107
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 406
>ref|XR_747953.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S acidic ribosomal protein
P0 pseudogene (LOC104662201), misc_RNA
Length=1101
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 353 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 402
>ref|XM_003952316.2| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X2, mRNA
Length=1259
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 511 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 560
>ref|XM_509423.4| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 451 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 500
>ref|XR_653099.1| PREDICTED: Pongo abelii 60S acidic ribosomal protein P0 pseudogene
(LOC100440667), misc_RNA
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 376 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 425
>ref|XM_002823848.3| PREDICTED: Pongo abelii ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 360 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 409
>ref|XM_009248306.1| PREDICTED: Pongo abelii ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 241 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 290
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(LOC100449653), misc_RNA
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Sbjct 350 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 399
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(LOC101006894), misc_RNA
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Sbjct 366 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 415
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mRNA
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Sbjct 452 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 501
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(LOC103875584), mRNA
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 350 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 399
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 511 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 560
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transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 451 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 500
>ref|XR_611390.1| PREDICTED: Pan paniscus 60S acidic ribosomal protein P0 pseudogene
(LOC100980640), misc_RNA
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Sbjct 363 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 412
>gb|KJ905905.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15575 RPLP0
gene, encodes complete protein
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 345 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 394
>gb|KJ897493.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06887 RPLP0
gene, encodes complete protein
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 345 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 394
>gb|KJ892047.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01441 RPLP0
gene, encodes complete protein
Length=1083
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 345 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 394
>ref|XM_008004922.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
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Sbjct 452 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 501
>ref|XR_180101.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P0 pseudogene
(LOC100601575), misc_RNA
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 358 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 407
>ref|XM_003279963.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P0,
transcript variant 2 (RPLP0), mRNA
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 457 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 506
>ref|XM_004089450.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
mRNA
Length=1278
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 517 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 566
>ref|XR_121779.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P0 pseudogene
(LOC100599701), misc_RNA
Length=1118
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 357 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 406
>ref|XM_004053992.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein, large,
P0, transcript variant 3 (RPLP0), mRNA
Length=1018
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 456 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 505
>ref|XM_004053991.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein, large,
P0, transcript variant 2 (RPLP0), mRNA
Length=1277
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 516 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 565
>ref|XM_004053990.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein, large,
P0, transcript variant 1 (RPLP0), mRNA
Length=1217
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 456 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 505
>ref|NG_009952.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0 pseudogene 6 (RPLP0P6)
on chromosome 2
Length=1301
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 456 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 505
>ref|XM_003279962.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein, large, P0,
transcript variant 1 (RPLP0), mRNA
Length=1218
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 457 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 506
>ref|XM_001115939.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S acidic ribosomal protein P0-like
(LOC720470), partial mRNA
Length=881
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 324 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 373
>ref|XR_014620.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S acidic ribosomal protein P0-like
(LOC718979), miscRNA
Length=1130
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 369 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 418
>dbj|AB464171.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8219, Homo sapiens RPLP0
gene for ribosomal protein, large, P0, without stop codon,
in Flexi system
Length=968
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 289 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 338
>dbj|AK304674.1| Homo sapiens cDNA FLJ51469 complete cds, highly similar to 60S
acidic ribosomal protein P0
Length=940
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 200 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 249
>emb|CU678561.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017017
3' read RPLP0 mRNA
Length=1273
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 690 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 641
>emb|CU678560.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017017
5' read RPLP0 mRNA
Length=938
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 296 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 345
>emb|CU674565.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018879
3' read RPLP0 mRNA
Length=1196
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 690 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 641
>emb|CU674564.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018879
5' read RPLP0 mRNA
Length=1015
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 296 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 345
>dbj|AK291109.1| Homo sapiens cDNA FLJ75549 complete cds, highly similar to Homo
sapiens ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcript
variant 1, mRNA
Length=1095
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 404
>gb|AC200148.4| Pongo abelii BAC clone CH276-525G20 from chromosome 19, complete
sequence
Length=218720
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216617 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 216666
>gb|DQ894996.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009456; FLH180169.01L;
RZPDo839G12131D ribosomal protein, large, P0 (RPLP0)
gene, encodes complete protein
Length=994
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 351
>gb|DQ891813.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004443; FLH180173.01X; RZPDo839G12132D
ribosomal protein, large, P0 (RPLP0) gene, encodes
complete protein
Length=994
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 351
>gb|BC071911.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6569344, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1514
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 805
>gb|BC003075.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3506537, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3473
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2477 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 2428
>gb|BC071877.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5087581, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2735
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 732
>gb|BC033190.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone IMAGE:4622715),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=2238
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 1523
>gb|BC001764.1| Homo sapiens Tax1 (human T-cell leukemia virus type I) binding
protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3352710), **** WARNING:
chimeric clone ****
Length=4833
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3091 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 3042
>gb|BC021049.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3505381, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2567
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1808 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 1857
>gb|BC070194.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:88175
IMAGE:6457312), complete cds
Length=932
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 348 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 397
>gb|BC003655.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:4770
IMAGE:3541947), complete cds
Length=1145
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 387 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 436
>gb|BC000087.2| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:3280
IMAGE:3507437), complete cds
Length=1100
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 341 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 390
>gb|BC015690.1| Homo sapiens ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:23431
IMAGE:4660892), complete cds
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to 60S acidic ribosomal protein P0
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to 60S acidic ribosomal protein P0
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(LOC100595617), misc_RNA
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P0 (RPLP0) mRNA, partial cds
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Sbjct 290 GACCTCACTGAGATTAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 339
>ref|XM_005352075.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster 60S acidic ribosomal protein
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(Rplp0), mRNA
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Sbjct 453 GACCTCACTGAGATTAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 502
>ref|XR_175794.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein, large,
P0 pseudogene (LOC101133218), misc_RNA
Length=1376
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 372 GACCTCAGTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 421
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mRNA
dbj|AB170149.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10454, similar to
human ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcriptvariant
1, mRNA, RefSeq: NM_001002.2
Length=1066
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Query 4 CTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 359 CTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 405
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 371 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAACAAGGTTCCAGCTGC 420
>ref|XM_006151538.1| PREDICTED: Tupaia chinensis ribosomal protein, large, P0 (RPLP0),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 371 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAACAAGGTTCCAGCTGC 420
>ref|XM_006143293.1| PREDICTED: Tupaia chinensis 60S acidic ribosomal protein P0-like
(LOC102475312), mRNA
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 306 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAACACGGTTCCAGCTGC 355
>ref|XR_012192.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S acidic ribosomal protein P0-like
(LOC705501), miscRNA
Length=1086
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 50
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Sbjct 329 GACCTCACTGAGATCGGGTATATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCCAGCTGC 378
>gb|AC193264.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-289J19 from chromosome 12, complete
sequence
Length=195004
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>gb|AC004263.1| Homo sapiens PAC clone 278C19 from 12q, complete sequence
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Query 1 GACCTCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGT 41
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sequence
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Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC 50
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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HuRef SCAF_1103279188433, whole genome shotgun sequence
gb|DS486016.1| Homo sapiens SCAF_1103279188433 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC 50
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Sbjct 55125179 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC 55125130
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shotgun sequence
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Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC 50
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Sbjct 85028935 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC 85028886
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Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC 50
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Sbjct 84961721 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC 84961672
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shotgun sequence
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Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAA 48
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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right flanking sequence - CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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HSCHR2_CTG5
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assembly
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 68759912 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 68759961
>ref|NC_018913.2| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001610.2| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 85062922 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 85062971
>ref|NW_004929300.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150084.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=68452320
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 63955449 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 63955498
>gb|KE141320.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold277, whole genome
shotgun sequence
Length=6984217
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 2005309 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 2005260
>gb|CM000492.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808386
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 85029608 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 85029657
>gb|GL583198.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_218, whole genome
shotgun sequence
Length=3405282
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 1859921 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 1859872
>gb|DS990654.1| Homo sapiens SCAF_1112675837378 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=57109622
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 55125964 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 55126013
>gb|CH471053.2| Homo sapiens 211000035841913 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=86821413
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84893982 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 84894031
>ref|NW_001838769.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188433, whole genome shotgun sequence
gb|DS486016.1| Homo sapiens SCAF_1103279188433 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=57109151
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 55125505 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 55125554
>ref|AC_000134.1| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000463.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808360
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85029261 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 85029310
>gb|CM000253.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=236827137
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84962047 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 84962096
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Length=248653822
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88722885 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 88722838
>gb|CH003449.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234033217
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84874612 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 84874659
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC
>ref|NM_021103.3| Homo sapiens thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=482
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC 18
>gb|M92383.1|HUMTHYMB10 Homo sapiens thymosin beta-10 gene, 3'end
Length=1262
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGAAAC 217
>ref|NM_001132722.1| Pongo abelii thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
emb|CR859898.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469K1916 (from clone DKFZp469K1916)
Length=594
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 3
>emb|CR858855.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469E0218 (from clone DKFZp469E0218)
Length=536
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 3
>ref|XM_009184529.1| PREDICTED: Papio anubis thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=506
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 47
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 97 TCCGAGCCCGGGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 51
>ref|XM_007970038.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=510
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 47
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 97 TCCGAGCCCGGGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 51
>ref|XM_004642810.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=476
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 47
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 TCCGAGCCCGAGCTCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 14
>ref|XM_005586755.1| PREDICTED: Macaca fascicularis thymosin beta-10-like (LOC102141262),
mRNA
Length=276
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 47
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 TCCGAGCCCATGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 14
>ref|XM_001086739.2| PREDICTED: Macaca mulatta thymosin beta-10-like (LOC697702),
mRNA
Length=478
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 47
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 TCCGAGCCCATGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAGA 7
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG
>ref|XM_010383290.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana thymosin beta 10 (TMSB10),
mRNA
Length=554
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 231
>ref|XM_001165388.4| PREDICTED: Pan troglodytes thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=394
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 71
>ref|XM_009184529.1| PREDICTED: Papio anubis thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=506
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 188
>gb|KJ897976.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_07370 TMSB10
gene, encodes complete protein
Length=264
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 128
>gb|KJ892702.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_02096 TMSB10
gene, encodes complete protein
Length=264
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 128
>ref|XM_007970038.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=510
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 188
>ref|XM_005586755.1| PREDICTED: Macaca fascicularis thymosin beta-10-like (LOC102141262),
mRNA
Length=276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 151
>ref|XM_005575447.1| PREDICTED: Macaca fascicularis thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=581
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 262
>ref|NM_001193442.1| Macaca mulatta thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=460
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 141
>gb|EU832349.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067378; DKFZo008H0327
thymosin beta 10 protein (TMSB10) gene, encodes complete
protein
Length=178
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 36 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 85
>gb|EU831614.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100066643; DKFZo007C1119
thymosin beta 10 protein (TMSB10) gene, encodes complete
protein
Length=178
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 85
>gb|EU832434.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067463; DKFZo004H0328
thymosin beta 10 protein (TMSB10) gene, encodes complete
protein
Length=178
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 85
>gb|EU831701.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100066730; DKFZo003C1120
thymosin beta 10 protein (TMSB10) gene, encodes complete
protein
Length=178
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 85
>dbj|AK311952.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92220, Homo sapiens thymosin, beta 10 (TMSB10),
mRNA
Length=213
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 92 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 141
>gb|BC107889.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6651898
Length=535
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 96 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 145
>gb|BC016025.1| Homo sapiens thymosin beta 10, mRNA (cDNA clone MGC:10193 IMAGE:3909431),
complete cds
Length=511
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 74 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 123
>gb|BC016731.1| Homo sapiens thymosin beta 10, mRNA (cDNA clone MGC:24497 IMAGE:4095378),
complete cds
Length=500
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 96 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 145
>gb|BT007903.1| Synthetic construct Homo sapiens thymosin, beta 10 mRNA, partial
cds
Length=135
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 63
>gb|S54005.1| thymosin beta-10 [human, metastatic melanoma cell line, mRNA,
453 nt]
Length=453
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 79 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 128
>gb|DQ000522.1| Synthetic construct clone PSF:105402 thymosin gene, complete
cds
Length=207
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 86 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 135
>dbj|AK130949.1| Homo sapiens cDNA FLJ27439 fis, clone ADG99901, highly similar
to Homo sapiens thymosin, beta 10 (TMSB10)
Length=469
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 97 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 146
>gb|AC022210.8| Homo sapiens BAC clone RP11-617F9 from 2, complete sequence
Length=164846
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 21248 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 21297
>ref|NM_021103.3| Homo sapiens thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=482
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 158
>gb|AY891607.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH110731.01L thymosin
beta 10 (TMSB10) mRNA, partial cds
Length=135
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 63
>gb|AY891606.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH110730.01L thymosin
beta 10 (TMSB10) mRNA, partial cds
Length=135
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 63
>gb|AY453400.1| Homo sapiens migration-inducing protein 12 (MIG12) mRNA, complete
cds
Length=207
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 91
>gb|M92383.1|HUMTHYMB10 Homo sapiens thymosin beta-10 gene, 3'end
Length=1262
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 577 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 626
>gb|M20259.1|HUMTHYB10 Human thymosin beta-10 mRNA, complete cds
Length=439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 123
>gb|M92381.1|HUMTHMBX Human thymosin beta 10 mRNA, complete cds
Length=400
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 31 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 80
>ref|XM_004660532.1| PREDICTED: Jaculus jaculus thymosin beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=389
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 72
>ref|XM_008515964.1| PREDICTED: Equus przewalskii thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=536
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 212
>ref|XM_004805679.1| PREDICTED: Mustela putorius furo thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=492
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 164
>ref|XM_004742304.1| PREDICTED: Mustela putorius furo thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=493
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 165
>ref|XM_004437205.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum thymosin beta 10 (TMSB10),
mRNA
Length=472
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 152
>ref|XM_002922868.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca thymosin beta-10-like (LOC100481935),
mRNA
Length=455
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 80 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 127
>ref|NM_001081865.1| Equus caballus thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
gb|AF506973.1| Equus caballus thymosin beta 10 mRNA, complete cds
Length=465
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 113
>ref|XM_010329980.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis thymosin beta 10 (TMSB10),
mRNA
Length=489
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 CAGACATGGGAGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 167
>ref|XR_611437.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC100984437 (LOC100984437),
misc_RNA
Length=411
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAA-TCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 38 CAGACATGGGGGAAAGTCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 88
>ref|XM_006236692.2| PREDICTED: Rattus norvegicus thymosin, beta 10 (Tmsb10), transcript
variant X1, mRNA
Length=523
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 188
>ref|XM_002726952.4| PREDICTED: Rattus norvegicus thymosin, beta 10-like (LOC100364435),
mRNA
Length=203
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 96
>ref|XM_007101628.1| PREDICTED: Physeter catodon thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=403
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 29 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 78
>ref|XM_006986525.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii thymosin beta 10 (Tmsb10),
mRNA
Length=553
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 215
>ref|XM_006866589.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica thymosin beta 10 (TMSB10),
mRNA
Length=379
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 24 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAAGCCAAGCTGAAGAAAACG 73
>ref|XM_006736280.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii thymosin beta-10-like (LOC102728833),
mRNA
Length=135
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 62
>ref|XM_849812.3| PREDICTED: Canis lupus familiaris thymosin beta 10 (TMSB10),
mRNA
Length=465
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 88 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 137
>ref|XM_005385446.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera thymosin beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=495
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 114 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 163
>ref|XM_005335872.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus thymosin beta 10 (Tmsb10),
transcript variant X2, mRNA
Length=457
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 142
>ref|XM_005335871.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus thymosin beta 10 (Tmsb10),
transcript variant X1, mRNA
Length=469
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 154
>ref|XM_005355342.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster thymosin beta-10-like (LOC101979766),
partial mRNA
Length=188
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 61 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 110
>ref|XR_219863.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus uncharacterized LOC101826287
(LOC101826287), misc_RNA
Length=610
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 232 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 278
>ref|XM_004642810.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=476
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 103 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 152
>ref|XM_004640893.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta-10-like (LOC101573786),
mRNA
Length=181
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 25 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 74
>ref|XM_004638587.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta-10-like (LOC101589050),
mRNA
Length=414
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 44 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 93
>ref|XM_004637467.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta-10-like (LOC101573893),
mRNA
Length=184
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 46 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 95
>ref|XM_004632457.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta-10-like (LOC101588355),
mRNA
Length=201
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 14 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 63
>emb|FQ229048.1| Rattus norvegicus TL0ADA4YC18 mRNA sequence
Length=417
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 89 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 135
>emb|FQ229044.1| Rattus norvegicus TL0ADA4YD22 mRNA sequence
Length=490
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 90 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 136
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 89 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 135
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 89 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 135
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 91 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 137
>emb|FQ223015.1| Rattus norvegicus TL0ADA16YF14 mRNA sequence
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Sbjct 89 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 135
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mRNA
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Sbjct 247 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 293
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mRNA
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Sbjct 236 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 282
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mRNA
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Sbjct 175 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 221
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mRNA
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 94 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCAAAGCTGAAGAAAACG 143
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 91 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 137
>gb|BC145877.1| Mus musculus thymosin, beta 10, mRNA (cDNA clone MGC:175764 IMAGE:40131180),
complete cds
gb|BC145879.1| Mus musculus thymosin, beta 10, mRNA (cDNA clone MGC:175766 IMAGE:40131182),
complete cds
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 52 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 98
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 60 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 106
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 73 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 119
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 70 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 116
>gb|BC038926.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:4986146
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 93 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 139
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 79 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 125
>dbj|AK131711.1| Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:1700019O07 product:thymosin, beta 10, full
insert sequence
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 92 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 138
>dbj|AK161987.1| Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding
region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720414F23
product:thymosin, beta 10, full insert sequence
Length=476
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 92 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 138
>gb|BC099374.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:30934123
Length=486
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 74 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 120
>dbj|AK019232.1| Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:2700094D06 product:thymosin, beta
10, full insert sequence
Length=477
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 93 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 139
>dbj|AK019212.1| Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:2700055M20 product:thymosin, beta
10, full insert sequence
Length=476
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 92 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 138
>dbj|AK012361.1| Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:2700043G09 product:thymosin, beta
10, full insert sequence
Length=474
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 92 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 138
>dbj|AK008557.1| Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:2010309L16 product:thymosin, beta
10, full insert sequence
Length=476
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 92 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 138
>dbj|AK005512.1| Mus musculus adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:1600021K12 product:thymosin, beta 10,
full insert sequence
Length=475
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 138
>dbj|AK003178.1| Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:1100001I24 product:thymosin, beta 10,
full insert sequence
Length=482
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 138
>gb|BC094284.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:4983428
Length=508
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 65 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 111
>gb|AC153842.9| Mus musculus 6 BAC RP23-348K12 (Roswell Park Cancer Institute
(C57BL/6J Female) Mouse BAC Library) complete sequence
Length=174100
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 111780 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 111826
>gb|BC093587.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:4217456
Length=488
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
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Sbjct 77 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 123
>ref|NM_001132722.1| Pongo abelii thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
emb|CR859898.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469K1916 (from clone DKFZp469K1916)
Length=594
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 91 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAAGCCAAGCTGAAGAAAACG 140
>emb|CR858855.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469E0218 (from clone DKFZp469E0218)
Length=536
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 91 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAAGCCAAGCTGAAGAAAACG 140
>gb|BC048070.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:6479038
Length=523
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 71 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 117
>gb|BC092009.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:5684043
Length=487
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 80 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 126
>gb|BC089326.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:6407612
Length=489
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 97
>gb|BC089327.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:6411114
Length=495
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 31 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 77
>emb|Z48496.1| M.musculus mRNA for testis-specific thymosin beta-10
Length=553
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 170 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 216
>gb|M58405.1|RATTHYBB R.norvegicus thymosin beta-10 gene, complete cds
Length=446
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 118
>gb|M58404.1|RATTHYBA R.norvegicus thymosin beta-10 (testis-specific) gene, complete
cds
Length=539
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 211
>gb|M17698.1|RATTHYB10 Rat thymosin beta-10 mRNA, complete cds
Length=444
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 116
>ref|XR_396506.1| PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102639762 (LOC102639762),
transcript variant X3, ncRNA
ref|XR_384214.1| PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102639762 (LOC102639762),
transcript variant X3, ncRNA
Length=218
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 87 CAGACATGCGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 135
>ref|XR_396505.1| PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102639762 (LOC102639762),
transcript variant X2, ncRNA
ref|XR_384213.1| PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102639762 (LOC102639762),
transcript variant X2, ncRNA
Length=217
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 CAGACATGCGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 134
>ref|XR_396504.1| PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102639762 (LOC102639762),
transcript variant X1, ncRNA
ref|XR_384212.1| PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102639762 (LOC102639762),
transcript variant X1, ncRNA
Length=669
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455 CAGACATGCGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 503
>ref|XM_004658161.1| PREDICTED: Jaculus jaculus thymosin beta-10-like (LOC101617512),
mRNA
Length=450
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 87 CAGACATGGGAGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 135
>gb|BC100417.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:30916881
Length=851
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455 CAGACATGCGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 503
>emb|AL772386.4| Mouse DNA sequence from clone RP23-89G22 on chromosome 15, complete
sequence
Length=149807
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 54279 CAGACATGCGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 54327
>ref|XM_010599958.1| PREDICTED: Loxodonta africana thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=459
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 GACATGGGAGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 152
>ref|XR_504150.1| PREDICTED: Tarsius syrichta thymosin beta-10 pseudogene (LOC103257988),
misc_RNA
Length=486
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 97 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 144
>ref|XM_007470593.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=477
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 105 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 152
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10 (TMSB10), mRNA
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Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 54 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 101
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mRNA
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 48
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Sbjct 14 CAGACATGGGGGAAATTGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 61
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mRNA
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Query 6 ATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 96 ATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 140
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mRNA
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 48
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Sbjct 14 CAGACATGGGGGAAATTGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 61
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 26 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 73
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mRNA
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 48
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Sbjct 27 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGACAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 74
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 102 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 149
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mRNA
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 105 GACATGGGAGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 152
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mRNA
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 74 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 121
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Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 93 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 140
>ref|XM_002806293.1| PREDICTED: Macaca mulatta thymosin beta-10-like (LOC100425343),
mRNA
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Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 48
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Sbjct 62 CAGACATGGGGGAAATCCCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 109
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Length=515
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 143 CAGATATGGGAGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 192
>ref|XM_008840250.1| PREDICTED: Nannospalax galili thymosin beta 10 (Tmsb10), transcript
variant X2, mRNA
Length=521
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 134 GACATGGGAGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 180
>ref|XM_008840249.1| PREDICTED: Nannospalax galili thymosin beta 10 (Tmsb10), transcript
variant X1, mRNA
Length=518
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 131 GACATGGGAGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 177
>ref|XM_008155906.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=401
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
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Sbjct 29 CAGACATGGGGGAAGTCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 78
>ref|XM_007627323.1| PREDICTED: Cricetulus griseus thymosin beta-10 (LOC103161833),
transcript variant X2, mRNA
Length=254
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 94
>ref|XM_007627322.1| PREDICTED: Cricetulus griseus thymosin beta-10 (LOC103161833),
transcript variant X1, mRNA
Length=444
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Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 284
>ref|XM_007646137.1| PREDICTED: Cricetulus griseus thymosin beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=317
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 160
>ref|XM_006900380.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=376
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 69
>ref|XM_006878969.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii serine/arginine repetitive matrix
protein 3-like (LOC102865159), mRNA
Length=654
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 59
>ref|XM_006878963.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii thymosin beta-10-like (LOC102858657),
mRNA
Length=234
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 59
>ref|XM_006164767.1| PREDICTED: Tupaia chinensis thymosin beta-10-like (LOC102500685),
mRNA
Length=236
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 79 CAGACATGGGGGAAATTGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 128
>ref|XM_005372022.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster thymosin beta-10-like (LOC101991541),
mRNA
Length=449
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 54 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 97
>ref|XM_005368111.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster thymosin beta-10-like (LOC101984915),
mRNA
Length=491
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 128
>ref|XM_005364723.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster thymosin beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=550
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 212
>ref|NG_021482.1| Mus musculus predicted gene, 20570 (Gm20570) pseudogene on chromosome
18
Length=672
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 191 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGATGAAGAAAAC 237
>ref|NG_021481.1| Mus musculus predicted gene 3788 (Gm3788) pseudogene on chromosome
3
Length=677
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACAT-GGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 191 GACATGGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 238
>gb|AC133191.3| Mus musculus chromosome 18 clone RP23-390K15, complete sequence
Length=212060
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 160451 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGATGAAGAAAAC 160497
>gb|AC113528.8| Mus musculus chromosome 18, clone RP23-419F17, complete sequence
Length=217309
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 209711 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGATGAAGAAAAC 209757
>gb|AY325252.1| Rattus norvegicus Da1-6 mRNA, complete cds
Length=7134
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 GACATGGGGGAAATCACCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 320
>gb|AC158386.4| Mus musculus chromosome 3, clone RP24-281K23, complete sequence
Length=177594
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GACAT-GGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 135483 GACATGGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 135436
>gb|BC037153.1| Mus musculus thymosin, beta 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:2649813),
partial cds
Length=478
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 GACATGGGGGAAATCCCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 129
>gb|AC102164.7| Mus musculus chromosome 3, clone RP23-438M14, complete sequence
Length=184952
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACAT-GGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 151424 GACATGGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 151471
>gb|AF090913.1|AF090913 Homo sapiens clone HQ0290
Length=1402
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 CAGGCATGGTGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 1060
>ref|XM_006729072.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii thymosin beta-10-like (LOC102749022),
mRNA
Length=135
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 48
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 GACATGGGGGAAATCTCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 61
>ref|XM_002709679.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=510
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 139 GACATGGGGGAGATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 186
>ref|XM_008063441.1| PREDICTED: Tarsius syrichta thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=434
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 65 GACATGGGGGAGATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 112
>ref|XM_007948883.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=464
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 ATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 108 ATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAAAAAACG 152
>ref|XM_004704259.1| PREDICTED: Echinops telfairi thymosin beta-10-like (LOC101649176),
mRNA
Length=135
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 48
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 14 CAGACATGGGAGAAATTGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAA 61
>ref|XM_004431443.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum thymosin beta-10-like (LOC101406306),
mRNA
Length=494
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 113 GACACGGGGGAAATTGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 160
>ref|XM_004415424.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens thymosin beta 10 (TMSB10),
mRNA
Length=477
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104 GACATGGGGGAAGTTGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 151
>ref|XM_004413386.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens thymosin beta-10-like
(LOC101366342), mRNA
Length=478
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAA 47
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 GACATGGGGGAAATTGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAA 132
>ref|XM_004713857.1| PREDICTED: Echinops telfairi thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=135
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAACG 50
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 14 CAGACATGGGAGAAATTGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAGACG 63
>gb|AC173113.4| Mus musculus BAC clone RP23-120D6 from chromosome 3, complete
sequence
Length=172004
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26514 GACATGGGGTAAATCACCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 26468
>gb|AC135289.3| Mus musculus BAC clone RP23-279D12 from 3, complete sequence
Length=180967
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 49
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70145 GACATGGGGTAAATCACCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAAAAC 70191
>ref|XM_005372978.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera thymosin beta-10-like (LOC102006731),
mRNA
Length=769
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 44/46 (96%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 46
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 CAGACATGGAGGAAATCCCCAGCTTCGATAAGGCCAAGCTGAAGAA 415
>gb|AC188147.18| Canis familiaris chromosome 5, clone XX-293F17, complete sequence
Length=201489
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sequence
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Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
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Sbjct 63955127 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 63955078
>gb|KE141320.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold277, whole genome
shotgun sequence
Length=6984217
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
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Sbjct 2005631 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 2005680
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Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
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Sbjct 85029286 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 85029237
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shotgun sequence
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>gb|DS990654.1| Homo sapiens SCAF_1112675837378 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 55125642 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 55125593
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>gb|CH471053.2| Homo sapiens 211000035841913 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
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Sbjct 84893660 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 84893611
>ref|NW_001838769.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188433, whole genome shotgun sequence
gb|DS486016.1| Homo sapiens SCAF_1103279188433 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
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Sbjct 55125183 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 55125134
>ref|AC_000134.1| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000463.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
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Sbjct 85028939 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 85028890
>gb|CM000253.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=236827137
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Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
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Sbjct 84961725 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 84961676
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC
>ref|NC_000002.12| Homo sapiens chromosome 2, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000664.2| Homo sapiens chromosome 2, GRCh38 reference primary assembly
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 84906015 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 84906064
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HSCHR2_CTG5
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assembly
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 68759896 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 68759945
>ref|NC_018913.2| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001610.2| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=243205335
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 85062906 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 85062955
>ref|NW_004929300.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150084.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=68452320
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 63955433 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 63955482
>gb|KE141320.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold277, whole genome
shotgun sequence
Length=6984217
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 2005325 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 2005276
>gb|CM000492.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808386
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 85029592 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 85029641
>gb|GL583198.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_218, whole genome
shotgun sequence
Length=3405282
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 1859937 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 1859888
>gb|DS990654.1| Homo sapiens SCAF_1112675837378 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=57109622
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55125948 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 55125997
>gb|CH471053.2| Homo sapiens 211000035841913 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=86821413
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84893966 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 84894015
>ref|NW_001838769.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188433, whole genome shotgun sequence
gb|DS486016.1| Homo sapiens SCAF_1103279188433 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=57109151
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55125489 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 55125538
>ref|AC_000134.1| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000463.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808360
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85029245 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 85029294
>gb|CM000253.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=236827137
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84962031 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 84962080
>gb|CH003497.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=248653822
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAG-ACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88722904 AAAATGGCAGACAAACCAGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 88722854
>gb|CH003449.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234033217
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCA-GACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84874593 AAAATGGCAGACAAACCAGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 84874643
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG
>ref|NM_001132722.1| Pongo abelii thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
emb|CR859898.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469K1916 (from clone DKFZp469K1916)
Length=594
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 4
>emb|CR858855.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469E0218 (from clone DKFZp469E0218)
Length=536
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 4
>dbj|AK130949.1| Homo sapiens cDNA FLJ27439 fis, clone ADG99901, highly similar
to Homo sapiens thymosin, beta 10 (TMSB10)
Length=469
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 10
>gb|AC022210.8| Homo sapiens BAC clone RP11-617F9 from 2, complete sequence
Length=164846
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20926 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 20877
>ref|NM_021103.3| Homo sapiens thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=482
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 71 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 22
>gb|M92383.1|HUMTHYMB10 Homo sapiens thymosin beta-10 gene, 3'end
Length=1262
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 221
>dbj|D28363.1|HUMTB22 Homo sapiens mRNA for thymosin beta-10, 5'UTR region
Length=89
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 59 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCGCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 10
>ref|XM_009184529.1| PREDICTED: Papio anubis thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=506
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 GTTCCGAGCCCGGGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 52
>ref|XM_007970038.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=510
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 GTTCCGAGCCCGGGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 52
>ref|XM_004642810.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=476
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 TCGCTCCGAGCCCGAGCTCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 15
>ref|XM_005586755.1| PREDICTED: Macaca fascicularis thymosin beta-10-like (LOC102141262),
mRNA
Length=276
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62 GTTCCGAGCCCATGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 15
>ref|XM_001086739.2| PREDICTED: Macaca mulatta thymosin beta-10-like (LOC697702),
mRNA
Length=478
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 50
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 GTTCCGAGCCCATGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGCTGCAGCAAG 8
>gb|S54005.1| thymosin beta-10 [human, metastatic melanoma cell line, mRNA,
453 nt]
Length=453
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGC 41
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 TCGTTCCGAGCCCGAGATCCTGGTGCTCCCACTCGCGTTGC 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC
>ref|XM_010383290.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana thymosin beta 10 (TMSB10),
mRNA
Length=554
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 215
>ref|XM_009184529.1| PREDICTED: Papio anubis thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=506
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 172
>ref|XM_007970038.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=510
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 172
>ref|XM_005586755.1| PREDICTED: Macaca fascicularis thymosin beta-10-like (LOC102141262),
mRNA
Length=276
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 135
>ref|XM_005575447.1| PREDICTED: Macaca fascicularis thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=581
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 246
>ref|XM_004642810.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=476
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 87 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 136
>ref|XM_004640893.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta-10-like (LOC101573786),
mRNA
Length=181
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 9 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 58
>ref|XM_004638587.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta-10-like (LOC101589050),
mRNA
Length=414
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 28 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 77
>ref|XM_004637467.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta-10-like (LOC101573893),
mRNA
Length=184
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 30 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 79
>ref|XM_004660532.1| PREDICTED: Jaculus jaculus thymosin beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=389
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 8 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 57
>ref|NM_001193442.1| Macaca mulatta thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=460
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 76 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 125
>ref|XM_001086739.2| PREDICTED: Macaca mulatta thymosin beta-10-like (LOC697702),
mRNA
Length=478
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 78 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 127
>dbj|AK311952.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92220, Homo sapiens thymosin, beta 10 (TMSB10),
mRNA
Length=213
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 76 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 125
>gb|BC107889.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6651898
Length=535
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 80 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 129
>gb|BC016025.1| Homo sapiens thymosin beta 10, mRNA (cDNA clone MGC:10193 IMAGE:3909431),
complete cds
Length=511
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 58 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 107
>gb|BC016731.1| Homo sapiens thymosin beta 10, mRNA (cDNA clone MGC:24497 IMAGE:4095378),
complete cds
Length=500
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 80 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 129
>gb|S54005.1| thymosin beta-10 [human, metastatic melanoma cell line, mRNA,
453 nt]
Length=453
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 63 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 112
>dbj|AK130949.1| Homo sapiens cDNA FLJ27439 fis, clone ADG99901, highly similar
to Homo sapiens thymosin, beta 10 (TMSB10)
Length=469
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 81 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 130
>gb|AC022210.8| Homo sapiens BAC clone RP11-617F9 from 2, complete sequence
Length=164846
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 21232 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 21281
>ref|NM_021103.3| Homo sapiens thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=482
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 93 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 142
>gb|AY453400.1| Homo sapiens migration-inducing protein 12 (MIG12) mRNA, complete
cds
Length=207
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 26 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 75
>gb|M92383.1|HUMTHYMB10 Homo sapiens thymosin beta-10 gene, 3'end
Length=1262
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 561 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 610
>gb|M20259.1|HUMTHYB10 Human thymosin beta-10 mRNA, complete cds
Length=439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 58 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 107
>gb|M92381.1|HUMTHMBX Human thymosin beta 10 mRNA, complete cds
Length=400
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 15 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 64
>ref|XM_001165388.4| PREDICTED: Pan troglodytes thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=394
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 6 AAAATGGCAGACAACCCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 55
>ref|XR_611437.1| PREDICTED: Pan paniscus uncharacterized LOC100984437 (LOC100984437),
misc_RNA
Length=411
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAA-TCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 22 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAAGTCGCCAGCTTCGATAAGGC 72
>gb|KJ897976.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_07370 TMSB10
gene, encodes complete protein
Length=264
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 66 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 112
>gb|KJ892702.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_02096 TMSB10
gene, encodes complete protein
Length=264
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 66 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 112
>ref|XM_007101628.1| PREDICTED: Physeter catodon thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=403
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 13 AAAATGGCAGACAAGCCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 62
>ref|XM_006164767.1| PREDICTED: Tupaia chinensis thymosin beta-10-like (LOC102500685),
mRNA
Length=236
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 63 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATTGCCAGCTTCGATAAGGC 112
>ref|XM_005385446.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera thymosin beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=495
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 98 AAAATGGCAGACAAGCCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 147
>ref|XM_005355342.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster thymosin beta-10-like (LOC101979766),
partial mRNA
Length=188
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 45 AAAATGGCAGACAAGCCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 94
>ref|XM_004632457.1| PREDICTED: Octodon degus thymosin beta-10-like (LOC101588355),
mRNA
Length=201
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 1 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 47
>gb|EU832349.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067378; DKFZo008H0327
thymosin beta 10 protein (TMSB10) gene, encodes complete
protein
Length=178
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 23 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 69
>gb|EU831614.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100066643; DKFZo007C1119
thymosin beta 10 protein (TMSB10) gene, encodes complete
protein
Length=178
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 23 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 69
>gb|EU832434.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067463; DKFZo004H0328
thymosin beta 10 protein (TMSB10) gene, encodes complete
protein
Length=178
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 23 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 69
>gb|EU831701.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100066730; DKFZo003C1120
thymosin beta 10 protein (TMSB10) gene, encodes complete
protein
Length=178
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 23 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 69
>gb|BT007903.1| Synthetic construct Homo sapiens thymosin, beta 10 mRNA, partial
cds
Length=135
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 1 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 47
>ref|NM_001132722.1| Pongo abelii thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
emb|CR859898.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469K1916 (from clone DKFZp469K1916)
Length=594
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAA 47
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Sbjct 75 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAA 121
>emb|CR858855.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469E0218 (from clone DKFZp469E0218)
Length=536
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAA 47
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Sbjct 75 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAA 121
>gb|AY891607.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH110731.01L thymosin
beta 10 (TMSB10) mRNA, partial cds
Length=135
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 1 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 47
>gb|AY891606.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH110730.01L thymosin
beta 10 (TMSB10) mRNA, partial cds
Length=135
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 1 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 47
>ref|XM_006236692.2| PREDICTED: Rattus norvegicus thymosin, beta 10 (Tmsb10), transcript
variant X1, mRNA
Length=523
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 124 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 173
>ref|XM_002726952.4| PREDICTED: Rattus norvegicus thymosin, beta 10-like (LOC100364435),
mRNA
Length=203
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 81
>ref|XM_008515964.1| PREDICTED: Equus przewalskii thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=536
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 AAAATGGCAGACAAGCCTGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 196
>ref|XR_504150.1| PREDICTED: Tarsius syrichta thymosin beta-10 pseudogene (LOC103257988),
misc_RNA
Length=486
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 128
>ref|XM_007627323.1| PREDICTED: Cricetulus griseus thymosin beta-10 (LOC103161833),
transcript variant X2, mRNA
Length=254
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 33 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 82
>ref|XM_007627322.1| PREDICTED: Cricetulus griseus thymosin beta-10 (LOC103161833),
transcript variant X1, mRNA
Length=444
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 272
>ref|XM_007646137.1| PREDICTED: Cricetulus griseus thymosin beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=317
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 148
>ref|XM_007470593.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
Length=477
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 87 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 136
>ref|XM_007175368.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni thymosin beta
10 (TMSB10), mRNA
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Sbjct 36 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 85
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mRNA
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Sbjct 151 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 200
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mRNA
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Sbjct 8 AAAATGGCAGACAAGCCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAA 54
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Sbjct 8 AAAATGGCAGACAAGCCTGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 57
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Sbjct 8 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 57
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mRNA
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Sbjct 75 ATGGCAGACAAGCCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 121
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mRNA
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Sbjct 11 AAAATGGCAGACAAGCCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGACAAGGC 60
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 78 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 127
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 90 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 139
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mRNA
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Sbjct 36 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 85
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Sbjct 151 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 200
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(LOC101826287), misc_RNA
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Sbjct 214 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 263
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Sbjct 99 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 148
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Sbjct 100 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 149
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Sbjct 84 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 133
>ref|XM_004653628.1| PREDICTED: Jaculus jaculus thymosin beta-10-like (LOC101607710),
mRNA
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Sbjct 1 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCCATAAGGC 47
>ref|XM_004437205.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum thymosin beta 10 (TMSB10),
mRNA
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Sbjct 87 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 136
>ref|XM_004326336.1| PREDICTED: Tursiops truncatus thymosin beta-10-like (LOC101339007),
mRNA
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Sbjct 56 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 105
>ref|XM_004271617.1| PREDICTED: Orcinus orca thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
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Sbjct 75 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 124
>ref|XM_002922868.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca thymosin beta-10-like (LOC100481935),
mRNA
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Sbjct 62 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 111
>emb|FQ229048.1| Rattus norvegicus TL0ADA4YC18 mRNA sequence
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Sbjct 71 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 120
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Sbjct 72 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 121
>emb|FQ221466.1| Rattus norvegicus TL0ADA35YP07 mRNA sequence
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Sbjct 71 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 120
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Sbjct 71 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 120
>emb|FQ224120.1| Rattus norvegicus TL0ACA76YD14 mRNA sequence
Length=495
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Sbjct 73 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 122
>emb|FQ223015.1| Rattus norvegicus TL0ADA16YF14 mRNA sequence
Length=485
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 71 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 120
>ref|NG_021482.1| Mus musculus predicted gene, 20570 (Gm20570) pseudogene on chromosome
18
Length=672
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 173 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 222
>ref|NM_001190327.1| Mus musculus thymosin, beta 10 (Tmsb10), transcript variant 1,
mRNA
Length=637
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Sbjct 229 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 278
>ref|NM_001039392.2| Mus musculus thymosin, beta 10 (Tmsb10), transcript variant 2,
mRNA
Length=626
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 218 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 267
>ref|NM_025284.4| Mus musculus thymosin, beta 10 (Tmsb10), transcript variant 3,
mRNA
Length=565
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Sbjct 157 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 206
>ref|NM_021261.2| Rattus norvegicus thymosin, beta 10 (Tmsb10), mRNA
Length=489
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 73 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 122
>gb|BC145877.1| Mus musculus thymosin, beta 10, mRNA (cDNA clone MGC:175764 IMAGE:40131180),
complete cds
gb|BC145879.1| Mus musculus thymosin, beta 10, mRNA (cDNA clone MGC:175766 IMAGE:40131182),
complete cds
Length=226
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 34 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 83
>gb|BC126092.1| Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8362119
Length=460
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 42 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 91
>gb|BC080312.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:6814184
Length=492
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 55 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 104
>gb|BC070416.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:5714153
Length=487
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 52 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 101
>gb|AC133191.3| Mus musculus chromosome 18 clone RP23-390K15, complete sequence
Length=212060
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 160433 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 160482
>gb|BC038926.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:4986146
Length=509
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 75 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 124
>gb|BC059777.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:6478409
Length=519
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 61 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 110
>gb|AC113528.8| Mus musculus chromosome 18, clone RP23-419F17, complete sequence
Length=217309
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 209693 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 209742
>dbj|AK131711.1| Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:1700019O07 product:thymosin, beta 10, full
insert sequence
Length=476
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 74 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 123
>dbj|AK161987.1| Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding
region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720414F23
product:thymosin, beta 10, full insert sequence
Length=476
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 123
>gb|BC099374.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:30934123
Length=486
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 105
>ref|NM_001081865.1| Equus caballus thymosin beta 10 (TMSB10), mRNA
gb|AF506973.1| Equus caballus thymosin beta 10 mRNA, complete cds
Length=465
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 AAAATGGCAGACAAGCCTGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 97
>dbj|AK019232.1| Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:2700094D06 product:thymosin, beta
10, full insert sequence
Length=477
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 124
>dbj|AK019212.1| Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:2700055M20 product:thymosin, beta
10, full insert sequence
Length=476
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 123
>dbj|AK012361.1| Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:2700043G09 product:thymosin, beta
10, full insert sequence
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Sbjct 74 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 123
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enriched library, clone:2010309L16 product:thymosin, beta
10, full insert sequence
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Sbjct 74 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 123
>dbj|AK005512.1| Mus musculus adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:1600021K12 product:thymosin, beta 10,
full insert sequence
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Sbjct 74 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 123
>dbj|AK003178.1| Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:1100001I24 product:thymosin, beta 10,
full insert sequence
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Sbjct 74 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 123
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cds
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Sbjct 47 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 96
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(C57BL/6J Female) Mouse BAC Library) complete sequence
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Sbjct 152 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 201
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Sbjct 54 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 103
>gb|M58404.1|RATTHYBA R.norvegicus thymosin beta-10 (testis-specific) gene, complete
cds
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Sbjct 147 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 196
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Sbjct 52 AAAATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 101
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mRNA
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAG 48
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Sbjct 55 AAAACGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGGTAAG 102
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 87 AAAATGGCAGACAAGCCGGATATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 136
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protein 3-like (LOC102865159), mRNA
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Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 1 ATGGCAGACAAGCCTGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 47
>ref|XM_006736280.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii thymosin beta-10-like (LOC102728833),
mRNA
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Query 4 ATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 1 ATGGCAGACAAGCCGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 47
>ref|XM_006727757.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii thymosin beta-10-like (LOC102734120),
mRNA
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 75 AAAATGGCAGACAAGCCGGATATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 124
>ref|XM_005368111.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster thymosin beta-10-like (LOC101984915),
mRNA
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Query 1 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 50
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Sbjct 67 AAAATGGCAGACAAGCTGGACATGGGGGAAATCGCCAGCTTCGATAAGGC 116
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mRNA
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Sbjct 29 AAAATGGCAGACAAACCAGACATGGGGGGAATCGCCAGCTTCAATAGGGC 78
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 1784472 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1784521
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 93754339 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 93754388
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shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 1726197 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1726246
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shotgun sequence
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Strand=Plus/Minus
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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sequence
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 1747156 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1747205
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HuRef SCAF_1103279188423, whole genome shotgun sequence
gb|DS486098.1| Homo sapiens SCAF_1103279188423 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 7028295 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 7028246
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shotgun sequence
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 93753986 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 93754035
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 94192827 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 94192876
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG
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>ref|NT_005403.18| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR2_CTG7_2
gb|GL000029.2| Homo sapiens chromosome 2 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 4864221 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 4864270
>ref|NC_018913.2| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 99981450 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 99981499
>ref|NW_004929303.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150087.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 4650952 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 4651001
>gb|KE141153.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold85, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 1773025 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 1773074
>gb|CM000492.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808386
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 93743023 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 93743072
>gb|GL583075.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_95, whole genome
shotgun sequence
Length=8717270
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Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 1714767 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 1714816
>gb|DS990736.1| Homo sapiens SCAF_1112675837368 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=8817077
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 7039505 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 7039456
>gb|CH003449.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234033217
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 92596749 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 92596798
>gb|CH471127.2| Homo sapiens 211000035842547 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=10207486
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735723 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 1735772
>ref|NW_001838818.2| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188423, whole genome shotgun sequence
gb|DS486098.1| Homo sapiens SCAF_1103279188423 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=8817198
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7039611 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 7039562
>ref|AC_000134.1| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000463.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=234808360
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 93742670 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 93742719
>gb|CM000253.1| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
Length=236827137
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 94181394 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 94181443
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG
>ref|XM_010386769.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
Length=4233
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1754
>ref|XM_010386768.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
Length=4236
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1754
>ref|XM_001159759.4| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4227
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1750
>ref|XM_009236435.1| PREDICTED: Pongo abelii eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), partial mRNA
Length=4000
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1517
>ref|XM_003805399.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), mRNA
Length=4232
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1754
>gb|KJ898069.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_07463 EIF5B
gene, encodes complete protein
Length=3792
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1568 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1617
>ref|XM_005264075.2| PREDICTED: Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
Length=4505
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1746
>ref|XM_004031497.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4684
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1754
>ref|XM_003274844.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4677
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1754
>dbj|AB383972.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KSDA0741, Homo sapiens EIF5B
gene for eukaryotic translation initiation factor 5B, complete
cds, without stop codon, in Flexi system
Length=3701
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1530 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1579
>dbj|AK308176.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98124
Length=3394
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1718
>gb|AC198155.2| Nomascus leucogenys BAC clone CH271-127K22 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=168245
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145290 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 145339
>gb|AC185995.2| Pan troglodytes BAC clone CH251-277I3 from chromosome 2, complete
sequence
Length=161457
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10519 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 10568
>emb|CR857972.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469A1813 (from clone DKFZp469A1813)
Length=4213
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1717
>gb|AC079447.4| Homo sapiens BAC clone RP11-111H13 from 2, complete sequence
Length=175567
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175055 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 175104
>gb|AC018690.5| Homo sapiens BAC clone RP11-527J8 from 2, complete sequence
Length=233117
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1537
>emb|AL133563.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434I036 (from clone DKFZp434I036);
partial cds
Length=3792
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1239 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1288
>emb|AJ006776.1| Homo sapiens mRNA for translation initiation factor 2 (IF2 gene)
Length=4169
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1643 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1692
>dbj|AB018284.1| Homo sapiens mRNA for KIAA0741 protein, partial cds
Length=4177
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 1653 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1702
>ref|NM_015904.3| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 5B (EIF5B),
mRNA
Length=4698
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 1736
>gb|BC032639.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 5B, mRNA
(cDNA clone MGC:44860 IMAGE:5496504), complete cds
Length=4149
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Sbjct 1505 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGAGAGAAAAAG 1554
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Sbjct 1683 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGACGAGGAGACAGAAAAAG 1732
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5B (EIF5B), mRNA
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Sbjct 2223 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGAGAGAAAAAG 2272
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Sbjct 1818 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGACGAGGAGACAGAAAAAG 1867
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Sbjct 1818 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGACGAGGAGACAGAAAAAG 1867
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factor 5B (EIF5B), mRNA
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Sbjct 1676 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGAGAGAAAAAG 1725
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mRNA
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Sbjct 1644 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGACGAGGAGACAGAAAAAG 1693
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factor 5B (EIF5B), mRNA
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Sbjct 1669 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGACGAGGAGAGAGAAAAAG 1718
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factor 5B (EIF5B), mRNA
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Sbjct 1581 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAAGAGAGAGAAAAAG 1630
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factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1688 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAAAGAGAAAAAG 1737
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Sbjct 1691 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAAAGAGAAAAAG 1740
>ref|XM_008530656.1| PREDICTED: Equus przewalskii eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
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Sbjct 1917 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGAGAGAACAAG 1966
>ref|XM_007521879.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
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Sbjct 1473 TGGATTAGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGAGAGAAAAAG 1522
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Sbjct 1505 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAAGAGAGAGAAAAAG 1554
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factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1677 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAAGAGAGAGAAAAAG 1726
>ref|XM_005626021.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1677 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAAGAGAGAGAAAAAG 1726
>ref|XM_005599797.1| PREDICTED: Equus caballus eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1716 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGAGAGAACAAG 1765
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5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1716 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGAGAGAACAAG 1765
>ref|XM_001490220.4| PREDICTED: Equus caballus eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1716 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGAGAGAACAAG 1765
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initiation factor 5B (Eif5b), mRNA
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Sbjct 1673 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAAAGAGAAAAAG 1722
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factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1810 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAAGAGAGAGAAAAAG 1859
>ref|XM_004792570.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1810 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAAGAGAGAGAAAAAG 1859
>ref|XM_004753015.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 1810 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAAGAGAGAGAAAAAG 1859
>ref|XM_004669781.1| PREDICTED: Jaculus jaculus eukaryotic translation initiation
factor 5B (Eif5b), mRNA
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 1562 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAAGAGAGAGAAAAAG 1611
>ref|XM_004615796.1| PREDICTED: Sorex araneus eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), mRNA
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Sbjct 1560 TGGATTAGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGAGAGAAAAAG 1609
>ref|XM_004458061.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 2316 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGATAGAGAAAAAG 2365
>ref|XM_004400120.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens eukaryotic translation
initiation factor 5B (EIF5B), mRNA
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 1675 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAAGAGAGAGAAAAAG 1724
>ref|XM_004369315.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris eukaryotic translation
initiation factor 5B (EIF5B), mRNA
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 1678 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGAGAGAAGAAG 1727
>ref|XM_002919955.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4466
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
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Sbjct 1664 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAAGAGAGAGAAAAAG 1713
>ref|XM_008254682.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1698 TGGACTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAAAGAGAAAAAG 1747
>ref|XM_006870745.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4342
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Query 1 TGGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 1567 TGGGTTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGAAGAGGAGAGAGAAAAAG 1616
>ref|XM_008845864.1| PREDICTED: Nannospalax galili eukaryotic translation initiation
factor 5B (Eif5b), mRNA
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Query 2 GGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAGGAGACAGAAAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||
Sbjct 1688 GGATTGGATGATTGGGAAGCTATGGCCAGTGATGAAGAAAGAGAAAAAG 1736
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG
>ref|XM_001159759.4| PREDICTED: Pan troglodytes eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
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Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 234 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 283
>ref|XM_009236435.1| PREDICTED: Pongo abelii eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), partial mRNA
Length=4000
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Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
>ref|XM_003805399.2| PREDICTED: Pan paniscus eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), mRNA
Length=4232
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Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 238 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 287
>gb|KJ898069.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_07463 EIF5B
gene, encodes complete protein
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Sbjct 101 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 150
>ref|XM_005264075.2| PREDICTED: Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
Length=4505
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Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 233 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 282
>ref|XM_004031497.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
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Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 238 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 287
>emb|CU689458.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100020589
5' read EIF5B mRNA
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Sbjct 52 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 101
>dbj|AB383972.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KSDA0741, Homo sapiens EIF5B
gene for eukaryotic translation initiation factor 5B, complete
cds, without stop codon, in Flexi system
Length=3701
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Sbjct 63 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 112
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Sbjct 202 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 251
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Sbjct 202 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 251
>gb|BC022260.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 5B, mRNA
(cDNA clone IMAGE:4804924), partial cds
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Sbjct 98 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 147
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(cDNA clone IMAGE:4041983), partial cds
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Sbjct 70 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 119
>emb|CR857972.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp469A1813 (from clone DKFZp469A1813)
Length=4213
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Sbjct 202 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 251
>gb|AC079447.4| Homo sapiens BAC clone RP11-111H13 from 2, complete sequence
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Sbjct 163610 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 163659
>emb|AJ006776.1| Homo sapiens mRNA for translation initiation factor 2 (IF2 gene)
Length=4169
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Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 176 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 225
>dbj|AB018284.1| Homo sapiens mRNA for KIAA0741 protein, partial cds
Length=4177
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Sbjct 186 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 235
>ref|NM_015904.3| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 5B (EIF5B),
mRNA
Length=4698
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Sbjct 220 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 269
>gb|BC032639.1| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 5B, mRNA
(cDNA clone MGC:44860 IMAGE:5496504), complete cds
Length=4149
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Sbjct 142 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 191
>gb|AF078035.1|AF078035 Homo sapiens translation initiation factor IF2 mRNA, complete
cds
Length=3900
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Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 153 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 202
>ref|XM_010386769.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 240 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 287
>ref|XM_010386768.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
Length=4236
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 240 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 287
>ref|XM_009184767.1| PREDICTED: Papio anubis eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), mRNA
Length=4347
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 237 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 284
>ref|XM_008980137.1| PREDICTED: Callithrix jacchus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
Length=4615
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 374 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 421
>ref|XM_002757416.3| PREDICTED: Callithrix jacchus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
Length=4618
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 374 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 421
>ref|XM_008576819.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 220 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 267
>ref|XM_008576818.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 220 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 267
>ref|XM_008254682.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4201
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 233 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 280
>ref|XM_008156516.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4312
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 99 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 146
>ref|XM_008061213.1| PREDICTED: Tarsius syrichta eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
Length=4018
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 40 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 87
>ref|XM_008061212.1| PREDICTED: Tarsius syrichta eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
Length=4021
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 40 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 87
>ref|XM_008008162.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
Length=4483
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 218 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 265
>ref|XM_008008161.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
Length=4486
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 218 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 265
>ref|XM_007197301.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni eukaryotic translation
initiation factor 5B (EIF5B), transcript variant X2,
mRNA
Length=5232
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 209 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 256
>ref|XM_007197300.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni eukaryotic translation
initiation factor 5B (EIF5B), transcript variant X1,
mRNA
Length=5235
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 209 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 256
>ref|XM_006050937.1| PREDICTED: Bubalus bubalis eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=5174
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 224 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 271
>ref|XM_007118527.1| PREDICTED: Physeter catodon eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X7, mRNA
Length=4500
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 230 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 277
>ref|XM_007118526.1| PREDICTED: Physeter catodon eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X6, mRNA
Length=4627
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 357 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 404
>ref|XM_007118525.1| PREDICTED: Physeter catodon eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X5, mRNA
Length=4311
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 41 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 88
>ref|XM_007118524.1| PREDICTED: Physeter catodon eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X4, mRNA
Length=4376
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 106 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 153
>ref|XM_007118523.1| PREDICTED: Physeter catodon eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X3, mRNA
Length=4427
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 157 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 204
>ref|XM_007118522.1| PREDICTED: Physeter catodon eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
Length=4577
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 310 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 357
>ref|XM_007118521.1| PREDICTED: Physeter catodon eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
Length=4580
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 310 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 357
>ref|XM_007097795.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=5169
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 245 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 292
>ref|XM_006930077.1| PREDICTED: Felis catus eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), mRNA
Length=5685
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 758 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 805
>ref|XM_006916181.1| PREDICTED: Pteropus alecto eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=5033
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 213 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 260
>ref|XM_006753315.1| PREDICTED: Myotis davidii eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), mRNA
Length=3651
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 156 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 203
>ref|XM_006097746.1| PREDICTED: Myotis lucifugus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4171
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 218 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 265
>ref|XM_005977090.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4197
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 79 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 126
>ref|XM_005892247.1| PREDICTED: Bos mutus eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), mRNA
Length=4017
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 374 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 421
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factor 5B (EIF5B), mRNA
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Sbjct 71 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 118
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5B (EIF5B), partial mRNA
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Sbjct 26 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 73
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factor 5B (EIF5B), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 40 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 87
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factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 212 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 259
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factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 212 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 259
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factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 353 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 400
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factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 353 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 400
>ref|XM_005336387.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus eukaryotic translation
initiation factor 5B (Eif5b), mRNA
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Sbjct 205 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 252
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5B (EIF5B), mRNA
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Sbjct 312 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 359
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5B (EIF5B), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 252 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 299
>ref|XM_005193823.1| PREDICTED: Bos taurus eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 146 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 193
>ref|XM_005193822.1| PREDICTED: Bos taurus eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 313 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 360
>ref|XM_003582755.2| PREDICTED: Bos taurus eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 312 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 359
>ref|XM_004844429.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 5B (Eif5b), mRNA
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Sbjct 252 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 299
>ref|XM_004896558.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber eukaryotic translation initiation
factor 5B (Eif5b), mRNA
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 249 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 296
>ref|XM_004792571.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 345 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 392
>ref|XM_004792570.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 345 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 392
>ref|XM_004753015.1| PREDICTED: Mustela putorius furo eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4327
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 345 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 392
>ref|XM_004006136.1| PREDICTED: Ovis aries eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), mRNA
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 204 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 251
>ref|NM_001261610.1| Macaca mulatta eukaryotic translation initiation factor 5B (EIF5B),
mRNA
Length=4267
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 179 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 226
>ref|XM_003274844.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4677
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 240 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 287
>gb|AC197939.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-54K17 from chromosome 13, complete
sequence
Length=167547
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Strand=Plus/Minus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 10924 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 10877
>gb|AC198155.2| Nomascus leucogenys BAC clone CH271-127K22 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=168245
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 133287 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 133334
>gb|BC109632.1| Bos taurus eukaryotic translation initiation factor 5B, mRNA
(cDNA clone MGC:134193 IMAGE:8058440), complete cds
Length=1165
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 202 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 249
>ref|XM_010593546.1| PREDICTED: Loxodonta africana eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=3860
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CACCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 CACCAAGGATGACATTGATCTCGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 251
>ref|XM_010352067.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis eukaryotic translation
initiation factor 5B (EIF5B), transcript variant X2, mRNA
Length=4217
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230 CCAAGGATGAGATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 277
>ref|XM_010352066.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis eukaryotic translation
initiation factor 5B (EIF5B), transcript variant X1, mRNA
Length=4220
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 230 CCAAGGATGAGATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 277
>ref|XM_008700422.1| PREDICTED: Ursus maritimus eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=5063
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 116 CCAAGGATGACATTGATCTCGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 163
>ref|XM_007466891.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4333
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 CCAAGGATGACATTGATCTCGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 115
>ref|XM_006887854.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), partial mRNA
Length=3038
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100 CCAAGGATGATATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 147
>ref|XM_006734218.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=3864
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 247 CCAAGGATGACATTGATCTCGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 294
>ref|XM_006172356.1| PREDICTED: Tupaia chinensis eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=5442
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 357 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAGATAGAAGGAG 404
>ref|XM_006203937.1| PREDICTED: Vicugna pacos eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), mRNA
Length=5065
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 CCAAGGATGATATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 868
>ref|XM_006191697.1| PREDICTED: Camelus ferus eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), mRNA
Length=4492
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248 CCAAGGATGATATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 295
>ref|XM_003471712.2| PREDICTED: Cavia porcellus eukaryotic translation initiation
factor 5B (Eif5b), transcript variant X1, mRNA
Length=4543
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 209 CCAAGGGTGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 256
>ref|XM_005004455.1| PREDICTED: Cavia porcellus eukaryotic translation initiation
factor 5B (Eif5b), transcript variant X2, mRNA
Length=4540
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 209 CCAAGGGTGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 256
>ref|XM_004704343.1| PREDICTED: Echinops telfairi eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4356
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 CCAAGGATGATATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 251
>ref|XM_004400120.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens eukaryotic translation
initiation factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4504
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 CCAAGGATGACATTGATCTCGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 257
>ref|XM_004324097.1| PREDICTED: Tursiops truncatus eukaryotic translation initiation
factor 5B-like (LOC101331205), mRNA
Length=2375
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 CCAAGGATGACATTGATCTCGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 267
>ref|XM_004277754.1| PREDICTED: Orcinus orca eukaryotic translation initiation factor
5B (EIF5B), mRNA
Length=4492
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 CCAAGGATGACATTGATCTCGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 258
>ref|XM_003794337.1| PREDICTED: Otolemur garnettii eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4439
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
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Sbjct 46 CCAAGGATGATATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 93
>ref|XM_002919955.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4466
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 CCAAGGATGACATTGATCTCGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 249
>ref|XM_006870745.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica eukaryotic translation initiation
factor 5B (EIF5B), mRNA
Length=4342
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 CCAAGGATGATATTGATCTCGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 146
>ref|XM_005400748.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera eukaryotic translation initiation
factor 5B (Eif5b), transcript variant X2, mRNA
Length=4421
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 CCAAGGATGATATTGATGTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 251
>ref|XM_005400747.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera eukaryotic translation initiation
factor 5B (Eif5b), transcript variant X1, mRNA
Length=4418
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CCAAGGATGACATTGATCTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 50
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 CCAAGGATGATATTGATGTTGATGCCTTGGCTGCAGAAATAGAAGGAG 251
>ref|XM_004633250.1| PREDICTED: Octodon degus eukaryotic translation initiation factor
5B (Eif5b), mRNA
Length=4376
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sequence
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188396, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
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Sbjct 5156 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5107
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Sbjct 5156 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5107
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Sbjct 5156 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5107
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Sbjct 5156 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5107
>ref|XM_005246399.1| PREDICTED: Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant
X3, mRNA
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Sbjct 5156 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5107
>ref|XM_005246398.1| PREDICTED: Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 5156 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5107
>ref|XM_005246397.1| PREDICTED: Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 5156 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5107
>dbj|AB384664.2| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB0006, Homo sapiens FN1 gene
for fibronectin precursor, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
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Sbjct 4527 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4478
>gb|GU584098.1| Synthetic construct recombinant fibronectin/cadherin gene, complete
cds
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>ref|NG_012196.1| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), RefSeqGene on chromosome 2
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Sbjct 56946 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 56897
>gb|BC143763.1| Homo sapiens fibronectin 1, mRNA (cDNA clone MGC:177294 IMAGE:9052277),
complete cds
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Sbjct 4764 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4715
>gb|BC143754.1| Homo sapiens fibronectin 1, mRNA (cDNA clone MGC:177285 IMAGE:9052268),
complete cds
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Sbjct 4764 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4715
>dbj|AK300458.1| Homo sapiens cDNA FLJ54550 complete cds, highly similar to Homo
sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 6, mRNA
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Sbjct 1405 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 1356
>dbj|AK300246.1| Homo sapiens cDNA FLJ53292 complete cds, highly similar to Homo
sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 5, mRNA
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Sbjct 939 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 890
>gb|EU831936.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100066965; DKFZo008D0123
fibronectin 1 protein (FN1) gene, encodes complete protein
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Sbjct 4540 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4491
>gb|EU832031.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067060; DKFZo004D0124
fibronectin 1 protein (FN1) gene, encodes complete protein
Length=6574
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Sbjct 4540 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4491
>dbj|AB385106.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5488, Homo sapiens FN1 gene
for fibronectin precursor, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
Length=6812
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Sbjct 4527 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4478
>gb|BC117176.1| Homo sapiens fibronectin 1, mRNA (cDNA clone MGC:150785 IMAGE:40125727),
complete cds
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Sbjct 4764 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4715
>ref|NM_002026.2| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 4784 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4735
>ref|NM_212482.1| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 5057 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5008
>ref|NM_212478.1| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 4, mRNA
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Sbjct 4784 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4735
>ref|NM_212476.1| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 5, mRNA
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Query 1 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 4784 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4735
>ref|NM_212474.1| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 6, mRNA
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Query 1 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 4784 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4735
>gb|BC100030.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30343682, containing frame-shift
errors
Length=7501
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Query 1 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 4783 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4734
>gb|BC078656.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30347017, containing frame-shift
errors
Length=7501
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Query 1 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 4783 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4734
>dbj|AB209840.1| Homo sapiens mRNA for Fibronectin 1 variant protein
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Sbjct 4776 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4727
>dbj|AB209287.1| Homo sapiens mRNA for Fibronectin 1 variant protein
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Sbjct 757 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 708
>emb|CR936623.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I1370 (from clone DKFZp686I1370)
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Sbjct 924 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 875
>dbj|AB191261.1| Homo sapiens FN1 mRNA for fibronectin 1, complete cds
Length=7753
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Query 1 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 4784 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4735
>emb|CR749666.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O13149 (from clone DKFZp686O13149)
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Sbjct 1399 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 1350
>emb|CR749317.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H0342 (from clone DKFZp686H0342)
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Sbjct 4783 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4734
>emb|CR749316.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K08164 (from clone DKFZp686K08164)
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Sbjct 5056 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5007
>emb|CR749281.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F10164 (from clone DKFZp686F10164)
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Sbjct 4823 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4774
>emb|BX640875.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O1166 (from clone DKFZp686O1166)
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Sbjct 5058 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5009
>emb|BX640608.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686M04163 (from clone DKFZp686M04163)
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Sbjct 4784 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4735
>emb|BX538018.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686E169 (from clone DKFZp686E169)
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Sbjct 4785 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4736
>emb|BX538017.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O016 (from clone DKFZp686O016)
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Sbjct 4785 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4736
>emb|BX537590.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686I155 (from clone DKFZp686I155)
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Sbjct 5059 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5010
>emb|AL832202.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H112 (from clone DKFZp686H112)
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Sbjct 4785 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4736
>emb|X02761.1| Human mRNA for fibronectin (FN precursor)
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Sbjct 4438 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4389
>emb|BX649182.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686K139 (from clone DKFZp686K139);
complete cds
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Sbjct 4783 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4734
>emb|BX641150.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H05109 (from clone DKFZp686H05109)
Length=9157
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Query 1 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 3267 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 3218
>emb|BX640999.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O12165 (from clone DKFZp686O12165);
complete cds
Length=7299
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Query 1 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 4033 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 3984
>emb|BX640920.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O22169 (from clone DKFZp686O22169)
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Query 1 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 1220 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 1171
>emb|BX640803.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686O1570 (from clone DKFZp686O1570)
Length=8421
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Query 1 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 5058 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5009
>emb|BX640802.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F219 (from clone DKFZp686F219);
complete cds
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Query 1 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 4783 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4734
>emb|BX640731.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686M2451 (from clone DKFZp686M2451);
complete cds
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Sbjct 4785 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4736
>emb|BX640638.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686L11144 (from clone DKFZp686L11144)
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Query 1 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 827 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 778
>emb|AL832771.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B197 (from clone DKFZp686B197)
Length=7502
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Sbjct 4785 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4736
>gb|AC012462.5| Homo sapiens BAC clone RP11-566P21 from 2, complete sequence
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Sbjct 18606 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 18655
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Sbjct 823 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 774
>gb|U42593.1|HSU42593 Human fibronectin (FN1) mRNA, splice variant, partial cds
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Sbjct 113 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 64
>gb|U42458.1|HSU42458 Human fibronectin (FN1) mRNA, splice variant not containing EIIIA
domain, partial cds
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Sbjct 174 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 125
>gb|M12549.1|HUMFN3A Human fibronectin gene type III homology unit corresponding to
the cell-binding domain, exons 6 and 7
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Sbjct 1009 GCTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 960
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transcript variant X10, mRNA
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Sbjct 5158 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5110
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transcript variant X9, mRNA
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Sbjct 4885 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4837
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transcript variant X8, mRNA
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Sbjct 4885 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4837
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transcript variant X7, mRNA
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transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 4885 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4837
>ref|XM_003925566.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis fibronectin 1 (FN1),
transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 4885 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4837
>ref|XM_010336358.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis fibronectin 1 (FN1),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 4885 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4837
>ref|XM_010336357.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis fibronectin 1 (FN1),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 4885 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4837
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 4885 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4837
>ref|XM_010336355.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis fibronectin 1 (FN1),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 4885 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4837
>ref|XM_010372183.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X19, mRNA
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Sbjct 5160 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5112
>ref|XM_010372182.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X18, mRNA
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Sbjct 5160 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5112
>ref|XM_010372181.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X17, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372180.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X16, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372179.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X15, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372178.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X14, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372177.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X13, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
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variant X12, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372175.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X11, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372174.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X10, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372172.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X9, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372171.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X8, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372170.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X7, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372169.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X6, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372168.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372167.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372166.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372165.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_010372164.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 4887 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4839
>ref|XM_009238072.1| PREDICTED: Pongo abelii fibronectin 1 (FN1), mRNA
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Sbjct 5154 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5106
>ref|XM_009183009.1| PREDICTED: Papio anubis fibronectin (LOC101004025), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 2993 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 2945
>ref|XM_009183008.1| PREDICTED: Papio anubis fibronectin (LOC101004025), transcript
variant X4, mRNA
Length=5303
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Sbjct 2629 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 2581
>ref|XM_009183006.1| PREDICTED: Papio anubis fibronectin (LOC101004025), transcript
variant X3, mRNA
Length=5963
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Query 2 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 2985 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 2937
>ref|XM_003907916.2| PREDICTED: Papio anubis fibronectin (LOC101004025), transcript
variant X2, mRNA
Length=6053
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Query 2 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 2985 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 2937
>ref|XM_009183005.1| PREDICTED: Papio anubis fibronectin (LOC101004025), transcript
variant X1, mRNA
Length=6155
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Query 2 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 2985 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 2937
>ref|XM_003805007.2| PREDICTED: Pan paniscus fibronectin 1 (FN1), transcript variant
X24, mRNA
Length=7585
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Query 2 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 4881 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4833
>ref|XM_008966359.1| PREDICTED: Pan paniscus fibronectin 1 (FN1), transcript variant
X23, mRNA
Length=7777
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Query 2 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 4881 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4833
>ref|XM_008966352.1| PREDICTED: Pan paniscus fibronectin 1 (FN1), transcript variant
X22, mRNA
Length=7131
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Query 2 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 4881 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4833
>ref|XM_008966347.1| PREDICTED: Pan paniscus fibronectin 1 (FN1), transcript variant
X21, mRNA
Length=7852
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Query 2 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 50
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Sbjct 4885 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4837
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Sbjct 5049 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5001
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Sbjct 4979 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4931
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Sbjct 4666 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4618
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Sbjct 4977 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4929
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Sbjct 4667 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4619
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Sbjct 4941 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4893
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Sbjct 4704 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4656
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Sbjct 4783 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4735
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Sbjct 5056 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5008
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Sbjct 5056 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5008
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variant X1, mRNA
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Sbjct 4517 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4469
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Sbjct 4517 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4469
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Sbjct 4517 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4469
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variant 3 (FN1), mRNA
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Sbjct 4517 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4469
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Sbjct 4731 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4683
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Sbjct 4790 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4742
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Sbjct 5017 CTGATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4969
>ref|XM_004262751.1| PREDICTED: Orcinus orca fibronectin 1, transcript variant 6 (FN1),
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Sbjct 4745 GCTGATGGTAGCTGTGGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4696
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Sbjct 4603 GCTGATGGTAGCTGTGGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4554
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Sbjct 4597 GCTGATGGTAGCTGTGGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4548
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Sbjct 4878 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4833
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Sbjct 4878 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4833
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X14, mRNA
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Sbjct 4878 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4833
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Sbjct 5151 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5106
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Sbjct 4878 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4833
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Sbjct 4878 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4833
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Sbjct 5151 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5106
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Sbjct 4878 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4833
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Sbjct 5151 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5106
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Sbjct 5151 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5106
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Sbjct 4878 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4833
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X5, mRNA
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Sbjct 5151 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5106
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Sbjct 5151 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5106
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X2, mRNA
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Sbjct 5151 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5106
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X1, mRNA
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Sbjct 5151 ATGGTAGCTGTAGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5106
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variant X9, mRNA
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Sbjct 4788 CTGATGGTAGCTGTGGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4740
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variant X8, mRNA
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Sbjct 4884 CTGATGGTAGCTGTGGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4836
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variant X7, mRNA
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Sbjct 4611 CTGATGGTAGCTGTGGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4563
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variant X6, mRNA
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Sbjct 4884 CTGATGGTAGCTGTGGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4836
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variant X5, mRNA
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Sbjct 4611 CTGATGGTAGCTGTGGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 4563
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variant X4, mRNA
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Sbjct 5061 CTGATGGTAGCTGTGGACTTGCTCCCAGGCACAGTGAACTCCTGGACAG 5013
>ref|XM_007086092.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica fibronectin 1 (FN1), transcript
variant X3, mRNA
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variant X1, mRNA
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X4, mRNA
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>ref|XM_003254042.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys fibronectin 1, transcript variant
4 (FN1), mRNA
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2 (FN1), mRNA
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1 (FN1), mRNA
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variant 4 (FN1), mRNA
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variant 3 (FN1), mRNA
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variant 2 (FN1), mRNA
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Sbjct 4297 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4346
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variant 1 (FN1), mRNA
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Sbjct 4570 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4619
>ref|XM_001083548.2| PREDICTED: Macaca mulatta fibronectin 1 (FN1), mRNA
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Sbjct 4707 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4756
>dbj|AB384664.2| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB0006, Homo sapiens FN1 gene
for fibronectin precursor, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
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Sbjct 4079 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4128
>gb|GU584098.1| Synthetic construct recombinant fibronectin/cadherin gene, complete
cds
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Sbjct 1373 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 1422
>ref|NG_012196.1| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), RefSeqGene on chromosome 2
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Sbjct 54111 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 54160
>gb|BC143763.1| Homo sapiens fibronectin 1, mRNA (cDNA clone MGC:177294 IMAGE:9052277),
complete cds
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Sbjct 4316 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4365
>gb|BC143754.1| Homo sapiens fibronectin 1, mRNA (cDNA clone MGC:177285 IMAGE:9052268),
complete cds
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Sbjct 4316 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4365
>dbj|AK300458.1| Homo sapiens cDNA FLJ54550 complete cds, highly similar to Homo
sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 6, mRNA
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Sbjct 957 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 1006
>gb|EU831936.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100066965; DKFZo008D0123
fibronectin 1 protein (FN1) gene, encodes complete protein
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Sbjct 4092 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4141
>gb|EU832031.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067060; DKFZo004D0124
fibronectin 1 protein (FN1) gene, encodes complete protein
Length=6574
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Sbjct 4092 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4141
>dbj|AB385106.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5488, Homo sapiens FN1 gene
for fibronectin precursor, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
Length=6812
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 4079 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4128
>gb|BC117176.1| Homo sapiens fibronectin 1, mRNA (cDNA clone MGC:150785 IMAGE:40125727),
complete cds
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Sbjct 4316 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4365
>ref|NM_002026.2| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 4336 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4385
>ref|NM_212482.1| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 4609 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4658
>ref|NM_212478.1| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 4, mRNA
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Sbjct 4336 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4385
>ref|NM_212476.1| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 5, mRNA
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Sbjct 4336 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4385
>ref|NM_212474.1| Homo sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 6, mRNA
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>gb|BC100030.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30343682, containing frame-shift
errors
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Sbjct 4335 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4384
>gb|BC078656.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:30347017, containing frame-shift
errors
Length=7501
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Sbjct 4335 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4384
>dbj|AB209840.1| Homo sapiens mRNA for Fibronectin 1 variant protein
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complete cds
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Sbjct 4337 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4386
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>gb|U42457.1|HSU42457 Human fibronectin (FN1) mRNA, splice variant not containing EIIIB
domain, partial cds
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>ref|XM_010616019.1| PREDICTED: Fukomys damarensis fibronectin 1 (Fn1), transcript
variant X8, mRNA
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Sbjct 4250 GTCTTGATTCCCCAACTGGAATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4299
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variant X7, mRNA
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variant X6, mRNA
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Sbjct 4250 GTCTTGATTCCCCAACTGGAATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4299
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variant X5, mRNA
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Sbjct 4523 GTCTTGATTCCCCAACTGGAATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4572
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Sbjct 4250 GTCTTGATTCCCCAACTGGAATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4299
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Sbjct 4523 GTCTTGATTCCCCAACTGGAATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4572
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Sbjct 4523 GTCTTGATTCCCCAACTGGAATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4572
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variant X1, mRNA
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Sbjct 4523 GTCTTGATTCCCCAACTGGAATTGACTTTTCTGATATTACTGCCAACTCT 4572
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variant X19, mRNA
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Sbjct 4713 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACCGCCAACTCT 4762
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Sbjct 4440 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACCGCCAACTCT 4489
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Sbjct 4440 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACCGCCAACTCT 4489
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Sbjct 4440 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACCGCCAACTCT 4489
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Sbjct 4440 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACCGCCAACTCT 4489
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Sbjct 4440 GTCTTGATTCCCCAACTGGCATTGACTTTTCTGATATTACCGCCAACTCT 4489
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sapiens fibronectin 1 (FN1), transcript variant 5, mRNA
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30 |
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shotgun sequence
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Query 1 CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC 50
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Sbjct 13241401 CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC 13241450
>gb|GL583018.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_38, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC 50
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Sbjct 13911977 CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC 13912026
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Sbjct 29885135 CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC 29885086
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 3356877 CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC 3356828
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HuRef SCAF_1103279188091, whole genome shotgun sequence
gb|DS486145.1| Homo sapiens SCAF_1103279188091 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC 50
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Sbjct 1794759 CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC 1794808
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shotgun sequence
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Query 1 CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC 50
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Sbjct 29885231 CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC 29885182
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Sbjct 29853768 CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC 29853719
Lambda K H
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Lambda K H
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right flanking sequence - CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT
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>ref|NT_011362.11| Homo sapiens chromosome 20 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR20_CTG2
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assembly
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Sbjct 3489158 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 3489207
>ref|NC_018931.2| Homo sapiens chromosome 20, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 33029307 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 33029356
>ref|NW_004929418.1| Homo sapiens chromosome 20 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150202.1| Homo sapiens chromosome 20 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 3324325 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 3324374
>gb|KE141113.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold14, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 13217529 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 13217480
>gb|GL583018.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_38, whole genome
shotgun sequence
Length=17231844
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 13889376 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 13889327
>gb|CM000510.1| Homo sapiens chromosome 20, whole genome shotgun sequence
Length=59656813
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 29908993 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 29909042
>gb|DS990783.1| Homo sapiens SCAF_1112675837036 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 1770872 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 1770823
>gb|CH003515.1| Homo sapiens chromosome 20, whole genome shotgun sequence
Length=62536925
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 30797019 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 30797068
>gb|CH003467.1| Homo sapiens chromosome 20, whole genome shotgun sequence
Length=59663740
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 29823066 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 29823115
>gb|CH471077.2| Homo sapiens 211000035835434 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=33108650
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 3380730 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 3380779
>ref|NW_001838664.2| Homo sapiens chromosome 20 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188091, whole genome shotgun sequence
gb|DS486145.1| Homo sapiens SCAF_1103279188091 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 1770901 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 1770852
>ref|AC_000152.1| Homo sapiens chromosome 20, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000481.1| Homo sapiens chromosome 20, whole genome shotgun sequence
Length=59656706
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 29909089 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 29909138
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Length=59605541
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 29877621 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 29877670
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CAGCCACAAGACCCCGGCGCACGCTCACCATTTCCGACCGATCCGGTAGC
right flanking sequence - CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT
>ref|XM_009437071.1| PREDICTED: Pan troglodytes dynein, light chain, roadblock-type
1 (DYNLRB1), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 409 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 458
>ref|XM_514596.3| PREDICTED: Pan troglodytes dynein, light chain, roadblock-type
1 (DYNLRB1), transcript variant X2, mRNA
Length=706
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 413 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 462
>ref|XM_008957203.1| PREDICTED: Pan paniscus dynein, light chain, roadblock-type 1
(DYNLRB1), transcript variant X4, mRNA
Length=703
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 409 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 458
>ref|XM_003831823.2| PREDICTED: Pan paniscus dynein, light chain, roadblock-type 1
(DYNLRB1), transcript variant X3, mRNA
Length=709
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 415 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 464
>ref|XM_008957202.1| PREDICTED: Pan paniscus dynein, light chain, roadblock-type 1
(DYNLRB1), transcript variant X2, mRNA
Length=1094
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 800 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 849
>ref|NR_104032.1| Homo sapiens dynein, light chain, roadblock-type 1 (DYNLRB1),
transcript variant 6, non-coding RNA
Length=799
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 490 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 539
>ref|NM_001281729.1| Homo sapiens dynein, light chain, roadblock-type 1 (DYNLRB1),
transcript variant 5, mRNA
Length=1100
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
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Sbjct 791 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 840
>ref|NM_001281728.1| Homo sapiens dynein, light chain, roadblock-type 1 (DYNLRB1),
transcript variant 4, mRNA
Length=792
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 532
>ref|NM_001281727.1| Homo sapiens dynein, light chain, roadblock-type 1 (DYNLRB1),
transcript variant 3, mRNA
Length=713
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 453
>ref|NM_014183.3| Homo sapiens dynein, light chain, roadblock-type 1 (DYNLRB1),
transcript variant 1, mRNA
Length=717
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 457
>ref|NM_177953.2| Homo sapiens dynein, light chain, roadblock-type 1 (DYNLRB1),
transcript variant 2, mRNA
Length=796
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 487 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 536
>ref|XM_004062038.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla dynein, light chain, roadblock-type
1 (DYNLRB1), mRNA
Length=1119
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 444
>ref|XM_004062037.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla dynein, light chain, roadblock-type
1 (DYNLRB1), mRNA
Length=729
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 444
>emb|AL136173.24| Human DNA sequence from clone RP5-914B9 on chromosome 20, complete
sequence
Length=23442
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20075 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 20124
>dbj|AK026864.1| Homo sapiens cDNA: FLJ23211 fis, clone ADSU01503, highly similar
to AF161511 Homo sapiens HSPC162 mRNA
Length=651
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 393
>gb|AF165516.1|AF165516 Homo sapiens bithoraxoid-like protein (BLP) mRNA, complete cds
Length=670
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 410
>gb|AF161511.1|AF161511 Homo sapiens HSPC162 mRNA, complete cds
Length=687
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 428
>gb|AF111848.1|AF111848 Homo sapiens PRO0529 mRNA, complete cds
Length=3115
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2870 CCCCCAAGAATGTTAATGTCAATCATGTCAGTGGACTAGCACATGGCAGT 2919
>gb|BC002481.1| Homo sapiens dynein, light chain, roadblock-type 1, mRNA (cDNA
clone MGC:773 IMAGE:3347555), complete cds
Length=728
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blast search - nt
left flanking sequence - TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT
>ref|XM_010607657.1| PREDICTED: Fukomys damarensis guanine nucleotide-binding protein
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 755 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 706
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Sbjct 2750 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 2701
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Sbjct 2792 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 2743
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Sbjct 2795 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 2746
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Sbjct 1149 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 1100
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Sbjct 740 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 691
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Sbjct 685 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 636
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Sbjct 687 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 638
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Sbjct 719 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 670
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Sbjct 746 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 697
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Sbjct 791 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 742
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Sbjct 2420 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 2371
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Sbjct 2465 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 2416
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Sbjct 2543 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 2494
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Sbjct 687 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 638
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Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 719 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 670
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variant X2, mRNA
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Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 746 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 697
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Sbjct 788 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 739
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Sbjct 667 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 618
>ref|XM_004647236.1| PREDICTED: Octodon degus guanine nucleotide-binding protein G(s)
subunit alpha isoforms XLas-like (LOC101584539), transcript
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subunit alpha isoforms XLas-like (LOC101584539), transcript
variant X2, mRNA
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subunit alpha isoforms XLas-like (LOC101584539), transcript
variant X1, mRNA
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variant X4, mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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protein G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC101403929),
mRNA
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subunit alpha isoforms XLas-like (LOC101286834), mRNA
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mRNA
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mRNA
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mRNA
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mRNA
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mRNA
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mRNA
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Sbjct 1111 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 1062
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GNAS complex locus (GNAS) gene, encodes complete protein
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Sbjct 853 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 804
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cds
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Sbjct 631 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 582
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protein G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC100473680),
mRNA
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Sbjct 845 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 796
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5 (GNAS), mRNA
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Sbjct 3038 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 2989
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1 (GNAS), mRNA
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Sbjct 2792 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 2743
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20
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Sbjct 75026 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 74977
>gb|EU832170.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067199; DKFZo008H0125
GNAS complex locus protein (GNAS) gene, encodes complete
protein
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Sbjct 780 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 731
>gb|EU832264.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067293; DKFZo004H0126
GNAS complex locus protein (GNAS) gene, encodes complete
protein
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Sbjct 780 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 731
>dbj|AB385065.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5212, Homo sapiens GNAS
gene for guanine nucleotide-binding protein G, complete cds,
without stop codon, in Flexi system
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Sbjct 809 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 760
>emb|CU678145.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017171
3' read GNAS mRNA
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Sbjct 401 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 450
>emb|CU679150.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017175
3' read GNAS mRNA
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Sbjct 401 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 450
>dbj|AK315874.1| Homo sapiens cDNA, FLJ79523 complete cds, highly similar to Guanine
nucleotide-binding protein G(s)subunit alpha
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Sbjct 903 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 854
>dbj|AK315860.1| Homo sapiens cDNA, FLJ79509 complete cds, highly similar to Guanine
nucleotide-binding protein G(s)subunit alpha
Length=1308
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Sbjct 722 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 673
>ref|NM_080425.2| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 2,
mRNA
ref|NM_001077490.1| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 2,
mRNA
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Sbjct 3014 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 2965
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non-coding RNA
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Sbjct 890 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 841
>ref|NM_016592.2| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 4,
mRNA
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Sbjct 1811 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 1762
>ref|NM_080426.2| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 3,
mRNA
Length=1884
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Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 1114 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 1065
>ref|NM_000516.4| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 1,
mRNA
Length=1926
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 1156 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 1107
>dbj|AK225818.1| Homo sapiens mRNA for guanine nucleotide binding protein, alpha
stimulating activity polypeptide 1 isoform b variant, clone:
FCC129A01
Length=1369
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Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 923 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 874
>gb|BC108315.1| Homo sapiens GNAS complex locus, mRNA (cDNA clone IMAGE:6092583),
complete cds
Length=1755
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Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 1020 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 971
>gb|BC008855.2| Homo sapiens GNAS complex locus, mRNA (cDNA clone IMAGE:4106768),
complete cds
Length=1710
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Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 945 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 896
>dbj|AK122771.1| Homo sapiens cDNA FLJ16311 fis, clone SPLEN2010187, highly similar
to GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(S), ALPHA SUBUNIT
Length=1953
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 1207 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 1158
>dbj|AK093534.1| Homo sapiens cDNA FLJ36215 fis, clone THYMU2000684, highly similar
to Guanine nucleotide-binding protein G-s-alpha-4
Length=1779
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 1034 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 985
>dbj|AK054862.1| Homo sapiens cDNA FLJ30300 fis, clone BRACE2003210, highly similar
to GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(S), ALPHA SUBUNIT
Length=2834
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 2088 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 2039
>gb|BT009905.1| Homo sapiens GNAS complex locus mRNA, complete cds
Length=1185
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 800 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 751
>dbj|AB220439.1| Macaca fascicularis mRNA, clone QccE-18185: similar to Homo sapiens
GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 1, mRNA,
NM_000516.3
Length=1424
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 50
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Sbjct 782 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 733
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GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 4, mRNA,
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complete cds
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(GNASS) mRNA, complete cds
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(GNASL) mRNA, complete cds
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mRNA, partial cds
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sequence
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complete cds
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>dbj|AK026564.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22911 fis, clone KAT05860, highly similar
to HSGSA2R Human mRNA for coupling protein G(s) alpha subunit
(alpha-S2) (stimulatory regulatory component Gs of adenylyl
cyclase)
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locus (GNAS) mRNA, complete cds
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locus (GNAS) mRNA, partial cds
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locus (GNAS) mRNA, partial cds
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complete cds
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cds
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partial cds
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exons 7 through 13
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Sbjct 812 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGGATGACCATGTTGTAGCTGCT 763
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(stimulatory regulatory component Gs of adenylyl cyclase)
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(stimulatory regulatory component Gs of adenylyl cyclase)
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G(s) subunit alpha isoforms short (LOC103285782), transcript
variant X7, mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms short (LOC103285782), transcript
variant X6, mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms short (LOC103285782), transcript
variant X5, mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms short (LOC103285782), transcript
variant X4, mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms short (LOC103285782), transcript
variant X3, mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms short (LOC103285782), transcript
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Sbjct 2699 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGAATGACCATGTTGTAGCTGCT 2650
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G(s) subunit alpha isoforms short (LOC103285782), transcript
variant X1, mRNA
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G(s) subunit alpha (LOC103255823), transcript variant X2,
mRNA
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>ref|XM_008053765.1| PREDICTED: Tarsius syrichta guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103255823), transcript variant X1,
mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC103115369), mRNA
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variant X13, mRNA
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Sbjct 688 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGAATGACCATGTTGTAGCTGCT 639
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Sbjct 1098 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGAATGACCATGTTGTAGCTGCT 1049
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variant X10, mRNA
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Sbjct 637 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGAATGACCATGTTGTAGCTGCT 588
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Sbjct 761 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGAATGACCATGTTGTAGCTGCT 712
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variant X8, mRNA
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Sbjct 782 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGAATGACCATGTTGTAGCTGCT 733
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variant X7, mRNA
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Sbjct 2576 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGAATGACCATGTTGTAGCTGCT 2527
>ref|XM_006049041.1| PREDICTED: Bubalus bubalis GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X6, mRNA
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Sbjct 2621 TGCAGGCGGTTGGTCTGGTTGTCCTCCCGAATGACCATGTTGTAGCTGCT 2572
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variant X5, mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms short-like (LOC102774843), transcript
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G(s) subunit alpha isoforms short-like (LOC102774843), transcript
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G(s) subunit alpha isoforms short-like (LOC102341817),
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G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC102252262), transcript
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G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC102252262), transcript
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1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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right flanking sequence - CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA
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(GNAS), transcript variant X2, mRNA
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(GNAS), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1571 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1620
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protein G(s) subunit alpha (LOC104663797), transcript variant
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G(s) subunit alpha (LOC100408515), transcript variant X14,
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variant X1, mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC102252262), transcript
variant X7, mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC102252262), transcript
variant X6, mRNA
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Sbjct 1061 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1110
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G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC102252262), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 1044 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1093
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G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC102252262), transcript
variant X3, mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC102252262), transcript
variant X2, mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC102252262), transcript
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Sbjct 1350 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1399
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Sbjct 3033 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3082
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Sbjct 3075 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3124
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variant X12, mRNA
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Sbjct 1060 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1109
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variant X11, mRNA
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Sbjct 1052 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1101
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variant X10, mRNA
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Sbjct 1150 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1199
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variant X9, mRNA
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Sbjct 1091 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1140
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variant X8, mRNA
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Sbjct 1137 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1186
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variant X6, mRNA
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Sbjct 3132 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3181
>ref|XM_005569455.1| PREDICTED: Macaca fascicularis GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 3129 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3178
>ref|XM_005569454.1| PREDICTED: Macaca fascicularis GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 3132 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3181
>ref|XM_005569453.1| PREDICTED: Macaca fascicularis GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 3177 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3226
>ref|XM_005569452.1| PREDICTED: Macaca fascicularis GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 3174 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3223
>ref|XM_005569451.1| PREDICTED: Macaca fascicularis GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 3177 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3226
>ref|XM_005260401.1| PREDICTED: Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X6, mRNA
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Sbjct 1531 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1580
>ref|XM_003277503.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys GNAS complex locus (GNAS), mRNA
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Sbjct 1358 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1407
>ref|XM_004062443.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla GNAS complex locus (GNAS),
mRNA
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Sbjct 1073 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1122
>ref|XM_004062442.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla GNAS complex locus (GNAS),
mRNA
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Sbjct 2249 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 2298
>ref|XM_004062441.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla GNAS complex locus (GNAS),
mRNA
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Sbjct 1578 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1627
>ref|XM_004062440.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla GNAS complex locus (GNAS),
mRNA
Length=1533
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Sbjct 1136 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1185
>ref|NM_001077488.2| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 6,
mRNA
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1541 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1590
>ref|NM_001077489.2| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 7,
mRNA
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Sbjct 1493 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1542
>ref|XM_001083687.2| PREDICTED: Macaca mulatta GNAS complex locus, transcript variant
5 (GNAS), mRNA
Length=3795
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Sbjct 3420 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3469
>ref|XM_001083221.2| PREDICTED: Macaca mulatta GNAS complex locus, transcript variant
1 (GNAS), mRNA
Length=3549
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 3174 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3223
>ref|NG_016194.1| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), RefSeqGene on chromosome
20
Length=78456
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 76087 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 76136
>dbj|AK315860.1| Homo sapiens cDNA, FLJ79509 complete cds, highly similar to Guanine
nucleotide-binding protein G(s)subunit alpha
Length=1308
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Sbjct 1104 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1153
>ref|NM_080425.2| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 2,
mRNA
ref|NM_001077490.1| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 2,
mRNA
Length=3784
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 3396 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3445
>ref|NR_003259.1| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 8,
non-coding RNA
Length=1638
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1272 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1321
>ref|NM_016592.2| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 4,
mRNA
Length=2581
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 2193 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 2242
>ref|NM_080426.2| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 3,
mRNA
Length=1884
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1496 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1545
>ref|NM_000516.4| Homo sapiens GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 1,
mRNA
Length=1926
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1538 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1587
>gb|BC020762.1| Homo sapiens fibrinogen beta chain, mRNA (cDNA clone IMAGE:4767234),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=1629
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1237 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1286
>dbj|AK225818.1| Homo sapiens mRNA for guanine nucleotide binding protein, alpha
stimulating activity polypeptide 1 isoform b variant, clone:
FCC129A01
Length=1369
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1305 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1354
>gb|BC108315.1| Homo sapiens GNAS complex locus, mRNA (cDNA clone IMAGE:6092583),
complete cds
Length=1755
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1402 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1451
>gb|BC008855.2| Homo sapiens GNAS complex locus, mRNA (cDNA clone IMAGE:4106768),
complete cds
Length=1710
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1327 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1376
>dbj|AK122771.1| Homo sapiens cDNA FLJ16311 fis, clone SPLEN2010187, highly similar
to GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(S), ALPHA SUBUNIT
Length=1953
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1589 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1638
>dbj|AK093534.1| Homo sapiens cDNA FLJ36215 fis, clone THYMU2000684, highly similar
to Guanine nucleotide-binding protein G-s-alpha-4
Length=1779
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1416 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1465
>dbj|AK054862.1| Homo sapiens cDNA FLJ30300 fis, clone BRACE2003210, highly similar
to GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(S), ALPHA SUBUNIT
Length=2834
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 2470 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 2519
>dbj|AB220439.1| Macaca fascicularis mRNA, clone QccE-18185: similar to Homo sapiens
GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 1, mRNA,
NM_000516.3
Length=1424
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1164 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1213
>dbj|AB220406.1| Macaca fascicularis mRNA, clone QccE-13704: similar to Homo sapiens
GNAS complex locus (GNAS), transcript variant 4, mRNA,
NM_016592.1
Length=1074
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 777 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 826
>gb|BC066923.1| Homo sapiens GNAS complex locus, mRNA (cDNA clone IMAGE:4814812),
complete cds
Length=1516
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1140 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1189
>gb|BC036081.1| Homo sapiens GNAS complex locus, mRNA (cDNA clone IMAGE:5302402),
containing frame-shift errors
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Sbjct 2211 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 2260
>gb|AF513867.1| Macaca mulatta GNAS1 (GNAS1) gene, partial cds
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Sbjct 103 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 152
>gb|BC022875.1| Homo sapiens, Similar to GNAS complex locus, clone IMAGE:4108909,
mRNA, partial cds
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Sbjct 1028 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1077
>emb|AL109840.24| Human DNA sequence from clone RP4-543J19 on chromosome 20, complete
sequence
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Sbjct 8253 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 8302
>gb|BC104928.1| Homo sapiens GNAS complex locus, mRNA (cDNA clone IMAGE:8143931),
complete cds
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Sbjct 1228 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1277
>gb|AC010102.3|AC010102 Homo sapiens BAC clone RP11-486B15 from 2, complete sequence
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Sbjct 5444 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 5493
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Sbjct 1258 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1307
>gb|BC089157.1| Homo sapiens GNAS complex locus, mRNA (cDNA clone IMAGE:6647888),
complete cds
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Sbjct 1456 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1505
>gb|BC002722.2| Homo sapiens GNAS complex locus, mRNA (cDNA clone IMAGE:3627815),
complete cds
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Sbjct 1300 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1349
>gb|AF105253.1|AF105253 Homo sapiens neuroendocrine secretory protein 55 mRNA, complete
cds
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Sbjct 2193 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 2242
>gb|M14631.1|HUMGNPAS Human guanine nucleotide-binding protein G-s, alpha subunit mRNA,
partial cds
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Sbjct 1152 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1201
>gb|M21142.1|HUMGNAS6 Human guanine nucleotide-binding protein alpha-subunit gene (G-s-alpha),
exons 7 through 13
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Sbjct 1902 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1951
>emb|X04408.1| Human mRNA for coupling protein G(s) alpha subunit (alpha-S2)
(stimulatory regulatory component Gs of adenylyl cyclase)
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Sbjct 1250 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1299
>emb|X04409.1| Human mRNA for coupling protein G(s) alpha-subunit (alpha-S1)
(stimulatory regulatory component Gs of adenylyl cyclase)
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Sbjct 1152 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1201
>ref|XR_087450.3| PREDICTED: Callithrix jacchus guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha pseudogene (LOC100403761), misc_RNA
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Sbjct 1276 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAGTTAATTA 1325
>ref|XM_008842353.1| PREDICTED: Nannospalax galili guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103741475), transcript variant X10,
mRNA
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Sbjct 1148 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1197
>ref|XM_008842347.1| PREDICTED: Nannospalax galili guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103741475), transcript variant X9,
mRNA
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Sbjct 1131 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1180
>ref|XM_008842338.1| PREDICTED: Nannospalax galili guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103741475), transcript variant X8,
mRNA
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Sbjct 1086 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1135
>ref|XM_008842329.1| PREDICTED: Nannospalax galili guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103741475), transcript variant X7,
mRNA
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Sbjct 1170 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1219
>ref|XM_008842323.1| PREDICTED: Nannospalax galili guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103741475), transcript variant X6,
mRNA
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Sbjct 1176 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1225
>ref|XM_008842315.1| PREDICTED: Nannospalax galili guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103741475), transcript variant X5,
mRNA
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Sbjct 1218 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1267
>ref|XM_008842308.1| PREDICTED: Nannospalax galili guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103741475), transcript variant X4,
mRNA
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Sbjct 1283 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1332
>ref|XM_008842302.1| PREDICTED: Nannospalax galili guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103741475), transcript variant X3,
mRNA
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Sbjct 3021 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3070
>ref|XM_008842299.1| PREDICTED: Nannospalax galili guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103741475), transcript variant X2,
mRNA
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Sbjct 3147 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3196
>ref|XM_008842295.1| PREDICTED: Nannospalax galili guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103741475), transcript variant X1,
mRNA
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Sbjct 3303 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3352
>ref|XM_006177310.1| PREDICTED: Camelus ferus GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 996 CTAAGAAGGGAACCTCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1045
>ref|XM_006177309.1| PREDICTED: Camelus ferus GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 1043 CTAAGAAGGGAACCTCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1092
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variant X6, mRNA
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Sbjct 976 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1025
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variant X4, mRNA
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Sbjct 1318 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1367
>ref|XM_004785801.1| PREDICTED: Mustela putorius furo GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 1254 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1303
>ref|XM_004785800.1| PREDICTED: Mustela putorius furo GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 1366 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1415
>ref|XM_004759944.1| PREDICTED: Mustela putorius furo GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X6, mRNA
ref|XM_004785803.1| PREDICTED: Mustela putorius furo GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 1106 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1155
>ref|XM_004759943.1| PREDICTED: Mustela putorius furo GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X5, mRNA
ref|XM_004785799.1| PREDICTED: Mustela putorius furo GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 1301 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1350
>ref|XM_004759942.1| PREDICTED: Mustela putorius furo GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 1420 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1469
>ref|XM_004759941.1| PREDICTED: Mustela putorius furo GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 1423 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1472
>ref|XM_004759940.1| PREDICTED: Mustela putorius furo GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X2, mRNA
Length=1729
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Sbjct 1465 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1514
>ref|XM_004759939.1| PREDICTED: Mustela putorius furo GNAS complex locus (GNAS), transcript
variant X1, mRNA
Length=1732
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1468 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1517
>ref|XM_004430232.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum guanine nucleotide-binding
protein G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC101403929),
mRNA
Length=3288
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 2940 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAGTTAATTA 2989
>dbj|AK026564.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22911 fis, clone KAT05860, highly similar
to HSGSA2R Human mRNA for coupling protein G(s) alpha subunit
(alpha-S2) (stimulatory regulatory component Gs of adenylyl
cyclase)
Length=1670
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Sbjct 1376 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAGAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1425
>ref|NM_001003263.1| Canis lupus familiaris GNAS complex locus (GNAS), mRNA
emb|Z12168.1| C.familiaris mRNA for stimulatory GTP binding protein alpha subunit
Length=1927
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1535 CTAAGAAGGGAACACCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1584
>ref|XM_008053766.1| PREDICTED: Tarsius syrichta guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103255823), transcript variant X2,
mRNA
Length=1890
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1533 CTAAGAAGGGAA-CCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1581
>ref|XM_008053765.1| PREDICTED: Tarsius syrichta guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103255823), transcript variant X1,
mRNA
Length=1638
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1281 CTAAGAAGGGAA-CCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1329
>emb|X07036.1| Human mRNA stimulatory GTP-binding protein alpha subunit
Length=1552
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
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Query 1 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 50
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Sbjct 1194 CTAAGAA-GGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1242
>ref|XM_008699450.1| PREDICTED: Ursus maritimus guanine nucleotide-binding protein
G(s) subunit alpha (LOC103670935), transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 3381 AAG-AGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 3427
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variant 5, mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC100942694), partial
misc_RNA
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Sbjct 1287 CTAAGAAGGGAA-CCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAAT 1333
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variant 2 (LOC100966563), mRNA
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Sbjct 3388 CTAAGAAGGGAA-CCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAAT 3434
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variant 1 (LOC100966563), mRNA
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Sbjct 3433 CTAAGAAGGGAA-CCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAAT 3479
>dbj|AK315874.1| Homo sapiens cDNA, FLJ79523 complete cds, highly similar to Guanine
nucleotide-binding protein G(s)subunit alpha
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Sbjct 1285 CTAAGAAGGGAACCCCCAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAA 1327
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complete cds
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G(s) subunit alpha (LOC103565402), transcript variant X3,
mRNA
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Sbjct 1041 CTAAGAAGGGAACGCCC-AGTTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1089
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G(s) subunit alpha (LOC103565402), transcript variant X2,
mRNA
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Sbjct 1044 CTAAGAAGGGAACGCCC-AGTTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1092
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G(s) subunit alpha (LOC103565402), transcript variant X1,
mRNA
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G(s) subunit alpha isoforms XLas-like (LOC100056464), mRNA
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variant X9, mRNA
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variant X8, mRNA
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variant X7, mRNA
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variant X3, mRNA
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Sbjct 1101 CTAAGAAGGGAA--CCTAAATTTAATTAAAGCCTTAAGCACAATTAATTA 1148
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variant X2, mRNA
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genome shotgun sequence
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sequence
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 3 AGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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sequence
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Query 3 AGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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shotgun sequence
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Query 3 AGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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genome shotgun sequence
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sequence
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sequence
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Query 1 CTCTACCGGCGGGATTTGATGGCGTGATGGTATGTGTTGTAATGGCGGCC 50
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Query 1 CTCTACCGGCGGGATTTGATGGCGTGATGGTATGTGTTGTAATGGCGGCC 50
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Query 1 CTCTACCGGCGGGATTTGATGGCGTGATGGTATGTGTTGTAATGGCGGCC 50
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Lambda K H
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blast search - nt
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Sbjct 293 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 244
>ref|XM_525601.5| PREDICTED: Pan troglodytes ribosomal protein L3 (RPL3), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 305 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 256
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(LOC463109), misc_RNA
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 189 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 140
>ref|XM_002834649.3| PREDICTED: Pongo abelii 60S ribosomal protein L3-like (LOC100450002),
partial mRNA
Length=812
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 128 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 79
>ref|XM_009234390.1| PREDICTED: Pongo abelii ribosomal protein L3 (RPL3), transcript
variant X2, mRNA
Length=1289
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 311 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 262
>ref|XM_009234389.1| PREDICTED: Pongo abelii ribosomal protein L3 (RPL3), transcript
variant X1, mRNA
Length=1260
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 282 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 233
>ref|XM_008975111.1| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein L3 (RPL3), transcript
variant X2, mRNA
Length=1497
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 519 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 470
>ref|XM_003821613.2| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein L3 (RPL3), transcript
variant X1, mRNA
Length=2045
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 1067 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 1018
>gb|KJ905898.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15568 RPL3
gene, encodes complete protein
Length=1341
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 355 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 306
>gb|KJ905897.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15567 RPL3
gene, encodes complete protein
Length=1341
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 355 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 306
>gb|KJ897480.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06874 RPL3
gene, encodes complete protein
Length=1341
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 355 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 306
>gb|KJ897479.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06873 RPL3-like
gene, encodes complete protein
Length=1341
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 355 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 306
>ref|NM_001280414.1| Pan troglodytes 60S ribosomal protein L3-like (LOC744903), mRNA
Length=1310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 316 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 267
>dbj|AB266619.1| Homo sapiens ASC-1 mRNA for hypothetical protein, partial cds
Length=1056
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 134 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 85
>dbj|AK306826.1| Pan troglodytes mRNA for 60S ribosomal protein L3, complete cds,
clone: PtsC-77-5_D01
Length=1312
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 318 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 269
>dbj|AB528226.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KE0539, Homo sapiens RPL3
gene for ribosomal protein L3, without stop codon, in Flexi
system
Length=1226
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 299 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 250
>dbj|AK297711.1| Homo sapiens cDNA FLJ59135 complete cds, highly similar to 60S
ribosomal protein L3
Length=847
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 316 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 267
>emb|CU677948.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017194
5' read RPL3 mRNA
Length=1116
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 306 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 257
>emb|CU675425.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100019249
5' read RPL3 mRNA
Length=1225
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 306 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 257
>emb|CU678985.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100019251
5' read RPL3 mRNA
Length=1258
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 306 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 257
>dbj|AK315693.1| Homo sapiens cDNA, FLJ96791, Homo sapiens ribosomal protein L3
(RPL3), mRNA
Length=1238
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 316 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 267
>gb|BC127794.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40133674
Length=639
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 112 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 63
>gb|BC011860.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4310440, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2326
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 1319 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 1270
>emb|CU013454.1| Homo sapiens RPL3, mRNA (cDNA clone IMAGE:100000423), complete
cds, without stop codon, in Gateway system
Length=1243
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 309 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 260
>emb|CU013166.1| Homo sapiens RPL3, mRNA (cDNA clone IMAGE:100000519), complete
cds, with stop codon, in Gateway system
Length=1246
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 309 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 260
>gb|BC017593.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:2988782, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3547
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 2552 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 2503
>gb|BC107711.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:104284
IMAGE:6699816), complete cds
Length=1325
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 320 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 271
>gb|BC088373.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:111436
IMAGE:6195715), complete cds
Length=1305
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 313 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 264
>gb|BC063662.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:70878
IMAGE:3852576), complete cds
Length=1299
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
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Sbjct 303 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 254
>gb|BC012786.2| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:16463
IMAGE:3951917), complete cds
Length=1323
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 254
>gb|BC015767.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:23196
IMAGE:4861546), complete cds
Length=1295
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 250
>gb|BC013674.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:17324
IMAGE:4152521), complete cds
Length=1317
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 250
>gb|BC012146.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:20359
IMAGE:4549682), complete cds
Length=1298
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 254
>gb|BC008492.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:14821
IMAGE:4251511), complete cds
Length=1322
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 267
>gb|BC008003.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:15830
IMAGE:3507481), complete cds
Length=1291
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 246
>gb|BC033296.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4510463)
Length=1299
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 247
>dbj|AK092695.1| Homo sapiens cDNA FLJ35376 fis, clone SKMUS2004044, highly similar
to Homo sapiens ribosomal protein L3 (RPL3), transcript
variant 2, mRNA
Length=1160
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 267
>gb|BC036582.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:42068
IMAGE:4796724), complete cds
Length=2127
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 906
>gb|BC014017.2| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:20304
IMAGE:4128023), complete cds
Length=1311
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 249
>gb|BC006483.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, transcript variant 1, mRNA
(cDNA clone IMAGE:2905497), complete cds
Length=1304
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 254
>gb|BC022790.1| Homo sapiens, clone IMAGE:3538792, mRNA, partial cds
Length=1200
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 155
>emb|AL022326.1| Human DNA sequence from clone RP3-333H23 on chromosome 22q12.1-12.3,
complete sequence
Length=122888
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50573 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50622
>emb|CR926481.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G0827 (from clone DKFZp468G0827)
Length=1932
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 318 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 269
>emb|CR456566.1| Homo sapiens RPL3 full length open reading frame (ORF) cDNA clone
(cDNA clone C22ORF:pGEM.RPL3)
Length=1243
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 253
>dbj|AK130450.1| Homo sapiens cDNA FLJ26940 fis, clone RCT07237, highly similar
to 60S ribosomal protein L3
Length=2230
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 1204
>gb|BC041578.1| Homo sapiens zinc finger protein 114, mRNA (cDNA clone IMAGE:4640152),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=3538
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2543 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 2494
>emb|AL832757.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686B0827 (from clone DKFZp686B0827)
Length=5458
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 785 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 736
>emb|X73460.1| H.sapiens mRNA for ribosomal protein L3
Length=1272
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 247
>ref|NM_001033853.1| Homo sapiens ribosomal protein L3 (RPL3), transcript variant
2, mRNA
Length=1201
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 358 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 309
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1, mRNA
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Sbjct 358 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 309
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protein L3 (RPL3) mRNA, partial cds
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Sbjct 290 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 241
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errors
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IMAGE:2961541), complete cds
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Sbjct 293 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 244
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cds
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Sbjct 295 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 246
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(cDNA clone IMAGE:3912046), complete cds
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Sbjct 299 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 250
>gb|BC013861.1| Homo sapiens ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3917924)
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Sbjct 299 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 250
>emb|AJ238852.1| Homo sapiens partial rpl3 gene for ribosomal protein L3, U82
snoRNA, U83a snoRNA and U83b snoRNA genes
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Sbjct 897 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 848
>gb|L22453.1|HUMTAPR Homo sapiens HIV-1 TAR RNA binding protein (TARBP-b) mRNA, complete
cds
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Sbjct 293 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 244
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Sbjct 276 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 227
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L3 pseudogene (LOC101046063), misc_RNA
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Sbjct 310 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 264
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(LOC104654042), mRNA
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Sbjct 312 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 266
>ref|XM_010389277.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana ribosomal protein L3 (RPL3),
mRNA
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Sbjct 357 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 311
>ref|XR_750058.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S ribosomal protein L3 pseudogene
(LOC104677493), misc_RNA
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Sbjct 295 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 249
>ref|XM_010379765.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S ribosomal protein L3 (LOC104675284),
mRNA
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Sbjct 307 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 261
>ref|XR_748655.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S ribosomal protein L3 pseudogene
(LOC104667292), misc_RNA
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Sbjct 311 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 265
>ref|XR_748446.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S ribosomal protein L3 pseudogene
(LOC104665690), misc_RNA
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Sbjct 314 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 268
>ref|XR_748173.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S ribosomal protein L3 pseudogene
(LOC104663762), misc_RNA
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Sbjct 327 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 281
>ref|XM_009196169.1| PREDICTED: Papio anubis 60S ribosomal protein L3-like (LOC101011294),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 290 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 244
>ref|XM_009196168.1| PREDICTED: Papio anubis 60S ribosomal protein L3-like (LOC101011294),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 290 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 244
>ref|XM_009206850.1| PREDICTED: Papio anubis 60S ribosomal protein L3-like (LOC101018441),
mRNA
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Sbjct 320 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 274
>ref|XR_645665.1| PREDICTED: Papio anubis 60S ribosomal protein L3-like (LOC103883439),
misc_RNA
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Sbjct 370 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 324
>ref|XR_645012.1| PREDICTED: Papio anubis 60S ribosomal protein L3 pseudogene (LOC101018880),
misc_RNA
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Sbjct 313 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 267
>ref|XM_002763565.3| PREDICTED: Callithrix jacchus 60S ribosomal protein L3-like (LOC100385093),
mRNA
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Sbjct 359 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 313
>ref|XM_002763492.3| PREDICTED: Callithrix jacchus ribosomal protein L3 (RPL3), mRNA
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Sbjct 408 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 362
>ref|XR_609828.1| PREDICTED: Pan paniscus 60S ribosomal protein L3 pseudogene (LOC100996024),
misc_RNA
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Sbjct 200 CGAGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 151
>ref|XR_088661.3| PREDICTED: Callithrix jacchus 60S ribosomal protein L3 pseudogene
(LOC100395959), misc_RNA
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Sbjct 311 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 265
>ref|XR_494133.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus 60S ribosomal protein L3 pseudogene
(LOC103224436), misc_RNA
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 327 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 281
>ref|XM_005559062.1| PREDICTED: Macaca fascicularis ribosomal protein L3 (RPL3), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 323 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 277
>ref|XM_005559061.1| PREDICTED: Macaca fascicularis ribosomal protein L3 (RPL3), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 323 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 277
>ref|XM_004437873.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum ribosomal protein L3 (RPL3),
mRNA
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 314 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 268
>ref|XR_121398.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein L3 pseudogene
(LOC100589146), misc_RNA
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 322 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 276
>ref|XM_004063493.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L3, transcript
variant 2 (RPL3), mRNA
Length=1192
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 358 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 312
>ref|XM_004063492.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla ribosomal protein L3, transcript
variant 1 (RPL3), mRNA
Length=1445
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 464 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 418
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Length=1404
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 309 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 263
>ref|XM_001082799.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L3-like, transcript
variant 1 (LOC693573), mRNA
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 326 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 280
>ref|XR_092068.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L3-like (LOC100425638),
miscRNA
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 677 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 631
>ref|XR_012873.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L3-like (LOC707358),
miscRNA
Length=1320
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 323 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 277
>gb|AC199580.6| Rhesus Macaque BAC CH250-160C21 () complete sequence
Length=160058
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 38138 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 38184
>ref|NM_001283214.1| Macaca fascicularis 60S ribosomal protein L3 (RPL3), mRNA
dbj|AB170937.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-11248, similar to
human ribosomal protein L3 (RPL3), mRNA, RefSeq: NM_000967.2
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 344 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 298
>dbj|AB170927.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QorA-11132, similar to
human ribosomal protein L3 (RPL3), mRNA, RefSeq: NM_000967.2
Length=1321
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 270
>dbj|AB170240.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10953, similar to
human ribosomal protein L3 (RPL3), mRNA, RefSeq: NM_000967.2
Length=1252
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 270
>dbj|AB169493.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-11024, similar to
human ribosomal protein L3 (RPL3), mRNA, RefSeq: NM_000967.2
Length=1310
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 271
>ref|XR_749976.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S ribosomal protein L3-like
(LOC104676837), misc_RNA
Length=1124
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 AGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 651 AGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 607
>ref|XM_010371711.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana 60S ribosomal protein L3-like
(LOC104668912), transcript variant X2, mRNA
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Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 290 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATAGGTGG 244
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(LOC104668912), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 290 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATAGGTGG 244
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(LOC462916), misc_RNA
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Sbjct 297 CGAGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 251
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misc_RNA
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Sbjct 289 CGAGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 243
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mRNA
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Sbjct 289 GAGGGGTTTCCATGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGT 243
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misc_RNA
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Sbjct 359 CGAGGGGTTTCCATGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 313
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Sbjct 394 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACAACCATGGGTGG 348
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Sbjct 313 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACAACCATGGGTGG 267
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misc_RNA
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Sbjct 311 CGAGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 265
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(LOC100385664), misc_RNA
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Sbjct 320 CGAGGGGTTTCCATGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 274
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Sbjct 372 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGG 329
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variant X2, mRNA
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Sbjct 382 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGG 339
>ref|XM_006105650.1| PREDICTED: Myotis lucifugus ribosomal protein L3 (RPL3), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 381 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGG 338
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGG 44
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Sbjct 365 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGG 322
>ref|XM_004092867.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys ribosomal protein L3 (RPL3), mRNA
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Sbjct 240 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGG 197
>ref|XM_004044486.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla 60S ribosomal protein L3-like,
transcript variant 2 (LOC101150350), mRNA
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Sbjct 271 CGAGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 225
>ref|XM_004044485.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla 60S ribosomal protein L3-like,
transcript variant 1 (LOC101150350), mRNA
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 319 CGAGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 273
>ref|XR_013132.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L3-like (LOC706712),
miscRNA
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 313 CGAGGGGTTTCCATGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 267
>gb|AC200336.2| Pongo abelii BAC clone CH276-196P21 from chromosome 6, complete
sequence
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 110969 CGAGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 110923
>gb|AC160026.2| Pan troglodytes BAC clone CH251-166J6 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=172151
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Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 162729 CGAGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 162775
>gb|AC159019.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-550K12 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=196429
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119887 CGAGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 119841
>ref|XR_655150.1| PREDICTED: Pongo abelii 60S ribosomal protein L3 pseudogene (LOC100452328),
misc_RNA
Length=1237
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Query 2 GAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
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Sbjct 310 GAGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 265
>ref|XR_616628.1| PREDICTED: Callithrix jacchus 60S ribosomal protein L3 pseudogene
(LOC100413430), misc_RNA
Length=409
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Strand=Plus/Minus
Query 2 GAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 GAGGGGTTTCCATATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGGTGT 251
>ref|XR_092253.1| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L3-like (LOC698625),
miscRNA
Length=1311
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Strand=Plus/Minus
Query 2 GAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGG 44
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGG 322
>ref|NG_010941.1| Homo sapiens ribosomal protein L3 pseudogene 7 (RPL3P7) on chromosome
6
Length=1493
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 AGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 AGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 370
>emb|Z98200.9| Human DNA sequence from clone RP1-111B22 on chromosome 6q16-21,
complete sequence
Length=153382
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 AGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149768 AGGGGTTTCCACATAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 149724
>ref|XM_005871387.1| PREDICTED: Myotis brandtii ribosomal protein L3 (RPL3), mRNA
Length=1379
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 395 GGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATAGGTGG 352
>ref|XR_012704.2| PREDICTED: Macaca mulatta 60S ribosomal protein L3-like (LOC705076),
miscRNA
Length=1261
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Query 2 GAGGGGTTTCCACGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 47
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 GAGGAGTTTCCATGTAGCCCACAATGCCCACAACCACCATGGGTGG 244
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTCTACCGGCGGGATTTGATGGCGTGATGGTATGTGTTGTAATGGCGGCC
>ref|XM_008975111.1| PREDICTED: Pan paniscus ribosomal protein L3 (RPL3), transcript
variant X2, mRNA
Length=1497
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Strand=Plus/Plus
Query 6 CCGGCGGGATTTGATGGCGTGATGGTATGTGTTGTAATGGCGGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CCGGCGGGATTTGATGGCGTGATGGTATGTGTTGTAATGGCGGCC 45
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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right flanking sequence - AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA
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HSCHR22_CTG3_2
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150214.1| Homo sapiens chromosome 22 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=29713884
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 95273 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 95322
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 17986063 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 17986112
>ref|NW_001838745.1| Homo sapiens chromosome 22 genomic scaffold, alternate assembly
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gb|DS486047.1| Homo sapiens SCAF_1103279188372 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 18009535 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 18009584
>ref|AC_000154.1| Homo sapiens chromosome 22, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 22882402 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 22882451
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Sbjct 23719869 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 23719918
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1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG
>ref|NM_001675.4| Homo sapiens activating transcription factor 4 (ATF4), transcript
variant 1, mRNA
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Sbjct 58 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 9
>ref|NM_182810.2| Homo sapiens activating transcription factor 4 (ATF4), transcript
variant 2, mRNA
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Sbjct 53 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 4
>dbj|AK296028.1| Homo sapiens cDNA FLJ58799 complete cds, highly similar to Cyclic
AMP-dependent transcription factor ATF-4
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Sbjct 58 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 9
>emb|AL022312.7| Human DNA sequence from clone RP5-1104E15 on chromosome 22q12.3-13.1,
complete sequence
Length=112460
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Sbjct 61305 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 61256
>dbj|AK057751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25022 fis, clone CBL01850, highly similar
to CYCLIC-AMP-DEPENDENT TRANSCRIPTION FACTOR ATF-4
Length=1418
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Query 1 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 50
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Sbjct 57 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 8
>emb|AJ340452.1| Homo sapiens genomic sequence surrounding NotI site, clone NL1-VO2C
Length=680
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Query 1 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 50
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Sbjct 495 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 544
>gb|U03712.1|HSU03712 Human TAXREB67 pseudogene, complete sequence
Length=1442
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Query 1 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 50
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Sbjct 55 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 6
>dbj|D90209.1|HUMTAXREBA Homo sapiens mRNA for DNA binding protein TAXREB67, complete
cds
Length=2015
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Query 1 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 50
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Sbjct 55 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 6
>emb|Z79837.1| H.sapiens chromosome 22 CpG island DNA genomic Mse1 fragment,
clone 301h9, reverse read 301h9.r
Length=410
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Query 1 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 50
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Sbjct 122 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGNNAAAGTAG 171
>ref|XM_009438329.1| PREDICTED: Pan troglodytes activating transcription factor 4
(ATF4), transcript variant X1, mRNA
Length=1908
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 50
|||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GGAAAACGCACACGTGCAGGGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 492
>ref|XM_003846210.2| PREDICTED: Pan paniscus activating transcription factor 4 (ATF4),
mRNA
Length=1908
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 50
|||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GGAAAACGCACACGTGCAGGGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 492
>ref|XM_004063500.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla activating transcription factor
4 (tax-responsive enhancer element B67), transcript variant
1 (ATF4), mRNA
Length=1913
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 50
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 GGAAAACGCACACTTGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 497
>ref|NM_001252517.1| Pan troglodytes activating transcription factor 4 (ATF4), mRNA
Length=1422
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 50
|||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 GGAAAACGCACACGTGCAGGGAAAACTACATCTGTGGGCGGGCAAAGTAG 6
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1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA
>ref|XM_009438329.1| PREDICTED: Pan troglodytes activating transcription factor 4
(ATF4), transcript variant X1, mRNA
Length=1908
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 1079
>ref|XM_003846210.2| PREDICTED: Pan paniscus activating transcription factor 4 (ATF4),
mRNA
Length=1908
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 1079
>gb|KJ905692.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15362 ATF4
gene, encodes complete protein
Length=1185
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 376
>gb|KJ890723.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00117 ATF4
gene, encodes complete protein
Length=1185
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 327 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 376
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variant 1, mRNA
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Sbjct 1149 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 1198
>ref|NM_182810.2| Homo sapiens activating transcription factor 4 (ATF4), transcript
variant 2, mRNA
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Sbjct 542 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 591
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4 (tax-responsive enhancer element B67), transcript variant
2 (ATF4), mRNA
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Sbjct 468 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 517
>ref|XM_004063500.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla activating transcription factor
4 (tax-responsive enhancer element B67), transcript variant
1 (ATF4), mRNA
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Sbjct 1035 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 1084
>ref|NM_001252517.1| Pan troglodytes activating transcription factor 4 (ATF4), mRNA
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Sbjct 544 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 593
>dbj|AB489145.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB9540, Homo sapiens ATF4
gene for activating transcription factor 4, without stop codon,
in Flexi system
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Sbjct 271 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 320
>dbj|AK296028.1| Homo sapiens cDNA FLJ58799 complete cds, highly similar to Cyclic
AMP-dependent transcription factor ATF-4
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Sbjct 649 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 698
>emb|CU680155.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017071
3' read ATF4 mRNA
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Sbjct 809 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 760
>emb|CU680154.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017071
5' read ATF4 mRNA
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Sbjct 278 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 327
>gb|DQ894942.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009402; FLH179657.01L;
RZPDo839B01131D activating transcription factor 4
(tax-responsive enhancer element B67) (ATF4) gene, encodes complete
protein
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Sbjct 284 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 333
>gb|DQ891758.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004388; FLH179661.01X; RZPDo839B01132D
activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67) (ATF4) gene, encodes complete protein
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Sbjct 284 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 333
>emb|CU013230.1| Homo sapiens ATF4, mRNA (cDNA clone IMAGE:100000010), complete
cds, without stop codon, in Gateway system
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Sbjct 281 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 330
>emb|CU012942.1| Homo sapiens ATF4, mRNA (cDNA clone IMAGE:100000106), complete
cds, with stop codon, in Gateway system
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Sbjct 281 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 330
>gb|BC073754.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:88758 IMAGE:6580199),
complete cds
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Sbjct 515 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 564
>gb|BC073990.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:88042 IMAGE:6022488),
complete cds
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Sbjct 490 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 539
>gb|BC022088.2| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:4076 IMAGE:3030097),
complete cds
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Sbjct 525 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 574
>gb|BC044895.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:25133 IMAGE:4513828),
complete cds
Length=1429
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Sbjct 510 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 559
>gb|BC024775.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:30184 IMAGE:4992862),
complete cds
Length=1421
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Sbjct 524 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 573
>gb|BC016855.2| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:17066 IMAGE:3850361),
complete cds
Length=1408
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Sbjct 518 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 567
>gb|BC008090.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:9337 IMAGE:3454473),
complete cds
Length=1429
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 526 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 575
>gb|BT008126.1| Synthetic construct Homo sapiens activating transcription factor
4 (tax-responsive enhancer element B67) mRNA, partial cds
Length=1056
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Sbjct 262 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 311
>emb|AL022312.7| Human DNA sequence from clone RP5-1104E15 on chromosome 22q12.3-13.1,
complete sequence
Length=112460
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 62497 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 62546
>emb|CR456384.1| Homo sapiens ATF4 full length open reading frame (ORF) cDNA clone
(cDNA clone C22ORF:pGEM.ATF4.V4)
Length=1267
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 442 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 491
>emb|CR450353.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H102D
for gene ATF4, activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67); complete cds; without stopcodon
Length=1053
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 262 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 311
>dbj|AK057751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25022 fis, clone CBL01850, highly similar
to CYCLIC-AMP-DEPENDENT TRANSCRIPTION FACTOR ATF-4
Length=1418
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 546 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 595
>gb|AY892782.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH012178.01L activating
transcription factor 4 (ATF4) mRNA, partial cds
Length=1056
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 262 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 311
>gb|BC011994.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:10001 IMAGE:3882614),
complete cds
Length=1416
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 524 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 573
>dbj|D90209.1|HUMTAXREBA Homo sapiens mRNA for DNA binding protein TAXREB67, complete
cds
Length=2015
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 1143 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 1192
>gb|M86842.1|HUMCREB2A Human cAMP response element regulatory protein (CREB2) mRNA,
complete cds
Length=1241
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 369 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 418
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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22 22 39916790 39916690 100m AGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACACCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGG
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22 22 39916780 39916680 100m CTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGC
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22 22 39916771 39916671 100m CCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAATGGCCAATGCTGCCGCGGGCAC
22 22 39916768 39916668 100m CCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGC
22 22 39916756 39916656 100m CGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGAGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATAC
22 22 39916753 39916653 100m GATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGACCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCC
22 22 39916750 39916650 100m GGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTACAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAACGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATG
22 22 39916747 39916647 100m TTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTG
22 22 39916744 39916644 100m AGCCGCTGGGGTTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTCCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCC
22 22 39916741 39916641 100m CGCTGGGGGTGGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTG
22 22 39916738 39916638 100m TGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGAC
22 22 39916735 39916635 100m GGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCT
22 22 39916732 39916632 100m TTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAG
22 22 39916729 39916629 100m CCGCTGCAGAGCCTGGTGCCGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGC
22 22 39916726 39916626 100m CTGCAGAGCCTGGTCCTCCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGG
22 22 39916723 39916623 100m CAGCGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAG
22 22 39916720 39916620 100m AGCCGGGTGCTGCTCCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAG
22 22 39916717 39916617 100m CTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGAAA
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Sbjct 17984900 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 17984851
>ref|NW_001838745.1| Homo sapiens chromosome 22 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188372, whole genome shotgun sequence
gb|DS486047.1| Homo sapiens SCAF_1103279188372 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
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Sbjct 18008372 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 18008323
>ref|AC_000154.1| Homo sapiens chromosome 22, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
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Sbjct 22881239 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 22881190
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
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Sbjct 23718706 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 23718657
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genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGG-AGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
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Sbjct 39875390 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 39875340
>ref|NW_004929430.1| Homo sapiens chromosome 22 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150214.1| Homo sapiens chromosome 22 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGG-AGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
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Sbjct 19265756 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 19265706
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGG-AGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
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Sbjct 22881641 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 22881591
>gb|DS990685.1| Homo sapiens SCAF_1112675837317 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGG-AGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
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Sbjct 18008515 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 18008465
>gb|CH003517.1| Homo sapiens chromosome 22, whole genome shotgun sequence
Length=36095843
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGG-AGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
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Sbjct 24394215 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 24394165
>gb|CH003469.1| Homo sapiens chromosome 22, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGG-AGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
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Sbjct 22554642 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 22554592
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA
>ref|NC_000022.11| Homo sapiens chromosome 22, GRCh38 Primary Assembly
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 39521808 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 39521857
>ref|NT_011520.13| Homo sapiens chromosome 22 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR22_CTG3_2
gb|GL000155.2| Homo sapiens chromosome 22 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 20812244 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 20812293
>ref|NC_018933.2| Homo sapiens chromosome 22, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001630.2| Homo sapiens chromosome 22, whole genome shotgun sequence
Length=51262586
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Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 39876553 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 39876602
>ref|NW_004929430.1| Homo sapiens chromosome 22 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150214.1| Homo sapiens chromosome 22 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=29713884
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 19266919 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 19266968
>gb|KE141238.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold92, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 11636920 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 11636871
>gb|GL583230.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_250, whole genome
shotgun sequence
Length=2468864
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 95273 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 95322
>gb|CM000512.1| Homo sapiens chromosome 22, whole genome shotgun sequence
Length=34107248
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 22882804 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 22882853
>gb|DS990685.1| Homo sapiens SCAF_1112675837317 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=21026749
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18009678 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 18009727
>gb|CH003517.1| Homo sapiens chromosome 22, whole genome shotgun sequence
Length=36095843
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 24395378 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 24395427
>gb|CH003469.1| Homo sapiens chromosome 22, whole genome shotgun sequence
Length=34001133
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 22555805 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 22555854
>gb|CH471095.1| Homo sapiens 211000035831980 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=20974061
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 17986063 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 17986112
>ref|NW_001838745.1| Homo sapiens chromosome 22 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188372, whole genome shotgun sequence
gb|DS486047.1| Homo sapiens SCAF_1103279188372 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=21026802
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 18009535 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 18009584
>ref|AC_000154.1| Homo sapiens chromosome 22, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000483.1| Homo sapiens chromosome 22, whole genome shotgun sequence
Length=34107095
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 22882402 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 22882451
>gb|CM000273.1| Homo sapiens chromosome 22, whole genome shotgun sequence
Length=35075081
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23719869 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 23719918
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG
>ref|NM_001675.4| Homo sapiens activating transcription factor 4 (ATF4), transcript
variant 1, mRNA
Length=2041
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 87 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 38
>ref|NM_182810.2| Homo sapiens activating transcription factor 4 (ATF4), transcript
variant 2, mRNA
Length=1439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 82 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 33
>gb|BC073754.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:88758 IMAGE:6580199),
complete cds
Length=1417
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 6
>gb|BC022088.2| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:4076 IMAGE:3030097),
complete cds
Length=1429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 16
>gb|BC044895.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:25133 IMAGE:4513828),
complete cds
Length=1429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 1
>gb|BC016855.2| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:17066 IMAGE:3850361),
complete cds
Length=1408
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 9
>emb|AL022312.7| Human DNA sequence from clone RP5-1104E15 on chromosome 22q12.3-13.1,
complete sequence
Length=112460
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61334 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 61285
>dbj|AK057751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25022 fis, clone CBL01850, highly similar
to CYCLIC-AMP-DEPENDENT TRANSCRIPTION FACTOR ATF-4
Length=1418
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 37
>emb|AJ340452.1| Homo sapiens genomic sequence surrounding NotI site, clone NL1-VO2C
Length=680
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 466 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 515
>gb|U03712.1|HSU03712 Human TAXREB67 pseudogene, complete sequence
Length=1442
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 35
>dbj|AK296028.1| Homo sapiens cDNA FLJ58799 complete cds, highly similar to Cyclic
AMP-dependent transcription factor ATF-4
Length=1521
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGG-AGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 38
>gb|BC024775.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:30184 IMAGE:4992862),
complete cds
Length=1421
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGG-AGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 14
>gb|BC008090.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:9337 IMAGE:3454473),
complete cds
Length=1429
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGG-AGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 16
>gb|BC011994.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:10001 IMAGE:3882614),
complete cds
Length=1416
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGG-AGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 14
>emb|Z79837.1| H.sapiens chromosome 22 CpG island DNA genomic Mse1 fragment,
clone 301h9, reverse read 301h9.r
Length=410
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGC-GGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 142
>dbj|D90209.1|HUMTAXREBA Homo sapiens mRNA for DNA binding protein TAXREB67, complete
cds
Length=2015
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 50/51 (98%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGG-AGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 35
>ref|XM_009438329.1| PREDICTED: Pan troglodytes activating transcription factor 4
(ATF4), transcript variant X1, mRNA
Length=1908
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAG 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 570 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGTGCAG 523
>ref|XM_003846210.2| PREDICTED: Pan paniscus activating transcription factor 4 (ATF4),
mRNA
Length=1908
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAG 48
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Sbjct 570 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGTGCAG 523
>ref|NM_001252517.1| Pan troglodytes activating transcription factor 4 (ATF4), mRNA
Length=1422
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Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAG 48
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Sbjct 84 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGTGCAG 37
>emb|AJ338204.1| Homo sapiens genomic sequence surrounding NotI site, clone NL1-FD1R
Length=741
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 49/51 (96%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACAC-GCGCAGAG 50
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Sbjct 466 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGNGAGGAGGGAAAACGCACACCGCGCAGAG 516
>ref|XM_004063500.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla activating transcription factor
4 (tax-responsive enhancer element B67), transcript variant
1 (ATF4), mRNA
Length=1913
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 575 TGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACTTGCAGAG 526
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA
>ref|XM_009438329.1| PREDICTED: Pan troglodytes activating transcription factor 4
(ATF4), transcript variant X1, mRNA
Length=1908
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 1030 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 1079
>ref|XM_003846210.2| PREDICTED: Pan paniscus activating transcription factor 4 (ATF4),
mRNA
Length=1908
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 1030 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 1079
>gb|KJ905692.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15362 ATF4
gene, encodes complete protein
Length=1185
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 327 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 376
>gb|KJ890723.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00117 ATF4
gene, encodes complete protein
Length=1185
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 327 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 376
>ref|NM_001675.4| Homo sapiens activating transcription factor 4 (ATF4), transcript
variant 1, mRNA
Length=2041
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 1149 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 1198
>ref|NM_182810.2| Homo sapiens activating transcription factor 4 (ATF4), transcript
variant 2, mRNA
Length=1439
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 542 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 591
>ref|XM_004063501.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla activating transcription factor
4 (tax-responsive enhancer element B67), transcript variant
2 (ATF4), mRNA
Length=1346
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 468 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 517
>ref|XM_004063500.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla activating transcription factor
4 (tax-responsive enhancer element B67), transcript variant
1 (ATF4), mRNA
Length=1913
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 1035 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 1084
>ref|NM_001252517.1| Pan troglodytes activating transcription factor 4 (ATF4), mRNA
Length=1422
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 544 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 593
>dbj|AB489145.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB9540, Homo sapiens ATF4
gene for activating transcription factor 4, without stop codon,
in Flexi system
Length=1070
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 271 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 320
>dbj|AK296028.1| Homo sapiens cDNA FLJ58799 complete cds, highly similar to Cyclic
AMP-dependent transcription factor ATF-4
Length=1521
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 649 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 698
>emb|CU680155.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017071
3' read ATF4 mRNA
Length=1137
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 809 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 760
>emb|CU680154.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017071
5' read ATF4 mRNA
Length=1194
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 278 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 327
>gb|DQ894942.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009402; FLH179657.01L;
RZPDo839B01131D activating transcription factor 4
(tax-responsive enhancer element B67) (ATF4) gene, encodes complete
protein
Length=1096
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 284 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 333
>gb|DQ891758.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004388; FLH179661.01X; RZPDo839B01132D
activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67) (ATF4) gene, encodes complete protein
Length=1096
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 284 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 333
>emb|CU013230.1| Homo sapiens ATF4, mRNA (cDNA clone IMAGE:100000010), complete
cds, without stop codon, in Gateway system
Length=1087
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 281 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 330
>emb|CU012942.1| Homo sapiens ATF4, mRNA (cDNA clone IMAGE:100000106), complete
cds, with stop codon, in Gateway system
Length=1090
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 281 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 330
>gb|BC073754.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:88758 IMAGE:6580199),
complete cds
Length=1417
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 515 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 564
>gb|BC073990.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:88042 IMAGE:6022488),
complete cds
Length=1396
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 490 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 539
>gb|BC022088.2| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:4076 IMAGE:3030097),
complete cds
Length=1429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 525 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 574
>gb|BC044895.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:25133 IMAGE:4513828),
complete cds
Length=1429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 510 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 559
>gb|BC024775.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:30184 IMAGE:4992862),
complete cds
Length=1421
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 524 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 573
>gb|BC016855.2| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:17066 IMAGE:3850361),
complete cds
Length=1408
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 518 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 567
>gb|BC008090.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:9337 IMAGE:3454473),
complete cds
Length=1429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 526 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 575
>gb|BT008126.1| Synthetic construct Homo sapiens activating transcription factor
4 (tax-responsive enhancer element B67) mRNA, partial cds
Length=1056
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 262 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 311
>emb|AL022312.7| Human DNA sequence from clone RP5-1104E15 on chromosome 22q12.3-13.1,
complete sequence
Length=112460
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 62497 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 62546
>emb|CR456384.1| Homo sapiens ATF4 full length open reading frame (ORF) cDNA clone
(cDNA clone C22ORF:pGEM.ATF4.V4)
Length=1267
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 442 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 491
>emb|CR450353.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H102D
for gene ATF4, activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67); complete cds; without stopcodon
Length=1053
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 311
>dbj|AK057751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25022 fis, clone CBL01850, highly similar
to CYCLIC-AMP-DEPENDENT TRANSCRIPTION FACTOR ATF-4
Length=1418
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 546 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 595
>gb|AY892782.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH012178.01L activating
transcription factor 4 (ATF4) mRNA, partial cds
Length=1056
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 262 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 311
>gb|BC011994.1| Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax-responsive
enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:10001 IMAGE:3882614),
complete cds
Length=1416
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
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Sbjct 524 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 573
>dbj|D90209.1|HUMTAXREBA Homo sapiens mRNA for DNA binding protein TAXREB67, complete
cds
Length=2015
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 1192
>gb|M86842.1|HUMCREB2A Human cAMP response element regulatory protein (CREB2) mRNA,
complete cds
Length=1241
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGA 418
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
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22 22 39916859 39916759 100m GCTTCCCCCTTGGCGGCACCGCCCTGGCCCCAGGCCGCACCCCACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTAC
22 22 39916855 39916755 100m CCCCCTTGGCGGCACCGCCCTGGCCCCAGGCCGCACCCCACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCAC
22 22 39916852 39916752 100m CCTTGGCGGCACCGCCCTGGCCCCAGGCCGCACCCCACCAATCCAAATCCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACACGCCCCGGTACTCACGCC
22 22 39916849 39916749 100m TGGCGGCACCGCCCTGGCCCCAGGCCGCACCCCACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATG
22 22 39916846 39916746 100m CGGCACCGCCCTGGCCCCAGGCCGCACCCCACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCT
22 22 39916842 39916742 100m ACCGCCCTGGCCCCAGGCCGCACCCCACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAT
22 22 39916839 39916739 100m GCCCTGGCCCCAGGCCGCACCCCACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCG
22 22 39916836 39916736 100m CTGGCCCCAGGCCGCACCCCACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTG
22 22 39916833 39916733 100m GCCCCAGGCCGCACCCCACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGG
22 22 39916829 39916729 100m CAGGCCGCACCCCACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTG
22 22 39916826 39916726 100m GCCGCACCCCACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCG
22 22 39916822 39916722 100m CACCCCACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGC
22 22 39916817 39916717 100m CACCAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGC
22 22 39916814 39916714 100m CAATCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTG
22 22 39916811 39916711 100m TCCAAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTG
22 22 39916808 39916708 100m AAAACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCCCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTG
22 22 39916805 39916705 100m ACCCGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTG
22 22 39916802 39916702 100m CGCGCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCG
22 22 39916799 39916699 100m GCCGGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCG
22 22 39916796 39916696 100m GGCCCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCGGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTG
22 22 39916793 39916693 100m CCCAGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAA
22 22 39916790 39916690 100m AGGAGCACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACACCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGG
22 22 39916785 39916685 100m CACAGCTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCTTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAAT
22 22 39916780 39916680 100m CTGGACGACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGC
22 22 39916774 39916674 100m GACCCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGG
22 22 39916771 39916671 100m CCGCCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAATGGCCAATGCTGCCGCGGGCAC
22 22 39916768 39916668 100m CCCCGGTACTCACGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGC
22 22 39916756 39916656 100m CGCCATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGAGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATAC
22 22 39916753 39916653 100m GATGGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGACCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCC
22 22 39916750 39916650 100m GGCTTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTACAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAACGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATG
22 22 39916747 39916647 100m TTAAGCCGCTGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTG
22 22 39916744 39916644 100m AGCCGCTGGGGTTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTCCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCC
22 22 39916741 39916641 100m CGCTGGGGGTGGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTG
22 22 39916738 39916638 100m TGGGGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGAC
22 22 39916735 39916635 100m GGGTTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCT
22 22 39916732 39916632 100m TTGCCGCTGCAGAGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAG
22 22 39916729 39916629 100m CCGCTGCAGAGCCTGGTGCCGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGC
22 22 39916726 39916626 100m CTGCAGAGCCTGGTCCTCCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGG
22 22 39916723 39916623 100m CAGCGCCTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAG
22 22 39916720 39916620 100m AGCCGGGTGCTGCTCCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAG
22 22 39916717 39916617 100m CTGGTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGAAA
22 22 39916714 39916614 100m TTGCTGCTGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAA
22 22 39916711 39916611 100m CTGCTCCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGC
22 22 39916708 39916608 100m CCGCCGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACA
22 22 39916704 39916604 100m CGCCGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCG
22 22 39916701 39916601 100m CGCTGCAAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAG
22 22 39916698 39916598 100m TGCAAAGGCCATTGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAGA
22 22 39916695 39916594 27m1d73m AAAGGCCAATGCTGCCGCAGGCATTGCDTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGGGGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAAC
22 22 39916692 39916592 100m GGCCAATGCTGCCGCAGGCACTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAGAAAACTA
22 22 39916672 39917839 73m39917813F27M CTGCTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTG
22 22 39916669 39917842 70m39917813F30M CTGCCCCTAATACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAACGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGAT
22 22 39916659 39917852 60m39917813F40M TACGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGG
22 22 39916657 39917854 58m39917813F42M CGCCATGGTGGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGT
22 22 39916648 39917863 49m39917813F51M GGCCGTGGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGAC
22 22 39916642 39917869 43m39917813F57M GGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGGA
22 22 39916642 39917869 43m39917813F57M GGACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGGTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAA
22 22 39916640 39917871 41m39917813F59M ACCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAAC
22 22 39916639 39917872 40m39917813F60M CCCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACC
22 22 39916638 39917873 39m39917813F61M CCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG GAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCA
22 22 39916638 39917873 39m39917813F61M CCTGAGGGCGGGGAGGAGGGAAAACACACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGGATAGATGACCTGGAAACCA
22 22 39916628 39917883 29m39917813F71M GGGAGGAGGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGGTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGA
22 22 39916622 39917889 23m39917813F77M AGGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCT
22 22 39916621 39917890 22m39917813F78M GGGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTG
22 22 39916620 39917891 21m39917813F79M GGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAAGGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCAAGCCAGATGACCTTCTGA
22 22 39916620 39917891 21m39917813F79M GGAAAACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGA
22 22 39916616 39917895 17m39917813F83M AACGCACACGCGCAGAG AAAACGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCAC
22 22 39916616 39917895 17m39917813F83M AACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCAC
22 22 39916616 39917895 17m39917813F83M AACGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCGTGCCAGATTACCTTCTGACCAC
22 22 39916614 39917897 15m39917813F85M CGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCACGT
22 22 39916614 39917897 15m39917813F85M CGCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCACGT
22 22 39916613 39917898 14m39917813F86M GCACACGCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCACGTT
22 22 39916607 39917904 8m39917813F92M GCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCACGTTGGATGA
22 22 39916607 39917904 8m39917813F92M GCGCAGAG AAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCACGTTGGATGA
22 22 39916606 39917905 7m39917813F93M CGCAGAG AAAATGGATTTGGAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCACGTTGGATGAC
22 22 39917803 39917903 100M ATGTTGGAGAAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCACGTTGGATG
22 22 39917806 39917906 100M TTGGAGAAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCCCGTTGGATGACA
22 22 39917809 39917909 100M GAGAAAATGGATTTGAAGGAGTTCGACTTGGATGCCCTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCACGTTGGATGACACTT
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22 22 39917845 39917945 100M CTGTTGGGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCACGTTGGATGACACTTGTGATCTCTTTGCCCCCCTAGTCCAGGCGACTAATA
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22 22 39917851 39917951 100M GGTATAGATGACCTGGAAACCATGCCAGATGACCTTCTGACCACGTTGGATGACACTTGTGATCTCTTTGCCCCCCTAGTCCAGGAGACTAATAAGCAGC
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19 pairs
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 76291074 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 76291123
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shotgun sequence
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Lambda K H
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assembly
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>ref|NC_018914.2| Homo sapiens chromosome 3, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001611.2| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 169656407 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 169656456
>ref|NW_004929311.1| Homo sapiens chromosome 3 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 76097848 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 76097897
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shotgun sequence
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 167063527 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 167063576
>gb|GL583009.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_29, whole genome
shotgun sequence
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>gb|DS990653.1| Homo sapiens SCAF_1112675837330 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 24364932 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 24364883
>gb|CH003498.1| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 176687417 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 176687466
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Length=196156484
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Sbjct 167600944 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 167600993
>ref|NW_001838884.2| Homo sapiens chromosome 3 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188385, whole genome shotgun sequence
gb|DS486015.1| Homo sapiens SCAF_1103279188385 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=64955803
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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>gb|CH471052.2| Homo sapiens 211000035835664 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=101945515
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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>ref|AC_000135.1| Homo sapiens chromosome 3, alternate assembly HuRef, whole genome
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gb|CM000464.1| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
Length=195175600
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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>gb|CM000254.1| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG
>ref|XM_010382755.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Sbjct 734 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 783
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mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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>ref|XM_003894850.2| PREDICTED: Papio anubis SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 753 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 802
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 748 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 797
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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>ref|XM_003817671.2| PREDICTED: Pan paniscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 743 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 792
>ref|XM_007972134.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 933 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 982
>ref|XM_005546351.1| PREDICTED: Macaca fascicularis SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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>ref|XM_003256435.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 733 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 782
>ref|XM_004037991.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 733 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 782
>ref|NM_001195502.1| Macaca mulatta SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 697 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 746
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translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 703 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 752
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Sbjct 703 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 752
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MGC:21260 IMAGE:4706586), complete cds
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cds
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Sbjct 696 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 745
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Sbjct 733 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 782
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mRNA
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Sbjct 983 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1032
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Sbjct 797 CAGTGTGGGCGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 846
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Sbjct 651 CAGTGTGGGTGCTGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 700
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Sbjct 651 CAGTGTGGGTGCTGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 700
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(LOC103259691), misc_RNA
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Sbjct 687 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGTTGTTG 736
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Sbjct 706 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 755
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Sbjct 954 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1003
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(S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
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Sbjct 951 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1000
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mRNA
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Sbjct 855 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 904
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mRNA
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Sbjct 760 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 809
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Sbjct 957 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1006
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 644 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 693
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 644 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 693
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(SEC62), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 706 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 755
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(SEC62), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 955 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1004
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variant X2, mRNA
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Sbjct 706 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 755
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variant X1, mRNA
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Sbjct 958 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1007
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mRNA
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Sbjct 962 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1011
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(LOC101325008), mRNA
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Sbjct 65 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 114
>ref|XM_004270568.1| PREDICTED: Orcinus orca SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Sbjct 706 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 755
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mRNA
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Sbjct 962 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1011
>dbj|AK391969.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10038E09, expressed in hypothalamus
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Sbjct 696 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 745
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Sbjct 962 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1011
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Sbjct 681 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 730
>ref|NM_001105305.1| Sus scrofa SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
emb|AM397624.1| Sus scrofa mRNA for translocation protein 1 (TLOC1 gene)
Length=1197
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Sbjct 681 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 730
>dbj|AK230984.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010075C06, expressed in alveolar macrophage
Length=2672
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Sbjct 713 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 762
>ref|XM_007522942.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=1260
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGT 48
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Sbjct 720 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGT 767
>ref|XM_010632464.1| PREDICTED: Fukomys damarensis SEC62 homolog (S. cerevisiae) (Sec62),
mRNA
Length=2546
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 1089 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTTCTTGCTGTTG 1138
>ref|XM_010211765.1| PREDICTED: Tinamus guttatus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2278
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 651 CAGTGTAGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTTCTTGCTGTTG 700
>ref|XM_009673741.1| PREDICTED: Struthio camelus australis SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2291
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 670 CAGTGTAGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTTCTTGCTGTTG 719
>ref|XM_008142278.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
Length=2336
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Sbjct 720 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 769
>ref|XM_008142276.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
Length=1436
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 717 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 766
>ref|XR_505190.1| PREDICTED: Tarsius syrichta translocation protein SEC62 pseudogene
(LOC103273532), misc_RNA
Length=1395
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Sbjct 672 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTGTTCTTCTCCCTGCTGTTG 721
>ref|XM_006736341.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 339 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTTCTTGCTGTTG 388
>ref|XM_006764088.1| PREDICTED: Myotis davidii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
Length=2304
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 693 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 742
>ref|XM_006764087.1| PREDICTED: Myotis davidii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
Length=2392
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 781 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 830
>ref|XM_006088859.1| PREDICTED: Myotis lucifugus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
Length=2307
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 693 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 742
>ref|XM_006088858.1| PREDICTED: Myotis lucifugus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
Length=2332
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 718 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 767
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transcript variant X3, mRNA
Length=2301
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 693 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 742
>ref|XM_005886561.1| PREDICTED: Myotis brandtii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
Length=2307
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 699 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 748
>ref|XM_005886560.1| PREDICTED: Myotis brandtii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
Length=2391
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 783 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 832
>ref|XM_005019616.1| PREDICTED: Anas platyrhynchos SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2267
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 777 CAGTGTAGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTTCTTGCTGTTG 826
>ref|XM_004787725.1| PREDICTED: Mustela putorius furo SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=3710
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 748 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTTCTTGCTGTTG 797
>ref|XM_004756544.1| PREDICTED: Mustela putorius furo SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=3970
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 1009 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTTCTTGCTGTTG 1058
>ref|XM_004393221.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=1425
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Strand=Plus/Plus
Query 2 AGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 707 AGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTTCTTGCTGTTG 755
>gb|BC105971.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
IMAGE:4475515), partial cds
Length=542
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Strand=Plus/Plus
Query 10 TGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 110 TGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 150
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG
>ref|XM_010382755.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=4686
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 90 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 139
>ref|XM_001162878.3| PREDICTED: Pan troglodytes SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=4679
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 158
>ref|XM_003894850.2| PREDICTED: Papio anubis SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2728
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 109 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 158
>ref|XM_008970911.1| PREDICTED: Pan paniscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X3, mRNA
Length=4678
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 104 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 153
>ref|XM_008970910.1| PREDICTED: Pan paniscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
Length=4120
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 99 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 148
>ref|XM_003817671.2| PREDICTED: Pan paniscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
Length=4673
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 99 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 148
>gb|KC005990.1| Homo sapiens SEC62 splice variant mRNA, complete cds
Length=663
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 37 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 86
>ref|XM_003256435.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=5192
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 89 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 138
>ref|XM_004037991.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=6572
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 89 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 138
>ref|NM_001195502.1| Macaca mulatta SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=2601
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 53 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 102
>gb|EU832302.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067331; DKFZo008C0527
translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
Length=1243
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 59 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 108
>gb|EU832386.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067415; DKFZo004C0528
translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
Length=1243
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 59 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 108
>ref|NM_003262.3| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=6541
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 68 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 117
>gb|BC012035.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
MGC:21260 IMAGE:4706586), complete cds
Length=1444
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 52 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 101
>gb|DQ148153.1| Macaca mulatta clone ss1_l15_t7_368 translocation protein 1 (TLOC1)
mRNA, partial cds
Length=429
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 41 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 90
>gb|AC008040.7| Homo sapiens 3 BAC RP11-379K17 (Roswell Park Cancer Institue
Human BAC Library) complete sequence
Length=204917
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127862 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 127813
>dbj|AB024586.2| Homo sapiens HTP1 gene for translocation protein 1, complete
cds
Length=6007
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 1062 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 1111
>emb|CR926121.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459D1710 (from clone DKFZp459D1710)
Length=2366
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 60 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 109
>ref|NM_001134176.1| Pongo abelii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
emb|CR861192.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459E013 (from clone DKFZp459E013)
Length=4661
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 63 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 112
>gb|U93239.1|HSU93239 Human Sec62 (Sec62) mRNA, complete cds
Length=2337
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 49 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 98
>gb|BC105971.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
IMAGE:4475515), partial cds
Length=542
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 151 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 200
>emb|BX648539.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779P0521 (from clone DKFZp779P0521)
Length=4635
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 52 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 101
>emb|BX537668.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686H01109 (from clone DKFZp686H01109)
Length=8359
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8031 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 8080
>gb|BC007040.1| Homo sapiens translocation protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4051378)
Length=530
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 109
>gb|BC003677.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
IMAGE:3932691), partial cds
Length=530
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 60 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 109
>dbj|D87127.1| Homo sapiens mRNA for translocation protein-1, complete cds
Length=2491
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 49 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 98
>ref|XM_008983478.1| PREDICTED: Callithrix jacchus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2626
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 339 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 388
>ref|XM_006232224.2| PREDICTED: Rattus norvegicus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (Sec62),
transcript variant X1, mRNA
Length=2580
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 280 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 329
>ref|XM_008705353.1| PREDICTED: Ursus maritimus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=3590
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 94 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 143
>ref|XM_007972134.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2840
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 GAAGTTGGTGAACCGTCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 338
>ref|XM_007077103.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=3688
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 85 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 134
>ref|XM_003991924.2| PREDICTED: Felis catus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=3693
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 85 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 134
>ref|XM_006910818.1| PREDICTED: Pteropus alecto SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Sbjct 116 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 165
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 19 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 68
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 97 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 146
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 464 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 513
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(Sec62), mRNA
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Sbjct 245 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 294
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 71 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 120
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 77 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 126
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(Sec62), mRNA
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Sbjct 178 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 227
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(Sec62), mRNA
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Sbjct 7 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 56
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 104 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 153
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 365 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 414
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mRNA
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Sbjct 180 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 229
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(LOC100477650), mRNA
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Sbjct 67 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 116
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Sbjct 57 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 106
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gb|AY325207.1| Rattus norvegicus Ab2-292 mRNA, complete cds
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Sbjct 698 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 747
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1 AAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAAGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 49
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transcript variant X1, mRNA
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Query 2 AAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 1 AAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAAGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 49
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mRNA
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Sbjct 445 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCCGTAGCCAAGTATCTTCG 494
>ref|XM_008576143.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Sbjct 153 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCTAAGTATCTTCG 202
>ref|XM_008051774.1| PREDICTED: Tarsius syrichta SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 7 GAAGTCGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 56
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 7 GAAGTCGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 56
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 62 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 111
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 310 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 359
>ref|XM_007197532.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni SEC62 homolog
(S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
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Sbjct 307 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 356
>ref|XM_006055957.1| PREDICTED: Bubalus bubalis SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Sbjct 211 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 260
>ref|XM_007115655.1| PREDICTED: Physeter catodon SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 220 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 269
>ref|XM_007115654.1| PREDICTED: Physeter catodon SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 310 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 359
>ref|XM_006535534.1| PREDICTED: Mus musculus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (Sec62),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 622 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 671
>ref|XM_005908154.1| PREDICTED: Bos mutus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 62 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 111
>ref|XM_005908153.1| PREDICTED: Bos mutus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 314 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 363
>ref|XM_005386094.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera translocation protein SEC62-like
(LOC102021462), mRNA
Length=2309
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Sbjct 52 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAAGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 101
>ref|XM_005382963.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(Sec62), transcript variant X3, mRNA
Length=2653
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Sbjct 90 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAAGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 139
>ref|XM_005382962.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(Sec62), transcript variant X2, mRNA
Length=2670
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Sbjct 107 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAAGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 156
>ref|XM_005382961.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(Sec62), transcript variant X1, mRNA
Length=2652
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Sbjct 89 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAAGCTGTAGCCAAGTATCTTCG 138
>ref|XM_004424758.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=1447
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Sbjct 62 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 111
>ref|XM_004323576.1| PREDICTED: Tursiops truncatus translocation protein SEC62-like
(LOC101331299), mRNA
Length=656
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 66 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 115
>ref|XM_004270568.1| PREDICTED: Orcinus orca SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=1424
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 62 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 111
>dbj|AK391969.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10038E09, expressed in hypothalamus
Length=2190
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 52 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 101
>ref|NM_001205604.1| Bos taurus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=3921
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 318 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 367
>gb|DQ886440.1| Sus scrofa translocation protein 1 mRNA, complete cds
Length=1197
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 37 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 86
>ref|NM_001105305.1| Sus scrofa SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
emb|AM397624.1| Sus scrofa mRNA for translocation protein 1 (TLOC1 gene)
Length=1197
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 37 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 86
>dbj|AK230984.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010075C06, expressed in alveolar macrophage
Length=2672
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 68 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 117
>gb|BC067202.1| Mus musculus SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
MGC:70047 IMAGE:6332701), complete cds
Length=2430
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 44 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 93
>gb|BC017162.1| Mus musculus SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
IMAGE:4485281), partial cds
Length=883
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 510 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 559
>ref|NM_027016.2| Mus musculus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (Sec62), mRNA
Length=3966
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 509 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 558
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Sbjct 127948 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 127997
>gb|AC130842.5| Mus musculus BAC clone RP24-448N19 from chromosome 3, complete
sequence
Length=184249
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 96727 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 96678
>dbj|AK088093.1| Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:E430004A04 product:TRANSLOCATIONAL
PROTEIN-1 (SIMILAR TO TRANSLOCATION PROTEIN 1) homolog
[Homo sapiens], full insert sequence
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Sbjct 58 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 107
>dbj|AK090078.1| Mus musculus CRL-2116 JC cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:G430093G17 product:TRANSLOCATIONAL PROTEIN-1 (SIMILAR
TO TRANSLOCATION PROTEIN 1) homolog [Homo sapiens], full
insert sequence
Length=2336
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 59 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 108
>dbj|AK013922.1| Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:3100002M17 product:hypothetical protein,
full insert sequence
Length=684
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
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Sbjct 324 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 373
>gb|BC048532.1| Mus musculus translocation protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6545004)
Length=370
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 59 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 108
>gb|BC108162.1| Bos taurus SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:8049559),
partial cds
Length=374
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Sbjct 69 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAGTTTCTTCG 118
>gb|BC071243.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:6467799, containing frame-shift
errors
Length=2353
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 59 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 108
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Sbjct 46 GAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 95
>ref|XM_004704235.1| PREDICTED: Echinops telfairi SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Query 4 GTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTGGCCAAGTATCTTCG 50
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Sbjct 57 GTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGAAGGCTGTAGCCAAATATCTTCG 103
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Lambda K H
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genome shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188385, whole genome shotgun sequence
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sequence
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>ref|AC_000135.1| Homo sapiens chromosome 3, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
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right flanking sequence - CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG
>ref|XM_001162878.3| PREDICTED: Pan troglodytes SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Sbjct 218 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 267
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 213 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 262
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 208 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 257
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 208 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 257
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Sbjct 146 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 195
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 198 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 247
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 198 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 247
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translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
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Sbjct 168 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 217
>gb|EU832386.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067415; DKFZo004C0528
translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
Length=1243
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Sbjct 168 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 217
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Sbjct 177 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 226
>gb|BC012035.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
MGC:21260 IMAGE:4706586), complete cds
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Sbjct 161 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 210
>gb|AC008040.7| Homo sapiens 3 BAC RP11-379K17 (Roswell Park Cancer Institue
Human BAC Library) complete sequence
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Sbjct 126524 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 126475
>dbj|AB024586.2| Homo sapiens HTP1 gene for translocation protein 1, complete
cds
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Sbjct 1876 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 1925
>emb|CR926121.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459D1710 (from clone DKFZp459D1710)
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Sbjct 169 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 218
>ref|NM_001134176.1| Pongo abelii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
emb|CR861192.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459E013 (from clone DKFZp459E013)
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Sbjct 172 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 221
>gb|U93239.1|HSU93239 Human Sec62 (Sec62) mRNA, complete cds
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Sbjct 158 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 207
>gb|BC105971.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
IMAGE:4475515), partial cds
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Sbjct 260 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 309
>emb|BX648539.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779P0521 (from clone DKFZp779P0521)
Length=4635
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Sbjct 161 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 210
>gb|BC007040.1| Homo sapiens translocation protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4051378)
Length=530
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 169 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 218
>gb|BC003677.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
IMAGE:3932691), partial cds
Length=530
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 169 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 218
>dbj|D87127.1| Homo sapiens mRNA for translocation protein-1, complete cds
Length=2491
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 158 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 207
>ref|XM_003924954.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis SEC62 homolog (S.
cerevisiae) (SEC62), mRNA
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 198 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 247
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(SEC62), mRNA
Length=4686
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Sbjct 199 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 248
>ref|XM_003894850.2| PREDICTED: Papio anubis SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Sbjct 218 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 267
>ref|XM_008983478.1| PREDICTED: Callithrix jacchus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2626
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 448 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 497
>ref|XM_007972134.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2840
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 398 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 447
>ref|XM_005546351.1| PREDICTED: Macaca fascicularis SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=3787
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Sbjct 573 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 622
>ref|NM_001195502.1| Macaca mulatta SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=2601
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 162 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 211
>gb|DQ148153.1| Macaca mulatta clone ss1_l15_t7_368 translocation protein 1 (TLOC1)
mRNA, partial cds
Length=429
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 150 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 199
>ref|XM_008705353.1| PREDICTED: Ursus maritimus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Sbjct 203 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 252
>ref|XM_008576143.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 262 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 311
>ref|XM_008531048.1| PREDICTED: Equus przewalskii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2725
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Sbjct 213 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 262
>ref|XM_008266466.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2584
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Sbjct 410 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 459
>ref|XM_008142278.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 185 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 234
>ref|XM_008142276.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
Length=1436
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 182 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 231
>ref|XM_007522942.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=1260
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 185 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 234
>ref|XM_007077103.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=3688
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 194 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 243
>ref|XM_003991924.2| PREDICTED: Felis catus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=3693
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 194 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 243
>ref|XM_006861820.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2336
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 185 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 234
>ref|XM_006890365.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=1201
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 107 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 156
>ref|XM_006736341.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2277
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 128 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 177
>ref|XM_006764088.1| PREDICTED: Myotis davidii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
Length=2304
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 158 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 207
>ref|XM_006764087.1| PREDICTED: Myotis davidii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
Length=2392
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 246 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 295
>ref|XM_006200823.1| PREDICTED: Vicugna pacos SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2579
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 422 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 471
>ref|XM_006188072.1| PREDICTED: Camelus ferus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
Length=1362
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 109 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 158
>ref|XM_006188071.1| PREDICTED: Camelus ferus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
Length=2258
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 158 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 207
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 183 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 232
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Sbjct 158 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 207
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 248 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 297
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 206 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 255
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Sbjct 386 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 435
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 213 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 262
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 474 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 523
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Sbjct 163 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 212
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Sbjct 163 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 212
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mRNA
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Sbjct 163 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 212
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 217 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 266
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 171 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 220
>ref|XM_004393221.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Sbjct 171 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 220
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Sbjct 161 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 210
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(LOC100477650), mRNA
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Sbjct 176 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 225
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Sbjct 146 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 195
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emb|AM397624.1| Sus scrofa mRNA for translocation protein 1 (TLOC1 gene)
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Sbjct 146 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 195
>dbj|AK230984.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010075C06, expressed in alveolar macrophage
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG
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(SEC62), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 835 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 884
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variant X2, mRNA
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Sbjct 586 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 635
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variant X1, mRNA
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Sbjct 988 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 1037
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 628 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 677
>ref|XM_004756544.1| PREDICTED: Mustela putorius furo SEC62 homolog (S. cerevisiae)
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Sbjct 889 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 938
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Sbjct 578 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 627
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Sbjct 578 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 627
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Sbjct 586 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 635
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 586 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 635
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 613 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 662
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 613 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 662
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mRNA
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Sbjct 842 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 891
>ref|XM_003794655.1| PREDICTED: Otolemur garnettii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
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Sbjct 578 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 627
>dbj|AK391969.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10038E09, expressed in hypothalamus
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Sbjct 576 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 625
>ref|XM_002920845.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca translocation protein SEC62-like
(LOC100477650), mRNA
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
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Sbjct 591 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 640
>ref|NM_001205604.1| Bos taurus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
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Sbjct 842 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 891
>gb|DQ886440.1| Sus scrofa translocation protein 1 mRNA, complete cds
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Sbjct 561 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 610
>gb|EU832302.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067331; DKFZo008C0527
translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
Length=1243
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Sbjct 583 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 632
>gb|EU832386.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067415; DKFZo004C0528
translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
Length=1243
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
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Sbjct 583 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 632
>ref|NM_001105305.1| Sus scrofa SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
emb|AM397624.1| Sus scrofa mRNA for translocation protein 1 (TLOC1 gene)
Length=1197
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
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Sbjct 561 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 610
>dbj|AK230984.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010075C06, expressed in alveolar macrophage
Length=2672
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
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Sbjct 593 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 642
>ref|NM_003262.3| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=6541
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Sbjct 576 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 625
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Human BAC Library) complete sequence
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cds
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mRNA
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mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 531 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATCCTTG 580
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 608 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 657
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 591 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 640
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 586 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATCCTTG 635
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 834 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATCCTTG 883
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(Sec62), mRNA
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Sbjct 687 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 736
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transcript variant X1, mRNA
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mRNA
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Sbjct 837 GATCTATGACCCAGTTCACTTCAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 886
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 524 GATCTATGACCCAGTTCACTTCAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 573
>ref|XM_006188071.1| PREDICTED: Camelus ferus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 524 GATCTATGACCCAGTTCACTTCAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 573
>ref|XM_005602096.1| PREDICTED: Equus caballus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Sbjct 801 GATCTATGACCCAGTTCACTTCAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 850
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(LOC102021462), mRNA
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Sbjct 576 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 625
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(Sec62), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 614 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 663
>ref|XM_005382962.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(Sec62), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 631 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 680
>ref|XM_005382961.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(Sec62), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 613 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 662
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(Sec62), mRNA
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Sbjct 769 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 818
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(Sec62), mRNA
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Sbjct 600 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 649
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(Sec62), mRNA
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Sbjct 1119 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 1168
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 595 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 644
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 601 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 650
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(LOC101331299), mRNA
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Sbjct 590 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATCCTTG 639
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mRNA
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Sbjct 586 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATCCTTG 635
>gb|BC067202.1| Mus musculus SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
MGC:70047 IMAGE:6332701), complete cds
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Sbjct 568 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 617
>gb|BC023720.1| Mus musculus SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
IMAGE:5347105), partial cds
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Sbjct 248 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 297
>ref|NM_001034129.1| Rattus norvegicus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (Sec62), mRNA
gb|AY325207.1| Rattus norvegicus Ab2-292 mRNA, complete cds
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Sbjct 1222 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 1271
>ref|NM_027016.2| Mus musculus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (Sec62), mRNA
Length=3966
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Sbjct 1033 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 1082
>gb|AC158135.5| Mus musculus chromosome 3, clone RP24-393I15, complete sequence
Length=191562
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Sbjct 140124 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 140173
>gb|AC130842.5| Mus musculus BAC clone RP24-448N19 from chromosome 3, complete
sequence
Length=184249
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Sbjct 84552 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 84503
>dbj|AK088093.1| Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:E430004A04 product:TRANSLOCATIONAL
PROTEIN-1 (SIMILAR TO TRANSLOCATION PROTEIN 1) homolog
[Homo sapiens], full insert sequence
Length=2332
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Sbjct 582 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 631
>dbj|AK090078.1| Mus musculus CRL-2116 JC cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:G430093G17 product:TRANSLOCATIONAL PROTEIN-1 (SIMILAR
TO TRANSLOCATION PROTEIN 1) homolog [Homo sapiens], full
insert sequence
Length=2336
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
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Sbjct 583 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 632
>gb|BC071243.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:6467799, containing frame-shift
errors
Length=2353
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 633
>gb|BC053504.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:6394089
Length=2466
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
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Sbjct 571 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 620
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mRNA
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCT 48
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Sbjct 918 GATCTATGACCCAGTTCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCT 965
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mRNA
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
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Sbjct 969 GATCTATGACCCAGTGCACATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 1018
>ref|XM_007077103.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Sbjct 609 GATATATGACCCGGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 658
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mRNA
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 609 GATATATGACCCGGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 658
>ref|XM_004834575.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(Sec62), mRNA
Length=3058
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
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Sbjct 702 GATCTATGACCCAGTTCATATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 751
>ref|XM_004882986.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(Sec62), mRNA
Length=1690
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
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Sbjct 531 GATCTATGACCCAGTTCATATTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 580
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
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Sbjct 524 GATTTATGACCCAGTCCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 573
>ref|XM_004618879.1| PREDICTED: Sorex araneus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GATCTATGACCCAGTTCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 50
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524 GATTTATGACCCAGTCCACTTTAAAACATTTGTCATGGGATTAATTCTTG 573
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG
>ref|XM_001162878.3| PREDICTED: Pan troglodytes SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=4679
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 218 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 267
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transcript variant X3, mRNA
Length=4678
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 213 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 262
>ref|XM_008970910.1| PREDICTED: Pan paniscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 208 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 257
>ref|XM_003817671.2| PREDICTED: Pan paniscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 208 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 257
>gb|KC005990.1| Homo sapiens SEC62 splice variant mRNA, complete cds
Length=663
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 146 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 195
>ref|XM_003256435.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=5192
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 198 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 247
>ref|XM_004037991.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=6572
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 198 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 247
>gb|EU832302.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067331; DKFZo008C0527
translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
Length=1243
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 168 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 217
>gb|EU832386.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067415; DKFZo004C0528
translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
Length=1243
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 168 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 217
>ref|NM_003262.3| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=6541
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 177 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 226
>gb|BC012035.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
MGC:21260 IMAGE:4706586), complete cds
Length=1444
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 161 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 210
>gb|AC008040.7| Homo sapiens 3 BAC RP11-379K17 (Roswell Park Cancer Institue
Human BAC Library) complete sequence
Length=204917
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 126524 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 126475
>dbj|AB024586.2| Homo sapiens HTP1 gene for translocation protein 1, complete
cds
Length=6007
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 1876 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 1925
>emb|CR926121.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459D1710 (from clone DKFZp459D1710)
Length=2366
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 169 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 218
>ref|NM_001134176.1| Pongo abelii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
emb|CR861192.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459E013 (from clone DKFZp459E013)
Length=4661
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 172 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 221
>gb|U93239.1|HSU93239 Human Sec62 (Sec62) mRNA, complete cds
Length=2337
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 207
>gb|BC105971.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
IMAGE:4475515), partial cds
Length=542
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 260 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 309
>emb|BX648539.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779P0521 (from clone DKFZp779P0521)
Length=4635
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 161 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 210
>gb|BC007040.1| Homo sapiens translocation protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4051378)
Length=530
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 218
>gb|BC003677.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
IMAGE:3932691), partial cds
Length=530
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 218
>dbj|D87127.1| Homo sapiens mRNA for translocation protein-1, complete cds
Length=2491
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 207
>ref|XM_003924954.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis SEC62 homolog (S.
cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=4648
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 198 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 247
>ref|XM_010382755.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=4686
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 248
>ref|XM_003894850.2| PREDICTED: Papio anubis SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2728
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 267
>ref|XM_008983478.1| PREDICTED: Callithrix jacchus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2626
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 497
>ref|XM_007972134.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2840
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 447
>ref|XM_005546351.1| PREDICTED: Macaca fascicularis SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=3787
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 622
>ref|NM_001195502.1| Macaca mulatta SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=2601
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 211
>gb|DQ148153.1| Macaca mulatta clone ss1_l15_t7_368 translocation protein 1 (TLOC1)
mRNA, partial cds
Length=429
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 150 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 199
>ref|XM_008705353.1| PREDICTED: Ursus maritimus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=3590
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 252
>ref|XM_008576143.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2457
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 311
>ref|XM_008531048.1| PREDICTED: Equus przewalskii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2725
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 262
>ref|XM_008266466.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2584
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 459
>ref|XM_008142278.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
Length=2336
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 234
>ref|XM_008142276.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
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(SEC62), mRNA
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 171 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 220
>ref|XM_004393221.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Sbjct 171 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 220
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>ref|NM_001105305.1| Sus scrofa SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
emb|AM397624.1| Sus scrofa mRNA for translocation protein 1 (TLOC1 gene)
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Sbjct 146 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 195
>dbj|AK230984.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010075C06, expressed in alveolar macrophage
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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>gb|GL583009.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_29, whole genome
shotgun sequence
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>gb|DS990653.1| Homo sapiens SCAF_1112675837330 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 167602282 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 167602331
>ref|NW_001838884.2| Homo sapiens chromosome 3 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188385, whole genome shotgun sequence
gb|DS486015.1| Homo sapiens SCAF_1103279188385 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 24364101 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 24364052
>gb|CH471052.2| Homo sapiens 211000035835664 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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>ref|AC_000135.1| Homo sapiens chromosome 3, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000464.1| Homo sapiens chromosome 3, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 167064930 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 167064979
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG
>ref|XM_010382755.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Sbjct 734 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 783
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mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 753 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 802
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mRNA
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Sbjct 753 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 802
>ref|XM_008970911.1| PREDICTED: Pan paniscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 748 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 797
>ref|XM_008970910.1| PREDICTED: Pan paniscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 743 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 792
>ref|XM_003817671.2| PREDICTED: Pan paniscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
Length=4673
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 743 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 792
>ref|XM_007972134.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 933 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 982
>ref|XM_005546351.1| PREDICTED: Macaca fascicularis SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 1108 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1157
>ref|XM_003256435.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=5192
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 733 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 782
>ref|XM_004037991.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=6572
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 733 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 782
>ref|NM_001195502.1| Macaca mulatta SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=2601
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 697 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 746
>gb|EU832302.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067331; DKFZo008C0527
translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
Length=1243
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 703 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 752
>gb|EU832386.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067415; DKFZo004C0528
translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
Length=1243
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 703 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 752
>ref|NM_003262.3| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=6541
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 712 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 761
>gb|BC012035.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
MGC:21260 IMAGE:4706586), complete cds
Length=1444
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 696 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 745
>gb|AC008040.7| Homo sapiens 3 BAC RP11-379K17 (Roswell Park Cancer Institue
Human BAC Library) complete sequence
Length=204917
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 115160 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 115111
>dbj|AB024586.2| Homo sapiens HTP1 gene for translocation protein 1, complete
cds
Length=6007
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 4190 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 4239
>emb|CR926121.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459D1710 (from clone DKFZp459D1710)
Length=2366
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 705 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 754
>ref|NM_001134176.1| Pongo abelii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
emb|CR861192.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459E013 (from clone DKFZp459E013)
Length=4661
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 707 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 756
>gb|U93239.1|HSU93239 Human Sec62 (Sec62) mRNA, complete cds
Length=2337
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 693 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 742
>emb|BX648539.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779P0521 (from clone DKFZp779P0521)
Length=4635
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 696 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 745
>dbj|D87127.1| Homo sapiens mRNA for translocation protein-1, complete cds
Length=2491
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 693 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 742
>ref|XM_003924954.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis SEC62 homolog (S.
cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=4648
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 733 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 782
>ref|XM_008983478.1| PREDICTED: Callithrix jacchus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2626
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 983 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1032
>ref|XM_008576143.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2457
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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(S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
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mRNA
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(SEC62), transcript variant X2, mRNA
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(SEC62), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 706 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 755
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variant X1, mRNA
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Sbjct 958 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1007
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mRNA
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Sbjct 962 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1011
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(LOC101325008), mRNA
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mRNA
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Sbjct 706 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 755
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mRNA
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Sbjct 962 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1011
>dbj|AK391969.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10038E09, expressed in hypothalamus
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Sbjct 696 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 745
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Sbjct 962 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 1011
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emb|AM397624.1| Sus scrofa mRNA for translocation protein 1 (TLOC1 gene)
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Sbjct 681 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 730
>dbj|AK230984.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010075C06, expressed in alveolar macrophage
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 713 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGTTG 762
>ref|XM_007522942.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Sbjct 720 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTGT 767
>ref|XM_010632464.1| PREDICTED: Fukomys damarensis SEC62 homolog (S. cerevisiae) (Sec62),
mRNA
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Sbjct 1089 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTTCTTGCTGTTG 1138
>ref|XM_010211765.1| PREDICTED: Tinamus guttatus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 651 CAGTGTAGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTTCTTGCTGTTG 700
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 670 CAGTGTAGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTTCTTGCTGTTG 719
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 720 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 769
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 717 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 766
>ref|XR_505190.1| PREDICTED: Tarsius syrichta translocation protein SEC62 pseudogene
(LOC103273532), misc_RNA
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Sbjct 672 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTGTTCTTCTCCCTGCTGTTG 721
>ref|XM_006736341.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Sbjct 339 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTTCTTGCTGTTG 388
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 693 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 742
>ref|XM_006764087.1| PREDICTED: Myotis davidii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 781 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 830
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 693 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 742
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transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 718 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 767
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 693 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 742
>ref|XM_005886561.1| PREDICTED: Myotis brandtii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 699 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 748
>ref|XM_005886560.1| PREDICTED: Myotis brandtii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 783 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTCCTTGCTATTG 832
>ref|XM_005019616.1| PREDICTED: Anas platyrhynchos SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 777 CAGTGTAGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTTCTTGCTGTTG 826
>ref|XM_004787725.1| PREDICTED: Mustela putorius furo SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 748 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTTCTTGCTGTTG 797
>ref|XM_004756544.1| PREDICTED: Mustela putorius furo SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=3970
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Query 1 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 1009 CAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTTCTTGCTGTTG 1058
>ref|XM_004393221.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=1425
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Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
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Query 2 AGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 707 AGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGCATTCTTCTTCTTGCTGTTG 755
>gb|BC105971.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
IMAGE:4475515), partial cds
Length=542
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Query 10 TGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 50
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Sbjct 110 TGCAGGCTGTTTTGTAGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTG 150
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG
>ref|XM_001162878.3| PREDICTED: Pan troglodytes SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Sbjct 218 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 267
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transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 213 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 262
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 208 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 257
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 208 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 257
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Sbjct 146 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 195
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 198 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 247
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(SEC62), mRNA
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Sbjct 198 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 247
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translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
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Sbjct 168 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 217
>gb|EU832386.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067415; DKFZo004C0528
translocation protein 1 protein (TLOC1) gene, encodes
complete protein
Length=1243
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Sbjct 168 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 217
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Sbjct 177 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 226
>gb|BC012035.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
MGC:21260 IMAGE:4706586), complete cds
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Sbjct 161 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 210
>gb|AC008040.7| Homo sapiens 3 BAC RP11-379K17 (Roswell Park Cancer Institue
Human BAC Library) complete sequence
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Sbjct 126524 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 126475
>dbj|AB024586.2| Homo sapiens HTP1 gene for translocation protein 1, complete
cds
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Sbjct 1876 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 1925
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Sbjct 169 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 218
>ref|NM_001134176.1| Pongo abelii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
emb|CR861192.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459E013 (from clone DKFZp459E013)
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Sbjct 172 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 221
>gb|U93239.1|HSU93239 Human Sec62 (Sec62) mRNA, complete cds
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Sbjct 158 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 207
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IMAGE:4475515), partial cds
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Sbjct 260 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 309
>emb|BX648539.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp779P0521 (from clone DKFZp779P0521)
Length=4635
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 161 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 210
>gb|BC007040.1| Homo sapiens translocation protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4051378)
Length=530
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 169 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 218
>gb|BC003677.1| Homo sapiens SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone
IMAGE:3932691), partial cds
Length=530
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 169 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 218
>dbj|D87127.1| Homo sapiens mRNA for translocation protein-1, complete cds
Length=2491
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 158 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 207
>ref|XM_003924954.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis SEC62 homolog (S.
cerevisiae) (SEC62), mRNA
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 198 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 247
>ref|XM_010382755.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=4686
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 199 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 248
>ref|XM_003894850.2| PREDICTED: Papio anubis SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2728
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 218 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 267
>ref|XM_008983478.1| PREDICTED: Callithrix jacchus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2626
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 448 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 497
>ref|XM_007972134.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2840
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 398 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 447
>ref|XM_005546351.1| PREDICTED: Macaca fascicularis SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=3787
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Sbjct 573 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 622
>ref|NM_001195502.1| Macaca mulatta SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62), mRNA
Length=2601
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 162 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 211
>gb|DQ148153.1| Macaca mulatta clone ss1_l15_t7_368 translocation protein 1 (TLOC1)
mRNA, partial cds
Length=429
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Sbjct 150 CTTCAAAAGCAGTGGATTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 199
>ref|XM_008705353.1| PREDICTED: Ursus maritimus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
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Sbjct 203 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 252
>ref|XM_008576143.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 262 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 311
>ref|XM_008531048.1| PREDICTED: Equus przewalskii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2725
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Sbjct 213 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 262
>ref|XM_008266466.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2584
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 410 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 459
>ref|XM_008142278.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 185 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 234
>ref|XM_008142276.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
Length=1436
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 182 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 231
>ref|XM_007522942.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 185 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 234
>ref|XM_007077103.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=3688
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 194 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 243
>ref|XM_003991924.2| PREDICTED: Felis catus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=3693
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 194 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 243
>ref|XM_006861820.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2336
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 185 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 234
>ref|XM_006890365.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=1201
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 107 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 156
>ref|XM_006736341.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii SEC62 homolog (S. cerevisiae)
(SEC62), mRNA
Length=2277
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 128 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 177
>ref|XM_006764088.1| PREDICTED: Myotis davidii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
Length=2304
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 158 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 207
>ref|XM_006764087.1| PREDICTED: Myotis davidii SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
Length=2392
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 246 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 295
>ref|XM_006200823.1| PREDICTED: Vicugna pacos SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
mRNA
Length=2579
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 422 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 471
>ref|XM_006188072.1| PREDICTED: Camelus ferus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X2, mRNA
Length=1362
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 CTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 50
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Sbjct 109 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 158
>ref|XM_006188071.1| PREDICTED: Camelus ferus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (SEC62),
transcript variant X1, mRNA
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(SEC62), mRNA
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(SEC62), mRNA
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(LOC100477650), mRNA
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Sbjct 146 CTTCAAAAGCAGTGGATTGCCTTTTGGATTCAAAGTGGGCAAAGGCCAAG 195
>dbj|AK230984.1| Sus scrofa mRNA, clone:AMP010075C06, expressed in alveolar macrophage
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Sbjct 150583879 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 150583928
>ref|NT_016354.20| Homo sapiens chromosome 4 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR4_CTG12
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assembly
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>ref|NC_018915.2| Homo sapiens chromosome 4, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001612.2| Homo sapiens chromosome 4, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 50
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Sbjct 151481489 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 151481538
>ref|NW_004929320.1| Homo sapiens chromosome 4 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150104.1| Homo sapiens chromosome 4 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 91656291 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 91656340
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shotgun sequence
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Sbjct 18715553 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 18715602
>gb|GL582996.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_16, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 6294244 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 6294293
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Sbjct 148373993 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGGG-CTGGGCGACCGGCT 148374041
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG
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(MAB21L2), mRNA
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>ref|XM_001151747.2| PREDICTED: Pan troglodytes mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
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Sbjct 1801 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 1752
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mRNA
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Sbjct 1793 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 1744
>ref|XM_003899260.2| PREDICTED: Papio anubis mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 6731 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 6682
>ref|XM_009207692.1| PREDICTED: Papio anubis mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 7750 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 7701
>ref|XM_003815862.2| PREDICTED: Pan paniscus mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
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Sbjct 1795 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 1746
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 762 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 713
>ref|XM_007999967.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2482 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 2433
>ref|XM_007999966.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
transcript variant X1, mRNA
Length=3563
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Sbjct 2591 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 2542
>ref|XM_004040480.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla mab-21-like 2 (C. elegans)
(MAB21L2), mRNA
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Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 1802 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 1753
>ref|NG_032855.1| Homo sapiens LPS-responsive vesicle trafficking, beach and anchor
containing (LRBA), RefSeqGene on chromosome 4
Length=757839
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Sbjct 436772 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 436821
>gb|HQ448192.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100071588; CCSB006694_03
mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2) gene, encodes
complete protein
Length=1179
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Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 747 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 698
>ref|XM_001082398.2| PREDICTED: Macaca mulatta mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
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Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 1785 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 1736
>ref|NM_006439.4| Homo sapiens mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2), mRNA
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Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 1802 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 1753
>ref|NM_001283399.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101867053 (LOC101867053),
mRNA
dbj|AB173786.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10236, similar to
human mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2), mRNA, RefSeq: NM_006439.3
Length=2224
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Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 743 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 694
>gb|AC110813.4| Homo sapiens BAC clone RP11-1336O20 from 4, complete sequence
Length=117167
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Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 7574 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 7525
>dbj|AK055665.1| Homo sapiens cDNA FLJ31103 fis, clone IMR322000072, highly similar
to Homo sapiens mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
Length=2540
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 1576 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 1527
>gb|AF370007.1|AF370007 Homo sapiens MAB21L2 protein mRNA, complete cds
Length=1127
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 703 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 654
>gb|AF262032.1|AF262032 Homo sapiens MAB21L2 protein (MAB21L2) mRNA, complete cds
Length=2494
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 1452 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 1403
>gb|BC009983.2| Homo sapiens mab-21-like 2 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:15078
IMAGE:4125321), complete cds
Length=2282
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Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 1300 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 1251
>gb|AF155219.1|AF155219 Homo sapiens MAB21L2 (MAB21L2) gene, complete cds
Length=1382
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 894 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 845
>ref|XM_008267347.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
Length=2693
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Strand=Plus/Minus
Query 3 AGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 1717 AGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 1670
>ref|XM_003257793.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
Length=2763
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 1793 GTAGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGTGAG 1744
>ref|XM_005440895.1| PREDICTED: Falco cherrug mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
Length=1193
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 AGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 780 AGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCCGTCAGCGAG 733
>ref|XM_005243333.1| PREDICTED: Falco peregrinus mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
Length=1193
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 AGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 780 AGCACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCCGTCAGCGAG 733
>ref|XM_008426291.1| PREDICTED: Poecilia reticulata mab-21-like 1 (C. elegans) (mab21l1),
mRNA
Length=1878
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 CACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 1089 CACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGTTCAGCGAG 1044
>ref|XM_007568655.1| PREDICTED: Poecilia formosa mab-21-like 1 (C. elegans) (mab21l1),
mRNA
Length=2229
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 CACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 1044 CACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGTTCAGCGAG 999
>ref|XM_005796808.1| PREDICTED: Xiphophorus maculatus protein mab-21-like 1-like (LOC102232952),
mRNA
Length=2172
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Strand=Plus/Minus
Query 5 CACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGGTCAGCGAG 50
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Sbjct 1024 CACCCAGGCGTCGCTCTCTGCCGAGCTCTGCTTGCCGTTCAGCGAG 979
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT
>ref|XM_001151747.2| PREDICTED: Pan troglodytes mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
Length=2776
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 50
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Sbjct 1954 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 2003
>ref|XM_003815862.2| PREDICTED: Pan paniscus mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
Length=2769
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 50
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Sbjct 1948 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 1997
>gb|KJ893084.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_02478 MAB21L2
gene, encodes complete protein
Length=1209
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 50
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Sbjct 915 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 964
>ref|XM_004040480.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla mab-21-like 2 (C. elegans)
(MAB21L2), mRNA
Length=2783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 50
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Sbjct 1955 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 2004
>ref|NG_032855.1| Homo sapiens LPS-responsive vesicle trafficking, beach and anchor
containing (LRBA), RefSeqGene on chromosome 4
Length=757839
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 50
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Sbjct 436619 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 436570
>ref|XM_003257793.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
Length=2763
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 50
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Sbjct 1946 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 1995
>gb|HQ448192.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100071588; CCSB006694_03
mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2) gene, encodes
complete protein
Length=1179
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 50
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Sbjct 900 AAACACCCACGAGAAACGGACTGGGACGAGTCGTGCCTGGGCGACCGGCT 949
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dbj|AB173786.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10236, similar to
human mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2), mRNA, RefSeq: NM_006439.3
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HuRef SCAF_1103279188415, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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(MAB21L2), mRNA
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>ref|XM_001151747.2| PREDICTED: Pan troglodytes mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2),
mRNA
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(MAB21L2), mRNA
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Sbjct 2352 ACCCAACCAAAACAAATCACATTCTTGCACAAAAGTGATCGTTTTCTTCC 2401
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IMAGE:4125321), complete cds
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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mRNA
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human mab-21-like 2 (C. elegans) (MAB21L2), mRNA, RefSeq: NM_006439.3
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mRNA
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Sbjct 141401027 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 141401076
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Sbjct 135176607 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 135176656
>ref|NW_001838952.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188412, whole genome shotgun sequence
gb|DS486020.1| Homo sapiens SCAF_1103279188412 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 983676 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 983627
>gb|CH471062.2| Homo sapiens 211000035832302 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 11551331 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 11551380
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 132993032 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 132993081
>gb|CM000256.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 133923315 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 133923364
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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blast search - nt
left flanking sequence - GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC
>ref|XM_010388101.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana early growth response 1 (EGR1),
mRNA
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Sbjct 58 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 9
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mRNA
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Sbjct 198 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 149
>ref|XM_005557906.1| PREDICTED: Macaca fascicularis early growth response 1 (EGR1),
mRNA
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Sbjct 198 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 149
>ref|NG_021374.1| Homo sapiens early growth response 1 (EGR1), RefSeqGene on chromosome
5
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Sbjct 5037 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 4988
>gb|AC207169.4| Homo sapiens FOSMID clone ABC12-46887400J6 from chromosome 5,
complete sequence
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Sbjct 8138 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 8187
>gb|AC004821.3| Homo sapiens chromosome 5 clone RP1-98O22, complete sequence
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Sbjct 16289 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 16338
>gb|AC113403.4| Homo sapiens chromosome 5 clone RP11-461O14, complete sequence
Length=167159
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Sbjct 95014 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 94965
>dbj|AK298101.1| Homo sapiens cDNA FLJ56577 complete cds, highly similar to Early
growth response protein 1
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Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCT 49
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Sbjct 49 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCT 1
>dbj|AK301065.1| Homo sapiens cDNA FLJ60905 complete cds, highly similar to Early
growth response protein 1
Length=1404
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Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCT 49
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Sbjct 49 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCT 1
>ref|XM_003900165.2| PREDICTED: Papio anubis early growth response 1 (EGR1), mRNA
Length=3133
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Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGAT 45
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Sbjct 45 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGAT 1
>ref|XM_003776672.2| PREDICTED: Pongo abelii early growth response 1 (EGR1), mRNA
Length=3190
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Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGA 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 44 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGA 1
>ref|XM_004042587.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla early growth response 1 (EGR1),
mRNA
Length=3142
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Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGA 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 44 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGA 1
>ref|NM_007913.5| Mus musculus early growth response 1 (Egr1), mRNA
Length=3072
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Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
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Sbjct 50 GCGGCGAATCGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 1
>gb|AC114820.4| Mus musculus BAC clone RP23-70M6 from 18, complete sequence
Length=174470
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86023 GCGGCGAATCGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 86072
>dbj|AK146322.1| Mus musculus TIB-55 BB88 cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:I730052D02 product:early growth response 1, full
insert sequence
Length=3087
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 GCGGCGAATCGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 1
>dbj|AK040925.1| Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:A530045N19 product:early growth response
1, full insert sequence
Length=2803
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 GCGGCGAATCGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 1
>dbj|AK037837.1| Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:A130053K08 product:early growth response
1, full insert sequence
Length=3050
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 GCGGCGAATCGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 1
>gb|M28844.1|MUSKROX2S1 Mus musculus zinc finger protein (Krox-24) gene, exon 1
Length=1983
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 GCGGCGAATCGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 1392
>gb|J04154.1|RATNGF1A Rattus norvegicus nerve growth factor (NGF-IA) gene, complete
cds
Length=4321
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 GCGGCGAATCGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 532
>gb|M38174.1|MUSKROX24A Mouse nuclear protein Krox-24 mRNA, 5' end
Length=390
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 GCGGCGAATCGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 2
>emb|X12617.1| Mouse mgEgr-1 gene for mitogen inducible zinc finger protein
5'-flanking region
Length=1200
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 985 GCGGCGAATCGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 936
>emb|AJ243425.1| Homo sapiens EGR1 gene for early growth response protein 1
Length=6590
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 2/50 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2417 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCG-GCTGG-ATCTCTC 2370
>ref|XM_002744204.2| PREDICTED: Callithrix jacchus early growth response 1 (EGR1),
mRNA
Length=3149
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGAT 45
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 GCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGAT 1
>ref|XM_004802827.1| PREDICTED: Mustela putorius furo early growth response 1 (EGR1),
mRNA
Length=3175
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 9 TGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 TGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 10
>dbj|AK145198.1| Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:G930017O08 product:early growth
response 1, full insert sequence
Length=3085
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTC 48
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 GCGGCGAATCGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTC 2
>ref|XM_001502553.3| PREDICTED: Equus caballus early growth response 1 (EGR1), mRNA
Length=3188
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGCGGATGGCGGCGGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 50
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 GCGGCGG-CGGCGGCAGCGGCTCCCCAAGTTCTGCGCGCTGGGATCTCTC 46
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT
>ref|XM_009449740.1| PREDICTED: Pan troglodytes early growth response 1 (EGR1), mRNA
Length=3129
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 650
>gb|KM114058.1| Homo sapiens early growth response 1 (Egr-1) mRNA, complete cds
Length=1632
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 378
>ref|XM_003829222.2| PREDICTED: Pan paniscus early growth response 1 (EGR1), mRNA
Length=2938
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 462
>gb|KJ891093.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_00487 EGR1
gene, encodes complete protein
Length=1761
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 394 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 443
>ref|XM_004042587.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla early growth response 1 (EGR1),
mRNA
Length=3142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 655
>dbj|AB591041.1| Synthetic construct DNA, clone: pFN21AB7053, Homo sapiens EGR1
gene for early growth response 1, without stop codon, in Flexi
system
Length=1646
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 387
>ref|NG_021374.1| Homo sapiens early growth response 1 (EGR1), RefSeqGene on chromosome
5
Length=10824
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6287 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 6336
>dbj|AK298101.1| Homo sapiens cDNA FLJ56577 complete cds, highly similar to Early
growth response protein 1
Length=1005
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 660
>dbj|AK301065.1| Homo sapiens cDNA FLJ60905 complete cds, highly similar to Early
growth response protein 1
Length=1404
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 660
>gb|EU832310.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067339; DKFZo008D0327
early growth response 1 protein (EGR1) gene, encodes
complete protein
Length=1675
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 400
>gb|EU832395.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067424; DKFZo004D0328
early growth response 1 protein (EGR1) gene, encodes
complete protein
Length=1675
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 400
>gb|AC207169.4| Homo sapiens FOSMID clone ABC12-46887400J6 from chromosome 5,
complete sequence
Length=40187
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6888 TGAACAACGAGAAGGTGCTGGTGGAGACCAGTTACCCCAGCCAAACCACT 6839
>emb|CU687282.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100023224
5' read EGR1 mRNA
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1 (EGR1), mRNA
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mRNA
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mRNA
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mRNA
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mRNA
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transcript variant 3, mRNA
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containing frame-shift errors
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>ref|NW_004929324.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150108.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 12209837 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 12209788
>gb|KE144953.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold291, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 344721 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 344672
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shotgun sequence
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>gb|DS990705.1| Homo sapiens SCAF_1112675837091 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>ref|NW_001838953.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188146, whole genome shotgun sequence
gb|DS486067.1| Homo sapiens SCAF_1103279188146 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 4089764 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 4089813
>gb|CH471062.2| Homo sapiens 211000035832302 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 24756509 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 24756460
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 146192481 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 146192432
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Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC
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(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 1259 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1210
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1193 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1144
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1258 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1209
>ref|XM_003276547.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin), transcript variant 1 (SPARC), mRNA
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Sbjct 1265 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1216
>ref|XM_004042854.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 1374 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1325
>ref|NM_003118.3| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
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Sbjct 1263 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1214
>dbj|AK299441.1| Homo sapiens cDNA FLJ55667 complete cds, highly similar to Secreted
protein acidic and rich in cysteine
Length=1384
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Sbjct 1099 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1050
>gb|M25746.1|HUMSPARC10 Human osteonectin gene exon 10, complete cds
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Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 190 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 141
>gb|BC072457.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:88065 IMAGE:6186685), complete cds
Length=3178
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Sbjct 1165 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1116
>gb|BC004974.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:3651 IMAGE:2906092), complete cds
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Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 1110 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1061
>dbj|AK126525.1| Homo sapiens cDNA FLJ44561 fis, clone UTERU3008671, weakly similar
to SPARC precursor
Length=3747
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Sbjct 2767 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 2718
>dbj|AK092877.1| Homo sapiens cDNA FLJ35558 fis, clone SPLEN2004984, highly similar
to M.musculus mRNA for myosin I
Length=5347
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 4361 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 4312
>dbj|AK096969.1| Homo sapiens cDNA FLJ39650 fis, clone SMINT2005075, highly similar
to SPARC PRECURSOR
Length=2035
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 1055 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1006
>gb|AC011374.6| Homo sapiens chromosome 5 clone CTB-113P19, complete sequence
Length=203961
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 112164 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 112213
>ref|NM_001133570.1| Pongo abelii secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
emb|CR861427.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L172 (from clone DKFZp459L172)
Length=2214
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 1168 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1119
>ref|NM_001135387.1| Pongo abelii DKFZP468G1528 protein (DKFZP468G1528), mRNA
emb|CR860251.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G1528 (from clone DKFZp468G1528)
Length=2168
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 1174 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1125
>gb|BC008011.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:15881 IMAGE:3529445), complete cds
Length=2089
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Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 1068 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1019
>gb|J03040.1|HUMSPARC Human SPARC/osteonectin mRNA, complete cds
Length=2133
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Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 1117 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1068
>ref|XM_010358657.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3230
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Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 1265 ATTTTTAGCACCGTTAAAGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1216
>ref|XM_003900399.2| PREDICTED: Papio anubis secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3250
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 1260 ATTTTTAGCACCGTTAAAGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1211
>ref|XM_008015060.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2248
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Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
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Sbjct 1260 ATTTTTAGCACCGTTAAAGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1211
>ref|XM_005558311.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925878 (LOC101925878),
mRNA
Length=3259
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Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 ATTTTTAGCACCGTTAAAGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1211
>dbj|AB169483.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-10162, similar to
human secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA, RefSeq: NM_003118.1
Length=2141
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Query 1 ATTTTTAGCACCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 50
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145 ATTTTTAGCACCGTTAAAGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTC 1096
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG
>ref|XM_010344580.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis secreted protein,
acidic, cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2219
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Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 687 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 736
>ref|XM_001168719.2| PREDICTED: Pan troglodytes secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3237
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Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 720 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 769
>ref|XM_008954424.1| PREDICTED: Pan paniscus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
Length=3159
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 654 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 703
>ref|XM_008954423.1| PREDICTED: Pan paniscus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
Length=3224
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 719 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 768
>ref|XM_008988403.1| PREDICTED: Callithrix jacchus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
Length=2256
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 735 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 784
>ref|XM_002744407.3| PREDICTED: Callithrix jacchus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
Length=2258
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 737 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 786
>gb|KJ892190.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01584 SPARC
gene, encodes complete protein
Length=1041
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 586 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 635
>ref|XM_004042854.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3708
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 835 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 884
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(SPARC), mRNA
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Sbjct 724 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 773
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gene for secreted protein, acidic, cysteine-rich, without stop
codon, in Flexi system
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Sbjct 530 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 579
>dbj|AK299441.1| Homo sapiens cDNA FLJ55667 complete cds, highly similar to Secreted
protein acidic and rich in cysteine
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Sbjct 560 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 609
>dbj|AK315591.1| Homo sapiens cDNA, FLJ96669, highly similar to Homo sapiens secreted
protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA
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Sbjct 603 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 652
>gb|DQ896734.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011194; FLH199402.01L;
RZPDo839E0481D secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC) gene, encodes complete protein
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Sbjct 543 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 592
>gb|DQ893415.2| Synthetic construct clone IMAGE:100006045; FLH199496.01X; RZPDo839E0482D
secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC) gene, encodes complete protein
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Sbjct 543 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 592
>gb|M25743.1|HUMSPARC07 Human osteonectin gene, exon 7
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Sbjct 82 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 131
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(osteonectin) mRNA, partial cds
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Sbjct 521 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 570
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mRNA (cDNA clone MGC:88065 IMAGE:6186685), complete cds
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Sbjct 626 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 675
>gb|BC004974.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:3651 IMAGE:2906092), complete cds
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Sbjct 571 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 620
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Sbjct 79 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 128
>dbj|AK092877.1| Homo sapiens cDNA FLJ35558 fis, clone SPLEN2004984, highly similar
to M.musculus mRNA for myosin I
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Sbjct 3822 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 3871
>dbj|AK096969.1| Homo sapiens cDNA FLJ39650 fis, clone SMINT2005075, highly similar
to SPARC PRECURSOR
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Sbjct 516 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 565
>gb|AC011374.6| Homo sapiens chromosome 5 clone CTB-113P19, complete sequence
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Sbjct 116272 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 116223
>ref|NM_001133570.1| Pongo abelii secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
emb|CR861427.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L172 (from clone DKFZp459L172)
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Sbjct 629 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 678
>ref|NM_001135387.1| Pongo abelii DKFZP468G1528 protein (DKFZP468G1528), mRNA
emb|CR860251.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G1528 (from clone DKFZp468G1528)
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Sbjct 635 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 684
>emb|CR456799.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0918D
for gene SPARC, secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin);
complete cds, incl. stopcodon
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Sbjct 521 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 570
>gb|AY890858.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH021180.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
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Sbjct 521 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 570
>gb|AY890767.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH117998.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
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Sbjct 521 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 570
>gb|AY888194.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH118002.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
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Sbjct 521 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 570
>gb|AY893724.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH058045.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
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>gb|AY893274.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH058050.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
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Sbjct 521 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 570
>gb|AY889978.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116994.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
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Sbjct 521 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 570
>gb|AY892460.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116990.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
Length=912
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Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 521 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 570
>gb|BC008011.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:15881 IMAGE:3529445), complete cds
Length=2089
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Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 529 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 578
>gb|J03040.1|HUMSPARC Human SPARC/osteonectin mRNA, complete cds
Length=2133
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Sbjct 578 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 627
>emb|Y00755.1| Human mRNA for extracellular matrix protein BM-40
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Sbjct 555 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 604
>ref|XM_010358657.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 724 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAAGACAACAACCTTCTGACTGAG 773
>ref|XM_003276547.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin), transcript variant 1 (SPARC), mRNA
Length=3613
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Sbjct 724 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAATCTTCTGACTGAG 773
>ref|XM_003782024.1| PREDICTED: Otolemur garnettii secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=1314
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Sbjct 626 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACCGAG 675
>ref|XM_003900399.2| PREDICTED: Papio anubis secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 719 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAAGACAACAACCTCCTGACTGAG 768
>ref|XM_008015060.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 719 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAAGACAACAACCTCCTGACTGAG 768
>ref|XM_006863898.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=916
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Sbjct 525 TCCTGGTCACCCTGTACGAAAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 574
>ref|XM_005558311.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925878 (LOC101925878),
mRNA
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Sbjct 719 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAAGACAACAACCTCCTGACTGAG 768
>ref|XM_001101364.2| PREDICTED: Macaca mulatta secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 832 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAAGACAACAACCTCCTGACTGAG 881
>dbj|AB169483.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-10162, similar to
human secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA, RefSeq: NM_003118.1
Length=2141
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Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 604 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAAGACAACAACCTCCTGACTGAG 653
>ref|XM_007188622.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni secreted protein,
acidic, cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2239
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Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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Sbjct 640 TCCTGGTCACACTGTACGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACCGAG 689
>ref|XM_007107983.1| PREDICTED: Physeter catodon secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2281
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 TCCTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAG 50
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HuRef SCAF_1103279188146, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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right flanking sequence - ACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGGGTAAGTGGTCTCTCT
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HSCHR5_CTG4
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assembly
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genome shotgun sequence
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>ref|NW_004929324.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>gb|DS990705.1| Homo sapiens SCAF_1112675837091 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>ref|NW_001838953.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188146, whole genome shotgun sequence
gb|DS486067.1| Homo sapiens SCAF_1103279188146 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 ACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGGGTAAGTGGTCTCTCT 50
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Sbjct 4089794 ACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGGGTAAGTGGTCTCTCT 4089843
>gb|CH471062.2| Homo sapiens 211000035832302 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=48999907
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Query 1 ACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGGGTAAGTGGTCTCTCT 50
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Sbjct 24756479 ACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGGGTAAGTGGTCTCTCT 24756430
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=175444460
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Query 1 ACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGGGTAAGTGGTCTCTCT 50
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Sbjct 146192451 ACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGGGTAAGTGGTCTCTCT 146192402
>gb|CM000256.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=176344326
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Query 1 ACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGGGTAAGTGGTCTCTCT 50
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Sbjct 147128463 ACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGGGTAAGTGGTCTCTCT 147128414
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA
>ref|NM_003118.3| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
Length=3604
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1253 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 1204
>dbj|AK299441.1| Homo sapiens cDNA FLJ55667 complete cds, highly similar to Secreted
protein acidic and rich in cysteine
Length=1384
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1089 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 1040
>gb|M25746.1|HUMSPARC10 Human osteonectin gene exon 10, complete cds
Length=1109
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 180 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 131
>gb|BC072457.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:88065 IMAGE:6186685), complete cds
Length=3178
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1155 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 1106
>gb|BC004974.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:3651 IMAGE:2906092), complete cds
Length=2114
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1100 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 1051
>dbj|AK092877.1| Homo sapiens cDNA FLJ35558 fis, clone SPLEN2004984, highly similar
to M.musculus mRNA for myosin I
Length=5347
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 4351 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 4302
>dbj|AK096969.1| Homo sapiens cDNA FLJ39650 fis, clone SMINT2005075, highly similar
to SPARC PRECURSOR
Length=2035
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1045 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 996
>gb|AC011374.6| Homo sapiens chromosome 5 clone CTB-113P19, complete sequence
Length=203961
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 112174 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 112223
>ref|NM_001133570.1| Pongo abelii secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
emb|CR861427.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L172 (from clone DKFZp459L172)
Length=2214
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1158 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 1109
>ref|NM_001135387.1| Pongo abelii DKFZP468G1528 protein (DKFZP468G1528), mRNA
emb|CR860251.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G1528 (from clone DKFZp468G1528)
Length=2168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1164 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 1115
>gb|BC008011.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:15881 IMAGE:3529445), complete cds
Length=2089
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1058 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 1009
>gb|J03040.1|HUMSPARC Human SPARC/osteonectin mRNA, complete cds
Length=2133
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1107 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 1058
>ref|XM_001168719.2| PREDICTED: Pan troglodytes secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3237
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1249 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCCCCAGGCAGA 1200
>ref|XM_008954424.1| PREDICTED: Pan paniscus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
Length=3159
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1183 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCCCCAGGCAGA 1134
>ref|XM_008954423.1| PREDICTED: Pan paniscus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
Length=3224
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1248 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCCCCAGGCAGA 1199
>ref|XM_003276547.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin), transcript variant 1 (SPARC), mRNA
Length=3613
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1255 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCCCCAGGCAGA 1206
>ref|XM_004042854.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3708
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1364 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCCCCAGGCAGA 1315
>dbj|AK126525.1| Homo sapiens cDNA FLJ44561 fis, clone UTERU3008671, weakly similar
to SPARC precursor
Length=3747
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 2757 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCAAGGCAGA 2708
>ref|XM_010358657.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3230
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1255 CCGTTAAAGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCCCCAGGCAGA 1206
>ref|XM_003900399.2| PREDICTED: Papio anubis secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3250
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1250 CCGTTAAAGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCCCCAGGCAGA 1201
>ref|XM_008015060.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2248
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1250 CCGTTAAAGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCCCCAGGCAGA 1201
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Sbjct 1250 CCGTTAAAGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCCCCAGGCAGA 1201
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Query 1 CCGTTAATGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCTCCAGGCAGA 50
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Sbjct 1135 CCGTTAAAGTATTCACTTAAATCTATGTTAGCACCTTGTCCCCAGGCAGA 1086
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 12210438 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 12210487
>ref|NC_018916.2| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001613.2| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 150476074 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 150476123
>ref|NW_004929324.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150108.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 12206403 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 12206452
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shotgun sequence
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 341287 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 341336
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shotgun sequence
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 24641999 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 24642048
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 146189240 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 146189289
>gb|DS990705.1| Homo sapiens SCAF_1112675837091 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 4093243 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 4093194
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 155359800 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 155359849
>ref|NW_001838953.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188146, whole genome shotgun sequence
gb|DS486067.1| Homo sapiens SCAF_1103279188146 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 4093198 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 4093149
>gb|CH471062.2| Homo sapiens 211000035832302 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 24753075 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 24753124
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 146189047 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 146189096
>gb|CM000256.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 147125059 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 147125108
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Query 11 CCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 148356526 CCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 148356565
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 151667527 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 151667478
>ref|NT_029289.12| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR5_CTG4
gb|GL000050.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 12213868 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 12213819
>ref|NC_018916.2| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001613.2| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=180347728
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 150479504 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 150479455
>ref|NW_004929324.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150108.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=16301478
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 12209833 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 12209784
>gb|KE144953.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold291, whole genome
shotgun sequence
Length=25011268
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 344717 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 344668
>gb|GL582980.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_0, whole genome
shotgun sequence
Length=48689161
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 24645429 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 24645380
>gb|CM000495.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=175444886
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 146192670 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 146192621
>gb|DS990705.1| Homo sapiens SCAF_1112675837091 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=16305513
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 4089813 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 4089862
>gb|CH003500.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=188135019
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 155363230 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 155363181
>gb|CH003452.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=177800000
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 148359946 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 148359897
>ref|NW_001838953.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188146, whole genome shotgun sequence
gb|DS486067.1| Homo sapiens SCAF_1103279188146 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=16305437
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 4089768 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 4089817
>gb|CH471062.2| Homo sapiens 211000035832302 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=48999907
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 24756505 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 24756456
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=175444460
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 146192477 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 146192428
>gb|CM000256.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=176344326
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 147128489 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 147128440
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA
>ref|XM_001168719.2| PREDICTED: Pan troglodytes secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3237
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 1072 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 1023
>gb|KJ892190.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01584 SPARC
gene, encodes complete protein
Length=1041
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 938 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 889
>ref|XM_003981374.2| PREDICTED: Felis catus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2196
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 993 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 944
>ref|NM_001290612.1| Panthera tigris altaica secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
gb|KF896583.1| Panthera tigris altaica clone PTA13186 SPARC isoform 1 (SPARC)
mRNA, complete cds
Length=2148
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 950 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 901
>ref|XM_006214955.1| PREDICTED: Vicugna pacos secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
Length=1855
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 864 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 815
>ref|XM_006214954.1| PREDICTED: Vicugna pacos secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
Length=2143
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 959 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 910
>ref|XM_006174614.1| PREDICTED: Camelus ferus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
Length=1852
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 864 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 815
>ref|XM_006174613.1| PREDICTED: Camelus ferus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
Length=2156
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 959 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 910
>ref|XM_003276547.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin), transcript variant 1 (SPARC), mRNA
Length=3613
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 1076 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 1027
>ref|XM_004042854.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3708
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 1187 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 1138
>ref|NM_003118.3| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
Length=3604
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 1076 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 1027
>dbj|AB464190.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB4604, Homo sapiens SPARC
gene for secreted protein, acidic, cysteine-rich, without stop
codon, in Flexi system
Length=926
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 882 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 833
>dbj|AK299441.1| Homo sapiens cDNA FLJ55667 complete cds, highly similar to Secreted
protein acidic and rich in cysteine
Length=1384
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 912 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 863
>emb|CU678835.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018786
3' read SPARC mRNA
Length=1414
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 104
>dbj|AK315591.1| Homo sapiens cDNA, FLJ96669, highly similar to Homo sapiens secreted
protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA
Length=994
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 906
>gb|DQ896734.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011194; FLH199402.01L;
RZPDo839E0481D secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC) gene, encodes complete protein
Length=952
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 895 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 846
>gb|DQ893415.2| Synthetic construct clone IMAGE:100006045; FLH199496.01X; RZPDo839E0482D
secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC) gene, encodes complete protein
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Sbjct 895 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 846
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Sbjct 153 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 104
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(osteonectin) mRNA, partial cds
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Sbjct 873 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 824
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mRNA (cDNA clone MGC:88065 IMAGE:6186685), complete cds
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Sbjct 978 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 929
>gb|BC004974.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:3651 IMAGE:2906092), complete cds
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to SPARC precursor
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Sbjct 2093 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 2044
>dbj|AK092877.1| Homo sapiens cDNA FLJ35558 fis, clone SPLEN2004984, highly similar
to M.musculus mRNA for myosin I
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Sbjct 4174 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 4125
>dbj|AK096969.1| Homo sapiens cDNA FLJ39650 fis, clone SMINT2005075, highly similar
to SPARC PRECURSOR
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>gb|AC011374.6| Homo sapiens chromosome 5 clone CTB-113P19, complete sequence
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>ref|NM_001133570.1| Pongo abelii secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
emb|CR861427.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L172 (from clone DKFZp459L172)
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Sbjct 981 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 932
>ref|NM_001135387.1| Pongo abelii DKFZP468G1528 protein (DKFZP468G1528), mRNA
emb|CR860251.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G1528 (from clone DKFZp468G1528)
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Sbjct 987 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 938
>emb|CR456799.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0918D
for gene SPARC, secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin);
complete cds, incl. stopcodon
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Sbjct 873 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 824
>gb|AY890858.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH021180.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
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Sbjct 873 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 824
>gb|AY890767.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH117998.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
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>gb|AY888194.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH118002.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
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Sbjct 873 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 824
>gb|AY893724.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH058045.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
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Sbjct 873 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 824
>gb|AY893274.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH058050.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
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Sbjct 873 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 824
>gb|AY889978.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116994.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
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Sbjct 873 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 824
>gb|AY892460.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116990.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
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Sbjct 873 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 824
>gb|BC008011.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:15881 IMAGE:3529445), complete cds
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Sbjct 881 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 832
>gb|J03040.1|HUMSPARC Human SPARC/osteonectin mRNA, complete cds
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Sbjct 930 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 881
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Sbjct 907 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 858
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 928 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCAATGTACTTGTCATTGTCCA 879
>ref|XM_003404613.2| PREDICTED: Loxodonta africana secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 991 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCAATGTACTTGTCATTGTCCA 942
>ref|XM_010592007.1| PREDICTED: Loxodonta africana secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 994 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCAATGTACTTGTCATTGTCCA 945
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(osteonectin) (Sparc), mRNA
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Sbjct 965 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 916
>ref|XM_010358657.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 1076 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATATACTTGTCATTGTCCA 1027
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(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 1071 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATATACTTGTCATTGTCCA 1022
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1006 GCCAAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 957
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1071 GCCAAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 1022
>ref|XM_008015060.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 1071 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATATACTTGTCATTGTCCA 1022
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(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 1000 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCGTTGTCCA 951
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Sbjct 381 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCAATGTACTTGTCATTGTCCA 332
>ref|XM_005558311.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925878 (LOC101925878),
mRNA
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Sbjct 1071 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATATACTTGTCATTGTCCA 1022
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cysteine-rich (osteonectin) (Sparc), mRNA
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Sbjct 1150 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCAATGTACTTGTCATTGTCCA 1101
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(osteonectin) (Sparc), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1004 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 955
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(osteonectin) (Sparc), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1004 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 955
>ref|XM_004836548.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (Sparc), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1010 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 961
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(osteonectin) (Sparc), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1023 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 974
>ref|XM_004896734.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (Sparc), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1014 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 965
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 910 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATGGTCCA 861
>ref|XM_004801694.1| PREDICTED: Mustela putorius furo secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 876 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATGGTCCA 827
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 914 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATGGTCCA 865
>ref|XM_004737781.1| PREDICTED: Mustela putorius furo secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1001 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATGGTCCA 952
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1007 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATGGTCCA 958
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 858 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 809
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 864 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 815
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 867 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 818
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 873 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 824
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Sbjct 700 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCAATGTACTTGTCATTGTCCA 651
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(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 1184 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATATACTTGTCATTGTCCA 1135
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(SPARC), mRNA
gb|GQ221054.1| Ovis aries secreted, acidic, cysteine-rich protein (SPARC) mRNA,
complete cds
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Sbjct 873 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCGTTGTCCA 824
>ref|NM_001285662.1| Capra hircus secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
gb|EU239656.1| Capra hircus osteonectin mRNA, complete cds
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Sbjct 873 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCGTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 824
>dbj|AB169483.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-10162, similar to
human secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA, RefSeq: NM_003118.1
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Sbjct 956 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATATACTTGTCATTGTCCA 907
>ref|NM_001031794.1| Sus scrofa secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
gb|AY963262.1| Sus scrofa SPARC mRNA, complete cds
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Sbjct 864 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCAATGTACTTGTCATTGTCCA 815
>ref|XM_010217668.1| PREDICTED: Tinamus guttatus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 977 GCCGAAGCAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 928
>ref|XM_010118100.1| PREDICTED: Chlamydotis macqueenii secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 918 GCCGAAGCAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 869
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 867 GCCGAAGCAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 818
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1028 GCCGAAGCAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 979
>ref|XM_010013750.1| PREDICTED: Nestor notabilis secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 867 GCCGAAGCAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 818
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1011 GCCGAAGCAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 962
>ref|XM_009942619.1| PREDICTED: Opisthocomus hoazin secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 867 GCCGAAGCAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 818
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 912 GCCGAAGCAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 863
>ref|XM_009701161.1| PREDICTED: Cariama cristata secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 867 GCCGAAGCAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 818
>ref|XM_009285821.1| PREDICTED: Aptenodytes forsteri secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 952 GCCGAAGCAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 903
>ref|XM_006150826.1| PREDICTED: Tupaia chinensis secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 980 GCCAAAGCAGCCGGCCCACTCGTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 931
>ref|XM_005619272.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 998 GCCGAAGCAGCCCGCCCACTCGTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 949
>ref|XM_005376168.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (Sparc), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1019 GCCGAAGCAACCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 970
>ref|XM_005376167.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (Sparc), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1025 GCCGAAGCAACCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 976
>ref|XM_005376166.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (Sparc), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1028 GCCGAAGCAACCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 979
>ref|XM_005376165.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (Sparc), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1031 GCCGAAGCAACCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 982
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(osteonectin) (Sparc), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 870 GCCAAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 821
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(osteonectin) (Sparc), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 873 GCCAAAGCAGCCGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 824
>ref|XM_004696735.1| PREDICTED: Echinops telfairi secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 874 GCCAAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCGTTGTCCA 825
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 873 GCCAAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCGTTGTCCA 824
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 913 GCCGAAACAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 864
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(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 867 GCCGAAACAGCTGGCCCACTCCTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 818
>ref|XM_005350046.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (Sparc), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 869 GCCAAAGCAGCCGGCCCATTCGTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 820
>ref|XM_005350045.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (Sparc), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 872 GCCAAAGCAGCCGGCCCATTCGTCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 823
>ref|XM_004428629.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
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Query 1 GCCGAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA 50
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Sbjct 955 GCCAAAGCAGCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCGTGGTCCA 906
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC
>ref|XM_010344580.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis secreted protein,
acidic, cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 691 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 740
>ref|XM_001168719.2| PREDICTED: Pan troglodytes secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 724 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 773
>ref|XM_008954424.1| PREDICTED: Pan paniscus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 658 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 707
>ref|XM_008954423.1| PREDICTED: Pan paniscus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
Length=3224
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 723 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 772
>ref|XM_008988403.1| PREDICTED: Callithrix jacchus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 739 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 788
>ref|XM_002744407.3| PREDICTED: Callithrix jacchus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 741 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 790
>gb|KJ892190.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01584 SPARC
gene, encodes complete protein
Length=1041
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 590 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 639
>ref|XM_004042854.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
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Sbjct 839 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 888
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(SPARC), mRNA
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Sbjct 728 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 777
>dbj|AB464190.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB4604, Homo sapiens SPARC
gene for secreted protein, acidic, cysteine-rich, without stop
codon, in Flexi system
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Sbjct 534 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 583
>dbj|AK299441.1| Homo sapiens cDNA FLJ55667 complete cds, highly similar to Secreted
protein acidic and rich in cysteine
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Sbjct 564 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 613
>dbj|AK315591.1| Homo sapiens cDNA, FLJ96669, highly similar to Homo sapiens secreted
protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA
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Sbjct 607 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 656
>gb|DQ896734.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011194; FLH199402.01L;
RZPDo839E0481D secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC) gene, encodes complete protein
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Sbjct 547 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 596
>gb|DQ893415.2| Synthetic construct clone IMAGE:100006045; FLH199496.01X; RZPDo839E0482D
secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC) gene, encodes complete protein
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Sbjct 547 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 596
>gb|M25743.1|HUMSPARC07 Human osteonectin gene, exon 7
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Sbjct 86 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 135
>gb|BT019645.1| Synthetic construct Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) mRNA, partial cds
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Sbjct 525 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 574
>gb|BC072457.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:88065 IMAGE:6186685), complete cds
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Sbjct 630 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 679
>gb|BC004974.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:3651 IMAGE:2906092), complete cds
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Sbjct 575 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 624
>gb|AY545555.1| Homo sapiens cysteine-rich protein (SPARC) mRNA, partial cds
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Sbjct 83 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 132
>dbj|AK092877.1| Homo sapiens cDNA FLJ35558 fis, clone SPLEN2004984, highly similar
to M.musculus mRNA for myosin I
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Sbjct 3826 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 3875
>dbj|AK096969.1| Homo sapiens cDNA FLJ39650 fis, clone SMINT2005075, highly similar
to SPARC PRECURSOR
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Sbjct 520 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 569
>gb|AC011374.6| Homo sapiens chromosome 5 clone CTB-113P19, complete sequence
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Sbjct 116268 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 116219
>ref|NM_001133570.1| Pongo abelii secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
emb|CR861427.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L172 (from clone DKFZp459L172)
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Sbjct 633 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 682
>ref|NM_001135387.1| Pongo abelii DKFZP468G1528 protein (DKFZP468G1528), mRNA
emb|CR860251.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G1528 (from clone DKFZp468G1528)
Length=2168
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Sbjct 639 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 688
>emb|CR456799.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0918D
for gene SPARC, secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin);
complete cds, incl. stopcodon
Length=912
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Sbjct 525 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 574
>gb|AY890858.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH021180.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
Length=912
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>gb|AY890767.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH117998.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
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Sbjct 525 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 574
>gb|AY888194.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH118002.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
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>gb|AY893724.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH058045.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
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Sbjct 525 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 574
>gb|AY893274.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH058050.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 525 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 574
>gb|AY889978.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116994.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 525 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 574
>gb|AY892460.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116990.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
Length=912
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Sbjct 525 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 574
>gb|BC008011.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:15881 IMAGE:3529445), complete cds
Length=2089
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 533 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 582
>gb|J03040.1|HUMSPARC Human SPARC/osteonectin mRNA, complete cds
Length=2133
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 582 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 631
>emb|Y00755.1| Human mRNA for extracellular matrix protein BM-40
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Sbjct 559 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 608
>ref|XM_003276547.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin), transcript variant 1 (SPARC), mRNA
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Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 728 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAATCTTCTGACTGAGAAGC 777
>ref|XM_003782024.1| PREDICTED: Otolemur garnettii secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=1314
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 630 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACCGAGAAGC 679
>ref|XM_006863898.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=916
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 529 GGTCACCCTGTACGAAAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 578
>ref|XM_006893680.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=915
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAA 48
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Sbjct 528 GGTCACCCTGTACGAGAGAGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAA 575
>ref|XM_007188622.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni secreted protein,
acidic, cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2239
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 644 GGTCACACTGTACGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACCGAGAAGC 693
>ref|XM_007107983.1| PREDICTED: Physeter catodon secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2281
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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Sbjct 679 GGTCACGCTGTACGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACCGAGAAGC 728
>ref|XM_004453455.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus SPARC-like (LOC101441396), mRNA
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Query 1 GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGC 50
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5 5 151043666 151047028 41M151047088F59m GCCGGCCCACTCATCCAGGGCGATGTACTTGTCATTGTCCA GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGC
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5 5 151043702 151046035 5M151047088F61m957n34m GTCCT GGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151043703 151046034 4M151047088F61m957n35m TCCT GGTCACCCTGTATTAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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5 5 151047089 151046032 37m957n63m CTGGTCACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047086 151046029 40m957n60m GTCACGCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047083 151046026 43m957n57m ACCCTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGATA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047080 151046023 46m957n54m CTGTATGAGAGGGATGAGGACAACAGCCTTCTGACTGAGAAGCAGA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047077 151046020 49m957n51m TATGAGAGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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5 5 151047071 151046014 55m957n45m AGGGATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGGGTGAAGAAGA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047068 151046011 42m957n58m GATGAGGACAACAACCTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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5 5 151047056 151045999 30m957n70m AACCTTCTGGCTGAGAAGCAGAAGCTGCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047053 151045996 27m957n73m CTTCTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047050 151045993 24m957n76m CTGACTGAGAAGCAGAAGCTGCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047047 151045990 21m957n79m ACTGAGAAGCAGAAGCTGCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047044 151045987 18m957n82m GAGAAGCAGAAGCTGCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047041 151045984 15m957n85m AAGCAGAAGCTGCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047038 151045981 12m957n88m CAGAAGCTGCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047035 151045978 9m957n91m AAGCTGCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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5 5 151047029 151045972 3m957n97m CGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151047007 151046907 100m TTGCTGGCCCCGTGCTGGTGAAGATCCAGTCCCATTCCTAGAACTGGGCCCCCAGCTGCAGGGCGGCATCCTGCTCCGGAGCGTGCATTTACCCCTGAGC
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5 5 151046843 151046743 100m CTGAGAAGTCCTGCAGCAGAGACCTGCTCCCTTTGCTTAACCTAACGTTAAACA
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-9005:-8674
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 24762134 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 24762183
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC
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assembly
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Sbjct 12233270 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 12233221
>ref|NC_018916.2| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001613.2| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 150498917 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 150498868
>ref|NW_004929324.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150108.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=16301478
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Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 12229246 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 12229197
>gb|KE144953.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold291, whole genome
shotgun sequence
Length=25011268
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 364322 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 364273
>gb|GL582980.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_0, whole genome
shotgun sequence
Length=48689161
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 24664895 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 24664846
>gb|CM000495.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=175444886
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Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 146212071 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 146212022
>gb|DS990705.1| Homo sapiens SCAF_1112675837091 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=16305513
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Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 4070412 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 4070461
>gb|CH003500.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=188135019
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 155382639 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 155382590
>gb|CH003452.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=177800000
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148379348 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 148379299
>ref|NW_001838953.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188146, whole genome shotgun sequence
gb|DS486067.1| Homo sapiens SCAF_1103279188146 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=16305437
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4070360 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 4070409
>gb|CH471062.2| Homo sapiens 211000035832302 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=48999907
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24775918 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 24775869
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=175444460
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 146211885 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 146211836
>gb|CM000256.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=176344326
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 147147902 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 147147853
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1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC
>ref|XM_001168719.2| PREDICTED: Pan troglodytes secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 381 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 332
>ref|XM_008954424.1| PREDICTED: Pan paniscus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
Length=3159
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 315 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 266
>ref|XM_008954423.1| PREDICTED: Pan paniscus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
Length=3224
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 380 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 331
>gb|KJ892190.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01584 SPARC
gene, encodes complete protein
Length=1041
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 247 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 198
>ref|NM_003118.3| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
Length=3604
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 385 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 336
>dbj|AB464190.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB4604, Homo sapiens SPARC
gene for secreted protein, acidic, cysteine-rich, without stop
codon, in Flexi system
Length=926
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 191 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 142
>dbj|AK299441.1| Homo sapiens cDNA FLJ55667 complete cds, highly similar to Secreted
protein acidic and rich in cysteine
Length=1384
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 221 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 172
>dbj|AK295554.1| Homo sapiens cDNA FLJ60561 complete cds, highly similar to Complement
C4-B precursor
Length=2506
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2448 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 2399
>emb|CU678834.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018786
5' read SPARC mRNA
Length=1264
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 198 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 149
>dbj|AK315591.1| Homo sapiens cDNA, FLJ96669, highly similar to Homo sapiens secreted
protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA
Length=994
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 215
>gb|DQ896734.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011194; FLH199402.01L;
RZPDo839E0481D secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC) gene, encodes complete protein
Length=952
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 155
>gb|DQ893415.2| Synthetic construct clone IMAGE:100006045; FLH199496.01X; RZPDo839E0482D
secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC) gene, encodes complete protein
Length=952
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 155
>gb|M25740.1|HUMSPARC04 Human osteonectin gene, exon 4
Length=108
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 76 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 27
>gb|BT019645.1| Synthetic construct Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) mRNA, partial cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 182 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 133
>gb|BC072457.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:88065 IMAGE:6186685), complete cds
Length=3178
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 287 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 238
>gb|BC004974.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:3651 IMAGE:2906092), complete cds
Length=2114
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 232 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 183
>dbj|AK096969.1| Homo sapiens cDNA FLJ39650 fis, clone SMINT2005075, highly similar
to SPARC PRECURSOR
Length=2035
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 264 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 215
>gb|AC011374.6| Homo sapiens chromosome 5 clone CTB-113P19, complete sequence
Length=203961
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
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Sbjct 121896 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 121945
>ref|NM_001135387.1| Pongo abelii DKFZP468G1528 protein (DKFZP468G1528), mRNA
emb|CR860251.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G1528 (from clone DKFZp468G1528)
Length=2168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 296 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 247
>emb|CR456799.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0918D
for gene SPARC, secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin);
complete cds, incl. stopcodon
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 182 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 133
>gb|AY890858.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH021180.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
Length=912
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 182 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 133
>gb|AY890767.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH117998.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
Length=912
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 182 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 133
>gb|AY888194.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH118002.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 182 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 133
>gb|AY893724.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH058045.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 182 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 133
>gb|AY893274.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH058050.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 182 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 133
>gb|AY889978.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116994.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 182 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 133
>gb|AY892460.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116990.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 182 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 133
>gb|BC008011.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:15881 IMAGE:3529445), complete cds
Length=2089
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 190 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 141
>gb|J03040.1|HUMSPARC Human SPARC/osteonectin mRNA, complete cds
Length=2133
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 239 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 190
>emb|Y00755.1| Human mRNA for extracellular matrix protein BM-40
Length=946
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
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Sbjct 216 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 167
>ref|XM_010358657.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3230
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 TCCTCTGCACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 336
>ref|XM_003276547.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin), transcript variant 1 (SPARC), mRNA
Length=3613
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 TCCTCTGCACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 336
>ref|XM_004042854.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3708
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 496 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACATCCACCTGGACAGGATTAGC 447
>dbj|AK092877.1| Homo sapiens cDNA FLJ35558 fis, clone SPLEN2004984, highly similar
to M.musculus mRNA for myosin I
Length=5347
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3483 TCCTCTGCACCACCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 3434
>ref|NM_001133570.1| Pongo abelii secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
emb|CR861427.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L172 (from clone DKFZp459L172)
Length=2214
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 TCCTCTGCACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 241
>ref|XM_003900399.2| PREDICTED: Papio anubis secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3250
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 380 TCCTCTGGACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 331
>ref|XM_008015060.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2248
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 380 TCCTCTGGACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 331
>ref|XM_005558311.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925878 (LOC101925878),
mRNA
Length=3259
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 380 TCCTCTGGACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 331
>ref|XM_001101364.2| PREDICTED: Macaca mulatta secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=1718
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 TCCTCTGGACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 444
>dbj|AB169483.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-10162, similar to
human secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA, RefSeq: NM_003118.1
Length=2141
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 TCCTCTGGACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 217
>ref|XM_010592016.1| PREDICTED: Loxodonta africana secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X3, mRNA
Length=2126
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATT 47
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 TCCTCAGCACCTTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATT 191
>ref|XM_003404613.2| PREDICTED: Loxodonta africana secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
Length=2189
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATT 47
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 TCCTCAGCACCTTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATT 254
>ref|XM_010592007.1| PREDICTED: Loxodonta africana secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
Length=2192
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATT 47
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 TCCTCAGCACCTTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATT 257
>ref|XM_006893680.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=915
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGG 44
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 TCCTCAGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGG 142
>ref|XM_006150826.1| PREDICTED: Tupaia chinensis secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2138
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 7 GCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 GCACCTTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC 240
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC
>ref|NR_109873.1| Homo sapiens uncharacterized LOC101927096 (CTB-113P19.1), long
non-coding RNA
tpe|HG498622.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000373847.1 (CTB-113P19.1
gene), antisense
Length=1973
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 943
>ref|NM_003118.3| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
Length=3604
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 126 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 175
>dbj|AK299441.1| Homo sapiens cDNA FLJ55667 complete cds, highly similar to Secreted
protein acidic and rich in cysteine
Length=1384
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 54
>gb|BC072457.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:88065 IMAGE:6186685), complete cds
Length=3178
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 77
>dbj|AK096969.1| Homo sapiens cDNA FLJ39650 fis, clone SMINT2005075, highly similar
to SPARC PRECURSOR
Length=2035
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 54
>gb|BC039364.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5270693
Length=1983
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 943
>gb|AC109999.2| Homo sapiens chromosome 5 clone CTD-2265M6, complete sequence
Length=143750
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4842 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 4793
>gb|AC011374.6| Homo sapiens chromosome 5 clone CTB-113P19, complete sequence
Length=203961
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 135670 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 135621
>ref|NM_001135387.1| Pongo abelii DKFZP468G1528 protein (DKFZP468G1528), mRNA
emb|CR860251.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G1528 (from clone DKFZp468G1528)
Length=2168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 37 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 86
>dbj|D28381.1|HUMO40 Homo sapiens mRNA for osteonectin, 5'UTR region
Length=90
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 56
>gb|U65081.1|HSU65081 Homo sapiens osteonectin (SPARC) gene, promoter region
Length=1370
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 1415 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 1464
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protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA
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Sbjct 5 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGANCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 54
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cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
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Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 237 TCCCGCAGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 286
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(osteonectin), transcript variant 1 (SPARC), mRNA
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Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 126 TCCCGCAGACCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 175
>ref|NM_001133570.1| Pongo abelii secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
emb|CR861427.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L172 (from clone DKFZp459L172)
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Query 1 TCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 35 TCCCGCAGACCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 84
>ref|XM_003900399.2| PREDICTED: Papio anubis secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Query 10 CCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 130 CCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 170
>ref|XM_005558311.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925878 (LOC101925878),
mRNA
Length=3259
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Query 10 CCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 130 CCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 170
>ref|XM_001101364.2| PREDICTED: Macaca mulatta secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
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Query 10 CCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 246 CCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 286
>dbj|AB169483.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-10162, similar to
human secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA, RefSeq: NM_003118.1
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Query 10 CCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 50
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Sbjct 16 CCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGC 56
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
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Sbjct 364328 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 364279
>gb|GL582980.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_0, whole genome
shotgun sequence
Length=48689161
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24664901 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 24664852
>gb|CM000495.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
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Sbjct 146212077 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 146212028
>gb|DS990705.1| Homo sapiens SCAF_1112675837091 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
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Sbjct 4070406 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 4070455
>gb|CH003500.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=188135019
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
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Sbjct 155382645 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 155382596
>gb|CH003452.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
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Sbjct 148379354 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 148379305
>ref|NW_001838953.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188146, whole genome shotgun sequence
gb|DS486067.1| Homo sapiens SCAF_1103279188146 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
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Sbjct 4070354 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 4070403
>gb|CH471062.2| Homo sapiens 211000035832302 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=48999907
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
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Sbjct 24775924 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 24775875
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=175444460
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
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Sbjct 146211891 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 146211842
>gb|CM000256.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=176344326
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
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Sbjct 147147908 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 147147859
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC
>ref|XM_001168719.2| PREDICTED: Pan troglodytes secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3237
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
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Sbjct 379 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 330
>ref|XM_008954424.1| PREDICTED: Pan paniscus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
Length=3159
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 313 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 264
>ref|XM_008954423.1| PREDICTED: Pan paniscus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
Length=3224
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
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Sbjct 378 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 329
>gb|KJ892190.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_01584 SPARC
gene, encodes complete protein
Length=1041
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
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Sbjct 245 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 196
>ref|NM_003118.3| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
Length=3604
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
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Sbjct 383 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 334
>dbj|AB464190.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB4604, Homo sapiens SPARC
gene for secreted protein, acidic, cysteine-rich, without stop
codon, in Flexi system
Length=926
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
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Sbjct 189 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 140
>dbj|AK299441.1| Homo sapiens cDNA FLJ55667 complete cds, highly similar to Secreted
protein acidic and rich in cysteine
Length=1384
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
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Sbjct 219 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 170
>dbj|AK295554.1| Homo sapiens cDNA FLJ60561 complete cds, highly similar to Complement
C4-B precursor
Length=2506
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
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Sbjct 2446 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 2397
>emb|CU678834.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018786
5' read SPARC mRNA
Length=1264
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 147
>dbj|AK315591.1| Homo sapiens cDNA, FLJ96669, highly similar to Homo sapiens secreted
protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA
Length=994
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 213
>gb|DQ896734.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011194; FLH199402.01L;
RZPDo839E0481D secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC) gene, encodes complete protein
Length=952
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 153
>gb|DQ893415.2| Synthetic construct clone IMAGE:100006045; FLH199496.01X; RZPDo839E0482D
secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC) gene, encodes complete protein
Length=952
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 153
>gb|M25740.1|HUMSPARC04 Human osteonectin gene, exon 4
Length=108
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 25
>gb|BT019645.1| Synthetic construct Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) mRNA, partial cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 131
>gb|BC072457.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:88065 IMAGE:6186685), complete cds
Length=3178
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 236
>gb|BC004974.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:3651 IMAGE:2906092), complete cds
Length=2114
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 181
>dbj|AK096969.1| Homo sapiens cDNA FLJ39650 fis, clone SMINT2005075, highly similar
to SPARC PRECURSOR
Length=2035
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 213
>gb|AC011374.6| Homo sapiens chromosome 5 clone CTB-113P19, complete sequence
Length=203961
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121898 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 121947
>ref|NM_001135387.1| Pongo abelii DKFZP468G1528 protein (DKFZP468G1528), mRNA
emb|CR860251.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G1528 (from clone DKFZp468G1528)
Length=2168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 245
>emb|CR456799.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834D0918D
for gene SPARC, secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin);
complete cds, incl. stopcodon
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 131
>gb|AY890858.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH021180.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 131
>gb|AY890767.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH117998.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 131
>gb|AY888194.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH118002.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 131
>gb|AY893724.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH058045.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 131
>gb|AY893274.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH058050.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 131
>gb|AY889978.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116994.01X secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, complete cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 131
>gb|AY892460.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116990.01L secreted
protein acidic cysteine-rich (SPARC) mRNA, partial cds
Length=912
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 131
>gb|BC008011.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:15881 IMAGE:3529445), complete cds
Length=2089
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 139
>gb|J03040.1|HUMSPARC Human SPARC/osteonectin mRNA, complete cds
Length=2133
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 188
>emb|Y00755.1| Human mRNA for extracellular matrix protein BM-40
Length=946
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 165
>ref|XM_010358657.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3230
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 CTCTGCACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 334
>ref|XM_003276547.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin), transcript variant 1 (SPARC), mRNA
Length=3613
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 CTCTGCACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 334
>dbj|AK092877.1| Homo sapiens cDNA FLJ35558 fis, clone SPLEN2004984, highly similar
to M.musculus mRNA for myosin I
Length=5347
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 CTCTGCACCACCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 3432
>ref|NM_001133570.1| Pongo abelii secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
emb|CR861427.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L172 (from clone DKFZp459L172)
Length=2214
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 CTCTGCACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 239
>ref|XM_003900399.2| PREDICTED: Papio anubis secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3250
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 378 CTCTGGACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 329
>ref|XM_008015060.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2248
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 378 CTCTGGACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 329
>ref|XM_005558311.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925878 (LOC101925878),
mRNA
Length=3259
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 378 CTCTGGACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 329
>ref|XM_001101364.2| PREDICTED: Macaca mulatta secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=1718
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 CTCTGGACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 442
>dbj|AB169483.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-10162, similar to
human secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA, RefSeq: NM_003118.1
Length=2141
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 CTCTGGACCGTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 215
>ref|XM_006150826.1| PREDICTED: Tupaia chinensis secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=2138
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5 GCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 GCACCTTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 238
>ref|XM_010592016.1| PREDICTED: Loxodonta africana secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X3, mRNA
Length=2126
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 235 CTCAGCACCTTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTGGCTC 186
>ref|XM_003404613.2| PREDICTED: Loxodonta africana secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X2, mRNA
Length=2189
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 298 CTCAGCACCTTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTGGCTC 249
>ref|XM_010592007.1| PREDICTED: Loxodonta africana secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), transcript variant X1, mRNA
Length=2192
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 301 CTCAGCACCTTCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTGGCTC 252
>ref|XM_006893680.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=915
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 183 CTCAGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGGTTGGCTC 134
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC
>ref|NR_109873.1| Homo sapiens uncharacterized LOC101927096 (CTB-113P19.1), long
non-coding RNA
tpe|HG498622.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000373847.1 (CTB-113P19.1
gene), antisense
Length=1973
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 949
>ref|NM_003118.3| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
Length=3604
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 169
>gb|BC072457.1| Homo sapiens secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin),
mRNA (cDNA clone MGC:88065 IMAGE:6186685), complete cds
Length=3178
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 71
>gb|BC039364.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5270693
Length=1983
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 949
>gb|AC109999.2| Homo sapiens chromosome 5 clone CTD-2265M6, complete sequence
Length=143750
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4848 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 4799
>gb|AC011374.6| Homo sapiens chromosome 5 clone CTB-113P19, complete sequence
Length=203961
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 135676 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 135627
>ref|NM_001135387.1| Pongo abelii DKFZP468G1528 protein (DKFZP468G1528), mRNA
emb|CR860251.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468G1528 (from clone DKFZp468G1528)
Length=2168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 31 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 80
>gb|U65081.1|HSU65081 Homo sapiens osteonectin (SPARC) gene, promoter region
Length=1370
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 1333
>emb|X82259.1| H.sapiens BM-40 gene
Length=2313
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1409 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 1458
>dbj|D28381.1|HUMO40 Homo sapiens mRNA for osteonectin, 5'UTR region
Length=90
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 CACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 CACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
>dbj|AK299441.1| Homo sapiens cDNA FLJ55667 complete cds, highly similar to Secreted
protein acidic and rich in cysteine
Length=1384
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 ACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 48
>dbj|AK096969.1| Homo sapiens cDNA FLJ39650 fis, clone SMINT2005075, highly similar
to SPARC PRECURSOR
Length=2035
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 ACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 48
>ref|XM_004042854.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla secreted protein, acidic,
cysteine-rich (osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3708
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 CCACATTCCCGCAGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 280
>dbj|AK315591.1| Homo sapiens cDNA, FLJ96669, highly similar to Homo sapiens secreted
protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA
Length=994
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 ACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1 ACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGANCGCGCTCTGCCTGCC 48
>ref|XM_003276547.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin), transcript variant 1 (SPARC), mRNA
Length=3613
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 CCACATTCCCGCAGACCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 169
>ref|NM_001133570.1| Pongo abelii secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)
(SPARC), mRNA
emb|CR861427.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459L172 (from clone DKFZp459L172)
Length=2214
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 29 CCACATTCCCGCAGACCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 78
>ref|XM_003900399.2| PREDICTED: Papio anubis secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=3250
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 115 CCACATTCCTGCAGACCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 164
>ref|XM_005558311.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925878 (LOC101925878),
mRNA
Length=3259
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 115 CCACATTCCTGCAGACCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 164
>ref|XM_001101364.2| PREDICTED: Macaca mulatta secreted protein, acidic, cysteine-rich
(osteonectin) (SPARC), mRNA
Length=1718
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 CCACATTCCTGCAGACCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 280
>dbj|AB169483.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-10162, similar to
human secreted protein, acidic, cysteine-rich (osteonectin)(SPARC),
mRNA, RefSeq: NM_003118.1
Length=2141
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 CACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
|||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 CACATTCCTGCAGACCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCC 50
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
5 5 151043130 151052697 30M7973N69M1494N1M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
5 5 151049315 151052697 30M1788N69M1494N1M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
5 5 151049333 151052690 12M1788N87M1469N1M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
5 5 151051156 151052690 99M1434N1M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||T
5 5 151051159 151052693 96M1434N4M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTC
5 5 151051162 151052696 93M1434N7M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGC
5 5 151051165 151052699 90M1434N10M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCAC
5 5 151051168 151052702 87M1434N13M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCAC
5 5 151051171 151052705 84M1434N16M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTC
5 5 151051174 151052708 81M1434N19M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTC
5 5 151051177 151052711 78M1434N22M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTC
5 5 151051180 151052714 75M1434N25M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGT
5 5 151051183 151052717 72M1434N28M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTC
5 5 151051186 151052720 69M1434N31M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTC
5 5 151051189 151052723 66M1434N34M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGC
5 5 151051192 151052726 63M1434N37M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCACC
5 5 151051195 151052729 60M1434N40M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCACCATC
5 5 151051198 151052732 57M1434N43M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCACCATCATC
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5 5 151051210 151052744 45M1434N55M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTAC
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5 5 151051216 151052750 39M1434N61M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCAC
5 5 151051219 151052753 36M1434N64M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTG
5 5 151051222 151052756 33M1434N67M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGAC
5 5 151051225 151052759 30M1434N70M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGG
5 5 151051228 151052762 27M1434N73M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATT
5 5 151051231 151052765 24M1434N76M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTTCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGC
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5 5 151052450 151052550 100M ACCACACACATGGATGGCCTGGAAACCGATCTTGCCCAGATCCCAGGGGACTGAGTGCCACAGTTTCCCACTTGTTAAGACACA
5 5 151052472 151052572 100M CACATGGATGGCCTGGAAACCGATCTTGCCCAGATCCCAGGGGACTGAGTGCCACAGTTTCCCACTTGTTAAGTCAAAGCCGTGTTTCCTTCATAGCCCA
5 5 151052535 151052635 100M ACTTGTTAAGTCAAAGCCGTGTTTCCTTCATAGCCCACTGAGGACCCCACCCTGCATTTCTGCTGGAAGGAGCCTCATGTAGGCTGTCCTCGTGCCCCAG
5 5 151052560 151052660 100M CTTCATAGCCCACTGAGGACCCCACCCTGCATTTCTGCTGGAAGGAGCCTCATGTAGGCTGTCCTCGTGCCCCAGGCCCAGGCAGCCAAGGGCAGCTTGG
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5 5 151052691 151066471 76M151066496F24m TCCGCCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTCCCACCTGGACAGGATTAGCTC CCACATTCCCGCGGTCCTTGAGAC
5 5 151052692 151066470 75M151066496F25m CCGCCACCTCCTCCTCTTCGGTTTCCTCTGCTCCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACT
5 5 151052705 151066457 62M151066496F38m CTCTTCGGTTTCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGC
5 5 151052713 151066449 54M151066496F46m TTTCCTCTGCACCATCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCC
5 5 151052727 151066435 40M151066496F60m TCATCAAATTCTCCTACTTCCACCTGGACAGGATTAGCTC CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGCCTGC
5 5 151052762 151055737 5M151066496F71m10663n24m AGCTC CCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTATGCCTGCCGCCTGCCTGCCTGCCACTGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151066503 151055740 79m10663n21m AAACCCCTCCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGCCTGCCTGCCACTGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151066500 151055737 76m10663n24m CCCCTTTACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGCCTGCCTGCCACTGAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151066497 151055734 27m10663n73m CTCCACATTCCCGCGGTCCTTCAGACT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151066494 151055731 30m10663n70m CACATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 151066491 151055728 33m10663n67m ATTCCCGCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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5 5 151066485 151055722 39m10663n61m GCGGTCCTTCAGACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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5 5 151066473 151055710 51m10663n49m ACTGCCCGGAGAGCGCGCTCTGCCTGCCGCCTGCCTGCCTGCCACTGAGGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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>ref|XM_010332733.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis guanine nucleotide
binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1),
mRNA
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Sbjct 653 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 604
>ref|XM_010384641.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 742 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 693
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
variant X4, mRNA
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
variant X3, mRNA
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 574 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 525
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 448 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 399
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protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 740 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 691
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beta-2-like 1 pseudogene (LOC100432783), misc_RNA
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Sbjct 432 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 383
>ref|XM_009209738.1| PREDICTED: Papio anubis guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 712 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 663
>ref|XM_003900658.2| PREDICTED: Papio anubis guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 740 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 691
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gene, encodes complete protein
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>gb|KJ898203.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_07597 GNB2L1
gene, encodes complete protein
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Sbjct 405 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 356
>ref|XM_008015592.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 616 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 567
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subunit beta-2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 568 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 519
>ref|XM_003279578.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1, transcript variant
1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 746 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 697
>ref|XM_004043173.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 753 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 704
>ref|NG_032940.1| Rattus norvegicus guanine nucleotide-binding protein subunit
beta-2-like 1-like (LOC100911540) pseudogene on chromosome 12
Length=1105
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Sbjct 442 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 393
>gb|GU727632.1| Homo sapiens epididymis tissue sperm binding protein Li 3a mRNA,
complete cds
Length=954
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Sbjct 340 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 291
>ref|XM_001105066.2| PREDICTED: Macaca mulatta guanine nucleotide-binding protein
subunit beta-2-like 1-like, transcript variant 4 (LOC708526),
mRNA
Length=1243
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Sbjct 568 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 519
>dbj|AB463707.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8255, Homo sapiens GNB2L1
gene for guanine nucleotide binding protein (G protein), beta
polypeptide 2-like 1, without stop codon, in Flexi system
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Sbjct 349 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 300
>dbj|AK301029.1| Homo sapiens cDNA FLJ60170 complete cds, highly similar to Guanine
nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1
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Sbjct 282 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 233
>emb|CU689261.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018874
3' read GNB2L1 mRNA
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Sbjct 630 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 679
>emb|CU689260.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018874
5' read GNB2L1 mRNA
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Sbjct 356 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 307
>dbj|AK310916.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17958
Length=1090
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Sbjct 456 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 407
>gb|DQ894596.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009056; FLH176783.01L;
RZPDo839H04121D guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1) gene, encodes
complete protein
Length=994
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Sbjct 362 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 313
>gb|DQ891422.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004052; FLH176787.01X; RZPDo839H04122D
guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1) gene, encodes complete protein
Length=994
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 362 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 313
>emb|AM393661.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002008 for hypothetical
protein (GNB2L1 gene)
Length=993
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Sbjct 360 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 311
>ref|NM_006098.4| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
Length=1125
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Sbjct 446 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 397
>gb|BC000672.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3350045, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2033
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Sbjct 1354 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 1305
>gb|BC073781.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6086784),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=1568
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 887 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 838
>gb|BC021034.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834363, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2680
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 1438 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 1487
>gb|BC014582.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3996513),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=1150
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 460 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 411
>gb|BC002620.1| Homo sapiens mRNA similar to guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (cDNA clone IMAGE:3161058)
Length=3247
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 2574 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 2525
>gb|AY336089.1| Homo sapiens proliferation-inducing gene 21 mRNA, complete cds
Length=965
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 347 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 298
>gb|BC014256.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:20686 IMAGE:4765908),
complete cds
Length=1095
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 423 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 374
>gb|AY159316.1| Homo sapiens lung cancer oncogene 7 mRNA, complete cds
Length=1616
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 914 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 865
>gb|BC019093.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:29656 IMAGE:4893346),
complete cds
Length=1104
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 424 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 375
>gb|BC000366.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:8325 IMAGE:2819249),
complete cds
Length=1111
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 434 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 385
>gb|BC000214.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:2416 IMAGE:2959178),
complete cds
Length=1137
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 464 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 415
>gb|BC017287.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:29695 IMAGE:4892271),
complete cds
Length=1083
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 411 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 362
>gb|BC010119.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:19788 IMAGE:3835636),
complete cds
Length=1111
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 421 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 372
>gb|BC019362.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:3561 IMAGE:2823761),
complete cds
Length=1122
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 428 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 379
>gb|BC029996.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4519568)
Length=952
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 50
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Sbjct 273 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 224
>gb|BT008246.1| Synthetic construct Homo sapiens guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 mRNA, partial
cds
Length=954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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complete cds
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beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:9338 IMAGE:3455986),
complete cds
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human guanine nucleotide binding protein (G protein), betapolypeptide
2-like 1 (GNB2L1), mRNA, RefSeq: NM_006098.2
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beta polypeptide 2-like 1 variant, clone: adKA02454
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beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:24470 IMAGE:4083071),
complete cds
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for gene GNB2L1, guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1; complete cds, without stopcodon
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>emb|CR456978.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C085D
for gene GNB2L1, guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1; complete cds, incl. stopcodon
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nucleotide binding protein beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1)
mRNA, partial cds
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>gb|AY892767.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024733.01L guanine
nucleotide binding protein beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1)
mRNA, partial cds
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beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4705256)
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>gb|M24194.1|HUMMHBA123 Human MHC protein homologous to chicken B complex protein mRNA,
complete cds
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beta-2-like 1 pseudogene (LOC100456399), misc_RNA
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protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript variant
X2, mRNA
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>ref|XM_008956905.1| PREDICTED: Pan paniscus guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 744 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACGAATCGCCTCGTG 695
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 740 AGAACGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCGCCTCGTG 691
>ref|XR_621570.1| PREDICTED: Callithrix jacchus guanine nucleotide-binding protein
subunit beta-2-like 1 pseudogene (LOC100895688), misc_RNA
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protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1
(GNB2L1), mRNA
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Sbjct 432 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCTACAAATCGGCGCGTG 383
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 584 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCTACAAATCGGCGCGTG 535
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protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 456 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCTACAAATCGGCGCGTG 407
>ref|XM_006177985.1| PREDICTED: Camelus ferus guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 456 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCTACAAATCGGCGCGTG 407
>ref|XM_005410096.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (Gnb2l1), mRNA
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Sbjct 460 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCTACAAATCGTCTTGTG 411
>ref|XM_004468588.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 512 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCAACAAATCGGCGCGTG 463
>ref|XM_004316678.1| PREDICTED: Tursiops truncatus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1, transcript variant
2 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 458 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCTACAAATCGGCGCGTG 409
>ref|XM_004316677.1| PREDICTED: Tursiops truncatus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1, transcript variant
1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 469 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCTACAAATCGGCGCGTG 420
>ref|XM_004277640.1| PREDICTED: Orcinus orca guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 446 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCTACAAATCGGCGCGTG 397
>ref|XM_008544294.1| PREDICTED: Equus przewalskii guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCG 43
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Sbjct 454 AGAATGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCG 412
>ref|XM_006923230.1| PREDICTED: Pteropus alecto guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
Length=1162
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCG 43
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Sbjct 505 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCTACAAATCG 463
>ref|XM_004443583.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1),
mRNA
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCG 43
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Sbjct 470 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGTCCCACAAATCG 428
>ref|NM_001242446.1| Equus caballus guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Query 1 AGAAGGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCG 43
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Sbjct 445 AGAATGCCACACTCAGCACATCCTTGGTATGGCCCACAAATCG 403
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG
>ref|XR_094237.3| PREDICTED: Pongo abelii guanine nucleotide-binding protein subunit
beta-2-like 1 pseudogene (LOC100432783), misc_RNA
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Sbjct 10 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 59
>ref|NG_032940.1| Rattus norvegicus guanine nucleotide-binding protein subunit
beta-2-like 1-like (LOC100911540) pseudogene on chromosome 12
Length=1105
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Query 1 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 81
>gb|JN104586.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein beta polypeptide
2-like 1 (GNB2L1) mRNA, partial cds
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Query 1 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 263
>dbj|AK303316.1| Homo sapiens cDNA FLJ56705 complete cds, highly similar to Guanine
nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1
Length=1016
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 44 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 93
>dbj|AK301468.1| Homo sapiens cDNA FLJ52787 complete cds, highly similar to Guanine
nucleotide-binding protein subunitbeta 2-like 1
Length=1035
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Query 1 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 81
>dbj|AK310916.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17958
Length=1090
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Query 1 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 83
>ref|NM_006098.4| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
Length=1125
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Query 1 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 50
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Sbjct 36 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 85
>gb|BC000672.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3350045, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2033
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Query 1 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 50
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Sbjct 944 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 993
>gb|BC073781.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6086784),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=1568
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Query 1 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 526
>gb|BC021034.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834363, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2680
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 1799
>gb|BC002620.1| Homo sapiens mRNA similar to guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (cDNA clone IMAGE:3161058)
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1, transcript variant
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protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript variant
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subunit beta-2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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subunit beta-2-like 1-like (LOC708526), mRNA
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subunit beta-2-like 1-like, transcript variant 4 (LOC708526),
mRNA
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Sbjct 158 GTGTTGCTCGTTTCTCTGAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCG 207
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human guanine nucleotide binding protein (G protein), betapolypeptide
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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genome shotgun sequence
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 180101606 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 180101655
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279184519, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 175396144 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 175396193
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Sbjct 176297055 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 176297104
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC
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>ref|NT_023133.14| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR5_CTG5
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assembly
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genome shotgun sequence
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>ref|NW_004929325.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Query 1 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
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Sbjct 3311471 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 3311422
>gb|GL583209.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_229, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 44609 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 44658
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Sbjct 175398263 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 175398214
>gb|DS990839.1| Homo sapiens SCAF_1112675833464 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 3202390 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 3202341
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Sbjct 187383966 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 187384015
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Sbjct 188058175 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 188058126
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>ref|NW_001838967.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279184519, whole genome shotgun sequence
gb|DS486201.1| Homo sapiens SCAF_1103279184519 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 3202173 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 3202124
>gb|CH471165.2| Homo sapiens 211000035830525 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
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Sbjct 175397841 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 175397792
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Sbjct 176298752 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 176298703
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA
>ref|XM_010332733.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis guanine nucleotide
binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1),
mRNA
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 566 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 517
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protein subunit beta-2-like 1 pseudogene (LOC101028399),
misc_RNA
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 259 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 210
>ref|XM_010384641.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 655 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 606
>ref|XM_009450356.1| PREDICTED: Pan troglodytes guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 487 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 438
>ref|XM_009450355.1| PREDICTED: Pan troglodytes guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 360 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 311
>ref|XM_009450354.1| PREDICTED: Pan troglodytes guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 487 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 438
>ref|XM_518165.5| PREDICTED: Pan troglodytes guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 361 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 312
>ref|XM_009209738.1| PREDICTED: Papio anubis guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1370
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 625 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 576
>ref|XM_003900658.2| PREDICTED: Papio anubis guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1398
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 653 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 604
>ref|XM_008956915.1| PREDICTED: Pan paniscus guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1157
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 657 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 608
>ref|XM_008956905.1| PREDICTED: Pan paniscus guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1410
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 657 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 608
>ref|XR_621570.1| PREDICTED: Callithrix jacchus guanine nucleotide-binding protein
subunit beta-2-like 1 pseudogene (LOC100895688), misc_RNA
Length=1085
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 336 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 287
>ref|XM_002806602.3| PREDICTED: Callithrix jacchus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
Length=1410
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 653 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 604
>gb|KJ906040.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_15710 GNB2L1
gene, encodes complete protein
Length=1083
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 318 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 269
>gb|KJ898203.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_07597 GNB2L1
gene, encodes complete protein
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Sbjct 318 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 269
>ref|XM_008015592.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 529 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 480
>ref|XM_005558843.1| PREDICTED: Macaca fascicularis Guanine nucleotide-binding protein
subunit beta-2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 481 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 432
>ref|XM_003279578.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1, transcript variant
1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 659 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 610
>ref|XM_004043173.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 666 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 617
>ref|NG_032940.1| Rattus norvegicus guanine nucleotide-binding protein subunit
beta-2-like 1-like (LOC100911540) pseudogene on chromosome 12
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Sbjct 355 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 306
>gb|GU727632.1| Homo sapiens epididymis tissue sperm binding protein Li 3a mRNA,
complete cds
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Sbjct 253 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 204
>ref|XM_001105066.2| PREDICTED: Macaca mulatta guanine nucleotide-binding protein
subunit beta-2-like 1-like, transcript variant 4 (LOC708526),
mRNA
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Sbjct 481 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 432
>dbj|AB463707.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB8255, Homo sapiens GNB2L1
gene for guanine nucleotide binding protein (G protein), beta
polypeptide 2-like 1, without stop codon, in Flexi system
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Sbjct 262 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 213
>dbj|AK303316.1| Homo sapiens cDNA FLJ56705 complete cds, highly similar to Guanine
nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1
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Sbjct 367 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 318
>dbj|AK301468.1| Homo sapiens cDNA FLJ52787 complete cds, highly similar to Guanine
nucleotide-binding protein subunitbeta 2-like 1
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Sbjct 355 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 306
>emb|CU689260.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100018874
5' read GNB2L1 mRNA
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Sbjct 269 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 220
>dbj|AK310916.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17958
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 369 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 320
>gb|DQ894596.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009056; FLH176783.01L;
RZPDo839H04121D guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1) gene, encodes
complete protein
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Sbjct 275 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 226
>gb|DQ891422.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004052; FLH176787.01X; RZPDo839H04122D
guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1) gene, encodes complete protein
Length=994
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 275 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 226
>emb|AM393661.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100002008 for hypothetical
protein (GNB2L1 gene)
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Sbjct 273 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 224
>ref|NM_006098.4| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 359 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 310
>gb|BC000672.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3350045, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 1267 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 1218
>gb|BC073781.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6086784),
**** WARNING: chimeric clone ****
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 800 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 751
>gb|BC021034.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834363, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2680
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 1525 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 1574
>gb|BC014582.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3996513),
**** WARNING: chimeric clone ****
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 373 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 324
>gb|BC002620.1| Homo sapiens mRNA similar to guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (cDNA clone IMAGE:3161058)
Length=3247
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 2487 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 2438
>gb|AY336089.1| Homo sapiens proliferation-inducing gene 21 mRNA, complete cds
Length=965
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 256 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 207
>gb|BC014256.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:20686 IMAGE:4765908),
complete cds
Length=1095
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 336 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 287
>gb|AY159316.1| Homo sapiens lung cancer oncogene 7 mRNA, complete cds
Length=1616
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 827 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 778
>gb|BC019093.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:29656 IMAGE:4893346),
complete cds
Length=1104
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 337 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 288
>gb|BC000366.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:8325 IMAGE:2819249),
complete cds
Length=1111
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 347 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 298
>gb|BC000214.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:2416 IMAGE:2959178),
complete cds
Length=1137
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 377 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 328
>gb|BC017287.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:29695 IMAGE:4892271),
complete cds
Length=1083
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 324 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 275
>gb|BC010119.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:19788 IMAGE:3835636),
complete cds
Length=1111
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 334 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 285
>gb|BC019362.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:3561 IMAGE:2823761),
complete cds
Length=1122
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 341 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 292
>gb|BC029996.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4519568)
Length=952
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 186 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 137
>gb|BT008246.1| Synthetic construct Homo sapiens guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 mRNA, partial
cds
Length=954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 253 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 204
>gb|BC032006.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:21438 IMAGE:4750184),
complete cds
Length=1143
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 338 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 289
>gb|BC014788.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:9338 IMAGE:3455986),
complete cds
Length=1084
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 343 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 294
>dbj|AB168677.1| Macaca fascicularis testis cDNA clone: QtsA-14081, similar to
human guanine nucleotide binding protein (G protein), betapolypeptide
2-like 1 (GNB2L1), mRNA, RefSeq: NM_006098.2
Length=1117
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 353 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 304
>dbj|AK222488.1| Homo sapiens mRNA for guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1 variant, clone: adKA02454
Length=1098
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 359 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 310
>gb|BC021993.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:24470 IMAGE:4083071),
complete cds
Length=1142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 359 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 310
>emb|CR541909.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834H0433D
for gene GNB2L1, guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1; complete cds, without stopcodon
Length=951
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 253 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 204
>emb|CR456978.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834C085D
for gene GNB2L1, guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1; complete cds, incl. stopcodon
Length=954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 253 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 204
>gb|AC008443.10| Homo sapiens chromosome 5 clone CTC-338M12, complete sequence
Length=120515
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 62741 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 62790
>gb|AY892768.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024734.01L guanine
nucleotide binding protein beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1)
mRNA, partial cds
Length=954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 253 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 204
>gb|AY892767.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH024733.01L guanine
nucleotide binding protein beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1)
mRNA, partial cds
Length=954
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 253 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 204
>gb|BC035460.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4705256)
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
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protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (Gnb2l1),
mRNA
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nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1
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binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1, transcript variant
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1, transcript variant
1 (GNB2L1), mRNA
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protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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3' read GNB2L1 mRNA
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beta-2-like 1 pseudogene (LOC100432783), misc_RNA
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (Gnb2l1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 341 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATAACGACA 292
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (Gnb2l1), transcript
variant X1, partial mRNA
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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misc_RNA
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binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (Gnb2l1),
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binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (Gnb2l1),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 384 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATAACAACA 335
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protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 367 TCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 321
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protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Query 3 TCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCAC 49
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Sbjct 367 TCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 321
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subunit beta-2-like 1-like (LOC101999098), misc_RNA
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subunit beta-2-like 1-like (LOC101827432), misc_RNA
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Sbjct 232 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATAACGACA 183
>ref|XM_005071975.1| PREDICTED: Mesocricetus auratus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (Gnb2l1), mRNA
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Sbjct 383 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATAACAACA 334
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 360 CATCCCAGGAGCCGGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCACA 311
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 111 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACTACA 62
>ref|XM_004443583.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1),
mRNA
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Sbjct 383 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAAGAGATGACCACA 334
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protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 383 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGAT 341
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 367 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAAGAGATCACCAC 319
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(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCAC 49
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Sbjct 359 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCCGAGGAGATGACCAC 311
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protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 526 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCGTCTGAGGAGATGACCAC 478
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protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 355 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 307
>ref|XM_006746567.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 385 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 337
>ref|XM_005977722.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii guanine nucleotide-binding protein
subunit beta-2-like 1-like (LOC102319433), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 363 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAAATGACCAC 315
>ref|XM_005977721.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii guanine nucleotide-binding protein
subunit beta-2-like 1-like (LOC102319433), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 608 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAAATGACCAC 560
>ref|XM_005682793.1| PREDICTED: Capra hircus guanine nucleotide binding protein (G
protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 383 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAAATGACCAC 335
>ref|XM_005658237.1| PREDICTED: Sus scrofa guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), transcript variant
X1, mRNA
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Sbjct 641 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 593
>ref|NM_001281479.1| Ovis aries guanine nucleotide binding protein (G protein), beta
polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
gb|KC422451.1| Ovis aries breed Duo Lang guanine nucleotide-binding protein
beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1) mRNA, complete cds
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Sbjct 319 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAAATGACCAC 271
>ref|XM_004413494.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens guanine nucleotide binding
protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1),
mRNA
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Sbjct 385 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 337
>dbj|AK398315.1| Sus scrofa mRNA, clone: TES010110E04, expressed in testis
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Sbjct 388 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 340
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Sbjct 361 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 313
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 309
>dbj|AK400828.1| Sus scrofa mRNA, clone: PST010049H10, expressed in prostate
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Sbjct 356 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 308
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blood lymphocytes
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Sbjct 387 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 339
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Sbjct 1252 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 1204
>dbj|AK392619.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10090D08, expressed in hypothalamus
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gland
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Sbjct 358 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 310
>dbj|AK394803.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVR010015H02, expressed in ovary
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCAC 49
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Sbjct 386 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 338
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beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Sbjct 358 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAAGAGATCACCAC 310
>dbj|AK345704.1| Sus scrofa mRNA, clone:LNG010090H07, expressed in lung
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCAC 49
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 309
>dbj|AK351147.1| Sus scrofa mRNA, clone:TES010006C09, expressed in testis
Length=1122
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCAC 49
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Sbjct 358 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 310
>dbj|AK347796.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010099G10, expressed in ovary
Length=1120
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCAC 49
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Sbjct 355 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 307
>dbj|AK239961.1| Sus scrofa mRNA, clone:UTR010015H04, expressed in uterus
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCAC 49
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Sbjct 359 CATCCCAGGAGCCCGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 311
>dbj|AK237420.1| Sus scrofa mRNA, clone:SPL010041B01, expressed in spleen
Length=1123
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>ref|XM_006766846.1| PREDICTED: Myotis davidii guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
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Query 3 TCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCAC 49
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Sbjct 416 TCCCAGGAGCCAGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 370
>ref|XM_006105763.1| PREDICTED: Myotis lucifugus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
Length=1165
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCAC 49
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Sbjct 416 TCCCAGGAGCCAGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 370
>ref|XM_005862335.1| PREDICTED: Myotis brandtii guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
Length=1165
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCAC 49
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Sbjct 416 TCCCAGGAGCCAGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATGACCAC 370
>ref|XM_005350198.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (Gnb2l1), mRNA
Length=1258
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Sbjct 361 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 312
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
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Sbjct 356 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 307
>emb|FQ220428.1| Rattus norvegicus TL0ADA42YO17 mRNA sequence
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Sbjct 361 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 312
>emb|FQ220419.1| Rattus norvegicus TL0ADA42YP04 mRNA sequence
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
>emb|FQ220391.1| Rattus norvegicus TL0ADA43YB03 mRNA sequence
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
>emb|FQ230328.1| Rattus norvegicus TL0AEA9YH18 mRNA sequence
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Sbjct 358 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 309
>emb|FQ230117.1| Rattus norvegicus TL0ADA45YJ11 mRNA sequence
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
>emb|FQ230018.1| Rattus norvegicus TL0ADA45YO14 mRNA sequence
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Sbjct 365 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 316
>emb|FQ230003.1| Rattus norvegicus TL0ADA45YP06 mRNA sequence
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Sbjct 355 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 306
>emb|FQ229923.1| Rattus norvegicus TL0ADA46YD12 mRNA sequence
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Sbjct 356 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 307
>emb|FQ229916.1| Rattus norvegicus TL0ADA46YD23 mRNA sequence
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Sbjct 355 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 306
>emb|FQ229911.1| Rattus norvegicus TL0ADA46YE06 mRNA sequence
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
>emb|FQ229908.1| Rattus norvegicus TL0ADA46YE09 mRNA sequence
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Sbjct 358 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 309
>emb|FQ220314.1| Rattus norvegicus TL0ADA43YF19 mRNA sequence
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>emb|FQ220286.1| Rattus norvegicus TL0ADA43YH14 mRNA sequence
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>emb|FQ220277.1| Rattus norvegicus TL0ADA43YI04 mRNA sequence
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
>emb|FQ220151.1| Rattus norvegicus TL0ADA44YA09 mRNA sequence
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
>emb|FQ229758.1| Rattus norvegicus TL0ADA46YM17 mRNA sequence
Length=1116
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
>emb|FQ229737.1| Rattus norvegicus TL0ADA46YO01 mRNA sequence
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
>emb|FQ233024.1| Rattus norvegicus TL0AEA63YI04 mRNA sequence
Length=1118
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 357 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 308
>gb|AF295529.1|AF295529 Mus musculus activated protein kinase C receptor (Rack1) gene,
exons 1 through 7 and partial cds
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 5137 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 5088
>ref|NM_175802.2| Bos taurus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta
polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
emb|AJ132860.1| Bos taurus mRNA for receptor for activated C kinase
Length=1091
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 351 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 302
>gb|BC063809.1| Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:72712 IMAGE:6919982),
complete cds
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Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
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Sbjct 361 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 312
>gb|U03390.1|RNU03390 Rattus norvegicus Sprague Dawley protein kinase C receptor mRNA,
complete cds
Length=1089
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||
Sbjct 349 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCAGAGGAGATGACAACA 300
>ref|XM_008683729.1| PREDICTED: Ursus maritimus guanine nucleotide binding protein
(G protein), beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
Length=1167
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Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCAC 49
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Sbjct 424 CATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAAGAAATGACCAC 376
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC
>ref|NM_006098.4| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1 (GNB2L1), mRNA
Length=1125
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
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Sbjct 8 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 57
>gb|BC000214.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:2416 IMAGE:2959178),
complete cds
Length=1137
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
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Sbjct 26 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 75
>dbj|AK095666.1| Homo sapiens cDNA FLJ38347 fis, clone FCBBF4000173, highly similar
to Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like
1
Length=981
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
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Sbjct 6 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 55
>gb|BC021993.1| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:24470 IMAGE:4083071),
complete cds
Length=1142
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Query 1 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
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Sbjct 8 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 57
>gb|AC008443.10| Homo sapiens chromosome 5 clone CTC-338M12, complete sequence
Length=120515
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 64438 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 64389
>dbj|D28398.1|HUMGPB57 Homo sapiens mRNA for G protein beta subunit-like protein 12.3,
5'UTR region
Length=109
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Query 1 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
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Sbjct 5 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 54
>emb|Z55281.1| H.sapiens CpG island DNA genomic Mse1 fragment, clone 30b11,
forward read cpg30b11.ft1b
Length=268
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
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Sbjct 212 TCACTGCAAGGCGGNGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 261
>dbj|AK222488.1| Homo sapiens mRNA for guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1 variant, clone: adKA02454
Length=1098
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8 TCACTGCAAGGCGGAGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 57
>gb|M24194.1|HUMMHBA123 Human MHC protein homologous to chicken B complex protein mRNA,
complete cds
Length=1093
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 47
>gb|BC000672.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3350045, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2033
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 GCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 921 GCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 965
>gb|BC021034.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834363, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2680
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 GCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1871 GCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 1827
>gb|BC000366.2| Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein),
beta polypeptide 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:8325 IMAGE:2819249),
complete cds
Length=1111
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
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Query 6 GCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCC 45
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1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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reads
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5 5 180666155 180669205 22M309N46M2641N32M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATC
5 5 180666555 180669170 27M1909N72M606N1M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
5 5 180666577 180669192 5M1909N72M606N23M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGC
5 5 180668499 180669209 64M610N36M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAG
5 5 180668532 180669242 31M610N69M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAG
5 5 180668536 180669242 27M606N73M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAG
5 5 180668540 180669174 99M534N1M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||G
5 5 180668543 180669177 96M534N4M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTG
5 5 180668546 180669180 93M534N7M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGA
5 5 180668549 180669183 90M534N10M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGAT
5 5 180668552 180669186 87M534N13M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCC
5 5 180668555 180669189 84M534N16M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGGGATCCCAGA
5 5 180668558 180669192 81M534N19M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGC
5 5 180668561 180669195 78M534N22M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCA
5 5 180668564 180669198 75M534N25M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGG
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5 5 180668570 180669204 69M534N31M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTACCAT
5 5 180668573 180669207 66M534N34M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCC
5 5 180668576 180669210 63M534N37M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGG
5 5 180668579 180669213 60M534N40M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGC
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5 5 180668594 180669228 45M534N55M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACT
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5 5 180668606 180669240 33M534N67M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGG
5 5 180668609 180669243 30M534N70M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGA
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5 5 180668620 180670895 19M534N78M180670899F3m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCA
5 5 180668620 180670895 19M534N78M180670899F3m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCA
5 5 180668620 180670895 19M534N78M180670899F3m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCA
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5 5 180668620 180670895 19M534N78M180670899F3m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCA
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5 5 180668620 180670895 19M534N78M180670899F3m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCA
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5 5 180668988 180669088 100M CACACTCCTCAGCAATGCTGAGTAACTTATTTAAAGTGAGGGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCACTTCCCAAATGGACTGGATCT
5 5 180668992 180669092 100M CTCCTCAGCAATGCTGAGTAACTTATTTAAAGTGAGGGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCC
5 5 180668996 180669096 100M TCAGCAATGCTGAGTAACTTATTTAAAGTGAGGGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGCGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGCTCTCCCCTGGG
5 5 180668999 180669099 100M GCAATGCTGAGTAACTTATTTAAAGTGAGGGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAA
5 5 180669007 180669107 100M GAGTAACTTATTTAAAGTGAGGGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAA
5 5 180669010 180669110 100M TAACTTATTTAAAGTGAGGGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTG
5 5 180669013 180669113 100M CTTATTTAAAGTGAGGGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCCCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCAT
5 5 180669016 180669116 100M ATTTAAAGTGAGGGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCA
5 5 180669019 180669119 100M TAAAGTGAGGGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCAAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCT
5 5 180669022 180669122 100M AGTGAGGGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCAC
5 5 180669025 180669125 100M GAGGGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTC
5 5 180669028 180669128 100M GGAGGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGC
5 5 180669031 180669131 100M GGCCAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCA
5 5 180669034 180669134 100M CAAACATCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGAT
5 5 180669037 180669137 100M ACATCTTCTGAAGGTGTCCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTCT
5 5 180669040 180669140 100M TCTTCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCC
5 5 180669043 180669143 100M TCTGTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAA
5 5 180669046 180669146 100M GTAGGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGC
5 5 180669049 180669149 100M GGTGTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCC
5 5 180669052 180669152 100M GTGCTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGA
5 5 180669055 180669155 100M CTCTGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCT
5 5 180669058 180669158 100M TGCTTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAG
5 5 180669061 180669161 100M TTTCCAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTCTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGA
5 5 180669065 180669165 100M CAGTTCCCAAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAG
5 5 180669068 180669168 100M TTCCCAAATGGACTGGACCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTA
5 5 180669073 180669173 100M AAATGGACTGGATCTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGC
5 5 180669083 180669183 100M GATCTGCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGAT
5 5 180669086 180669186 100M CTCCCCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCC
5 5 180669090 180669190 100M CCTGGGAAACCAGCCAATTGCATCCGCCGCACTTCTGCCCAGATTCTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAG
5 5 180669093 180669193 100M GGGAAACCAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCG
5 5 180669096 180669196 100M AAACCAGCCACTTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAG
5 5 180669100 180669200 100M CAGCCAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTT
5 5 180669104 180669204 100M CAATTGCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTCTTCCCAAAGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCAT
5 5 180669107 180669207 100M TTTCATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCC
5 5 180669111 180669211 100M ATCCACCTCACTTCTGCCCAGATTCTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGA
5 5 180669115 180669215 100M ACCTCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCT
5 5 180669118 180669218 100M TCACTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAG
5 5 180669121 180669221 100M CTTCTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGG
5 5 180669124 180669224 100M CTGCCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCA
5 5 180669127 180669227 100M CCCAGATTTTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTCAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAAC
5 5 180669130 180669230 100M AGATTCTTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGG
5 5 180669136 180669236 100M TTCCCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCT
5 5 180669139 180669239 100M CCAAGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCCTCTGAG
5 5 180669142 180669242 100M AGGCCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATATGAGGAG
5 5 180669145 180669245 100M CCCCAGAGCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATA
5 5 180669148 180669248 100M CAGAGCTAAATGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGACGAGATAACC
5 5 180669152 180669252 100M GCTAAGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACAT
5 5 180669156 180669256 100M AGTGAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCTCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACATCACT
5 5 180669159 180669259 100M GAGCAGCTACTTGCGTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACATCACTAAC
5 5 180669173 180670876 78M180670899F22m GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCGGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGA
5 5 180669173 180670876 78M180670899F22m GTTTTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGA
5 5 180669173 180670876 78M180670899F22m GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTTCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCAATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGA
5 5 180669173 180670876 78M180670899F22m GTTGTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCCGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGA
5 5 180669176 180670873 75M180670899F25m GTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAG
5 5 180669176 180670873 75M180670899F25m GTGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAG
5 5 180669177 180670872 74M180670899F26m TGAGATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGG
5 5 180669180 180670869 71M180670899F29m GATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTG
5 5 180669180 180670869 71M180670899F29m GATCCCAGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTG
5 5 180669186 180670863 65M180670899F35m AGAGGCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGC
5 5 180669190 180670859 61M180670899F39m GCGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGAGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGT
5 5 180669191 180670858 60M180670899F40m CGCAGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTT
5 5 180669194 180670855 57M180670899F43m AGGGTTCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCT
5 5 180669199 180670850 52M180670899F48m TCCATCCCAGGAGCCTGAGAGGGCAAACTGGCCATCTGAGGAGATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAG
5 5 180669241 180670808 10M180670899F90m GATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGTTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTC
5 5 180669241 180670808 10M180670899F90m GATAACCACA TCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTC
5 5 180670906 180670806 100m TTTCTTTTTCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGC
5 5 180670903 180670803 100m CTCTTTCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGC
5 5 180670900 180670800 100m TTTCACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGC
5 5 180670897 180670797 100m CACTGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCATTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCAT
5 5 180670894 180670794 100m TGCAAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGAC
5 5 180670891 180670791 100m AAGGCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGA
5 5 180670888 180670788 100m GCGGCGGCAGGAGAGGTTGTGTTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCCCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCA
5 5 180670885 180670785 100m GCGGCAGGAGAGGTTGTGGGGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGAT
5 5 180670882 180670782 100m GAAAGAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGAC
5 5 180670879 180670779 100m GAAGAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCT
5 5 180670876 180670776 100m GAGGTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCG
5 5 180670873 180670773 100m GTTGTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGG
5 5 180670870 180670770 100m GTGGTGCTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTAGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCAC
5 5 180670867 180670767 100m GTGCTAGTTTCTCTAAGCCACCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCCCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCT
5 5 180670864 180670764 100m CTAGTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAA
5 5 180670861 180670761 100m GTTTCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGG
5 5 180670858 180670758 100m TCTCTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCCCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCA
5 5 180670855 180670755 100m CTAAGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAAGGCCACAA
5 5 180670852 180670752 100m AGCCATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGG
5 5 180670848 180670748 100m ATCCAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGG
5 5 180670845 180670745 100m CAGTGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTA
5 5 180670842 180670742 100m TGCCATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACC
5 5 180670839 180670739 100m CATCCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAG
5 5 180670836 180670736 100m CCTCGTCGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATC
5 5 180670833 180670733 100m CGTCGCTGCAGCGACACGCGCCCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCT
5 5 180670830 180670730 100m CGCTGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACT
5 5 180670827 180670727 100m TGCAGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCCCCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACC
5 5 180670824 180670724 100m AGCGACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACCCCG
5 5 180670821 180670721 100m GACACACGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACCCCGCAG
5 5 180670818 180670718 100m ACACGCTCTCGCCGCCGGCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACCCCGCAGTTC
5 5 180670815 180670715 100m CGCTCTCGCCGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACCCCGCAGTTCCCG
5 5 180670812 180670712 100m TCTCGCGGCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACCCCGCAGTTCCCGGAC
5 5 180670809 180670709 100m CGCCCCCGCCATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACCCCGCAGTTCCCGGACATG
5 5 180670806 180670706 100m CGCCGCCATGACTGAGCAGATCACCCTTCGTGGCGCCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACCCCGCAGTTCCCGGACATGATC
5 5 180670803 180670703 100m CGCCATGACTGAGCAGATGCCCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACCCCGCAGTTCCCGGACATGATCCTC
5 5 180670800 180670700 100m CATGACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACCCCGCAGTTCCCGGACATGATCCTCTCC
5 5 180670797 180670697 100m GACTGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACCCCGCAGTTCCCGGACATGATCCTCTCCGCC
5 5 180670794 180670694 100m TGAGCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTCCCCCGCAGTTCCCGGACATGATCCTCTCCGCCTCT
5 5 180670791 180670691 100m GCAGATGACCCTTCGTGGCACCCTCAAGGGCCACAACGGCTGGGTAACCCAGATCGCTACTACCCCGCAGTTCCCGGACATGATCCTCTCCGCCTCTCGA
5 5 180670788 180669231 2m1457n98m GA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 180670785 180669339 5m1346n95m GACCC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 180670782 180669336 8m1346n92m CCTTCGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 5 180670779 180669332 12m1346n24m1d64m TCGTGGCACCCT|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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5 5 180670773 180669327 17m1346n83m CACCCTCAAGGGCCACA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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X2, mRNA
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X2, mRNA
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Sbjct 1005 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 956
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X1, mRNA
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X1, mRNA
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variant 1, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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mRNA
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1 (NRN1), mRNA
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3 (NRN1), mRNA
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2 (NRN1), mRNA
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Sbjct 998 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 949
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1 (NRN1), mRNA
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Sbjct 568 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 519
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Sbjct 493 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 444
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2 (NRN1), mRNA
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Sbjct 494 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 445
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Sbjct 471 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 422
>ref|XM_002915036.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca neuritin-like (LOC100480156),
mRNA
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Sbjct 471 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 422
>ref|XM_002803585.1| PREDICTED: Macaca mulatta neuritin-like, transcript variant 2
(LOC722968), mRNA
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Sbjct 474 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 425
>dbj|AK314095.1| Homo sapiens cDNA, FLJ94778, Homo sapiens neuritin 1 (NRN1),
mRNA
Length=633
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Sbjct 553 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 504
>ref|NM_001285189.1| Macaca fascicularis Neuritin (LOC101926116), mRNA
dbj|AB173835.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10580, similar to
human neuritin 1 (NRN1), mRNA, RefSeq: NM_016588.2
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Sbjct 498 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 449
>gb|BC042019.1| Homo sapiens neuritin 1, mRNA (cDNA clone MGC:44811 IMAGE:5312094),
complete cds
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Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
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Sbjct 1001 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 952
>ref|NM_016588.2| Homo sapiens neuritin 1 (NRN1), transcript variant 1, mRNA
Length=2072
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Sbjct 1000 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 951
>dbj|AK093824.1| Homo sapiens cDNA FLJ36505 fis, clone TRACH1000011, highly similar
to Homo sapiens neuritin mRNA
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Sbjct 1195 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 1146
>emb|AL136307.12| Human DNA sequence from clone RP3-380B8 on chromosome 6p24.1-25.3,
complete sequence
Length=186882
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Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
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Sbjct 143667 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 143716
>gb|BC002683.2| Homo sapiens neuritin 1, mRNA (cDNA clone MGC:3391 IMAGE:3605775),
complete cds
Length=1551
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Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
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Sbjct 478 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 429
>emb|AJ420483.1| Homo sapiens mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1708764
Length=1548
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
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Sbjct 474 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 425
>gb|AF136631.1|AF136631 Homo sapiens neuritin mRNA, complete cds
Length=1589
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
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Sbjct 517 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 468
>ref|XM_007466382.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=1579
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Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
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Sbjct 555 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 507
>ref|XM_007173912.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni neuritin 1 (NRN1),
transcript variant X3, mRNA
Length=1343
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 267
>ref|XM_007173911.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni neuritin 1 (NRN1),
transcript variant X2, mRNA
Length=1931
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 855
>ref|XM_007173910.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni neuritin 1 (NRN1),
transcript variant X1, mRNA
Length=1659
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
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Sbjct 631 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 583
>ref|XM_007125186.1| PREDICTED: Physeter catodon neuritin 1 (NRN1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1626
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Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
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Sbjct 608 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 560
>ref|XM_007125185.1| PREDICTED: Physeter catodon neuritin 1 (NRN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1351
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
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Sbjct 450 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 402
>ref|XM_003482121.2| PREDICTED: Sus scrofa neuritin-like (LOC100737220), transcript
variant X1, mRNA
Length=1578
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
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Sbjct 546 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 498
>ref|XM_005665547.1| PREDICTED: Sus scrofa neuritin-like (LOC100737220), transcript
variant X2, mRNA
Length=1456
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 376
>ref|XM_005665546.1| PREDICTED: Sus scrofa neuritin 1 (NRN1), transcript variant X1,
mRNA
Length=1456
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 376
>ref|XM_004315632.1| PREDICTED: Tursiops truncatus neuritin-like (LOC101317237), mRNA
Length=429
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 301
>ref|XM_004281058.1| PREDICTED: Orcinus orca neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=1580
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 510
>dbj|AK400249.1| Sus scrofa mRNA, clone: BFLT10114F10, expressed in brain (frontal
lobe)
Length=1508
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 521
>dbj|AK391612.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10007C12, expressed in hypothalamus
Length=1605
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 504
>ref|NM_001243601.1| Sus scrofa neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=1576
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 478
>dbj|AK233644.1| Sus scrofa mRNA, clone:LVRM10194G01, expressed in liver
Length=1581
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 483
>gb|AY609547.1| Sus scrofa clone Clu_169184.scr.msk.p1.Contig1, mRNA sequence
Length=1548
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 451
>ref|XM_004598617.1| PREDICTED: Ochotona princeps neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=758
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 CCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 495
>ref|XM_003897008.2| PREDICTED: Papio anubis neuritin 1 (NRN1), transcript variant
X2, mRNA
Length=2057
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 CCCCGTTACCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 943
>ref|XM_009204394.1| PREDICTED: Papio anubis neuritin 1 (NRN1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1527
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 CCCCGTTACCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 413
>ref|XM_008066861.1| PREDICTED: Tarsius syrichta neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=1596
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 556 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGAAGTTGAGG 507
>ref|XM_007634965.1| PREDICTED: Cricetulus griseus neuritin 1 (Nrn1), transcript variant
X2, mRNA
Length=623
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520 CCCCATTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 471
>ref|XM_003497478.2| PREDICTED: Cricetulus griseus neuritin 1 (Nrn1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1553
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCCCATTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 470
>ref|XM_007523282.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=619
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 CCCCGGTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 490
>ref|XM_006864110.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=2053
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 CCCCGTTGCTGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 965
>ref|XM_006516738.1| PREDICTED: Mus musculus neuritin 1 (Nrn1), transcript variant
X1, mRNA
Length=1671
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 CCCCGTTGCTGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 539
>ref|XM_006141238.1| PREDICTED: Tupaia chinensis neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=1671
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 707 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGAATGTTGAGG 658
>ref|XM_005398874.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera neuritin 1 (Nrn1), mRNA
Length=2031
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 986 CCCCATTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 937
>ref|XR_258100.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus neuritin-like (LOC101964651),
misc_RNA
Length=694
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CCCCGTTGCCGCTGCTGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 491
>ref|XM_003468824.2| PREDICTED: Cavia porcellus neuritin 1 (Nrn1), transcript variant
X1, mRNA
Length=752
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 CCCCATTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 451
>ref|XM_005003261.1| PREDICTED: Cavia porcellus neuritin 1 (Nrn1), transcript variant
X2, mRNA
Length=1153
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CCCCATTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 852
>ref|XM_004628382.1| PREDICTED: Octodon degus neuritin 1 (Nrn1), mRNA
Length=768
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 CCCCATTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 506
>ref|XM_004666156.1| PREDICTED: Jaculus jaculus neuritin 1 (Nrn1), mRNA
Length=1583
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 CCCCGTTGCCGCCGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 468
>ref|NM_153529.2| Mus musculus neuritin 1 (Nrn1), mRNA
Length=1622
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 CCCCGTTGCTGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 487
>gb|JN959630.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Nrn1:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38960
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22611 CCCCGTTGCTGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 22562
>gb|JN957747.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Nrn1:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=39023
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22611 CCCCGTTGCTGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 22562
>emb|FQ213150.1| Rattus norvegicus TL0AAA49YH06 mRNA sequence
Length=1168
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 75 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATATTGAGG 26
>gb|AC156802.7| Mus musculus BAC clone RP23-119P9 from chromosome 13, complete
sequence
Length=209975
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65520 CCCCGTTGCTGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 65471
>gb|BC035531.1| Mus musculus neuritin 1, mRNA (cDNA clone MGC:40786 IMAGE:5367281),
complete cds
Length=1626
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524 CCCCGTTGCTGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 475
>dbj|AK161859.1| Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:6330437A07 product:neuritin 1,
full insert sequence
Length=1557
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504 CCCCGTTGCTGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 455
>gb|AC160103.2| Mus musculus BAC clone RP24-422I4 from chromosome 13, complete
sequence
Length=201998
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119225 CCCCGTTGCTGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 119176
>gb|AC168059.3| Mus musculus BAC clone RP23-283G7 from chromosome 13, complete
sequence
Length=200413
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32206 CCCCGTTGCTGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 32255
>gb|BC087582.1| Rattus norvegicus neuritin 1, mRNA (cDNA clone MGC:105351 IMAGE:7315687),
complete cds
Length=1570
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 474 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATATTGAGG 425
>ref|NM_053346.1| Rattus norvegicus neuritin 1 (Nrn1), mRNA
gb|U88958.1|RNU88958 Rattus norvegicus neuritin mRNA, complete cds
Length=1614
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 537 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATATTGAGG 488
>ref|XM_006073145.1| PREDICTED: Bubalus bubalis neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=1494
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 547 CCCCGTTGCCGCCGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 499
>ref|XM_006198702.1| PREDICTED: Vicugna pacos neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=1389
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 CCCCGTTGCCACTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 328
>ref|XM_006181117.1| PREDICTED: Camelus ferus uncharacterized LOC102507248 (LOC102507248),
mRNA
Length=1780
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 763 CCCCGTTGCCACTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 715
>ref|XM_005971745.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=929
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 579 CCCCGTTGCCGCCGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 531
>ref|XM_005891154.1| PREDICTED: Bos mutus neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=2007
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 CCCCGTTGCCGCCGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 931
>ref|XM_004685057.1| PREDICTED: Condylura cristata neuritin-like (LOC101628931), mRNA
Length=507
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 427 CCCGGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 379
>ref|XM_004019145.1| PREDICTED: Ovis aries neuritin 1 (NRN1), mRNA
Length=1611
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 CCCCGTTGCCGCCGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 529
>gb|AF114833.1| Homo sapiens neuritin mRNA, complete cds
Length=1595
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 CCCCGTTGCC-CTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 482
>ref|NM_001046438.1| Bos taurus neuritin 1 (NRN1), mRNA
gb|BC112687.1| Bos taurus neuritin 1, mRNA (cDNA clone MGC:137702 IMAGE:8165046),
complete cds
Length=1562
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CCCCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 49
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578 CCCCGTTGCCGCCGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAG 530
>ref|XM_002720948.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus neuritin 1 (NRN1), transcript
variant X2, mRNA
Length=1556
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 530 CCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTACCTTGGATGTTGAGG 483
>ref|XM_008274256.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus neuritin 1 (NRN1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1929
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 CCGTTGCCGCTGCCGCAGAGTTCGAATAAGCTGCCTTGGATGTTGAGG 50
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Sbjct 30630324 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 30630275
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Sbjct 767008 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 766959
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shotgun sequence
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Sbjct 1171057 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 1171106
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 30488539 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 30488490
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shotgun sequence
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 3760393 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 3760344
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 30532934 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 30532885
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 3760452 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 3760403
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sequence
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 3750648 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 3750599
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 30488143 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 30488094
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 32286327 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 32286278
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 2203165 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 2203214
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 2052929 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 2052978
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HSCHR6_CTG1
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 30663426 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 30663475
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genome shotgun sequence
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 30693332 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 30693381
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 30633332 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 30633381
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Sbjct 18139744 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 18139793
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 30491547 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 30491596
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shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188254, whole genome shotgun sequence
gb|DS486075.1| Homo sapiens SCAF_1103279188254 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 3753656 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 3753705
>ref|AC_000138.1| Homo sapiens chromosome 6, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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shotgun sequence
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Sbjct 1168049 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTSACCCACTC 1168000
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gb|CM000670.2| Homo sapiens chromosome 8, GRCh38 reference primary assembly
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 30352371 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 30352420
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HSCHR8_CTG3
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assembly
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 18068026 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 18068075
>ref|NC_018919.2| Homo sapiens chromosome 8, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001616.2| Homo sapiens chromosome 8, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 30412357 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 30412406
>ref|NW_004929337.1| Homo sapiens chromosome 8 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150121.1| Homo sapiens chromosome 8 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 18205263 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 18205312
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 28754113 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 28754162
>gb|DS990733.1| Homo sapiens SCAF_1112675837080 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 8556672 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 8556623
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Length=146114269
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 38750073 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 38750122
>gb|CH003455.1| Homo sapiens chromosome 8, whole genome shotgun sequence
Length=141588970
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 28886539 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 28886588
>ref|NW_001839128.2| Homo sapiens chromosome 8 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188135, whole genome shotgun sequence
gb|DS486095.1| Homo sapiens SCAF_1103279188135 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 8556813 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 8556764
>gb|CH471080.2| Homo sapiens 211000035832717 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=31321926
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 17736427 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 17736476
>ref|AC_000140.1| Homo sapiens chromosome 8, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000469.1| Homo sapiens chromosome 8, whole genome shotgun sequence
Length=141418600
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 28754193 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 28754242
>gb|CM000259.1| Homo sapiens chromosome 8, whole genome shotgun sequence
Length=142535109
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 29168589 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 29168638
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG
>ref|NG_034142.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), RefSeqGene on chromosome
6
Length=12226
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 5218 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 5169
>ref|NR_120608.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
7, non-coding RNA
Length=2089
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 218 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 169
>ref|NM_001293214.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
4, mRNA
Length=2556
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 218 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 169
>ref|NM_001293213.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
3, mRNA
Length=2082
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 218 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 169
>ref|NM_178014.3| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
2, mRNA
Length=2688
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 218 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 169
>dbj|AK316265.1| Homo sapiens cDNA, FLJ79164 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-7 chain
Length=1419
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 62 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 13
>dbj|AK297638.1| Homo sapiens cDNA FLJ53063 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-7 chain
Length=1470
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 67 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 18
>dbj|AK303227.1| Homo sapiens cDNA FLJ52378 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-7 chain
Length=1348
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 78 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 29
>dbj|AK302195.1| Homo sapiens cDNA FLJ52029 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-7 chain
Length=972
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 67 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 18
>dbj|AB103606.1| Homo sapiens TUBB gene for beta-tubulin protein, complete cds
Length=5581
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 707 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 658
>gb|BC000222.1| Homo sapiens mRNA similar to tubulin, beta 5 (cDNA clone IMAGE:3352415)
Length=2822
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 1187 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 1138
>gb|BC085007.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6598943, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4143
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 1665 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 1616
>dbj|AB202098.1| Homo sapiens OK/SW-cl.56 gene for beta 5-tubulin, complete cds
Length=5583
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 707 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 658
>emb|BX248307.7| Human DNA sequence from clone DASS-191K16 on chromosome 6, complete
sequence
Length=54911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 22678 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 22629
>emb|AL845353.7| Human DNA sequence from clone DAQB-47P19 on chromosome 6, complete
sequence
Length=130755
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 103650 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 103601
>emb|AL662797.7| Human DNA sequence from clone CH501-252P9 on chromosome 6, complete
sequence
Length=171627
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 43503 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 43454
>emb|AL662848.6| Human DNA sequence from clone CH502-111D4 on chromosome 6, complete
sequence
Length=185617
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 28598 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 28549
>emb|CR788240.3| Human DNA sequence from clone DAMC-316D20 on chromosome 6, complete
sequence
Length=75074
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 53953 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 53904
>emb|CR759873.4| Human DNA sequence from clone DAAP-285E11 on chromosome 6, complete
sequence
Length=72240
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62155 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 62106
>dbj|BA000025.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 6p21.3, HLA Class I region
Length=2229817
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 1221770 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 1221819
>emb|BX927283.4| Human DNA sequence from clone DAMA-26D6 on chromosome 6, complete
sequence
Length=36216
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 25085 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 25036
>dbj|AK098772.1| Homo sapiens cDNA FLJ25906 fis, clone CBR04603, highly similar
to TUBULIN BETA-5 CHAIN
Length=2515
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 62 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 13
>emb|CR936878.10| Human DNA sequence from clone DADB-118P11 on chromosome 6, complete
sequence
Length=66216
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 41518 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 41469
>gb|BC103746.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:117247 IMAGE:6503977),
complete cds
Length=1715
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 61 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 12
>gb|BC070326.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:88329 IMAGE:6698679),
complete cds
Length=1686
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 54 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 5
>dbj|AB088100.1| Homo sapiens TUBB gene for tubulin, beta polypeptide, complete
cds
Length=5581
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 707 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 658
>gb|BC020946.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:26663 IMAGE:4795692),
complete cds
Length=1696
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 77 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 28
>dbj|AB023051.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 6p21.3, HLA class I region,
clone:876L4, complete sequence
Length=90244
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 84786 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 84835
>gb|AC006165.1|AC006165 Homo sapiens clone UWGC:y54c125 from 6p21, complete sequence
Length=44118
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Sbjct 38704 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 38753
>gb|AF070600.1|AF070600 Homo sapiens clone 24464 beta-tubulin mRNA, complete cds
Length=1685
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 56 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 7
>gb|J00314.1|HUMTBBM40 Human beta-tubulin gene, clone m40
Length=5117
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 178 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 129
>gb|BC002347.2| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8668 IMAGE:2964461),
complete cds
Length=1689
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGAC 48
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Sbjct 48 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGAC 1
>gb|BC007605.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:15683 IMAGE:3350604),
complete cds
Length=2514
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Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGAC 48
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Sbjct 48 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGAC 1
>ref|XM_004043596.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 5 (TUBB), mRNA
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 67 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGGCGG 18
>ref|XM_004043595.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 4 (TUBB), mRNA
Length=2679
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 197 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGGCGG 148
>ref|XM_004043592.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 1 (TUBB), mRNA
Length=2673
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 218 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGGCGG 169
>emb|CU104669.1| Gorilla DNA sequence from clone CH255-478L19, complete sequence
Length=160907
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 43746 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGGCGG 43697
>gb|AF141349.1|AF141349 Homo sapiens beta-tubulin mRNA, complete cds
Length=1601
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
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Sbjct 56 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCAACGG 7
>ref|XM_003272050.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, beta 2A class IIa, transcript
variant 4 (TUBB2A), mRNA
Length=2382
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Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCG 46
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Sbjct 61 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCG 16
>ref|XM_004087081.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, beta 2A class IIa (TUBB2A),
mRNA
Length=2668
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCG 46
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Sbjct 197 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCG 152
>ref|XM_003272047.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, beta 2A class IIa, transcript
variant 1 (TUBB2A), mRNA
Length=2671
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCG 46
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Sbjct 218 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCG 173
>emb|AL832497.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J1451 (from clone DKFZp686J1451)
Length=1641
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGC 45
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Sbjct 45 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGC 1
>dbj|AB062393.1| Homo sapiens OK/SW-cl.56 mRNA for beta 5-tubulin, complete cds
Length=2505
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACG 44
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Sbjct 44 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACG 1
>gb|BC001938.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:4101 IMAGE:2820585),
complete cds
gb|BC005838.2| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:2440 IMAGE:2820585),
complete cds
Length=1663
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAAC 43
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Sbjct 43 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAAC 1
>ref|XM_003944643.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis tubulin, beta class
I (TUBB), mRNA
Length=1821
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGGTTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCAAACGCGACGG 50
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 215 AGGCTGGAATGCGCCCCAGAGGCTGGAGCAGCGAGGTGCGAACGCGGCGG 166
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC
>ref|XR_022100.4| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin beta-7 chain pseudogene (LOC745637),
misc_RNA
Length=1650
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 502 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 551
>ref|XR_094005.3| PREDICTED: Pongo abelii tubulin beta-7 chain pseudogene (LOC100435159),
misc_RNA
Length=1535
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 510 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 559
>ref|XM_003897307.2| PREDICTED: Papio anubis tubulin, beta class I (TUBB), mRNA
Length=2677
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 665 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 714
>ref|XR_158375.2| PREDICTED: Pan paniscus tubulin beta chain-like (LOC100979008),
misc_RNA
Length=1506
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 502 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 551
>ref|XM_008543777.1| PREDICTED: Equus przewalskii tubulin, beta class I (TUBB), transcript
variant X1, mRNA
ref|XR_548651.1| PREDICTED: Equus przewalskii tubulin, beta class I (TUBB), transcript
variant X2, misc_RNA
Length=2476
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 555 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 604
>gb|KJ895812.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05206 TUBB
gene, encodes complete protein
Length=1464
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 429 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 478
>ref|NG_034142.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), RefSeqGene on chromosome
6
Length=12226
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 8226 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 8275
>ref|NM_001293216.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
6, mRNA
Length=2574
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 556 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 605
>ref|NM_001293215.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
5, mRNA
Length=2675
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 657 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 706
>ref|NM_001293214.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
4, mRNA
Length=2556
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 538 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 587
>ref|NM_178014.3| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
2, mRNA
Length=2688
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 670 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 719
>ref|NM_001293212.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
1, mRNA
Length=2772
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 803
>ref|XM_008175854.1| PREDICTED: Chrysemys picta bellii tubulin, beta class I (TUBB),
transcript variant X2, mRNA
Length=3793
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 543
>ref|XM_008175853.1| PREDICTED: Chrysemys picta bellii tubulin, beta class I (TUBB),
transcript variant X1, mRNA
Length=3790
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 543
>ref|XM_007973204.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus tubulin, beta class I (TUBB),
mRNA
Length=2545
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 534 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 583
>ref|XM_007646352.1| PREDICTED: Cricetulus griseus tubulin, beta class I (Tubb), transcript
variant X1, mRNA
Length=2431
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 632
>tpe|HG499124.1| TPA: Homo sapiens long non-coding RNA OTTHUMT00000471078.1 (XXbac-BPG252P9.9
gene), antisense
Length=773
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 403
>ref|XM_001491178.4| PREDICTED: Equus caballus tubulin, beta class I (TUBB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1795
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 552 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 601
>ref|XM_005603688.1| PREDICTED: Equus caballus tubulin, beta class I (TUBB), transcript
variant X2, mRNA
Length=1822
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 579 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 628
>ref|XM_005553615.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925816 (LOC101925816),
transcript variant X2, mRNA
Length=2566
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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(LOC101965993), transcript variant X2, mRNA
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(LOC101965993), transcript variant X1, mRNA
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variant 1 (TUBB), mRNA
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transcript variant 2 (LOC100600969), mRNA
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variant 4 (TUBB2A), mRNA
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mRNA
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mRNA
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mRNA
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variant 1 (TUBB2A), mRNA
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misc_RNA
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Sbjct 516 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 565
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variant 5 (TUBB), mRNA
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variant 4 (TUBB), mRNA
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Sbjct 677 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 726
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variant 3 (TUBB), mRNA
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Sbjct 381 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 430
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variant 2 (TUBB), mRNA
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Sbjct 592 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 641
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variant 1 (TUBB), mRNA
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Sbjct 671 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 720
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 682 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 731
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variant 3 (TUBB2A), mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 513 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 562
>gb|AC241600.4| Chlorocebus aethiops BAC clone CH252-59A19 from chromosome 6,
complete sequence
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 182235 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 182284
>ref|XM_002803662.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical protein LOC100426449 (LOC100426449),
mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 698 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 649
>dbj|AK316316.1| Homo sapiens cDNA, FLJ79215 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-7 chain
Length=2009
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 552 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 601
>dbj|AK316265.1| Homo sapiens cDNA, FLJ79164 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-7 chain
Length=1419
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 427 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 476
>dbj|AB463327.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB9038, Homo sapiens TBB5
gene for Tubulin beta chain, without stop codon, in Flexi system
Length=1349
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 373 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 422
>dbj|AK298889.1| Homo sapiens cDNA FLJ50617 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-7 chain
Length=1710
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 560 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 609
>dbj|AK302314.1| Homo sapiens cDNA FLJ56903 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-7 chain
Length=1773
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 623 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 672
>emb|CU676482.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100019426
5' read TUBB mRNA
Length=1069
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 380 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 429
>dbj|AK309684.1| Homo sapiens cDNA, FLJ99725
Length=1157
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 112 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 161
>gb|DQ894920.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100009380; FLH180253.01L;
RZPDo839A03133D tubulin, beta (TUBB) gene, encodes
complete protein
Length=1375
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 386 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 435
>gb|DQ891828.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100004458; FLH263550.01X;
RZPDo839B02134D tubulin, beta (TUBB) gene, encodes
complete protein
Length=1375
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 386 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 435
>gb|DQ891742.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004372; FLH180257.01X; RZPDo839A03134D
tubulin, beta (TUBB) gene, encodes complete protein
Length=1375
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 386 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 435
>dbj|AB170262.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-11062, similar to
human beta 5-tubulin (OK/SW-cl.56), mRNA, RefSeq: NM_178014.2
Length=1633
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 528 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 577
>dbj|AB103606.1| Homo sapiens TUBB gene for beta-tubulin protein, complete cds
Length=5581
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 3715 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 3764
>emb|CU104669.1| Gorilla DNA sequence from clone CH255-478L19, complete sequence
Length=160907
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 46758 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 46807
>gb|BC008791.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3617988, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4078
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 2118
>gb|BC000222.1| Homo sapiens mRNA similar to tubulin, beta 5 (cDNA clone IMAGE:3352415)
Length=2822
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 1639 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 1688
>gb|BC085007.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6598943, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4143
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 2117 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 2166
>gb|AF120325.1| Cricetulus griseus class I beta tubulin gene, complete cds
Length=3332
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2187 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 2236
>dbj|AB202098.1| Homo sapiens OK/SW-cl.56 gene for beta 5-tubulin, complete cds
Length=5583
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3715 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 3764
>dbj|AB128049.1| Macaca mulatta genes, MHC class I region, partial and complete
cds
Length=3284914
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704450 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 1704401
>gb|AC148710.1| Macaca mulatta Major Histocompatibility Complex BAC MMU399F22,
complete sequence
Length=158818
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23256 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 23305
>gb|AC148705.1| Macaca mulatta Major Histocompatibility Complex MMU348N13, complete
sequence
Length=186491
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 19358 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 19407
>emb|BX248307.7| Human DNA sequence from clone DASS-191K16 on chromosome 6, complete
sequence
Length=54911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 25686 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 25735
>emb|AL845353.7| Human DNA sequence from clone DAQB-47P19 on chromosome 6, complete
sequence
Length=130755
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 106658 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 106707
>emb|AL662797.7| Human DNA sequence from clone CH501-252P9 on chromosome 6, complete
sequence
Length=171627
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 46511 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 46560
>emb|AL662848.6| Human DNA sequence from clone CH502-111D4 on chromosome 6, complete
sequence
Length=185617
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Sbjct 31606 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 31655
>ref|NM_001032813.1| Macaca mulatta tubulin, beta class I (TUBB), mRNA
gb|AF147880.1|AF147880 Macaca mulatta beta-tubulin mRNA, complete cds
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 438 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 487
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Sbjct 508 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 557
>ref|NM_001135386.1| Pongo abelii DKFZP468I0328 protein (DKFZP468I0328), mRNA
emb|CR860249.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp468I0328 (from clone DKFZp468I0328)
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Sbjct 544 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 593
>ref|NM_001132525.1| Pongo abelii tubulin, beta class I (TUBB), mRNA
emb|CR859552.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459E2213 (from clone DKFZp459E2213)
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 391 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 440
>emb|CR788240.3| Human DNA sequence from clone DAMC-316D20 on chromosome 6, complete
sequence
Length=75074
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Sbjct 56961 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 57010
>emb|CR759873.4| Human DNA sequence from clone DAAP-285E11 on chromosome 6, complete
sequence
Length=72240
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Sbjct 65163 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 65212
>dbj|BA000025.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 6p21.3, HLA Class I region
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Sbjct 1218762 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 1218713
>emb|BX927283.4| Human DNA sequence from clone DAMA-26D6 on chromosome 6, complete
sequence
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Sbjct 28093 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 28142
>dbj|AK098772.1| Homo sapiens cDNA FLJ25906 fis, clone CBR04603, highly similar
to TUBULIN BETA-5 CHAIN
Length=2515
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Sbjct 515 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 564
>ref|NM_001244097.1| Cricetulus griseus tubulin, beta class I (Tubb), mRNA
emb|X60784.1| Cricetulus griseus (chinese hamster) mRNA for beta tubulin (clone
B16T)
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Sbjct 435 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 484
>emb|CR936878.10| Human DNA sequence from clone DADB-118P11 on chromosome 6, complete
sequence
Length=66216
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 44526 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 44575
>gb|BC103746.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:117247 IMAGE:6503977),
complete cds
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Sbjct 513 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 562
>gb|BC070326.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:88329 IMAGE:6698679),
complete cds
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 506 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 555
>gb|BC013374.2| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:16435 IMAGE:3946253),
complete cds
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 491 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 540
>gb|BC002347.2| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8668 IMAGE:2964461),
complete cds
Length=1689
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 500 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 549
>gb|BC001938.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:4101 IMAGE:2820585),
complete cds
gb|BC005838.2| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:2440 IMAGE:2820585),
complete cds
Length=1663
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 495 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 544
>dbj|AB088100.1| Homo sapiens TUBB gene for tubulin, beta polypeptide, complete
cds
Length=5581
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 3715 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 3764
>dbj|AB062393.1| Homo sapiens OK/SW-cl.56 mRNA for beta 5-tubulin, complete cds
Length=2505
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 496 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 545
>gb|BC021909.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:15853 IMAGE:3509417),
complete cds
Length=2508
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 490 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 539
>gb|BC020946.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:26663 IMAGE:4795692),
complete cds
Length=1696
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 529 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 578
>gb|BC019924.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:30201 IMAGE:4998571),
complete cds
Length=2500
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 488 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 537
>gb|BC007605.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:15683 IMAGE:3350604),
complete cds
Length=2514
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 500 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 549
>gb|BC001896.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3544415),
partial cds
Length=1239
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 52 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 101
>dbj|AB023051.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 6p21.3, HLA class I region,
clone:876L4, complete sequence
Length=90244
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 81778 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 81729
>gb|AC006165.1|AC006165 Homo sapiens clone UWGC:y54c125 from 6p21, complete sequence
Length=44118
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 35696 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 35647
>gb|AF070600.1|AF070600 Homo sapiens clone 24464 beta-tubulin mRNA, complete cds
Length=1685
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 508 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 557
>gb|AF070593.1|AF070593 Homo sapiens clones 24609 and 24716 beta-tubulin mRNA, complete
cds
Length=1668
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 491 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 540
>gb|AF070561.1|AF070561 Homo sapiens clone 24703 beta-tubulin mRNA, complete cds
Length=1667
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 491 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 540
>gb|J00314.1|HUMTBBM40 Human beta-tubulin gene, clone m40
Length=5117
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 3089 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 3138
>emb|V00599.1| Human mRNA fragment encoding beta-tubulin. (from clone D-beta-1)
Length=1441
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 343 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 392
>ref|XR_187602.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum tubulin beta chain-like
(LOC101394312), misc_RNA
Length=1299
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 2 AGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 AGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 398
>ref|XM_010359406.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin beta-7 chain-like
(LOC104659295), mRNA
Length=1077
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 82 AAGGAAGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 131
>ref|XR_749133.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin beta-7 chain pseudogene
(LOC104670398), misc_RNA
Length=1463
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 AAGGAAGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 562
>ref|XM_010368217.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin, beta class I (TUBB),
mRNA
Length=2666
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 670 AAGGAAGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 719
>ref|XM_008841243.1| PREDICTED: Nannospalax galili tubulin, beta class I (Tubb), mRNA
Length=1655
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 649
>ref|XR_607112.1| PREDICTED: Nannospalax galili tubulin beta-7 chain pseudogene
(LOC103730824), misc_RNA
Length=1579
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 486
>ref|XM_008692913.1| PREDICTED: Ursus maritimus tubulin, beta class I (TUBB), mRNA
Length=2529
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 575
>ref|XM_008576469.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus tubulin beta chain (LOC103593487),
mRNA
Length=1308
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174 AAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 223
>ref|XM_008575322.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus tubulin, beta class I (TUBB),
mRNA
Length=2694
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 726
>ref|NG_001206.4| Homo sapiens tubulin, beta pseudogene 1 (TUBBP1) on chromosome
8
Length=1865
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 615 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 664
>ref|XM_008159924.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus tubulin beta-2B chain-like (LOC103302880),
mRNA
Length=801
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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mRNA
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variant X2, mRNA
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variant X1, mRNA
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4B class IVb (TUBB4B), mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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partial mRNA
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Sbjct 439 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 488
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Sbjct 338 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 387
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mRNA
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Sbjct 549 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 598
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Sbjct 357 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 406
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(TUBB4A), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 373 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 422
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(TUBB4A), transcript variant X2, mRNA
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(TUBB4A), transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 373 AAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 422
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 547 AAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 596
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mRNA
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Sbjct 609 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 658
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Sbjct 545 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 594
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mRNA
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Sbjct 307 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 356
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Sbjct 537 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 586
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partial mRNA
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Sbjct 1375 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 1424
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Sbjct 561 AAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 610
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mRNA
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Sbjct 82 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 131
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Sbjct 319 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 368
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 310 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 359
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Sbjct 316 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 365
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 319 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 368
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mRNA
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Sbjct 527 AAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 576
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misc_RNA
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Sbjct 520 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 569
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 547 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 596
>ref|XM_005965418.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii tubulin beta-5 chain-like (LOC102329385),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 558 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 607
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mRNA
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Sbjct 199 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 248
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Sbjct 303 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 352
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mRNA
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Sbjct 364 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 413
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 406 AAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 455
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 397 AAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 446
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mRNA
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IVa (Tubb4a), transcript variant X1, mRNA
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misc_RNA
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variant X1, mRNA
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X1, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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transcript variant 1, mRNA
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(TUBB4B), mRNA
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(TUBB), mRNA
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(LOC101375541), misc_RNA
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IVa (TUBB4A), mRNA
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Sbjct 536 AAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 585
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transcript variant 1 (LOC101378226), mRNA
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Sbjct 536 AAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 585
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mRNA
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Sbjct 364 AAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 413
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Sbjct 539 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 588
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variant 1 (TUBB2A), mRNA
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misc_RNA
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mRNA
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Sbjct 532 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 581
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Sbjct 450 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 499
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(LOC100950590), partial misc_RNA
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Sbjct 259 AAGGAGGCAGAGAGCAGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 308
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mRNA
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Sbjct 319 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 368
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Sbjct 452 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 501
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gland
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Sbjct 452 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 501
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Sbjct 451 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 500
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mRNA
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Sbjct 542 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 591
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miscRNA
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Sbjct 425 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 474
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Sbjct 453 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 502
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Sbjct 198 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 247
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Sbjct 515 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 564
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Sbjct 449 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 498
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 449 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 498
>dbj|AK234279.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010036H08, expressed in ovary
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 452 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 501
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 117402 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 117451
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complete cds
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 533 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 582
>gb|BC105181.1| Bos taurus tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:128183 IMAGE:7898040),
complete cds
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 452 AAGGAGGCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 501
>ref|XR_648164.1| PREDICTED: Papio anubis tubulin beta chain-like (LOC103885217),
misc_RNA
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Query 2 AGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 1327 AGGACGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 1375
>ref|XR_258852.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster tubulin beta chain-like (LOC101996472),
misc_RNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACT 49
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Sbjct 498 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTTCAGCTGACCCACT 546
>ref|XM_003211199.2| PREDICTED: Meleagris gallopavo tubulin beta chain-like (LOC100551229),
partial mRNA
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Sbjct 217 AAGGAGGCGGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 266
>ref|XM_010643444.1| PREDICTED: Fukomys damarensis tubulin, beta class I (Tubb), mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 548 AAGGAGGCGGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 597
>ref|XM_010283971.1| PREDICTED: Phaethon lepturus tubulin beta-7 chain (LOC104618392),
mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 309 AAGGAGGCGGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 358
>ref|XR_719870.1| PREDICTED: Chaetura pelagica tubulin beta-2 chain-like (LOC104391591),
misc_RNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 304 AAGGAGTCAGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 353
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misc_RNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 212 AAGGAGGCGGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 261
>ref|XM_009873617.1| PREDICTED: Apaloderma vittatum tubulin beta chain (LOC104267217),
partial mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 305 AAGGAGTCGGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 354
>ref|XM_009700383.1| PREDICTED: Cariama cristata tubulin beta-7 chain-like (LOC104161826),
mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 307 AAGGAGGCGGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 356
>ref|XM_009493410.1| PREDICTED: Pelecanus crispus tubulin beta chain-like (LOC104025031),
mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 208 AAGGAGGCGGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 257
>ref|XM_009272626.1| PREDICTED: Aptenodytes forsteri tubulin beta-7 chain-like (LOC103893495),
mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 157 AAGGAGGCGGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 206
>ref|XM_008831205.1| PREDICTED: Nannospalax galili tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b),
mRNA
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Query 4 GAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 472 GAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 518
>ref|XM_008711289.1| PREDICTED: Ursus maritimus tubulin, beta 4A class IVa (TUBB4A),
mRNA
Length=1725
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCA 47
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Sbjct 303 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCA 349
>ref|XR_542152.1| PREDICTED: Calypte anna tubulin beta chain-like (LOC103533911),
misc_RNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 195 AAGGAGGCCGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 244
>ref|XM_008295605.1| PREDICTED: Stegastes partitus tubulin, beta class I (tubb), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 426 AAGGAGTCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTTACCCACTC 475
>ref|XM_008295604.1| PREDICTED: Stegastes partitus tubulin, beta class I (tubb), transcript
variant X1, mRNA
Length=1565
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 420 AAGGAGTCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTTACCCACTC 469
>ref|XM_008252902.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus tubulin, beta 4A class IVa (TUBB4A),
mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 459 AAGGAGGCCGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 508
>ref|XM_002714359.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus tubulin, beta class I (TUBB),
mRNA
Length=2232
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 476 AAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTCACCCACTC 525
>ref|XM_008150557.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus tubulin, beta 4A class IVa (TUBB4A),
mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 384 AAGGAGGCTGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 433
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Query 4 GAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 682 GAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 728
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transcript variant X2, mRNA
Length=2074
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 AAGGAAGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 557
>ref|XM_007460574.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer tubulin, beta 4A class IVa (TUBB4A),
transcript variant X1, mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 AAGGAAGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 422
>ref|XM_007458937.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 364 AAGGAGGCGGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 413
>ref|XM_007458936.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 481 AAGGAGGCGGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 530
>ref|XM_007458935.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
transcript variant X1, mRNA
Length=1347
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 373 AAGGAGGCGGAGAGCTGCGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 422
>ref|XM_006052357.1| PREDICTED: Bubalus bubalis tubulin beta chain-like (LOC102414085),
mRNA
Length=682
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Query 1 AAGGAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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Sbjct 512 AAGGAGGCCGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCCGCTGACCCACTC 561
>ref|XM_006045113.1| PREDICTED: Bubalus bubalis tubulin, beta 4A class IVa (TUBB4A),
transcript variant X2, mRNA
Length=2054
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 4 GAGGCAGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGCTTCCAGCTGACCCACTC 50
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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HSCHR6_CTG1
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assembly
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shotgun sequence
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>ref|NW_001838980.1| Homo sapiens chromosome 6 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188254, whole genome shotgun sequence
gb|DS486075.1| Homo sapiens SCAF_1103279188254 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 3765204 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 3765253
>gb|CH471081.1| Homo sapiens 211000035843014 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 3755400 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 3755449
>ref|AC_000138.1| Homo sapiens chromosome 6, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000467.1| Homo sapiens chromosome 6, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 30492895 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 30492944
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Sbjct 32291079 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 32291128
>gb|GL583147.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_167, whole genome
shotgun sequence
Length=4889187
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 1166305 AACACCCCTGACTCTGGARTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 1166256
>ref|NT_113891.3| Homo sapiens chromosome 6 genomic scaffold, GRCh38 alternate
locus group ALT_REF_LOCI_2 HSCHR6_MHC_COX_CTG1
gb|GL000251.2| Homo sapiens chromosome 6 genomic contig, GRCh38 reference assembly
alternate locus group ALT_REF_LOCI_2
Length=4795265
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 2204909 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2204958
>ref|NC_018917.2| Homo sapiens chromosome 6, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001614.2| Homo sapiens chromosome 6, whole genome shotgun sequence
Length=171376517
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 30695078 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 30695127
>ref|NW_004929326.1| Homo sapiens chromosome 6 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150110.1| Homo sapiens chromosome 6 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=58958719
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 30635078 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 30635127
>gb|KE141381.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold398, whole genome
shotgun sequence
Length=1375133
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 771760 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 771809
>ref|NC_000013.11| Homo sapiens chromosome 13, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000675.2| Homo sapiens chromosome 13, GRCh38 reference primary assembly
Length=114364328
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 41383936 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 41383887
>ref|NT_024524.15| Homo sapiens chromosome 13 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR13_CTG1
gb|GL000111.2| Homo sapiens chromosome 13 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=67794873
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 22975830 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 22975781
>ref|NC_018924.2| Homo sapiens chromosome 13, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001621.2| Homo sapiens chromosome 13, whole genome shotgun sequence
Length=115138643
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 41925945 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 41925896
>ref|NW_004929388.1| Homo sapiens chromosome 13 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150172.1| Homo sapiens chromosome 13 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=67708773
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 22905945 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 22905896
>gb|KE141174.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold88, whole genome
shotgun sequence
Length=22548905
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 5359961 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 5360010
>gb|GL583002.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_22, whole genome
shotgun sequence
Length=20912910
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 16938668 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 16938619
>gb|CM000503.1| Homo sapiens chromosome 13, whole genome shotgun sequence
Length=95379507
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 22757150 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 22757101
>gb|DS990731.1| Homo sapiens SCAF_1112675837062 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=9451432
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 4039244 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 4039293
>gb|CH003460.1| Homo sapiens chromosome 13, whole genome shotgun sequence
Length=95590859
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 22543948 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 22543899
>gb|CH471075.1| Homo sapiens 211000035844449 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=33583425
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 22750880 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 22750831
>ref|NW_001838073.2| Homo sapiens chromosome 13 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188117, whole genome shotgun sequence
gb|DS486093.1| Homo sapiens SCAF_1103279188117 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=9451680
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 4039302 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 4039351
>ref|AC_000145.1| Homo sapiens chromosome 13, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000474.1| Homo sapiens chromosome 13, whole genome shotgun sequence
Length=95380798
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 22757590 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 22757541
>gb|CM000264.1| Homo sapiens chromosome 13, whole genome shotgun sequence
Length=95789532
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 23015656 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 23015607
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG
>ref|XM_008959491.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin, beta class I (TUBB), mRNA
Length=2439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 1908 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 1859
>ref|NG_034142.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), RefSeqGene on chromosome
6
Length=12226
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 9690 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 9641
>ref|NR_120608.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
7, non-coding RNA
Length=2089
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 1535 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 1486
>ref|NM_001293216.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
6, mRNA
Length=2574
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 2020 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 1971
>ref|NM_001293215.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
5, mRNA
Length=2675
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 2121 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 2072
>ref|NM_001293214.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
4, mRNA
Length=2556
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 2002 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 1953
>ref|NM_001293213.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
3, mRNA
Length=2082
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 1528 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 1479
>ref|NM_178014.3| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
2, mRNA
Length=2688
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 2134 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 2085
>ref|NM_001293212.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
1, mRNA
Length=2772
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Sbjct 2218 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 2169
>ref|XM_004043596.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 5 (TUBB), mRNA
Length=2390
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Sbjct 1851 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 1802
>ref|XM_004043595.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 4 (TUBB), mRNA
Length=2679
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Sbjct 2140 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 2091
>ref|XM_004043594.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 3 (TUBB), mRNA
Length=2383
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Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 1844 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 1795
>ref|XM_004043593.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 2 (TUBB), mRNA
Length=2594
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 2055 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 2006
>ref|XM_004043592.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 1 (TUBB), mRNA
Length=2673
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 2134 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 2085
>dbj|AB103606.1| Homo sapiens TUBB gene for beta-tubulin protein, complete cds
Length=5581
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 5179 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 5130
>emb|CU104669.1| Gorilla DNA sequence from clone CH255-478L19, complete sequence
Length=160907
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Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 48221 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 48172
>gb|BC008791.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3617988, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4078
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 3533 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 3484
>gb|BC085007.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6598943, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4143
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 3581 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 3532
>gb|BC011718.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4099312, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3787
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3226 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 3177
>dbj|AB210212.1| Pan troglodytes TUBB gene for beta-tubulin, complete cds, cell_line:
Ericka
Length=5582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 5180 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 5131
>dbj|AB210211.1| Pan troglodytes TUBB gene for beta-tubulin, complete cds, cell_line:
Borie
Length=5582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 5180 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 5131
>dbj|AB202098.1| Homo sapiens OK/SW-cl.56 gene for beta 5-tubulin, complete cds
Length=5583
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 5178 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 5129
>emb|BX248307.7| Human DNA sequence from clone DASS-191K16 on chromosome 6, complete
sequence
Length=54911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27150 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 27101
>emb|AL845353.7| Human DNA sequence from clone DAQB-47P19 on chromosome 6, complete
sequence
Length=130755
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108123 ATTTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 108074
>emb|AL662797.7| Human DNA sequence from clone CH501-252P9 on chromosome 6, complete
sequence
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sequence
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sequence
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sequence
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sequence
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to TUBULIN BETA-5 CHAIN
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sequence
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complete cds
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cds
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complete cds
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clone:876L4, complete sequence
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mRNA
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13
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transcript variant 1 (LOC100600969), mRNA
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variant 4 (TUBB2A), mRNA
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mRNA
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mRNA
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mRNA
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variant 1 (TUBB2A), mRNA
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(LOC101127583), misc_RNA
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variant 3 (TUBB2A), mRNA
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Sbjct 1978 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 1931
>emb|AL731858.10| Human DNA sequence from clone RP11-396A22 on chromosome 13, complete
sequence
Length=72243
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Sbjct 13687 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 13734
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region
Length=1750601
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Sbjct 790601 ATTTAATGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 790650
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misc_RNA
Length=1533
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 993 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTGGAATG 946
>ref|XM_007973204.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus tubulin, beta class I (TUBB),
mRNA
Length=2545
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Sbjct 2003 TTAGTGACTTCAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 1956
>gb|AC241600.4| Chlorocebus aethiops BAC clone CH252-59A19 from chromosome 6,
complete sequence
Length=217614
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183704 TTAGTGACTTCAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 183657
>ref|XM_010368217.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin, beta class I (TUBB),
mRNA
Length=2666
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 3 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTT-AGAA 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2139 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTTAGAA 2093
>dbj|AK316316.1| Homo sapiens cDNA, FLJ79215 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-7 chain
Length=2009
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 8 GACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009 GACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 1967
>ref|XR_682541.1| PREDICTED: Pan troglodytes tubulin beta-7 chain pseudogene (LOC465403),
misc_RNA
Length=2562
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1936 TTA-TGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGGATG 1890
>ref|XR_611169.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin beta-7 chain pseudogene (LOC100987543),
misc_RNA
Length=2311
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1781 TTA-TGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGGATG 1735
>ref|NG_012211.1| Homo sapiens sterol carrier protein 2 (SCP2), RefSeqGene on chromosome
1
Length=131335
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 74231 TTA-TGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGGATG 74185
>dbj|AB128049.1| Macaca mulatta genes, MHC class I region, partial and complete
cds
Length=3284914
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 2/48 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1702980 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTT--AGAATG 1703025
>gb|AC148710.1| Macaca mulatta Major Histocompatibility Complex BAC MMU399F22,
complete sequence
Length=158818
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 2/48 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 24726 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTT--AGAATG 24681
>gb|AC148705.1| Macaca mulatta Major Histocompatibility Complex MMU348N13, complete
sequence
Length=186491
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 2/48 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 20827 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTT--AGAATG 20782
>emb|AL445183.19| Human DNA sequence from clone RP11-334A14 on chromosome 1, complete
sequence
Length=193774
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 43120 TTA-TGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGGATG 43074
>gb|J00314.1|HUMTBBM40 Human beta-tubulin gene, clone m40
Length=5117
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 48/51 (94%), Gaps = 2/51 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTTAGTG-ACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4556 ATTTAATGAACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTT-AGAATG 4507
>gb|K00842.1|HUMTBB7P human beta-tubulin pseudogene, clone 7-beta
Length=2610
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 7 TGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGAATG 50
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Sbjct 2053 TGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTTTTAGGATG 2010
>ref|XM_005553615.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925816 (LOC101925816),
transcript variant X2, mRNA
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Query 3 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTT 42
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Sbjct 2020 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTT 1981
>ref|XM_005553614.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC101925816 (LOC101925816),
transcript variant X1, mRNA
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Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
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Query 3 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTT 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1837 TTAGTGACTTTAATAGCCTGGATTTCCCTCTCCAAAACTT 1798
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC
>ref|NG_034142.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), RefSeqGene on chromosome
6
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 9970 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 10019
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7, non-coding RNA
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 1815 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 1864
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6, mRNA
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Sbjct 2300 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2349
>ref|NM_001293215.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
5, mRNA
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Sbjct 2401 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2450
>ref|NM_001293214.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
4, mRNA
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Sbjct 2282 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2331
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3, mRNA
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Sbjct 1808 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 1857
>ref|NM_178014.3| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
2, mRNA
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Sbjct 2414 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2463
>ref|NM_001293212.1| Homo sapiens tubulin, beta class I (TUBB), transcript variant
1, mRNA
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Sbjct 2498 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2547
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Sbjct 5459 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 5508
>gb|BC008791.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3617988, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 3813 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 3862
>gb|BC011718.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4099312, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 3506 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 3555
>emb|BX248307.7| Human DNA sequence from clone DASS-191K16 on chromosome 6, complete
sequence
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Sbjct 27430 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 27479
>emb|AL845353.7| Human DNA sequence from clone DAQB-47P19 on chromosome 6, complete
sequence
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Sbjct 108403 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 108452
>emb|AL662797.7| Human DNA sequence from clone CH501-252P9 on chromosome 6, complete
sequence
Length=171627
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Sbjct 48255 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 48304
>emb|CR788240.3| Human DNA sequence from clone DAMC-316D20 on chromosome 6, complete
sequence
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Sbjct 58705 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 58754
>emb|CR759873.4| Human DNA sequence from clone DAAP-285E11 on chromosome 6, complete
sequence
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 66907 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 66956
>dbj|BA000025.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 6p21.3, HLA Class I region
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Sbjct 1217018 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 1216969
>emb|BX927283.4| Human DNA sequence from clone DAMA-26D6 on chromosome 6, complete
sequence
Length=36216
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 29837 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 29886
>dbj|AK098772.1| Homo sapiens cDNA FLJ25906 fis, clone CBR04603, highly similar
to TUBULIN BETA-5 CHAIN
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 2259 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2308
>emb|CR936878.10| Human DNA sequence from clone DADB-118P11 on chromosome 6, complete
sequence
Length=66216
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 46270 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 46319
>gb|BC062532.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3637650),
complete cds
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 1577 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 1626
>gb|BC013374.2| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:16435 IMAGE:3946253),
complete cds
Length=2510
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 2235 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2284
>dbj|AB088100.1| Homo sapiens TUBB gene for tubulin, beta polypeptide, complete
cds
Length=5581
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 5459 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 5508
>dbj|AB062393.1| Homo sapiens OK/SW-cl.56 mRNA for beta 5-tubulin, complete cds
Length=2505
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 2242 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2291
>gb|BC021909.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:15853 IMAGE:3509417),
complete cds
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Sbjct 2234 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2283
>gb|BC001002.2| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3447696)
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Sbjct 1043 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 1092
>gb|BC007605.1| Homo sapiens tubulin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:15683 IMAGE:3350604),
complete cds
Length=2514
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2244 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2293
>dbj|AB023051.1| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 6p21.3, HLA class I region,
clone:876L4, complete sequence
Length=90244
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 80034 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 79985
>gb|AC006165.1|AC006165 Homo sapiens clone UWGC:y54c125 from 6p21, complete sequence
Length=44118
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 33952 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 33903
>ref|XM_003272050.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, beta 2A class IIa, transcript
variant 4 (TUBB2A), mRNA
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Sbjct 2125 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2174
>ref|XM_004087082.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, beta 2A class IIa (TUBB2A),
mRNA
Length=2249
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 1992 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2041
>ref|XM_004087081.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, beta 2A class IIa (TUBB2A),
mRNA
Length=2668
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 2411 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2460
>ref|XM_004087080.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, beta 2A class IIa (TUBB2A),
mRNA
Length=2660
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 2403 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2452
>ref|XM_003272047.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, beta 2A class IIa, transcript
variant 1 (TUBB2A), mRNA
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 2414 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2463
>ref|XM_004043596.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 5 (TUBB), mRNA
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 2134 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2183
>ref|XM_004043595.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 4 (TUBB), mRNA
Length=2679
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 2423 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2472
>ref|XM_004043594.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 3 (TUBB), mRNA
Length=2383
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2127 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2176
>ref|XM_004043593.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 2 (TUBB), mRNA
Length=2594
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2387
>ref|XM_004043592.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin, beta class I, transcript
variant 1 (TUBB), mRNA
Length=2673
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2466
>ref|XM_003272049.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, beta 2A class IIa, transcript
variant 3 (TUBB2A), mRNA
Length=2515
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2258 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2307
>emb|CU104669.1| Gorilla DNA sequence from clone CH255-478L19, complete sequence
Length=160907
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48504 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 48553
>gb|BC085007.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6598943, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4143
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AACACCCCTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 50
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Sbjct 3861 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 3910
>dbj|AB202098.1| Homo sapiens OK/SW-cl.56 gene for beta 5-tubulin, complete cds
Length=5583
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sequence
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Sbjct 33350 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 33399
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complete cds
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Sbjct 2234 AACACCCCTGACTCTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 2283
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mRNA
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Sbjct 1277 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 1326
>ref|NG_011428.3| Homo sapiens tubulin, beta pseudogene 2 (TUBBP2) on chromosome
13
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Sbjct 1241 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 1290
>emb|AL731858.10| Human DNA sequence from clone RP11-396A22 on chromosome 13, complete
sequence
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Sbjct 13410 AACATCCCTGACTGTGGAATGGTGTATACTGCCACATCAGTGTTTGAGTC 13361
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Sbjct 962707 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 962658
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 4696445 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 4696396
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 31420128 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 31420079
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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HSCHR6_CTG1
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 31576760 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 31576809
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188254, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 4697166 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 4697215
>ref|AC_000138.1| Homo sapiens chromosome 6, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 31420849 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 31420898
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Sbjct 33232845 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 33232894
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG
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(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 242 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 193
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1 (GPANK1), transcript variant X7, mRNA
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Sbjct 153 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 202
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 242 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 193
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(GPANK1), transcript variant X12, mRNA
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Sbjct 158 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 207
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variant 2, mRNA
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Sbjct 247 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 198
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variant 1, mRNA
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Sbjct 247 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 198
>ref|XM_005275474.1| PREDICTED: Homo sapiens G patch domain and ankyrin repeats 1
(GPANK1), transcript variant X1, mRNA
ref|XM_005275607.1| PREDICTED: Homo sapiens G patch domain and ankyrin repeats 1
(GPANK1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 158 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 207
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(GPANK1), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 158 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 207
>ref|XM_005249403.1| PREDICTED: Homo sapiens G patch domain and ankyrin repeats 1
(GPANK1), transcript variant X2, mRNA
ref|XM_005275179.1| PREDICTED: Homo sapiens G patch domain and ankyrin repeats 1
(GPANK1), transcript variant X2, mRNA
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(GPANK1), transcript variant X2, mRNA
Length=1944
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Sbjct 158 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 207
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variant 1, mRNA
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Sbjct 158 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 207
>gb|AF129756.1|DJ201G24 Homo sapiens MSH55 gene, partial cds; and CLIC1, DDAH, G6b, G6c,
G5b, G6d, G6e, G6f, BAT5, G5b, CSK2B, BAT4, G4, Apo M, BAT3,
BAT2, AIF-1, 1C7, LST-1, LTB, TNF, and LTA genes, complete
cds
Length=184666
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Sbjct 83939 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 83988
>dbj|AK123707.1| Homo sapiens cDNA FLJ41713 fis, clone HLUNG2011833, highly similar
to Homo sapiens MSH55 gene
Length=2793
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 158 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 207
>emb|BX511262.7| Human DNA sequence from clone DASS-336N12 on chromosome 6, complete
sequence
Length=69009
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Sbjct 45679 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 45630
>emb|AL805934.3| Human DNA sequence from clone DAQB-195H10 on chromosome 6, complete
sequence
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 54604 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 54555
>emb|AL670886.6| Human DNA sequence from clone CH502-88C14 on chromosome 6, complete
sequence
Length=90732
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 18783 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 18734
>emb|AL662899.5| Human DNA sequence from clone CH501-32J3 on chromosome 6, complete
sequence
Length=136493
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 8467 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 8418
>gb|BC112017.1| Homo sapiens casein kinase 2, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone
MGC:138222 IMAGE:8327485), complete cds
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 60 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 11
>gb|BC112019.1| Homo sapiens casein kinase 2, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone
MGC:138224 IMAGE:8327487), complete cds
Length=865
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 60 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 11
>emb|CR759761.9| Human DNA sequence from clone DAMC-157M7 on chromosome 6, complete
sequence
Length=83849
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 54584 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 54535
>emb|CR753842.3| Human DNA sequence from clone DADB-127H9 on chromosome 6, complete
sequence
Length=69013
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Sbjct 23595 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 23546
>dbj|BA000025.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 6p21.3, HLA Class I region
Length=2229817
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 277902 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 277951
>emb|CR354443.4| Human DNA sequence from clone DAMA-236L13 on chromosome 6, complete
sequence
Length=132551
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 47237 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 47188
>gb|DQ314868.1| Homo sapiens casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B) gene,
complete cds
Length=7855
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 2182 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 2133
>emb|AL132713.11| Human DNA sequence from clone RP1-71I17 on chromosome 6p21.2-22.1,
complete sequence
Length=163682
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 145627 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 145676
>emb|X57152.1| Human gene for casein kinase II subunit beta (EC 2.7.1.37)
Length=5917
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 929 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 880
>ref|XM_010362780.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana G patch domain and ankyrin
repeats 1 (GPANK1), transcript variant X6, mRNA
Length=1937
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 158 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 204
>ref|XM_010362773.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
Length=1113
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 247 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 201
>ref|XM_010362772.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
Length=1122
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 247 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 201
>ref|XM_003897359.2| PREDICTED: Papio anubis casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X2, mRNA
Length=1114
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 242 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 196
>ref|XM_007973128.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
Length=930
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 55 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 9
>ref|XM_005553515.1| PREDICTED: Macaca fascicularis casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X3, mRNA
Length=1105
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 242 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 196
>ref|XM_005553514.1| PREDICTED: Macaca fascicularis casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
Length=1114
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 242 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 196
>ref|XM_005553512.1| PREDICTED: Macaca fascicularis G patch domain and ankyrin repeats
1 (GPANK1), transcript variant X6, mRNA
Length=1927
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 152 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 198
>ref|XM_004093050.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
Length=1784
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 82 GCGGACCCGACCGCGGGAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 33
>ref|XM_003272106.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys G patch domain and ankyrin repeats
1, transcript variant 2 (GPANK1), mRNA
Length=3129
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 159 GCGGACCCGACCGCGGGAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 208
>gb|AC244030.2| Chlorocebus aethiops BAC clone CH252-211J7 from chromosome 6,
complete sequence
Length=172711
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 5950 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 5904
>dbj|AK346261.1| Sus scrofa mRNA, clone:LVRM10123B01, expressed in liver
Length=961
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTAGG 50
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Sbjct 63 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGGAATTAGG 14
>dbj|AK300671.1| Homo sapiens cDNA FLJ50688 complete cds, highly similar to Casein
kinase II subunit beta
Length=877
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 47 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 1
>dbj|AK308742.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98783
Length=1175
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 47 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 1
>gb|AC189961.4| Rhesus Macaque BAC CH250-366P8 () complete sequence
Length=164283
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 47219 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47173
>gb|AC148688.1| Macaca mulatta Major Histocompatibility Complex BAC MMU218K02,
complete sequence
Length=182826
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Identities = 47/47 (100%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 103359 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 103313
>ref|XM_006041921.1| PREDICTED: Bubalus bubalis casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
Length=940
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Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAA 45
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Sbjct 52 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAA 8
>ref|XM_005904193.1| PREDICTED: Bos mutus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X2, mRNA
Length=1123
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Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAA 45
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Sbjct 240 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAA 196
>ref|XM_005904192.1| PREDICTED: Bos mutus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X1, mRNA
Length=1132
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Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAA 45
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Sbjct 240 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAA 196
>emb|FQ482107.2| B.taurus DNA sequence from clone CH240-264I3, complete sequence
Length=130238
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Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAA 45
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Sbjct 83853 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAA 83897
>ref|XM_004695132.1| PREDICTED: Condylura cristata casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
Length=1096
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 227 GCGGACCCGACCGCGGCAAGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 181
>dbj|AK310551.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17593
Length=1094
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATT 47
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Sbjct 47 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGAAGTGGAAATT 1
>ref|XM_003985927.2| PREDICTED: Felis catus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
mRNA
Length=935
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAAT 46
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Sbjct 54 GCGGACCCAACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAAT 9
>ref|XM_005389350.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), transcript variant X2, mRNA
Length=933
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Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAAT 46
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Sbjct 52 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGGGGGGGGAGTGGAAAT 7
>gb|EU153401.1| Felis catus FLA extended class II, class II, class III, proximal
and central class I region genomic sequence
Length=2973765
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAAT 46
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Sbjct 1654174 GCGGACCCAACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAAT 1654219
>ref|XM_007537154.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
Length=1116
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGTGGAAATTA 48
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Sbjct 231 GCGGGCCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGGGTGGAAATTA 184
>emb|X16937.1| Human mRNA for phosvitin/casein kinase type II beta subunit (EC
2.7.1.37)
Length=921
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Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGT 40
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGT 1
>emb|X16312.1| Human mRNA for phosvitin/casein kinase II beta subunit
Length=921
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 40/40 (100%), Gaps = 0/40 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGT 40
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Sbjct 40 GCGGACCCGACCGCGGCAGGCGAAGTGGGGTGGGGGGAGT 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT
>ref|XM_010332266.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis casein kinase 2, beta
polypeptide (CSNK2B), mRNA
Length=1139
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 363 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 412
>ref|XM_010362774.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X3, mRNA
Length=712
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 136 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 185
>ref|XM_010362773.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
Length=1113
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 356 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 405
>ref|XM_010362772.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
Length=1122
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 356 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 405
>ref|XM_009450922.1| PREDICTED: Pan troglodytes casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
Length=819
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 46 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 95
>ref|XM_003311170.2| PREDICTED: Pan troglodytes casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
Length=1124
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 351 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 400
>ref|XM_003897359.2| PREDICTED: Papio anubis casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X2, mRNA
Length=1114
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 400
>ref|XM_009204829.1| PREDICTED: Papio anubis casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X1, mRNA
Length=1066
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 303 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 352
>ref|XM_003831558.2| PREDICTED: Pan paniscus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X2, mRNA
Length=1127
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 400
>ref|XM_003831559.2| PREDICTED: Pan paniscus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X1, mRNA
Length=1054
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 327
>ref|XM_008994153.1| PREDICTED: Callithrix jacchus lymphocyte antigen 6 complex, locus
G5B (LY6G5B), transcript variant X2, mRNA
Length=1963
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 110 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 159
>ref|XM_008711896.1| PREDICTED: Ursus maritimus casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
Length=987
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 215 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 264
>gb|KJ896664.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06058 CSNK2B
gene, encodes complete protein
Length=780
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 84 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 133
>ref|XM_008067700.1| PREDICTED: Tarsius syrichta casein kinase II subunit beta (LOC103270159),
transcript variant X2, mRNA
Length=1712
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 241
>ref|XM_008067699.1| PREDICTED: Tarsius syrichta casein kinase II subunit beta (LOC103270159),
transcript variant X1, mRNA
Length=1129
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 401
>ref|XM_007973128.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
Length=930
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 213
>ref|XM_007973127.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
Length=882
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 116 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 165
>ref|XM_007537154.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
Length=1116
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 339 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 388
>ref|XM_007098787.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
Length=940
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 212
>ref|XM_007098786.1| PREDICTED: Panthera tigris altaica casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
Length=934
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 157 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 206
>ref|XM_003985927.2| PREDICTED: Felis catus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
mRNA
Length=935
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 161 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 210
>ref|XM_006896184.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 21 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 70
>ref|XM_006896183.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
Length=919
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 145 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 194
>ref|XM_006883982.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii casein kinase II subunit beta-like
(LOC102850947), mRNA
Length=786
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 139 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 188
>ref|XM_006738462.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X3, mRNA
Length=692
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 74
>ref|XM_006738461.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
Length=1125
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 397
>ref|XM_006738460.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
Length=836
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 64 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 113
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mRNA
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Sbjct 359 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 408
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mRNA
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Sbjct 24 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 73
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(CSNK2B), mRNA
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Sbjct 297 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 346
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Sbjct 356 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 405
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Sbjct 356 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 405
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Sbjct 209 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 258
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transcript variant X1, mRNA
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(CSNK2B), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 351 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 400
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(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 351 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 400
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(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 263 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 312
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variant 2, mRNA
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Sbjct 356 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 405
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variant 1, mRNA
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Sbjct 356 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 405
>ref|XM_005389350.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 162 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 211
>ref|XM_005389349.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 390 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 439
>ref|XM_005370828.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 118 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 167
>ref|XM_005370827.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 209 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 258
>ref|XM_005370826.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 345 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 394
>ref|XM_005223674.1| PREDICTED: Bos taurus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 289 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 338
>gb|KF458135.1| Homo sapiens chromosome 6 WGS contig WGS_MXL_AL662899.5_9322
genomic sequence
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Sbjct 306 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 257
>ref|XM_004846979.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 140 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 189
>ref|XM_004846978.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 73 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 122
>ref|XM_004905441.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), mRNA
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Sbjct 79 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 128
>ref|XM_004695132.1| PREDICTED: Condylura cristata casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
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Sbjct 336 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 385
>ref|XM_004671870.1| PREDICTED: Jaculus jaculus casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), mRNA
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Sbjct 159 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 208
>ref|XM_004621279.1| PREDICTED: Sorex araneus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
mRNA
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 336 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 385
>ref|XM_004467843.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 180 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 229
>ref|XM_004467842.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant 2, mRNA
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 181 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 230
>ref|XM_004467841.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant 1, mRNA
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 184 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 233
>emb|HE864487.1| Bos taurus mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
663 (Csnk2b gene)
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
>emb|HE864486.1| Bos taurus mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
473 (Csnk2b gene)
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
>emb|HE864485.1| Bos taurus mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
281 (Csnk2b gene)
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
>emb|HE864484.1| Bos taurus mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
242 (Csnk2b gene)
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
>emb|HE864483.1| Bos taurus mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
191 (Csnk2b gene)
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
>emb|HE864482.1| Sus scrofa mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 927
(Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 29 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 78
>emb|HE864481.1| Sus scrofa mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 728
(Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 29 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 78
>emb|HE864480.1| Sus scrofa mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 538
(Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 29 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 78
>emb|HE864476.1| Sus scrofa mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
666 (Csnk2b gene)
Length=666
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 29 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 78
>emb|HE864475.1| Sus scrofa mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
476 (Csnk2b gene)
Length=476
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 29 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 78
>emb|HE864474.1| Sus scrofa mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
324 (Csnk2b gene)
Length=324
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 29 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 78
>emb|HE864473.1| Sus scrofa mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
204 (Csnk2b gene)
Length=204
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 29 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 78
>emb|HE864472.1| Macaca mulatta mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
2338 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
Length=2338
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 28 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 77
>emb|HE864471.1| Macaca mulatta mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
1331 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
Length=1331
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 28 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 77
>emb|HE864470.1| Macaca mulatta mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
1218 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
Length=1218
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 28 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 77
>emb|HE864469.1| Macaca mulatta mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
1141 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
Length=1141
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 28 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 77
>emb|HE864468.1| Macaca mulatta mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
992 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
Length=992
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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660 (Csnk2b gene)
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274 (Csnk2b gene)
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238 (Csnk2b gene)
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205 (Csnk2b gene)
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1327 (CSNK2B-LY6G5B-1327 gene)
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1181 (CSNK2B-LY6G5B-1181 gene)
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1103 (CSNK2B-LY6G5B-1103 gene)
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>emb|HE864458.1| Homo sapiens mRNA for chimera CSNK2B-LY6G5B splicing isoform
1072 (CSNK2B-LY6G5B-1072 gene)
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>emb|HE864457.1| Homo sapiens mRNA for chimera CSNK2B-LY6G5B splicing isoform
991 (CSNK2B-LY6G5B--991 gene)
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>emb|HE864456.1| Homo sapiens mRNA for chimera CSNK2B-LY6G5B splicing isoform
696 (CSNK2B-LY6G5B-696 gene)
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>emb|HE864455.1| Homo sapiens mRNA for chimera CSNK2B-LY6G5B splicing isoform
562 (CSNK2B-LY6G5B-562 gene)
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>emb|HE864454.1| Homo sapiens mRNA for chimera CSNK2B-LY6G5B splicing isoform
560 (CSNK2B-LY6G5B-560 gene)
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532 (CSNK2B-LY6G5B-532 gene)
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>emb|HE864452.1| Homo sapiens mRNA for chimera CSNK2B-LY6G5B splicing isoform
182 (CSNK2B-LY6G5B-182 gene)
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>emb|HE864447.1| Homo sapiens mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
806 (CSNK2B gene)
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Sbjct 28 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 77
>emb|HE864446.1| Homo sapiens mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
660 (CSNK2B gene)
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>emb|HE864445.1| Homo sapiens mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
318 (CSNK2B gene)
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>emb|HE864444.1| Homo sapiens mRNA for casein kinase II b subunit splicing isoform
247 (CSNK2B gene)
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>emb|HE864424.1| Bos taurus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 1239
(Csnk2b-Ly6g5b gene)
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>emb|HE864423.1| Bos taurus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 1049
(Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
>emb|HE864422.1| Bos taurus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 805
(Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
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(Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
>emb|HE864420.1| Bos taurus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 725
(Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
>emb|HE864419.1| Bos taurus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 640
(Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
>emb|HE864418.1| Bos taurus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 460
(Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
>emb|HE864415.1| Bos taurus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 201
(Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 27 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 76
>ref|XM_004390749.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris casein kinase 2, beta
polypeptide, transcript variant 2 (CSNK2B), mRNA
Length=1093
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Sbjct 320 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 369
>ref|XM_004390748.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris casein kinase 2, beta
polypeptide, transcript variant 1 (CSNK2B), mRNA
Length=708
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Sbjct 76 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 125
>ref|XM_004043667.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla casein kinase 2, beta polypeptide,
transcript variant 4 (CSNK2B), mRNA
Length=1674
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 82 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 131
>ref|XM_004043666.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla casein kinase 2, beta polypeptide,
transcript variant 3 (CSNK2B), mRNA
Length=1724
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 132 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 181
>ref|XM_004043665.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla casein kinase 2, beta polypeptide,
transcript variant 2 (CSNK2B), mRNA
Length=1901
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Sbjct 309 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 358
>ref|XM_004043664.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla casein kinase 2, beta polypeptide,
transcript variant 1 (CSNK2B), mRNA
Length=1948
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 356 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 405
>ref|NM_001145377.2| Sus scrofa casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B), mRNA
Length=817
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 36 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 85
>ref|NM_001257688.1| Macaca mulatta casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B), mRNA
Length=729
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 74 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 123
>dbj|AK400043.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10138B06, expressed in hypothalamus
Length=956
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 173 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 222
>gb|AC243944.2| Callithrix jacchus BAC clone CH259-148J2 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=217369
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 148063 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 148112
>gb|AC244030.2| Chlorocebus aethiops BAC clone CH252-211J7 from chromosome 6,
complete sequence
Length=172711
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6641 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 6690
>emb|FQ482107.2| B.taurus DNA sequence from clone CH240-264I3, complete sequence
Length=130238
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83138 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 83089
>dbj|AB590710.1| Synthetic construct DNA, clone: pFN21AE1709, Homo sapiens CSNK2B
gene for casein kinase 2, beta polypeptide, without stop
codon, in Flexi system
Length=662
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 74
>ref|XM_002930024.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca casein kinase II subunit beta-like,
transcript variant 2 (LOC100469386), mRNA
Length=880
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 103 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 152
>ref|XM_002930023.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca casein kinase II subunit beta-like,
transcript variant 1 (LOC100469386), mRNA
Length=854
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 77 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 126
>dbj|AK346261.1| Sus scrofa mRNA, clone:LVRM10123B01, expressed in liver
Length=961
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 172 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 221
>gb|EU282347.1| Sus scrofa casein kinase 2 beta polypeptide (CSNK2B) mRNA, complete
cds
Length=818
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 37 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 86
>dbj|AK300671.1| Homo sapiens cDNA FLJ50688 complete cds, highly similar to Casein
kinase II subunit beta
Length=877
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 156 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 205
>gb|EU153401.1| Felis catus FLA extended class II, class II, class III, proximal
and central class I region genomic sequence
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Sbjct 1653457 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 1653408
>emb|CU467793.10| Pig DNA sequence from clone CH242-60C3 on chromosome 7, complete
sequence
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Sbjct 161024 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 161073
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polypeptide (CSNK2B), mRNA
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Sbjct 135 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 184
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Sbjct 156 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 205
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Sbjct 135 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 184
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Sbjct 156 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 205
>emb|CU104666.2| Gorilla DNA sequence from clone CH255-415I16, complete sequence
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Sbjct 175820 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 175869
>gb|AC189961.4| Rhesus Macaque BAC CH250-366P8 () complete sequence
Length=164283
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Sbjct 47911 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 47960
>emb|CU104673.1| Gorilla DNA sequence from clone CH255-559J12, complete sequence
Length=169876
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Sbjct 88648 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 88697
>gb|AF129756.1|DJ201G24 Homo sapiens MSH55 gene, partial cds; and CLIC1, DDAH, G6b, G6c,
G5b, G6d, G6e, G6f, BAT5, G5b, CSK2B, BAT4, G4, Apo M, BAT3,
BAT2, AIF-1, 1C7, LST-1, LTB, TNF, and LTA genes, complete
cds
Length=184666
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Sbjct 83218 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 83169
>ref|NM_001046454.1| Bos taurus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B), mRNA
gb|BC110170.1| Bos taurus casein kinase 2, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone
MGC:134413 IMAGE:8067936), complete cds
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 142 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 191
>gb|AC148688.1| Macaca mulatta Major Histocompatibility Complex BAC MMU218K02,
complete sequence
Length=182826
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Sbjct 104051 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 104100
>emb|BX511262.7| Human DNA sequence from clone DASS-336N12 on chromosome 6, complete
sequence
Length=69009
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 46400 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 46449
>emb|AL805934.3| Human DNA sequence from clone DAQB-195H10 on chromosome 6, complete
sequence
Length=99109
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Sbjct 55325 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 55374
>gb|AY113186.1| Homo sapiens casein kinase II beta subunit mRNA, complete cds
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Sbjct 16 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 65
>emb|AL670886.6| Human DNA sequence from clone CH502-88C14 on chromosome 6, complete
sequence
Length=90732
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Sbjct 19504 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 19553
>emb|AL662899.5| Human DNA sequence from clone CH501-32J3 on chromosome 6, complete
sequence
Length=136493
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Sbjct 9188 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 9237
>gb|BC112017.1| Homo sapiens casein kinase 2, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone
MGC:138222 IMAGE:8327485), complete cds
Length=870
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Sbjct 169 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 218
>gb|BC112019.1| Homo sapiens casein kinase 2, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone
MGC:138224 IMAGE:8327487), complete cds
Length=865
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 169 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 218
>emb|CR759761.9| Human DNA sequence from clone DAMC-157M7 on chromosome 6, complete
sequence
Length=83849
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 55305 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 55354
>emb|CR753842.3| Human DNA sequence from clone DADB-127H9 on chromosome 6, complete
sequence
Length=69013
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 24316 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 24365
>emb|CR541699.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0628D
for gene CSNK2B, casein kinase 2, beta polypeptide; complete
cds, without stopcodon
Length=645
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 16 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 65
>dbj|BA000025.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 6p21.3, HLA Class I region
Length=2229817
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 277181 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 277132
>emb|CR354443.4| Human DNA sequence from clone DAMA-236L13 on chromosome 6, complete
sequence
Length=132551
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 47958 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 48007
>gb|DQ314868.1| Homo sapiens casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B) gene,
complete cds
Length=7855
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 2903 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 2952
>gb|AY894042.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH131038.01L casein kinase
2 beta polypeptide (CSNK2B) mRNA, partial cds
Length=648
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 16 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 65
>emb|AL773591.7| Pig DNA sequence from clone PigI-35B1 on chromosome 7, complete
sequence
Length=118404
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 114150 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 114101
>emb|AL132713.11| Human DNA sequence from clone RP1-71I17 on chromosome 6p21.2-22.1,
complete sequence
Length=163682
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 144906 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 144857
>gb|M30448.1|HUMCSK2B Human casein kinase II beta subunit mRNA, complete cds
Length=2527
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 112 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 161
>emb|X57152.1| Human gene for casein kinase II subunit beta (EC 2.7.1.37)
Length=5917
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 1649 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 1698
>emb|X16937.1| Human mRNA for phosvitin/casein kinase type II beta subunit (EC
2.7.1.37)
Length=921
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 149 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 198
>emb|X16312.1| Human mRNA for phosvitin/casein kinase II beta subunit
Length=921
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 149 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 198
>ref|XM_010601540.1| PREDICTED: Loxodonta africana casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 143 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAGTTCTT 192
>ref|XM_003422275.2| PREDICTED: Loxodonta africana casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
Length=1114
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 340 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAGTTCTT 389
>ref|XM_008821527.1| PREDICTED: Nannospalax galili casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), mRNA
Length=930
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 159 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 208
>ref|XM_006256081.2| PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), transcript variant X1, mRNA
Length=951
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 182 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 231
>ref|XM_008537532.1| PREDICTED: Equus przewalskii casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 116 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGTCTCCGTGGCAATGAATTCTT 165
>ref|XM_008157353.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
Length=1088
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 344 GAGGTGTCCTGGATCTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 393
>ref|XR_505066.1| PREDICTED: Tarsius syrichta casein kinase II subunit beta pseudogene
(LOC103271743), misc_RNA
Length=925
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 137 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGACAATGAATTCTT 186
>ref|XM_007951357.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
Length=639
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 16 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGACTCCGTGGCAATGAATTCTT 65
>ref|XM_007951356.1| PREDICTED: Orycteropus afer afer casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
Length=906
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 133 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGACTCCGTGGCAATGAATTCTT 182
>ref|XR_474996.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus casein kinase II subunit beta
pseudogene (LOC103117134), misc_RNA
Length=396
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 20 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCTGTGGCAATGAATTCTT 69
>ref|XM_007459561.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
Length=1127
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 365 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTTCGTGGCAATGAATTCTT 414
>ref|XM_007459560.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
Length=880
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 118 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTTCGTGGCAATGAATTCTT 167
>ref|XM_007193948.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni casein kinase
2, beta polypeptide (CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
Length=744
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 163 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTTCGTGGCAATGAATTCTT 212
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2, beta polypeptide (CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 163 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTTCGTGGCAATGAATTCTT 212
>ref|XM_006041921.1| PREDICTED: Bubalus bubalis casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
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Sbjct 168 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 217
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(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 148 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTTCGTGGCAATGAATTCTT 197
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(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 129 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTTCGTGGCAATGAATTCTT 178
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polypeptide (Csnk2b), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 336 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGGAATGAATTCTT 385
>ref|XM_006995260.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii casein kinase 2, beta
polypeptide (Csnk2b), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 269 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGGAATGAATTCTT 318
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(CSNK2B), mRNA
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Sbjct 157 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGGGGCAATGAATTCTT 206
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transcript variant X2, mRNA
ref|XM_006536512.1| PREDICTED: Mus musculus casein kinase 2, beta polypeptide (Csnk2b),
transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 146 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 195
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transcript variant X1, mRNA
ref|XM_006536511.1| PREDICTED: Mus musculus casein kinase 2, beta polypeptide (Csnk2b),
transcript variant X1, mRNA
ref|XM_006537244.1| PREDICTED: Mus musculus casein kinase 2, beta polypeptide (Csnk2b),
transcript variant X1, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 350 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 399
>ref|XM_005696585.1| PREDICTED: Capra hircus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCTTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 79
>ref|XM_005696584.1| PREDICTED: Capra hircus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCTTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 79
>ref|XM_001917690.3| PREDICTED: Equus caballus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 120 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGTCTCCGTGGCAATGAATTCTT 169
>ref|XM_005603732.1| PREDICTED: Equus caballus casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 170 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGTCTCCGTGGCAATGAATTCTT 219
>ref|XM_005338997.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus casein kinase 2, beta
polypeptide (Csnk2b), mRNA
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Sbjct 364 GAGGTGTCTTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 413
>ref|XM_003473978.2| PREDICTED: Cavia porcellus casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), mRNA
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 134 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGACTCCGTGGCAATGAATTCTT 183
>ref|XM_004598706.1| PREDICTED: Ochotona princeps casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
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Query 4 GTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 362 GTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 408
>emb|HE864442.1| Mus musculus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
1108 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>emb|HE864441.1| Mus musculus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
979 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>emb|HE864440.1| Mus musculus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
713 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>emb|HE864437.1| Mus musculus mRNA for Csnk2b splicing isoform 780 (Csnk2b gene)
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>emb|HE864436.1| Mus musculus mRNA for Csnk2b splicing isoform 670 (Csnk2b gene)
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>emb|HE864435.1| Mus musculus mRNA for Csnk2b splicing isoform 132 (Csnk2b gene)
Length=132
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>emb|HE864434.1| Rattus norvegicus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
2531 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>emb|HE864433.1| Rattus norvegicus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
2275 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>emb|HE864432.1| Rattus norvegicus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
2050 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>emb|HE864431.1| Rattus norvegicus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform
901 (Csnk2b-Ly6g5b gene)
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>emb|HE864426.1| Rattus norvegicus mRNA for Csnk2b splicing isoform 662 (Csnk2b
gene)
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>emb|HE864425.1| Rattus norvegicus mRNA for Csnk2b splicing isoform 280 (Csnk2b
gene)
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Sbjct 30 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 79
>ref|XM_004415236.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens casein kinase 2, beta
polypeptide, transcript variant 2 (CSNK2B), mRNA
Length=995
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 223 GAGGTGTCCTGGATCTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 272
>ref|XM_004415235.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens casein kinase 2, beta
polypeptide, transcript variant 1 (CSNK2B), mRNA
Length=848
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 76 GAGGTGTCCTGGATCTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 125
>ref|XM_004093050.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
Length=1784
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 192 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGCCTCCGTGGCAATGAATTCTT 241
>ref|NM_001142511.2| Ovis aries casein kinase 2, beta polypeptide (CSNK2B), mRNA
Length=933
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 152 GAGGTGTCCTGGATTTCTTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 201
>ref|XM_003789011.1| PREDICTED: Otolemur garnettii casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
Length=1089
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATT 47
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Sbjct 304 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATT 350
>gb|JN959145.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Csnk2b:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 14808 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 14857
>gb|JN954491.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Ly6g5c:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38029
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 32361 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 32312
>gb|JN950543.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Ly6g5c:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=37973
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 32305 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 32256
>gb|JN947244.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Csnk2b:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=37945
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 14808 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 14857
>emb|FQ214437.1| Rattus norvegicus TL0AAA41YL09 mRNA sequence
Length=948
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 162 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 211
>emb|FQ224491.1| Rattus norvegicus TL0ACA64YF05 mRNA sequence
Length=953
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 166 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 215
>emb|FQ230013.1| Rattus norvegicus TL0ADA45YO19 mRNA sequence
Length=921
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 134 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 183
>ref|NM_031021.3| Rattus norvegicus casein kinase 2, beta polypeptide (Csnk2b),
transcript variant 1, mRNA
Length=915
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 146 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 195
>ref|NM_001035238.2| Rattus norvegicus casein kinase 2, beta polypeptide (Csnk2b),
transcript variant 2, mRNA
Length=864
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 50
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Sbjct 95 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 144
>gb|FJ422549.1| Ovis aries CSNK2B (CSNK2B) mRNA, complete cds
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sequence
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sequence
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>emb|CU406961.7| Mouse DNA sequence from clone CH29-167B15 on chromosome 17, complete
sequence
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cds; BAT4, NG20 (NG20), BAT3, BAT2, AIF-1, B144, lymphotoxin
beta, TNF, and TNF beta genes, complete cds; IKBL gene,
partial cds; and unknown gene
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MGC:5980 IMAGE:3485097), complete cds
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library, clone:4930407M15 product:casein kinase II, beta
subunit, full insert sequence
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enriched library, clone:2700043N06 product:casein kinase II,
beta subunit, full insert sequence
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Sbjct 138 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 187
>dbj|AK010730.1| Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:2410079O09 product:casein kinase II, beta subunit,
full insert sequence
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Sbjct 140 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 189
>dbj|AK002903.1| Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:0610042C23 product:casein kinase II, beta
subunit, full insert sequence
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Sbjct 143 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 192
>emb|BX883045.1| Rattus norvegicus chromosome 20, major histocompatibility complex,
assembled from 40 BACs, strain Brown Norway (BN/ssNHsd),
RT1n haplotype; segment 4/11
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Sbjct 318862 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 318813
>emb|CR974444.18| Mouse DNA sequence from clone RP23-115O3 on chromosome 17, complete
sequence
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Sbjct 56496 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 56447
>gb|BC078807.1| Rattus norvegicus casein kinase 2, beta subunit, mRNA (cDNA clone
MGC:93390 IMAGE:7133064), complete cds
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Sbjct 95 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 144
>emb|X80685.1| M.musculus gMCK2-beta gene
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Sbjct 2184 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 2233
>gb|L15619.1|RATCK2BETA Rat casein kinase II beta subunit (CK2) mRNA, complete cds
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Sbjct 129 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 178
>emb|X56502.1| Mouse CKII beta mRNA for casein kinase II beta subunit
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Sbjct 137 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 186
>emb|X52959.1| Mouse mRNA for casein kinase II beta subunit (EC 2.7.1.37)
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Sbjct 143 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAATTCTT 192
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mRNA
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Sbjct 163 GAGGTGTCCTGGATCTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAGTTCTT 212
>ref|XM_006104619.1| PREDICTED: Myotis lucifugus casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), mRNA
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Sbjct 139 GAGGTGTCCTGGATCTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAGTTCTT 188
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(CSNK2B), mRNA
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>ref|XM_005627149.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X3, mRNA
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(CSNK2B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 171 GAGGTGTCTTGGATATCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 220
>ref|XM_003431652.2| PREDICTED: Canis lupus familiaris casein kinase 2, beta polypeptide
(CSNK2B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 229 GAGGTGTCTTGGATATCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGCAATGAATTCTT 278
>ref|XM_004311207.1| PREDICTED: Tursiops truncatus casein kinase 2, beta polypeptide,
transcript variant 2 (CSNK2B), mRNA
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Sbjct 359 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGACTTCGTGGCAATGAATTCTT 408
>ref|XM_004311206.1| PREDICTED: Tursiops truncatus casein kinase 2, beta polypeptide,
transcript variant 1 (CSNK2B), mRNA
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Sbjct 76 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGACTTCGTGGCAATGAATTCTT 125
>ref|XM_004286596.1| PREDICTED: Orcinus orca casein kinase 2, beta polypeptide, transcript
variant 2 (CSNK2B), mRNA
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Sbjct 352 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGACTTCGTGGCAATGAATTCTT 401
>ref|XM_004286595.1| PREDICTED: Orcinus orca casein kinase 2, beta polypeptide, transcript
variant 1 (CSNK2B), mRNA
Length=848
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Sbjct 76 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGACTTCGTGGCAATGAATTCTT 125
>emb|FQ212674.1| Rattus norvegicus TL0AAA51YP12 mRNA sequence
Length=929
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Sbjct 134 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCCGTGGTAATGAACTCTT 183
>ref|XR_746360.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis casein kinase II subunit
beta pseudogene (LOC101030254), misc_RNA
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Sbjct 609 GAGGTGTCCTGGATTTCCTGGTTCTGTGGGCTCTGTGACAATGAATTCT 657
>ref|XM_003508482.2| PREDICTED: Cricetulus griseus casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), mRNA
ref|XM_007614675.1| PREDICTED: Cricetulus griseus casein kinase 2, beta polypeptide
(Csnk2b), mRNA
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genome shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 24650456 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 24650504
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shotgun sequence
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Sbjct 17694745 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 17694793
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shotgun sequence
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Sbjct 17786571 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 17786619
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shotgun sequence
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Sbjct 22503894 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 22503942
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Sbjct 107885005 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 107884957
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Sbjct 24506077 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 24506125
>gb|DS990673.1| Homo sapiens SCAF_1112675837361 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 18297043 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 18297091
>gb|DS990896.1| Homo sapiens SCAF_1112675830882 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=1895119
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Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCC 49
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Sbjct 1445325 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 1445277
>gb|CH003507.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=139801695
Score = 80.5 bits (43), Expect = 5e-13
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCC 49
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Sbjct 115477866 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 115477818
>gb|CH003470.1| Homo sapiens chromosome X, whole genome shotgun sequence
Length=150422324
Score = 80.5 bits (43), Expect = 5e-13
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 27601460 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 27601508
>gb|CH003459.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=131157419
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCC 49
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Sbjct 108230642 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 108230594
>emb|CT009680.1| Human chromosome X complete sequence
Length=154047547
Score = 80.5 bits (43), Expect = 5e-13
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 26322310 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 26322358
>gb|CH471074.1| Homo sapiens 211000035840903 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=35626972
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Strand=Plus/Plus
Query 2 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 25292783 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 25292831
>ref|NW_001842360.1| Homo sapiens chromosome X genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188416, whole genome shotgun sequence
gb|DS486035.1| Homo sapiens SCAF_1103279188416 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=28681338
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Strand=Plus/Plus
Query 2 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 18297074 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 18297122
>gb|CH471054.1| Homo sapiens 211000035840223 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=79994791
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCC 49
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Sbjct 58117566 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 58117518
>ref|NW_001838062.1| Homo sapiens chromosome 12 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279181937, whole genome shotgun sequence
gb|DS486258.1| Homo sapiens SCAF_1103279181937 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=1895027
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCC 49
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Sbjct 1445153 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 1445105
>ref|AC_000155.1| Homo sapiens chromosome X, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000484.1| Homo sapiens chromosome X, whole genome shotgun sequence
Length=143733266
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Strand=Plus/Plus
Query 2 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 24506113 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 24506161
>ref|AC_000144.1| Homo sapiens chromosome 12, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000473.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=130617856
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCC 49
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Sbjct 107885120 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 107885072
>gb|CM000274.1| Homo sapiens chromosome X, whole genome shotgun sequence
Length=155407050
Score = 80.5 bits (43), Expect = 5e-13
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 30894501 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 30894549
>gb|CM000263.1| Homo sapiens chromosome 12, whole genome shotgun sequence
Length=133516800
Score = 80.5 bits (43), Expect = 5e-13
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCC 49
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Sbjct 110493737 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 110493689
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA
>ref|XM_005249061.1| PREDICTED: Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1),
transcript variant X3, mRNA
Length=1808
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1094 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1045
>ref|NG_029020.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), RefSeqGene
on chromosome 6
Length=16432
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 13718 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 13669
>ref|NM_145905.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), transcript
variant 7, mRNA
Length=1887
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1135 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1086
>ref|NM_145901.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), transcript
variant 3, mRNA
Length=2198
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1446 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1397
>ref|NM_145902.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), transcript
variant 4, mRNA
Length=2165
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1413 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1364
>ref|NM_145899.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), transcript
variant 1, mRNA
Length=2031
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1230
>ref|NM_002131.3| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), transcript
variant 2, mRNA
Length=1998
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1197
>ref|NM_145903.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), transcript
variant 5, mRNA
Length=1884
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1083
>dbj|AK301434.1| Homo sapiens cDNA FLJ54188 complete cds, moderately similar to
High mobility group protein HMG-I/HMG-Y
Length=1733
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1090
>dbj|AK308245.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98193
Length=1680
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1420 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1371
>gb|BC007657.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3344837, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1933
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1196 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1147
>gb|BC015789.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:23654 IMAGE:4866014), complete cds
Length=1878
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1086
>gb|BC078664.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3941503
Length=4397
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 3606 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 3557
>gb|BC004924.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:4854 IMAGE:3605116), complete cds
Length=1873
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1077
>gb|BC008832.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:12816 IMAGE:4308914), complete cds
Length=1911
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1159 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1110
>gb|BC071863.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:88532 IMAGE:4651720), complete cds
Length=1483
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 739 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 690
>gb|BC063434.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:74577 IMAGE:5399570), complete cds
Length=1790
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1002
>dbj|AK096863.1| Homo sapiens cDNA FLJ39544 fis, clone PUAEN2008980, moderately
similar to HIGH MOBILITY GROUP PROTEIN HMG-I
Length=1899
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1186 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1137
>gb|BC067083.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:71296 IMAGE:4110270), complete cds
Length=1876
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1134 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1085
>emb|AL354740.29| Human DNA sequence from clone RP11-513I15 on chromosome 6, complete
sequence
Length=151828
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 112856 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 112807
>dbj|AK130027.1| Homo sapiens cDNA FLJ26517 fis, clone KDN07769
Length=1779
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1066 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1017
>gb|BC071864.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:88534 IMAGE:6083428), complete cds
Length=1887
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1105
>gb|BC008963.2| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:2962998, containing frame-shift
errors
Length=1749
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 962
>gb|BC015662.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
IMAGE:4844539)
Length=1088
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 758 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 807
>gb|L17131.1|HUMHMGIY Homo sapiens high mobility group protein (HMG-I(Y)) gene exons
1-8, complete cds
Length=10144
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9265 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 9216
>gb|M23618.1|HUMHMGYD Human HMG-Y protein isoform mRNA (HMGI gene), clone 11D
Length=1675
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 916
>gb|M23617.1|HUMHMGYC Human HMG-Y protein isoform mRNA (HMGI gene), clone 10A
Length=1768
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1009
>gb|M23616.1|HUMHMGYB Human HMG-Y protein isoform mRNA (HMGI gene), clone 8A
Length=1875
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1165 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1116
>gb|M23615.1|HUMHMGYA Human HMG-Y protein isoform mRNA (HMGI gene), clone 2B
Length=1840
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1130 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1081
>gb|M23619.1|HUMHMGIB Human HMG-I protein isoform mRNA (HMGI gene), clone 6A
Length=1978
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1268 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1219
>gb|M23614.1|HUMHMGIA Human HMG-I protein isoform mRNA (HMGI gene), clone 7C
Length=1873
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1163 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1114
>emb|X14958.1| Human hmgI mRNA for high mobility group protein Y
Length=1875
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 50
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Sbjct 1156 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1107
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Sbjct 1189 CGAAGGGGGCTGTCCAACCTAGTACGGGGACTAGGGAAGTTGGGGAAGGA 1140
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Lambda K H
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right flanking sequence - GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA
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transcript variant X4, mRNA
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transcript variant X3, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1344 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1393
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1214 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1263
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mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1130 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1179
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1163 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1212
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transcript variant X3, mRNA
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1, transcript variant 4 (HMGA1), mRNA
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Sbjct 2029 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 2078
>ref|XM_004043850.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla high mobility group AT-hook
1, transcript variant 3 (HMGA1), mRNA
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Sbjct 1221 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1270
>ref|XM_004043849.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla high mobility group AT-hook
1, transcript variant 2 (HMGA1), mRNA
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Sbjct 1177 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1226
>ref|XM_004043848.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla high mobility group AT-hook
1, transcript variant 1 (HMGA1), mRNA
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Sbjct 1168 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1217
>dbj|AK305375.1| Pan troglodytes mRNA for high mobility group protein HMG-I/HMG-Y,
complete cds, clone: PtsC-22-5_F01
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Sbjct 1235 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1284
>ref|NM_001246496.1| Pan troglodytes high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), mRNA
dbj|AK306394.1| Pan troglodytes mRNA for high mobility group protein HMG-I/HMG-Y,
complete cds, clone: PtsC-42-5_H08
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Sbjct 1272 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1321
>dbj|AK306117.1| Pan troglodytes mRNA for high mobility group protein HMG-I/HMG-Y,
complete cds, clone: PtsC-68-5_A04
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Sbjct 1195 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1244
>ref|NG_029020.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), RefSeqGene
on chromosome 6
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Sbjct 13821 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 13870
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variant 7, mRNA
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Sbjct 1238 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1287
>ref|NM_145901.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), transcript
variant 3, mRNA
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Sbjct 1549 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1598
>ref|NM_145902.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), transcript
variant 4, mRNA
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Sbjct 1516 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1565
>ref|NM_145899.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), transcript
variant 1, mRNA
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Sbjct 1382 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1431
>ref|NM_002131.3| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), transcript
variant 2, mRNA
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Sbjct 1349 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1398
>ref|NM_145903.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1 (HMGA1), transcript
variant 5, mRNA
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1235 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1284
>dbj|AK301434.1| Homo sapiens cDNA FLJ54188 complete cds, moderately similar to
High mobility group protein HMG-I/HMG-Y
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1242 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1291
>dbj|AK308245.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98193
Length=1680
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1523 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1572
>gb|AC192183.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-305P12 from chromosome 6, complete
sequence
Length=175932
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 117247 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 117296
>gb|BC007657.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3344837, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1933
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1299 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1348
>gb|BC015789.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:23654 IMAGE:4866014), complete cds
Length=1878
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1238 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1287
>gb|BC078664.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3941503
Length=4397
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 3709 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 3758
>gb|BC004924.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:4854 IMAGE:3605116), complete cds
Length=1873
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1229 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1278
>gb|BC008832.2| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:12816 IMAGE:4308914), complete cds
Length=1911
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Sbjct 1262 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1311
>gb|BC071863.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:88532 IMAGE:4651720), complete cds
Length=1483
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 842 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 891
>gb|BC063434.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:74577 IMAGE:5399570), complete cds
Length=1790
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1154 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1203
>dbj|AK096863.1| Homo sapiens cDNA FLJ39544 fis, clone PUAEN2008980, moderately
similar to HIGH MOBILITY GROUP PROTEIN HMG-I
Length=1899
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1289 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1338
>gb|BC067083.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:71296 IMAGE:4110270), complete cds
Length=1876
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1237 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1286
>emb|AL354740.29| Human DNA sequence from clone RP11-513I15 on chromosome 6, complete
sequence
Length=151828
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 112959 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 113008
>dbj|AK130027.1| Homo sapiens cDNA FLJ26517 fis, clone KDN07769
Length=1779
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1169 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1218
>gb|BC071864.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
MGC:88534 IMAGE:6083428), complete cds
Length=1887
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1306
>gb|BC008963.2| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:2962998, containing frame-shift
errors
Length=1749
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1163
>gb|BC015662.1| Homo sapiens high mobility group AT-hook 1, mRNA (cDNA clone
IMAGE:4844539)
Length=1088
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 606
>gb|L17131.1|HUMHMGIY Homo sapiens high mobility group protein (HMG-I(Y)) gene exons
1-8, complete cds
Length=10144
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9368 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 9417
>emb|X14958.1| Human hmgI mRNA for high mobility group protein Y
Length=1875
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1259 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1308
>emb|X14957.1| Human hmgI mRNA for high mobility group protein I
Length=1907
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 50
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Sbjct 1292 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCAAGAGCCCTGTGGCCGCCA 1341
>gb|M23618.1|HUMHMGYD Human HMG-Y protein isoform mRNA (HMGI gene), clone 11D
Length=1675
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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on chromosome 13
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Sbjct 1204 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCATGAGCCCTGTGGCTGCCA 1253
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sequence
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(LOC103783990), misc_RNA
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Sbjct 1200 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 1248
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(LOC101142088), misc_RNA
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on chromosome 12
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Sbjct 1269 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 1317
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on chromosome X
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Sbjct 1273 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 1321
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Sbjct 95958 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 95910
>gb|AC196301.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-352G16 from chromosome x, complete
sequence
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Sbjct 95958 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 95910
>emb|CT806415.3| CH251-183N18, complete sequence
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Sbjct 57333 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 57285
>gb|AC144548.8| Homo sapiens 12 BAC RP11-478C19 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
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Sbjct 26486 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 26534
>tpg|BK000551.1| TPA_exp: Homo sapiens HMGA1L3 retropseudogene, complete sequence
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Sbjct 1176 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 1224
>gb|AC005907.1| Homo sapiens 12q24.1 PAC P443K8 (Rosewell Park Cancer Institute
Human Pac Library) complete sequence
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Sbjct 19605 GATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACGAGCCCTGTGTCCGCC 19653
>gb|AF116914.1|AF116914 Homo sapiens HMGIY-related protein, retropseudogene sequence
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Sbjct 1260 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 1308
>gb|AC107293.4| Homo sapiens Xp BAC RP11-436D22 (Roswell Park Cancer Institute
Human BAC Library) complete sequence
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Sbjct 147135 ATGCAGTCACTTATTGTCCAGGTGAGGCCCACAAGCCCTGTGGCCGCCA 147087
>ref|XM_010352937.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana high mobility group protein
HMG-I/HMG-Y-like (LOC104653886), mRNA
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Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 27110024 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 27109980
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shotgun sequence
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Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 8745980 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 8746024
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shotgun sequence
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Sbjct 38179 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 38132
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shotgun sequence
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Sbjct 6245431 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 6245387
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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>ref|NW_001838951.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188395, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 6369951 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 6369907
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sequence
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Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 6375029 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 6374985
>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 72288060 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 72288016
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shotgun sequence
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 194664052 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 194664099
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Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 72975185 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 72975141
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 197207998 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 197208045
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA
>ref|NC_000007.14| Homo sapiens chromosome 7, GRCh38 Primary Assembly
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Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 5530574 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5530525
>ref|NT_007819.18| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR7_CTG1
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assembly
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 5520574 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5520525
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genome shotgun sequence
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Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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>ref|NW_004929329.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
Length=50362920
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 5559788 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5559739
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 5483161 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5483112
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Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 4474747 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 4474698
>gb|DS990771.1| Homo sapiens SCAF_1112675837207 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5668743
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Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 5285394 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5285345
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 5280543 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5280494
>ref|NW_001838998.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188262, whole genome shotgun sequence
gb|DS486133.1| Homo sapiens SCAF_1103279188262 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5668350
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 5284992 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5284943
>gb|CH471144.1| Homo sapiens 211000035837778 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=5843728
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5472379 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5472330
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000468.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=152870189
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Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 5482747 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5482698
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
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Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 5616550 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5616501
>gb|CM000258.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=153561227
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Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 5529982 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5529933
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA
>ref|XM_008973178.1| PREDICTED: Pan paniscus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=2004
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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Sbjct 743 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 694
>ref|XM_008963291.1| PREDICTED: Pan paniscus actin, cytoplasmic 1 (LOC100990579),
mRNA
Length=1298
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 509
>ref|XM_003804319.2| PREDICTED: Pan paniscus actin, cytoplasmic 1-like (LOC100987691),
mRNA
Length=822
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 53
>gb|KJ896369.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05763 ACTB
gene, encodes complete protein
Length=1257
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 484
>ref|XM_006715764.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, beta (ACTB), transcript variant
X1, mRNA
Length=1816
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 556 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 507
>dbj|AK316361.1| Homo sapiens cDNA, FLJ79260 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1087
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 325 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 276
>dbj|AK301372.1| Homo sapiens cDNA FLJ55253 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 1
Length=1255
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 468 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 419
>ref|NG_007992.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB), RefSeqGene (LRG_132) on chromosome
7
Length=10454
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6987 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 6938
>ref|NM_001101.3| Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1852
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 503
>dbj|AB385102.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5455, Homo sapiens ACTB
gene for actin, cytoplasmic 1, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
Length=1142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 428
>emb|CU680417.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017100
3' read ACTB mRNA
Length=1087
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 676 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 725
>emb|CU680416.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017100
5' read ACTB mRNA
Length=1262
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RZPDo839A1191D actin, beta (ACTB) gene, encodes complete
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>gb|DQ890960.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003590; FLH168003.01X; RZPDo839A1192D
actin, beta (ACTB) gene, encodes complete protein
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clone ****
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cds
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>gb|BC021242.1| Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter,
y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3677363),
**** WARNING: chimeric clone ****
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WARNING: chimeric clone ****
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cds
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>gb|BC065493.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6482790, **** WARNING: chimeric
clone ****
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>gb|BC021035.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834434, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 468 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 419
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complete cds
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>gb|BC013380.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:16525 IMAGE:4025526),
complete cds
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Sbjct 543 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 494
>gb|BC001301.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:5475 IMAGE:3451917),
complete cds
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Sbjct 535 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 486
>gb|BC016045.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:20387 IMAGE:4564532),
complete cds
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>gb|BC004251.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:10559 IMAGE:3623067),
complete cds
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Sbjct 529 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 480
>gb|BC012854.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3863361), partial
cds
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Sbjct 425 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 376
>gb|AY582799.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB) gene, complete cds
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Sbjct 3920 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 3871
>dbj|AK125561.1| Homo sapiens cDNA FLJ43573 fis, clone RECTM2001691, highly similar
to Actin, cytoplasmic 2
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Sbjct 992 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 943
>dbj|AK223055.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: KAT00430
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Sbjct 552 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 503
>dbj|AK223032.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: JTH03396
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Sbjct 552 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 503
>dbj|AK222925.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC07191
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Sbjct 552 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 503
>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
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Sbjct 581 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 532
>gb|AC006483.3| Homo sapiens BAC clone CTB-161C1 from 7, complete sequence
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cds
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
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cds
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970497.1| Homo sapiens isolate 4T-14 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970496.1| Homo sapiens isolate 4T-13 actin-like protein (ACT) gene, partial
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970495.1| Homo sapiens isolate 4T-12 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970494.1| Homo sapiens isolate 4T-11 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970493.1| Homo sapiens isolate 4T-10 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970492.1| Homo sapiens isolate 4T-9 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970491.1| Homo sapiens isolate 4T-8 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970490.1| Homo sapiens isolate 4T-7 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970489.1| Homo sapiens isolate 4T-6 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970488.1| Homo sapiens isolate 4T-5 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970487.1| Homo sapiens isolate 4T-4 actin-like protein (ACT) gene, partial
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Length=310
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>gb|AY970486.1| Homo sapiens isolate 4T-3 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970485.1| Homo sapiens isolate 4T-2 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970477.1| Homo sapiens isolate 4N-13 actin-like protein (ACT) gene, partial
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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>gb|AY970476.1| Homo sapiens isolate 4N-12 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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>gb|AY970475.1| Homo sapiens isolate 4N-11 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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>gb|AY970474.1| Homo sapiens isolate 4N-10 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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>gb|AY970473.1| Homo sapiens isolate 4N-9 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 50
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>gb|AY970472.1| Homo sapiens isolate 4N-8 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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>gb|AY970375.1| Homo sapiens isolate 1N-13 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970374.1| Homo sapiens isolate 1N-12 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970372.1| Homo sapiens isolate 1N-10 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970371.1| Homo sapiens isolate 1N-9 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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>gb|AY970370.1| Homo sapiens isolate 1N-8 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>gb|AY970369.1| Homo sapiens isolate 1N-7 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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>gb|AY970368.1| Homo sapiens isolate 1N-6 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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>gb|AY970367.1| Homo sapiens isolate 1N-5 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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>gb|AY970366.1| Homo sapiens isolate 1N-4 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970365.1| Homo sapiens isolate 1N-3 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970364.1| Homo sapiens isolate 1N-2 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970363.1| Homo sapiens isolate 1N-1 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
>dbj|AK130157.1| Homo sapiens cDNA FLJ26647 fis, clone MPE04710, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
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>dbj|AK130062.1| Homo sapiens cDNA FLJ26552 fis, clone LNF01613, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1806
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Sbjct 552 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 503
>dbj|AK058019.1| Homo sapiens cDNA FLJ25290 fis, clone STM07156, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC 1
Length=1804
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Sbjct 552 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 503
>gb|BC008633.1|BC008633 Homo sapiens, actin, beta, clone IMAGE:4179564, mRNA, partial
cds
Length=1744
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Sbjct 449 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 400
>dbj|AK025375.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21722 fis, clone COLF0522, highly similar
to HSACTB Homo sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1872
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Sbjct 552 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 503
>emb|X63432.1| H.sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1802
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 541 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 492
>emb|X00351.1| Human mRNA for beta-actin
Length=1761
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 509 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 460
>gb|AY891016.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH007203.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
Length=1128
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Sbjct 468 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 419
>gb|AY889707.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116685.01X actin beta
(ACTB) mRNA, complete cds
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Sbjct 468 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 419
>gb|AY892160.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116681.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
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Sbjct 468 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 419
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complete cds
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Sbjct 539 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 490
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errors
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(LOC104657250), mRNA
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(LOC104676787), mRNA
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Sbjct 540 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 493
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Sbjct 660 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 613
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(LOC104665032), misc_RNA
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Sbjct 473 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 426
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misc_RNA
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Sbjct 915 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 868
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Sbjct 660 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 613
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mRNA
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Sbjct 546 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 499
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mRNA
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Sbjct 375 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 328
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Sbjct 562 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 515
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mRNA
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Sbjct 340 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 293
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mRNA
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Sbjct 531 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 484
>ref|XM_004045059.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
2 (ACTB), mRNA
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Sbjct 676 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 629
>ref|XM_004045058.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
1 (ACTB), mRNA
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Sbjct 516 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 469
>gb|JF304773.1| Papio anubis beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 181 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 134
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mRNA
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Sbjct 766 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 813
>ref|XM_002802729.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical protein LOC100430113 (LOC100430113),
mRNA
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Sbjct 345 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 392
>ref|XM_002802726.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 4 (LOC100428865), mRNA
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 466 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 419
>ref|XM_002802725.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 3 (LOC100428865), mRNA
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 583 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 536
>ref|XM_002802724.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 2 (LOC100428865), mRNA
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 566 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 519
>ref|XM_002802723.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 1 (LOC100428865), mRNA
Length=1854
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 563 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 516
>ref|XR_012665.2| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like (LOC705671),
miscRNA
Length=1831
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 552 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 505
>ref|NM_001285025.1| Macaca fascicularis actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB170391.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10647, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 552 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 505
>gb|DQ464112.1| Macaca fascicularis beta-actin (ACTB) mRNA, partial cds
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 337 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 290
>ref|NM_001033084.1| Macaca mulatta actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1584
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 493 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 446
>gb|AY497558.1| Macaca mulatta beta-actin mRNA, partial cds
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 304 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 257
>dbj|AB169683.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-17788, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1934
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 672 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 625
>gb|S79782.1| actin [Macaca fuscata=Japanese monkeys, brain, mRNA Partial,
331 nt]
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Sbjct 125 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 78
>gb|AY970501.1| Homo sapiens isolate 4T-18 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>ref|NM_001133354.1| Pongo abelii actin, beta (ACTB), mRNA
emb|CR860982.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A196 (from clone DKFZp459A196)
Length=1844
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 569 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 522
>emb|CR860530.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A127 (from clone DKFZp459A127)
Length=1833
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 552 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 505
>dbj|AB004047.1| Cercopithecus aethiops mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1138
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 478 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 431
>ref|XM_008698477.1| PREDICTED: Ursus maritimus actin, beta (ACTB), partial mRNA
Length=1713
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Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 398 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 352
>ref|XM_006765441.1| PREDICTED: Myotis davidii actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1800
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 545 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 499
>ref|XM_006107702.1| PREDICTED: Myotis lucifugus actin, cytoplasmic 2-like (LOC102425233),
mRNA
Length=1615
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 366 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 320
>ref|XM_005883637.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=1695
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 376 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 330
>ref|XM_005874162.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, beta-like 2 (ACTBL2), mRNA
Length=1065
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 347 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 301
>ref|XM_004394150.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1842
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 551 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 505
>gb|JQ284425.1| Myotis laniger isolate SE actin beta (ACTB) mRNA, partial cds
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cds
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cds
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cds
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
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cds
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCATCACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA 172
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Sbjct 469 ACCAGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 422
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(LOC104679102), misc_RNA
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Sbjct 1500 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 1453
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mRNA
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Sbjct 551 ACCAGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 504
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(LOC104671851), mRNA
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Sbjct 294 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 247
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mRNA
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Sbjct 569 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGA 522
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misc_RNA
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Sbjct 541 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGA 494
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mRNA
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Sbjct 536 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGA 489
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mRNA
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Sbjct 552 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGA 505
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mRNA
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Sbjct 627 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGA 580
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Sbjct 827 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 780
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Sbjct 1088 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 1041
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2520 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 2473
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1405 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 1358
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misc_RNA
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Sbjct 491 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 444
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mRNA
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Sbjct 473 ACCGGAGTCCATCACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 426
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(LOC101153347), misc_RNA
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Sbjct 594 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 550
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 503 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCATACAGGGA 456
>gb|JQ284428.1| Rousettus leschenaultii isolate ZG actin beta (ACTB) mRNA, partial
cds
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Sbjct 119 ACCGGAGTCCATCACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 72
>gb|JQ284423.1| Chaerephon plicatus isolate QW actin beta (ACTB) mRNA, partial
cds
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 117 ACCGGAGTCCATCACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 70
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miscRNA
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Sbjct 535 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 488
>gb|AC188451.1| Macaca mulatta chromosome UNK clone CH250-53H12, complete sequence
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Sbjct 37056 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACTGCCAGAGGCGTACAGGGA 37009
>gb|AC146674.3| Callithrix jacchus clone CH259-338M13, complete sequence
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Sbjct 6683 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGA 6636
>gb|AC146883.3| Callithrix jacchus clone CH259-225J7, complete sequence
Length=216802
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Sbjct 202247 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGA 202200
>gb|AF209434.1|AF209434 Macaca fuscata beta-actin mRNA, partial cds
Length=795
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 191 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGCCGTACAGGGA 144
>ref|XM_005870207.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, cytoplasmic 1-like (LOC102251030),
transcript variant X2, mRNA
Length=1324
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Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 338 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTATAGGGA 292
>ref|XM_005870206.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, cytoplasmic 1-like (LOC102251030),
transcript variant X1, mRNA
Length=1453
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Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 467 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTATAGGGA 421
>ref|XR_186995.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens actin, cytoplasmic 1-like
(LOC101372193), misc_RNA
Length=1856
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 551 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 505
>ref|XR_165464.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis actin-like (LOC101042779),
misc_RNA
Length=1565
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 555 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTAGGGCCAGAGGTGTACAGGGA 508
>ref|XM_010308044.1| PREDICTED: Balearica regulorum gibbericeps actin, alpha skeletal
muscle (LOC104630651), mRNA
Length=1318
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 ACCGGAGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 337
>ref|XM_009199671.1| PREDICTED: Papio anubis actin, cytoplasmic 1-like (LOC100998182),
transcript variant X2, mRNA
Length=2170
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1431 ACCAGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 1384
>ref|XM_003919235.2| PREDICTED: Papio anubis actin, cytoplasmic 1-like (LOC100998182),
transcript variant X1, mRNA
Length=2241
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 1502 ACCAGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 1455
>ref|XR_161063.2| PREDICTED: Papio anubis actin, clone 302-like (LOC101006302),
misc_RNA
Length=1874
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Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 620 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 576
>ref|XR_089002.3| PREDICTED: Callithrix jacchus actin, cytoplasmic 1-like (LOC100386679),
misc_RNA
Length=1721
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 465 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGA 421
>ref|XR_620001.1| PREDICTED: Callithrix jacchus actin, cytoplasmic 1-like (LOC100385804),
misc_RNA
Length=1783
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 544 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTATGGCCAGAGGCGTACAAGGA 497
>ref|XM_008019768.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus actin, cytoplasmic 1-like (LOC103247680),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1947 ACCAGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 1900
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2004 ACCAGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 1957
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1
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Sbjct 651 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 604
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Sbjct 558 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGACCAGAGGCATACAGGGA 511
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Sbjct 491 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGACCAGAGGCATACAGGGA 444
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mRNA
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Sbjct 384 ACCGGAGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 337
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mRNA
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Sbjct 384 ACCGGAGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 337
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5
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Sbjct 649 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 605
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Sbjct 218 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
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Sbjct 220 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 173
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Sbjct 220 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 173
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Sbjct 218 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
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Sbjct 221 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|HM358954.1| Homo sapiens clone Hep3-12 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 220 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 173
>gb|HM358951.1| Homo sapiens clone Hep3-9 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 218 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|HM358948.1| Homo sapiens clone Hep3-6 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 220 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 173
>gb|HM358947.1| Homo sapiens clone Hep3-5 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 220 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 173
>gb|HM358941.1| Homo sapiens clone Alex-22 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCAACACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|HM358940.1| Homo sapiens clone Alex-21 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 218 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|HM358929.1| Homo sapiens clone Alex-7 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 221 ACCGGAGTCCAACACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|HM358928.1| Homo sapiens clone Alex-6 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 218 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|GQ455648.1| Clupea harengus alpha actin mRNA, complete cds
Length=1540
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Sbjct 532 ACCGGAGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 485
>gb|FJ973623.1| Homo sapiens beta-actin pseudogene, partial sequence
Length=682
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Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 126 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 82
>gb|AC096542.2| Homo sapiens chromosome 1 clone RP11-332L18, complete sequence
Length=189411
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Sbjct 116868 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 116915
>gb|AC035147.4| Homo sapiens chromosome 5 clone CTD-2309M13, complete sequence
Length=104940
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Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 56843 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 56887
>gb|AC026692.5| Homo sapiens chromosome 5 clone CTC-257L10, complete sequence
Length=139377
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Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 109669 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 109625
>gb|AY970467.1| Homo sapiens isolate 4N-3 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
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Sbjct 218 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|AY970445.1| Homo sapiens isolate 3N-9 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|AY970424.1| Homo sapiens isolate 2T-5 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|AY970423.1| Homo sapiens isolate 2T-4 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|AY970401.1| Homo sapiens isolate 1T-18 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|AY970400.1| Homo sapiens isolate 1T-17 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=311
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 44/45 (98%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 GGAGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>gb|AY970398.1| Homo sapiens isolate 1T-15 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 ACCAGAGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 174
>ref|XR_165577.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis actin, cytoplasmic
1-like (LOC101041536), misc_RNA
Length=1116
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGT 41
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 ACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGT 434
>ref|XM_010079722.1| PREDICTED: Pterocles gutturalis actin, alpha skeletal muscle
(LOC104466338), mRNA
Length=1280
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 347 CCGGAGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 301
>ref|XM_008851372.1| PREDICTED: Nannospalax galili actin, beta (Actb), mRNA
Length=1848
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAG 45
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 567 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCATACAG 524
>ref|XM_004671307.1| PREDICTED: Jaculus jaculus actin, beta (Actb), transcript variant
X2, mRNA
Length=1059
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 338 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGACCAGAGGCATACAGGGA 292
>ref|XM_004671306.1| PREDICTED: Jaculus jaculus actin, beta (Actb), transcript variant
X1, mRNA
Length=1233
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 512 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGACCAGAGGCATACAGGGA 466
>ref|XR_193418.1| PREDICTED: Jaculus jaculus actin, cytoplasmic 1-like (LOC101615400),
misc_RNA
Length=1128
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 467 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGACTAGAGGCGTACAGGGA 421
>ref|XM_004426882.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum actin, alpha 1, skeletal
muscle, transcript variant 3 (ACTA1), mRNA
Length=1255
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 344 CCGGAGTCCAGCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTAGAGGGA 298
>ref|XM_004426881.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum actin, alpha 1, skeletal
muscle, transcript variant 2 (ACTA1), mRNA
Length=1481
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 559 CCGGAGTCCAGCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTAGAGGGA 513
>ref|XM_004426880.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum actin, alpha 1, skeletal
muscle, transcript variant 1 (ACTA1), mRNA
Length=1491
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 577 CCGGAGTCCAGCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTAGAGGGA 531
>gb|FJ389357.1| Onychomys leucogaster beta-actin (Actb) mRNA, partial cds
Length=283
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 73 CCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGACCAGAGGCATACAGGGA 27
>gb|AY970503.1| Homo sapiens isolate 4T-20 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 48
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 174
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA
>ref|NG_007992.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB), RefSeqGene (LRG_132) on chromosome
7
Length=10454
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5028 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 5077
>ref|NM_001101.3| Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1852
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>dbj|AK308277.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98225
Length=1499
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>dbj|AK309997.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17039
Length=1846
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>gb|BC053988.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5920354, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 838 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 887
>gb|BC021242.1| Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter,
y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3677363),
**** WARNING: chimeric clone ****
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Sbjct 2261 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 2310
>gb|BC009275.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3960255), ****
WARNING: chimeric clone ****
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Sbjct 497 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 546
>dbj|AK225414.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC08987
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Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>gb|BC065493.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6482790, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 1647 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 1696
>gb|BC014861.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8968 IMAGE:3870487),
complete cds
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complete cds
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Sbjct 19 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 68
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complete cds
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Sbjct 11 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 60
>gb|BC016045.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:20387 IMAGE:4564532),
complete cds
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Sbjct 19 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 68
>gb|BC004251.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:10559 IMAGE:3623067),
complete cds
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Sbjct 5 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 54
>gb|AY582799.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB) gene, complete cds
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Sbjct 1961 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 2010
>dbj|AK223055.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: KAT00430
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Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>dbj|AK223032.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: JTH03396
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Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>dbj|AK222925.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC07191
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Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
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Sbjct 57 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 106
>gb|AC006483.3| Homo sapiens BAC clone CTB-161C1 from 7, complete sequence
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Sbjct 169985 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 170034
>gb|AY952326.1| Synthetic construct beta-actin GFP expression vector, complete
sequence
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Sbjct 3823 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 3872
>dbj|AK130157.1| Homo sapiens cDNA FLJ26647 fis, clone MPE04710, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
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Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>dbj|AK130062.1| Homo sapiens cDNA FLJ26552 fis, clone LNF01613, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
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Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>dbj|AK098751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25885 fis, clone CBR02968, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC TYPE 5
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Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>dbj|AK058019.1| Homo sapiens cDNA FLJ25290 fis, clone STM07156, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC 1
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Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>dbj|AK025375.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21722 fis, clone COLF0522, highly similar
to HSACTB Homo sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
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Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>dbj|D28354.1|HUMBA13 Homo sapiens mRNA for beta-actin, 5'UTR region
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Sbjct 28 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 77
>emb|X63432.1| H.sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
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Sbjct 17 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 66
>gb|BC002409.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8647 IMAGE:2961617),
complete cds
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Sbjct 15 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 64
>gb|BC023204.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3461395), containing
frame-shift errors
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 64
>gb|BC014401.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3504279, containing frame-shift
errors
Length=1812
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Sbjct 20 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 69
>gb|BC013835.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:4152631)
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Sbjct 16 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 65
>gb|M10277.1|HUMACCYBB Human cytoplasmic beta-actin gene, complete cds
Length=3646
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 269 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 318
>ref|XM_008963291.1| PREDICTED: Pan paniscus actin, cytoplasmic 1 (LOC100990579),
mRNA
Length=1298
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 50
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Sbjct 34 GCACAGAGCCTCGCCTTTGCTGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCA 83
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clone ****
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7 7 5568112 5568212 100M TGAAGCTGTAGCCGCGCTCGGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCC
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7 7 5568118 5568218 100M TGTAGCCGCGCTCGGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTA
7 7 5568121 5568221 100M CGCCGCGCTCGGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGAT
7 7 5568124 5568224 100M CGCGCTCGGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGG
7 7 5568127 5568227 100M NCTCGGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCAC
7 7 5568130 5568230 100M CGGTGAGGATCTTCATGAGGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGT
7 7 5568133 5568233 100M TGAGGATCTTCATGAGGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTG
7 7 5568136 5568236 100M GGATCTTCATGAGGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGT
7 7 5568139 5568239 100M TCTTCATGAGGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGAC
7 7 5568142 5568242 100M TCATGAGGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCC
7 7 5568145 5568245 100M TGAGGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTC
7 7 5568148 5568248 100M GGTAGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACC
7 7 5568151 5568251 100M AGTCAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGA
7 7 5568154 5568254 100M CAGTCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTC
7 7 5568157 5568257 100M TCAGGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGGGACCCCGTTACCGGAGTCCAT
7 7 5568160 5568260 100M GGTCCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCAC
7 7 5568160 5570179 1M60N74M5570205F25m C||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATC
7 7 5568163 5568263 100M CCCGGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGAT
7 7 5568166 5568266 100M GGCCAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCC
7 7 5568169 5568269 100M CAGCCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGT
7 7 5568172 5568272 100M CCAGGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGT
7 7 5568175 5568275 100M GGTCCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACG
7 7 5568178 5568278 100M CCAGACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCC
7 7 5568181 5568281 100M GACGCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGA
7 7 5568184 5568284 100M GCAGGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGC
7 7 5568187 5568287 100M GGATGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTA
7 7 5568190 5568290 100M TGGCATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAG
7 7 5568193 5568293 100M CATGGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA
7 7 5568196 5568296 100M GGGGGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAG
7 7 5568199 5568299 100M GGAGGGCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC
7 7 5568202 5568302 100M GGTCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACAGC
7 7 5568204 5570195 91M5570205F9m GCATACCGCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGC
7 7 5568204 5570195 91M5570205F9m GCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGC
7 7 5568204 5570195 91M5570205F9m GCATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGGCCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGC
7 7 5568205 5570194 90M5570205F10m CATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCC
7 7 5568205 5570194 90M5570205F10m CATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCC
7 7 5568205 5570194 90M5570205F10m CATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCC
7 7 5568205 5570194 90M5570205F10m CATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCC
7 7 5568206 5570193 89M5570205F11m ATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCT
7 7 5568206 5570193 89M5570205F11m ATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCT
7 7 5568206 5570193 89M5570205F11m ATACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCT
7 7 5568207 5570192 88M5570205F12m TACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTC
7 7 5568208 5570191 87M5570205F13m ACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGAGA GCACAGAGCCTCG
7 7 5568208 5570191 87M5570205F13m ACCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCG
7 7 5568209 5570190 86M5570205F14m CCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGC
7 7 5568209 5570190 86M5570205F14m CCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGC
7 7 5568209 5570190 86M5570205F14m CCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGC
7 7 5568209 5570190 86M5570205F14m CCCCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGC
7 7 5568211 5570188 84M5570205F16m CCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCT
7 7 5568211 5570188 84M5570205F16m CCTCGTAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCT
7 7 5568215 5570184 80M5570205F20m GTAGATGGGCACAGTCTGGGTGACCCCGTCTCCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGC
7 7 5568216 5570183 79M5570205F21m TAGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCC
7 7 5568217 5570182 78M5570205F22m AGATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCG
7 7 5568218 5570181 77M5570205F23m GATGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGACAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGA
7 7 5568220 5570179 75M5570205F25m CGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATC
7 7 5568220 5570179 75M5570205F25m TGGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATTCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATC
7 7 5568221 5570178 74M5570205F26m GGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC
7 7 5568221 5570178 74M5570205F26m GGGCACAGCGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACTGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC
7 7 5568221 5570178 74M5570205F26m GGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC
7 7 5568221 5570178 74M5570205F26m GGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC
7 7 5568221 5570178 74M5570205F26m GGGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC
7 7 5568222 5570177 73M5570205F27m GGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCG
7 7 5568222 5570177 73M5570205F27m GGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCG
7 7 5568222 5570177 73M5570205F27m GGCACAGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCG
7 7 5568225 5570174 70M5570205F30m ACAGTGTGGGTGACCCCGTCCCCGGAGTCCATCACGATCCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCG
7 7 5568227 5570172 68M5570205F32m AGTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCC
7 7 5568228 5570171 67M5570205F33m GTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCC
7 7 5568228 5570171 67M5570205F33m GTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCC
7 7 5568228 5570171 67M5570205F33m GTGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCC
7 7 5568229 5570170 66M5570205F34m TGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG
7 7 5568229 5570170 66M5570205F34m TGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG
7 7 5568229 5570170 66M5570205F34m TGTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG
7 7 5568230 5570169 65M5570205F35m GTGGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGT
7 7 5568232 5570167 63M5570205F37m GGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCC
7 7 5568232 5570167 63M5570205F37m GGGTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCC
7 7 5568234 5570165 61M5570205F39m GTGACCCCGTCACCGGAGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATA GCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCAC
7 7 5570211 5570111 100m CCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGCCAGCCGACCGGGGCAGGCGGCTCACGGCCCG
7 7 5570208 5569248 55m860n45m GCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570205 5569245 52m860n48m AGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570202 5569242 49m860n51m ACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570199 5569239 46m860n54m GAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570196 5569236 43m860n57m CCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGGCCACACCCGCCGCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570192 5569232 39m860n61m GCCTTTGCCAATCCGCGGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570185 5570085 100m CCGACCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGCCAGCCGACCGGGGCAGGCGGCTCACGGCCCGGCCGCAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGC
7 7 5570181 5569221 28m860n72m TCCGCCGCCCGTCCAAACCCGCCGCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570178 5569218 25m860n75m GCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570175 5569215 22m860n78m GCCCGTCCACACCCGCCGCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570168 5569278 15m790n85m CACACCCGCCGCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570158 5569198 5m860n95m GCCAG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570155 5569195 2m860n98m AG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570142 5570042 100m CAGCCGACCGGGGCGGGCGGCTCACGGCCCGGCCGCAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGG
7 7 5570139 5570039 100m CCGACCGGGGCAGGCGGCTCACGGCTCGGCCGCAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGG
7 7 5570136 5570036 100m ACCGGGGCAGGCGGCCCACGGCCCGGCCGGAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGA
7 7 5570130 5570030 100m GCAGGCGGCACACGGCCCGGCCGCAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGA
7 7 5570125 5570025 100m CGGCTCACGGCCCGGCCGCAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGACCGCC
7 7 5570121 5570021 100m TCCCGGCCCGGCCGCAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGACCGCCGTGG
7 7 5570116 5570016 100m GCCCGGCCGCAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGACCGCCGTGGGGGGC
7 7 5570113 5570013 100m CGGCCGCAGGCGCCCGCGGCCCCATCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGACCGCCGTGGGGGGCGCG
7 7 5570110 5570010 100m CCGCAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGACCGCCGTGGGGGGCGCGGGA
7 7 5570107 5570007 100m CAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGACCGCCGTGGGGGGCGCGGGAGAA
7 7 5570104 5570004 100m GCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGACCGCCGTGGGGGGCGCGGGAGAAGCC
7 7 5570101 5570001 100m GCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGACCGCCGTGGGGGGCGCGGGAGAAGCCCCT
7 7 5570098 5569998 100m GCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGGCGCCGTCTGGGCCGCCGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGACCGCCGTGGGGGGCGCGGGAGAAGCCCCTGGG
7 7 5570095 5569995 100m GCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGACCGCCGTGGGGGGCGCGGGAGAAGCCCCTGGGCCT
7 7 5570092 5569992 100m CCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGACCGCCGTGGGGGGCGCGGGAGAAGCCCCTGGGCCTCCG
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 76305222 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 76305175
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 196700222 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 196700269
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Sbjct 72484241 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 72484194
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sequence
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Sbjct 17373763 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 17373810
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HuRef SCAF_1103279188395, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 6369949 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 6369902
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sequence
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Sbjct 6375027 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 6374980
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shotgun sequence
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Sbjct 72288058 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 72288011
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shotgun sequence
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Sbjct 194664057 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 194664104
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Sbjct 72975183 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 72975136
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Sbjct 197208003 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 197208050
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC
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Sbjct 5530598 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5530549
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HSCHR7_CTG1
gb|GL000055.2| Homo sapiens chromosome 7 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Query 1 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 50
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Sbjct 5520598 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5520549
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genome shotgun sequence
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Sbjct 5569812 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5569763
>ref|NW_004929329.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150113.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 50
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Sbjct 5559812 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5559763
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Length=152869804
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Sbjct 5483185 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5483136
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Query 1 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 50
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Sbjct 4474771 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 4474722
>gb|DS990771.1| Homo sapiens SCAF_1112675837207 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 50
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Sbjct 5285418 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5285369
>tpg|BL000002.1| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158409401
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Query 1 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 50
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Sbjct 5280567 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5280518
>ref|NW_001838998.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188262, whole genome shotgun sequence
gb|DS486133.1| Homo sapiens SCAF_1103279188262 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 50
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Sbjct 5285016 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5284967
>gb|CH471144.1| Homo sapiens 211000035837778 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=5843728
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Query 1 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 50
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Sbjct 5472403 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5472354
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000468.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Query 1 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 50
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Sbjct 5482771 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5482722
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158329839
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Query 1 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 50
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Sbjct 5616574 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5616525
>gb|CM000258.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=153561227
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 50
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Sbjct 5530006 GCCGAGACCGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 5529957
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA
>ref|XM_008973178.1| PREDICTED: Pan paniscus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=2004
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 689
>ref|XM_008963291.1| PREDICTED: Pan paniscus actin, cytoplasmic 1 (LOC100990579),
mRNA
Length=1298
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 504
>ref|XM_003804319.2| PREDICTED: Pan paniscus actin, cytoplasmic 1-like (LOC100987691),
mRNA
Length=822
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 97 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 48
>gb|KJ896369.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05763 ACTB
gene, encodes complete protein
Length=1257
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 528 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 479
>ref|XM_006715764.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, beta (ACTB), transcript variant
X1, mRNA
Length=1816
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 502
>dbj|AK316361.1| Homo sapiens cDNA, FLJ79260 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1087
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 320 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 271
>dbj|AK301372.1| Homo sapiens cDNA FLJ55253 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 1
Length=1255
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 463 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 414
>ref|NG_007992.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB), RefSeqGene (LRG_132) on chromosome
7
Length=10454
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6982 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 6933
>ref|NM_001101.3| Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1852
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 498
>dbj|AB385102.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5455, Homo sapiens ACTB
gene for actin, cytoplasmic 1, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
Length=1142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 472 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 423
>emb|CU680417.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017100
3' read ACTB mRNA
Length=1087
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 681 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 730
>emb|CU680416.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017100
5' read ACTB mRNA
Length=1262
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 385
>dbj|AK308277.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98225
Length=1499
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 466
>dbj|AK309997.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17039
Length=1846
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 588 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 539
>gb|DQ894128.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008588; FLH167999.01L;
RZPDo839A1191D actin, beta (ACTB) gene, encodes complete
protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 436
>gb|DQ890960.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003590; FLH168003.01X; RZPDo839A1192D
actin, beta (ACTB) gene, encodes complete protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 436
>gb|BC053988.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5920354, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2633
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 1309
>gb|BC113036.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:40021898), partial
cds
Length=308
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 93
>gb|BC021242.1| Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter,
y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3677363),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=4112
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2780 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 2731
>gb|BC009275.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3960255), ****
WARNING: chimeric clone ****
Length=2308
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 1016 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 967
>dbj|AK225414.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC08987
Length=1656
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 498
>gb|DQ471327.1| Homo sapiens PS1TP5-binding protein 1 (PS1TP5BP1) mRNA, complete
cds
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Sbjct 463 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 414
>gb|BC065493.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6482790, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3439
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Sbjct 2166 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 2117
>gb|BC021035.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834434, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4951
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Sbjct 3564 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 3613
>gb|BT019932.1| Synthetic construct Homo sapiens actin, beta mRNA, partial cds
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Sbjct 463 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 414
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complete cds
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Sbjct 537 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 488
>gb|BC013380.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:16525 IMAGE:4025526),
complete cds
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Sbjct 538 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 489
>gb|BC001301.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:5475 IMAGE:3451917),
complete cds
Length=1805
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Sbjct 530 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 481
>gb|BC016045.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:20387 IMAGE:4564532),
complete cds
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Sbjct 538 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 489
>gb|BC004251.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:10559 IMAGE:3623067),
complete cds
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Sbjct 524 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 475
>gb|BC012854.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3863361), partial
cds
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Sbjct 420 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 371
>gb|AY582799.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB) gene, complete cds
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Sbjct 3915 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 3866
>dbj|AK125561.1| Homo sapiens cDNA FLJ43573 fis, clone RECTM2001691, highly similar
to Actin, cytoplasmic 2
Length=2244
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Sbjct 987 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 938
>dbj|AK223055.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: KAT00430
Length=1643
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 498
>dbj|AK223032.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: JTH03396
Length=1820
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 498
>dbj|AK222925.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC07191
Length=1833
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 498
>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1850
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 576 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 527
>gb|AC006483.3| Homo sapiens BAC clone CTB-161C1 from 7, complete sequence
Length=196416
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Sbjct 171939 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 171890
>gb|AY970500.1| Homo sapiens isolate 4T-17 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970499.1| Homo sapiens isolate 4T-16 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970498.1| Homo sapiens isolate 4T-15 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970497.1| Homo sapiens isolate 4T-14 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970496.1| Homo sapiens isolate 4T-13 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970495.1| Homo sapiens isolate 4T-12 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970494.1| Homo sapiens isolate 4T-11 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970493.1| Homo sapiens isolate 4T-10 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970492.1| Homo sapiens isolate 4T-9 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970491.1| Homo sapiens isolate 4T-8 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970490.1| Homo sapiens isolate 4T-7 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970489.1| Homo sapiens isolate 4T-6 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970488.1| Homo sapiens isolate 4T-5 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970487.1| Homo sapiens isolate 4T-4 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970486.1| Homo sapiens isolate 4T-3 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970485.1| Homo sapiens isolate 4T-2 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970478.1| Homo sapiens isolate 4N-14 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970477.1| Homo sapiens isolate 4N-13 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970476.1| Homo sapiens isolate 4N-12 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970475.1| Homo sapiens isolate 4N-11 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970474.1| Homo sapiens isolate 4N-10 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970473.1| Homo sapiens isolate 4N-9 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970472.1| Homo sapiens isolate 4N-8 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970471.1| Homo sapiens isolate 4N-7 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970470.1| Homo sapiens isolate 4N-6 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970469.1| Homo sapiens isolate 4N-5 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970468.1| Homo sapiens isolate 4N-4 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970444.1| Homo sapiens isolate 3N-8 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970443.1| Homo sapiens isolate 3N-7 actin-like protein (ACT) gene, partial
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Length=310
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
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>gb|AY970376.1| Homo sapiens isolate 1N-14 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970375.1| Homo sapiens isolate 1N-13 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970374.1| Homo sapiens isolate 1N-12 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970373.1| Homo sapiens isolate 1N-11 actin-like (ACT) gene, partial sequence
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>gb|AY970372.1| Homo sapiens isolate 1N-10 actin-like protein (ACT) gene, partial
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>gb|AY970371.1| Homo sapiens isolate 1N-9 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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>gb|AY970370.1| Homo sapiens isolate 1N-8 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970369.1| Homo sapiens isolate 1N-7 actin-like protein (ACT) gene, partial
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Length=310
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970368.1| Homo sapiens isolate 1N-6 actin-like protein (ACT) gene, partial
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Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970367.1| Homo sapiens isolate 1N-5 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970366.1| Homo sapiens isolate 1N-4 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970365.1| Homo sapiens isolate 1N-3 actin-like protein (ACT) gene, partial
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970364.1| Homo sapiens isolate 1N-2 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970363.1| Homo sapiens isolate 1N-1 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>dbj|AK130157.1| Homo sapiens cDNA FLJ26647 fis, clone MPE04710, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1805
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 498
>dbj|AK130062.1| Homo sapiens cDNA FLJ26552 fis, clone LNF01613, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1806
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 498
>dbj|AK058019.1| Homo sapiens cDNA FLJ25290 fis, clone STM07156, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC 1
Length=1804
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 498
>gb|BC008633.1|BC008633 Homo sapiens, actin, beta, clone IMAGE:4179564, mRNA, partial
cds
Length=1744
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 444 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 395
>dbj|AK025375.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21722 fis, clone COLF0522, highly similar
to HSACTB Homo sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1872
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 498
>emb|X00351.1| Human mRNA for beta-actin
Length=1761
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 504 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 455
>gb|AY891016.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH007203.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 463 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 414
>gb|AY889707.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116685.01X actin beta
(ACTB) mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 463 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 414
>gb|AY892160.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116681.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 463 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 414
>gb|BC002409.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8647 IMAGE:2961617),
complete cds
Length=1849
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 534 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 485
>gb|BC023204.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3461395), containing
frame-shift errors
Length=1805
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 533 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 484
>gb|BC014401.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3504279, containing frame-shift
errors
Length=1812
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 537 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 488
>gb|BC013835.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:4152631)
Length=1834
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 535 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 486
>gb|M10277.1|HUMACCYBB Human cytoplasmic beta-actin gene, complete cds
Length=3646
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 2128 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 2079
>emb|X63432.1| H.sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1802
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
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(LOC104657250), mRNA
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Sbjct 1339 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 1290
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(LOC104655172), misc_RNA
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Sbjct 535 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 486
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mRNA
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Sbjct 546 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 497
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Sbjct 655 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 606
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Sbjct 468 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 419
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misc_RNA
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Sbjct 910 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 861
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Sbjct 655 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 606
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Sbjct 394 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 345
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mRNA
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Sbjct 541 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 492
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mRNA
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Sbjct 370 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 321
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mRNA
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Sbjct 335 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 286
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mRNA
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Sbjct 526 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 477
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(LOC101153347), misc_RNA
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Sbjct 592 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 543
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2 (ACTB), mRNA
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Sbjct 671 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 622
>ref|XM_004045058.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
1 (ACTB), mRNA
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Sbjct 511 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 462
>dbj|AK306863.1| Pan troglodytes mRNA for actin, cytoplasmic 1, complete cds,
clone: PtsC-1-5_F07
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGGACAGGGATAGCACA 498
>gb|JF304773.1| Papio anubis beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 176 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 127
>ref|XM_002916463.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca actin, cytoplasmic 1-like (LOC100481739),
mRNA
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Sbjct 481 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 432
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mRNA
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Sbjct 771 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 820
>ref|XM_002802729.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical protein LOC100430113 (LOC100430113),
mRNA
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Sbjct 350 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 399
>ref|XM_002802726.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 4 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 461 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 412
>ref|XM_002802725.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 3 (LOC100428865), mRNA
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 578 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 529
>ref|XM_002802724.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 2 (LOC100428865), mRNA
Length=1857
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 561 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 512
>ref|XM_002802723.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 1 (LOC100428865), mRNA
Length=1854
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 558 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 509
>ref|NM_001285025.1| Macaca fascicularis actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB170391.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10647, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1729
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 498
>gb|DQ464112.1| Macaca fascicularis beta-actin (ACTB) mRNA, partial cds
Length=421
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 332 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 283
>ref|NM_001033084.1| Macaca mulatta actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1584
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 488 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 439
>gb|AY497558.1| Macaca mulatta beta-actin mRNA, partial cds
Length=838
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 299 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 250
>dbj|AB169683.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-17788, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1934
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 667 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 618
>gb|S79782.1| actin [Macaca fuscata=Japanese monkeys, brain, mRNA Partial,
331 nt]
Length=331
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 120 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 71
>gb|AY970501.1| Homo sapiens isolate 4T-18 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 167
>gb|AY970407.1| Homo sapiens isolate 1T-24 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 AGTCCATCAAGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970403.1| Homo sapiens isolate 1T-20 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 AGTCCATCACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>gb|AY970402.1| Homo sapiens isolate 1T-19 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 AGTCCATCACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 167
>ref|NM_001133354.1| Pongo abelii actin, beta (ACTB), mRNA
emb|CR860982.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A196 (from clone DKFZp459A196)
Length=1844
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 564 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 515
>emb|CR860530.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A127 (from clone DKFZp459A127)
Length=1833
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 498
>dbj|AB004047.1| Cercopithecus aethiops mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1138
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 473 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 424
>ref|XM_006906563.1| PREDICTED: Pteropus alecto actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1825
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 557 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 509
>ref|XM_006765441.1| PREDICTED: Myotis davidii actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1800
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 541 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 493
>ref|XM_006107702.1| PREDICTED: Myotis lucifugus actin, cytoplasmic 2-like (LOC102425233),
mRNA
Length=1615
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 362 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 314
>ref|XM_005883637.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=1695
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 372 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 324
>ref|XM_005874162.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, beta-like 2 (ACTBL2), mRNA
Length=1065
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 343 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 295
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 499
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Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Sbjct 111 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 63
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cds
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Sbjct 117 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 69
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miscRNA
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 499
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mRNA
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Sbjct 564 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGAAAGCACA 515
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misc_RNA
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Sbjct 463 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGAAAGCACA 414
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misc_RNA
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Sbjct 536 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGAGAGCACA 487
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mRNA
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Sbjct 531 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGAAAGCACA 482
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mRNA
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGAAAGCACA 498
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mRNA
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Sbjct 622 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGAAAGCACA 573
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misc_RNA
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Sbjct 486 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGCACA 437
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mRNA
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Sbjct 468 AGTCCATCACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 419
>ref|XM_003795439.1| PREDICTED: Otolemur garnettii actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 498 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCATACAGGGACAGCACA 449
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Sbjct 216 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 167
>ref|XR_013702.2| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like (LOC711964),
miscRNA
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Sbjct 530 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGCACA 481
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 6678 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGAAAGCACA 6629
>gb|AC146883.3| Callithrix jacchus clone CH259-225J7, complete sequence
Length=216802
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 202242 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGAAAGCACA 202193
>gb|AF209434.1|AF209434 Macaca fuscata beta-actin mRNA, partial cds
Length=795
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCACA 50
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Sbjct 186 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGCCGTACAGGGACAGCACA 137
>ref|XM_010345369.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis actin, beta (ACTB),
mRNA
Length=1900
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 635 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAAGGAAAGCAC 587
>ref|XM_009199671.1| PREDICTED: Papio anubis actin, cytoplasmic 1-like (LOC100998182),
transcript variant X2, mRNA
Length=2170
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 1426 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGCAC 1378
>ref|XM_003919235.2| PREDICTED: Papio anubis actin, cytoplasmic 1-like (LOC100998182),
transcript variant X1, mRNA
Length=2241
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 1497 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGCAC 1449
>ref|XM_005870207.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, cytoplasmic 1-like (LOC102251030),
transcript variant X2, mRNA
Length=1324
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 334 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTATAGGGACAGCAC 286
>ref|XM_005870206.1| PREDICTED: Myotis brandtii actin, cytoplasmic 1-like (LOC102251030),
transcript variant X1, mRNA
Length=1453
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 463 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTATAGGGACAGCAC 415
>ref|XR_186995.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens actin, cytoplasmic 1-like
(LOC101372193), misc_RNA
Length=1856
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 547 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGCAC 499
>gb|JQ284428.1| Rousettus leschenaultii isolate ZG actin beta (ACTB) mRNA, partial
cds
Length=401
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 114 AGTCCATCACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 66
>gb|JQ284423.1| Chaerephon plicatus isolate QW actin beta (ACTB) mRNA, partial
cds
Length=613
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 112 AGTCCATCACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 64
>gb|AY970503.1| Homo sapiens isolate 4T-20 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 216 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGCAC 168
>ref|XR_161063.2| PREDICTED: Papio anubis actin, clone 302-like (LOC101006302),
misc_RNA
Length=1874
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 618 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGCA 571
>ref|NG_007577.3| Homo sapiens actin, beta pseudogene 11 (ACTBP11) on chromosome
1
Length=1910
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 646 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 599
>ref|NG_003019.4| Homo sapiens actin, beta pseudogene 2 (ACTBP2) on chromosome
5
Length=1995
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 647 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 600
>gb|HM358977.1| Homo sapiens clone Huh7-12 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 216 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
>gb|HM358976.1| Homo sapiens clone Huh7-14 actin-like mRNA, partial sequence
Length=309
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 215 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 168
>gb|HM358963.1| Homo sapiens clone Huh7-10 actin-like mRNA, partial sequence
Length=309
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 215 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 168
>gb|HM358961.1| Homo sapiens clone Huh7-2 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 216 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
>gb|HM358958.1| Homo sapiens clone Hep3-18 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 216 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
>gb|HM358954.1| Homo sapiens clone Hep3-12 actin-like mRNA, partial sequence
Length=309
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 215 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 168
>gb|HM358951.1| Homo sapiens clone Hep3-9 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 216 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
>gb|HM358948.1| Homo sapiens clone Hep3-6 actin-like mRNA, partial sequence
Length=309
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 215 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 168
>gb|HM358947.1| Homo sapiens clone Hep3-5 actin-like mRNA, partial sequence
Length=309
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 215 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 168
>gb|HM358928.1| Homo sapiens clone Alex-6 actin-like mRNA, partial sequence
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 216 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
>gb|FJ973623.1| Homo sapiens beta-actin pseudogene, partial sequence
Length=682
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 124 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 77
>gb|AC096542.2| Homo sapiens chromosome 1 clone RP11-332L18, complete sequence
Length=189411
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 116873 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 116920
>gb|AC035147.4| Homo sapiens chromosome 5 clone CTD-2309M13, complete sequence
Length=104940
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 56845 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 56892
>gb|AC026692.5| Homo sapiens chromosome 5 clone CTC-257L10, complete sequence
Length=139377
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 109667 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 109620
>gb|AY970467.1| Homo sapiens isolate 4N-3 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 216 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
>gb|AY970445.1| Homo sapiens isolate 3N-9 actin-like protein (ACT) gene, partial
cds
Length=310
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCA 48
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Sbjct 216 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
>gb|AY970424.1| Homo sapiens isolate 2T-5 actin-like protein (ACT) gene, partial
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Sbjct 216 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
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Sbjct 216 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
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Sbjct 216 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
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Sbjct 216 AGTCCAACACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
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Sbjct 216 AGTCCATCATGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCA 169
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Sbjct 379 AGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 330
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Sbjct 395 AGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 346
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Sbjct 386 AGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 337
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Sbjct 342 AGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 293
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Sbjct 345 AGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 296
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Sbjct 550 AGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 501
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Sbjct 563 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCATACAGAGACAGCACA 514
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Sbjct 1942 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGC 1896
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Sbjct 1999 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGC 1953
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Sbjct 822 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGC 776
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Sbjct 1083 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGC 1037
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 2515 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGC 2469
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1400 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGC 1354
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(ACTA1), mRNA
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Sbjct 344 AGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 295
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mRNA
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Sbjct 379 AGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 330
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mRNA
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Sbjct 379 AGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 330
>gb|HM358941.1| Homo sapiens clone Alex-22 actin-like mRNA, partial sequence
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Sbjct 216 AGTCCAACACAATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 167
>gb|GQ455648.1| Clupea harengus alpha actin mRNA, complete cds
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Sbjct 527 AGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 478
>gb|AY878120.1| Acipenser transmontanus beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 218 AGTCCATCACAATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCACA 169
>ref|XR_750273.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 1-like
(LOC104679102), misc_RNA
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Query 2 GTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGC 47
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Sbjct 675 GTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGACAGC 630
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 43
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Sbjct 1495 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 1453
>ref|XM_010375481.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 1-like
(LOC104671851), mRNA
Length=930
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGA 43
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Sbjct 289 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGTGTACAGGGA 247
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(LOC104466338), mRNA
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 343 AGTCCAGCACGATACCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGACAGCAC 295
>ref|XM_004426882.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum actin, alpha 1, skeletal
muscle, transcript variant 3 (ACTA1), mRNA
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 340 AGTCCAGCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCAC 292
>ref|XM_004426881.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum actin, alpha 1, skeletal
muscle, transcript variant 2 (ACTA1), mRNA
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 555 AGTCCAGCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCAC 507
>ref|XM_004426880.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum actin, alpha 1, skeletal
muscle, transcript variant 1 (ACTA1), mRNA
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Query 1 AGTCCATCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTACAGGGATAGCAC 49
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Sbjct 573 AGTCCAGCACGATGCCAGTGGTACGGCCAGAGGCGTAGAGGGACAGCAC 525
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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reads
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Strand=Plus/Plus
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Sbjct 5283383 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 5283432
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sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 50
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Sbjct 5470752 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 5470801
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 50
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Sbjct 5481138 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 5481187
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Query 1 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 50
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Sbjct 5614919 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 5614968
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Query 1 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 50
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Sbjct 5528355 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 5528404
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5529663 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5529614
>ref|NT_007819.18| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR7_CTG1
gb|GL000055.2| Homo sapiens chromosome 7 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5519663 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5519614
>ref|NC_018918.2| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001615.2| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5568877 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5568828
>ref|NW_004929329.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150113.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5558877 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5558828
>gb|CM000497.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5482272 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5482223
>gb|CH003502.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 4473835 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 4473786
>gb|DS990771.1| Homo sapiens SCAF_1112675837207 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5284505 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5284456
>gb|CH003454.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=154169609
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5470389 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5470340
>tpg|BL000002.1| TPA: Homo sapiens chromosome 7
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5279632 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5279583
>ref|NW_001838998.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188262, whole genome shotgun sequence
gb|DS486133.1| Homo sapiens SCAF_1103279188262 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5668350
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5284103 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5284054
>gb|CH471144.1| Homo sapiens 211000035837778 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=5843728
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5471472 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5471423
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000468.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=152870189
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5481858 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5481809
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158329839
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5615639 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5615590
>gb|CM000258.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=153561227
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 5529075 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5529026
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG
>ref|XM_006715764.1| PREDICTED: Homo sapiens actin, beta (ACTB), transcript variant
X1, mRNA
Length=1816
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 50
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Sbjct 228 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 179
>ref|NG_007992.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB), RefSeqGene (LRG_132) on chromosome
7
Length=10454
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 50
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Sbjct 6659 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 6610
>gb|AY582799.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB) gene, complete cds
Length=7399
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 50
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Sbjct 3592 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 3543
>dbj|AK125561.1| Homo sapiens cDNA FLJ43573 fis, clone RECTM2001691, highly similar
to Actin, cytoplasmic 2
Length=2244
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 615
>gb|AC006483.3| Homo sapiens BAC clone CTB-161C1 from 7, complete sequence
Length=196416
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171616 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 171567
>gb|M10277.1|HUMACCYBB Human cytoplasmic beta-actin gene, complete cds
Length=3646
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ACAACACTGTCTTAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 50
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1805 ACAACACTGTCTCAGACACCTAGTCAGAGAGACAAACACCAGAAAAAGAG 1756
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG
>ref|XM_004045059.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
2 (ACTB), mRNA
Length=1945
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 252
>ref|XM_004045058.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
1 (ACTB), mRNA
Length=1785
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 92
>dbj|AK304552.1| Homo sapiens cDNA FLJ52842 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 1
Length=1486
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 128
>dbj|AK301372.1| Homo sapiens cDNA FLJ55253 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 1
Length=1255
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 128
>ref|NG_007992.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB), RefSeqGene (LRG_132) on chromosome
7
Length=10454
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5939 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 5988
>ref|NM_001101.3| Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1852
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 128
>dbj|AK308277.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98225
Length=1499
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 128
>dbj|AK309997.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17039
Length=1846
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 128
>gb|BC053988.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5920354, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2633
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 938
>gb|BC021242.1| Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter,
y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3677363),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=4112
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2312 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 2361
>gb|BC009275.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3960255), ****
WARNING: chimeric clone ****
Length=2308
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 597
>dbj|AK225414.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC08987
Length=1656
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 128
>gb|BC065493.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6482790, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 1747
>gb|BC021035.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834434, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4951
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4033 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 3984
>gb|BC014861.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8968 IMAGE:3870487),
complete cds
Length=1884
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 118
>gb|BC013380.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:16525 IMAGE:4025526),
complete cds
Length=1820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 119
>gb|BC001301.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:5475 IMAGE:3451917),
complete cds
Length=1805
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 62 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 111
>gb|BC016045.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:20387 IMAGE:4564532),
complete cds
Length=1841
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 70 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 119
>gb|BC004251.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:10559 IMAGE:3623067),
complete cds
Length=1811
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Sbjct 56 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 105
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Sbjct 2872 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 2921
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to Actin, cytoplasmic 1
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Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 128
>dbj|AK130062.1| Homo sapiens cDNA FLJ26552 fis, clone LNF01613, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
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Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 128
>dbj|AK098751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25885 fis, clone CBR02968, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC TYPE 5
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Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 128
>dbj|AK058019.1| Homo sapiens cDNA FLJ25290 fis, clone STM07156, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC 1
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Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 128
>dbj|AK025375.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21722 fis, clone COLF0522, highly similar
to HSACTB Homo sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
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Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 128
>emb|X63432.1| H.sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
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Sbjct 68 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 117
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Sbjct 36 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 85
>gb|BC002409.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8647 IMAGE:2961617),
complete cds
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Sbjct 66 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 115
>gb|BC014401.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3504279, containing frame-shift
errors
Length=1812
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Sbjct 71 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 120
>gb|BC013835.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:4152631)
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>gb|K00790.1|HUMACTBET Human fibroblast beta-actin mRNA, 5' end
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
>gb|M10277.1|HUMACCYBB Human cytoplasmic beta-actin gene, complete cds
Length=3646
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 1087 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 1136
>gb|AF404278.1| Oryctolagus cuniculus beta-actin mRNA, partial cds
Length=238
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Query 2 TCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 4 TCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 52
>gb|DQ894128.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008588; FLH167999.01L;
RZPDo839A1191D actin, beta (ACTB) gene, encodes complete
protein
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Sbjct 19 CACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 66
>gb|DQ890960.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003590; FLH168003.01X; RZPDo839A1192D
actin, beta (ACTB) gene, encodes complete protein
Length=1168
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Query 3 CACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 19 CACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 66
>ref|XM_010357019.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 2-like
(LOC104657250), mRNA
Length=2615
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Sbjct 253 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 302
>ref|XM_010381661.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 1-like
(LOC104676787), mRNA
Length=1789
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 67 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 116
>ref|XM_010376630.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin-85C (LOC104672769),
mRNA
Length=1202
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 78 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 127
>ref|XM_010366994.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1909
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 187 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 236
>ref|XM_008973178.1| PREDICTED: Pan paniscus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=2004
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 270 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 319
>ref|XM_008963291.1| PREDICTED: Pan paniscus actin, cytoplasmic 1 (LOC100990579),
mRNA
Length=1298
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 85 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 134
>ref|XM_008018962.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus actin-1 (LOC103246954), mRNA
Length=635
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 111 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 160
>dbj|AK306863.1| Pan troglodytes mRNA for actin, cytoplasmic 1, complete cds,
clone: PtsC-1-5_F07
Length=1824
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 128
>dbj|AK223032.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: JTH03396
Length=1820
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 79 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 128
>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1850
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 108 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 157
>dbj|AB385102.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5455, Homo sapiens ACTB
gene for actin, cytoplasmic 1, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
Length=1142
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 CCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8 CCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 53
>gb|KJ896369.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05763 ACTB
gene, encodes complete protein
Length=1257
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 CATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 CATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 109
>ref|XR_746932.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 1-like
(LOC104655172), misc_RNA
Length=1717
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 ACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 47
>ref|XR_635573.1| PREDICTED: Papio anubis actin, cytoplasmic 1-like (LOC101008554),
misc_RNA
Length=2173
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 433 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAATGGCTCCGG 482
>ref|XM_003895688.2| PREDICTED: Papio anubis actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1910
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 187 CTCGCCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 236
>ref|XM_002802726.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 4 (LOC100428865), mRNA
Length=1757
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 77 CTCGCCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 126
>ref|XM_002802725.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 3 (LOC100428865), mRNA
Length=1874
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 110 CTCGCCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 159
>ref|XM_002802724.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 2 (LOC100428865), mRNA
Length=1857
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 93 CTCGCCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 142
>ref|XM_002802723.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 1 (LOC100428865), mRNA
Length=1854
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 90 CTCGCCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 139
>ref|NM_001285025.1| Macaca fascicularis actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB170391.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10647, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1729
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 79 CTCGCCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 128
>gb|DQ471327.1| Homo sapiens PS1TP5-binding protein 1 (PS1TP5BP1) mRNA, complete
cds
Length=1128
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 ATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 44
>gb|BT019932.1| Synthetic construct Homo sapiens actin, beta mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 ATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 44
>ref|NM_001033084.1| Macaca mulatta actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1584
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 20 CTCGCCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTTGTCGACAACGGCTCCGG 69
>gb|AY891016.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH007203.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
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Sbjct 1 ATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 44
>gb|AY892160.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116681.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
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Query 7 ATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 50
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Sbjct 1 ATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGG 44
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Lambda K H
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7 7 5569230 5569130 100m GGCTTCGCGGGCGACGATGCCCCCCGGGCCGTCTTCCCCTCCATCGTGGGGCGCCCCAGGCACCAGGTAGGGGAGCTGGCTGGGTGGGGCAGCCCCGGGA
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7 7 5569212 5568978 48m134n52m GCCCCCCGGGCCGTCTTCCCCTCCATCGTGGGGCGCCCCAGGCACCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGCGTGATGGTGGGCATGGGTCAGAAGGATTCCTA
7 7 5569209 5569109 100m CCCCGGGCCGTCTTCCCCTCCATCGTGGGGCGCCCCAGGCACCAGGTAGGGGAGCTGGCTGGGTGGGGCAGCCCCGGGAGCGGGCGGGAGGCAAGGGCGC
7 7 5569205 5569105 100m GGGCCGTCTTCCCCTCCATCGTGGGGCGCCCCAGGCACCAGGTAGGGGAGCTGGCTGGGTGGGGCAGCCCCGGGAGCGGGCGGGAGGCAAGGGCGCTTTC
7 7 5569202 5568968 38m134n62m CCGTCTTCCCCTCCATCGTGGGGCGCCCCGGGGACCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGCGTGATGGTGGGCATGGGTCAGAAGGATTCCTA
7 7 5569199 5568965 35m134n65m TCTTCCCCTCCATCGTGGGGCGCCCCAGGCACGGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGCGTGATGGTGGGCATGGGTCAGAAGGATTCCTA
7 7 5569195 5569095 100m CCCCTCCATCGTGGGGCGCCCCAGGCACCAGGTAGGGGAGCTGGCTGGGTGGGGCAGCCCCGGGAGCGGGCGGGAGGCAAGGGCGCTTTCTCTGGACAGG
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7 7 5569189 5568955 25m134n75m CATCGTGGGGCGCCCCAGGCATCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGCGTGATGGTGGGCATGGGTCAGAAGGATTCCTA
7 7 5569186 5568952 22m134n78m CGTGGGGCGCCCCAGGCACCAG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GGCGTGATGGTGGGCTTGGGTCAGAAGGATTCCTA
7 7 5569182 5569082 100m GGGCGCCCCAGGCACCAGGTAGGGGAGCTGGCTGGGTGGGGCAGCCCCGGGAGCGGGCGGGAGGCAAGGGCGCTTTCTCTGCACAGGAGCCTCCCGGTTT
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7 7 5569173 5569073 100m AGGCACCAGGTAGGGGAGCTGGCTGGGTGGGGCAGCCCCGGGAGCGGGCGGGAGGCAAGGGCGCTTTCTCTGCACAGGAGCCTCCCGGTTTCCGGGGTGG
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shotgun sequence
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>gb|DS990698.1| Homo sapiens SCAF_1112675837162 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 7591000 TAGAAGGTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 7590951
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>gb|DS486060.1| Homo sapiens SCAF_1103279188217 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 7591026 TAGAAGGTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 7590977
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Sbjct 196700414 GAAGATGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 196700461
>gb|CH471098.1| Homo sapiens 211000035834540 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 13921063 TAGAAGGTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 13921014
>ref|NW_001838549.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188217:1-11933214, whole genome shotgun
sequence
Length=11933214
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Sbjct 7591026 TAGAAGGTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 7590977
>ref|AC_000133.1| Homo sapiens chromosome 1, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000462.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Query 3 GAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 194664249 GAAGATGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 194664296
>gb|CM000252.1| Homo sapiens chromosome 1, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 211339893 TAGAAGGTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 211339844
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Query 3 GAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 197208195 GAAGATGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 197208242
>gb|KE141546.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold641, whole genome
shotgun sequence
Length=1373184
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Query 3 GAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 37982 GAAGATGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 37935
>gb|GL583306.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_326, whole genome
shotgun sequence
Length=1313070
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Query 3 GAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 32048 GAAGATGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 32001
>gb|CH471100.2| Homo sapiens 211000035839546 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=17411188
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Query 3 GAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 17373955 GAAGATGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 17374002
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC
>ref|NC_000007.14| Homo sapiens chromosome 7, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000669.2| Homo sapiens chromosome 7, GRCh38 reference primary assembly
Length=159345973
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 5530562 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5530513
>ref|NT_007819.18| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR7_CTG1
gb|GL000055.2| Homo sapiens chromosome 7 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=58109653
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5520562 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5520513
>ref|NC_018918.2| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001615.2| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=159147065
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 5569776 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5569727
>ref|NW_004929329.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150113.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=50362920
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 5559776 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5559727
>gb|CM000497.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=152869804
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 5483149 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5483100
>gb|CH003502.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=147693610
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 4474735 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 4474686
>gb|DS990771.1| Homo sapiens SCAF_1112675837207 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5668743
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Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 5285382 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5285333
>tpg|BL000002.1| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158409401
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Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 5280531 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5280482
>ref|NW_001838998.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188262, whole genome shotgun sequence
gb|DS486133.1| Homo sapiens SCAF_1103279188262 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5668350
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 5284980 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5284931
>gb|CH471144.1| Homo sapiens 211000035837778 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=5843728
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 5472367 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5472318
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000468.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=152870189
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 5482735 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5482686
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158329839
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 5616538 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5616489
>gb|CM000258.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=153561227
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 50
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Sbjct 5529970 GCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGC 5529921
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT
>ref|NG_007992.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB), RefSeqGene (LRG_132) on chromosome
7
Length=10454
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 6350 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 6301
>ref|NM_001101.3| Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1852
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
>dbj|AB385102.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5455, Homo sapiens ACTB
gene for actin, cytoplasmic 1, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
Length=1142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 281 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 232
>emb|CU680416.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017100
5' read ACTB mRNA
Length=1262
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 243 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 194
>dbj|AK308277.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98225
Length=1499
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 275
>dbj|AK309997.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17039
Length=1846
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
>gb|DQ894128.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008588; FLH167999.01L;
RZPDo839A1191D actin, beta (ACTB) gene, encodes complete
protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 245
>gb|DQ890960.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003590; FLH168003.01X; RZPDo839A1192D
actin, beta (ACTB) gene, encodes complete protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 245
>gb|BC053988.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5920354, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2633
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 1117
>gb|EF095209.1| Homo sapiens beta-actin mRNA, partial cds
Length=364
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 193
>gb|BC021242.1| Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter,
y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3677363),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=4112
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 2540
>gb|BC009275.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3960255), ****
WARNING: chimeric clone ****
Length=2308
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 825 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 776
>dbj|AK225414.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC08987
Length=1656
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
>gb|DQ471327.1| Homo sapiens PS1TP5-binding protein 1 (PS1TP5BP1) mRNA, complete
cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 223
>gb|BC065493.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6482790, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 1926
>gb|BC021035.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834434, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4951
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 3755 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 3804
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Sbjct 272 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 223
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complete cds
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Sbjct 346 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 297
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complete cds
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Sbjct 339 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 290
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complete cds
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Sbjct 347 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 298
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complete cds
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Sbjct 333 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 284
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cds
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Sbjct 229 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 180
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Sbjct 3283 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 3234
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to Actin, cytoplasmic 2
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Sbjct 355 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 306
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
>gb|AC006483.3| Homo sapiens BAC clone CTB-161C1 from 7, complete sequence
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Sbjct 171307 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 171258
>dbj|AK130157.1| Homo sapiens cDNA FLJ26647 fis, clone MPE04710, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
>dbj|AK130062.1| Homo sapiens cDNA FLJ26552 fis, clone LNF01613, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
>dbj|AK098751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25885 fis, clone CBR02968, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC TYPE 5
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Sbjct 287 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 238
>dbj|AK058019.1| Homo sapiens cDNA FLJ25290 fis, clone STM07156, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC 1
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
>gb|BC008633.1|BC008633 Homo sapiens, actin, beta, clone IMAGE:4179564, mRNA, partial
cds
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Sbjct 253 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 204
>dbj|AK025375.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21722 fis, clone COLF0522, highly similar
to HSACTB Homo sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
>emb|X63432.1| H.sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
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Sbjct 345 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 296
>emb|X00351.1| Human mRNA for beta-actin
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Sbjct 313 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 264
>gb|AY891016.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH007203.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
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Sbjct 272 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 223
>gb|AY889707.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116685.01X actin beta
(ACTB) mRNA, complete cds
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Sbjct 272 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 223
>gb|AY892160.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116681.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
Length=1128
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Sbjct 272 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 223
>gb|BC002409.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8647 IMAGE:2961617),
complete cds
Length=1849
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Sbjct 343 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 294
>gb|BC023204.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3461395), containing
frame-shift errors
Length=1805
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Sbjct 342 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 293
>gb|BC014401.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3504279, containing frame-shift
errors
Length=1812
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 348 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 299
>gb|BC013835.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:4152631)
Length=1834
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 344 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 295
>gb|M10277.1|HUMACCYBB Human cytoplasmic beta-actin gene, complete cds
Length=3646
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 1496 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 1447
>ref|XM_003213989.2| PREDICTED: Meleagris gallopavo actin, cytoplasmic 2-like (LOC100544583),
mRNA
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Sbjct 174 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 125
>gb|KM491709.1| Macaca fascicularis beta-actin (ACTB) mRNA, partial cds
Length=1126
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 263 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 214
>ref|XM_010642839.1| PREDICTED: Fukomys damarensis actin, beta (Actb), mRNA
Length=1356
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Sbjct 306 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 257
>ref|XM_010578558.1| PREDICTED: Haliaeetus leucocephalus actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=1964
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Sbjct 307 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCATCCCAGTTGGTGACGAT 258
>ref|XM_010342311.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis actin, gamma 1 (ACTG1),
mRNA
Length=1714
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Sbjct 151 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 102
>ref|XM_010357019.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 2-like
(LOC104657250), mRNA
Length=2615
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Sbjct 530 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 481
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Sbjct 1148 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 1099
>ref|XR_746932.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 1-like
(LOC104655172), misc_RNA
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Sbjct 273 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 224
>ref|XM_010381661.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 1-like
(LOC104676787), mRNA
Length=1789
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Sbjct 344 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 295
>ref|XM_010376630.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin-85C (LOC104672769),
mRNA
Length=1202
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 355 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 306
>ref|XM_010366994.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1909
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 464 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 415
>gb|KF860681.1| Scytodes thoracica clone SCV142 mRNA sequence
Length=522
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Sbjct 275 TAGAAAGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>ref|XM_010074039.1| PREDICTED: Pterocles gutturalis actin, cytoplasmic 2-like (LOC104459850),
mRNA
Length=1755
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Sbjct 134 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 85
>ref|XM_010001333.1| PREDICTED: Chaetura pelagica actin-like 9 (ACTL9), transcript
variant X3, mRNA
Length=1129
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 269 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 220
>ref|XM_010001331.1| PREDICTED: Chaetura pelagica actin-like 9 (ACTL9), transcript
variant X1, mRNA
Length=1140
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 280 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 231
>ref|XM_009575804.1| PREDICTED: Fulmarus glacialis actin, beta (ACTB), mRNA
Length=937
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 143 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTAGTGACGAT 94
>ref|XR_683351.1| PREDICTED: Phalacrocorax carbo actin, clone 302-like (LOC104045636),
misc_RNA
Length=1129
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Sbjct 355 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 306
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Sbjct 353 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 304
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Sbjct 287 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 238
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Sbjct 337 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 288
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Sbjct 337 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 288
>gb|KJ896370.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05764 ACTG1
gene, encodes complete protein
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Sbjct 337 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 288
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X2, mRNA
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
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mRNA
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Sbjct 185 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 136
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Sbjct 272 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 223
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Sbjct 388 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 339
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mRNA
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Sbjct 350 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 301
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Sbjct 272 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 223
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Sbjct 272 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 223
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Sbjct 386 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 337
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variant X1, mRNA
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Sbjct 307 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 258
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Sbjct 290 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 241
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partial mRNA
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Sbjct 287 TAGAATGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 238
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mRNA
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Sbjct 299 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 250
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Sbjct 310 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 261
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Sbjct 323 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 274
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Sbjct 359 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 310
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X2, mRNA
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Sbjct 554 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 505
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X1, mRNA
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Sbjct 554 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 505
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 245 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 196
>ref|XM_006635160.1| PREDICTED: Lepisosteus oculatus actin, cytoplasmic 2-like (LOC102690749),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
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mRNA
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Sbjct 343 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 294
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Sbjct 296 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 247
>ref|XM_006210388.1| PREDICTED: Vicugna pacos actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 273 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 224
>ref|XM_006176094.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 280 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 231
>ref|XM_006128029.1| PREDICTED: Pelodiscus sinensis actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC102458214), mRNA
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Sbjct 313 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 264
>gb|KF410817.1| Rapana venosa actin (Act1) mRNA, complete cds
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Sbjct 386 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 337
>ref|XM_006034798.1| PREDICTED: Alligator sinensis actin, gamma 1 (ACTG1), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 306 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 257
>ref|XM_005982118.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii actin, beta (ACTB), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 293 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 244
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Sbjct 296 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 247
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Sbjct 382 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 333
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Sbjct 278 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 229
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 349 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 300
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variant X1, mRNA
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transcript variant X3, misc_RNA
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Sbjct 288 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 239
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Sbjct 296 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 247
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 288 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 239
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Sbjct 359 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 310
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Sbjct 428 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 379
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Sbjct 428 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 379
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Sbjct 311 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 262
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Sbjct 314 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 265
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Sbjct 292 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 243
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variant X2, mRNA
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Sbjct 308 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 259
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Sbjct 309 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 260
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Sbjct 312 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 263
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mRNA
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Sbjct 289 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 240
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Sbjct 263 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 214
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misc_RNA
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Sbjct 272 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 223
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Sbjct 277 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 228
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X1, mRNA
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Sbjct 230 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 181
>ref|XM_004603819.1| PREDICTED: Sorex araneus actin, cytoplasmic 2-like (LOC101545833),
mRNA
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Sbjct 272 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 223
>ref|XM_004462729.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus actin-like (LOC101439156), mRNA
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Sbjct 367 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 318
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Sbjct 290 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 241
>ref|XM_004338010.1| Acanthamoeba castellanii str. Neff actin subfamily protein (ACA1_223930)
mRNA, complete cds
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Sbjct 824 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 775
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Sbjct 272 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 223
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complete cds
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
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Sbjct 531 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 482
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Sbjct 411 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 362
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Sbjct 480 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 431
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1 (ACTB), mRNA
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Sbjct 320 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 271
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Sbjct 530 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 481
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Sbjct 436 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 387
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Sbjct 357 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 308
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
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>gb|JX045433.1| Toxoplasma gondii strain VAND actin gene, complete cds
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>gb|JX045432.1| Toxoplasma gondii strain GUYKOE actin gene, complete cds
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>gb|JX045428.1| Toxoplasma gondii strain TgCatBr9 actin gene, complete cds
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>gb|JX045429.1| Toxoplasma gondii strain TgCatBr6 actin gene, complete cds
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>gb|JX045426.1| Toxoplasma gondii strain BOF actin gene, complete cds
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>gb|JX045427.1| Toxoplasma gondii strain FOU actin gene, complete cds
gb|JX045431.1| Toxoplasma gondii strain TgCatBr3 actin gene, complete cds
gb|JX045437.1| Toxoplasma gondii strain TgCatBr2 actin gene, complete cds
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>gb|JX045422.1| Toxoplasma gondii strain CTG actin gene, complete cds
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>gb|JX045423.1| Toxoplasma gondii strain VEG actin gene, complete cds
gb|JX045424.1| Toxoplasma gondii strain DEG actin gene, complete cds
gb|JX045425.1| Toxoplasma gondii strain ME49 actin gene, complete cds
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>ref|XM_003754973.1| PREDICTED: Sarcophilus harrisii actin, cytoplasmic type 5-like
(LOC100923807), mRNA
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>gb|JX046106.1| Capra hircus beta-actin (ACTB) mRNA, complete cds
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Sbjct 280 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 231
>gb|JN558341.1| Polarella glacialis clone 4 actin 1 gene, partial sequence
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Sbjct 146 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 97
>ref|NG_030530.1| Canis lupus familiaris actin, cytoplasmic 2 pseudogene (LOC610787)
on chromosome 3
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Sbjct 277 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 228
>dbj|AK306863.1| Pan troglodytes mRNA for actin, cytoplasmic 1, complete cds,
clone: PtsC-1-5_F07
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
>gb|JF303662.1| Trichoplusia ni actin mRNA, complete cds
Length=1460
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Sbjct 336 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 287
>ref|NR_037688.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 3, non-coding
RNA
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Sbjct 411 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 362
>ref|NM_001199954.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 530 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 481
>ref|NM_001614.3| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 411 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 362
>ref|NM_001195845.1| Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), mRNA
Length=2173
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Sbjct 418 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 369
>ref|XM_003026104.1| Schizophyllum commune H4-8 Actin-1, mRNA
Length=1498
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Sbjct 368 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 319
>gb|HM140791.1| Hyalomma asiaticum actin mRNA, complete cds
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>ref|XM_002802729.1| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical protein LOC100430113 (LOC100430113),
mRNA
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 541 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 590
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Sbjct 270 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 221
>ref|XM_002802725.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 3 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 387 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 338
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Sbjct 370 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 321
>ref|XM_002802723.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
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Sbjct 367 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 318
>gb|FJ514819.1| Sporisorium scitamineum actin (ACT1) gene, complete cds
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Sbjct 1449 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 1400
>gb|AC207299.5| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-45392900D8 from chromosome 17,
complete sequence
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Sbjct 31651 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 31602
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
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Sbjct 296 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 247
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
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Sbjct 345 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 296
>emb|FN392558.1| Imantonia rotunda partial mRNA for actin, contig 15964
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Sbjct 329 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 378
>ref|XM_002503045.1| Micromonas sp. RCC299 chromosome 6 hypothetical protein (ACTIN)
mRNA, complete cds
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Sbjct 350 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 301
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Sbjct 421 TAGAAGGTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 372
>gb|CP001327.1| Micromonas sp. RCC299 chromosome 6, complete sequence
Length=1431126
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Sbjct 87112 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 87161
>ref|NG_011433.1| Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), RefSeqGene on chromosome
17
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Sbjct 5808 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 5759
>ref|XM_002294881.1| Thalassiosira pseudonana CCMP1335 actin-like protein (ACT1),
mRNA
Length=1319
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 278 TAGAAAGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 229
>gb|EU343999.1| Candida savonica strain WM 07.62 actin gene, partial cds
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Sbjct 56 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 7
>gb|EU262946.1| Oncorhynchus kisutch cytoplasmic beta actin mRNA, partial cds
gb|KM025034.1| Oncorhynchus kisutch beta-actin mRNA, partial cds
Length=304
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Sbjct 242 TAGAAGGTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 193
>gb|EF437156.1| Globodera rostochiensis beta-actin (act-1) gene, complete cds
Length=2095
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Sbjct 879 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 830
>gb|EU284024.1| Heterodera cynodontis isolate CD274 clone 1 actin gene, partial
cds
Length=903
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 73 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 24
>gb|EU284023.1| Heterodera cynodontis isolate CD274 clone 2 actin gene, partial
cds
Length=911
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 77 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 28
>dbj|AK304637.1| Homo sapiens cDNA FLJ57283 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1387
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 341 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 292
>dbj|AK301175.1| Homo sapiens cDNA FLJ58286 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1389
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 344 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 295
>gb|EU832621.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067650; DKFZo008B0831
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 294 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 245
>gb|EU832693.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067722; DKFZo004B0832
actin, gamma 1 protein (ACTG1) gene, encodes complete
protein
Length=1171
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 294 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 245
>emb|CU680176.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017126
5' read ACTG1 mRNA
Length=1134
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 288 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 239
>emb|CU676328.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100021914
5' read ACTG1 mRNA
Length=1161
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 288 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 239
>dbj|AB374098.1| Ixodes persulcatus act mRNA for actin, complete cds
Length=1131
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 275 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 226
>dbj|AK291937.1| Homo sapiens cDNA FLJ78508 complete cds
Length=1510
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 344 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 295
>gb|EU176631.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011619; FLH263907.01L;
RZPDo839C03246D actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes
complete protein
Length=1168
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 294 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 245
>gb|EU046492.1| Neovison vison beta-actin mRNA, complete cds
Length=1435
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
>gb|BC142413.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:159611 IMAGE:8448844),
complete cds
Length=1845
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 360 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 311
>ref|NM_001134769.1| Pan troglodytes actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
dbj|AB222159.1| Pan troglodytes verus actg1 mRNA for actin, gamma 1, complete
cds, clone: PstA5646
Length=1942
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 344 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 295
>gb|BT030480.1| Bos taurus actin, beta (ACTB), mRNA, complete cds
Length=1776
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 301 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 252
>gb|DQ386914.1| Lygus lineolaris putative actin mRNA, complete cds
Length=1237
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 359 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATATCGTCCCAGTTGGTGACGAT 310
>gb|DQ891374.2| Synthetic construct clone IMAGE:100004004; FLH176328.01X; RZPDo839C01122D
actin, gamma 1 (ACTG1) gene, encodes complete protein
Length=1168
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 294 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 245
>ref|NM_001285025.1| Macaca fascicularis actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB170391.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10647, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1729
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 356 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 307
>gb|DQ233465.1| Cervus elaphus beta-actin mRNA, partial cds
Length=684
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 155 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 106
>emb|CT837965.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) cDNA clone:OSIGCRA107C01,
full insert sequence
Length=1198
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 297 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 248
>gb|DQ980417.1| Chrysochromulina sp. NIES-1333 actin gene, partial cds
Length=1036
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 207 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 158
>gb|DQ980436.1| Apusomonas proboscidea clone apactin4rt actin mRNA, partial cds
Length=1050
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 218 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 169
>gb|DQ980418.1| Chrysochromulina sp. NIES-1333 actin gene, partial cds
Length=1036
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 207 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 158
>gb|DQ980438.1| Chrysochromulina sp. NIES-1333 actin mRNA, partial cds
Length=1036
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 50
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Sbjct 207 TAGAAGGTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGAT 158
>gb|DQ980416.1| Apusomonas proboscidea clone apactin1g actin gene, partial cds
Length=1453
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7 7 5570158 5569198 95m860n5m GCCAGCTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGACGATGCCCCCCGG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570155 5569195 98m860n2m AGCTCACCATGGATGATGATATCGCCGCGCTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGACGATGCCCCCCGGGCCGTC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 5570142 5570042 100m CAGCCGACCGGGGCGGGCGGCTCACGGCCCGGCCGCAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGG
7 7 5570139 5570039 100m CCGACCGGGGCAGGCGGCTCACGGCTCGGCCGCAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGG
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7 7 5570130 5570030 100m GCAGGCGGCACACGGCCCGGCCGCAGGCGGCCGCGGCCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGGGGGAACCGGA
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sequence
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shotgun sequence
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 239468 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 239422
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 74927592 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 74927638
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shotgun sequence
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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HuRef SCAF_1103279188205, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 1018820 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 1018866
>ref|AC_000149.1| Homo sapiens chromosome 17, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 74927842 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 74927888
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shotgun sequence
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 3193055 GTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 3193009
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shotgun sequence
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 4350916 GTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 4350962
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shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 7590994 GTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 7590948
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shotgun sequence
Length=19557365
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 7591020 GTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 7590974
>gb|CH471098.1| Homo sapiens 211000035834540 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
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Sbjct 13921057 GTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 13921011
>ref|NW_001838549.1| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188217:1-11933214, whole genome shotgun
sequence
Length=11933214
Score = 76.8 bits (41), Expect = 6e-12
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7591020 GTGTGGTCCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 7590974
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA
>ref|NC_000007.14| Homo sapiens chromosome 7, GRCh38 Primary Assembly
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Length=159345973
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 5529636 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5529587
>ref|NT_007819.18| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR7_CTG1
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assembly
Length=58109653
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 5519636 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5519587
>ref|NC_018918.2| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 5568850 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5568801
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5558850 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5558801
>gb|CM000497.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=152869804
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5482245 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5482196
>gb|CH003502.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=147693610
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 4473808 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 4473759
>gb|DS990771.1| Homo sapiens SCAF_1112675837207 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5668743
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5284478 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5284429
>gb|CH003454.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=154169609
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 5470362 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5470313
>tpg|BL000002.1| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158409401
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5279605 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5279556
>ref|NW_001838998.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188262, whole genome shotgun sequence
gb|DS486133.1| Homo sapiens SCAF_1103279188262 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=5668350
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5284076 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5284027
>gb|CH471144.1| Homo sapiens 211000035837778 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=5843728
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5471445 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5471396
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000468.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=152870189
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5481831 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5481782
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158329839
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 5615612 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5615563
>gb|CM000258.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=153561227
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Minus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 5529048 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5528999
>ref|NC_018916.2| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001613.2| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
Length=180347728
Score = 82.4 bits (44), Expect = 1e-13
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150106.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 27109581 CTCGTCATCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCACGGGCGA 27109630
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shotgun sequence
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>ref|NW_001838951.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188395, whole genome shotgun sequence
gb|DS486048.1| Homo sapiens SCAF_1103279188395 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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>gb|CH471084.1| Homo sapiens 211000035840020 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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>ref|AC_000137.1| Homo sapiens chromosome 5, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000466.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 72974742 CTCGTCATCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCACGGGCGA 72974791
>gb|CM000495.1| Homo sapiens chromosome 5, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 72287890 CTCGTCATCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCAGCTTCACGGGCGA 72287939
>gb|DS990686.1| Homo sapiens SCAF_1112675837340 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 6369658 CTCGTCATCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCAGCTTCACGGGCGA 6369707
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG
>ref|NG_007992.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB), RefSeqGene (LRG_132) on chromosome
7
Length=10454
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 6344 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 6295
>ref|NM_001101.3| Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 301
>dbj|AB385102.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5455, Homo sapiens ACTB
gene for actin, cytoplasmic 1, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
Length=1142
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 275 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 226
>emb|CU680416.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100017100
5' read ACTB mRNA
Length=1262
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 237 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 188
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Sbjct 318 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 269
>dbj|AK309997.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17039
Length=1846
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 301
>gb|DQ894128.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008588; FLH167999.01L;
RZPDo839A1191D actin, beta (ACTB) gene, encodes complete
protein
Length=1168
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 288 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 239
>gb|DQ890960.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003590; FLH168003.01X; RZPDo839A1192D
actin, beta (ACTB) gene, encodes complete protein
Length=1168
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 288 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 239
>gb|BC053988.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5920354, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2633
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 1160 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 1111
>gb|EF095209.1| Homo sapiens beta-actin mRNA, partial cds
Length=364
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 236 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 187
>gb|BC021242.1| Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter,
y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3677363),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=4112
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 2583 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 2534
>gb|BC009275.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3960255), ****
WARNING: chimeric clone ****
Length=2308
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 819 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 770
>dbj|AK225414.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC08987
Length=1656
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 301
>gb|DQ471327.1| Homo sapiens PS1TP5-binding protein 1 (PS1TP5BP1) mRNA, complete
cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 266 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 217
>gb|BC065493.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6482790, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 1920
>gb|BC021035.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834434, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4951
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 3761 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 3810
>gb|BT019932.1| Synthetic construct Homo sapiens actin, beta mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 266 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 217
>gb|BC014861.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8968 IMAGE:3870487),
complete cds
Length=1884
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 340 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 291
>gb|BC013380.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:16525 IMAGE:4025526),
complete cds
Length=1820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 341 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 292
>gb|BC001301.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:5475 IMAGE:3451917),
complete cds
Length=1805
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 284
>gb|BC016045.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:20387 IMAGE:4564532),
complete cds
Length=1841
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 341 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 292
>gb|BC004251.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:10559 IMAGE:3623067),
complete cds
Length=1811
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 278
>gb|BC012854.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3863361), partial
cds
Length=1729
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 223 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 174
>gb|AY582799.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB) gene, complete cds
Length=7399
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 3277 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 3228
>dbj|AK125561.1| Homo sapiens cDNA FLJ43573 fis, clone RECTM2001691, highly similar
to Actin, cytoplasmic 2
Length=2244
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 300
>dbj|AK223055.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: KAT00430
Length=1643
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 301
>dbj|AK223032.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: JTH03396
Length=1820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 301
>dbj|AK222925.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC07191
Length=1833
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 301
>gb|AC006483.3| Homo sapiens BAC clone CTB-161C1 from 7, complete sequence
Length=196416
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171301 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 171252
>dbj|AK130157.1| Homo sapiens cDNA FLJ26647 fis, clone MPE04710, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1805
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 301
>dbj|AK130062.1| Homo sapiens cDNA FLJ26552 fis, clone LNF01613, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1806
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 301
>dbj|AK098751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25885 fis, clone CBR02968, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC TYPE 5
Length=1607
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 232
>dbj|AK058019.1| Homo sapiens cDNA FLJ25290 fis, clone STM07156, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC 1
Length=1804
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 301
>gb|BC008633.1|BC008633 Homo sapiens, actin, beta, clone IMAGE:4179564, mRNA, partial
cds
Length=1744
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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to HSACTB Homo sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
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(ACTB) mRNA, partial cds
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(ACTB) mRNA, complete cds
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Sbjct 266 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 217
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(ACTB) mRNA, partial cds
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Sbjct 266 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 217
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complete cds
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Sbjct 337 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 288
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frame-shift errors
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errors
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mRNA
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mRNA
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(LOC104657250), mRNA
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(LOC104655172), misc_RNA
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(LOC104676787), mRNA
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mRNA
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Sbjct 458 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 409
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misc_RNA
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variant X3, mRNA
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variant X1, mRNA
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Sbjct 274 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 225
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Sbjct 137 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTAGTGACGATGCCGTG 88
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Sbjct 541 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 492
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mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 284 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 235
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 349 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 300
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Sbjct 285 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 236
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Sbjct 296 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 247
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 347 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 298
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 281 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 232
>emb|LK052943.1| Rhodosporidium toruloides strain CECT1137, genomic scaffold,
scaffold RHTO0S08
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Sbjct 135983 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 135934
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X2, mRNA
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
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mRNA
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Sbjct 179 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 130
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Sbjct 382 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 333
>ref|XM_007969038.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus actin, cytoplasmic 1 (LOC103219323),
mRNA
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Sbjct 344 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 295
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>ref|XM_001515099.3| PREDICTED: Ornithorhynchus anatinus actin, cytoplasmic type 5
(LOC100092493), mRNA
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Sbjct 380 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 331
>ref|XM_007525054.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus actin, beta (ACTB), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 301 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 252
>ref|XM_007447079.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 284 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 235
>ref|XM_007268004.1| Fomitiporia mediterranea MF3/22 Actin/actin-like protein (FOMMEDRAFT_169042),
partial mRNA
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variant X1, mRNA
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misc_RNA
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mRNA
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complete cds
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Sbjct 266 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 217
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mRNA, complete cds
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Sbjct 343 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 294
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mRNA
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Sbjct 329 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 280
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2 (ACTB), mRNA
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1 (ACTB), mRNA
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variant 2 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 524 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 475
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variant 1 (ACTG1), mRNA
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Sbjct 351 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 302
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
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(LOC100923807), mRNA
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
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Sbjct 274 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 225
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Sbjct 140 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 91
>gb|JN558340.1| Polarella glacialis clone 3 actin 1 gene, partial sequence
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Sbjct 140 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 91
>ref|NG_030530.1| Canis lupus familiaris actin, cytoplasmic 2 pseudogene (LOC610787)
on chromosome 3
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Sbjct 271 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 222
>dbj|AK306863.1| Pan troglodytes mRNA for actin, cytoplasmic 1, complete cds,
clone: PtsC-1-5_F07
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Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 301
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Sbjct 196989 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 196940
>gb|JF303662.1| Trichoplusia ni actin mRNA, complete cds
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Sbjct 330 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 281
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cds
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Sbjct 137 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 88
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Sbjct 412 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 363
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Sbjct 381 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATACCGTG 332
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Sbjct 366 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATACCGTG 317
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mRNA
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Sbjct 547 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 596
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variant 4 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 264 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 215
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variant 3 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 381 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 332
>ref|XM_002802724.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 2 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 364 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 315
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variant 1 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 361 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 312
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Sbjct 462 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 413
>ref|XM_002603087.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
>ref|XM_002591972.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
>ref|XM_002590479.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1134
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
>ref|XM_002590113.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
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Sbjct 339 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 290
>emb|FN392558.1| Imantonia rotunda partial mRNA for actin, contig 15964
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Sbjct 335 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 384
>ref|XM_002503045.1| Micromonas sp. RCC299 chromosome 6 hypothetical protein (ACTIN)
mRNA, complete cds
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Sbjct 344 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 295
>gb|CP001327.1| Micromonas sp. RCC299 chromosome 6, complete sequence
Length=1431126
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Sbjct 87118 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 87167
>emb|FP236798.3| H.melpomene DNA sequence from clone AEHM-3O10, complete sequence
Length=106998
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 103251 GTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 103300
>ref|XM_002294881.1| Thalassiosira pseudonana CCMP1335 actin-like protein (ACT1),
mRNA
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Sbjct 272 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATTCCGTG 223
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gb|KM025034.1| Oncorhynchus kisutch beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 236 GTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 187
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cds
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Sbjct 67 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 18
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cds
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Sbjct 71 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 22
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cytoplasmic 1
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
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I, clone PbURM
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Sbjct 2533 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 2484
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complete cds
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>gb|BC142413.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:159611 IMAGE:8448844),
complete cds
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Sbjct 276 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 227
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dbj|AB170391.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10647, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
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Sbjct 350 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 301
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Sbjct 149 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 100
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Sbjct 201 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 152
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Sbjct 212 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 163
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Sbjct 201 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 152
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Sbjct 201 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 152
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Sbjct 298 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 249
>gb|DQ826531.1| Chinchilla lanigera beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 244 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 195
>gb|DQ838049.1| Bos grunniens beta-actin mRNA, complete cds
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Sbjct 266 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 217
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Sbjct 135 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 86
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Sbjct 291 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 242
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Sbjct 353 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 304
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Sbjct 305 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 256
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Sbjct 102 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 53
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
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gb|BC102948.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:128179 IMAGE:7945368),
complete cds
Length=1948
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Sbjct 358 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 309
>ref|NM_001033618.1| Bos taurus actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
gb|BC102951.1| Bos taurus actin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:128210 IMAGE:7949739),
complete cds
Length=2032
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Sbjct 363 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 314
>emb|CR731624.2| Tetraodon nigroviridis full-length cDNA
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Sbjct 303 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 254
>emb|CR724354.2| Tetraodon nigroviridis full-length cDNA
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Sbjct 343 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 294
>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
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Sbjct 379 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 330
>gb|AY090616.1| Calotes versicolor beta actin-like protein mRNA, partial cds
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Sbjct 144 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 95
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Sbjct 266 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 217
>emb|AJ719605.1| Gallus gallus mRNA for hypothetical protein, clone 4h19
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Sbjct 353 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 304
>emb|AJ719332.1| Gallus gallus mRNA for hypothetical protein, clone 1h13
Length=1984
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Sbjct 353 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 304
>emb|Z70044.1| C.familiaris mRNA for beta-actin
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Sbjct 202 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 153
>emb|V00002.1| Acanthamoeba castelani gene encoding actin I
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Sbjct 402 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 353
>gb|AY443356.1| Heterodera cyperi actin gene, partial cds
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Sbjct 74 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 25
>gb|AY443355.1| Heterodera ripae actin gene, partial cds
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Sbjct 74 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 25
>gb|AY443354.1| Heterodera avenae actin gene, partial cds
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Sbjct 74 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 25
>gb|AY443353.1| Heterodera litoralis actin gene, partial cds
Length=938
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Sbjct 74 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 25
>gb|AY443352.1| Heterodera schachtii actin gene, partial cds
Length=961
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Sbjct 74 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 25
>gb|AY443351.1| Heterodera latipons actin gene, partial cds
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Sbjct 110 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 61
>gb|AY161282.1| Heterodera glycines actin 1 gene, complete cds
Length=2286
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 844 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 795
>gb|AY161281.1| Globodera rostochiensis actin 2 mRNA, complete cds
Length=1131
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
>gb|AF539593.1| Globodera rostochiensis actin mRNA, complete cds
Length=1131
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 269 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
>gb|AF318603.2| Heterodera glycines actin 1 mRNA, complete cds
Length=1367
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 351 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 302
>dbj|AB060287.1| Lethenteron camtschaticum LjCA1 mRNA for cytoplasmic actin, complete
cds
Length=1940
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 347 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 298
>dbj|AB035662.1| Branchiostoma belcheri BbNA3 mRNA for notochord actin, complete
cds
Length=1493
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 315 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 266
>dbj|AB035661.1| Branchiostoma belcheri BbNA2 mRNA for notochord actin, complete
cds
Length=1638
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 322 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 273
>dbj|AB035660.1| Branchiostoma belcheri BbNA1 mRNA for notochord actin, complete
cds
Length=1491
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 329 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 280
>gb|AF191490.1|AF191490 Bos taurus beta actin mRNA, partial cds
Length=244
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 166 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 117
>ref|NM_001003349.1| Canis lupus familiaris actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
gb|AF021873.2|AF021873 Canis familiaris beta-actin mRNA, complete cds
Length=1714
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 266 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 217
>gb|AF038150.1|AF038150 Mustela putorius furo beta-actin mRNA, partial cds
Length=1685
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 94 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 45
>ref|NM_001081838.1| Equus caballus actin, beta (ACTB), mRNA
gb|AF035774.1|AF035774 Equus caballus beta actin mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 266 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 217
>dbj|AB004047.1| Cercopithecus aethiops mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1138
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 276 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 227
>gb|M26111.1|GOOACTB Goose beta-actin mRNA, complete cds
Length=1994
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 341 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 292
>ref|XR_126997.3| PREDICTED: Pan troglodytes actin, cytoplasmic 1-like (LOC100614593),
misc_RNA
Length=1154
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Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 293 TGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 245
>ref|XR_611144.1| PREDICTED: Pan paniscus actin, cytoplasmic 1-like (LOC100979812),
misc_RNA
Length=1129
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 268 TGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
>ref|XM_008007862.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus actin, cytoplasmic 2-like (LOC103240948),
mRNA
Length=1092
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 172 TGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 124
>ref|NG_007577.3| Homo sapiens actin, beta pseudogene 11 (ACTBP11) on chromosome
1
Length=1910
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 449 TGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 401
>ref|XM_006798433.1| PREDICTED: Neolamprologus brichardi actin, alpha cardiac muscle
1-like (LOC102790683), mRNA
Length=1376
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Strand=Plus/Minus
Query 2 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 338 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTG 290
>ref|XM_005942649.1| PREDICTED: Haplochromis burtoni actin, alpha cardiac muscle 1-like
(LOC102299125), mRNA
Length=1412
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 2 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 371 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTG 323
>ref|XM_005723771.1| PREDICTED: Pundamilia nyererei actin, alpha cardiac muscle 1-like
(LOC102213611), mRNA
Length=1406
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
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Strand=Plus/Minus
Query 2 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 365 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTG 317
>ref|XM_004540354.1| PREDICTED: Maylandia zebra actin, alpha cardiac muscle 1-like
(LOC101481306), mRNA
Length=1386
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 346 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGATGATGCCGTG 298
>dbj|AK316361.1| Homo sapiens cDNA, FLJ79260 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 2
Length=1087
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGC 46
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Sbjct 123 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGC 78
>gb|AC096542.2| Homo sapiens chromosome 1 clone RP11-332L18, complete sequence
Length=189411
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 117070 TGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 117118
>gb|S64189.1| type 2 actin [Emiliania huxleyi=Prymnesiophyte algae, CCMP379,
mRNA Partial, 629 nt]
Length=629
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCG 48
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Sbjct 236 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCG 189
>ref|XM_010359323.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin (LOC104659174), partial
mRNA
Length=515
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 269 GTGTGATGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 220
>ref|XM_010074039.1| PREDICTED: Pterocles gutturalis actin, cytoplasmic 2-like (LOC104459850),
mRNA
Length=1755
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 128 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATACCGTG 79
>ref|XM_010002717.1| PREDICTED: Chaetura pelagica actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=1048
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 164 GTGTGGTGCCAAATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 115
>emb|LL595631.1| Diphyllobothrium latum genome assembly D_latum_Geneva ,scaffold
DILT_scaffold0024896
Length=5986
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 3107 GTGTGATGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTAGTGACGATGCCGTG 3058
>emb|LL188537.1| Heligmosomoides polygyrus genome assembly H_bakeri_Edinburgh
,scaffold HPBE_scaffold0000168
Length=137732
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
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Sbjct 548 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTCACGATTCCGTG 499
>emb|LN108414.1| Spirometra erinaceieuropaei genome assembly S_erinaceieuropaei
,scaffold SPER_scaffold0102096
Length=3425
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 50
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 GTGTGATGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCCGTG 422
>ref|XM_009252134.1| PREDICTED: Pongo abelii actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=2015
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 384
>ref|XM_003831125.2| PREDICTED: Pan paniscus actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=1957
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 47
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 380 GTGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGTCGTCCCAGTTGGTGACGATGCC 334
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA
>ref|XM_008575956.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus actin, cytoplasmic 1 (LOC103593038),
mRNA
Length=1823
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>gb|KJ696744.1| Rattus norvegicus beta-actin (Actb) mRNA, partial cds
Length=560
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 76 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 125
>gb|KJ896369.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_05763 ACTB
gene, encodes complete protein
Length=1257
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 87 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 136
>ref|XM_003277926.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys actin, cytoplasmic 1-like (LOC100598411),
mRNA
Length=1218
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 109 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 158
>ref|XM_004045059.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
2 (ACTB), mRNA
Length=1945
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 279
>ref|XM_004045058.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
1 (ACTB), mRNA
Length=1785
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 70 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 119
>ref|NM_031144.3| Rattus norvegicus actin, beta (Actb), mRNA
Length=1293
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 100 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 149
>emb|FQ232650.1| Rattus norvegicus TL0AEA64YO15 mRNA sequence
Length=1286
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 151
>emb|FQ232063.1| Rattus norvegicus TL0AEA67YC11 mRNA sequence
Length=1288
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 102 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 151
>emb|FQ231503.1| Rattus norvegicus TL0AEA6YE04 mRNA sequence
Length=1288
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 151
>dbj|AK304552.1| Homo sapiens cDNA FLJ52842 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 1
Length=1486
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>dbj|AK301372.1| Homo sapiens cDNA FLJ55253 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 1
Length=1255
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>ref|NG_007992.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB), RefSeqGene (LRG_132) on chromosome
7
Length=10454
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5966 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 6015
>ref|NM_001101.3| Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1852
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>dbj|AB385102.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5455, Homo sapiens ACTB
gene for actin, cytoplasmic 1, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
Length=1142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 31 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 80
>dbj|AK308277.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98225
Length=1499
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>dbj|AK309997.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17039
Length=1846
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Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>gb|DQ894128.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008588; FLH167999.01L;
RZPDo839A1191D actin, beta (ACTB) gene, encodes complete
protein
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Sbjct 44 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 93
>gb|DQ890960.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003590; FLH168003.01X; RZPDo839A1192D
actin, beta (ACTB) gene, encodes complete protein
Length=1168
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Sbjct 44 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 93
>gb|BC053988.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5920354, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 916 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 965
>gb|BC021242.1| Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter,
y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3677363),
**** WARNING: chimeric clone ****
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Sbjct 2339 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 2388
>gb|BC009275.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3960255), ****
WARNING: chimeric clone ****
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Sbjct 575 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 624
>dbj|AK225414.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC08987
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Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>gb|DQ471327.1| Homo sapiens PS1TP5-binding protein 1 (PS1TP5BP1) mRNA, complete
cds
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Sbjct 22 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>gb|BC065493.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6482790, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 1725 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 1774
>gb|BC021035.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834434, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4951
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Sbjct 4006 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 3957
>gb|BT019932.1| Synthetic construct Homo sapiens actin, beta mRNA, partial cds
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Sbjct 22 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>gb|BC014861.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8968 IMAGE:3870487),
complete cds
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Sbjct 96 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 145
>gb|BC013380.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:16525 IMAGE:4025526),
complete cds
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Sbjct 97 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 146
>gb|BC001301.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:5475 IMAGE:3451917),
complete cds
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Sbjct 89 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 138
>gb|BC016045.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:20387 IMAGE:4564532),
complete cds
Length=1841
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Sbjct 97 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 146
>gb|BC004251.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:10559 IMAGE:3623067),
complete cds
Length=1811
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 83 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 132
>gb|AY582799.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB) gene, complete cds
Length=7399
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Sbjct 2899 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 2948
>gb|BC063166.1| Rattus norvegicus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:72783 IMAGE:6920838),
complete cds
Length=1296
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 103 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 152
>dbj|AK223055.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: KAT00430
Length=1643
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>dbj|AK222925.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC07191
Length=1833
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>gb|AC006483.3| Homo sapiens BAC clone CTB-161C1 from 7, complete sequence
Length=196416
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 170923 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 170972
>ref|NM_001133354.1| Pongo abelii actin, beta (ACTB), mRNA
emb|CR860982.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A196 (from clone DKFZp459A196)
Length=1844
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 123 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 172
>emb|CR860530.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A127 (from clone DKFZp459A127)
Length=1833
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>dbj|AK130157.1| Homo sapiens cDNA FLJ26647 fis, clone MPE04710, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1805
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>dbj|AK130062.1| Homo sapiens cDNA FLJ26552 fis, clone LNF01613, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1806
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>dbj|AK058019.1| Homo sapiens cDNA FLJ25290 fis, clone STM07156, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC 1
Length=1804
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>gb|AF404278.1| Oryctolagus cuniculus beta-actin mRNA, partial cds
Length=238
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 79
>gb|BC008633.1|BC008633 Homo sapiens, actin, beta, clone IMAGE:4179564, mRNA, partial
cds
Length=1744
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 52
>dbj|AK025375.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21722 fis, clone COLF0522, highly similar
to HSACTB Homo sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1872
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>emb|V01217.1| Rat gene encoding cytoplasmic beta-actin
Length=4100
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 1314
>emb|X63432.1| H.sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1802
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 95 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 144
>emb|X00351.1| Human mRNA for beta-actin
Length=1761
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 112
>gb|AY891016.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH007203.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>gb|AY889707.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116685.01X actin beta
(ACTB) mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>gb|AY892160.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116681.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>gb|BC002409.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8647 IMAGE:2961617),
complete cds
Length=1849
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 93 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 142
>gb|BC014401.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3504279, containing frame-shift
errors
Length=1812
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 98 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 147
>gb|BC013835.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:4152631)
Length=1834
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 143
>gb|M10277.1|HUMACCYBB Human cytoplasmic beta-actin gene, complete cds
Length=3646
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 1163
>ref|XM_010596269.1| PREDICTED: Loxodonta africana actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1836
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 157
>ref|XM_010357019.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 2-like
(LOC104657250), mRNA
Length=2615
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 329
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 898 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCACGGGCGA 947
>ref|XR_746932.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 1-like
(LOC104655172), misc_RNA
Length=1717
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 74
>ref|XM_010381661.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 1-like
(LOC104676787), mRNA
Length=1789
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 143
>ref|XM_010376630.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin-85C (LOC104672769),
mRNA
Length=1202
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 154
>ref|XM_010366994.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1909
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 263
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Sbjct 214 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 263
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Sbjct 297 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 346
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mRNA
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Sbjct 112 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 161
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Sbjct 22 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
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Sbjct 138 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 187
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mRNA
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Sbjct 100 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 149
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Sbjct 31 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 80
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X2, mRNA
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Sbjct 60 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 109
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Sbjct 116 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 165
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variant X4, mRNA
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Sbjct 43 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 92
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variant X3, mRNA
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Sbjct 52 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 101
>ref|XM_005982116.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii actin, beta (ACTB), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 37 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 86
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variant X1, mRNA
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Sbjct 43 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 92
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Sbjct 45 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 94
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 109 CTCGTCGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 158
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 92 CTCGTCGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 141
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transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 101 CTCGTCGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 150
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X1, mRNA
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Sbjct 146 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 195
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variant X3, mRNA
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Sbjct 109 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 158
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variant X2, mRNA
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Sbjct 178 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 227
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variant X1, mRNA
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Sbjct 178 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 227
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variant X2, mRNA
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Sbjct 178 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 227
>ref|XM_004894014.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, beta (Actb), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 178 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 227
>ref|XM_004380832.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris actin, beta, transcript
variant 2 (ACTB), mRNA
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 22 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>ref|XM_004380831.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris actin, beta, transcript
variant 1 (ACTB), mRNA
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 27 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 76
>gb|JX446579.1| Capra hircus breed Kajang beta-actin mRNA, partial cds
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 22 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>dbj|AK306863.1| Pan troglodytes mRNA for actin, cytoplasmic 1, complete cds,
clone: PtsC-1-5_F07
Length=1824
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 106 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>ref|XM_002802726.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 4 (LOC100428865), mRNA
Length=1757
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 104 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 153
>ref|XM_002802725.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 3 (LOC100428865), mRNA
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 137 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 186
>ref|XM_002802724.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 2 (LOC100428865), mRNA
Length=1857
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 120 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 169
>ref|XM_002802723.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 1 (LOC100428865), mRNA
Length=1854
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 117 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 166
>gb|BC142413.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:159611 IMAGE:8448844),
complete cds
Length=1845
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 110 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 159
>gb|BT030480.1| Bos taurus actin, beta (ACTB), mRNA, complete cds
Length=1776
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 51 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 100
>gb|DQ661647.1| Bubalus bubalis beta-actin mRNA, complete cds
Length=1143
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 32 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 81
>ref|NM_001285025.1| Macaca fascicularis actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB170391.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10647, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1729
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 106 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>gb|DQ838049.1| Bos grunniens beta-actin mRNA, complete cds
Length=1128
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 22 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>ref|NM_001033084.1| Macaca mulatta actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1584
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 47 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 96
>gb|AY141970.1| Bos taurus beta-actin (ACTB) mRNA, complete cds
Length=1804
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 61 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 110
>ref|NM_173979.3| Bos taurus actin, beta (ACTB), mRNA
gb|BC102948.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:128179 IMAGE:7945368),
complete cds
Length=1948
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 114 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 163
>dbj|AK223032.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: JTH03396
Length=1820
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 106 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1850
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 135 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 184
>gb|AY646115.1| Spermophilus citellus beta-actin mRNA, complete cds
Length=1190
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 29 CTCGTCGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 78
>ref|NM_001081838.1| Equus caballus actin, beta (ACTB), mRNA
gb|AF035774.1|AF035774 Equus caballus beta actin mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>dbj|AB004047.1| Cercopithecus aethiops mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1138
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 81
>ref|XR_504851.1| PREDICTED: Tarsius syrichta actin, cytoplasmic 1-like (LOC103269026),
misc_RNA
Length=1135
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 24 TCGTCGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 72
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Sbjct 1 TCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 46
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to ACTIN, CYTOPLASMIC TYPE 5
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGC 48
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Sbjct 106 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGTGGGC 153
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Sbjct 13 CTCGTTGTCGACAATGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 62
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mRNA
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Sbjct 200 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 243
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mRNA
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Sbjct 96 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 139
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mRNA
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Sbjct 109 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 152
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mRNA
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Query 7 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 112 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
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misc_RNA
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Sbjct 51 CTCGTCGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGGGGGCGA 100
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Sbjct 40 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 86
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Sbjct 22 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 68
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alpha subunit 2 (catalytic) (RALGAPA2), mRNA
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Sbjct 5722 CTCGTGGTCGACAATGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 5771
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misc_RNA
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Sbjct 22 CTCGTGGTCGACAATGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
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misc_RNA
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 22 CTCGTGGTCGACAATGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
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Sbjct 23 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCAGGCGA 72
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Sbjct 30 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCAGGCGA 79
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 47 CTCGTGGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 96
>ref|XM_005697907.1| PREDICTED: Capra hircus actin, cytoplasmic 1-like (LOC102179831),
transcript variant X1, mRNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 46 CTCGTGGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 95
>ref|XM_003124280.3| PREDICTED: Sus scrofa actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1888
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 140 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTTGCGGGCGA 189
>ref|XM_005397842.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera actin, beta (Actb), mRNA
Length=1833
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 47
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Sbjct 137 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 183
>ref|XM_005003653.1| PREDICTED: Cavia porcellus actin, beta (Actb), transcript variant
X1, mRNA
Length=1813
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 47
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Sbjct 108 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 154
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partial mRNA
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 47
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Sbjct 22 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 68
>ref|XR_192401.1| PREDICTED: Octodon degus actin, cytoplasmic 1-like (LOC101565700),
misc_RNA
Length=530
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 47
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Sbjct 22 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 68
>ref|XM_004617349.1| PREDICTED: Sorex araneus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1302
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 26 CTCGTGGTCGACAATGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 75
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mRNA
Length=603
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 96 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTTGCGGGCGA 145
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variant 2 (ACTB), mRNA
Length=1800
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 89 CTCGTGGTCGACAACGGCTCTGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 138
>ref|XM_004440873.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum actin, beta, transcript
variant 1 (ACTB), mRNA
Length=1817
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 106 CTCGTGGTCGACAACGGCTCTGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 155
>ref|XM_004310959.1| PREDICTED: Tursiops truncatus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1776
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 47
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 86
>ref|XM_004268956.1| PREDICTED: Orcinus orca actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1848
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 47
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 152
>gb|JX046106.1| Capra hircus beta-actin (ACTB) mRNA, complete cds
Length=1147
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 CTCGTGGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 79
>gb|HM067830.1| Ovis aries clone ACTB_SLIP_1 beta-actin variant 2 (ACTB) mRNA,
complete cds
Length=1905
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 CTCGTGGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 143
>ref|XM_002610521.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1214
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 CTCGTCGTTGACAATGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 74
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complete cds
Length=1584
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Strand=Plus/Plus
Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 71 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 117
>gb|BC138611.1| Mus musculus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:170236 IMAGE:8861631),
complete cds
Length=1584
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 71 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 117
>ref|NM_007393.3| Mus musculus actin, beta (Actb), mRNA
Length=1889
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 104 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 150
>gb|EF043617.1| Synthetic construct clone ATCC 10373495 beta actin mRNA, complete
cds
Length=1128
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Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 25 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>gb|BC083054.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:5292509
Length=1420
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 84 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 130
>gb|AY550069.1| Sus scrofa cytoskeletal beta actin mRNA, partial cds
Length=1862
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 109 CTCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTTGCGGGCGA 158
>ref|NM_001172909.1| Cavia porcellus actin, beta (Actb), mRNA
gb|AF508792.1| Cavia porcellus beta actin mRNA, complete cds
Length=1746
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 47
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Sbjct 29 CTCGTTGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 75
>gb|AC146674.3| Callithrix jacchus clone CH259-338M13, complete sequence
Length=228448
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 7 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 6243 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 6286
>dbj|AK145308.1| Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:G930045M01 product:actin, beta,
cytoplasmic, full insert sequence
Length=1890
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Plus
Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 106 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 152
>dbj|AK145196.1| Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:G930017L07 product:actin, beta,
cytoplasmic, full insert sequence
Length=1892
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 106 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 152
>dbj|AK145191.1| Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:G930017C13 product:actin, beta,
cytoplasmic, full insert sequence
Length=1266
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 106 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 152
>dbj|AK151010.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830020D20 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1263
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 103 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 149
>dbj|AK149920.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:G530105O18 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1265
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 106 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 152
>dbj|AK151999.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830044M14 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1266
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
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Sbjct 201807 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 201850
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human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1934
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Sbjct 226 CTCGTTGTCGACAATGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 275
>dbj|AK088691.1| Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:E430023M04 product:ACTIN,
CYTOPLASMIC 1 (BETA-ACTIN), full insert sequence
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Sbjct 103 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 149
>dbj|AK078935.1| Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:9130206A13 product:Mus musculus actin, beta,
cytoplasmic (Actb), full insert sequence
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Sbjct 106 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 152
>dbj|AK075973.1| Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:2510022L14 product:Mus musculus actin,
beta, cytoplasmic (Actb), full insert sequence
Length=1264
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Sbjct 103 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 149
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Sbjct 105 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 151
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emb|X60733.1| O.cuniculus mRNA for gamma-non muscle actin
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Sbjct 97 CTCGTGGTCGACAATGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 146
>gb|AC144818.4| Mus musculus BAC clone RP23-97O1 from chromosome 5, complete
sequence
Length=213322
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Sbjct 73183 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 73229
>gb|BC023204.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3461395), containing
frame-shift errors
Length=1805
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Sbjct 98 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 141
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gb|U39357.1|OAU39357 Ovis aries beta actin mRNA, complete cds
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Sbjct 108 CTCGTGGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 157
>gb|J04181.1|MUSACTMEL Mouse A-X actin mRNA, complete cds
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Sbjct 87 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCGA 133
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mRNA
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Sbjct 1 TCGTGGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCAGGCGA 49
>dbj|AK167825.1| Mus musculus TIB-55 BB88 cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:I730030O08 product:actin, beta, cytoplasmic, full
insert sequence
Length=1266
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Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCG 49
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Sbjct 106 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGCG 151
>ref|XR_748352.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 1-like
(LOC104665032), misc_RNA
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGC 48
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Sbjct 22 CTCGTTGTCGACAAAGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGC 69
>ref|XR_013702.2| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like (LOC711964),
miscRNA
Length=1786
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGC 48
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Sbjct 89 CTCGTTGTGGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGC 136
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 47
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Sbjct 56 CTCGTTGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 102
>ref|XM_008983711.1| PREDICTED: Callithrix jacchus actin, cytoplasmic 1 (LOC100406296),
mRNA
Length=1871
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Sbjct 187 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTTGCGGGCGA 230
>ref|XM_007186768.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni actin, beta (ACTB),
mRNA
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Sbjct 55 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 95
>ref|XM_007129304.1| PREDICTED: Physeter catodon actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1881
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Query 7 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 47
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Sbjct 66 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG 106
>ref|XM_006899045.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii actin, cytoplasmic 1-like (LOC102851783),
mRNA
Length=1128
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Sbjct 22 CTCGTGGTCGACAATGGCTCTGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>ref|XM_006886155.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=907
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Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 GTCATCGACAATGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
>ref|XM_005785082.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 putative actin (ACT-3) mRNA, complete
cds
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Sbjct 146 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCGGGCTTCGCGGGCGA 189
>ref|XM_005785080.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 hypothetical protein (EMIHUDRAFT_441780)
mRNA, complete cds
Length=1475
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Query 7 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 82 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCGGGCTTCGCGGGCGA 125
>ref|XM_005766710.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 putative actin (ACT-10) mRNA, complete
cds
Length=1601
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Query 7 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 146 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCGGGCTTCGCGGGCGA 189
>ref|XM_005766708.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 putative actin (ACT-9) mRNA, complete
cds
Length=1550
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Query 7 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 153 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCGGGCTTCGCGGGCGA 196
>ref|XM_005621020.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), transcript
variant X2, mRNA
Length=1924
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Query 7 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 138 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCAGGCGA 181
>ref|XM_005621019.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1993
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Query 7 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 138 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCAGGCGA 181
>ref|XR_273910.1| PREDICTED: Macaca fascicularis actin, cytoplasmic 1-like (LOC102118153),
misc_RNA
Length=1737
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 44 CTCGTTGTGGACAACAGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 93
>ref|XM_004695506.1| PREDICTED: Condylura cristata actin, cytoplasmic 2-like (LOC101631398),
mRNA
Length=1161
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 39 CTCGTCATCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCGGGCTTCGCCGGCGA 88
>ref|XR_177126.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta pseudogene (LOC101153021),
misc_RNA
Length=1222
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 22 CTCGTTGTTGACAACGGCTCTGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 71
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Query 7 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 102 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGGTTCGCGGGCGA 145
>gb|HQ682101.1| Ixodes ricinus beta actin mRNA, partial cds
Length=432
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 25 CTCGTTGTGGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCCGGCGA 74
>ref|NM_001195845.1| Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), mRNA
Length=2173
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Query 7 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 174 GTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCAGGCGA 217
>ref|XM_002435599.1| Ixodes scapularis hypothetical protein, mRNA
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Query 1 CTCGTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 186 CTCGTTGTGGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCCGGCGA 235
>dbj|AK283785.1| Gryllus bimaculatus mRNA, GBcontig30646
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Sbjct 122 GTCGTTGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCCGGCGA 168
>gb|EF095209.1| Homo sapiens beta-actin mRNA, partial cds
Length=364
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Query 10 GACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 50
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Sbjct 1 GACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGGCGA 41
>dbj|AK152083.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830047F13 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
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Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG-CGA 50
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Sbjct 106 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGGCGA 153
>dbj|AK152052.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830046H22 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1264
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Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG-CGA 50
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Sbjct 103 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGGCGA 150
>dbj|AK152043.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830046B04 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1267
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Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG-CGA 50
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Sbjct 106 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGGCGA 153
>dbj|AK151956.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830043N10 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1263
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Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG-CGA 50
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Sbjct 102 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGGCGA 149
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library, clone:I830086L04 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
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Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG-CGA 50
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Sbjct 106 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGGCGA 153
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library, clone:I830080J03 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
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Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG-CGA 50
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Sbjct 106 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGGCGA 153
>dbj|AK152470.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830074D14 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1264
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Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG-CGA 50
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Sbjct 103 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGGCGA 150
>dbj|AK152433.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830072C08 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1264
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Query 4 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAGGCCGGCTTCGCGGG-CGA 50
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Sbjct 103 GTCGTCGACAACGGCTCCGGCATGTGCAAAGCCGGCTTCGCGGGGCGA 150
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library, clone:I830055G08 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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genome shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188262, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC
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partial mRNA
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mRNA
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misc_RNA
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misc_RNA
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misc_RNA
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mRNA
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gene, encodes complete protein
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mRNA
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>ref|XR_176613.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, cytoplasmic 1-like
(LOC101153347), misc_RNA
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>ref|XM_004045059.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
2 (ACTB), mRNA
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>ref|XM_004045058.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
1 (ACTB), mRNA
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>ref|NG_003019.4| Homo sapiens actin, beta pseudogene 2 (ACTBP2) on chromosome
5
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Sbjct 396 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 347
>dbj|AK304552.1| Homo sapiens cDNA FLJ52842 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 1
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Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>ref|NG_007992.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB), RefSeqGene (LRG_132) on chromosome
7
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Sbjct 6290 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 6241
>ref|NM_001101.3| Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>dbj|AB385102.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5455, Homo sapiens ACTB
gene for actin, cytoplasmic 1, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
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Sbjct 221 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 172
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5' read ACTB mRNA
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Sbjct 183 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 134
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Sbjct 264 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 215
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Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>gb|DQ894128.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008588; FLH167999.01L;
RZPDo839A1191D actin, beta (ACTB) gene, encodes complete
protein
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Sbjct 234 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 185
>gb|DQ890960.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003590; FLH168003.01X; RZPDo839A1192D
actin, beta (ACTB) gene, encodes complete protein
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Sbjct 234 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 185
>gb|BC053988.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5920354, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 1106 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 1057
>gb|EF095209.1| Homo sapiens beta-actin mRNA, partial cds
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Sbjct 182 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 133
>gb|BC021242.1| Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter,
y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3677363),
**** WARNING: chimeric clone ****
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Sbjct 2529 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 2480
>gb|BC009275.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3960255), ****
WARNING: chimeric clone ****
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Sbjct 765 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 716
>dbj|AK225414.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC08987
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Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>gb|DQ471327.1| Homo sapiens PS1TP5-binding protein 1 (PS1TP5BP1) mRNA, complete
cds
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Sbjct 212 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 163
>gb|BC065493.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6482790, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 1915 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 1866
>gb|BC021035.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834434, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 3815 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 3864
>gb|BT019932.1| Synthetic construct Homo sapiens actin, beta mRNA, partial cds
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Sbjct 212 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 163
>gb|BC014861.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8968 IMAGE:3870487),
complete cds
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 286 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 237
>gb|BC013380.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:16525 IMAGE:4025526),
complete cds
Length=1820
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 287 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 238
>gb|BC001301.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:5475 IMAGE:3451917),
complete cds
Length=1805
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 279 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 230
>gb|BC016045.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:20387 IMAGE:4564532),
complete cds
Length=1841
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 287 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 238
>gb|BC004251.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:10559 IMAGE:3623067),
complete cds
Length=1811
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 273 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 224
>gb|BC012854.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3863361), partial
cds
Length=1729
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 169 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 120
>gb|AY582799.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB) gene, complete cds
Length=7399
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 3223 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 3174
>dbj|AK223055.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: KAT00430
Length=1643
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>dbj|AK223032.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: JTH03396
Length=1820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>dbj|AK222925.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC07191
Length=1833
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>gb|AC035147.4| Homo sapiens chromosome 5 clone CTD-2309M13, complete sequence
Length=104940
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 57096 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 57145
>gb|AC026692.5| Homo sapiens chromosome 5 clone CTC-257L10, complete sequence
Length=139377
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 109416 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 109367
>gb|AC006483.3| Homo sapiens BAC clone CTB-161C1 from 7, complete sequence
Length=196416
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171247 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 171198
>dbj|AK130157.1| Homo sapiens cDNA FLJ26647 fis, clone MPE04710, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1805
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>dbj|AK130062.1| Homo sapiens cDNA FLJ26552 fis, clone LNF01613, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1806
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>dbj|AK098751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25885 fis, clone CBR02968, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC TYPE 5
Length=1607
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 227 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 178
>dbj|AK058019.1| Homo sapiens cDNA FLJ25290 fis, clone STM07156, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC 1
Length=1804
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>gb|AF404278.1| Oryctolagus cuniculus beta-actin mRNA, partial cds
Length=238
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 171
>gb|BC008633.1|BC008633 Homo sapiens, actin, beta, clone IMAGE:4179564, mRNA, partial
cds
Length=1744
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 144
>dbj|AK025375.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21722 fis, clone COLF0522, highly similar
to HSACTB Homo sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1872
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>emb|X63432.1| H.sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1802
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 236
>emb|X00351.1| Human mRNA for beta-actin
Length=1761
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 253 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 204
>gb|AY891016.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH007203.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 212 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 163
>gb|AY889707.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116685.01X actin beta
(ACTB) mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 212 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 163
>gb|AY892160.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116681.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 212 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 163
>gb|BC002409.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8647 IMAGE:2961617),
complete cds
Length=1849
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 234
>gb|BC023204.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3461395), containing
frame-shift errors
Length=1805
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 233
>gb|BC014401.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3504279, containing frame-shift
errors
Length=1812
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transcript variant X1, mRNA
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misc_RNA
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Sbjct 212 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 163
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Sbjct 290 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 241
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mutant allele Lrrc58:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Sbjct 28308 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 28259
>gb|JN946857.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Lrrc58:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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clone: PtsC-1-5_F07
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Sbjct 293 GGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
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Sbjct 292 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 243
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Sbjct 292 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 243
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variant 3 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 327 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 278
>ref|XM_002802724.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 2 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 310 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 261
>ref|XM_002802723.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 1 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 307 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 258
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miscRNA
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Sbjct 279 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTGTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 230
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miscRNA
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Sbjct 287 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTTGTCGCC 238
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16
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Sbjct 373 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 324
>gb|FJ716131.1| Dicentrarchus labrax alpha actin mRNA, complete cds
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Sbjct 218 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 169
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Sbjct 2480 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 2431
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Sbjct 81 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 32
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sequence
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Sbjct 118571 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 118522
>gb|AC160987.4| Mus musculus BAC clone RP23-248O24 from chromosome 16, complete
sequence
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Sbjct 191234 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 191283
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Sbjct 237 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 188
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complete cds
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Sbjct 293 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 244
>dbj|AK147818.1| Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:G270053C20 product:F11 receptor, full insert sequence
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Sbjct 2456 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 2407
>dbj|AB169683.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-17788, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
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>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
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emb|CR860982.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A196 (from clone DKFZp459A196)
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Sbjct 313 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCTTCGTCGCC 264
>emb|CR860530.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A127 (from clone DKFZp459A127)
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Sbjct 1542 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 1493
>dbj|AB004047.1| Cercopithecus aethiops mRNA for beta-actin, complete cds
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Sbjct 222 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCATCGCC 173
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Sbjct 298 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 249
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1-like (LOC101045766), misc_RNA
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Sbjct 213 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 167
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1-like (LOC101041793), misc_RNA
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Sbjct 290 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 244
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mRNA
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Sbjct 384 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 338
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1-like (LOC101041536), misc_RNA
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Sbjct 217 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 171
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transcript variant X1, mRNA
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misc_RNA
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Sbjct 284 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTTGCC 235
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misc_RNA
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Sbjct 240 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 194
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misc_RNA
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Sbjct 214 ATGCGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 165
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transcript variant X2, mRNA
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mRNA
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Sbjct 313 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 267
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misc_RNA
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Sbjct 215 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 169
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misc_RNA
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Sbjct 285 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 239
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mRNA
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Sbjct 280 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 234
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mRNA
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Sbjct 293 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 247
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mRNA
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Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 250
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misc_RNA
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Sbjct 291 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 245
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mRNA
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Sbjct 371 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 325
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variant X3, partial mRNA
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Sbjct 283 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 237
>ref|XM_003510702.2| PREDICTED: Cricetulus griseus actin, gamma 1 (Actg1), transcript
variant X2, partial mRNA
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
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Sbjct 283 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 237
>ref|XM_003496882.2| PREDICTED: Cricetulus griseus actin, gamma 1 (Actg1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1900
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
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Sbjct 286 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 240
>ref|XM_007447079.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer actin, beta (ACTB), mRNA
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Sbjct 230 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 181
>ref|XM_007129304.1| PREDICTED: Physeter catodon actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1881
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 250 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 201
>ref|NG_007577.3| Homo sapiens actin, beta pseudogene 11 (ACTBP11) on chromosome
1
Length=1910
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Sbjct 396 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 350
>ref|XM_005618839.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris actin, alpha 1, skeletal muscle
(ACTA1), mRNA
Length=1548
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 324
>ref|XM_005320388.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus actin, alpha 1, skeletal
muscle (Acta1), transcript variant X3, mRNA
Length=1460
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 306 ATGGGGTACTTCAGAGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 257
>ref|XM_005320387.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus actin, alpha 1, skeletal
muscle (Acta1), transcript variant X2, mRNA
Length=1455
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATGGGGTACTTCAGAGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 252
>ref|XM_005320386.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus actin, alpha 1, skeletal
muscle (Acta1), transcript variant X1, mRNA
Length=1473
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 319 ATGGGGTACTTCAGAGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 270
>ref|XR_123365.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys POTE ankyrin domain family member
H-like (LOC100592762), misc_RNA
Length=2078
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 2017 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTTGCC 1968
>ref|XR_177126.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta pseudogene (LOC101153021),
misc_RNA
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Sbjct 212 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTTGCC 163
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misc_RNA
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Sbjct 212 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTTGCC 163
>ref|XR_173789.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta pseudogene (LOC101148119),
misc_RNA
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Sbjct 296 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 250
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Sbjct 212 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 166
>ref|NG_022872.1| Homo sapiens actin, gamma 2, smooth muscle, enteric pseudogene
(LOC391334) on chromosome 22
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Sbjct 303 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTTGCC 254
>ref|XM_002812357.1| PREDICTED: Pongo abelii POTE ankyrin domain family member I (LOC100436479),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 2401 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTTGCC 2352
>ref|NG_018190.1| Mus musculus predicted gene 4750 (Gm4750) pseudogene on chromosome
X
ref|NG_017989.1| Mus musculus predicted pseudogene 8464 (Gm8464) on chromosome
X
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Sbjct 309 ATGGGGTACTTCAGGGTCGGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 260
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Sbjct 180 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 131
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Sbjct 180 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 131
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Sbjct 171 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 122
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Sbjct 169 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 120
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Sbjct 139 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 90
>gb|AC200629.4| Pongo abelii BAC clone CH276-421J22 from chromosome 15, complete
sequence
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Sbjct 118832 ATGCGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 118783
>emb|BX890566.9| Mouse DNA sequence from clone RP23-342I1 on chromosome X, complete
sequence
Length=173737
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Sbjct 62105 ATGGGGTACTTCAGGGTCGGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 62056
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Sbjct 120502 ATGGGGTACTTCAGGGTCGGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 120551
>ref|NM_001285025.1| Macaca fascicularis actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB170391.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10647, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
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Sbjct 293 GGGTACTTCAGGGTGAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 247
>gb|AC146674.3| Callithrix jacchus clone CH259-338M13, complete sequence
Length=228448
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Sbjct 6427 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 6381
>gb|BC016624.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:4501052
Length=2224
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Sbjct 506 ATGGGGTACTTCAGGGTCGGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 457
>gb|AC146883.3| Callithrix jacchus clone CH259-225J7, complete sequence
Length=216802
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Sbjct 201991 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 201945
>gb|AY646115.1| Spermophilus citellus beta-actin mRNA, complete cds
Length=1190
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Sbjct 219 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 173
>gb|AC096542.2| Homo sapiens chromosome 1 clone RP11-332L18, complete sequence
Length=189411
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
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Sbjct 117123 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 117169
>emb|AL080243.21| Human DNA sequence from clone RP11-12M9 on chromosome 22, complete
sequence
Length=176287
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Sbjct 99410 ATGGGGTACTTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTTGCC 99459
>emb|BX548004.7| Mouse DNA sequence from clone RP23-334I1 on chromosome X, complete
sequence
Length=107181
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Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 62115 ATGGGGTACTTCAGGGTCGGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 62066
>ref|XM_009568861.1| PREDICTED: Cuculus canorus actin, cytoplasmic type 5 (LOC104066279),
transcript variant X1, mRNA
Length=1213
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTC 44
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Sbjct 277 ATGGGGTACTTCAAGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTC 234
>ref|XM_009297927.1| PREDICTED: Danio rerio zgc:86725 (zgc:86725), mRNA
Length=1380
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 ATGGGGTATTTGAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 271
>emb|LN595124.1| Cyprinus carpio genome assembly common carp genome ,scaffold
000004407
Length=103605
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Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22145 ATGGGGTATTTGAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 22099
>emb|LN590773.1| Cyprinus carpio genome assembly common carp genome ,scaffold
000000208
Length=1027199
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805269 ATGGGGTATTTGAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 805223
>ref|XR_618787.1| PREDICTED: Callithrix jacchus actin, cytoplasmic 2-like (LOC100407524),
misc_RNA
Length=1284
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 ATGGGGTACCTCAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 175
>ref|XM_008698477.1| PREDICTED: Ursus maritimus actin, beta (ACTB), partial mRNA
Length=1713
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143 ATGGGGTACTTGAGAGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 94
>ref|XM_007065846.1| PREDICTED: Chelonia mydas actin, cytoplasmic type 5-like (LOC102932532),
transcript variant X1, mRNA
Length=1755
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 223 ATGGGATACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGAGCCTCATCGCC 174
>ref|XM_006992672.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii actin, cytoplasmic
1-like (LOC102927578), mRNA
Length=1273
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 GGGTACTTCAGGGTCAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 238
>ref|XM_006992671.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii actin, cytoplasmic
1-like (LOC102927271), mRNA
Length=1846
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 GGGTACTTCAGGGTCAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 238
>ref|XM_003124280.3| PREDICTED: Sus scrofa actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1888
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 284
>ref|XM_005368002.1| PREDICTED: Microtus ochrogaster actin, beta (Actb), mRNA
Length=1867
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Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 301 GGGTACTTCAGGGTCAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 255
>ref|XM_004380831.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris actin, beta, transcript
variant 1 (ACTB), mRNA
Length=1724
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 168
>gb|KC292631.1| Microtus levis beta actin (Actb) mRNA, partial cds
Length=1717
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Query 4 GGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 180 GGGTACTTCAGGGTCAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 134
>gb|HM754625.1| Rachycentron canadum beta actin-1 gene, complete cds
Length=5072
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 ATGGGGTACTTCAAGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 983
>gb|HM107871.1| Myodes glareolus beta-actin mRNA, partial cds
Length=1062
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 50
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Sbjct 199 GGGTACTTCAGGGTCAGAATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTCGCC 153
>ref|XM_002916463.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca actin, cytoplasmic 1-like (LOC100481739),
mRNA
Length=1289
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 184
>gb|FJ713569.1| Hemibarbus mylodon muscle actin type 1 mRNA, complete cds
Length=1329
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 ATGGGGTATTTGAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 215
>emb|CR382374.13| Zebrafish DNA sequence from clone DKEY-151E22 in linkage group
25, complete sequence
Length=135516
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90991 ATGGGGTATTTGAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 91037
>emb|CR382364.23| Zebrafish DNA sequence from clone CH211-198E11 in linkage group
25, complete sequence
Length=206681
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59731 ATGGGGTATTTGAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 59685
>gb|AY550069.1| Sus scrofa cytoskeletal beta actin mRNA, partial cds
Length=1862
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 ATGGGGTACTTGAGGGTCAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 253
>emb|BX323069.12| Zebrafish DNA sequence from clone DKEYP-69D2 in linkage group
25, complete sequence
Length=54390
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19063 ATGGGGTATTTGAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 19017
>gb|BC071401.1| Danio rerio zgc:86725, mRNA (cDNA clone MGC:86725 IMAGE:6897544),
complete cds
Length=1381
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGGGTACTTCAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 47
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 ATGGGGTATTTGAGGGTGAGGATGCCTCTCTTGCTCTGGGCCTCGTC 254
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
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7
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**** WARNING: chimeric clone ****
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Sbjct 29 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 78
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clone ****
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complete cds
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Sbjct 19 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 68
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complete cds
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Sbjct 20 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 69
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complete cds
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Sbjct 12 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 61
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complete cds
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Sbjct 20 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 69
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complete cds
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Sbjct 6 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 55
>gb|AY582799.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB) gene, complete cds
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Sbjct 1962 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 2011
>dbj|AK223055.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: KAT00430
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Sbjct 29 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 78
>dbj|AK223032.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: JTH03396
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Sbjct 29 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 78
>dbj|AK222925.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC07191
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Sbjct 29 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 78
>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
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Sbjct 58 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 107
>gb|AC006483.3| Homo sapiens BAC clone CTB-161C1 from 7, complete sequence
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Sbjct 169986 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 170035
>gb|AY952326.1| Synthetic construct beta-actin GFP expression vector, complete
sequence
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Sbjct 3824 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 3873
>dbj|AK130157.1| Homo sapiens cDNA FLJ26647 fis, clone MPE04710, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
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Sbjct 29 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 78
>dbj|AK130062.1| Homo sapiens cDNA FLJ26552 fis, clone LNF01613, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
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Sbjct 29 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 78
>dbj|AK098751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25885 fis, clone CBR02968, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC TYPE 5
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Query 1 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 50
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Sbjct 29 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 78
>dbj|AK058019.1| Homo sapiens cDNA FLJ25290 fis, clone STM07156, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC 1
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Query 1 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 50
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Sbjct 29 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 78
>dbj|AK025375.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21722 fis, clone COLF0522, highly similar
to HSACTB Homo sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
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Query 1 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 50
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Sbjct 29 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 78
>dbj|D28354.1|HUMBA13 Homo sapiens mRNA for beta-actin, 5'UTR region
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Query 1 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 50
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Sbjct 29 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 78
>emb|X63432.1| H.sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
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Query 1 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 50
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Sbjct 18 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 67
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complete cds
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Query 1 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 50
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Sbjct 16 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 65
>gb|BC023204.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3461395), containing
frame-shift errors
Length=1805
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Sbjct 16 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 65
>gb|BC014401.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3504279, containing frame-shift
errors
Length=1812
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Query 1 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 50
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Sbjct 21 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 70
>gb|BC013835.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:4152631)
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>gb|M10277.1|HUMACCYBB Human cytoplasmic beta-actin gene, complete cds
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Query 1 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 50
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Sbjct 270 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 319
>ref|XM_008963291.1| PREDICTED: Pan paniscus actin, cytoplasmic 1 (LOC100990579),
mRNA
Length=1298
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 50
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Sbjct 35 CACAGAGCCTCGCCTTTGCTGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 84
>gb|BC021035.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834434, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Query 1 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCC-GCCCGTCCA-CACCCGCCGCCAG 50
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4085 CACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCCGCCCGTCCACCACCCGCCGCCAG 4034
>ref|XM_003277926.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys actin, cytoplasmic 1-like (LOC100598411),
mRNA
Length=1218
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 4 AGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 50
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 35 AGAGCCTCGCCTTTGCCGCTCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAG 81
Lambda K H
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Gapped
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7 7 5568774 5568874 100M GGTAGCGGGCCACTCACCTGGGTCATCTTCTCGCGGTTGGCCTTGGGGGTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGGGCTCCTCGGGAGCCACACGCA
7 7 5568777 5568877 100M AGCGGGCCACTCACCTGGGTCATCTTCTCGCGGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCT
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7 7 5568786 5568886 100M CTCACCTGGGTCATCTTCTCGCGGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCTCATTGTAGA
7 7 5568789 5568889 100M CCCTGGGTCATCTTCTCGCGGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGG
7 7 5568792 5568892 100M TGGGTCATCTTCTCGCGGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGT
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7 7 5568798 5568898 100M ATCTTCTCGCGGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGGGCC
7 7 5568801 5568901 100M TTCTCGCGGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGA
7 7 5568804 5568904 100M TCGCGGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATTT
7 7 5568807 5568907 100M GGGTTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCT
7 7 5568810 5568910 100M TTGGCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCA
7 7 5568813 5568913 100M GCCTTGGGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGT
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7 7 5568819 5568919 100M GGGTTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGTGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCC
7 7 5568822 5568922 100M TTCAGGGGGGCCTCGGTCAGCAGCACGGGGTGCTCCTCGGGAGCCACACGCAGCTCATTGTAGAAGGGGTGGTGCCAGATTTTCTCCATGTCGTCCCAGT
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7 7 5570205 5569245 48m860n52m AGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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7 7 5570199 5569239 54m860n46m GAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGCTCACCAT||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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assembly
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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sequence
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genome shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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>ref|NW_001838951.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188395, whole genome shotgun sequence
gb|DS486048.1| Homo sapiens SCAF_1103279188395 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 72287666 TCGCCCGTGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGATGACGAG 72287617
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 72974791 TCGCCCGTGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGATGACGAG 72974742
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 72287939 TCGCCCGTGAAGCTGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGATGACGAG 72287890
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shotgun sequence
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Lambda K H
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right flanking sequence - CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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>ref|NT_007819.18| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR7_CTG1
gb|GL000055.2| Homo sapiens chromosome 7 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
Length=58109653
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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>ref|NC_018918.2| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001615.2| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=159147065
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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>ref|NW_004929329.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
Length=50362920
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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Sbjct 5559804 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 5559755
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Length=152869804
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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Sbjct 5483177 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 5483128
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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>gb|DS990771.1| Homo sapiens SCAF_1112675837207 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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Sbjct 5280559 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 5280510
>ref|NW_001838998.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188262, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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Sbjct 5285008 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 5284959
>gb|CH471144.1| Homo sapiens 211000035837778 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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Sbjct 5472395 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 5472346
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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Sbjct 5482763 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 5482714
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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Sbjct 5616566 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 5616517
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
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Sbjct 5529998 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 5529949
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1.33 0.621 1.12
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG
>ref|XM_008575956.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus actin, cytoplasmic 1 (LOC103593038),
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 125 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 76
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gene, encodes complete protein
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 136 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 87
>ref|XM_003277926.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys actin, cytoplasmic 1-like (LOC100598411),
mRNA
Length=1218
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 158 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 109
>ref|XM_004045059.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
2 (ACTB), mRNA
Length=1945
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 279 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 230
>ref|XM_004045058.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta, transcript variant
1 (ACTB), mRNA
Length=1785
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
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Sbjct 119 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 70
>ref|NM_031144.3| Rattus norvegicus actin, beta (Actb), mRNA
Length=1293
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 149 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 100
>emb|FQ232650.1| Rattus norvegicus TL0AEA64YO15 mRNA sequence
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Sbjct 151 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 102
>emb|FQ232063.1| Rattus norvegicus TL0AEA67YC11 mRNA sequence
Length=1288
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Sbjct 151 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 102
>emb|FQ231503.1| Rattus norvegicus TL0AEA6YE04 mRNA sequence
Length=1288
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 151 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 102
>dbj|AK304552.1| Homo sapiens cDNA FLJ52842 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 1
Length=1486
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>dbj|AK301372.1| Homo sapiens cDNA FLJ55253 complete cds, highly similar to Actin,
cytoplasmic 1
Length=1255
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>ref|NG_007992.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB), RefSeqGene (LRG_132) on chromosome
7
Length=10454
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Sbjct 6015 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 5966
>ref|NM_001101.3| Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1852
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>dbj|AB385102.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB5455, Homo sapiens ACTB
gene for actin, cytoplasmic 1, complete cds, without stop codon,
in Flexi system
Length=1142
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Sbjct 80 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 31
>dbj|AK308277.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98225
Length=1499
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>dbj|AK309997.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17039
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>gb|DQ894128.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008588; FLH167999.01L;
RZPDo839A1191D actin, beta (ACTB) gene, encodes complete
protein
Length=1168
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Sbjct 93 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 44
>gb|DQ890960.2| Synthetic construct clone IMAGE:100003590; FLH168003.01X; RZPDo839A1192D
actin, beta (ACTB) gene, encodes complete protein
Length=1168
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 93 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 44
>gb|BC053988.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5920354, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2633
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Sbjct 965 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 916
>gb|BC021242.1| Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter,
y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3677363),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=4112
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 2388 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 2339
>gb|BC009275.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3960255), ****
WARNING: chimeric clone ****
Length=2308
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 624 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 575
>dbj|AK225414.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC08987
Length=1656
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>gb|DQ471327.1| Homo sapiens PS1TP5-binding protein 1 (PS1TP5BP1) mRNA, complete
cds
Length=1128
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 22
>gb|BC065493.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6482790, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3439
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 1774 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 1725
>gb|BC021035.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834434, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4951
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 3957 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 4006
>gb|BT019932.1| Synthetic construct Homo sapiens actin, beta mRNA, partial cds
Length=1128
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 22
>gb|BC014861.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8968 IMAGE:3870487),
complete cds
Length=1884
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 145 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 96
>gb|BC013380.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:16525 IMAGE:4025526),
complete cds
Length=1820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 146 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 97
>gb|BC001301.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:5475 IMAGE:3451917),
complete cds
Length=1805
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 138 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 89
>gb|BC016045.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:20387 IMAGE:4564532),
complete cds
Length=1841
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 146 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 97
>gb|BC004251.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:10559 IMAGE:3623067),
complete cds
Length=1811
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 132 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 83
>gb|AY582799.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB) gene, complete cds
Length=7399
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 2948 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 2899
>gb|BC063166.1| Rattus norvegicus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:72783 IMAGE:6920838),
complete cds
Length=1296
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 152 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 103
>dbj|AK223055.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: KAT00430
Length=1643
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>dbj|AK222925.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC07191
Length=1833
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>gb|AC006483.3| Homo sapiens BAC clone CTB-161C1 from 7, complete sequence
Length=196416
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 170972 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 170923
>ref|NM_001133354.1| Pongo abelii actin, beta (ACTB), mRNA
emb|CR860982.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A196 (from clone DKFZp459A196)
Length=1844
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 172 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 123
>emb|CR860530.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459A127 (from clone DKFZp459A127)
Length=1833
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>dbj|AK130157.1| Homo sapiens cDNA FLJ26647 fis, clone MPE04710, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1805
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>dbj|AK130062.1| Homo sapiens cDNA FLJ26552 fis, clone LNF01613, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1806
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>dbj|AK058019.1| Homo sapiens cDNA FLJ25290 fis, clone STM07156, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC 1
Length=1804
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>gb|AF404278.1| Oryctolagus cuniculus beta-actin mRNA, partial cds
Length=238
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 30
>gb|BC008633.1|BC008633 Homo sapiens, actin, beta, clone IMAGE:4179564, mRNA, partial
cds
Length=1744
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 52 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 3
>dbj|AK025375.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21722 fis, clone COLF0522, highly similar
to HSACTB Homo sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1872
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>emb|V01217.1| Rat gene encoding cytoplasmic beta-actin
Length=4100
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 1265
>emb|X63432.1| H.sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1802
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 144 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 95
>emb|X00351.1| Human mRNA for beta-actin
Length=1761
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 112 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 63
>gb|AY891016.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH007203.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 22
>gb|AY889707.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116685.01X actin beta
(ACTB) mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 22
>gb|AY892160.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH116681.01L actin beta
(ACTB) mRNA, partial cds
Length=1128
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 22
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Sbjct 142 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 93
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errors
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Sbjct 147 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 98
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Sbjct 143 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 94
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Sbjct 143 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 94
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mRNA
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Sbjct 154 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 105
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Sbjct 263 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 214
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Sbjct 263 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 214
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Sbjct 346 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 297
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mRNA
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Sbjct 161 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 112
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 22
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Sbjct 187 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 138
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mRNA
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Sbjct 149 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 100
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Sbjct 80 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 31
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X2, mRNA
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Sbjct 109 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 60
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Sbjct 165 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 116
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variant X4, mRNA
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Sbjct 92 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 43
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variant X3, mRNA
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Sbjct 101 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 52
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variant X2, mRNA
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Sbjct 86 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 37
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variant X1, mRNA
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Sbjct 92 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 43
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Sbjct 94 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 45
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 158 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACGACGAG 109
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transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 141 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACGACGAG 92
>ref|XM_005340038.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus actin, beta (Actb),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 150 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACGACGAG 101
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X1, mRNA
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Sbjct 195 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 146
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variant X3, mRNA
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Sbjct 158 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 109
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variant X2, mRNA
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Sbjct 227 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 178
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variant X1, mRNA
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Sbjct 227 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 178
>ref|XM_004894015.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, beta (Actb), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 227 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 178
>ref|XM_004894014.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber actin, beta (Actb), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 227 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 178
>ref|XM_004380832.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris actin, beta, transcript
variant 2 (ACTB), mRNA
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 22
>ref|XM_004380831.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris actin, beta, transcript
variant 1 (ACTB), mRNA
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Sbjct 76 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 27
>gb|JX446579.1| Capra hircus breed Kajang beta-actin mRNA, partial cds
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 22
>dbj|AK306863.1| Pan troglodytes mRNA for actin, cytoplasmic 1, complete cds,
clone: PtsC-1-5_F07
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 106
>ref|XM_002802726.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 4 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 153 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 104
>ref|XM_002802725.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 3 (LOC100428865), mRNA
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Sbjct 186 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 137
>ref|XM_002802724.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 2 (LOC100428865), mRNA
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 169 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 120
>ref|XM_002802723.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 1 (LOC100428865), mRNA
Length=1854
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 166 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 117
>gb|BC142413.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:159611 IMAGE:8448844),
complete cds
Length=1845
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Sbjct 159 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 110
>gb|BT030480.1| Bos taurus actin, beta (ACTB), mRNA, complete cds
Length=1776
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 100 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 51
>gb|DQ661647.1| Bubalus bubalis beta-actin mRNA, complete cds
Length=1143
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Sbjct 81 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 32
>ref|NM_001285025.1| Macaca fascicularis actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB170391.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10647, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1729
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 106
>gb|DQ838049.1| Bos grunniens beta-actin mRNA, complete cds
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 22
>ref|NM_001033084.1| Macaca mulatta actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1584
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 96 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 47
>gb|AY141970.1| Bos taurus beta-actin (ACTB) mRNA, complete cds
Length=1804
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 110 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 61
>ref|NM_173979.3| Bos taurus actin, beta (ACTB), mRNA
gb|BC102948.1| Bos taurus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:128179 IMAGE:7945368),
complete cds
Length=1948
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 163 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 114
>dbj|AK223032.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: JTH03396
Length=1820
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 106
>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1850
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 184 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 135
>gb|AY646115.1| Spermophilus citellus beta-actin mRNA, complete cds
Length=1190
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 78 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACGACGAG 29
>ref|NM_001081838.1| Equus caballus actin, beta (ACTB), mRNA
gb|AF035774.1|AF035774 Equus caballus beta actin mRNA, complete cds
Length=1128
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 22
>dbj|AB004047.1| Cercopithecus aethiops mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1138
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 81 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 32
>ref|XR_504851.1| PREDICTED: Tarsius syrichta actin, cytoplasmic 1-like (LOC103269026),
misc_RNA
Length=1135
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGA 49
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Sbjct 72 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACGACGA 24
>gb|DQ826531.1| Chinchilla lanigera beta-actin mRNA, partial cds
Length=351
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGA 49
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Sbjct 46 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGA 1
>dbj|AK098751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25885 fis, clone CBR02968, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC TYPE 5
Length=1607
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 GCCCACGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 106
>gb|KM491709.1| Macaca fascicularis beta-actin (ACTB) mRNA, partial cds
Length=1126
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 62 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCATTGTCGACAACGAG 13
>ref|XM_010345369.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis actin, beta (ACTB),
mRNA
Length=1900
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
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Sbjct 243 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 200
>ref|XM_002751780.3| PREDICTED: Callithrix jacchus actin, cytoplasmic 1-like (LOC100412618),
mRNA
Length=1794
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
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Sbjct 139 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 96
>ref|XM_008998197.1| PREDICTED: Callithrix jacchus actin-1-like (LOC100895380), partial
mRNA
Length=438
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
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Sbjct 152 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 109
>ref|XM_002748970.3| PREDICTED: Callithrix jacchus actin, cytoplasmic 1-like (LOC100404409),
mRNA
Length=1805
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
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Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 112
>ref|XR_504827.1| PREDICTED: Tarsius syrichta actin, cytoplasmic 1-like (LOC103268595),
misc_RNA
Length=1150
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 100 TCGCCCCCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACGACGAG 51
>ref|XM_007447079.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1791
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 86 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 40
>ref|XM_006859867.1| PREDICTED: Chrysochloris asiatica actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1059
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 68 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 22
>ref|XM_006895663.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii Ral GTPase activating protein,
alpha subunit 2 (catalytic) (RALGAPA2), mRNA
Length=5829
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 5771 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCATTGTCGACCACGAG 5722
>ref|XR_438857.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii actin, cytoplasmic 1-like (LOC102861830),
misc_RNA
Length=833
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCATTGTCGACCACGAG 22
>ref|XR_438835.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii actin, cytoplasmic 1-like (LOC102857579),
misc_RNA
Length=1129
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCATTGTCGACCACGAG 22
>ref|XM_006210388.1| PREDICTED: Vicugna pacos actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1724
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 72 TCGCCTGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 23
>ref|XM_006176094.1| PREDICTED: Camelus ferus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1734
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 79 TCGCCTGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 30
>ref|XM_005697908.1| PREDICTED: Capra hircus actin, cytoplasmic 1-like (LOC102179831),
transcript variant X2, mRNA
Length=1638
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 96 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACCACGAG 47
>ref|XM_005697907.1| PREDICTED: Capra hircus actin, cytoplasmic 1-like (LOC102179831),
transcript variant X1, mRNA
Length=1766
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 95 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACCACGAG 46
>ref|XM_003124280.3| PREDICTED: Sus scrofa actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1888
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 189 TCGCCCGCAAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 140
>ref|XM_005397842.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera actin, beta (Actb), mRNA
Length=1833
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 183 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 137
>ref|XM_005003653.1| PREDICTED: Cavia porcellus actin, beta (Actb), transcript variant
X1, mRNA
Length=1813
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 154 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 108
>ref|XM_004648829.1| PREDICTED: Octodon degus actin, cytoplasmic 1-like (LOC101588623),
partial mRNA
Length=915
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 68 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 22
>ref|XR_192401.1| PREDICTED: Octodon degus actin, cytoplasmic 1-like (LOC101565700),
misc_RNA
Length=530
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 68 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACAACGAG 22
>ref|XM_004617349.1| PREDICTED: Sorex araneus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1302
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 75 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCATTGTCGACCACGAG 26
>ref|XM_004448468.1| PREDICTED: Dasypus novemcinctus actin, cytoplasmic 1-like (LOC101430119),
mRNA
Length=603
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 145 TCGCCCGCAAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 96
>ref|XM_004440874.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum actin, beta, transcript
variant 2 (ACTB), mRNA
Length=1800
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 138 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCAGAGCCGTTGTCGACCACGAG 89
>ref|XM_004440873.1| PREDICTED: Ceratotherium simum simum actin, beta, transcript
variant 1 (ACTB), mRNA
Length=1817
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 155 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCAGAGCCGTTGTCGACCACGAG 106
>ref|XM_004310959.1| PREDICTED: Tursiops truncatus actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1776
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 86 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 40
>ref|XM_004268956.1| PREDICTED: Orcinus orca actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1848
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 152 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGAG 106
>gb|JX046106.1| Capra hircus beta-actin (ACTB) mRNA, complete cds
Length=1147
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 79 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACCACGAG 30
>gb|HM067830.1| Ovis aries clone ACTB_SLIP_1 beta-actin variant 2 (ACTB) mRNA,
complete cds
Length=1905
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 143 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACCACGAG 94
>ref|XM_002610521.1| Branchiostoma floridae hypothetical protein, mRNA
Length=1214
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 74 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCATTGTCAACGACGAG 25
>gb|BC138614.1| Mus musculus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:170239 IMAGE:8861634),
complete cds
Length=1584
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 71
>gb|BC138611.1| Mus musculus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:170236 IMAGE:8861631),
complete cds
Length=1584
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 71
>ref|NM_007393.3| Mus musculus actin, beta (Actb), mRNA
Length=1889
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 150 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 104
>gb|EF043617.1| Synthetic construct clone ATCC 10373495 beta actin mRNA, complete
cds
Length=1128
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 25
>gb|BC083054.1| Mus musculus cDNA clone IMAGE:5292509
Length=1420
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 84
>gb|AY550069.1| Sus scrofa cytoskeletal beta actin mRNA, partial cds
Length=1862
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 149 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 103
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Sbjct 149 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 103
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Sbjct 152 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
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library, clone:I830011N18 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
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Sbjct 152 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
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library, clone:I830011L20 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
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Sbjct 152 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
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enriched library, clone:G930034F16 product:actin, beta,
cytoplasmic, full insert sequence
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Sbjct 152 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
>dbj|AK166349.1| Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:G830047A17 product:actin, beta,
cytoplasmic, full insert sequence
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Sbjct 152 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
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Sbjct 201850 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 201807
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human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1934
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Sbjct 275 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCATTGTCGACAACGAG 226
>dbj|AK088691.1| Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:E430023M04 product:ACTIN,
CYTOPLASMIC 1 (BETA-ACTIN), full insert sequence
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Sbjct 149 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 103
>dbj|AK078935.1| Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:9130206A13 product:Mus musculus actin, beta,
cytoplasmic (Actb), full insert sequence
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Sbjct 152 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
>dbj|AK075973.1| Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:2510022L14 product:Mus musculus actin,
beta, cytoplasmic (Actb), full insert sequence
Length=1264
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Sbjct 149 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 103
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Sbjct 151 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 105
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emb|X60733.1| O.cuniculus mRNA for gamma-non muscle actin
Length=1839
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Sbjct 146 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCATTGTCGACCACGAG 97
>gb|AC144818.4| Mus musculus BAC clone RP23-97O1 from chromosome 5, complete
sequence
Length=213322
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Sbjct 73229 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 73183
>gb|BC023204.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3461395), containing
frame-shift errors
Length=1805
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Sbjct 141 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 98
>ref|NM_001009784.1| Ovis aries actin, beta (ACTB), mRNA
gb|U39357.1|OAU39357 Ovis aries beta actin mRNA, complete cds
Length=2191
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Sbjct 157 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACCACGAG 108
>gb|J04181.1|MUSACTMEL Mouse A-X actin mRNA, complete cds
Length=1857
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
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Sbjct 133 TCGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 87
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mRNA
Length=1795
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Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGA 49
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Sbjct 49 TCGCCTGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACCACGA 1
>dbj|AK167825.1| Mus musculus TIB-55 BB88 cDNA, RIKEN full-length enriched library,
clone:I730030O08 product:actin, beta, cytoplasmic, full
insert sequence
Length=1266
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Strand=Plus/Minus
Query 2 CGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 151 CGCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
>ref|XR_748352.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana actin, cytoplasmic 1-like
(LOC104665032), misc_RNA
Length=1237
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Query 3 GCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 69 GCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCTTTGTCGACAACGAG 22
>ref|XR_013702.2| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like (LOC711964),
miscRNA
Length=1786
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 46/48 (96%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 GCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 136 GCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCCACAACGAG 89
>ref|XM_010642839.1| PREDICTED: Fukomys damarensis actin, beta (Actb), mRNA
Length=1356
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Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 102 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACAACGAG 56
>ref|XM_008983711.1| PREDICTED: Callithrix jacchus actin, cytoplasmic 1 (LOC100406296),
mRNA
Length=1871
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230 TCGCCCGCAAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 187
>ref|XM_007186768.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni actin, beta (ACTB),
mRNA
Length=1765
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Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 95 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 55
>ref|XM_007129304.1| PREDICTED: Physeter catodon actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1881
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 4 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
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Sbjct 106 CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 66
>ref|XM_006899045.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii actin, cytoplasmic 1-like (LOC102851783),
mRNA
Length=1128
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCAGAGCCATTGTCGACCACGAG 22
>ref|XM_006886155.1| PREDICTED: Elephantulus edwardii actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA
Length=907
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCATTGTCGATGAC 25
>ref|XM_005785082.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 putative actin (ACT-3) mRNA, complete
cds
Length=1529
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 TCGCCCGCGAAGCCCGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 146
>ref|XM_005785080.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 hypothetical protein (EMIHUDRAFT_441780)
mRNA, complete cds
Length=1475
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125 TCGCCCGCGAAGCCCGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 82
>ref|XM_005766710.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 putative actin (ACT-10) mRNA, complete
cds
Length=1601
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 TCGCCCGCGAAGCCCGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 146
>ref|XM_005766708.1| Emiliania huxleyi CCMP1516 putative actin (ACT-9) mRNA, complete
cds
Length=1550
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 TCGCCCGCGAAGCCCGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 153
>ref|XM_005621020.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), transcript
variant X2, mRNA
Length=1924
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCGCCTGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 138
>ref|XM_005621019.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), transcript
variant X1, mRNA
Length=1993
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCGCCTGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 138
>ref|XR_273910.1| PREDICTED: Macaca fascicularis actin, cytoplasmic 1-like (LOC102118153),
misc_RNA
Length=1737
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 93 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCTGTTGTCCACAACGAG 44
>ref|XM_004695506.1| PREDICTED: Condylura cristata actin, cytoplasmic 2-like (LOC101631398),
mRNA
Length=1161
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 88 TCGCCGGCGAAGCCCGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGATGACGAG 39
>ref|XR_177126.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla actin, beta pseudogene (LOC101153021),
misc_RNA
Length=1222
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
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Sbjct 71 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCAGAGCCGTTGTCAACAACGAG 22
>gb|JF417981.1| Helicoverpa armigera actin mRNA, complete cds
Length=1348
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145 TCGCCCGCGAACCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 102
>gb|HQ682101.1| Ixodes ricinus beta actin mRNA, partial cds
Length=432
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 74 TCGCCGGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCCACAACGAG 25
>ref|NM_001195845.1| Canis lupus familiaris actin, beta (ACTB), mRNA
Length=2173
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 TCGCCTGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 174
>ref|XM_002435599.1| Ixodes scapularis hypothetical protein, mRNA
Length=306
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 235 TCGCCGGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCCACAACGAG 186
>dbj|AK283785.1| Gryllus bimaculatus mRNA, GBcontig30646
Length=941
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
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Sbjct 168 TCGCCGGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCAACGAC 122
>gb|EF095209.1| Homo sapiens beta-actin mRNA, partial cds
Length=364
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTC 41
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTC 1
>dbj|AK152083.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830047F13 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1267
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Query 1 TCG-CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 TCGCCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
>dbj|AK152052.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830046H22 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1264
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCG-CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 150 TCGCCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 103
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library, clone:I830046B04 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCG-CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 TCGCCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
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library, clone:I830043N10 product:actin, beta, cytoplasmic,
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Query 1 TCG-CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCGCCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 102
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library, clone:I830086L04 product:actin, beta, cytoplasmic,
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Identities = 46/48 (96%), Gaps = 1/48 (2%)
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Query 1 TCG-CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
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Sbjct 153 TCGCCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
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library, clone:I830080J03 product:actin, beta, cytoplasmic,
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Query 1 TCG-CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
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Sbjct 153 TCGCCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
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Query 1 TCG-CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 150 TCGCCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 103
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library, clone:I830072C08 product:actin, beta, cytoplasmic,
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Query 1 TCG-CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 150 TCGCCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 103
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Query 1 TCG-CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 TCGCCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
>dbj|AK151898.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830042F20 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1264
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Query 1 TCG-CCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 150 TCGCCCCGCGAAGCCGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 103
>dbj|AK150854.1| Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I830016F03 product:actin, beta, cytoplasmic,
full insert sequence
Length=1267
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGG-CCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 47
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 TCGCCCGCGAAGCCGGGCTTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGAC 106
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Length=568
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Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TCGCCCGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 44
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 71 TCGCCTGCGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGAC 28
>gb|M26111.1|GOOACTB Goose beta-actin mRNA, complete cds
Length=1994
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 8 CGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGACGACGAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 139 CGAAGCCGGCCTTGCACATGCCGGAGCCGTTGTCGATGACGAG 97
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG
>ref|NG_007992.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB), RefSeqGene (LRG_132) on chromosome
7
Length=10454
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5012 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 5061
>ref|NM_001101.3| Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1852
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>dbj|AK308277.1| Homo sapiens cDNA, FLJ98225
Length=1499
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>dbj|AK309997.1| Homo sapiens cDNA, FLJ17039
Length=1846
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>gb|BC053988.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:5920354, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2633
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 871
>gb|BC021242.1| Homo sapiens solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter,
y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3677363),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=4112
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2245 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 2294
>dbj|AK225414.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC08987
Length=1656
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>gb|BC014861.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8968 IMAGE:3870487),
complete cds
Length=1884
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 51
>gb|BC013380.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:16525 IMAGE:4025526),
complete cds
Length=1820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 52
>gb|BC016045.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:20387 IMAGE:4564532),
complete cds
Length=1841
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 52
>gb|AY582799.1| Homo sapiens actin, beta (ACTB) gene, complete cds
Length=7399
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1945 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 1994
>dbj|AK223055.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: KAT00430
Length=1643
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>dbj|AK223032.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: JTH03396
Length=1820
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>dbj|AK222925.1| Homo sapiens mRNA for beta actin variant, clone: HRC07191
Length=1833
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>ref|NM_001009945.1| Pan troglodytes actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB188274.1| Pan troglodytes verus actb mRNA for beta-actin, complete cds
Length=1850
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 90
>gb|AC006483.3| Homo sapiens BAC clone CTB-161C1 from 7, complete sequence
Length=196416
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169969 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 170018
>gb|AY952326.1| Synthetic construct beta-actin GFP expression vector, complete
sequence
Length=8085
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3807 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 3856
>dbj|AK130157.1| Homo sapiens cDNA FLJ26647 fis, clone MPE04710, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1805
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>dbj|AK130062.1| Homo sapiens cDNA FLJ26552 fis, clone LNF01613, highly similar
to Actin, cytoplasmic 1
Length=1806
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>dbj|AK098751.1| Homo sapiens cDNA FLJ25885 fis, clone CBR02968, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC TYPE 5
Length=1607
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>dbj|AK058019.1| Homo sapiens cDNA FLJ25290 fis, clone STM07156, highly similar
to ACTIN, CYTOPLASMIC 1
Length=1804
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>dbj|AK025375.1| Homo sapiens cDNA: FLJ21722 fis, clone COLF0522, highly similar
to HSACTB Homo sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1872
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>dbj|D28354.1|HUMBA13 Homo sapiens mRNA for beta-actin, 5'UTR region
Length=90
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 61
>emb|X63432.1| H.sapiens ACTB mRNA for mutant beta-actin (beta'-actin)
Length=1802
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
>gb|BC014401.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3504279, containing frame-shift
errors
Length=1812
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 53
>gb|BC013835.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:4152631)
Length=1834
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 49
>gb|BC065493.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6482790, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=3439
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633 CGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 1680
>gb|BC002409.2| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:8647 IMAGE:2961617),
complete cds
Length=1849
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 48
>gb|BC023204.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3461395), containing
frame-shift errors
Length=1805
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 48
>ref|XM_003895688.2| PREDICTED: Papio anubis actin, beta (ACTB), mRNA
Length=1910
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 120 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGCTCCGCCGCCCG 169
>ref|XM_008963291.1| PREDICTED: Pan paniscus actin, cytoplasmic 1 (LOC100990579),
mRNA
Length=1298
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 18 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCTGATCCGCCGCCCG 67
>ref|XM_008018962.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus actin-1 (LOC103246954), mRNA
Length=635
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 44 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGCTCCGCCGCCCG 93
>ref|XM_007969038.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus actin, cytoplasmic 1 (LOC103219323),
mRNA
Length=1816
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGCTCCGCCGCCCG 55
>ref|XM_002802726.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 4 (LOC100428865), mRNA
Length=1757
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 10 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGCTCCGCCGCCCG 59
>ref|XM_002802725.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 3 (LOC100428865), mRNA
Length=1874
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 43 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGCTCCGCCGCCCG 92
>ref|XM_002802724.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 2 (LOC100428865), mRNA
Length=1857
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 26 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGCTCCGCCGCCCG 75
>ref|XM_002802723.1| PREDICTED: Macaca mulatta actin, cytoplasmic 1-like, transcript
variant 1 (LOC100428865), mRNA
Length=1854
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 23 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGCTCCGCCGCCCG 72
>ref|NM_001285025.1| Macaca fascicularis actin, beta (ACTB), mRNA
dbj|AB170391.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QmoA-10647, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1729
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 12 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGCTCCGCCGCCCG 61
>dbj|AB169683.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-17788, similar to
human actin, beta (ACTB), mRNA, RefSeq: NM_001101.2
Length=1934
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 132 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGCTCCGCCGCCCG 181
>gb|M10277.1|HUMACCYBB Human cytoplasmic beta-actin gene, complete cds
Length=3646
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 254 CGCGTCCG-CCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 302
>gb|BC021035.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3834434, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=4951
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCC-GCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4099 GTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCCGCCCG 4052
>gb|BC001301.1| Homo sapiens actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:5475 IMAGE:3451917),
complete cds
Length=1805
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 CGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCG 44
>ref|XR_635573.1| PREDICTED: Papio anubis actin, cytoplasmic 1-like (LOC101008554),
misc_RNA
Length=2173
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 47/49 (96%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCC 49
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 366 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTGGCCGCTCCGCCGCCC 414
>gb|JN964682.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Vmp1:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=37851
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964681.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Gusb:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38885
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964680.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Adipor2:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38511
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964679.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Uvrag:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38093
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964678.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Fam117a:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38080
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964677.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Tcfe3:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38128
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964676.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Sez6l2:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38766
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964675.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Tyk2:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38453
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964674.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Fam115a:tm2e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=40485
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
>gb|JN964673.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Cdh9:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=38070
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
>gb|JN964672.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Edem1:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38253
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964671.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Srek1:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=37918
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964670.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Srpx:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=37915
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964669.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Defb40:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38079
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964668.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Ern1:tm1e(KOMP)Ucd; transgenic
Length=39010
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964667.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Kctd21:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=38676
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964666.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Gpr63:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=39873
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964665.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Hp:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38713
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964664.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Gabpb1:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=40086
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964663.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Mob3b:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=38525
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964662.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Tbk1:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=37966
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964661.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Nme5:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38393
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964660.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Dlg5:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=37894
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964659.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Lman1:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=38188
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
>gb|JN964658.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Prkci:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=37960
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964657.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Scn3a:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38035
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964656.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Qrfp:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38097
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964655.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Tigd3:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=40081
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964654.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Tmem87a:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=37846
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964653.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Mtmr3:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38393
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964652.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Sdhb:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=37920
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964651.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Thoc4:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38066
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964650.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Mapre1:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38018
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964649.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Mrgprd:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=37475
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964648.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Sh3tc1:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
Length=38000
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964647.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Ces1f:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
Length=38055
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
>gb|JN964646.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Dysf:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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mutant allele Zic3:tm1a(EUCOMM)Wtsi tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Card10:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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mutant allele Epb4.9:tm1a(KOMP)Ucd; transgenic
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mutant allele Trp53:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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mutant allele Ccl5:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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mutant allele Pcsk5:tm1a(KOMP)Ucd; transgenic
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>gb|JN964614.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Kcnc4:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Rbpj:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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mutant allele Hp:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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>gb|JN964611.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Dbp:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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>gb|JN964610.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Crygd:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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>gb|JN964609.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Gm4567:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
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>gb|JN964608.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Gm6878:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
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>gb|JN964607.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Gm6268:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964606.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Phldb3:tm1(KOMP)Ucd;
transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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>gb|JN964605.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele A230083G16Rik:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
>gb|JN964604.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Zmiz1:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
>gb|JN964603.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Hjurp:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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>gb|JN964602.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Irgq:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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mutant allele Pkd1l2:tm1a(KOMP)Ucd; transgenic
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Ambra1:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
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mutant allele Fam55d:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Nkain2:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
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mutant allele Dnttip2:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
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mutant allele Seh1l:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
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Pitpnc1:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
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mutant allele Dlg5:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964574.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Ubr5:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
>gb|JN964573.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Ankrd33b:tm1e(KOMP)Ucd; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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Rpf1:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
>gb|JN964571.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Hfe2:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964570.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Hemk1:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964569.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Nup35:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964568.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Snapc3:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
>gb|JN964567.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Ssu72:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
>gb|JN964566.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Ngdn:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964565.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Lingo1:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964564.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Fam188a:tm1a(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
>gb|JN964563.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele 5730528L13Rik:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
>gb|JN964562.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Rcan1:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964561.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Lin28a:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20649 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20690
>gb|JN964560.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Larp1:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
>gb|JN964559.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Pdss1:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964558.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Nphs1:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964557.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Ncdn:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964556.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Fhl2:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
>gb|JN964555.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Lancl1:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
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mutant allele Cnga2:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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Myo5b:tm2e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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mutant allele Dbndd2:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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mutant allele Gucy2f:tm2a(KOMP)Wtsi; transgenic
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>gb|JN964538.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Ubp1:tm1e(KOMP)Ucd; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
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mutant allele Ppm1b:tm1a(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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4922502D21Rik:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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Pyroxd1:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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Ehmt1:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964521.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964520.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
S100a14:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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>gb|JN964519.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Atp5d:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964518.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Cdh17:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
>gb|JN964516.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Aqp4:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
>gb|JN964515.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Utp14b:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Slfn3:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
>gb|JN964513.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Tcfcp2:tm1e(KOMP)Ucd; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
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Hoxb2:tm1e(KOMP)Wtsi; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20699 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20740
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Ccnd1:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20701 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20742
>gb|JN964510.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Ass1:tm1e(EUCOMM)Hmgu; transgenic
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Query 1 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 42
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Sbjct 20700 CGCGTCCGCCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCC 20741
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Defb45:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Ccdc83:tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Sbjct 9527028 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 9527077
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HuRef SCAF_1103279188377, whole genome shotgun sequence
gb|DS486029.1| Homo sapiens SCAF_1103279188377 genomic scaffold, whole genome
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sequence
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Sbjct 4176071 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 4176120
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shotgun sequence
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Sbjct 10888640 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 10888689
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Sbjct 11083972 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 11084021
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Sbjct 11005206 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 11005255
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Lambda K H
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right flanking sequence - ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA
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>ref|NT_007819.18| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR7_CTG1
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assembly
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Sbjct 10972372 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 10972421
>ref|NC_018918.2| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Sbjct 11022560 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 11022609
>ref|NW_004929329.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150113.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 11012560 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 11012609
>gb|KE141248.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold159, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 11758853 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 11758804
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Sbjct 18671384 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 18671335
>gb|GL583150.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_170, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 3287125 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 3287174
>gb|CM000497.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 10880593 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 10880642
>gb|DS990667.1| Homo sapiens SCAF_1112675837322 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 4723400 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 4723449
>gb|CH003502.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=147693610
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 9518594 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 9518643
>gb|CH003454.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=154169609
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 11105600 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 11105649
>tpg|BL000002.1| TPA: Homo sapiens chromosome 7
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 10732336 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 10732385
>ref|NW_001839003.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188377, whole genome shotgun sequence
gb|DS486029.1| Homo sapiens SCAF_1103279188377 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 4723435 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 4723484
>gb|CH471073.1| Homo sapiens 211000035839577 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=37175744
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 4167643 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 4167692
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000468.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=152870189
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 10880210 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 10880259
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 11075544 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 11075593
>gb|CM000258.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=153561227
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 10996778 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 10996827
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG
>ref|XM_001146689.3| PREDICTED: Pan troglodytes PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 1471 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1520
>ref|XM_009452656.1| PREDICTED: Pan troglodytes PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 1472 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1521
>ref|XM_009452655.1| PREDICTED: Pan troglodytes PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X1, mRNA
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 1474 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1523
>ref|XM_003824996.2| PREDICTED: Pan paniscus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X3, mRNA
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 1507 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1556
>ref|XM_008978687.1| PREDICTED: Pan paniscus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 1508 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1557
>ref|XM_008978686.1| PREDICTED: Pan paniscus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X1, mRNA
Length=3520
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 1511 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1560
>gb|KJ898070.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_07464 PHF14
gene, encodes complete protein
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 1064 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1113
>ref|XM_005249911.2| PREDICTED: Homo sapiens PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X4, mRNA
Length=2665
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 656 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 705
>ref|XM_005249910.2| PREDICTED: Homo sapiens PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X3, mRNA
Length=4163
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 1445 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1494
>ref|XM_005249909.2| PREDICTED: Homo sapiens PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X2, mRNA
Length=3424
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 1445 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1494
>ref|XM_006715801.1| PREDICTED: Homo sapiens PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X5, mRNA
Length=3452
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 1446 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1495
>ref|XM_005249908.2| PREDICTED: Homo sapiens PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X1, mRNA
Length=3455
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1446 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1495
>ref|NR_033436.1| Homo sapiens PHD finger protein 14 (PHF14), transcript variant
4, non-coding RNA
Length=2644
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 660 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 709
>ref|NR_033435.1| Homo sapiens PHD finger protein 14 (PHF14), transcript variant
3, non-coding RNA
Length=7582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 660 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 709
>ref|NM_014660.3| Homo sapiens PHD finger protein 14 (PHF14), transcript variant
2, mRNA
Length=8370
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
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Sbjct 1448 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1497
>dbj|AB463167.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KA0783, Homo sapiens PHF14
gene for PHD finger protein 14, without stop codon, in Flexi
system
Length=2681
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1054
>dbj|AK295461.1| Homo sapiens cDNA FLJ57112 complete cds, highly similar to PHD
finger protein 14
Length=2554
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 692
>dbj|AK294419.1| Homo sapiens cDNA FLJ61230 complete cds, highly similar to PHD
finger protein 14
Length=2479
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 660 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 709
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IMAGE:8862519), complete cds
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Sbjct 1403 CGCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1452
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sequence
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sequence
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Sbjct 1084 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1132
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Sbjct 368 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 416
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14 (PHF14), transcript variant X7, mRNA
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Sbjct 1156 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1204
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14 (PHF14), transcript variant X6, mRNA
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14 (PHF14), transcript variant X5, misc_RNA
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14 (PHF14), transcript variant X4, mRNA
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14 (PHF14), transcript variant X3, mRNA
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14 (PHF14), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1156 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1204
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14 (PHF14), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1156 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1204
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variant X3, mRNA
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Sbjct 1432 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1480
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Sbjct 1432 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1480
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1432 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1480
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Sbjct 1158 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1206
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transcript variant X12, mRNA
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Sbjct 1503 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1551
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transcript variant X10, mRNA
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transcript variant X8, mRNA
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Sbjct 1503 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1551
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transcript variant X6, misc_RNA
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Sbjct 1503 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1551
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Sbjct 1503 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1551
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Sbjct 1054 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1102
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Sbjct 1152 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1200
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Sbjct 1306 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1354
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Sbjct 1306 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1354
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Sbjct 208 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 256
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Sbjct 208 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 256
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Sbjct 651 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 699
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1188 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1236
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1189 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1237
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Sbjct 892 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 940
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mRNA
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Sbjct 1240 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1288
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Sbjct 1567 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1615
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Sbjct 1572 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1620
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1573 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1621
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Sbjct 1578 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1626
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1579 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1627
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variant X2, mRNA
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Sbjct 331 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 379
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1125 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1173
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mRNA
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Sbjct 1420 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1468
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(PHF14), mRNA
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Sbjct 1171 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1219
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partial misc_RNA
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Sbjct 1019 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1067
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variant 3 (PHF14), mRNA
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Sbjct 1447 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1495
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mRNA
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Sbjct 1390 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1438
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Sbjct 665 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 713
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Sbjct 1207 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1255
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Sbjct 1450 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1498
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1450 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1498
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1450 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1498
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variant X6, mRNA
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Sbjct 1463 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1511
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Sbjct 1126 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1174
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Sbjct 1126 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1174
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Sbjct 1464 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1512
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Sbjct 1126 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1174
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Sbjct 1126 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1174
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Sbjct 661 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 709
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Sbjct 1427 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1475
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mRNA
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Sbjct 1125 GATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1170
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 208 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 256
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 996 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1044
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1361 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1409
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1361 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1409
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1361 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1409
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Sbjct 1191 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1239
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variant X3, mRNA
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Sbjct 1152 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGAATTACAGTCCATGAAG 1200
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1446 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGAATTACAGTCCATGAAG 1494
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1152 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGAATTACAGTCCATGAAG 1200
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variant X3, mRNA
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Sbjct 1112 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1160
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Sbjct 1112 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1160
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1112 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1160
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mRNA
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Sbjct 1145 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1193
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variant X3, mRNA
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Sbjct 1549 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1597
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1550 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1598
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1551 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1599
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mRNA
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Sbjct 1126 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1174
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Sbjct 1432 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1480
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Sbjct 1119 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1167
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Sbjct 1119 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1167
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1119 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1167
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Sbjct 1162 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1210
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Sbjct 1509 GCTGATGAAATAATTCAGTGCGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1557
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Sbjct 1509 GCTGATGAAATAATTCAGTGCGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1557
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variant X3, mRNA
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Sbjct 1509 GCTGATGAAATAATTCAGTGCGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1557
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1509 GCTGATGAAATAATTCAGTGCGACAATTGTGGCATTACAGTCCATGAAG 1557
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transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 1183 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1231
>ref|XM_005550109.1| PREDICTED: Macaca fascicularis PHD finger protein 14 (PHF14),
transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 1306 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1354
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variant X2, mRNA
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variant X9, mRNA
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variant X8, mRNA
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variant X7, mRNA
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variant X5, mRNA
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variant X4, mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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transcript variant 2, mRNA
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transcript variant 1, mRNA
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14 (PHF14), mRNA
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>ref|XM_001084293.2| PREDICTED: Macaca mulatta PHD finger protein 14, transcript variant
1 (PHF14), mRNA
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>ref|XM_001084412.1| PREDICTED: Macaca mulatta PHD finger protein 14, transcript variant
2 (PHF14), mRNA
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Sbjct 1451 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACGGTCCATGAAG 1499
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transcript variant X5, mRNA
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transcript variant X4, misc_RNA
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 1271 GATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1316
>ref|XM_008854523.1| PREDICTED: Nannospalax galili PHD finger protein 14 (Phf14),
transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1271 GATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1316
>ref|XM_006063848.1| PREDICTED: Bubalus bubalis PHD finger protein 14 (PHF14), partial
mRNA
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Sbjct 1117 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGTATTACAGTTCATGAAG 1165
>ref|XM_006984250.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii PHD finger protein
14 (Phf14), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1363 GATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1408
>ref|XM_006984249.1| PREDICTED: Peromyscus maniculatus bairdii PHD finger protein
14 (Phf14), transcript variant X1, mRNA
Length=3332
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Sbjct 1363 GATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1408
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Sbjct 637 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATAACAGTTCATGAAG 685
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1385 GCTGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATAACAGTTCATGAAG 1433
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mRNA
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Sbjct 1043 GATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1088
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mRNA
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Sbjct 1123 CGCAGATGAAATAATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACTGTTCATGAAG 1172
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mRNA
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Sbjct 1390 GCTGATGAAATCATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCACGAAG 1438
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Sbjct 505 GCTGATGAAATCATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCACGAAG 553
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variant X2, mRNA
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Sbjct 278 GATGAAATCATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 323
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1060 GATGAAATCATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTTCATGAAG 1105
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Sbjct 1006 GCTGATGAGATCATTCAGTGTGACAATTGTGGCATTACAGTACATGAAG 1054
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1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA
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14 (PHF14), transcript variant X7, mRNA
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14 (PHF14), transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 272 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 321
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14 (PHF14), transcript variant X5, misc_RNA
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Sbjct 272 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 321
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14 (PHF14), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 272 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 321
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14 (PHF14), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 272 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 321
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14 (PHF14), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 272 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 321
>ref|XM_010345731.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis PHD finger protein
14 (PHF14), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 272 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 321
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 566 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 615
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 566 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 615
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 566 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 615
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variant X3, mRNA
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Sbjct 588 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 637
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variant X2, mRNA
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Sbjct 589 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 638
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variant X1, mRNA
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Sbjct 591 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 640
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variant X3, mRNA
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Sbjct 548 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 597
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variant X2, mRNA
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Sbjct 548 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 597
>ref|XM_009242978.1| PREDICTED: Pongo abelii PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 548 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 597
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variant X6, mRNA
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Sbjct 582 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 631
>ref|XM_009203333.1| PREDICTED: Papio anubis PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 245 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 294
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variant X4, mRNA
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Sbjct 245 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 294
>ref|XM_009203331.1| PREDICTED: Papio anubis PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 583 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 632
>ref|XM_009203330.1| PREDICTED: Papio anubis PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 245 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 294
>ref|XM_009203329.1| PREDICTED: Papio anubis PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 245 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 294
>ref|XM_003824996.2| PREDICTED: Pan paniscus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 636 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 685
>ref|XM_008978687.1| PREDICTED: Pan paniscus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 637 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 686
>ref|XM_008978686.1| PREDICTED: Pan paniscus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 640 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 689
>ref|XM_009002356.1| PREDICTED: Callithrix jacchus PHD finger protein 14 (PHF14),
transcript variant X13, mRNA
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Sbjct 274 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 323
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transcript variant X12, mRNA
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
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transcript variant X11, mRNA
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
>ref|XM_009002354.1| PREDICTED: Callithrix jacchus PHD finger protein 14 (PHF14),
transcript variant X10, mRNA
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
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transcript variant X9, misc_RNA
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
>ref|XM_009002353.1| PREDICTED: Callithrix jacchus PHD finger protein 14 (PHF14),
transcript variant X8, mRNA
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
>ref|XM_009002352.1| PREDICTED: Callithrix jacchus PHD finger protein 14 (PHF14),
transcript variant X7, mRNA
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
>ref|XR_622280.1| PREDICTED: Callithrix jacchus PHD finger protein 14 (PHF14),
transcript variant X6, misc_RNA
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
>ref|XR_622279.1| PREDICTED: Callithrix jacchus PHD finger protein 14 (PHF14),
transcript variant X5, misc_RNA
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 619 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 668
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 181 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 230
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transcript variant X8, mRNA
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Sbjct 522 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 571
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Sbjct 425 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 474
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transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 303 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 352
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transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 425 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 474
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 425 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 474
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 425 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 474
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 425 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 474
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 425 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 474
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variant X3, mRNA
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Sbjct 562 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 611
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variant X2, mRNA
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Sbjct 562 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 611
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variant X5, mRNA
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Sbjct 563 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 612
>ref|XM_005249908.2| PREDICTED: Homo sapiens PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 563 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 612
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transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 302 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 351
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transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 425 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 474
>ref|XM_005550108.1| PREDICTED: Macaca fascicularis PHD finger protein 14 (PHF14),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 425 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 474
>ref|XM_005550107.1| PREDICTED: Macaca fascicularis PHD finger protein 14 (PHF14),
transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 425 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 474
>ref|XM_005550106.1| PREDICTED: Macaca fascicularis PHD finger protein 14 (PHF14),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 425 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 474
>ref|XM_005550105.1| PREDICTED: Macaca fascicularis PHD finger protein 14 (PHF14),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 425 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 474
>ref|XM_003252564.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys PHD finger protein 14, transcript
variant 2 (PHF14), mRNA
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Sbjct 569 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 618
>ref|XM_004045111.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla PHD finger protein 14 (PHF14),
mRNA
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Sbjct 236 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 285
>ref|XM_001084293.2| PREDICTED: Macaca mulatta PHD finger protein 14, transcript variant
1 (PHF14), mRNA
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Sbjct 570 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 619
>ref|NM_014660.3| Homo sapiens PHD finger protein 14 (PHF14), transcript variant
2, mRNA
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Sbjct 565 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 614
>dbj|AB463167.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KA0783, Homo sapiens PHF14
gene for PHD finger protein 14, without stop codon, in Flexi
system
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Sbjct 122 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 171
>gb|BC152414.1| Homo sapiens PHD finger protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:176640
IMAGE:8862519), complete cds
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Sbjct 520 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 569
>gb|AC188592.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-462C24 from chromosome 7, complete
sequence
Length=201129
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 117436 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 117387
>ref|XM_001084412.1| PREDICTED: Macaca mulatta PHD finger protein 14, transcript variant
2 (PHF14), mRNA
Length=3434
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 570 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 619
>gb|AC146204.3| Pan troglodytes BAC clone RP43-25M3 from chromosome 7, complete
sequence
Length=188265
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Sbjct 56795 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 56746
>dbj|AB018326.1| Homo sapiens mRNA for KIAA0783 protein, partial cds
Length=4231
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 520 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 569
>gb|AC007029.3|AC007029 Homo sapiens clone RP5-855F16, complete sequence
Length=95345
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Sbjct 11783 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 11734
>ref|XM_010610532.1| PREDICTED: Fukomys damarensis PHD finger protein 14 (Phf14),
transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 182 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 231
>ref|XM_010610531.1| PREDICTED: Fukomys damarensis PHD finger protein 14 (Phf14),
transcript variant X3, mRNA
Length=2921
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 182 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 231
>ref|XM_010610530.1| PREDICTED: Fukomys damarensis PHD finger protein 14 (Phf14),
transcript variant X2, mRNA
Length=2922
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 182 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 231
>ref|XM_010610529.1| PREDICTED: Fukomys damarensis PHD finger protein 14 (Phf14),
transcript variant X1, mRNA
Length=3071
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 182 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 231
>ref|XM_008686335.1| PREDICTED: Ursus maritimus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X13, mRNA
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Sbjct 167 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 216
>ref|XM_008686334.1| PREDICTED: Ursus maritimus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X12, mRNA
Length=3723
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Sbjct 167 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 216
>ref|XM_008686333.1| PREDICTED: Ursus maritimus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X11, mRNA
Length=2904
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Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 167 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 216
>ref|XM_008686332.1| PREDICTED: Ursus maritimus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X10, mRNA
Length=2907
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Sbjct 167 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 216
>ref|XM_008686331.1| PREDICTED: Ursus maritimus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X9, mRNA
Length=2820
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 167 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 216
>ref|XM_008686330.1| PREDICTED: Ursus maritimus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X8, mRNA
Length=2823
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 167 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 216
>ref|XM_008686329.1| PREDICTED: Ursus maritimus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X7, mRNA
Length=2841
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATGCTTCAAAGGACAGTGGA 50
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Sbjct 167 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 216
>ref|XM_008686328.1| PREDICTED: Ursus maritimus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X6, mRNA
Length=3228
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transcript variant X1, mRNA
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14 (PHF14), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 270 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 319
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14 (PHF14), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 270 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 319
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14 (PHF14), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 270 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 319
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Sbjct 245 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 294
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Sbjct 313 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 362
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Sbjct 314 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 363
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Sbjct 441 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 490
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Sbjct 441 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 490
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 441 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 490
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Sbjct 298 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 347
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partial mRNA
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Sbjct 11 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 60
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variant X8, mRNA
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Sbjct 548 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 597
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variant X5, mRNA
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Sbjct 541 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 590
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variant X4, mRNA
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Sbjct 542 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 591
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Sbjct 542 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 591
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variant X3, mRNA
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Sbjct 542 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 591
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variant X9, misc_RNA
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Sbjct 542 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 591
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variant X2, mRNA
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Sbjct 540 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 589
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variant X1, mRNA
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Sbjct 543 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 592
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Sbjct 218 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 267
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Sbjct 215 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 264
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mRNA
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Sbjct 245 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 294
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Sbjct 281 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 330
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Sbjct 610 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 659
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Sbjct 610 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 659
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Sbjct 610 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 659
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Sbjct 610 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 659
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mRNA
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Sbjct 344 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 393
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(Phf14), partial mRNA
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Sbjct 137 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 186
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variant X10, mRNA
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Sbjct 590 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 639
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variant X9, mRNA
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Sbjct 590 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 639
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Sbjct 590 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 639
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variant X11, misc_RNA
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Sbjct 590 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 639
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variant X8, mRNA
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Sbjct 590 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 639
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variant X7, mRNA
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Sbjct 590 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 639
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Sbjct 591 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 640
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Sbjct 591 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 640
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Sbjct 683 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 732
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Sbjct 687 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 736
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 689 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 738
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Sbjct 694 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 743
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Sbjct 509 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 558
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variant X1, mRNA
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Sbjct 179 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 228
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(PHF14), mRNA
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Sbjct 278 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 327
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partial misc_RNA
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Sbjct 144 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 193
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Sbjct 524 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 573
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Sbjct 470 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 519
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(LOC100476418), mRNA
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Sbjct 314 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 363
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Sbjct 524 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 573
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1, mRNA
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Sbjct 527 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 576
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Sbjct 510 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 559
>gb|BC040236.1| Mus musculus PHD finger protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:36262
IMAGE:3585881), complete cds
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Sbjct 490 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 539
>dbj|AK016517.1| Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:4932409F11 product:hypothetical PHD-finger
containing protein, full insert sequence
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Sbjct 527 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 576
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(C57BL/6J Female) Mouse BAC Library) complete sequence
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Sbjct 50513 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCTTCAAAGGACAGTGGA 50464
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 508 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCATCAAAGGACAGTGGA 557
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 241 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCATCAAAGGACAGTGGA 290
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transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 401 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 450
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transcript variant X4, misc_RNA
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Sbjct 402 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 451
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Sbjct 402 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 451
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 402 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 451
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 402 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 451
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variant X7, mRNA
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Sbjct 550 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 599
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variant X6, mRNA
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Sbjct 551 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 600
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transcript variant X4, misc_RNA
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Sbjct 599 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 648
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Sbjct 599 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 648
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Sbjct 274 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 323
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 274 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 323
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Sbjct 285 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 334
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 106 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCATCAAAGGACAGTGGA 155
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14 (Phf14), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 500 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 549
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14 (Phf14), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 500 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 549
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variant X3, mRNA
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Sbjct 265 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 314
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variant X2, mRNA
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Sbjct 559 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 608
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variant X1, mRNA
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Sbjct 265 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 314
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 513 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 562
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mRNA
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Sbjct 255 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 304
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Sbjct 338 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 387
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mRNA
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Sbjct 188 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 237
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Sbjct 582 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCATCAAAGGACAGTGGA 631
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transcript variant 3, mRNA
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Sbjct 582 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCATCAAAGGACAGTGGA 631
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transcript variant 2, mRNA
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Sbjct 582 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCATCAAAGGACAGTGGA 631
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transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 582 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCATCAAAGGACAGTGGA 631
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mRNA
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Sbjct 518 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 567
>ref|XM_004389351.1| PREDICTED: Trichechus manatus latirostris PHD finger protein
14 (PHF14), mRNA
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Sbjct 519 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCATCAAAGGACAGTGGA 568
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mRNA
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Sbjct 488 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGATCCCTCAAAGGACAGTGGA 537
>emb|FQ209867.1| Rattus norvegicus TL0ABA38YL14 mRNA sequence
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Sbjct 479 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 528
>emb|FQ221829.1| Rattus norvegicus TL0ADA31YD10 mRNA sequence
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Sbjct 480 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 529
>gb|BC166456.1| Rattus norvegicus PHD finger protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:187735
IMAGE:9025134), complete cds
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Sbjct 246 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 295
>ref|NM_001110492.1| Rattus norvegicus PHD finger protein 14 (Phf14), mRNA
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Sbjct 515 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 564
>gb|AY383666.1| Rattus norvegicus LRRGT00011 mRNA, complete cds
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Sbjct 758 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCTTCAAAGGACAGTGGA 807
>ref|XM_008148675.1| PREDICTED: Eptesicus fuscus PHD finger protein 14 (PHF14), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 537 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCCTCAAAGGACAGTGGA 586
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variant X3, mRNA
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Sbjct 671 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCCTCAAAGGACAGTGGA 720
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variant X2, mRNA
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Sbjct 672 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCCTCAAAGGACAGTGGA 721
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variant X1, mRNA
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Sbjct 673 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCCTCAAAGGACAGTGGA 722
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variant X3, mRNA
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Sbjct 241 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCCTCAAAGGACAGTGGA 290
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Sbjct 241 ATTCTGAAGGGAGTGGTAATGGAAGTGAAGACCCCTCAAAGGACAGTGGA 290
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variant 3, mRNA
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gene, encodes complete protein
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Sbjct 1226 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 1275
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Sbjct 1304 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 1353
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1304 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 1353
>ref|XM_003268951.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys zinc finger, MIZ-type containing
2 (ZMIZ2), mRNA
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Sbjct 1223 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 1272
>ref|XM_004045398.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla zinc finger, MIZ-type containing
2, transcript variant 3 (ZMIZ2), mRNA
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Sbjct 1075 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 1124
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2, transcript variant 2 (ZMIZ2), mRNA
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2, transcript variant 1 (ZMIZ2), mRNA
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Sbjct 1163 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 1212
>ref|XM_002817987.1| PREDICTED: Pongo abelii zinc finger, MIZ-type containing 2 (ZMIZ2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1302 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 1351
>gb|AF357908.1| Homo sapiens TRAFIP20 (TRAFIP20) mRNA, complete cds
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Sbjct 1179 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 1228
>gb|AC187626.2| Pan troglodytes BAC clone CH251-364I20 from chromosome 7, complete
sequence
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Sbjct 60319 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 60270
>gb|BC110435.1| Homo sapiens zinc finger, MIZ-type containing 2, mRNA (cDNA clone
MGC:117172 IMAGE:5518312), complete cds
Length=3823
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Sbjct 1118 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 1167
>gb|BC021924.1| Homo sapiens zinc finger, MIZ-type containing 2, mRNA (cDNA clone
IMAGE:4591999), complete cds
Length=2750
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Sbjct 234 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 283
>dbj|AK090841.1| Homo sapiens cDNA FLJ33522 fis, clone BRAMY2006375, highly similar
to PIAS-like protein Zimp7
Length=3240
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Sbjct 582 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 631
>gb|BC016968.1| Homo sapiens, clone IMAGE:4428301, mRNA
Length=2182
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Sbjct 1146 CAAGTCTCCCTTCTTGCCTGATCTCAAGCCCAACCTCAACTCCTTGCACT 1195
>gb|AC013436.5| Homo sapiens BAC clone RP11-105B9 from 7, complete sequence
Length=63823
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Strand=Plus/Minus
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variant 1, mRNA
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2 (ZMIZ2), transcript variant X7, misc_RNA
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2 (ZMIZ2), transcript variant X5, mRNA
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2 (ZMIZ2), transcript variant X4, mRNA
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2 (ZMIZ2), transcript variant X3, mRNA
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2 (ZMIZ2), transcript variant X1, mRNA
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>dbj|AB384316.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KSDA1886, Homo sapiens ZMIZ2
gene for zinc finger MIZ domain-containing protein 2, complete
cds, without stop codon, in Flexi system
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containing 2 (ZMIZ2), transcript variant X2, mRNA
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containing 2 (ZMIZ2), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 13541429 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 13541380
>ref|NC_018918.2| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001615.2| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 75607513 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 75607464
>ref|NW_004929332.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150116.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 14238552 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 14238503
>gb|KE141117.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold50, whole genome
shotgun sequence
Length=1080549
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 608662 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 608613
>gb|CM000497.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 70764456 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 70764407
>gb|CH003502.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 65468352 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 65468303
>tpg|BL000002.1| TPA: Homo sapiens chromosome 7
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Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 75217421 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 75217372
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000468.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 70764091 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 70764042
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Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 75010590 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 75010541
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Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 70546061 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 70546012
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA
>ref|NC_000007.14| Homo sapiens chromosome 7, GRCh38 Primary Assembly
gb|CM000669.2| Homo sapiens chromosome 7, GRCh38 reference primary assembly
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Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 76060420 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 76060469
>ref|NT_007933.16| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR7_CTG4_4
gb|GL000059.2| Homo sapiens chromosome 7 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 13553641 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 13553690
>ref|NC_018918.2| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001615.2| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=159147065
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Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 75619709 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 75619758
>ref|NW_004929332.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150116.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=77944650
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Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 14250748 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 14250797
>gb|KE141117.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold50, whole genome
shotgun sequence
Length=1080549
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Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 620858 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 620907
>gb|CM000497.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=152869804
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 70776655 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 70776704
>gb|CH003502.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=147693610
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 65480549 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 65480598
>gb|CH003454.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=154169609
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 71178626 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 71178675
>tpg|BL000002.1| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158409401
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 75229633 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 75229682
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000468.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=152870189
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 70776291 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 70776340
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158329839
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Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 75022802 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 75022851
>gb|CM000258.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=153561227
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 70558260 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 70558309
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG
>ref|XM_003318527.2| PREDICTED: Pan troglodytes malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X2, mRNA
Length=1188
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 185 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 136
>ref|XM_001156205.3| PREDICTED: Pan troglodytes malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X1, mRNA
Length=1345
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 184 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 135
>ref|XM_003808922.2| PREDICTED: Pan paniscus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X2, mRNA
Length=2076
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 185 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 136
>ref|XM_003808920.2| PREDICTED: Pan paniscus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X1, mRNA
Length=1356
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 184 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 135
>ref|NR_104165.1| Homo sapiens malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2),
transcript variant 4, non-coding RNA
Length=687
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 190 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 141
>ref|NM_001282404.1| Homo sapiens malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2),
transcript variant 3, mRNA
Length=2099
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 190 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 141
>ref|NM_001282403.1| Homo sapiens malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2),
transcript variant 2, mRNA
Length=2142
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 190 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 141
>ref|NM_005918.3| Homo sapiens malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2),
transcript variant 1, mRNA
Length=2268
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 190 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 141
>dbj|AK290779.1| Homo sapiens cDNA FLJ75674 complete cds, highly similar to Homo
sapiens malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2),
mRNA
Length=1569
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 124 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 75
>gb|AC198621.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-590G17 from chromosome 7, complete
sequence
Length=206741
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 56609 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 56658
>gb|AC093136.3| Pan troglodytes clone RP43-116L11, complete sequence
Length=179629
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 96690 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 96641
>gb|AC006330.5| Homo sapiens BAC clone RP11-229D13 from 7, complete sequence
Length=96299
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 4348 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 4397
>dbj|AK095803.1| Homo sapiens cDNA FLJ38484 fis, clone FEBRA2023227, highly similar
to MALATE DEHYDROGENASE, MITOCHONDRIAL PRECURSOR (EC 1.1.1.37)
Length=2020
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 124 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 75
>gb|AC145375.5| Pan troglodytes BAC clone RP43-57M5 from chromosome 7, complete
sequence
Length=217260
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 214417 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 214466
>dbj|AK293460.1| Homo sapiens cDNA FLJ52880 complete cds, highly similar to Malate
dehydrogenase, mitochondrial precursor (EC 1.1.1.37)
Length=1548
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCAT 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCAT 1
>ref|XM_010387435.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana malate dehydrogenase 2, NAD
(mitochondrial) (MDH2), mRNA
Length=2248
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 176 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAAAGCATGG 127
>ref|XM_003895851.2| PREDICTED: Papio anubis malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), mRNA
Length=2256
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 198 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAAAGCATGG 149
>ref|XM_008018380.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X2, mRNA
Length=1184
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 192 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAAAGCATGG 143
>ref|XM_008018379.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X1, mRNA
Length=1443
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 282 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAAAGCATGG 233
>ref|XM_007186564.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni malate dehydrogenase
2, NAD (mitochondrial) (MDH2), mRNA
Length=1301
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 97
>ref|XM_007103976.1| PREDICTED: Physeter catodon malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), mRNA
Length=1401
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 191 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 142
>ref|XR_287774.1| PREDICTED: Macaca fascicularis uncharacterized LOC102121276 (LOC102121276),
misc_RNA
Length=1868
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 140 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAAAGCATGG 91
>ref|XM_004321556.1| PREDICTED: Tursiops truncatus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), mRNA
Length=1289
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 134 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 85
>ref|XM_004268815.1| PREDICTED: Orcinus orca malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), mRNA
Length=1296
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 134 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 85
>ref|XM_004045614.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla malate dehydrogenase 2, NAD
(mitochondrial), transcript variant 3 (MDH2), mRNA
Length=2201
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 257 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGTTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 208
>ref|XM_004045613.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla malate dehydrogenase 2, NAD
(mitochondrial), transcript variant 2 (MDH2), mRNA
Length=2064
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGTTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 114
>ref|XM_004045612.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla malate dehydrogenase 2, NAD
(mitochondrial), transcript variant 1 (MDH2), mRNA
Length=2327
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGTTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 208
>ref|XM_003276623.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), mRNA
Length=2809
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 409 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCTGAGAGCATGG 360
>gb|AC216099.4| Pongo abelii BAC clone CH276-442N23 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=221322
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 5117 GCTGCGGCGGAGAACAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 5068
>ref|NM_001283160.1| Macaca fascicularis Malate dehydrogenase, mitochondrial (MDH2),
mRNA
dbj|AB169676.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-17106, similar to
human malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2), mRNA,
RefSeq: NM_005918.2
Length=2257
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 178 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAAAGCATGG 129
>ref|NM_001134205.1| Pongo abelii malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2),
mRNA
emb|CR925943.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp470E0311 (from clone DKFZp470E0311)
Length=1349
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 157 GCTGCGGCGGAGAACAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 108
>ref|XM_003416586.2| PREDICTED: Loxodonta africana malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), mRNA
Length=1323
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 179 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 130
>ref|XM_010375649.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana malate dehydrogenase, mitochondrial-like
(LOC104671997), transcript variant X2, mRNA
Length=1138
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 118 GCTGCGGCGGAAAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAAAGCATGG 69
>ref|XM_010375648.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana malate dehydrogenase, mitochondrial-like
(LOC104671997), transcript variant X1, mRNA
Length=1317
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 160 GCTGCGGCGGAAAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAAAGCATGG 111
>ref|XM_005661955.1| PREDICTED: Sus scrofa malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X1, mRNA
Length=2064
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 177 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 128
>ref|XM_003794238.1| PREDICTED: Otolemur garnettii malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), mRNA
Length=1118
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 114 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 65
>dbj|AK399962.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10108A02, expressed in hypothalamus
Length=2167
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 180 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 131
>dbj|AK398042.1| Sus scrofa mRNA, clone: TCH010075A11, expressed in trachea
Length=2188
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 160 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 111
>dbj|AK400328.1| Sus scrofa mRNA, clone: CLNT10013C05, expressed in colon
Length=2160
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 115 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 66
>dbj|AK398705.1| Sus scrofa mRNA, clone: UTR010095G12, expressed in uterus
Length=2136
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 180 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 131
>dbj|AK394868.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVR010042D06, expressed in ovary
Length=2111
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 102 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 53
>ref|NM_001244153.1| Sus scrofa malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2),
mRNA
Length=2095
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 101 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 52
>dbj|AK232730.1| Sus scrofa mRNA, clone:LVRM10014H04, expressed in liver
Length=2097
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 103 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 54
>dbj|AK238803.1| Sus scrofa mRNA, clone:THY010032C03, expressed in thymus
Length=2133
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 166 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 117
>dbj|AK235801.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10116E04, expressed in ovary
Length=2158
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 169 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 120
>dbj|AK235773.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10114A11, expressed in ovary
Length=2155
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 169 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 120
>gb|AC090553.3| Sus scrofa clone RP44-508O6, complete sequence
Length=107475
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 50
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Sbjct 59188 GCTGCGGCGGAGAGCGGCGCCGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG 59139
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA
>ref|XM_003808922.2| PREDICTED: Pan paniscus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X2, mRNA
Length=2076
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 494
>ref|XM_003808920.2| PREDICTED: Pan paniscus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X1, mRNA
Length=1356
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 613 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 662
>gb|KJ897180.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_06574 MDH2
gene, encodes complete protein
Length=1146
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 591
>ref|NM_001282404.1| Homo sapiens malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2),
transcript variant 3, mRNA
Length=2099
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 450 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 499
>ref|NM_005918.3| Homo sapiens malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2),
transcript variant 1, mRNA
Length=2268
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 619 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 668
>ref|XM_004045613.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla malate dehydrogenase 2, NAD
(mitochondrial), transcript variant 2 (MDH2), mRNA
Length=2064
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 472
>ref|XM_004045612.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla malate dehydrogenase 2, NAD
(mitochondrial), transcript variant 1 (MDH2), mRNA
Length=2327
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 686 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 735
>dbj|AK316587.1| Homo sapiens cDNA, FLJ95392, highly similar to Homo sapiens malate
dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2), mRNA
Length=1042
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 502 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 551
>dbj|AK290779.1| Homo sapiens cDNA FLJ75674 complete cds, highly similar to Homo
sapiens malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2),
mRNA
Length=1569
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 602
>gb|DQ896341.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100010801; FLH193458.01L;
RZPDo839G0668D malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2) gene, encodes complete protein
Length=1057
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 499 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 548
>gb|DQ893080.2| Synthetic construct clone IMAGE:100005710; FLH193462.01X; RZPDo839G0678D
malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2)
gene, encodes complete protein
Length=1057
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 499 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 548
>gb|DQ402957.1| Homo sapiens mitochondrial malate dehydrogenase 2, NAD (MDH2)
mRNA, partial cds; nuclear gene for mitochondrial product
Length=915
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 463
>gb|BC001917.1| Homo sapiens malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial), mRNA
(cDNA clone MGC:3559 IMAGE:2823443), complete cds
Length=1244
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 505 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 554
>gb|AC093136.3| Pan troglodytes clone RP43-116L11, complete sequence
Length=179629
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108997 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 109046
>gb|AC005077.5| Homo sapiens BAC clone CTA-228D17 from 7, complete sequence
Length=240379
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 232315 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 232266
>dbj|AK128072.1| Homo sapiens cDNA FLJ46193 fis, clone TESTI4006234
Length=5250
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 383
>dbj|AK095803.1| Homo sapiens cDNA FLJ38484 fis, clone FEBRA2023227, highly similar
to MALATE DEHYDROGENASE, MITOCHONDRIAL PRECURSOR (EC 1.1.1.37)
Length=2020
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 384 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 433
>emb|CR536548.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834E0920D
for gene MDH2, malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial);
complete cds, incl. stopcodon
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Sbjct 477 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 526
>gb|AF047470.1|AF047470 Homo sapiens malate dehydrogenase precursor (MDH) mRNA, nuclear
gene encoding mitochondrial protein, complete cds
Length=1321
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 563 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 612
>ref|XM_003318527.2| PREDICTED: Pan troglodytes malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X2, mRNA
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 445 AGTGTACAACCCCAACAAAATTTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 494
>ref|XM_001156205.3| PREDICTED: Pan troglodytes malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X1, mRNA
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 613 AGTGTACAACCCCAACAAAATTTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 662
>ref|XM_003276623.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), mRNA
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Sbjct 1176 AGTGTACAACCCCAACAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 1225
>gb|AC216099.4| Pongo abelii BAC clone CH276-442N23 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=221322
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Sbjct 17472 AGTGTACAACCCCAACAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 17521
>gb|AC198621.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-590G17 from chromosome 7, complete
sequence
Length=206741
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Sbjct 44305 AGTGTACAACCCCAACAAAATTTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 44256
>gb|AC145375.5| Pan troglodytes BAC clone RP43-57M5 from chromosome 7, complete
sequence
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 202102 AGTGTACAACCCCAACAAAATTTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 202053
>ref|NM_001134205.1| Pongo abelii malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2),
mRNA
emb|CR925943.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp470E0311 (from clone DKFZp470E0311)
Length=1349
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Sbjct 586 AGTGTACAACCCCAACAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 635
>ref|XM_010387435.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana malate dehydrogenase 2, NAD
(mitochondrial) (MDH2), mRNA
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Sbjct 605 AGTGTACAACCCCAGCAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 654
>ref|XM_010375648.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana malate dehydrogenase, mitochondrial-like
(LOC104671997), transcript variant X1, mRNA
Length=1317
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Sbjct 589 AGTGTACAACCCCAGCAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 638
>ref|XM_010364902.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana malate dehydrogenase, mitochondrial-like
(LOC104663627), mRNA
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Sbjct 513 AGTGTACAACCCCAGCAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 562
>ref|XM_003895851.2| PREDICTED: Papio anubis malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), mRNA
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Sbjct 627 AGTGTACAACCCCAGCAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 676
>ref|XM_002711906.2| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus malate dehydrogenase 2, NAD
(mitochondrial) (MDH2), mRNA
Length=1302
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Sbjct 607 AGTGTACAACCCCAACAGGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 656
>ref|XM_008018380.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X2, mRNA
Length=1184
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Sbjct 452 AGTGTACAACCCCAGCAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 501
>ref|XM_008018379.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial)
(MDH2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 711 AGTGTACAACCCCAGCAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 760
>ref|XM_001114888.2| PREDICTED: Macaca mulatta malate dehydrogenase, mitochondrial-like
(LOC719983), mRNA
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Sbjct 585 AGTGTACAACCCCAGCAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 634
>gb|DQ402955.1| Lepus europaeus mitochondrial malate dehydrogenase 2, NAD (MDH2)
mRNA, partial cds; nuclear gene for mitochondrial product
Length=894
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Sbjct 414 AGTGTACAACCCCAACAGGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 463
>gb|DQ402954.1| Oryctolagus cuniculus mitochondrial malate dehydrogenase 2, NAD
(MDH2) mRNA, partial cds; nuclear gene for mitochondrial
product
Length=891
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 50
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Sbjct 408 AGTGTACAACCCCAACAGGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 457
>gb|AC093131.2| Papio anubis clone RP41-51G4, complete sequence
Length=181049
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Sbjct 5755 AGTGTACAACCCCAGCAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 5804
>ref|NM_001283160.1| Macaca fascicularis Malate dehydrogenase, mitochondrial (MDH2),
mRNA
dbj|AB169676.1| Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-17106, similar to
human malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (MDH2), mRNA,
RefSeq: NM_005918.2
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Sbjct 607 AGTGTACAACCCCAGCAAGATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCA 656
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7 7 75684175 75677472 29m6603n71m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGGCTG
7 7 75684172 75677469 26m6603n74m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGGCTGGAG
7 7 75684169 75677466 23m6603n77m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGCCGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGGCTGGAGCGG
7 7 75684165 75689750 19m6603n68m75689738F13M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG AGTGTACAACCCC
7 7 75684151 75689764 5m6603n68m75689738F27M |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGG
7 7 75677991 75677542 99m349n1m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||C
7 7 75677988 75677539 96m349n4m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGG
7 7 75677973 75677524 81m349n19m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAG
7 7 75677969 75677520 77m349n23m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGC
7 7 75677966 75677517 74m349n26m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGC
7 7 75677954 75677505 62m349n38m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGC
7 7 75677947 75677498 55m349n45m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGG
7 7 75677937 75677488 45m349n55m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGG
7 7 75677933 75677484 41m349n59m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGG
7 7 75677922 75677473 30m349n70m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGGCT
7 7 75677915 75677466 23m349n77m |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGGCTGGAGCGG
7 7 75677871 75677771 100m ACAAA
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7 7 75677791 75677691 100m ACAAATGGACCGGCCCTGGAGCGGGACTACCTCGCCCCCTTTTCCCCGGCTTTCTCCCCCGCACCTCCAGGCCAGTGTCAGGGCC
7 7 75677774 75677674 100m AAATGGACCGGCCCTGGAGCGGGACTACCTCGCCCCCTTTTCCCCGGCTTTCTCCCCCGCACCTCCAGGCCAGTGTCAGGGCCTGCCCCGGGCGCCACAG
7 7 75677766 75677666 100m CGGCCCTGGAGCGGGACTACCTCGCCCCCTTTTCCCCGGCTTTCTCCCCCGCACCTCCAGGCCAGTGTCAGGGCCTGCCCCGGGCGCCACAGTCTCCAGC
7 7 75677761 75677661 100m CTGGAGCGGGACTACCTCGCCCCCTTTTCCCCGGCTTTCTCCCCCGCACCTCCAGGCCAGTGTCAGGGCCTGCCCCGGGCGCCACAGTCTCCAGCCAGTG
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7 7 75677672 75677572 100m TCCAGCCAGTGCCGGGCATCCCTGCGGTCCAGGCTGGCCTGGAGAGGGTCAGAGCTGCCCGCGAACCGGGGACGCACGTGGCCCGGGCCGGGGGGCCTCC
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7 7 75677645 75677545 100m TCCAGGCTGGCCTGGAGAGGGTCAGAGCTGCCCGCGAACCGGGGACGCACGTGGCCCGGGCCGGGGGGCCTCCGCCTGCAGGCCGCCCCTCGTCTGGCCT
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7 7 75677601 75677501 100m ACGCACGTGGCCCGGGCCGGGGGGCCTCCGCCTGCAGGCCGCCCCTCGTCTGGCCTACCTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCTCTGGC
7 7 75677597 75677497 100m ACGTGGCCCGGGCCGGGGGGCCTCCGCCTGCAGGCCGCCCCTCGTCTGGCCTACCTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGC
7 7 75677594 75677494 100m TGGCCCGGGCGGGGGGGCCTCCGCCTGCAGGCCGCCCCTCGTCTGGCCTACCTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGG
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7 7 75677583 75677483 100m GGGGGGCCTCCGCCTGCAGGCCGCCCCTCGTCTGGCCTACCTGGGCCGAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGA
7 7 75677536 75689776 61m75689738F39M GAGGTGCTGAAGCTGCGGCGGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCT
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7 7 75677517 75689795 42m75689738F58M GGAGAGCAGCGCTGGCAGGCCGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCAGAGCCAAC
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7 7 75677497 75689815 22m75689738F78M CGGGCGAGGGCGGAGAGCATGG AGTGTACAACCCCAACAAAATCTTCGGCGTGACGACCCTGGACATCGTCAGAGCCAACACCTTTGTTGCAGAGCTGAA
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Sbjct 50430085 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50430134
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 48598125 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 48598174
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shotgun sequence
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 46747301 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 46747350
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Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 52573464 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 52573415
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
right flanking sequence - AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG
>ref|NC_000007.14| Homo sapiens chromosome 7, GRCh38 Primary Assembly
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 76302944 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 76302993
>ref|NT_007933.16| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR7_CTG4_4
gb|GL000059.2| Homo sapiens chromosome 7 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 13796165 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 13796214
>ref|NC_018918.2| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001615.2| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 75862354 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 75862403
>ref|NW_004929332.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150116.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 14493393 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 14493442
>gb|KE141117.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold50, whole genome
shotgun sequence
Length=1080549
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 867540 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 867589
>gb|CM000497.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 71018965 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 71019014
>gb|CH003502.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 65690831 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 65690880
>gb|CH003454.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 71421632 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 71421681
>tpg|BL000002.1| TPA: Homo sapiens chromosome 7
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 75472156 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 75472205
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000468.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 71018582 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 71018631
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 75265325 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 75265374
>gb|CM000258.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 70800760 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 70800809
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC
>ref|XR_746952.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana heat shock protein beta-1
pseudogene (LOC104655302), misc_RNA
Length=806
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 94 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 45
>ref|XM_010387433.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana heat shock 27kDa protein 1
(HSPB1), mRNA
Length=898
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 211 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 162
>ref|XM_519162.5| PREDICTED: Pan troglodytes heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=947
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 260 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 211
>ref|XM_003780459.2| PREDICTED: Pongo abelii heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=803
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 265 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 216
>ref|XM_003846008.2| PREDICTED: Pan paniscus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=947
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 260 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 211
>ref|XM_008018402.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus heat shock protein beta-1 (LOC103246661),
mRNA
Length=572
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 183 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 134
>ref|XM_004045620.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 4 (HSPB1), mRNA
Length=925
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 265 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 216
>ref|XM_004045619.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 3 (HSPB1), mRNA
Length=978
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 265 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 216
>ref|XM_004045618.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 2 (HSPB1), mRNA
Length=958
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 265 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 216
>ref|XM_004045617.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 1 (HSPB1), mRNA
Length=1437
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 216
>dbj|AB528488.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6909, Homo sapiens HSPB1
gene for heat shock 27kDa protein 1, without stop codon, in
Flexi system
Length=632
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 16
>gb|AC206559.4| Pongo abelii BAC clone CH276-41P10 from chromosome unknown, complete
sequence
Length=210819
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 171835 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 171786
>ref|NG_008995.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), RefSeqGene (LRG_248)
on chromosome 7
Length=8740
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5211 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 5162
>ref|NM_001540.3| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=914
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 162
>dbj|AK311894.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92160, Homo sapiens heat shock 27kDa protein
1 (HSPB1), mRNA
Length=656
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 45
>gb|AC186393.2| Pan troglodytes BAC clone CH251-279L5 from chromosome 7, complete
sequence
Length=191011
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 19263 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 19214
>gb|DQ896669.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011129; FLH263661.01L;
RZPDo839E01155D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
Length=658
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 29
>gb|DQ894489.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008949; FLH263716.01L;
RZPDo839D0299D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
Length=658
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 29
>gb|DQ893349.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100005979; FLH263580.01X;
RZPDo839E01156D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
Length=658
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 29
>gb|DQ891304.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100003934; FLH263567.01X;
RZPDo839D02100D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
Length=658
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 78 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 29
>gb|AC182768.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-178I17 from chromosome 7, complete
sequence
Length=186886
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164508 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 164459
>gb|BT019887.1| Synthetic construct Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 mRNA,
partial cds
Length=618
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 56 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 7
>gb|BC073768.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:88776
IMAGE:5444848), complete cds
Length=794
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 27
>gb|BC012768.2| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:16252
IMAGE:3689220), complete cds
Length=781
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 29
>gb|BC012292.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:21487
IMAGE:3862626), complete cds
Length=833
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 80
>gb|DQ379985.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1) gene, complete
cds
Length=5687
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 2114
>gb|BC000510.2| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:8509
IMAGE:2822325), complete cds
Length=867
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 155 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 106
>gb|AC006388.3| Homo sapiens BAC clone CTA-363M4 from 7, complete sequence
Length=59241
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49009 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 49058
>gb|L39370.1|HUMHSP27X Homo sapiens heat shock protein 27 (HSPB1) gene, complete cds
Length=2496
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 256
>emb|CR536489.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0917D
for gene HSPB1, heat shock 27kDa protein 1; complete cds,
incl. stopcodon
Length=618
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 7
>emb|CR407614.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B022D
for gene HSPB1, heat shock 27kDa protein 1 complete cds, without
stopcodon
Length=615
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 7
>gb|AY890826.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH009565.01L heat shock
27kDa protein 1 (HSPB1) mRNA, partial cds
Length=618
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 56 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 7
>dbj|AB020027.1| Homo sapiens HSP27 mRNA, complete cds
Length=764
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 81 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 32
>emb|AL050380.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp586P1322 (from clone DKFZp586P1322)
Length=640
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 70 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 21
>gb|AF086135.1|HUMZA89B11 Homo sapiens full length insert cDNA clone ZA89B11
Length=750
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 124 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 75
>gb|U90906.1|HSU90906 Human clone 23827 heat shock protein mRNA, complete cds
gb|FJ224323.1| Homo sapiens epididymis secretory protein Li 102 (HEL-S-102)
mRNA, complete cds
Length=865
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 163 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 114
>emb|Z23090.1| H.sapiens mRNA for 28 kDa heat shock protein
Length=1231
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Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 547 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 498
>emb|X54079.1| Human mRNA for heat shock protein HSP27
Length=789
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 108 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 59
>ref|XM_003895845.2| PREDICTED: Papio anubis heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=892
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 206 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACTCGGCGCTC 157
>ref|XR_613818.1| PREDICTED: Callithrix jacchus heat shock protein beta-1 pseudogene
(LOC100405418), misc_RNA
Length=777
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCTCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 39
>ref|XM_002743949.3| PREDICTED: Callithrix jacchus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=1350
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCTCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 618
>ref|XR_143851.2| PREDICTED: Callithrix jacchus heat shock protein beta-1 pseudogene
(LOC100407852), misc_RNA
Length=767
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCTCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 39
>ref|NG_008236.2| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 pseudogene 2 (HSPB1P2)
on chromosome X
Length=941
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Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 146
>ref|NG_021311.2| Homo sapiens coiled-coil domain containing 22 (CCDC22), RefSeqGene
on chromosome X
Length=25062
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3982 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 4031
>ref|NG_009095.2| Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, L type, alpha
1F subunit (CACNA1F), RefSeqGene on chromosome X
Length=35304
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
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Sbjct 3921 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 3872
>ref|NM_001260949.2| Macaca mulatta heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=893
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 208 AAGGGATCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 159
>gb|AC232271.2| Homo sapiens BAC clone RP11-922B14 from chromosome x, complete
sequence
Length=187486
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49031 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 48982
>gb|AC233276.3| Homo sapiens BAC clone RP11-57A11 from chromosome x, complete
sequence
Length=157051
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133605 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 133556
>gb|AC209049.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC12-46881500I4 from chromosome x,
complete sequence
Length=35407
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28245 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 28196
>dbj|AB170214.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10826, similar to
human coatomer protein complex, subunit zeta 2 (COPZ2), mRNA,
RefSeq: NM_016429.1
Length=932
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 AAGGGATCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 45
>gb|BT019888.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 mRNA, complete cds
Length=618
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCACGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 7
>gb|AF235097.2| Homo sapiens chromosome X multiple clones map p11.23, complete
sequence
Length=140335
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 41403 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 41452
>gb|AC149133.1| Pan troglodytes chromosome X clone RP43-010O16 map human ortholog
p11.23 complete sequence
Length=179327
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169555 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 169604
>gb|AC093131.2| Papio anubis clone RP41-51G4, complete sequence
Length=181049
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 144483 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACTCGGCGCTC 144434
>emb|AJ006216.1| Homo sapiens CACNA1F gene, exons 1 to 48
Length=31501
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1661 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 1612
>emb|X03901.1| Human pseudogene for heat shock protein 27
Length=1684
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 907
>ref|XR_162377.2| PREDICTED: Papio anubis heat shock protein beta-1 pseudogene
(LOC101004512), misc_RNA
Length=781
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 50/52 (96%), Gaps = 2/52 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AAGGGGTCCCAGCTGGGG-CCCC-GCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 98 AAGGGGTCCCAGCTGGGGTCCCCGGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 47
>ref|XR_609808.1| PREDICTED: Pan paniscus heat shock protein beta-1 pseudogene
(LOC100989392), misc_RNA
Length=597
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 GGGTCCCAGCTGGGGTCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 7
>ref|NM_001283885.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865323 (LOC101865323),
mRNA
dbj|AB173221.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-21560, similar to
human heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA, RefSeq: NM_001540.2
Length=845
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 7 TCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 TCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 96
>dbj|AK296890.1| Homo sapiens cDNA FLJ52243 complete cds, highly similar to Heat-shock
protein beta-1
Length=672
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 9 CCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 CCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 47
>gb|KM215216.1| Bubalus bubalis HSPB1 (HSPB1) gene, complete cds
Length=712
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 53 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 7
>ref|XM_007468802.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=849
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 174 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 128
>ref|XM_007186570.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni heat shock 27kDa
protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=856
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 169 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 123
>ref|XM_006057129.1| PREDICTED: Bubalus bubalis heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=893
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 210 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 164
>ref|XM_007103974.1| PREDICTED: Physeter catodon heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=859
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 183 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 137
>ref|XM_005892870.1| PREDICTED: Bos mutus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=939
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 53 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 7
>ref|XM_005225115.1| PREDICTED: Bos taurus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), transcript
variant X1, mRNA
Length=885
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 206 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 160
>ref|XM_004321557.1| PREDICTED: Tursiops truncatus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=854
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 187 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 141
>ref|XR_183586.1| PREDICTED: Orcinus orca heat shock 27kDa protein 1 pseudogene
(LOC101288848), misc_RNA
Length=864
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 187 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 141
>ref|XM_004268817.1| PREDICTED: Orcinus orca heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=864
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 188 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 142
>dbj|AB605262.1| Bos taurus HSPB1 mRNA for heat shock 27kDa protein 1, complete
cds
Length=672
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 103 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 57
>ref|NM_001025569.1| Bos taurus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=812
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 174 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 128
>gb|BC102129.1| Bos taurus heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:127043
IMAGE:7942274), complete cds
Length=848
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 158 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 112
>gb|BT021550.1| Bos taurus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA, complete
cds
Length=856
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 4 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 177 GGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGCACTCGGCGCTC 131
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG
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mRNA
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gene for heat shock 27kDa protein 1, without stop codon, in
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on chromosome 7
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protein beta-1
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Sbjct 167 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 216
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1 (HSPB1), mRNA
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sequence
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Sbjct 254 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 303
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Sbjct 254 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 303
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RZPDo839D02100D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
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Sbjct 254 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 303
>gb|AC182768.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-178I17 from chromosome 7, complete
sequence
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Sbjct 164684 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 164733
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Sbjct 232 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 281
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partial cds
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Sbjct 232 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 281
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IMAGE:5444848), complete cds
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Sbjct 252 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 301
>gb|BC012768.2| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:16252
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Sbjct 254 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 303
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IMAGE:3862626), complete cds
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Sbjct 305 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 354
>gb|DQ379985.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1) gene, complete
cds
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Sbjct 2339 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 2388
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IMAGE:2822325), complete cds
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Sbjct 331 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 380
>gb|BC014920.1|BC014920 Homo sapiens, clone IMAGE:3906970, mRNA, partial cds
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Sbjct 191 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 240
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Sbjct 48833 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 48784
>gb|L39370.1|HUMHSP27X Homo sapiens heat shock protein 27 (HSPB1) gene, complete cds
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Sbjct 481 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 530
>emb|CR536489.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0917D
for gene HSPB1, heat shock 27kDa protein 1; complete cds,
incl. stopcodon
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Sbjct 232 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 281
>emb|CR407614.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B022D
for gene HSPB1, heat shock 27kDa protein 1 complete cds, without
stopcodon
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Sbjct 232 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 281
>gb|AY890826.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH009565.01L heat shock
27kDa protein 1 (HSPB1) mRNA, partial cds
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Sbjct 232 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 281
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Sbjct 257 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 306
>emb|AL050380.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp586P1322 (from clone DKFZp586P1322)
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Sbjct 118 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 167
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Sbjct 300 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 349
>gb|U90906.1|HSU90906 Human clone 23827 heat shock protein mRNA, complete cds
gb|FJ224323.1| Homo sapiens epididymis secretory protein Li 102 (HEL-S-102)
mRNA, complete cds
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Sbjct 339 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 388
>emb|Z23090.1| H.sapiens mRNA for 28 kDa heat shock protein
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Sbjct 723 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 772
>emb|X54079.1| Human mRNA for heat shock protein HSP27
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Sbjct 284 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 333
>ref|XM_010387433.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana heat shock 27kDa protein 1
(HSPB1), mRNA
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Sbjct 387 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACGGCGGACCG 436
>ref|XM_003780459.2| PREDICTED: Pongo abelii heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
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Sbjct 441 AGCCGGCAGCTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 490
>ref|XM_004045620.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 4 (HSPB1), mRNA
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Sbjct 441 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGAGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 490
>ref|XM_004045619.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 3 (HSPB1), mRNA
Length=978
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 441 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGAGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 490
>ref|XM_004045618.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 2 (HSPB1), mRNA
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 441 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGAGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 490
>ref|XM_004045617.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 1 (HSPB1), mRNA
Length=1437
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 441 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGAGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 490
>gb|AC206559.4| Pongo abelii BAC clone CH276-41P10 from chromosome unknown, complete
sequence
Length=210819
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 172011 AGCCGGCAGCTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 172060
>ref|XM_002743949.3| PREDICTED: Callithrix jacchus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=1350
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 843 AGCCGGCAGCTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACGGCGGACCG 892
>ref|XM_008018402.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus heat shock protein beta-1 (LOC103246661),
mRNA
Length=572
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 359 AGCCGGCAGCTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACGGCGGACCG 408
>ref|NM_001260949.2| Macaca mulatta heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=893
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AGCCGGCAACTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACTGCGGACCG 50
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Sbjct 384 AGCCGGCAGCTCAGCAGCGGGGTCTCGGAGATCCGGCACACGGCGGACCG 433
>ref|XM_003934276.2| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis heat shock 27kDa protein
1 (HSPB1), mRNA
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Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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7 7 75932384 75933327 9M725N64M118N27M AGATCACCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932387 75932487 100M TCACCGGTGAGCCCCCCTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGG
7 7 75932390 75933333 3M725N64M118N33M CCG|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932394 75932494 100M TGAGCCCCCCTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTA
7 7 75932397 75932497 100M GCCCCCCTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAAC
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Lambda K H
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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genome shotgun sequence
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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Sbjct 14493484 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 14493533
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shotgun sequence
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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Sbjct 65690922 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 65690971
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Sbjct 75472247 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 75472296
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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Sbjct 71018673 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 71018722
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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Sbjct 75265416 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 75265465
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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Sbjct 70800851 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 70800900
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG
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pseudogene (LOC104655302), misc_RNA
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Sbjct 102 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 53
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(HSPB1), mRNA
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
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Sbjct 219 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 170
>ref|XM_519162.5| PREDICTED: Pan troglodytes heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
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Sbjct 268 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 219
>ref|XM_003780459.2| PREDICTED: Pongo abelii heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=803
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
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Sbjct 273 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 224
>ref|XM_003846008.2| PREDICTED: Pan paniscus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 268 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 219
>ref|XM_008018402.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus heat shock protein beta-1 (LOC103246661),
mRNA
Length=572
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 191 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 142
>ref|XM_004045620.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 4 (HSPB1), mRNA
Length=925
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 224
>ref|XM_004045619.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 3 (HSPB1), mRNA
Length=978
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 224
>ref|XM_004045618.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 2 (HSPB1), mRNA
Length=958
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 224
>ref|XM_004045617.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 1 (HSPB1), mRNA
Length=1437
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 224
>dbj|AB528488.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6909, Homo sapiens HSPB1
gene for heat shock 27kDa protein 1, without stop codon, in
Flexi system
Length=632
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 24
>gb|AC206559.4| Pongo abelii BAC clone CH276-41P10 from chromosome unknown, complete
sequence
Length=210819
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171843 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 171794
>ref|NG_008995.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), RefSeqGene (LRG_248)
on chromosome 7
Length=8740
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5219 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 5170
>ref|NM_001540.3| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=914
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 170
>dbj|AK311894.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92160, Homo sapiens heat shock 27kDa protein
1 (HSPB1), mRNA
Length=656
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
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Sbjct 102 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 53
>gb|AC186393.2| Pan troglodytes BAC clone CH251-279L5 from chromosome 7, complete
sequence
Length=191011
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19271 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 19222
>gb|DQ896669.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011129; FLH263661.01L;
RZPDo839E01155D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 37
>gb|DQ894489.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008949; FLH263716.01L;
RZPDo839D0299D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 37
>gb|DQ893349.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100005979; FLH263580.01X;
RZPDo839E01156D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
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Sbjct 86 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 37
>gb|DQ891304.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100003934; FLH263567.01X;
RZPDo839D02100D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
Length=658
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 37
>gb|AC182768.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-178I17 from chromosome 7, complete
sequence
Length=186886
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
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Sbjct 164516 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 164467
>gb|BT019887.1| Synthetic construct Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 mRNA,
partial cds
Length=618
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
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Sbjct 64 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 15
>gb|BC073768.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:88776
IMAGE:5444848), complete cds
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
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Sbjct 84 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 35
>gb|BC012768.2| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:16252
IMAGE:3689220), complete cds
Length=781
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 37
>gb|BC012292.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:21487
IMAGE:3862626), complete cds
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
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Sbjct 137 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 88
>gb|DQ379985.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1) gene, complete
cds
Length=5687
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
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Sbjct 2171 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 2122
>gb|BC000510.2| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:8509
IMAGE:2822325), complete cds
Length=867
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 114
>gb|AC006388.3| Homo sapiens BAC clone CTA-363M4 from 7, complete sequence
Length=59241
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
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Sbjct 49001 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 49050
>gb|L39370.1|HUMHSP27X Homo sapiens heat shock protein 27 (HSPB1) gene, complete cds
Length=2496
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 313 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 264
>emb|CR536489.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0917D
for gene HSPB1, heat shock 27kDa protein 1; complete cds,
incl. stopcodon
Length=618
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Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 15
>emb|CR407614.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B022D
for gene HSPB1, heat shock 27kDa protein 1 complete cds, without
stopcodon
Length=615
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 15
>gb|AY890826.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH009565.01L heat shock
27kDa protein 1 (HSPB1) mRNA, partial cds
Length=618
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 15
>dbj|AB020027.1| Homo sapiens HSP27 mRNA, complete cds
Length=764
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 89 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 40
>emb|AL050380.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp586P1322 (from clone DKFZp586P1322)
Length=640
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 29
>gb|AF086135.1|HUMZA89B11 Homo sapiens full length insert cDNA clone ZA89B11
Length=750
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 132 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 83
>gb|U90906.1|HSU90906 Human clone 23827 heat shock protein mRNA, complete cds
gb|FJ224323.1| Homo sapiens epididymis secretory protein Li 102 (HEL-S-102)
mRNA, complete cds
Length=865
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 122
>emb|Z23090.1| H.sapiens mRNA for 28 kDa heat shock protein
Length=1231
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 506
>emb|X54079.1| Human mRNA for heat shock protein HSP27
Length=789
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 116 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 67
>ref|XM_003895845.2| PREDICTED: Papio anubis heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=892
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGAC 166
>gb|AC093131.2| Papio anubis clone RP41-51G4, complete sequence
Length=181049
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGAC 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144491 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGAC 144443
>ref|NM_001260949.2| Macaca mulatta heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=893
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 AGTCGCGGAAGGGATCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 167
>dbj|AB170214.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-10826, similar to
human coatomer protein complex, subunit zeta 2 (COPZ2), mRNA,
RefSeq: NM_016429.1
Length=932
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 AGTCGCGGAAGGGATCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 53
>gb|BT019888.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 mRNA, complete cds
Length=618
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 64 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCACGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 15
>ref|NM_001283885.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101865323 (LOC101865323),
mRNA
dbj|AB173221.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-21560, similar to
human heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA, RefSeq: NM_001540.2
Length=845
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 50
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 AGTCGCGGAAAGGATCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG 104
>gb|KM215216.1| Bubalus bubalis HSPB1 (HSPB1) gene, complete cds
Length=712
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 AGTCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 19
>ref|XM_006057129.1| PREDICTED: Bubalus bubalis heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=893
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 AGTCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 176
>ref|XM_005892870.1| PREDICTED: Bos mutus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=939
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 AGTCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 19
>ref|XM_005225115.1| PREDICTED: Bos taurus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), transcript
variant X1, mRNA
Length=885
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 AGTCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 172
>dbj|AB605262.1| Bos taurus HSPB1 mRNA for heat shock 27kDa protein 1, complete
cds
Length=672
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 114 AGTCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 69
>ref|NM_001025569.1| Bos taurus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=812
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 AGTCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 140
>gb|BC102129.1| Bos taurus heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:127043
IMAGE:7942274), complete cds
Length=848
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 AGTCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 124
>gb|BT021550.1| Bos taurus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA, complete
cds
Length=856
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 45/46 (98%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 AGTCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 143
>ref|XM_007468802.1| PREDICTED: Lipotes vexillifer heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=849
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 TCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 140
>ref|XM_007186570.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni heat shock 27kDa
protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=856
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 TCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 135
>ref|XM_007103974.1| PREDICTED: Physeter catodon heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=859
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 TCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 149
>ref|XM_004321557.1| PREDICTED: Tursiops truncatus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=854
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 TCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 153
>ref|XR_183586.1| PREDICTED: Orcinus orca heat shock 27kDa protein 1 pseudogene
(LOC101288848), misc_RNA
Length=864
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 TCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 153
>ref|XM_004268817.1| PREDICTED: Orcinus orca heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=864
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 TCGCGGAAAGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 154
>ref|XM_005972242.1| PREDICTED: Pantholops hodgsonii heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=520
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 44/46 (96%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG 46
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 126 AGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCTTAGGAGCGAGAAGGG 81
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC
>ref|NG_008995.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), RefSeqGene (LRG_248)
on chromosome 7
Length=8740
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5478 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 5527
>gb|AC186393.2| Pan troglodytes BAC clone CH251-279L5 from chromosome 7, complete
sequence
Length=191011
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19530 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 19579
>gb|AC182768.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-178I17 from chromosome 7, complete
sequence
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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Sbjct 164775 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 164824
>gb|DQ379985.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1) gene, complete
cds
Length=5687
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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Sbjct 2430 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 2479
>gb|AC006388.3| Homo sapiens BAC clone CTA-363M4 from 7, complete sequence
Length=59241
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Sbjct 48742 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 48693
>gb|L39370.1|HUMHSP27X Homo sapiens heat shock protein 27 (HSPB1) gene, complete cds
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Sbjct 572 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 621
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Length=750
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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Sbjct 391 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 440
>gb|GQ436788.1| Ailuropoda melanoleuca heat shock protein beta-1 (HSPB1) gene,
complete cds
Length=1193
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 50
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Sbjct 336 AGCTGACGGTCAAGACGAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCC 385
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1 (HSPB1), mRNA
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Sbjct 472 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 514
>ref|XM_519162.5| PREDICTED: Pan troglodytes heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=947
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 527 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 569
>ref|XM_003780459.2| PREDICTED: Pongo abelii heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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(LOC100405418), misc_RNA
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 355 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 397
>ref|XM_003846008.2| PREDICTED: Pan paniscus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 527 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 569
>ref|XM_002743949.3| PREDICTED: Callithrix jacchus heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 934 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 976
>ref|XR_143851.2| PREDICTED: Callithrix jacchus heat shock protein beta-1 pseudogene
(LOC100407852), misc_RNA
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 355 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 397
>ref|XM_004045620.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 4 (HSPB1), mRNA
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 532 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 574
>ref|XM_004045619.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 3 (HSPB1), mRNA
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 532 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 574
>ref|XM_004045618.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 2 (HSPB1), mRNA
Length=958
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 532 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 574
>ref|XM_004045617.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla heat shock 27kDa protein 1,
transcript variant 1 (HSPB1), mRNA
Length=1437
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 532 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 574
>dbj|AB528488.1| Synthetic construct DNA, clone: pF1KB6909, Homo sapiens HSPB1
gene for heat shock 27kDa protein 1, without stop codon, in
Flexi system
Length=632
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 332 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 374
>ref|NM_001540.3| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1), mRNA
Length=914
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 478 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 520
>dbj|AK296890.1| Homo sapiens cDNA FLJ52243 complete cds, highly similar to Heat-shock
protein beta-1
Length=672
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 258 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 300
>dbj|AK311894.1| Homo sapiens cDNA, FLJ92160, Homo sapiens heat shock 27kDa protein
1 (HSPB1), mRNA
Length=656
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 361 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 403
>gb|DQ896669.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100011129; FLH263661.01L;
RZPDo839E01155D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 345 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 387
>gb|DQ894489.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100008949; FLH263716.01L;
RZPDo839D0299D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 345 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 387
>gb|DQ893349.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100005979; FLH263580.01X;
RZPDo839E01156D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 345 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 387
>gb|DQ891304.2| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100003934; FLH263567.01X;
RZPDo839D02100D heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1)
gene, encodes complete protein
Length=658
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 345 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 387
>gb|BT019888.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 mRNA, complete cds
Length=618
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 323 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 365
>gb|BT019887.1| Synthetic construct Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1 mRNA,
partial cds
Length=618
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 365
>gb|BC073768.1| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:88776
IMAGE:5444848), complete cds
Length=794
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 385
>gb|BC012768.2| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:16252
IMAGE:3689220), complete cds
Length=781
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 345 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 387
>gb|BC000510.2| Homo sapiens heat shock 27kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:8509
IMAGE:2822325), complete cds
Length=867
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 464
>gb|BC014920.1|BC014920 Homo sapiens, clone IMAGE:3906970, mRNA, partial cds
Length=724
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
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Sbjct 282 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 324
>emb|CR536489.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834F0917D
for gene HSPB1, heat shock 27kDa protein 1; complete cds,
incl. stopcodon
Length=618
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 365
>emb|CR407614.1| Homo sapiens full open reading frame cDNA clone RZPDo834B022D
for gene HSPB1, heat shock 27kDa protein 1 complete cds, without
stopcodon
Length=615
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 365
>gb|AY890826.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH009565.01L heat shock
27kDa protein 1 (HSPB1) mRNA, partial cds
Length=618
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Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 365
>dbj|AB020027.1| Homo sapiens HSP27 mRNA, complete cds
Length=764
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 390
>emb|AL050380.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp586P1322 (from clone DKFZp586P1322)
Length=640
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 209 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 251
>gb|U90906.1|HSU90906 Human clone 23827 heat shock protein mRNA, complete cds
gb|FJ224323.1| Homo sapiens epididymis secretory protein Li 102 (HEL-S-102)
mRNA, complete cds
Length=865
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 472
>emb|Z23090.1| H.sapiens mRNA for 28 kDa heat shock protein
Length=1231
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 856
>emb|X54079.1| Human mRNA for heat shock protein HSP27
Length=789
Score = 80.5 bits (43), Expect = 1e-12
Identities = 43/43 (100%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 417
>gb|AC093131.2| Papio anubis clone RP41-51G4, complete sequence
Length=181049
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 48/51 (94%), Gaps = 1/51 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAG-CCC 50
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 144750 AGCTAACGGTTAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGTCCC 144800
>emb|X16477.1| Human mRNA fragment for estrogen-regulated 24k protein
Length=409
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 41
>ref|XM_001378935.3| PREDICTED: Monodelphis domestica heat shock 27kDa protein 1 (HSPB1),
mRNA
Length=940
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 AGCTGACCGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 513
>ref|XR_180315.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys heat shock protein beta-1-like
(LOC100606388), misc_RNA
Length=739
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333 AGCTGACGGTTAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 375
>gb|AY518309.1| Saguinus oedipus intracellular estradiol-binding protein mRNA,
complete cds
Length=737
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 43
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 AGCTGACCGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGG 369
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
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7 7 75932275 75932175 100m TGCTGAGTTGCCGGCTGAGCGCGCGGCTGTAGGCGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCT
7 7 75932272 75932172 100m TGAGTTGCCGGCTGAGCGCGCGGCTGTAGGCGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCT
7 7 75932269 75932169 100m GTTGCCGGCTGAGCGCGCGGCTGTAGGCGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCC
7 7 75932266 75932166 100m GCCGGCTGAGCGCGCGGCTGTAGGCGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCC
7 7 75932263 75932163 100m GGCTGAGCGCGCGGCTGTAGGCGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAA
7 7 75932260 75932160 100m TGAGCGCGCGGCTGTAGGCGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCA
7 7 75932257 75932157 100m GCGCGCGGCTGTAGGCGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTG
7 7 75932254 75932154 100m CGCGGCTGTAGGCGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGA
7 7 75932251 75932151 100m GGCTGTAGGCGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTTTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCA
7 7 75932248 75932148 100m TGTAGGCGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTC
7 7 75932245 75932145 100m AGGCGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTC
7 7 75932242 75932142 100m CGGGCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGG
7 7 75932239 75932139 100m CCGCGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAG
7 7 75932236 75932136 100m CGGCCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCG
7 7 75932233 75932133 100m CCACTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGG
7 7 75932230 75932130 100m CTGCGGGGCTCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAG
7 7 75932227 75932127 100m CGGGCCTCTCGATGGGGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCC
7 7 75932224 75932124 100m GGCTCTGGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAA
7 7 75932221 75932121 100m TCTCGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGC
7 7 75932218 75932118 100m CGATGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTG
7 7 75932215 75932115 100m TGGCGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTC
7 7 75932212 75932111 70m1d30m CGGCGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCDAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAG
7 7 75932209 75932109 100m CGGGGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAG
7 7 75932206 75932106 100m GGGGCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCG
7 7 75932203 75932103 100m GCAGGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCT
7 7 75932200 75932100 100m GGGGGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATG
7 7 75932197 75932097 100m GGCGCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGG
7 7 75932194 75932094 100m GCACGTAGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTA
7 7 75932191 75932091 100m CGTAGCCGGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCA
7 7 75932188 75932088 100m AGCCTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTC
7 7 75932185 75932085 100m CTGGCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCG
7 7 75932182 75932082 100m GCCAGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAA
7 7 75932179 75932079 100m AGCTGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGG
7 7 75932176 75932076 100m TGCTGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTC
7 7 75932173 75932073 100m TGCCGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCA
7 7 75932170 75932070 100m CGCCTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCT
7 7 75932167 75932067 100m CTAACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGG
7 7 75932164 75932064 100m ACCACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCC
7 7 75932161 75932061 100m ACTGCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCG
7 7 75932158 75932058 100m GCGACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAG
7 7 75932155 75932055 100m ACCACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAG
7 7 75932152 75932052 100m ACTCCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGA
7 7 75932149 75932049 100m CCTCCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAA
7 7 75932146 75932046 100m CCGGCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGG
7 7 75932143 75932043 100m GCAGCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGCC
7 7 75932140 75932040 100m GCCGGGGCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCG
7 7 75932137 75932037 100m GGGGCAGCCGGAGGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCG
7 7 75932134 75932034 100m GCAGCCCGAAGGCCTGGTCGAAGAGGCGGCTATGCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACGCGGCGCTC
7 7 75932101 75932392 59m75932352F41M GCGGGTACCAGTCGCGGAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACC
7 7 75932085 75933133 43m75932352F42M725N15M GAAGGGGTCCCAGCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932073 75933145 31m75932352F42M725N27M GCTGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932071 75933147 29m75932352F42M725N29M TGGGGCCCCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932064 75933154 22m75932352F42M725N36M CCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932064 75933154 22m75932352F42M725N36M CCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932064 75933154 22m75932352F42M725N36M CCGCAGGAGCGAGAAGGGGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932053 75933165 11m75932352F42M725N47M AGAAGGGGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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7 7 75932048 75933170 6m75932352F42M725N52M CGGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932047 75933171 5m75932352F42M725N53M GGACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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7 7 75932046 75933172 4m75932352F42M725N54M GACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932046 75933172 4m75932352F42M725N54M GACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932046 75933172 4m75932352F42M725N54M GACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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7 7 75932046 75933172 4m75932352F42M725N54M GACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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7 7 75932045 75933173 3m75932352F42M725N55M ACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932045 75933173 3m75932352F42M725N55M ACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932045 75933173 3m75932352F42M725N55M ACG AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGACATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932342 75933167 51M725N49M CCCCGGACGAGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932345 75933170 48M725N52M CGGACGAGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932348 75933173 45M725N55M ACGAGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932351 75933176 42M725N58M AGCTGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932354 75932454 100M TGACGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCCCCCTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGG
7 7 75932357 75933182 36M725N64M CGGTCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932360 75933303 33M725N64M118N3M TCAAGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932363 75933306 30M725N64M118N6M AGACCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932366 75933309 27M725N64M118N9M CCAAGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932369 75933312 24M725N64M118N12M AGGATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932372 75933315 21M725N64M118N15M ATGGCGTGGTGGAGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932375 75932475 100M GCGTGGTGGAGATCACCGGTGAGCCCCCCTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGGG
7 7 75932378 75932478 100M TGGTGGAGATCACCGGTGAGCCCCCCTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGGCCCG
7 7 75932381 75932481 100M TGGAGATCACCGGTGAGCCCCCCTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGG
7 7 75932384 75933327 9M725N64M118N27M AGATCACCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932387 75932487 100M TCACCGGTGAGCCCCCCTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGG
7 7 75932390 75933333 3M725N64M118N33M CCG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 7 75932394 75932494 100M TGAGCCCCCCTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTA
7 7 75932397 75932497 100M GCCCCCCTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAAC
7 7 75932400 75932500 100M CCCTTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTT
7 7 75932403 75932503 100M CTGCTCCTGCAGGGGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAAAGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGC
7 7 75932408 75932508 100M CCTGGAGGGGAGAGGAGCAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGCCCAGC
7 7 75932411 75932511 100M GCAGGGGAGAGGAGGAGTCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGCCCAGCACC
7 7 75932416 75932516 100M GGAGAGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGCCCAGCACCGGGAA
7 7 75932420 75932520 100M AGGAGGAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGCCCAGCACCGGGAAAAAC
7 7 75932425 75932525 100M GAGGCTAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGCCCAGCACCGGGAAAAACAGGAC
7 7 75932430 75932530 100M TAGCAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGCCCAGCACCGGGAAAAACAGGACTCCTG
7 7 75932433 75932533 100M CAGGGCGGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGCCCAGCACCGGGAAAAACAGGACTCCTGATT
7 7 75932439 75932539 100M GGGCAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGGCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGCCCAGCACCGGGAAAAACAGCACTCCTGATTCCCTTG
7 7 75932442 75932542 100M CAGGGCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGCCCAGCACCGGGAAAAACAGGACTCCTGATTCCCTTGCTC
7 7 75932446 75932546 100M GCCGGGGGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGCCCAGCACCGGGAAAAACAGGACTCCTGATTCCCTTGCTCAGGA
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7 7 75932452 75932552 100M GGCGTGCGGTTGAAACGGGGGTCCCGGGGGCCTGGGGAGTTAAACGTTGGCCCAGCACCGGGAAAAACAGGACTCCTGATTCCCTTGCTCAGGAATTGGG
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2E (KMT2E), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 103247 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 103198
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2E (KMT2E), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 5073 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 5024
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2E (KMT2E), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 5133 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 5084
>ref|XR_175160.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla histone-lysine N-methyltransferase
MLL5-like (LOC101144971), partial misc_RNA
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Sbjct 3322 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 3273
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sequence
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Sbjct 5066 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 5017
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transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 5214 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 5165
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Sbjct 5214 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 5165
>gb|AF519459.1| Homo sapiens MLL5 (MLL5) mRNA, complete cds
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>gb|AY157990.1| Homo sapiens myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia 5 (MLL5)
mRNA, complete cds, alternatively spliced
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Sbjct 4440 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 4391
>gb|AC005070.1| Homo sapiens BAC clone CTB-152G17 from 7q22-q31.1, complete sequence
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>ref|XM_004652885.1| PREDICTED: Jaculus jaculus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (Kmt2e), mRNA
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Sbjct 5079 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGGAGGCGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 5030
>ref|XM_010380516.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 4635 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 4583
>ref|XM_010380510.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAG---GAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 50
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Sbjct 5175 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 5123
>ref|XM_010380503.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X1, mRNA
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Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
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Query 1 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAG---GAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 50
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Sbjct 5111 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 5059
>ref|XM_007982490.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 4441 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 4389
>ref|XM_007982489.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 4788 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 4736
>ref|XM_007982488.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 4860 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 4808
>ref|XM_007982487.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 4822 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 4770
>ref|XM_007982486.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 5209 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 5157
>ref|XM_007982484.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAG---GAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 50
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Sbjct 5120 CTGGTTTTGATAGTAAGACGAAGAAGAAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGGGGTG 5068
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC
>ref|NG_033949.1| Homo sapiens lysine (K)-specific methyltransferase 2E (KMT2E),
RefSeqGene on chromosome 7
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 103435 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 103484
>ref|XM_006716049.1| PREDICTED: Homo sapiens lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X2, mRNA
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5261 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5310
>ref|XM_005250493.1| PREDICTED: Homo sapiens lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X1, mRNA
Length=6782
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5321 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5370
>ref|XR_175160.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla histone-lysine N-methyltransferase
MLL5-like (LOC101144971), partial misc_RNA
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 3510 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 3559
>ref|NM_018682.3| Homo sapiens lysine (K)-specific methyltransferase 2E (KMT2E),
transcript variant 2, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5254 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5303
>ref|NM_182931.2| Homo sapiens lysine (K)-specific methyltransferase 2E (KMT2E),
transcript variant 1, mRNA
Length=6873
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5402 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5451
>gb|AY147037.1| Homo sapiens MLL5 (MLL5) mRNA, complete cds; alternatively spliced
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5402 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5451
>gb|AF519459.1| Homo sapiens MLL5 (MLL5) mRNA, complete cds
Length=6543
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5069 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5118
>gb|AY157990.1| Homo sapiens myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia 5 (MLL5)
mRNA, complete cds, alternatively spliced
Length=5337
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 4628 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 4677
>gb|AC005070.1| Homo sapiens BAC clone CTB-152G17 from 7q22-q31.1, complete sequence
Length=113033
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Sbjct 11763 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 11812
>ref|XM_009453929.1| PREDICTED: Pan troglodytes lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X7, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 4761 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 4810
>ref|XM_009453928.1| PREDICTED: Pan troglodytes lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X6, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 4913 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 4962
>ref|XM_009453927.1| PREDICTED: Pan troglodytes lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X5, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5207 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5256
>ref|XM_009453926.1| PREDICTED: Pan troglodytes lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X4, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5202 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5251
>ref|XM_009453925.1| PREDICTED: Pan troglodytes lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5537 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5586
>ref|XM_003318730.3| PREDICTED: Pan troglodytes lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5414 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5463
>ref|XM_009453924.1| PREDICTED: Pan troglodytes lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5328 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5377
>ref|XM_008963547.1| PREDICTED: Pan paniscus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X7, mRNA
Length=6129
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 4666 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 4715
>ref|XM_008963546.1| PREDICTED: Pan paniscus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X6, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 4493 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 4542
>ref|XM_008963545.1| PREDICTED: Pan paniscus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X5, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5158 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5207
>ref|XM_008963544.1| PREDICTED: Pan paniscus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X4, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5007 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5056
>ref|XM_008963543.1| PREDICTED: Pan paniscus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5201 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5250
>ref|XM_003811182.2| PREDICTED: Pan paniscus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5419 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5468
>ref|XM_008963542.1| PREDICTED: Pan paniscus lysine (K)-specific methyltransferase
2E (KMT2E), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 5284 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 5333
>gb|AC188594.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-483H4 from chromosome 7, complete
sequence
Length=195867
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Query 1 CTGCCGTAGTCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 50
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Sbjct 132076 CTGCCGTAATCCCCCCTCCTCCTCCACCACCACCTGCTCCAGGACCGCAC 132125
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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Effective search space used: 1711909892800
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7 7 104753051 104752951 100m TGGTAGGGTTCTGAGAGGGCAAAAAATGCCCTGGAGTCACGTGGTGTCCTGGAACTGTTTGCTGGCTCGTGGTGCCAGGAAGTGCTTGATTTGGTCCTGA
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7 7 104752985 104752885 100m TTGTGGTGCCAGGAAGTGCTTGATTTGGTCCTGATGTAAACACAGTTTGTTGAGAAAGACTACCTTTGAGCTGATTATAATTCTGAAAGTTTGCAGAGGG
7 7 104752982 104752882 100m TGGTGCCAGGAAGTGCTTGATTTGGTCCTGATGTAAACACAGTTTGTTGAGAAAGACTACCTTTGAGCTGATTATAATTCTGAAAGTTTGCAGAGGGCTG
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Sbjct 148419338 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 148419387
>ref|NT_007933.16| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR7_CTG4_4
gb|GL000059.2| Homo sapiens chromosome 7 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188223, whole genome shotgun sequence
gb|DS486135.1| Homo sapiens SCAF_1103279188223 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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sequence
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>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 142195789 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 142195838
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Sbjct 147454747 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 147454796
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Sbjct 142786990 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 142787039
>ref|NC_018918.2| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
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Sbjct 148124819 TCCTAAACCAGTGCGAAACAGACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 148124868
>ref|NW_004929333.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150117.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 8786208 TCCTAAACCAGTGCGAAACAGACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 8786257
>gb|KE141099.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold15, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 4135405 TCCTAAACCAGTGCGAAACAGACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 4135454
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Sbjct 142195843 TCCTAAACCAGTGCGAAACAGACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 142195892
>gb|DS990773.1| Homo sapiens SCAF_1112675837168 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 4076113 TCCTAAACCAGTGCGAAACAGACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 4076162
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA
>ref|XM_006715919.1| PREDICTED: Homo sapiens contactin associated protein-like 2 (CNTNAP2),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 6135 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 6086
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Sbjct 7985 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 7936
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complete sequence
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Sbjct 30329 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 30378
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complete sequence
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complete sequence
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complete sequence
Length=31471
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complete sequence
Length=32540
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Sbjct 20945 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 20896
>gb|AC237281.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-50117900C12 from chromosome unknown,
complete sequence
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Sbjct 10507 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 10458
>gb|AC236921.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC11-49430500D10 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=38912
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Query 1 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 50
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Sbjct 4107 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 4156
>gb|AC237043.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC12-46340200M20 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=39222
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 50
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Sbjct 22936 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 22887
>ref|NG_007092.2| Homo sapiens contactin associated protein-like 2 (CNTNAP2), RefSeqGene
on chromosome 7
Length=2311634
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 50
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Sbjct 2307729 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 2307680
>gb|AC083849.6| Homo sapiens BAC clone RP11-163I18 from 7, complete sequence
Length=128611
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 57840 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 57791
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Length=3401
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Strand=Plus/Minus
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Sbjct 2899 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 2850
>emb|CR933671.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781D1846 (from clone DKFZp781D1846)
Length=6089
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Query 1 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 50
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Sbjct 4164 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 4115
>gb|AF319045.1|AF319045 Homo sapiens contactin-associated protein 2 (CNTNAP2) mRNA, complete
cds
Length=8107
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Sbjct 7605 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 7556
>gb|AC005378.2| Homo sapiens PAC clone RP5-1137M13 from 7q33-q35, complete sequence
Length=129036
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 50
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Sbjct 50399 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 50448
>ref|XM_003820514.1| PREDICTED: Pan paniscus contactin associated protein-like 2 (CNTNAP2),
mRNA
Length=9811
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Strand=Plus/Minus
Query 3 AACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 50
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Sbjct 7904 AACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 7857
>ref|XM_519462.4| PREDICTED: Pan troglodytes contactin associated protein-like
2 (CNTNAP2), mRNA
Length=8611
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 50
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Sbjct 8338 AGAACAGATTCCATCAGAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 8289
>ref|XM_003270875.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys contactin associated protein-like
2 (CNTNAP2), mRNA
Length=9925
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 50
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Sbjct 8008 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACGACCTGA 7959
>gb|AC192005.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-597A14 from chromosome 7, complete
sequence
Length=219887
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAACAGATTCCATCATAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 50
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175499 AGAACAGATTCCATCAGAGAAGGAAAGAAAAGCTTCTTGACACAACCTGA 175450
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG
>ref|XM_006715919.1| PREDICTED: Homo sapiens contactin associated protein-like 2 (CNTNAP2),
transcript variant X1, mRNA
Length=8044
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 50
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Sbjct 6384 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 6433
>ref|XM_003270875.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys contactin associated protein-like
2 (CNTNAP2), mRNA
Length=9925
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8259 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 8308
>ref|XM_003820514.1| PREDICTED: Pan paniscus contactin associated protein-like 2 (CNTNAP2),
mRNA
Length=9811
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 50
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Sbjct 8155 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 8204
>ref|NM_014141.5| Homo sapiens contactin associated protein-like 2 (CNTNAP2), mRNA
Length=9894
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 50
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Sbjct 8234 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 8283
>gb|AC238680.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC11-48323400L15 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=41483
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 50
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Sbjct 30080 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 30031
>gb|AC237156.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC8-2145240M16 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=31471
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 50
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Sbjct 20480 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 20529
>gb|AC237106.4| Homo sapiens FOSMID clone ABC7-42499900J11 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=32540
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 50
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Sbjct 21194 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 21243
>gb|AC237281.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC14-50117900C12 from chromosome unknown,
complete sequence
Length=41389
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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>gb|AC192005.3| Pan troglodytes BAC clone CH251-597A14 from chromosome 7, complete
sequence
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Sbjct 4413 TCCTAAACCAGTGCGAAACAAACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 4462
>gb|AC238541.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-43992300F17 from chromosome unknown,
complete sequence
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>gb|AC237030.4| Homo sapiens FOSMID clone ABC10-43644600F21 from chromosome unknown,
complete sequence
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Sbjct 28674 TCCTAAACCAGTGCGAAACAGACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 28723
>gb|AC236921.2| Homo sapiens FOSMID clone ABC11-49430500D10 from chromosome unknown,
complete sequence
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>gb|AC005378.2| Homo sapiens PAC clone RP5-1137M13 from 7q33-q35, complete sequence
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Sbjct 50150 TCCTAAACCAGTGCGAAACAGACAGTAACAATGTCCCCAGCTGACTTCAG 50101
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>ref|XM_004093284.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys potassium voltage-gated channel,
subfamily H (eag-related), member 2 (KCNH2), mRNA
Length=3562
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3292 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 3243
>ref|NM_001204798.1| Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related),
member 2 (KCNH2), transcript variant 4, mRNA
Length=2463
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2196 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 2147
>ref|NM_172056.2| Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related),
member 2 (KCNH2), transcript variant 2, mRNA
Length=3558
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3291 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 3242
>ref|NG_008916.1| Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related),
member 2 (KCNH2), RefSeqGene (LRG_288) on chromosome
7
Length=39966
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 33251 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 33202
>gb|DQ784808.1| Homo sapiens potassium voltage-gated channel subfamily H member
2 (KCNH2) gene, complete cds
Length=38963
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7713 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 7762
>gb|BC080563.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6340663, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2523 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 2474
>gb|AC146440.5| Pan troglodytes BAC clone RP43-11P11 from chromosome 7, complete
sequence
Length=181369
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50238 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50287
>gb|BC001914.1| Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related),
member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3510423), partial
cds
Length=2819
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2547 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 2498
>gb|AC006343.3| Homo sapiens PAC clone RP4-548K24 from 7q34-q36, complete sequence
Length=124877
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16934 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 16885
>emb|AJ609614.1| Homo sapiens mRNA for potassium voltage-gated channel, subfamily
H (eag-related), member 2, putative transcript variant 4,
(KCNH2 gene)
Length=2123
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 1821
>gb|AF052728.1|AF052728 Homo sapiens HERG-USO (HERG) mRNA, alternatively spliced, partial
cds
Length=767
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 461
>gb|AC192348.4| Rhesus Macaque BAC CH250-193G17 () complete sequence
Length=176096
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 50/53 (94%), Gaps = 3/53 (6%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAAC---CCACCCACTGTGCACAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 115981 GGGAGGAAGTCCTCAGTGTCCAGACACACCAACAACCCACCCACTGTGCACAG 115929
>gb|AY927580.1| Homo sapiens mRNA sequence
Length=1215
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 41/41 (100%), Gaps = 0/41 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 TCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCCTCAGTGTCCAGACACACCAACCCACCCACTGTGCACAG 41
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG
>ref|XM_004093284.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys potassium voltage-gated channel,
subfamily H (eag-related), member 2 (KCNH2), mRNA
Length=3562
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2907 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 2956
>ref|NM_001204798.1| Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related),
member 2 (KCNH2), transcript variant 4, mRNA
Length=2463
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1811 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 1860
>ref|NM_172056.2| Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related),
member 2 (KCNH2), transcript variant 2, mRNA
Length=3558
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2906 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 2955
>ref|NG_008916.1| Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related),
member 2 (KCNH2), RefSeqGene (LRG_288) on chromosome
7
Length=39966
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32866 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 32915
>gb|DQ784808.1| Homo sapiens potassium voltage-gated channel subfamily H member
2 (KCNH2) gene, complete cds
Length=38963
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8098 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 8049
>gb|BC080563.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:6340663, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=2783
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2138 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 2187
>gb|BC001914.1| Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related),
member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3510423), partial
cds
Length=2819
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2162 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 2211
>gb|BT007336.1| Homo sapiens potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related),
member 2 mRNA, complete cds
Length=2319
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 2206
>gb|AY927580.1| Homo sapiens mRNA sequence
Length=1215
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 328
>gb|AY927502.1| Homo sapiens mRNA sequence
Length=1182
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 752 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 801
>gb|AC006343.3| Homo sapiens PAC clone RP4-548K24 from 7q34-q36, complete sequence
Length=124877
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16549 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 16598
>gb|AY889518.1| Synthetic construct Homo sapiens clone FLH015592.01X potassium
voltage-gated channel subfamily H member 2 (KCNH2) mRNA, complete
cds
Length=2319
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 2206
>emb|AJ609614.1| Homo sapiens mRNA for potassium voltage-gated channel, subfamily
H (eag-related), member 2, putative transcript variant 4,
(KCNH2 gene)
Length=2123
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 1534
>dbj|AB044806.1| Homo sapiens HERG mRNA for HERG-USO, alternatively spliced, complete
cds
Length=3337
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2688 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 2737
>gb|AF052728.1|AF052728 Homo sapiens HERG-USO (HERG) mRNA, alternatively spliced, partial
cds
Length=767
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 172
>gb|AC146440.5| Pan troglodytes BAC clone RP43-11P11 from chromosome 7, complete
sequence
Length=181369
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 50623 GCAGGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAAGTCAGGCCCTCCAAGCG 50574
>ref|XM_004065454.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla potassium voltage-gated channel,
subfamily H (eag-related), member 2 (KCNH2), mRNA
Length=2065
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 45/45 (100%), Gaps = 0/45 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAG 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906 GGGTCACTGGGCTCCTTTAATTCACCTAAACTCAGGCCCTCCAAG 1950
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
7 7 150646561 150646661 100M AACAGAAATGCTAGAATGAACCACATGCAGTAAGGCCCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGA
7 7 150646565 150646665 100M GAAATGCTAGAATGAACCACATGCAGTAAGGCCCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTG
7 7 150646568 150646668 100M ATGCTAGAATGAACCACATGCAGTAAGGCCCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGA
7 7 150646572 150646672 100M TAGAATGAACCACATGCAGTAAGGCCCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACA
7 7 150646575 150646675 100M AATGAACCACATGCAGTAAGGCCCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAG
7 7 150646578 150646678 100M GAACCACATGCAGTAAGGCCCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCT
7 7 150646581 150646681 100M CCACATGCAGTAAGGCCCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAA
7 7 150646584 150646684 100M CATGCAGTAAGGCCCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATG
7 7 150646587 150646687 100M GCAGTAAGGCCCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCC
7 7 150646590 150646690 100M GTAAGGCCCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTAC
7 7 150646594 150646694 100M GGCCCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATC
7 7 150646597 150646697 100M CCAGTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAAC
7 7 150646600 150646700 100M GTGTTATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTAT
7 7 150646604 150646704 100M TATGTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGAATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTC
7 7 150646607 150646707 100M GTAGTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAA
7 7 150646610 150646710 100M GTGAAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGA
7 7 150646613 150646713 100M AAACTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCT
7 7 150646616 150646716 100M CTTTGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGC
7 7 150646619 150646719 100M TGATTTTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTAT
7 7 150646624 150646724 100M TTAGTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTG
7 7 150646627 150646727 100M GTTTTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCC
7 7 150646630 150646730 100M TTGTGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGA
7 7 150646633 150646733 100M TGGGGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGC
7 7 150646636 150646736 100M GGGTGTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGCACA
7 7 150646640 150646740 100M GTGTATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGCACACAGG
7 7 150646643 150646743 100M TATTTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGCACACAGGGCC
7 7 150646646 150646746 100M TTGTGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGCACAAAGGGCCGAG
7 7 150646649 150646749 100M TGTTTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGCACACAGGGCCGAGGGA
7 7 150646652 150646752 100M TTGTACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGCACACAGGGCCGAGGGAAGG
7 7 150646655 150646755 100M TACAGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGCACACAGGGCCGAGGGAAGGACA
7 7 150646658 150646758 100M AGAGCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGCACACAGGGCCGAGGGAAGGACAGGC
7 7 150646661 150646761 100M GCTGAGAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGCACACAGGGCCGAGGGAAGGACAGGCAAA
7 7 150646666 150646766 100M GAAACAAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGCACACAGGGCCGAGGGAAGGACAGGCAAAGGGGG
7 7 150646671 150646771 100M AAAGTCTAAAATGTCCTACCATCAACTATGGTCGAAAGAGCTTGCTATATCTGCCCTGAGGCACACAGGGCCGAGGGAAGGACAGGCAAAGGGGGAGGAA
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Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 152407899 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 152407948
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 157873085 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 157873134
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Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 153101733 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 153101782
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Lambda K H
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right flanking sequence - AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 158869855 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 158869904
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HSCHR7_CTG4_4
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assembly
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 96363076 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 96363125
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genome shotgun sequence
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 158670929 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 158670978
>ref|NW_004929334.1| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 4291922 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 4291971
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shotgun sequence
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 795336 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 795385
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 3490066 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 3490115
>gb|CM000497.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 152400702 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 152400751
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 147420995 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 147420946
>gb|DS990805.1| Homo sapiens SCAF_1112675837154 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 469103 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 469054
>gb|CH003454.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 153711767 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 153711816
>tpg|BL000002.1| TPA: Homo sapiens chromosome 7
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 157943284 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 157943333
>ref|NW_001839100.2| Homo sapiens chromosome 7 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188209, whole genome shotgun sequence
gb|DS486167.1| Homo sapiens SCAF_1103279188209 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Strand=Plus/Minus
Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 469077 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 469028
>gb|CH471149.1| Homo sapiens 211000035843051 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=5180218
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 4713929 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 4713978
>ref|AC_000139.1| Homo sapiens chromosome 7, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000468.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 152401113 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 152401162
>tpg|BL000001.2| TPA: Homo sapiens chromosome 7
Length=158329839
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 157866298 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 157866347
>gb|CM000258.1| Homo sapiens chromosome 7, whole genome shotgun sequence
Length=153561227
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 153094938 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 153094987
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG
>ref|XM_010329586.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis WD repeat domain 60
(WDR60), mRNA
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 561 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 610
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(LOC100440833), partial mRNA
Length=1287
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 740 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 789
>ref|XM_009204321.1| PREDICTED: Papio anubis WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X5, mRNA
Length=3215
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 519 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 568
>ref|XM_009204320.1| PREDICTED: Papio anubis WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X4, mRNA
Length=3025
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 329 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 378
>ref|XM_009204319.1| PREDICTED: Papio anubis WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X3, mRNA
Length=3068
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 728
>ref|XM_009204318.1| PREDICTED: Papio anubis WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X2, mRNA
Length=3052
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 728
>ref|XM_009204317.1| PREDICTED: Papio anubis WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X1, mRNA
Length=3377
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 728
>ref|XM_008969400.1| PREDICTED: Pan paniscus WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X4, mRNA
Length=4005
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 828 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 877
>ref|XM_008969399.1| PREDICTED: Pan paniscus WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X3, mRNA
Length=3647
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 548 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 597
>ref|XM_008969398.1| PREDICTED: Pan paniscus WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X2, mRNA
Length=3716
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 597
>ref|XR_611386.1| PREDICTED: Pan paniscus WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X1, misc_RNA
Length=3403
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 548 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 597
>ref|XM_009002754.1| PREDICTED: Callithrix jacchus WD repeat domain 60 (WDR60), mRNA
Length=3916
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Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 751 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 800
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gene, encodes complete protein
Length=3330
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Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 589 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 638
>ref|NG_034051.1| Homo sapiens WD repeat domain 60 (WDR60), RefSeqGene on chromosome
7
Length=96615
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Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 25065 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 25114
>ref|XR_428179.1| PREDICTED: Homo sapiens WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X5, misc_RNA
Length=3542
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 727
>ref|XM_006716041.1| PREDICTED: Homo sapiens WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X4, mRNA
Length=3777
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Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 678 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 727
>ref|XM_005551287.1| PREDICTED: Macaca fascicularis WD repeat domain 60 (WDR60), mRNA
Length=3767
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Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 676 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 725
>ref|XM_005341238.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus WD repeat domain 60
(Wdr60), mRNA
Length=4695
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 711 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 760
>ref|XR_242045.1| PREDICTED: Homo sapiens WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X3, misc_RNA
Length=2931
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 727
>ref|XM_005249549.1| PREDICTED: Homo sapiens WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X1, mRNA
Length=3364
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 370
>ref|XM_004046563.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla WD repeat domain 60 (WDR60),
mRNA
Length=3758
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 726
>ref|XM_001093529.2| PREDICTED: Macaca mulatta WD repeat-containing protein 60-like
(LOC705152), mRNA
Length=983
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 581
>emb|CU677023.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100020496
5' read WDR60 mRNA
Length=1303
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 589
>ref|NM_018051.4| Homo sapiens WD repeat domain 60 (WDR60), mRNA
Length=3789
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 731
>gb|AC124833.1| Homo sapiens BAC clone RP11-324E12 from 7, complete sequence
Length=80050
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 44912 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 44961
>gb|BC014491.1| Homo sapiens WD repeat domain 60, mRNA (cDNA clone MGC:23239
IMAGE:4906683), complete cds
Length=3785
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 682 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 731
>ref|XR_381520.1| PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 60 (Wdr60), transcript
variant X2, misc_RNA
Length=4629
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 819 ACTCTGAAAGAATAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 868
>ref|XM_006515780.1| PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 60 (Wdr60), transcript
variant X1, mRNA
Length=4636
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 815 ACTCTGAAAGAATAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 864
>gb|JN947834.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Wdr60:tm1a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 7828 ACTCTGAAAGAATAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 7877
>gb|BC138916.1| Mus musculus WD repeat domain 60, mRNA (cDNA clone IMAGE:8861938),
complete cds
Length=2246
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 626 ACTCTGAAAGAATAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 675
>ref|NM_146039.3| Mus musculus WD repeat domain 60 (Wdr60), mRNA
Length=3725
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Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 693 ACTCTGAAAGAATAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 742
>dbj|AK144138.1| Mus musculus kidney CCL-142 RAG cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:G430034I10 product:Hypothetical G-protein
beta WD-40 repeats containing protein, full insert sequence
Length=3724
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Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 693 ACTCTGAAAGAATAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 742
>dbj|AK052482.1| Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:D430033N04 product:hypothetical G-protein
beta WD-40 repeats containing protein, full insert sequence
Length=3181
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 657 ACTCTGAAAGAATAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 706
>dbj|AK046399.1| Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length
enriched library, clone:B230380A12 product:hypothetical
protein, full insert sequence
Length=3257
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 655 ACTCTGAAAGAATAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 704
>gb|AC104832.8| Mus Musculus Strain C57BL6/J Chromosome 12 BAC, RP23-38P6, complete
sequence
Length=179216
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ACTCTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 129247 ACTCTGAAAGAATAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 129198
>ref|XM_005003501.1| PREDICTED: Cavia porcellus WD repeat domain 60 (Wdr60), transcript
variant X2, mRNA
Length=3306
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Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 533 CTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGGGAGAGAAAG 579
>ref|XM_003469442.2| PREDICTED: Cavia porcellus WD repeat domain 60 (Wdr60), transcript
variant X1, mRNA
Length=3414
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGAGAAAGAAAG 50
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Sbjct 533 CTGAAAGAGGAGATGAAGATAGAGAAAGAAGATACCGGGAGAGAAAG 579
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT
>ref|XM_010329586.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis WD repeat domain 60
(WDR60), mRNA
Length=3546
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 71 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 120
>ref|XM_010375367.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana WD repeat domain 60 (WDR60),
transcript variant X2, mRNA
Length=3767
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 170 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 219
>ref|XM_009243486.1| PREDICTED: Pongo abelii WD repeat-containing protein 60-like
(LOC100440833), partial mRNA
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Sbjct 232 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 281
>ref|XM_009204321.1| PREDICTED: Papio anubis WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X5, mRNA
Length=3215
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Sbjct 334 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 383
>ref|XM_009204320.1| PREDICTED: Papio anubis WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X4, mRNA
Length=3025
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 144 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 193
>ref|XM_009204319.1| PREDICTED: Papio anubis WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 171 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 220
>ref|XM_009204318.1| PREDICTED: Papio anubis WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X2, mRNA
Length=3052
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 171 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 220
>ref|XM_009204317.1| PREDICTED: Papio anubis WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X1, mRNA
Length=3377
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 171 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 220
>gb|KJ899078.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_08472 WDR60
gene, encodes complete protein
Length=3330
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 81 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 130
>ref|NG_034051.1| Homo sapiens WD repeat domain 60 (WDR60), RefSeqGene on chromosome
7
Length=96615
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 18278 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 18327
>ref|XR_428179.1| PREDICTED: Homo sapiens WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X5, misc_RNA
Length=3542
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Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 170 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 219
>ref|XM_006716041.1| PREDICTED: Homo sapiens WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X4, mRNA
Length=3777
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 170 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 219
>ref|XM_005551287.1| PREDICTED: Macaca fascicularis WD repeat domain 60 (WDR60), mRNA
Length=3767
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 168 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 217
>ref|XR_242045.1| PREDICTED: Homo sapiens WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X3, misc_RNA
Length=2931
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 170 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 219
>ref|XM_003281601.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys WD repeat domain 60 (WDR60), mRNA
Length=3757
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 184 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 233
>ref|XM_004046563.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla WD repeat domain 60 (WDR60),
mRNA
Length=3758
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 169 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 218
>ref|XM_001093529.2| PREDICTED: Macaca mulatta WD repeat-containing protein 60-like
(LOC705152), mRNA
Length=983
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 24 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 73
>emb|CU677023.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100020496
5' read WDR60 mRNA
Length=1303
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 32 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 81
>ref|NM_018051.4| Homo sapiens WD repeat domain 60 (WDR60), mRNA
Length=3789
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 174 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 223
>gb|AC124833.1| Homo sapiens BAC clone RP11-324E12 from 7, complete sequence
Length=80050
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 38125 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 38174
>gb|BC014491.1| Homo sapiens WD repeat domain 60, mRNA (cDNA clone MGC:23239
IMAGE:4906683), complete cds
Length=3785
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 174 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 223
>ref|XM_008969400.1| PREDICTED: Pan paniscus WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X4, mRNA
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 320 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAAATGACCTCAGAAAACATCT 369
>ref|XM_008969399.1| PREDICTED: Pan paniscus WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X3, mRNA
Length=3647
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 40 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAAATGACCTCAGAAAACATCT 89
>ref|XM_008969398.1| PREDICTED: Pan paniscus WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X2, mRNA
Length=3716
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 40 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAAATGACCTCAGAAAACATCT 89
>ref|XR_611386.1| PREDICTED: Pan paniscus WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X1, misc_RNA
Length=3403
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 40 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAAATGACCTCAGAAAACATCT 89
>ref|XM_006730693.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii WD repeat domain 60 (WDR60),
mRNA
Length=3171
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 16 AGAAGAACAAAAGATGATACTTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 65
>ref|XM_004414600.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens WD repeat domain 60 (WDR60),
mRNA
Length=3189
Score = 82.4 bits (44), Expect = 3e-13
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 16 AGAAGAACAAAAGATGATACTTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 65
>ref|XM_008688570.1| PREDICTED: Ursus maritimus WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X2, mRNA
Length=3664
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 73 AGAAGAACAAAGGATGATACTTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 122
>ref|XM_008688569.1| PREDICTED: Ursus maritimus WD repeat domain 60 (WDR60), transcript
variant X1, mRNA
Length=3763
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
|||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 AGAAGAACAAAGGATGATACTTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 122
>ref|XM_002923458.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca WD repeat domain 60 (WDR60),
mRNA
Length=3189
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 AGAAGAACCAAAGATGATACCTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 50
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Sbjct 10 AGAAGAACAAAGGATGATACTTGGAAAGCAGATGACCTCAGAAAACATCT 59
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
reads
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7 7 158664171 158669317 82M5046N18M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TAAGTAAAGTAAGAAGTG
7 7 158664174 158669320 79M5046N21M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TAAGTAAAGTAAGAAGTGAAG
7 7 158664177 158669323 76M5046N24M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TAAGTAAAGTAAGAAGTGAAGAGA
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7 7 158664186 158669332 67M5046N33M ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TAAGTAAAGTAAGAAGTGAAGAGAAAGATGAAG
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5 |
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 50
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genome shotgun sequence
gb|CM001616.2| Homo sapiens chromosome 8, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 618458 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 618409
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 608458 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 608409
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 465011 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 464962
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sequence
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Sbjct 460276 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 460227
>ref|NW_001839101.1| Homo sapiens chromosome 8 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279182856, whole genome shotgun sequence
gb|DS486333.1| Homo sapiens SCAF_1103279182856 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 464826 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 464777
>ref|AC_000140.1| Homo sapiens chromosome 8, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 464826 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 464777
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Sbjct 589372 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 589323
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG
>ref|NM_207332.2| Homo sapiens glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript variant 1,
mRNA
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Sbjct 1287 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1336
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variant X12, misc_RNA
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Sbjct 1571 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1620
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variant X11, mRNA
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Sbjct 1581 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1630
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variant X10, mRNA
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Sbjct 1466 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1515
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variant X9, mRNA
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Sbjct 1581 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1630
>ref|XM_009454734.1| PREDICTED: Pan troglodytes glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X8, mRNA
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Sbjct 1581 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1630
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variant X7, misc_RNA
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Sbjct 1581 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1630
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variant X6, misc_RNA
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Sbjct 1581 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1630
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Sbjct 1581 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1630
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Sbjct 1581 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1630
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variant X3, mRNA
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Sbjct 1581 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1630
>ref|XM_009454732.1| PREDICTED: Pan troglodytes glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 1527 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1576
>ref|XM_009454731.1| PREDICTED: Pan troglodytes glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 1581 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1630
>ref|XM_009243497.1| PREDICTED: Pongo abelii glutamate-rich protein 1-like (LOC100445203),
partial mRNA
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Sbjct 1097 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1146
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Sbjct 1233 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1282
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1272 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1321
>ref|XM_006716235.1| PREDICTED: Homo sapiens glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 1272 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1321
>ref|XM_006716234.1| PREDICTED: Homo sapiens glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X2, mRNA
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Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
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Sbjct 1272 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1321
>ref|XM_004046567.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla glutamate-rich 1 (ERICH1),
mRNA
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Sbjct 1281 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1330
>dbj|AK297476.1| Homo sapiens cDNA FLJ56027 complete cds, highly similar to Glutamate-rich
protein 1
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Sbjct 1257 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1306
>gb|EU832095.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067124; DKFZo008A0725
glutamate-rich 1 protein (ERICH1) gene, encodes complete
protein
Length=1375
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Sbjct 1231 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1280
>gb|EU832187.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067216; DKFZo004A0726
glutamate-rich 1 protein (ERICH1) gene, encodes complete
protein
Length=1375
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
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Sbjct 1231 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1280
>dbj|AK290264.1| Homo sapiens cDNA FLJ76240 complete cds, highly similar to Homo
sapiens glutamate-rich 1 (ERICH1), mRNA
Length=1656
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Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
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Sbjct 1271 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1320
>gb|BC046243.1| Homo sapiens glutamate-rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:46463 IMAGE:5207311),
complete cds
Length=1836
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Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
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Sbjct 1274 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1323
>gb|BC016017.1| Homo sapiens glutamate-rich 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4712459)
Length=603
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Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
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Sbjct 354 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 403
>gb|AC090691.16| Homo sapiens chromosome 8, clone RP11-338B22, complete sequence
Length=180766
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Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
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Sbjct 131004 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 130955
>dbj|AK125470.1| Homo sapiens cDNA FLJ43481 fis, clone OCBBF3002553
Length=3634
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Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
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Sbjct 188 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 237
>emb|BX647093.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C02111 (from clone DKFZp686C02111)
Length=6158
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Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
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Sbjct 1696 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1745
>emb|AL833324.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686C1433 (from clone DKFZp686C1433)
Length=3187
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 564
>gb|AC100797.4| Homo sapiens chromosome 8, clone RP11-43A14, complete sequence
Length=200340
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 2 TTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7973 TTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 7925
>ref|XR_747948.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana glutamate-rich 1 (ERICH1),
transcript variant X3, misc_RNA
Length=1676
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 ATTGAAGCGTGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1206
>ref|XR_747947.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana glutamate-rich 1 (ERICH1),
transcript variant X2, misc_RNA
Length=1506
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167 ATTGAAGCGTGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1216
>ref|XM_010363106.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana glutamate-rich 1 (ERICH1),
transcript variant X1, mRNA
Length=1686
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATTGAAGCATGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 50
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167 ATTGAAGCGTGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1216
>ref|XM_003271380.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys glutamate-rich 1 (ERICH1), mRNA
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variant X2, mRNA
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Sbjct 1159 ATTGAAGCGCGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1208
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1261 ATTGAAGCGCGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1310
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variant X4, mRNA
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Sbjct 1199 ATTGAAGCGCGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1248
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variant X3, mRNA
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variant X2, misc_RNA
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Sbjct 1271 ATTGAAGCGCGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1320
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variant X1, mRNA
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Sbjct 1271 ATTGAAGCGCGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1320
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variant X5, misc_RNA
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Sbjct 1238 ATTGAAGCGCGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1287
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variant X3, mRNA
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Sbjct 1176 ATTGAAGCGCGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1225
>ref|XM_005562505.1| PREDICTED: Macaca fascicularis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 1176 ATTGAAGCGCGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1225
>ref|XM_005562504.1| PREDICTED: Macaca fascicularis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 1248 ATTGAAGCGCGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 1297
>ref|XM_001118749.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC722627 (LOC722627),
mRNA
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Sbjct 2553 ATTGAAGCGCGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCACGATGCCTCCTG 2602
>ref|XM_006141630.1| PREDICTED: Tupaia chinensis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 970 ATTGAAGAGTGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCATGATGCCTCCTG 1019
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variant X3, mRNA
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Sbjct 1117 ATTGAAGAGTGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCATGATGCCTCCTG 1166
>ref|XM_006141628.1| PREDICTED: Tupaia chinensis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 1105 ATTGAAGAGTGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCATGATGCCTCCTG 1154
>ref|XM_006141627.1| PREDICTED: Tupaia chinensis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 1117 ATTGAAGAGTGCTCTGGAAATGTTCCCAGAACATTGCATGATGCCTCCTG 1166
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA
>ref|NM_207332.2| Homo sapiens glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript variant 1,
mRNA
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Sbjct 383 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 432
>ref|XM_005266020.2| PREDICTED: Homo sapiens glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 368 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 417
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variant X3, mRNA
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Sbjct 368 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 417
>ref|XM_006716234.1| PREDICTED: Homo sapiens glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 368 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 417
>ref|XM_003271380.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys glutamate-rich 1 (ERICH1), mRNA
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Sbjct 623 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 672
>ref|XM_004046567.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla glutamate-rich 1 (ERICH1),
mRNA
Length=1817
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Sbjct 377 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 426
>dbj|AK297476.1| Homo sapiens cDNA FLJ56027 complete cds, highly similar to Glutamate-rich
protein 1
Length=2443
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Sbjct 353 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 402
>gb|EU832095.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067124; DKFZo008A0725
glutamate-rich 1 protein (ERICH1) gene, encodes complete
protein
Length=1375
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Sbjct 327 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 376
>gb|EU832187.1| Synthetic construct Homo sapiens clone HAIB:100067216; DKFZo004A0726
glutamate-rich 1 protein (ERICH1) gene, encodes complete
protein
Length=1375
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 50
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Sbjct 327 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 376
>dbj|AK290264.1| Homo sapiens cDNA FLJ76240 complete cds, highly similar to Homo
sapiens glutamate-rich 1 (ERICH1), mRNA
Length=1656
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 50
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Sbjct 367 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 416
>gb|BC046243.1| Homo sapiens glutamate-rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:46463 IMAGE:5207311),
complete cds
Length=1836
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Sbjct 370 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 419
>gb|BC016017.1| Homo sapiens glutamate-rich 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4712459)
Length=603
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Sbjct 404 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 453
>gb|AC090691.16| Homo sapiens chromosome 8, clone RP11-338B22, complete sequence
Length=180766
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Sbjct 136404 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 136355
>dbj|AK055649.1| Homo sapiens cDNA FLJ31087 fis, clone IMR321000074
Length=1692
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Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 50
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Sbjct 1527 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 1576
>gb|AC100797.4| Homo sapiens chromosome 8, clone RP11-43A14, complete sequence
Length=200340
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 50
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Sbjct 13509 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 13460
>gb|AF161437.1|AF161437 Homo sapiens HSPC319 mRNA, partial cds
Length=496
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 50
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Sbjct 327 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAAA 376
>ref|XR_747948.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana glutamate-rich 1 (ERICH1),
transcript variant X3, misc_RNA
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 49
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Sbjct 383 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 431
>ref|XR_747947.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana glutamate-rich 1 (ERICH1),
transcript variant X2, misc_RNA
Length=1506
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 49
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Sbjct 383 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 431
>ref|XM_010363106.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana glutamate-rich 1 (ERICH1),
transcript variant X1, mRNA
Length=1686
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 49
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Sbjct 383 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 431
>ref|XM_009212440.1| PREDICTED: Papio anubis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X2, mRNA
Length=1669
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 49
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Sbjct 351 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 399
>ref|XM_009212439.1| PREDICTED: Papio anubis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1709
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 49
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Sbjct 391 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 439
>ref|XM_005562507.1| PREDICTED: Macaca fascicularis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X4, mRNA
Length=1573
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 49
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Sbjct 368 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 416
>ref|XR_279616.1| PREDICTED: Macaca fascicularis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X5, misc_RNA
Length=1758
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Sbjct 368 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 416
>ref|XM_005562506.1| PREDICTED: Macaca fascicularis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X3, mRNA
Length=1696
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 49
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Sbjct 368 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 416
>ref|XM_005562505.1| PREDICTED: Macaca fascicularis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X2, mRNA
Length=1696
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 49
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Sbjct 368 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 416
>ref|XM_005562504.1| PREDICTED: Macaca fascicularis glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
variant X1, mRNA
Length=1768
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 49
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Sbjct 368 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 416
>ref|XM_001118749.2| PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC722627 (LOC722627),
mRNA
Length=2676
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 1 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 49
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Sbjct 1601 ATCAGGATCCTCATGACCAGCCAAAGAGAAGAAGAATTAGGAAGCATAA 1649
>ref|XR_681756.1| PREDICTED: Pan troglodytes glutamate-rich 1 (ERICH1), transcript
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Sbjct 4385 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4434
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exocytosis 2, transcript variant 3 (RIMS2), mRNA
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Sbjct 4451 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4500
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alternatively spliced
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>gb|AC016832.8| Homo sapiens, clone RP11-132E3, complete sequence
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>emb|CR749374.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781A0653 (from clone DKFZp781A0653)
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Sbjct 3581 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 3630
>dbj|AP004712.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 8q23, clone: KB1819F10,
complete sequence
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Sbjct 146758 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 146807
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Sbjct 45711 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 45760
>ref|XM_010354522.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana regulating synaptic membrane
exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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membrane exocytosis protein 2-like (LOC102997750), transcript
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membrane exocytosis protein 2-like (LOC102997750), transcript
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membrane exocytosis protein 2-like (LOC102997750), transcript
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protein 2-like (LOC100624568), mRNA
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exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X10, mRNA
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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>ref|NW_001839136.1| Homo sapiens chromosome 8 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188253, whole genome shotgun sequence
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>ref|AC_000140.1| Homo sapiens chromosome 8, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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blast search - nt
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Sbjct 1060 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 1109
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Sbjct 5288 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 5337
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Sbjct 3333 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 3382
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Sbjct 4519 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4568
>ref|XM_008975207.1| PREDICTED: Pan paniscus regulating synaptic membrane exocytosis
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Sbjct 4578 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4627
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Sbjct 4644 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4693
>ref|XM_008975205.1| PREDICTED: Pan paniscus regulating synaptic membrane exocytosis
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Sbjct 4920 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4969
>ref|XM_008975204.1| PREDICTED: Pan paniscus regulating synaptic membrane exocytosis
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Sbjct 4922 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4971
>ref|XM_006716699.1| PREDICTED: Homo sapiens regulating synaptic membrane exocytosis
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2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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exocytosis 2, transcript variant 4 (RIMS2), mRNA
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exocytosis 2, transcript variant 3 (RIMS2), mRNA
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alternatively spliced
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>emb|CR749374.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781A0653 (from clone DKFZp781A0653)
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Sbjct 3581 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 3630
>dbj|AP004712.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 8q23, clone: KB1819F10,
complete sequence
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Sbjct 146758 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 146807
>dbj|AP002849.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 8q23, clone: KB1495A5
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Sbjct 45711 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 45760
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exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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>ref|XM_009213462.1| PREDICTED: Papio anubis regulating synaptic membrane exocytosis
protein 2-like (LOC101005523), transcript variant X2, mRNA
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>ref|XM_009213461.1| PREDICTED: Papio anubis regulating synaptic membrane exocytosis
protein 2-like (LOC101005523), transcript variant X1, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X48, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X45, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X44, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X43, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X42, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X41, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X40, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X36, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X35, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X29, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X27, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X26, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X25, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X24, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X22, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X20, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X19, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X18, mRNA
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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blast search - nt
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Sbjct 3333 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 3382
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Sbjct 4578 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4627
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2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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exocytosis 2, transcript variant 6 (RIMS2), mRNA
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exocytosis 2, transcript variant 4 (RIMS2), mRNA
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exocytosis 2, transcript variant 3 (RIMS2), mRNA
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Sbjct 4451 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4500
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Sbjct 3426 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 3475
>gb|AY163163.1| Homo sapiens Rab3-interacting protein (RIM2) mRNA, partial cds;
alternatively spliced
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>gb|AC107933.6| Homo sapiens chromosome 8, clone RP11-959C6, complete sequence
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>gb|AC016832.8| Homo sapiens, clone RP11-132E3, complete sequence
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>emb|CR749374.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781A0653 (from clone DKFZp781A0653)
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Sbjct 3581 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 3630
>dbj|AP004712.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 8q23, clone: KB1819F10,
complete sequence
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Sbjct 146758 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 146807
>dbj|AP002849.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 8q23, clone: KB1495A5
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Sbjct 45711 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 45760
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exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3455 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 3503
>ref|XM_009213462.1| PREDICTED: Papio anubis regulating synaptic membrane exocytosis
protein 2-like (LOC101005523), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 227 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 275
>ref|XM_009213461.1| PREDICTED: Papio anubis regulating synaptic membrane exocytosis
protein 2-like (LOC101005523), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 596 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 644
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2 (RIMS2), transcript variant X48, mRNA
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Sbjct 4207 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4255
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2 (RIMS2), transcript variant X45, mRNA
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Sbjct 411 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 459
>ref|XM_008001319.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus regulating synaptic membrane exocytosis
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Sbjct 397 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 445
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2 (RIMS2), transcript variant X43, mRNA
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Sbjct 480 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 528
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Sbjct 462 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 510
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2 (RIMS2), transcript variant X41, mRNA
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>ref|XM_008001315.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus regulating synaptic membrane exocytosis
2 (RIMS2), transcript variant X40, mRNA
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>ref|XM_008001314.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus regulating synaptic membrane exocytosis
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2 (RIMS2), transcript variant X36, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X35, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X29, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X27, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X26, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X25, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X24, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X22, mRNA
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transcript variant X4, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X2, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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exocytosis 2, transcript variant 6 (RIMS2), mRNA
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exocytosis 2, transcript variant 4 (RIMS2), mRNA
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exocytosis 2, transcript variant 3 (RIMS2), mRNA
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alternatively spliced
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>gb|AC107933.6| Homo sapiens chromosome 8, clone RP11-959C6, complete sequence
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>emb|CR749374.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781A0653 (from clone DKFZp781A0653)
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Sbjct 2863 GTACTATGGATATAGAGGAGAGAAATCGCCAAATGAAAATTAACAAATAC 2912
>dbj|AP004712.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 8q23, clone: KB1819F10,
complete sequence
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2 (Rims2), transcript variant X22, mRNA
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2 (Rims2), transcript variant X21, mRNA
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2 (Rims2), transcript variant X20, mRNA
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2 (Rims2), transcript variant X16, mRNA
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2 (Rims2), transcript variant X14, mRNA
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2 (Rims2), transcript variant X13, mRNA
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Sbjct 3431 CTATGGATATAGAGGAGAGAAATCGCCAAATGAAAATTAACAAATAC 3477
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2 (Rims2), transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 3470 CTATGGATATAGAGGAGAGAAATCGCCAAATGAAAATTAACAAATAC 3516
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2 (Rims2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 3557 CTATGGATATAGAGGAGAGAAATCGCCAAATGAAAATTAACAAATAC 3603
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2 (Rims2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 3590 CTATGGATATAGAGGAGAGAAATCGCCAAATGAAAATTAACAAATAC 3636
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2 (Rims2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3611 CTATGGATATAGAGGAGAGAAATCGCCAAATGAAAATTAACAAATAC 3657
>ref|XM_008577286.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus regulating synaptic membrane
exocytosis 2 (RIMS2), mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X5, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 3080 CTATGGATATAGAGGAGAGAAATCGCCAAATGAAAATTAACAAATAC 3126
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2 (RIMS2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 3256 CTATGGATATAGAGGAGAGAAATCGCCAAATGAAAATTAACAAATAC 3302
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2 (RIMS2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 3475 CTATGGATATAGAGGAGAGAAATCGCCAAATGAAAATTAACAAATAC 3521
>ref|XM_008522439.1| PREDICTED: Equus przewalskii regulating synaptic membrane exocytosis
2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3556 CTATGGATATAGAGGAGAGAAATCGCCAAATGAAAATTAACAAATAC 3602
>ref|XM_008255810.1| PREDICTED: Oryctolagus cuniculus regulating synaptic membrane
exocytosis 2 (RIMS2), mRNA
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membrane exocytosis 2 (Rims2), transcript variant X3, mRNA
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exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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protein 2-like (LOC100624568), mRNA
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exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X27, mRNA
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exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X26, mRNA
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sequence
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Sbjct 4920 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4969
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2 (RIMS2), transcript variant X11, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X10, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 4892 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4941
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2 (RIMS2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 4895 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4944
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2 (RIMS2), transcript variant X3, mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 4033 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4082
>ref|XM_005251106.1| PREDICTED: Homo sapiens regulating synaptic membrane exocytosis
2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 4099 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4148
>ref|XM_004047415.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla regulating synaptic membrane
exocytosis 2, transcript variant 6 (RIMS2), mRNA
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Sbjct 3834 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 3883
>ref|XM_004047413.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla regulating synaptic membrane
exocytosis 2, transcript variant 4 (RIMS2), mRNA
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Sbjct 4385 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4434
>ref|XM_004047412.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla regulating synaptic membrane
exocytosis 2, transcript variant 3 (RIMS2), mRNA
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Query 1 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 50
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Sbjct 4451 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4500
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Sbjct 3426 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 3475
>gb|AY163163.1| Homo sapiens Rab3-interacting protein (RIM2) mRNA, partial cds;
alternatively spliced
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Sbjct 467 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 516
>gb|AC107933.6| Homo sapiens chromosome 8, clone RP11-959C6, complete sequence
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Sbjct 41193 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 41144
>gb|AC016832.8| Homo sapiens, clone RP11-132E3, complete sequence
Length=184558
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Query 1 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 50
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Sbjct 172384 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 172335
>emb|CR749374.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp781A0653 (from clone DKFZp781A0653)
Length=4405
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Query 1 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 50
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Sbjct 3581 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 3630
>dbj|AP004712.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 8q23, clone: KB1819F10,
complete sequence
Length=149677
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Query 1 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 50
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Sbjct 146758 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 146807
>dbj|AP002849.2| Homo sapiens genomic DNA, chromosome 8q23, clone: KB1495A5
Length=205990
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 50
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Sbjct 45711 CGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 45760
>ref|XM_010354522.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana regulating synaptic membrane
exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
Length=4219
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Query 2 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 50
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Sbjct 3455 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 3503
>ref|XM_009213462.1| PREDICTED: Papio anubis regulating synaptic membrane exocytosis
protein 2-like (LOC101005523), transcript variant X2, mRNA
Length=3602
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 50
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Sbjct 227 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 275
>ref|XM_009213461.1| PREDICTED: Papio anubis regulating synaptic membrane exocytosis
protein 2-like (LOC101005523), transcript variant X1, mRNA
Length=3971
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 2 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 50
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Sbjct 596 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 644
>ref|XM_008001323.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus regulating synaptic membrane exocytosis
2 (RIMS2), transcript variant X48, mRNA
Length=5732
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
Identities = 49/49 (100%), Gaps = 0/49 (0%)
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Query 2 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 50
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Sbjct 4207 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 4255
>ref|XM_008001320.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus regulating synaptic membrane exocytosis
2 (RIMS2), transcript variant X45, mRNA
Length=1936
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 2 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 50
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Sbjct 411 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 459
>ref|XM_008001319.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus regulating synaptic membrane exocytosis
2 (RIMS2), transcript variant X44, mRNA
Length=1922
Score = 91.6 bits (49), Expect = 5e-16
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Query 2 GTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG 50
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2 (RIMS2), transcript variant X3, mRNA
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membrane exocytosis protein 2-like (LOC102997750), transcript
variant X4, mRNA
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membrane exocytosis protein 2-like (LOC102997750), transcript
variant X3, mRNA
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membrane exocytosis protein 2-like (LOC102997750), transcript
variant X2, mRNA
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membrane exocytosis protein 2-like (LOC102997750), transcript
variant X1, mRNA
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protein 2-like (LOC100624568), mRNA
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Sbjct 3061 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATGTTTCTACTAA 3110
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complete sequence
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Sbjct 3547 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATGTTTCCACTAA 3596
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exocytosis 2 (RIMS2), mRNA
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2 (RIMS2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 3535 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3584
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2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3550 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3599
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2 (RIMS2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 2968 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3017
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2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3544 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3593
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membrane exocytosis protein 2-like (LOC102997750), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 3251 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3300
>ref|XM_007173380.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni regulating synaptic
membrane exocytosis protein 2-like (LOC102997750), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 3137 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3186
>ref|XM_007173379.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni regulating synaptic
membrane exocytosis protein 2-like (LOC102997750), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 3185 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3234
>ref|XM_007173378.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni regulating synaptic
membrane exocytosis protein 2-like (LOC102997750), transcript
variant X1, mRNA
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Sbjct 3203 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3252
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2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3544 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3593
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2 (RIMS2), transcript variant X8, mRNA
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Sbjct 122 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 171
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2 (RIMS2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 3539 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3588
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2 (RIMS2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 3539 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3588
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2 (RIMS2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 3572 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3621
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2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3596 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3645
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2 (RIMS2), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 166 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 215
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2 (RIMS2), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1431 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 1480
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2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 1692 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 1741
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exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3265 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3314
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2 (RIMS2), transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 166 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 215
>ref|XM_005879298.1| PREDICTED: Myotis brandtii regulating synaptic membrane exocytosis
2 (RIMS2), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 1719 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 1768
>ref|XM_005879295.1| PREDICTED: Myotis brandtii regulating synaptic membrane exocytosis
2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3395 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3444
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2 (RIMS2), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 3259 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3308
>ref|XM_005662911.1| PREDICTED: Sus scrofa regulating synaptic membrane exocytosis
protein 2-like (LOC100624568), mRNA
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Sbjct 2752 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 2801
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exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X27, mRNA
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Sbjct 3618 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3667
>ref|XM_005627858.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris regulating synaptic membrane
exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X26, mRNA
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Sbjct 187 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 236
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exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X20, mRNA
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Sbjct 3558 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3607
>ref|XM_005627851.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris regulating synaptic membrane
exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X19, mRNA
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Sbjct 3501 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3550
>ref|XM_005627850.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris regulating synaptic membrane
exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X18, mRNA
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Sbjct 3561 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3610
>ref|XM_005627849.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris regulating synaptic membrane
exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X17, mRNA
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Sbjct 3627 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3676
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exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X16, mRNA
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Sbjct 3807 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3856
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exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X15, mRNA
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Sbjct 3840 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3889
>ref|XM_005627846.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris regulating synaptic membrane
exocytosis 2 (RIMS2), transcript variant X14, mRNA
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Sbjct 3837 TATCGATCAGGATGGGATCCTCATAGAGGGGCAGATAATATTTCCACTAA 3886
>ref|XM_005381997.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera regulating synaptic membrane exocytosis
2 (Rims2), mRNA
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8 8 105160855 105160955 100M AAGCAGACAAATGGGCATATCAGGGAAGAACATGACAAAAAGCACCAGCATCAGTGGAGACATGTGCTCACTGGAGAAGAATGATGGCAGCCAGTCTGAC
8 8 105160858 105160958 100M CAGACAAATGGGCATATCAGGGAAGAACATGACAAAAAGCACCAGCATCAGTGGAGACATGTGCTCACTGGAGAAGAATGATGGCAGCCAGTCTGACACT
8 8 105160861 105160961 100M ACAAATGGGCATATCAGGGAAGAACATGACAAAAAGCACCAGCATCAGTGGAGACATGTGCTCACTGGAGAAGAATGATGGCAGCCAGTCTGACACTGCA
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8 8 105160867 105160967 100M GGGCATATCAGGGAAGAACATGACAAAAAGCACCAGCATCAGTGGAGACATGTGCTCACTGGAGAAGAATGATGGCAGCCAGTCTGACACTGCAGTGGGC
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8 8 105160981 105105703 95M105105698F5M TGGCAAAAAGCGGCGCTCTAGCCTTGGTGCCAAAATGGTAGCTATCGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG TATCG
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8 8 105160983 105105705 93M105105698F7M GCAAAAAGCGGCGCTCTAGCCTTGGTGCCAAAATGGTAGCTATCGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG TATCGAT
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8 8 105160983 105105705 93M105105698F7M GCAAAAAGCGGCGCTCTAGCCTTGGTGCCAAAATGGTAGCTATCGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG TATCGAT
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8 8 105160985 105105707 91M105105698F9M AAAAAGCGGCGCTCTAGCCTTGGTGCCAAAATGGTAGCTATCGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG TATCGATCA
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8 8 105160989 105105711 87M105105698F13M AGCGGCGCTCTAGCCTTGGTGCCAAAATGGTAGCTATCGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG TATCGATCAGGAG
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8 8 105160990 105105712 86M105105698F14M GCGGCGCTCTAGCCTTGGTGCCAAAATGGTAGCTATCGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG TATCGATCAGGATG
8 8 105160990 105105712 86M105105698F14M GCGGCGCTCTAGCCTTGGTGCCAAAATGGTAGCTATCGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG TATCGATCAGGATG
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8 8 105160991 105105713 85M105105698F15M CGGCGCTCTAGCCTTGGTGCCAAAATGGTAGCTATCGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG TATCGATCAGGATGG
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8 8 105160992 105105714 84M105105698F16M GGCGCTCTAGCCTTGGTGCCAAAATGGTAGCTATCGTTGGTCTGTCACGGAAAAGTCGCAGTGCTTCTCAGCTCAGCCAAACGG TATCGATCAGGATGGG
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Sbjct 127691291 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 127691242
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HSCHR9_CTG35
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assembly
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 59470739 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 59470690
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genome shotgun sequence
gb|CM001617.2| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 130604765 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 130604716
>ref|NW_004929366.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150150.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 59622832 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 59622783
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shotgun sequence
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 31127710 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 31127661
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shotgun sequence
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 29425788 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 29425739
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 100069139 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 100069090
>gb|DS990738.1| Homo sapiens SCAF_1112675837241 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 5796871 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 5796822
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 106070330 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 106070281
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 98507781 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 98507732
>ref|NW_001839239.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188296, whole genome shotgun sequence
gb|DS486100.1| Homo sapiens SCAF_1103279188296 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 5796984 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 5796935
>gb|CH471090.1| Homo sapiens 211000035837865 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 14592287 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 14592238
>ref|AC_000141.1| Homo sapiens chromosome 9, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000470.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 100069676 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 100069627
>gb|CM000260.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 101104456 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 101104407
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC
>ref|NC_000009.12| Homo sapiens chromosome 9, GRCh38 Primary Assembly
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Sbjct 127691667 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 127691716
>ref|NT_008470.20| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR9_CTG35
gb|GL000089.2| Homo sapiens chromosome 9 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 59471115 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 59471164
>ref|NC_018920.2| Homo sapiens chromosome 9, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001617.2| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=141360467
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 130605141 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 130605190
>ref|NW_004929366.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150150.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=62239741
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 59623208 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 59623257
>gb|KE141132.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold24, whole genome
shotgun sequence
Length=42088895
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 31128086 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 31128135
>gb|GL582982.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_2, whole genome
shotgun sequence
Length=39054256
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 29426164 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 29426213
>gb|CM000499.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=110558802
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 100069515 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 100069564
>gb|DS990738.1| Homo sapiens SCAF_1112675837241 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=8434405
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 5797247 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 5797296
>gb|CH003504.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=116547660
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 106070706 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 106070755
>gb|CH003456.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=109101138
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 98508157 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 98508206
>ref|NW_001839239.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188296, whole genome shotgun sequence
gb|DS486100.1| Homo sapiens SCAF_1103279188296 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
Length=8434505
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 5797360 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 5797409
>gb|CH471090.1| Homo sapiens 211000035837865 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=25070985
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 14592663 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 14592712
>ref|AC_000141.1| Homo sapiens chromosome 9, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000470.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=110559325
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 100070052 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 100070101
>gb|CM000260.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=111583154
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-17
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 101104832 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 101104881
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA
>ref|XM_009457332.1| PREDICTED: Pan troglodytes syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
mRNA
Length=3791
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2373 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2324
>ref|XM_004048661.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla syntaxin binding protein 1
(STXBP1), mRNA
Length=3644
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2219 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2170
>ref|NG_016623.1| Homo sapiens syntaxin binding protein 1 (STXBP1), RefSeqGene
on chromosome 9
Length=87510
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 84085 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 84036
>ref|NM_003165.3| Homo sapiens syntaxin binding protein 1 (STXBP1), transcript
variant 1, mRNA
Length=3976
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2542 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2493
>ref|NM_001032221.3| Homo sapiens syntaxin binding protein 1 (STXBP1), transcript
variant 2, mRNA
Length=3850
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2416 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2367
>dbj|AK094794.1| Homo sapiens cDNA FLJ37475 fis, clone BRAWH2012698
Length=2582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 1158 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 1109
>dbj|AB209180.1| Homo sapiens mRNA for Syntaxin binding protein 1 variant protein
Length=3088
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 1680 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 1631
>emb|AL162426.20| Human DNA sequence from clone RP11-56D16 on chromosome 9, complete
sequence
Length=163338
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 104604 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 104555
>gb|AF004563.1|AF004563 Homo sapiens hUNC18b alternatively-spliced mRNA, complete cds
Length=3899
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2465 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2416
>gb|AF004562.1|AF004562 Homo sapiens hUNC18a alternatively-spliced mRNA, complete cds
Length=3773
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2339 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2290
>dbj|D63851.1| Homo sapiens mRNA for unc-18 homologue, complete cds
Length=3692
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2289 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2240
>ref|NM_001133100.1| Pongo abelii syntaxin binding protein 1 (STXBP1), mRNA
emb|CR860559.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459B217 (from clone DKFZp459B217)
Length=3766
Score = 89.8 bits (48), Expect = 2e-15
Identities = 48/48 (100%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3 TGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2339 TGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2292
>ref|XM_003911918.2| PREDICTED: Papio anubis syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X2, mRNA
Length=3829
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2415 TATGATTCTCAACGAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2366
>ref|XM_003911919.2| PREDICTED: Papio anubis syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X1, mRNA
Length=3955
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2541 TATGATTCTCAACGAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2492
>ref|XM_008006158.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X3, mRNA
Length=3696
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2279 TATGATTCTCAACGAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2230
>ref|XM_008006157.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2434 TATGATTCTCAACGAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2385
>ref|XM_008006156.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X1, mRNA
Length=3980
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2561 TATGATTCTCAACGAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2512
>ref|XM_005582167.1| PREDICTED: Macaca fascicularis syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X2, mRNA
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2270 TATGATTCTCAACGAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2221
>ref|XM_005582166.1| PREDICTED: Macaca fascicularis syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X1, mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2396 TATGATTCTCAACGAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2347
>ref|NM_001261163.1| Macaca mulatta syntaxin binding protein 1 (STXBP1), mRNA
Length=3807
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2389 TATGATTCTCAACGAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2340
>ref|XM_008975809.1| PREDICTED: Pan paniscus syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X3, mRNA
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2343 TATGATTCTCAACAAGGACAG-AACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2295
>ref|XM_008975808.1| PREDICTED: Pan paniscus syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X2, mRNA
Length=3739
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2322 TATGATTCTCAACAAGGACAG-AACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2274
>ref|XM_003822293.2| PREDICTED: Pan paniscus syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X1, mRNA
Length=3886
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Query 1 TATGATTCTCAACAAGGACAGGAACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 50
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Sbjct 2469 TATGATTCTCAACAAGGACAG-AACAACCCCAAACAAGGTTTTAAAAACA 2421
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC
>ref|XM_009457332.1| PREDICTED: Pan troglodytes syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
mRNA
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2749 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2798
>ref|XM_008975809.1| PREDICTED: Pan paniscus syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X3, mRNA
Length=3760
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2719 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2768
>ref|XM_008975808.1| PREDICTED: Pan paniscus syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X2, mRNA
Length=3739
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2698 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2747
>ref|XM_003822293.2| PREDICTED: Pan paniscus syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X1, mRNA
Length=3886
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2845 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2894
>ref|XM_004048661.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla syntaxin binding protein 1
(STXBP1), mRNA
Length=3644
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2595 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2644
>ref|NG_016623.1| Homo sapiens syntaxin binding protein 1 (STXBP1), RefSeqGene
on chromosome 9
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Sbjct 84461 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 84510
>ref|NM_003165.3| Homo sapiens syntaxin binding protein 1 (STXBP1), transcript
variant 1, mRNA
Length=3976
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2918 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2967
>ref|NM_001032221.3| Homo sapiens syntaxin binding protein 1 (STXBP1), transcript
variant 2, mRNA
Length=3850
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2792 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2841
>dbj|AB209180.1| Homo sapiens mRNA for Syntaxin binding protein 1 variant protein
Length=3088
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2056 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2105
>emb|AL162426.20| Human DNA sequence from clone RP11-56D16 on chromosome 9, complete
sequence
Length=163338
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 104980 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 105029
>ref|NM_001133100.1| Pongo abelii syntaxin binding protein 1 (STXBP1), mRNA
emb|CR860559.1| Pongo abelii mRNA; cDNA DKFZp459B217 (from clone DKFZp459B217)
Length=3766
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2717 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2766
>gb|AF004563.1|AF004563 Homo sapiens hUNC18b alternatively-spliced mRNA, complete cds
Length=3899
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2841 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2890
>gb|AF004562.1|AF004562 Homo sapiens hUNC18a alternatively-spliced mRNA, complete cds
Length=3773
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2715 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2764
>dbj|D63851.1| Homo sapiens mRNA for unc-18 homologue, complete cds
Length=3692
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2665 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 2714
>ref|XM_003264167.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
mRNA
Length=3736
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2688 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCACCCC 2737
>dbj|AK094794.1| Homo sapiens cDNA FLJ37475 fis, clone BRAWH2012698
Length=2582
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Query 1 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 1534 GTTAGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTTCCCAGGCATCATCCC 1583
>ref|XM_010367839.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana syntaxin binding protein 1
(STXBP1), mRNA
Length=3833
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Query 4 AGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2791 AGTCCGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCACCCC 2837
>ref|XM_003911918.2| PREDICTED: Papio anubis syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X2, mRNA
Length=3829
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Query 4 AGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2790 AGTCCGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCACCCC 2836
>ref|XM_003911919.2| PREDICTED: Papio anubis syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X1, mRNA
Length=3955
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Query 4 AGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2916 AGTCCGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCACCCC 2962
>ref|XM_005582167.1| PREDICTED: Macaca fascicularis syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X2, mRNA
Length=3682
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 4 AGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2645 AGTCCGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCACCCC 2691
>ref|XM_005582166.1| PREDICTED: Macaca fascicularis syntaxin binding protein 1 (STXBP1),
transcript variant X1, mRNA
Length=3808
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 4 AGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2771 AGTCCGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCACCCC 2817
>ref|NM_001261163.1| Macaca mulatta syntaxin binding protein 1 (STXBP1), mRNA
Length=3807
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 4 AGTCTGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCATCCC 50
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Sbjct 2764 AGTCCGGAGCCTGTGGCCCAGGCCCTTCTGTCCCCAGGCATCACCCC 2810
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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9 9 130453702 130453602 100m TTGGACCTCCTGAGATATCCTGATTGTCTCCTCCCAGGTTATTTGGATGAGAGCAGGCACTGAGGGGTAGGGACTGGAATGAAGATAGCAGATTAGTCCT
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Sbjct 2640694 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 2640743
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shotgun sequence
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 36691442 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 36691491
>gb|GL582982.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_2, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 34701466 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 34701515
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Sbjct 105355226 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 105355275
>gb|DS990917.1| Homo sapiens SCAF_1112675837156 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 103797600 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 103797649
>ref|NW_001839241.2| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188211, whole genome shotgun sequence
gb|DS486279.1| Homo sapiens SCAF_1103279188211 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 598289 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 598240
>gb|CH471090.1| Homo sapiens 211000035837865 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 19891616 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 19891665
>ref|AC_000141.1| Homo sapiens chromosome 9, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000470.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 105355725 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 105355774
>gb|CM000260.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 106403785 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 106403834
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CCGCCCGACTGCCATCGCCCGGCCCGGCCGCGCCCGCGGAACCAGACCAG
>ref|XM_009244976.1| PREDICTED: Pongo abelii proline-rich coiled-coil 2B (PRRC2B),
transcript variant X7, mRNA
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Sbjct 138 CCGCCCGACTGCCATCGCCCGGCCCGGCCGCGCCCGCGGAACCAGACCAG 187
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transcript variant X6, mRNA
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Sbjct 138 CCGCCCGACTGCCATCGCCCGGCCCGGCCGCGCCCGCGGAACCAGACCAG 187
>ref|XM_009244974.1| PREDICTED: Pongo abelii proline-rich coiled-coil 2B (PRRC2B),
transcript variant X5, mRNA
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Sbjct 138 CCGCCCGACTGCCATCGCCCGGCCCGGCCGCGCCCGCGGAACCAGACCAG 187
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transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 138 CCGCCCGACTGCCATCGCCCGGCCCGGCCGCGCCCGCGGAACCAGACCAG 187
>ref|XM_002820312.3| PREDICTED: Pongo abelii proline-rich coiled-coil 2B (PRRC2B),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 138 CCGCCCGACTGCCATCGCCCGGCCCGGCCGCGCCCGCGGAACCAGACCAG 187
>gb|AC231197.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC11-48257100K5 from chromosome unknown,
complete sequence
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Sbjct 20255 CCGCCCGACTGCCATCGCCCGGCCCGGCCGCGCCCGCGGAACCAGACCAG 20206
>gb|AC212262.3| Homo sapiens FOSMID clone ABC9-43813500N16 from chromosome 9,
complete sequence
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Query 1 CCGCCCGACTGCCATCGCCCGGCCCGGCCGCGCCCGCGGAACCAGACCAG 50
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Sbjct 29180 CCGCCCGACTGCCATCGCCCGGCCCGGCCGCGCCCGCGGAACCAGACCAG 29131
>emb|AL354855.26| Human DNA sequence from clone RP11-643E14 on chromosome 9, complete
sequence
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Sbjct 109329 CCGCCCGACTGCCATCGCCCGGCCCGGCCGCGCCCGCGGAACCAGACCAG 109378
>gb|BC002872.2| Homo sapiens HLA-B associated transcript 2-like, mRNA (cDNA clone
IMAGE:3944379), complete cds
Length=1142
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Sbjct 2 CCGCCCGACTGCCATCGCCCGGCCCGGCCGCGCCCGCGGAACCAGACCAG 51
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG
>ref|XM_010372819.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana growth factor independent
1B transcription repressor (GFI1B), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 138 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 187
>ref|XM_010372818.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana growth factor independent
1B transcription repressor (GFI1B), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 143 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 192
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repressor (GFI1B), transcript variant X4, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 173 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 222
>ref|XM_009457575.1| PREDICTED: Pan troglodytes growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X3, mRNA
Length=1760
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 173 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 222
>ref|XM_528450.5| PREDICTED: Pan troglodytes growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 173 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 222
>ref|XM_009457574.1| PREDICTED: Pan troglodytes growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X1, mRNA
Length=1898
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 173 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 222
>ref|XM_003918620.2| PREDICTED: Papio anubis growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X2, mRNA
Length=2015
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 353 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 402
>ref|XM_009198734.1| PREDICTED: Papio anubis growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 400 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 449
>ref|XM_008975996.1| PREDICTED: Pan paniscus growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 132 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 181
>ref|XM_003822414.2| PREDICTED: Pan paniscus growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X1, mRNA
Length=2463
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 806 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 855
>ref|NG_034227.1| Homo sapiens growth factor independent 1B transcription repressor
(GFI1B), RefSeqGene on chromosome 9
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 46115 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 46164
>ref|NM_004188.5| Homo sapiens growth factor independent 1B transcription repressor
(GFI1B), transcript variant 1, mRNA
Length=2479
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 806 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 855
>ref|XM_008005831.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X4, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 545 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 594
>ref|XM_008005830.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X3, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 545 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 594
>ref|XM_008005829.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 703 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 752
>ref|XM_008005828.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 703 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 752
>ref|XM_006717298.1| PREDICTED: Homo sapiens growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X2, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 432 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 481
>ref|XM_006717297.1| PREDICTED: Homo sapiens growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X1, mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 108 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 157
>ref|XM_005580546.1| PREDICTED: Macaca fascicularis growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X2, mRNA
Length=1906
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 382 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 431
>ref|XM_005580545.1| PREDICTED: Macaca fascicularis growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), transcript variant X1, mRNA
Length=2043
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 381 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 430
>ref|XM_004048790.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla growth factor independent
1B transcription repressor (GFI1B), mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 685 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 734
>ref|XM_003276793.1| PREDICTED: Nomascus leucogenys growth factor independent 1B transcription
repressor, transcript variant 1 (GFI1B), mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 814 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 863
>ref|XM_002799945.1| PREDICTED: Macaca mulatta growth factor independent 1B transcription
repressor (GFI1B), mRNA
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Query 1 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 50
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Sbjct 148 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 197
>ref|XM_001103109.2| PREDICTED: Macaca mulatta growth factor independent 1B transcription
repressor, transcript variant 1 (GFI1B), mRNA
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Sbjct 132 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 181
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mRNA (cDNA clone MGC:50140 IMAGE:5170920), complete cds
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Sbjct 806 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 855
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complete cds
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Sbjct 132 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 181
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mRNA (cDNA clone IMAGE:5204065)
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of CDKN1A, translocated in CML), mRNA (cDNA clone IMAGE:5205687),
partial cds
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Sbjct 3 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 52
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sequence
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Sbjct 33395 GTGTGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 33444
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transcription repressor (GFI1B), transcript variant 1, mRNA
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Sbjct 117 GTGCGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 166
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repressor (GFI1B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 1 TGGGGTGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 47
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1B transcription repressor (GFI1B), transcript variant
X2, mRNA
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Sbjct 132 GTGTGAGGTGTGCACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 181
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1B transcription repressor (GFI1B), transcript variant
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Sbjct 132 GTGTGAGGTGTGCACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTGGTGAAGAGCAAG 181
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repressor (GFI1B), transcript variant X4, mRNA
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Sbjct 92 GTGTGAGGCGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTAGTGAAGAGCAAG 141
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repressor (GFI1B), transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 10 GTGTGAGGCGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTAGTGAAGAGCAAG 59
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repressor (GFI1B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 66 GTGTGAGGCGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTAGTGAAGAGCAAG 115
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repressor (GFI1B), transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 66 GTGTGAGGCGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTAGTGAAGAGCAAG 115
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complete sequence
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Sbjct 120080 GTGTGAGGCGCACACTGAAAATGCCACGCTCCTTCCTAGTGAAGAGCAAG 120129
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<-------- --------> |
Left flanking sequence | Right flanking sequence |
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left flanking sequence - GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGCT
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>ref|NT_008470.20| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR9_CTG35
gb|GL000089.2| Homo sapiens chromosome 9 genomic contig, GRCh38 reference primary
assembly
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genome shotgun sequence
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sequence
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sequence
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shotgun sequence
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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>ref|NW_001838336.2| Homo sapiens chromosome 16 genomic scaffold, alternate assembly
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 14104 CGTGGATCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 14055
>ref|AC_000148.1| Homo sapiens chromosome 16, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 75852478 CGTGGATCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 75852527
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Sbjct 75225645 CGTGGATCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 75225694
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Lambda K H
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blast search - nt
left flanking sequence - GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGCT
>ref|NM_006088.5| Homo sapiens tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), mRNA
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Sbjct 78 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGCT 29
>gb|BC029529.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:33915 IMAGE:5274343),
complete cds
Length=1579
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Query 1 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGCT 50
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Sbjct 50 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGCT 1
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Length=667
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGCT 50
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Sbjct 194 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGCT 243
>emb|AJ334482.1| Homo sapiens genomic sequence surrounding NotI site, clone NR1-KL9R
Length=680
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 194 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGCT 243
>dbj|AK026167.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22514 fis, clone HRC12119, highly similar
to HSBT278 Homo sapiens mRNA for beta tubulin
Length=1579
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Query 1 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGC 49
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Sbjct 49 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGC 1
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Length=2057
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Query 1 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGC 49
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Sbjct 50 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGC 2
>emb|X02344.1| Homo sapiens beta 2 gene
Length=3284
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Query 3 AGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGCT 50
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Sbjct 719 AGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAGTGCT 672
>dbj|AK098686.1| Homo sapiens cDNA FLJ25820 fis, clone TST07642, highly similar
to TUBULIN BETA-2 CHAIN
Length=1492
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Query 1 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGA 45
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Sbjct 45 GCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGA 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG
>ref|XM_003911025.2| PREDICTED: Papio anubis tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
mRNA
Length=1808
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 511 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 560
>ref|XM_008970129.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin beta chain (LOC103785843), mRNA
Length=1352
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 58 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 107
>gb|KJ893022.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_02416 TUBB4B
gene, encodes complete protein
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 260 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 309
>ref|XM_008005489.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
mRNA
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 289 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 338
>ref|XM_003279810.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, beta 4B class IVb (TUBB2C),
mRNA
Length=1878
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 148 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 197
>ref|XM_004048941.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin beta-4 chain-like,
transcript variant 2 (LOC101142053), mRNA
Length=1910
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 186 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 235
>ref|XM_004048940.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin beta-4 chain-like,
transcript variant 1 (LOC101142053), mRNA
Length=1889
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Sbjct 165 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 214
>ref|NM_001246378.1| Pan troglodytes tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), mRNA
dbj|AK306296.1| Pan troglodytes mRNA for tubulin beta-2C chain, complete cds,
clone: PtsC-51-5_A01
Length=1577
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Sbjct 266 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 315
>gb|HQ447292.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100070603; CCSB002550_03
tubulin, beta 2C (TUBB2C) gene, encodes complete protein
Length=1437
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Sbjct 245 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 294
>dbj|AB590760.1| Synthetic construct DNA, clone: pFN21AE1911, Homo sapiens TUBB2C
gene for tubulin, beta 2C, without stop codon, in Flexi
system
Length=1352
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 204 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 253
>ref|NM_001194791.1| Macaca mulatta tubulin, beta 4B class IVb (TUBB2C), mRNA
Length=1619
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 252 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 301
>ref|XM_002799911.1| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin beta-2C chain-like, transcript
variant 4 (LOC100425863), mRNA
Length=1656
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 289 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 338
>ref|XM_002799910.1| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin beta-2C chain-like, transcript
variant 3 (LOC100425863), mRNA
Length=1582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 215 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 264
>ref|XM_002799908.1| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin beta-2C chain-like, transcript
variant 1 (LOC100425863), mRNA
Length=1647
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 280 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 329
>dbj|AK298087.1| Homo sapiens cDNA FLJ59940 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-2C chain
Length=1014
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 269 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 318
>emb|CU691670.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100019435
5' read TUBB2C mRNA
Length=1073
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 211 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 260
>ref|NM_001284966.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101866438 (LOC101866438),
mRNA
dbj|AB170261.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-11061, similar to
human tubulin, beta, 2 (TUBB2), mRNA, RefSeq: NM_006088.3
Length=1521
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 266 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 315
>gb|AF064849.1| Homo sapiens map 4q35 repeat region, complete sequence
Length=570
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 242 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 291
>dbj|AK021414.1| Homo sapiens cDNA FLJ11352 fis, clone HEMBA1000020, highly similar
to Tubulin beta-2C chain
Length=1424
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Strand=Plus/Plus
Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 269 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 318
>gb|BC071888.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3958193, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1933
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 619 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 668
>emb|BX255925.17| Human DNA sequence from clone RP13-122B23 on chromosome 9, complete
sequence
Length=100719
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 37319 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 37368
>gb|AY167990.1| Homo sapiens class IVb beta tubulin mRNA, complete cds
Length=1338
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 195 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 244
>dbj|AK098686.1| Homo sapiens cDNA FLJ25820 fis, clone TST07642, highly similar
to TUBULIN BETA-2 CHAIN
Length=1492
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 264 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 313
>dbj|AK026609.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22956 fis, clone KAT09938, highly similar
to HSBT278 Homo sapiens mRNA for beta tubulin
Length=1579
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 269 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 318
>dbj|AK026594.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22941 fis, clone KAT08078, highly similar
to HSBT278 Homo sapiens mRNA for beta tubulin
Length=1587
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 269 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 318
>dbj|AK026167.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22514 fis, clone HRC12119, highly similar
to HSBT278 Homo sapiens mRNA for beta tubulin
Length=1579
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 268 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 317
>dbj|AK000560.1| Homo sapiens cDNA FLJ20553 fis, clone KAT11806, highly similar
to X79535 H
Length=1586
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 269 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 318
>ref|NM_006088.5| Homo sapiens tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), mRNA
Length=1591
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 297 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 346
>gb|BC071889.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:88568 IMAGE:4905049),
complete cds
Length=1590
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 233 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 282
>gb|BC002885.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:11278 IMAGE:3944735),
complete cds
Length=1560
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 239 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 288
>gb|BC007889.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:14233 IMAGE:4127195),
complete cds
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 233 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 282
>gb|BC004188.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:2826 IMAGE:2964559),
complete cds
gb|BC012835.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:4826 IMAGE:3603755),
complete cds
Length=1568
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 244 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 293
>emb|BX648521.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F0685 (from clone DKFZp686F0685)
Length=2057
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 269 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 318
>gb|BC039175.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:21910 IMAGE:4385885),
complete cds
Length=1551
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 242 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 291
>gb|BC024038.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:10845 IMAGE:3616531),
complete cds
Length=1544
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 233 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 282
>emb|AL832497.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J1451 (from clone DKFZp686J1451)
Length=1641
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 330 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 379
>gb|BC029529.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:33915 IMAGE:5274343),
complete cds
Length=1579
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 269 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 318
>gb|BC019829.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:29954 IMAGE:5110038),
complete cds
Length=1577
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Sbjct 258 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 307
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Sbjct 235 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 284
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Sbjct 232 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 281
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(LOC104680770), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 63 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCTTTCG 112
>ref|XM_010386858.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin beta-4B chain-like
(LOC104680770), transcript variant X1, mRNA
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mRNA
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Sbjct 27 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCTTTCG 76
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transcript variant X3, mRNA
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Sbjct 195 CGTGGATCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 244
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 312 CGTGGATCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 361
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 204 CGTGGATCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 253
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on chromosome 16
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partial mRNA
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Sbjct 246 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCTGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 295
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mRNA
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Sbjct 138 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCTGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 187
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mRNA
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Sbjct 195 CGTGGATCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 244
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clone ****
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Sbjct 195 CGTGGATCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 244
>gb|AF355125.1| Homo sapiens clone HSA16q24 beta-tubulin 4Q (TUBB4Q) pseudogene,
partial sequence
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Sbjct 1053 CGTGGATCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 1102
>gb|AC010552.6| Homo sapiens chromosome 16 clone RP11-568F1, complete sequence
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Sbjct 58369 CGTGGATCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 58320
>gb|AC133919.3| Homo sapiens chromosome 16 clone RP11-356C4, complete sequence
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Sbjct 118990 CGTGGATCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 119039
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Sbjct 1323 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGGTCGGGGCCCTTCG 1372
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mRNA
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Sbjct 291 GTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCTGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 339
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 305 GTGGACCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 353
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 294 GTGGACCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 342
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 301 GTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCTGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 349
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 292 GTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCTGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 340
>ref|XM_004892758.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b),
transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 303 GTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCTGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 351
>ref|XM_004892757.1| PREDICTED: Heterocephalus glaber tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 294 GTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCTGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 342
>ref|XM_010352113.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis tubulin beta chain
(LOC101052549), mRNA
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Sbjct 135 CGTGGACCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCCGGGCCCTTCG 184
>ref|XM_008704284.1| PREDICTED: Ursus maritimus tubulin beta chain (LOC103675253),
mRNA
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Sbjct 138 CGTGGACCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 187
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4B class IVb (TUBB4B), mRNA
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Sbjct 37 CGTGGACCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 86
>ref|XM_007103643.1| PREDICTED: Physeter catodon tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
mRNA
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Sbjct 29 CGTGGACCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 78
>ref|XM_006918134.1| PREDICTED: Pteropus alecto tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
mRNA
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Sbjct 138 CGTGGACCTGGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 187
>ref|XM_003780283.1| PREDICTED: Pongo abelii tubulin, beta 8 class VIII (TUBB8), mRNA
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Sbjct 195 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCTGTGCGCTCGGCGCCCTTCG 244
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mRNA
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|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 TGGACCTTGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 362
>ref|XM_005652746.1| PREDICTED: Sus scrofa tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), transcript
variant X7, mRNA
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Sbjct 317 CGTGGACCTTGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 366
>ref|XM_005652745.1| PREDICTED: Sus scrofa tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), transcript
variant X6, mRNA
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 317 CGTGGACCTTGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 366
>ref|XM_005652744.1| PREDICTED: Sus scrofa tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), transcript
variant X5, mRNA
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Sbjct 326 CGTGGACCTTGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 375
>ref|XM_005652743.1| PREDICTED: Sus scrofa tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), transcript
variant X4, mRNA
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Sbjct 335 CGTGGACCTTGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 384
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variant X1, mRNA
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Sbjct 317 CGTGGACCTTGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 366
>ref|XM_005652742.1| PREDICTED: Sus scrofa tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), transcript
variant X3, mRNA
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Sbjct 347 CGTGGACCTTGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 396
>ref|XM_005652741.1| PREDICTED: Sus scrofa tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), transcript
variant X2, mRNA
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Sbjct 359 CGTGGACCTTGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 408
>ref|XM_005625060.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris tubulin beta-4B chain-like
(LOC102153202), mRNA
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Query 1 CGTGGATCTGGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 50
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Sbjct 271 CGTGGACCTAGAGCCCGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGACCCTTCG 320
>dbj|AK396267.1| Sus scrofa mRNA, clone: PCT010030F04, expressed in placenta
Length=1586
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Sbjct 283 CGTGGACCTTGAGCCGGGCACCATGGACTCCGTGCGCTCGGGGCCCTTCG 332
>dbj|AK399046.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVRM10042B10, expressed in ovary
Length=1588
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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20 |
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Sbjct 931916 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 931867
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sequence
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Sbjct 24139063 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 24139014
>ref|AC_000141.1| Homo sapiens chromosome 9, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 109595105 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 109595056
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Sbjct 110651232 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 110651183
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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right flanking sequence - TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC
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>ref|NT_008470.20| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, GRCh38 Primary Assembly
HSCHR9_CTG35
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assembly
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Sbjct 69021951 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 69022000
>ref|NC_018920.2| Homo sapiens chromosome 9, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001617.2| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 140285689 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 140285738
>ref|NW_004929369.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150153.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
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Sbjct 919957 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 920006
>gb|KE141132.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold24, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 41152253 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 41152302
>gb|GL582982.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_2, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 38963936 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 38963985
>gb|CM000499.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 109595727 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 109595776
>gb|DS990895.1| Homo sapiens SCAF_1112675837073 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 933112 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 933161
>gb|CH003504.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 115606304 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 115606353
>gb|CH003456.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 108044063 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 108044112
>ref|NW_001839245.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188128, whole genome shotgun sequence
gb|DS486257.1| Homo sapiens SCAF_1103279188128 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 933079 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 933128
>gb|CH471090.1| Homo sapiens 211000035837865 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=25070985
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 24140371 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 24140420
>ref|AC_000141.1| Homo sapiens chromosome 9, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
gb|CM000470.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
Length=110559325
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 109596268 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 109596317
>gb|CM000260.1| Homo sapiens chromosome 9, whole genome shotgun sequence
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 110652540 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 110652589
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG
>ref|NM_006088.5| Homo sapiens tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), mRNA
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 50
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Sbjct 82 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 33
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Query 1 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 50
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Sbjct 54 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 5
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complete cds
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Query 1 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 50
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Sbjct 54 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 5
>emb|AJ336575.1| Homo sapiens genomic sequence surrounding NotI site, clone NR1-QE11C
Length=667
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Query 1 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 50
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Sbjct 190 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 239
>emb|AJ334482.1| Homo sapiens genomic sequence surrounding NotI site, clone NR1-KL9R
Length=680
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Query 1 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 50
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Sbjct 190 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 239
>dbj|AK098686.1| Homo sapiens cDNA FLJ25820 fis, clone TST07642, highly similar
to TUBULIN BETA-2 CHAIN
Length=1492
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Query 1 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGA 49
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Sbjct 49 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGA 1
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Length=3284
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 GGAAG-AGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCGCGCAGAG 676
>gb|BC019829.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:29954 IMAGE:5110038),
complete cds
Length=1577
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Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCG 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43 GGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAGAGCGGGCG 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC
>ref|XM_010386859.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin beta-4B chain-like
(LOC104680770), transcript variant X2, mRNA
Length=1371
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 153 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 202
>ref|XM_010386858.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin beta-4B chain-like
(LOC104680770), transcript variant X1, mRNA
Length=1581
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 412
>ref|XM_010372652.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin beta chain (LOC104669623),
mRNA
Length=1324
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 166
>ref|XM_009245058.1| PREDICTED: Pongo abelii tubulin beta-4B chain-like (LOC100438882),
mRNA
Length=1228
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 26 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 75
>ref|XM_003911025.2| PREDICTED: Papio anubis tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
mRNA
Length=1808
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 601 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 650
>ref|XM_008970129.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin beta chain (LOC103785843), mRNA
Length=1352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 148 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 197
>gb|KJ893022.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_02416 TUBB4B
gene, encodes complete protein
Length=1467
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 350 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 399
>ref|XM_008005489.1| PREDICTED: Chlorocebus sabaeus tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
mRNA
Length=1586
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 379 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 428
>ref|XM_003279813.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys family with sequence similarity
166, member A (FAM166A), mRNA
Length=2162
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 2154 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 2105
>ref|XM_003279810.2| PREDICTED: Nomascus leucogenys tubulin, beta 4B class IVb (TUBB2C),
mRNA
Length=1878
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 238 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 287
>ref|NM_001246378.1| Pan troglodytes tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), mRNA
dbj|AK306296.1| Pan troglodytes mRNA for tubulin beta-2C chain, complete cds,
clone: PtsC-51-5_A01
Length=1577
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 356 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 405
>gb|HQ447292.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100070603; CCSB002550_03
tubulin, beta 2C (TUBB2C) gene, encodes complete protein
Length=1437
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 335 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 384
>dbj|AB590760.1| Synthetic construct DNA, clone: pFN21AE1911, Homo sapiens TUBB2C
gene for tubulin, beta 2C, without stop codon, in Flexi
system
Length=1352
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 294 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 343
>ref|NM_001194791.1| Macaca mulatta tubulin, beta 4B class IVb (TUBB2C), mRNA
Length=1619
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 342 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 391
>ref|XM_002799911.1| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin beta-2C chain-like, transcript
variant 4 (LOC100425863), mRNA
Length=1656
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 379 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 428
>ref|XM_002799910.1| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin beta-2C chain-like, transcript
variant 3 (LOC100425863), mRNA
Length=1582
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 305 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 354
>ref|XM_002799908.1| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin beta-2C chain-like, transcript
variant 1 (LOC100425863), mRNA
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Sbjct 370 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 419
>dbj|AK298087.1| Homo sapiens cDNA FLJ59940 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-2C chain
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Sbjct 833 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 882
>emb|CU691670.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100019435
5' read TUBB2C mRNA
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Sbjct 301 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 350
>ref|NM_001284966.1| Macaca fascicularis uncharacterized LOC101866438 (LOC101866438),
mRNA
dbj|AB170261.1| Macaca fascicularis brain cDNA clone: QbsB-11061, similar to
human tubulin, beta, 2 (TUBB2), mRNA, RefSeq: NM_006088.3
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Sbjct 356 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 405
>gb|AF064849.1| Homo sapiens map 4q35 repeat region, complete sequence
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Sbjct 332 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 381
>gb|BC071888.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3958193, **** WARNING: chimeric
clone ****
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Sbjct 709 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 758
>emb|BX255925.17| Human DNA sequence from clone RP13-122B23 on chromosome 9, complete
sequence
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Sbjct 37883 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 37932
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Sbjct 285 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 334
>dbj|AK026609.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22956 fis, clone KAT09938, highly similar
to HSBT278 Homo sapiens mRNA for beta tubulin
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Sbjct 359 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 408
>dbj|AK026594.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22941 fis, clone KAT08078, highly similar
to HSBT278 Homo sapiens mRNA for beta tubulin
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Sbjct 359 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 408
>dbj|AK026167.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22514 fis, clone HRC12119, highly similar
to HSBT278 Homo sapiens mRNA for beta tubulin
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Sbjct 358 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 407
>dbj|AK000560.1| Homo sapiens cDNA FLJ20553 fis, clone KAT11806, highly similar
to X79535 H
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Sbjct 359 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 408
>emb|X02344.1| Homo sapiens beta 2 gene
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Sbjct 1887 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 1936
>ref|NM_006088.5| Homo sapiens tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), mRNA
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Sbjct 387 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 436
>gb|BC071889.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:88568 IMAGE:4905049),
complete cds
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Sbjct 323 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 372
>gb|BC002885.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:11278 IMAGE:3944735),
complete cds
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Sbjct 329 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 378
>gb|BC007889.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:14233 IMAGE:4127195),
complete cds
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Sbjct 323 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 372
>gb|BC004188.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:2826 IMAGE:2964559),
complete cds
gb|BC012835.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:4826 IMAGE:3603755),
complete cds
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Sbjct 334 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 383
>emb|BX648521.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F0685 (from clone DKFZp686F0685)
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Sbjct 833 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 882
>gb|BC039175.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:21910 IMAGE:4385885),
complete cds
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Sbjct 332 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 381
>gb|BC024038.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:10845 IMAGE:3616531),
complete cds
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Sbjct 323 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 372
>emb|AL832497.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J1451 (from clone DKFZp686J1451)
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Sbjct 420 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 469
>gb|BC029529.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:33915 IMAGE:5274343),
complete cds
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Sbjct 359 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 408
>gb|BC019829.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:29954 IMAGE:5110038),
complete cds
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Sbjct 348 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 397
>gb|BC019359.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:13231 IMAGE:4024979),
complete cds
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Sbjct 325 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 374
>gb|BC001911.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:2666 IMAGE:3544236),
complete cds
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Sbjct 322 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 371
>gb|BC002783.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:4028 IMAGE:3614023),
complete cds
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Sbjct 332 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 381
>ref|XM_006737380.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii tubulin, beta 4B class IVb
(TUBB4B), transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 295 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAG 342
>ref|XM_006737379.1| PREDICTED: Leptonychotes weddellii tubulin, beta 4B class IVb
(TUBB4B), transcript variant X1, mRNA
Length=1587
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Query 2 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAG 49
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Sbjct 397 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAG 444
>ref|XM_004416661.1| PREDICTED: Odobenus rosmarus divergens tubulin, beta 4B class
IVb (TUBB4B), mRNA
Length=1560
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Query 2 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAG 49
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Sbjct 367 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAG 414
>ref|XM_008704284.1| PREDICTED: Ursus maritimus tubulin beta chain (LOC103675253),
mRNA
Length=1420
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Sbjct 228 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 277
>ref|XM_008576469.1| PREDICTED: Galeopterus variegatus tubulin beta chain (LOC103593487),
mRNA
Length=1308
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 95 TGGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 144
>ref|XM_005625060.1| PREDICTED: Canis lupus familiaris tubulin beta-4B chain-like
(LOC102153202), mRNA
Length=1571
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Sbjct 361 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 410
>ref|XM_005408610.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b),
transcript variant X2, mRNA
Length=1592
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 394 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCGGAGC 443
>ref|XM_005408609.1| PREDICTED: Chinchilla lanigera tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b),
transcript variant X1, mRNA
Length=1581
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 383 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCGGAGC 432
>ref|XM_005336880.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus tubulin, beta 4B class
IVb (Tubb4b), transcript variant X2, mRNA
Length=1546
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 347 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCCGAGC 396
>ref|XM_005336879.1| PREDICTED: Spermophilus tridecemlineatus tubulin, beta 4B class
IVb (Tubb4b), transcript variant X1, mRNA
Length=1580
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 378 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCCGAGC 427
>ref|XM_004048941.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin beta-4 chain-like,
transcript variant 2 (LOC101142053), mRNA
Length=1910
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 276 TGGTGCAGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 325
>ref|XM_004048940.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin beta-4 chain-like,
transcript variant 1 (LOC101142053), mRNA
Length=1889
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 255 TGGTGCAGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 304
>ref|XM_004826825.1| PREDICTED: Mustela putorius furo tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
mRNA
Length=1404
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Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 212 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACGGAAGGCGCGGAGC 260
>ref|XM_004780818.1| PREDICTED: Mustela putorius furo tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
transcript variant X1, mRNA
Length=1443
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 251 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACGGAAGGCGCGGAGC 299
>ref|XM_002926120.1| PREDICTED: Ailuropoda melanoleuca tubulin beta-2C chain-like
(LOC100463763), mRNA
Length=1535
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 48/49 (98%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 342 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 390
>ref|XR_745291.1| PREDICTED: Saimiri boliviensis boliviensis tubulin beta chain-like
(LOC101031586), misc_RNA
Length=1517
Score = 84.2 bits (45), Expect = 8e-14
Identities = 47/48 (98%), Gaps = 0/48 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 322 GTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCACGGAGC 369
>ref|XM_007521499.1| PREDICTED: Erinaceus europaeus tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
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(LOC104678490), transcript variant X1, mRNA
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IVb (Tubb4b), mRNA
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variant X1, mRNA
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variant X3, mRNA
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variant X2, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X2, mRNA
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transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 391 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 440
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transcript variant X2, mRNA
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Sbjct 294 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 343
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transcript variant X1, mRNA
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mRNA
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Sbjct 318 TGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 367
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mRNA
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Sbjct 405 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 454
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phosphate), member 3 (SLC34A3), mRNA
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Sbjct 2172 TGGTGCTGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 2221
>dbj|AK396267.1| Sus scrofa mRNA, clone: PCT010030F04, expressed in placenta
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Sbjct 373 TGGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 422
>dbj|AK399046.1| Sus scrofa mRNA, clone: OVRM10042B10, expressed in ovary
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Sbjct 373 TGGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 422
>dbj|AK396972.1| Sus scrofa mRNA, clone: PTG010042H07, expressed in pituitary
gland
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Sbjct 373 TGGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 422
>dbj|AK392590.1| Sus scrofa mRNA, clone: HTMT10088C11, expressed in hypothalamus
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Sbjct 372 TGGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 421
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Sbjct 349 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCGGAGC 398
>ref|XM_002805536.1| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin beta-8 chain-like, transcript
variant 2 (LOC709331), mRNA
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Sbjct 180 TGGGGCTGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 229
>dbj|AK349426.1| Sus scrofa mRNA, clone:PTG010068E12, expressed in pituitary gland
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Sbjct 374 TGGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 423
>dbj|AK235338.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10070A11, expressed in ovary
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Sbjct 370 TGGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 419
>dbj|AK235126.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVRM10051G07, expressed in ovary
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Sbjct 370 TGGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 419
>dbj|AK234279.1| Sus scrofa mRNA, clone:OVR010036H08, expressed in ovary
Length=1587
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Sbjct 373 TGGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 422
>ref|XM_001100146.1| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin beta-8 chain-like, transcript
variant 1 (LOC709331), mRNA
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Sbjct 285 TGGGGCTGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 334
>ref|NM_001244098.1| Cricetulus griseus tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b), mRNA
emb|X60785.1| Cricetulus griseus (chinese hamster) mRNA for beta tubulin (clone
B3T)
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Sbjct 326 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCAGAGC 375
>ref|XM_007198452.1| PREDICTED: Balaenoptera acutorostrata scammoni tubulin, beta
4B class IVb (TUBB4B), mRNA
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Query 2 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 128 GGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCGGAGC 176
>ref|XM_006269387.1| PREDICTED: Alligator mississippiensis tubulin, beta 3 class III
(TUBB3), mRNA
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Query 2 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 302 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGGGCCGAGC 350
>ref|XM_010364028.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin beta-8 chain-like
(LOC104662906), mRNA
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Sbjct 24 TGGGGCCGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 73
>ref|XM_009199699.1| PREDICTED: Papio anubis tubulin beta-8 chain-like (LOC101018350),
mRNA
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Sbjct 339 TGGGGCCGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 388
>ref|XM_008831205.1| PREDICTED: Nannospalax galili tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b),
mRNA
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Sbjct 390 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 439
>ref|XM_006233582.2| PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b),
transcript variant X1, mRNA
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Sbjct 365 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 414
>ref|XM_008539011.1| PREDICTED: Equus przewalskii tubulin beta chain (LOC103563572),
mRNA
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Sbjct 70 TGGTGCGGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 119
>ref|XM_007103643.1| PREDICTED: Physeter catodon tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
mRNA
Length=1334
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 119 TGGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 168
>ref|XM_005652746.1| PREDICTED: Sus scrofa tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), transcript
variant X7, mRNA
Length=1561
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 43/44 (98%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCG 44
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Sbjct 407 TGGTGCCGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCG 450
>ref|XM_005606067.1| PREDICTED: Equus caballus tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
mRNA
Length=1299
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 84 TGGTGCGGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 133
>ref|XM_005595442.1| PREDICTED: Macaca fascicularis tubulin beta-8 chain-like (LOC102123543),
mRNA
Length=1493
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 TGGGGCCGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 349
>ref|XM_004640358.1| PREDICTED: Octodon degus tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b),
mRNA
Length=1288
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Sbjct 86 TGGCGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 135
>ref|XM_004654131.1| PREDICTED: Jaculus jaculus tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b),
transcript variant X2, mRNA
Length=1482
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||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 294 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 343
>ref|XM_004654130.1| PREDICTED: Jaculus jaculus tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b),
transcript variant X1, mRNA
Length=1499
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 299 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 348
>ref|NM_199094.2| Rattus norvegicus tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b), mRNA
Length=1578
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Sbjct 352 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 401
>gb|JN957733.1| Mus musculus targeted KO-first, conditional ready, lacZ-tagged
mutant allele Tubb2c:tm2a(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=38039
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Sbjct 23369 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 23418
>gb|JN954118.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele 4933433C11Rik:tm1(KOMP)Wtsi;
transgenic
Length=37274
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 6141 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 6190
>gb|JN949815.1| Mus musculus targeted non-conditional, lacZ-tagged mutant allele
Tubb2c:tm2e(EUCOMM)Wtsi tm1e(EUCOMM)Wtsi; transgenic
Length=37976
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 23306 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 23355
>gb|JN947143.1| Mus musculus targeted deletion, lacZ-tagged mutant allele Fam166a:tm1(KOMP)Ucd;
transgenic
Length=37222
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Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 23682 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 23633
>emb|FQ212956.1| Rattus norvegicus TL0AAA50YI04 mRNA sequence
Length=1577
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Sbjct 349 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 398
>emb|FQ213825.1| Rattus norvegicus TL0AAA45YH10 mRNA sequence
Length=1571
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Sbjct 349 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 398
>emb|FQ218503.1| Rattus norvegicus TL0ABA51YL12 mRNA sequence
Length=1581
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 349 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 398
>emb|FQ215022.1| Rattus norvegicus TL0ACA50YB23 mRNA sequence
Length=1570
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 349 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 398
>emb|FQ227178.1| Rattus norvegicus TL0AEA14YK04 mRNA sequence
Length=1568
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 349 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 398
>ref|XR_014813.2| PREDICTED: Macaca mulatta tubulin beta-8 chain-like (LOC722862),
miscRNA
Length=1376
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 326 TGGGGCCGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 375
>ref|NG_008221.2| Mus musculus tubulin, beta 4B class IVB, pseudogene 1 (Tubb4b-ps1)
on chromosome 5
Length=1748
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 454 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 503
>ref|NM_146116.2| Mus musculus tubulin, beta 4B class IVB (Tubb4b), mRNA
Length=1600
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 397 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 446
>gb|BC090334.1| Rattus norvegicus tubulin, beta 2c, mRNA (cDNA clone IMAGE:7301482),
**** WARNING: chimeric clone ****
Length=4215
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 2986 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 3035
>gb|AC112938.11| Mus musculus chromosome 5, clone RP24-72E12, complete sequence
Length=235924
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 232348 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 232299
>gb|AC122471.4| Mus musculus BAC clone RP24-322M5 from chromosome 2, complete
sequence
Length=206592
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
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Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 44364 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 44413
>gb|AF355134.1| Papio hamadryas clone PHA122M7 beta-tubulin 4Q (TUBB4Q) pseudogene,
partial sequence
Length=2802
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 1601 TGGGGCCGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 1650
>gb|AF355133.1| Papio hamadryas clone PHA256F15 beta-tubulin 4Q (TUBB4Q) pseudogene,
partial sequence
Length=2797
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591 TGGGGCCGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 1640
>gb|AF355132.1| Papio hamadryas clone PHA140N17 beta-tubulin 4Q (TUBB4Q) pseudogene,
partial sequence
Length=2792
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1587 TGGGGCCGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 1636
>gb|AF355131.1| Papio hamadryas clone PHA269I4 beta-tubulin 4Q (TUBB4Q) pseudogene,
partial sequence
Length=2775
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1579 TGGGGCCGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 1628
>gb|AF355130.1| Papio hamadryas clone PHA443J9 beta-tubulin 4Q (TUBB4Q) gene,
complete cds
Length=2790
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592 TGGGGCCGGAAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 1641
>gb|AC145450.4| Mus musculus strain C57BL/6J clone rp23-430i3, complete sequence
Length=208207
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 180082 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 180033
>gb|BC060597.1| Rattus norvegicus tubulin, beta 2c, mRNA (cDNA clone MGC:73008
IMAGE:6889737), complete cds
Length=1582
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 356 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 405
>dbj|AK167022.1| Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:I1C0028A18 product:Tubulin beta-2 chain
homolog [Homo sapiens], full insert sequence
Length=1545
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 352 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 401
>dbj|AK146587.1| Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920030A10
product:Tubulin beta-2 chain homolog [Homo sapiens],
full insert sequence
Length=1552
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 353 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 402
>dbj|AK076895.1| Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:4930542G03 product:TUBULIN BETA-2 CHAIN homolog
[Homo sapiens], full insert sequence
Length=1551
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 354 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 403
>dbj|AK015901.1| Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:4930526G20 product:TUBULIN BETA-2 CHAIN homolog
[Homo sapiens], full insert sequence
Length=1545
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 350 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 399
>dbj|AK006924.1| Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched
library, clone:1700069N23 product:TUBULIN BETA-2 CHAIN homolog
[Homo sapiens], full insert sequence
Length=876
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 161 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 210
>gb|AC133939.4| Mus musculus BAC clone RP23-402F1 from chromosome 5, complete
sequence
Length=193121
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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Sbjct 20248 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 20199
>emb|AJ249551.1| Meriones unguiculatus partial mRNA for beta-tubulin (Tub gene)
Length=1460
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 260 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 309
>gb|BC083319.1| Mus musculus tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:101937 IMAGE:5699674),
complete cds
Length=1570
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 339 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 388
>emb|AL732309.9| Mouse DNA sequence from clone RP23-132N23 on chromosome 2, complete
sequence
Length=221859
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 115993 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 115944
>gb|BC022919.1| Mus musculus tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:28623 IMAGE:4221189),
complete cds
Length=1561
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 336 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 385
>gb|BC005547.1| Mus musculus tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:6713 IMAGE:3585500),
complete cds
Length=1561
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 329 TGGGGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGTGCAGAGC 378
>ref|XM_006027831.1| PREDICTED: Alligator sinensis tubulin, beta 3 class III (TUBB3),
mRNA
Length=1480
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 46/49 (94%), Gaps = 0/49 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||
Sbjct 228 GGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAGGGGGCCGAGC 276
>ref|XR_265426.1| PREDICTED: Geospiza fortis tubulin beta-2 chain-like (LOC102042150),
misc_RNA
Length=1173
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 44/46 (96%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 GCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 152 GCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCCGAGC 197
>emb|FQ228801.1| Rattus norvegicus TL0ADA51YK12 mRNA sequence
Length=1565
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-11
Identities = 47/50 (94%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGTGCTGGGAACAACTGGGCCAAGGGGCACTACACAGAAGGCGCGGAGC 50
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8:29
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|
9 |
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 919998 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 920047
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Sbjct 41152294 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 41152343
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shotgun sequence
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Length=116547660
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>ref|NW_001839245.1| Homo sapiens chromosome 9 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188128, whole genome shotgun sequence
gb|DS486257.1| Homo sapiens SCAF_1103279188128 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 933120 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 933169
>gb|CH471090.1| Homo sapiens 211000035837865 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=25070985
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 24140412 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 24140461
>ref|AC_000141.1| Homo sapiens chromosome 9, alternate assembly HuRef, whole genome
shotgun sequence
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 109596309 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 109596358
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Length=111583154
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG
>ref|NM_006088.5| Homo sapiens tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), mRNA
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Query 1 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 50
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Sbjct 97 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 48
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Query 1 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 50
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Sbjct 69 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 20
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complete cds
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Query 1 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 50
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Sbjct 69 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 20
>gb|BC019829.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:29954 IMAGE:5110038),
complete cds
Length=1577
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Query 1 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 50
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Sbjct 58 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 9
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Length=667
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Sbjct 175 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 224
>emb|AJ334482.1| Homo sapiens genomic sequence surrounding NotI site, clone NR1-KL9R
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Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 50
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Sbjct 175 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 224
>dbj|AK098686.1| Homo sapiens cDNA FLJ25820 fis, clone TST07642, highly similar
to TUBULIN BETA-2 CHAIN
Length=1492
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 50
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 CGGCGGTGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 15
>emb|X02344.1| Homo sapiens beta 2 gene
Length=3284
Score = 86.1 bits (46), Expect = 2e-14
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 1/50 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 50
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Sbjct 739 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAG-AGGAGGAAGTAGACAAACAGCAGCAGAAG 691
>gb|BC004188.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:2826 IMAGE:2964559),
complete cds
gb|BC012835.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:4826 IMAGE:3603755),
complete cds
Length=1568
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Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAG 44
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Sbjct 44 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGCAG 1
>gb|AF064849.1| Homo sapiens map 4q35 repeat region, complete sequence
Length=570
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Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGC 42
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Sbjct 42 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGC 1
>gb|BC002783.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:4028 IMAGE:3614023),
complete cds
Length=1552
Score = 78.7 bits (42), Expect = 4e-12
Identities = 42/42 (100%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGC 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 CGGCGGCGGCGGCGGGGAAGCAGGAGGAAGTAGACAAACAGC 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 1711909892800
right flanking sequence - GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG
>ref|XM_008970129.1| PREDICTED: Pan paniscus tubulin beta chain (LOC103785843), mRNA
Length=1352
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 189 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 238
>gb|KJ893022.1| Synthetic construct Homo sapiens clone ccsbBroadEn_02416 TUBB4B
gene, encodes complete protein
Length=1467
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 391 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 440
>ref|XM_004048941.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin beta-4 chain-like,
transcript variant 2 (LOC101142053), mRNA
Length=1910
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 317 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 366
>ref|XM_004048940.1| PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla tubulin beta-4 chain-like,
transcript variant 1 (LOC101142053), mRNA
Length=1889
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 296 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 345
>ref|NM_001246378.1| Pan troglodytes tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), mRNA
dbj|AK306296.1| Pan troglodytes mRNA for tubulin beta-2C chain, complete cds,
clone: PtsC-51-5_A01
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 397 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 446
>gb|HQ447292.1| Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100070603; CCSB002550_03
tubulin, beta 2C (TUBB2C) gene, encodes complete protein
Length=1437
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 376 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 425
>dbj|AB590760.1| Synthetic construct DNA, clone: pFN21AE1911, Homo sapiens TUBB2C
gene for tubulin, beta 2C, without stop codon, in Flexi
system
Length=1352
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 335 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 384
>dbj|AK298087.1| Homo sapiens cDNA FLJ59940 complete cds, highly similar to Tubulin
beta-2C chain
Length=1014
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 874 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 923
>emb|CU691670.1| Synthetic construct Homo sapiens gateway clone IMAGE:100019435
5' read TUBB2C mRNA
Length=1073
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 342 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 391
>gb|AF064849.1| Homo sapiens map 4q35 repeat region, complete sequence
Length=570
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 422
>gb|BC071888.1| Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3958193, **** WARNING: chimeric
clone ****
Length=1933
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 750 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 799
>emb|BX255925.17| Human DNA sequence from clone RP13-122B23 on chromosome 9, complete
sequence
Length=100719
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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Sbjct 37924 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 37973
>gb|AY167990.1| Homo sapiens class IVb beta tubulin mRNA, complete cds
Length=1338
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 375
>dbj|AK098686.1| Homo sapiens cDNA FLJ25820 fis, clone TST07642, highly similar
to TUBULIN BETA-2 CHAIN
Length=1492
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 378
>dbj|AK026609.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22956 fis, clone KAT09938, highly similar
to HSBT278 Homo sapiens mRNA for beta tubulin
Length=1579
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 449
>dbj|AK026594.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22941 fis, clone KAT08078, highly similar
to HSBT278 Homo sapiens mRNA for beta tubulin
Length=1587
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 449
>dbj|AK026167.1| Homo sapiens cDNA: FLJ22514 fis, clone HRC12119, highly similar
to HSBT278 Homo sapiens mRNA for beta tubulin
Length=1579
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 399 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 448
>dbj|AK000560.1| Homo sapiens cDNA FLJ20553 fis, clone KAT11806, highly similar
to X79535 H
Length=1586
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 449
>emb|X02344.1| Homo sapiens beta 2 gene
Length=3284
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1928 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 1977
>ref|NM_006088.5| Homo sapiens tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B), mRNA
Length=1591
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 477
>gb|BC071889.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:88568 IMAGE:4905049),
complete cds
Length=1590
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 413
>gb|BC002885.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:11278 IMAGE:3944735),
complete cds
Length=1560
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 419
>gb|BC007889.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:14233 IMAGE:4127195),
complete cds
Length=1550
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 413
>gb|BC004188.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:2826 IMAGE:2964559),
complete cds
gb|BC012835.2| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:4826 IMAGE:3603755),
complete cds
Length=1568
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 424
>emb|BX648521.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686F0685 (from clone DKFZp686F0685)
Length=2057
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 874 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 923
>gb|BC039175.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:21910 IMAGE:4385885),
complete cds
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 422
>gb|BC024038.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:10845 IMAGE:3616531),
complete cds
Length=1544
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 413
>emb|AL832497.1| Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp686J1451 (from clone DKFZp686J1451)
Length=1641
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 461 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 510
>gb|BC029529.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:33915 IMAGE:5274343),
complete cds
Length=1579
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 449
>gb|BC019829.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:29954 IMAGE:5110038),
complete cds
Length=1577
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Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 389 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 438
>gb|BC019359.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:13231 IMAGE:4024979),
complete cds
Length=1548
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 415
>gb|BC001911.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:2666 IMAGE:3544236),
complete cds
Length=1557
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 412
>gb|BC002783.1| Homo sapiens tubulin, beta 2C, mRNA (cDNA clone MGC:4028 IMAGE:3614023),
complete cds
Length=1552
Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-16
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 422
>ref|XM_010386859.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin beta-4B chain-like
(LOC104680770), transcript variant X2, mRNA
Length=1371
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 194 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGGAAGGAGGCTGAG 243
>ref|XM_010386858.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin beta-4B chain-like
(LOC104680770), transcript variant X1, mRNA
Length=1581
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 404 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGGAAGGAGGCTGAG 453
>ref|XM_010372652.1| PREDICTED: Rhinopithecus roxellana tubulin beta chain (LOC104669623),
mRNA
Length=1324
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 158 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGGAAGGAGGCTGAG 207
>ref|XM_009245058.1| PREDICTED: Pongo abelii tubulin beta-4B chain-like (LOC100438882),
mRNA
Length=1228
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 67 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGGAAGGAGGCTGAG 116
>ref|XM_003911025.2| PREDICTED: Papio anubis tubulin, beta 4B class IVb (TUBB4B),
mRNA
Length=1808
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 642 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGGAAGGAGGCTGAG 691
>ref|NM_001194791.1| Macaca mulatta tubulin, beta 4B class IVb (TUBB2C), mRNA
Length=1619
Score = 87.9 bits (47), Expect = 6e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
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Query 1 GCGCGGAGCTGGTGGACTCGGTGCTGGATGTTGTGAGAAAGGAGGCTGAG 50
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MT MT 3374 3764 45m3710F55M GGTAAGCATTAGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAAC
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MT MT 3374 3764 45m3710F55M GGTAAGCATTAGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG GAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAAC
MT MT 3374 3764 45m3710F55M GGTAAGCATTAGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG GAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAAC
MT MT 3374 3764 45m3710F55M GGTAAGCATTAGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAAC
MT MT 3373 3765 44m3710F56M GTAAGCATTAGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACA
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MT MT 3373 3765 44m3710F56M GTAAGCATTAGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACA
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MT MT 3368 3770 39m3710F61M CATTAGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACT
MT MT 3367 3771 38m3710F62M ATTAGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTA
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MT MT 3365 3773 36m3710F64M TAGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAAT
MT MT 3365 3773 36m3710F64M TAGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCCACATTACTAAT
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MT MT 3364 3774 35m3710F65M AGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATA
MT MT 3364 3774 35m3710F65M AGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATA
MT MT 3364 3774 35m3710F65M AGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATA
MT MT 3364 3774 35m3710F65M AGGAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATA
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MT MT 3362 3776 33m3710F67M GAATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAG
MT MT 3361 3777 32m3710F68M AATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG GAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGT
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MT MT 3360 3778 31m3710F69M ATGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG GAGTAGGCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTG
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MT MT 3359 3779 30m3710F70M TGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGG
MT MT 3359 3959 30m3710F69M180N1M TGCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||G
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MT MT 3358 3960 29m3710F69M180N2M GCCATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||GC
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MT MT 3356 3782 27m3710F73M CATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACTCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGCGGCTC
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MT MT 3355 3783 26m3710F74M ATTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCC
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MT MT 3354 3784 25m3710F75M TTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG GAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCT
MT MT 3354 3784 25m3710F75M TTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCT
MT MT 3354 3784 25m3710F75M TTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG GAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCT
MT MT 3354 3784 25m3710F75M TTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG GAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCT
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MT MT 3354 3784 25m3710F75M TTGCGATTAGAATGGGTACAATGAG CAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCT
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MT MT 3350 3788 21m3710F79M GATTAGAATGGGTACAATGAG GAGTAGCCCAAACAATCTCATATGAAGTCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAA
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MT MT 3745 3645 100m GCTAGGGTGACTTCATATGAGATTGTTTGGGCTACTGCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGT
MT MT 3742 3642 100m AGGGTGACTTCATATGAGATTGTTTGGGCTACTGCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAA
MT MT 3739 3639 100m GTGACTTCATATGAGATTGTTTGGGCTACTGCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGG
MT MT 3736 3636 100m ACTTCATATGAGATTGTTTGGGCTACTGCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTA
MT MT 3733 3633 100m TCATATGAGATTGTTTGGGCTACTGCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGC
MT MT 3730 3630 100m TATGAGATTGTTTGGGCTACTGCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAG
MT MT 3727 3627 100m GAGATTGTTTGGGCTACTGCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGG
MT MT 3724 3624 100m ATTGTTTGGGCTACTGCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGG
MT MT 3721 3621 100m GTTTGGGCTACTGCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTA
MT MT 3718 3618 100m TGGGCTACTGCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAA
MT MT 3715 3615 100m GCTACTGCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAA
MT MT 3712 3611 3m1d97m ACTDTCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAATAG
MT MT 3709 3609 100m GCTCGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGA
MT MT 3706 3606 100m CGCAGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGC
MT MT 3703 3603 100m AGTGCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTA
MT MT 3700 3600 100m GCGCCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAGGT
MT MT 3697 3597 100m CCGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAGGTTGA
MT MT 3696 3751 94m3746F6M CGATCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCCTCA
MT MT 3693 3593 100m TCAGGGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAGGTTGAGGTT
MT MT 3689 3758 87m3746F13M GGCGTAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACT
MT MT 3687 3760 85m3746F15M CGGAGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGACTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTAT
MT MT 3684 3763 82m3746F18M AGTTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAA
MT MT 3682 3765 80m3746F20M TTTGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACA
MT MT 3680 3767 78m3746F22M TGAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATT
MT MT 3679 3768 77m3746F23M GAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTA
MT MT 3679 3768 77m3746F23M GAGTTTGATGCTCCCCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTA
MT MT 3679 3768 77m3746F23M GAGTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTA
MT MT 3677 3770 75m3746F25M GTTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACT
MT MT 3676 3771 74m3746F26M TTTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTA
MT MT 3675 3772 73m3746F27M TTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAA
MT MT 3675 3772 73m3746F27M TTGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAA
MT MT 3674 3773 72m3746F28M TGATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAAT
MT MT 3673 3774 71m3746F29M GATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATA
MT MT 3673 3774 71m3746F29M GATGCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATA
MT MT 3670 3777 68m3746F32M GCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGT
MT MT 3670 3777 68m3746F32M GCTCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGT
MT MT 3668 3779 66m3746F34M TCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGG
MT MT 3668 3959 66m3746F33M180N1M TCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||G
MT MT 3668 3779 66m3746F34M TCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAA CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGGGG
MT MT 3668 3959 66m3746F33M180N1M TCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAA CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGGG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||G
MT MT 3668 3779 66m3746F34M TCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGG
MT MT 3668 3959 66m3746F33M180N1M TCACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTG||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||G
MT MT 3666 3781 64m3746F36M ACCCTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGGGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCT
MT MT 3663 3784 61m3746F39M CTGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCT
MT MT 3662 3785 60m3746F40M TGATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTT
MT MT 3660 3787 58m3746F42M ATCAGAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTA
MT MT 3656 3791 54m3746F46M GAGGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCCTTAAACT
MT MT 3654 3793 52m3746F48M GGATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCT
MT MT 3653 3794 51m3746F49M GATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTC
MT MT 3652 3795 50m3746F50M ATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCCCC
MT MT 3652 3795 50m3746F50M ATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCC
MT MT 3652 3795 50m3746F50M ATTGAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCC
MT MT 3651 3796 49m3746F51M TTGAGTAACCGGCTAGGCTAGAGGTGCCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCA
MT MT 3651 3796 49m3746F51M TTGAGTAACCGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTACTAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCA
MT MT 3649 3798 47m3746F53M GAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACC
MT MT 3649 3798 47m3746F53M GAGTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACC
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAAAAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGGGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCT
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGGGGCCTAG CCCTCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCT
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCT
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCT
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCA
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAACCGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCT
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAACCGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCT
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCT
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCT
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCT
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGTTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCT
MT MT 3647 3800 45m3746F55M GTAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCT
MT MT 3646 3801 44m3746F56M TAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTT
MT MT 3646 3801 44m3746F56M TAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTT
MT MT 3646 3801 44m3746F56M TAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGTTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTT
MT MT 3646 3801 44m3746F56M TAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTT
MT MT 3646 3801 44m3746F56M TAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACTTTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCCCCCTT
MT MT 3646 3801 44m3746F56M GAAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTT
MT MT 3645 3802 43m3746F57M AAACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTA
MT MT 3644 3803 42m3746F58M AACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTAT
MT MT 3644 3803 42m3746F58M AACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTAT
MT MT 3644 3803 42m3746F58M AACGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTAT
MT MT 3642 3805 40m3746F60M CGGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCA
MT MT 3641 3806 39m3746F61M GGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCAC
MT MT 3641 3806 39m3746F61M GGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCAC
MT MT 3641 3806 39m3746F61M GGCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCAC
MT MT 3640 3807 38m3746F62M GCTAGGCTAGAGGTGCATAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACA
MT MT 3640 3807 38m3746F62M GCTAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACA
MT MT 3638 3809 36m3746F64M TAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAAC
MT MT 3638 3809 36m3746F64M TAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAAC
MT MT 3638 3809 36m3746F64M TAGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAAC
MT MT 3637 3810 35m3746F65M AGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACA
MT MT 3637 3810 35m3746F65M AGGCTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCCCCCTTATCACAACA
MT MT 3634 3813 32m3746F68M CTAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAA
MT MT 3633 3814 31m3746F69M TAGAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAG
MT MT 3631 3816 29m3746F71M GAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAA
MT MT 3631 3816 29m3746F71M GAGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAA
MT MT 3630 3817 28m3746F72M AGGTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAAC
MT MT 3628 3819 26m3746F74M GTGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACAC
MT MT 3627 3820 25m3746F75M TGGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACC
MT MT 3626 3821 24m3746F76M GGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCT
MT MT 3626 3821 24m3746F76M TGCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCT
MT MT 3625 3822 23m3746F77M GCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTC
MT MT 3625 3822 23m3746F77M GCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTC
MT MT 3625 3822 23m3746F77M GCTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCAACATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACTTC
MT MT 3624 3823 22m3746F78M CTAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCT
MT MT 3624 3823 22m3746F78M CAAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCCCT
MT MT 3623 3824 21m3746F79M TAGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTG
MT MT 3622 3825 20m3746F80M AGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGA
MT MT 3622 3825 20m3746F80M AGAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGA
MT MT 3621 3826 19m3746F81M GAATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGAT
MT MT 3620 3827 18m3746F82M AATAAATAGGAGGCCTAG CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATT
MT MT 3736 3836 100M TCACCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCC
MT MT 3739 3839 100M CCCTAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCATC
MT MT 3742 3842 100M TAGCCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCATCATG
MT MT 3745 3845 100M CCATCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCATCATGACC
MT MT 3748 3848 100M TCATTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCATCATGACCCTT
MT MT 3751 3851 100M TTCTACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCATCATGACCCTTGGC
MT MT 3754 3854 100M TACTATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCATCATGACCCTTGGCCAT
MT MT 3757 3857 100M TATCAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCATCATGACCCTTGGCCATAAT
MT MT 3760 3860 100M CAACATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCATCATGACCCTTGGCCATAATATG
MT MT 3763 3863 100M CATTACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCATCATGACCCTTGGCCATAATATGATT
MT MT 3766 3866 100M TACTAATAAGTGGCTCCTTTAACCTCTCCACCCTTATCACAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCATCATGACCCTTGGCCATAATATGATTTAT
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right flanking sequence - CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTG
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MT MT 6096 5996 100m ATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAG
MT MT 6093 5993 100m ACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTG
MT MT 6090 5990 100m AATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGC
MT MT 6087 5987 100m TCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTA
MT MT 6084 5984 100m TGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGA
MT MT 6081 5981 100m GCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTC
MT MT 6078 5978 100m GTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAG
MT MT 6075 5975 100m ACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTC
MT MT 6072 5972 100m ATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATG
MT MT 6069 5969 100m ACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGC
MT MT 6066 5966 100m TTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCGGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCATCTCATGCGCCGA
MT MT 6063 5963 100m TAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATA
MT MT 6060 5960 100m ATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATA
MT MT 6057 5957 100m TGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGT
MT MT 6054 5954 100m TCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATA
MT MT 6051 5951 100m TTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTG
MT MT 6048 5948 100m CCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTC
MT MT 6045 5945 100m AGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCCCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAA
MT MT 6042 5942 100m AGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGT
MT MT 6039 5939 100m TTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTT
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MT MT 6033 5933 100m GGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGT
MT MT 6030 5930 100m TGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTG
MT MT 6027 5927 100m CCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAG
MT MT 6024 5924 100m AGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGA
MT MT 6021 5921 100m TCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATA
MT MT 6018 5918 100m GCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTC
MT MT 6015 5915 100m CTAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAAC
MT MT 6012 5912 100m ATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAATGTTCCAATGTTTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGT
MT MT 6009 5909 100m AGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGG
MT MT 6006 5906 100m AGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGA
MT MT 6003 5903 100m CTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAACA
MT MT 6000 5900 100m AGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAACATCA
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MT MT 5974 6230 69m6200F31M TGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTC
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MT MT 5972 6232 67m6200F33M CGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCT
MT MT 5971 6233 66m6200F34M GCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTA
MT MT 5970 6234 65m6200F35M CCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTAC
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MT MT 5964 6240 59m6200F41M AATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGC
MT MT 5960 6244 55m6200F45M GGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGC
MT MT 5959 6245 54m6200F46M GTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCA
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MT MT 5956 6248 51m6200F49M TAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTTTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCT
MT MT 5954 6250 49m6200F51M GTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGACTAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGAATCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGC
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MT MT 5953 6251 48m6200F52M TGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCT
MT MT 5952 6252 47m6200F53M GTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTA
MT MT 5952 6252 47m6200F53M GTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGGCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTA
MT MT 5952 6252 47m6200F53M GTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTA
MT MT 5952 6252 47m6200F53M GTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTA
MT MT 5951 6253 46m6200F54M TTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTAT
MT MT 5948 6256 43m6200F57M CAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGT
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MT MT 5947 6257 42m6200F58M AATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTG
MT MT 5946 6258 41m6200F59M ATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGG
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MT MT 5944 6260 39m6200F61M GTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAG
MT MT 5943 6261 38m6200F62M TCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGG
MT MT 5943 6261 38m6200F62M TCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGG
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MT MT 5942 6262 37m6200F63M CTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGC
MT MT 5942 6262 37m6200F63M CTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGC
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MT MT 5941 6263 36m6200F64M TTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTACCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCC
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MT MT 5940 6264 35m6200F65M TTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCG
MT MT 5940 6264 35m6200F65M TTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCG
MT MT 5939 6265 34m6200F66M TGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCGGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGG
MT MT 5939 6265 34m6200F66M TGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGG
MT MT 5938 6266 33m6200F67M GTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGG
MT MT 5937 6267 32m6200F68M TGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAG
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MT MT 5936 6268 31m6200F69M GGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGGGC
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MT MT 5935 6269 30m6200F70M GTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCA
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MT MT 5934 6270 29m6200F71M TTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCGG
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MT MT 5933 6271 28m6200F72M TTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCTGAGCAGG
MT MT 5933 6271 28m6200F72M TTGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGG
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MT MT 5932 6272 27m6200F73M TGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGA
MT MT 5932 6272 27m6200F73M TGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCGTCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGA
MT MT 5932 6272 27m6200F73M TGTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGA
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MT MT 5931 6273 26m6200F74M GTAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTACTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAAGAA
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MT MT 5930 6274 25m6200F75M TAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGCAC
MT MT 5930 6274 25m6200F75M TAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAAG
MT MT 5930 6274 25m6200F75M TAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAAC
MT MT 5930 6274 25m6200F75M TAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGGGCAGGAAA
MT MT 5930 6274 25m6200F75M TAGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAAC
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MT MT 5929 6275 24m6200F76M AGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACA
MT MT 5929 6275 24m6200F76M AGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCCGGAAAA
MT MT 5929 6275 24m6200F76M AGAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGGACA
MT MT 5928 6276 23m6200F77M GAGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAG
MT MT 5927 6277 22m6200F78M AGAATAGTCAACGGTCGGCGAA CACAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAAGAGG
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MT MT 5926 6278 21m6200F79M GAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGT
MT MT 5926 6278 21m6200F79M GAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGT
MT MT 5926 6278 21m6200F79M GAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGT
MT MT 5926 6278 21m6200F79M GAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGT
MT MT 5926 6278 21m6200F79M GAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGG
MT MT 5926 6278 21m6200F79M GAATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGG
MT MT 5924 6280 19m6200F81M ATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGTTG
MT MT 5924 6280 19m6200F81M ATAGTCAACGGTCGGCGAA CATCAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTCCTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGTTG
MT MT 5924 6280 19m6200F81M ATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGTTG
MT MT 5924 6280 19m6200F81M ATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGTTG
MT MT 5924 6280 19m6200F81M ATAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGTTG
MT MT 5923 6281 18m6200F82M TAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGGAAAGGTTGA
MT MT 5923 6281 18m6200F82M TAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGGTGA
MT MT 5923 6281 18m6200F82M TAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGTTGA
MT MT 5923 6281 18m6200F82M TAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGTTGA
MT MT 5923 6281 18m6200F82M TAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGTTGA
MT MT 5923 6281 18m6200F82M TAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGGGCAGGAACAGGTTGA
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MT MT 5923 6281 18m6200F82M TAGTCAACGGTCGGCGAA CATAAGCTTCTGACTCTTACCTCCCTCTCTCCTACTCCTGCTCGCATCTGCTATAGTGGAGGCCGGAGCAGGAACAGGTTGA
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Lambda K H
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MT MT 6034 5934 100m TGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGG
MT MT 6031 5931 100m CTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTT
MT MT 6028 5927 48m1d52m GCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCDAGCTATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAG
MT MT 6025 5925 100m CAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAG
MT MT 6022 5922 100m CTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAAT
MT MT 6019 5919 100m GGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGT
MT MT 6016 5916 100m TCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAA
MT MT 6013 5913 100m AATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCGTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGG
MT MT 6010 5910 100m AAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACGGTCG
MT MT 6007 5907 100m GAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAAAAGTCAACGGTCGGCG
MT MT 6005 6455 91m6447F9M GGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTAAACG CCCCTCTTC
MT MT 6004 6456 90m6447F10M GCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCG
MT MT 6003 6457 89m6447F11M CTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGT
MT MT 6003 6457 89m6447F11M CTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGT
MT MT 5999 6461 85m6447F15M GAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTGAACG CCCCTCTTCGTCTTA
MT MT 5999 6461 85m6447F15M GAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGA
MT MT 5999 6461 85m6447F15M GAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAAGA CCCCTCTTCGTCTGA
MT MT 5996 6464 82m6447F18M CTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCC
MT MT 5996 6464 82m6447F18M CTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCC
MT MT 5993 6467 79m6447F21M TGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTC
MT MT 5991 6469 77m6447F23M CCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCT
MT MT 5991 6469 77m6447F23M CCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCT
MT MT 5989 6471 75m6447F25M TAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAA
MT MT 5989 6471 75m6447F25M TAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATACGTCCTAA
MT MT 5989 6471 75m6447F25M TAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGCTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAA
MT MT 5988 6472 74m6447F26M AGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAAT
MT MT 5988 6472 74m6447F26M AGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCTTCCTAAT
MT MT 5986 6474 72m6447F28M GACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCA
MT MT 5985 6475 71m6447F29M ACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCAC
MT MT 5985 6475 71m6447F29M ACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCAC
MT MT 5985 6475 71m6447F29M ACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCAC
MT MT 5983 6477 69m6447F31M TCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAG
MT MT 5983 6477 69m6447F31M TCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAG
MT MT 5981 6479 67m6447F33M CAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCA
MT MT 5981 6479 67m6447F33M CAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCC
MT MT 5980 6480 66m6447F34M AGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAG
MT MT 5980 6480 66m6447F34M AGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAG
MT MT 5980 6480 66m6447F34M AGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAG
MT MT 5979 6481 65m6447F35M GCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGT
MT MT 5979 6481 65m6447F35M GCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGT
MT MT 5979 6481 65m6447F35M GCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGT
MT MT 5978 6482 64m6447F36M CTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTC
MT MT 5976 6484 62m6447F38M CATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCT
MT MT 5975 6485 61m6447F39M ATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTA
MT MT 5975 6485 61m6447F39M ATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTA
MT MT 5975 6485 61m6447F39M ATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTA
MT MT 5973 6487 59m6447F41M GCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACT
MT MT 5973 6487 59m6447F41M GCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACT
MT MT 5972 6488 58m6447F42M CGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTT
MT MT 5971 6489 57m6447F43M GCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGCAGAGAATAGTCCACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTC
MT MT 5971 6489 57m6447F43M GCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTC
MT MT 5969 6491 55m6447F45M CGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGGCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTC
MT MT 5968 6492 54m6447F46M GAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCC
MT MT 5968 6492 54m6447F46M GAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCC
MT MT 5968 6492 54m6447F46M GAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCC
MT MT 5967 6493 53m6447F47M AATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCT
MT MT 5966 6494 52m6447F48M ATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTA
MT MT 5964 6496 50m6447F50M AATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATC
MT MT 5964 6496 50m6447F50M AATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATC
MT MT 5964 6496 50m6447F50M AATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATC
MT MT 5963 6497 49m6447F51M ATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCT
MT MT 5962 6498 48m6447F52M TAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTC
MT MT 5962 6498 48m6447F52M TAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTC
MT MT 5961 6499 47m6447F53M AGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCGCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCT
MT MT 5961 6499 47m6447F53M AGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCT
MT MT 5960 6500 46m6447F54M GGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTC
MT MT 5960 6500 46m6447F54M GGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCATAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTC
MT MT 5959 6501 45m6447F55M GTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCC
MT MT 5959 6501 45m6447F55M GTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCC
MT MT 5959 6501 45m6447F55M GTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCC
MT MT 5957 6503 43m6447F57M ATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCA
MT MT 5957 6503 43m6447F57M ATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCA
MT MT 5957 6503 43m6447F57M ATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCA
MT MT 5956 6504 42m6447F58M TAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAG
MT MT 5956 6504 42m6447F58M TAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAG
MT MT 5956 6504 42m6447F58M TAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAG
MT MT 5955 6505 41m6447F59M AGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGT
MT MT 5954 6506 40m6447F60M GTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTC
MT MT 5953 6507 39m6447F61M TGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCC
MT MT 5952 6508 38m6447F62M GTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCT
MT MT 5950 6510 36m6447F64M TCCAATGTCTTTGTGGCTTGTAGAGAAAAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAG
MT MT 5950 6510 36m6447F64M TCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCGCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAG
MT MT 5949 6511 35m6447F65M CCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGC
MT MT 5948 6512 34m6447F66M CAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCT
MT MT 5948 6512 34m6447F66M CAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCT
MT MT 5948 6512 34m6447F66M CAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCT
MT MT 5945 6515 31m6447F69M TGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCT
MT MT 5942 6518 28m6447F72M CTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGC
MT MT 5941 6519 27m6447F73M TTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCA
MT MT 5940 6520 26m6447F74M TTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCAT
MT MT 5939 6521 25m6447F75M TGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATC
MT MT 5938 6522 24m6447F76M GTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCA
MT MT 5938 6522 24m6447F76M GTGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCCCAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCA
MT MT 5937 6523 23m6447F77M TGGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCAC
MT MT 5936 6524 22m6447F78M GGTTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACT
MT MT 5934 6526 20m6447F80M TTTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTAT
MT MT 5933 6527 19m6447F81M TTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATA
MT MT 5933 6527 19m6447F81M TTGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATA
MT MT 5932 6528 18m6447F82M TGTAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATAC
MT MT 5930 6530 16m6447F84M TAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTA
MT MT 5930 6530 16m6447F84M TAGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTA
MT MT 5929 6531 15m6447F85M AGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTAC
MT MT 5929 6531 15m6447F85M AGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTAC
MT MT 5929 6531 15m6447F85M AGAGAATAGTCAACG CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTAC
MT MT 6437 6537 100M TACCAAACGCCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAG
MT MT 6440 6540 100M CAAACGCCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACC
MT MT 6443 6543 100M ACGCCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCA
MT MT 6446 6546 100M CCCCTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCAACC
MT MT 6449 6549 100M CTCTTCGTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCAACCTCA
MT MT 6452 6552 100M TTCGTCTGATCCGACCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCAACCTCAACA
MT MT 6455 6555 100M GTCTGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCAACCTCAACACCA
MT MT 6458 6558 100M TGATCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCAACCTCAACACCACCT
MT MT 6461 6561 100M TCCGTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCAACCTCAACACCACCTTCT
MT MT 6464 6564 100M GTCCTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCAACCTCAACACCACCTTCTTCG
MT MT 6467 6567 100M CTAATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCAACCTCAACACCACCTTCTTCGACC
MT MT 6470 6570 100M ATCACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCAACCTCAACACCACCTTCTTCGACCCCG
MT MT 6473 6573 100M ACAGCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCTAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCAACCTCAACACCACCTTCTTCGACCCCGCCG
MT MT 6476 6576 100M GCAGTCCTACTTCTCCTATCTCTCCCAGTCCGAGCTGCTGGCATCACTATACTACTAACAGACCGCAACCTCAACACCACCTTCTTCGACCCCGCCGGCG
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genome shotgun sequence
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 7704325 AATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACTCAATACCAAACACCCCT 7704278
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Sbjct 94577723 AATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACTCAATACCAAACACCCCT 94577676
>gb|DS990658.1| Homo sapiens SCAF_1112675837357 genomic scaffold, whole genome
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shotgun sequence
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Query 1 AATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAACGCCCCT 48
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Sbjct 39399235 AATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACTCAATACCAAACACCCCT 39399282
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shotgun sequence
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Query 1 AATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAACGCCCCT 48
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Sbjct 94577473 AATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACTCAATACCAAACACCCCT 94577426
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Query 1 AATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAACGCCCCT 48
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Sbjct 32484300 AATCATTAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAACACCCCT 32484253
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assembly
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Query 1 AATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAACGCCCCT 48
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Sbjct 14260777 AATCATTAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAACACCCCT 14260730
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shotgun sequence
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Query 1 AATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAACGCCCCT 48
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Sbjct 2056352 AATCATTAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAACACCCCT 2056399
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Query 1 AATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAACGCCCCT 48
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Sbjct 12873545 AATCATTAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAACACCCCT 12873498
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Lambda K H
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reads
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MT MT 5994 6424 79m6404F21M GTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAAC AATTATCAATATAAAACCCCC
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MT MT 5978 6440 63m6404F37M CTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAAC AATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATAC
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MT MT 5973 6445 58m6404F42M GCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTCTTTGTGGTTTGTAGAGAATAGTCAAC AATTAGCAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAAC
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MT MT 6148 6048 100m TAGTCAGTTGCCAAAGCCTCCGATTATGATGGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTA
MT MT 6145 6045 100m TCAGTTGCCAAAGCCTCCGATTATGATGGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCT
MT MT 6142 6042 100m GTTGCCAAAGCCTCCGATTATGATGGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGA
MT MT 6139 6039 100m GCCAAAGCCTCCGATTATGATGGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGG
MT MT 6136 6036 100m AAAGCCGCCGATTATGATGGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTG
MT MT 6133 6033 100m GCCTCCGATTATGATGGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCT
MT MT 6130 6030 100m TCCGATTATGATGGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGC
MT MT 6127 6027 100m GATTATGATGGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGG
MT MT 6124 6024 100m TATGATGGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCC
MT MT 6121 6021 100m GATGGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGC
MT MT 6118 6018 100m GGGTATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCG
MT MT 6115 6015 100m TATTACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCT
MT MT 6112 6012 100m TACTATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTAGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGA
MT MT 6109 6009 100m TATGAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATA
MT MT 6106 6006 100m GAAGAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGG
MT MT 6103 6003 100m GAAGATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGG
MT MT 6100 6000 100m GATTATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTT
MT MT 6097 5997 100m TATTACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGA
MT MT 6094 5994 100m TACAAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCT
MT MT 6091 5991 100m AAATGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTG
MT MT 6088 5988 100m TGCATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCT
MT MT 6085 5985 100m ATGGGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGG
MT MT 6082 5982 100m GGCTGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACT
MT MT 6079 5979 100m TGTGACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCA
MT MT 6076 5976 100m GACGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCT
MT MT 6073 5973 100m GATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCAT
MT MT 6070 5970 100m AACGTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCG
MT MT 6067 5967 100m GTTGTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCG
MT MT 6064 5964 100m GTAGATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAAT
MT MT 6061 5961 100m GATGTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAAT
MT MT 6058 5958 100m GTGGTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGG
MT MT 6055 5955 100m GTCGTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTAT
MT MT 6052 5952 100m GTTACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGT
MT MT 6049 5949 100m ACCTAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTAGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTT
MT MT 6046 5946 100m TAGAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCA
MT MT 6044 6373 94m6368F6M GAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTC
MT MT 6044 6373 94m6368F6M GAAGGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTT
MT MT 6041 5941 100m GGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTACAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGTTCCAATGTC
MT MT 6041 6376 91m6368F9M GGTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTAT
MT MT 6040 6377 90m6368F10M GTTGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTAAAGTGT CTCCTCTATC
MT MT 6038 6379 88m6368F12M TGCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTT
MT MT 6037 6380 87m6368F13M GCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTA
MT MT 6037 6380 87m6368F13M GCCTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGGCTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTA
MT MT 6035 6382 85m6368F15M CTGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGG
MT MT 6034 6383 84m6368F16M TGGCTGGCCCAGCTCGGCTCGGATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGGATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGG
MT MT 6033 6384 83m6368F17M GGCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCCAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAAGGG
MT MT 6032 6385 82m6368F18M GCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTACGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCCTAGGGGC
MT MT 6032 6385 82m6368F18M GCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGC
MT MT 6032 6385 82m6368F18M GCTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGC
MT MT 6031 6386 81m6368F19M CTGGCCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCC
MT MT 6027 6390 77m6368F23M CCCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCA
MT MT 6026 6391 76m6368F24M CCAGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAA
MT MT 6024 6393 74m6368F26M AGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGTGGCCATCACTT
MT MT 6024 6393 74m6368F26M AGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATT
MT MT 6024 6393 74m6368F26M AGCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGGATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATT
MT MT 6023 6394 73m6368F27M GCTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTT
MT MT 6022 6395 72m6368F28M CTCGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTC
MT MT 6020 6397 70m6368F30M CGGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCAT
MT MT 6019 6398 69m6368F31M GGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATC
MT MT 6019 6398 69m6368F31M GGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGGGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATC
MT MT 6019 6398 69m6368F31M GGCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATC
MT MT 6018 6399 68m6368F32M GCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCA
MT MT 6018 6399 68m6368F32M GCTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCA
MT MT 6017 6400 67m6368F33M CTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCAC
MT MT 6017 6400 67m6368F33M CTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCAC
MT MT 6017 6400 67m6368F33M CTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCTAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCAC
MT MT 6017 6400 67m6368F33M CTCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCAC
MT MT 6016 6401 66m6368F34M TCGAATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACA
MT MT 6013 6404 63m6368F37M AATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACA
MT MT 6012 6405 62m6368F38M ATAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAA
MT MT 6011 6406 61m6368F39M TAAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAAT
MT MT 6010 6407 60m6368F40M AAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATT
MT MT 6010 6407 60m6368F40M AAGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATT
MT MT 6009 6408 59m6368F41M AGGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTA
MT MT 6008 6409 58m6368F42M GGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTAT
MT MT 6008 6409 58m6368F42M GGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTAT
MT MT 6008 6409 58m6368F42M GGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTAT
MT MT 6008 6409 58m6368F42M GGAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTAT
MT MT 6007 6410 57m6368F43M GAGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATC
MT MT 6006 6411 56m6368F44M AGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCA
MT MT 6006 6411 56m6368F44M AGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCA
MT MT 6006 6411 56m6368F44M AGGCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCA
MT MT 6004 6413 54m6368F46M GCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAAT
MT MT 6004 6413 54m6368F46M GCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAAT
MT MT 6004 6413 54m6368F46M GCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAAT
MT MT 6004 6413 54m6368F46M GCTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAAT
MT MT 6003 6414 53m6368F47M CTTAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATA
MT MT 6001 6416 51m6368F49M TAGAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGCATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATA
MT MT 5999 6418 49m6368F51M GAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAA
MT MT 5999 6418 49m6368F51M GAGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGAATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAA
MT MT 5998 6419 48m6368F52M AGCTGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAA
MT MT 5995 6422 45m6368F55M TGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAGTAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCC
MT MT 5995 6422 45m6368F55M TGTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCC
MT MT 5994 6423 44m6368F56M GTGCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCC
MT MT 5992 6425 42m6368F58M GCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCT
MT MT 5992 6425 42m6368F58M GCCTTGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCT
MT MT 5992 6425 42m6368F58M GCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCT
MT MT 5992 6425 42m6368F58M GCCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCT
MT MT 5991 6426 41m6368F59M CCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTG
MT MT 5991 6426 41m6368F59M CCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTG
MT MT 5991 6426 41m6368F59M CCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTG
MT MT 5991 6426 41m6368F59M CCTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTG
MT MT 5990 6427 40m6368F60M CTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGC
MT MT 5990 6427 40m6368F60M CTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGC
MT MT 5990 6427 40m6368F60M CTAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGC
MT MT 5989 6428 39m6368F61M TAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCC
MT MT 5989 6428 39m6368F61M TAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCC
MT MT 5989 6428 39m6368F61M TAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCC
MT MT 5989 6428 39m6368F61M TAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCC
MT MT 5989 6428 39m6368F61M TAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCC
MT MT 5989 6428 39m6368F61M TAGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCC
MT MT 5988 6429 38m6368F62M AGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCA
MT MT 5988 6429 38m6368F62M AGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCA
MT MT 5988 6429 38m6368F62M AGGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCT
MT MT 5987 6430 37m6368F63M GGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCAT
MT MT 5987 6430 37m6368F63M GGACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCAT
MT MT 5986 6431 36m6368F64M GACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATA
MT MT 5986 6431 36m6368F64M GACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATA
MT MT 5986 6431 36m6368F64M GACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATA
MT MT 5986 6431 36m6368F64M GACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATGTAAAACCCCCTGCCATA
MT MT 5985 6432 35m6368F65M ACTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCAGAA
MT MT 5984 6433 34m6368F66M CTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATACAACCCCCTGCCATAAC
MT MT 5984 6433 34m6368F66M CTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAAC
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MT MT 5984 6433 34m6368F66M CTCCAGCTCATGCGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAAC
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MT MT 5972 6445 22m6368F78M CGCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAAC
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MT MT 5971 6446 21m6368F79M GCCGAATAATAGGTATAGTGT CTCCTCTATCTTAGGGGCCATCAATTTCATCACAACAATTATCAATATAAAACCCCCTGCCATAACCCAATACCAAACG
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-39:-118
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22:-138
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49:121
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-20:-162
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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MT MT 7678 7881 94m7876F6M AAATGATTATGAGGGCGTGATCATGAAAGGTGATAAGCTCTTCTATGATAGGGGAAGTAGCGTCTTGTAGACCTACTTGCGCTGCATGTGCCAT CAAATC
MT MT 7678 7881 94m7876F6M AAATGATTATGAGGGCGTGATCATGAAAGGTGATAAGCTCTTCTATGATAGGGGAAGTAGCGTCTTGTAGACCTACTTGCGCTGCATGTGCCAT CAAATC
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MT MT 7674 7885 90m7876F10M GATTATGAGGGCGTGATCATGAAAGGTGATAAGCTCTTCTATGATAGGGGAAGTAGCGTCTTGTAGACCTACTTGCGCTGCATGTGCCAT CAAATCAATT
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MT MT 7673 7886 89m7876F11M ATTATGAGGGCGTGATCATGAAAGGTGATAAGCTCTTCTATGATAGGGGAAGTAGCGTCTTGTAGACCTACTTGCGCTGCATGTGCCAT CAAATCAATTG
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MT MT 7672 7887 88m7876F12M TTATGAGGGCGTGATCATGAAAGGTGATAAGCTCTTCTATGATAGGGGAAGTAGCGTCTTGTAGACCTACTTGCGCTGCATGTGCCAT GAAATCAATTGG
MT MT 7672 7887 88m7876F12M TTATGAGGGCGTGATCATGAAAGGTGATAAGCTCTTCTATGATAGGGGAAGTAGCGTCTTGTAGACCTACTTGCGCTGCATGTGCCAT CAAATCAATTGG
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MT MT 7668 7891 84m7876F16M GAGGGCGTGATCATGAAAGGTGATAAGCTCTTCTATGATAGGGGAAGTAGCGTCTTGTAGACCTACTTGCGCTGCATGTGCCAT CAAATCAATTGGCCAC
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MT MT 7662 7897 78m7876F22M GTGATCATGAAAGGTGATAAGCTCTTCTATGATAGGGGAAGTAGCGTCTTGTAGACCTACTTGCGCTGCATGTACCAT CAAATCAATTGGCCACCAATGG
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MT MT 7652 7907 68m7876F32M AAGGTGATAAGCTCTTCTATGATAGGGGAAGTAGCGTCTTGTAGACCTACTTGCGCTGCATGTGCCAT CAAATCAATTGGCCACCAATGGTACTGAACCT
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Sbjct 5257 TTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT 5208
Lambda K H
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Lambda K H
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right flanking sequence - AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAA
blast search - nt
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MT MT 8487 8667 84m8652F16M GGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAA
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MT MT 8485 8669 82m8652F18M GCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATG
MT MT 8485 8669 82m8652F18M GCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATG
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MT MT 8482 8672 79m8652F21M TTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCAAACAATGACT
MT MT 8473 8681 70m8652F30M GAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACG
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MT MT 8471 8683 68m8652F32M GGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAA
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MT MT 8469 8685 66m8652F34M TAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACC
MT MT 8467 8687 64m8652F36M GGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTC
MT MT 8467 8687 64m8652F36M GGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTC
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MT MT 8460 8694 57m8652F43M GTTTGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTAGGGGGGT AAGCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAA
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MT MT 8459 8695 56m8652F44M TTTGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACATCAAAACAAA
MT MT 8457 8697 54m8652F46M TGTGTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGC AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATG
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MT MT 8454 8700 51m8652F49M GTTTAATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATA
MT MT 8450 8704 47m8652F53M AATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAACCA
MT MT 8450 8704 47m8652F53M AATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCA
MT MT 8450 8704 47m8652F53M AATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAACCA
MT MT 8449 8705 46m8652F54M ATATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCAT
MT MT 8448 8706 45m8652F55M TATTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATA
MT MT 8446 8708 43m8652F57M TTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACA
MT MT 8446 8708 43m8652F57M TTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAACCATACA
MT MT 8446 8708 43m8652F57M TTTTTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAACCATACA
MT MT 8443 8711 40m8652F60M TTAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAA
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MT MT 8442 8712 39m8652F61M TAGTTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAAC
MT MT 8442 8712 39m8652F61M TAGTTGGGTTATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATTACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAACCATACACAAC
MT MT 8439 8715 36m8652F64M TTGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGG AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACT
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MT MT 8438 8716 35m8652F65M TGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTA
MT MT 8438 8716 35m8652F65M TGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTA
MT MT 8438 8716 35m8652F65M TGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTA
MT MT 8438 8716 35m8652F65M TGGGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTA
MT MT 8436 8718 33m8652F67M GGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAA
MT MT 8436 8718 33m8652F67M GGTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAA
MT MT 8435 8719 32m8652F68M GTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAG
MT MT 8435 8719 32m8652F68M GTGATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAG
MT MT 8432 8722 29m8652F71M ATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGAC
MT MT 8432 8722 29m8652F71M ATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGAC
MT MT 8432 8722 29m8652F71M ATGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGAC
MT MT 8431 8723 28m8652F72M TGAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACG
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MT MT 8430 8724 27m8652F73M GAGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGA
MT MT 8429 8725 26m8652F74M AGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAA
MT MT 8429 8725 26m8652F74M AGGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAATGACGAA
MT MT 8428 8726 25m8652F75M GGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAAC
MT MT 8428 8726 25m8652F75M GGAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATTACCACCCGACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAACCATACACAACACTAAAGGACGAAC
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MT MT 8427 8727 24m8652F76M GAATAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACC
MT MT 8424 8730 21m8652F79M TAGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGA
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MT MT 8423 8731 20m8652F80M AGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAAGGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGAT
MT MT 8423 8731 20m8652F80M AGTGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGAT
MT MT 8421 8733 18m8652F82M TGTAAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCT
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MT MT 8418 8736 15m8652F85M AAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGACATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTT
MT MT 8418 8736 15m8652F85M AAGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTT
MT MT 8417 8737 14m8652F86M AGGAGAATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTA
MT MT 8417 8737 14m8652F86M AGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTA
MT MT 8417 8737 14m8652F86M AGGAGTATGGGGGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTA
MT MT 8406 8748 3m8652F97M GGT AATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTATACTAGTATCC
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MT MT 8648 8748 100M ACTAATCACCACCCAACAATGACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTATACTAGTATCC
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MT MT 8669 8769 100M ACTAATCAAACTAACCTCAAAACAAATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACA
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MT MT 8681 8781 100M AACCTCAAAACAAATGATAACCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTC
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MT MT 8693 8793 100M AATGATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCT
MT MT 8696 8796 100M GATAGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCAC
MT MT 8699 8799 100M AGCCATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCA
MT MT 8702 8802 100M CATACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTT
MT MT 8705 8805 100M ACACAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACA
MT MT 8708 8808 100M CAACACTAAAGGACGAACCTGATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCA
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MT MT 8717 8817 100M AGGACGAACCTGATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAA
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MT MT 8723 8823 100M AACCTGATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCT
MT MT 8726 8826 100M CTGATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATA
MT MT 8729 8829 100M ATCTCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAAC
MT MT 8732 8832 100M TCTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTA
MT MT 8735 8835 100M TATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCTACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCC
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MT MT 8750 8850 100M AATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTA
MT MT 8753 8853 100M CATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGA
MT MT 8756 8856 100M TTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCG
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MT MT 8762 8862 100M TGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCA
MT MT 8765 8865 100M CACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTG
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MT MT 8771 8871 100M TAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATA
MT MT 8774 8874 100M CCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGC
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MT MT 8780 8880 100M CGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGCTTTCGC
MT MT 8783 8883 100M ACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGCTTTCGCTCT
MT MT 8787 8887 100M CTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCACAGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGA
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HSCHR1_CTG3
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Sbjct 46924 TTGCCACAACTAACCTCCTTGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACC 46973
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MT MT 8507 8794 67m8762F33M TTATAATTTTTTATTTTTATGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTC
MT MT 8493 8808 53m8762F47M TNTTATGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCA
MT MT 8490 8811 50m8762F50M TATGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACC
MT MT 8490 8811 50m8762F50M TATGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACC
MT MT 8490 8811 50m8762F50M TATGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACC
MT MT 8490 8811 50m8762F50M TATGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGATTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACC
MT MT 8490 8811 50m8762F50M TATGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACC
MT MT 8489 8812 49m8762F51M ATGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCA
MT MT 8488 8813 48m8762F52M TGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCAC
MT MT 8488 8813 48m8762F52M TGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCAC
MT MT 8488 8813 48m8762F52M TGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCAC
MT MT 8488 8813 48m8762F52M TGGGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCAC
MT MT 8486 8815 46m8762F54M GGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCC
MT MT 8486 8815 46m8762F54M GGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCC
MT MT 8486 8815 46m8762F54M GGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCC
MT MT 8486 8815 46m8762F54M GGCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCC
MT MT 8485 8816 45m8762F55M GCTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCG
MT MT 8484 8817 44m8762F56M CTTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAA
MT MT 8483 8818 43m8762F57M TTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAAC
MT MT 8483 8818 43m8762F57M TTTGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAACATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAAC
MT MT 8481 8820 41m8762F59M TGGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTA
MT MT 8480 8821 40m8762F60M GGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTAT
MT MT 8480 8821 40m8762F60M GGTGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTAT
MT MT 8478 8823 38m8762F62M TGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCT
MT MT 8478 8823 38m8762F62M TGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCT
MT MT 8478 8823 38m8762F62M TGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCT
MT MT 8478 8823 38m8762F62M TGAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCT
MT MT 8477 8824 37m8762F63M GAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTA
MT MT 8477 8824 37m8762F63M GAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTA
MT MT 8477 8824 37m8762F63M GAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTA
MT MT 8477 8824 37m8762F63M GAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTA
MT MT 8477 8824 37m8762F63M GAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTA
MT MT 8477 8824 37m8762F63M GAGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTA
MT MT 8476 8825 36m8762F64M AGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTAT
MT MT 8476 8825 36m8762F64M AGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTAT
MT MT 8476 8825 36m8762F64M AGGGAGGTAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTAT
MT MT 8469 8832 29m8762F71M TAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTA
MT MT 8469 8832 29m8762F71M TAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTA
MT MT 8469 8832 29m8762F71M TAGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTA
MT MT 8468 8833 28m8762F72M AGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAG
MT MT 8468 8833 28m8762F72M AGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAG
MT MT 8468 8833 28m8762F72M AGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAG
MT MT 8468 8833 28m8762F72M AGGTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAG
MT MT 8467 8834 27m8762F73M GGTGGTAGTTAGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGC
MT MT 8466 8835 26m8762F74M GTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCC
MT MT 8466 8835 26m8762F74M GTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCC
MT MT 8466 8835 26m8762F74M GTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCC
MT MT 8466 8835 26m8762F74M GTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCC
MT MT 8466 8835 26m8762F74M GTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCC
MT MT 8466 8835 26m8762F74M GTGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCC
MT MT 8465 8836 25m8762F75M TGGCAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCA
MT MT 8465 8836 25m8762F75M TGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCA
MT MT 8465 8836 25m8762F75M TGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCA
MT MT 8465 8836 25m8762F75M TGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCA
MT MT 8465 8836 25m8762F75M TGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCA
MT MT 8465 8836 25m8762F75M TGGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAGCTATCTATAAACCTAGCCA
MT MT 8464 8837 24m8762F76M GGTAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCAT
MT MT 8462 8839 22m8762F78M TAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGG
MT MT 8462 8839 22m8762F78M TAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGG
MT MT 8462 8839 22m8762F78M TAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGG
MT MT 8462 8839 22m8762F78M TAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGG
MT MT 8462 8839 22m8762F78M TAGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGG
MT MT 8461 8839 20m1i1m8762F78M AGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGG
MT MT 8461 8840 21m8762F79M AGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGC
MT MT 8461 8840 21m8762F79M AGTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGC
MT MT 8460 8841 20m8762F80M GTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCC
MT MT 8460 8841 20m8762F80M GTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCC
MT MT 8460 8841 20m8762F80M GTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCC
MT MT 8460 8841 20m8762F80M GTTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTGACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCC
MT MT 8459 8842 19m8762F81M TTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCA
MT MT 8459 8842 19m8762F81M TTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCA
MT MT 8459 8842 19m8762F81M TTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCA
MT MT 8459 8842 19m8762F81M TTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCA
MT MT 8459 8842 19m8762F81M TTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCA
MT MT 8459 8842 19m8762F81M TTTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCA
MT MT 8458 8843 18m8762F82M TTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCAT
MT MT 8458 8843 18m8762F82M TTGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCAT
MT MT 8457 8844 17m8762F83M TGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATC
MT MT 8457 8844 17m8762F83M TGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATC
MT MT 8457 8844 17m8762F83M TGTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATC
MT MT 8456 8845 16m8762F84M GTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTAACTATAAACCTAGCCATGGCCATCC
MT MT 8456 8845 16m8762F84M GTGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCC
MT MT 8455 8846 15m8762F85M TGTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCC
MT MT 8454 8847 14m8762F86M GTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCC
MT MT 8454 8847 14m8762F86M GTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCC
MT MT 8454 8847 14m8762F86M GTTTAATATTTTTA TTCCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCC
MT MT 8454 8847 14m8762F86M GTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCC
MT MT 8454 8847 14m8762F86M GTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCC
MT MT 8454 8847 14m8762F86M GTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCC
MT MT 8454 8847 14m8762F86M GTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCC
MT MT 8454 8847 14m8762F86M GTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCC
MT MT 8454 8847 14m8762F86M GTTTAATATTTTTA TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCC
MT MT 8454 8847 14m8762F86M GTTTAATATTTTTA TTGCCACAACAAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAAGCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCC
MT MT 8752 8852 100M TCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATG
MT MT 8755 8855 100M TTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGC
MT MT 8758 8858 100M TTATTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGG
MT MT 8761 8861 100M TTGCCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGC
MT MT 8764 8864 100M CCACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGT
MT MT 8767 8867 100M CAACTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGAT
MT MT 8770 8870 100M CTAACCTCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTAT
MT MT 8773 8873 100M ACCTCCTCGGACTCCTGGCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGG
MT MT 8776 8876 100M TCCTCGGACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGCTT
MT MT 8779 8879 100M TCGGACTCCCGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCACAGTGATTATAGGCTTTCG
MT MT 8783 8883 100M ACTCCTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGCTTTCGCTCT
MT MT 8787 8887 100M CTGCCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCACAGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGA
MT MT 8790 8890 100M CCTCACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCACAGAGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTA
MT MT 8793 8893 100M CACTCATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTACAA
MT MT 8800 8900 100M TTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCCCAGTGATTATAGGCTTTCGCTATAAGATTAAAAATGCCCT
MT MT 8805 8905 100M CCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCACAGTGATTATAGGCATTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCC
MT MT 8811 8911 100M ACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCAGGCACAGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCT
MT MT 8814 8914 100M CAACTATCTATAATCCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCTCAGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCTTAC
MT MT 8817 8917 100M CTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCTTACCAC
MT MT 8820 8920 100M TCTAAAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCTTACCACAAG
MT MT 8823 8923 100M ATAAACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCACAGAGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCTTACCACAAGGCC
MT MT 8826 8926 100M ACCCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCTTACCACAAGGCACAC
MT MT 8829 8929 100M CTAGTCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCTCAGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCTTACCACAAGGCACACCTA
MT MT 8832 8932 100M GCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCTTACCACAAGGCCCACCTACAC
MT MT 8835 8935 100M ATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCTTACCACAAGGCACACCTACACCCC
MT MT 8838 8938 100M GCCATCCCCTTATGAGCGGGCACGGTGATTATAGGCTTTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCTTACCACAAGGCACACCTACACCCCTTA
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MT MT 9297 9727 84m9712F16M AGGCCGGAGGTCATTAGGAGGGCTGAGAGGGCCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTAC
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MT MT 9282 9742 69m9712F31M AGGAGGGCTGAGAGGGCCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGGTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTC
MT MT 9282 9742 69m9712F31M AGGAGGGCTGAGAGGGCCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTC
MT MT 9281 9743 68m9712F32M GGAGGGCTGAGAGGGCCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGCTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCA
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MT MT 9280 9744 67m9712F33M GAGGGCTGAGAGGGCCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAG
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MT MT 9279 9745 66m9712F34M AGGGCTGAGAGGGCCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGA
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MT MT 9277 9747 64m9712F36M GGCTGAGAGGGCCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGT
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MT MT 9276 9748 63m9712F37M GCTGAGAGGGCCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTA
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MT MT 9274 9750 61m9712F39M TGAGAGGGCCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGGCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGAACT
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MT MT 9268 9756 55m9712F45M GGCCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGT
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MT MT 9267 9757 54m9712F46M GCCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTC
MT MT 9266 9758 53m9712F47M CCCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCT
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MT MT 9265 9759 52m9712F48M CCCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTC
MT MT 9264 9760 51m9712F49M CCTGTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGGCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCC
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MT MT 9261 9763 48m9712F52M GTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTT
MT MT 9261 9763 48m9712F52M GTTAGGGGTCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTT
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MT MT 9253 9771 40m9712F60M TCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTT
MT MT 9253 9771 40m9712F60M TCATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTT
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MT MT 9252 9772 39m9712F61M CATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTTC
MT MT 9252 9772 39m9712F61M CATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTTC
MT MT 9252 9772 39m9712F61M CATGGGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTTA
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MT MT 9248 9776 35m9712F65M GGCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTTCCGAC
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MT MT 9247 9777 34m9712F66M GCTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGGCTCCCTTCACCATTTCCGACG
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MT MT 9246 9778 33m9712F67M CTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTTCCGACGG
MT MT 9246 9778 33m9712F67M CTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTTCCGACGG
MT MT 9246 9778 33m9712F67M CTGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTTCCGACGG
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MT MT 9245 9779 32m9712F68M TGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTTCCGACGGC
MT MT 9245 9779 32m9712F68M TGGGTTTTACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTTCCGACGGC
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MT MT 9238 9786 25m9712F75M TACTATATGATAGGCATGTGATTGG TGGGTCTCTATTTTACCCTCCTACAAGCCTCAGAGTACTTCGAGTCTCCCTTCACCATTTCCGACGGCATCTACG
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Strand=Plus/Minus
Query 1 ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACA 50
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8101969 ATTACTACCACTGACATGACTCTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACA 8101920
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT
right flanking sequence - ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACA
reads
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MT MT 10718 10618 100m TGTTGGAGATTGAGACTAGTAGGGCTAGGCCCACCGCTGCTTCGCAGGCGGCAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGT
MT MT 10715 10615 100m TGGAGATTGAGACTAGTAGGGCTAGGCCCACCGCTGCTTCGCAGGCGGCAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTT
MT MT 10712 10612 100m AGATTGAGACTAGTAGGGCTAGGCCCACCGCTGCTTCGCAGGCGGCAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAG
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MT MT 10706 10606 100m AGACTAGTAGGGCTAGGCCCACCGCTGCTTCGCAGGCGGCAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTAT
MT MT 10703 10603 100m CTAGTAGGGCTAGGCCCACCGCTGCTTCGCAGGCGGCAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAG
MT MT 10700 10600 100m GTAGGGCTAGGCCCACCGCTGCTTCGCAGGCGGCAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGT
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MT MT 10694 10594 100m CTAGGCCCACCGCTGCTTCGCAGGCGGCAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTAT
MT MT 10691 10591 100m GGCCCACCGCTGCTTCGCAGGCGGCAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAAT
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MT MT 10679 10578 48m1d52m CTTCGCAGGCGGCAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTADGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGT
MT MT 10676 10576 100m CGCAGGCGGCAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTAT
MT MT 10673 10573 100m AGGCGGCAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTAT
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MT MT 10667 10567 100m CAAAGACTAGTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTC
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MT MT 10658 10558 100m GTATGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGTGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAG
MT MT 10655 10555 100m TGGCAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAG
MT MT 10652 10552 100m CAATAGGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGA
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MT MT 10646 10545 95m1d5m GCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGGGDATATG
MT MT 10643 10543 100m CAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAG
MT MT 10640 10540 100m TATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTG
MT MT 10637 10537 100m TGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGA
MT MT 10634 10534 100m CTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCG
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MT MT 10616 10516 100m TGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAG
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MT MT 10607 10507 100m TGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGAT
MT MT 10604 10504 100m GAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGT
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MT MT 10598 10496 78m2d22m CTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCDDAGAAGTGAGATGGTAAATGCTA
MT MT 10595 10495 100m TAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAG
MT MT 10592 10492 100m TGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTAT
MT MT 10589 10489 100m ACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAAT
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MT MT 10583 10483 100m ATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT
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MT MT 10580 10791 97m10789F3M GCATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAGTGCTAGTATAATATTTAT ATT
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MT MT 10578 10793 95m10789F5M ATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTAC
MT MT 10577 10794 94m10789F6M TTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACT
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MT MT 10576 10795 93m10789F7M TATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTA
MT MT 10576 10795 93m10789F7M TATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT GTTACTA
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MT MT 10575 10796 92m10789F8M ATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTAC
MT MT 10575 10796 92m10789F8M ATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTAC
MT MT 10574 10797 91m10789F9M TTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACC
MT MT 10574 10797 91m10789F9M TTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGGGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACC
MT MT 10574 10797 91m10789F9M TTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACC
MT MT 10571 10800 88m10789F12M CTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACT
MT MT 10570 10801 87m10789F13M TTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTG
MT MT 10569 10802 86m10789F14M TCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGA
MT MT 10568 10803 85m10789F15M CTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGAC
MT MT 10567 10804 84m10789F16M TAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACA
MT MT 10566 10805 83m10789F17M AGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACAT
MT MT 10566 10805 83m10789F17M AGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACAT
MT MT 10566 10805 83m10789F17M AGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACAT
MT MT 10565 10806 82m10789F18M GGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATG
MT MT 10565 10806 82m10789F18M GGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATG
MT MT 10565 10806 82m10789F18M GGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATG
MT MT 10564 10807 81m10789F19M GCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGA
MT MT 10563 10808 80m10789F20M CATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGAC
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MT MT 10559 10812 76m10789F24M GTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTC
MT MT 10559 10812 76m10789F24M GTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCGTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTC
MT MT 10559 10812 76m10789F24M GTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTC
MT MT 10559 10812 76m10789F24M GTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTC
MT MT 10558 10813 75m10789F25M TAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCC
MT MT 10558 10813 75m10789F25M TAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCA
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MT MT 10556 10815 73m10789F27M GGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAA
MT MT 10556 10815 73m10789F27M GGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAA
MT MT 10555 10816 72m10789F28M GGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTGGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAA
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MT MT 10554 10817 71m10789F29M GAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAA
MT MT 10554 10817 71m10789F29M GAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAA
MT MT 10553 10818 70m10789F30M AGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAA
MT MT 10551 10820 68m10789F32M GATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGAGGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAAC
MT MT 10551 10820 68m10789F32M GATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTTGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAAC
MT MT 10551 10820 68m10789F32M GATGTGAGGTGTGAACGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAAC
MT MT 10551 10820 68m10789F32M GATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAAC
MT MT 10549 10822 66m10789F34M TATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACAC
MT MT 10549 10822 66m10789F34M TATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACAC
MT MT 10549 10822 66m10789F34M TATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACAC
MT MT 10548 10823 65m10789F35M ATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACA
MT MT 10546 10824 63m10789F25M1I11M GAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACAT
MT MT 10546 10824 63m10789F25M1I11M GAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACAT
MT MT 10545 10826 62m10789F38M AGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAA
MT MT 10545 10826 62m10789F38M AGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT GTTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAA
MT MT 10544 10827 61m10789F39M GGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAAT
MT MT 10544 10827 61m10789F39M GGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAAT
MT MT 10544 10826 61m10789F25M1I13M GGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAA
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MT MT 10543 10827 60m10789F25M1I14M GTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAAT
MT MT 10543 10828 60m10789F40M GTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATT
MT MT 10543 10827 60m10789F25M1I14M GTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAAT
MT MT 10542 10828 59m10789F25M1I15M TGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATT
MT MT 10541 10830 58m10789F42M GTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTG
MT MT 10541 10830 58m10789F42M GTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTG
MT MT 10541 10829 58m10789F25M1I16M GTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT GTTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTT
MT MT 10540 10831 57m10789F43M TGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGA
MT MT 10540 10831 57m10789F43M TGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGA
MT MT 10538 10832 55m10789F25M1I19M AGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAA
MT MT 10538 10833 55m10789F45M AGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAAT
MT MT 10538 10833 55m10789F45M AGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAAT
MT MT 10538 10832 55m10789F25M1I19M AGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAA
MT MT 10538 10833 55m10789F45M AGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAAT
MT MT 10537 10834 54m10789F46M GCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATC
MT MT 10536 10835 53m10789F47M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCA
MT MT 10536 10835 53m10789F47M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATACTTTGAATCA
MT MT 10536 10834 53m10789F25M1I21M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATC
MT MT 10536 10835 53m10789F47M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCA
MT MT 10536 10835 53m10789F47M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCA
MT MT 10536 10835 53m10789F47M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCA
MT MT 10536 10835 53m10789F47M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATAATTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCA
MT MT 10536 10835 53m10789F47M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTACTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCA
MT MT 10536 10834 53m10789F25M1I21M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGGGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATC
MT MT 10535 10836 52m10789F48M GATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAA
MT MT 10535 10836 52m10789F48M GATAAACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAA
MT MT 10535 10836 52m10789F48M GATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAA
MT MT 10535 10836 52m10789F48M GATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAA
MT MT 10534 10837 51m10789F49M ATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAAC
MT MT 10534 10837 51m10789F49M ATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAAC
MT MT 10534 10837 51m10789F49M ATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAAC
MT MT 10534 10837 51m10789F49M ATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAAC
MT MT 10533 10838 50m10789F50M TATACTGGTATTCATAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACA
MT MT 10533 10838 50m10789F50M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACA
MT MT 10533 10838 50m10789F50M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACA
MT MT 10533 10837 50m10789F27M1I22M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAAC
MT MT 10533 10838 50m10789F50M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACA
MT MT 10533 10838 50m10789F50M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACA
MT MT 10532 10838 49m10789F28M1I22M ATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACA
MT MT 10532 10839 49m10789F51M ATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACAC
MT MT 10532 10839 49m10789F51M ATACTAGTATTCCTAGAAGTGATATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACAC
MT MT 10532 10839 49m10789F51M ATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACAC
MT MT 10531 10840 48m10789F52M TACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACA
MT MT 10531 10840 48m10789F52M TACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACA
MT MT 10530 10841 47m10789F53M ACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAA
MT MT 10530 10841 47m10789F53M ACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAA
MT MT 10530 10841 47m10789F53M ACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAA
MT MT 10530 10841 47m10789F53M ACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAA
MT MT 10529 10841 46m10789F25M1I28M CTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAA
MT MT 10529 10842 46m10789F54M CTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAAC
MT MT 10529 10841 46m10789F25M1I28M CTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAA
MT MT 10528 10843 45m10789F55M TAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACC
MT MT 10527 10844 44m10789F56M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCA
MT MT 10527 10844 44m10789F56M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGAATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCA
MT MT 10527 10844 44m10789F56M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCC
MT MT 10527 10844 44m10789F56M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCA
MT MT 10527 10844 44m10789F56M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCA
MT MT 10526 10844 43m10789F25M1I31M GTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCA
MT MT 10526 10844 43m10789F25M1I31M GTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCA
MT MT 10526 10845 43m10789F57M GTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCAC
MT MT 10526 10845 43m10789F57M GTATTCCTAGAAGGGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCAC
MT MT 10526 10845 43m10789F57M GTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCAC
MT MT 10525 10846 42m10789F58M TATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACC
MT MT 10525 10846 42m10789F58M TATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACC
MT MT 10525 10846 42m10789F58M TATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACC
MT MT 10525 10846 42m10789F58M TATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATAATTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACC
MT MT 10525 10846 42m10789F58M TATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACC
MT MT 10525 10846 42m10789F58M TATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACC
MT MT 10525 10846 42m10789F58M TATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACC
MT MT 10524 10847 41m10789F59M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCC
MT MT 10524 10847 41m10789F59M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCC
MT MT 10524 10847 41m10789F59M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCC
MT MT 10524 10847 41m10789F59M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT GTTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCC
MT MT 10524 10847 41m10789F59M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCC
MT MT 10524 10847 41m10789F59M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCC
MT MT 10524 10847 41m10789F59M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCC
MT MT 10524 10847 41m10789F59M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCC
MT MT 10524 10847 41m10789F59M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAC ATTACCACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCC
MT MT 10524 10847 41m10789F59M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCC
MT MT 10524 10847 41m10789F59M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCC
MT MT 10523 10848 40m10789F60M TTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCA
MT MT 10523 10848 40m10789F60M TTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCA
MT MT 10523 10848 40m10789F60M TTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCA
MT MT 10523 10848 40m10789F60M TTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCA
MT MT 10523 10848 40m10789F60M TTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCA
MT MT 10523 10848 40m10789F60M TTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCC
MT MT 10523 10848 40m10789F60M TTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCTCCCG
MT MT 10523 10848 40m10789F60M TTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACCGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTTAATCAACACAACCACCCA
MT MT 10523 10848 40m10789F60M TTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCCCCCG
MT MT 10523 10848 40m10789F60M TTCCTAGAAGTGATATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCT
MT MT 10523 10848 40m10789F60M TTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACACA
MT MT 10522 10849 39m10789F61M TCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCAC
MT MT 10522 10849 39m10789F61M TCGTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCAC
MT MT 10522 10849 39m10789F61M TCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATGTTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCAC
MT MT 10522 10849 39m10789F61M TCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCAC
MT MT 10521 10850 38m10789F62M CCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACA
MT MT 10521 10850 38m10789F62M CCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACA
MT MT 10521 10850 38m10789F62M CCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACA
MT MT 10521 10850 38m10789F62M CCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACA
MT MT 10521 10850 38m10789F62M CCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACA
MT MT 10520 10851 37m10789F63M CTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAG
MT MT 10520 10851 37m10789F63M CTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT GTTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAG
MT MT 10520 10851 37m10789F63M CTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAG
MT MT 10520 10851 37m10789F63M CTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAG
MT MT 10520 10851 37m10789F63M CTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAG
MT MT 10520 10851 37m10789F63M CTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAG
MT MT 10519 10852 36m10789F64M TAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGC
MT MT 10519 10852 36m10789F64M TAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT GTTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGC
MT MT 10519 10852 36m10789F64M TAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGC
MT MT 10519 10852 36m10789F64M TAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT GTTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGC
MT MT 10519 10852 36m10789F64M TAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGC
MT MT 10519 10852 36m10789F64M TAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGC
MT MT 10518 10853 35m10789F65M AGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGCC
MT MT 10518 10853 35m10789F65M AGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGCC
MT MT 10518 10853 35m10789F65M AGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGAATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAGTCAACACAACCACCCACAGCC
MT MT 10518 10853 35m10789F65M AGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT GTTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGCC
MT MT 10518 10853 35m10789F65M AGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACAACCCACAGCC
MT MT 10518 10853 35m10789F65M AGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGCC
MT MT 10517 10854 34m10789F66M GAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGCCT
MT MT 10517 10854 34m10789F66M GAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGCCT
MT MT 10517 10854 34m10789F66M GAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGCCT
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MT MT 10516 10855 33m10789F67M AAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTTAT ATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAACCACCCACAGCCTA
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HuRef SCAF_1103279188412, whole genome shotgun sequence
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MT MT 10564 11134 79m11114F21M GCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACA
MT MT 10564 11134 79m11114F21M GCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACA
MT MT 10564 11134 79m11114F21M GCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACA
MT MT 10551 11147 66m11114F34M GATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCT
MT MT 10550 11148 65m11114F35M ATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTT
MT MT 10548 11150 63m11114F37M ATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGG
MT MT 10548 11150 63m11114F37M ATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGG
MT MT 10548 11150 63m11114F37M ATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGG
MT MT 10547 11151 62m11114F38M TGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCGTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGC
MT MT 10546 11152 61m11114F39M GAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCT
MT MT 10543 11155 58m11114F42M GTGGGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATC
MT MT 10538 11160 53m11114F47M AGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCAC
MT MT 10537 11161 52m11114F48M GCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACC
MT MT 10536 11162 51m11114F49M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCC
MT MT 10536 11162 51m11114F49M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCC
MT MT 10536 11162 51m11114F49M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCC
MT MT 10536 11162 51m11114F49M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCC
MT MT 10536 11162 51m11114F49M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCC
MT MT 10535 11163 50m11114F50M GATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCG
MT MT 10535 11163 50m11114F50M GATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCG
MT MT 10535 11163 50m11114F50M GATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCG
MT MT 10534 11164 49m11114F51M ATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGA
MT MT 10533 11165 48m11114F52M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGAT
MT MT 10533 11165 48m11114F52M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGAT
MT MT 10533 11165 48m11114F52M TATACTAGTATTCCTAGAAGGGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGAT
MT MT 10532 11166 47m11114F53M ATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATG
MT MT 10532 11166 47m11114F53M ATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATG
MT MT 10532 11166 47m11114F53M ATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATG
MT MT 10531 11167 46m11114F54M TACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGA
MT MT 10531 11167 46m11114F54M TACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGA
MT MT 10530 11168 45m11114F55M ACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGGAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAG
MT MT 10529 11169 44m11114F56M CTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGG
MT MT 10528 11170 43m11114F57M TAGTATTCCTAGAAGTGACATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGC
MT MT 10527 11171 42m11114F58M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCA
MT MT 10527 11171 42m11114F58M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCA
MT MT 10527 11171 42m11114F58M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCA
MT MT 10524 11174 39m11114F61M ATTCCTAGAAGTGAGATGGGAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACC
MT MT 10524 11174 39m11114F61M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACC
MT MT 10524 11174 39m11114F61M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACC
MT MT 10524 11174 39m11114F61M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACC
MT MT 10524 11174 39m11114F61M ATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACC
MT MT 10523 11175 38m11114F62M TTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCA
MT MT 10522 11176 37m11114F63M TCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAG
MT MT 10522 11176 37m11114F63M TCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAG
MT MT 10522 11176 37m11114F63M TCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAG
MT MT 10520 11178 35m11114F65M CTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCC
MT MT 10520 11178 35m11114F65M CTAGAAGTGATATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCC
MT MT 10520 11178 35m11114F65M CTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCC
MT MT 10520 11178 35m11114F65M CTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCC
MT MT 10520 11178 35m11114F65M CTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCC
MT MT 10518 11180 33m11114F67M AGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAG
MT MT 10512 11186 27m11114F73M GAGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCC
MT MT 10512 11186 27m11114F73M GAGATGGTAAATGCTAGTATGATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCC
MT MT 10511 11187 26m11114F74M AGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCT
MT MT 10511 11187 26m11114F74M AGATGGTAAATGCTAGTATCATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCT
MT MT 10511 11187 26m11114F74M ACATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTCCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCT
MT MT 10511 11187 26m11114F74M AGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGAGGAGGCAACCAGCCAGAGCGCCT
MT MT 10511 11187 26m11114F74M AGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCT
MT MT 10511 11187 26m11114F74M AGATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCT
MT MT 10510 11188 25m11114F75M GATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTG
MT MT 10510 11188 25m11114F75M GATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTG
MT MT 10509 11189 24m11114F76M ATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGA
MT MT 10509 11189 24m11114F76M ATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGA
MT MT 10509 11189 24m11114F76M ATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGA
MT MT 10509 11189 24m11114F76M ATGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGTAACCAGCCAGAACGCCTGA
MT MT 10508 11190 23m11114F77M TGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAA
MT MT 10508 11190 23m11114F77M TGGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAA
MT MT 10507 11191 22m11114F78M GGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAAC
MT MT 10507 11191 22m11114F78M GGTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAAC
MT MT 10506 11192 21m11114F79M GTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACG
MT MT 10506 11192 21m11114F79M GTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACG
MT MT 10506 11192 21m11114F79M GTAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACG
MT MT 10505 11193 20m11114F80M TAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGC
MT MT 10505 11193 20m11114F80M TAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGC
MT MT 10505 11193 20m11114F80M TAAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGC
MT MT 10504 11194 19m11114F81M AAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCA
MT MT 10504 11194 19m11114F81M AAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCA
MT MT 10504 11194 19m11114F81M AAATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCA
MT MT 10503 11195 18m11114F82M AATGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAG
MT MT 10503 11195 18m11114F82M AAGGCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCTTCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAG
MT MT 10500 11198 15m11114F85M GCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCA
MT MT 10500 11198 15m11114F85M GCTAGTATAATATTT TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCA
MT MT 11104 11204 100M ATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACT
MT MT 11107 11207 100M ATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCC
MT MT 11110 11210 100M TTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTAT
MT MT 11113 11213 100M TATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCT
MT MT 11116 11216 100M ATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACA
MT MT 11119 11219 100M TTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCC
MT MT 11122 11222 100M TTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTGCACCCTAG
MT MT 11125 11225 100M GAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAG
MT MT 11128 11228 100M ACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCT
MT MT 11131 11231 100M ACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCC
MT MT 11134 11234 100M CTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTC
MT MT 11137 11237 100M ATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCC
MT MT 11140 11240 100M CCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTAC
MT MT 11143 11243 100M ACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCA
MT MT 11146 11246 100M TTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCG
MT MT 11149 11249 100M GCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCAC
MT MT 11152 11252 100M ATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAA
MT MT 11155 11255 100M ATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTT
MT MT 11158 11258 100M ACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATGTACA
MT MT 11161 11261 100M CGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTC
MT MT 11164 11264 100M TGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACA
MT MT 11167 11267 100M GGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACA
MT MT 11170 11270 100M AACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCC
MT MT 11173 11273 100M CAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAG
MT MT 11176 11276 100M CCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCT
MT MT 11179 11279 100M GAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCAC
MT MT 11182 11282 100M CGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAA
MT MT 11185 11285 100M CTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACA
MT MT 11188 11288 100M AACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTC
MT MT 11191 11291 100M GCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTAC
MT MT 11194 11294 100M GGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACTAC
MT MT 11197 11297 100M ACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACTACTCA
MT MT 11200 11300 100M TACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACTACTCACTC
MT MT 11203 11303 100M TTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACTACTCACTCTCA
MT MT 11206 11306 100M CTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACTACTCACTCTCACTG
MT MT 11209 11309 100M TTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACTACTCACTCTCACTGCCC
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shotgun sequence
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genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Query 1 CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACA 50
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Query 1 CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACA 50
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Sbjct 297669 CATTCACAGCCACGGAGCTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACA 297620
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Query 1 CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACA 50
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Sbjct 124638467 CATTCACAGCCACGGAGCTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACA 124638516
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MT MT 10567 11107 77m11085F23M TAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATC
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MT MT 10564 11989 74m11085F23M879N3M GCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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MT MT 10551 11123 61m11085F39M GATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCT
MT MT 10551 11123 61m11085F39M GATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATCA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCT
MT MT 10551 11123 61m11085F39M GATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA TATTTACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCT
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MT MT 10549 11125 59m11085F41M TATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA TATTCACAGCCACAGAGCTAATCATATTTTATATCTTCTTC
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MT MT 10527 11147 37m11085F63M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA TATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCT
MT MT 10527 11147 37m11085F63M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA TATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCT
MT MT 10527 11147 37m11085F63M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA TATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCT
MT MT 10527 11147 37m11085F63M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCT
MT MT 10527 11147 37m11085F63M AGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCT
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MT MT 10518 11156 28m11085F72M AGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCA
MT MT 10518 11216 28m11085F71M60N1M AGAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||A
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MT MT 10517 11157 27m11085F73M GAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA TATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCAT
MT MT 10517 11157 27m11085F73M GAAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCAT
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MT MT 10516 11158 26m11085F74M AAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA TATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATC
MT MT 10516 11158 26m11085F74M AAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATC
MT MT 10516 11158 26m11085F74M AAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATC
MT MT 10516 11158 26m11085F74M AAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATC
MT MT 10516 11158 26m11085F74M AAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA TATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATC
MT MT 10516 11158 26m11085F74M AAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATC
MT MT 10516 11158 26m11085F74M AAGTGAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATC
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MT MT 10512 11162 22m11085F78M GAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCC
MT MT 10512 11162 22m11085F78M GAGATGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCC
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MT MT 10508 11166 18m11085F82M TGGTAAATGCTAGTATAA CATTCACAGCCACAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATG
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MT MT 11096 11196 100M CAGAACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGG
MT MT 11099 11199 100M AACTAATCATATTTTATATCTTCTTCGAAAACACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCAC
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MT MT 11108 11208 100M TATTTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCT
MT MT 11111 11211 100M TTTATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATT
MT MT 11114 11214 100M ATATCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTA
MT MT 11117 11217 100M TCTTCTTCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACAC
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MT MT 11123 11223 100M TCGAAACCACACTTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGT
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MT MT 11135 11235 100M TTATCCCCACCTTGGCTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCC
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MT MT 11150 11250 100M CTATCATCACCCGATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACT
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MT MT 11162 11262 100M GATGAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCA
MT MT 11165 11265 100M GAGGCAACCAGCCAGAACGCCTGAACGCAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAA
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MT MT 11192 11292 100M CAGGCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGTCTCCGTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACT
MT MT 11195 11295 100M TCACATACTTCCTATTCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCATTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACTACT
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MT MT 11210 11310 100M TCTACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACTACTCACTCTCACTGCCCA
MT MT 11213 11313 100M ACACCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACTACTCACTCTCACTGCCCAAGA
MT MT 11216 11316 100M CCCTAGTAGGCTCCCTTCCCCTACTCATCGCACTAATTTACACTCACAACACCCTAGGCTCACTAAACATTCTACTACTCACTCTCACTGCCCAAGAACT
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200 pairs
9:3
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-15:7
-15:7
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genome shotgun sequence
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Sbjct 42577628 CTAAAACTAATTGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACT 42577582
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Query 1 CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACT 47
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Sbjct 8101995 CTAAAACTAATTGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACT 8101949
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Effective search space used: 852954396357
blast search - nt
left flanking sequence - GGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG
right flanking sequence - CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTC
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MT MT 10647 10547 100m GGCACAATATTGGCTAAGAGGGAGTGGGTGTTGAGGGTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATA
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MT MT 10611 10511 100m GTTATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTG
MT MT 10608 10508 100m ATGAGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGA
MT MT 10605 10504 46m1d54m AGAGTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATADGTAGGGAGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGT
MT MT 10602 10502 100m GTAGCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAA
MT MT 10599 10499 100m GCTATAATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGCAGTATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATGGTAAATG
MT MT 10594 10774 88m10763F12M AATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATTAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATC
MT MT 10594 10774 88m10763F12M AATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATC
MT MT 10594 10774 88m10763F12M AATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATC
MT MT 10594 10774 88m10763F12M AATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATC
MT MT 10594 10774 88m10763F12M AATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATC
MT MT 10594 10774 88m10763F12M AATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATC
MT MT 10594 10774 88m10763F12M AATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATTAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATC
MT MT 10593 10775 87m10763F13M ATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCG
MT MT 10593 10775 87m10763F13M ATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCG
MT MT 10593 10775 87m10763F13M ATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCG
MT MT 10593 10775 87m10763F13M ATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGTGATG GTAAAACTAATCG
MT MT 10593 10775 87m10763F13M ATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCG
MT MT 10593 10775 87m10763F13M ATGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCG
MT MT 10592 10776 86m10763F14M TGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGT
MT MT 10592 10776 86m10763F14M TGCACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGT
MT MT 10592 10776 86m10763F14M TGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGT
MT MT 10592 10776 86m10763F14M TGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGT
MT MT 10592 10776 86m10763F14M TGAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGT
MT MT 10592 10776 86m10763F14M TGAACAGCTATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGT
MT MT 10591 10777 85m10763F15M GAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTC
MT MT 10591 10777 85m10763F15M GAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTC
MT MT 10591 10777 85m10763F15M GAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGACATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTC
MT MT 10591 10777 85m10763F15M GAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTC
MT MT 10591 10777 85m10763F15M GAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTC
MT MT 10591 10777 85m10763F15M GAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG ATAAACCTAATCGTC
MT MT 10591 10777 85m10763F15M GAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTC
MT MT 10591 10777 85m10763F15M GAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATTCTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTC
MT MT 10591 10777 85m10763F15M GAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTC
MT MT 10591 10777 85m10763F15M GAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTC
MT MT 10591 10777 85m10763F15M GAACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTC
MT MT 10590 10778 84m10763F16M AACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCC
MT MT 10590 10778 84m10763F16M AACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCC
MT MT 10590 10778 84m10763F16M AACAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCC
MT MT 10588 10780 82m10763F18M CAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCA
MT MT 10588 10780 82m10763F18M CAGCGATTGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCA
MT MT 10588 10780 82m10763F18M CAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCA
MT MT 10588 10780 82m10763F18M CAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCA
MT MT 10588 10780 82m10763F18M CAGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCA
MT MT 10587 10781 81m10763F19M AGCGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAA
MT MT 10585 10783 79m10763F21M CGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACA
MT MT 10585 10783 79m10763F21M CGATAGTATTATTCCTTCTAGGAATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACA
MT MT 10585 10783 79m10763F21M CGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACA
MT MT 10585 10783 79m10763F21M CGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACA
MT MT 10585 10783 79m10763F21M CGATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACA
MT MT 10584 10784 78m10763F22M GATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAA
MT MT 10584 10784 78m10763F22M GATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAA
MT MT 10584 10784 78m10763F22M GATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAA
MT MT 10584 10784 78m10763F22M GATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAA
MT MT 10584 10784 78m10763F22M GATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAA
MT MT 10583 10785 77m10763F23M ATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAAT
MT MT 10583 10925 77m10763F21M140N2M ATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGCATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACA||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||CT
MT MT 10583 10785 77m10763F23M ATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAAT
MT MT 10583 10785 77m10763F23M ATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAAT
MT MT 10583 10785 77m10763F23M ATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGTTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAAT
MT MT 10583 10785 77m10763F23M ATAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAAT
MT MT 10582 10786 76m10763F24M TAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATT
MT MT 10582 10786 76m10763F24M TAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATT
MT MT 10582 10786 76m10763F24M TAGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATT
MT MT 10582 10786 76m10763F24M TTGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATT
MT MT 10581 10787 75m10763F25M AGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTA
MT MT 10581 10787 75m10763F25M AGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTA
MT MT 10581 10787 75m10763F25M AGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTA
MT MT 10581 10787 75m10763F25M AGTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTA
MT MT 10581 10787 75m10763F25M AGTATTAATCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTA
MT MT 10580 10788 74m10763F26M GTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTAT
MT MT 10580 10788 74m10763F26M GTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTAT
MT MT 10580 10788 74m10763F26M GTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTAT
MT MT 10580 10788 74m10763F26M GTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTAT
MT MT 10580 10788 74m10763F26M GTATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTAT
MT MT 10579 10789 73m10763F27M TATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATA
MT MT 10578 10790 72m10763F28M ATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATAT
MT MT 10578 10790 72m10763F28M ATTATTACTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATAGTCCCAACAATTATAT
MT MT 10578 10790 72m10763F28M ATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCACCAATTATAT
MT MT 10578 10790 72m10763F28M ATTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATAT
MT MT 10577 10791 71m10763F29M TTATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATT
MT MT 10576 10792 70m10763F30M TATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTA
MT MT 10576 10792 70m10763F30M TATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTA
MT MT 10576 10792 70m10763F30M TATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTA
MT MT 10576 10792 70m10763F30M TATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTA
MT MT 10575 10793 69m10763F31M ATTCCTTCTAGGCATAGGAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTAC
MT MT 10575 10793 69m10763F31M ATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTAC
MT MT 10575 10793 69m10763F31M ATTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTAC
MT MT 10574 10794 68m10763F32M TTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACT
MT MT 10574 10794 68m10763F32M TTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACT
MT MT 10574 10794 68m10763F32M TTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACT
MT MT 10574 10794 68m10763F32M TTCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACT
MT MT 10573 10795 67m10763F33M TCCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTA
MT MT 10572 10796 66m10763F34M CCTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTAC
MT MT 10571 10797 65m10763F35M CTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACC
MT MT 10571 10797 65m10763F35M CTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCACAACAATTATATTACTACC
MT MT 10571 10797 65m10763F35M CTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACC
MT MT 10571 10797 65m10763F35M CTTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACC
MT MT 10570 10798 64m10763F36M TTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCA
MT MT 10570 10798 64m10763F36M TTCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGAGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGACCCAACAATTATATTACTACCA
MT MT 10569 10799 63m10763F37M TCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCAC
MT MT 10569 10799 63m10763F37M TCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCAC
MT MT 10569 10799 63m10763F37M TCTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCAC
MT MT 10568 10800 62m10763F38M CTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACT
MT MT 10568 10800 62m10763F38M CTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACT
MT MT 10568 10800 62m10763F38M CTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACT
MT MT 10568 10800 62m10763F38M CTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACT
MT MT 10568 10800 62m10763F38M CTAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACT
MT MT 10567 10801 61m10763F39M TAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTG
MT MT 10567 10801 61m10763F39M TAGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTG
MT MT 10566 10802 60m10763F40M AGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGA
MT MT 10566 10802 60m10763F40M AGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGA
MT MT 10566 10802 60m10763F40M AGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGA
MT MT 10566 10802 60m10763F40M AGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGA
MT MT 10566 10802 60m10763F40M AGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGA
MT MT 10566 10802 60m10763F40M AGGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGA
MT MT 10565 10803 59m10763F41M GGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGAC
MT MT 10565 10803 59m10763F41M GGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGAC
MT MT 10565 10803 59m10763F41M GGCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGAC
MT MT 10564 10804 58m10763F42M GCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACA
MT MT 10564 10804 58m10763F42M GCATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACA
MT MT 10563 10805 57m10763F43M CATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACAT
MT MT 10563 10805 57m10763F43M CATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACAT
MT MT 10563 10805 57m10763F43M CATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCATAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACAT
MT MT 10563 10805 57m10763F43M CATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACAT
MT MT 10562 10806 56m10763F44M ATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATAATATTACTACCACTGACATG
MT MT 10562 10806 56m10763F44M ATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATG
MT MT 10562 10806 56m10763F44M ATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATG
MT MT 10562 10806 56m10763F44M ATAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATG
MT MT 10561 10807 55m10763F45M TAGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGA
MT MT 10560 10808 54m10763F46M AGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGAC
MT MT 10560 10808 54m10763F46M AGTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGAC
MT MT 10559 10809 53m10763F47M GTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTACATTACTACCACTGACATGACT
MT MT 10559 10809 53m10763F47M GTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACT
MT MT 10559 10809 53m10763F47M GTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACT
MT MT 10559 10809 53m10763F47M GTAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACT
MT MT 10558 10810 52m10763F48M TAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTT
MT MT 10558 10810 52m10763F48M TAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTT
MT MT 10558 10810 52m10763F48M TAGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTT
MT MT 10557 10811 51m10763F49M AGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTT
MT MT 10557 10811 51m10763F49M AGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTT
MT MT 10557 10811 51m10763F49M AGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTT
MT MT 10557 10811 51m10763F49M AGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTT
MT MT 10557 10811 51m10763F49M AGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTT
MT MT 10557 10811 51m10763F49M AGGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTT
MT MT 10556 10812 50m10763F50M GGGAGGATATGAGGTGCGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTC
MT MT 10556 10812 50m10763F50M GGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTC
MT MT 10556 10812 50m10763F50M GGGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTC
MT MT 10555 10813 49m10763F51M GGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCC
MT MT 10555 10813 49m10763F51M GGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCA
MT MT 10555 10813 49m10763F51M GGAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCC
MT MT 10554 10814 48m10763F52M GAGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCA
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MT MT 10553 10815 47m10763F53M AGGATATGAGGGGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAA
MT MT 10553 10815 47m10763F53M AGGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAA
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MT MT 10552 10816 46m10763F54M GGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAA
MT MT 10552 10816 46m10763F54M GGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAA
MT MT 10552 10816 46m10763F54M GGATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAA
MT MT 10551 10817 45m10763F55M GATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAA
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MT MT 10550 10818 44m10763F56M ATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAA
MT MT 10550 10818 44m10763F56M ATATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAACAA
MT MT 10549 10819 43m10763F57M TATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAA
MT MT 10548 10820 42m10763F58M ATGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAAC
MT MT 10547 10821 41m10763F59M TGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACA
MT MT 10547 10821 41m10763F59M TGAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACA
MT MT 10546 10822 40m10763F60M GAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACAC
MT MT 10546 10822 40m10763F60M GAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACAC
MT MT 10546 10822 40m10763F60M GAGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACAC
MT MT 10545 10823 39m10763F61M AGGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACA
MT MT 10545 10823 39m10763F61M AGGTGTGAGCCATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAGCACA
MT MT 10544 10824 38m10763F62M GGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACAT
MT MT 10544 10824 38m10763F62M GGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACAT
MT MT 10544 10824 38m10763F62M GGTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACAT
MT MT 10543 10825 37m10763F63M GTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATA
MT MT 10543 10825 37m10763F63M GTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATA
MT MT 10543 10825 37m10763F63M GTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATA
MT MT 10543 10825 37m10763F63M GTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATA
MT MT 10543 10824 37m10763F51M1I11M GTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACAT
MT MT 10543 10825 37m10763F63M GTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATA
MT MT 10543 10825 37m10763F63M GTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATA
MT MT 10543 10824 37m10763F51M1I11M GTGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACAT
MT MT 10542 10826 36m10763F64M TGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAA
MT MT 10542 10826 36m10763F64M TGTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAA
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MT MT 10541 10827 35m10763F65M GTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAAT
MT MT 10541 10827 35m10763F65M GTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAGAATACATAAT
MT MT 10541 10827 35m10763F65M GTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAAT
MT MT 10541 10827 35m10763F65M GTGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAAT
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MT MT 10540 10828 34m10763F66M TGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATT
MT MT 10540 10828 34m10763F66M TGAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATT
MT MT 10539 10829 33m10763F67M GAGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTT
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MT MT 10538 10830 32m10763F68M AGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTGG
MT MT 10538 10830 32m10763F68M AGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTG
MT MT 10538 10830 32m10763F68M AGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGACCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTG
MT MT 10538 10830 32m10763F68M AGCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTG
MT MT 10537 10831 31m10763F69M GCGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGA
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MT MT 10536 10832 30m10763F70M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAA
MT MT 10536 10832 30m10763F70M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACTTAATTTGAA
MT MT 10536 10832 30m10763F70M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAA
MT MT 10536 10832 30m10763F70M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAA
MT MT 10536 10832 30m10763F70M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAA
MT MT 10536 10832 30m10763F70M CGATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAA
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MT MT 10535 10833 29m10763F71M GATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAAT
MT MT 10535 10833 29m10763F71M GATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAAT
MT MT 10535 10833 29m10763F71M GATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAAT
MT MT 10535 10832 29m10763F51M1I19M GATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAA
MT MT 10535 10833 29m10763F71M GATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAAT
MT MT 10534 10834 28m10763F72M ATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATC
MT MT 10534 10834 28m10763F72M ATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATC
MT MT 10534 10834 28m10763F72M ATATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATC
MT MT 10533 10835 27m10763F73M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCA
MT MT 10533 10835 27m10763F73M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCA
MT MT 10533 10835 27m10763F73M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCA
MT MT 10533 10835 27m10763F73M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCA
MT MT 10533 10835 27m10763F73M TATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCA
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MT MT 10532 10836 26m10763F74M ATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAA
MT MT 10532 10836 26m10763F74M ATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAA
MT MT 10532 10836 26m10763F74M ATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAA
MT MT 10532 10836 26m10763F74M ATACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG GTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAA
MT MT 10531 10837 25m10763F75M TACTAGTATTCCTAGAAGTGAGATG CTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCACTGACATGACTTTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAAC
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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HuRef SCAF_1103279188412, whole genome shotgun sequence
gb|DS486020.1| Homo sapiens SCAF_1103279188412 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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shotgun sequence
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MT MT 11261 11161 100m TGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATC
MT MT 11258 11158 100m GTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCCGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGGCTCATCGGG
MT MT 11255 11155 100m TAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGA
MT MT 11252 11152 100m ATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGA
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MT MT 11246 11146 100m GCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCA
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MT MT 11213 11113 100m TAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATAT
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MT MT 11207 11107 100m AGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATA
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MT MT 11117 11383 85m11369F15M ATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCT
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MT MT 11096 11404 64m11369F36M GTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGA
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MT MT 11092 11408 60m11369F40M CTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCC
MT MT 11092 11408 60m11369F40M CTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT TTCGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCC
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MT MT 11091 11409 59m11369F41M TGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCC
MT MT 11090 11410 58m11369F42M GTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCT
MT MT 11090 11410 58m11369F42M GTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCT
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MT MT 11081 11419 49m11369F51M ATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCAT
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MT MT 11078 11422 46m11369F54M ATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTC
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MT MT 11076 11424 44m11369F56M TAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCGTGTCGA
MT MT 11076 11424 44m11369F56M TAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGA
MT MT 11076 11424 44m11369F56M TAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGA
MT MT 11076 11424 44m11369F56M TAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGCTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGA
MT MT 11076 11424 44m11369F56M TAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGA
MT MT 11076 11424 44m11369F56M TAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGCTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGA
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MT MT 11073 11427 41m11369F59M GGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGC
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MT MT 11072 11428 40m11369F60M GAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGGGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACGTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCC
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MT MT 11071 11429 39m11369F61M AGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCC
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MT MT 11069 11431 37m11369F63M ATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATGCCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCC
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MT MT 11068 11432 36m11369F64M TTTGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCA
MT MT 11066 11434 34m11369F66M TGTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATC
MT MT 11065 11435 33m11369F67M GTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCG
MT MT 11065 11435 33m11369F67M GTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCG
MT MT 11065 11435 33m11369F67M GTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCG
MT MT 11065 11435 33m11369F67M GTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACATCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCTCCCATCG
MT MT 11065 11435 33m11369F67M GTAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCG
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MT MT 11064 11436 32m11369F68M TAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT TTCGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGC
MT MT 11064 11436 32m11369F68M TAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGC
MT MT 11064 11436 32m11369F68M TAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGC
MT MT 11064 11436 32m11369F68M TAGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGC
MT MT 11063 11437 31m11369F69M AGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCT
MT MT 11063 11437 31m11369F69M AGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCT
MT MT 11063 11437 31m11369F69M AGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCT
MT MT 11063 11437 31m11369F69M AGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCT
MT MT 11063 11437 31m11369F69M AGGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCT
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MT MT 11062 11438 30m11369F70M GGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTG
MT MT 11062 11438 30m11369F70M GGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTG
MT MT 11062 11438 30m11369F70M GGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTG
MT MT 11062 11438 30m11369F70M GGGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTG
MT MT 11061 11439 29m11369F71M GGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGG
MT MT 11061 11439 29m11369F71M GGAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGG
MT MT 11060 11440 28m11369F72M GAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGG
MT MT 11060 11440 28m11369F72M GAGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGG
MT MT 11059 11441 27m11369F73M AGATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGT
MT MT 11058 11442 26m11369F74M GATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTC
MT MT 11058 11442 26m11369F74M GATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTC
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MT MT 11057 11443 25m11369F75M ATTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT TTCGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCA
MT MT 11056 11444 24m11369F76M TTAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAA
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MT MT 11055 11445 23m11369F77M TAGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAAT
MT MT 11054 11446 22m11369F78M AGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATA
MT MT 11054 11446 22m11369F78M AGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATA
MT MT 11054 11446 22m11369F78M AGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATA
MT MT 11054 11446 22m11369F78M AGTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATA
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MT MT 11053 11447 21m11369F79M GTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAG
MT MT 11053 11447 21m11369F79M GTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAG
MT MT 11053 11447 21m11369F79M GTATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAG
MT MT 11052 11448 20m11369F80M TATAGAGAGGTAGAGTTTTT TTAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGT
MT MT 11052 11448 20m11369F80M TATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGT
MT MT 11052 11448 20m11369F80M TATAGAGAGGTAGAGTTTTT ATAGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGT
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MT MT 11371 11471 100M GTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAAC
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MT MT 11377 11477 100M ATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCG
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MT MT 11386 11486 100M TACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTA
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MT MT 11398 11498 100M TTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCA
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MT MT 11404 11504 100M CTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTAACACTCA
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MT MT 11410 11510 100M AAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCACACTCATTCTCA
MT MT 11413 11513 100M GCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCACACTCATTCTCAACC
MT MT 11416 11516 100M CATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCACACTCATTCTCAACCCCC
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MT MT 11437 11537 100M GGGTCAATAGTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCACACTCATTCTCAACCCCCTGACAAAACACATAGCCTACC
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MT MT 11443 11543 100M ATAGTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCACACTCATTCTCAACCCCCTGACAAAACACATAGCCTACCCCTTCC
MT MT 11446 11546 100M GTACTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCACACTCATTCTCAACCCCCTGACAAAACACATAGCCTACCCCTTCCTTG
MT MT 11449 11549 100M CTTGCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCACACTCATTCTCAACCCCCTGACAAAACACATAGCCTACCCCTTCCTTGTAC
MT MT 11452 11552 100M GCCGCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCACACTCATTCTCAACCCCCTGACAAAACACATAGCCTACCCCTTCCTTGTACTAT
MT MT 11455 11555 100M GCAGTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCACACTCATTCTCAACCCCCTGACAAAACACATAGCCTACCCCTTCCTTGTACTATCCC
MT MT 11458 11558 100M GTACTCTTAAAACTAGGCGGCTATGGTATAATACGCCTCACACTCATTCTCAACCCCCTGACAAAACACATAGCCTACCCCTTCCTTGTACTATCCCTAT
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HuRef SCAF_1103279188412, whole genome shotgun sequence
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MT MT 11421 11321 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAG
MT MT 11418 11318 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTT
MT MT 11415 11315 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGAT
MT MT 11412 11311 60m1d40m GTADGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTT
MT MT 11409 11309 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCT
MT MT 11406 11306 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGG
MT MT 11403 11303 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCA
MT MT 11400 11300 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTG
MT MT 11397 11296 24m1d76m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAG
MT MT 11394 11294 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTG
MT MT 11391 11291 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGT
MT MT 11388 11288 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGT
MT MT 11385 11285 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGA
MT MT 11382 11281 59m1d41m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGADGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGT
MT MT 11379 11278 6m1d94m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTA
MT MT 11376 11276 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGT
MT MT 11373 11273 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAG
MT MT 11370 11270 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCT
MT MT 11367 11267 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGG
MT MT 11364 11264 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTG
MT MT 11361 11260 55m1d45m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGDCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGT
MT MT 11358 11258 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGA
MT MT 11355 11255 100m GTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTG
MT MT 11352 11252 100m AGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAA
MT MT 11349 11249 100m TAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATT
MT MT 11346 11246 100m TCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGT
MT MT 11343 11243 100m TATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCG
MT MT 11340 11240 100m TAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATG
MT MT 11337 11237 100m GTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGT
MT MT 11334 11234 100m GTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGG
MT MT 11331 11231 100m GGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGA
MT MT 11328 11228 100m TCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGG
MT MT 11325 11225 100m GGAGTTTGATAGTTCTTCGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAG
MT MT 11322 11222 100m GTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCT
MT MT 11319 11219 100m TGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACT
MT MT 11316 11216 100m TAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGG
MT MT 11313 11212 46m1d54m TTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTGGGDTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGT
MT MT 11310 11210 100m TTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAG
MT MT 11307 11206 87m1d13m GGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACDAGGGGGTAGAATA
MT MT 11304 11204 100m AGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGG
MT MT 11301 11200 68m1d32m GAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGDAAGGGAGCCTACTAGGGGGTAGAATAGGAAGT
MT MT 11298 11198 100m AGTGAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTAT
MT MT 11295 11195 100m GAGTAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTG
MT MT 11292 11191 72m1d28m TAGTAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACDAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTG
MT MT 11289 11189 100m TAGAATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCG
MT MT 11286 11186 100m AATGTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTC
MT MT 11283 11183 100m GTTTAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGG
MT MT 11280 11180 100m TAGTGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGT
MT MT 11277 11177 100m TGAGCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGGGTTCAGGCGTTCT
MT MT 11274 11174 100m GCCTAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGC
MT MT 11271 11171 100m TAGGGTGTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGG
MT MT 11268 11108 1m60n99m G||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AGGAAGTATGTGCCTGCGGTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCACGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAAT
MT MT 11265 11165 100m GTTGTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCT
MT MT 11262 11162 100m GTGAGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCAT
MT MT 11259 11159 100m AGTGTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGG
MT MT 11256 11156 100m GTAAATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTG
MT MT 11253 11153 100m AATTAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATG
MT MT 11250 11150 100m TAGTGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATA
MT MT 11247 11146 75m1d25m TGCGATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGDGTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCA
MT MT 11244 11144 100m GATGAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAG
MT MT 11241 11141 100m GAGTAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTG
MT MT 11238 11138 100m TAGGGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGG
MT MT 11235 11135 100m GGGAAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATA
MT MT 11232 11132 100m AAGGGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGT
MT MT 11229 11129 100m GGAGCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTG
MT MT 11226 11126 100m GCCTACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTT
MT MT 11223 11123 100m TACTAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCG
MT MT 11220 11120 100m TAGGGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAG
MT MT 11217 11117 100m GGTGTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAG
MT MT 11214 11114 100m GTAGAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATA
MT MT 11211 11111 100m GAATAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAA
MT MT 11208 11108 100m TAGGAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAGGATATAAAAT
MT MT 11205 11105 100m GAAGTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATG
MT MT 11202 11102 100m GTATGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATT
MT MT 11199 11099 100m TGTGCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGT
MT MT 11196 11096 100m GCCTGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCT
MT MT 11193 11093 100m TGCGTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTG
MT MT 11190 11090 100m GTTCAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCT
MT MT 11187 11087 100m CAGGCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTG
MT MT 11184 11084 100m GCGTTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAAT
MT MT 11181 11081 100m TTCTGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTT
MT MT 11178 11078 100m TGGCTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTTTA
MT MT 11175 11075 100m CTGGTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATT
MT MT 11172 11072 100m GTTGCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAG
MT MT 11169 11069 100m GCCTCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAG
MT MT 11166 11066 100m TCATCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATT
MT MT 11163 11063 100m TCGGGTGATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGT
MT MT 11160 11060 100m CGTGATGAGAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGG
MT MT 11157 11057 100m GATGATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAG
MT MT 11154 11054 100m GATAGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT
MT MT 11151 11050 91m1d9m AGCCAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGDAGATTAGTA
MT MT 11148 11048 100m CAAGGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATA
MT MT 11145 11045 100m GGTGGGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATTAGTATAGAG
MT MT 11141 11383 87m11371F13M GGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCT
MT MT 11141 11383 87m11371F13M GGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCT
MT MT 11141 11383 87m11371F13M GGGATAAGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCT
MT MT 11135 11389 81m11371F19M AGTGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTAC
MT MT 11133 11391 79m11371F21M TGTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTATAGATACCTCTTTACGG
MT MT 11132 11392 78m11371F22M GTGGTTTCGAAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGA
MT MT 11123 11401 69m11371F31M AAGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTA
MT MT 11122 11402 68m11371F32M AGAAGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTAT
MT MT 11119 11405 65m11371F35M AGATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTATAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGAC
MT MT 11118 11406 64m11371F36M GATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACT
MT MT 11118 11406 64m11371F36M GATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACT
MT MT 11117 11407 63m11371F37M ATATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTC
MT MT 11115 11409 61m11371F39M ATAAAATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCC
MT MT 11110 11414 56m11371F44M ATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTATAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAG
MT MT 11110 11414 56m11371F44M ATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAG
MT MT 11110 11414 56m11371F44M ATATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTATAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGTCTCCCTAAAG
MT MT 11109 11415 55m11371F45M TATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGC
MT MT 11109 11415 55m11371F45M TATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTATAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGC
MT MT 11109 11415 55m11371F45M TATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGC
MT MT 11109 11415 55m11371F45M TATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGC
MT MT 11108 11416 54m11371F46M ATGATTAGTTCTGGGGCTGTGTATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCC
MT MT 11108 11416 54m11371F46M ATGATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCC
MT MT 11106 11418 52m11371F48M GATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCA
MT MT 11105 11419 51m11371F49M ATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCAT
MT MT 11105 11419 51m11371F49M ATTAGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCAT
MT MT 11102 11422 48m11371F52M AGTTCTGTGGCTGTGAATGTTATCATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCCTGTC
MT MT 11101 11423 47m11371F53M GTTCTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCGCTAAAGCCCATGTCG
MT MT 11098 11426 44m11371F56M CTGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAG
MT MT 11097 11427 43m11371F57M TGTGGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGC
MT MT 11094 11430 40m11371F60M GGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCC
MT MT 11094 11430 40m11371F60M GGCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCC
MT MT 11093 11431 39m11371F61M GCTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTCCGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCC
MT MT 11092 11432 38m11371F62M CTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTATAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCA
MT MT 11092 11432 38m11371F62M CTGTGAATGTTATAATTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCA
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MT MT 11077 11447 23m11371F77M TTAAGGAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAG
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MT MT 11072 11452 18m11371F82M GAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTT
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MT MT 11072 11452 18m11371F82M GAGATTTGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTT
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MT MT 11066 11458 12m11371F88M TGTAGGGAGATT AGTAAAGATACCTCTTTACGGACTCCACTTATGACTCCCTAAAGCCCATGTCGAAGCCCCCATCGCTGGGTCAATAGTACTTGCCGCA
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genome shotgun sequence
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sequence
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Query 1 ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCT 50
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Query 1 ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCT 50
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Query 1 ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCT 50
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MT MT 11414 11314 100m GCTTTAGGGAGTCATAAGTGGAGTCCGTAAAGAGGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATA
MT MT 11411 11310 12m1d88m TTAGGGAGTCATDAAGTGGAGTCCGTAAAGAGGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGAGTTTGATAGTTC
MT MT 11408 11308 100m GGGAGTCATAAGTGGAGTCCGTAAAGAGGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTT
MT MT 11405 11305 100m AGTCATAAGTGGAGTCCGTAAAGAGGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGG
MT MT 11402 11302 100m CATAAGTGGAGTCCGTAAAGAGGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAG
MT MT 11399 11299 100m AAGTGGAGTCCGTAAAGAGGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGA
MT MT 11396 11295 10m1d90m TGGAGTCCGTDAAAGAGGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGAGTGAGAGT
MT MT 11393 11293 100m AGTCCGTAAAGAGGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGA
MT MT 11390 11290 100m CCGTAAAGAGGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTA
MT MT 11387 11287 100m TAAAGAGGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA
MT MT 11384 11284 100m AGAGGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAA
MT MT 11381 11281 100m GGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGT
MT MT 11381 11659 94m11654F6M GGTATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCC
MT MT 11378 11278 100m ATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTAGAATGTTTA
MT MT 11378 11662 91m11654F9M ATCTTTACTATAAAAGCTATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATT
MT MT 11360 11680 73m11654F27M ATTGTGTAAGCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGA
MT MT 11354 11686 67m11654F33M TAAGGTAGTCATATTAAGTTGTGGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTC
MT MT 11351 11689 64m11654F36M GCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACC
MT MT 11351 11689 64m11654F36M GCTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGTTAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACC
MT MT 11350 11690 63m11654F37M CTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCG
MT MT 11350 11690 63m11654F37M CTAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCG
MT MT 11349 11691 62m11654F38M TAGTCATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGG
MT MT 11345 11695 58m11654F42M CATATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCA
MT MT 11342 11698 55m11654F45M ATTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTC
MT MT 11341 11699 54m11654F46M TTAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCA
MT MT 11340 11700 53m11654F47M TAAGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCGCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCAT
MT MT 11338 11702 51m11654F49M AGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTC
MT MT 11338 11702 51m11654F49M AGTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTC
MT MT 11337 11703 50m11654F50M GTTGTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCT
MT MT 11334 11706 47m11654F53M GTTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCAT
MT MT 11333 11707 46m11654F54M TTGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATA
MT MT 11332 11708 45m11654F55M TGGCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAA
MT MT 11330 11710 43m11654F57M GCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGGGAGAGTGAGTAGTA ACATCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATC
MT MT 11330 11710 43m11654F57M GCTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATC
MT MT 11329 11711 42m11654F58M CTCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCG
MT MT 11328 11712 41m11654F59M TCAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGC
MT MT 11327 11713 40m11654F60M CAGGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCC
MT MT 11325 11715 38m11654F62M GGAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCA
MT MT 11324 11716 37m11654F63M GAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCAC
MT MT 11324 11716 37m11654F63M GAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA GCAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCAC
MT MT 11324 11716 37m11654F63M GAGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCAC
MT MT 11323 11717 36m11654F64M AGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACG
MT MT 11323 11717 36m11654F64M AGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACG
MT MT 11323 11717 36m11654F64M AGTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACG
MT MT 11322 11718 35m11654F65M GTTTGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGG
MT MT 11319 11721 32m11654F68M TGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCT
MT MT 11319 11721 32m11654F68M TGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCT
MT MT 11319 11721 32m11654F68M TGATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCT
MT MT 11318 11722 31m11654F69M GATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCTT
MT MT 11317 11723 30m11654F70M ATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTA
MT MT 11317 11723 30m11654F70M ATAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTA
MT MT 11316 11724 29m11654F71M TAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGTCCACGGACTTAC
MT MT 11316 11724 29m11654F71M TAGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTAC
MT MT 11315 11725 28m11654F72M AGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACA
MT MT 11315 12062 28m11654F71M337N1M AGTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTAC|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MT MT 11314 11726 27m11654F73M GTTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACAT
MT MT 11313 11727 26m11654F74M TTCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATC
MT MT 11312 11728 25m11654F75M TCTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCC
MT MT 11311 11729 24m11654F76M CTTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGGA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCT
MT MT 11310 11730 23m11654F77M TTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTC
MT MT 11310 11730 23m11654F77M TTGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTC
MT MT 11309 11731 22m11654F78M TGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCA
MT MT 11309 11731 22m11654F78M TGGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCA
MT MT 11308 11732 21m11654F79M GGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCAT
MT MT 11308 11732 21m11654F79M GGGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCAT
MT MT 11307 11733 20m11654F80M GGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATT
MT MT 11307 11733 20m11654F80M GGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATT
MT MT 11307 11733 20m11654F80M GGCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATT
MT MT 11306 11734 19m11654F81M GCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTA
MT MT 11306 11734 19m11654F81M GCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCAGTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTA
MT MT 11306 11734 19m11654F81M GCAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTA
MT MT 11305 11735 18m11654F82M CAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTAC
MT MT 11305 11735 18m11654F82M CAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTAC
MT MT 11305 11735 18m11654F82M CAGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTAC
MT MT 11304 11736 17m11654F83M AGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACT
MT MT 11304 11736 17m11654F83M AGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACT
MT MT 11304 11736 17m11654F83M AGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACT
MT MT 11304 11736 17m11654F83M AGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACT
MT MT 11304 11736 17m11654F83M AGTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACT
MT MT 11303 11737 16m11654F84M GTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCTTACATCCTCATTACTA
MT MT 11303 11737 16m11654F84M GTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTA
MT MT 11303 11737 16m11654F84M GTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCTTACATCCTCATTACTA
MT MT 11303 11737 16m11654F84M GTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTA
MT MT 11303 11737 16m11654F84M GTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTA
MT MT 11303 11737 16m11654F84M GTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTA
MT MT 11303 11737 16m11654F84M GTGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTA
MT MT 11302 11738 15m11654F85M TGAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTAT
MT MT 11301 11739 14m11654F86M GAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATT
MT MT 11301 11739 14m11654F86M GAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATT
MT MT 11301 11739 14m11654F86M GAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATT
MT MT 11301 11739 14m11654F86M GAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCAACGGGCTTACATCCTCATTACTATT
MT MT 11301 11739 14m11654F86M GAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCTTACATCCTCATTACTATT
MT MT 11301 11739 14m11654F86M GAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATT
MT MT 11301 11739 14m11654F86M GAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATT
MT MT 11301 11739 14m11654F86M GAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATT
MT MT 11301 11739 14m11654F86M GAGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATT
MT MT 11300 11740 13m11654F87M AGAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTC
MT MT 11299 11741 12m11654F88M GAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCTTACATCCTCATTACTATTCT
MT MT 11299 11741 12m11654F88M GAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCT
MT MT 11299 11741 12m11654F88M GAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCTTACATCCTCATTACTATTCT
MT MT 11299 11741 12m11654F88M GAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCTTACATCCTCATTACTATTCT
MT MT 11299 11741 12m11654F88M GAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCTTACATCCTCATTACTATTCT
MT MT 11299 11741 12m11654F88M GAGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCT
MT MT 11298 11742 11m11654F89M AGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCTG
MT MT 11298 11742 11m11654F89M AGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTAACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCTG
MT MT 11298 11742 11m11654F89M AGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCTG
MT MT 11298 11742 11m11654F89M AGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCTG
MT MT 11298 11742 11m11654F89M AGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCTG
MT MT 11298 11742 11m11654F89M AGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCTG
MT MT 11298 11742 11m11654F89M AGTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCTG
MT MT 11297 11743 10m11654F90M GTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCTTACATCCTCATTACTATTCTGC
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MT MT 11297 11743 10m11654F90M GTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCTGC
MT MT 11297 11743 10m11654F90M GTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCTGC
MT MT 11297 11743 10m11654F90M GTGAGTAGTA ACAGCCATTCTCATCCAAACCCCCTGAAGCTTCACCGGCGCAGCCATTCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTACTATTCTGC
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CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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MT MT 12531 12431 100m AGTTCGAGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGG
MT MT 12528 12428 100m TCGAGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTA
MT MT 12525 12425 100m AGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGA
MT MT 12522 12422 100m TAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTT
MT MT 12519 12419 100m TAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTT
MT MT 12516 12416 100m CTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTT
MT MT 12513 12413 100m CTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTTGT
MT MT 12510 12410 100m GGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGG
MT MT 12507 12407 100m CTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCTACAATGGATTTTACATAATGGGAGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTT
MT MT 12504 12403 88m1d12m GGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTGDTTAGGGTTAACG
MT MT 12501 12401 100m ACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAG
MT MT 12498 12398 100m TGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGT
MT MT 12495 12395 100m ATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGT
MT MT 12492 12392 100m TTGTTGTGTGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAG
MT MT 12489 12389 100m TTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGAT
MT MT 12486 12386 100m TGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGG
MT MT 12483 12383 100m GGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGG
MT MT 12480 12380 100m AGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAAT
MT MT 12477 12377 100m GACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAG
MT MT 12474 12374 100m TGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGA
MT MT 12471 12370 55m1d45m TAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTDTTAGGGTTAACGAGGGGGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTC
MT MT 12468 12368 100m TAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAG
MT MT 12465 12365 100m AGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGT
MT MT 12462 12362 100m TGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAG
MT MT 12459 12358 43m1d57m ATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTGDTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTG
MT MT 12456 12355 40m1d60m CGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTGDTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTT
MT MT 12453 12353 100m CAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTAT
MT MT 12450 12349 34m1d66m TGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTGDTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTA
MT MT 12447 12346 31m1d69m ATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTDTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTG
MT MT 12444 12344 100m TTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGAGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTG
MT MT 12440 12340 100m ATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATG
MT MT 12437 12337 100m ATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTA
MT MT 12434 12334 100m GGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGAGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTATT
MT MT 12431 12331 100m GTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTATTACT
MT MT 12431 12738 95m12734F5M GTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGGGTGCATGGTTA CCGCT
MT MT 12428 12328 100m TGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTATTACTTTT
MT MT 12427 12742 91m12734F9M GAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACA
MT MT 12427 12742 91m12734F9M GAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACA
MT MT 12424 12745 88m12734F12M TTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGAAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACC
MT MT 12424 12745 88m12734F12M TTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACC
MT MT 12423 12746 87m12734F13M TTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCT
MT MT 12423 12746 87m12734F13M TTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCT
MT MT 12421 12748 85m12734F15M TTTTTGTTAGGGGTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTAT
MT MT 12418 12751 82m12734F18M TTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCC
MT MT 12418 12751 82m12734F18M TTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCC
MT MT 12412 12757 76m12734F24M GGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGT
MT MT 12410 12759 74m12734F26M GTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTC
MT MT 12407 12762 71m12734F29M AACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATC
MT MT 12403 12766 67m12734F33M AGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCT
MT MT 12402 12767 66m12734F34M GGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTG
MT MT 12402 12767 66m12734F34M GGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATAGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTG
MT MT 12399 12770 63m12734F37M TGGTAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGA
MT MT 12396 12773 60m12734F40M TAAGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGATGG
MT MT 12394 12775 58m12734F42M AGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCG
MT MT 12394 12775 58m12734F42M AGGATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCG
MT MT 12391 12778 55m12734F45M ATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTTAGAGGGCGTAG
MT MT 12391 12778 55m12734F45M ATGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAG
MT MT 12390 12779 54m12734F46M TGGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGG
MT MT 12389 12780 53m12734F47M GGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGA
MT MT 12389 12780 53m12734F47M GGGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGA
MT MT 12388 12781 52m12734F48M GGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAA
MT MT 12388 12781 52m12734F48M GGGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAA
MT MT 12387 12782 51m12734F49M GGGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAAT
MT MT 12386 12783 50m12734F50M GGGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATT
MT MT 12385 12784 49m12734F51M GGAATTAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGGAGGAATTA
MT MT 12380 12789 44m12734F56M TAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCC
MT MT 12380 12789 44m12734F56M TAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCC
MT MT 12380 12789 44m12734F56M TAGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCC
MT MT 12379 12790 43m12734F57M AGGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATAGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCT
MT MT 12378 12791 42m12734F58M GGGAAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTT
MT MT 12375 12794 39m12734F61M AAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTA
MT MT 12375 12794 39m12734F61M AAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTT
MT MT 12375 12794 39m12734F61M AAGTCAGGGTTAGGGTGATTATAGTAGTGTGCATAGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTT
MT MT 12375 12794 39m12734F61M AAGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTT
MT MT 12374 12795 38m12734F62M AGTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTG
MT MT 12373 12796 37m12734F63M GTCAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGC
MT MT 12371 12798 35m12734F65M CAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTC
MT MT 12371 12798 35m12734F65M CAGGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTC
MT MT 12370 12799 34m12734F66M AGGGTTAGGGCGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAAAAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCA
MT MT 12369 12800 33m12734F67M GGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCAT
MT MT 12369 12800 33m12734F67M GGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGGGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCAT
MT MT 12369 12800 33m12734F67M GGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCAAGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCAT
MT MT 12369 12800 33m12734F67M GGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCAT
MT MT 12369 12800 33m12734F67M GGGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCAT
MT MT 12369 12800 33m12734F67M GGGTTAGGGTGGGTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGGAGGAATTATATCCTTCTTGCTCAT
MT MT 12368 12801 32m12734F68M GGTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGTTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATC
MT MT 12367 12802 31m12734F69M GTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCA
MT MT 12367 12802 31m12734F69M GTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCA
MT MT 12367 12802 31m12734F69M GTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCA
MT MT 12367 12802 31m12734F69M GTTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCA
MT MT 12366 12803 30m12734F70M TTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAG
MT MT 12366 12803 30m12734F70M TTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCTGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAG
MT MT 12366 12803 30m12734F70M TTAGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAG
MT MT 12364 12805 28m12734F72M AGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTT
MT MT 12364 12805 28m12734F72M AGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATAGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTT
MT MT 12364 12805 28m12734F72M AGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATAGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTT
MT MT 12364 12805 28m12734F72M AGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATAGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCCTGCTCATCAGTT
MT MT 12364 12805 28m12734F72M AGGGTGGTTATAGTAGTGTGCATAGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCCTGCTCATCAGTT
MT MT 12362 12807 26m12734F74M GGTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGA
MT MT 12362 12807 26m12734F74M GGTGGTTATAGTCGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGA
MT MT 12361 12808 25m12734F75M GTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGAT
MT MT 12361 12808 25m12734F75M GTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGAT
MT MT 12361 12808 25m12734F75M GTGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGAT
MT MT 12360 12809 24m12734F76M TGGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATG
MT MT 12359 12810 23m12734F77M GGTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGA
MT MT 12358 12811 22m12734F78M GTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGAT
MT MT 12358 12811 22m12734F78M GTTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGAT
MT MT 12357 12812 21m12734F79M TTATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGGGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATA
MT MT 12356 12813 20m12734F80M TATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATAC
MT MT 12355 12814 19m12734F81M ATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACG
MT MT 12355 12814 19m12734F81M ATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACG
MT MT 12355 12814 19m12734F81M ATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACG
MT MT 12355 12814 19m12734F81M ATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGTTACG
MT MT 12355 12814 19m12734F81M ATAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACG
MT MT 12354 12815 18m12734F82M TAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGC
MT MT 12354 12815 18m12734F82M TAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGC
MT MT 12354 12815 18m12734F82M TAGTAGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGC
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MT MT 12350 12819 14m12734F86M AGTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGA
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MT MT 12349 12820 13m12734F87M GTGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAG
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MT MT 12348 12821 12m12734F88M TGTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGC
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MT MT 12347 12822 11m12734F89M GTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGCGCA
MT MT 12347 12822 11m12734F89M GTGCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCA
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MT MT 12345 12824 9m12734F91M GCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGA
MT MT 12345 12824 9m12734F91M GCATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGA
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MT MT 12343 12826 7m12734F93M ATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGTAGATG
MT MT 12343 12826 7m12734F93M ATGGTTA CCGCTAACAACCTATTCCAACTGTTCATCGGCTGAGAGGGGGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATG
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951:821
-873:-899
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<-------- --------> |
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Sbjct 32330409 TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGACGCCAACACA 32330360
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Sbjct 134926011 TATCCTTTTTACTCATTAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACA 134925962
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Sbjct 84816204 TATCCTTTTTACTCATTAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACA 84816155
>ref|NW_004929323.1| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 4527099 TATCCTTTTTACTCATTAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACA 4527148
>ref|NW_001838952.2| Homo sapiens chromosome 5 genomic scaffold, alternate assembly
HuRef SCAF_1103279188412, whole genome shotgun sequence
gb|DS486020.1| Homo sapiens SCAF_1103279188412 genomic scaffold, whole genome
shotgun sequence
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Sbjct 4527033 TATCCTTTTTACTCATTAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACA 4527082
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shotgun sequence
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Sbjct 129449675 TATCCTTTTTACTCATTAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACA 129449626
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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blast search - nt
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reads
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MT MT 12531 12431 100m AGTTCGAGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGG
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MT MT 12525 12425 100m AGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGA
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MT MT 12495 12395 100m ATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGT
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MT MT 12483 12383 100m GGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGG
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MT MT 12470 12792 92m12785F8M AATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTC
MT MT 12469 12793 91m12785F9M ATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCT
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MT MT 12468 12794 90m12785F10M TAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTT
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MT MT 12466 12796 88m12785F12M AAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGGATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGC
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MT MT 12459 12803 81m12785F19M ATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAG
MT MT 12459 12803 81m12785F19M ATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAG
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MT MT 12457 12805 79m12785F21M GCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTT
MT MT 12457 12805 79m12785F21M GCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTT
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MT MT 12449 12813 71m12785F29M GGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATAC
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MT MT 12444 12818 66m12785F34M TTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCG
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MT MT 12442 12820 64m12785F36M ACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAG
MT MT 12442 12820 64m12785F36M ACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAG
MT MT 12441 12821 63m12785F37M CATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGC
MT MT 12441 12821 63m12785F37M CATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGC
MT MT 12438 12824 60m12785F40M AATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGA
MT MT 12437 12824 13m1i46m12785F40M ATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGA
MT MT 12437 12824 13m1i46m12785F40M ATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGA
MT MT 12437 12825 59m12785F41M ATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGAT
MT MT 12437 12825 59m12785F41M ATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGTGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGAT
MT MT 12436 12826 58m12785F42M TGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATG
MT MT 12436 12826 58m12785F42M TGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATG
MT MT 12435 12827 57m12785F43M GGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGC
MT MT 12435 12827 57m12785F43M GGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGC
MT MT 12433 12828 9m1i46m12785F44M GGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCC
MT MT 12433 12828 9m1i46m12785F44M GGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCC
MT MT 12433 12829 55m12785F45M GGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCA
MT MT 12432 12830 54m12785F46M GGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAA
MT MT 12432 12830 54m12785F46M GGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAA
MT MT 12432 12830 54m12785F46M GGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAA
MT MT 12432 12830 54m12785F46M GGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGTTGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAA
MT MT 12431 12831 53m12785F47M GTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGCAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAAC
MT MT 12430 12832 52m12785F48M TATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACA
MT MT 12430 12832 52m12785F48M TATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCACATGCCAACA
MT MT 12430 12831 6m1i46m12785F47M TATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAAC
MT MT 12430 12831 6m1i46m12785F47M TATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAAC
MT MT 12429 12833 51m12785F49M ATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACAC
MT MT 12428 12834 50m12785F50M TGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACA
MT MT 12427 12835 49m12785F51M GTTTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAG
MT MT 12427 12835 49m12785F51M GAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAG
MT MT 12427 12835 49m12785F51M GAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAG
MT MT 12427 12834 3m1i46m12785F50M GAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACA
MT MT 12426 12836 48m12785F52M AGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGC
MT MT 12425 12837 47m12785F53M GTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGAGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCA
MT MT 12425 12837 47m12785F53M GTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACTCCCGAGCAGATGCCAACACAGCA
MT MT 12424 12838 46m12785F54M TTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAG
MT MT 12423 12839 45m12785F55M TTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGC
MT MT 12422 12840 44m12785F56M TTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCC
MT MT 12422 12840 44m12785F56M TTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCC
MT MT 12421 12841 43m12785F57M TTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCA
MT MT 12419 12843 41m12785F59M TTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATT
MT MT 12419 12843 41m12785F59M TTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGAGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATT
MT MT 12419 12843 41m12785F59M TTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGAGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATT
MT MT 12416 12846 38m12785F62M GTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTGGATGATACGACCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAA
MT MT 12416 12846 38m12785F62M GTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAA
MT MT 12416 12846 38m12785F62M GTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAA
MT MT 12416 12846 38m12785F62M GTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAA
MT MT 12416 12846 38m12785F62M GTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAA
MT MT 12415 12847 37m12785F63M TTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAG
MT MT 12414 12848 36m12785F64M TAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGC
MT MT 12414 12848 36m12785F64M TAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGC
MT MT 12414 12848 36m12785F64M TAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGC
MT MT 12414 12848 36m12785F64M TAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGAGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGC
MT MT 12414 12848 36m12785F64M TAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGC
MT MT 12414 12848 36m12785F64M TAGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGC
MT MT 12413 12849 35m12785F65M AGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCA
MT MT 12413 12849 35m12785F65M AGGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGACATTCAAGCA
MT MT 12412 12850 34m12785F66M GGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGAAGCCATTCAAGCAA
MT MT 12412 12850 34m12785F66M GGGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGGATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAA
MT MT 12411 12851 33m12785F67M GGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAAT
MT MT 12411 12851 33m12785F67M GGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAAT
MT MT 12411 12851 33m12785F67M GGTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGAGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAAT
MT MT 12410 12852 32m12785F68M GTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATC
MT MT 12410 12852 32m12785F68M GTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATC
MT MT 12410 12852 32m12785F68M GTTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATC
MT MT 12409 12853 31m12785F69M TTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGAGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCC
MT MT 12409 12853 31m12785F69M TTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGAGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCC
MT MT 12409 12853 31m12785F69M TTAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGACATTCAAGCAATCC
MT MT 12408 12854 30m12785F70M TAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCT
MT MT 12408 12854 30m12785F70M TAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCT
MT MT 12408 12854 30m12785F70M TAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCT
MT MT 12408 12854 30m12785F70M TAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGACGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCT
MT MT 12408 12854 30m12785F70M TAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCT
MT MT 12408 12854 30m12785F70M TAACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCT
MT MT 12407 12855 29m12785F71M AACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTA
MT MT 12407 12855 29m12785F71M AACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTA
MT MT 12407 12855 29m12785F71M AACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTA
MT MT 12406 12856 28m12785F72M ACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATGCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTAT
MT MT 12406 12856 28m12785F72M ACGAGGGCGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTAT
MT MT 12406 12856 28m12785F72M ACGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCAATTCAAGCAATCCTAT
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MT MT 12405 12857 27m12785F73M CGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATA
MT MT 12405 12857 27m12785F73M CGAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATA
MT MT 12404 12858 26m12785F74M GAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATAC
MT MT 12404 12858 26m12785F74M GAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATAC
MT MT 12404 12858 26m12785F74M GAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATAC
MT MT 12404 12858 26m12785F74M GAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATAC
MT MT 12404 12858 26m12785F74M GAGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATAC
MT MT 12403 12859 25m12785F75M AGGGTGGTAAGGATGGGGGGAGTTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGGTACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACA
MT MT 12403 12859 25m12785F75M AGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACA
MT MT 12403 12859 25m12785F75M AGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACA
MT MT 12403 12859 25m12785F75M AGGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACA
MT MT 12402 12860 24m12785F76M GGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAA
MT MT 12402 12860 24m12785F76M GGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTGTACAA
MT MT 12402 12860 24m12785F76M GGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAA
MT MT 12402 12860 24m12785F76M GGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAA
MT MT 12402 12860 24m12785F76M GGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAA
MT MT 12402 12860 24m12785F76M GGGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAA
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCATTCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12401 12861 23m12785F77M GGTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12400 12862 22m12785F78M GTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACC
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MT MT 12400 12862 22m12785F78M GTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCGGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATGCAAGCAATCCTATACAACC
MT MT 12400 12862 22m12785F78M GTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACC
MT MT 12400 12862 22m12785F78M GTGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACC
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MT MT 12399 12863 21m12785F79M TGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCG
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MT MT 12399 12863 21m12785F79M TGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCG
MT MT 12399 12863 21m12785F79M TGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCG
MT MT 12399 12863 21m12785F79M TGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAAAACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACAG
MT MT 12399 12863 21m12785F79M TGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCG
MT MT 12399 12863 21m12785F79M TGGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCG
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MT MT 12398 12864 20m12785F80M GGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGT
MT MT 12398 12864 20m12785F80M GGTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAGGCAATCCTATACCACCGT
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MT MT 12397 12865 19m12785F81M GTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTA
MT MT 12397 12865 19m12785F81M GTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTA
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MT MT 12397 12865 19m12785F81M GTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTA
MT MT 12397 12865 19m12785F81M GTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTA
MT MT 12397 12865 19m12785F81M GTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCGGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTA
MT MT 12397 12865 19m12785F81M GTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTA
MT MT 12397 12865 19m12785F81M GTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATATGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTA
MT MT 12397 12865 19m12785F81M GTAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATCCGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTA
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MT MT 12396 12866 18m12785F82M TAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTAT
MT MT 12396 12866 18m12785F82M TAAGGATGGGAGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTAT
MT MT 12396 12866 18m12785F82M TAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTAT
MT MT 12396 12866 18m12785F82M TAAGAATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCCACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTAT
MT MT 12396 12866 18m12785F82M TAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTAT
MT MT 12396 12866 18m12785F82M TAAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTAT
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MT MT 12395 12867 17m12785F83M AAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATC
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MT MT 12395 12867 17m12785F83M AAGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATC
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MT MT 12394 12868 16m12785F84M AGGATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCG
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MT MT 12392 12870 14m12785F86M GATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGC
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MT MT 12392 12870 14m12785F86M GATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGC
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MT MT 12391 12871 13m12785F87M ATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCG
MT MT 12391 12871 13m12785F87M ATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCG
MT MT 12391 12871 13m12785F87M ATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCG
MT MT 12391 12871 13m12785F87M ATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCG
MT MT 12391 12871 13m12785F87M ATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCG
MT MT 12391 12871 13m12785F87M ATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCG
MT MT 12391 12871 13m12785F87M ATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCG
MT MT 12391 12871 13m12785F87M ATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCG
MT MT 12391 12871 13m12785F87M ATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCG
MT MT 12391 12871 13m12785F87M ATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCG
MT MT 12391 12871 13m12785F87M ATGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCG
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MT MT 12390 12872 12m12785F88M TGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGA
MT MT 12390 12872 12m12785F88M TGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGA
MT MT 12390 12872 12m12785F88M TGGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGA
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12389 12873 11m12785F89M GGGGGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12386 12876 8m12785F92M GGGAATTA TATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGCGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGAATCGGCGATATC
MT MT 12775 12875 100M TAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATAT
MT MT 12778 12878 100M GAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGG
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MT MT 12543 12443 100m TGGCTCAGTGTCAGTTCGAGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTT
MT MT 12540 12440 100m CTCAGTGTCAGTTCGAGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTAC
MT MT 12537 12437 100m AGTGGCAGTTCGAGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTGCATA
MT MT 12534 12434 100m GTCAGTTCGAGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATG
MT MT 12531 12431 100m AGTTCGAGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGG
MT MT 12528 12428 100m TCGAGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTA
MT MT 12525 12425 100m AGATAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGA
MT MT 12522 12422 100m TAATAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTT
MT MT 12519 12419 100m TAACTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTT
MT MT 12516 12416 100m CTTCTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTT
MT MT 12513 12413 100m CTTGGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTTGT
MT MT 12510 12410 100m GGTCTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGG
MT MT 12507 12407 100m CTAGGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCTACAATGGATTTTACATAATGGGAGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTT
MT MT 12504 12403 88m1d12m GGCACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTGDTTAGGGTTAACG
MT MT 12501 12401 100m ACATGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAG
MT MT 12498 12398 100m TGAATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGT
MT MT 12495 12395 100m ATATTGTTGTGGGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGT
MT MT 12492 12392 100m TTGTTGTGTGGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGGTGGTAAG
MT MT 12483 12788 59m1i25m12774F15M GGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATC
MT MT 12483 12789 84m12774F16M GGAAGAGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCC
MT MT 12478 12793 54m1i25m12774F20M AGACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCT
MT MT 12477 12795 78m12774F22M GACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTG
MT MT 12477 12795 78m12774F22M GACTGATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTG
MT MT 12472 12800 73m12774F27M ATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCAT
MT MT 12472 12800 73m12774F27M ATAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCAT
MT MT 12471 12801 72m12774F28M TAATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATC
MT MT 12469 12803 70m12774F30M ATAAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAG
MT MT 12467 12804 43m1i25m12774F31M AAAGGTGGATGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGT
MT MT 12458 12814 59m12774F41M TGCGACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCACATCAGTTGATGATAAG
MT MT 12455 12817 56m12774F44M GACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCC
MT MT 12454 12818 55m12774F45M ACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCG
MT MT 12454 12818 55m12774F45M ACAATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCG
MT MT 12452 12820 53m12774F47M AATGGATTTTACATAATGGGGGGATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAG
MT MT 12452 12820 53m12774F47M AATGGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAG
MT MT 12449 12822 27m1i23m12774F49M GGATTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCA
MT MT 12446 12825 22m1i25m12774F52M TTTTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGAT
MT MT 12444 12828 45m12774F55M TTACATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCC
MT MT 12440 12832 41m12774F59M ATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACA
MT MT 12440 12832 41m12774F59M ATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACA
MT MT 12440 12832 41m12774F59M ATAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACA
MT MT 12439 12833 40m12774F60M TAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACAC
MT MT 12439 12833 40m12774F60M TAATGGGGGCATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACAC
MT MT 12439 12832 15m1i25m12774F59M TAATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACA
MT MT 12438 12834 39m12774F61M AATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACA
MT MT 12437 12835 38m12774F62M ATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAG
MT MT 12437 12835 38m12774F62M ATGGGGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAG
MT MT 12433 12838 9m1i25m12774F65M GGGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAG
MT MT 12432 12839 8m1i25m12774F66M GGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGC
MT MT 12432 12839 8m1i25m12774F66M GGTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGC
MT MT 12431 12841 32m12774F68M GTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCA
MT MT 12431 12840 7m1i25m12774F67M GTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCC
MT MT 12431 12841 32m12774F68M GTATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCA
MT MT 12430 12842 31m12774F69M TATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCAC
MT MT 12430 12842 31m12774F69M TATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCAT
MT MT 12429 12843 30m12774F70M ATGAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATT
MT MT 12427 12845 28m12774F72M GAGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCA
MT MT 12426 12846 27m12774F73M AGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAA
MT MT 12426 12846 27m12774F73M AGTTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAA
MT MT 12424 12848 25m12774F75M TTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGC
MT MT 12424 12848 25m12774F75M TTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGC
MT MT 12424 12848 25m12774F75M TTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGC
MT MT 12424 12848 25m12774F75M TTTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATCCAAGC
MT MT 12423 12849 24m12774F76M TTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCA
MT MT 12423 12849 24m12774F76M TTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCA
MT MT 12423 12849 24m12774F76M TTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCA
MT MT 12423 12849 24m12774F76M TTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCA
MT MT 12423 12849 24m12774F76M TTTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCG
MT MT 12422 12850 23m12774F77M TTTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAA
MT MT 12421 12851 22m12774F78M TTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAAT
MT MT 12421 12851 22m12774F78M TTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGAGACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAAT
MT MT 12421 12851 22m12774F78M TTTTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAAT
MT MT 12419 12853 20m12774F80M TTTGTTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCC
MT MT 12417 12855 18m12774F82M TGGTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTA
MT MT 12415 12857 16m12774F84M TTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATA
MT MT 12415 12857 16m12774F84M TTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATA
MT MT 12415 12857 16m12774F84M TTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATAGCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATA
MT MT 12415 12857 16m12774F84M TTAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATA
MT MT 12414 12858 15m12774F85M TAGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATAC
MT MT 12413 12859 14m12774F86M AGGGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACA
MT MT 12411 12861 12m12774F88M GGTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAAC
MT MT 12410 12862 11m12774F89M GTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACC
MT MT 12410 12862 11m12774F89M GTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACATCC
MT MT 12410 12862 11m12774F89M GTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAAATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACC
MT MT 12410 12862 11m12774F89M GTTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACC
MT MT 12409 12863 10m12774F90M TTAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCG
MT MT 12408 12864 9m12774F91M TAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACCCAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGT
MT MT 12408 12864 9m12774F91M TAACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGT
MT MT 12407 12865 8m12774F92M AACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTA
MT MT 12407 12865 8m12774F92M AACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTA
MT MT 12407 12865 8m12774F92M AACGAGGG CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTA
MT MT 12764 12864 100M CTGAGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATGCAAGCAATCCTATACAACCGT
MT MT 12767 12867 100M AGAGGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATC
MT MT 12770 12870 100M GGGCGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGC
MT MT 12773 12873 100M CGTAGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGAT
MT MT 12776 12876 100M AGGAATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGCCGATATC
MT MT 12779 12879 100M AATTATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGT
MT MT 12782 12882 100M TATATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTC
MT MT 12785 12885 100M ATCCTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGCTTCATC
MT MT 12788 12888 100M CTTCTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCAAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTC
MT MT 12791 12891 100M CTTGCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCC
MT MT 12794 12894 100M GCTCATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTA
MT MT 12797 12897 100M CATCAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCA
MT MT 12800 12900 100M CAGTTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGA
MT MT 12803 12903 100M TTGATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTT
MT MT 12806 12906 100M ATGATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATC
MT MT 12809 12909 100M ATACGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTA
MT MT 12812 12912 100M CGCCCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTACAC
MT MT 12815 12915 100M CCGAGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTACACTCC
MT MT 12818 12918 100M AGCAGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTACACTCCAAC
MT MT 12821 12921 100M AGATGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTACACTCCAACTCA
MT MT 12824 12924 100M TGCCAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTACACTCCAACTCATGA
MT MT 12827 12927 100M CAACACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTACACTCCAACTCATGAGAC
MT MT 12830 12930 100M CACAGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTACACTCCAACTCATGAGACCCA
MT MT 12833 12933 100M AGCAGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTACACTCCAACTCATGAGACCCACAA
MT MT 12836 12936 100M AGCCATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTACACTCCAACTCATGAGACCCACAACAA
MT MT 12839 12939 100M CATTCAAGCAATCCTATACAACCGTATCGGCGATATCGGTTTCATCCTCGCCTTAGCATGATTTATCCTACACTCCAACTCATGAGACCCACAACAAATA
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MT MT 14788 15279 38m15218F62M TAATTAGTTTTATTAGGGGGTTAATTTTGCGTATTGGG ACAGACCTAGTTCAATGAATCTGAGGAGGCTACTCAGTAGACAGTCCCACCCTCACACGATT
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MT MT 14844 15086 71m15058F29M GAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA GGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAA
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MT MT 14838 15092 65m15058F35M TCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA GGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCG
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MT MT 14823 15107 50m15058F50M GTTGGATGGGGGGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATTTTATTA CGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGC
MT MT 14823 15107 50m15058F50M GTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA GGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGC
MT MT 14823 15107 50m15058F50M GTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA GGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGC
MT MT 14823 15107 50m15058F50M GTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA CGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGC
MT MT 14821 15109 48m15058F52M TGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA GGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTT
MT MT 14821 15109 48m15058F52M TGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA GGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTT
MT MT 14821 15109 48m15058F52M TGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA GGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTT
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MT MT 14820 15110 47m15058F53M GGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGGGGTTAATTAGTTTTATTA CGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTG
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MT MT 14814 15116 41m15058F59M GGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA GGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTA
MT MT 14814 15116 41m15058F59M GGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA GGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTA
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MT MT 14811 15119 38m15058F62M GGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATTTTATTA CGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAG
MT MT 14811 15119 38m15058F62M GGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA GGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAG
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MT MT 14807 15123 34m15058F66M AGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA CGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAAC
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MT MT 14806 15124 33m15058F67M GGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA CGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACA
MT MT 14806 15124 33m15058F67M GGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA CGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCACCTATAGCAACA
MT MT 14806 15124 33m15058F67M GGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA GGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACA
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MT MT 14805 15125 32m15058F68M GTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA CGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAG
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MT MT 14803 15127 30m15058F70M CGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA CGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCC
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MT MT 14802 15128 29m15058F71M GATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTA CGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCT
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254:388
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300:365
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417:299
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254:508
254:508
254:508
254:508
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-456:-333
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381:419
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382:523
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-382:-535
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323:657
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617:433
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MDT-AP-0369_MB-0369_Primary_A14804 |
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MT |
14780 |
N/A |
MT |
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|
|
43 |
<-------- --------> |
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blast search - genome
left flanking sequence - GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT
>ref|NC_018913.2| Homo sapiens chromosome 2, alternate assembly CHM1_1.1, whole
genome shotgun sequence
gb|CM001610.2| Homo sapiens chromosome 2, whole genome shotgun sequence
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Sbjct 33822019 GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATAAATGAGTGGTTAATTAATT 33822068
>ref|NW_004929300.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, alternate assembly
CHM1_1.1, whole genome shotgun sequence
gb|KE150084.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic scaffold, whole genome shotgun
sequence
Length=68452320
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 12714546 GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATAAATGAGTGGTTAATTAATT 12714595
>gb|KE141358.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold109, whole genome
shotgun sequence
Length=58306400
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT 50
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Sbjct 29612873 GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATAAATGAGTGGTTAATTAATT 29612824
>gb|GL582986.1| Homo sapiens unplaced genomic scaffold scaffold_6, whole genome
shotgun sequence
Length=35059763
Score = 87.9 bits (47), Expect = 3e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT 50
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 17651330 GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATAAATGAGTGGTTAATTAATT 17651281
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
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Lambda K H
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right flanking sequence - TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTACGGATCATTT
blast search - nt
left flanking sequence - GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT
right flanking sequence - TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTACGGATCATTT
reads
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MT MT 15013 14913 100m ATATTGAGGCGCCATTGGCGTGAAGGTAGCGGATGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGG
MT MT 15010 14910 100m TTGAGGCGCCATTGGCGTGAAGGTAGCGGATGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGA
MT MT 15007 14907 100m AGGCGCCATTGGCGTGAAGGTAGCGGATGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTA
MT MT 15004 14904 100m CGCCATTGGCGTGAAGGTAGCGGATGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTG
MT MT 15001 14901 100m CATTGGCGTGAAGGTAGCGGATGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCAT
MT MT 14998 14898 100m TGGCGTGAAGGTAGCGGATGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGC
MT MT 14995 14895 100m CGTGAAGGTAGCGGATGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAG
MT MT 14992 14892 100m GAAGGTAGCGGATGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAA
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MT MT 14986 14886 100m AGCGGATGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCC
MT MT 14983 14883 100m GGATGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGT
MT MT 14980 14880 100m TGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGT
MT MT 14977 14877 100m TTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGAT
MT MT 14974 14874 100m AGCCATAATTTTCGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTG
MT MT 14971 14871 100m CATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAG
MT MT 14968 14868 100m AATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGAT
MT MT 14965 14865 100m TAACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGTAGGATCAG
MT MT 14962 14862 100m CGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCA
MT MT 14959 14859 100m CTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGC
MT MT 14956 14856 100m GAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCC
MT MT 14953 14853 100m TGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAG
MT MT 14950 14850 100m TGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAG
MT MT 14947 14847 100m GGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGA
MT MT 14944 14844 100m CGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCC
MT MT 14941 14841 100m TTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAA
MT MT 14938 14777 97m61n3m ATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGAAGGCGCCAAGGAGAGAGCCGAA|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||TTT
MT MT 14935 14835 100m AAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCA
MT MT 14932 14832 100m AGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCA
MT MT 14929 14829 100m CGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGC
MT MT 14926 14826 100m TTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGA
MT MT 14923 14823 100m AGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGAT
MT MT 14920 14820 100m CGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTT
MT MT 14917 14817 100m CTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGA
MT MT 14914 14814 100m GTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGG
MT MT 14911 14811 100m AGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGT
MT MT 14908 14808 100m AGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGG
MT MT 14905 14805 100m GCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG
MT MT 14902 14802 100m TGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTC
MT MT 14899 14799 100m CTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGAT
MT MT 14896 14796 100m GGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAA
MT MT 14893 14792 86m1d14m ATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGADGGTCGATGAATGAG
MT MT 14890 14790 100m GTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTG
MT MT 14887 14787 100m CTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTT
MT MT 14884 14784 100m TGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT
MT MT 14881 14781 100m TGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAA
MT MT 14878 14778 100m TTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTT
MT MT 14875 14775 100m GGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTAT
MT MT 14872 14772 100m GGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTTTTATTAG
MT MT 14844 15052 65m15018F35M GAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTA
MT MT 14840 15056 61m15018F39M TTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATT
MT MT 14833 15063 54m15018F46M ATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTACGGATC
MT MT 14830 15066 51m15018F49M CGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATT
MT MT 14829 15067 50m15018F50M GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTT
MT MT 14829 15067 50m15018F50M GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTT
MT MT 14829 15067 50m15018F50M GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTT
MT MT 14827 15069 48m15018F52M AGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCT
MT MT 14827 15069 48m15018F52M AGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTACGGATCATTTCT
MT MT 14826 15070 47m15018F53M GATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGGGAGGCCTATATTACGGATCATTTCCC
MT MT 14825 15071 46m15018F54M ATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCT
MT MT 14825 15071 46m15018F54M ATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCT
MT MT 14823 15073 44m15018F56M GTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTAC
MT MT 14822 15074 43m15018F57M TTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACT
MT MT 14821 15075 42m15018F58M TGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTC
MT MT 14821 15075 42m15018F58M TGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAATT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTC
MT MT 14820 15076 41m15018F59M GGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCA
MT MT 14820 15076 41m15018F59M GGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCA
MT MT 14819 15077 40m15018F60M GATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAG
MT MT 14819 15077 40m15018F60M GATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAG
MT MT 14819 15077 40m15018F60M GATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAG
MT MT 14818 15078 39m15018F61M ATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGA
MT MT 14818 15078 39m15018F61M ATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGA
MT MT 14818 15078 39m15018F61M ATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGA
MT MT 14818 15078 39m15018F61M ATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGA
MT MT 14817 15079 38m15018F62M TGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAA
MT MT 14815 15081 36m15018F64M GGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAAC
MT MT 14815 15081 36m15018F64M GGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAAC
MT MT 14815 15081 36m15018F64M GGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAAC
MT MT 14814 15082 35m15018F65M GGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACC
MT MT 14813 15083 34m15018F66M GTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCT
MT MT 14812 15084 33m15018F67M TGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTG
MT MT 14812 15084 33m15018F67M TGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTG
MT MT 14812 15084 33m15018F67M TGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTG
MT MT 14812 15084 33m15018F67M TGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTG
MT MT 14812 15084 33m15018F67M TGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTG
MT MT 14811 15085 32m15018F68M GGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGA
MT MT 14809 15087 30m15018F70M GGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAA
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MT MT 14809 15087 30m15018F70M GGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAA
MT MT 14809 15087 30m15018F70M GGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAA
MT MT 14808 15088 29m15018F71M GAGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAAC
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MT MT 14807 15089 28m15018F72M AGGTCGATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACA
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MT MT 14801 15095 22m15018F78M ATGAATGAGTGGTTAATTAGTT TTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCA
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HuRef SCAF_1103279188412, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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sequence
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Sbjct 17651470 ATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTT 17651518
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Lambda K H
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reads
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MT MT 14934 14834 100m AAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCAT
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MT MT 14858 14994 74m14969F26M CCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCA
MT MT 14855 14997 71m14969F29M AGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTAAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGC
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MT MT 14828 15024 44m14969F56M GAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTG
MT MT 14825 15027 41m14969F59M ATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCT
MT MT 14824 15028 40m14969F60M TGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTC
MT MT 14822 15030 38m14969F62M TTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATTATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTT
MT MT 14821 15031 37m14969F63M TGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTC
MT MT 14819 15033 35m14969F65M GATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCCTCCT
MT MT 14819 15033 35m14969F65M GATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCT
MT MT 14819 15033 35m14969F65M GATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCT
MT MT 14818 15034 34m14969F66M ATGGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTA
MT MT 14816 15036 32m14969F68M GGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACA
MT MT 14816 15036 32m14969F68M GGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACA
MT MT 14816 15036 32m14969F68M GGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACA
MT MT 14816 15036 32m14969F68M GGGGTGGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACA
MT MT 14811 15041 27m14969F73M GGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCG
MT MT 14811 15041 27m14969F73M GGGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCG
MT MT 14810 15042 26m14969F74M GGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGG
MT MT 14810 15042 26m14969F74M GGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGG
MT MT 14810 15042 26m14969F74M GGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGG
MT MT 14810 15042 26m14969F74M GGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGG
MT MT 14810 15042 26m14969F74M GGGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGG
MT MT 14809 15043 25m14969F75M GGAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGA
MT MT 14808 15044 24m14969F76M GAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGAC
MT MT 14808 15044 24m14969F76M GAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGAC
MT MT 14808 15044 24m14969F76M GAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGAC
MT MT 14808 15044 24m14969F76M GAGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGAC
MT MT 14807 15045 23m14969F77M AGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACG
MT MT 14807 15045 23m14969F77M AGGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACG
MT MT 14806 15046 22m14969F78M GGTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGA
MT MT 14805 15047 21m14969F79M GTCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAG
MT MT 14804 15048 20m14969F80M TCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGG
MT MT 14804 15048 20m14969F80M TCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGG
MT MT 14804 15048 20m14969F80M TCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGG
MT MT 14804 15048 20m14969F80M TCGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGG
MT MT 14803 15049 19m14969F81M CGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGC
MT MT 14803 15049 19m14969F81M CGATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGC
MT MT 14802 15050 18m14969F82M GATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCC
MT MT 14802 15050 18m14969F82M GATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCC
MT MT 14801 15051 17m14969F83M ATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCG
MT MT 14801 15051 17m14969F83M ATGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCT
MT MT 14800 15052 16m14969F84M TGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACCAGGCCTA
MT MT 14800 15052 16m14969F84M TGAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTA
MT MT 14799 15053 15m14969F85M GAATGAGTGGTAAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTAT
MT MT 14799 15053 15m14969F85M GAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTAT
MT MT 14799 15053 15m14969F85M GAATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTAT
MT MT 14798 15054 14m14969F86M AATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATA
MT MT 14798 15054 14m14969F86M AATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATA
MT MT 14798 15054 14m14969F86M AATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATA
MT MT 14798 15054 14m14969F86M AATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATA
MT MT 14798 15054 14m14969F86M AATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATA
MT MT 14798 15054 14m14969F86M AATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTGCACATCGGACGAGGCCTATA
MT MT 14798 15054 14m14969F86M AATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGGGGCCTATA
MT MT 14798 15054 14m14969F86M AATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATA
MT MT 14797 15055 13m14969F87M ATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATAT
MT MT 14797 15055 13m14969F87M ATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATAT
MT MT 14797 15055 13m14969F87M ATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATAT
MT MT 14797 15055 13m14969F87M ATGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATAT
MT MT 14796 15056 12m14969F88M TGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATT
MT MT 14796 15056 12m14969F88M TGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATT
MT MT 14796 15056 12m14969F88M TGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATT
MT MT 14796 15056 12m14969F88M TGAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATT
MT MT 14795 15057 11m14969F89M GAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTA
MT MT 14795 15057 11m14969F89M GAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTA
MT MT 14795 15057 11m14969F89M GAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGGGCCTCAATATTCTTTATCTTCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTA
MT MT 14795 15057 11m14969F89M GAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTA
MT MT 14795 15057 11m14969F89M GAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTA
MT MT 14795 15057 11m14969F89M GAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCAACCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTA
MT MT 14795 15057 11m14969F89M GAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTA
MT MT 14795 15057 11m14969F89M GAGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTA
MT MT 14794 15058 10m14969F90M AGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTAC
MT MT 14794 15058 10m14969F90M AGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTAC
MT MT 14794 15058 10m14969F90M AGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTAC
MT MT 14794 15058 10m14969F90M AGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGGCGAGGCCTATATTAC
MT MT 14794 15058 10m14969F90M AGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTAC
MT MT 14794 15058 10m14969F90M AGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTAC
MT MT 14794 15058 10m14969F90M AGTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTAC
MT MT 14793 15059 9m14969F91M GTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACG
MT MT 14793 15059 9m14969F91M GTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGTCTATATTACG
MT MT 14793 15059 9m14969F91M GTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACG
MT MT 14793 15059 9m14969F91M GTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACG
MT MT 14793 15059 9m14969F91M GTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACG
MT MT 14793 15059 9m14969F91M GTGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACG
MT MT 14792 15060 8m14969F92M TGGTTAAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGG
MT MT 14787 15125 3m14969F95M60N2M AAT TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGAGC||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||AG
MT MT 14959 15059 100M GACGTAAATTATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACG
MT MT 14962 15062 100M GTAAATTATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGAT
MT MT 14965 15065 100M AATTATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCAT
MT MT 14968 15068 100M TATGGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTC
MT MT 14971 15071 100M GGCTGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCT
MT MT 14974 15074 100M TGAATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACT
MT MT 14977 15077 100M ATCATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAG
MT MT 14980 15080 100M ATCCGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAA
MT MT 14983 15083 100M CGCTACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCT
MT MT 14986 15086 100M TACCTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAA
MT MT 14989 15089 100M CTTCACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACA
MT MT 14992 15092 100M CACGCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCG
MT MT 14995 15095 100M GCCAATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGTACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCA
MT MT 14998 15098 100M AATGGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTA
MT MT 15001 15101 100M GGCGCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCC
MT MT 15004 15104 100M GCCTCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCC
MT MT 15007 15107 100M TCAATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGC
MT MT 15010 15110 100M ATATTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTG
MT MT 15013 15113 100M TTCTTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTACTGCTTGCAA
MT MT 15016 15116 100M TTTATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTA
MT MT 15019 15119 100M ATCTGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAG
MT MT 15022 15122 100M TGCCTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAA
MT MT 15025 15125 100M CTCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAG
MT MT 15028 15128 100M TTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCT
MT MT 15031 15131 100M CTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCA
MT MT 15034 15134 100M CACATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTCGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAG
MT MT 15037 15137 100M ATCGGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCT
MT MT 15040 15140 100M GGACGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTATG
MT MT 15043 15143 100M CGAGGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTATGTCC
MT MT 15046 15146 100M GGCCTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTTCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTATGTCCTCC
MT MT 15049 15149 100M CTATATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTATGTCCTCCCGT
MT MT 15052 15152 100M TATTACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTATGTCCTCCCGTGAG
MT MT 15055 15155 100M TACGGATCATTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTATGTCCTCCCGTGAGGCC
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MT MT 15064 15164 100M TTTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTATGTCCTCCCGTGAGGCCAAATATCAT
MT MT 15067 15167 100M CTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTATGTCCTCCCGTGAGGCCAAATATCATTCT
MT MT 15070 15170 100M TACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTATGTCCTCCCGTGAGGCCAAATATCATTCTGAG
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MT MT 15088 15188 100M ATCGGCATTATCCTCCTGCTTGCAACTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTATGTCCTCCCGTGAGGCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAA
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Sbjct 42573538 AGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATATTGGATGGGGTGGGGAG 42573584
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shotgun sequence
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Sbjct 16830463 AGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATATTGGATGGGGTGGGGAG 16830417
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Sbjct 129445771 AGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATATTGGATGGGGTGGGGAG 129445817
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HuRef SCAF_1103279188412, whole genome shotgun sequence
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shotgun sequence
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Lambda K H
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blast search - nt
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right flanking sequence - GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCC
reads
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MT MT 14983 14883 100m GGATGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGT
MT MT 14980 14880 100m TGATTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGT
MT MT 14977 14877 100m TTCAGCCATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGAT
MT MT 14974 14874 100m AGCCATAATTTTCGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTG
MT MT 14971 14871 100m CATAATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAG
MT MT 14968 14868 100m AATTTACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGAT
MT MT 14965 14865 100m TAACGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGTAGGATCAG
MT MT 14962 14862 100m CGTCTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCA
MT MT 14959 14859 100m CTCGAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGC
MT MT 14956 14856 100m GAGTGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCC
MT MT 14953 14853 100m TGATGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAG
MT MT 14950 14850 100m TGTGGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAG
MT MT 14947 14847 100m GGGCGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGA
MT MT 14944 14844 100m CGATTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCC
MT MT 14941 14841 100m TTGATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAA
MT MT 14938 14838 100m ATGAAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTT
MT MT 14935 14835 100m AAAAGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCA
MT MT 14932 14832 100m AGGCGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCA
MT MT 14929 14829 100m CGGTTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGC
MT MT 14926 14826 100m TTGAGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGA
MT MT 14923 14823 100m AGGCGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGAT
MT MT 14920 14820 100m CGTCTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTT
MT MT 14917 14817 100m CTGGTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGA
MT MT 14914 14814 100m GTGAGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGG
MT MT 14911 14811 100m AGTAGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGT
MT MT 14908 14808 100m AGTGCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGG
MT MT 14905 14805 100m GCATGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG
MT MT 14902 14802 100m TGGCTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTC
MT MT 14899 14799 100m CTAGGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGAT
MT MT 14896 14796 100m GGAATAGTCCTGTGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAGGTCGATGAA
MT MT 14884 15173 79m15153F21M TGGTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GTCAAATATCATTCTGAGGGG
MT MT 14882 15175 77m15153F23M GTGATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCC
MT MT 14880 15177 75m15153F25M GATTTGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCAC
MT MT 14876 15181 71m15153F29M TGGAGGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTTAGGGGCCACAGTA
MT MT 14872 15185 67m15153F33M GGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGGGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTA
MT MT 14872 15185 67m15153F33M GGATCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTA
MT MT 14869 15188 64m15153F36M TCAGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGGGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAA
MT MT 14867 15190 62m15153F38M AGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAAC
MT MT 14867 15190 62m15153F38M AGGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCCCAGTAATTACAAAC
MT MT 14866 15191 61m15153F39M GGCAGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACT
MT MT 14863 15194 58m15153F42M AGGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTAC
MT MT 14862 15195 57m15153F43M GGCGCCAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACT
MT MT 14857 15200 52m15153F48M CAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGGGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCG
MT MT 14857 15200 52m15153F48M CAAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCG
MT MT 14856 15201 51m15153F49M AAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGC
MT MT 14856 15201 51m15153F49M AAGGAGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGC
MT MT 14852 15205 47m15153F53M AGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATC
MT MT 14852 15205 47m15153F53M AGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATC
MT MT 14852 15205 47m15153F53M AGTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATC
MT MT 14851 15206 46m15153F54M GTGAGCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCC
MT MT 14847 15210 42m15153F58M GCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATA
MT MT 14847 15210 42m15153F58M GCCGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATA
MT MT 14847 15210 42m15153F58M GCCGAAGATTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATA
MT MT 14845 15212 40m15153F60M CGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAAGATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACA
MT MT 14845 15212 40m15153F60M CGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACA
MT MT 14845 15212 40m15153F60M CGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACA
MT MT 14845 15212 40m15153F60M CGAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACA
MT MT 14844 15213 39m15153F61M GAAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACAT
MT MT 14843 15214 38m15153F62M AAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATT
MT MT 14843 15214 38m15153F62M AAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCGGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATGCGCCATCCCATACATT
MT MT 14843 15214 38m15153F62M AAGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGTGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATT
MT MT 14842 15215 37m15153F63M AGTTTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTG
MT MT 14839 15218 34m15153F66M TTCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGA
MT MT 14838 15219 33m15153F67M TCATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGAC
MT MT 14837 15220 32m15153F68M CATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACA
MT MT 14837 15220 32m15153F68M CATCATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCAGCCATCCAATACATTGGGACA
MT MT 14834 15223 29m15153F71M CATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGAC
MT MT 14834 15223 29m15153F71M CATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGAC
MT MT 14834 15223 29m15153F71M CATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGAC
MT MT 14833 15224 28m15153F72M ATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACC
MT MT 14833 15224 28m15153F72M ATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACC
MT MT 14833 15224 28m15153F72M ATGCGGAGATGTTGGATGGGGGGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACC
MT MT 14833 15224 28m15153F72M ATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACC
MT MT 14833 15224 28m15153F72M ATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACC
MT MT 14833 15224 28m15153F72M ATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACC
MT MT 14833 15224 28m15153F72M ATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACC
MT MT 14833 15224 28m15153F72M ATGCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACC
MT MT 14831 15226 26m15153F74M GCGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTA
MT MT 14830 15227 25m15153F75M CGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAG
MT MT 14830 15227 25m15153F75M CGGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAG
MT MT 14829 15228 24m15153F76M GGAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGT
MT MT 14828 15229 23m15153F77M GAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTT
MT MT 14828 15229 23m15153F77M GAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTT
MT MT 14828 15229 23m15153F77M GAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTT
MT MT 14828 15229 23m15153F77M GAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTT
MT MT 14828 15229 23m15153F77M GAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTT
MT MT 14828 15229 23m15153F77M GAGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTT
MT MT 14827 15230 22m15153F78M AGATGTTGGATGGGGGGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTCGTTC
MT MT 14827 15230 22m15153F78M AGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTC
MT MT 14827 15230 22m15153F78M AGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTC
MT MT 14827 15230 22m15153F78M AGATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTC
MT MT 14826 15231 21m15153F79M GATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCA
MT MT 14826 15231 21m15153F79M GATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCA
MT MT 14825 15232 20m15153F80M ATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAA
MT MT 14825 15232 20m15153F80M ATGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAA
MT MT 14824 15233 19m15153F81M TGTTGGATGGGGTGGGGAG GTCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAAT
MT MT 14824 15233 19m15153F81M TGTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAAT
MT MT 14823 15234 18m15153F82M GTTGGATGGGGTGGGGAG GTCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATG
MT MT 14823 15234 18m15153F82M GTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATG
MT MT 14823 15234 18m15153F82M GTTGGATGGGGTGGGGAG GTCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATG
MT MT 14823 15234 18m15153F82M GTTGGATGGGGTGGGGAG GTCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATG
MT MT 14823 15234 18m15153F82M GTTGGATGGGGTGGGGAG GTCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATG
MT MT 14823 15234 18m15153F82M GTTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATG
MT MT 14822 15235 17m15153F83M TTGGATGGGGTGGGGAG GTCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGA
MT MT 14822 15235 17m15153F83M TTGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGA
MT MT 14821 15236 16m15153F84M TGGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATCCATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAT
MT MT 14820 15237 15m15153F85M GGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAAT
MT MT 14820 15237 15m15153F85M GGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAAT
MT MT 14820 15237 15m15153F85M GGATGGGGTGGGGAG GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAAT
MT MT 15143 15243 100M TCCCGTGAGGCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAATCTGAGG
MT MT 15146 15246 100M CGTGAGGCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAATCTGAGGAGG
MT MT 15149 15249 100M GAGGCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAATCTGAGGAGGCTA
MT MT 15152 15252 100M GCCAAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAATCTGAGGAGGCTACTC
MT MT 15155 15255 100M AAATATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAATCTGAGGAGGCTACTCAGT
MT MT 15158 15258 100M TATCATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAATCTGAGGAGGCTACTCAGTAGA
MT MT 15161 15261 100M CATTCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAATCTGAGGAGGCTACTCAGTAGACAG
MT MT 15164 15264 100M TCTGAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAATCTGAGGAGGCTACTCAGTAGACAGTCC
MT MT 15167 15267 100M GAGGGGCCACAGTAATTACAAACTTACTATCCGCCATCCCATACATTGGGACAGACCTAGTTCAATGAATCTGAGGAGGCTACTCAGTAGACAGTCCCAC
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MT MT 15224 15502 65m15468F35M AGGTCTGTCCCAATGTATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGAC
MT MT 15224 15502 65m15468F35M AGGTCTGTCCCAATGTATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGAC
MT MT 15224 15502 65m15468F35M AGGTCTGTCCCAATGTATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGAC
MT MT 15223 15503 64m15468F36M GGTCTGTCCCAATGTATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACC
MT MT 15223 15503 64m15468F36M GGTCTGTCCCAATGTATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACC
MT MT 15221 15505 62m15468F38M TCTGTCCCAATGTATTGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCA
MT MT 15221 15505 62m15468F38M TCTGTCCCAATGTATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCA
MT MT 15221 15505 62m15468F38M TCTGTCCCAATGTATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCG
MT MT 15218 15508 59m15468F41M GTCCCAATGTATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGAC
MT MT 15218 15508 59m15468F41M GTCCCAATGTATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGAC
MT MT 15214 15512 55m15468F45M CAATGTATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATT
MT MT 15214 15512 55m15468F45M CAATGTATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA TATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATT
MT MT 15208 15518 49m15468F51M ATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA TATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCC
MT MT 15208 15518 49m15468F51M ATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCC
MT MT 15208 15518 49m15468F51M ATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA TATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCC
MT MT 15208 15518 49m15468F51M ATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCC
MT MT 15208 15518 49m15468F51M ATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCC
MT MT 15208 15518 49m15468F51M ATGGGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCC
MT MT 15205 15521 46m15468F54M GGATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAG
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MT MT 15204 15522 45m15468F55M GATGGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGC
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MT MT 15201 15525 42m15468F58M GGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAA
MT MT 15201 15525 42m15468F58M GGCGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAA
MT MT 15200 15526 41m15468F59M GCGGATAGTAAGGTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAAC
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MT MT 15199 15527 40m15468F60M CGGATAGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACC
MT MT 15194 15532 35m15468F65M AGTAAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA TATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTA
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MT MT 15191 15535 32m15468F68M AAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAAC
MT MT 15191 15535 32m15468F68M AAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATCCCCTAGCCAACCCCTTAAAC
MT MT 15191 15535 32m15468F68M AAGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAAC
MT MT 15190 15536 31m15468F69M AGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA TATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACA
MT MT 15190 15536 31m15468F69M AGTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACA
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MT MT 15189 15537 30m15468F70M GTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACAC
MT MT 15189 15537 30m15468F70M GTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA TATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACAC
MT MT 15189 15537 30m15468F70M GTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACAC
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MT MT 15189 15537 30m15468F70M GTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA TATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACAC
MT MT 15189 15537 30m15468F70M GTTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACAC
MT MT 15188 15538 29m15468F71M TTTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACC
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MT MT 15187 15539 28m15468F72M TTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA TATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCC
MT MT 15187 15539 28m15468F72M TTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCC
MT MT 15187 15539 28m15468F72M TTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCC
MT MT 15187 15539 28m15468F72M TTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCC
MT MT 15187 15539 28m15468F72M TTGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCC
MT MT 15186 15540 27m15468F73M TGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCC
MT MT 15186 15540 27m15468F73M TGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCC
MT MT 15186 15540 27m15468F73M TGTAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCC
MT MT 15184 15542 25m15468F75M TAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTC
MT MT 15184 15542 25m15468F75M TAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA TATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTC
MT MT 15184 15542 25m15468F75M TAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTC
MT MT 15184 15542 25m15468F75M TAATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTC
MT MT 15183 15543 24m15468F76M AATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCC
MT MT 15183 15543 24m15468F76M AATTACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTAC
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MT MT 15180 15546 21m15468F79M TACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCA
MT MT 15180 15546 21m15468F79M TACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCA
MT MT 15179 15547 20m15468F80M ACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCAC
MT MT 15179 15547 20m15468F80M ACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCAC
MT MT 15179 15547 20m15468F80M ACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCAC
MT MT 15179 15547 20m15468F80M ACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCAC
MT MT 15179 15547 20m15468F80M ACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCAC
MT MT 15179 15547 20m15468F80M ACTGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACCCCCCTCCCCAC
MT MT 15177 15549 18m15468F82M TGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACAT
MT MT 15177 15549 18m15468F82M TGTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACAT
MT MT 15176 15550 17m15468F83M GTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATC
MT MT 15176 15550 17m15468F83M GTGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATC
MT MT 15175 15551 16m15468F84M TGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCA
MT MT 15175 15551 16m15468F84M TGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCA
MT MT 15175 15551 16m15468F84M TGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACACCTTAAACACCCCTCCCCACATCA
MT MT 15175 15551 16m15468F84M TGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCA
MT MT 15175 15551 16m15468F84M TGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCA
MT MT 15175 15551 16m15468F84M TGGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCA
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MT MT 15174 15552 15m15468F85M GGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAA
MT MT 15174 15552 15m15468F85M GGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAA
MT MT 15174 15552 15m15468F85M GGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAA
MT MT 15174 15552 15m15468F85M GGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAA
MT MT 15174 15552 15m15468F85M GGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAA
MT MT 15174 15552 15m15468F85M GGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAA
MT MT 15174 15552 15m15468F85M GGCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAA
MT MT 15173 15553 14m15468F86M GCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAG
MT MT 15173 15553 14m15468F86M GCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAG
MT MT 15173 15553 14m15468F86M GCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAG
MT MT 15173 15553 14m15468F86M GCCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTACGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAG
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MT MT 15172 15554 13m15468F87M CCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAGC
MT MT 15172 15554 13m15468F87M CCCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAGC
MT MT 15171 15555 12m15468F88M CCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAGCC
MT MT 15171 15555 12m15468F88M CCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAGCC
MT MT 15171 15555 12m15468F88M CCCTCAGAATGA CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAGCC
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MT MT 15467 15567 100M CATTAACACTATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAGCCCGAATGATATTT
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MT MT 15476 15576 100M TATTCTCACCTGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAGCCCGAATGATATTTCCTATTCGC
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MT MT 15500 15600 100M ACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAGCCCGAATGATATTTCCTATTCGCCTACACAATTCTCCGATCCGTCCC
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MT MT 15512 15612 100M ATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTCCCCACATCAAGCCCGAATGATATTTCCTATTCGCCTACACAATTCTCCGATCCGTCCCTAACAAACTAGG
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